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gi|32 : --A-CA--T----A----T--A-CAC----A----TGT--GTA--C----A---C-AC-------------AT---A----TA-CA-TA-------------CA----------TAC--A-CTT--G-----C-ACATA----T--AC----A--TAT--Acccgtatagaccgggaaatgcatgctgaaaaatacaaaatcagtttttaaatgtatacgcacacggatatactagtacatatacaaacaaaagcatatgtatcacaagcacacgtttataccggtacatgtatattaaacacaaaacactactggcacata
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gi|11 : aaatatatgataaaagtccatgaacacgtctgacttatttggcttcaaacaccatcaggaaaacaaatagcaacaacctcttcagaatgaacaggaaacagtgatgaacaaaggtggagCAT------AC----ACAC--ACA----TACATG--TATA-TA---ACG-G-TA-CATG-ATTAC------TAACATACACATTCAGTATCACATG----C-A-CAT----G---C-ACG--TA-T--------ACAC--C---C--GT------AT-Ag
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gi|18 : gtacacatatacacatacctatatgtacacatatacactcacgcccgcccgcacgcacatgctcaaatgcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatatataTACATG-C-ACNNNNNN-NNNNGTGTA------TAC--ATGC-ACACAT--A----A--A--------T-CCT--G---GT--TATA--GGT--GTA-------TAC------ATGCACACAT
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gi|2 : atacgtacggacacaactatgcatacgcacgaagactcgcacTTTAGAACTACATGTAATATTCTATTTAAGAATCCTTGAAACAAAAAC-AAAATTCAAGGTGCTCATTTAGGATAACAAAGAGACTGAGATGCTTTTATGACCATTGTAAGATCAATATGTCCAGGTGCATCTCAATGACATATTTAAGATGCTATGTTTAGATA-----T-ACACGTAATACCCTATTTGAGAGTCCTTGAAGCG-AAAAACGAAA-TTCAAGGTGCTCATTTAGGATAATACAGAGAATGACATGCATTTATGGCCATCATAAGATC-AGTATATCCCGTTCTTCTCAATATCGTTCTATGTGCGCATGGAAACAGTATAATAGTGGTAGCTAATTTAAG-AAAAACATAGTTAA-----------------C----GAAATATACTATGTCATTGACATGAGAAAAACAGAAAACAACACCCTTATAATATAGTTTTCAGTTCTTACGTTCTTGCTTTACTAAATAAAAGTTACCTCTCTGTTCATAGCAAAATAGTAAACCGGTTTTACATG-CCA---ATGC-ATGCGTGCA------TAC--ATAT-ACACAT--A----C--A--------TACGT--AC--GT-ACATA--CGC--ACA-------CAC------ATGCACACATGTA-CAC--G--T-AC---ATTCG---------------TACAT----ACAT------AC----ACAC--GCA----CACACG--TACG-CA--CATA-GGTA-CCTACATTAG------TG-CATACGCACGCA----CATCTG----T-A-TAT-AC-G---C-ACA--TA-C--------ATAC--G---C--AT------AT-ACGC--------CCGCA--CG--T--ACGTACATACA---TCG----CACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNGCACACGCGTACA-CGTAC----ATAC--GCAAATACATACGTA--CATA--AATAC----ACACG--CACACAAT--TAC--ATGCCTA-CA--TAAGTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGT--AACA--TGTACA-TACGCACCCACGTAA--ACACGCACGTA-CACATG--TGCATGC-GCACGTACACA--CGTACAAG--CGTAAACACGCACGC------ACAC-A---------TGTACATGCGCACGTACAGCC----------GTAAACAC--GCACGTA-CACACGT---CCACA----CGT--CCGCATGCACATACGCACATACGTACACA-CGTC----CC-CATG--T----ACATA---TGCACATACGCACGCACATAT--GCATATATACATGC-CTA---ATGTATAC--AT--ATCCA--CTCAATAAT-------AATG-ATATACATACAC--TACT--GATA---CATAATTCACGGTGAAAACA--TATTCTTTTTAATATTCAGCTCTATCCTTTGTTACAAACACACATCTAAATCAATTTGCCGAACCTGACTAGTAACAGGTTTTTT--ACACGGAAAGGTTCTATATTTAGATATGGTGCGTGTACATTCCAGCATGGTCCAGTATGCTAACAATACATTAGGTATTTGTGAATTAACATGGACATGAGCGACGTTTATGCTTACACACACTCACACACACACTAAACACAAACATGCTATCTTTCAATTCCAAGCGCTGTCGTTAGACACCGCAGAGATATA-----TA------AATAT--GTAATTAAGTCACTGATCACAAAGTAATAATATAATTATTACAGGGTACAATATATTCTACTATCTCGTCGCATGAAATGTAAATGCGGGTTACAAAAAATATTGAGATTAATTAAGCTGAAATGAGTTGA------------------------AAATGCACAGGGAGTCTAAGCGATAATATTACAGTCTATTTTGTAAACAGGATTAGAG-------TTTTATGTGTTCAGTTGAAATTCAGATCAATATTTAAGATTATTCTTAATATACATTCCTTAACCAAATACATACAAACCTACTGTGCAATATCATATGTAGCATTATTCTTAAATAATAAAGAATACACATACATAAAAAAACTTACTTGTTGTAGTGCAGCAAAAAAAAAA----TGTCATTTTAATTACTGAATTTTTGCTTTTCACAAATTTTGTCATATATCAAGTTCTCAACCACAATAACTTGTATTGTATTTATTTATTAACAATTCTATATTCTTATTCTATAAAATTATTATCAAATACTGTATAGGACCCTAACAGACTTTAATTGGATATCCCTTTATCATGTATTAAGATCAGAGAACATATTTCAACATAAGGAGGTGACTTTAATTACAGCAGTCACTAAA--------ACATTTGATATAGACGTGCATCCTGTCATGTGAGGTGATTTAGGGGATAGTGTGATTTTGTAAAACAATGACATATCATTGGTTTAAACTAAACATATATAGAAATACATAAACAGCGCATGCATATAATAGGGAAACTGTATCACAAAAACAATACTAATTATCAAAATATATCATAATAAGAATAAACATGGAATTTTACAAAAGCG-----TACACTTCCTCCAAGAACTCACGTATTAAATTATAGTAAATTTATATAAATTTATAGTGAGC--C-ATTGTAAATTTATGGTTTTAACTCATGCAGATCTACAACTGGGTACGCACACATGTGCAGATCCACAAC--CGATTACTATCTC-CTGTACTCCAAGGTCCAAGAGGTAGCTA-ACTATTGTTAATTGTTAGTGATTTCATTGTAAATTCATGATCTTAATTCATGGAGATCTGTAACTGGATACGTATACATGTGC
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gi|24 : acaACATA-CACACA--CACACGC-GCGCGCACACA--CACACA------CAAATACACACGC------ACGC-A---------TGCACACACGCACGCACG--C----------ACAAACAC--ACAC
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gi|3 : --GTA--TATAC--G---CACGCGCG--------CACGAACGCACATACATACAC----ACA--TACACATGTACA-T-CCGTAACC-CGTA--CATACGCA--------CTCACGTA------------------AACACGCACGTA-CACATGTA----CATGCGCACGTACGCACGTAAACACGCACGTACA---CACGTCCGCAAG----TACATACG----CACATACGCACGCACGTACGCATATATACAC--GCCTT-ATGTATACATATCCACTCAATAATAATGGTGTACATACATTACT--GACA---CATAATTAACGGTGAAAATA--TATTGTTTTAAATATTCAGCTCTATCCTTTGTTACAAACACACATCTAAATCAGTTTGCCGAACCTGACTAGTAACAG-TTTTTTTTACACCGAAAGGTTCCATATTTAGATATGGTGCGTGTACATTCCAGCGTGGTCAAGTGTACTAACAATATATTAGGTATTTATGAATTTAAATGGACATGAGTGACGTTTATGCCTACACACACTCACACACACACTAAACACAAACATGCTATCTTTCAATACCAAGCGCTGTCGTTAGACACCGCAGAGATATA-----TATATATAAACAT--GTAAATAAGTCACTGATCACAAAATAACAATATTATTATTACAGGATACAATATATTCTACTATCTCGTCGCATGTAATGTTAATGCAGGTAACAAAAAATATTGAGATTAATTAAGCTTAAACGAGTTGAGTTACACAA-TAAGCATTACAGTGAAAATGCACAGGGAGTCTAAGCGATAATATTACAGTCTATTTTGTAAACAGGATTAGAGCTTTATATTTTATATGTTCAGTTGAAATTCAGATCAATATTTAAGATTATTCTTAATATACATACCTTAACC---------------TACTGTGTAATATAATATGTAACTTTATTCTCATATAATAAAGAAAGCACATACATAAAAAAACTTACTTGTTGCAGTGCAGCAAAAAAAA------------TTTAATTACTGAATTTTGGCTTTTCACAAATTTTGTCATATAGCAAGTTCTCAACTTCAATAACTT------TATTTATTAATAAACAATTCTATATTCTTATTCTATAAAATTACTATCAAATAACGTATAGGACCCTCACAGACTTTAATTGGATATCCATGTATCATGTATTAAGATCAAAGAACAAATTACAACATAAGGCGGTGACTTTGATTACAGCAGTCACTAAAA--CTCACATTTGATATAGACGTGCATCCTGCCATGTAAGGTGATTTAGGGGATAGTGT---------AAAACAATGACATATCATTGGTTTAAACTAAACATATATAAAAATACATAAACAGCGCATGCATATAATAGGAAAACTGTATCACAAAAACAATACTAATTATCAAAATATATCATAATAAGAATAAACATGGGATTTTACAAAAGCGTACACTACACTTCCTCCGAAAACACACGTATGAATTTATAGTAGATTTATATAAATTTATAGTAAGC--C-ATTGAAAATTTATGGTTTTAACTCATGCAGATCTACAACTGAGTACGCACACATGTGCAGATCCACAACCG-AGTACT--ATCTC-CTGTTCTCCAAGGTCTAAGAGGTAGCAA-ACTATTGTTAATTGTTAGTGATTTTATTGTAAATTCGTGATCTTAATTCATGCAGATCTGCAACTGGATACGTATACGTGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatatacgcacgcgcgcacgaacgcacatacatacacacatacacatgtacatccgtaacccgtacatacgcactcacgtaaacacgcacgtacacatgtacatgcgcacgtacgcacgtaaacacgcacgtacacacgtccgcaagtacatacgcacatacgcacgcacgtacgcatatatacacgccttatgtatacatatccactcaataataatggtgtacatacattactgacacataattaacggtgaaaatatattgttttaaatattcagctctatcctttgttacaaacacacatctaaatcagtttgccgaacctgactagtaacagttttttttacaccgaaaggttccatatttagatatggtgcgtgtacattccagcgtggtcaagtgtactaacaatatattaggtatttatgaatttaaatggacatgagtgacgtttatgcctacacacactcacacacacactaaacacaaacatgctatctttcaataccaagcgctgtcgttagacaccgcagagatatatatatataaacatgtaaataagtcactgatcacaaaataacaatattattattacaggatacaatatattctactatctcgtcgcatgtaatgttaatgcaggtaacaaaaaatattgagattaattaagcttaaacgagttgagttacacaataagcattacagtgaaaatgcacagggagtctaagcgataatattacagtctattttgtaaacaggattagagctttatattttatatgttcagttgaaattcagatcaatatttaagattattcttaatatacataccttaacctactgtgtaatataatatgtaactttattctcatataataaagaaagcacatacataaaaaaacttacttgttgcagtgcagcaaaaaaaatttaattactgaattttggcttttcacaaattttgtcatatagcaagttctcaacttcaataactttatttattaataaacaattctatattcttattctataaaattactatcaaataacgtataggaccctcacagactttaattggatatccatgtatcatgtattaagatcaaagaacaaattacaacataaggcggtgactttgattacagcagtcactaaaactcacatttgatatagacgtgcatcctgccatgtaaggtgatttaggggatagtgtaaaacaatgacatatcattggtttaaactaaacatatataaaaatacataaacagcgcatgcatataataggaaaactgtatcacaaaaacaatactaattatcaaaatatatcataataagaataaacatgggattttacaaaagcgtacactacacttcctccgaaaacacacgtatgaatttatagtagatttatataaatttatagtaagccattgaaaatttatggttttaactcatgcagatctacaactgagtacgcacacatgtgcagatccacaaccgagtactatctcctgttctccaaggtctaagaggtagcaaactattgttaattgttagtgattttattgtaaattcgtgatcttaattcatgcagatctgcaactggatacgtatacgtgtgcggat
gi|30 : gtccaggtggatttcaatgacatatttaagatgctatgtttagatctacacgtaatatcctatttgagagtccttgaagcgaaaaacaaaattcaaggtgctcatttaggataatacagagaatgagatgcatttatggccatcataagatcagtatatcccgttcttctcaatatcgttctatatgcgcatggaaacagcattatagtggtagctattttaaggaaaaacatagttaaggaaatatactatgtcactgacatgagaaaaacagaaacaacacccttataatatagttttcagttcttacgttctggctttactaaatttaagttacctctctgttcatagcaaaatagtcaaccagttttacatgccaatgcatgcgtgcatacatatacacatacatacatacgtacgtacgtacacacgcacacatataaacacgtgtacacgtacatacgcaaatacatcgtatatacatacatacacacgcacacacgtacgcacgtatatacctacataagtacatacgcacgcacatcagtatatacgcacataatacgtatacacgcctgcatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG-GTGC-ATGTATA-CACAT--ATATGCACACGCACACACACAggat
gi|30 : gctattgGCATGTA-TACACATA----TATGCACACGCACACACACA---ATATACATACA---atatacatacatt
gi|31 : gctattgataggtGC-A----TACATG--TAC--A-----TA-C--AT---TA--T--GAA----T-----ATCACA------C--GCATA---CA-----CGC--ACGCACGTA-TG--C--ATAC----A---tt
gi|32 : ----TACATATA----CACATGTGTACACACATATACATACATACACTTGC----ACATATACATAT
gi|33 : aGTCGT---ACAG-GCAGAGACATA-----TG------AACAT--GTAACTGAGTCACTGAT-ACAAa
gi|34 : agtgGTTAG-TATCACAGACATATA-----TA------AACATATGTAATTAAGTCACTGTTTAAAAAATgtt
gi|35 : CAAGTGCGCA-CGCAC----GCAT--GCACACACGCACGTA--CATA--AATAC----AAACA--C
gi|36 : aCAGAGACATAACATATA------AACAT--GTAATTAAGTCACTGATTAtc
gi|4 : CACTTACCCACAACTGCACACATAA--TAC-ATGTACA-CA-AC--ACGCATGCACGCACGCACTCACGCATGTAT--GCATTTA-ATAATGTATGCATATATGCATGCACAATA----C
gi|4 : tactgtCACTTACC--C----------ACAACTGCACACATAATACATGTA----CACA-ACACGCATGCACGCACGCACTCACG-------CATGTATGCATT----TA-------------ATA-------ATGTATGCATATATGCAT--GC----ACA-ATAC---TCCCTTTG--AACATCTGTATATACAAAATATTTCGA-AGTTCATA--TAAGAATGAAAAAA---AATGTTTTTAATATTtccctttgaacatctgtatatacaaaatatttcgaagttcatataagaatgaaaaaaaatgtttttaatattttttttatgttatcctatttgtagtatcccttgtaccgtcactcatccacacatgcacacataaaacatgtacacaacacacacggacgcacgcacacatgcaagcacgcatgcatgtaaacatgtatgtaagcatgtatgtaagcatgtatgtatataagcatgtatgtatacatgcatgcatgcatgcacgcacgcacgcatgtacacacacttgtccatatatgcccacgcatgcaagtgcatgcatgggcacatgcatgtacgcagccacatatgcacatgcatacgcgcatgcacacatacgcacccgtgcgcgccttcacacattcaaaacacacacacatggatatatacgtacatacaaaactacaccatgtatcttattattttcattaaaatcttaaatgcaagaccatattaaatgtctgtatcgttcctagatagagatacattattcactcagtttccaaattaatatacatacatta
gi|4 : tactgtCATCCACACAT----GCACACATAA-A-AC-ATGTACA-CA-AC--ACACACGGACGCACGCACACATGCAAGCAC--GCATGCATGTAA-ACATGTATGTAAGCATGTAT-GTA----AGC-----ATGTATGTATAT----AAGCAT--GTATGTATACATG---CATGCATGCAT----GCACGCACGCACGCATGTACACACACTTGTCCATATATGCCCA---C-G----CATGCAAGTGCATGCATGGGCACATGCATGTACG--C-------------AGC-CACATATG-CACATGCA----TACGCGCATGCA--CACATACGCAC--CCGTGCG---CGCCTTCACACA----TTCA-AAA----CACACACACATGGATATATACGTACATACAttttttatgttatcctatttgtagtatcccttgtaccgtcactcatccacacatgcacacataaaacatgtacacaacacacacggacgcacgcacacatgcaagcacgcatgcatgtaaacatgtatgtaagcatgtatgtaagcatgtatgtatataagcatgtatgtatacatgcatgcatgcatgcacgcacgcacgcatgtacacacacttgtccatatatgcccacgcatgcaagtgcatgcatgggcacatgcatgtacgcagccacatatgcacatgcatacgcgcatgcacacatacgcacccgtgcgcgccttcacacattcaaaacacacacacatggatatatacgtacatacaaaactacaccatgtatcttattattttcattaaaatcttaaatgcaagaccatattaaatgtctgtatcgttcctagatagagatacattattcactcagtttccaaattaatatacatacatta
gi|5 : tactgtcacttacccacaactgcacacataatacatgtacacaacacgcatgcacgcacgcactcacgcatgtatgcatttaataatgtatgcatatatgcatgcacaatactccctttgaacatctgtatatacaaaatatttcgaagttcatataagaatgaaaaaaaatgtttttaatattttttttatgttatcctatttgtagtatcccttgtaccgtcactTA--TAC--G--CA-CA-C--GGATATA--CTAGTA----C-----AT-ATA------C--AAACA---AA-----AGC--A--TATGTATCA--C--AAGC----A---CAC------G---------------T---TTATAC------C-G------G---------TAC----AT--GTA-----T---AT-------TAAA-CA-----CA-A--A-A-CA-C------------TAC-----TG-GCA-CATAC--ACAAA----TA----CTTGTATAT-A--A--CA-GTACATGAATACTCAAAC--ATACACTATTATCATCACAGTC-ACACGTATATA-----CAT-GTACATGCATGCAATAACATA---CAACATTATCATCACAT--GCACACGTTTATACCGGTACTCGT-CATCATATAACAATACTGGCAAATACACACATA--CATGTCTATACTGGTACATGTCCACTTAATCATAC--AAAATTATCA--T---CACTTACACAC----GTATATACCG-GTAC-A--TACA-TGCaaactacaccatgtatcttattattttcattaaaatcttaaatgcaagaccatattaaatgtctgtatcgttcctagatagagatacattattcactcagtttccaaattaatatacatacatta
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): ATTGCTTTTAAAATTACTAGACAATGTAAATATACCATACATTAAATACAACCGTAATTATATAAATACA
Unaligned ( gi|37 ): CATATATACATAATATAATTCATAACTGCACTGGTATATC
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