lowQualScore : 111 22 1 3333333333333 222222 222 2 1 33 33 1 1 1
lowQualScore : 777 555 22 999999 2 7777777777777 333333 222 9 1 3 0 3 0 2 8 5 5 5 1 3 2 33 55 1 2 6 00 4 7 4 2 1 5 7 777 9 4 1 3 2 5 1 6 1
lowQualScore : ... ... .. ...... . ............. ...... ... . . . . . . . . . . . . . . .. .. . . . .. . . . . . . . ... . . . . . . . . .
lowQualScore : 888 666 44 666666 2 1111111111111 000000 555 9 4 6 8 0 6 3 2 0 0 0 9 9 6 77 00 6 9 7 00 4 0 4 9 6 0 8 000 0 0 8 8 1 7 7 6 8
consensus : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTG------GTGGTAC------T------GGAGATG------AGACAGGATCTAATATATTGGAGATGGAGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTT-A-CTATCTCATACTTCATTTNATTGTATTTCATGNAAACTATAGTAT-TTCNTACANTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ANTTGCACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAA-GTATTTTGTTTACTTTGATGNGAT-AGAGAAAGTNAATT
Reference ( gi|2 ) : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTG------GTTGTAC------T------GGAGATG------AGACAGGATCTGTGATATTAGAGATGGAGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTG-T-A-CTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTATATTTTTATACTTGCCTGCCGAATC-ATTCAGTAC-ACTTGCATATGTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACATTTGAA-GTTTTTTGTTAACTTTGATGAGAT-AAACAAAGTAAATT
gi|4 : GATATTGAT---GATGATTGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAG------GTGGTAC------T-----------TG------AG---------------TTGGAGATG-AGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGAACAACCTGGCTAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATT-A-TTGTTTTTTACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGAATA-TCTTATACTTGCCTCCATAATC-AATTAATAC-ACTAGCAGATTTATCTGTAAATACTAGTTATGACTTATATA---TTAAACGTTTGAA-GTATTTTGTATTCTTCGATGAGATAAAATAAAGTTAATT
gi|5 : GATATTGAT---GATGATTATGATAATATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTG------ATGGTAC------TAGAGAAGGAGATG------AGACAGGATCTAATATATTGGAGATGGATATG-GACAGGATGGaatacacag
gi|16 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataatgatattGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTG------GT
gi|10 : GATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAG------GT
gi|12 : cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgatgttATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTG------GT
gi|3 : tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcTATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAA---TGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTG------ATGGTAC------T------GGAGATGGAGATGAGACAGGATCTAATATATTGGAGATGGATATG-GACAGGATGGAAGAGATTGGAG------------------ATGGAACAACATGGATGAAGCAAATGATTGTAGATATAATTGTGTT-A-CTATCTCATACTTTATGT-----TATTTCTTAAAAACTATAGTATA--TATAGAATTGACTCCACAATC-ATTGAATAC-AATTGTAAATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATATATTAAAACGTTTGAA-GTACTTTGTTTACTTTGATGTGAT-AAAGTAAGTCAATTg
gi|9 : gacatTATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAA---TGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTG------ATaacacacaa
gi|1 : taannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataatgatattgacatTGAT---GAT---GTTGTTTATATTGATGATGATCAAGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTATCGATGGCATTG------GTAGTACTAGAGAT------GGAGATG------AGACAGGATCTGTAATA------ATGGAGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGTTGGAAAATTGGACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATT-A-CTATCTCATACTTCATTTCATTGTATTTCATGTGATCTATAGAATA-TCTTATACTTGCCTCCATAATCAATTT--TAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACTATTGAG-GTATTTTGTTTACTTTGATGAGAT-AGAGAAAGTg
gi|6 : TGAT---GAT---TGTGATAACATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACAATGGCATTG------GTGGTAC------T------GGAGATGGAGATGAGACAGGATCTAATATATTGGAGATGGATATA-GACATGATGGAAGAGATTGGAG------------------ATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTG-T-AACTATCTCATACTTTATTT-----TAATTCATAAAAACTATAGTAT--TTCTACAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTGTGATTCATATA---TTAAACGTTTGAA-GTATTTTGTTTACTTTGATGTGAT-AGAGAAAGTAAATTtcattattacacag
gi|14 : ttgaTGGTGATACAGGTAAGGA------TGAGAAAGTATCAGGTAATGGAAAGGATGATATCAATAAATATTGAAA------T------GAAGATA------AGATAGGATATATGAAAATGGAGATTGAGATGAGACAGGATCTACACGACTATACATGAAAATATGACAGTAGATAAAAT-TCCTGAATAAAGCAAaattcacagt
gi|7 : aaTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATT-----------------------------------------GACGG---------TACTGGATATGGAGATG-GACAGGATGGATTAAACTGGAGATGGTGATAAGATCTTAGATAGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTACAATTGTGTT-A-CTATCTCATACTTCATTTGATTTTATTTCATGTAAACGATAGTAT-TTAGTACACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-AATTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAA-GTATTTTGTCAACTTTGATAAGAT-AGACAAAGTAAATT
gi|8 : AATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTG------GTGGTAC------TAGAGAAGGAGATG------AGACAGGATCTAATATATTGGAGATGGATATG-GACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTT-A-CTGTCTAATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTAAAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAA-GTATTTTGTTTACTTTGAaatacacag
gi|11 : GATG------AAACAGGATCTAATATATTGGAGATGGATATG-GTCAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATTATTGTAAGTATAATTGTG-TGA-CTTTCTCATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTACAGTTAACTCCACAATC-ATTCAATACAATTTATACATTGATTTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAA-GTACTTTGTTTTCTTTAATGTGAT-AGAGAAAGTAAATT
gi|13 : TG------AGACAGGATCTGTGATATT------GGAGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAATTAAATAATTGTAGGTATAATTGTG-T-A-CTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACAATAGTAT-TTCATATATTTGCCTGCATAATA-ATCAAAGAC-ACTTACATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATAAA---TCAAACATTTGAA-GTATTTTGTTTACTTTGATGAGAT-AGACAAAGTGAATTaatacactg
gi|17 : TTGGAGATG-AGATG-GACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGAaataaacagt
gi|15 : acttgagTTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCTTATACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAAC-TTCAAACGTTTT
gi|15 : ATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAA-GTTTTatatataaataataactatcatttacagat
Alignments
lowQualScore : 111 1 333333 222222 1111111
lowQualScore : 444 777 0 4 888888 0 000000 3 55 0 4 0000000 1 6 0 2 9 2 1 4 77 3 1 0 4 4 1 3 666 1 66 1
lowQualScore : ... ... . . ...... . ...... . .. . . ....... . . . . . . . . .. . . . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 000 000 5 4 333333 1 999999 6 00 1 6 8888888 2 6 1 0 7 5 0 0 22 0 0 5 0 0 0 0 444 0 44 0
consensus : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
Reference ( family-1878 ) : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTNATTGTATTTCATGNAAACTATAGTAT-TTCNTACANTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ANTTGCACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGNGATAGAG-AAAGTNAATT
gi|1 : TGAT---GAT---GTTGTTTATATTGATGATGATCAAGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTATCGATGGCATTGGTAG-TACTAGAGATGGAGATG------A-GACAGGATCTGTAATA--------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGTTGGAAAATTGGACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTACTATCTCATACTTCATTTCATTGTATTTCATGTGATCTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATCAATTT--TAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACTATTGAGGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTTCATT
gi|10 : GATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTattacacag
gi|11 : cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgatgttGATG------A-AACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGTCAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATTATTGTAAGTATAATTGTGTGACTTTCTCATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTACAGTTAACTCCACAATC-ATTCAATACAATTTATACATTGATTTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTTCTTTAATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|12 : ATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGaatacactg
gi|13 : tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcTG------A-GACAGGATCT--GTGATATTGGAGATGGA-------------CAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAATTAAATAATTGTAGGTATAATTGTGT-ACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACAATAGTAT-TTCATATATTTGCCTGCATAATA-ATCAAAGAC-ACTTACATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATAAA---TCAAACATTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAC-AAAGTGAATT
gi|14 : TGGTGATACAGGTAAGGAT------GAGAAAGTATCAGGTAATGGAAAGGATGATATCAATAAATATT------GAA-ATG------AAGATAAGATAG--GATATAT-GAAAATGGAGATTGAGATGAGACAGGATCTACACGACTATACATGAAAATATGACAGTAGATAAAAT-TCCTGAATAAAGCAAaataaacagt
gi|15 : aaTTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCTTATACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAAC--TTCAAACGTTTTATATA
gi|15 : ATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGT-TTTtaaataataactatcatttacagat
gi|16 : ttgtatttcatgtaaactatagtatttcttatacttgcttgcataatcattcaatacacttgcatatttatctgtaaatgatagttattatttatatatGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGT
gi|17 : TTGGAGATG-AGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGA
gi|2 : acttgagGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTTG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--GTGATATTAGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTG-TACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTATATTTTTATACTTGCCTGCCGAATC-ATTCAGTAC-ACTTGCATATGTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACATTTGAAGTTTTTTGTTAACTTTGATGAGATAAAC-AAAGTAAATT
gi|3 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGAAGAGATTGGAGAT------------------GGAACAACATGGATGAAGCAAATGATTGTAGATATAATTGTGTTACTATCTCATACTTTATGT-----TATTTCTTAAAAACTATAGTAT-AT-ATAGAATTGACTCCACAATC-ATTGAATAC-AATTGTAAATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATATATTAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTACTTTGATGTGATAAAG-TAAGTCAATT
gi|4 : gacatGATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTGG-TACT-----------TG------A-G-----------------TTGGAGAT-GAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGAACAACCTGGCTAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTATTGTTTTTTACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATC-AATTAATAC-ACTAGCAGATTTATCTGTAAATACTAGTTATGACTTATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTATTCTTCGATGAGATAAAATAAAGTTAATTaacacacaa
gi|5 : GATATTGAT---GATGATTATGATAATATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGATGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGaatacacag
gi|6 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataatgatattTGAT---GAT---TGTGATAACATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------AGACATGATGGAAGAGATTGGAGATGGAA------------------CAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTAACTATCTCATACTTTATTT-----TAATTCATAAAAACTATAGTAT-TTC-TACAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTGTGATTCATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|7 : ttgaTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGACGG-TACT------G-------------------GAT----------------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATTAAACTGGAGATGGTGATAAGATCTTAGATAGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTACAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTTTATTTCATGTAAACGATAGTAT-TTAGTACACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-AATTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTCAACTTTGATAAGATAGAC-AAAGTAAATTaattcacagt
gi|8 : AATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTGTCTAATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTAAAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGAaatacacag
gi|9 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATG
Alignments
lowQualScore : 111 1 333333 222222 1111111
lowQualScore : 444 777 0 4 888888 0 000000 3 55 0 4 0000000 1 6 0 2 9 2 1 4 77 0 1 0 4 4 1 0 666 0 66 1
lowQualScore : ... ... . . ...... . ...... . .. . . ....... . . . . . . . . .. . . . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 000 000 5 4 333333 1 999999 6 00 1 6 8888888 2 6 1 0 4 5 4 0 22 5 6 5 0 0 6 5 444 8 44 0
consensus : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
Reference ( family-1878 ) : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
gi|1 : TGAT---GAT---GTTGTTTATATTGATGATGATCAAGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTATCGATGGCATTGGTAG-TACTAGAGATGGAGATG------A-GACAGGATCTGTAATA--------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGTTGGAAAATTGGACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTACTATCTCATACTTCATTTCATTGTATTTCATGTGATCTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATCAATTT--TAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACTATTGAGGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTTCATT
gi|10 : GATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTattacacag
gi|11 : cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgatgttGATG------A-AACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGTCAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATTATTGTAAGTATAATTGTGTGACTTTCTCATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTACAGTTAACTCCACAATC-ATTCAATACAATTTATACATTGATTTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTTCTTTAATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|12 : ATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGaatacactg
gi|13 : tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcTG------A-GACAGGATCT--GTGATATTGGAGATGGA-------------CAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAATTAAATAATTGTAGGTATAATTGTGT-ACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACAATAGTAT-TTCATATATTTGCCTGCATAATA-ATCAAAGAC-ACTTACATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATAAA---TCAAACATTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAC-AAAGTGAATT
gi|14 : TGGTGATACAGGTAAGGAT------GAGAAAGTATCAGGTAATGGAAAGGATGATATCAATAAATATT------GAA-ATG------AAGATAAGATAG--GATATAT-GAAAATGGAGATTGAGATGAGACAGGATCTACACGACTATACATGAAAATATGACAGTAGATAAAAT-TCCTGAATAAAGCAAaataaacagt
gi|15 : aaTTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCTTATACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAAC--TTCAAACGTTTTATATA
gi|15 : ATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGT-TTTtaaataataactatcatttacagat
gi|16 : ttgtatttcatgtaaactatagtatttcttatacttgcttgcataatcattcaatacacttgcatatttatctgtaaatgatagttattatttatatatGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGT
gi|17 : TTGGAGATG-AGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGA
gi|2 : acttgagGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTTG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--GTGATATTAGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTG-TACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTATATTTTTATACTTGCCTGCCGAATC-ATTCAGTAC-ACTTGCATATGTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACATTTGAAGTTTTTTGTTAACTTTGATGAGATAAAC-AAAGTAAATT
gi|3 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGAAGAGATTGGAGAT------------------GGAACAACATGGATGAAGCAAATGATTGTAGATATAATTGTGTTACTATCTCATACTTTATGT-----TATTTCTTAAAAACTATAGTAT-AT-ATAGAATTGACTCCACAATC-ATTGAATAC-AATTGTAAATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATATATTAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTACTTTGATGTGATAAAG-TAAGTCAATT
gi|4 : gacatGATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTGG-TACT-----------TG------A-G-----------------TTGGAGAT-GAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGAACAACCTGGCTAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTATTGTTTTTTACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATC-AATTAATAC-ACTAGCAGATTTATCTGTAAATACTAGTTATGACTTATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTATTCTTCGATGAGATAAAATAAAGTTAATTaacacacaa
gi|5 : GATATTGAT---GATGATTATGATAATATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGATGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGaatacacag
gi|6 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataatgatattTGAT---GAT---TGTGATAACATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------AGACATGATGGAAGAGATTGGAGATGGAA------------------CAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTAACTATCTCATACTTTATTT-----TAATTCATAAAAACTATAGTAT-TTC-TACAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTGTGATTCATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|7 : ttgaTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGACGG-TACT------G-------------------GAT----------------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATTAAACTGGAGATGGTGATAAGATCTTAGATAGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTACAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTTTATTTCATGTAAACGATAGTAT-TTAGTACACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-AATTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTCAACTTTGATAAGATAGAC-AAAGTAAATTaattcacagt
gi|8 : AATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTGTCTAATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTAAAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGAaatacacag
gi|9 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATG
blockSeqs : GAT GAT T A AGAGAA GAGATG A . T TGAGATG G T G T T A A TC G . A T TAT AT A
blockSeqs : GAT . T . AGAGAA GAGATG . . G . G T T G G T . CA T . . C . G G
blockSeqs : . . T . . . . . G . A T T G G T . CT C . . C . C A
blockSeqs : . . T . . . . . G . A T T G G T . TT C . . C . C C
blockSeqs : . . T . . . . . T . G T A G G A . CT A . . A . G T
blockSeqs : . . A . . . . . G . A T T T T T . AG C . . C . G A
blockSeqs : . . A . . . . . T . C . T . T A . TC A . . A . C A
blockSeqs : . . . . . . . . T . G . . . . T . A C . . A .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . A . C A . . A .
blockSeqs : . . . . T . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ****** **
originalCons : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
finalCons : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
Alignments
lowQualScore : 111 1 333333 222222 1111111
lowQualScore : 444 777 0 4 888888 0 000000 3 55 0 4 0000000 1 6 0 2 9 2 1 4 77 0 1 0 4 4 1 0 666 0 66 1
lowQualScore : ... ... . . ...... . ...... . .. . . ....... . . . . . . . . .. . . . . . . . ... . .. .
lowQualScore : 000 000 5 4 333333 1 999999 6 00 1 6 8888888 2 6 1 0 4 5 4 0 22 5 6 5 0 0 6 5 444 8 44 0
consensus : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
Reference ( family-1878 ) : GATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCNTATACTTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTNAATT
gi|1 : TGAT---GAT---GTTGTTTATATTGATGATGATCAAGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTATCGATGGCATTGGTAG-TACTAGAGATGGAGATG------A-GACAGGATCTGTAATA--------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGTTGGAAAATTGGACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTACTATCTCATACTTCATTTCATTGTATTTCATGTGATCTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATCAATTT--TAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACTATTGAGGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAG-AAAGTTCATT
gi|10 : GATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTattacacag
gi|11 : cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgatgttGATG------A-AACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGTCAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATTATTGTAAGTATAATTGTGTGACTTTCTCATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTACAGTTAACTCCACAATC-ATTCAATACAATTTATACATTGATTTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTTCTTTAATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|12 : ATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGaatacactg
gi|13 : tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcTG------A-GACAGGATCT--GTGATATTGGAGATGGA-------------CAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAATTAAATAATTGTAGGTATAATTGTGT-ACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACAATAGTAT-TTCATATATTTGCCTGCATAATA-ATCAAAGAC-ACTTACATATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATAAA---TCAAACATTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGAGATAGAC-AAAGTGAATT
gi|14 : TGGTGATACAGGTAAGGAT------GAGAAAGTATCAGGTAATGGAAAGGATGATATCAATAAATATT------GAA-ATG------AAGATAAGATAG--GATATAT-GAAAATGGAGATTGAGATGAGACAGGATCTACACGACTATACATGAAAATATGACAGTAGATAAAAT-TCCTGAATAAAGCAAaataaacagt
gi|15 : aaTTGTATTTCATGTAAACTATAGTAT-TTCTTATACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-ACTTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAAC--TTCAAACGTTTTATATA
gi|15 : ATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGT-TTTtaaataataactatcatttacagat
gi|16 : ttgtatttcatgtaaactatagtatttcttatacttgcttgcataatcattcaatacacttgcatatttatctgtaaatgatagttattatttatatatGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGT
gi|17 : TTGGAGATG-AGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGA
gi|2 : acttgagGATATTGAT---GAT---TGTGATGATATTGATGATGAGTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTTG-TACT------GGAGATG------A-GACAGGATCT--GTGATATTAGAGATGGAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAGATAAGATGGTAGATGGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTG-TACTATCTCATACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGTATATTTTTATACTTGCCTGCCGAATC-ATTCAGTAC-ACTTGCATATGTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACATTTGAAGTTTTTTGTTAACTTTGATGAGATAAAC-AAAGTAAATT
gi|3 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGAAGAGATTGGAGAT------------------GGAACAACATGGATGAAGCAAATGATTGTAGATATAATTGTGTTACTATCTCATACTTTATGT-----TATTTCTTAAAAACTATAGTAT-AT-ATAGAATTGACTCCACAATC-ATTGAATAC-AATTGTAAATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATATATTAAAACGTTTGAAGTACTTTGTTTACTTTGATGTGATAAAG-TAAGTCAATT
gi|4 : gacatGATATTGATGATGAT---TGTGATGATATTGATGATGATTATGTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAATAATGGCATAGGTGG-TACT-----------TG------A-G-----------------TTGGAGAT-GAGAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGCGATGGAAATAAGATAGTAGTTGGAACAACCTGGCTAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTATTATTGTTTTTTACTTCATTTGATTGTATTTCATGTAAACTATAGAAT-ATCTTATACTTGCCTCCATAATC-AATTAATAC-ACTAGCAGATTTATCTGTAAATACTAGTTATGACTTATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTATTCTTCGATGAGATAAAATAAAGTTAATTaacacacaa
gi|5 : GATATTGAT---GATGATTATGATAATATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGATGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGaatacacag
gi|6 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataatgatattTGAT---GAT---TGTGATAACATTGATGATGATAATGTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACAATGGCATTGGTGG-TACT------GGAGATGGAGATGA-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------AGACATGATGGAAGAGATTGGAGATGGAA------------------CAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTAACTATCTCATACTTTATTT-----TAATTCATAAAAACTATAGTAT-TTC-TACAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTGTGATTCATATA---TTAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGATGTGATAGAG-AAAGTAAATT
gi|7 : ttgaTTGAGGAAGTATCAGGTAATGTTAACAATGGCATTGACGG-TACT------G-------------------GAT----------------ATGGAGAT-------GGACAGGATGGATTAAACTGGAGATGGTGATAAGATCTTAGATAGAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTACAATTGTGTTACTATCTCATACTTCATTTGATTTTATTTCATGTAAACGATAGTAT-TTAGTACACTTGCTTGCATAATC-ATTCAATAC-AATTGCATATTTATCTGTAAATGATAGTTATTATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTCAACTTTGATAAGATAGAC-AAAGTAAATTaattcacagt
gi|8 : AATATCGGGTAATGTTAACGATGGCATTGGTGG-TACTAGAGAAGGAGATG------A-GACAGGATCT--AATATATTGGAGATGGATAT-------GGACAGGATGGATGAGATTGGAGATGGAAATCAGATGG-AGATGAAACAACCTGGATAAAGCAAATGATTGTAGGTATAATTGTGTTACTGTCTAATACTTTATTTTATTTTATTTCATAAAAACTATAGTAT-TTTCTAAAATTGCCTCCACAATC-ATTCAATAC-AATTGTACATTTATCTGTAAATGATAGTTATGATTTATATA---TAAAACGTTTGAAGTATTTTGTTTACTTTGAaatacacag
gi|9 : TATTGAT---GAT---TGTGATAATATTGATGATAAT---GTTGATGAAATATCGGGTAATGTTAACGATGACATTGATG