lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222222222222222 1111111 1111111111 111111111 2222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 1111111111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111111111111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111111111111111111 1111111111 11 333333333333333333333333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111 111111 3333333333333333 1111111 22222222 55555555555555555555555555555 222222222222 1111111111 2222222222222 1
lowQualScore : 5555555555555555555 3 1 22 222 444 33333 444 1111111 555555555 11 0000000000 1 4444 222222222 0 2 333 4444 33333333 0000000000000 111 4444444 11 3333 111 555555 1 7777777 0 111 222 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33333333333 111 11 0 1111 111 22222 33333 4444444444444444 222222222 6666 11111 555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 0 1 1111 22222 5555555 0 77777777777777 333333 3333333 2222 33 2 444444444444444444444444 22 444444 111 111 111 11 8888888 333 22 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 33 111 0 666666666 00 111 333333333 00 33333 1 555555555 111 222222222 111 44444444444 44 6666666 8888888888888888888888888888 222 111 22 5555555555 1 33333333 44444444444 0 11 222222 22222 33333 3333333 44 333 66666666666 111 2222 7777777777 00 555 666666666666666666666666 1 111 2 111111 111 3 111 333333 22222 2222 111 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111 111 3333333333 0 3333 22 111 333333333 111 1111 9999999999999999 111 333333333 22222 444444444 33 1111 5555 1 0 111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 1111 444444 3333333333333 333 1 333333 111 333 5555555555 555555 2222222 111 3 1 222222 222 4444 2 55 1 3333333333333333 111 2222 5555 0 1 1111111 2 22 11111111 111 2 55555555 333 7777777777777777 1 9999 1 00000000000000000000000000000 1 1 777777777777 11 4444 33333 44444 2222222222 3 333333 222 222 2222 6666 222 99 22 3333333333333 333 6 666 5
lowQualScore : ................... . . .. ... ... ..... ... ....... ......... .. .......... . .... ......... . . ... .... ........ ............. ... ....... .. .... ... ...... . ....... . ... ... . ........................................................................................................................................................................... ........... ... .. . .... ... ..... ..... ................ ......... .... ..... ... ................................................................... . . . . .... ..... ....... . .............. ...... ....... .... .. . ........................ .. ...... ... ... ... .. ....... ... .. ... .................................................................................................................................................................................................................... . .. ... . ......... .. ... ......... .. ..... . ......... ... ......... ... ........... .. ....... ............................ ... ... .. .......... . ........ ........... . .. ...... ..... ..... ....... .. ... ........... ... .... .......... .. ... ........................ . ... . ...... ... . ... ...... ..... .... ... . ...................................................................................................................................................................................................................................... .............. ... .......... . .... .. ... ......... ... .... ................ ... ......... ..... ......... .. .... .... . . ................................................... . .... ...... ............. ... . ...... ... ... .......... ...... ....... ... . . ...... ... .... . .. . ................ ... .... .... . . ....... . .. ........ ... . ........ ... ................ . .... . ............................. . . ............ .. .... ..... ..... .......... . ...... ... ... .... .... ... .. .. ............. ... . ... .
lowQualScore : 7777777777777777777 1 5 00 444 777 33333 777 6666666 333333333 88 8888888888 2 7777 333333333 5 4 999 9999 88888888 4444444444444 888 1111111 44 4444 777 777777 0 3333333 9 666 666 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333333 333 00 7 4444 222 99999 44444 1111111111111111 999999999 4444 88888 888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 8 8 5 5555 66666 7777777 8 55555555555555 666666 2222222 6666 88 3 888888888888888888888888 44 111111 333 222 222 00 3333333 555 88 333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 77 222 7 444444444 99 888 222222222 99 44444 9 555555555 111 666666666 111 11111111111 88 9999999 9999999999999999999999999999 888 111 11 3333333333 3 88888888 22222222222 6 44 333333 22222 00000 9999999 66 333 55555555555 111 5555 6666666666 99 444 444444444444444444444444 4 888 6 999999 111 0 111 000000 66666 6666 888 7 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 00000000000000 444 7777777777 8 0000 22 444 888888888 444 7777 4444444444444444 333 111111111 88888 777777777 66 9999 4444 8 9 444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 8888 111111 7777777777777 444 0 111111 666 222 6666666666 000000 0000000 777 1 8 666666 888 5555 7 55 1 4444444444444444 999 8888 3333 5 2 0000000 6 88 66666666 999 2 11111111 444 2222222222222222 7 6666 2 44444444444444444444444444444 2 0 333333333333 77 2222 00000 22222 3333333333 5 555555 333 333 8888 6666 666 44 22 7777777777777 222 0 555 0
consensus : ATAGTAGTAT---A-AG------T---C-GT-A-AT--AG---T---AGTA-----A---TA---G---TAG---------TA--G---N------A-GTA----G---NA----GCAGTA---GT---A--------G-----TN------GTA---G------TAG--T--A-G---TAGT------A-GT------AG-T---A---GTAGTAGT--G-A----T----G-TC---AT--TAT-----TAN----CAG---TAGT---A---G----T--A---AT----AT----A-TAAT----TAT--T--GG----TGG------TA---G---TAGT-A-T------A-G-TAGTAG-----T-A--AG---AAA---N--AGTA--GC--T----GTAGCA---GT--A-GTA----G---TA-----GC----A----------G----TAGTA---------G---TA-----G--TAGTAGTTG-T---A----G---T----A--A-----A--GT--------T-A--T-A--------G--NA-GT-A-G-TAG---T---AGTAGT------A-GA--A---A------T------A-----G-TA----G-TAGCAGC---A------G---CT---GTN-GC-A------G---TAGTA---G---T--AGT---G---G---TA--GTAG---TA----NT-GAT-G-T------AT--TAT-----------TA------N----C--AGT---A---G---TA---G-T--AAT-A--N---TAG-----TAG-CANTG-----GT------AGA---AGTAGT-A-T---GA----TA-GTAACA-GN------AGTA---G---A---A--------------G---TAG---T---T--GA-AGCA-GT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GCA--G-----TA---G---------T---A-----------G-TAG------CAGTA-----------------GT-----T---GT---AG---T--A--N--N----A-GTA--------GTA---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---A---TAG-TAGTA---GA----A-----GT---AGTA----G---C------A--GT--AGC----T---G--------TT----G-TA---GTAGT------AG---TAGT---A------GTA-----G----TA---G-T--A--AT-G-T------N-----AT--------T-A--T---A-----A---T----------C--AGT---A----GT---AG----T---A----G-T-A-T--TA---T---------T-----AT--C------AG---T---A---G---TGG------T------AGTA------GT-A-T-G--G-----A-TAGTAGC----A---AG---NA-----AN--AGTAGT--T-----------GTA---G------C---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----GC----AG----T----A---G---------TAG----CA-----G--TAGC-A----AT--T-G-TAG-T-------A-N---A-----A-GTA--GAA---GT---A--G-N-A------GCA---GTA------G------------NA---GTA-G---N--A---GT---A---A------TA------G---C---A---GCAG-T------A---GTAG---TGGCGG-T-GT--C---GGC---GG---TA---GC---GGTA-G-CG----GCAG--T-A--G--CA---G-TA-G------TA---GT------------A---GTAGNAGCA-GTA--G-C---GN--T--------ATCAGCAGT-AGTAGTG--A--N----AGTA--GT---A-----GTA---G--TA-----GTAGTA------GT---A---GT----AGTT---GTA---GTN-GT--AG----ATGCT----GT---AGTAGTNGT--TGTAGTAGTTGCTGTA
Reference ( gi|3 ) : ATAGTAGTAT---A-AG------T---C-AT-A-AT--AG---T---AGTA-----A---TA---A---TAG---------TA--G---A------A-GTA----G---AA----GCAGCA---GC---A--------G-----CT------GTA---G------CAG--T--G-G---TAGT------A-GT------GG-T---A---GTAATAGT--G-A----T----G-TC---AT--TAT-----TAT----CAG---TAGT---A---G----T--A---AT----AT---TA-TAAT----CAT--T--GG----TGG------TA---G---TAGT-A-T--G---A-A-TAGTAG-----CCA-AAG---AAA---A--AGTA--GC--T----GTAGCA---GT--A-GTA----G---TA-----GC----A----------A----CAGTA---------G---CA-----G--CAGCAATTG-T---A----G---T----A-TA-----A--GT--------T-A--T-A--------A--AA-GT-A-G-TAA---T---AATAGC------A-GA--A---A------T------A-----A-TA----G-CAGCAGC---A------G---CT---GTT-GC-A------G---TAGTA---G---T--AGT---G---G---TA--GTAG---TA----CT-GAT-G-T--C---AT--TAT-----------TA------T----C--AGT---A---G---TA---G-T--AAT-A--T---TAT-----TAG-CATTG-----GT------GGA---AGTAGT-A-TG--GA----TA-GTAACA-GA------AGTA---A---A---A--------------G---TAG---T---T--GA-AGCA-AT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GCA--A-----CA---G---------T---A-----------G-CAG------CAGTA-----------------AT-----T---GT---AG---T--A--T--A----A-GTA--------ATA---A-------TA-GT--A------G-----T-----A---A---TAC-TAGTA---GA----A-----GT---AGTA----G---C------A--GC--AGC----T---G--------CT----G-TA---GCAGT------AG---TGGT---A------GTA-----G----TA---G-T--G--AT-G-T------C-----AT--------T-A--T---A-----A---T----------C--AGT---A----GT---AG----T---A----A-T-A-T--TA---T---------T-----AT--C------AG---T---G---G---TGG------T------AGTA------GT-A-T-G--G-----A-TAGTAGC---CA-A-AG---AA-----AA--AGTAGT--T-----------GTA---G------C---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----GC----AA----C----A---G---------TAG----CA-----G--CAGC-A----AT--T-G-TAG-T-------A-T---A-----A-GTA--AAA---AT---A--G-A-A------GCA---ATA------G------------AA---GTA-G---A--A---GT---A---A------TA------G---C---A---GCAG-T------A---GTAA---TGGCGG-T-GT--C---GGC---GG---TG---GC---GATA-G-CG----GCAG--T-G--A--CA---G-TA-A------TA---GT------------A---GCAGAAACA-GTA--A-C---GC--T--------ATCAGCAAT-AATAGTG--A--A----AGTA--GC---A-----GCA---G--CA-----ATAATA------GT---A---GT----AGTT---GTA---GTC-GT--AG----ATGCT----GT---AGTAGTTGT--TGTAGTAGTTACTTTAAAAAAATAAAATCACCCTTATCT
gi|5 : ATAGTAGTAG---A-A-------------AT-A-AT--AG---T---AATA-----A---TA---G---TAG---------TG--G---T------G-GTG----G---TATG--GTAGTACTTGT---AATATTATGG-----TG------GTG---G------TAG--T--A-G---TAGT------A-GT------TG-T---A---GTAGTAGT--G-A----T----G------ATGGTGT-----TAG----AAG---TAGTCGAG---G----T--G---GTGGTGAT---GA-TAAT----GATGGT--GG----TGG------TA---G---TGGT-A-G--T---A-G-TAATAGAGGTNNNN-NNN---NNN---T--AATA--GA--G----GTAGTA---GT--A-GTA----T---TG-----AT----A----------G----AAGTA---------G---CA-----G--TAGTAGTGG-T---G----G---T-------------A--GT--------T-A--T-A--------G--TA-TT-A-G-TAA---T---GGTTGT------G-GA--A---G------A------A-----G-TA----T-AAG-------------------T---GTT-G---------G---TGATT---G---T--GGT---G---T---TA--GT---------------------------------T-----------TA------G----T--AGT---A---G---TA---G-T--A---A--T---TG------TGG-CAGTG-----GT------AGA---AGTAGTAA-TG--G-----TA-GTGGTA-GC------AATA---G---A---A--------------G---TAGCGAT---T--G---GTG-ATTTAA-GT---------A------T---------A--GTA-----GAA--G-----TA---G---------T---A-----------G-TAT------AATTG-----------------GT-----T---GT---GG---T--A--G--T----A-GTA--------GTA---A-------TA-GT--A------G-----T-----A---T---TAT-TAGTA---GT----G-----GT---AGTG----G---C------A--GT--AGT----T---G--------TT----G-TG---GTGGC------GG---TGAT---A------GAA-----G----TA---C-T--A--AT-G-G------T-----GG--------T-G--T---T-----G---G----------C--TGT---G----GT---AG----T---A----G-T-A-G--TA---G---------T-----GG--T------GG---T---G---C---TGG------T------GTTA------GT-A-T-A--G-------TAGTA
gi|19 : ATAGTAGTATCATA-AG------TAG-C-ATCA-GT--AGATGT---AGTA-----A---TG---A---TAGAAGTGGGAGTA--G---C------A-GTA----G---TA----ACAGCA---GT---A--------G-----CCAAAGCAGTA---G------CAG--T--G-G---TAGTATCAGAA-GC------AG-T---A---TCAATAGT--G-A------------C---AG--TA------GATG---CAG---TAGT---A---ttagtgttggtggtggtggtggtgg
gi|17 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgtttagtattatcattatcattattattagaagtagacaaagtagcaACAGTAGT-T------G------T---C-AT-A-GT--AG---TTGTAGTA-----G---TA---AAG-TAG---------TA--G---T------A-ATA----G---AA----GTAGTA---GTTAAA--------G-----TT------GTG---G------TTG--T--G-G---TAGT------A-GT------AG-T---AT--GTA-TAAT--A-A----T----G------AT--TAT-----GAT----T-G---AAGT---A---G----T--A-----------------------------------------G------TA---G---TAGT-A-G--A---A-G-TAGTA------TTA-AAT---AAA---T--ATTG--GA--T----ATAATA---CT--A-GTA----G---TA-----a
gi|20 : gtagtagatgtagttgctgttgtttttgtagtagcagtatataatgtaatgacatgttagtaataaaaaaagatatattgttgtagtaATAGTAGT-------AG------T---A-GC-A-AT--AG---T---AGTA-----AAAGTG---A---CGG---------TGGTG---AT-----A-GTA----G---TA----GTAGAA---GA---A--------A-----TG------GTG---G------TGG--T--G-G---TGGT------A-GT------AG-T---A---GTAGTGGT--G-A----T----G-GT---AA--CAG-----TAG----AAG---TAGT---A---G----T--A---GT----A-----A-TAA-----CGG--T--GG----TGA------TATT-G---TAGT-A-G--T---A-G-TAGTAA-----CGG-TGGTACAAG---A--AGTA--GT--A----GTGG-A---AT--G-GTG----G---TG-----Gtatgtagtcatatcagtaat
gi|34 : ggtggtggtggtagaagtaatagtATTGTAGTAC---A-AG------TAGTT-AT-T-AT--AG---T---CATA-----A---GA---G---TAG---------TA--G---T------A-GTA----G---TA----GTAGTA---GA---A--------G-----TT------TTG---G------TTG--A--A-G---TAGT------A-GT------TG-T---
gi|1 : tagttgttgcagtagttgttactgttgaaataataatagttTAGTGGTGTTTGA-AA------T---A-GT-A-AT--AG---T---GGTATTAATA---TA---AA--TAG---------TA--G---T------A-GTA----G---AACAT-GGAGCA---GT---A--------G-----TT------TTA---G------TAA--T--A-T---TAGT------A-GT------TG-T---A---GTATTAGT--A-GCAATT----G-TC---GT--TGT------AC----AAG---TTTT---C---G----T--ATAAAT----AT---TT-T--T----TTT--T--AG-----AG------TA---G---TAGT-A----------A-CAGTA--------A-AAG---AAG---A--AGTA--GT--T----ATAACA---------------------------GC----A----------G----CAGTA---------G---TA-----G--TAGTAAT-------A----T---T----A-T-------------------T-A--T-----------------T-A-G-TAG---T---AATT-------------------------T------A-----A-TA----G-TAGTAGA---A------G---TT---GTT-GT-T------GATATGGTT---G---T--TGT---T---G---TA--ATAG---TA----GTAGAA-G-T--G---GTGGTAG-----------TA------A----N--NNN---N---N---NN---N-N--NNN-N--N---NNN-----NNN-NNNNN-----NN------NNN---NNNNNN-N-NN--NN----NN-NNNNNN-NN------NNNN---N---N---N--------------N---NNN---N---N--NN-NNNN-NN---N-NN---------N--N---N---------N--NNN-----NNN--N-----NN---N---------N---N-----------N-NNN------NAGTA-----------------AT-----G---GT---AA---T--G--T---------------------TG---A-------TA-GT--G------T-----T-----A---A---TCG-TAGCA---TA----A-----GT---AGTA----G-----------------AG-------------------------------GAAGT------AG---TGGT---A------GTA-----G----TA---G-T------T-G-T------------AG--------T-A--G---A-----A---G----------C--ATA---A----GC---AG--------A----A-T-T-T--T----T---------TGC---AT--T------AG---T---A---G---TTG------C------AGTA------GT-A-T-G--tg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagTGGTAGTAG---A-AG------TAGGT-GT-A-GT--AG---T---TGTG-----T---TA---G---AAG---------TA--G---T------T-GGA----G---AA----GTAGTA---AC---A--------G-----TA------GTG---G------TGG--T--G-G---TAGT------A-GT------AG-T---G---ATGATGAT--G-G----T----G-GA---GA--TATAGTGGTAG----TAG---TAGA---A---G----T--A---GT----A-----A-TAGT-----AG--T--AG----TGG------TG---G---TGGT----------A-A-TAGTCG-----T------------------AGTA--AT--T----GTGGCG---GT--G-GTG----G---TA-----GT----A----------G----TAGTA---------GTGTTG-----G--TTGCGGTTG-T---A----G---TGGTGA-TG-----ATGAT--------T-A--N-N--------N--NN-NN-N-N-NNN---N---NNNNNN------N-NN--N---N------N------N-----N-NN----N-NNNNNNN---N------N---NN---NNN-NN-N------N---NNNNN---N---N--GGT---G---G---TG--GTGG---TG----CA-GGT-G--------GT--GAT---------------------------AGT---A---G---TA---G-T--GGG-A--G---TGG-----TGG-TGGTG-----GT------GGA---AATA----------A----TA-GTAGTA-GA------AG---------A---A--------------G---TAG---T-------A-AAT--AT---A-GT---------A--G---T---------A--GCA-----GTA--G-----AA---G---------T---G-----------G-TTG------TGGTG-----------------GG-----T---GT---GG---T--A--T--tgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|19 : tgatggTATTATTAG---A-AG------T---AGAC-A-A---AG---T---AGCA-----A---TA---G---TAG---------TA--TCATA------A-GTA----G----------CATCA---GT---A--------G-----AT------GTA---G------TAA--T--G-A---TAGA------A-GT------GG-G---A---GTAGCAGT--------------------------AG-----TAA----CAG---CAGT---A---G----C--C---A--------------AAG----CAG--T--AG----CAG------TG---G---TAGT-A-TCAG---A-AGCAGTAT-----CAA-TAG---TGA---C--AGTA--GA--T----G---CA---GT--A-GTA----ta
gi|15 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgtttagtattatcattatcatTAGTAGTAT---T-AG------T------T-G-A---AG---T---AGTA-----A---T----------G---------T--------------A-GCA----G---CA----GTAGTA---TT---A--------G-----TT------GTA---G------TAG--T--A-A---T-GT------A-GT------AG-C---A---GTAATAGTA-G-T----T----G-TT---GT--TGTAA---GAT----CAG---CAGT---A---G--------------------------------------T--GG----TGGCGATTCTA---G---TAGT-A-G--A---A-G-TAGTA--------A-TGG---TAA---A--AGTA--GA--T----GGAGTA---GT--A-GTA----T---TA-----GT----A----------G----TGGTa
gi|13 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgatagtatttgttatattagagttgttgttgtactagtagaggTGGTAGCGT---T-AG------T---T-GT-A-AT--GG-------A--A-----A---TG---G---TAG---------TA--G---C------A-GTG----G---AA-----CA-CA---TA---A--------GGGAATTT------GTA---G------TAG--T--ACA---TA-T------A-GT------GG-T---A---GTGATAGT--G-G----------------------------TAG----CAG---TAGT---T---G----T--A---ATGGAAAT---GG-AAGTGGGACACG-TAAGGGAATTGG------TA---G---TAGT-A-T--ATACA-G-TGGTAG-----TGA-AAG---------G--GGTA--GC--G----GT---A---GT--T-GTA----A---TG-----GA----A----------A----TGGTA---------G---TG-----G--------TTG-T---GAAACA---T----G-TA-----A--GG--------G-AATT-G--------G--TA-GT-A-GTTAA---TGC-AGTGGT------A-GT--G---A------T------A-----A-TG----G-TAGCGGT---A------G---TT---GT
gi|25 : aacaataacatgattagtaataatagagatgtactagtagttgtagtgaaagTAGTTGTAT---T-AG------T---A-GT-A-CT--AG---T---AACA-----G---TA---A---TAT---------TA--G---T------A-GTA----G---TA----GCAGTT---AA---A--------G-----TA------ATA---G------TGG--T--G-A---TGGT------G-GT------GG-T---A---GTATTAGaatg
gi|23 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggtggtggtggtggtaataaaattagtagtggtgggcgtggtagtagaagtagTAGTAGTAG---G-AG------T---A-GT-AGACGGAG---T---AGTG-----ACGGTG---A---TAG---------CA--G---AAAATGGA-GTA----A---AA----GCAGAA---AC---A--------C-----C---------A---G------CAG--C--A-G---TAGT------A-GT------AA-T---A---GTGAAAGT--A-A----A----G-GT---AT--AAG-----TAT----TAG---TAcagaag
gi|39 : tgacggtattgtaattatttgaaatagtatgattgtggcagtagtagTAATAGTAT---G-AGAGGTGGT---T-GT-G-GT--AG---T---AGTA-----G---TA---G---TAG---------TA--G---A------G-ATG----G---TG----GAGGTA---GT---A--------G-----TT------GTT---G------TGG--T--G-G---TTGT------C-GT------AG-C---A---GTaacatagcataatgaaggtg
gi|28 : aatagtggAGTATCAT---C-AG----------C-AT-A-AC--AT---T---AGCA-----A---CA---T---TAG---------CA--G---A------A-GAA----G---CA----ACAACA---TC---A--------G-----CA------GTA---G------CAG--T--A-G---CTGC------A-AC------AG-T---A---GTAATAG
gi|21 : agcatcagcaatcgcaatcgcaatcatagtcacagtcgtagcagtagttgctgtagaAGCAGTGT---A---------T---C-ATTA-AT--AG---C---AACA-----G---TATAGA---TAG---------TT--G---T------A-GCA----G---AA----GTAGTA---GT---A--------G-----AA------ATA---A------TAC--T--A-C---TACT------A-GT------AG-T---A---GTAATAGT--A-A----T----A------AT--AAT-------------AA---TAAC---A---A----T--A---AT----AT---AA-CAA-----CAT-----------TAG------TA---G---AAGT-A-T--T---A-A-TATTAaagt
gi|40 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaAGTAGTATTA-ATAG------T---T-GT-T-GT--GG---T---ATTA-----G---TA---A---TAG---------TA--G---G------A-GT----------T----GTTACA---GT---A--------G-----TT------GTA---GTTGACACAG--T--A-G---TTGT------T-GT------AG-T---A---GTAGTAaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|42 : gtaaaAGTAGTAG---T-AG------T---T-GT-A-GT--AG---TATCAGTA-----G---CA---A---TAG---------TA--C---A------ATGTA----GCAAAA----TCAGTA---GC---A--------G-----
gi|27 : aagaagtacttcgagtagcGTTGTAT---A-AG------T--------A-AT--AG---T---AGTG-----A----G---G---TAG---------TA--G---T------T-GTTTCT-G---AA----TGAGTA---GC---A--------G-----TA------GTA---G------TAGATT--G-G---TAAT------T-GT------GG-T---T---GTA-------------------G-CC---GT---AG-----TAT----AAG---TAGA---C---G----T--G---AT----GT---AG-TA------TAT--T--AA----TAG------TA---G---TAGT-A-ta
gi|32 : tattgttT---A-AG------T---T-AT-A-AA--AG---C---AGTG-----G---TA---------G---------TA--G---C------A-GTA----G---TA----CCAGTA---GT---A--------A-----CT------GTA---G------CAA--T--A-T---CAGT------A-GC------AA-T---A---GCAATACC--G-G----T----G-------------------------CTG---CAAC---A---G----T--A---AT----AT---CA-TTAT----TAT--T--gtaatgatgcattacaagcagt
gi|45 : tatgcagtatgagttgattttact---C-AT-G-AA--AG---T---AGTA-----A---TA---G---TAG---------TA--G---A------A-ATA----G---TA----GTAGAA---AC---A----------------------GTA---G------CAG--T--G-A---TAGA------A-GT------GGAT---A---AGAATAat
gi|31 : -AT-A-AT--AA-------AATA-----A---TA-------TAA---------TA--T---A------A--TA----A---AA----TCAATACAGGC---A--------C-----CA------GTA---A------CAG--T--A-G---TAGA------A-GC------AG-C---A---GCAGAAGT--A-A----T----A-AT---AG--TAA-----TAG----CAGACGTAGT---A---G----T--A---AT----A
gi|34 : gaaattatta-AT-A-AT--AA---T---AGTT-----A---TT---G---TAG---------TA--C---A------A-GTA----G---------TTATTA----T---A--------G-----TC------ATA---A------GAG--T--A-G---TAGT------A-GT------AG-T---A---GTAGTAG-----A----A----G-TT---TT--GGT-----TG-----AAG---TAGT---A---G----T--gacatagacgtagatgta
gi|25 : tagttgttgcagtagttgttactgttgaaT-G-AT--GG---T---GGTG-----G---TG---G---TGG---------TA--A-------------TA----A---AA----TTAGTA---GT---G--------G------T------G-G---G------C-G--T--G-G---TAGT------A-GA------AG-T---A---GTAGT--T--G------T----A-TT---AG--TAG-----TAC----TAG---TAAC---A---G----T--A---AT----AT---TA-------------------------G------TA---G---TAG---------------TAGCAG-----TTA-AAG---TAA---T--AGTG--GT--G----ATGGTG---GT--G-GTA----G---TA-----TT----A----------G----CAGAA---------G---tgttg
gi|35 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggT-A-AA--AG---T---A-TA-----A---T--------TAG---------TA--G---A------A-ATA----G---AAAAAAGAAGTA---GT---G--------G-----AT------ATA---G------CAA--T--A-G---TAGC------A-GC------AG-T---A---TT----GT---------T----A-TT---AT--TAT-----TAT----AAC---TAGT---A---G----A--A---AT----A
gi|9 : aaagtagaagtagttaatattattat-A-AT--AA---T----GTC-----A---TG---A---TAA---------T---G---A---------T-----G---AT----GTAGCA---GT---A--------G--------------TA---G------TAG--T--A-G---TAGT------A-GT------AC-T---A---GTAAAAGT---------T------TC---A---GA-------AG----CAG---CAGC---A---G----T--AT--AC----AT---AA-TAGT----TAT--T---G----TAG------TA---G---TAGT-A-C--T---G-G-TTGTAG-----CTG-CAG---CAA--------TA--TG--T----GTAGCA---GT--A-TTA----G---AA-----GC----A----------
gi|39 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaa-A-AT--AG---T---GGTA-----A---TA---G---TAT---------GA--G---A------G-GTG----G---TT----GTGGTA---GT---A--------G-----TA------GTA---G------TAG--T--A-GAGATGGT------G-GA------GG-T---A---GTAGT--T--G-T----T----G-TG---GT--GGT-----TGT----C-G---TAGC---A---G----T--
gi|7 : T--AG---T---AGTA-----A---AA---G---GAG---------TA--A---A------A-GTA----G---CA----GTAGAA---GA---A--------G--------------TA---G------AAA--TAAG-A---AAAT------A-GTTTTTGCAG-C---A---GTAAAAGT--A-------------TC---AC--T-------TAT-----AG---CAGC---A---G----A--A---GC----GT---AA-TAAG----AAG--T--AC----TGA------CA---G---AAGC-A--------A-A-----AG-----TTG-AAG---AAG---C--AGCA--GC--A----GTCGCAAACGT--T-GTT----G---TA-----GC----A----------A----CATCA---------G---AA-----G--TAGAAAC------------------------------A--GT----------------------------A-GT-A-G-TAG---C---AGTAGC------A-GA--A---A------A------A-----G-TG----A-TAGCACC---A------G---CTTAAGTA-GC-A------G---TCGTA---A---T--AGT---A---G---TA--ACAG----AGAAGCA-GAA-G-TAGC---AG--TAG-----------CA------G----C--AGC---A---GACACA---G-T--AAA-A--G---TAG-----TAG-CAGAA-----AT------AGA---AGTAGT-A-T---------TA-GCAGCA-GA--------TA---A---A------------------G---TAG---T---T--GT-AGCA-TC---A-GCTGAAGAAGAA--G---C---------A--GTA-----GTA--G-----CA---G---------C---A-----------G-CAG------CAGTA-----------------GT-----A---GT---AG---T--A--G--C----A-GCA--------GAA---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---A---TCG-CAGCAGCTGA----A-----AT---AGTA----G---C------A--GC--AGA----A---A--------AC----G-TA---GTTGC------AA---TGGT---A------
gi|25 : T--GG---T---GGTA-----A---TA---AAATTAG---------TA--G---T------G-GTG----G---GC----GTGGTA---GT---A--------G-----AA------GTA---G------TAG--T--T-G---TATT------A-GT------AG-T---ACTAGTAACAGT--A-A----T----------------AT-----TAG----TAG---TAGT---A---GCAGTT--A---AA----GT---AA-TAGT----GGTGAT--GG----TGG------TG---G---TAGT-A-T----------TAGCAG-----acatttattactgtagaaataacagcaagggaagta
gi|43 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggtggtggG---T---GGTG-----G---TG---G---TAG---------TA--G---A------A-GTA----G---TA----GCAGTA---GT---A--------G-----aag
gi|31 : ggtggtggtggtggttatggtagttgtggttacggtggttacg---AGTA-----A---CA---G---TAG---------TA--G---A------A-GCA----G---CA----GCAGAA---GT---A--------A-----TA------ATA---G------TAA--T--A-G---CAGA------C-GT------AG-T---A---GTAATAGta
gi|42 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccA--G---A------A-GTACTTCG---A-----GTAGCA---GT---A--------G--------------TA---G------TAG--T--T-G---TAGT------A-GTATC---AG-T---A---GCAATAGTACA-A----T----G-T----AG--CAA-----AAT----CAG---TAGC---A---G----T--A---acatagacgtagatgta
gi|2 : a------A-GTA----G---AA----GCATTA---GCA--A--------G-----TTA-----GTA---A------TTG--T--G-G---TAGT------ATGT------GT-T-------GTA--AGT--GTA----C----G-T----AT--T----------------G---TAGT---A---G-------A---A-----------G-TAAT----CTT--T----------G------TA---G---TAGC-A-G--A---A-A-TAGT
gi|41 : ttgtA----G---CA----GCGGCA---GC---G--------G-----CA------GTA---G------CAG--T--A-G---TAGT------A-GT------AG-C---G---GCAATATC--G-A----TG---G-TA---AA--TAT-----AATGATGCAG---TAGT---A---G----T--G---AA----AT---AA-TAtgtagtaaaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|28 : cA----GCATCA---GC---A--------A-----TC------GCAATCG------CAA--T--C-A---TAGTCAC---A-GT------CG-T---A---GCAGTAGTT-G-C----T----G-TAGA-AG--TAT-----CAT----CAG---CA--------------T--A---AC----AT---TA-------------------------------------G---CAAC-A-T-------------TAG-----C----AG---AAG---A--AGCA--AC---------AACA---TC--A-GCA----G---TA-----GC----A-----------------GTA---------G---CT-----G--CAACAGTAG-T---A----A---T----A-GA-----A--GT--------
gi|46 : AGTA---GC---A--------A-----TT------GTA---G------TTG--T--A-G---TAGTGC----A-GT------GG-T---A---GTAATAG
gi|41 : gttgtaacatCA---GC---A--------G-----C---------G---G------CAG--C--G-G---CAGT------A-GC------AG-T---A---GTAGTAGT--A-G----C----G-GC---A----A------TAT----CGA---TGGT---A-----------A---AT----AT---AA-TGAT-------------G----CAG------TA---G---TAGT-G----A---A-A-TAATAcagtag
gi|36 : ---A--------G-----TT------G-A---G------TAT--T--A-C---TAGT------A-GT------AG-T---A---GTAATAGT--A-A----A----A------GT--TGT-------------AG---TAGT---A---T----T--A---AT----A-----A-TAAC----CCT--T--AG----TAA------TA---G---TAAC-ACT--T---A-G-TAGTAG---------AAG---AAG---A--TGT
gi|27 : aaaaa--------G-----TT------GTA---T------AAG--T--A-A---TAGT------A-GT------GA-----G---GTAGTAGT--T-G----T----T-TCTGAAT--GAG-----TAG----CAG---TAGT---A---G----T--A---G-----AT---TGGTAAT----TGT-----GG----TTG------TA---GCCGTAGT-A-T--A---A-G-TAGACG-----T-----G---ATG---T--AGTA--TA--T-----TAATA---GT--A-GTA----G---TA-----GT----A----------A----tataaca
gi|9 : tattgttT------GTA---G------CAG--T--A-G---TAGT------A-GT------AG-T---A---GTAGTACT--A-G----TAAAAG-TT----T--CAG-----AAG----CAG---CAGC---A---G----T--AT--AC----AT---AA-TAGT----TAT--T--G-----TAG------TA---G---TAGT-A-C----------TGGTTG--------------------------TA--GC--T----GCAGCA---AT--ATGT-----G---TA-----GC----A----------G----TATTA---------G---AA-----G--CAtgatgcattacaagcagt
gi|42 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataatgatga------GTA---G------CAG--T--A-G---TAGT------A-GT------TG-T---A---GTAGTATC--A-G----T----A-GC---AA--TAG-----TA-----CAA---T-GT---A---G----C--A---A--------------AAT----CA-------G----TAG------CA---G---TA
gi|25 : aagaagtacttcgaA---G------AAA--T--A-A---TGGT------T-GT------GG-T---G---GTGATGAT--G-A----T----GGTG---AT--GGT-----GGT-----GG---TGGT---G---G----T--A---AT----A--------AA------AT--T--AG----TAG------TG---G---TGG-------G---C-G-TGGTAG-----T----AG---AAG---T--AGTA--GT--T----GTATTA---GT--A-GTA----C---TA-----GT----A----------A----CAGTAATATTAGTAG---TA-----G--TAGCAGTTA-A---A----G---T----AATA-----GTGGT--------G-A--T-G--------G--TG-GT-G-G-TAG---T---ATTAGC------A-GA--A---
gi|20 : --G-G---TGGT------G-GT------GG-TAGAA---GTAATAGT----A----T----A-GT---AG--TAG-----TAG----CAA---TAGT---A---G----T--A---AA----A-----G-TGA-----CGG--T--GG----TGA------TA---G---TAG---------------TAGTAG---------AAG---AAA---T--GGTG--GTGGTGGTGGTAGTA---GT--A-GTA----G---TG-----GT----G----------A----TGGTA---------A---CA-----G--TAGAAGTAG-T---A----G---T-------------A--GT--------A-A--T-A--------A--CG-GT-G-G-TGA---T----ATTGT------A-G--------------T------A-----G-TA----G-TAGTAAC---G------G----T---GGT-ACAA------G---AAGTA---G---T--AGT---G---GAA-TG--GTGG---Tg
gi|17 : -G---TAGT------A-GA------TG-T---A---GT-----T--G-C----T----G-TT---GT--TTT-----TGT-----AG---TAGC---A---G----T--A--------------TA-TAAT--------------------G------TA---A---TGAC-A-T--G---T---TAGTAA-----TAA-AAA---AAG---A--TATATTGT--T----GTAGTA---AC--A-GTA----G---TT-----GT----C----------A----TAGTA---------G-------------------TTG-T---A----G---T----A-----------GT------------------------A--AA-GT-A-G-TAG---T---AATAG----------A--A---G------T------A-----G-TA----G-T--TAA----A------G---TT---GTG-GT-T------G---TGGTA---G---T--AGT---A---G---TAT-GTA----TA----AT-AAT-G--------AT--TAT-----------GA------T----TGAAGT---A---G---TA---G-T--AGT-A----------------------------GT------AGA---AGTAGT-A-T-------------TAA------------ATA---A---A----------------------TAT---T---G--GA-TATA-AT---A-CT---------A--G---T---------A--GTA-----TAT--G-----TA---G---------T---C-----------A-TAT------CAGTA-----------------AT-----gg
gi|34 : T------A-GT------TG-T---T---GCAGTAGT---------T----G-TT---AC--TGT-----T--------------GA---A---A----T--A---AT----A-----A-TAGT----TAT--T--G-----TAG------TACAAG---TAGTTA-T----------TA-TAG-----TCATAAG---A---------GTA--GT--A----GTAGTA---GT--A-GTA----G---TA-----G-----A----------AGTTTTGGTT---------G---AA-----G--TAGTAGTTG-T---
gi|19 : T------GT-T---A---CTATTATT--G-A----T-----------AT--TAT-----CAT----CAG---TGTT---AT--G----TTTA---GT----AT---TA-TCAT----TAT--C------------------A---T---TATT-A-T----------TAGAAG-----T----AG---ACA---A--AGT--------------AGCA---AT--A-GTA----G---TA-----TC----A----------T----AAGTA---------G---CA-----T--CAGTAGATG-T---A----G---T-------------A--AT--------G-A--T-A--------G--AA-GT-G-G-------G---AGTAGC------A-GT--A---G------T------A-----A-CA----G-CAGTAGCCAAA------G---CA---GTA-GC-A------G---TGGTA---G---T--ATC---A---G---AA--GCAG---TA-------------T--C---AA--TAG-----------TG------A----C--AGT---AGATG---CA---G-T--AGT-A--tg
gi|15 : gtataatcactattataatcaatatattactgt---AT--TATCTA--TAC----CGA---TAGT---ATTTG----T--T---AT----AT---TA-GAGT----TGT--T--GT----TG-------TA---C---TAGT-A-G--A---G-G-TAGTAG-----T------------------ATTA--GT--T----GAAGTA---GT--A-AT-----G---TA-----GC----A----------G----CAGTA---------G---TA-----T--TAG---TTG-T---A----G---T----AGTA-----A------------T-G--T-A--------G--TA-GC-A-G-TAA---T---AGTAGT------T-GT--T---G------TTGT---A-----A-GA----T-CAGCAGT---A------G---TG---GTG-GC-G------A---TTCTA---G---T--AGT---A---G---AA--GTAG---TA----AT-GGT-A-A--A---AG--TA------------GA------T--------GG---A---G---TA---G-T--AGT-A--T---TAG-----TAG----TG-----GT------a
gi|36 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattact---AT--TAC-----TAG----TAG---TAGT---A---G----T--A---AT----AG---TA-AAA--------------G----TTG------TA---G---TAGT-A-T--T---A-A-TAATAA-----CCCTTAG---TAA---T--AGTA--ACA-C----TTAGTA---GT--A-GAA----G---AA-----G
gi|35 : aaaaaagttgagtAG---TAGT------------T--A---AT----AT---TA-TTAT---------------------------TA---A---AAGT-A-T--A---A-T-TAGTAG-----AAA-TAG---AAA---A--A----------------AGAA---GT--A-GTG----GATATA-----GC----A----------A----TAGTA---------G---CA-----G--CAGTA-TTG-T------------T----A-TT-----A---T--------T-A--T-----------------T-A---TAA---C-----TAGT------A-GA--A---A------T------A-----atgttataaca
gi|25 : aaagtagaG---TGGT---G---G----T--G---ATG---AT---GA-TGGT----GAT-----GG----TGG------TG---G---TGGT-G--------------GTA-----------AT---AAA---ATTAGTA--GT--G----GTGGGC---GT--G-GTA----G---TA-----GA----A----------G----TAGTA---------G-------------------TTG-T---A--------------------------T--------T-A-------------------GT-A-G-TAC---T---AGTAAC------A-GT--A---A------T------A-----T-TA----G-TAGTAGT---A------G---CA---GTT-AA-A------G---TAATA---G---T--GGT---G---A---TG--GTGG---T
gi|40 : agaaataatggttG---TAAA---A---G----T--A---GT----AT---TAATAGT----TGT--T--G-----TGG------TA---T---TAGT-A----------A-TAGTAG---------------------G--AGTT--GT--T----ACAGTA---GT--T-GTA----G---TT-----GA----C----------A----CAGTA---------G---TT-----G--TTGTAGTAG-T---A----G---T----A-ggtagtattagcagaag
gi|21 : ---TAGT---ACATG----T--A---AA----ATCTATA-TAAA----TAT--T--CA----AAG------CA---G---T-GT-A-T--C---A-T-TAATAG-----CAA-CAG---TAT---A--GATA--GT--T----GTAGCA---GA--A-GTA----G---TA-----GT----A----------G----AAATA---------A---TA-----C--TACTACTAG-T---A----G---T----A-----------------------G--T-A--------A--TA-GT-A-A-TAA---T---AATAAT------A-AC--A---A------T------A-----A-TA------TAACAAC---A------T---TA---GTA-GA-A------G---TATTA---A---T--ATTAAAG---T---TG--GAAA---TA----CT-GAT-T-T--G---AT--TAG-----------TAAACGTGT----C--AGT---A---
gi|23 : T----AT---TG-TAAT----TAT--T--------TGA-------A---A---TAGT-A-T--G---A-T-T------------------------------GTG--GC---------AGTA---GT--A-GTA----G---TA-----GT----A----------G----GAGTA---------G---TA-----G--ACGGA---G-T---A----G---T----G-AC-----G--GT--------G-A--T-AGCAG----A--AA-AT-G-G--AG---T---AAAAGC------A-GA--A---A-----------------------------CACCAGC---A------G---CA---GT-----A------G---TAGTA---A---T--AGT---G---A---AA--GTA
gi|31 : tgacggAAT----TAT--T--AA----TAA------TA---AAA-TAAT-A-T--A---ATA-TAATA--------A-AAT---CAATACA--GGCA--CC--A----GTAACA---GT--A-GTA----G---AA-----GC----A----------G----CAGCA---------G---AA-----G--TAATAATAG-T---A----A---T----A-----------------------G--C-A--------G--AC-GT-A-G-TAG---T---AATAGaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|45 : ga--T--AG----TAA------TA---G---TAGT-A-G--A---A-A-TAGTAG-----T----AG---AAA---C--AGTA--GC--A----GTGATA---GA--A-GTG----G---acatagacgtagatgta
gi|39 : catgaaag--T--AG----TGG------TA---A---TAGT-A-T--G---A-G----------------------------A--GGTG--GT--T----GTGGTA---GT--A-GTA----G---TA-----GT----AGTAGAG----A----TGGTG---------G---AG-----G--TAGTAGTTG-T---T----G---T----ataagaata
gi|10 : aaG----TAG------TA---G---TTGT-G-T--T---A-G-AAGTAG-----TTG-GAG---AAG---T--AGTA--AC--A----GTAGTG---GT--G-GTG----G---TA-----GT----A-----------------GTA---------G---TG-----A--TGATGATGG-T---G----GAGAT----A-TAGTGGTA--GT--------A-G--T-A--------G--AA-GT-A-G-TAA---T---AGTAGT------A-GT--G---G------TGGTGGTA-----A-TA----G-TCGTAGT---A------A---TT---GTG-GC-G------G---TGGTG---G---T--AGT---A---G---TA--GTAG---TG----TT-G---G-T--T---GC--GGT-----------TG------T-------AGT---G---G---TG---A-T--GATGA--T---TAN-----NNN-NNNNN-----NN------NNN---NNNNNN-N-NN--NN----NN-NNNNNN-NN------NNNN---N---N---NNNNNNNNNNNNNNGG---TGG---TGG-T--GG-TGCA------G-GT---------G--G---T---------G--ATA-----GTA--G-----TA---G---------T---G-----------G-GAG------TGGTG-----------------GT-----G---GT---GG---T--G--G--A----A-ATA--------ATA---G-------TA-GT--A------G-----A-----A---G---AAG-TAGTA---AA----T-----AT---AGTA----G---T------A--GC--A-------------------------G-TA---GAAGT------GG---TTGT---G------GTG-----G---------G-T--G---T-G-G------T-----AT--------T-A--ggtggttgtcgtagcagt
gi|32 : tgatggtggtagtagaagtaggtG----TGG------TA---G---TAGC-A----------G-TAGTA------CCA-GT-------------AGTA--AC--T----GTAGCA---AT--A-TCA----G---TA-----GC----A----------A----TAGCA---------A---TACCGGTG--CTGCAACAG-T---A----A---T----A-TC-----A---T--------T-A--T-
gi|42 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaagcaG----TAG------CA---G---TAGT-A-G--T---A-G-TTGTAG-----T------------------AGTA--TC--A----GTAGCA---AT--A-GTACAATG---TA-----GC----A----------AAAT-CAGTA---------G---CA-----G--TAtattat
gi|7 : aagaagtacttcgaG------TA---G---CAGT-A-G--A---A-G-AAGTAG-----AAATAAG---AAA---AT-AGTT--TT--T----GCAGCA---GT--A-AAA----G---TA-----TC----A----------C----TTATA---------G---CA-----G--CAG-AAGCG-T---A-------------A-TA-----A--G----------------------------AA-GT-A-C-TGA---C---AGAAGC------A-AA--A---G------T------T-----G-AA----G-AAGCAGC---A------G---CA---GTC-GC-AAACGTTG---TTGTA---G---C--AAC---A---T---CA--GAAG---TA----GA-AAC-A-G--T---AG--TAG-----------TA------G----C--AGT---A---G---CA---G-A--AAA-A--G---TGA-----TAG-CACCA-----GC------TTA---AGTAGC-A------G----TC-GTAATA-GT------AGTA---A---C---A--------------G----AG-----------A-AGCA-GA---A-GT---------A--G---C---------A--GTA-----GCA--G-----CA---G---------C---A-----------GACA-------CAGTA-----------------AA-----A---GT---AG---T--A--G--C----A-GAA--------ATA---G-------AA-GT--A------G-----T-----A---T---TAG-CAGCA---GATAA-A-----GT---AGTT----G---T------A--GC--ATC----A---G--------CT----G-AA---GAAGA------AG---C------A------GTA-----G----TA---G-C------------------------------------------------A---G----------C--AGC---A----GC---AG----T---A----G-T-A-G--TA---G---------T-----AG--C------AG---C---A---G---AAG------T------AGTA------GT-A------------A-TCGCAGC--------AG---CT-----GA--AATAGT--A-----------GCA---G------C---A-G----A--AAACGT---A-----G---TT----GC----AA----T----G---G---------TAA----C-------------------AT--T---TAT-T-------ACT-----------GTA--GAA---AT---A--A-C-A------GCA---AGG------G------------AA---GTA-
gi|27 : tagtagtaaaaggagtaaaaG------TT---G---TTGT-A-T--A---A-G-TAATAG-----T-A-GTG---AGG---T--AGTA--GT--T----GTTTCT---GA--A-TGA----G---TA-----GC----A----------G----TAGTA---------G---TA-----GATTGGTAATTG-T--------------------------G--GT--------T-G--T-A--------G--CC-GT-A-G-T-A---T---A--AGT------A-GA--C---G------T------G-----A-T-----G-TAGTA---------------------------------------TATTA---A---T--AGT---A---G---TA--GTAG---TA----AT-GAT-G----C---AT--TAC-----------AA------G----C--AGT---
gi|13 : tattA---A---TAAC-A-T--G---A-T-TAGTAA-----TAA-TAG---AGA----------------T----GTACTA---GT--A-GTT----G---TA-----GT----G----------A----AAGTG---------G---TA-----G--CGTTAGTTG-T---A-------------------------------------A--T-G--------G--AA-AT-G-G-TAG---T---AGCAGT------G-GA--ACACA------T------A-----A-GG----G-AA--------------------T----TT-GT-A------G---TAGTACATA---T--AGT---G---G---TA--GTGA---TA----GT-GGT-----------------------------A------G----C--AGT---A---G---TT---G-T--AAT-G----------------G-AA--------AT------GGA---AGTGG--------GA----CACGTAAGG-GA------ATTG--------------------------G---TAG---T---------AGTATAT---A--C---------A--G---T---------G--GTA-----GTG--A-----AA---G---------G---G-----------G-TAG------CGGTA-----------------GT-----T---GT---AA---T--G--G--A----A-ATG--------GTA---G-------TG-GT--T------G-----T-----G---A---AAC-ATGTAAGGGA----ATTG--GT---AGTA----GT--T------AATGC--AG-----T---G--------------G-TA---GTGAT------AA---TGGT---A------GCG-----G----TA---G-T------T-G-T------A-----AT--------
gi|45 : aac-A-T--G---A-A--AGTAG-----T----------AA---T--AGTA--G---------TAGAA---AT--A-GTA----G---TA-----GA----A----------A----CAGTA---------G---CA-----G--g
gi|46 : c-A-TAGTAG-----C----------AA---T--TGTA--GT--T----GTAGTA---GTGCA-GTG----G---TA-----GT----A----------A----TAGCA---------G---TA-----G--tgatagaagtggataagaata
gi|47 : gttgtaacAGTAG-----TC----G---CAA---C--AGTA--G---------TCCCA---GT--A-GTA----G---TA-----GC----A----------G----CAATA---------G---CA-----G--TACCA
gi|23 : agcG---AAA---T--AGTATGAT--T----GTGGCA---GT--A-GTA----G---TA-----------------------------GTA---------G---TA-----G--GAG-------T---A----G---T----A-GA-----C--G----------------------------GA-GT-A-G-TGACGGT---GATAGC------A-GA--A---AATGGAGT------A-----A-AA----G-CAGAAAC---A------C---CA---GCA-GC-A------G---TAGTA---G---T--AAT---A---G---TG--AAAG---TA----AA-GGT-A-T--A---AG--TAT-----------TA------
gi|42 : tgacggtattgtaattattt---AAG---A--AGTA---C--TTCGAGTAGCA---GT--A-GTA----G---TAGTT--GT----A----------G----TAGTA---------T---CA-----G--TAGCAA----T---A----G---T----A-CA-----AT-GT--------A-G--C-A--------A--AA-TC-A-G-TAG---C---AGTAgtaaacatagcataatgaaggtg
gi|1 : --AGTA--GC--A----ACAGCA---GT--A-GTA----G---AA-----GC----AGCAGCGAAACA----CAGTA---------G---AA-----G--TAGCAGTAG-T---A----G---C----A-GA-----A--GA--------G-G--T-A--------G--GA-AA-A-G-TAT---T---TGCAAC------A-GA--A---A------T------A-----G-TA----G-TAGCAGC---A------G---C------T-GA-A------G---TAGTT---G---T--AAT---A---T---CA--GCAG---CA-------GA----------------AA-----------TA------G----T--AGT---A---G---TA---G-C--AAC-A--GAAATAG-----TAG-CA--------AC------AGA---AGTAGT---T----A----TA-GTAGCA-GC------AGCA---G---AAGCA--------------G---TAG---C---C--GT-AGCA-GC---A-GC---------A--G---G---------A--GTA-----GCC--A-----TA---G---------T---A-----------G-CAG------AAGCAGTCGATGTTTTGTTGTTAT-----T---GT---AC---T--T--T--ATTGCT-GTT--------GTT---A-------TA-GT--A------G-----T-----A---G---TAC-TAGTA---GA----A-----GA---AGTA----G---T------A--GC--AGC--------------------------A---GCAA-------AA---T--------------TA-----C----TA---G-C--A--AT-A-T------C-----AG--------C-AGTT---A-----A-----------------AGT---A----GT---AG----T----------T-G-T--AG---T---------T-----A---C------AG---C---A---A---TAA------A------AATA------GA-A-T-A-----------AGTATC---TT-C-AG---CA-----AA--AGTA----------------GTA---G------C---A-G----T--G---GT---A-----G---TT----TC----AT----C----A---G---------CAT----TA-----A--TAGA-A----AT--A-G-TAG-C-------A-G---C-----A-GCA--AA---------A--G-A-A------GTC---GTA------G------------TA---GTA-G---C--A---CC---A---A------TA------G---T---A---GTAG-T------A---G
gi|41 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaatt--AGCG--GC--A----GCGGCA---GT--A-GCA----G---TA-----GT----A----------G----TAGTA---------G---CG-----G--CAAT-ATCGAT---G----G---T----A--A-----A------------T-A--T-A--------ATGAT-GC-A-G-TAG---T---AGT-----------GA--A---A------T------A-----A-TA----atcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|47 : cagc--AGCA--GT--A----GTCGCA---AC--A-GTA----G---TC-----CC----A----------G----TAGTA---------G---TA-----G--CAGCAATAG-C---A----G---T----A-
gi|20 : GTG--GT--G----GTAGAA---GT--A-ATA----G---TA---------------------------TAGTA---------G---TA-----G--TAGCAATAG-T---A----G---T----A-AA-----A--GT--------G-A--C-G--------G--TG-GT-G-A-TAG---T---AGTAGT------A-GA--A---G------A------A-----A-TG----G-TGGTGGT---G------G---TG---GTA-GT-A------G---TAGTA---G---T--GGT---G---A---TG--GTAA---CA----GTAGAA-G-T----------------------------------------AGT---A---G---TA---G-T--AA-----------------TAA-C---G-----GT------G------GTGAT-A-TT--G-----TA-GTAGTA-GT------AGTA---A---C---G--------------G---TGG---T---A--CA-AGAA-GT---A-GT---------A--G---T---------G--Gcca
gi|43 : ggtgGTG--GT--G----GTAGTA---GA--A-GTA----G---TA-----GC----A----------G----TAGTA---------G---TA-----aatggtggtgg
gi|15 : ggtggtggtggtggttatggtagttgtggttacggtggttacggtgTA--TC--T----ATACCG---AT--A-GTA----T---TT-----GT----T----------A----TATTA---------G--------------AGTTGTTG-T---T----G---T----A-CT-----A--GT---------------A--------G--AG-GT-A-G-TAG---T---ATTAGT------T-GA--A---G------T------A-----G-TA----A-T-GTAGC---A------G---C-----------A------G---TAGTA---T---T--AGT---T---G---TA--GTAG---TA--------AT-G-T----------------------------------------AGT---A---G---CA---G-T--AAT-A--G---TAG-----TTG---TTG-----TT------GTA---AG------------A----T------CA-GC------AGTA---G---T---G--------------G---TGGCGAT---T--CT-AGTA-GT---A-GA---------A--G---T---------A--GTAATG--GTA--A-----AA---G---------T---A-----------G-ATG------GAGTA----------------------------GT---AG---T--A--T--T----A-GTA--------GT
gi|34 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactatTA--GT--T----GTTGCA---GT--A-GTT----G---TT-----ACTGTTG----------A-----AATA---------A---TA-----A--TAGTTATTG-T---A----G---T----A-CAAGT--A--GT--------T-A--T-T--------A--TA-GT-C-A-TAA---G---AGTAGT------A-GT--A---G------T------A-----G-TA----G-TAGTAGA---A------G---TTTTGGTT-GA-A------G---TAGTA---G---T--TGT---ggt
gi|9 : --T----GTAGCA---GT--A-GTA----G---TA-----GT----A----------G----TAGTA---------G---TA--------C---------T---A----G---T----A-AA-----A--GT--------T-T--C-A--------G--AA-GC-A-G-------C---AGCAGT------A-TA--C---A------T------A-----A-T-----------------A------G---TT---ATT-GT-A------G---TAGTA---G---T--ACT---G---G---TT--GTAG---------CT-G--------C---AG--CAA-----------TA------T--------GT-------G---TA---G-C--AGT-A--T---TAG-----AAG-CAtg
gi|25 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataatgatga----GTGGTG---GT--G-GTG----G---TA-----AT----A----------A----AATTA---------G---TA-----G--TGGTGGGCG-T---G----G---T----A-----------------------G--T-A--------G--AA-GT-A-G-TAG---T---TGTATT------A-GT--A---G------T------A-----C-TA----G-TAACAGT---A------A----T---ATTAGT-A------G---TAGTA---G---C--AGTTAAA---G---TA--ATAG---TG----GT-GAT-G-------------------------------------------GT---G---G---TG---G-T--AGT-A--T---TA
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatg----GTAGCA---GT--A-GTA----G---TAGATTGGT----A----------A----TTGTG---------G---TT-----G--TAGC---CG-T---A----G---T----A-TA-----A--GT----------------------------A-GA-C-G-TGA---T----GTAGT------A-TATTA---A------T------A-----G-TA----G-TAGTAGT---A------A----T---GAT-GC-A------T---TACAA---G---C--AGT---gcagaag
gi|45 : tattgttgttgtataagtaatagtagtgaggtagtagttgtttctgaatga----GTAGTA---AT--A-GTA----G---TA-----GA----A----------A----TAGTA---------G---TA-----G--AAACA---G-T---A----G---C-------------A--GT--------G-A--T-A--------G--AA-GT-G-GATAA---G---AATA
gi|18 : catgaaa----GTTGTA---GT--A-GTA----G---TT-----GT----A----------A----CGGTA---------G---TG-----A--TAG-A--TG-T---A----G---T----G-GA-----A--GT--------TAA--T-ATGGTACTTG--CA-GT-G-G-TAG---T---GGTAAC------A-GT--A---A------T------G-----A-TA----A-TTGTAGT---G------G---CT---ATG-GC-A------G---AGGTA---G---A--TGT-------G---TA--ATTG---TA----GT-G-------------------------------G------C----C--AGT---T---G---TA---G-T--GATAA--T---TGT-----T-G-TGTAA-----GC------GGA---CGTGGT-AGTG--GT----TG-CT--------------GTA---C---G---A------------------T-----T---T--GT-AGCG-GT---C-AT---------G--G---A---------A--GTG-----GTA--A-----CT---G---------T---A-----------G-TGG------TGGTG-----------------TA-----T---GT---TG---T--A--T--T----G-GTG--------ATA---G-------CA-GT--G------G-----T-----T---A---TAT-T
gi|32 : tgtgatgAGCA---GT--G-GTA----G---TA-----GC----A----------G----TAGTA---------C---CA-----G--TAGTAACTG-T---A----G---C----A-----------------------A--T-A--------T--CA-GT-A-G-------C---AATAGC------------------------------A-----A-TA----C-CGG-------------------T---GCT-GC-A------A---CAGTA---A---T--A
gi|21 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaAGCA---GT-----------G---TA-----TC----A----------T----TAATA---------G---CA-----A--CAGTA-----T---A----G--------A-TA--------GT--------T-G--T-A--------------GC-A-G-AAG---T---AGTAGT------A-GA--A---A------T------A-----A-TA---------------------------CT---ACT-AC------------TAGTA---G---T--AGT---A---A---TA--GTAA---TA----AT-AAT--------------------------------------------AAT---A---A---CA---A-T--AAT-A------TAA-----CAA-CATTA-----GT------AGA---AGTATT-A------A----TA-TTAAtcattattattat
gi|31 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaGCA---CC--A-GTA----A---CA-----GT----A----------G----TAGAA---------G---CA-----G--CAGCAG-------------------------A-----A--GT--------A-A--T-A--------A------------TAG---T---AATAGC------A-GA--C---G------T------A-----G-TA----G-TAATAGagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|40 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacag--A-GTA----G---TA-----TT----A----------A----TAGTT---------G-------------------TTG-T---G----G---T----A-TT-----A--GT--------A-A--T-A--------G--TA-GG-A-G-TTG---T---TACAGT------A-GT--T---G------T------A-----G-TT----GACA-CAGT---A------G---TT---GTT-GT-A------G---TAGTA---G---T--Aacatagacgtagatgta
gi|39 : gtaaa--A-ATA----G---TG-----GT----A----------A----TAGTA---------T---GA-----G--AGGTGGTTG-T---G----G---T----A-------------------------------------------GT-A-G-TAG---T---AGTAGT------A-GA--G---A------T------G-----G-TG----G-AGGTAGT---A------G---TT---GTT-GT-G------G---TGGTT---G---T--CGT---A---G---CA--GT
gi|2 : -GTA----G---TA-----GA----A----------G----CATTA---------G---CA-----AGTTAGTAATTG-TGGTA----G---T----A-TG-----T--GT--------T-G--T-A--------A--GT-GT-ACG-T-A---T---TGTAGT------A-GA--A---G------T------A-----A-T----------------------------CT----TT-GT-A------G---TAGCA---G---A--AAT---A---G---TT--GTAG---TA----
gi|46 : tt-GTT----G---TA-----AC----A---------------TAGTA---------G---CA-----A--TTGTAGTTG-T---A----G---T----A-----------GT------------------------G--CA-GT-G-G-TAG---T---AATAGC------A-Gaaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|36 : A----G---TA-----TT----A----------C----TAGTA---------G---TA-----G--TAGTAAT-------A----G---T----A-AA-----A--GT--------T-G--T-A--------G--TA-GT-A-T-TAA---T---AATAACCCTT--A-G--------------T------A-----A-TA----G-TAACA----------------CT--------T-A------G---TAGTA---G---A--AGtag
gi|28 : aaaaaagttg---TA-----GT----C----------A----CAGTC---------G---TA-----G--CAGTAGTTG-C---T----G---T----A-GA-----A--GTATCATCAGC-A--T-A--------A--CA-TT-A-G-CAA---C---ATTAGC------A-GA--A---G------A------A-----G-CA----A-CAACATC---A------G---CA---GTA-GC-A------G---TAGCT---G---C--AAC---A---G---TA--GTAA---TA----aagatgttataaca
gi|35 : agcatcagcaatcgcaatcgcaatcaAGTA---------G---AA-----G--TAGT------T---A----A---T----A-TT-----A---T--------T-A--TTA--------A--AA-GT-A---TAA---T-----TAGT------A-GA--A---A------T------AG----A-AA----A-AAGAAGT---A------G----------T-GG-AT-----A---TAGCA---A---T--AGT---A---G---CA--GCAG---TA----TT-GTT-A-T--T---AT--TAT-----------TA------T----A--ACT---A---G---TA---G-A--AAT-A--gaagt
gi|17 : aaGTA---------G---TA-----G--CAGTA------------------T----A-TA-----AT-GT--------A-A--T-G--------A--CATGTTA-G-TAA---T---AAAAAA------A-GA--T---A------T------ATTGTTG-TA----G-TAACAGT---A------G---TT---GTC-AT-A------G---TAGTT---G---T--AGT---A---G---TAAAGTAG---TA----GT-AAT-----------------------------A------G----A--AGT---A---G---TA---G-TT-AAA-G--T---TGT------GG-TTGTG-----GT------AGT---AGTAGT-A-TG--TA----TA-ATAATG---------ATTA------------------------------TGA---T---T--GA-AGTA-GT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GAA--G-----TA---G---------T---A-----------T-TA--------AATA-----------------AA-----T---AT---TG---G--A--T--A-------TA--------ATA---C-------TA-GT--A------G-----T-----A---
gi|42 : gtagtagatgtagttgctgttgtttttA-----G--TAGCAGTAG-T---A----G---T----A-----------GT--------T-G--T-A--------------GT-A-G-TAT---C---AGTAGC------------A---A------T------A-----G-TACAATG-TAGCAAA---A------T---CA---GTA-GC-A------G---TAtatgtagtcatatcagtaat
gi|32 : aagaagtacttcg-TA-----A--GT--------T-A--T-A--------A--AA-GC-A-G-TGG---T---AGTAGC------A-G--------------T------A-----G-TA----C-CAGTAGT---A------A---CT---GTA-GC-A------A---TATCA---G---T--AGC---A---A---TA--GCAA---TA----CC-GGT-G---------------------------------------C--TGC---A---A---CA---G-T--AAT-A--T---CAT-----TAT-TATT
gi|45 : tatgcagtatgagttgattttact-A--T-G--------A--AA-GT-A-G-TAA---T---AGTAGT------A-GA--A---A------T------A-----G-TA----G-TAGAAAC---A---------------GTA-GC-A------G---TGATA---G---A--AGT---G---G---at
gi|40 : c--T-A--------A--AA-GT-A-G-TAT---T---AATAGTTGTTGTG-GT--A---T------T------A-----G-TA----A-TAGTAGG---A------G---TT---GTT-AC-A------G---TAGTT---G---T--AGT---T---GACACA--GTAG---T----------T-G-T--T--------------------------------------GT---A---G---TA---G-T--AGT-A--ataagaata
gi|39 : g-A--------A--TA-GT-G-G-TAA---T---AGTATG------A-GA--G---G------T------G-----G-TT----G-TGGTAGT---A------G---TA---GT-----A------G---TAGTA---GAGAT--GGT---G---G---AG--GTAG---TAG---TT-GTT-G-T--G---GT--GGT-----------TG------T----C---GT---A---G---CA---G-T--
gi|19 : --------A--AA-GT-A-G-CAA---T---AGTAGT------A-T---C---A------T------A-----AGTA----G-CATCAGT---A------G---AT---GTA-GT-A------A---TGATA---G---A--AGT---G---G---GA--GTAG---------------------C---AG--TAG-----------TA------A----C--AGC---A---G---TA---G-C--CAA-A--G---CAG-----TAG-CAGTG-----GTAGTATCAGA---AGCAGT-A-TC--AA----TA-GTGAC----------AGTA---G---ATGCA--------------G---TAG---T---
gi|25 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgtttagtattatcattatcattattattagaagtagac-GT-G-G-TGG---T---AATA-----------A--A---A------T--------------TA----G-TAGTGGT---G------G------------GC--------G---TGGTA---G---T--AGA---A---G---TA--GTAG---T----------T-G-T-------------------------A------T----T--AGT---A---G---TA---C-T--AGT-A--A---CAG-----TAA-TATTA-----GT------------AGTAGT-A------G----CA-GTTA----A------AGTA---A---T---A--------------G---TGG-------T--GATGGTG-GT---G-GT---------A--G---T---------A--TTA-----GCA--aa
gi|28 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggtggtg-A-G-CAA---TCGCAATCGC------A---------A------T------C-----A-TA----G-T--CA-C---A------G---TC---GTA-GC-A------G---TAGT-------------T---GCT-G---TA--GAAG-----------------------------TAT-----------CA------T----C--AGC---A--------------T--AAC-A--T---TAG-----CAA-CATTA-----GC------AGA---AGAAGC-A------A----CA-ACATCA-GC------AGTA---G---C---A--------------G---TAG---C---T------GCA-AC---A-GT---------A--G---T---------A--ATA-----Ggaag
gi|31 : agcatc-A-G-TAA---C---AGTAGT------A-GA--A-------------------------------G-CAGCAGC---A------G---AA---GTA-AT-A------A---TAGTA---A---T--AGC---AGACG---TA--GTAG---TA----aagt
gi|20 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacc-G-TGG---T---GGTGGT------A-GA--A---G------T------A-----A-TA----G-TA-TAGT---A------G---TA---GTA-GC-A------A---TAGTA---G---T--AAA---A---G---TG--ACGG---TG----GT-GAT---------------AG-----------TA------G----T--AGT---A---G---AA---G-A--AAT-G--G---TGG-----TGG-TGGTG-----GT------AGT---AGTAGT-AGTGGTGA----TG-GTAAC----------AGTA---G---A---A--------------G---TAG---T---A--GT-AGTA-AT---A-AC---------G--G---T---------G--GTG-----ATATTG-----TA---G---------T---A-----------G-TAG------TAGTA-----------------AC-----G---GT---GG---T--A--C--A----A-GAA--------GTA---G-------TA-GT--G------G-----------A---A---TGG-TGGTG---Gatagacatagacgtagatgta
gi|9 : gAA---T---AATGTC------ATGAT-A---A------T------G-----A-TGAT--G-TAGCAGT---A------G---T-----------A------G---TAGTA---G---T--AGT---A---G---TA--CTAG---TA----AA-AGT-T-T--C---AG--AAG-----------CA------G----C--AGC---A---G---TATACA-T--AAT-AG-T---TAT-----T-------------GT------AGT---AGTAGT-ACTG--GT----T-----------------------------------------------G---TAG---C---T--GC-AGCA-AT---ATGT-----------------------------GTA-----GCA--G-----TA---T---------T---A-----------G-AAG------CA
gi|5 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaA---T---AGTAGT------A-GA--A---A------T------A-----A-TA----G-TAATAAT---A------G--------------------------TAGTG---G---T--GGT---G---G---TATGGTAG---TA----CT---T-G-T--A---AT---AT-----------TA------T-------GGT---G---G---TG---G-T--AGT-A--G---TAG-----TAG---TTG------T------AGT---AGTAGTGA-TG---A----TG-GTGTTA-GA------AGTA---GTCGA---G--------------G---TGG---TGG-T--GA-TG---AT---A-AT---------G--A---T---------G--GTG-----GTG--G-----TA---G---------T---G-----------G-TAG------TAGTA-----------------ATAGAGGT---NN---NN---N--N--N--N----N-NTA--------ATA---GAGG----TA-GT--A------G-----T-----A---G---TAT-TGATA---GA----A-----GT---AGCA----G---T------A--GT--AG-----T---G--------------G-TG---GTAGT------TA---TAGT---A------TTA-----G----TA---A-T--G--GTTG-T------GGAAGAAG--------T-A--T---A-----AGTGT----------T--GGT---G----AT---TG----T---G----G-T-G-T--TA---G---------T------T--T------AG---T---A---G---TAG------T------AGTA------AT---T-GT-G-----G-CAGTGGT--------------A-----GA--AGTAGT----------------A---A------T---G-G----T--A---GT---G-----G---TA----GC----AA-----------------------TAG----AA-----G--TAGC-G----AT--T-GGTGA-T-------T-T---A-----A-GTA--TAG----T---A--G-A-A------G------TA------G------------TA---GTA-T---A--ATTGGT---T---G------TG------G---T---A---GTAG-T------A---GTAA---TAGTAG-T-AT--T---ATT---AG---TA---GT---GGTA-G-TG----GCAG--T--------A---G-TT-G------TT---GT------------G---GTGG---CG-GTG--A---------T--------AGAAGTACT-AATGGTG-----------GTG--TT---G-----GCT---G-------------TG------GT---A---GT----AGTA---GTA---GTG-GT---G----GTGCT----G-----GT-GTTAG--TATAGTAGT
gi|21 : ------T------A-----A-TA----G-CAACAGT---ATAGATAG---TT---GTA-GC-A------G---AAGTA---G---T--AGT---A---G---AA--ATAA---TA----C-------------------TAC-----------TA------C----T--AGT---A---G---TA---G-T--AAT-A--G---TAA-----TAA-TAATA-----AT------AAC---AATAAT--------A----TA-ACAACA-TT------AGTA---G---A---A--------------G---TAattagtgttggtggtggtggtggtgg
gi|42 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagtgtatcat------A-----G-TA----G-CAGTAGT---A------G---TA---GTT-GT-A------G---TAGTA---T---C--AGT---A---G---CA--ATAG---TA----C--AAT-G-T------AG--CAA-----------AA------T----C--AGT---A---G---CA---G-T--Attaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|47 : aagaagtacttcg------A-----G-TA----G-TCGCAAC---A------G---TA---GTC-CC-A------G---TAGTA---G---T--AGC---A---GCAATA--GCAG---TA----C
gi|41 : agcA----G-CGGCAGC---G------G---CA---GTA-GC-A------G---TAGTA---G---T--AGT---A---G---CG--GCAA---TA----TC-GATGG-T--A---AA--TAT-----------AA------TGATGC--AGT---A---G---TA---G-TGAAAT-A--A---TAca
gi|34 : cagc----G-CAGTAGT---T------GTTACT---GTT-GA-A------A---TAATA---A---T--AGT---T---A---TT--GTAG---TA----CA-AGTAG-T--T---AT--TATAGTCATAAGAGTA------G----T--AGT---A---G---TA---G-T--AGT-A--G---TAG-----AAG-TTTTG-----GT------TGA---AGTAGT-A-
gi|46 : tagttgttAGTAGC---A------A---TT---GTA-GT-T------G---TAGTA---G---TGCAGT---G---G---TA--GTAA---TA----gttgttg
gi|34 : gttgtaacat---A------G---TT---GTT-GC-A------G---TAGTT---G---T--TAC---T---G---TT--GAAA---TA----AT-AAT-A--------GT--TAT-----------TG------T-------AGTACAA---G---TA---G-T----T-A--T---TA------TAGTCATAA-----G-------------AGTAGT-A------G----TA-GTAGTA-GT------AGTA---G---A---A--------------GTTTTGG---T---T--GA-AGTA-GT---A-GT---------T--G---T---------gcagtag
gi|27 : t------G---TT---GTT-GT-ATAA---G---TAATA---G---T--AGT---GAG-G---TA--GTAG---T------T-G-T-T-T--CTGAAT--GAG-----------TA------G----C--AGT---A---G---TA---G-T--AG--A--T---TGG-----TA---ATTGTGGTTGT------AGC---CGTAGT-A-TA---------A-GTA----GA------CGTG---A---T------------------G---TAG---T-------ATATTA-AT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GTA--ATGATGCA---T---------T---A-----------C-AAG------CAGTtg
gi|18 : tatt---GTT-GT-A------G---TAGTA---G---T--TGTAACG---G---TA--GTGA---TA-------GAT-G-T----------------------------------------AGT---G---G---AA---GTT--AAT-A--TGG-TAC-----TTG-CAGTG-----GT------------AGTGGT-A------A----CA-GTAAT--GA--------TA---A---T---T--------------G---TAG---T---------GGCT-AT---G-GC---------A--G---A---------G--GTAGATGTGTA--A-----TT---G---------T---A-----------G-TGG------C--CA-----------------GT-----T---GT----------------------A-GTG--------ATA---A-------TT-GT--T------G-----T---------G---TA---AGCG---GA----C-----GT---GGTA----G---T------G--GT--TGC----T---GTACGAT--TT----G-TA---GCGGTCATGGAAG---TGGT---AACT---GTA-----G----TG---G-T--G--GT-G-TATGTTGT-----AT--------TGG--T---G-----A---T-------------AGC---A----GT---GG----T---T----A-T-A-T--T
gi|25 : tgtgatg-A------A---TAATG---G---T--TGT---G---G---TG--GTGA---TG----AT-GAT-GGT--G---AT--GGT-----------GG------T-------GGT---G---G---TG---G-T--AAT-A--A---AAT-----TAG-TAGTG-----GT------GG--------GC-G-TG--G-----TA-GTA----GA------AGTA--------------------------G---TAG---T---T--G----TA-TT---A-GT---------A--G---T---------A--CTA-----GTA--A-----CA---G---------T---A-----------A-TAT------TAGTA-----------------GT-----A---GT---AG---C--AGTT--A----A---A--------GTA---A-------TA-GT--G------G-----T-----G---A---TGG-TGGTG---GT----A-----GT---ATTA----G---C------A--GA--AG
gi|17 : agaGTA---G---T--AGA---T---G---TA--GT------------T-GCT-G-T--T---GT--TTT-----------TG------T-------AGT---A---G---CA---G-T--A-T-A--T---AAT-------------------GT------------AATGAC-A-TG--T-----TA-GTAATA-AA------A--A---A---A---G--------------A---TA--------T----------AT---T-GT---------T--G---T---------A--GTA-----ACA--G-----TA---G---------T---T-----------G-TCA------TAGTA-----------------GT-----T---GT---AG---T--A------------GTA--------A-A---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---A---TA----------GA----A-----GT---AGTA----G---T------T--AA--AGT----T---G---------T----G---------GT------TG---TGGT---A------GTA-----G----TA---G-T-----AT-G------------------------T-A--T---A-----A---------------------------------------T---A----A-TGA-T--TA---T---------G-----AT--TGA----AG---T---A---G---TAG------T------AGTA------GT-A-G-A--A-----G-TAGTA-T---TA-A-AT---AA-----AT--ATTGGA--T-----------ATA---A------T---A-C----T--A---GT---A-----G---TA----
gi|15 : TA---G---T--ATT---T---G---TT--ATAT---TA-------GA--G-T--T---GT--TGT-----------T----------------GT---A---C---TA---G-T--AGA-G--G---TAG-----TAG-TATTA-----GT------TGA---AGTAGT-A------A----T--GTAGCA-GC------AGTA---G---T---A--------------T---TAG---T---T--GT-AGTA-GT---A-AT------------G---T---------A--GTA-----GCA--G-----TA---A---------T---A-----------G-TAG------TTGTT-----------------GT-----T---GT---AA---G--A--T--C----A-GCA--------GTA---G-------TG-GT--G------G-----C-----G---ATTCTAG-TAGTA---GA----A-----GT---AGTAATG-G---T------A--AA--AGT----A---G--------AT----G-GA---GTAGT------AG---TATT---A------GTA-----G----TG---G-T--tatgtagtcatatcagtaat
gi|39 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgaA---A---T--AGT---G---G---TA--ATAG---TA----TGAGAG-G-T--G---GT--TGT---------------------------GGT---A---G---TA---G-T--AGT-A--G---TAG-----TAG-AGATG-----GT------GGA---GGTAGT-A-
gi|20 : GT---G---G---TG--GTGG---TA-------GAA-G-T--A---AT---AG-----------TA------T-------AGT---A---G---TA---G-T--AGC-A--A---TAG-----TAG-TAAAA-----GT------GAC---GGTGGTGA-TA--G-----TA-GTAGTA-GA------AGAA---A---T---G--------------G---TGG---T---G--GT-GGTG-GT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GTG--G-----TG---A---------T---G-----------G-TAA------CAGTA-----------------GA-----A---GT---AG---T--A--G--T----A-GTA--------ATA---A-------CG-GT--G------G-----T-----G---A---TAT-T-GTA---GT----A-----GT---AGTA----G---T------A--AC--GG-----T---G--------GTACAAG-AA---GTAGT------AG---TGG----A------ATG-----G----TG---G-T--G--gttgttgtggtggttgtcgtagcagt
gi|19 : gT---G---T---TA--CTAT---TA----TT-GAT----------AT--TAT-----------CA------T----C--AGT----------------G-T--TAT-G--T---T-------TAG-TATT--------------------ATCATT-A-TC--AT----TA-TTATTA-GA------AGTAGACA---A---A--------------G---TAG---------------CA-AT---A-GT---------A-------------------GTA-----TCA--T-----AA---G---------T---A-----------G-CAT------CAGTA-----------------GA-----T---GT----------------------A-GTA--------ATG---A-------TA-GA--A------G-----T-----G---G---GAG-TAGCA---GT----A-----GT---AACA----G---C------A--GT--AGC----CAAAG--------CA----G-TA---GCAGT------GG---TAGT---A------TCA-----G----AA---G-C--A--GT-A-T------C-----A-----------A--T---A-----G---TGA--------C--AGT---AGAT-GC---AG----T---A----G-T-A-g
gi|15 : gtataatcactattataatcaatatattactgtT---G---A---TA--GTATCATTA----TT-GTT-G-T--A---AT--TAT-----------CA------T----C--ATT---A---T---TA---C-T--ATT-A--TC--TATACCGATAG-TATTT-----GT------TAT---ATTAGA-G-TT--GT----T--GTTGTA-CT------AGTA---G---A---G--------------G---TAG---T---------AGTA-TT---A-GT---------T--G---A---------A--GTA-----GTA--A-----T----G---------T---A-----------G-CAG------CAGTA----------------------------------G---T--A--T----------TA--------GTT---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---A---TG--TAGTA---GC----A-----GT---AATA----G---T------A--GT--TGT----T---G--------TT----G-TA---AGATC------AG---CAGT---A------GTG-----G----TG---G-C--G--AT---T------C--------------------T---A-----G---T-------------AGT---A----GA---AG----T---A----G-T-A-A--TG---G---------T-----AA--A------AG---T---A---GA--TGGAG----T------AGTA------GT-A-T------------TAGTAGa
gi|9 : gctattagttgttataattataactacttaaatT-AAT-G-T--C---AT--GATAATGATGATG-TA------G----C--AGT---A---G---TA---G-T--AGT-A--G---TAG-----TAG-TACTA-----GT------AAA---AGT--T-T-CA--GA-----A-GCAGCA-GC------AGTATACA---T---A--------------A---TAG---T---T----------AT---T-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GTA--C-----TGGTTG---------T---A-----------G-CTG------CAGCA-----------------ATATG--T---GT---AG---C--A--tggt
gi|23 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaa---AT--GAT-----------TG------T-------GGC---A---G---TA---G-T--AGT-A--G---TAG-----TAG-GAGTA-----GT------AGACGGAGTAGTGA-CG--G-----TG-ATAGCA-GAAAATGGAGTA---A---A---A--------------G---CA-----------GA-AACA-CC---A-GC---------A--G---C---------A--GTA-----GTA--G-----TA---A---------T---A-----------G-TGA------AAGTA-----------------AA-----G---GTATAAG---T--A--T--T----A-GTA--------AAC---A-------TA-GC--A------------T-----A---A---Tgtattagaagca
gi|35 : tgacggtattgtaattatttgaaatagt--AGT---A---G---T------T--AAT-A--T---TAT-----TA----TTA---------------A---A--AGT-A-TA--AT----TA-GTA----GA------AATA---G---A---A--------------A----------------AA-AGAA-GT---A-GT---------G--GA--T---------A---TA-----GCA--A-----TA---G---------T---A-----------G-CAG------CAGT------------------AT-----T---GT--------T--A--T--T----A-TTATT------ATA---AC------TA-GT--A------G-----A-----A---A---TAgaaggtg
gi|40 : aaagtaga--AGT---A---G---TA---T-T--AAT-AG-T---TGTTG---TGG-TATTA-----GT------------AATAGT-A-GG--AG----TT-GTTACA-GT------AGT------------T--------------G---TAG---T---T--GA-CACA-GT---A-GT---------T--G---T---------T--GTA-----GTA--G-----TA---G---------T---A-----------
gi|10 : gtaaaGT---A---G---TA---G-A--AGT-AGGTG--TAG-----TAG-TTGTG-----TT------AGA---AGTAGT---TG--GAGAAGTA-GTAACA-GT------AGTG--------------------------G---TGG---T---------GGTA-GT---A-GT---------A--G---T---------G--ATG-----ATG--A-----TG---G---------T---G-----------G--AGATA---TAGTG-----------------GT-----A---GT---AG---T--A--G--A----A-GTA--------GTA---A-------TA-GT--A------G-----T-----A---G---TGG-TGGTG---GT----A-----AT---AGTC----G---T------A--GT--A----------A--------TT----G-TG---GCGGT------GG---TGGT---A------GTA-----G----TA---G-T--A--GT-G-T------TG----GT--------T-G--C---G-----G---T----------T---GT---A----GT---GG----T---G----A-TGA-T--GA---T---------T-----AN--N------NN---N---N---N---NNN------N------NNNN------NN-N-N-N--N-----N-NNNNNNN---NN-N-NN---NN-----NN--NNNNNN--NNNNNNNNNNNGGTG---G------T---G-G----T--G---GTGCAG-----G---TG----GT----GA----T----A---G---------TAG----TA-----G--TGGG-A----GT--G-G-TGG-T-------G-G---T-----G-GTG--GAA---AT---A--A-T-A------GTA---GTA------G------------AA---GAA-G---T--A---GT---A---AATATAGTA------G---T---A---GCAG-T------A---GAAG---TGGTTG-T-GG--T---GGG---TG---TG---G
gi|9 : tgatggtg-T--AATGA--T---GATG----TAG-CAGTA-----GT------AGT---AGTAGT-A------G----TA-GTACT----------AGTA---A---A---A--------------G---T-----T---TCAGA-AGCA-GC---A-GC---------A--G---T---------A---TAC----ATA--A-----TA---G---------T---T-----------A-TTG------TAGTA----------------------------GT---AG---T--A--C--T----G-GTT--------GTA---G-------CT-GC--A------G-----C-----A---A---TAT-GTGTA---GC----A-----GT---ATTA----G---A------A--GC--Atatta
gi|20 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgaG-----GT------GGT---GGTGGT-A-----GA-----A-GTAATA-GT------A-TA---G---T---A--------------G---TAG---T---------AGCA-AT---A-GT---------A--G---T---------A--AAA-----GTG--A-----CG---G---------T---G-----------G-TGA------TAGTA----------------------------GT---AG---T--A--G--A----A-GAA--------ATG---G-------TG-GT--G------G-----T-----G---G---TGG-TAGTA---GT----A-----GT---AGTG----G---T------G--AT--GGT----A---A--------CA----G-TA---GAAGT------AG---TAGT---A------GTA-----A----TAACGG-T--G--GT-G-A------T-----AT--------T-G--T---A-----G---T-------------AGT---A----GT---AG----T---A----A-C-G-G--TG---G---------T-----AC--A------AG---A---A---G---TAG------T------AGTG------GA-A-T-G--G-------TGGTGG
gi|45 : T------GAA---AGTAGT-A------A----TA-GTAGTA-GA------AAT------------A--------------G---TAG---T---A--GA-AACA-GT---A-GC---------A--G---T---------G--ATA-----G
gi|31 : caGA---AAT--T-A-TT--AA----TA-ATAAAA-TA------A-TA---T---A---AT-------------A---TAA---T---A--AA-ATCA-AT---A-CA---------G--G---C---------A--CCA-----GTA--A-----CA---G---------T---A-----------G-TAG------AAGCA----------------------------GC---AG---C--A--G--A----A-GTA--------ATA---A-------TA-GT--A----------------------A-------TAGCA---GA----C-----GT---AGTA----G---T------A--AT--AGaagtggataagaata
gi|32 : A---AGCAGT-------GG----TA-GTAGCA-GT------AGTA---C---C---A--------------G---TAG---TAACT--GT-AGCA-AT---A--T----------------C---------A--GTA-----GCA--A-----TA---G---------C---AATACCGGTGCTG-CAA------CAGTA-----------------AT-----acatagacgtagatgta
gi|39 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataa---AGTGGT-A------A----TA-GTATGA-GA------GGTG--------------------------G---TTG---T---G--GT-AGTA-GT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GAG--A-----TG---G---------T---G-----------G-AGG------TAGTA-----------------GT-----T---GT---TG---T--atcattattattat
gi|21 : aatGTATC-A-TT--AA----TA-GCAACA-G---------TA---T---A---G--------------A---TAG---T---T--GT-AGCA-GA---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GAA--A-----TA---ATACTACTACT---A-----------G-TAG------TAGTA-----------------AT-----A---GT---AA---TA-A--T--A----A--TA--------ATA---A-------CA-AT--A------A-----TATAACA---A---CAT-TAGTA---GA----A-----GT---ATTA----ggtggttgtcgtagcagt
gi|9 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagt--GA----TA-ATGAT--GA------TGTA---G---C---A--------------G---TAG---T---A--GT-AGTA-GT---A-GT---------A--G---T---------A--CTA-----GTA--A-----AA---G---------TTTCA-----------G-AAG------CAGCA----------------------------GC---AG---T--A--T--A----C-ATA--------ATA---G-------TT-AT--T------G-----T-----A---G---TAG-TAGTA---CT----G-----GT---TGTA----G---C------T--GC--AGCAATAT---G---------T----G-TA---GCAGT------AT---TAGA---A------GCA-----atattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|13 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatA----CA-ATAACATGATT----AGTA---A---T---A--------------A---TAG---A------GA-TGTA-CT---A-GT---------A--G---T---------T--GTA-----GTG--A-----AA---G---------T---G-----------G-TAG------CGTTA-----------------GT-----T---GT---AA---T--G--G--A----A-ATG--------GTA---G-------TA-GC--A------G-----TGG---A---A---CACATAAGG---GA----ATTT--GT---AGTA----G---T------A---C--ATA----TA--G--------TG----G-TA---GTGAT------AG---TGGT---A------GCA-----G----TA---G-T------T-G-T------A-----AT--------G-G--A---A-----A---T-------------GGA---A----GT---GG--------G----A-C-A-------------------C-----GT--A------AG-------G---GAATTGG------T------AGTA------GT-A-T-A--T-----A-CAGTGGT--------AG---TG-----AA--AGGGGT--A-----------GCG---G------T---A-G----T--T---GT---A-----A---TG----GA----AA----T----G---G---------TAG----TG-----G-------------T--T-G-TGA-A-------A-C---A-----T-GTA--AG---------G--G-A-A------TTG---GTA------G------------TA---GT--------------T---A---A------T-------G---C---A---GTGG-T------A---GTGA---TAATGG-T-AG--C---GGT---AG---TT---GT---AAT
gi|7 : a----TA-GTAAAA-GG------AGTA---A---A---A--------------G---TAGCAGT---A--GA-AGAA-GT---A-GA---------A--A---T---------A--AGA-----A-A--A-----TA---G---------T---TTTT--------G-CAG------CAGTA-----------------AA--------------AG---T--A--T--C----A-CTT--------ATA---G-------CA-GC--A------GAAGCGT-----A---A---TA------A---GA----A-----GT---ACTG----A---C------A--GA--AGC----AAAAG--------TT----G-AA---GAAGC------AG---CAGC---A------GTC-----G----CA---A-------AC-G-T------T-----GT--------T-G--T---AGCAACA---T----------C--AGA---A----GT---AG----A---A----A-C-A-G--TA---G---------T-----AG--T------AG---C---A---G---TAG------C------AGAA------AA-A-G-T--G-----A-TAGCA-C---CA----GCTTAA-----GT--AGCAGT--C-----------GTA---A------T---A-G----T--A---GT---AACAGAG---AA----GC----AG----A----A---G---------TAG----CA-----G--TAGC-A----GC--A-G-CAG---------A-C---AC----A-GTA--AAA---GT---A--G-T-A------GCAGAAATA------G------------AA---GTA-G-----------T---A---T------TA------G---C---A---GCAGAT------AAA-GTAG---TTGTAG-C-AT--C---AGC--------TG---AA---GA-A-G-AA----GCAG--T-------------------------A---GT------------A---GCAG---CA-G-------------------------CAGCAGT-AGTAGT-----------AGTA--GC---A-----GCA---G------------A-A------GT---A---GT----A------GTA---ATC-GC--AG----CAGCT----GA---AATAGTg
gi|42 : tagA-GA------AGTACTTC---G---A--------------G---TAG---C---A--GT-AGTA-GT---A-GT---------T--G---T---------A--GTA-----GTA--T-----CA---G---------T---A-----------G-CAA------TAGTAC----------------AA-----T---GT---AG---C--A--A--A----A-TCA--------GTA---G-------CA-GT--A------agcagcagaaaacgtagttgcaatggtaacatttattactgtagaaataacagcaagggaagta
gi|27 : aA------AGTA---A---T---A--------------G---TAG---T------GA-GGTA-GT---A-GT---------T--G---TTTCTGAATGA--GTA-----GCA--G-----TA---G---------T---A-----------G-TAGAT----TGGTA-----------------AT-----T---GT---GG---T----------------TG---------TA---G-------CC-GT--A------G-----T-----A-------TA---AGTA---GA----C-----GT---GAT-------------------GT--AG-------------------T----A-TA---TTAAT------AG---TAGT---A------GTA-----G----TA---A-T--G--AT-G--------C-----AT--------T-A--C---A-----A---G----------C--AGT---
gi|40 : tattgttgttgtatGTA---A---A---A--------------G---TAG---T---------ATTA-AT---A-GTTGTTGT---G--G---T---------A--TTA-----GTA--A-----TA---G---------T---A-----------G-GAGTTGTTACAGTA-----------------GT-----T---GT---AG---TTGA--C--AC---A-GTA--------GTT---G-------TT-GT--A------G-----T-----A---G---TAG-TA
gi|21 : TA---T---A---A--------------A---TAT---T---C--AA-AGCA-GT-----GT---------A--TCATT---------A--ATA-----GCA--A-----CA---G---------T---A-------------TAG--------ATA-----------------GT-----T---GT---AG---C--A--G--A----A-GTA--------GTA---G-------TA-GA--A------A-----T-----A---A---TAC-TACTA---CT----A-----GT---AGTA----G---T------A--------------------------------A-TA---GTAAT------AA---TAAT---A------ATA-----A----CA---A-T--A--AT----------------AT--------A-A--C---A-----A--------------C--ATT---A----GT---AG----A---A----G-T-A-T--TA---A---------T-----AT--T------AA---A---G---T---TGG------A------AATA------
gi|36 : tagtacatgtaaaatctaA---A---A---A-------------------AG---T---T--GA--GTA-TT---A-CT---------A--G---T---------A--GTA-----GTA--G-----TA---A---------T---A-----------G-TAA------AAGTT-----------------GT-----A---GT---AG---T--A--T--T----A-ATA--------ATA---ACCCTTAGTA-AT--A------G-----T-----A---A---CAC-T--T----------A-----GT---AGTA----G---A------A--GA--AGA----T---G--------TT----A-TA---ACActgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : a---A---A--------------T---TAT---T---T--GA-A----AT---A-GT---------ATGA---T---------T--GTG-----GCA--G-----TA---G---------T---A-----------G-TAG------TAGTA-----------------GG-----A---GT---AG---T--A--G--A----C-GGA--------GTA---G-------TG-AC--G------G-----T-----G---A---TAG-CAGAA---AA----T-----GG---AGTA----A---A------A--GC--AGA----A---A--------C--------A---CCAGC------AG---CAGT---A------GTA-----G----TA---A-T--A--GT-G-A------A-----AG--------T-A--A---AGGT--A---T----------A--AGT---A----TT---AG----T---A----A-
gi|47 : tgacggtattgt---A--------------G---TAG---T---C--GC-AACA-GT---A-GTCCCAGT---A--G---T---------A--GTA-----GCA--G-----CA---A---------T---A-----------G-CAG------TAacatagcataatgaaggtg
gi|34 : agc---TAG---T---T--GT-TGCA-GT---A-GT---------T--G---TT--------ACTGTT-----GAA--A-----TA---A---------T---A-----------A-TAG---------TT-----------------AT-----T---GT---AG---T--A--C--A----A-GTA--------GTT---A-------TT-AT--A------G-----T-----C---A---TAA-GAGTA---GT----A-----GT---AGTA----G---T------A--GT--A-------------------------G-TA---GAAGT------TT---TGGTTGAA------GTA-----G----TA---G-T--cca
gi|25 : --GA-AATA-AT---G-GT---------T--G---T---------G--GTG-----GTG--A-----TG---A---------T---G-----------A-TGG------TGATG-----------------GT-----G---GT---GG---T--G--G--T----G-GTA--------ATA---A-------AA-TT--A------G-----T-----A---G---TGG-TGGGC---GT----G-----GT---AGTA----G---A------A--GT--AGT----A---G--------TT----G-TA---TTAGT------AG---TACT---A------GTA-----A----CA---G-T--A--AT-A-T------T-----AG--------T-AG-T---A-----G---T-------------AGC---A----GTTAAAG----T---A----A-T-A-G--TG---G---------T----------------GA---T---G---G---TGG------T------GGTA------GT-A-T------------TAGCAGtgttg
gi|37 : a--GA-AGTG-TT---G-GT---------A--C---T---------A--GTA-----GCA--A-----TA---A---------T---G-----------G-TAG------CCGTG-----------------GT-----G---GT---AG---T--A--aag
gi|32 : gttatcgttatcatcagcattaA-AGCA--------GT---------G--G---T---------A--GTA-----GCA--G-----TA---G---------T---A-----------C-CAG------TAGTA-----------------AC-----T---GT---AGCAAT--A--T--C----A-GTA--------GCA---A-------TA-GC--A------A-----T-----ACCGG---TGC-T-GCA---AC----A-----GT---AATA----T---C------A--gttgttattttggttgttgttattgtac
gi|41 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataa-AGCA-GT---A-GT---------A--G---T---------A--GTA-----GCG--G-----CA---A---------T---A-----------T-CGA------TGGTA-----------------AA-----T---AT---AA---TG-A--T---------GCA--------GTA---G-------TA-GTGAA------A-----T-----A---A---TAttattattat
gi|28 : cagcagcggcagcggcagtGCA-AT---C-GC---------A--A---T---------C--ATA-----GTC--A-----CA---G---------T---C-----------G-TAG------CAGTA-----------------GT-----T---GC---TG---T--A--G--A----A-GTATCATCAGCATA---A-------CA-TT--A------G-----C-----A---A---CAT-TAGCA---GA----A-----GA---AGCA----A---C------A--AC--ATC----A---G--------CA----G-TA---GCAGT------AG---CTGC---A------ACA-----G----TA---G-T--A--AT-
gi|18 : agcatcagcaatcT---A-GT---------A--G---T---------A--GTT-----GTA--A-----CG---G---------T---A-----------G-TGA------TAG-A------------------------T---GT---AG---T--G--G--A----A-GT----------TA---A-------TA--T--G------G-----T-----A---C---TTG-CAGTG---GT----A-----GT---GGTA----A---C------A--GT--AA-----T---GATAA----TT----G-TA---GTGGC------TA---TGGC---A------GAG-----G----TA---GAT--G---T-G-T------A-----AT--------T-G--T---A-----G---TGGC-------C--AGT---T----GT---AG----T---G----A-TAA-T--TG---TTG-------T-----GT--A------AG---C---GGACG---TGG------T------AGTGGTTGCTGT-A-C-G--A-----T-TTGTAGCGGTCA-T-GG---AA-----GT--GGTAAC--T-----------GTA---G------T---G-G----T--G---GT---------G---TATGTTGT----AT----T----G---G---------TGA----TA-----G--CAGT-G----GT--T-A-TAagaagt
gi|41 : tgtgatggttg---A-GC---------A--G---C---------G--GCA-----GCG--G-----CA---G---------T---A-----------G-CAG------TAGTA----------------------------GT---AG---T--A--G--C----G-GCA--------ATATCGA-------TG-GT--A------------------A---A---TA--TAAT----GA----T-----GC---AGTA----G---T------A--Gtt
gi|47 : c---A-GC---------A--G---T---------A--GTC-----GCA--A-----CA---G---------T---A-----------G-TCC------CAGTA----------------------------GT---AG---T--A--G--C----A-GCA--------ATA---G-------CA-GT--A------tgaaataata
gi|2 : -GT---------A--G---T---------A--GAA-----GCA--T-----TA---G---------C---A--------------AGT-----TAGTA-----------------AT-----TGTGGT---AG---T--A--T--G----T-GTT--------GTA---A-------GT-GT--AC-----G-----T-----A---T---TG--TAGTA---GA----A-----GT---AAT-------------------------C----T------------TT----G-TA---GTAGC------AG---AAAT---A------GTT-----G----TA---G-T--A--AA-A-T------C-----Acca
gi|39 : tt---------A--A---T---------A--GTG-----GTA--A-----TA---G---------T---A-----------T-GAG------AGGTG-----------------GT-----T---GT---GG---T--A------------GTA--------GTA---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---G---AGA-TGGTG---GA----G-----GT---AGTA----G---TTGTTGTG--GT--GGT----T---G--------TC----G-TA---GCAGT------aatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|12 : ---------A--G---T---------A--GTA-----GTG--G-----TA---G---------T---G-----------G-TAG------CAGTA-----------------AT-----T---ATGACAG---T--G--G--A----T-GGG--------ATG---G-------TG-GT--A------G-----TC----G---G---TGG-TAGTGTT-GATGTTG-----GT---AGTG----G---T---------GT--AAA----T---G--------CT----GATA---GCGGT------AG---TGGT---G------GTT-----G----GG---G-C--G--TT-G-G------T-----GT--------T--------------------------------AGC---A----GT---GG----A---A----G-T-G-T--TG---A---------T-----GT--T------GG---T---A---G---TGG------T-------GTA------A--A-T-GTTG-----A-TAG
gi|46 : attgcttgtggtatttgtaaaactggtactggtactgattgtgttagtgccataggtata--G---T---------T--GTA-----ACA--------TA---G---------T---A-----------G-CAA------TTGTA-----------------GT-----T---GT---AG---T-------------A-GT---------GCA---G-------TG-GT--A------G-----T-----A---A---TAG-CAGTA---Gctgtagtgttggtggggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|42 : ---------A--GTA-----GCA--G-----TA---G---------T---A-----------G-TAG------TTGTA----------------------------GT---AG---T--A--T--C----A-GTA--------GCA---A-------TA-GT--A------------C-----A---A---TG--TAGCA---AA----A-----TC---AGTA----G---C------A--GT--A
gi|40 : aagaagtacttcg--GTA-----AAA--G-----TA---G---------T---A-----------T-TAA------TAGTT-----------------GT-----T---GT---GG---T--A--T--T----A-GTA--------ATA---G-------TA-GG--A------GT----T-----G---T---TAC--AGTA---GT----T-----GT---AGTT----GACAC------A--GT--AGT----T---G--------TT----G-TA---GTAGT------AG---T
gi|35 : A---G---------T---A-----------G-AAG------TAGT------------------------------T---AA---T--A--T--T----A-TTA--------TTA---A-------AA-GT--A------------T-----A---A---T---TAGTA---GA----A-----AT---AGAAAAAAG---A------A--GT--AGT----G---G--------AT----A-TA---GCAAT------AG---TAGC---A------GCA-----G----TA---T-T--GTTATTA-T------T-----AT--------T-A--T---A-----A---C----------T--AGT---A----GA---AA----T---A----a
gi|10 : aa---G---------T---A-----------G-TAG------AAGTA-----------------GG-----T---GT---AG---T--A------------GTT--------GTG---T-------TA-GA--A------G-----T-----A---G---T---TGG-A---GA----A-----GT---AGTA----A---C------A--G-------------------------------TA---GTGGT------GG---TGGT---A------GTA-----G----TA---G-T--G--AT-GAT------G-----ATGGTGGAGAT-A--T---A-----G---TGG--------T--AGT---A----GT---AG----A---A----G-T-A-G--TA---A---------T-----AG--T------AG---T---A---G---TGG------T------GGTG------GT-A------------A-TAGTCGT------------------------AGTAAT--T-----------GTG---G------C---G-G----T--G---GT---G-----G---TA----GT----AG----T----A---G---------TAG----TGTTG--G--TTGC-G----GT--T-G-TAG-TGGTGATGA-T---G-----A-TTA--NNN---NN---N--N-N-N------NNN---NNN------N------------NN---NNN-N---N--N---NN---N---N------NN------N---N---N---NNNN-N------N---NNNN---NNNNNN-N-NN--NNN-GGT---GG---TG---GT---GGT--G-CA----G--G--T-G----------G-TG-A------TA---GT------------A---GTAG-------------------------------TGGG-----AGTGGTG-----------GTG--GT---G-----GTG---G--AA-----ATAATA------GT---A---GT----AGAA---GAA---GTA-GT--AA----ATATA----GT---AGTAGCAGT--AGAAGTGGTT
gi|17 : tgatggtg---G---------T---A-----------G-TAG------CAGTA--------------------------------------T--A--T--A----ATGTA--------ATG---A-------CATGTT-A------G-----T-----A---A---TAA-AAAAA---GATAT-ATTGTTGT---AGTA----A---C------A--GT--AGT----T---G--------TC----A-TA---GTAGT------TG---TAGT---A------GTAAA---G----TA---G-T--A--GT----------------AA--------T-A--G---A-----A------------------GT---A----GT---AG----TT--A----A-A-G-T--TG---T---------G-----GT--T-------G---T---G---G---TAG------T------AGTA------GT-A-T-G--T-----A-TAATA--------A-TG---AT-----TA----TGAT--T-----------GAA---G------T---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----GT----AG----A----A---G---------TAG----TA-----gtggtgggtgtggtatta
gi|25 : gtagtagatgtagttgctgttgttttt---A-----------G-AAA------TAATG-----------------GT-----T---GT---GG---T--G------------GTG--------ATG---A-------TG-AT--G------G-----T-----G---A---TGG-TGGTG---GT----G-----GT---GGTA----A---T------A--A---AAT----T---A--------------G-TA---GTGGT------GGGCGTGGT---A------GTA-----G----AA---G-T--A-----G-T------A-----GT--------T---------------------------------GT---A----TT---AG----T---A----G-T-A-C--TA---G---------T-----AA--C------AG---T---A---A---TAT------T------AGTA------GT-A------------G-TAGCAGT---TA-A-AG---TA-----AT--AGTGGT--G-----------ATG---G------T---G-G----T--G---GT---A-----G---TA----TT----AG----C----A---G---------AAG----ttaaataaatattggatataatactagtagtatatgtagtcatatcagtaat
gi|34 : G------CAGTA-----------------GT-----T---GTT--AC---T--G--TTGA----A-ATA--------ATA---A-------TA-GT---------------T-----A---T---TG--TAGTA---CA----A-----GT---AGTT----A---T------T--AT--AGT----C---A--------TA----A-GA---GTAGT------AG---TAGT---A------GTA-----G----TA---G-TA-G--AA-G-T------T------T--------T-GGTT---G-----A-----------------AGT---A----GT---AG----T---
gi|15 : tagttgttAGTA-----------------TT-----T---GT---TA---T--A--T--T----A-G------------A---G-------TT-GT--T------G-----T-----T---G---TAC-TAGTA---GA----G-----GT---AGTA----G---T------A--TT--AGT----T---GAAGTAGTAAT----G-TA---GCAGC------AG---TAGT---ATTAGTTGTA-----G----TA---G-T--A--AT-G-T------A-----GT-----------------------A---G----------C--AGT---A----AT---AG----T---A----GTT-G-T--TG---T---------TGTAAGAT--CAGCAGTAG---T---G---G---TGGCGATTCT------AGTA------GT-A------G-----A--AGTAGT---AA-T-GG---TA-----AA--AGTAGA--T-----------GGA---G------T---A-G----T--A---GT---A-----T---TA----GT----AG----T----G---G---------Ttgttg
gi|43 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgatGTA-----------------GT-----T---GT---GG---T-----T--AC---G-GTG--------GTT---A-------CG-GT--G------G-----T-----G---G---TGG-TAGTA---GA----A-----GT---AGTA----G---C------A--GT--AG
gi|32 : ggtggtggtggtggttatgTG-----------------AT-----T---TT---AC---T-----T--A----A-GTT--------ATA---A-------AA-GC--A------G-----T-----G---G---TA----GTA---GC----A-----GT---AGTA----C---C------A--GT--AGT----A---A--------CT----G-TA---GCAAT------AT---CAGT---A------GCA-----A----TA---G-C--A--AT-A-C------CGGT--GC--------T-G--C---A-----A--------------C--AGT---A----AT---AT----C---A----T-T-A-T--TA---T---------T-----AT--tagta
gi|9 : tatgcagtatgagt-----T---GT---AG---C--A--G--T----A-GTA--------GTA---G-------TA-GT--A------G-----T-----A---G---TAC-TAGTA---AA----A-----GTTTCAGAA----G---C------A--GC--AGCAGTAT---A--------C-----A-TA---ATAGT------TA---TTGT---A------GTA-----G----TA---G-T--A--CT-G--------------GT--------T-G--T---AGCTGCA---G----------C--AAT---ATGT-GT---AG----C---A----G-T-A-T--TA---
gi|19 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataatgatgaT---AT---T--A--G--A----A-GTAG-------ACA---A--------A-GT--A------G-----C-----A---A---TA----------------------GT---AGTA----T---CATA---A--GT--AGC----A---T--------CA----G-TAGATGTAGT------AA---TGAT---A------GAA-----G----TG---G-G--A--GT-A-G------C-----AG--------T-AG-T---A-----A--------------C--AGC---A----GT---AG----C---C----A-A-A-G--CA---G---------T-----AG--C------AG---T---G---G---TAG------TATCAGAAGCA------GT-A-T-C--A-----A-TAGTGAC------------------------AGTAGA--T-----------GCA---G------T---A-G----T--A---gaagca
gi|31 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgtttagtattatcattatcattatT---AA---T--A--T--A----ATATA--------ATA---A-------AA-TC--A------A-----T-----ACAGG---CAC-CAGTA---AC----A-----GT---AGTA----G---A------A--GC--AGC----A---G--------C--------A---GAAGT------AA---TAAT---A------GTA-----A----TA---G-CA-G--AC-G-T-------------------------------------------------------AGT---A----GT---AA----T---A----a
gi|19 : gaaattattaataataaaa--A----A-GTA--------GCA---A-------TA-GT--A------G-----T-----ATC-A---TA---AGTA---GC----A-----TC---AGTA----G---A------T--GT--AG-----T---A--------AT----GATA---GAAGT------GG---GAGT---A------GCA-----G----TA---G-T--A--AC-A-G------C-----AG--------T-A--GCCAA-----A---G----------C--AGT---A----GC---AG----T---G----G-T-A-G--TA---TCAGAAGCAGT-----AT--C------AA---T---A---G---TGA------C------AGTA------G--A-T-G--C-----AGTAGTAgacatagacgtagatgta
gi|39 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgtttagtattatcattatcattattattagaagtagaca----A-GTG--------GTA---A-------TA-GT--ATGAGAGG-----T-----G---G---TTG-TGGTA---GT----A-----GT---AGTA----G---T------A--GTAGAGA----T---G--------GT----G-GAG--GTAGT------AG---TTGT---T------GTG-----G----TG---G-T------T-G-T------C-----GT--------a
gi|46 : aat-GTA--------ACA-----------TA-GT--A------G-----C-----A---A---TTG-TAGTT---GT----A-----GT---AGT-----G---C------A--GT--GGT----A---G--------TA----A-TA---GCAGT------AG---agcagt
gi|45 : gtt--------ATG---A-------AA-GT--A------G-----T-----A---A---TAG-TAGTA---GA----A-----AT---AGTA----G---T------A--GA--AAC--------------------------A---GTAGC------AG---TGAT---A------GAA-----G----TG---G-
gi|42 : cA-GA--A------G-----T-----A---C---TTC-GAGTA---GC----A-----GT---AGTA----G---T------A-----------------G--------TT----G-TA---GTAGT------AT---CAGT---A------GCA-----A----TA---G-TACA--AT-G-T------------AG--------C-A--A---A-----A---T----------C--AGT---A----GC---AG----T---A----ataagaata
gi|31 : a--A------G-----T-----A---A---CAG-TAGTA---GA----A-----GC---AGCA----G---C------A--GA--AGT----A---A--------TA----A-TA---GTAAT------AG---CAGA---C------GTA-----G----TA---G-T--A--AT-
gi|36 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacc--A------G-----T-----A---T---TAC-TAGTA---GT----A-----GT---AGTA----A---T------A--GT--AAA----A---G--------TT----G-TA---GTAGT------AT---TAAT---A------ATA-----ACCCTTA---G-T--A--AT-A-G------T-----A-----------A--C---A-----C---T----------T--AGT---A----GT---AG----agacatagacgtagatgta
gi|40 : aaaaaagttgGTA---AA----A-----GT---AGTA----T---T------A--AT--AGT----T---G--------TT----G-TG---GTATT------AG---TAAT---A------GTA-----G----GA---G-T------T-G-T------T-----A---------------------------------------C--AGT---A----GT---TG----T---A--------G-T--TG---A---------C-----A---C------AG---T---A---G---TTG------T------TGTA------GT-A------------G-TAGTAaagaagatgttataaca
gi|17 : -----GT---AGTA----G---A------T--GT--AGT----T---G--------CT----G-TT---GTTTT------TG---TAGT---A------GCA-----G----TAT--A-T--A--AT-G-T------A-----AT--------G-A--C---AT----G---T----------T--AGT---A----AT---AA----A---AAAAGA-T-A----TA---T---------T-----GT--T-------G---T---A---G---TAA------C------AGTA------GT---T-GT-C-----A-TAGTAGT---TG-T-AG---TAGT---AA--AGTAGT--A-----------GTA---A------T---A-G----A--A---GT---A-----G---TA----GT----TA----A----AGTTG---------TGG----TT-----G--TGGT-A----GT--A-G-TAG-T-------A-T---G-----T-ATA--ATA---AT---G--A-T-T------ATG---ATT------G------------AA---GTA-G---T--A---GT---A---G------TA------G---T---A---GAAG-T------A---GTA
gi|15 : T---ATTA----G----------A--GT--TGT----T---G--------TT----G-TA---CTAGT------AG---AGGT---A------GTA-----G----TA---T-T--A--GT-T-G------A-----AG--------T-AG-T---A-----A---T--------------GT---A----GC---AG----C---A----G-T-A-G--TA---T---------T-----A-----------G---T---T---G---TAG------T------AGTA---------A-T-G----------TAGTAGC--------AG---TA-----AT--AGTAGT--T-----------GTT---G------T---T-G----T--A--------A-----G----A----TC----AG----C----A---G---------TAG----TG-----G--TGGC-G----AT--T-C-TAG-T-------------------A-GTA--GAA---GT---A--G-T-A------ATG---GTA------A------------AA---GTA-G---A--T---GG---A---G------TA------G---T---A---GTAT-T------A---GTAG---TGGttaaataaatattggatataatactagtagtatatgtagtcatatcagtaat
gi|37 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgatagtatttgttaT---AGTA----G---C------A--AT--AA-----T---G--------------G-TA---GCCGT------GG---TGGT---A------GTA-----G----TT---G-T--T--AT-t
gi|41 : gttatcgttatcatcagcattagaagtgttggtac---AGCA----G---C------G--GC--AGC----G---G--------CA----G-TA---GCAGT------AG---TAGT---A------GTA-----G----CG---G-C--A--AT-A-T------CG----ATGGTAAA--T-A--T---A-----A---TGATG------C--AGT---A----GT---AG----TGA-A----A-T-A-A--TA---tttggttgttgttattgtac
gi|46 : cTA----G---T------A--GC--AAT----T---G--------TA----G-TT---GTAGT------AG---T-GC---A------GTG-----G----TA---G-T--A--AT-A-G------C-----AG--------T-A--
gi|41 : gttgtaaca---C------A--GC--AGC----G---G--------CA----G-CG---GCAGT------AG---CAGT---A------GTA-----G----TA---G-T--A--GC-G-G------C-----A-----------A--T---------A---T----------C--GAT---G----GT---A---------A----A-T-A-T--AA---T---------G-----ATG-C------AG---T---A---G---TAG------TGA----AATA------AT-A-g
gi|9 : ----T---G--------AT----G-TA---GCAGT------AG---TAGT---A------GTA-----G----TA---G-T--A--GT-A-C------T-----AG--------T-A--A---A-----AGTTT----------C--AGA---A----GC---AG----C---A----G-C-A-G--TA---TACA------T-----AA--T------AGTTAT---T---G---TAG------T------AGTA------GT-A-C-T--G-----G-TTGTAGC---TG-C-AG---CA-----A-----TATG--T-----------GTA---G------C---A-G----T--A---TT---A-----G---AA----GC----A
gi|27 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataatga----T---G--------TT----G-TT---GTATA------AG---TAAT---A------GTAGTGAGG----TA---G-TA-G--TT-G-T-------------T--------T-C--TG--A-----A---T----------G--AGT---A----GC---AG----T---A----G-T-A-G--TA-------------G-----AT--------------------------TGG------T------AAT--------T-G-T-G--G-------TTGTAGC---CG-T-AG---TA-----TA--AGTAGA--C-----------GTG---A------T-----G----T--A---GT---A---------TA----TT----AA----T----A---G---------TAG----TA-----G--TAGT-A----ATGAT-G-CAT-T-------A-C---A-----A-GCA--
gi|18 : tat---G--------TT----G-TA---GTAGT------AG---TTGT---A------ACG-----G----TA---G-T--G--AT-A---------------------------------G-----A---T--------------GT---A----GT---GGAAGTT---A----A-T-A-TGGTA---C---------T-----TG--C------AG---T---GGTAG---TGG------T------AACA------GTAA-T-G--ATAATTG-TAGTGGC---TA-T-GG---CA-----GA--GGTAGA--T-----------GT----G------T---A-A----T--T---GT---A-----G---TG----GC----------C----A---G---------TTG----TA-----G--TGAT-A----AT--T-G-TTG-T-------G-T---A-----A-GCG--GAC---GT---G--G-T-AGTGGTTGCT---GTA------C------------GATTTGTA-G---C--G---GT---C---A------TG------G---A---A---GTGG-T------AACTGTAG---TGGTGG-T-GT--A---TGT---TGTATTG---GT---GATA-G-CA----GTGG--T-gt
gi|42 : tgtgatg----G-TA---GCAGT------AG---TAGT---A------GTT-----G----TA---G-T--A--GT-A-T------C-----AG--------T-AG-C---A-----A---T-------------AGT---ACAATGT---AG----C---A----A-A-A-T--CA---G---------T-----AG--C------AG---T---tatatt
gi|25 : aagaagtacttcgaA---GAAAT------AA---TGGT---T------GTG-----G----TG---G-T--G--AT-GAT------G-----AT--------G-G--T---G-----A---TGGTGG-----T--GGT---G----GT---GG----T---A----A-T-A-A--AA---T---------T-----AG--T------AG---T---G---G---TGG-----------------------GC-G-T-G--G-------TAGTAG--------------AA-----GT--AGTAGT--T-----------GTA---T------T---A-G----T--A---GT---A-----C---TA----GT----AA----C----A----------------------------------------------G-TAA-T-------A-T---T-----A-GTA---------------------------GTA---GTA------G------------CA---GTT-A---A--A---GT---A---A------TA------G---T---G---GTGA-T------G---GTGG---TGGTAG-T-AT--T---AGC---AG---a
gi|20 : GT------GG---TGGT---G------GTA-----G----AA---G-T--A--AT----------------AG--------T-A--T---A------------------------GT---A----GT---AG----TAGCA----A-T-A-G--TA---G---------T-----AA--A------AG---TGACG---G---TGG------T------GATA------GT-A------------G-TAGTAG-------A-AG---AA-----AT--GGTGGTGGTGGTG-------GTA---G------T---A-G----T--A---GT---A-----G---TG----GT----GA----T----G---G---------TAA----CA-----G--TAGA-A----GT--A-G-TAG-T-------------------A-GTA--ATA---AC---G--G-T-G------GTG---ATATT----G------------TA---GTA-G---T--A---GT---A---G------TA------A---C---G---GTGG-TACAAGAA---GTAG---TAGTGG-A-AT------GGT---GG---TG---Gaag
gi|34 : gT------AG---TTGT---T------GCA-----G----TA---G-T------T-G-T------T-----AC--------T-G--T-------------T----------G--A-----A----AT---AA----T---A----A-T-AGT--TA---T---------T-----GT---------AG---T---A---C---AAG------T------AGT--------T-A-T------------TA-TAGT---CATA-AG---A-----------GTAGT--A-----------GTA---G------T---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----G-----AAGTTTT----G---G---------TTG----AA-----G--TAGT-A----GT--T-G-T
gi|19 : ---TGTT---A------CTA-----T----TA---T-T--G--AT----------------AT--------T-A--T---C-----A---T----------C--AGT---GTTATGTTT-AG----T---A----T-T-A-T--CA---T---------T-----AT--C------A----T--------------------T------ATTA------TT-A------G-----A--AGTAGA---CA-A-A-----------------------------------GTA---G------C---A-A----T--A---GT---A-----G---TA----TC----AT----A----A---G---------TAG----CA-----T--CAGT-A----GA--T-G-TAG-TA------A-T---G-----A--TA--GAA---GT---G--G-G-A------GTA---GCA------G------------TA---GTA-A---C--A---GC---A---G------TA------G---CCAAA---GCAG-T------A---GCAG---TGGTAG-T-AT--CAGAAGC---AG---TA---TC---AATA-G-TG----ACAG--TAG--ATGCA---G-TA-G------TA---tg
gi|13 : gtataatcactattataatcaatatattactgt---TAGT---A------ATA-----A----TA---G-A--G--AT-G-T------------AC--------T-AG-T---A-----G---T----------TGTAGTGAAA----GT---GG----T---A----G-C-G-T--TAG--T---------T-----GT---------AA---T---G---GAAATGG------T------AGTA------GC-AGT-G--G-----A-----ACA---CATA-AG---GG-----AATTTGTAGT--A-----------GTA----------C---ATA----T--A---GT---G-----G---TA----GT----GA----T----A---G---------TGG----TA-----G--CAGT-A----GT--T-G-TAA-T-------G-G---A-----A-ATG--GAA---GT---G--G-G-ACAC---GTA---AGG------G------------AATTGGTA-G---T--A---GT---AT--A------TA----------C---A---GTGG-T------A---GTGA---AAGGGG-T---------AGC---GG---TA---GT---TGTA-A-TG----GAAA--T-G--G--TA---G-TG-G------TT---GT-------------------GAAACATGTA--A-G---GG--A--------ATTGG---T-AGTAGTT--A--A----TGCA--GT---G-----GTA---G--TG-----ATAATG------GT---AGCGGT----AGTT---GTA---ATa
gi|17 : aacaataacatgatGT---A------GTA-----GATG-TA---G-TT-G--CT-G-T------T-----GT--------T------------------T----------T--TGT---A----GT---AG----C---A----G-T-A-T---A---T---------A-----AT----------------------------G------T------AATG------AC-A-T-G--T-------TAGTAAT---AA-A-AA---AA-----GA--TATA-T--T-----------GT------------------------------T---------G---TA----GT----AA----C----A---G---------TAGTTGTCA--------TAGT-A----GT--T-G-TAG-T-------------------A-GT---AAA---GT---A--G-T-A------GTA---ATA------G------------AA---GTA-G---T--A---GTTAAA---G------TT------G---T---G---GTTG-T------G---GTAG---TAGTAG-T-AT--G---TAT---AA---TA---AT---GATT-A-TG------AT--T-G--A---A---G-TA-G------TA---GT------------A---GTAGTAGAA-GTA--G---------T--------ATTA--AATAAATATTG--G--A------TA----------------------TA-----ATACTA------GT---A---GT----ATAT---GTA---GTC-AT--Ag
gi|9 : A---A-T--A--AT-G-T------C-----AT--------G-A--T---A-----A---TGATGATGTAGC--AGT---A----GT---AG----T---A----G-T-A-G--TA---G---------T----------------AG---T---A---C---TAG------T------AAAA------GT-T-TCA--G-----A--AGCAGCAG-CA-GTAT---AC-----AT--AATAGT--T-----------ATT---G------T---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----CT----GG----T----T---G---------TAG----CT-----G--CAGC-A----ATA-T-G-T-G-T-------A-G---C-----A-GT-----A---TT---A--G-A-A------GCA---tcagtaat
gi|23 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaa-T--G--AC-G-G------T-----AT--------T-G--T---A-----A---T----------T--ATT---T----GA---AA----T---A----G-T-A-T--GA---T---------T-----GTGGC------AG---T---A---G---TAG------T------AGTA------GT-A-G-G--A-----G-TAGTAGA---CG-G-AG---TA-----GT--GACGGT--G-----------ATA---G------C---A-GAAAATGGA---GT---A-----A---AA----GC----AG----A----A---A---------CAC----CA-----G--CAGC-A----GT--A-G-TAG-T-------A-A---T-----A-GTG--AAA---GT---A--A-A-G------G------TA------T------------AA---GTA-T---T--A---GT---AAACA------TA------G---C---A--------------------TAA---TGAAGG-T-G
gi|19 : --------T-A--T---A-----A---T----------C--ACT---A----TT---A-----T---A----A-TCA-A--TA---T---------------AT--T------AC---T---G---T---TGT------T------ACTA------TT-A-T-T--G-----A-TATTATC--------------A-----TC--AGT-GT--T-----------AT-----------------G----T------TT---A-----G---TA----TT----AT----C----A---T---------TAT----CA-----T--TA---------T--T-A-T---T-------A-G---A-----A-GTA--GAC---AA---A--G-T-A------GCA---ATA------G------------TA---GTA-T---C--A----T---A---AG-----TA------G---C---A---TCAG-T------A---G-----------A-T-GT------------AG---TA---AT---GATA-G-A-------AG--T-G--G--GA---G-TA-G------CA---GT------------A---GTAACAGCA-GTA--------GC--C--------A-AAGCAGT-AGCAGTG--G--T----AGTA--TC---A-----GAA---G--CA-----GTATCA------AT---A---GT-----------------GACAGT--AG----ATGCA----GT---AGTA
gi|15 : g--AGT---A----TT---TG----T---T----A-T-A-T--TAGAGT---------T-----------------G---T---T---G---TTG------T------ACTA------GT-A-G-A--G-----G-TAGTAGT------------------------ATTAGT--T-----------GAA---G------T---A-G----T--A---AT---------G---TA----GC----AG----C----A---G---------TAG----TA-----T--TAG--------T--T-G-TAG-T-------AGT---A-----ATGTA--G------T---A--G-C-A------GTA---ATA------G------------TA---GTT-G---T--T---GTTGTA---A------GA------T---C---A---GCAG-T------A---GTGG---TGGCGA-T--T--C--------------TA---GT---AGTA-G-AA----GTAG--T-A--A--TG---G-TA-A------AA---GT------------A---GATGGAGTA-GTA--G---------T--------ATTAGTAGT-a
gi|35 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgat--AGT---A----GT---------T---A----A-T-A-T--TA---T---------T-----AT-----------------------------------T------AAAA------GT-A-T-A--A-----T-TAGTAGA---AA-T-AG---AA-----AA--A---------------------A---G------A---A-G----T--A---GT---G-----GATATA----GC----AA----T----A---G---------TAG----CA-----G--CAGT------AT--T-GTTAT-T-------A-T---T-----A-TTA--TAA---CT---A--G-T-A------GAA---ATA------ggt
gi|40 : aaagtagaGT---A----AA---AG----T---A----G-T-A-T--TA---A---------T-----AG--T------TG---T---T---G---TGG------T------ATTA------GT-A------------A-TAGTAG----------G---AGTTGTTAC--AGTAGT--T-----------GTA---GTTGACAC---A-G----T--A---GT---T-----G---TT----GT----AG----T----A---G---------TAG----TA-----
gi|36 : ---------T-----AT--T------AC---T---A---G---TAG------T------AGTA------GT-A------------A-TAGTA-----------------------A--A--AGT--T-----------GTA---G------T---A-G----T--A---TT---A-----A---TA----AT----AA----CCCTTA---G---------TAA----TA-----G--TAAC-A----CT--TAG-TAG-T-------A-G---A-----A-G
gi|32 : aaaaaagttgag--C------AG---T---G---G---TAG------T------AGCA------G-----------------TAGTA-C---C----------A-----GT--AGTAAC--T-----------GTA---G------C---A-A----T--A---TC---A-----G---TA----GC----AA----T----A---G---------CAA----TACCGGTG--CTGC-A----AC--A-G-TAA-T-------A-T---aagatgttataaca
gi|42 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaag------AG---T---A---G---CAG------T------AGTA------GT-A------------G-TTGTAGT------------------------AGTATC--A-----------GTA---G------C---A-A----T--A---GT---ACAAT-G---TA----GC----AAAAT-C----A---G---------TAG----CA-----G--TAcattattattat
gi|39 : aagaagtacttcg------AA---T---A---G---TGG------T------AATA------GT-A-T-G--A-----G-AGGTGGT---T---------------------GTGGT--A-----------GTA---G------T---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----GA----GA----T----G---G---------TGG----AG-----G--TAGT-A----GT--T-G-TTG-T-------
gi|27 : G---T---T---G---TTG------T------ATAA------GT-A------------A-TAGTAGT---------G---AG-----GT--AGTAGT--T-----------GTT---T------C---T-G----A--A---TG---A-----G---TA----GC----AG----T----A---G---------TAG----TA-----GATTGGT-A----AT--T-G-TGGTT-------G-T---AGCCGTA-GTA--TAA---GT---A--G-A-C------GTG---AT-------G------------TA---GTA-T------A---TT---A---A------TA------G---T---A---GTAG-T------A---GTAA---TGggtggttgtcgtagcagt
gi|21 : tattG------C------AGT-------GT-A-T-C--A-----T-TAATAGC---AA-C-AG---TA-----TA--GATAGT--T-----------GTA---G------CAGAA-G----T--A---GT---A-----G---TA----GA----AA----T----A---ATACTACTACTAG----TA-----G--TAGT-A----AT--A-G-TAA-TA------A-T---AAT---A-ATA--ACA---AT---A--ATATA------ACA---ACA------T------------TA---GTA-G---A--A---GT---A---T------TA------atgcattacaagcagt
gi|46 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaa-----A-TAGTAGC--------------A-----AT--TGTAGT--T-----------GTA---G------T---A-G----TGCA---GT---G-----G---TA----GT----AA----T----A---G---------CAG----TA-----G--atattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|42 : gttgtaacAGTAGC--------AG---TA-----GT--AGTAGT--T-----------GTA---G------T---A-G----T--A---TC---A-----G---TA----GC----AA----T----A---G---------TA-----CAAT---G--TAGC-A----A
gi|47 : aagaagtacttcgAGTAGT---C-----G---CA-----AC--AGTAGT--C-----------C------------C---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----GC----AG----C----A---A---------TAG----CA-----G--TACC-A----aatcagtagcagta
gi|42 : agc---AA-----GA--AGTACT--TCGA--------GTA---G------C---A-G----T--A---GTAGTA-----G---TT----GT----AG----T----A---G---------TAT----CA-----G--TAGC-A----A-------TAG-T-------A-C---A-----ATGTAGCAAA---ATC--A--G-T-A------GCA---GTA------
gi|32 : A-----AA--AGCAGT--G-----------GTA---G------T---A-G----C--A---GT---A-----G---TA----CC----AG----T----A---G---------TAA----CT-----G--TAGC-A----A-----------T-------A-T---C-----A-GTA--GCA---AT----------A------GCA---ATA------
gi|40 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttatA-----AT--AGTTGT--T-----------GTG---G------T---A-T----T--A---GT---A-----A---TA----GT----AG----G----A---G---------TTG----TT-----A--CAGT-A----GT--T-G-TAG-T-------ccggtgctgcaacagtaatatcattattattat
gi|45 : gtaaaagtagtatt-----AA--AGTAGTAATA----------GTA---G------T---A-GAAA-T--A---GT---A-----G---TA----GA----AA----C----A---G---------TAG----CA-----G--tgacacagtagttgttgtagtagtagta
gi|47 : catg--AGCAGT--A-----------GTC---G------C---A-A----C--A---GT---A-----G---TC----CC----AG----T----A---G---------TAG----TA-----G--CAGC-A----AT--A-G-CAG-T-------A-tgatagaagtggataagaata
gi|20 : GTGGT--G-----------GTA---G------A---A-G----T--A---AT---A-----G---TA----------------T----A---G---------TAG----TA-----G--TAGC-A----AT--A-G-TAG-T-------A-A---A-----A-GTG--ACG---GT---G--G-T-G------ATA---GTA------G------------TA---GTA-G---A--A---GA---A---A------TG------G---T---G---GTGG-T------G---GTGG---TAGTAG-T---------AGT---AG---TG---GT---GATG-G-TA----ACAG--T-A--G--AA---G-TA-G------TA---GT------------A---GTAATAACG-GTG--G-T---GA--T--------ATT-GTAGT-AGTAGT-----------AGTA--AC---G-----GTG---GTACA-----AGA--A------GT---A---GT----AGTcca
gi|34 : ggtgTAGT--T-----------GTT---G------C---A-G----T--A---GT---T-----G---TT----ACTGTTGA---------A---A---------TAA----TA-----A--TAGT-T----AT--T-G-TAG-T-------A-C---A-----A-GTA--GTT---AT---T--A-T-A------GTC---ATA------A------------GA---GTA-G---T--A---GT---A---G------TA------G---T---A---GTAG-T------A---Gggaatggtggtgg
gi|28 : AGT--C-----------GTA---G------C---A-G----T--A---GT---T-----G---CT----GT----AG----A----A---G---------TAT----CA-----T--CAGC-ATAACAT--TAG-CAA-C-------A-T---T-----A-GCA--GAA-----------G-A-A------GCA---ACAACATCAG------------CA---GTA-G---C--A---GT---A---G------CT------G---C---A---ACAG-T------A---GTAA---TAGaagttttggttgaagtagtagttgttg
gi|32 : agcatcagcaatcgcaatcgcaatcatagtcacAGT--T-----------ATAAAAG------C---A-G----T--G---GT---A-----G---TA----GC----AG----T----A---G---------TAC----CA-----G--TAGT-A----AC--T-G-TAG------------------------------------------------------CA---ATA------T------------CA---GTA-GC--AATA---GC---A---A------TACCGGT-G---C---T---GCAA-C------A---GTAA---Taagt
gi|9 : tatgcagtatgagttgattttactta--T-----------GTA---G------C---A-G----T--A---GT---A-----G---TA----G-----------T----A---G---------TA-------------------------------G-TAG-T-------A-C---T-----A-GTA--AAA---GTTTCA--G-A-A------GCA---GCA------G------------CA---GTA-T---A--C---AT---A---A------TAGTTATTG---T---A---GTAG-T------A---GTAC---TGGT---T-GT------AGC---TG---CA---GC---AATATG-T--------G--T-A--G--CA---G-TA-T------TA---GA------------A---GCAatcattattattat
gi|31 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataatgatga-----------GTA---A------C---A-G----T--A---GT---A-----G---AA----GC----AG----C----A---G---------CAG----AA-----G--TAAT-A----AT--A-G-TAA-T-------------------A-GCA--GAC---GT---A--G-T-A------GTA---ATA------G------------AC---ATA-G---A--C---GT---A---
gi|41 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacca---G------C---A-G----T--A---GC---A-----G---TA----G-----------T----A---G---------TAG----TA-----G--CGGC-A----A---T-A-TCG---------A-T---------G-GTA--AAT---AT---AATG-A-T------GCA---GTA------G------------TA---GT--G---A--A---AT---A---A------TA------gatgta
gi|28 : cagcagcggcagcg---TA----GT----CA----C----A---G---------TCG----TA-----G--CAGT-A----GT--T-G-CTG-T-------A-G---A-----A-GTA---------TC--A--T-C-A------GCA----TA------A------------CA---TTA-G---C--A---AC---A---T------TA------G---C---A---GAAG-A------A---GCAA---CAACA-----T--C---AGC---AG---TA---GC---AGTA-G-CT----GCAA--C-A--G--TA---G-TA-A------TA---GA------------A---G
gi|31 : agcatcagcaatcgcaatcgcaatcaA----C----A---G-----------G----CA-----C--CAGT-A----AC--A-G-TAG-T-------A-G---A-----A-GCA--GCA---GC---A--G-A-A------GTA---ATA------A------------------TA-G-----------T---A---A------TA------G---C---AGACGTAG-T------A---GTAA---TAGt
gi|35 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaat----A---G---------TAG----AA-----G--TAGTTA----AT--A-T-TAT-T-------A-TTAAA-----A-GTA--TAA---TT---A--G-T-A------GAA---ATA------G------------AA---AAAAG---A--A---GT---A---G------TG------GATAT---A---GCAA-T------A---GTAG---CAGCAG-T-AT--T---Gacatagacgtagatgta
gi|23 : aa---G---------TGG----CA-----G--TAGT-A----GT--A-G-TAG-T-------A-G---G-----A-GTA--G------T---A--G-A-C------GGA---GTA------G------------------TG-A---C--G---GT---G---A------TA------G---C---A---GAA---------------AA---TGG-AG-T-AA--A---AGC---AG---AA---AC---ACCA-G-CA----GCAG--T-A--G--TA---G-TA-A------TA---GT-------------------GAA--A-GTA--A-A---GG--T--------ATAAG---T-ATTAGTA--A--A----CATA--GC---A-----ttattattattataactagtagaaata
gi|27 : tgacggtattgtaattatttgaaatagtatgattT--T-G-TTG-T-------A-T---A-----A-GTA--ATA---GT---AGTG-A-G------GTA---GTA------GTTGTTTCTGAATGA---GTA-G---C--A---GT---A---G------TA------G---T---A---G-AT-T------G---GTAA---TTGTGGTT-GT------AGC---CG---TA---GTATAAGTA-GACGTGATGTAG--T----A--TA---T-TA-A------TA---GT------------A---GTAGTAGTA-ATG--A-T---GCATT--------ACAAGCAGT-taatgaaggtg
gi|21 : tattg-TAG-T-------A-C---A-----T-GTA--AAATCTAT---A--T-A-A------ATA---TTC------A------------AA---GCA-GTGTATCA---TT---A---A------TA------G---C---A---ACAG-T------A----TA------------------------------------------GATA-G-TT----GTAG----------CA---G-AA-G------TA---GT------------A---GTAGAAATA-ATACTA-CT--AC--T--------AGTAGTAGT-AATAGTA--A--T----AATA--AT---A-----ATA---A--CA-----ATAATA------
gi|32 : ---AT---A--A-A-A------GCA---GTG------G------------TA---GTA-G---C--A---GT---A---G------TA----------C--------CAG-T------A---GTAACTGTAGCAA-T-AT--CAGTAGC---AA---TA---GC---AATA-C-CG----GTGC--T-GCAA--CA---G-TA-A------TA---taacaacattagtagaagtattaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|20 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttT---A--G-A-A------GTA---ATA------G------------TA----TA-G---T--A---GT---A---G------TA------G---C---A---ATAG-T------A---GTAA---AAGTGA-------------C---GG---TG---GT---GATA-G-TA----GTAG--T-A--G--AA---G-AA-A------TG---GT------------G---GTGG-------TG--G-T---GG--T--------AGTAGTAGT-AGTGGTG--A--T----GGTA--AC---A-----GTA---G--AA-----GTAGTA------GT---A---GT----AATA---ACG---GTG-GT---G----ATATT----GT---AGTAGT--------AGTAGTAACtcattattattat
gi|28 : ggtggtggtgg-A------GCA---ATC------G------------CA---ATC-G---C--A---AT---C---A------TA------G---T---C---ACAG-T------C---GTA------GCAG-TAGT--T---G-C---TG---TA---GA---AGTA-T-CA----TCAGCAT-A--A--CATTAG-CA-A------CA---TT------------A---GCAGAAGAA-GCA--A-C---AA--C--------ATCAGCAGT-AGCAGT-----------AGCT--GC---A-----ACA---G--TA-----GTAATA------GA---A---GT----ggtggtacaagaagtagtagtggaatggtggtgg
gi|41 : agcatc-A------GCA---GCG------G------------CA---GCG-G---C--A---GT---A---G------CA------G---T---A---GTAG-T------A---GTAG---CGGCAA-T-AT--C---GAT---GG---TA--------AATA----------TAA--T-G--ATGCA---G-TA-G------TA---GT-------------------GAAATA-ATA--
gi|15 : cA---GTA------G------------AG---GTA-G---T--A---GT---A---T------TA------G---T---T---GAAG-T------A---GTAA---T----G-T-AG--C---AGC---AG---TA---GT---ATTA-G-TT----GTAG--T--------A---G-TA-ATG----TA---GT------------A---GCAGTAATA-GTA--GTT---GT--TGTTGTAAGATCAGCAGT-AGTGGTGGCG--ATTCTAGTA--GT---A-----GAA---G--TA-----GTAATG------GTAAAA---GT----AGAT---GGA---GTA-GT--AGT---AT--------T---AGTAGTGGT--
gi|23 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgatagtatttgttatattagagttgttgttgtactA---GTA-G---T--A---GT---A---G------TA------G---T---A---GGAG-T------A---GTA-----GACGG-A-GT------AGT---GA---CG---GT---GATA-G-CA----GAAAA-T-G--G---A---G-TA-A-------A-----------------A---GCAGAAACA-CCA--G-C---AG--C--------AGTAGTAGT-AATAGTG--A--A----AGTA--AA---G-----GTA---T--AA-----GTATTA------GT---A---
gi|2 : tgacggtattgtaattatttgaaatagtatgattgtggcA---GTA-G---A--A---GC---A---T------TA------G---C---A-----AGTT------A---GTAA---TTGTGG-TAGT--A---TGT---GT---TGTAAGT---G-TA---CGTATTGTAG--T-A--G--AA---G-TA-ATCTTTGTA---GT------------A---GCAGAAATA-GTaacatagcataatgaaggtg
gi|43 : ttgtA---GTA-G---A--A---GT---A---G------TA------G---C---A---GTAG-T------A---GTAtgtagtaaaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|25 : ggtggtggtggtggttatggtagttgtggttacggtggttacggtggtggtggtA-G---A--A---AT---A---A------TG------G---T---T---GTGG-T------G---GTGA---TGATGA-T-GG--T---GAT---GG---TG---GT---GGTG-G-TG----GTAA--T-A--A--AA---T-TA-G------TA---GTGGTGGGCGTGGTA---GTAGAAGTA-GTA--G-T---TG--T--------ATTAGTAGT-ACTAGTA--A-------------------------CA---G--TA-----ATATTA------GT---A---GT----AGTA---GCA---GT---T--AA----A--------GT---AATAGTGGT--GATGGTGGT
gi|32 : ---A--A---GT---T---A------TA------A---A---A---GCAG-T------G---GTAG---TAGCAG-T-A--------------G---TA---CC---AGTA-G-TA----ACTG--T-A--G--CA---A-TA-T------CA---GT------------A---GCAATAGCA-ATA--C-CGGTGC--T--------G-CAACAGT-AATAggtagtattagcagaag
gi|9 : tatgcagtatgagttgattttactt---A--A---AT---A---A------TG------T---C---A--------T------G---ATAA---TGATGA-T-GTAGC---AGT---AG---TA---GT---AGTA-G-TA----GTAG--T-A--C--TA---G-TA-A------AA---GT------------T---TCAGAAGCA-GCA--G-C---AG--T--------AT--ACA-T-AATAGTT--A--T----TGTA--GT---A-----G-------------------TA------GT---A---CT----GGTT---GTA---GCT-GC--AGCAATATG-T----GT---AGCAGTtcattattattat
gi|18 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaga---GT---G---A------TG------G---T---T---GTAG-T------A---GTAG---T------T-GT------AAC---GG---TA---GT---GATA-G-AT----GTAG--T-G--G--AA---GTTA-A------TATG-GT------------ACTTGCAG---TG-GTA--G-T---GG--T--------AACAGTAAT-GATAATT--G--T----AGTG--GCTATG-----GCAGAGG--TAGATGTGTAATT------GT---A---GTGGCCAGTT---GTA---GTG-AT--AA----TTGTT----GTGTAAGCGGACGT--GGTAGTGGTTGCTGTAattagaagca
gi|41 : t---C---A---GCAG-C------G---GCAG---CGGCAG-T-AG--C---AGT---AG---TA---GT---AGTA-G-CG----GCA--------A--TA---T-CG-A------TG---GT--------------------AAATA--TA--A-T---G------------AT--GCAGT-AGTAGTG--A--A----Acgatttgtagcggtcatggaagtggtaactgtagtggtggtgtatgttgtattggtgatagcagtggttatatt
gi|44 : CAG-T------G---GCTT---TGGCGG-T-GA--CGATGGCGATGG---TG---GT---GGTG-G-TG----GTGG--T-G--A--CA-----TATT------TA---GC------------G---GTAGTAACA-GTtaata
gi|43 : a-T------G---GTAG---TTGTGG-T-TA--C---GGT---GG---TT---AC---GGTG-G-TG----GTGG--T-A--G--TA---G-AA-G------TA---GT------------A---GCAGTAGTA-GTA--ggtag
gi|32 : ggtggtggtggtggttaGC---AG---TG---GT---AGTA-G-CA----GTAG--T-A--C--CA---G-TA-G------TAACTGT------------A---GCAATATCA-GTA--------GC--A--------AT-AGCAAT-ACCGGT------------GCT--GC---A-----ACA---G--TA-----ATA
gi|41 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaaC---AG---CA---GC---GGCA-G-CG----GCAG--T-A--G--CA---G-TA-G------TA---GT------------A---GTAGCGGCA-ATA--T-C---GA--T--------GGTA--AAT--ATAATG--ATGC----AGTA--GT---A-----GT----G--AA-----ATAATA------tcattattattat
gi|9 : ---TG---AT---GAT--G-TA----GCAG--T-A--G--TA---G-TA-G------TA---GT------------A---GTAGTACTA-GTA--A-A---AG--T--------TTCAG-----------------A----AGCA--GC---A-----GCA---G--TATAC--ATAATAGTTATTGT---A---GT----AGTA---GTACTGGTT-GT--AG----CTGCA----GC---AATA--TG---TGTAGCAGT
gi|21 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaataatgtcatgataaATA-G-CA----ACAG--T----A--TA---GATA-G------TT---GT------------A---GCAGAAGTA-GTA--G--------------------TAGAAAT-AATACTA--C--T----ACTA--GT---A-----GTA---G--TA-----ATAGTA------AT---A---AT----AATattagaagca
gi|34 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagtgtatcattaAA--T-A--A--TA---G-TT-A------TT---GT------------A---GTACAAGTA-GT-------------T--------ATTA----T-AGTCATA--A--G----AGTA--GT---A-----GTA---G--TA-----GTAGTA------GT---A---GA----AGTT---TTG---GTT-GA--AG--------------T---AGTAGTTGT--TGaataacaataatataacaacattagtagaagtattaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|31 : tagttgttgcagtagttgttactgttgaaat--CA---G-TA-A------CA---GT------------A---GTAGAAGCA-GCA--G-C----------------AGAAGTAAT-AATAGTA--A---------TA--GC---A-----GAC---G----------TAGTA------GT---A---AT----AGAC---ATA---GAC-GT--AG----ATG
gi|27 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacA---G-TA-A------TA---GT------------A---GT-GAGGTA-GTA--G-TT--GT--T---------TCTG-AAT-GA--GTA--G--C----AGTA--GT---A-----GTA---G---A-----TTGGTA------AT---T---GT----GGTT---GTA---GCC-GT--AGT---ATA-----------AGTAGACGTGATGTAGTAta
gi|40 : tattgttgttgtata---G-TA-A------AA---GT------------A---GTATTAATA-GT-----T---GT--T------------GTGGT-ATTAGTA--A--T----AGTA--GG---A-----GTT---G--TT-----ACAGTA------GT---T---GT----AGTT---GAC---ACA-GT--AG----TTGTT----GT---AGTAGTAGT--tattaatagtagtagtagtaatgatgcattacaagcagt
gi|17 : -A------TT---GT------------T---GTAGTAACA-GTA--------GT--T--------GTCA-TAGT-AGTTGTA--G--T----AGTAAAGT---A-----GTA---G--TA-----ATAGAA------GT---A---GT----AGTT---AAA---GTT-GT--GG----TTGTG----GT---AGTAGTAGTA-TGTAa
gi|23 : gtagtagatgtagttgctgttgtttttgtagtagcagtatataatgtaatgacatgttagtaataaaaaaagatatTG--A-C---GG--T--------ATT-GTAAT-TAT-TTG--A--A----A-TA--GT---ATGATTGTG---G--CA-----GTAGTA------GT---A---GT----AGTA---GGA---GTA-GT--AG----ACGGA----GT---AGTGACGGT--GATAGCAGtaataatgattatgattgaagtagtagtagtagtagaagtagtattaaataaatattggatataatactagtagtatatgtagtcatatcagtaat
gi|37 : --------ATCAGCATT-AGAAGTG--T--T----GGTA--CT---A-----GTA---G--CA-----ATAATG------GT---A---GC----CGTG---GTG---GTA-GT--AG----TTGTT----AT---TTTGGTTGT--TGTaaaatggagtaaaagcagaaacaccagcagcagtagtagtaatagtgaaagtaaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|36 : gttatcgttatcAGTAGT-AATAGTA--A--A----AGTT--GT---A-----GTA---G--TA-----TTAATA------AT---A---AC----CCTTA--GTA---ATA-GT--A-----ACACT-----T---AGTAGTtattgtac
gi|40 : aaaaaagttgagtattactagtagtAGTATT-AATAGTT--G--T----TGTG--GT---A-----TTA---G--TA-----ATAGTA------GG---A---GT----TGTTACAGTA---GTT-GT--AG----TTGAC----AC---AGTAGTTGT--TGTAGTAGTagaagaagatgttataaca
gi|39 : gtaaaagtAAT-AGTGGTA--A--T----AGTA--TG---A-----GAG---G--TG-----GTTGTG------GT---A---GT----AGTA---GTA---GTA-GTAGAG----ATGGTGGAGGT---AGTAGTTGT--TGTGGTGGTTagta
gi|32 : AGTG-----------GTA--GT---A-----GCA---G--TA-----GTACCA------GT---A---GT----AACT---GTA---Ggtcgtagcagt
gi|36 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaagcTA--GT---A-----GTA---G--TA-----GTAATA------GT---A---AA----AGTT---GTA---GTA-GT--Acaatatcagtagcaatagcaataccggtgctgcaacagtaatatcattattattat
gi|28 : aaaaaagttgagtattacA--GC---A-----TCA---G--CA-----ATCGCA------AT---C---GC----AATC---ATA---GTC-AC--AG----TCGTA----GC---AGTAGTTGC--TGTAGAAGTttaataataacccttagtaatagtaacacttagtagtagaagaagatgttataaca
gi|36 : A---G--TA-----TTACTA------GT---A---GT----AGTA---GTA---ATA-GT--AA----AAGTT----GT---AGTAGTatcatcagcataacattagcaacattagcagaagaagcaacaacatcagcagtagcagtagctgcaacagtagtaatagaagt
gi|46 : aaaaaagttgATA------GT---A---GC----AATT---GTA---GTT-GT--AGTA--GTGCA----GT---GGTAGTAAT--AGCAGTAGattaataataacccttagtaatagtaacacttagtagtagaagaagatgttataaca
13 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTGAGTAGGTGGTGTTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGGTAGTGTAAATGGTGGTGGTGGTAGTAGCGGTGGTGGTGGTGGTAAACATTATGGTGGTAGTGACGAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAACGGTGGTTGTTATTGCGGCGGTGGTGAT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|29 ): GATAGTGGTGGTAGTGATAATGGTGGTGGTGATAGTGACGGAGATGGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGTGACAATGGTAGTGGTATGTGTAGTGGTTGTGGTGTGTTTGATAGTGGTAATGCTGGTGGTGGTGGT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Unaligned ( gi|38 ): GTAGTAGTAGTAGTAAAATAAGAATAAGTATTGGTGACAGTAGCAACATCACTAGCGGTATTATCAGTAGTGGTGGTTACAACAACAGAAGAAG
Alignments
lowQualScore : 222222 11 11111111 555555555555555555555 11111111111111111 3333333333333333333333 111111111111 22222222222222222 111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222222 333333333333333333333333333333 111111111 111 1111111111 1111111111 1111 11111 66666666666666666666666666 111 1111 444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 222222222222222222222222 4444444444444444444444444444 111111 3333333333333 111 111 111
lowQualScore : 888888 3 6 00 66 9999 6 1 6666 3 7777 666 22222222 55 777 666 000000000000000000000 666 44444444444444444 7777 9999999999999999999999 1 9999999 777777777777 2 888888 555 33 55555555555555555 22 44 777777777 444 444 444 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444 1 22 99999999999 5 0 33333333333 1 8888 0 2 4444 222222222222222222222222222222 33 2 1 1 33 66666 0 0 33 999999999 4 2 1 66 444 666 444 333 3 22 22 2 333 0 3 888888888 44 2 888888888 2 2 777777 2 5555 1111111111 7777777777 666666 444 555 6666 3 7 1 2 5555 8888 66 1 1 66666 4 777 66666666666666666666666666 1 111 777 1 777 2222 77 777 444444444444444444444444444444444444444444444 0 222222 1 222222 11 777 1 222222222222222222222222 777 666 66 1 66 8888888888888888888888888888 4 1 66 5 444444 66 5 66 2 5555555555555 5 777 000 6 888 1 99 6 444 444 2
lowQualScore : ...... . . .. .. .... . . .... . .... ... ........ .. ... ... ..................... ... ................. .... ...................... . ....... ............ . ...... ... .. ................. .. .. ......... ... ... ... ..... .............................................................. .... . .. ........... . . ........... . .... . . .... .............................. .. . . . .. ..... . . .. ......... . . . .. ... ... ... ... . .. .. . ... . . ......... .. . ......... . . ...... . .... .......... .......... ...... ... ... .... . . . . .... .... .. . . ..... . ... .......................... . ... ... . ... .... .. ... ............................................. . ...... . ...... .. ... . ........................ ... ... .. . .. ............................ . . .. . ...... .. . .. . ............. . ... ... . ... . .. . ... ... .
lowQualScore : 888888 0 7 00 99 0000 4 0 0000 6 5555 444 11111111 11 000 444 333333333333333333333 444 99999999999999999 7777 8888888888888888888888 0 3333333 333333333333 9 222222 000 99 11111111111111111 99 33 222222222 444 444 444 44444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222 0 66 55555555555 0 6 11111111111 8 3333 2 1 7777 333333333333333333333333333333 11 4 4 0 44 33333 5 9 44 999999999 0 4 0 44 111 888 111 999 1 88 88 3 555 8 6 000000000 77 0 000000000 0 0 222222 0 7777 2222222222 5555555555 444444 111 888 1111 6 3 0 3 7777 5555 11 6 5 22222 4 222 99999999999999999999999999 9 000 000 6 888 7777 99 888 111111111111111111111111111111111111111111111 3 888888 0 888888 66 888 6 888888888888888888888888 000 444 11 0 11 8888888888888888888888888888 4 0 11 0 444444 99 0 99 0 9999999999999 0 999 000 7 555 0 22 7 000 000 5
consensus : ATAGTAGT------ANAA-GTCGTAA--TAGTA---GTAATAGTAGTAGNAGTAGNA--GCA-GC---A---GTA--------GTNGTAGTAGTAGT---AGTAGTAGT---AGTAGTAGTGA---TGT-G-T--TATTAGCAG---TAGT---------A---G--TAA----TA--A-TAATTATT---------GGTAGTAG--TA---GT-------A--T-A-GT------AGTA---GT--A--A--GA--A-ATA---G-TAGCTGTAGCA---------G---TAGT---AGTAGCAGT---AGTAGTA--G--TAGTA---------G--------TTG----TAGT-A---A----A----------GT------TA--TA----GCAGTAGTAG--TAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGCAGCAGTT---GTNGC---AGTAGTAGTAGT---GGTAGTAG---TANT-GATGT-A-TTA---TT--ANCA--GTAG-TAGTAGTANTAGTAGC--ANTA--GTAGAAGTA--GTA-TG-ATAGTANCA-GTAGTAGNAGTAG---TNGNAGCAGT---AGTAGT---AGTAGNAGTAGTA--G--TAGTA---GTAGTTGTA---------GTANNA-GTAGT---------A-GTAGTA-GTAG---TAG-TAGTAGA---AGTAGTA----G---CAGT-AGNTGT---TGT------AGTAGTAGTAGTA---GTAGTA--GT----AAT-G-TTATTATAATCAGTA----GT--AGTAGTATTANTATAAGTAG-TG--GTAGTAGTAT--G--GATAGTAGC--AA-GTANTAGTAGTT---GTA---GTAGTAGTAGTAGCAGTAGTAGCAG---TAGC---AATTGTAGT---A---NAAGT------AGAA---------------GTAGN-------AGCA------GTAGCAGT------AGCAGTAATAGC---AGCAGTAGTAGTGGC----GGTGTC---GGCGG------TAGCGGTAGCGGCAGTA---GCA---GTAGTAGTAG--TAGNA--GCGGTAGCG-------NT-ATC--A----GC---AGTAG-TAGTGANA--GTAGTAGT-GGT------AGT--AGTA-GTA--GTAGT-N-----------G-TAGT--AGTAGA---TGC-TGTAGTAGTNGT--TG-TAG---TAGT---TGCTNTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGT------ATAA-GTCGTAA--TAGTA---GTAATAGTAGTAGNAGTAGNA--GCA-GT---A---GTA--------GTNGTAGTAGTAGT---AGTAGTAGT---AGTAGTAGTGA---TGTCA-T--TATTANCAG---TAGT---------A---G--TAA----TAT-A-TAATTATT---------GGTGGTAG--TA---GT-------A--T-A-GT------AGTA---GT--A--A--GA--A-ANA---G-TAGCTGTAGCA---------G---TAGT---AGTAGCAGT---AGTAGTA--G--TAGTA---------G--------TTG----TAGT-A---A----A----------GT------TA--TA----GNAGTAGTAG--TAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGCAGCAGCT---GTNGC---AGTAGTAGTAGT---GGTAGTAG---TANT-GATGT-A-TTA---TT--ANCA--GTAG-TAGTAATANTAGTAGC--ANTG--GTAGAAGTA--GTA-TG-ATAGTAACA-GNAGTAGAAGTAG---TTGAAGCAGT---AGTAGT---AGTAGCAGTAGTA--G--TAGCA---GTAGTTGTA---------GTANNA-GTAGT---------A-GTAGTA-GTAA---TAG-TAGTAGA---AGTAGTA----G---CAGT-AGCTGT---TGT------AGTAGTAGTAGTA---GTAGTA--GT----AAT-G-TNATTATAATCAGTA----GT--AGTAGTATTATTATCAGTAG-TG--GTAGTAGTAT--G--GATAGTAGC--AA-GNAANAGTAGTT---GTA---GCAGTAGTAGTAGCAGTAGTAGCAG---TAGC---AATTGTAGT---A---NAAGT------AGAA---------------GTAGN-------AGCA------GTAGNAGT------AGNAGTAATAGC---AGCAGTAGTAGTGGC----GGTGTC---GGCGG------TAGCGGTAGCGGCAGTA---GCA---GTAGTAGTAG--TAGNA--GCAGTAGCG-------NT-ATC--A----GC---AGTAG-TAGTGANA--GTAGTAGT-AGT------AGT--AGTA-GTA--GTAGT-T-----------G-TAGT--NGTAGA---TGC-TGTAGTAGTNGT--TG-TAG---TAGT---TGCTGTA
gi|1 : A---------G---TAGC---AACAGCAGT---AGTAGAA--G--CAGCA---------G--------C-G----AAAC-A---C----A----------GT-----------A----GAAGTAGCAG--TAGTAGCA-----------GAAGAGGTAGGAAAAGTATTT---GCAAC---AGAAATAGTAGT---AGCAGCAG-----CT-GA-------------------A--GTAG-TTGTAATATCAGCAGC--A--------GAAATA--GTAGTA-GTAGCAACA-GAAATAGTAGCAA---CAGAAGTAGT-----TA-T---AGTAGCAGCAGCA--G--AAGCA---GTAGCCGTA---------G---CA-GCAGC---------A-GGAGTA-GCCA---TAG-TAGCAGA---AG-------------CAGT-CGATGT---TTT-------GTTGTTATTGTA---CT-TTA--TT----GCT-G-TTGTTATA----GTA----GT--AGTACTAGTAGAAGAAGTAG-TA--GCAGCAGCAA--A--ATTACTAGC--AA--TATCAGCAGTTAAAGTA---GTAGTTGTAGTTACAGCAATAAAAA---TAG----AAT--AAGT---ATCTTCAGC------AAAA---------------GTAGT-------AGCA------GTGGTAGTTTCATCAGCATTAATAGA---AATAGTAGCAGCAGCAAAAGAAGTC-------G------TAGTAGTAGCACCAATA---GTA---GTAGTAG
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattAGTAGTAGCAGAAGAG-GTAGGAA--AAGTATTTGCAACAGAAATAGTAGTAGCA--GCA-GCTGAA---GTA--------GTTGTAATATCAGC---AGCAGAAAT---AGTAGTAG---------------TAGCAACAGAAATAGT---------A---G--CAA----CAG-A---------------------AGTAG--T-----T-------A--T-A-GT------AGCA---GC--AGCA--GA--A-GCA---G-TAGCCGTAGCA---------G---CAGCAGGAGTAGCCAT---AGTAGCA--G--AAGCA---------GTCGATGTTTTG----TTGT-T---ATTGTACTTTATTGCTGT------TG--TT----ATAGTAGTAG--TACTAGTA-----------GAAGAAGTAGTAGCAGCAGC------AAA---ATTACTAGCAAT---ATCAGCAG----------------------TT--AA-A--GTAG-TAGTTGTAGTTACAGC--AA-----TAAAAATA--GAA-TA---AGTATCT-TCAGCAAAAGTAG---T---AGCAGT---GGTAGTTTCATCAGCATTAATA--G--AAATA---GTAGCAGCA---------GCAAAA-GAAGT---------C-GTAGTA-GTAG---CAC-CAATAGT---AGTAGTA----GAT-CAGCGAAAT-T---TAT------AGTNNNNNNNNNN---NNNNNN--NN----NNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN----NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNNNN--N--NNNNNNNNN--NN-NNNNNNNNNNNN---NNN---NNNNNACT-GTCACAGCA---GCAG---TA-T---AA---TAGT---A---TAAGTACA---AGAA---------------GTAGC-------AGCC------GCAGCNNN------NNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN---NNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN---NNNNNNNNNN--NNNNNNTGTTGTTGTG-------GT-GAT--A----GT---AGTAG-TAATAGAA--GTAGTAGT-GGTGTTTGAAAT--AGTA-ATA--GTGGTATTAATATAAATAG-TAGT--AGTAGA----ACATGGAGCAGTAGT--TT-TAG---TAAT---atcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagc-GTTATAG--TAGTA---GTACTAGTAGAAGAAGTAGTA--GCA-GC---A---GCA--------AAATTACTAGCAAT---ATCAGCAGTTAAAGTAGTAGT-----TGTAG-T--TA----CAG---CAAT---------A---A--AAA----TAG-AATAAGTATCTTCAGCAAAAGTAGTAG--CA---GT-------GG-T-A-GTTTCATCAGCA---TT--A--ATAGA--A-ATA---G-TAGCAGCAGCAAAAGAAGTCG---TAGT---AGTAGCACC---AATAGTA--G--TAGTA---------G--------AT-----CAGCGA---A----A----------TT------TA--TA----GTNNNNNNNN--NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN---NNNNNNNNNNNN---NNNNNNNN---NNNN-NNNNN-N-NNN---NN--NNNN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTCACAGCAGCA--GTA-TA-ATAGTATAA-GTACAAGAAGTAG---CAGCCGCAGC---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNN--N--NNNNN---NNNNNNNNN---------NNNNNN-NNNNN---------N-NNNNNN-NNNN---NNN-NNNNNNN---NNNNNNN----N---NNNT--GTTGT---TGTGGTGATAGTAGTAGTAATA---GAAGTA--GT----AGT-GGTGTTTGAAAT-AGTA----AT--AGTGGTATTAATATAAATAG-TA--GTAGTAG--------------AAC--AT-GGAGCAGTAGTT---TTA---GTAATATTAGTAGTTGTAGTATTAG---TAGC---AATTGTCGTTGTA---CAAGTTTTCGTATAA---------------ATATTTTTTTTTAG-A------GTAGTAGT------AACAGTAAAAGA---AGAAGTAGTTATAAC----AG---C---AGCAG------TAGTAGTAGTAATATTA---TTA---TTAGTAGTAATTTAATA--GTAGTAG------------A----A----GT---TGTTG-T--TGATATGGTTGTTGT-TGT------AAT--AGTA-GTA--GAAGT-G-----------G-TGGT--AGTAattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttGCAG--CA---GT-------A--T-A-AT------AGTATAAGT--ACAA--GA--A-GTA---G-CAGCCGCAGCN---------N---NNNN---NNNNNNNNN---NNNNNNN--N--NNNNN---------N--------NNN----NNNN-N---N----N----------NN------NN--NN----NNNNNNNNNN--NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTGTTGTT---GTGGTGATAGTAGTAGTAAT---AGAAGTAG---TAGT-GGTGT-T-TGA-------AATA--GTAA-TAGTGGTATTAATATA--AATA--GTAGTAGTA--G-----------AACATGGAGCAG---TAG---TTTTAGTAAT---ATTAGT---AGTTGTAGTATTA--G--TAGCAATTGTCGTTGTACAAGTTTTCGTATAA-ATATTTTTTTTTAGA-GTAGTA-GTAA---CAG-TAAAAGA---AGAAGTA----G-------------T---TAT------AACAGCAGCAGTA---GTAGTA--GT----AAT-A-TTATTAT------TA----GT--AGTAAT-TTA--AT-AGTAG-TA--GAAGTTGT-T--GTTGAT--------------ATGGTTGTT---GTT---GTAATAGTAGTAGAAGTGGTGGTAG---TAAN---NNNNNNNNN---N---NNNNN------NNNN---------------NNNNN-------NNNN------NNNNNNNN------NNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNN---NNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN---NNAGTAATGG--TAATG--TTGATAGTG-------TTAATCGTA----GCATAAGTAG-TAGAGGAA--GTAGTGGT-AGT------AGT--AGTT-GTA--GTAGA-A-----------G-CATA--AGCAGAATTTTT-TGCATTAGTAGT--TG-CAG---TAGTATGTGTTGTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacaTGGTAGTAGAAGTAGGT--GTA-GT---A---GTT--------GTGTTAGAAGTAGTTGGAGAAGTAGT---AACAGTAGTGG---TGG---------TGGTAG---TAGT---------A---G--TGA----TG--A-TGAT-------------GGTGG-AG-------AT-------A--T-A-GT------GGTA---GT--A---------------------------------------------GT---AGAAGTAGT---AATAGTA--G--TAGTG---------G--------TGG----TGGT-A---AT---A----------GT------CG--TA----GTAATTGTGG--CGGTGGTG-----------G---TAGTAGTAGTAG----T---GTTG--------GTTGCGGT---TGTAGTGG---TGAT-GATG--A-TTA---NN--NNNN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNN--NNN-NN-NNNNNNNNN-NNGGTGGTGGTGG---T----GCAG-----GTGGT---GATAGTAGTAGTG--G--GAGTG---GTGGTGGTG---------GTGGAA-ATAAT---------A-GTAGTA-GAAG---AAG-TAGTAAATATAGTAGTA----G---CAGT-AGAAGT---GGT------TGTGGTGGGTGTG---GTATTA--agtgtgcgtattgtattagagg
gi|12 : tgatggA---GTA---GTAGTGGTAG--TGGTA--GCAGTA--A-------TT-ATG--A-----C---AGTGGATGG-GATG--GTGGTAGTCGGT------GGT--AGTG-TTG--AT-GT-TG----------G-TAGTGGTGTAAA---TGC-TG--ATAGCGGT--AG-TGG---TGGT---TG
gi|13 : attgcttgtggtatttgtaaaactggtactggtactgattgtgttagtgccataggtataTAGTA-------ATAATAGA--GATGTACTAGTAGTT---GTA---GTGAAAGTGGTAGCGTTAGTTGTAA---TGGA---AATGGTAGT---A---GCAGT------GGAACACATAAGGGAATTTGTAGT-------AGTACATATAGTGGTAGT------GATAGTGGTAGC---AGTAGTTGTAATGGA----AATGGA---AGTGGGACACGTAAGGGAATTGGTAGTA---GTATATACAGTGGTAG--TGAAA--GGGGTAGCG-------GT-A---------------GTTG-TAATGGAA--ATGGTAGT-GGT------TGTGAAACATGTAAGGGAAT-T-----------GGTAGT--AGTTAA---TGC-AGTGGTAGTGATAATGGTAGCGGTAGT---TGgggcgttggtgttagcagtggaagtgttgatgttggtagtggtgtaaatgttgatagctgtagtgttggtggggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgatT---GATAGTATCATTATT-GTTGT-AATTA---TC--ATCA--TTAT-TACTATTATCTATACC--GATA--GTATTTGTT--ATA-TT-AGAGTT----GTTGTTGTACTAG---TAGAGGTAGT---AGTATT---AGTTGAAGTAGTAATG--TAGCA---GCAGT---A---------GTAT----TAGT---------T-GTAGTA-GTAA---T-G-TAGTAGC---AGTAATA----G---TAGT-TGTTGT---TGT------AAGATCAGCAGTA---GTGGTG------------G-CGATTCTAGT-AGTA----GA--AGTAGTAATGGTAAAAGTAGATGGAGTAGTAGTAT-------TAGTAGtaatg
gi|15 : gctattagttgttataattataactacttaaatTAG---TATTTGTTAT-A-TTAGAGTT--GTTGTTGTAC-TAGTAGAGGTAGTAGT--ATTA--GTTGAAGTA--GTA----AT-GTAGCA-GCAGTAGTATTAG---TTGTAGTAGT---AAT-GT---AGTAGCAGTAATA--G--TAGTT---GTTGTTGTA---------AGATCA-GCAGT---------A-GTGGTG-GCGATTCTAG-TAGTAGA---AGTAGTA----A---TGGT-AAAAGTAGATGG------AGTAGTAGTATTA---GTAGTG--GT----tggt
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgaGTAGTAGA---TGTAGT--TGC---TGTTG-T--TTTT----G---TAGT---------A---G--CAG----TAT-A-TAAT-----------------GTAA--TG---AC-------A--T-G-TT------AGTA---AT--A--A--AA--A-A--------AGATATATT----------G---TTGT---AGTAACAGT---AGTTGTC--A--TAGTA---------G--------TTG----TAGT-AGTAA----A----------GT------AG--TA----GTAATAGAAG--TAGTAGTT-----------AAAGTTGTGGT---------T---GTGGT---AGTAGTAGTA-T----GTA-TAA---TAAT-GAT-T-A-TGA---TTGAAGTA--GTAG-TAGTAGTAGAAGTAGT--ATTA--A-ATAAATATTGGA-T--ATAATACTA-GTAGTATATGTAG---TCATATCAGT---AAT
gi|18 : GTTGTAG--TAGTAGTT-----------GTAACGGTAGTGATAGATGTA---GTGGA---AGT--TAATA-T---GGTACTTG---CAGT-G--GT-A-GTG---GT--AACA--GTAA-TGATAATTGTAGTGGC--TATG--GCAGAGGTA--G-A-TG--T-GTAATT-GTAGTGGC--CAG---TTGTAGTGAT---AATTGT---TGTGTAAGCGGAC--G--TGGTA---GTGGTTGCT---------GTACGA-TTTGT---------A-GCGGTC-ATGG---AAG-TGGTAAC---TGTAGTG----G---TGGT-GTATGT---TGT------ATTGGTGATAGCA---GTGGT
gi|19 : tgtgatgTACTA--TT----ATT-G-ATATTATCATCAGTGTTATGTTTAGTATTATCATTATCATTAT-TA--TTAGAAGTA------GA------C--AA-A--------------GTA---GCAATAGTAGTATCATAAGTAGCAT---CAGT---AGATGTAGT---A---ATGAT------AGAA---------------GTGGG-------AGTA------GCAGTAGT------AACAGCAGTAGCCAAAGCAGTAGCAGTGGT----AGTATCAGAAGCAG------TATCAATAGTGACAGTAGATGCA---GTAGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgtGTAGT---AGAAGCATTAGCA--AGTTAGTA---ATTGTGGTA---------GTATGT-GTTGT---------AAGT-GTACGTAT---T-G-TAGTAGA---AGTAAT----------------CT-T---TGT------AGTAGCAGAAATA---GTTGTA--GT----AAa
gi|20 : ttGTGGTGGTGGTAGAA--GTA-AT---A---GTA------------TAGTAGTAGT---AGCAATAGT---AGTAAAAGTGA---CGGTG-G--TGATAGTAG---TAGT---------A---G---AA----GAA-A-TGGTGGT----------GGTGGTGG--TA---GT-------AG-T-A-GT------AGTG---GT--G--ATGGT--A-ACA---G-TAGAAGTAGTA---------G---TAGT---AATAACGGT---GGTGATATTG--TAGTA---------G--------TAG----TAGT-A---AC---G----------GTGG----TA--CAAGAAGTAGTAGTGGAATGGTGGTG-----------Gaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : g---TAGT---------ACATG--TAAAATCTAT-A-TAAATATT---------CAAAGCAG--T----GT-------A--TCA-TT------AATA---GC--A--A--CA--GTATA---GATAGTTGTAGCA---------GAAGTAGT---AGTAGAAAT---AATACTA--C--TACTA---------G--------TAG----TAGT-A---A----------------------------------TAGTAATAA--TAATAATA-----------ACAATAATA-TAACAACATTA---GTAGA---AGTATTAATATTAAAGTTGGAAA---TACT-GATTTGA-TTA---GT--A
gi|21 : A----GCAGT-GTAT--CATTAATA-----------GCAACAGTA-TAG--ATAGTT---GTAGC---AGAAGTAGTAGT---AGAAATAA---TACT-----------A---CT--ACTA--GTAG-TAGTAATAGTAATAAT--AATA--ATAACAATA--ATA-TA-ACA---ACA-TTAGTAGAAGTAaacgtgtcagta
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaa-TA-ATAGCAACA-GTA-TAGA--TAG---TTGTAGCAGA---AGTAGT---AGTAGAAATAATA--C--TACTA---CTAGTAGTA---------GTAATA-GTAAT---------A-ATAATA-ATAA---CAA-TAATA-------TAACA----A---CATT-A---------GT------AGAAGTATTAATA---TTAA-A--GTTGGAAAT-ACTGATT-TGATTAGTA----ttaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagtgtatcatTATTGTAATTAT-TT--GAAATAGTAT--G---ATTGTGGC--A--GTAGTAGTAGTA---GTA---GGAGTAGTAGACGGAGTAGTGACGGTGATAGCAGAAAATGGAGT---A---AAAGC------AGA------------------AAC-------ACCA------GCAGCAGT------AGTAGTAATAGT---GAAAGTAaacgtgtcagta
gi|23 : tgacggGAAATA--GTA-TG-ATTGTGGCA-GTAGTAGTAGTAG---TAGGAGTAGT---AGACGG---AGTAGTGACGGTG--A--TAGCA---GAAAATGGA---------GTAAAA-GCAGA---------A-ACACCA-GCAG---CAG-TAGTAGT---AATAGTG----A---AAGT-AAA-GG---TAT------A--AGTATTAGTAAACATAGCA---T----AAT-G-aaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|25 : tgacggtattgtaattattt--GTGG-TGGTGATGATGATGGT--GATG--GTGG---TG--GT---G-GTGGTAATA-AAATTAGTAGTGG---TGG--GC-GT---GGTAGT---AGAAGTAGTAGTT--G--TATTA---GTAGTACTA---------GTAACA-GTAAT---------A-TTAGTA-GTAG---TAG-CAGTTAA---AGTAATA----G---TGGT--GATG-----GT------GGTGGTAGTATTA---GCAGAA--Gaaggtg
gi|27 : agaaataatggttGTTG--TT---GT-------A--T-AAGT------AATA---GT--A--GT-GA--G-GTA---G-TAGTTGTTTCT---------G---AATG---AGTAGCAGT---AGTAGTA--GATTGGTA---------A--------TTG----TGGT-----------------------------TG--TA----GCCGTAGTA---TA--AGTA-----------GACGTGAT-GTAGTA-------------------TATTAATAGT---AGTAGTAG---TAAT-GATGC-A-TTA---CA--AGCA--GT
gi|28 : tattA----GCATCAGCAA--TCGCAATC-----------GCAATCATAGT--CA-CAGTC---GTAGC---AGTAGT-----T---GCT-GTA---------GAAGT-A-TCA---TC--AGCA----------TAACATTAGCAAC--ATTA--GCAGAAGAA--GCA----ACAACATCA-GCAGTAGCAGTAG---CTGCAACAGT---AGTAAT---AGAAG
gi|3 : ATAGTAGT------ATAA-GTCATAA--TAGTA---GTAATAATAGTAGAAGTAGAA--GCA-GC---A---GCA--------GCTGTAGCAGTGGT---AGTAGTGGT---AGTAATAGTGA---TGTCA-T--TATTATCAG---TAGT---------A---G--TAA----TATTA-TAATCATT---------GGTGGTAG--TA---GT-------A--TGA-AT------AGTA---GCCAA--A--GA--A-AAA---G-TAGCTGTAGCA---------G---TAGT---AGTAGCAAC---AGTAGCA--G--CAGCA---------A--------TTG----TAGT-AT--A----A----------GT------TA--TA----AAAGTAGTAA--TAATAGCA-----------GAAATAATAGCAGCAGCAGCT---GTTGC---AGTAGTAGTAGT---GGTAGTAG---TACT-GATGTCA-TTA---TT--ATCA--GTAG-TAGTAATATTATTAGC--ATTG--GTGGAAGTA--GTA-TGGATAGTAACA-GAAGTAAAAGTAG---TTGAAGCAAT---AGTAGT---AGTAGCAACAGTA--G--CAGCA---GTAATTGTA---------GTATAA-GTAAT---------A-ATAGTA-GTAA---TAC-TAGTAGA---AGTAGTA----G---CAGC-AGCTGC---TGT------AGCAGTAGTGGTA---GTAGTA--GT----GAT-G-TCATTATAATCAGTA----GT--AGTAATATTATTATCAGTGG-TG--GTAGTAGTAT--G--GATAGTAGCCAAA-GAAAAAGTAGTT---GTA---GCAGTAGTAGTAGCAACAGTAGCAG---CAGC---AATTGTAGT---A---TAAGT------AAAA---------------ATAGA-------AGCA------ATAGAAGT------AGAAGTAATAGC---AGCAGTAGTAATGGC----GGTGTC---GGCGG------TGGCGATAGCGGCAGTG---ACA---GTAATAGTAG--CAGAA--ACAGTAACG-------CT-ATC--A----GC---AATAA-TAGTGAAA--GTAGCAGC-AGC------AAT--AATA-GTA--GTAGT-T-----------G-TAGT--CGTAGA---TGC-TGTAGTAGTTGT--TG-TAG---TAGT---TACTTTAt
gi|31 : AATTATT---------AATAATAAAATA---AT-------A--T-A-AT------A-TA---AT--A--A--AATCA-ATACAGG-CACCAGTAACA---------G---TAGT---AGAAGCAGC---AGCAGAA--G--TAATA--------------------A----TAGT-A----------------------------A--TA----GCAGACGTAG--TAGTAATA-----------GACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaCA---GTAACAGTAG--TAGAA--GCAG-----------------C--A----GC---AGAAG-TAATAATA--GTAATAGC-AGA------CGT--AGTA-GTA--ATAGA-C-----------A-TAGA--CGTAGA---TGatgta
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacGCA--G--TATGA---------G--------TTGATTTTACT-T---A----A----------GT------TA--TA----AAAGCAGTGG--TAGT---A-----------GCAGTAGTACCAGTAGTAACT---GTAGC---AATATCAGTAGC---AATAGCAA---TACC-G--GT-G-CTG----C--AACA--GTAA-TATCATTATTATTAta
gi|32 : tatAGTT---ATAAAAGCAGTGGTAGTAGCAGTAGTACCAG---TAGT---AACTGTAGC---A---A---T------ATCA---------------GT----------AGCA------ATAGCAAT------ACCGGTGCT-GC---AACAGTAATAt
gi|34 : tatgcagtatgagttgattttactta-TAGTTGTTGCA---------G---TAGT---TGTTACTGTTGAAATAATA--A--TAGTT---------A--------TTG----TAGT-AC--A----A----------GTAGTTATTA--TA----GTCATAAGAG--TAGTAGTA-----------G---TAGTAGTAGTAGAAGTTTTGGTTGA---AGTAGTAGTTGT---tcattattattat
gi|35 : A--G--TAGAA---GTAGTT--A---------ATATTA-TTATT---------A-AAAGTA--TAA---T---TAGTAGA---AATAGAAAAAAG---AAGT-AGTGGA---TAT------AGCAATAGTAGCA---GCAGTATTGT----TATTA-TTATTATAACTAGTA----GA--AATAtg
gi|35 : aaTAA--AAGTA----TAAT--TAGTAGAAATAGAA--AAAAGA---A---GTA--------GTGG--ATA-TAGC---AATAGTAGC---AGCAGTATTGT---TATTA-T--TATTATAAC---TAGT---------A---G--AAA----TA
gi|36 : aaagtagaagtagttaatattattatA--------GTATTACTAGTAGT---AGTAGTAAT---AGTAAAAGT-----TGT-------------AG---TAGT---------A---T--TAA----TA--A-TAACCCTT---------AGTAATAG--TA---AC-------ACTT-A-GT------AGTA---G---A--A--GA--A-
gi|37 : aaaaaagttg-ATC--A----GC---ATTAG-AAGTGTTG--GTACTAGT-AGC------AAT--AATG-GTA--GCCGT-G-----------G-TGGT--AGTAGT---TGT-TATTTTGGTTGT--TG-Tgatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcGTAG--TA---GT-------AG-T-A-GT------AA-A---AT--A--A--GA--A-TAA---G-TATTGGTGACA---------G---TAGC---AACATCACT---AGCGGTA--T--TATCA---------G--------TAG----TGGT----------G----------GT------TA--CA----ACAACAGAAG--AAGtattgtac
gi|39 : AAT---AGTGGTAATAGTA--T--GAGAG---GTGGTTGTG---------GTAGTA-GTAGT---------A-GTAGTA-G-------AGATGGTGGA---GGT-------------AGT-AGTTGT---TGT------GGTGGTTGTCGTA---GCAGT
gi|40 : GTAAAAGTAGTA--T--TAATA---GTTGTTGTG---------GTATTA-GTAAT---------A-GTAGGA-GTTG---TTA-CAGTAGT---TGTAGTT----GACACAGT-AGTTGT---TGT------AGTAGTAGTA
gi|41 : CAG------CAGCGGCAGCGGCAGTA---GCA---GTAGTAGTAG--TAGCG--GCAATATCGATGGTAAAT-ATA--ATGATGC---AGTAG-TAGTGAAA---TAATA
gi|42 : AGAAGTAC---TTCGAGTAGC---AGTAGT---AGTAGTTGTAGTA--G--TATCA---GTAGCAATA---------GTACAATGTAGC---------A-AAATCA-GTAG---CAG-TA
gi|43 : aGTGGTGGTGGTG--G--TTATG---GTAGTTGTG---------GTTACG-GTGGT---------T-ACGGTG-GTGG---TGG-TAGTAGA---AGTAGTA----G---CAGT-AG
gi|43 : gTGGTAGTTGT----GGTTAC---GGTGG------TTACGGTGGTGGTGGTA---GTA---GAAGTAGTAG--CAGTA--GTAGTAtagta
gi|45 : ggtggtggtggtggttaA--TG----AAAGTAGTAA--TAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGAAACA------GTAGC---AGTGATAGAAGT---GG
gi|46 : c-GTTGTAACATAGTA---GCAATTGTAGTTGTAGTAGT---GCA-GT---G---GTA--------GTAATAGCAGTAGataagaata
gi|47 : AGCAGTAGTC--GCA-AC---A---GTA--------GTCCCAGTAGTAGT---AGCAGCAAT---AGCAGTA
gi|5 : ATAGTAGT------AGAA-AT---AA--TAGTA---ATAATAGTAGTGGTGGTGGTATGGTA-GT---ACTTGTAATATTATGGTGGTGGTAGTAGT---AGTAGTTGT---AGTAGTAGTGA---TG--A-TGGTGTTAGAAG---TAGTCGAGGTGGTG---G--TGA----TG--A-TAATGAT----------GGTGGTGG--TA---GT-------G------GT------AGTA---GT--A--A---------TA---G--AGGTNNNNNN---------N---NNNT---AATAGAGGT---AGTAGTA--G--TA---------------------TTGA---TAG------A----A----------GT-----------A----GCAGTAGTAG--TGGTGGTA-----------GTTATAGTATTAGTAATGGTT---GTGGA---AGAAGTATAAGT---GTTGGTGA---TTGT-GGTGT----TA---GT---TTA--GTAG-TAGTAGTAATTGTGGC--AGTG--GTAGAAGTA--GTAATG-GTAGTGGTA-GCAATAGAAGTAGCGATTG--GTGATTTAAGTA-T---AGTAGAAGTAGTA--G--TATAA---TTGGTTGTG---------GTAGTA-GTAGT---------A-ATAGTA-GTAT---TAT-TAGTAGT---GGTAGTG----G---CAGT-AGTTGT---TGT------GGTGGCGGTGATA---GAAGTA--CT----AAT-G-GTGGTGTTGGCTGTG----GT--AGTAGTAGT------AGTGG-TG--GTGCTGGTGTTAG--TATAGT------A-GTATTAGT-GTTG--GTG---GTGGTGGTGGTGGcca
gi|7 : --TAGTA---GTAAAAGGAGTAAAAGTAGCA--GTA-GA---A---GAA--------GTAGAAATAAGAA----AATAGTTTT---TGCAGCAGTAAAAGTATCACT--TAT-AGCAG---CAGA---------A---GCGTAA----TA--A-GAAGTACT---------GACAGAAG--CAAAAGTTGAAGAAG--C-A-GC------AGCA---GT--C--G--CA--A-AC----G-TTGTTGTAGCAACATCA---G---AAGT---AGAAACAGT---AGTAGTA--G--CAGTAGCAGAAAAAG--------TGA----TAGC-ACC-A----G----------CT------TAAGTA----GCAGTCGTAA--TAGTAGTAACAGAGAAGCAGAAGTAGCAGTAGCAGCAGCA---GACAC---AGTAAAAGTAGT---AGCAGAAA---TA---GAAGT-A-GTA---TT--AGCA--GCAGATAA-AGTAGTTGTAGC--ATCA--GCTGAAGAA--G--------A--AGCA-GTAGTAGCAGCAG---CAGCAGTAGT---AGTAGT---AGCAGCAGAAGTA--G--TAGTA---ATCGCAGCA---------GCTGAA-ATAGT---------A-GCAGCA-GAAA---ACG-TAGTTGC---AATGGTA----A---CATT-TATTAC---TGT------AGAAATAACAGCA---AGGGAA--GT----A
gi|9 : ------ATAATGTCATGA--TAATG---ATGAT----GTAGCAGTAGTA--GTA-GT---A---GTA--------GT
gi|9 : agtggtggtaataatatgatgatattgagatgatatttatagtgacagttgtggtgttagtgatttgactatgcgatgattctgttaatacagttgactgtgataattatagtgctgctacatctgttgctactgatagtgattaaacaaattatgctgttgtaactgcataaaataacgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagaaaTGTAGCA---------G---TAGT---AGTAGTAGT---AGTAGTA--C--TAGTA------------------------------A---A----A----------GT------TT--CA----GAAGCAGCAG--CAGTA-T-------------ACATAATAGT---------T---ATTGT---AGTAGTAGTACT---GGTTGTAG-----CT-GCAGC-A-ATA---T---------GT-G-TAGCAGTATTAGAAGC--Aagtactagtaaaagtttcagaagcagcagcagtatacataatagttattgtagtagtagtactggttgtagctgcagcaatatgtgtagcagtattagaagca
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTGAGTAGGTGGTGTTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGGTAGTGTAAATGGTGGTGGTGGTAGTAGCGGTGGTGGTGGTGGTAAACATTATGGTGGTAGTGACGAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAACGGTGGTTGTTATTGCGGCGGTGGTGAT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|29 ): GATAGTGGTGGTAGTGATAATGGTGGTGGTGATAGTGACGGAGATGGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGTGACAATGGTAGTGGTATGTGTAGTGGTTGTGGTGTGTTTGATAGTGGTAATGCTGGTGGTGGTGGT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Unaligned ( gi|44 ): ACAGTGGCTTTGGCGGTGACGATGGCGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGACATATTTAGCGGTAGTAACAGTGGTAG
Alignments
lowQualScore : 444444444444 111 1111 11111111 11111 111111 5555555555555 222222222 111 222222222222 1111111 44444444444444444444444444444444444444444 44444444444444444444444444444444 11111111111 222222222222222222222222 222222222222222222222222222 111111 11111 111111 44444444444444444444444444444 1111111 1111111 22222222222222222 111111111 111111 11111111 3333333333333333333333333333333333333333 22222222 222222222222222222 2222222222 222222222 222222222
lowQualScore : 777777777777 1 111 1 0 1 1 66 2222 777 66666666 11 11111 222222 6666666666666 222222222 77 000 333333333333 0 0000000 22222222222222222222222222222222222222222 5 999999 3 555 2 33 11 1 66666666666666666666666666666666 5 1 11111111111 6 555555555555555555555555 1 444 2 0 0 666666666666666666666666666 11 22 333 2 2 1 0 1 3 444 22 22 1 999999 5555 1 1 333 333 1 555555 333 4 2 4444 1 1 22 1 444 22 1 1 5555555 222 5555555 22 222 6666666 22 222 1 22 22 4444 1 7777 555 5555555 1 77 555555 1 33333 555 0 0 5555 2 999 1 44444 555 44 3 1 999 4 555555 4 4 00000000000000000000000000000 4 0 2222222 555 0 1 2 0 0 66 3 0000000 777 11111111111111111 4 666666666 1 2 444444 88888888 2 1 0 9999999999999999999999999999999999999999 00000000 5 1 77 0 888888888888888888 5 1111111111 1 66 5 000000000 5 000000000 0 1 888 1 5 77 1 5 8 1
lowQualScore : ............ . ... . . . . .. .... ... ........ .. ..... ...... ............. ......... .. ... ............ . ....... ......................................... . ...... . ... . .. .. . ................................ . . ........... . ........................ . ... . . . ........................... .. .. ... . . . . . . ... .. .. . ...... .... . . ... ... . ...... ... . . .... . . .. . ... .. . . ....... ... ....... .. ... ....... .. ... . .. .. .... . .... ... ....... . .. ...... . ..... ... . . .... . ... . ..... ... .. . . ... . ...... . . ............................. . . ....... ... . . . . . .. . ....... ... ................. . ......... . . ...... ........ . . . ........................................ ........ . . .. . .................. . .......... . .. . ......... . ......... . . ... . . .. . . . .
lowQualScore : 222222222222 0 777 1 3 0 0 99 1111 888 11111111 11 11111 888888 9999999999999 999999999 99 000 111111111111 5 9999999 55555555555555555555555555555555555555555 3 666666 1 444 6 99 22 0 55555555555555555555555555555555 6 1 99999999999 1 555555555555555555555555 9 777 7 6 5 111111111111111111111111111 99 99 777 2 1 0 8 4 1 444 88 88 0 222222 3333 0 8 222 222 0 000000 222 5 3 7777 8 8 55 0 888 22 0 5 0000000 888 6666666 66 888 8888888 22 888 6 22 22 2222 6 2222 666 4444444 6 88 222222 9 22222 222 1 5 3333 0 000 3 44444 444 66 0 0 777 0 000000 0 0 88888888888888888888888888888 0 1 6666666 888 6 5 6 2 2 99 1 3333333 888 66666666666666666 8 666666666 6 5 444444 11111111 9 0 8 9999999999999999999999999999999999999999 77777777 7 0 99 4 222222222222222222 0 9999999999 0 11 0 000000000 0 000000000 2 0 999 9 7 33 0 7 0 0
consensus : ATAGTAGTAGAAG---T-G-AATAGTA---GTAACAGTAGTAGAAGTAGNA--GCAGC---A---GTA--------GTNGTAGTAG-----TAGT------AGTAGTAGTAGTAGTAGTGATG-T--TTATCAGCAGTAGT---------AG--TA---ATA--ATAATTATTGGTAGTAG--TA---GT-------AT-A-GTAGTA---GT--A--A-GA--AGTA---GTAGCNGTAGCA------GTA-GTAGTAGCAG---TAGTAGCAG--CAGTAGT--------TG----TAGT-A----AAGTTA--TAGCAGTAGTAGTAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGNAGTAG---------------TT-GTAGC---AGTA-GTAGTAGTGGTAGTAG---TANT-G--ATGT-A-TTA---TTANCA--GT---AG-TAGTAG-TANTAGTAGCANTAGTAG--AAGT--A--GTA--TG-AT-A--GTAGCA-GTAGT---A---GNAGTA------G---TNGNAG---CA-G-T--AGTAGT---A--GTAGNAG-TA-------GTAG---TAGTAGTAGTTGTA------GTANNAG---TAGT-------A--GT---AG-T--A--GTAGT---A-GTAGTAGN---AGTAGT---AG---C---AGT-AGNTGTTG------TAGTAG-T--A--GTAGTA---GTAGTAGT----AATGNT-ATTATAANTAGTAGTA---GT--AGTANTAGTA--NAAGTAG-T---G--GT-AGT-AGTA-TGG--------ATAGTAGC--AAGTANCA-GTAGT---T---GTA---GTAGTAGTAGTAGCAGTAGTAGCAGTAGTAATTGT---A---GT---A---TAA------GT---ANAAGTA-------GTAGCAGTAGTAGT------AGCAGTA--------ATAGCAACAGTAG-TAG--TGGC----GGT-GTCGGCGGTAGCG---------GTAGCGG--------CAG-TAGCGGTAGTAGTAGTAGNAGCG--GTAGCG-------GT-ATCA----GCAGTAG-TAG----------TGATA--GTAGTAGT-GG---------TAGT-AGTAGTAGT---------AGTNGTAGTA--GTAGATGC-TGTAGTAGTTGTT-GTAGTAGT-TGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTANAAG---TCGTAATAGTA---GTAATAGTAGTAGNAGTAGNA--GCAGC---A---GTA--------GTNGTAGTAG-----TAGT------AGTAGTAGTAGTAGTAGTGATG-T-GTTATTAGCAGTAGT---------AG--TA---ATA--ATAATTATTGGTAGTAG--TA---GT-------AT-A-GTAGTA---GT--A--A-GA--AATA---GTAGCTGTAGCA------GTA-GTAGTAGCAG---TAGTAGTAG--TAGTAGT--------TG----TAGT-A----AAGTTA--TAGCAGTAGTAGTAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGCAGCAG---------------TT-GTNGC---AGTA-GTAGTAGTGGTAGTAG---TANT-G--ATGT-A-TTA---TTANCA--GT---AG-TAGTAG-TANTAGTAGCANTAGTAG--AAGT--A--GTA--TG-AT-A--GTANCA-GTAGT---A---GNAGTA------G---TNGNAG---CA-G-T--AGTAGT---A--GTAGNAG-TA-------GTAG---TAGTAGTAGTTGTA------GTANNAG---TAGT-------A--GT---AG-T--A--GTAGT---A-GTAGTAGA---AGTAGT---AG---C---AGT-AGNTGTTG------TAGTAG-T--A--GTAGTA---GTAGTAGT----AATGTT-ATTATAATCAGTAGTA---GT--AGTATTANTA--TAAGTAG-T---G--GT-AGT-AGTA-TGG--------ATAGTAGC--AAGTANTA-GTAGT---T---GTA---GTAGTAGTAGTAGCAGTAGTAGCAGTAGCAATTGT---A---GT---A---NAA------GT---AGAAGTA-------GNAGCAGTAGCAGT------AGCAGTA--------ATAGCAGCAGTAG-TAG--TGGC----GGT-GTCGGCGGTAGCG---------GTAGCGG--------CAG-TAGCAGTAGTAGTAGTAGNAGCG--GTAGCG-------NT-ATCA----GCAGTAG-TAG----------TGANA--GTAGTAGT-GG---------TAGT-AGTAGTAGT---------AGTNGTAGTA--GTAGATGC-TGTAGTAGTNGTT-GTAGTAGT-TGCTNTA
gi|1 : A------GTA-GCAACAGCAG---TAGTAGAAG--CAGCAGC---------G----AAAC-A----CAGT-----AGAAGTAGCAGTAGTAGCA-----------GAAGAGGTAGGAAAAGTAT---------------TT-GCAAC---AGAA-ATAGTAGTAGCAGCAG-----CT-G--A-----------------A--GT---AG-TTGTAA-TATCAGCAGCA------G--AAAT--A--GTA-----GT-A--GTAGCA-ACAGA---A---ATAGTA------G---CAACAG---AA-G-T--AGTTAT---A--GTAGCAG-CA-------GCAG---AAGCAGTAGCCGTA------G---CAG---CAGC-------A--GG---AG-T--A--GCCAT---A-GTAGCAGA---AG------------C---AGT-CGATGTTT------T-GTTG-T--T--ATTGTA---CT-TTATT----GCTGTT-GTTATA----GTAGTA---GT--ACTAGTAGAA--GAAGTAG-T---A--GC-AGC-AGCA-AAA--------TTACTAGC--AA-TATCA-GCAGT---TAAAGTA---GTAGTTGTAGTTACAGCAATAAAAATAG-AAT--A---A---GT---ATCTTCA------GC---AAAAGTA-------GTAGCAGTGGTAGTTTCATCAGCATTA--------ATAGAAATAGTAG-CAG--CAGCAAAAGAA-GTC----GTAGTA---------GTAGCAC--------CAA-TAGTAGTAGTAG
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATTTGCAACAGAAATAGTAGTAGCA--GCAGCTGAA---GTA--------GTTGTAATAT-----CAGC------AGCAGAAATAGTAGTAGT----------AGCAACAGAAAT---------AG--TA---GCA--ACA-------GAAGTAG--T-----T-------AT-A-GTAGCA---GC--AGCA-GA--AGCA---GTAGCCGTAGCA------GCA-GCAGGAGTAGCCATAGTAGCAG--AAGCAGTCGATGTTTTG----TTGTTATTGTACTTTA--TTGCTGTTGTTATAGTAGTA-----------G---TACTAGTAGAAGAAG---------------TA-GTAGC---AGCA-GCAA-AAT--TACTAG---CAA-------------TA---TCAGCA--GTTAAAG-TAGTAG-TTGTAGTTACAGCAATAA--AAAT--A--GAA--TA----A--GTATCT-TCAGC---A---AAAGTA------G---T---AG---CA-G-T--GGTAGTTTCA--TCAGCAT-TA-------ATAG---AAATAGTAGCAGCA------GCAAAAG---AAGT-------C--GT---AG-T--A--GTAGC---A-CCAATAGT---AGTAGT---AGAT-C---AGCGAAAT-TTA------TAGTNN-N--N--NNNNNN---NNNNNNNN----NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN---NN--NNNNNNNNNN--NNNNNNN-N---N--NN-NNN-NNNN-NNN--------NNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNN---N---NNN---NNNNNACT-GT--CA-CAGCAGCAGTA-TAA---T---A---GT---A---TAA------GTACAAGAAGTA-------GCAGCCGCAGCNNN------NNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNN--------NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTTGTG-------GT-GATA----GTAGTAG-TAA----------TAGAA--GTAGTAGT-GGTGTTTGAAATAGT-AATAGTGGTATTAATATAAATAGTAGTA--GTAGA-ACATGGAGCAGTAGTT-TTAGTAAT-atcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagTAGTAGT--------T-------GTA---GTTACAGCAATAAAAATAGAA---TA-----A---GTA--------TCTTCAGCAA-----AAGT------AGTAGCAGTGGTAGT--T--------TCATCAGCATTAAT---------AG--AA---ATA------------GTAGCAG--CA---GC-------A--A--------------A--A-GA--AGTC---GTAGTAGTAGCA------CCA-ATAGTAGTAG---TAG-ATCAG--CGAAATT--------TA----TAGT-N----NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------NN-NNNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-N--NNNN-N-NNN---NNNNNN--NN---NN-NNNNNN-NACT-GTCACAGCAGCAG------------TA--TA-AT-A--GTATAA-GTACA---A---GAAGTA------G---CAGCCG---CA-G-C--NNNNNN---N--NNNNNNN-NN-------NNNN---NNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN---NNNN-------N--NN---NN-N--N--NNNNN---N-NNNNNNNN---NNNNNN---NN---N---NNT--GTTGTTGTGGTGATAGTAG-T--A--GTAATA---GAAGTAGT----AGTGGT-GTTTGAAATAGTAATA---GT--GGTATTAATA--TAAATAG-T---A--GT-AGT-AG-------------------AAC--ATGGAGCA-GTAGT---T---TTA---GTAATATTAGTAGTTGTAGTATTAGTAGCAATTGT---CGTTGT---A---CAAGTTTTCGT---ATAAATATTTTTTTTTAG-AGTAGTAGT------AACAGTA--------AAAGAAGAAGTAG-T----T------------------ATAAC------------AGCAG--------CAG-TAGTAGTAGTAATATTATTATTA--GTAGTA-------AT--TTA----ATAGTAG-TAGAAGTTGTTGTTGATATGGTTGTTGT-TG---------TAAT-AGTAGTAGA---------AGTGGTGGTA--GTAattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagAGCAG--CA---GT-------AT-A-ATAGTATAAGT--ACAA-GA--AGTA---GCAGCCGCAGCN------NNN-NNNNNNNNNN---NNNNNNNNN--NNNNNNN--------NN----NNNN-N----NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTGTTG---------------TT-GTGGTGATAGTA-GTAGTAATAGAAGTAG---TAGT-G--GTGT-T-TGA-----AATA--GT---AA-TAGTGG-TATTAATATAAATAGTAG--TAGT--A--GAA--C--AT-G--G-AGCA-GTAGTTTTA---GTAATA------T---TAGTAG---TT-G-T--AGTATT---A--GTAGCAA-TT-------GTCG---TTGTACAAGTTTTC------GTATAAA---TATTTTTTTTTA--G----AG-T--A--GTAGT---A-ACAGTAAA---AG-A-----AG---A---AGT-AG---TTA------TAACAG-C--A--GCAGTA---GTAGTAGT----AATATT-ATTAT---TAGTAGTA---ATTTAATAGTAGTA--GAAGTTG-T---T--GT---T-GATA-TGGTTGTTGTTGTAATAGT--A-GTAGAA-GTGGT---G---GTA---GTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N---NN---N---NNN------NN---NNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN----NNN-NNNNNNAGTAATG---------GTAATGT--------TGA-TAGTGTTAATCGTAGCATAAGTA--GTAGAG-------GA-AGTA----GTGGTAG-TAG----------TAGTT--GTAGTAGA-AG---------CATA-AGCAGAATT---------TTTTGCATTA--GTAGTTGC-AGTAGTATGTGTT-GTA--AGTGTGCannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacTGGTAGTAGAAGTAGGT--GTAGT---A---GTT--------GTGTTAGAAG-----TAGTTGGAGAAGTAGTAACAGTAGTGGTGGTG----------GTAGTAGT---------AG--TG---ATG--ATGA----TGGTGG-AG-------AT-------AT-A-GTGGTA---G--------------TA---GTAGA---AGTA------GTA-ATAGTAGTAG---TGGTGGTGG--TAATAGT--------CG----TAGT-A----A--TTG--TGGCGGTGGTGGTAGTAGTA-----------G---TAGT----------G---------------TTGGTTGC---GGTT-GTAGTGGTG------------AT-G--ATG--A-TTA---NNNNNN--NN---NN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--N--NNN--NN-NN-N--NNNNNN-NNGGT---G---GTGGTG------G---T----G---CA-G-----GTGGT---G--ATAGTAG-TA-------GTGG---GAGTGGTGGTGGTG------GTGGAAA---TAAT-------A--GT---AG-T--A--GAAGA---A-GTAGTAAATATAGTAGT---AG---C---AGT-AGAAGTGG------TTGTGG-T--G--GGTGTG---GTATTAgtattgtattagagg
gi|12 : tgatgg---GTGGTATTTGTAAAACTGGTACTGGTACTGATTGTGTTA---GTGCCA---TAG------GT---ATAAGTA-------GTAGTGGTAGTGGT------AGCAGTA--------ATTATGACAGTGGATGGGATGGT----GGTAGTCGGTGGTAGTGTTGATGTTGGTAGTGGTGTAAATGCTGATAGCGGTAGTGGTGGTTGGGGCG--TTGGTG-------TT-AGCA----GTGGAAG-TGT----------TGATG--TTGGTAGT-GG---------T-GTAAATGTTGAT---------AGCTGTAGT---GT---TGG-TGGGGTCTTTGTT-GT
gi|12 : attgcttA--GTAGTAGT-GG---------TAGT-GGTAGCAGT---------AATTATGACA--GTGGATGG-GATGGTGGTAGTCGGTGGTAGT-tatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|12 : attgcttgtggtatttgtaaaactggtactggtactgattgtgttagtgccataggtataAGTAGTAGTGGTAGTG--GTAGCA-------GTAATTATG--ACAGTGGATGG-----------GATG--GTGGTAGTCGG---------TGGT-AGTGTTGAT---------GTTGGTAGTGGTGTAAATGC-TG--ATAGCGGTA-GTGGTGGT-TGgttgatgttggtagtggtgtaaatgctgatagcggtagtggtggttggggcgttggtgttagcagtggaagtgttgatgttggtagtggtgtaaatgttgatagctgtagtgttggtggggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|13 : attgcttgtggtatttgtaaaactggtactggtactgattgtgttagtgccataggtataTA-GTAATAATAG----AGATGTAC--TAGTAGT--------TG----TAGTGA----AAGTGG--TAGC-GT--TAGTTGTAATG-----------GAAATGGTAGTAGCAGTGGAACACATAAGGGAATTT-GTAGT---AGTACATA-TAGTGGTAGTGA---TAGT-G--GT-------------AGCA--GT---AG-TTGTAA-TGGAAATGGAAGTGGGAC--ACGT--AAGGGAATTG-GT-A--GTAGTATATA-C---A---GTGGTA------G---TGAAAG---GG-G-T--AGCGGT---A--GTTGTAA-TG-------GAAA---TGGTAGTGGTTGTGAAACATGTAAGGGAATTGGT-------A--GT---AGTT--AATGCAGT---G-GTAGTGAT---AATGGT---AG---C---GGT-AGTTGTgggcgttggtgttagcagtggaagtgttgatgttggtagtggtgtaaatgttgatagctgtagtgttggtggggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgatTGATAGTATCATTATT-G--TTGT-AATTA---TCATCA--TT---AT-TACTAT-TATCTATACCGATAGTAT--TTGT--T--ATA--T---T-A--G-AGTT-GTTGT---T---GTACTA------G---TAGAGG---TA-G-T--AGTATT---A--GTTGAAG-TA-------GTAA---T-GTAGCAGCAGTA------GTATTAG---TTGT-------A--GT---AG-T--A--AT--------GTAGTAGC---AGTAAT---AG---T---AGT-TGTTGTTG------TAAGAT-C--A--GCAGTA---GTGGTGGC----G------ATTCTAGT-AGTAGAA---GT--AGTAATGGTA--AAAGTAGAT---GGAGT-AGT-AGTA-T-----------TAGTAGaatg
gi|15 : gctattagttgttataattataactacttaaatTAG---TATTTG--TTAT-A-TTAGAGTTGTTGTTGT---AC-TAGTAG-AGGTAGTAGTATTAGTTG--AAGT--A--GTA-----AT----GTAGCA-GCAGT---A---GTATTA------G---TTGTAG---TA-G-T--AAT-GT---A--GTAGCAG-TA-------ATAG---TAGTTGTTGTTGTA------AGATCAG---CAGT-------A--GT---GG-T--G--GCGATTCTA-GTAGTAGA---AGTAGT---AA---T---GGT-AAA------------AGTAGATGGA--GTAGTA---GTATTAGT----AGTGtggt
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgaTAGTAG--ATGT--A--GT---TG-CT-GTTGTTTTT-GTAGT---A---GCAGTATATAATG---TAATGA---CATGTT--AGTAAT---A--AAAAAAGATATATTGTTGTAG---TAACAGTAGTTGTC------ATAGTAG---TTGT-------A--GT---AG-TAAA--GTAGT---A-GTAATAGA---AGTAGT---AG---TTAAAGT-TGTGGTTG------TGGTAG-T--A--GTAGTAT--GTA-TAAT----AATG---ATTATGATT-GAAGTA---GT--AGTAGTAGTA--GAAGTAG-T---A--TTAAATAAATATTGG--------ATA-T------AATACTA-GTAGTATAT---GTA---GTCATATCAGTAgt
gi|18 : gGTTGTAGTAGTAGTT-----------GTAACGGTAGTGATAGATG---------------TA-GTGGA---AGT---TAATA-TGGTACTTG---CAGT-G----GT-A-GTG---GTAACA--GT---AA-TGATAA-TTGTAGTGGCTATGGCAG--AGGT--A--G-A--TG--T----GTAATT-GTAGT---G---GC--CA------G---TTGTAG---TG-A-T--AATTGT---T--GTGTAAG-CG-------GACG---TGGTAGTGGTTGCT------GTACGAT---TTGT-------A--GC---GG-T--C--ATGGA---A-GTGGTAAC---TGTAGT---GG---T---GGT-GTATGTTG------TATTGG-T--G--ATAGCA---GTGGTat
gi|19 : tgtgatg--ATAT-A-TTA---CTGTTG--TT---AC-TATTAT-TGATATTATCATCAGT-GTTATGTTTA--GTA--TT-ATCA--TTATCA-TTATT---ATTAGAAGTA------G---ACAAAG---TA-G-C--AATAGT---A--GTATCAT-AA-------GTAG---CATCAGTAGATGTA------GTAATGA---TAGA-------A--GTGGGAG-T--A--GCAGT---A-GTAACAGC---AGTAGCCAAAG---C---AGT-AGCAGTGG------TAGTAT-C--A--GAAGCA---GTATCAAT----AGTGAC-AGTAGATGCAGTAGTA---tatatt
gi|19 : gtataatcactattataatcaTAG---TATT-ATCAT-T-A-TCA---TTATTA--TT---AG-AAGTAGACAA-AGTAGCAATAGTAG------------TA--TC-AT-AA-GTAGCA-TCAGT---A---GATGTA------G---TAATGA---TA-G-A--AGTGGG---A--GTAGCAG-TA-------GTAA---CAGCAGTAGCCAAA------GCAGTAG---CAGT-------G--GT---AG-T--A--TCAGA---A-GCAGTATC---AATAGT---GA---C---AGT-AGATGCAG------TAGTAa
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgttGTAGTA---GA--AGCATTAGCAAGTTAGTAA-T---T--GT-GGT-AGTA-TG----------T-GTTGT--AAGT-GTACGTA-T---T---GTA---GTAGAAGTAATCTTTGTAGTAGCAGAAATAGTTGT---A---GT---A---AAA------a
gi|20 : ttGTGGTGGTGGTAG--AAGT--A--ATA--GT-AT-A--GTAGTA-GTAGC---A---ATAGTA------G---TAAAAGTGACG-G-T--GGTGAT---A--GTAGTAG-TA-------GAAGAAATGGTGGTGGTGGTG------GTAGTAG---TAGT-------A--GT---GG-T--G--ATGGT---A-ACAGTAGA---AGTAGT---AG---T---AGT-AATAACGG------TGGTGA-T--ATTGTAGTA---GTAGTAGT----AACGGT-GGTACAAGAAGTAGTA---GT--GGAATtcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : gTAGTACATGT--AAAATCTATA--TAAATAT-TCAAA--GC-AGT--GTA-TCA--------TTAATAGC--AA----CA-GTA----------TA---G--ATAGTTGTAGCAGAAGTAGTAGTAGAAATAAT---A---CT---A---CTA------CT---AGTAGTA-------GTAATAGTAATAAT------AATAATAACAATAATATAACAACATTAG-TAG--ggtggtgg
gi|21 : AGCAGT-GTATCATTAATA-----------GCAACAGTA-TAG--ATAG---------------TT-GTAGC---AGAA-GTAGTAGTAGAAATAA---TACT-------------A---CTAC-----T---AG-TAGTAG-TAATAGTAATAATAATAA--TAAC--A--ATA--AT-AT-A--ACAACA-TTAGT---A---GAAGTA------aagtattaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaa--TA-AT-A--GCAACA-GTA-T---A---GA--TA------G---TTGTAG---CA-G-A--AGTAGT---A--GTAGAAA-TA-------ATAC---TACTACTAGTAGTA------GTAATAG---TAAT-------A--AT---AA-T--A--ATAAC---A-ATAATA-------TAAC---AA---C---ATT-A------G------TAGAAG-T--A--TTAATA---TTAA-AGTTGGAAATACTGATT-TGATTAGTAttaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagtgtatcatG-TATT-GTA--ATTATTTG--AAAT--A--GTA--TG-AT-T--GTGGCA-GTAGT---A---GTAGTA------G---TAGGAG---TA-G-T--AGACGG---A--GTAGTGA-CG-------GTGA---TAGCAGAAAATGGA------GTAAAAG---CAGA-------A--AC---AC-C--A--GCAGC---A-GTAGTAGT---AATAGT---GA---A---AGT-AAA-GGTA------TA--AG-T--A--TTAGTAAACATAGCA-T----AATGaacgtgtcagta
gi|25 : tgacgA--TG-AT-G--GTGATG-GTGGT---G---GTGGTG------G---TAATAA---AA-T-T--AGTAGT---G--GTGGGCG-TG-------GTAG---TAGAAGTAGTAGTT------GTATTAG---TAGT-------A--CT---AG-T--A--ACAGT---A-ATATTAGT---AGTAGT---AG---C---AGT-TAAAGTAA------TAGTGG-T--G--ATGGTG---GTGGTAGT----Aaaggtg
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgGTTG--TT---GT-------AT-AAGTAATA---GT--A--GTGA--GGTA---GTAGTTGTTTCT------GAA-TGAGTAGCAG---TAGTAGTAGATTGGTAAT--------TG----TGGT----------TG--TAGCCGTAGTA-TA--AGTA-----------GACGTGAT-GTAGTA--------------------------------TA-TTAATAGTAGTAGTAG---TAAT-G--ATGC-A-TTA---CAAGCA--GT---ttagcagaag
gi|28 : tattAGCATCAGCAATCGCAATC-----------GCAATCATAGT--CA-CAG---------------TC-GTAGC---AGTA-GT-----TGCT-GTA---------G--AAGT-A-TCA---TCAGCA-------------TAA-CATTAGCAACATTAGCAG--AAGA--A--GCA-----AC-A--ACATCA-GCAGT---A---GCAGTA------G---CTGCAA---CA-G-T--AGTAAT---A--GAAG
gi|3 : ATAGTAGTATAAG---TCATAATAGTA---GTAATAATAGTAGAAGTAGAA--GCAGC---A---GCA--------GCTGTAGCAG-----TGGT------AGTAGTGGTAGTAATAGTGATG-TCATTATTATCAGTAGT---------AG--TA---ATATTATAATCATTGGTGGTAG--TA---GT-------ATGA-ATAGTA---GCCAA--A-GA--AAAA---GTAGCTGTAGCA------GTA-GTAGTAGCAA---CAGTAGCAG--CAGCAAT--------TG----TAGT-AT---AAGTTA--TAAAAGTAGTAATAATAGCA-----------GAAATAATAGCAGCAGCAG---------------CT-GTTGC---AGTA-GTAGTAGTGGTAGTAG---TACT-G--ATGTCA-TTA---TTATCA--GT---AG-TAGTAA-TATTATTAGCATTGGTGG--AAGT--A--GTA--TGGAT-A--GTAACA-GAAGT---A---AAAGTA------G---TTGAAG---CA-A-T--AGTAGT---A--GTAGCAA-CA-------GTAG---CAGCAGTAATTGTA------GTATAAG---TAAT-------A--AT---AG-T--A--GTAAT---A-CTAGTAGA---AGTAGT---AG---C---AGC-AGCTGCTG------TAGCAG-T--A--GTGGTA---GTAGTAGT----GATGTC-ATTATAATCAGTAGTA---GT--AATATTATTA--TCAGTGG-T---G--GT-AGT-AGTA-TGG--------ATAGTAGCCAAAGAAAAA-GTAGT---T---GTA---GCAGTAGTAGTAGCAACAGTAGCAGCAGCAATTGT---A---GT---A---TAA------GT---AAAAATA-------GAAGCAATAGAAGT------AGAAGTA--------ATAGCAGCAGTAG-TAA--TGGC----GGT-GTCGGCGGTGGCG---------ATAGCGG--------CAG-TGACAGTAATAGTAGCAGAAACA--GTAACG-------CT-ATCA----GCAATAA-TAG----------TGAAA--GTAGCAGC-AG---------CAAT-AATAGTAGT---------AGTTGTAGTC--GTAGATGC-TGTAGTAGTTGTT-GTAGTAGT-TACTTTAt
gi|31 : AATTATTAATAATAAAATA---AT-------AT-A-ATA-TA---AT--A--A-AATCAATACAGGCACCAGTAACA------GTA-GTAGAAGCAG---CAGCAGAAG--TAATA-----------A----TAGT-A---------A--TAGCAGACGTAGTAGTAATA-----------GACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaA---GTAACAGTAGTAGAAGCAGCA--GCAGA---A---GTA--------ATAATAGTAA-----TAGC------AGACGTAGTAGTAATAGatgta
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCAG--TATGAGT--------TGATTTTACT-T----AAGTTA--TAA-A--AGCAGTGGTAGTA-----------GCAGTAGTACCAGTAGTAA---------------CT-GTAGC---AATA-TCAGTAGCAATAGCAA---TACC-G----GT-G-CTG----CAACA--GT---AA-TATCAT-TATTATTAacatagacgtagatgta
gi|32 : tatAGT---T---ATAAAAGCAGTGGTAGTAGCAGTAGTACCAGTAGTAACTGT---A---GC---A---A---------T---ATCAGT----------AGCAATAGCAAT------ACCGGTG--------CT-GCAACAGTAA-TAt
gi|34 : tatgcagtatgagttgattttacttaTA------G---TTGTTG---CA-G-T--AGTTGTT--ACTGTTGAAA-TA-------ATAA---TAGT--TA-TTGTA------GTACAAG---TAGTT------ATTAT---AG-T--C--ATAAG---A-GTAGTAGT---AGTAGT---AG---T---AGT-AGAAGTTT------TGGTTG-A--A--GTAGTA---GTTGTtcattattattat
gi|35 : ---A--GTAGAAG-TA-------GT-----TAATATTA-TTAT--------TAAAAG---TA-T-------A--AT------T--A--GTAGA---A-ATAGAAAA---A--AGA---AG---T---AGT-GGATATAG------CAATAG-T--A--GCAGCA---GTATTGTT----ATTATT-ATTATAACTAGTAGAA---AT--Atg
gi|36 : aaTA---TTACTA--GT---AG-TAGTAG-TAATAGTAAAAGTTGTAG--TAGT--A--TTA-----AT-A--ATAACC-CT-----------TAGTA------A---TAGTAA---CA-C-T----TAGT---A--GTAGAAG-AA-------G
gi|37 : aaaaaagttgag-ATCA----GCATTAG-AAG----------TGTTG--GTACTAGT-AG---------CAAT-AATGGTAGC---------CGTGGTGGTA--GTAGTTGT-TATTTTGGTTGTT-GTatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcTAGTAGTAG--TA---GT-------AA-A-ATAAGA---AT--A--A-GT--ATTG---GTGACAGTAGCA------ACA-TCACTAGCGG---TATTATCAG--TAGTGGT--------GG----Ttattgtac
gi|39 : gAA-TA-------GTGG---TAATAGTA--TG-A------GAGGTGG---TTGT-------G--GT---AG-T--A--GTAGT---A-GTAGTAGA---GATGGTGGAGG---T---AGT-AGTTGTTG------TGGTGG-T--T--GTCGTA---GCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : --GTAAAAG-TA-------GTAT---TAATAGTTGTTGTG------GTATTAG---TAAT-------A--GT---AG-G--A--GTTGT---T-ACAGTAGT---TGTAGT---TGACAC---AGT-AGTTGTTG------TAGTA--------GTAGTA---
gi|41 : CAGCAGCG---------GCAGCGG--------CAG-TAGCAGTAGTAGTAGTAGCGGCA--ATATCGATGGTAAAT-ATAATGATGCAGTAG-TAG----------TGAAA---TAATA
gi|42 : AG-TA-------GCAG---TAGTAGTAGTTGTA------GTAGTAT---CAGT-------A--GC---AA-T--A--GTACA---ATGTAGCAAA---ATCAGT---AG---C---AGT-A
gi|43 : aagaagtacttcg--GTGGTGG-TG-------GTGG---TTATGGTAGTTGTG------GTTACGG---TGGT-------T--AC---GG-T--G--GTGGT---G-GTAGTAGA---AGTAGT---AG---C---AGT-AGTAGT
gi|45 : gAGTAGTAATAGTAGTA-----------GAAATAGTAGTAGAAACA-------------------GTAGC---AGTG-ATAGAAGTGGa
gi|46 : catgaa--------ATAGTAGC--AATT-----GTAGT---T---GTA---GTAGT-GCAGTGGTAGTAATAGCAGTAGataagaata
gi|47 : gttgtaacAGCAGTAGTC--GCAAC---A---GTA--------GTCCCAGTAG-----TAGT------AGCAGCAATAGCAGTA
gi|5 : ATAGTAGTAGAAA---T---AATAGTA---ATAATAGTAGTGGTGGTGGTATGGTAGT---ACTTGTAATATTATGGTGGTGGTAG-----TAGT------AGTAGTTGTAGTAGTAGTGATGAT-GGTGTTAGAAGTAGTCGAGGTGGTGG--TG---ATG--ATAATGAT-GGTGGTGG--TA---GT-------G----GTAGTA---GT--A--A-------TA---G-AGGTNNNNNN------NNN-NTAATAGAGG---TAGTAGTAG--TA----T--------TGA---TAG-------AAGT-----AGCAGTAGTAGTGGTGGTA-----------GTTATAGTATTAGTAATGG---------------TT-GTGGA---AGAA-GTATAAGTGTTGGTGA---TTGT-G--GTGT----TA---GT-TTA--GT---AG-TAGTAG-TAATTGTGGCAGTGGTAG--AAGT--A--GTAA-TG-GT-A--GTGGTA-GCAAT---A---GAAGTA------GCGATTGGTG----A-T-TTAAGTA-T---A--GTAGAAG-TA-------GTAG---TATAATTGGTTGTG------GTAGTAG---TAGT-------A--AT---AG-T--A--GTATT---A-TTAGTAGT---GGTAGT---GG---C---AGT-AGTTGTTG------TGGTGG-C--G--GTGATA---GAAGTACT----AATGGT-GGTGTTGGCTGTGGTA---GT--AGTAGTAGT-----GGTGG-T---G--CT-GGT-GTTA--GT--------ATAGT------AGTATTA-GT-GT---TG--GTG---GTGGTGGTGGTGGcca
gi|7 : TAGTA---GTAAAAGGAGTAAAAGTAGCA--GTAGA---A---GAA--------GTAGAAATAAGAAAATAGT------TTTTGCAGCAGTAAAAGT-ATC-A-CTTAT-AGCAGCAGA---------AGCGTA---ATA--AGAAGTACTGACAGAAG--CAAAAGTTGAAGAAGC-A-GCAGCA---GT--C--G-CA--AAC----GTTGTTGTAGCAACATCAGAA-GTAGAAACAG---TAGTAGTAG--CAGTAGCAGAAAAAGTGA---TAGC-ACC--AGCTTAAGTAGCAGTCGTAATAGTAGTAACAGAGAAGCAGAAGTAGCAGTAGCAGCAG---------------CA-GACAC---AGTA-AAAGTAGTAGCAGAAA---TA---G--AAGT-A-GTA---TTAGCA--GC---AGATAA-AG-TAGTTGTAGCATCAGCTG--AAGA--A--G----------A----AGCA-GTAGT---A---GCAGCA------G---CAGCAG---TA-G-T--AGTAGT---A--GCAGCAG-AA-------GTAG---TAGTAATCGCAGCA------GCTGAAA---TAGT-------A--GC---AG-C--A--GAAAA---C-GTAGTTGC---AATGGT---AA---C---ATT-TATTACTG------TAGAAA-T--A--ACAGCA---AGGGAAGT----A
gi|9 : ---GTA--------GCAGTAGTAG-----TAGT------AGTAGTAGTACTAGTA--AAAG-T-TTCAGAAGCAGCAGC---------AG--TATACATA--ATAGTTATT-GTAGTAG--TA---GT-------AC----TGGT-----T------------------GTAGCTGCAGCA------ATATGT-GTAGCAG---TATTAGAAG--CA
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTGAGTAGGTGGTGTTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGGTAGTGTAAATGGTGGTGGTGGTAGTAGCGGTGGTGGTGGTGGTAAACATTATGGTGGTAGTGACGAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAACGGTGGTTGTTATTGCGGCGGTGGTGAT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|29 ): GATAGTGGTGGTAGTGATAATGGTGGTGGTGATAGTGACGGAGATGGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGTGACAATGGTAGTGGTATGTGTAGTGGTTGTGGTGTGTTTGATAGTGGTAATGCTGGTGGTGGTGGT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Unaligned ( gi|44 ): ACAGTGGCTTTGGCGGTGACGATGGCGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGACATATTTAGCGGTAGTAACAGTGGTAG
Alignments
lowQualScore : 1111 444444444 111111 1111111111 111 666666666666666666666666666 111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333 44444444444444444444444444 1111111 3333333333333333333333333333333333333333 2222222222222222 1111111111 111111 22222222222222222222222 44444444444444444444444 1111111 2222222 11111111111111 1111111 222222222222 11111111111 111111111 1111111 1111111 1111111111111 2222222
lowQualScore : 4444 000000000 5 888 33 222222 1 5555555555 999999 1 88888 88888 7777777 555 555 000 999999999999999999999999999 777 777 4 66 2 111111111 0 44 55 8888888888888888888888888888888888888888888888 1 7777 555 3 44 6666 2 11111111111111111111111111 2 1 555 77777 4 5555 0 1 5555555 555 0000000 66666 6666666666666666666666666666666666666666 1 33 444 1 333 2 333 1 1 22 3 4444 33 2 5555555555555555 44 333 0 222 1 1 66666 1 444 22 1 1 4444444 888888888 22 666666666 22 999999999999999 5555555 1 22 22 5555 22 77777777 444 1 3333 9999999 22 66 222 1 444444 44444 1 22 777 11 2 2 1111111111 11 000000 888888888 33 444 1 1 33 00000000000000000000000 3 3 2 44444444444444444444444 0000000 444 0 555 2 44 0 777 33 5555 0000000 44444444444444 0000000 2 999999 999999 0 3 2 3 444 3 55 444444444444 55555555555 111111111 3 7777 555 0 22 3333333 444 888888 2 1111111 7777 555 2 2 9999999 3 555 888888 44 3 3 1 8888888888888 1111111 1 0 888
lowQualScore : .... ......... . ... .. ...... . .......... ...... . ..... ..... ....... ... ... ... ........................... ... ... . .. . ......... . .. .. .............................................. . .... ... . .. .... . .......................... . . ... ..... . .... . . ....... ... ....... ..... ........................................ . .. ... . ... . ... . . .. . .... .. . ................ .. ... . ... . . ..... . ... .. . . ....... ......... .. ......... .. ............... ....... . .. .. .... .. ........ ... . .... ....... .. .. ... . ...... ..... . .. ... .. . . .......... .. ...... ......... .. ... . . .. ....................... . . . ....................... ....... ... . ... . .. . ... .. .... ....... .............. ....... . ...... ...... . . . . ... . .. ............ ........... ......... . .... ... . .. ....... ... ...... . ....... .... ... . . ....... . ... ...... .. . . . ............. ....... . . ...
lowQualScore : 8888 888888888 7 888 00 888888 0 7777777777 666666 0 33333 33333 0000000 888 888 444 222222222222222222222222222 888 888 4 11 9 777777777 6 66 22 2222222222222222222222222222222222222222222222 0 1111 444 1 22 0000 8 66666666666666666666666666 5 1 000 11111 8 7777 6 9 5555555 000 2222222 77777 4444444444444444444444444444444444444444 8 22 111 4 999 1 777 0 9 66 2 5555 55 1 6666666666666666 33 222 5 999 6 7 33333 6 222 00 0 4 6666666 000000000 00 222222222 55 666666666666666 0000000 5 11 11 4444 11 33333333 111 5 6666 1111111 44 11 888 5 444444 00000 7 33 555 00 0 1 5555555555 22 000000 999999999 22 444 0 9 77 99999999999999999999999 1 1 9 66666666666666666666666 6666666 777 9 888 1 22 8 555 22 9999 8888888 33333333333333 8888888 5 666666 666666 8 6 1 3 333 3 00 111111111111 88888888888 888888888 1 2222 444 6 00 4444444 888 888888 9 1111111 0000 000 9 9 9999999 1 444 888888 22 1 1 0 1111111111111 6666666 0 5 888
consensus : ATAGTAGTAG-A--AGT-GA-----ATA-GT---AGTAGCAG------TAGTAGAAGTAGTAGCAG---C------AGTA------GTNGTAGT-----AG-----TAGT---A---GTA---GT---AGTAGTAG---TAG--TG-A-T----GT--TT----AT--CAGCA---GTAGT---AGTA-ATA--GTAGTT--ATTG--GTAGTAG--TAGTA-T-AGTAGTA---GT--A-----A--GA--AGT---------A---GTAGCAGT----AGCA---GTA-GTAGTAGCAGT--AG---TAGCAGCAGTA---GTTG----TAGTA-A-A---GT-ATAGCAGTAGTA---GTAG-----TAGTAGNAATAGTA----GTAGCAGTAGTT---G---TAGC---AGTAGTAGTAGT------AGT-----AGTAG---TAN---T-----G--AT-----GT-A-TTA---TT--ANCA--GT---AGTAG---TAG-T---ANTAGTAGCANTAG----TAGAAGTAG-TA--TG-----------ATA--G---TAGCAGTAGT---AGNA-GTAGTNGCG-GCAGTAGTAG-T---A--GTAGNAG-TA-------GTA---------GTA--GTAGTAGTTGT---------AGTANNA---------------GT-------AGT-A--GTA--G----T--AGTA---GT---A---GTAGTA-GT---AGTAGTAG---C---AGT-AGNTGT--TG-T------AGTA-----G-T--AGTAGTA---GTAGTAGTA-AT-GNTA----T--TATAA-----NTAGT---------AGTAG--TAGT---ANTAGTANA--AGTA-----------------G-TN--GT-AGT-AGTA-TGGATAGT---AGC--AA-GTANCAGTAGT---T---GTA---GTAGTAGTAGTAG-CAGT--AGTAGCAGTAG--TAATTGT---AGT---ANA-AGT------ANA-----AGTAGT-------AGCAGTAGTA------GT------AGCAGTAA-TAGCAACAGTAG-TAG--TGGC----GGT-GTCGGCGGTAGCG---------GTAGCGG--------CGG-TAGCGGTAGTAGT---AGTAGTAGCG-----G-TAGCG------GT-A-T--T--AGC---AGT---AG-TAG-TGAT--A--G-T---AGTAGTGGT------A--GT-AG-TAGTAGTAGTNG------T------AGTAGTAGN---TGTTGTAGTAGTTG---TTGTAGTAGTTGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAG-A--AGT-GA-----ATA-GT---AGTAACAG------TAGTAGAAGTAGNAGCAG---C------AGTA------GTNGTAGT-----AG-----TAGT---A---GTA---GT---AGTAGTAG---TAG--TG-A-T----GT--TT----AT--CAGCA---GTAGT---AGTA-ATA--ATAATT--ATTG--GTAGTAG--TAGTA-T-AGTAGTA---GT--A-----A--GA--AGT---------A---GTAGCNGT----AGCA---GTA-GTAGTAGCAGT--AG---TAGCAGCAGTA---GTTG----TAGTA-A-A---GTTATAGCAGTAGTA---GTAG-----TAGTAGAAATAGTA----GTAGNAGTAGTT---G---TAGC---AGTAGTAGTAGT------GGT-----AGTAG---TAN---T-----G--AT-----GT-A-TTA---TT--ANCA--GT---AGTAG---TAG-T---ANTAGTAGCANTAG----TAGAAGTAG-TA--TG-----------ATA--G---TAGCAGTAGT---AGNA-GTAGTNGNA-GCAGTAGTAG-T---A--GTAGNAG-TA-------GTA---------GTA--GTAGTAGTTGT---------AGTANNA---------------GT-------AGT-A--GTA--G----T--AGTA---GT---A---GTAGTA-GN---AGTAGTAG---C---AGT-AGNTGT--TG-T------AGTA-----G-T--AGTAGTA---GTAGTAGTA-AT-GNTA----T--TATAA-----NTAGT---------AGTAG--TAGT---ANTAGTANA--AGTA-----------------G-TG--GT-AGT-AGTA-TGGATAGT---AGC--AA-GTANCAGTAGT---T---GTA---GTAGTAGTAGTAG-CAGT--AGTAGCAGTAG--TAATTGT---AGT---ATA-AGT------ANA-----AGTAGT-------AGCAGTAGTA------GT------AGCAGTAA-TAGCAACAGTAG-TAG--TGGC----GGT-GTCGGCGGTAGCG---------GTAGCGG--------CAG-TAGCGGTAGTAGT---AGTAGNAGCG-----G-TAGCG------GT-A-T--C--AGC---AGT---AG-TAG-TGAT--A--G-T---AGTAGTGGT------A--GT-AG-TAGTAGTAGTNG------T------AGTAGTAGA---TGCTGTAGTAGTTG---TTGTAGTAGTTGCTTTA
gi|1 : A---GTA-GCAACAGCAGT--AG---TAGAAGCAGCA---GC-G----AAACA-C-A---GT---AGAAGTAGCA---GTAG-----TAGCAGAAGAGGTA----GGAAAAGTATTT---G---CAAC---AGAAATAGTAGT------AGC-----AGCAG-----C---T-----G--A------------------------A--GT---AGTTG---TAA-T---ATCAGCAGCA----------GAAATAG-TA---------------GTA--G---TAGCAACAGA---AATA-GTAGCAACA-GAAGTAGTTA-T---A--GTAGCAG-CA-------GCA---------GAA--GCAGTAGCCGT---------AG---CA---------------GC-------AGC-A--GGA--G----T--AGCC---AT---A---GTAGCA-GA---AG---------C---AGT-CGATGT--TT-T-------GTT-----G-T--TATTGTA---CT--T--TA-TT-GCTG----T--TGTTA------TAGT---------AGTAG--TACT---AGTAGAAGA--AGTA-----------------G-TA--GC-AGC-AGCA-AAATTACT---AGC--AA--TATCAGCAGT---TAAAGTA---GTAGTTGTAGTTA-CAGC--AATAAAAATAGAATAA--GT---ATC---TTC-AGC------AAA-----AGTAGT-------AGCAGTGGTA------GTTTCATCAGCATTAA-TAGAAATAGTAG-CAG--CAGCAAAAGAA-GTC----GTAGTA---------GTAGCAC--------CAA-TA---GTAGTAGT---AG-ATCAGCG-----
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattAGTAG-A--AGT--A-----GCA-GT---AGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATTTGCAA---C------AGAA------ATAGTAGT-----AG-----CAGC---A---GCT---GA---AGTAGTTG---TAA--T-------------------AT--CAGCA---GCAGA---AATA-GTA--GTA-----------GTAGCAA--CAG-A---AATAGTA---GC--A-----ACAGA--AGT---------A---GTTATAGT----AGCA---GCA-GCAGAAGCAGT--AGCCGTAGCAGCAGCA---GGAG----TAGCC-ATA---G---TAGCAGAAGCA---GTCGATGTTTTGTTGTTATTGTACTTTATTGCTGTTGTT---A---TAGT---AGTAGTACTAGTAGAAGAAGT-----AGTAG---CAG---CAGCAAA--ATTACTAGC-A-ATA---TC--AGCA--GTTAAAGTAG---TAG-T---TGTAGTTACAGCAA----TAAAAATAG-AA--TA-------------A--G---TATCTTCAGC---AAAA-GTAGT---A-GCAGTGGTAG-TTTCA--TCAGCAT-TA-------ATA---------GAA--ATAGTAGCAGC---------AGCAAAA---------------GA-------AGT-C--GTA--G----T--AGTA---GC---A---CCAATA-GT---AGTAGTAGAT-C---AGCGAAAT-T--TA-T------AGTN-----N-N--NNNNNNN---NNNNNNNNN-NN-NNNN----N--NNNNN-----NNNNN---------NNNNN--NNNN---NNNNNNNNN--NNNN-----------------N-NN--NN-NNN-NNNN-NNNNNNNN---NNN--NN-NNNNNNNNNNN---N---NNN---NNNNNACT-GT---CA-C--AGCAGCAGTA---TAA---T---AGT---ATA-AGT------ACA-----AGAAGT-------AGCAGCCGCA------GC------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNN--------NNN-NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNTGTTG-TTGTG------GT-G-A--T--AGT---AGT---AG-TAA-TAGA--A--G-T---AGTAGTGGTGTTTGAA--AT-AG-TAATAGTGGTAT------T------AATA-TAAA---TA--GTAGTAGTAGAACATGGAGCAGTAGTTTTAaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacATAGTAGTAGTACTAGTAGA-----AGAAGT---AGTAGCAG------CAGCAAAATTACTAGCAATATC------AGCA------GTTAAAGT-----AG-----TAGT---T---GTA---GTTACAGCAATAAAAATAGAATA-AGT----AT--CT-----T--CAGCAAAAGTAGT---AGCA-GTG--GTAGTTTCATCA--GCATTAA--TAGAAAT-AGTAGCA---GC--AGCAAAA--GA--AGT---------C---GTAGTAGT----AGCA---CCA-ATAGTAGTAGT--AG----ATCAGCGAAA---TTTA----TAGTN-N-N---NNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-----NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNN---N---NNNN---NNNNNNNNNNNN------NNN-----NNNNN---NNN---N-----N--NN-----NN-N-NNN---NN--NNNN--NN---NNNNN---NNN-N---ACT-GT--CAC--------AGCAGCAG-TA--TA-----------ATA--G---TATAAGTACA---AGAA-GTAGCAGCC-GCAGCNNNNN-N---N--NNNNNNN-NN-------NNN---------NNN--NNNNNNNNNNN---------NNNNNNN---------------NN-------NNN-N--NNN--N----N--NNNN---NN---N---NNNNNN-NN---NNNNNNNN---N---NNT--GTTGT--TG-TGGTGATAGTA-----G-T--AGTAATA---GAAGTAGTA-GT-GGTG----T--TTGAA-----ATAGT---------AATAG--TGGT---ATTAATATA--AATA-----------------G-TA--GT-AGT-AG--------------AAC--AT-GGAGCAGTAGT---T---TTA---GTAATATTAGTAG-TTGT--AGTATTAGTAG--CAATTGT---CGTTGTACA-AGTTTTCGTATA-----AATATTTTTTTTTAG-AGTAGTA------GT------AACAGTAA-AAGAAGAAGTAG-TTA--TAAC----AG----CAGCAGTAGTA---------GTAGTAA--------TAT-TAT---TATTAGT---AGTAAT---------T-TAATA------GT-A-G--T--AGA---AGT---TG-TTGTTGAT--ATGG-T---TGTTGTTGT------A--AT-AG-TAGTAGAAGTGG------T------GGTAGTAgtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttAGTAGTAG-C--AGT-GG------TA-GTTTCATCAGCAT------TAATAGAAATAGTAGCAG---C------AGCAAAAGAAGTCGTAGT-----AG-----TAGC---ACCAATA---GT---AGTAGTAGAT-CAG--CG-A-A----AT--TT----AT---AGTN---NNNNN---NNNN-NNN--NNNNNN--NNNN--NNNNNNN--NNNNN-N-NNNNNNN---NN--N-----N--NN--NNN---------N---NNNNNNNN----NNNN---NNN-NNNNNNNNNNN--NN---NNNNNNNNNNN---NNNN----NNNNN-N-NACTGTCACAGCAGCAGTA----TAA-----TAGTATAAGTACAA----GAAGTAGCAGCC---G---CAGC---NNNNNNNNNNNN------NNN-----NNNNN---NNN---N-----N--NN-----NN-N-NNN---NN--NNNN--NN---NNNNN---NNN-N---NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNN-NNNNTG-----------TTGTTG---TGGTGATAGT---AGTA-GTAATAGAA-GTAGTAGTGG-T---G--TTTGAAA-TA-------GTA---------ATA--GTGGTA--T-T---------AATATAA---------------AT-------AGT-A--GTA--G----T--AGAACATGG---A---GCAGTA-GTTTTAGTAATAT---T---AGT-AGTTGT--AG-T------ATTA-----G-T--AGCAATT---GTCGTTGTACAA-GTTT----TCGTATAA-----ATATTTTTTTTTAGAGTAG--TAGT---AACAGTAAA--AGAA-----------------G-AA--GT-AGT---TA-TA-ACAGC---AGC--A--GTAGTAGTAGT---A---ATA---TTATTATTAGTAG-TAATTTAATAGTAGTAG--AAGTTGT---TGTTG-ATATGGT------TGT-----TGTTGT-------AATAGTAGTAGAAGTGGT------GGTAGTAA-NNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNN--------NNN-NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-----N-NNNNN------NN-N-N--N--NNN---NNN---NN-NNN-NNNN--N--N-N---AGTAATGGT------AATGT-TGATAGTGTTAATCG------TAGCATAAGTAGTAGA----G--GAAGTAGTGG---TAGTAGTAGTTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaAGCAG--CAGTA-T-AATAGTATAAGT--ACA---A--GA--AGT---------A---GCAGCCGC----AGCN---NNN-NNNNNNNNNNN--NN---NNNNNNNNNNN---NNNN----NNNNN-N-N---NNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-----NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNTGTTGTT---G---TGGTGATAGTAGTAGTAAT------AGA-----AGTAG---TAG---T-----G--GT-----GT-T-TGA-------AATA--GT---AATAG---TGG-T---ATTAATATAAATAG----TAGTAGTAG-AA--C------------ATG--G----AGCAGTAGTTTTAGTA-ATATTAGTA-GTTGTAGTAT-T---A--GTAGCAA-TT-------GTC---------GTT--GTACAAGTTTT---------CGTATAAATATTTTTTTTTAGAGT-------AGT-A--GTA--A----C--AGTA---A----A-----AGAA-GA---AGTA-------------------GT--TA-T------AACA-----G-C--AGCAGTA---GTAGTAGTA-AT-ATTA----T--TAT--------TAGT---------AGTAATTTAAT---AGTAGTAGA--AGTT-----------------G-TT--GT---T-GATA-TG-----------------------GTTGT---T---GTT---GTAATAGTAGTAG-AAGT--GGTGGTAGTAA--NNNNNNN---NNN---NNN-NNN------NNN-----NNNNNN-------NNNNNNNNNN------NN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN----NNN-NNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNN--------NNN-NNNNNNNAGTAAT---GGTAATGTTG-----A-TAGTG------TTAA-T--CGTAGCATAAGT---AG-TAG-AGGA--A--G-T---AGTGGTAGT------A--GT-AG-TTGTAGTAGAAG------C------ATAAGCAGAATTTTTTGCATTAGTAG---TTGCAGTAGTtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacGT-GA------TA-GT---AGTA---G------TAATAGAAGTAGTAGTGG---TGTTTGAAATA------GTAATAGT-----GG-----TATT---A---ATATAAAT---AGTAGTAG---TAG--AACA-T----GG-------------AGCA---GTAGTTTTAGTA-ATA--TTAGTA--GTTGTAGTATTAG--TAGCAAT-TGTCGTT---GT--A-----C---A--AGTTTTCGTATAA---ATATTTTTTTTTAG-A---GTA-GTAGTAACAGT--AA---AAGAAGAAGTA---GTTA----TA-------------ACAGCAGCAGTA---GTAG-----TAGTAATATTATTA----TTAGTAGTAATT-------TAAT---AGTAGTAGAAGT------TGT-----TGTTGA--TA----T-----G--GT------T-G-TTG---TTGTAATA--GT---AGTAG---AAG-T---GGTGGTAGTAANNN----NNNNNNNNN-NN--NN-----------NNN--N---NNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N---N--NNNNNNN-NN-------NNN---------NNN--NNNNNNNNNNN---------NNNNNNN---------------NNNNNNNNNAGT-A--ATG--G----T--AATG---TT---G---ATAGTG-TT---AATCGTAG---C---A-T-AAGTA----G-T------AGAG-----G-A--AGTAGTG---GTAGTAGTA-GT-TGTA----G--TAGAA-----GCATA---------AGCAG--AATT---TTTTGCATT--AGTA-----------------G-TT--GC-AGT-AGTA-TG--T-GT---TGT--AA-GTGTGCGTA-T---T---GTA---TTAGatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtgG------TAGTAGAAGTAGGTGTAG---T------AGTT------GTGTTAGA-----AG-----TAGTTGGA---GAA---GT---AGTAACAG---TAG--TG-G-T----GG--T----------GGTA---GTAGT---AGTG-ATG--ATGAT------G--GTGG-AG----ATA-T-AGTGGTA---GT--A----------------------------GTAGAAGT----AGTA---ATA-GTAGTAGTGGT--GG---TGGTAA---TA---GTCG----TAGTA-A------TTGTGGCGGTGGTG---GTAG-----TAGTAG------TA----GT-------GTT---G--------------GTTGCGGT------TGT-----AGTGG---TGA---T-----G--AT-----G--A-TTA---NN--NNNN--NN---NNNNN---NNN-N---NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNN-NN--NN-----------NNN--N---NNNNNNNGGT---GGTG-GTGGTGCAG-GTGGTGATAG-T---A--GTAGTGG-GA-------GTG---------GTG--GTGGTGGTGGA---------AATAATA---------------GT-------AGT-A--GAA--G----A--AGTA---GT---AAATATAGTA-GT---AGCAGTAG---A---AGT-GGTTGT--GG-T------GGGT-----G-T--GGTATTA---agg
gi|12 : tgatggtg---GTGGTATTTGTAA-AACT--GGTACTGGTAC--TGATTGTGTTAGTGCCATA-GGT------ATA-----AGTAGT-------AGTGGTAGTG------GT------AGCAGTAA-TTATGACAGTGGATGGGATGGT----GGTAGTCGGTGGTAGTGTTGATGTTGGTAGTGGTGTAAATGCTGATAGCGGTAGTGGT---GGTTGGGGCG-----T-T---G------GT-G-T--T--AGC---AGTGGAAG-TGT-TGAT--G--T-T---GGTAGTGGT---------GTAAA-TGTTGATAGCTG------T------AGT-GT------TGGTGGGGTCTTTG---TTGT
gi|13 : attgcttTA---GT---A---ATAATA-GA---GAT-GTAC---T---AGT-AGTTGT--AG-T------GAAA-----G-T--GGTAGCG---TTAGTTGTA-AT-GG------------AA-----ATGGT---------AGTAG--CAGT---GG-AACACA----TA-----------------A-GG--G------AATT-TG--TAGT---AGT--AC-ATA----TAGT---G---GTA---GTGATAGTGGTAG-CAGT--AGTTGTAATGG--AAATGGA---AGT-------GGG------ACA-----CGTAAG-------GGAATTGGTA------GT------AGTA-T-A-T----ACAGTGG-TAG--TGAA----AGG-GGTAGCGGTAGTT---------GTAATGG--------AAA-T---GGTAGTGGT---TGT-GAAACAT----G-TAAGG------GA-A-T--T--GGT---AGT---AGTTAA-TG-C--A--G-T---GGTAGTGAT------A--AT-GG-TAGCGGTAGTTG------T------AATtatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgatT------GAT-----AGTATCATTAT---T-----G--TT-----GT-AATTA---TC--ATCA--TT---ATTAC---TAT-T---ATCTATACCGATAG----TATTTGTTA-TA--T-------------TA--G----AGTTGTTGT---TGTA-CTAGTAGAG-GTAGTAGTAT-T---A--GTTGAAG-TA-------GTAAT-------GTA--GCAGCAGTAGT---------ATTAGTT---------------GT-------AGT-A--GTAATG----T--AGTA---GC---A---GTAATA-GT---AGTTGT----------------TGT--TG-T------AAGA-----T-C--AGCAGTA---GTGGTGGCG-AT-TCT------------A-----GTAGT---------AGAAG--TAGT---AATGGTAAA--AGTA-----------------GATGGAGT-AGT-AGTA-T---TAGT---AGg
gi|15 : gctattagttgttataattataactacttaaatTAG---TAT---TT----G--TT-----AT-A-TTAGAGTT--GTTGTTGT---ACTAG---TAG-A---GGTAGTAGTATTAG----TTGAAGTAG-TA---------------AT---G---TAGCAGCAGT---AGTA-TTAGTTGTA-GTAGTAAT-G-T---A--GTAGCAG-TA-------ATA---------GTA--GTTGTTGTTGT---------AAGATCA---------------GC-------AGT-A--GTG--G----T--GGCG---ATTCTA---GTAGTA-GA---AGTAGTAA---T---GGT-AAA---------------AGTA-----GATGGAGTAGTA---GTATTAGTA-GT-GGTtggt
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatctataccgaTAG----TAGATGTAG-T---TGCTGTTGTTTTTGTA--G---TAGCAGTA-T---ATAATGTAATGACATGT--TAGTAA-T---A--AAAAAAGATATATTGTTGTA---------GTA--ACAGTAGTTGT---------CATAGTA---------------GT-------TGT-A--GTA--G----TAAAGTA---GT---A---GTAATA-GA---AGTAGTAG---TTAAAGT-TGTGGT--TG-T------GGTA-----G-T--AGTAGTAT--GTA-TAATA-AT-G--A----T--TATGA-----TT-GA---------AGTAG--TAGT---AGTAGTAGA--AGTA-----------------G-TA--TTAAATAAATATTGGATA-T---------A-ATACTAGTAGTATAT---GTA---GTCATATCAGTA
gi|18 : gATGGTT----GTAGTAGTAGTT---G---TAAC---GGTAGTGATAGA------TGT-----AGTGG---AAG---TT----A--AT-----AT-G-GTA---CT--TGCA--GT---GGTAG---TGG-T---AACAGTAATGATAA----TTGTAGTGGCTA--TG-----------GCA--GAGGTAGATGT-GT---AATT-GTAGTGGC---CAGTTGTAG-T---G--ATAATTG-TT-------GTGTAAGCGGACGTG--GTAGTGGTTGC---------TGTACGA---------------TT-------TGT-A--GCG--G----T--CATG---GA---A---GTGGTA-AC---TGTAGTGG---T---GGT-GTATGT--TG-T------ATTG-----G-T--GATAGCA---GTGGTat
gi|19 : tgtgGTA-TA-ATCACTA----T--TATAA-----TCAAT---------A---------T---ATTACT------GT--------------------TG--TT-ACT-ATTA-TTGATATT---ATC--A-----TCAGT-GT---T---ATG---TT--TAGTATTAT-CATT--A-T--CATTA------TTAT-----T---AGA-AGT------AGA-----CAAAGT-------AGCAATAGTA------GT------ATCA-TAAGTAGCATCAGTAG-ATG--TAGT----AAT-GATAGAAGTGGGA---------GTAGCAG--------TAG-TAACAGCAGTAGCCAAAGCAGTAGCA-----G-TGGTA------GT-A-T--C--AGA---AGC---AG-TAT-CAAT--A--G-TGACAGTAGATGC------A--GT-AG-TAtatatt
gi|19 : TAG---TAT---T-----ATCAT------T-A-TCA---TT--ATTA--TT---AGAAG---TAGAC---AA-AGTAGCAATAG----TAG-------TA--TC-----------ATAA-G---TAGCATCAGT---AGAT-GTAGTAATG-ATAGAAGTGG-G---A--GTAGCAG-TA-------GTA---------ACA--GCAGTAGCCAA---------AGCAGTA---------------GC-------AGT-G--GTA--G----T--ATCA---GA---A---GCAGTA-TC---AATAGTGA---C---AGT-AGATGC--AG-T------AGTA-----a
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgttGT---------AGTAG--AAGC---ATTAGCAAGTTAGTA-----------------A-TT--GT-GGT-AGTA-TG--T-GT---TGT--AA-GTGTACGTA-T---T---GTA---GTAGAAGTAATCT-TTGT--AGTAGCAGAAA--TAGTTGT---AGT---AAA-Aa
gi|20 : ttGTGG---TGG-T---GGTAGAAGTAATAG----TATA-GTAG-TA---------------GTA--G---CAATAGTAGT---AAAA-GTGACGGTG-GTGATAGTAG-T---A--GTAGAAG-AA-------ATG---------GTG--GTGGTGGTGGT---------AGTAGTA---------------GT-------AGT-G--GTG--A----T--GGTA---AC---A---GTAGAA-GT---AGTAGTAG---T---AAT-AACGGT--GG-T------GATA-----T-T---GTAGTA---GTAGTAGTA-AC-GGTG----G--TACAA-----GAAGT---------AGTAG--TGG----AATGGTtcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : gTA-TAAATATTCAAAGC--AGTGTATCATTAAT---------A---GCAACAGTA-TAGATAGT--TGTAGCAGAAG--TA---GT---AGT---AGA-AATA-----ATACTACTACTAGT-------AGTAGTAATA------GT------AATAATAA-TAATAACAATAA-TAggtgg
gi|21 : tagtacatgtaaaatctaAGCAGT-GT---ATCA-TTAATAGCA-ACAGTA-TAGAT---A--GTTGTAG-CA-------GAA---------GTA--GTAGTAGAAAT---------AATACTA---------------CT-------ACT-A--GTA--G----T--AGTA---AT---A---GTAATA-AT---AATAATAA---C---AAT-AA------TA-T------AACA-----A-C--ATTAGTA---GAAGTATTA-A----TA----T--TAAAG-----TTGGA---------AATAC--TGATTTGATTAGTAAA--CGTtaacaacattagtagaagtattaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaG-T---ATT-GTA--ATTAT----TTGAAATAG-TA--TG-----------ATT--G---TGGCAGTAGT---AGTA-GTAGTAGGA-GTAGTAGACG-G---A--GTAGTGA-CG-------GTG---------ATA--GCAGAAAATGG---------AGTAAAA---------------GC-------AGA-A--ACA--C----C--AGCA---GC---A---GTAGTA-GT---AATAGTGA---A---AGT-AAA-GG--TA-T------A--A-----G-T--ATTAGTAAACATAGCA-TA-AT-Ggtcagta
gi|25 : tgacgA--TG-----------ATG--G---TGATGGTGGT---GGTG-GTGGTAATA-AAATTAGTAG-T---G--GTGGGCG-TG-------GTA---------GTA--GAAGTAGTAGT---------TGTATTA---------------GT-------AGT-A--CTA--G----T--AACA---GT---A---ATATTA-GT---AGTAGTAG---C---AGT-TAAAGT--AA-T------AGTG-----G-T--GATGGTG---GTGGTAGTA-aaggtg
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgAGTAA-TA-------GTA---------GTGAGGTAGTAGTTGTTTCTGAATGAGTAGCA---------------GT-------AGT-A--GTA--GAT--T--GGTAATTGT---G---GTTGTA-GC---CGTAGTAT---A---AGT-AGACGTGATG-T------AGTATATTAA-T--AGTAGTA---GTAGTAATG-AT-GC-A----T--TACAA-----GCAGT---------ttagcagaag
gi|28 : tattgttgttgtataAGCATCAGCA---ATCG-----CAATCGCAATCATA----GT--CA-CAGTC---G---TAGC---AGTAGT-----T------GCT------GTA----------------G--AA-----GT-A-TCA---TC--AGCA---------------TAA-C---ATTAGCAACATTAG----CAGAAGAAG-CA---------------ACA--A---CATCAGCAGT---AGCA-GTAGCTGCA-ACAGTAGTAA-T---A--GAAG
gi|3 : ATAGTAGTAT-A--AGT-CATA---ATA-GT---AGTAATAA------TAGTAGAAGTAGAAGCAG---C------AGCA------GCTGTAGC-----AG-----TGGT---A---GTA---GT---GGTAGTAA---TAG--TG-A-T----GTCATT----AT--TATCA---GTAGT---AGTA-ATATTATAATC--ATTG--GTGGTAG--TAGTA-TGAATAGTA---GCCAA-----A--GA--AAA---------A---GTAGCTGT----AGCA---GTA-GTAGTAGCAAC--AG---TAGCAGCAGCA---ATTG----TAGTATA-A---GTTATAAAAGTAGTA---ATAA-----TAGCAGAAATAATA----GCAGCAGCAGCT---G---TTGC---AGTAGTAGTAGT------GGT-----AGTAG---TAC---T-----G--AT-----GTCA-TTA---TT--ATCA--GT---AGTAG---TAA-T---ATTATTAGCATTGG----TGGAAGTAG-TA--TGG----------ATA--G---TAACAGAAGT---AAAA-GTAGTTGAA-GCAATAGTAG-T---A--GTAGCAA-CA-------GTA---------GCA--GCAGTAATTGT---------AGTATAA---------------GT-------AAT-A--ATA--G----T--AGTA---AT---A---CTAGTA-GA---AGTAGTAG---C---AGC-AGCTGC--TG-T------AGCA-----G-T--AGTGGTA---GTAGTAGTG-AT-GTCA----T--TATAA-----TCAGT---------AGTAG--TAAT---ATTATTATC--AGTG-----------------G-TG--GT-AGT-AGTA-TGGATAGT---AGCCAAA-GAAAAAGTAGT---T---GTA---GCAGTAGTAGTAG-CAAC--AGTAGCAGCAG--CAATTGT---AGT---ATA-AGT------AAA-----AATAGA-------AGCAATAGAA------GT------AGAAGTAA-TAGCAGCAGTAG-TAA--TGGC----GGT-GTCGGCGGTGGCG---------ATAGCGG--------CAG-TGACAGTAATAGT---AGCAGAAACA-----G-TAACG------CT-A-T--C--AGC---AAT---AA-TAG-TGAA--A--G-T---AGCAGCAGC------A--AT-AA-TAGTAGTAGTTG------T------AGTCGTAGA---TGCTGTAGTAGTTG---TTGTAGTAGTTACTTTAt
gi|31 : AATT--ATTA--ATAATAAAATAATA-T-AATA-TA---AT--A-----A--AATCAAT---------ACAGGCACCAGT----AACA---GTA-GTAGAAGC-----AG---CAGCAGAAGTA---ATAA----TAGTA----------ATAGCAGACGTA---GTAG-----TAATAGACATAGAC----GTAGATGTAaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : ga---AGTAACAG------TAGTAGAAGCAGCAGCAG---A------AGTA------ATAATAGT-----AA-----TAGC---A---GAC---GT---AGTAGTAA---TAG--
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCAGTATGAGTTGATTTTACTT-A-A---GTTATAA-A--AGCA---GTGG-----TAGTAGCAGTAGTA----CCAGTAGTAACT---G---TAGC---AATATCAGTAGC------AAT-----AGCAA---TAC---C-----G---------GT-G-CTG----C--AACA--GT---AATAT---CAT-T---ATTATTAacatagacgtagatgta
gi|32 : tatAGT---T---ATAAAAGCAGTGGTAGTAG-CAGT--AGTACCAGTAG--TAACTGT---AGC-------AAT------AT--------CAGT-------AGCAATAGCA------AT------ACCGGTGC-T-GCAACAGTAA-TAt
gi|34 : tatgcagtatgagttgattttacttaTAGTTGTT-GCAGTAGTTG-TT--ACTGTTGAAA-TA-------ATA---------ATA--GT--TA-TTGT---------AGTACAA---------------GT-------AGTTATTATA--G----T--CATA---AG---A---GTAGTA-GT---AGTAGTAG---T---AGT-AGAAGT--TT-T------GGTT-----G-A--AGTAGTA---GTTGTtcattattattat
gi|35 : AGTAGA------AGT-----AGT-----TAA---T--------AT------T-A-TTA---TT--AAAA--GT---A-TA------------ATTAGTAGAAATAGAAAAAAGAAGTAG-TG---G-----------ATA------TAGCAATAGT---AGCA-GCAGTtg
gi|35 : aa---A--GTAGAAG-TA-------GT-----------TA--ATATTA-TTAT-----------TAAAA---------------GT-------A-T-A--AT--------T--AGTA---GA---A---ATAGAA-AA---A--AGAAG---T---AGT-GGATAT--AG-C------AATA-----G-T--AGCAGCA---GTATTGTTA-TT-ATTA----T--TATAA-----CTAGT---------AGAAA--TAattgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGTATTAC-T---A--GTAGTAG-TA-------GTA---------ATA--GTAAAAGTTGT---------AGTAGTA---------------TT-------AAT-A--ATA--ACCCTT--AGTA---AT---A---GTAACACTT---AGTAGTAG---A---AGA-AGATGT--TA-T------A
gi|37 : aaaaaagttg-A-T--C--AGC---ATT---AG-AAG-TGTT--G--G-T---ACTAGTAGC------A--AT-AA-TGGTAGCCGTGG------T------GGTAGTAGT---TGTTATTTTGGTTG---TTGTaca
gi|38 : gttatcgttatcTA--GTAGTAG--TAGTA-A-AATAAGA---AT--A-----A--GT--ATT---------G---GTGACAGT----AGCA---ACA-TCACTAGCGGT--AT---TATCAGTAGTG---GTGG----Ttattgtac
gi|39 : gAATAGTG-----G-TAATA------GT-A-T--G--AGA---GGT---GG-TTG-TG-------G-T---AGTAGTAGT------A--GT-AG-TAGAGATGGTGG------A------GGTAGTAGT---TGTTGTGGTGGTTG---TCGTAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : --GTAAAAG-TA-------GTA---------TTA--ATAGTTGTTGT---------GGTATTA---------------GT-------AAT-A--GTA--G----G--AGTT---GT---T---ACAGTA-GT---TGTAGTTGACAC---AGT-AGTTGT--TG-T------AGTA-----------GTAGTA---
gi|41 : CAGCAGCG---------GCAGCGG--------CAG-TAGCAGTAGTAGT---AGTAGCGGCA-----A-TATCG------AT-G-G--T--A-----AAT---A--TAA-TGATGCA--G-T---AGTAGTGA-------A--AT-AA-TA
gi|42 : AG-TA-------GCA---------GTA--GTAGTAGTTGT---------AGTAGTA---------------TC-------AGT-A--GCA--A----T--AGTA---CA---AT--GTAGCA-AA---ATCAGTAG---C---AGT-A
gi|43 : aagaagtacttcgGG--------TGG-TGGTGGTGGTTAT---GGTAGTTGTG-----G-TTACG------GT-GGT--T--A-C---GGT---GG-TGG-TGGT--A--G-T---AGAAGTAGT------A--GC-AG-TAGTAGTA
gi|43 : -----------ATG--G---TAGTTGTGGT---TACG-GTGGTTACG-GTGGTGGTGG-T---A--GTAGAAG-TA-------GTA---------GCA--GTAGTAGT
gi|43 : ggtggtggtggtggtt---C------GGTG------GTGGTGGT-----AG-----TAGA---A---GTA---GT---AGCAGTAG---TAG--Ta
gi|44 : ggtggtggtggtggttatggtagttgtggttacggtggttaAG--TGGC------T--TTGGCGGTGACG---------ATGGCGA--------TGG-TGGTGGTGGTGGT---GGTGACATAT-----T-TAGCG------GT-A-G--T--AAC---AGT---GG-TAG-a
gi|45 : acAGTAGTA---ATAG-----TAGTAGAAATAGTA----GTAGAAACA------G---TAGC---AGTGATAGAAGT------GG
gi|46 : catgaa-----------ATA--G---TAGCAATTGT---AGTT-GTAGTAGT--GCAGTGGTAG-T---A--ATAGCAG-TA-------Gataagaata
gi|47 : gttgtaacAGCAGTAGTCGCAA---C------AGTA------GTCCCAGT-----AG-----TAGT---A---GCA---GC---AATAGCAG---TA
gi|5 : AGTAGT---AGAA-ATAAT---A-GTAATAATAG-T---A--GTGGTGG-TG-------GTA----------TG--GTAGTACTTGT---------AATATTA----------------T-------GGT-G--GTG--G----T--AGTA---GT---A---GTAGTT-GT---AGTAGTAG---T---GAT--GATGG--TGTT------AGAA-----G-T--AGTCGAG---GTGGTGGTG-AT-GATA--------ATGATGGTGGTGGT---------AGTGG--TAGT---AGTAATAGA--GGTNNNNNNNNNNTAATAGAGG-TA--GT-AGT-AGTA-TTGATAG---------AA-GTAGCAGTAGT---A---GTG---GTGGTAGT--TA-----T--AGTATTAGTAA--TGGTTGT---GGA---AGA-AGT------ATA-----AGTGTT-------GGTGATTGTG------GT------GTTAGT-T-TAGTAGTAGTAG-TAA--TTGT----GG----CAGTGGTAGAA---------GTAGTAA--------TGG-TAGTGGTAGCAAT---AGAAGTAGCG-----ATTGGTGATTTAAGT-A-TAGT--AGA---AGT---AG-TAG-T-AT--A--ATT---GGTTGTGGT------A--GT-AG-TAGTAATAGTAGTATTATT------AGTAGTGGT---AGTGGCAGTAGTTG---TTGTGGTGGcca
gi|5 : atAGTAGTCG-A--GGT-GGTGGTGATG-AT---AATGATGG------TGGTGGTAGTGGTAGTAG---T------AATA------GAGGTNNN-----NNNNNNNTAAT---A---GAG---GT---AGTAGTAG---TAT--TG-A-TAGAAGT-------------AGCA---GTAGT---AGTG-GTG--GTAGTT--AT-A--GTATTAG--TA--A-T-GGTTGTG---G---A-----A--GA--AGT---------A---TAAGTGTT----GGTG---ATT-GTGGTGTTAGTTTAG---TAGTAGTAGTA---ATTG----TGGCA-------GTGGTAGAAGTAGTAATGGTAG-----TGGTAGCAATAGAA----GTAGCGATTGGT---GATTTA-----AGTA-TAGTAGA------AGT-----AGTAG---TATAATT-----G--GTT----GT-G-GTA---GT--AGTA--GT---AATAG---TAG-T---ATT------ATTAG----TAG-----------TG-----------GTA--G---TGGCAGTAGT------T-GTTGTGGTG-GCGGTGATAG-A---A--GTACTAA-TG-------GTG---------GT---GT--TGGCTGT---------GGTAGTA---------------GT-------AGT-A--GTG--G----T--GGTG---CT---G---GTGTTA-GT---A-TAGTAG---T---ATT-AG-TGT--TG---------GTG-----G-T--GGTGGTG---GTGGcggtgatagaagtactaatggtggtgttggctgtggtagtagtagtagtggtggtgctggtgttagtatagtagtattagtgttggtggtggtggtggtgg
gi|7 : atagtagtagaaataatagtaataatagtagtggtggtggtatggtagtacttgtaatattatggtggtggtagtagtagtagttgtagtagtagtgatgatggtgttagaTA-GT---AGTAAAAG------GAGTAAAAGTAGCAGTAG---A------AGAA------GTAGAAATAAGAAAA-----TAGT---T---TTT---GC---AGCAGTAA---AAG--TA-T-C----AC--TT----ATAGCAGCA---GAAGC----GTA-ATA--AGAAGT--ACTG--ACAGAAG--CA--A-A-AGTTG---------A-----A--GA--AGC---------A---GCAGCAGT----CGCAAACGTT-GTTGTAGCAAC--A----T--CAGAAGTA---G-----------A-A--------ACAGTAGTAGTA---GCAG-----TAGCAGAAAAAGTG----ATAGCACCAGCTTAAG---TAGC---AGTCGTAATAGT------AGTAACAGAGAAG---CA----------G--AA-----GT-A-GCA---GT--AGCA--GC---AGCAGACACAG-TAAAAGTAGTAGCAGAAA----TAGAAGTAG-TA--T-------------TA--G---CAGCAG--AT---A-AA-GTAGTTGTA-GCATCAGCTG-A---A--GAAGAAG-CA-------GTA---------GTA--GCA------GC---------AGCAGCA---------------GT-------AGT-A--GTA--G----T--AGCA---GC---A---GAAGTA-GT---AGTAATCG---C---AGC-AGCTGA--AA-T------AGTA-----G-C--AGCAGAAAACGTAGTTGCA-AT-GGTAACATT--TATTA-----CT-GT---------AGAAA--TAAC---AGCAAGGGA--AGTA-----------------
gi|9 : GTA------GCAGTAGT-----AG-----TAGT---A---GTA---GT---AGTACTAG---TAA-----A-A----GT--TTCAGAAG--CAGCA---GCAGT---A-TACATA--ATAGTT--ATTG---TAGTAG--TAGTA-C-TG--------------------------GT---------T---GTAGCTGC----AGCA---ATATGT-GTAGCAGT--AT---TAGAAGCA
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTGAGTAGGTGGTGTTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGGTAGTGTAAATGGTGGTGGTGGTAGTAGCGGTGGTGGTGGTGGTAAACATTATGGTGGTAGTGACGAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAACGGTGGTTGTTATTGCGGCGGTGGTGAT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|29 ): GATAGTGGTGGTAGTGATAATGGTGGTGGTGATAGTGACGGAGATGGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGTGACAATGGTAGTGGTATGTGTAGTGGTTGTGGTGTGTTTGATAGTGGTAATGCTGGTGGTGGTGGT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 1111 3333333 222222222222 11111111111 111111111 555555555555555555 111 111111111 222222222222 333333333333333333333333333333333333 222222222222222 11 1111111111111 11111111111111111111111111 222222222222222 66666666666666666666666 111111 111111111111111111111111 1111111111111 1111111111 11111111 11111 33333333333333333333333333333333 1111111 1111 1111 11111111 111111 111
lowQualScore : 5555 6666666 5 77 2 333333333333 99999999999 55 0 6666 666 666666666 555 555 44 555 888888888888888888 666 666 000 666 55 3 666 77777 22 222222222 2 888 33 1 444 222222222222 33 777 333 2 444 444 1 444 888888888888888888888888888888888888 4 5 777 22 3 33 6666 555 0 0 555 88888 1 777777777777777 88 22 555 444 2 5555 2 1 77777 33 2 4 11 2 2 333 333 333 1 1 999 777 1 777777777 22 777777777 4444 44 8888 333 4444 333 1 333 333 2222222222222 33333333333333333333333333 555555 777777777 22 333 6666666666 777 3 777777777777777 2 33 555 1 7777 8888 66 11111111111111111111111 4 666 000000 0 6 0 2 33 44 5555555 9999999999999 3 999999999999999999999999 3 3 8888888888888 5555555555 3 0 55 88888888 00000 0 11111111111111111111111111111111 2 22 666 0 3333333 666 3 0000 666 77777 66 88888 0 9999 2222 5 22222222 555555 44 111 4
lowQualScore : .... ....... . .. . ............ ........... .. . .... ... ......... ... ... .. ... .................. ... ... ... ... .. . ... ..... .. ......... . ... .. . ... ............ .. ... ... . ... ... . ... .................................... . . ... .. . .. .... ... . . ... ..... . ............... .. .. ... ... . .... . . ..... .. . . .. . . ... ... ... . . ... ... . ......... .. ......... .... .. .... ... .... ... . ... ... ............. .......................... ...... ......... .. ... .......... ... . ............... . .. ... . .... .... .. ....................... . ... ...... . . . . .. .. ....... ............. . ........................ . . ............. .......... . . .. ........ ..... . ................................ . .. ... . ....... ... . .... ... ..... .. ..... . .... .... . ........ ...... .. ... .
lowQualScore : 4444 3333333 7 99 2 444444444444 00000000000 55 7 7777 444 555555555 888 888 66 888 000000000000000000 444 444 000 444 00 1 333 77777 66 555555555 7 333 11 1 777 222222222222 44 888 999 5 444 444 3 777 333333333333333333333333333333333333 3 7 333 00 4 88 0000 888 5 8 444 33333 2 555555555555555 33 22 000 777 5 4444 8 0 66666 22 4 7 11 1 1 777 777 777 0 8 444 000 0 666666666 66 555555555 8888 77 5555 555 2222 444 9 333 333 7777777777777 88888888888888888888888888 555555 666666666 88 777 4444444444 444 6 555555555555555 7 99 444 0 2222 0000 88 88888888888888888888888 0 444 555555 2 5 7 1 55 22 5555555 9999999999999 3 222222222222222222222222 6 6 2222222222222 7777777777 6 4 00 11111111 00000 2 55555555555555555555555555555555 4 22 444 2 4444444 222 6 9999 444 55555 55 77777 5 3333 5555 3 66666666 333333 66 777 0
consensus : ATAGTAGTAG-A--AGT-G--A--AT-A--GTAGTAACA-----G------TAGTAGAA-----------GTAGTA--GCAG---CA---GTAGT---A-----GTAGTAGTAGTAGT---AGTA---GTA--GT---AGTAG--TAA-T-T--T--TNNCAGC---AGTAG---TAGT---A---GTA--GTAGTT--AT-----TGGTAGTA------G--TA-G-T-AT-AGTAGTA---GT-----A------AGA--AGTA---GTAGC--AGTAGCAGTA-GT---AGTAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTAGT--------TG-TAGTA-A-------AGT-A----TAGCAGTAGTAGTAGTA---GTAGNAATAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---AGTAGTAGTAG---TAGTA-----GTAGTANT-G--ATGT-A-TTAN-TANCAGT---AGTAG---TAG-TAN---TAGTAGCANTAGTAG--AAGT--AG-T-ATG-AT-A-G---TAGCAGTAG---TA---GNAGTAGTNG-CGGCGGT---AGTAGTAGTAGNAGTAGTA---------GTA--GTAGTAGT--------TGTA---GTANNAGTA----GTAGT---AG----TAGTAG--TAGTAGTA-GT---AGTAGT---AG---C---------AGT-A--GA-----T-G-------T--T-G------TA---------G--TAGTA---GTAG------T---A---GTAGTAGTAATGGT--A----TTATAAGCAGTAG-TAG--TAGT---AGTAGTAGA--AGTAGTG---GTAGTAGTATG-ATAGTAGC--AAGTANNAGTAGTT-GTA---GT------AGTAGTAGTAGNAGTAGTAGCAGTAGTAA-TTG--T---A---GT---ANAA------GT-AT------A--A---GTA-------GTAGCA-GT-AGTAGTAGCA-----------GTA-AT-AGCGGCAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCGGCGG-----TAGCG---------GTA--GCGG---CG---------GTGGCGGTAGTAGTGGT---AGTAGTG-----GTAGCGGT-A-N--TAGC---AGT---A-GTAG-TGATA--GTAGTAGTGGT---AGT----AGTAGTAGTAGTGGT---AG---TAGTAG-----TTGTTGTAGTGGTTG---TTGTAGTAGTNGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAG-A--AGT-G--A--AT-A--GTAGTAGCA-----G------TAGTAGAA-----------GTAGTA--GCAG---CA---GTAGT---N-----GTAGTAGTAGTAGT---AGTA---GTA--GT---AGTAG--TGA-TGT--T--TATCAGC---AGTAG---TAGT---A---ATA--GTAGTT--AT-----TGGTAGTA------G--TA-G-T-AT-AGTAGTA---GT-----A------AGA--AGTA---GTAGC--AGTAGCAGTA-GT---AGTAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTAGT--------TG-TAGTA-A-------AGT-A----TAGCAGTAGTAGTAGTA---GTAGNAATAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---AGTAGTAGTAG---TAGTA-----GTAGTANT-G--ATGT-A-TTAT-TANCAGT---AGTAG---TAG-TAN---TAGTAGCANTAGTAG--AAGT--AG-T-ATG-AT-A-G---TAGCAGTAG---TA---GNAGTAGTNG-CGGCAGT---AGTAGTAGTAGNAGTAGTA---------GTA--GTAGTAGT--------TGTA---GTANNAGTA----GTAGT---AG----TAGTAG--TAGTAGTA-GT---AGTAGT---AG---C---------AGT-A--GN-----T-G-------T--T-G------TA---------G--TAGTA---GTAG------T---A---GTAGTAGTAATGNT--A----TTATAANTAGTAG-TAG--TAGT---ANTAGTANA--AGTAGTN---GTAGTAGTATGGATAGTAGC--AAGTANCAGTAGTT-GTA---GT------AGTAGTAGTAGCAGTAGTAGCAGTAGTAA-TTG--T---A---GT---ANAA------GT-AN------A--A---GTA-------GTAGCA-GT-AGTAGTAGCA-----------GTA-AT-AGCAACAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCGGCGG-----TAGCG---------GTA--GCGG---CG---------GTAGCGGTAGTAGTAGT---AGTAGCG-----GTAGCGGT-A-T--TAGC---AGT---A-GTAG-TGATA--GTAGTAGTGGT---AGT----AGTAGTAGTAGTNGT---AG---TAGTAG-----NTGTTGTAGTAGTTG---TTGTAGTAGTTGCTTTA
gi|1 : TAGTA------G--CA-----AC-AGCAGTA---GT-----A-------GA--AGCA---GCAGCGAAACA-CAGTA-GA---AGTAGCAG---TAGTAGCAGAA---G-AG----------G-TAGGA-A-------A---------------AGTATTTGCA---ACAGAAATAGTAGTAGCA-GCAGCT---GAAGT---AGTTGTAATAT---CAGCA-----GCAGAAAT-------------AG-TAGTAGT---AGCAA---CAG-AAA---TAGTAGCAACAG-----AAGT--AG-TTATA-GT-A-G---CAGCAGCAG---AA---GCAGTAGCCG-TAGCAGC---AGCAGGAGTAGCCATAGTA---------GCA--GAAGCAGTCGATGTTTTGTT---GTTATTGTACTTTATTGC---TG----TTGTTA--TAGTAGTA-GT---ACTAGT---AG---A---------AGA-A-----------G-------T--A-G------TA---------G--CAGCA---GCAA------A---A---TTACTAGCAATATC--AGCAGTTA-AAGTAGTAG-TTG--TAGTTACAGCAATAAA--AATAG-A---ATA--AGTATCTTCAGCAA---AAGTAGTAGCAGTG-GTA---GTTTCATCAGCATTAATAGAAATAGTAGCAGCAGCAA----------A--------AGAA------GT-CG------T--A---GTA-------GTAGCA-CC-AATAGTAGTA-----------GTAGATCAGCGAAATTTA-TAG--T
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaatAGTAG-A--AGT----A--GC-A--GTAGTAGCA-----GAAGAGGTAGGAAAA-----------GTATTT--GCAA---CA---GAAAT---A-----GTAGTAGCAGCAGC---TGAA---GTA--GT---TGTAA--T------------ATCAGC---AGCAGAAATAGT---A---GTA--GTAGCA--ACAGAAATAGTAGCAACAGAAG--TA-G-TTAT-AGTAGCA---GC-----AGC----AGA--AGCA---GTAGC--CGTAGCAGCA-GC---AGGAGTAGCCATAGTAGCAGAA---GCAGTCGATGTTTTG-TTGT------------T-A----TTGTACT--TTATTGCT---GTTGTTATAGTAGTAGTA-CTAGTA---GAAGA---AGTAGTAGCAG---CAGCA-----AAATTACT-A----GC-A-ATAT-CAGCAGTTAAAGTAG---TAG-TTG---TAGTTACAGCAATAA--AAAT--AG-A-ATA-A----G---TATCTTCAG---CA---AAAGTAGTAG-CAGTGGT---AGTTTCATCAGCATTAATA---------GAA--ATAGTAGC--------AGCA---GCAAAAGAA----GTCGT---AG----TAGTAG--CACCAATA-GT---AGTAGT---AGAT-C---------AGCGA--AA-----T---------T--T-A------TA---------G--TNNNN---NNNN------N---N---NNNNNNNNNNNNNN--N----NNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNN---NNNNNNNNN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-NNN---NN------NNNACT-GT--CA-CAGCAGCAGTA-TAA------T---A---GT---ATAA------GT-AC------A--A---GAA-------GTAGCA-GC-CGCAGCNNNN-----------NNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-----NNNNN---------NNN--NNNN---NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNTGTTGTTGTGGT-G-A--TAGT---AGT---A-GTAA-TAGAA--GTAGTAGTGGT----GTTTGAAATAGTAATAGTGGT---AT---TAATAT-----AAATAGTAGTAGTAGAACATGGAGCAGTAGTTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacATAGTAGTAGTACTAGTAG--A--AGAA--GTAGTAGCA-----G------CAGCAAAA-----------TTACTA--GCAATATCA---GCAGTTAAA-----GTAGTAGTTGTAGTTACAGCA---ATA--AA---AATAGAATAAGTAT--C--T-TCAGCAAAAGTAG---TAGC---A---GTG--GTAGTTTCAT-----CAGCATTA------A--TA-GAA-AT-AGTAGCA---GCAGCAAA------AGA--AGTC---GTAGT--AGTAGCACCA-AT---AGTAGTAG---TAG-ATCAGCG---AAATT--------TA-TAGTN-N-------NNN-N----NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN---NNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNNN-----NNNNNNNN-N--NNNN-N-NNNN-NNNNNNN---NNNNN---NNN-NNA---CTGTCACAGCAGCA----------G-T-ATA-AT-A-G---TATAAGTAC---AA---GAAGTAGCAG-CCGCAGC---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNN--NNNNNNNN--------NNNN---NNNNNNNNN----NNNNN---NN----NNNNNN--NNNNNNNN-NN---NNNNNN---NN---N---------NNT----GT-----T-G-------T--T-GTGGTGATA---------G--TAGTA---GTAA------T---A---GAAGTAGTAGTGGT--G----TTTGAAATAGTAA-TAG--TGGT---ATTAATATA--AATAGTA---GTAGTAG----------AAC--ATGGAGCAGTAGTT-TTA---GT------AATATTAGTAGTTGTAGTATTAGTAGCAA-TTG--T---CGTTGT---ACAAGTTTTCGT-AT------A--A---ATATTTTTTTTTAG-A-GT-AGTAGTAACA-----------GTA-AA-AGAAGAAGTAG-TTA--TAACAG----CAGCAG-----TAGTA---------GTA--------------------GTAATATTATTATTAGT---AGTAAT------TTAATAGT-A-G--TAGA---AGT---T-GTTGTTGATATGGTTGTTGTTGT---AAT----AGTAGTAGAAGTGGT---GG---TAGTAgtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttAGCA------G--CA-G-T-AT-AATAGTATAAGT-----ACA----AGA--AGTA---GCAGC--CGCAGCNNNN-NN---NNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNNN--------NN-NNNNN-N-------NNN-N----NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTT---GTGGTGATAGTAGTAGTAA---TAGAA-----GTAGTAGT-G--GTGT-T-TGA---AATAGT---AATAG---TGG-TAT---TAATATAAATAGTAG--TAGT--AG-A-AC--AT-G-G----AGCAGTAGTTTTA---GTAATATTAG-TAGTTGT---AGTATTAGTAGCAATTGTC---------GTT--GTACAAGT--------TTTC---GTATAAATATTTTTTTTT---AG-----AGTAG--TAGTAACA-GT---AAAAGA---AG---A---------AGT-A-----------G-------T--T-A------TA---------A--CAGCA---GCAG------T---A---GTAGTAGTAATATT--A----TTAT---TAGTAG-TAATTTAAT---AGTAGTAGA--AGTTGTT---GT--TGATATG-------------------GTTGTT-GTT---GT------AATAGTAGTAGAAGTGGTGGTAGTAANNN-NNN--N---N---NN---NNNN------NN-NN------N--N---NNN-------NNNNNN-NN-NNNNNNNNNN-----------NNN-NN-NNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNNNNNN-----NNNNN---------NNN--NNNN---NN---------NNNNNNNNAGTAATGGT---AATGTTG-----ATAGTGTTAA-TCGTAGCATAAGT---A-GTAG-AGGAA--GTAGTGGTAGT---AGT----AGTTGTAGTAGAAGCATAAG---CAGAAT-----TTTTTGCATTAGTAG---TTGCAGTAGTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacAGTAATGG-T--AAT-GTTG--AT-A--GTGTTAATC-----G------TAGCATAA-----------GTAGTA--GAGG---AA---GTAGT---G-----GTAGTAGTAGTTGT---AGTA---GAA--GCATAAGCAG---AA-TTT--T--TTGCATT---AGTAG---TTGC---A---GTA--GTATGT--GT-----TGTAAGT-------G--TGCG-T-AT-TGTATTA---Gatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGTAGTAGAAGTAGGTGTAGTAG-TTG--T---G---TT---AGAA------GT-AGTTGGAGA--A---GTA-------GTAACA-GT-AGTGGTGGTG-----------GTA-----------GTAG-TAG--TGATGAT-GATGGTGGAGATATAGTG---------GTA--GTAG---------------TAGAAGTAGTAATAGT---AGTAGTG-----GTGGTGGT-A-A--TAGT---CGT---A-GTA----ATT--GTGGCGGTGGT---GGT----AGTAGTAGTAGT-GT--------TGGTTG-----CGGTTGTAGTGGTagg
gi|10 : tgaTGGTAGTAG-T--AGT-G--ATGAT-G--ATGGTGG-A-----GATA---TAGTGGTA-----------GTAGTA--GAAG---TA---GTAAT---A-----GTAGTAGTGGTGGT---GGTA---ATA--GT---CGTAG--TAA-T-T--G--TGGCGGT---GGTGG---TAGT---A---GTA--GTAGT---GT-----TGGTTGCG------G--T----T-GT-AGTGGTG---AT-----G------ATG--ATTA---NNNNN--NNNNNNNNNN-NN---NNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNNN--------NN-NNNNN-N-------NNN-N----NNG--GTGGTGGTGGTGCAGGTGGTGATAGTAGTAGTG-GGAGTG---GTGGT---GGTGGTGGAAA---TAATA-----GTAGTAGAAG--AAGT-A-GTAAATAT-AGT---AGTAG---CAG-TAG---AAGTGGTTGTGGTGG--GTGT--GG-T-ATgatgatgattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtggtggtggtgcaggtggtgatagtagtagtgggagtggtggtggtggtggaaataatagtagtagaagaagtagtaaatatagtagtagcagtagaagtggttgtggtgggtgtggtatta
gi|12 : tgatggtggtagtagaagtaggtgtagtagttgtgttagaagtagttggagaagtagtaacagtagtggtgg---GT------GGTATTTGTAAAACTGGTACTGGTACTGA-TTG--TGTTA---GTGCCATAG------GT-AT------A--A---GTA-------GTAGTG-GT-AGTGGTAGCA-----------GTA-AT-TATGACAGTGGATGGGATGGTGGTAGTCGGTGG-----TAGTGTTGATGTTGGTA--GTGG---TGTAAATGCTGATAGCGGTAGTGGTGGT---TGGGGCG-----TT---GGT-G-T--TAGC---AGTGGAA-GTGT-TGATG--TTGGTAGTGGT----GTA---AATGTTGATAGCTGT---AGTGTTGGTGGGGTCTTTGTTGT--TATTTA---TAGTGGTAGTta
gi|13 : attgcttT---AGTAATAATAGAGAT-------------GTA--CTAGTAGT--------TGTA---GTGAAAGTG----GTAGC---GT----TAGTTG--TAATGGAA-AT---GGTAGT---AG---C---------AGT-G--GAACACAT-AAGGGAATT--T-G------TA---------G--TAGTACATATAG------T---G---GTAGTGATAGTGGT--A----------GCAGTAG-TTG--TAAT---GGAAATGGA--AGTGGGACACGTAAGGGAATTGGTAGTAGT--ATATAC----AGTG-GTA---GT------GAAAGGGGTAGCGGTAGTTGTAATGGAAA-TGG--T---A---GT---GGTT------GT-GA------A--ACATGTA-------AGGGAA-TT-GGTAGTAGT-------------TA-AT-G----CAGTGG-TAG--TGATAAT-GGTAGCGG-----TAGTT---------GTA--ggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgat---TAGTA-----TCATTATT-G--TTGT-AATTAT-CATCATT---ATTAC---TAT-TAT---CTATACCGATAGTAT--TTGT--TA-T-AT---T-A-G----AGTTGTTG---TT---GTACTAGTAG-AGGTAGT---AGTATTAGTTGAAGTAGTA---------AT---GTAGCAGC--------AGTA---GTATTAGTT----GTAGT---AG----TAAT------GTAGTA-GC---AGTAAT---AG---T---------AGT-T--GT-----T-G-------T--T-G------TAAGATCAGCAG--TAGTG---GTGGCGATTCT---A---GTAGTAGAAGTAGTA-A----TGGTAAA-AGTAGATGG---AGT---AGTAGTATT--AGTAGTG---GTatg
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgaGTAGTAGATGTAGTTGCTGTTGTTT-TTG--T---A---GT---AGCA------GT-AT------ATAAT--GTA-------ATGACATGTTAGTAATAAAAAAAGATATATTGTT-GT-AGTAACAGTAG-TTG--TCATAGT-A---GTTG-----TAGTA---------GTAAAGTAG---TA---------GTAATAGAAGTAGTAGTTAAAGTTGTG-----GTTGTGGT-A-G--TAGT---AGT---ATGTA--TAATA--ATGATTATGATTGAAGT----AGTAGTAGTAGTAGA---AG---TAGTA
gi|17 : GTAGTAG-C--AGT-A--T--AT-AATGTAATGACATGTTAG------TAATAAAAAAAGATATATTGTTGTA--GTAA---CA---GTAGT---T-----GTCATAGTAGTTGT---AGTA---GTAAAGT---AGTAG--TAA-T-----------AGA---AGTAG---TAGTTAAA---GTT--GTGGTT--GT------GGTAGTA------G--TA-G-T-AT--GTA-TA---AT-----A------ATG--ATTATG-ATTGA--AGTAGTAGTA-GT---AGTAGAAG---TAGTATTA--A---ATAA----------A-TATTG-G-------A-T-A----TAATACTAGTAGTA-TAT--GTAGTCATATCAGTAttaaataaatattggatataatactagtagtatatgtagtcatatcagtaat
gi|18 : gtagtagatgtagttgctgttgtttttGTGATGGTTGTAGTA-GTAGTT---GTAAC---GGTAGTGATAGATGTAGTG-----GAAGT--T-A--ATAT-G-GTAC-TTGCAGT---GGTAG---TGG-TAA---CAGTAATGATAATTG--TAGT--GGCT-ATG-GC-A-GAGGTAGATGT-G---TA---ATTGTAGTGG-C--CAGT---TGTAGTGATAATTGTTGTGTAAGCGGACGTG--GTAGTGGT--------TGCT---GTACGATTT----GTAGC---GG----TCATGG--AAGTGGTA-AC---TGTAGT---GG---T---------GGT-G--TA-----T-G-------T--T-G------TA---------T--TGGTG---ATAG------C---A---GTGGTat
gi|19 : t--ATAT-A-TTAC-TGTTGTT---ACTAT---TAT-TGA---TATTATCATCAGT-GTTATGTTTAG-T-ATT-ATCA-T---TATCATTAT---TATTAGAAGTAGACA-AAGTAGC---AATAGTAGTATCATAAGTA---------GCA--TCAGTAGA--------TGTA---GTAATGATA----GAAGTGGGAG----TAGCAG--TAGTAACA-GC---AGTAGCCAAAG---C---------AGT-A--GC-----A-G-------T--G-G------TA---------G--TATCA---GAAG------C---A---GTATCAATAGTGAC--A----GTAGATGCAGTAG-TAtatatt
gi|19 : gtataatcactattataatcaTAGTATT-ATCAT-T-A-TCAT-TATTATT---AGAAG---TAGACAA----AGTAGCAATAGTAG-----------T-ATC-AT-AAG---TAGCATCAG---TA---GATGTAGTAA-TGATAGA---AGTGGGAGTAGCAGTAGTA---------ACA--GCAGTAGC--------CAAA---GCAGTAGCA----GTGGT---AG----TATCAG--AAGCAGTA-TC---AATAGT---GA---C---------AGT-A--GA-----T-G-------C--A-G------TA---------G--TAa
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcagtgttatgttGTAG-TAG--AAGC---ATTAGCAAGTTAGTAATT---GTGGTAGTATG--T-GTTGT--AAGTGTACGTA-TT-GTA---GT------AGAAGTAATCTTTGTAGTAGCAGAAATAG-TTG--T---A---GT---AAAA------a
gi|20 : ttGTGG---TGG-TGG---TAGAAGTAATAGTA------T--AG-T-A---GT-A-G---TAGCAATAG---TA---GTAAAAGTGA-CGGTGGTGATAGTAGTAGTAGAAGAAATG---------GTG--GTGGTGGT--------GGTA---GTAGTAGTA----GTGGT---GA----TGGTAA--CAGTAGAA-GT---AGTAGT---AG---T---------AAT-A--AC-----G-G-------T--G-G------TG---------A--TATT----GTAG------T---A---GTAGTAGTAACGGT--G----GTACAAGAAGTAG-TAG--TGG----AATGGTtcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : gAGCAGT-GTATCATTA---ATAGCAACAGTA-TAG---ATAGTT---GTAGC---AGAAGTAGTAG---TAGAA-----ATAATACT-------------AC-TACTAGT---AGTAG---TAA-TAG---TAATAATAATAATAA--CAAT--AA-T-----AT-A-A---CAACATTAG---TA---GAAGTAggtgg
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaAGCAG--T-GTATCA-TT---AATAGC---AA---C---------AGT-ATAGA-----TAG-------T--T-G------TA---------G--CAGAA---GTAG------T---A---GTAGAAATAATACT--A----CTAC------TAG-TAG--TAGT---AATAGTAAT--AATAATA---ATAACAATA---ATA-TAAC--AA----CATTAGTA-GAA---GT------ATTAATATTAA-AGT--TGGAAATACTGATTTGATT---A---GT---AAAC------GT-GT------C--A---GTA-------ttaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaG-TAT---T-GTA--ATTATTTG--AAAT--AG-T-ATG-AT-T-G---TGGCAGTAG---TA---GTAGTAGTAG-GAGTAGT---AGACGGAGTAGTGACGGTG---------ATA--GCAGAAAA--------TGGA---GTAAAAGCA----GAAAC---AC----CAGCAG--CAGTAGTA-GT---AATAGT---GA---A---------AGT-A--AA-------G-------G--T-A------TA-------------AGTA---TTAG------T---AAACATAGCA-TAATG
gi|25 : tgacgAG--AAAT--A----ATG-GT-T-G---TGGTGGTGA---TG---ATGATGGTGA-TGGTGGT---GGTGGTGGTAATAAAATTA---------GTA--GTGGTGGG--------CGTG---GTA---GTA----GAAGT---AG----TAGTTG--TATTAGTA-GT---ACTAGT---AA---C---------AGT-A---A-----T-A-------T--TAG------TA---------G--TAGTA---GCAG------TTAAA---GTAATAGTGGTG---------------ATGGTGG-TGG--TAGT---ATTAGCAGA--AGaaggtg
gi|25 : TG-GT-G-G---TGGTGGTAA---TA---AAATTAGTAG-TGGTGGG---CGTGGTAGTAGAAGTAGTA---------GTT--GTATTAGT--------AGTA---CTAGTAACA----GTAAT---AT----TAGTAG--TAGTAGCA-GTTAAAGTAAT---AG---T---------GGT----GA-----T-G------------G------TG---------G--TGGTA---GTAT------T---A---GCAGAAG
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggAGTAATAGTA---------GTGAGGTAGTAGT--------TGTTTCTGAATGAGTA----GCAGT---AG----TAGTAGATTGGTAATT-GT---GGTTGT---AG---CCGTAGTATAAGT-A--GA-----C-G-------TGAT-G------TA---------GTATATTA---ATAG------T---A---GTAGTAGTAATGATGCA----TTACAAGCAGT
gi|28 : tattgttgttgtataAGCA---TCAGCAATCGCAATCGCA-ATCATA---GTCAC---AGTCGTAGCAG---TAGTT-----GCTGTA---G--AAGT-A-TCAT-CAGCA-------------TAA-CAT---TAGCAACATTAGCAG--AAGA--AG-C-A---AC-A-A---CATCAGCAG---TA---GCAGTAG----CTGCAAC---AGTAGTAATAGAAGT
gi|3 : ATAGTAGTAT-A--AGT-C--ATAAT-A--GTAGTAATA-----A------TAGTAGAA-----------GTAGAA--GCAG---CA---GCAGC---T-----GTAGCAGTGGTAGT---AGTG---GTA--GT---AATAG--TGA-TGTCAT--TATTATC---AGTAG---TAGT---A---ATATTATAATC--AT-----TGGTGGTA------G--TA-G-T-ATGAATAGTA---GCCA---A------AGA--AAAA---GTAGC--TGTAGCAGTA-GT---AGTAGCAA---CAGTAGCAGCA---GCAAT--------TG-TAGTATA-------AGTTA----TAAAAGTAGTAATAATA---GCAGAAATAATAGCAGCA-GCAGCT---GTTGC---AGTAGTAGTAG---TGGTA-----GTAGTACT-G--ATGTCA-TTAT-TATCAGT---AGTAG---TAA-TAT---TATTAGCATTGGTGG--AAGT--AG-T-ATGGAT-A-G---TAACAGAAG---TA---AAAGTAGTTG-AAGCAAT---AGTAGTAGTAGCAACAGTA---------GCA--GCAGTAAT--------TGTA---GTATAAGTA----ATAAT---AG----TAGTAA--TACTAGTA-GA---AGTAGT---AG---C---------AGC-A--GC-----T-G-------C--T-G------TA---------G--CAGTA---GTGG------T---A---GTAGTAGTGATGTC--A----TTATAATCAGTAG-TAG--TAAT---ATTATTATC--AGTGGTG---GTAGTAGTATGGATAGTAGCCAAAGAAAAAGTAGTT-GTA---GC------AGTAGTAGTAGCAACAGTAGCAGCAGCAA-TTG--T---A---GT---ATAA------GT-AA------A--A---ATA-------GAAGCA-AT-AGAAGTAGAA-----------GTA-AT-AGCAGCAGTAG-TAA--TGGCGGT-GTCGGCGG-----TGGCG---------ATA--GCGG---CA---------GTGACAGTAATAGTAGC---AGAAACA-----GTAACGCT-A-T--CAGC---AAT---A-ATAG-TGAAA--GTAGCAGCAGC---AAT----AATAGTAGTAGTTGT---AG---TCGTAG-----ATGCTGTAGTAGTTG---TTGTAGTAGTTACTTTA
gi|31 : AATT--AT-----TAATAATA------AAATA-A-T-AT-AATA-TA---AT-----A------AAATCAATACAGGCACC--AGTAACAGTA-GT---AGAAGC------AGCAGCAGAA---GTAAT--------AA-TAGTA-------------A----TAGCAGACGTAGTAGTA---ATAGACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaAGTAACA-----G------TAGTAGAA-----------GCAGCA--GCAG---AA---GTAAT---A-----ATAGTAATAGCAGA---CGTA---GTA--GT---AATAG--atgta
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCAGTATGAGT--TGA-TTT--T---A---CT----TAA------GTTAT------A--A---A-----------AGCA-GT-GGTAGTAGCA-----------GTA-GT-ACCAGTAGTAA-CTG--TAGCAAT-AT---CAG-----TAGCA---------ATA--GCAATACCG---------GT-GCTGCAACAGTAAT---Aacatagacgtagatgta
gi|32 : tatAGTT-ATAAAAGC------AGTGGTAGTAGCAGTAGTACCAGTAGTAA-CTG--T---A---GC---AA---------T-AT--------------CA-------GTAGCA-AT-AGCAATACCG-----------GTG-CT--GCAACAGTAA-TAtcattattattat
gi|34 : tatgcagtatgagttgattttacttaT---AGTT---GTT--GC---AGTAG--T---TGT--T-------AC---TGTTG---AAAT---A---ATA--ATAGTT--AT-----TG-TAGTACAA---G--TA-G-TTAT-TATAGTC---AT-----A------AGA---GTA---GTAGT--AGTAGTAGTA-GT---AGAAGTTT---TGGTTGAAGTA---GTAGT--------TG-Ttcattattattat
gi|35 : AGT---AGAAG---TAGTT--A---ATA--TTA-TT--AT-----TAAAAGTA---------TA-A-T--T-AGTAGAA---AT-----AGAAAAAAGA--AGTA---GTGGA--TATAGCAATA-GT---AGCAGCAG---TAtg
gi|35 : aaAGTAGAAGTAGT-----------TA--ATATTA-T--------TAT-----TAAAAGTA-----TAAT---------TAGTAG--AAATAGAA-AA---A--AGA---AG---T---------AGT-G--GA-----T-A-------T--A-G------CA---------A--TAGTA---GCAG------C---A---GTATTGTTATTATT--A----TTATAACTAGTAG-AAA--TAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGT---ATTACTAGTAGTAGTAGTA---------ATA--GTAAAAGT--------TGTA---GTAGTATTA----ATAAT---AACCCTTAGTAA--TAGTAACACTT---AGTAGT---AG---A---------AGA-A--GA-----T-G-------T--T-A------TA---------
gi|37 : aaaaaagttg-A-T--CAGC---ATT---A-GAAG-TGTTG--GTACTAGTAGC---AAT----AATGGTAGCCGTGGT---GG---TAGTAG-----TTGTTATTTTGGTTG---TTGTaca
gi|38 : gttatcgttatc-----TAGTAGTA------G--TA-G-T-AA-AATAAGA---AT-----A------AGT--ATTG---GTGAC--AGTAGCAACA-TC---ACTAGCGG---TATTATCAGTA---GTGGT--------GG-Ttattgtac
gi|39 : g---AATAGTG-----GTAATAGT-A-T--GAGA---GGT---G-GTTG-TG-----GTAGTAGTAGT---AGT----AGTAGAGATGGTGGA---GG---TAGTAG-----TTGTTGTGGTGGTTG---TCGTAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : GTAAAAGTAGTA---------TTA--ATAGTTGT--------TGTG---GTATTAGTA----ATAGT---AG----GAGTTG--TTACAGTA-GT---TGTAGT---TGACAC---------AGT-A--GT-----T-G-------T--T-G------TA---------G--TA------GTAG------T---A---
gi|41 : --AGCA---GCGGC--AGCGGCAGTA-GC---AGTAGTAG---TAGTAGCGGCA---ATA-T--------CGATGGTA-A-------A-T-A----TAATGAT-GCAGTAGTA---GT-GAAATAATA
gi|42 : c-----A------AGA--AGTA---CTTCG--AGTAGCAGTA-GT---AGTAGTTG---TAGTAGTATCA---GTAGC--------AA-TAGTA-C-------AAT-G----TAGCAAAATCAGTAGCA---GTA
gi|43 : GG---TG---------GTGGTGGTGGTTATGGT---AGTTGTG-----GTTACGGT-GGT--TA-C---GGT---G-GTGG-TGGTA--GTAGAAGTAGT---AGC----AGTAGTAGTA
gi|43 : -AT-G-G---TAGTTGTGG---TT---ACGGTGGTTA-CGGTGGT---GGTGGTAGTAGAAGTAGTA---------GCA--GTAGTAGT--------
gi|44 : ggtggtggtggtggttAG--TGGC--T--TTGGCGG-----TGACG---------ATG--GCGA---TG---------GTGGTGGTGGTGGTGGT---GACATAT-----TTAGCGGT-A-G--TAAC---AGT---G-GTAG-a
gi|45 : acAGTAGTAATAGTA---GTAGAAATAGTAGTAGAA-ACA------GTAGC---AGTGATAGAAG---TGG
gi|46 : catgaa-AT-A-G---TAGCAATTG---TA---GTTGTAGTAG-T-GCAGT---GGTAGTAATAGCAGTAGataagaata
gi|47 : gttgtaacAGCA-----------GTAGTC--GCAA---CA---GTAGT---C-----CCAGTAGTAGTAGC---AGCA---ATA--GC---AGTA
gi|5 : ATAGTAGTAG-A--AAT----A--AT-A--GTAATAATA-----G------TAGTGGTG-----------GTGGTATGGTAG---TACTTGTAAT---ATTATGGTGGTGGTAGTAGT---AGTAGTTGTA--GT---AGTAG--TGA-TGA--TGGTGTTAGA---AGTAG---TCGA---G---GTG--GTGGTG--A------TGATAATG------A--TG-G-TGGT-GGTAGTG---GT------------AGT--AGTA---ATAGA--GGT-NNNNNN-NN---NNTAATAG---AGGTAGTAGTA---GTA-T--------TGATAG---A-------AG-------TAGCAGTAGTAGTGGTG---GTAGTTATAGTATTAGTA-ATGGTT---GTGGA---AGAAGTATAAG---TGTTG-----GTGATTGT-G----GT-G-TTAG-T-TTAGT---AGTAG---TAG-TAA---TTGTGGCAGTGGTAG--AAGT--AG-TAATG-GT-A-G---TGGTAGCAA---TA---GAAGTAGCGATTGGTGATTTAAGTA-TAGTAGAAGTAGTA---------GTA--TAATTGGT--------TGTG---GTAGTAGTA----GTAAT---AG----TAGTAT--TATTAGTA-GT---GGTAGT---GG---C---------AGT-A--GT-----T-G-------T--T-G------TG---------G--TGGCG---GTGA------T---A---GAAGTACTAATGGT--G----GTGTTGGCTGTGG-TAG--TAGT---AGTAGTGGT--GGTGCTG---GTGTTAGT----ATAGT------AGTATTAGT-GTTGGTG---GT------GGTGGTGGTGGcca
gi|7 : A-----G------TAGTAAAA-----------GGAGTA--AAAG---TA---GCAGT---A-----GAAGAAGTAGAAAT---A--A---GAA-------AATAG--T-----T--T--TTGCAGC---AGTA-----------A---A-A--GTA-TC--AC-----TTATAGCA------G--CA-G---A--AGC-GTA---AT-----A------AGA--AGTA---CTGAC--AGAAGCAAAA-GTTGAAGAAGCAG---CAGCAGTCGCAAACGTTGT--------TG-TAGCA-ACATCAGAAGT-AGAAACAGTAGTAGTAGCAGTA---GCAGAAAAAGTGATAGCA-CCAGCTTAAGTAGC---AGTCGTAATAG---TAGTAACAGAGAAGCA---G--AAGT-A-GCAG-TAGCAGC---AGCAGACACAG-TAAAAGTAGTAGCAGAAATAG--AAGT--AG-T-AT---T-A-G---CAGCAG--A---TA----AAGTAGTTG-TAGCATC---AGCTGAAGAAGAAGCAGTA---------GTA--GCAGCAGC-----------A---GCAGTAGTA----GTAGT---AG----CAGCAG---A--AGTA-GT---AGTAAT---CG---C---------AGC-A--GC-----T-G-------A--A-A------TA---------G--TAGCA---GCAG------A---AAACGTAGTTGCAATGGT--AACATTTATTACT-GTAG-AAA--TAAC---AGCAAGGGA--AGTA
gi|9 : tG---TA---GCAGT---A-----GTAGTAGTAGTAGT---AGTA---CTA--GT---AAAAG--T-----T--T--CAGAAGC---AGCAG---CAGT---ATACATA--ATAGTT--AT-----T-GTAGTA------G--TA-G-T-AC-TG----------------------------GTT---GTAGC--TGCAGCAATATGT----GTAGCAG---TATTAGAAGCA---
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTGAGTAGGTGGTGTTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGGTAGTGTAAATGGTGGTGGTGGTAGTAGCGGTGGTGGTGGTGGTAAACATTATGGTGGTAGTGACGAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAACGGTGGTTGTTATTGCGGCGGTGGTGAT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|29 ): GATAGTGGTGGTAGTGATAATGGTGGTGGTGATAGTGACGGAGATGGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGTGACAATGGTAGTGGTATGTGTAGTGGTTGTGGTGTGTTTGATAGTGGTAATGCTGGTGGTGGTGGT
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 2222 333333 22222222222222 33333333333333 111111111 11111111111 111111111 22222222222222222222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333 33333333333 1111111111 3333333333333333333 11111111111111111 1111111 2222222222 3333333333333333333333333 11111 111 111 111 111 222222222222222 1111111 111111111 22222222222222222222222 1111111111111 111111
lowQualScore : 7777 3 2 000000 77 0 3 99999999999999 1 0 55 77 99999999999999 0 444444444 2 0 88888888888 000000000 3 66666666666666666666666666 1 1 1 4444 2 444 444 5555 444 333333333333333333333333333333333333333333333333 7 88888888 1 444 99999 555 3 555 77777 1 11111111111 1 1 555 555 555 8888888888 5555 1 555 555 66666 2222222222222222222 2 444 444 2 33 444 1 2 55555555555555555 444 33 55 2 33 1 7777 55555 7777777 33 2 33 999999999 66 2 22 4444 22 22 999999 666666 2 999999 2 5555555 2 33 666 444 0 888 7777777777 1 0 555555555 2 0 777 66 7777777777777777777777777 1 11111 0 0 0 1 1 111 7 11 111 111 1 5 111 4 999999999999999 777777 2 5555555 1 888 1 1 1 2 3 666666666 777 2 00000000000000000000000 7777 7777777 4 6666 555 555 0 777 0 2222222222222 111111 4 666 8888888 0 2 3 1
lowQualScore : .... . . ...... .. . . .............. . . .. .. .............. . ......... . . ........... ......... . .......................... . . . .... . ... ... .... ... ................................................ . ........ . ... ..... ... . ... ..... . ........... . . ... ... ... .......... .... . ... ... ..... ................... . ... ... . .. ... . . ................. ... .. .. . .. . .... ..... ....... .. . .. ......... .. . .. .... .. .. ...... ...... . ...... . ....... . .. ... ... . ... .......... . . ......... . . ... .. ......................... . ..... . . . . . ... . .. ... ... . . ... . ............... ...... . ....... . ... . . . . . ......... ... . ....................... .... ....... . .... ... ... . ... . ............. ...... . ... ....... . . . .
lowQualScore : 0000 8 2 888888 99 4 0 44444444444444 2 1 11 99 22222222222222 6 111111111 3 5 99999999999 222222222 3 22222222222222222222222222 1 1 3 8888 7 777 777 1111 777 999999999999999999999999999999999999999999999999 7 55555555 0 333 22222 444 1 000 77777 6 55555555555 0 0 444 444 444 7777777777 7777 0 000 000 77777 4444444444444444444 7 777 777 7 77 777 0 7 99999999999999999 777 77 77 4 22 0 1111 99999 6666666 22 4 22 444444444 55 1 99 5555 99 99 777777 111111 2 777777 2 7777777 4 22 555 111 6 555 6666666666 8 6 333333333 5 3 888 00 1111111111111111111111111 6 66666 4 9 2 9 0 777 8 88 777 777 0 2 777 7 000000000000000 666666 4 6666666 2 888 2 8 2 6 8 000000000 000 5 99999999999999999999999 5555 1111111 2 8888 888 888 3 999 4 1111111111111 555555 0 888 9999999 1 9 9 0
consensus : ATAGTAGTAGAAGT-A--ATAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTAGTA--GCAGNA--------------GTAGTAGTAGTAGTAGTAGTNGTAGTAGTAGTAG--TAA---T-T--TCGGCAGCAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGTTA---T-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--T-AGTAGTA---GT--A------AGAAGTAGTAGCAGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---G--------TTG----TAGT-A-A-------AGT-A----TA---GCAGTAGTAGTAGTAGTA--------GNAATAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---A-GTAGTAGTAG---TAGTA-----GNAGTACTGATGT-A-NTANTAGCAGT---A---GTAG---TAGTAN---------TAGTA---GCAGT---AG---TAGAA-----GTAG-T-A-TG-----------ATA-G---TA---GCAG-TA--GT---AGTA-GTAGTN---GC-GGC------GGT---A--GTAGT-A--GTAGCAG---TA-----GTA-------GTA--GTAG-TAGT--TGT---------AGTAGNAGTAGT-A--GT----AG--TA--GTA------GTAG------TAGTAGTAG-TAGTAG--C---AGT-AGATGT--T-GTAGTAG--TAGTAGTA---G---TAGTAGTAATG--GTATTAT-A--GCAGTAGTAGTAGTAGTAGT--A--GA--AGTAGTGG---TAGTAGTATG-ATAGTAG-T--A-A--GTANTAGTAGT---T-GTAGTGGTAGTAGTNGNAGTA---GTAGCGGTAGTAATTGT---AGT---ATAAGTATAAGTAGTAGCG---GTAGTAGTAGNAGTAAT------AGCGA----CAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGTA---GCGGTGGCGGTGGTGGTGG---------TG---GTAGTGGTAG--T------AGT---G------GT---GGC---G---GTAGTAGC---AG---T---AGTAGTG--GTAGTAGTAGTGGTAGT----A-------ATAGTAGTAG------TGGTA-GT--AGT---A---GTTGTNGTAGTAGTTGTTGTAGTAGTNGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAGAAGTGA--ATAGTAGTAACAG------TAGTAGAAGTAGTA--GCAGCA--------------GTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAG--TAA---T-T--TTNNCAGCAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGTTA---T-----TGGTAGTA------G--TAGT-A--T-AGTAGTA---GT--A------AGAAGTAGTAGCAGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---G--------TTG----TAGT-A-A-------AGT-A----TA---GCAGTAGTAGTAGTAGTA--------GNAATAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---A-GTAGTAGTAG---TAGTA-----GTAGTANTGATGT-A-TTANTANCAGT---A---GTAG---TAGTAN---------TAGTA---GCANT---AG---TAGAA-----GTAG-T-A-TG-----------ATA-G---TA---GCAG-TA--GT---AGNA-GTAGTN---GC-GGC------GGT---A--GTAGT-A--GTAGNAG---TA-----GTA-------GTA--GTAG-TAGT--TGT---------AGTANNAGTAGT-A--GT----AG--TA--GTA------GTAG------TAGTAGTAG-TAGTAG--C---AGT-AGATGT--T-GTAGTAG--TAGTAGTA---G---TAGTAGTAATG--GTATTATAA--GCAGTAGTAGTAGTAGTAGT--A--GA--AGTAGTGG---TAGTAGTATG-ATAGTAG-C--A-A--GTANNAGTAGT---T-GTAGTAGTAGTAGTAGNAGTA---GTAGCAGTAGTAATTGT---AGT---ANAAGTATAAGTAGTAGCA---GTAGTAGTAGCAGTAAT------AGCGG----CAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGTA---GCGGTAGCGGCGGTGGCGG---------TA---GTAGTGGTAG--T------AGT---G------GT---AGC---G---GTANTAGC---AG---T---AGTAGTG--ATAGTAGTAGTGGTAGT----A-------GTAGTAGTAG------TGGTA-GT--AGT---A---GTTGTTGTAGTGGTTGTTGTAGTAGTNGCTTTA
gi|1 : ATTAGTAGCAACA---GCAGTAGTAGAAGCAGC------AGCGAAACACAGTAG-AAG--TAGCAGT-A--------GTA---GCAGAAGAGGTAGGAAAAG---------TATTTGCAACAGAAA--T------AGT---A------GT---AGC---A---GCAGCTGA---AG---T---AGTTGTA--ATATCAGCAGCAGAAAT----A-------GTAGTAGTAG------CAACA-GA--AAT---A---GTAGCAACAGAAGTAGTTATAGTAGCAGC
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaAGTAGAAGT-A--GCAGTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATTT--GCAACA--------------GAAATAGTAGTAGCAGCAGCTGAAGTAGTTGTAA--TA---------TCAGCAGCAGAAATAGTA---GT-A--GTAGCAA---CAGAAATAGTAGCAACAGAAG--TAGTTA--T-AGTAGCA---GC--AGC----AGAAGCAGTAGCCGTAGCA-G--CA-GC---AG---GAGTAGCCATAGTAGCAGAA---GCA---GTCGATGTTTTG----TTGT-------------T-A----TT---GTACT--TTATTGCTGTT--------GTTATAGTAGTAGTA-CTAGTA---GAAGA---A-GTAGTAGCAG---CAGCA-----AAATTACTA--GC-A-ATATCAGCAGTTAAA---GTAG---TAGTTG---------TAGTT---ACAGC---AA---TAAAA-----ATAG-A-A-TA-------------A-G---TA---TCTT-CA--GC---AAAA-GTAGTA---GC-AGT------GGT---A--GTTTC-A--TCAGCAT---TA-----ATA-------GAA--ATAG-TAGC--AGC---------AGCAAAAGAAGT-C--GT----AG--TA--GTA------GCAC------CAATAGTAG-TAGTAGATC---AGCGAAAT-T--T-ATAGTNN--NNNNNNNN---N---NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N--NN--NNNNNNNN---NNNNNNNNNN-NNNNNNN-N--N-N--NNNNNNNNNNN---N-NNNNNNNNNACTGTCACAGCA------GCAGTA-TAA---T---AGT---ATAAGTACAAGAAGTAGCAGCCGCAGCNNNNNNNNNNNN------NNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NN---NNNNNNNNNN--N------NNT---GTT----GT---TGT---G---GTGATAGT---AG---T---AGTAATA--GAAGTAGTAGTGGT-GTTTGAA-------ATAGTAATAG------TGGTA-TT--AATATAA---ATAGTAGTAGTAGAACATGGAGCAGTAGTTTTAagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacAGCA------G--CAGT-A--T-AATAGTATAAGT--ACA----AGAAGTAGCAGCCGCAGCN-N--NN-NN---NN---NNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNN---N--------NNN----NNNN-N-N-------NNN-N----NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTT---GTGGTGATA-GTAGTAGTAA---TAGAA-----GTAGTAGTGGTGT---TTGA-AATAGT---A---ATAG---TGGTAT---------TAATA---TAAAT---AG---TAGTA-----GTAG-A-A-C------------ATG-G----A---GCAG-TA--GTTTTAGTA-ATATTA---GT-AGT------TGT---A--GTATT-A--GTAGCAA---TT-----GTC-------GTT--GTAC-AAGT--TTT---------CGTATAAATATT-T--TTTTTTAG---A--GTA------GTAG------TAACAGTAA-AAGAAG--A---AGT-AG---T--T-ATAACAG--CAGCAGTA---G---TAGTAGTAATA--TTATTATTA--GTAGTAAT-TTAATAGTAGT--A--GA--AGTTGTTG---T-------TG-ATA-----------------TGGTTGT---T-GTTGTAATAGTAGTAGAAGTG---GTGGTAGTAANNNNNNN---NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NA---GTAATGGTAA--TGTTGATAGT---GTTAATCGT---AGC---ATAAGTAGTAGAGGAAG---T---AGTGGTA--GTAGTAGTTGTAGTAGA----A-------GCATAAGCAGAATTTTTTGCA-TT--AGT---A---GTTGCAGTAGTATGTGTTGTAgtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacGTGGT-A--GT----AG--AA--GTA------GGTG------TAGTAGTTG-TGTTAG--A---AGT-AG---T--T-GGAGAAG--TAGTAACA---G---TAGTGGTGGTG--GTA--------GTAGTAGTGATGATGATGGTGGA--GA--TATAGTGG---TAGTAGTA-G-A-AGTAG-T--A-A---TAGTAGTAGT---G-GTGGTGGTAATAGTCGTAGTAATTGTGGCGGTGGTGGTAGT---AGT---AGTAGTGT---TGGTTGCG---GTTGTAGTGGTGATGATGATTANNNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NN---NNGGTGGTGG--T------GGTGCAG------GT---GGT---G---ATAGTAGT---AG---T---GGGAGTG--GTGGTGGTGGTGGAAAT----A-------ATAGTAGTAG------AAGAA-GT--AGT---A---AATATAGTAGTAGCAGTAGAAGTGGTTagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : tgatgTGGTGGTGGAAAT-A--ATAGTAGTAGAAGAAG---TAGTAAATATAGTA--GTAGCA--------------GTAGAAGTGGTTGTGGTGGGTGTGGTATTAtggtgggtgtggtatta
gi|12 : tgatggtggtagtagaagtaggtgtagtagttgtgttagaagtagttggagaagtagtaacagtagtggtggtggtagtagtagtgatgatgatggtggagatatagtggtagtagtagaagtagtaatagtagtagtggtggtggtaatagtcgtagtaattgtggcggtggtggtagtagtagtagtgttggttgcggttgtagtggtgatgatgattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtggtggtggtgcaggtggtgatagtagtagtgggagtggtggGTGGTATTTGTAAAACTG---GTACTGGTACTGATTGTGTTAGTGCCATAGGTATAAGTAGTAGTG---GTAGTGGTAGCAGTAAT------TATGA----CAGTGGATGGGATGGTGGTAGTCG--GTGGTA---GTGTTGATGTTGGTAGTGGTGTAAATGCTG---ATAGCGGTAG--T------GGT---G------GTTGGGGCGTTG---GTGTTAGC---AG---TGGAAGTGTTG--ATGTTGGTAGTGGT-GT----AAATGTTGATAGCTGTAG------TGTTG-GTGGGGT---C---TTTGTTGT--TATTTATAGTGGTAGTG
gi|13 : attgcttAACAATAACATGATTA-GT---AA---TAATAG----AGATGTACTA---GTA---G--------TTG----TAGTGA-A-------AGT-GG---TA---GC-GT--TAGTTGTAATG--------GAAATGGTAGTAGCA-GTGG-------AAC---ACATAAGGGAAT---TTGTA-----GTAGTAC--ATAT-A-GTGGTAGTGAT---A---GTGG---TAGCAG---------TAGTT---GTAAT---GGAAATGGAA-----GTGG------G-----------ACACG---TAAGGGAAT-TG--GT---AGTA-GTATAT---AC-AGT------GGT---A--GT----------GAA-----A-----GGG-------GTA--GCGG-TAGT--TGT---------AATGGAAATGGT-A--GT----GG--TT--GTGAAACATGTAAGGGAATTGGTAGTAGTTAAT-G--C---AGT-G---GT--A-GTGATAA--TGGTAGCG---G---TAGTTGTAATG--tgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : ---TAGTA-----TCATTATTGTTGT-AATTATCATCATT---A---TTAC---TATTATCTATACCGATAGTATTTGTTAT---AT---TAGAGTTGTTGTTG-T-A-C-------------TA-G---TA---GAGG-TA--GT---AGTA-TTAGTT---GA-AGT------AGT---AATGTAGC-A--GCAGTAG---TA-----TTA-------GTT--GTAG-TAGTAATGT---------AGTAGCAGTAAT-A--GT----AG--TT--GTT------GTTG------TAAGATCAG-CAGTAG--T---GGT-GGCGAT--T-CTAGTAG--TAGAAGTA---G---TAATGGTAAAA--GTA-GAT----GGAGTAGTAGTATTAGTAGT--G--G
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgaT---AG---TAGAT-----GTAG-T---TGCTGTTGTTTTTGTA-G---TA---GCAG-TA---T---ATAATGTAATG---AC-A-T------GTT---A--GTAAT-A--AAAAAAGATATATTGTTGTA-------GTA--ACAG-TAGT--TGT---------CATAGTAGTTGT-A--GT----AG--TAAAGTA------GTAG------TAATAGAAG-TAGTAG--TTAAAGT-TGTGGT--T-GTGGTAG--TAGTAGTAT--G---TA-TAATAATG----ATTATGATTGAAGTAGTAGT---AGTAGT--A--GA--AGTAGTAT---TA--AATA-A-ATATTGGAT--ATA--ATACTAGTAGTATAT-GTAGTCATATCAGTAt
gi|18 : g--------GTGATGGTTGTAGTA-GTAGTT---GTAAC---G-GTAGTGATAGATGTAGTG-----GAAGT--TAATAT-G-GTACTTGCAGT---G---GTAG---TGGTAA---------CAGTA---ATGAT---AA---TTGTA-----GTGGCT-A-TG-----------GCA-GAGGTA---GATG-T---GT---AATT-GTAGTG---GCCAGT------TGT---A--GTGAT-A--ATTGTTG---T------GTAAGCGGACGTG--GTAG-TGGT--TGC---------TGTACGATTTGT-A--GC----GG--TC--ATG------GAAG------TGGTAACTG-TAGTGG--T---GGT-GTATGT--T-GTATTGG--TGATAGCA---G---TGGTat
gi|19 : t-A--GT-GTTA---TGTT--TAGTATTA------T--CATT-A--TCATTATTA---TT--A-------GAAGTAGACAAAGTAGCA-A--TA-GT---AG---TATCAT---AAGTAGCATCA---GTA---G--------ATG----TAGT-A-A-------TG--A----TA---GAAGTGGGAGTAGCAGTA--------GTAACAGCAGTAGCC-AAAGCA---GTAGC---A-GTGGTAGTAT---CAGAA-----GCAGTATCAA-------TAGTGACAGT---AGATGCAG---TAGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcGTAGTAGAAGCATTAGC--A--AGTTAGTAATTG---TGGTAGTATG--T-GTTG-T--A-A--GTGTACGTA-T---T-GTAGTAGAAGTAATCTTTGTA---GTAGCAGAAATAGTTGT---AGT---AAAAa
gi|20 : ttGTG---GTGGT---GG---TAGAA-----GTAA-T-A-GT-----------ATA-G---TA---GTAG-TA--GC---AATA-GTAGTAAAAGT-GAC------GGT---G--GTGAT-A--GTAGTAG---TA-----GAA-------GAA--ATGG-TGGT-----------------------GGT-G--GT----GG--TA--GTA------GTAG------TAGTGGTGA-TGGTAA--C---AGT-AGA---------AGTAG--TAGTAGTA---A---TAACGGTGGTG--ATATTGTA---GTAGTAGTAGTAACGGTGGT--A--CA--AGAAGTAG---TAGTGGAATG-GTGGTGG-tcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : gA---GCAGT-GTATCATTAATA--------GCAACAGTA-TAG---ATAGTT---GTAGC---A-GAAGTAGTAG---TAGAA-----ATAATACT----------ACTACTAGT---A---GTAG---TAATAG---------TAATA---ATAAT---AA---TAACA-----ATAA-T----------------ATA-A---CA---ACAT-TA--GT---AGAA-GTA
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaGC------AGT------GTATC-A--TTAATAG---CA-----ACA-------GTA---TAGATAGT--TGT---------AGCAGAAGTAGT-A--GT----AG--AA--ATA------ATAC------TACTACTAG-TAGTA---------------------GTAATAG--TAATAATA---A---TAATAACAATA--ATATAACAA---CATTAGTAGAAGTATTAAT--ATTAA--AGT--TGGAAATACTGATTTG-AT--TAG-T--A-AACGTGTCAGTAttaatattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaaTAA-TTG--TGGCGGT-GTTAATGTGGTACATGCGGTTGTGATGGAGATGG---------TA---GT----GTA----------AAT---G------GT---GGT---G---GTG---------G---T---AGTAGCG--GTGGTGGTGGTGGTA------A-------ACATTA-TGG------TGGTA-GT--GAC---GAACGTCGTCGTCGTGGTTATTGTGGTGG
gi|23 : ttgagtaggtggtgtGTAT---------T-GTA-----ATT---AT---TTGAA-----ATAG-T-A-TG-----------ATT-G---TG---GCAG-TA--GT---AGTA-GTAGTA---GG-AGT------AGT---A--GACGG-A--GTAGTGA---CG-----GTG-------ATA--GCAG-AAAA--TGG---------AGTAAAAGCAGA-A--AC----AC--CA--GCA------GCAG------TAGTAGTAA-TAGTGA--A---AGT-AAA-GG--T-ATA--AG--TATTAGTAAACA---TAGCA-TAATG--gaggtagttgtaacggtggttgttattgcggcggtggtgat
gi|25 : tgacgAGAA-----ATA----A-TG-----------GTT-G---TG---GTGG-TG--AT---GATG-ATGGTG---AT-GGT------GGT---G--GTGGT-G--GTAATAA---AA-----TTA-------GTA--GTGG-TGGG--CGT---------GGTA---GTAGA-A--GT----AG--TA--GTT------GTAT------TAGTAGTAC-TAGTAA--C---AGT-A-ATAT--TAGTAGTAG--TAGCAGTT---A---AAGTAATAGTG--GTG--AT------GGTGGTGGTAGTATTAGC--A--GA--AGaaggtg
gi|25 : GTGGTGGTGGTGGTA--------ATAAAATTAGTAGTG-GTGGGC---GTGGT---A-GTAGAAGTAG---TAGTT-----GTATTAGTA--GT-A-CTAGTAACAGT---A---ATAT---TAGTAG---------TAGTA---GCAGTTAAAG---TAATA-----GTGG-TGA-TG-----------GTG-G---TG---GTAG-TA--TT---AGCA-GAAG
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatgAGTAA---TA-----GTA-------GTGAGGTAG-TAGT--TGTTTCTGAATGAGTAGCAGTAGT-A--GT----AGATTG--GTAATT---GTGG------TTGTAGCCG-TAGTAT--A---AGT-AGACGTGAT-GTAGTATATTAATAGTA---G---TAGTAGTAATGATGCATTACAA--GCAGT
gi|28 : tattgttgttgtataAGCATCA--------GCAATCGCAATCGCA-ATCATA---GTCAC---A-GTCGTAGCAG---TAGTT-----GCTGTA--GAAGT-A-TCATCAGCA----------------TAACAT---------TAGCA---ACATT---AG---CAGAA-----GAAG-C-A--------------ACA-A---CA---TCAG-CA--GT---AGCA-GTAGCT---GC-AAC------AGT---A--GTAAT-A--GAAG
gi|29 : GATAGTGG---------TG---GTAGTGATAA--T------GGT---G------GT---GGT---G---ATAGTGAC---GGAGAT---GGTGGTGTTGTAATTGTGGTGGTAGT----G-------ACAATGGTAG------TGGTATGT---GT---A---GTGGTTGTGGTG--TGTT-TGATAGTGt
gi|3 : ATAGTAGTATAAGTCATAATAGTAGTAATAA------TAGTAGAAGTAGAA--GCAGCA--------------GCAGCTGTAGCAGTGGTAGTAGTGGTAGTAATAG--TGA---TGTCATTATTATCAGTAGTAGTA---AT-ATTATAATCA---T-----TGGTGGTA------G--TAGT-A--TGAATAGTA---GCCAA------AGAAAAAGTAGCTGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAA---CAGTAGCAGCA---GCA---A--------TTG----TAGT-ATA-------AGTTA----TA---AAAGTAGTAATAATAGCA--------GAAATAATAGCAGCA-GCAGCT---GTTGC---A-GTAGTAGTAG---TGGTA-----GTAGTACTGATGTCA-TTATTATCAGT---A---GTAG---TAATAT---------TATTA---GCATT---GG---TGGAA-----GTAG-T-A-TGG----------ATA-G---TA---ACAG-AA--GT---AAAA-GTAGTT---GA-AGC------AAT---A--GTAGT-A--GTAGCAA---CA-----GTA-------GCA--GCAG-TAAT--TGT---------AGTATAAGTAAT-A--AT----AG--TA--GTA------ATAC------TAGTAGAAG-TAGTAG--C---AGC-AGCTGC--T-GTAGCAG--TAGTGGTA---G---TAGTAGTGATG--TCATTATAA--TCAGTAGTAGTAATATTATT--A--TC--AGTGGTGG---TAGTAGTATGGATAGTAG-CCAA-A--GAAAAAGTAGT---T-GTAGCAGTAGTAGTAGCAACA---GTAGCAGCAGCAATTGT---AGT---ATAAGTAAAAATAGAAGCA---ATAGAAGTAGAAGTAAT------AGCAG----CAGTAG-TAA--TGGCGGT-GTCG--GCGGTG---GCGATAGCGGCAGTGACAG---------TA---ATAGTAGCAG--A------AAC---A------GT---AAC---G---CTATCAGC---AA---T---AATAGTG--AAAGTAGCAGCAGCAAT----A-------ATAGTAGTAG------TTGTA-GT--CGT---A---GATGCTGTAGTAGTTGTTGTAGTAGTTACTTTAtaatgctggtggtggtggt
gi|31 : AATTA---T-----TAATAATA------AAATAAT-A--T-AATA-TA---AT--A------A-AATCAATA-CAG--GCA-C--CA-GT---AA---CAGTAG---TAGAAGCAGCA---GCA---G--------AAG----TAAT-A-A----------------TA---GTAATAGCAGACGTAGTA--------GTAATAGACATAGAC-GTAGAT---GTAaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaAGTAACAG------TAGTAGAAGCAGCA--GCAGAA--------------GTAATAATAGTAATAGCAGACGTAGTAGTAATAG--
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacc-A--GTAACAG---TA-----GTA-------GAA--GCAG-CAGC--AGA---------AGTAATAATAGT-A--AT----AG--CA--GAC------GTAG------TAGTAATAG-ACATAG--A---CGT-AGATGT--acatagacgtagatgta
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCA---GTATGAG--------TTGATTTTACT-T-A-------AGTTA----TAAAAGCAGTGGTAGTAGCAGTA--------GTACCAGTAGTAAC-------T---GTAGC---A-ATATCAGTAG---CAATA-----GCAATACCGGTGC---T--GCAACAGT---A---ATAT---CATTAT---------TATTA---a
gi|32 : tatAGCA-G--TG-GT---AG---TAGCAG---TAGTACCAGTA---GTA---A--------CTG----TAGC-A-A---------T-A----T-----CAGTAGCAATAGCAATACCGGTGCTGCAACAGTAATATCA-TTAt
gi|34 : tatgcagtatgagttgattttacttaagttataaaTAGTT---GT-TGC------AGT---A--GTTGTTACTGTTGAAA---TA-----ATA-------ATA--GT---TA-T--TGT---------AGTACAAGTAGTTATTAT----AG--TC--ATA------AGAG------TAGTAGTAG-TAGTAG--T---AGT-AGAAGT--T-TTGGTTG--AAGTAGTA---G---TTGTttattat
gi|35 : AGTAGAAGTA---GTTA--ATA-TTA---T-----TATTAAAA------G--TA-T-AATT-AGTAGAA---AT--AGAAAAAAGAAGTAGTGGATATAGCA-A--TA-GT---AG---CAGCAG---TAtg
gi|35 : aaAGTA---GA-A--GTAGTTAATAT-----TATTATTA------A--AAGT-A--T-AAT--TA---GT--A-------GAAATAGAAAAA--AGAA-G--TA-GT---GGATATAGCAA---TAGTAGCAGCA---GTA------------TTG----TTAT-T-ATT-----ATT-A----TA---AC--TAGTAGAAATAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGTATTACTAGTAGTAGTAGTAATAG--TAAAAGT-T--------GTAGTAGTATTA---AT-A--ATAACCC---T-----TAGTAATA------G--TAAC-ACTT-AGTAGTA---G---A------AGAAG
gi|37 : aaaaaagttgATCAGC---AT---T---AGAAGTG--TTGGTACTAGTAGCAAT----A-------ATGGTAGCCG------TGGTG-GT--AGT---A---GTTGTTATTTTGGTTGTTGTatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatc-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--A-AATAAGA---AT--A------AGTATTGGTGACAGTAGCA-A--CA-TC---AC---TAGCGG---TATTATCAGTA---GTG---G--------TGG----Ttattgtac
gi|39 : gAA--T------AGT---G------GT---AAT---A---GTATGAGA---GG---T---GGTTGTG--GTAGTAGTAGTAGTAGT----A-------G-AG--ATGG------TGGAG-GT--AGT---A---GTTGTTGTGGTGGTTGTCGTAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : GTAAAAGTAGT-A--TT----AA--TA--GTT------GTTG------TGGTATTAG-TAATAG--T---AGG-AGTTGT--T-ACAGTAG--TTGTAGTT---GACACAGTAGT-------TGTT------GTAGTAGTAGTA
gi|41 : AGCAGCGGCAGCGGCA-G--TA-GC---AG---TAGTAG---TAGTAGCGGCA---ATA------------TCGA---TGGT-A-A-------A-T-A----TA---ATGAT-GCAGTAGTAGT---------GAAATAATA
gi|42 : c--A------AGAAGTACTTCGAGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGTTG---TAGTAGTATCA---GTA---G--------CAA----TAGT-A-C-------AAT-G----TA---GCAAAATCAGTAGCAGTA--------
gi|43 : GGTGGTGGTGG---------TG---GTTATGGTAG--T------TGT---G------GT---TAC---G---GTGGTTAC---GG---T---GGTGGTG--GTAGTAGAAGTAGTAGC----A-------GTAGTAGTA
gi|44 : AG--TGGC--T--TTG--GCGGTG---ACGATGGCGATGGTGGTGG---------TG---GTGGTGGTGACAT------ATT-----------T---AGC---G---GTAGTAAC---AG---T---GGTAG
gi|45 : acTGA--A-AGTAGTAATAG------TAGTAGAAATAGTA--GTAGAA--------------ACAGTAGCAGTGATAGAAGTGG
gi|46 : caGT-T--GTAACA----TA-----GTA-------GCA--ATTG-TAGT--TGT---------AGTAGT-GCAGT-G--GT----AG--TA--ATA------GCAG------TAGataagaata
gi|47 : AGCAGTAGTC--------GCAACAGTAGTCCCA-GTAGTA---GTAGC---A-GCAATAGCAG---TA
gi|5 : ATAGTAGTAGAAAT-A--ATAGTAATAATAG------TAGTGGTGGTGGTATGGTAGTACTTGTAATATTATGGTGGTGGTAGTAGTAGTAGTTGTAGTAGTAGTGA--TGA---T-G--GTGTTAGAAGTAGTCGAG---GT-G--GTGGTGA---T------GATAATG------A--TGGT-GG-T-GGTAGTG---GT--A-------GTAGTAATAGAGGTNNNN-N--NN-NN---N----TAATAG---AGGTAGTAGTA---GTA------------TTGA---TAG----A-------AGT-A---------GCAGTAGTAGTGGTGGTA--------GTTATAGTATTAGTA-ATGGTT---GTGGA---A-GAAGTATAAG---TGTTG-----GTGATTGTGGTGT----TAGT-TTAGT---A---GTAG---TAGTAA---------TTGTG---GCAGT---GG---TAGAA-----GTAG-T-AATG-----------GTA-G---TG---GTAG-CA--AT---AGAA-GTAGCG---ATTGGT------GATTTAA--GTA-T-A--GTAGAAG---TA-----GTA-------GTA--TAAT-TGGT--TGT---------GGTAGTAGTAGT-A--AT----AG--TA--GTA------TTAT------TAGTAGTGG-TAGTGG--C---AGT-AGTTGT--T-GTGGTGG--CGGTGATA---G---AAGTACTAATG--GTGGTGTTG--GCTGTGGTAGTAGTAGTAGT--G--GT--GGTGCTGG---TGTTAGT----ATAGT--------A--GTATTAGT-GT---TGGTGGTGGTGGTGGTGGcca
gi|7 : AGTAGTA--AAAGGA--------------GTAAAAGTAGCAGTAGAAGAAGTAGAAATAAGAAAATAG---T-T--TTTGCAGCAGTAAAAGTA-------------TCA---C-----TTATAGCA------G--CAG--A----AGC-GTA---AT--A------AGAAGTACTGACAGAAGCA-A--AA-GTTGAAG---AAGCAG---CAGCAGTCGCAAACGTT---G--------TTG----TAGC-A-ACATCAGAAGT-AGAAACA---GTAGTAGTAGCAGTAGCA--------GAAAAAGTGATAGCA-CCAGCTTAAGTAGC---A-GTCGTAATAG---TAGTAACAGAGAAGCA--GAAGT-A-GCAGTAGCAGC---A---GCAGACACAGTAAAAG------TAGTA---GCAGA---AA---TAGAA-----GTAG-T-A-T-------------TA-G---CA---GCAGATAAAGT---AGTT-GTAGCA---TC-AGCTGAAGAAGA---A--GCAGT-A--GTAGCAG---CA-----GCA-------GCA--GTAG-TAGT--AGT---------AGCAGCAGAAGT-A--GT----AG--TA--ATC------GCAG------CAGCTGAAA-TAGTAG--C---AGC-AGAAAA--C-GTAGTTG--CAATGGTA---A---CATT----------TATTA------CTGTAGAAATAACAGCAAG--G--GA--AGTA
gi|9 : t--------------GTAGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACTAGTAA--AAG---T-T--TCAGAAGCAGCAGCAGTATACAT-A--ATAGTTA---T-----T-GTAGTA------G--TAGT-A--C-TG-----------------------GTTGTAGCTGCAGCA-A--TATGT----G---TAGCAG---TATTAGAAGCA---
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 222 111 111111 222222222 111111 111 2222222222222222222222222222 111 11111 1111 222222222222222222 1111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444 11111 111111111111 11111 1111 111111111111 333333333333333333333333 11 11111111111 111111111 1111111111111111 111111111 11111111111111111111111111 111 11111111111111111111 33333333333333333333333333 1111 1111111111111111111111 111 111111 11111111 22222222222 11111111111 111111111 11111111 11111111111111111111
lowQualScore : 333 777 666666 1 000000000 666666 888 1 000 7777777777777777777777777777 1 000 2 777 4 55 1 66666 666 44444 999999999 3 3 1111 1 33 777777777777777777 33 555 6666 2 555 555 5555 555 4444444444444 9999 9999999999999999999999999999999999999999999999 0 1 33 11111 555 2 555 555 77777 1 999999999999 1 1 44444 0 555 666 7777 0000 1 555 777777777777 1 222222222222222222222222 555 5555 3 3 6666 6666 11 0 6666 2 00000000000 8888888 000000000 2222222222222222 333 333 1 2 3333 4444 333333333 22 333 2 88888888888888888888888888 2 33 111 2 6666 99999999999999999999 3 55 555 3 1 777 2 66666666666666666666666666 3333 66 1 3333 0 0 6666666666666666666666 333 0 444444 3 77777777 55555555555 888 1 555555 4 55 0 77777777777 666 1 4 555 222222222 44444444 5555 44444 444 8888888 1 444 4444 2 33 8888888888888 0 77777777777777777777 444 777 33 888888 555 33 2 555 1 6666 5 3 3 7
lowQualScore : ... ... ...... . ......... ...... ... . ... ............................ . ... . ... . .. . ..... ... ..... ......... . . .... . .. .................. .. ... .... . ... ... .... ... ............. .... .............................................. . . .. ..... ... . ... ... ..... . ............ . . ..... . ... ... .... .... . ... ............ . ........................ ... .... . . .... .... .. . .... . ........... ....... ......... ................ ... ... . . .... .... ......... .. ... . .......................... . .. ... . .... .................... . .. ... . . ... . .......................... .... .. . .... . . ...................... ... . ...... . ........ ........... ... . ...... . .. . ........... ... . . ... ......... ........ .... ..... ... ....... . ... .... . .. ............. . .................... ... ... .. ...... ... .. . ... . .... . . . .
lowQualScore : 333 555 444444 0 000000000 444444 888 0 000 4444444444444444444444444444 7 000 2 888 0 55 2 11111 444 22222 999999999 1 1 8888 2 11 888888888888888888 77 000 2222 9 000 000 9999 000 4444444444444 6666 1111111111111111111111111111111111111111111111 6 0 44 44444 000 9 000 000 77777 0 666666666666 0 0 22222 4 888 444 4444 6666 8 888 111111111111 4 666666666666666666666666 444 5555 1 1 5555 4444 22 8 7777 0 00000000000 5555555 888888888 0000000000000000 555 555 0 0 4444 2222 000000000 88 555 0 88888888888888888888888888 2 11 222 2 5555 11111111111111111111 6 55 777 6 1 888 3 33333333333333333333333333 4444 11 0 1111 2 8 0000000000000000000000 888 2 444444 4 00000000 88888888888 888 0 444444 0 00 5 66666666666 444 4 3 444 333333333 33333333 7777 88888 777 5555555 8 444 8888 5 77 3333333333333 8 33333333333333333333 777 333 77 222222 000 99 9 000 8 4444 2 3 8 5
consensus : ATAGTAGTAG---AAGT---AGTAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTAGTAGCAGAAG---------TAGCA------GTAGT---AGTAGTAGTNGTAGT---AGTAGT------------AGTAG---TTTCA-GCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--TAG-T-A--T-AGTAGTA---GT-----A------AGA--AGTA---GTAGCAGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TAGT-A-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTAGTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---A-GTAGTA---GTAG---TAGTA-----GNAGTACTGAT-GT----ANTAGTA-----GCAGT---AGTAG---TAGTAN---TAGT---AGCAGTAG---T------------AGAAGTAG-T----ATG-----------ATA-G---TA---GCAG-TA-GT---AGTAGTAGTN---GC-AGCGGTAGT---AGTAGTAGCAG-T---A-------GTA-------GTA---------GTAGTAGTTGT---------A------G---TA---GNA-GTAGT-A--GT----AG------T--A--GTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---C---A-----GT-AGATGT--T-G-TAG--TAGTAGTAGTA---GTAGTAGTAA----TG--GT-A----TTAT--AG-CAG-TAGTAG--TAGTAGTAGTA--GAAGTAGTGG---TAGTGGTA-TG-ATGGTGG-T--A--A--GTANTAGTAGT---TGTAGCGGTAGTA--GTAGNAGCAGTAGCGG-TAGC---GATTGT---A---GT---ATAA------GTANAAGTA-------GTAGCA---------GTAG---TAGTAGNAGTAATNGCGACAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGTA---GCGGTGGCGGTGGT---GGTGG---------TGGTAGTGGTA--------GT---AGTGG---T---GG---C---GGTAGTAGCGG---T---AGTAG-TG--GTAGTAG------TA-----GTGGTAGTA-------A------------TAGT---AGT---A--G------TGGTG---GT--AG-T---AGTNGT---NGTAGTGGTTG-TNGTAGCAGTGGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAG---AAGT---AATAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTAGTAGCAGNAG---------TAGTA------GTAGT---AGTAGTAGTNGTAGT---AGTAGT------------AGTAA---TTTCG-GCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--TAG-T-A--T-AGTAGTA---GT-----A------AGA--AGTA---GTAGCAGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TAGT-A-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTAGTAGTAGTAGTAGNAATAGTAGTAGCA-GTAGTT---GTAGC---A-GTAGTA---GTAG---TAGTA-----GNAGTACTGAT-GT----ANTANTA-----GCAGT---AGTAG---TAGTAN---TAGT---AGCAGTAG---T------------AGAAGTAG-T----ATG-----------ATA-G---TA---GCAG-TA-GT---AGTAGTAGTN---GC-GGCGGTAGT---AGTAGTAGCAG-T---A-------GTA-------GTA---------GTAGTAGTTGT---------A------G---TA---GNA-GTAGT-A--GT----AG------T--A--GTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---C---A-----GT-AGATGT--T-G-TAG--TAGTAGTAGTA---GTAGTAGTAA----TG--GT-A----TTAT--AG-CAG-TAGTAG--TAGTAGTAGTA--GAAGTAGTGG---TAGTAGTA-TG-ATAGTAG-T--A--A--GTANTAGTAGT---TGTAGTGGTAGTA--GTNGNAGTAGTAGCGG-TAGT---AATTGT---A---GT---ATAA------GTATAAGTA-------GTAGCG---------GTAG---TAGTAGNAGTAATAGCGACAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGTA---GCGGTGGCGGTGGT---GGTGG---------TGGTAGTGGTA--------GT---AGTGG---T---GG---C---GGTAGTAGCAG---T---AGTAG-TG--GTAGTAG------TA-----GTGGTAGTA-------A------------TAGT---AGT---A--G------TGGTA---GT--AG-T---AGTTGT---NGTAGTAGTTG-TTGTAGTAGTNGCTTTA
gi|1 : TA-TT-ATAACAT-T--A--A----ATTAGTAGC------AACAGCAGTA--GTAGAAGCAGCAGCG---------AAACAC---A---GT---AGAA------GTAGCAGTA-------GTAGCA---------GAAGAGGTAGGAAAAGTATTTGCAACAGAAA-TAG--TAG---------------TA---GCAGCAGC-----------TGA----------AGTAGTTGTA--------AT---A-T-----C---AG---C---AGCAGAAATAG---T---AGTAG-TA--GCAACAG------AA-----ATAGTAGCA-------A------------CAGA---AGT---A--G------TTATA---GT--AG-C---AGCAGC---AGAAGCAGTAG-CCGTAGCAGCAGC
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattataAGTAG---AAGT---AGCAGTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATTTGCAACAG---------AAATA------GTAGT---AGCAGCAGCTGAAGT---AGTTGT------------AATA------TCA-GCAG---CAGAAATAGTA---GT-A--GTAGC--A--A---CAGAAATAGTAGCAACAGAAG--TAG-TTA--T-AGTAGCA---GC-----AGC----AGA--AGCA---GTAGCCGTAGCA-G--CA-GC---AG---GAGTAGCCATAGTAGCAGAA---GCA---GTCGATGTTTTG----TTGT-------------T-A----T---------------T---GTACT--TTATTGCTGTTGTTATAGTAGTAGTA-CTAGTA---GAAGA---A-GTAGTA---GCAG---CAGCA-----AAATTACTA---GC----AATATCA-----GCAGTTAAAGTAG---TAGTTG---TAGT---TACAGCAA---T------------AAAAATAG-A----ATA-----------A---G---TA---TCTT-CA-GC---AAAAGTAGTA---GC-AGTGGTAGT---TTCATCAGCAT-T---A-------ATA-------GAA---------ATAGTAGCAGC---------A------G---CA---AAA-GAAGT-C--GT----AG------T--A--GTA---GCACCA-ATAGTAGTAGTAGAT-C---A-----GCGAAAT-T--T-A-TAG--T-NNNNNNNNN---NNNNNNNNNN----NN--NN-N----NNNN--NN-NNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN---NNNNNNNN-NN-NNNNNNN-N--N--N--NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNACTGTCACAGCAG---CAG-TA-T---AA---T---A---GT---ATAA------GTACAAGAA-------GTAGCA---------GCCG---CAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN---NNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNTGT---TGTTG---T---GG---T---GATAGTAGTAG---T---AATAG-AA--GTAGTAG------TG-----GTGTTTGAA-------A------------TAGT---AAT---A--G------TGGTA---TT--AA-TATAAATAGT---AGTAGTAGAAC-ATGGAGCAGTAGTTTTAaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacT---AGTAGTAGTACTAG------TAGAAGAAGTAGTAGCAGCAGCAAAATTACTAGCAATATCAGCAGTTAAAGTAGTAGTTGTAGTTACAGCAATAAAAATAGAATAAGTAT---CTTCA-GCAA---AAGTAGTAGCA---GT-G--GTAGT--TTCA---T-----CAGCATTA------A--TAGAA-A--T-AGTAGCA---GCAGCAAA------AGA--AGTC---GTAGTAGTAGCA-C--CA-AT---AG---TAGTAG---TAG-ATCAGCG---AAA---TT--------TA----TAGT-N-N-------NNN-N----N---------------N---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN---NNNNN---N-NNNNNN---NNNN---NNNNN-----NNNNNNNNNNN-NN----NNNNNNN-----NNNNN---NNNNN---NNNNNA---CTGTCACAGCAGCAG---T------------ATAA-TAG-T----ATA-------------A-G---TA----CA---A-GA---AGTAGCAGCC---GC-AGCNNNNNN---NNNNNNNNNNN-N---N-------NNN-------NNN---------NNNNNNNNNNN---------N------N---NN---NNN-NNNNN-N--NN----NN------N--N--NNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNN---T---------GT-TGTTGTGGT-GATAG--TAGTAGTAATA---GAAGTAGTAG----TG--GT-G----TT-TGAAA-TAG-TAATAG--TGGTATTAATA--TAAATAGTAG---TAGTAGAA-C--ATGG---------------AGCAGTAGT---TTTAGTAATATTA--GTAGTTGTAGTATTAG-TAGC---AATTGT---CGTTGT---ACAAGTTTTCGTATAAATATTTTTTTTTAG-A---------GTAG---TAGTAACAGTAAAA--GA-AGAAG-TAG--T-----T-AT-A--ACAGCA---GCAGTAGTAGTAGT---AATAT---------TATTATTAGTA--------GT---AAT-T---T---AA---T---AGTAGTAGAAG---T---TGTTGTTG--ATA-TGG------TT-----GTTGTTGTA-------A------------TAGT---AGTAGAA--G------TGGTG---GT--AG-T---Agtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttaAGCA------G--CAG-T-A--T-AATAGTATAAGT-----ACA----AGA--AGTA---GCAGCCGCAGCN-N--NN-NN---NN---NNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNN---NN--------NN----NNNN-N-N-------NNN-N----N---------------N---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTT---GTGGTGATA-GTAGTA---GTAA---TAGAA-----GTAGTAGTGGT-GTTTGAAATAGTA-----ATAGT---GGTAT---TAATAT---AAAT---AGTAGTAG---T------------AGAA-----C----ATG-----------G--------A---GCAG-TA-GTTTTAGTAATATTA---GT-AGTTGTAGT---ATTAGTAGCAA-T---T-------GTC-------GTT---------GTACAAGTTTT---------C------G---TA---TAA-ATATT-T--TTTTTTAG---------A--GTA---GTAGTA-ACAGTAAAAGAAG---A---A-----GT-AG---T--T-A-TAA--CAGCAGCAGTA---GTAGTAGTAA----TA--TT-A----TTAT-----TAG-TAGTAATTTAATAGTAGTA--GAAGTTGTTG---T--TGATA-TG-GTTGTTG-T-----T--GTAATAGTAGT---AGAAGTGGTGGTA--GTAANNNNNNNNNNNN-NNNN---NNNNNN---N---NN---NNNN------NNNNNNNNN-------NNNNNN---------NNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNNNNAGTAATGGT---AATGT---------TGATAGTGTTA--------AT---CGTAG---C---AT---A---AGTAGTAGAGG---A---AGTAG-TG--GTAGTAG------TA-----GTTGTAGTA-------G------------AAGCATAAGC---A--GAATTTTTTGCA---TT--AG-T---AGTTGC---AGTAGTATGTG-TTGTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacG-T---G-------GTA-------GTA---------GAAGTAGGTGT---------A------G---TA---GTT-GT-------GT------------T--A--GAA---GTAGTT-GGAGAAGTAGTAA---C---A-----GT-AG-TG-----G-TGG--TGGTAGTAGTA---GTGATGATGA----TG--GT-------------G-GAGATA-TAG--TGGTAGTAGTA--GAAGTAGTAA---TAGTAGTAGTG-GTGGTGG-T--AATA--GTCGTAGTAAT---TGTGGCGGTGGTG--GTAGTAGTAGTAGTGT-TGGTTGCGGTTGT---A---GTG--GTGA------TGATGATTA--------NNNNN---------NNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNNN---NNGGTGGTGGTGGTGCAGGTGG---------TGATAGTAGTA--------GTGGGAGTGG---T---GG---T---GGTGGTGGAAA---T---AATAG-TA--GTAGAAG------AA-----GTAGTA--A-------A------------TA-T---AGT---A--G------TAGCA---GT--AG-A---AGTGGT---TGTGGTGGGTG-TGGTATTAagtgtgcgtattgtattagagg
gi|12 : tgatgGTGGTATTT--GTAAAACTGGTACTGG-TACT---GATTGTGTTA---GTGCCATAG------GTATAAGTA-------GTAGTG---------GTAG---TGGTAGCAGTAATTATGACAGTGGATGGGATGGTGGTAGTCG--GTGGTA---GTGTTGATGTTGGT---AGTGGTGTAAATGCTGATAGCGGTA--------GT---GGTGG---TTGGGG---CGTTGGTGTTAGCAG---TGGAAGTGT-TG--ATGTTGG------TA-----GTGGT-GTAAATGTTGA------------TAGC---TGT---A--G------TGTTG---GTGGGG-T---CTTTGT---TGT--TATTTA-TAGTGGTAGTG
gi|13 : attgcttAACAATAACATGATTA-GT---AA---TAATAG----AGATGTACTA---GTA---GT--------TG----TAGTGA-A-------AGT-GG---T---------------A---GC-GT--TAGTTGTAATGGAAATGGTAGTAGCA-GTGG-------AAC---ACATAAGG---GAAT---TTGTA-----GTAGTAC--AT-AT----AGTGGTA-----GTGAT---AGTGG---TAGCAG---TAGT---TGTAATGGAAAT------------GGAAGTGG--------G-----------ACACG---TAAGGGAAT-TG-GT---AGTAGTATAT---AC-AGTGGTAGTGAAAGGGGTAGCGG-T---A-------GTT-------GTAATGGAAATGGTAGTGGTTGT---------GAAACATG---TAAGGGAA-TTGGT-A--GT----AGT-----T--AATGCA---GTGGTA-GTGATAATGGTAG---C---G-----GT-A---GT--T-G-TAA--Ttgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : T---ATACC---G-ATAGTATTTGTTA---TATTA-----GAGTTGTTGTT-GT----ACTAGTA-----G-AG-----GTAG---TAGTAT---TAGT--------T-------------------GAAGTAG-T----A-------------AT--G---TA---GCAG-CA-GT---AGTATTAGTT---GT-AGTAGTAAT----GTAGTAGCAG-T---A-------ATA-------GTA---------GTTGTTGTTGT---------A------AGATCA---GCA-GTAGT-G--GT----GGCGATTCT--A--GTA---GTAGAA-GTAGTAATGGTAA---A---A-----GT-AGATGG--A-G-TAG--TAGTATTAGTA---GTGGTg
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatcGTAG---T------------AGATGTAG-T-----TGCTGTTGTTTTTGTA-G---TA---GCAG-TATAT---AAT-GTAATG---AC--ATGTTAGT---AATAAAAAAAGAT---ATATTGTTGTA-------GTA---------ACAGTAGTTGT---------C------A---TA---GTA-GTTGT-A--GT----AG------TAAA--GTA---GTAGTA-ATAGAAGTAGTAG---TTAAA-----GT-TGTGGT--T-G-TGG--TAGTAGTAGTAT--GTA-TAATAA----TG-----A----TTAT--GA-TTG-AAGTAG--TAGTAGTAGTA--GAAGTAGTAT---TA--AATA--A-ATATTGGAT--AT-A--ATACTAGTAGTATATGTAGTCATATCA--GT
gi|18 : GTGATGGTTGTAGTA-GTAGTT---GTAAC---G-GTAGTG---ATAGATGTAGTG-----GAAGT--TAAT-AT----GGTACTT-----GCAGT---GGTAG---TGGTAA---CAGT---AATGATAA---T------------TGTAGTGGCT----ATG-----------GCA-GAGGTA---GATG-T--GT---AATTGTAGTG---GCCAGTTGTAGT---GATAATTGTTG-T-----------GTAAGCGGACGTG---------GTAGTGGTTGC---------T------G---TA---CGA-TTTGT-A--GC----GG------T--C--ATG---GAAGTG-GTAACTGTAGTGG---T---G-----GT-GTATGT--T-G-TAT--TGGTGATAGCA---GTGGTaat
gi|19 : t-A--GT-GT--T--A---TGTT--TAGTATTA------T--CAT-T-A--TCATTATTA---TT-----A-------GA--AGTA---GACAAAGTAGCA-A--TA-GT---AG---TATCAT---AAGTAGCATCA---GTA---GA--------TG----TAGT-A-A-------TG--A----T---------------A---GAAGTGGGAGTAGCAGTAGTAACAGCAGTAGCC-AAAGCA---GTAGC---A-GTGGTA---GTAT---CAGAA-----GCAGTATCAATAGT----GACAGTAGAT--GCAGT---AGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcGT---AGTAGAAGCAT-T---A-------GCAA------GT-----------TAGTAATTGT---------G------G---TA---GTATGT-------GT----TG------T--A----A---GT-GTACGTATT-GTAGTAG---A---A-----GT-AATCTT--T-G-TAG--TAGCAGAAATA---GTTGTAGTAA----a
gi|20 : ttGT---GGTGGTGG---T------------AGAAGTAA-T----AGT-----------ATA-G---TA---GTAG-TA-GC---AATAGTAGTAAAAGT-GACGGTGGT---GATAGTAGTAG-T---A-------GAA-------GAA---------ATGGTGGTGGT---------G------G---TG---GTA-GTAGT-A-------------------------------GTA-GTGGTGATGGTAA---C---A-----GT-AGA----------AG--TAGTAGTAGTA---ATAACGGTGG----TG--AT-A----TTGT--AG-TAG-TAGTAG--TAACGGTGGTA--CAAGAAGTAG---TAGTGGAA-TG-GTGGTGG-aatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : g---------------A---GCAGT-GTATCATTAATAGCAACAGTA-TAG---ATAGTT---GTAGC---A-GAAGTA---GTAG---TAGAA-----ATAATACT----------ACTACTA-----GTAGT---AGTAA---TAGTAA---TAAT------AATAA---T------------AACAATAA-T----ATA-----------ACA-A---CA---TTAG-TA-GA---AGTATTAAT
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaGTATC---ATTAATAGCAA-C---A-------GTA--------TA---------G--ATAGTTGT---------A------G---CA---GAA-GTAGT-A--GT----AG------A--A--ATA---ATACTA-CTACTAGTAGTA---------------------------G-TAA--TAGTAATAATA---ATAATAACAA----TA--AT-A----TAAC--AA-CAT-TAGTAG--AAGTATTAATATTAAAGT--TGGAAATACTGATT-TG-AT--TAG-T--A--AACGTGTCAGTAattaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaagcagtTAA-TTG--TGGCGGT-GTTAATGTGGTACATGCGGTTG---TGAT---GGAGA---------TGGTAGTGTAA--------AT---GGTGG---T---GG---T---GGTAGTAGCGG---T---GGTGG-TG--GTGGTAAACATTATG-----GTGGTAGTG-------ACGAACGTCGTCGTCGT---GGTT--ATTG------TGGTG---GG--AGGT---AGTTGT---AACGGTGGTTG-TTAT
gi|23 : ttgagtaggtggtgt---T---GA---C---GGTATT-GTAA---T-----TAT-TT--GAAATAG------TATGATTGTGGCAGTA-------G------------TAGT---AGT---A--G------TAGGA---GT--AG-T---AGACGG---AGTAGTGACGG-TGATAGCAGtgcggcggtggtgat
gi|23 : GAAATAG-T----ATG-----------ATT-G---TG---GCAG-TA-GT---AGTAGTAGTA---GG-AGTAGTAGA---CGGAGTAGTGA-C---G-------GTG-------ATA---------GCAGAAAATGG---------A------G---TA---AAA-GCAGA-A--AC----AC------C--A--GCA---GCAGTA-GTAGTAATAGTGA---A---A-----GT-AAA-GG--T-A-TA----AGTATTAGTAAACATAGCA-TAA----TG--aaaatggagtaaaagcagaaacaccagcagcagtagtagtaatagtgaaagtaaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|25 : tgacggtattgtaattatttATAATGG-TTG--TGGTGGT-GATG--ATGATG---GTGATGGTGGTGGT---GGTGG---------TAATAAAATTA--------GT---AGTGG---T---GGGCGT---GGTAGTAGAAG---T---AGTAG-TT--GTATTAG------TA-----GTACTAGTA-------A------------CAGT---AAT---A--T------TAGTA---GT--AG-T---AGCAGTTAAAGTAATAGTGG-TGATGGTGGTGaaggtg
gi|25 : agaaTAGTAGCAGTTAAAGT---AATAGTGGTGATGG------TGGTGGTAGTATTAGCAGAAG---------tagtattagcagaag
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggtggtggtggtggtaataaaattagtagtggtgggcgtggtagtagaagtagtagttgtattagtagtactagtaacagtaatattagtagAGTAA-T---A-------GTA-------GTGAG-------GTAGTAGTTGTTTCTGAATGA------G---TA---GCA-GTAGT-A--GT----AGAT----T--G--GTAATTGTGGTT-GTAGCCGTAGTAT---A---A-----GT-AGACGTGAT-G-TAGTATATTAATAGTA---GTAGTAGTAA----TGATGC-A----TTACA-AG-CAG-T
gi|28 : tattgttgttgtata--AGCA---ATCGCAATCGCA-A--TC-AT---AG---TCACAG---TCGTAGCAGTA---GTT---GC--------TG----TAG----A-------AGT-A----TCATCAGCATAACATTA---GCAACATTAGCAGAAGAAGCAACAACATCAGCA-GTAGCA---GTAGC---T-GCAACA---GTAG---TAATA-----GAAGT
gi|29 : agcatcGAT---AGTGG---------TGGTAGTGATA--------AT---GGTGG---T---GG---T---GATAGTGACGGAGAT---GGTGG-TGTTGTAATTG------TG-----GTGGTAGTG-------A------------CAAT---GGT---A--G------TGGTATGTGT--AG-T---GGTTGT---GGT-GTGTTTGATAGTGGTAAT-GCT
gi|3 : ATAGTAGTAT---AAGTCATAATAGTAGTAATAA------TAGTAGAAGTAGAAGCAGCAG---------CAGCT------GTAGC---AGTGGTAGTAGTGGT---AGTAAT------------AGTGA---TGTCA-TTATTATCAGTAGTAGTA---AT-ATTATAAT--C--A---T-----TGGTGGTA------G--TAG-T-A--TGAATAGTA---GCCA---A------AGA--AAAA---GTAGCTGTAGCA-G--TA-GT---AG---TAGCAA---CAGTAGCAGCA---GCA---AT--------TG----TAGT-ATA-------AGTTA----T---------------A---AAAGTAGTAATAATAGCAGAAATAATAGCAGCA-GCAGCT---GTTGC---A-GTAGTA---GTAG---TGGTA-----GTAGTACTGAT-GTC---ATTATTA-----TCAGT---AGTAG---TAATAT---TATT---AGCATTGG---T------------GGAAGTAG-T----ATGG----------ATA-G---TA---ACAG-AA-GT---AAAAGTAGTT---GA-AGCAATAGT---AGTAGTAGCAA-C---A-------GTA-------GCA---------GCAGTAATTGT---------A------G---TA---TAA-GTAAT-A--AT----AG------T--A--GTA---ATACTA-GTAGAAGTAGTAG---C---A-----GC-AGCTGC--T-G-TAG--CAGTAGTGGTA---GTAGTAGTGA----TG--TC-A----TTAT--AATCAG-TAGTAG--TAATATTATTA--TCAGTGGTGG---TAGTAGTA-TGGATAGTAG-CCAA--A--GAAAAAGTAGT---TGTAGCAGTAGTA--GTAGCAACAGTAGCAG-CAGC---AATTGT---A---GT---ATAA------GTAAAAATA-------GAAGCA---------ATAG---AAGTAGAAGTAATAGCAGCAGTAG-TAA--TGGCGGT-GTCG--GCGGTG---GCGATAGCGGCAGT---GACAG---------TAATAGTAGCA--------GA---AACAG---T---AA---C---GCTATCAGCAA---T---AATAG-TG--AAAGTAG------CA-----GCAGCAATA-------A------------TAGT---AGT---A--G------TTGTA---GT--CG-T---AGATGC---TGTAGTAGTTG-TTGTAGTAGTTACTTTAggtggtggtggt
gi|31 : AAT--T--A---T-----TAATAATA------AAATAA-T-A--T-AATA-TA---AT-----A------AAATCAATACAGGCACCAGTAACA-G--TA-GT---AG---AAGC------AGCAGCAGAA---GTA---AT--------AA----TAGT-A-------------A----T---------------A---GCAGACGTAGTAGTAATAGACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaCAG-T---A-------ACA-------GTA---------GTAGAAGCAGC---------A------G---CA---GAA-GTAAT-A--AT----AG------T--A--ATA---GCAGAC-GTAGTAGTAATAGA--C---ATAGACGT-AGATGT--atgta
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacAGTAACAG------TAGTAGAAGCAGCAGCAGAAG---------TAATA------ATAGT---AATAGCAGACGTAGT---AGTAAT------------AGa
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCA---GTATGAGT--------TGATTTTACT-T-A-------AGTTA----T---------------AAAAGCAGTGGTAGTAGCAGTAGTACCAGTAGTAAC-------T---GTAGC---A-ATATCA---GTAG---CAATA-----GCAATACCG---GT----GCT-GCA-----ACAGT---AATAT---CATTAT---TATT---Aacatagacgtagatgta
gi|34 : tatTAGTT---GT-TGCAGTAGT---TGT--TA-CTG-TTGAA-------ATA-------ATA---------ATAGTTATTGT---------A------G---TA---CAA-GTAGTTATTAT----AG------T--C--ATA---AGAGTA-GTAGTAGTAGTAG---T---A-----GT-AGAAGT--T-T-TGG--TTGAAGTAGTA---GTTGTt
gi|35 : AGTAGAAGTA---GTTA--ATA-T--T--A---T-----TATTAAAA------G--TA--T-AATT-AGTAGAA---AT-----AGAAAAAAGA--AGTA---GTGGATATAGCA-A--TA-GT---AG---CAGCAG---TAtg
gi|35 : aaAGTA---GA-A--GTAGT--T--AATAT-----TATTATTA------A--AAG-T-A--T-AAT--TA---GT-----A-------GA--AATA---GAAAAA--AGAA-G--TA-GT---GGATATAGCAA---TAGTAGCAGCA---GTA----T--------TG----TTAT-T-ATT-----ATT-A----T---------------A---AC--TAGTAGAAATAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGT---ATTACTAGTAGTAGT---AGTAAT------------AGTAAAAGTT-------G---TAGTAGTATTA---AT-A--ATAAC--C--C---T-----TAGTAATA------G--TAA-C-ACTT-AGTAGTA---G------A------AGA--AG
gi|37 : aaaaaagttgAGCAT---T---AGAAG-TG--TTGGTAC------TA-----GTAGCAATA-------A------------TGGT---AGC---C--G------TGGTG---GT--AG-T---AGTTGT---TATTTTGGTTG-TTGTatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcatc-----TAGTAGTA------G--TAG-T-A--A-AATAAGA---AT-----A------AGT--ATTG---GTGACAGTAGCA-A--CA-TC---AC---TAGCGG---TATTATCAGTA---GTG---GT--------GG----Ttattgtac
gi|39 : gA--------AT---AGTGG---T---AA---T---AGTATGAGAGG---T---GGTTG-TG--GTAGTAG------TA-----GTAGTAGTA-------G-------------AG-----AT---G--G------TGGAG---GT--AG-T---AGTTGT---TGTGGTGGTTG-TCGTAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : GTAAAAG-T---A-------GTA-------TTA---------ATAGTTGTTGT---------G------G---TA---TTA-GTAAT-A--GT----AG------G--A--GTT---GTTACA-GTAGTTGTAGTTGACAC---A-----GT-AGTTGT--T-G-TAG--TAGTAGTA
gi|41 : --AGCA---GCGGCAGCGGCA-G--TA-GC---AG---TAGTAG---TAGTAGCGGCA---ATA----T--------CGA---TGGT-A-A-------A-T-A----T---------------A---ATGAT-GCAGTAGTAGT-GAAATAATA
gi|42 : cAGA------------AGTA----CTTCGAGTAG---CAGTAGTAGTA---GT-T--GTAGTAGT--A---T-----CAGTAGCA------A--TAG-T-A--C-AAT-GTA---GC-----A------A-A--ATCA---GTAGCAGTA
gi|43 : aGGTGGT---GGTGG---------TGGTTATGGTA--------GT---TGTGG---T---TA---C---GGTGGTTACGG---T---GGTGG-TG--GTAGTAG------AA-----GTAGTAGCA-------G------------TAGT---AGT---A--
gi|44 : AG--TGGC--T--TTG--GCGGTG---ACGATGGCGATGGT---GGTGG---------TGGTGGTGGTGAC------AT---ATT-----T---AG---C---GGTAGTAACAG---T---GGTAG-
gi|45 : acAGTAGTAATAG------TAGTAGAAATAGTAGTAGAAA---------CAGTA------GCAGT---GATAGAAGTGG
gi|46 : catgaaGTTGTAACA--T---A-------GTA-------GCA---------ATTGTAGTTGT---------A------G---TA---GT--GCAGT-G--GT----AG------T--A--ATA---GCAGTA-Gataagaata
gi|47 : AGCAGTAGTCGCAACAGTAGTCCCA-GTAGTA---GTAGC---A-GCAATA---GCAG---TA
gi|5 : TAGTAGTAGAAATAATAGTAATA-ATAGT------------A-GTGGTG---GTGG---TA-TG-----GTAGTACT--T-GT----AATATTATGGTGGTGGT---AGTAG---TAGTAG---TTGT---AGTAGTAG---TGATGATGGTGTTAGAAGTAG-TCGAGGTG-----------GTG-G---TG---ATGA-TA-AT---GATGGTGGTG---GT-AGTGGTAGT---AGTAATAGAGG-TNN-N-------NNN-------NNN---------NTAATAGAGGT---------A------G---TA---GTA-GTATT-G--AT----AG------A--A--GTA---GCAGTA-GTAGTGGTGGTAG---T---T-----AT-AG-TAT--TAG-TAA--TGGTTGTGGAA---GAAGTA-TAAGTGTTG--GTGA----TTGT--GG-TGT-TAGT-T--TAGTAGTAGTA--GTAATTGTGG---CAGTGGTA--G-A-AGTAG-T--A--A------------T---GGTAGTGGTAGCA--ATAGA---AGTAGCGATTGGT---GATTTA---A---GT---AT-A------GTAGAAGTA-------GTAGTATAATTGGTTGTGG---TAGTAGTAGTAATAGTAGTATTAT-TAG--TAGTGGT-AGTG--GCAGTA---GTTGTTGTGGTGGC---GGTGA---------TAGAAGTACTA--------AT---GGTGGTGTT---GG---C---TGTGGTAGTAG---T---AGTAG-TG--GTGGTGC------TG-----GTGTTAGT--------A------------TAGT---AGT---A--T------TAGTG---TT--GG-T---GGTGGT---GGTGGTGGcca
gi|7 : aTAG------TAGTAAAAGGAGTAA---AAG---------TAGCA------GTAGA---AGAAGTAGAAATA-----AGAA--------------AATAG---TTTTT-GCAG---CAGTAA-A--A---GT-A--TCACT--T--A---T------AGCAGCA------G--AAG-C----------GTA---AT-----A------AGA--AGTA---CTGACAGAAGCA-A--AA-GTTGAAG---AAGCAG---CAGCAGTCGCAAACGTT---GT--------TG----TAGC-A-ACATCAGAAGT-AGAAAC---------------A---GTAGTAGTAGCAGTAGCAGAAAAAGTGATAGCA-CCAGCTTAAGTAGC---A-GTCGTA---ATAG---TAGTAACAGAGAAGCA--GAA-GT----AGCAGTA-----GCAGC---AGCAGACACAGTAAAAGTAGT---AGCAGAAA---T------------AGAAGTAG-T----AT-------------TA-G---CA---GCAGATA-A----AGTAGTTGTA---GC-ATCAGCTGA---AGAAGAAGCAG-T---A-------GTA-------GCA------------------GC---------A------G---CA---GCA-GTAGT-A--GT----AG------T--A--GCA---GCAGAA-GTAGTAGTAATCG---C---A-----GC-AGCTGA--A-A-TAG--TAGCAGCAGAAAACGTAGTTGCAA----TG--GT-AACATTTAT--TA-CTG-TAGAAA--TAACAGCAAGG--GAAGTA
gi|9 : G---------TAGCA------GTAGT---AGTAGTAGTAGTAGT---ACTAGT------------AAAAG---TTTCA-GAAG---CAGCAGCAGTATACAT-A--ATAGT--T--A---T-----T-GTAGTA------G--TAG-T-A--C-TG----------------------------GTT---GTAGCTGCAGCA-A--TATGT----G---TAGCAG---TATTAGAAGCA---
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 111 111111 111111111 1111111111 222222222222 11111 33333333333333333333333 11111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 33333333333333333 1111111111111 1111111111111 2222222222222222222222 55555555555555555555555 111111 4444444444444444444444444 222 111111 1111111111111 111111 222222 2222222222 1111111 111111111 22222222222222222 1111111111111 111111111111
lowQualScore : 444 444444 888 22 2 666666666 8888888888 777 1 777 0 000000000000 4 44 3 777 1 666 3 555 0 77777 555 22222 999999999999 2 00000000000000000000000 33 66666 444 444 2 444 444 22222222222 444 444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 555 1 2 3 1 444 1 99999 66666666 444 66666 1 0 555555 2 555 555 0 5555 555 6666 6666 3 1 0 3 44444444444444444 2 555 3 3 888888 1 5 22 888888 66 33 1 44 6666666 8888888 22 0 888888888 333 1 2 1 2 22 888888 22 333 2 5555555555555 2 888888 2 888888888 33 2222222222222 0 1 9999999999999999999999 3 555 1 7777 4444 66666666666666666666666 11 777 666666 22 8888 0 1 6 7777777777777777777777777 888 222 444444 1 1 7777777777777 444444 1 5 444444 44 2222222222 666 1 4444444 222222222 555 44 44444444444444444 1 99999999999 444 99999999 444 33 2 33 5555 33 444 1111111111111 66666 2 222222222222 444 2 33 555 55555 1 1 9999 3 999 888 1 3 2
lowQualScore : ... ...... ... .. . ......... .......... ... . ... . ............ . .. . ... . ... . ... . ..... ... ..... ............ . ....................... .. ..... ... ... . ... ... ........... ... ... .................................................................... ... . . . . ... . ..... ........ ... ..... . . ...... . ... ... . .... ... .... .... . . . . ................. . ... . . ...... . . .. ...... .. .. . .. ....... ....... .. . ......... ... . . . . .. ...... .. ... . ............. . ...... . ......... .. ............. . . ...................... . ... . .... .... ....................... .. ... ...... .. .... . . . ......................... ... ... ...... . . ............. ...... . . ...... .. .......... ... . ....... ......... ... .. ................. . ........... ... ........ ... .. . .. .... .. ... ............. ..... . ............ ... . .. ... ..... . . .... . ... ... . . .
lowQualScore : 000 444444 888 55 1 000000000 5555555555 000 0 888 9 555555555555 1 44 1 888 0 444 3 000 3 22222 444 11111 777777777777 9 77777777777777777777777 44 22222 444 444 7 777 777 77777777777 777 777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 000 9 8 6 8 777 5 66666 66666666 444 77777 0 7 111111 9 111 000 4 7777 888 8888 5555 3 9 8 1 33333333333333333 8 444 1 1 222222 0 7 44 222222 44 22 1 11 5555555 5555555 88 5 000000000 555 0 0 5 0 88 555555 88 555 0 2222222222222 1 222222 2 999999999 11 5555555555555 2 4 0000000000000000000000 3 555 3 2222 5555 66666666666666666666666 22 888 222222 55 5555 5 0 2 6666666666666666666666666 888 555 444444 0 4 6666666666666 444444 0 0 999999 33 0000000000 444 5 3333333 333333333 444 22 33333333333333333 7 55555555555 444 22222222 111 22 4 44 3333 44 444 2222222222222 22222 5 888888888888 777 7 77 444 55555 0 0 4444 1 666 555 0 1 7
consensus : ATAGTAGTAGAAGT---AATAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTA---GTAGCAGNAG---------TAG--CA------GTAGT---AGTAGTAGTNGTAGT---AGTAGTA------------GTAGTTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--T--AGT-A--T-AGTAGTAGT--A------AGA--A-----GTA---GT---AGCAGTAGCAGTA-GT---AG---TAG-----------CAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------T-G----TA---------GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTAGTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGT---AGCAGTAGCN---GTAGCAGTAGTA---G----TAG---TAGTA-----GNAGTANTGAT-G-T-ANTAGTA---GCAGT---AGTAG---TAGTAN---TAGT---AGCAGTGGTAGAAGTAG-TA----TG-----------ATAG---TAGCAG-TA-GTAGT------AGTAGTAGC-AGTGGT------AGTAGTA--GTAGCAG-TA-------GTA-------GTA--GTAGTAGTTGT---------AG---TAGNA-GTAGT-A--GTAG------T--AGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---C---A-----GT-AGNTGT--TG-TA---------G--TAGTAGTAGT---------A---GTAGTAGTAATG--GTA----TT--A-T-AA-CAG-TAGTAGTAGTAGTAGTA--GAAGTAGTGG---TAGTAGTA--TG-ATGGTAG-T--A--A--GTANTAGTAG---T---T-GTAGCGGTA----GTAGTAGCAGTAGTA-G------CG--GTA-----GCG-ATTGT---AGT---ATAAGT------ANAAGTAGT-------AGCA--GTAG------TAGTAGCAGTA-ATAGCGGCAGTAGTAGTGGCGGTGTCG--GCGGTA---GCGGTAG------CGGTG---------GT---GGTGGT--GGTAGTG--G----TA--------GTAGTGGTG---GC------GGT---AGTAGC------GG---TA--GT-AGTG--G----TA--GTA---G------TA-----GTG-----GTAGT-AG------------TAGT---AGT-A--GTGGTG---GTAG-T---AGTNGTNGT---AGT-GG---TTG---TNG-TAGCAGTAGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAGAAGT---AGTAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTA---GTAGCAGAAG---------TAG--CA------GTAGT---AGTAGTAGTNGTAGT---AGTAGTA------------GTAGTTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--T--AGT-A--T-AGTAGTAGT--A------AGA--A-----GTA---GT---AGCAGTAGCAGTA-GT---AG---TAG-----------CAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------T-G----TA---------GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTAGTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGT---AGCAGTAGTT---GTAGCAGTAGTA---G----TAG---TAGTA-----GNAGTACTGAT-G-T-ANTAGTA---GCAGT---AGTAG---TAGTAN---TAGT---AGCAGTAGTAGAAGTAG-TA----TG-----------ATAG---TAGCAG-TA-GTAGT------AGTAGTNGC-AGCGGT------AGTAGTA--GTAGCAG-TA-------GTA-------GTA--GTAGTAGTTGT---------AG---TAGNA-GTAGT-A--GTAG------T--AGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---C---A-----GT-AGATGT--TG-TA---------G--TAGTAGTAGT---------A---GTAGTAGTAATG--GTA----TT--A-T-AG-CAG-TAGTAGTAGTAGTAGTA--GAAGTAGTGG---TAGTGGTA--TG-ATGGTGG-T--A--A--GTANTAGTAG---T---T-GTAGCGGTA----GTAGTAGNAGCAGTA-G------CG--GTA-----GCG-ATTGT---AGT---ATAAGT------ANAAGTAGT-------AGCA--GTAG------TAGTAGNAGTA-ATNGCGACAGTAGTAGTGGCGGTGTCG--GCGGTA---GCGGTGG------CGGTG---------GT---GGTGGT--GGTAGTG--G----TA--------GTAGTGGTG---GC------GGT---AGTAGC------GG---TA--GT-AGTG--G----TA--GTA---G------TA-----GTG-----GTAGT-AA------------TAGT---AGT-A--GTGGTG---GTAG-T---AGTNGTNGT---AGT-GG---TTG---TNG-TAGCAGTGGCTTTA
gi|1 : ----TA--------GTAGCAACA---GC------AGT---AGTAGA------AG---CA--GC-AGCG--AAACACA--GTA---G------AA-----GTA-----GCAGT-AG------------TAGC---AGA-A--GAGGTA---GGAA-A---AGTATTTGC---AAC-AGAAATAG---TAG-TAGCAGCAGCT
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaatGTA---GCAACAG------CAGTA---------GT---AGAAGC--AGCAGCG--AAACACA--------GTAGAAGTA---GC------AGT---AGTAGCAGAAGAGG---TA--GG-AAAA--G----TA--TTT---G------CA-----ACA-----GAAAT-AG------------TAGT---AGC-A--GCAGCT---GAAG-T---AGTTGTAATATCAGC-AG---CAGAAATAG-TAGTAGTAGCgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattaAGTAGAAGT---AGCAGTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATTTGCAACAGAAA---------TAG-----------TAGT---AGCAGCAGCTGAAGT---AGTTGTA------------ATA---TCAGCAG---CAGAAATAGTA---GT-A--GTAGC--A--A---CAGAAATAGTAGCAACAGAAG--T--AGTTA--T-AGTAGCAGC--AGC----AGA--A-----GCA---GT---AGCCGTAGCAGCA-GC---AG---GAG-----------TAGCCATAGTAGCAGAA---GCA---GTCGATGTTTT-G----TT---------GT------------T-A----T---------------T---GTACT--TTATTGCTGTTGTTATAGTAGT---AGTACTAGTA---GAAGAAGTAGTA---G----CAG---CAGCA-----AAATTACTA---G-C-AATATCA---GCAGTTAAAGTAG---TAGTTG---TAGT---TACAGCAATAAAAATAG-AA----TA-----------A--G---TATCTT-CA-GCAAA------AGTAGTAGC-AGTGGT------AGTTTCA--TCAGCAT-TA-------ATA-------GAA--ATAGTAGCAGC---------AG---CAAAA-GAAGT-C--GTAG------T--AGTA---GCACCA-ATAGTAGTAGTAGAT-C---A-----GCGAAAT-T--TA-TA---------G--TNNNNNNNNN---------N---NNNNNNNNNNNN--NNN----NN--N-N-NN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN---NNNNNNNN--NN-NNNNNNN-N--N--N--NNNNNNNNNN---N---N-NNNNNNNNNNACTGTCACAGCAGCAGTA-------------TA------------AT---AGT---ATAAGT------ACAAGAAGT-------AGCA--GCCG------CAGCNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN---NNNNNNN------NNNNN---------NN---NNNNNN--NNNNNNN--N----NNNNNNNNNTGTTGTTGTG---GT------GAT---AGTAGT------AG---TA--AT-AGAA--G----TA--GTA---G------TG-----GTG-----TTTGA-AA------------TAGT---AAT-A--GTGGTA---TTAA-TATAAATAGTAGT---AGTAGA---ACA---TGG--AGCAGTAGTTTTAaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacT---AGTAGTAGTACTAG------TAGAAGAAGTA---GTAGCAGCAGCAAAATTACTAG--CAATATCAGCAGTTAAAGTAGTAGTTGTAGTTACAGCAATAAAAATAGAATAAGTATCTTCAGCAA---AAGTAGTAGCA---GT-G--GTAGT--TTCA---T-----CAGCATTA------A--T--AGA-AA-T-AGTAGCAGC--AGCAAA-AGA--A-----GTC---GT---AGTAGTAGCACCA-AT---AG---TAG-----------TAG---TAG-ATCAGCG---AAA---TT--------T-A----TA---------GTN-N-------NNN-N----N---------------N---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNN---N----NNN---NNNNN-----NNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNN---NNNNN---NNNNN---NNNNNA---CTGTCACAGCAGCAGTATAA-TAG-TA----TA-----------A--G---TA-CA---A-GAAGT------AGCAGCCGC-AGCNNN------NNNNNNN--NNNNNNN-NN-------NNN-------NNN--NNNNNNNNNNN---------NN---NNNNN-NNNNN-N--NNNN------N--NNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNN---T---------GT-TGTTGTGGTGATA---------G--TAGTAGTAAT---------A---GAAGTAGTAGTG--GTG----TTTGA---AA-TAG-TAATAGTGGTATTAATA--TAAATAGTAG---TAGTAGAA--C--ATGG---------------AGCAGTAG---T---T-TTAGTAATA----TTAGTAGTTGTAGTA-T------TA--GTA-----GCA-ATTGT---CGTTGTACAAGTTTTCGTATAAATATTTTTTTTTAG-A--GTAG------TAGTAACAGTA-AAAGAAGAAGTAGTTATAACAG---CA--GCAGTA---GTAGTAG------TAATATTATTATTAGT---AGTAATTTAATAGTA--G----TA--------GAAGTTGTT---GTTGATATGGT---TGTTGT------TG---TA--AT-AGTA--G----TA--GAA---G------TG-----GTG-----GTAGT-AA------------gtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttaATAGTAGCAGCAGC---AAAAGAAGTCGTAG------TAGTAGCACCA---ATAGTAGTAG---------TAGATCA------GCGAA---ATTTATAGTNNNNNN---NNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NN-N--NNNNN--N--N---N-----NNNNNNNN------N--N--NNN-N--N-NNNNNNNNN--N------NNN--N-----NNN---NN---NNNNNNNNNNNNN-NN---NN---NNN-----------NAC---T-GTCACAGCA---GCA---GTA-------TAA----TA---------GTATA-------AGT-A----CA--------------A---GAAGTAGCAGCCGCAGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNN---N----NNN---NNNNN-----NNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNN---NNNNN---NNNNN---NNNNTG---TTGT---TGTGGTGATAGTAGTAG-TA-----------------ATAG---AAGTAG-TA-GTGGTGTTTGAAATAGTAAT-AGTGGT------ATTAATA---TA--AA-TA-------GTA-------GTA--GTAGAACATGG---------AG---CAGTA-GTTTT-A--GTAA------T--ATTA---GTAGTT-GTAGTATTAGTAG---C---A-----AT-TGTCGT--TG-TACAAGTTTTCG--TATAAATATTTTTTTTTAGA---GTAGTAGTAACA--GTA--------A-A-AG-AAG-AAGTAGTTATAACAGCA--GCAGTAGTAG---TAGTAATA--TT-ATTAT-------------TAGTAGTAA---T---T--TA---ATA----GTAGTAGAAGTTGTT-GTTGATATG--GTT-----GTT-GTTGT---AAT---AGTAGT------AGAAGTGGT-------GGTA--GTAA------NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN---NNNNNNN------NNNNN---------NN---NNNNNN--NNNNNNN--N----NN--------NNNNNNNNN---NN------NNN---NNNNNN------NN---NA--GT-AATG--G----TAATGTT---GA-----TA-----GTG-----TTAAT-CG------------TAGCATAAGT-A--GTAGAG---GAAG-T---AGTGGTAGT---AGT-AG---TTG---TAG-TAGAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaG---------TGG--TG------ATAGT---AGTAGTAATAGAAGT---AGTAGTG------------GT-GTTT--GAAA---TAGTAATAGTG---GT-A--TTAAT-----A---T-----AAATAGTA------G--T--AGT-A--G-AACA-TGG----------AGC--A-----GTA---GTTTTAGTAATATTAGTA-GT---TG---TAG-----------TAT---TAGTAGCAATT---GTC---GT--------T-G----TACAAGTTTTCGTATA-------AAT-A----TTTTTTTTTAG-----A---GTAGTAGTAACAGTAAAAGAAGAAGTAGTTATAACAGCAGCA---GTAGTAGTAGTA---A----TAT---TATTA-----TTAGTAGTAAT-T-T-AATAGTA---GTAGA---AGTTG---T--TGT---TGAT---A----TGGTTGTTGTTG-TA-----------------ATAG---TAGTAG-AA-GTGGT------GGTAGTAAN-NNNNNN------NNNNNNN--NNNNNNN-NN-------NNN-------NNN--NNNNNNNNNNN---------NN---NNNNN-NNNNN-N--NNNN------N--NNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNN---N---N-----NN-NNNNNN--NN-NN---------N--NAGTAATGGT---------A---AT-GT--TGATA--GTG----TT--A---AT-C-G-TAGCATAAGTAGTAGAG--GAAGTAGTGG---TAGTAGTAGTTG--TAGTAG----A--A--GCATAAGCAGAATT---T-TTTGCATTA----GTAGTTGCAGTAGTATG------TGTTGTAAGTGTGCGTATTGT---ATT---Acataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttG-TG-------GTA-------GTA--GAAGTAGGTGT---------AG---TAGTT-GT-------GT--------T--AGAA---GTAGTT-GGAGAAGTAGTAA---C---A-----GT-AG-TG----G-TG---------G--TGGTAGTAGT---------A---GTGATGATGATG--GT--------------G-GAGATA-TAGTGGTAGTAGTA--GAAGTAGTAA---TAGTAGTAG-TG-GTGGTGG-T--AATA--GTCGTAGTAA---T---T-GTGGCGGTG----GTGGTAGTAGTAGTA-GTGT---TG--GTT-----GCG-GTTGT---AGTG--GTGATG------ATGATTA-N-------NNNN--NNNN------NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN---NNGGTGG------TGGTG---------GTGCAGGTGGT--GATAGTA--G----TA--------GTGGGAGTG---GT------GGT---GGTGGT------GG---AA--AT-AATA--G----TA--GTA---G------AA-----GAA-----GTAGTAAA------------TA-T---AGT-A--GTAGCA---GTAG-A---AGTGGTTGT---GGT-GG---GTG---TGG-TAgagg
gi|12 : tgatgGTGGTA----TTTGTAAAACTGGTA-C------TG--GTA-----CTG-ATTGTGTTAGTGCCATAGGT------ATAAGTAGT-------AGTG--GTAG------TGGTAGCAGTA-ATTATGACAGTGG--ATGG---------------------GATGG------TGGTA---------GT-----CGGT--GGTAGTGTTGATGTTG--------GTAGTGGTGTAAAT------GCT---GATAGC------GG---TA--GT-GGTG--G----TT--GGG---G------CG-----TTG-----GTGTT-AG------------CAGT---GGA-A--GTGTTG---ATGT-T---GGTAGTGGT----GT-AA---ATG---TTGATAGCTGTAtta
gi|13 : attgcttTAGTAATAA---T---A-----G--AGATGT--AC-TA---------G--TAGTTGTAGT---------G---AAAGTGGTAGCG--TTAG---TT--G-T-AA-TGG-AAATGGTAGTAGCAGTG--GAA----------CA----CA--TA-AGGG-------A--A--TTTGTAGTAG---TACAT-ATAGTGGTA----GTGATAGTGG---TA-G------CA--GTA-----G----TTGT---AAT---GGAAAT------GGAAGTGGG-------A-CAC-GTAAGGGAATTGGTAGTAGTATAT----ACAGTGGTAGTGAAAGGGGTA--GCGGTA---GTTGTAA------TGGAA---------AT---GGTAGT--GGTTGTG--A----AACAT-----GTAAGGGAA---TT------GGT---AGTAGT-----------TAATGC-AGTG--G----TA--GTG---A------TA-----ATG-----GTAGC-GG------------TAGT---TGT-A--ATGtgttggtggggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgatT---ATACCGATAGTATTTG----TTA---TATTA-----GAGTTGTTGTT-G-T-ACTAGTA---G-AG-----GTAG---TAGTAT---TAGT-----------T-GAAGTAG-TA-----------------AT-G---TAGCAG-CA-GTAGT------ATTAGTTGT-AGTAGT------AAT-GTA--GTAGCAG-TA-------ATA-------GTA--GTTGTTGTTGT---------AAGATCAGCA-GTAGT-G--GTGGCGATTCT--AGTA---GTAGAA-GTAGTAATGGTAA---A---A-----GT-AGATGG--AG-TA---------G--TAGTATTAGT---------A---GTGGT
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatagtatcattattgttgtaattatcatcattattactattatcGTAGTAGATGTAG-T-----TGCTGTTGTTTTTGTAG---TAGCAG-TATATAAT-------GTAATGAC-A-TGTT------AGTAATA--AAAAAAGATATATTGTTGTA-------GTA--ACAGTAGTTGT---------CA---TAGTA-GTTGT-A--GTAG------TAAAGTA---GTAGTA-ATAGAAGTAGTAG---TTAAA-----GT-TGTGGT--TG-TG---------G--TAGTAGTAGT---------AT--GTA-TAATAATG----A----TT--A-T-GA-TTG-AAGTAGTAGTAGTAGTA--GAAGTAGTAT---TA--AATA---A-ATATTGGAT--AT-A--ATACTAGTAG---TATAT-GTAGTCATA----TCAGTA
gi|18 : GTTGT---AGTAGTAGTT---GTAACGGTAGTG---A----TAGATGTAGTG-----GAAGT--TAAT-A-T-GGTACTT---GCAGT---GGTAG---TGGTAA---CAGT---AATGATAATTGTAGTGGCTA----TG-----------GCAGAGGTAGATG-T--GTAAT------TGTAGTGGCCAGTTGT------AGTGATA--ATTGTTG-T--------GTAAGCGGACGTG--GTAGTGGTTGC---------TG---TACGA-TTTGT-A--GCGG------T--CATG---GAAGTG-GTAACTGTAGTGG---T---G-----GT-GTATGT--TG-TA---------T--TGGTGATAGC---------A---GTGGTat
gi|19 : tgtgatg-A--GT-GT--T--A---TGTT--TAGTATTA------T--C--ATT-A--TCATTATTATT--A-------GA--A-----GTA---GA---CAAAGTAGCAATA-GT---AG---TAT-----------CAT---AAGTAGCATCA---GTA---GA--------T-G----TA---------GTA-A-------TG--A----T---------------A---GAAGTGGGAGTAGCAGTAGTAACAGCAGT---AGCCAAAGCA---GTAGCAGTGGTA---G----TAT---CAGAA-----GCAGTATCAATAG-T-GACAGTAGATGCAGT---AGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcGTAGTA--GAAGCAT-TA-------GCAA------GT----TAGTAATTGT---------GG---TAGTATGT-------GTTG------T--A--A---GT-GTACGTATT-GTAGTAG---A---A-----GT-AATCTT--TG-TA---------G--TAGCAGAAAT---------A---GTTGTAGTAAa
gi|20 : ttGT------AGAAGTAAT-------AGTATAGTAG------TAGTAGCAATA-GT------AGTAAAAGTGACGGTGGTG--ATAGTA---GTAGTAGAAGAAATGGTG---------GT---GGTGGT--GGTAGTA--G----TA--------GTAGTGGTG---AT------GGTAACAGTAGA------AG---TA--GT-AGTA--G----TA--ATAACGG------TG-----GTGATATTGTAGT-AG------------TAGT---AGT-A--ACGGTG---GTAC-A---AGAAGTAGT---AGT-GGAA-TGG---TGG-TGGaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : ggtggtggtgGC-AGTG-T------ATCATTA--ATAGCAA-CA-------GTA--------TA--G--ATAGTTGT---------AG---CAGAA-GTAGT-A--GTAG------A--AATA---ATACTA-CTACTAGTAGTA--------------------------G-TA---------A--TAGTAATAAT---------A---ATAATAACAATA--ATA----TA--A-C-AA-CAT-TAGTAGAAGTATTAATATTAAAGT--TGGAAATACTGATT--TG-AT--TAG-T--A--AACGTGTCAGTA
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaaTAATTGTGGCGGTGTTAATGTGGTACATGCGGTTG---------TG---------AT---GGAGAT--GGTAGTG--T----AA--------ATGGTGGTG---GT------GGT---AGTAGC------GG---TG--GT-GGTG--G----TG--GTA---AACATTATG-----GTG-----GTAGT-GACGAACGTCGTCGTCGT---GGTTATTGTGGTG---GGAGGT---AGTTGTAAC---GGT-GG---TTG---TTA-TTGCGGCG
gi|23 : ttgagtaggtggtgtTG---AC------GGT---ATT----------G---TA--ATTATTT--G----AA--ATA---G------TATGATTGTG-----GCAGT-AG------------TAGT---AGT-A--GTAGGA---GTAG-T---AGACGGAGT---AGT-GA---CGG---TGA-TAGCAGtggtgat
gi|23 : GAAATAG-TA----TG-----------ATTG---TGGCAG-TA-GTAGT------AGTAGTAGG-AGTAGT------AGACGGA--GTAGTGA-CG-------GTG-------ATA--GCAGAAAATGG---------AG---TAAAA-GCAGA-A--ACAC------C--AGCA---GCAGTA-GTAGTAATAGTGA---A---A-----GT-AAA-GG--TA-TA-------------AGTATTAGT---------AAACATAGCA-TAATG--aaaatggagtaaaagcagaaacaccagcagcagtagtagtaatagtgaaagtaaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|25 : tgacggtattgtaattatttAGAAATAATG---G----TTG---TGGTG-----GTGATGATGAT-GGT-GATGGTG---GTGGT---GGTGG---TAATAA---AATT---AGTAGTGGTGG-----G-CG----TG-----------GTAG---TAGAAG-TA-GTAGT------TGTATTAGT-AGTACT------AGTAACA--GTAATAT-TA-------GTA-------GTA--GTAGCAGTTAA---------AG---TAATA-GTGGT-G--ATGG------T--GGTG---GTAGTA-TTAGCAGAAGaaggtg
gi|25 : GTGGTGGTGGTGGTAATAAAATTAGT---AGTGGTGGGC---GTGGTAGTAGAA---G----TAG---TAGTT-----GTATTAGTA---G-T-ACTAGTA---ACAGT---AATAT---TAGTAG---TAGT---AGCAGT--TA-AAGTAA-TAGTGGTG-----------ATGG---TGGTGG-TA-GTATT------AGCAG
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatgAGTAA-TA-------GTA-------GTGAGGTAGTAGTTGTTTCTGAATGAG---TAGCA-GTAGT-A--GTAGAT----T--GGTAATTGTGGTT-GTAGCCGTAGTAT---A---A-----GT-AGACGTGATG-TA---------GTATATTAATAGT---------A---GTAGTAGTAATGATGCA----TT--A-CAAG-CAG-Taag
gi|28 : tattgttgttgtata--A-----GCA---AT---CGCAATCGCAATC-AT---AG---TCA-----------CAG---TCGTAGCAGTA---GTT---GC--------T-G----TA---------G---A-------AGT-A----TCATCAGCATAACATTA---GCAACATTAGCAGAAGAAGCAACAACATC---AGCAGTAGCA---GTAGCTGCAACA---G----TAG---TAATA-----GAAGT
gi|29 : agcatcG---------AT---AGTGGT--GGTAGTG--A----TA--------ATGGTGGTG---GT------GAT---AGTGAC------GGAGATG--GT-GGTGTTG----TA--ATT---G------TG-----GTG-----GTAGT-GA------------CAAT---GGT-A--GTGGTATGTGTAG-T---GGTTGTGGT----GT-GT---TTGA--TAG-TGGTAATG
gi|3 : ATAGTAGTATAAGTCATAATAGTAGTAATAA------TAGTAGAAGTA---GAAGCAGCAG---------CAG--CT------GTAGC---AGTGGTAGTAGTGGT---AGTAATA------------GTGATGTCATTATTATCAGTAGTAGTA---AT-ATTATAAT--C--A---T-----TGGTGGTA------G--T--AGT-A--TGAATAGTAGCCAA------AGA--A-----AAA---GT---AGCTGTAGCAGTA-GT---AG---TAG-----------CAA---CAGTAGCAGCA---GCA---AT--------T-G----TA---------GTATA-------AGTTA----T---------------A---AAAGTAGTAATAATAGCAGAAATAATAGC---AGCAGCAGCT---GTTGCAGTAGTA---G----TAG---TGGTA-----GTAGTACTGAT-G-TCATTATTA---TCAGT---AGTAG---TAATAT---TATT---AGCATTGGTGGAAGTAG-TA----TGG----------ATAG---TAACAG-AA-GTAAA------AGTAGTTGA-AGCAAT------AGTAGTA--GTAGCAA-CA-------GTA-------GCA--GCAGTAATTGT---------AG---TATAA-GTAAT-A--ATAG------T--AGTA---ATACTA-GTAGAAGTAGTAG---C---A-----GC-AGCTGC--TG-TA---------G--CAGTAGTGGT---------A---GTAGTAGTGATG--TCA----TT--A-T-AATCAG-TAGTAGTAATATTATTA--TCAGTGGTGG---TAGTAGTA--TGGATAGTAG-CCAA--A--GAAAAAGTAG---T---T-GTAGCAGTA----GTAGTAGCAACAGTA-G------CA--GCA-----GCA-ATTGT---AGT---ATAAGT------AAAAATAGA-------AGCA--ATAG------AAGTAGAAGTA-ATAGCAGCAGTAGTAATGGCGGTGTCG--GCGGTG---GCGATAG------CGGCA---------GT---GACAGT--AATAGTA--G----CA--------GAAACAGTA---AC------GCT---ATCAGC------AA---TA--AT-AGTG--A----AA--GTA---G------CA-----GCA-----GCAAT-AA------------TAGT---AGT-A--GTTGTA---GTCG-T---AGATGCTGT---AGT-AG---TTG---TTG-TAGTAGTTACTTTActggtggtggtggt
gi|31 : AAT--T--A---T-----TAATAATA------AAAT--AAT-A--T-AATA-TAAT--A------AAATCA-----ATACAGGC---ACCAGTAACAGTA-GT---AG---AAG-----------C------AGCAGCAGAA---GTA---AT--------A-A----TA---------GTA-------------A----T---------------A---GCAGACGTAGTAGTAATAG--ACA----T---AGACGTAGAT---GTAaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaCAG-TA-------ACA-------GTA--GTAGAAGCAGC---------AG---CAGAA-GTAAT-A--ATAG------T--AATA---GCAGAC-GTAGTAGTAATAGA--C---ATAGACGT-AGATGT--
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacAGTAACAG------TAGTAGAAGCA---GCAGCAGAAG---------TAA--TA------ATAGT---AATAGCAGACGTAGT---AGTAATA------------Ga
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCA---GTATGAGT--------T-GATTTTA---------CTT-A-------AGTTA----T---------------AAAAGCAGTGGTAGTAGCAGTAGTACCAGTAGT---AAC------T---GTAGCAATATCA---G----TAG---CAATA-----GCAATACCG---G-T-GCT-GCA---ACAGT---AATAT---CATTAT---TATT---Aacatagacgtagatgta
gi|34 : tatT------AGTTGTTGC-AGTAGT------TGT--TACTGTTGAAA-TA-------ATA-------ATA--GT--TA-TTGT---------AG---TACAA-GTAGTTATTATAG------T--CATA---AGAGTA-GTAGTAGTAGTAG---T---A-----GT-AGAAGT--TT-TG---------G--TTGAAGTAGT---------A---GTTGTt
gi|35 : AGTAGAAGTA---GTTA--ATA-T--T--A---T-----TATTAAAA------G--T--A-T-AATT-AGTAGAAAT--AGAAAAAAGA--A-----GTA---GT---GGATATAGCAATA-GT---AG---CAG-----------CAG---TAtg
gi|35 : aaAGTA---GA-A--GTAGT--T--AATAT-----TATTATTA------A--A--AGT-A--T-AAT--TAGT--A-------GA--A-----ATA---GA---AAAA--AGAAGTA-GT---GGATATAG-----------CAA---TAGTAGCAGCA---GTA----T--------T-G----TT---------ATT-ATT-----ATT-A----T---------------A---AC--TAGTAGAAATAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaA-A-------AGT-T----G---------------A---GTATTACTAGTAGTAGTAGTAATAGTAAA---AGTTGTAGTA---GTATTAATAATA---ACCCTTAG---TAATA-----GTAACACT------T-AGTAGTA---GAAGA---AG
gi|37 : aaaAGC------AT---TA--GA-AGTG--T----TG--GTA---C------TA-----GTA-----GCAAT-AA------------TGGT---AGC-C--GTGGTG---GTAG-T---AGTTGTTAT---TTT-GG---TTG---TTG-Tatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcatc-----TAGTAGTA------G--T--AGT-A--A-AATAAGAAT--A------AGT--A-----TTG---GT---GACAGTAGCAACA-TC---AC---TAG-----------CGG---TATTATCAGTA---GTG---GT--------G-G----Ttattgtac
gi|39 : gA--------ATAGTGGTA---AT------AGT---ATGAGA------GG---TG--GT-TGTG--G----TA--GTA---G------TA-----GTA-----GTAGT-AG-------------AG-----AT-G--GTGGAG---GTAG-T---AGTTGTTGT---GGT-GG---TTG---TCG-TAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : --GTAAAAG-TA-------GTA-------TTA--ATAGTTGTTGT---------GG---TATTA-GTAAT-A--GTAG------G--AGTT---GTTACA-GTAGTTGTAGTTGACAC---A-----GT-AGTTGT--TG-TA---------G--TAGTAGTA
gi|41 : --A-----GCA---GC---GGCAGCGGCAGTA-GC---AG---TAG-----------TAG---TAGTAGCGGCA---ATA----T--------C-GA---TG---------GTA-A-------A-T-A----T---------------A---ATGAT-GCAGTAGTAGT-GAAATAATA
gi|42 : cAGAA------------GTACTTCGAGTAG---CAGTAGTAGTA---GT-T--GTAGTAGT--A---T-----CAGTAGCA------A--T--AGT-A--C-AAT-GTAGC--A------A-A--A-----TCA---GT---AGCAGTA
gi|43 : aGGTG---------GT---GGTGGT--GGTTATG--G----TA--------GTTGTGGTT---AC------GGT---GGTTAC------GG---TG--GT-GGTG--G----TA--GTA---G------AA-----GTA-----GTAGC-AG------------TAGT---AGT-A--
gi|44 : AGTGGC--T-TTG--GCGGTG---ACGATGG------CGATG---------GT---GGTGGT--GGTGGTG--G----TGAC------ATATT--TA---GC------GGT---AGTAAC------AG---TG--GT-AG
gi|45 : acAGTAGTAATAG------TAGTAGAAATA---GTAGTAGAAA---------CAG--TA------GCAGT---GATAGAAGTGG
gi|46 : catgaaGTT--GTAACA--TA-------GTA-------GCA--ATTGTAGTTGT---------AG---TAGT--GCAGT-G--GTAG------T--AATA---GCAGTA-Gataagaata
gi|47 : AGCAGTAGTCGCAACAGTAGT---CCCAGTAGTA---GTAGCAGCAATA---G----CAG---TA
gi|5 : ATAGTAGTAGAAAT---AATAGTAATAATAG------TAGTGGTGGTG---GTA-TGGTAG---------TAC--TT------GTAAT---ATTA-TGGTGGTGGT---AGTAGTA------------GTAGTT------G---TAGTAGTAGTG---AT-G--ATGG---T--G---T-----TAGAAGTA------G--TCGAG--G--T-GGTGGTGAT--G------ATA--ATGATGGTG---GT---GGTAGTGGTAGTA-GT---AA---TAGAGGTNNNNNNNNNN---TAATAGAGGTA---GTA---GT--------A-G----TA---------TTG-AT------AGA-AG---T---------------A---GCAGTAGTAGTGGTGGTAGTTATAGTATT---AGTAATGGTT---GTGGAAGAAGTA---T----AAG---TGTTG-----GTGATTGTGGT-G-T---TAGT----TTAGT---AGTAG---TAGTAA---TTGT---GGCAGTGGTAGAAGTAG-TA-----------------ATGG---TAGTGG-TA-GCAAT------AGAAGTAGCGATTGGTGATTTAAGTA-TA--GTAGAAG-TA-------GTA-------GTA--TAATTGGTTGT---------GG---TAGTA-GTAGT-A--ATAG------T--AGTA---TTATTA-GTAGTGGTAGTGG---C---A-----GT-AGTTGT--TG-TG---------G--TGGCGGTGAT---------A---GAAGTACTAATG--GTG----GT--GTT-GG-CTG-TGGTAGTAGTAGTAGT-----GGTGGTGC---TGGTGTTA--GT-ATAGT---------A--GTATTAGT-G---T---TGGTGGTGGTG----GTGGTGGcca
gi|7 : TAG------TAGTAAAAGGA---GTAA---AAG---------TAG--CA------GTAGA---AGAAGTAGAAATA-----AGAA--A------------ATAGTTTTTGCAG---CAGTAA-A--A---GT-A--TCACT--T--A---T------AGCAGCA------G--A--AGC----------GTAAT--A------AGA--A-----GTA---CT---GACAGAAGCAAAA-GTTGAAG---AAG-----------CAG---CAGCAGTCGCAAACGTT---GT--------T-G----TA---------GCA-ACATCAGAAGT-AGAAAC---------------A---GTAGTAGTAGCAGTAGCAGAAAAAGTGAT---AGCACCAGCTTAAGTAGCAGTCGTA---A----TAG---TAGTAACAGAGAAGCA--GAA-G-T-AGCAGTA---GCAGC---AGCAGACACAGTAAAAGTAGT---AGCAGAAATAGAAGTAG-TA----T-------------TAG---CAGCAGATA-A-AGT------AGTTGTAGC-ATCAGC------TGAAGAA--GAAGCAG-TA-------GTA-------GCA-----------GC---------AG---CAGCA-GTAGT-A--GTAG------T--AGCA---GCAGAA-GTAGTAGTAATCG---C---A-----GC-AGCTGA--AA-TA---------G--TAGCAGCAGA---------AAACGTAGTTGCAATG--GTAACATTT--A-T-TA-CTG-TAGAAATAACAGCAAGG--GAAGTA
gi|9 : GATG---------TAG--CA------GTAGT---AGTAGTAGTAGTAGT---ACTAGTA------------AAAGTTTCAGAAG---CAGCAGCAGTATACAT-A--ATAGT--T--A---T-----T-GTAGTA------G--T--AGT-A--C-TG---------------------------GTT---GT---AGCTGCAGCAATATGT----G---TAG-----------CAG---TATTAGAAGCA---
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 1111 111111 111111111111 111111 111111111 111111111 111111111111111 22222222222222222 111111111111 11111111111 111111111111 44444444444444444444444444444444444444 11111111111 333333333333333333333 1111 222222 1111 1111111 1111111111111 11111111111111 44444444444444444444444444 44444444444444 1111111111111111111111 1111111 111111 11111111 2222222222222222222222222222222 111111111111 11111111 11111111 11 111111111111111 111111111111 111111111 1111111
lowQualScore : 0000 7 111111 333333333333 1 55 000000 1 444444444 444444444 333 2 777 0 555 44444 0 222222222222222 888888888888 99999999 0 22 22222222222222222 33 55555 444 0 0 2 000000000000 444 11111111111 444 0 444 444 444 999999999999 33 33333333333333333333333333333333333333 0 2 555 55555 1 00000000000 555555 66666 2 2 444 66666 1 333333333333333333333 444 1 444 555 33 6666 4444 1 444444 3 2 555 888888 3 1 888888 444 0 0 333 2 2 333 2 0 888888888 777 11 0 4444 2 888888 333 333 1111 55555 2 0000000 2 999999999 33 2222222222222 666 44444444444444 88888 44 44 555 6666 0 666 0 3 55555555555555555555555555 77 55 1 9999 2 0 00000000000000 8888888888888888888888 1 66 4444444 0 1 4 222222 2 4 66666666 777777 3 5555555555555555555555555555555 888888888888 2 77777777 8888888 555 99999999 00000000 0 33 33 2 2 11 222222222222222 1 2 333333333333 444 2 33 1 1 0 888 555 333333333 1 1 5555555 3 3 1
lowQualScore : .... . ...... ............ . .. ...... . ......... ......... ... . ... . ... ..... . ............... ............ ........ . .. ................. .. ..... ... . . . ............ ... ........... ... . ... ... ... ............ .. ...................................... . . ... ..... . ........... ...... ..... . . ... ..... . ..................... ... . ... ... .. .... .... . ...... . . ... ...... . . ...... ... . . ... . . ... . . ......... ... .. . .... . ...... ... ... .... ..... . ....... . ......... .. ............. ... .............. ..... .. .. ... .... . ... . . .......................... .. .. . .... . . .............. ...................... . .. ....... . . . ...... . . ........ ...... . ............................... ............ . ........ ....... ... ........ ........ . .. .. . . .. ............... . . ............ ... . .. . . . ... ... ......... . . ....... . . .
lowQualScore : 1111 6 555555 222222222222 0 00 555555 0 555555555 555555555 666 5 000 1 888 77777 7 444444444444444 444444444444 22222222 5 55 99999999999999999 22 99999 444 1 3 5 333333333333 444 99999999999 444 9 444 777 777 333333333333 99 44444444444444444444444444444444444444 2 4 444 66666 0 66666666666 666666 44444 4 4 111 22222 0 999999999999999999999 777 3 777 000 99 8888 3333 4 000000 3 9 000 222222 1 2 222222 111 5 1 777 1 1 777 1 3 000000000 000 55 8 2222 0 555555 555 555 1111 66666 2 2222222 4 444444444 22 2222222222222 999 22222222222222 33333 66 66 888 4444 5 444 1 6 55555555555555555555555555 55 88 9 4444 7 5 99999999999999 8888888888888888888888 0 11 4444444 4 6 4 888888 2 4 33333333 111111 7 9999999999999999999999999999999 666666666666 4 33333333 1111111 444 33333333 99999999 9 99 44 5 5 00 444444444444444 4 7 777777777777 777 7 77 7 0 5 555 444 333333333 0 0 2222222 3 3 0
consensus : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTAGT------AGC---AGNAGTAG--CAGT------AGTAGTAGTAGTNGTAGT---------AGTAGTAGTAG---------TTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--T--AG-T-A--T-AGTAGTA---GT-----A------AGA--A-----GTA---GTAGCAGTAGCAGTA-GT---A--------G---TAG-----------CAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT-T-G------------TA--GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCA-GTA--GTAG-----TAGTAGTAGNAACAG-----------TAGTAGCA----GTAGCN---GTAGCAG-TAGT-A---GTAGTAGTA-----GNAGTANTG-T-G-------T----AGTAGTA---GCAGT---AGTAG---T--AGTAN---TAGT---GGCAGTGGTAGAAGTAGTATG-ATAGTAGCAG-TAGT---AGT------AGTAGTAGC-AGTGGT------AGTAGTAGTAGCAGTA---GT-AGT-A---GTA-GTAGTTGT---------AG---TAGNAGTAGTAGT----A-G------TAGTA---GTAGTAGTAG---TAGTAGTAG---CA-----GT-AGNTGT--TG-TA---------G--TAGTAGTAGT---------A---GTAGTAGTAATG--GTA----TTA-T--AA-CAGTAG-----TAGT--AGTAGTAGTA--GAA---GT---AGTGG---TAGTGGT-A-TG-GT----G--GTAGT--A--A--GTAGTAGTAGTT-GTAGTGGTA----GTGGTAGCAGTAGTAG---TGGTAGCGATTGT---A---GT---ATAA------GTANA--AGTA-------GTAGCA-GTAG------TAGTAGNAGTA-ATAGCGG----CAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGT---------------A---GCGGT------------AGCGGTGGT---G----GTGGT---G---GTAGTG---GTA--------GTAG------TGGTGGCGGTAGTAGCGGTA--GT-AG-TGGTA--GTA------G-TA-----GTGGTAGT-A------------GTAGT---AG-TA--GTGGCGGTA---GT---AG---------TNGTTGT------AGT-G-GTTGTNGTAGCAGTAGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAGAAGT---AATAGTAGTAATAG------TAGTAGAAGTAGT------AGC---AGNAGTAG--CAGT------AGTAGTAGTAGTNGTAGT---------AGTAGTAGTAG---------TTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--T--AG-T-A--T-AGTAGTA---GT-----A------AGA--A-----GTA---GTAGCAGTAGCAGTA-GT---A--------G---TAG-----------CAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT-T-G------------TA--GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCA-GTA--GTAG-----TAGTAGTAGNAACAG-----------TAGTAGCA----GTAGCN---GTAGCAG-TAGT-A---GTAGTAGTA-----GNAGTANTGAT-G-------T----ANTAGTA---GCAGT---AGTAG---T--AGTAN---TAGT---AGCAGTGGTAGAAGTAGTATG-ATAGTAGCAG-TAGT---AGT------AGTAGTAGC-AGTGGT------AGTAGTAGTAGCAGTA---GT-AGT-A---GTA-GTAGTTGT---------AG---TAGNAGTAGTAGT----A-G------TAGTA---GTAGTAGTAG---TAGTAGTAG---CA-----GT-AGNTGT--TG-TA---------G--TAGTAGTAGT---------A---GTAGTAGTAATG--GTA----TTA-T--AA-CAGTAG-----TAGT--AGTAGTAGTA--GAA---GT---AGTGG---TAGTAGT-A-TG-AT----G--GTAGT--A--A--GTANTAGTAGTT-GTAGCGGTA----GTAGTAGCAGTAGTAG---CGGTAGCGATTGT---A---GT---ATAA------GTANA--AGTA-------GTAGCA-GTAG------TAGTAGCAGTA-ATAGCGG----CAGTAG-TAG--TGGCGGT-GTCG--GCGGT---------------A---GCGGT------------AGCGGTGGT---G----GTGGT---G---GTAGTG---GTA--------GTAG------TGGTGGCGGTAGTAGCGGTA--GT-AG-TGGTA--GTA------G-TA-----GTGGTAGT-A------------GTAGT---AG-TA--GTGGTGGTA---GT---AG---------TNGTNGT------AGT-G-GTTGTNGTAGCAGTAGCTTTA
gi|1 : ATTAT---A---AC---AT---------TAAATTAGTA-------GCAACA-GCAG------TAGTAGAAGCA-GCAGCGAAACACAGTAG-AAG--TAGCAGT-A--------GT---------------A---GCAGA------------AGAGGTAG----GAAAAGTATT---T---GCAACA---GAA--------ATAG------TAGTAGC---AGCAGCTGAA--GT-AG-TTGTA--ATA------T-CA-----GCAGCAGA-A------------ATAGT---AG-TA--GT---------------AGCAACAGAAATAGTAGCAACAGAAGT-A-GTTATAGTAGCAGCAGC
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatAGTAGAAGT---AGCAGTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAAGTATT------TGC---AACAGAAA--TAGT------AGTAGCAGCAGCTGAAGT---------AGTTGTAATA------------TCAGCAG---CAGAAATAGTA---GT-A--GTAGC--A--A---CAGAAATAGTAGCAACAGAAG--T--AG-TTA--T-AGTAGCA---GC-----AGC----AGA--A-----GCA---GTAGCCGTAGCAGCA-GC---A--------G---GAG-----------TAGCCATAGTAGCAGAA---GCA---GT-C-GATGTTTTGTTGTTATTGTA-C-------TTT-A----T---------------T---GCT-GTT--GTTA-----TAGTAGTAGTACTAG-----------TAGAAGAA----GTA------GTAGCAG-CAGC-A---AAATTACTA-----GCAATAT-----------------------CA---GCAGTTAAAGTAG---T--AGTTG---TAGT---TACAGCAATAAAAATAGAATA---AGTATCTT-CAGC---AAA------AGTAGTAGC-AGTGGT------AGTTTCATCAGCATTA---AT-AGA-A---ATA-GTAGCAGC---------AG---CAAAAGAAGTCGT----A-G------TAGTA---GCACCAATAG---TAGTAGTAGAT-CA-----GCGAAAT-T--TA-TA---------G--TNNNNNNNNN---------N---NNNNNNNNNNNN--NNN----NNN-N--NN-NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNN---NNNNNNN-N-NN-NN----N--NNNNN--N--N--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNACTGTCACAGCAGCAGTA-------TA------AT---A---GT---ATAA------GTACA--AGAA-------GTAGCA-GCCG------CAGCNNNNNNN-NNNNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNN---------------N---NNNNN------------NNNNNNNNN---N----NNNNN---N---NNNNNN---NNNNNNNNNNTGTTG------TTGTGGTGATAGTAGTAGTA--AT-AG-AAGTA--GTA------G-TG-----GTGTTTGA-A------------ATAGT---AA-TA--GTGGTATTA---ATATAAA---------TAGTAGT------AGTAG-AACATGG-AGCAGTAGTTTTAagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacTACTAGTAGAAG-----A-AGTAGTAGCAG------CAGCAAAATTACT------AGC---AATATCAG--CAGTTAAAGTAGTAGTTGTAGTTACAGC---------AATAAAAATAGAATAAGTATCTTCAGCAA---AAGTAGTAGCA---GT-G--GTAGT--TTCA---T-----CAGCATTA------A--T--AGAA-A--T-AGTAGCA---GCAGCAAA------AGA--A-----GTC---GTAGTAGTAGCACCA-AT---A--------G---TAG-----------TAG---TAG-ATCAGCG---AAA---TT-T-A------------TA--GTN-N-------NNN-N----N---------------N---NNN-NNN--NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNN----NNNNNN---NNNNNNN-NNNN-N---NNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNN-N-------N----NNNNNNN---NNNNN---NNNNN---N--NNNNA---CTGTCACAGCAGCAGTATAA-TAGTATA---AGTACAAG-AAGT---AGC------AGCCGCAGC-NNNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNN---NN-NNN-N---NNN-NNNNNNNN---------NN---NNNNNNNNNNNNN----N-N------NNNNN---NNNNNNNNNN---NNNNNNT------------GT-TGTTGTGGTGATA---------G--TAGTAGTAAT---------A---GAAGTAGTAGTG--GTG----TT--TGAAA-TAGTAA-----TAGT--GGTATTAATA--TAA---AT---AGTAG---TAGTAGA-A-C--AT----G--G--------------AGCAGTAGTT-TTAGTAATA----TTAGTAGTTGTAGTAT---TAGTAGCAATTGT---CGTTGT---ACAAGTTTTCGTATA--AATATTTTTTTTTAG-A-GTAG------TAGTAACAGTA-AAAGAAG----AAGTAG-T----------T-AT-A--ACAGC---------------A---GCAGT------------AGTAGTAGT---A----ATATT---A---TTATTA---GTA--------GTAA------T-TTAATAGTAGTAGAAGTT--GT-TGTTGATATGGTT------G-TT-----GTTGTAAT-A------------GTAGT---AG-AA--GTGGTGGTA---GT---Agtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagATAGTAGCAGCAGC---AAAAGAAGTCGTAG------TAGTAGCACCAAT------AGT---AGTAGTAGATCAGC------GAAATTTATAGTNNNNNN---------NNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NN-N--NNNNN--N--N---N-----NNNNNNNN------N--N--NN-N-N--N-NNNNNNN---NN-----N------NNN--N-----NNN---NNNNNNNNNNNNNNN-NN---N--------N---NNN-----------NAC---T-GTCACAGCA---GCA---GTATAA------------TA--GTATA-------AGT-A----CA--------------A---GAA-GTA--GCAG-----CCGCAGCNNNNNNNN-----------NNNNNNNN----NNNNNN---NNNNNNN-NNNN-N---NNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNN-N-------N----NNNNNNN---NNNNN---NNNNN---N--NNNTG---TTGT---TGTGGTGATAGTAGTAGTA---ATAGAAGTAG-TAGT---GGTGTTTGAAATAGTAAT-AGTGGT------ATTAATA-TA--AATA---GT-AGT-A---GTA-GAACATGG---------AG---CAGTAGTTTTAGT----A-A------TATTA---GTAGTTGTAG---TATTAGTAG---CA-----AT-TGTCGT--TG-TACAAGTTTTCG--TATAAATATTTTTTTTTAGA---GTAGTAGTAACA--GTA------A-A--AG-AAGAAG-----TAGT--TATAACAGCA--GCA---GT---AGTAG---TAGTAAT-A-TT-AT----T--AT------------TAGTAGTAATT--TAATAGTA----GTAGAAGTTGTTGTTGATATGGTTGTTGTTGT---A---AT---AGTA------GTAGA--AGTG-------GTGGTA-GTAA------NNNNNNNNNNN-NNNNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNN---------------N---NNNNN------------NNNNNNNNN---N----NNNNN---N---NNNNNN---NNN--------NNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--GT-AA-TGGTAATGTT------GATA-----GTGTTAAT-C------------GTAGCATAAG-TA--GTAGAGGAA---GT---AG---------TGGTAGT------AGT-A-GTTGTAGTAGAAGCAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaAGCA------G--C--AG-T-A--T-AATAGTATAAGT-----ACA----AGA--A-----GTA---GCAGCCGCAGCNNNN-NN---N--------N---NNN-----------NNN---NNNNNNNNNNN---NNN---NN-N-N------------NN--NNN-N-------NNN-N----N---------------N---NNN-NNN--NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNTGTTGTTGTG---GTGATAG-TAGT-A---GTAATAGAA-----GTAGTAGTGGT-G-------TTTGAAATAGTA---ATAGT---GGTAT---T--AATAT---AAAT---AGTAGTAGTAGAA----CATG-G----AGCAG-TAGTTTTAGT------AATATTAGT-AGTTGT------AGTATTAGTAGCAATT---GT-CGT-T---GTA-CAAGTTTT---------CG---TATAAATATTTTTTTTTA-G-------AGTA---GTAGTAACAG---TAAAAGAAG---AA-----GT-AG---T--TA-TA---------A--CAGCAGCAGT---------A---GTAGTAGTAATA--TTA----TTA-T-----TAGTAG-----TAATTTAATAGTAGTA--GAA---GT---TGTTG---T--TGAT-A-TG-GTTGTTGTTGTAAT--AGTA--GTAGAAGTGGTG-GTAGTAANN----NNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN---N---NN---NNNN------NNNNN--NNNN-------NNNNNN-NNNN------NNNNNNNNNNN-NNNNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNAGT---------------A---ATGGT------------AATGTTGAT---A----GTGTT---AATCGTAGCATAAGTA--------GTAGAGGAAGTAGTGGTAGTAGTAGTTGTA--GT-AG-AAGCA--TAA------G-CA-----GAATTTTT-T------------GCATT---AG-TA--GTTGCAGTA---GT---AT---------GTGTTGTA-----AGT-G-taagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacTGGTGGT---------AG---TAGAAGTAGGTGT----A-G------TAGTT---GTGTTAGAAG---TAGTTGGAG---AA-----GT-AG---T--AA-CA---------G--TAGTGGTGGT---------G---GTAGTAGTAGTG----A----TGA-T--GA-TGGTGGAGATATAGT--GGTAGTAGTA--GAA---GT---AGTAA---TAGTAGT-AGTG-GT----G--GTGGT--AATA--GTCGTAGTAATT-GTGGCGGTG----GTGGTAGTAGTAGTAGTGTTGGTTGCGGTTGT---A---GTG--GTGA------TGATG--ATTA--------NNNNN-NNNN------NNNNNNNNNNN-NNNNNNN----NNNNNN-NNN--NNNNNNN-NNNN--NNNNN---------------N---NNGGT------------GGTGGTGGTGCAG----GTGGT---G---ATAGTA---GTA--------GTGG------GAGTGGTGGTGGTGGTGGAA--AT-AA-TAGTA--GTA------G-AA-----GAAGTAGTAA------------ATA-T---AG-TA--GTAGCAGTA---GA---AG---------TGGTTGT------GGT-G-GGTGTGGTAtgcgtattgtattagagg
gi|10 : tgaATAGTGGTAGTAGT---AGAAGTAGTAATAG------TAGTAGTGGTGGT------GGT---AATAGTCG--TAGT------AATTGTGGCGGTGGTGGT---------AGTAGTAGTAG---------TGTTGGTTG---CGGTTGTAGTG---GT-G--ATGAT--G--A---T-----TANNNNNN------N--N--NN-N-N--N-NNNNNNN---NN-----N------NNN--N-----NNN---NNNNNNNNNNNNNNN-NN---NNNNNNNNGG---TGG-----------TGG---TGGT-GCAG-----GTG---GT-G-A------------TA--GTA----------GT-AG---T---------------G---GGA-GTG--GTGG-----TGGTGGTGGAAATAA-----------TAGTAGTA----GAAGAA---GTAGTAAATA-T-A---GTAGTAGCA-----GTAGAAGTG---G-------T----TGTGGTG---GGTGT---GGTAT---T--Atta
gi|12 : tgatggtggtagtagaagtaggtgtagtagttgtgttagaagtagttggagaagtagtaacagtagtggtggtggtagtagtagtgatgatgatggtggagatGTGGTA----TTTGTAAAACTGGTAC---TGGTACTGATTGTGTTA---GTGCCATAG------GTATA--AGTA-------GTAGTG-GTAG------TGGTAGCAGTA-ATTATGA----CAGTGGATGGGATGGTGGTAGTCG--GTGGTAGTGTTGATGTTGGTA---GTGGTGTAAATGCTGATAGCGGTAGT---G----GTGGTTGGG---GCGTTG---GTG--------TTAG------CAGTGGAAGTGTTGATGTTG--GT-AG-TGGT---GTA---------A-----ATGTTGAT-A------------GCTGT---AG-TG--TTGGTGG-G---GT---CT---------TTGTTGT--------T-A-TTTATAGTGGTAGTGG
gi|13 : attgctt---TAGTAATAA---TA-----G--AGATGT--AC-TA---------G--TAGTTGTAGT---------G---AAAGTGGTAGCG--TTAG---TTG-T--AA-TGGAAA-----TGGT--AGTAGCAGTG--GAACACAT---AAGGG---AATTTGT-A-------------GTAGT--A--C--ATA----TAGTG-GTAGTGATA----GTGGTAGCAGTAGT---------------TGT---A---AT---GGAA------ATGGA--AGTG-------GGA-CACGTAAGGGAATTGGTAGTAGTATATA--------CAGTGG-TAG--TGAAAGG-GGTA--GCGGT---------------A---GTTGT------------AATGGAAAT---G----GTAGT---G---GTTGTG---AAACAT-----GTAA------GGGAATTGGTAGTAGT--TAATGC-AG-TGGTA--GTG------A-TA-----ATGGTAGC-G------------GTAGT---TG-TA--ATGtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aacaataacatgat-------AGT-A----T--------------------CA-TTATTGTTG-----TAAT--TATCATCAT-----------TATTACTA----TTATCT---ATACCGA-TAGT-ATTTGTTATATTA-----GAGTTGTTGTT-G-------T----ACTAGTA---G-AG-----GTAG---T--AGTAT---TAGT-----------T-GAAGTAGTA---AT-GTAGCAG-CAGT---AGT------ATTAGTTGT-AGTAGT------AAT-GTAGTAGCAGTA---AT-AGT-A---GTT-GTTGTTGT---------AAGATCAGCAGTAGTGGT----G-GCGATTCTAGTA---GTAGAAGTAG---TAATGGTAA---AA-----GT-AGATGG--AG-TA---------G--TAGTATTAGT---------A---GTGGT
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgat-GT---A--------G---TAG-----------ATG---TAGTTGCTGTT---GTT---TT-T-G------------TA--GTA-GC------AGT-A----T---------------A---TAATGTA--ATGACATGTTAGTAATAAAAAAAGATATATTGTTGTAGTAACA----GTAGTT---GTCATAG-TAGT-T---GTAGTAGTA------AAGTA------G-------T----AGTAATA---GAAGT---AGTAG---T--TAAAG---TTGT---GGTTGTGGTAGTAGTAGTATGTATAATAATGA-TTAT---GAT------TGAAGTAGT-AGTAGT------AGTAGAAGTAGTATTA------AATAA---ATA-TTGGATAT---------AA---TACTAGTAGTA-T----ATG------TAGTC---ATATCAGTAA---T
gi|18 : -GTT--GTAG-----TAGTAGTTGTAACGG-----------TAGTGA-------TAGAT---GTAGTGG-AAGTTA---ATA-TGGTA-----CTTGCAGTG---G-------T----AGTGGTA---ACAGT---AATGA---T--AATTG---TAGT---GGCTATGGCAGAGGTAG-ATG--T-GTAATTG-TAGT---GGC--------CAGTTGT-AGTGAT------AATTGTTGTGTAAGCG---GA-CGT-G---GTA-GTGGTTGC---------TG---TACGATTTGTAGC----G-G------TCATG---GAAGTGGTAA---CTGTAGTGG---TG-----GT-GTATGT--TG-TA---------T--TGGTGATAGC---------A---GTGGT
gi|19 : tgtgatg-A--GT-GT--T--A---TGTT--TAGTATTA------T--C--AT-T-A--TCATTATTA---TT-----A-------GA--A-----GTA---GACAAAGTAGCAATA-GT---A--------G---TAT-----------CAT---AAGTAGCATCA---GTA---GA-T-G------------TA--GTA-A-------TG--A----T---------------A---GAA-GTG--GGAG-----TAGCAGTAGTAACAG-----------CAGTAGCC----AAAGCA---GTAGCAG-TGGT-A---GTATCAGAA-----GCAGTATCAATAG-------T----GACAGTAGATGCAGT---AGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcG-TAGT---AGA------AGCATTAGC-AA-GTT------AGTAATTGTGGTAGTATGTGT-TGT-AAGTGTACGTA-TTGT---------AG---TAGAAGTAATCTT----T-G------TAGTA---GCAGAAATAG---TTGTAGTAa
gi|20 : ttGT---GGTGGTGGTAGAAGTA------ATAGTA--------T---AGT------AGTAGTAGC-AATAGT------AGTAAAAGTGACGGTG---GT-GAT-A---GTA-GTAGTAGA---------AGAAATGGTGGTGGTGGT----G-G------TAGTA---GTAGTAGTGG---TGATGGTAA---CA-----GT-AGA---------A---------G--TAGTAGTAGT---------A---ATAACGGTGGTG--ATA----TTG-T--AG-TAGTAG-----TAGT--AACGGTGGTA--CAA---GA---AGTAG---TAGTGGA-A-TG-GT----G--GTGGaaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : g---------------A---GCA-GT---GTAT-----CATTAATAGCAACAG-----------TA-TAG------ATAGTT---GTAGCAG-AAGT-A---GTAGTAGAA-----ATAATACT-----------------ACTACTA---GTAGT---AGTAA---T--AGTAA---TAAT------AATAATAACAATAATATA-ACAACATTAG-TAGA---AGT------ATTAATA
gi|21 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaAGCAGT----GT-ATC-A---TTA-ATAGCAAC---------AG---TATAGATAGTTGT----A-G------CAGAA---GTAGTAGTAGAAATAATACTAC---TA-----CT-AGTAGT--AG-TA---------A--TAGTAATAAT---------A---ATAATAACAATA--ATA----TAA-C--AA-CATTAG-----TAGA--AGTATTAATATTAAA---GT-----TGGAAATACTGAT-T-TG-AT--------TAGT--A--AACGTGTCAGTAttaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaTAA-TTG--TGGCGGT-GTTAATGTGGT---------------ACATGCGGT---------------TGTGAT---G----GAGAT---G---GTAGTG---TAA--------ATGG------TGGTGGTGGTAGTAGCGGTG--GT-GG-TGGTG--GTAAACATTA-TG-----GTGGTAGT-GACGAACGTCGTCGTCGT---GGTTATTGTGGTGGGAG--GT---AG---------TTGTAAC------GGT-G-GTTGTTATTGCGG
gi|23 : ttgagtaggtggtgtTGACGGTATT----GTA--ATTAT-TTGAA--ATA------G-TATGATTGTGGCAGT-A------------GTAGT---AG-TA--GTAGGAGTA---GT---AG---------ACGGAGT------AGT-G-ACGGTGATAGCAGcggtggtgat
gi|23 : GAAATAGTATG-ATTGTGGCAG-TAGT---AGT------AGTAGTAGG-AGTAGT------AGACGGAGTAGTGACG---GT-GAT-A---GCA-GAAAATGG---------AG---TAAAAGCAGAAAC----A-C------CAGCA---GCAGTAGTAG---TAATAGTGA---AA-----GT-AAA-GG--TA-TA-------------AGTATTAGT---------AAACATAGCA-TAATG--aaaatggagtaaaagcagaaacaccagcagcagtagtagtaatagtgaaagtaaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|25 : tgacggtattgtaattatttAGAAATA---AT-GGT-T---GTG-GTGGTGAT---------GA---TGATGGTGATGGT----G-G------TGGTG---GTGGTAATAA---AATTAGTAG---TG-----GT-GGGCGT--GG-TA---------G--TAGAAGTAGT---------A---GTTGTATTAGTA--GTA----CTAGT--AA-CAGTAA-----TATT--AGTAGTAGTA--GCA---GTTAAAGTAA---TAGTGGTGA-TG-GT----G--GTGGT-----A--GTATTAGCAGaaggtg
gi|27 : GTTGT------TGTATAAGTAATAGTA---GTGAG------GTA-GTAGTTGTTTCTGAATGAG---TAGCAGTAGTAGT----A-GAT----TGGTAATTGTGGTTGTAG---CCGTAGTAT---AA-----GT-AGACGTGATG-TA---------GTATATTAATAGT---------A---GTAGTAGTAATGATGCA----TTA-C--AAGCAGTaag
gi|28 : tatt--A-----GCA---ATCGCAATCGCAATC-AT---A--------G---TCA-----------CAG---TCGTAGCAGTA---GTT---GC-T-G------------TA--G---A-------AGT-A----TCATCAGCATAACATTA---GCA-ACA--TTAG-----CAGAAGAAGCAACAA-----------CATCAGCA----GTAGCA---GTAGCTG-CAAC-A---GTAGTAATA-----GAAGT
gi|29 : agcatcGAT---A----GTGGT---G---GTAGTG---ATA--------ATGG------TGGTGGTGATAGTGACGGAG--AT-GG-TGGTGTTGTA------A-TT-----GTGGTGGT-A------------GTGAC---AA-TG--GTAGTGGTATGTGT---AG---------TGGTTGT------GGT-GTGTT-TGATAGTGGTA
gi|3 : ATAGTAGTATAAGTCATAATAGTAGTAATAA------TAGTAGAAGTAGA------AGC---AGCAGCAG--CTGT------AGCAGTGGTAGTAGTGGT---------AGTAATAGTGA---------TGTCATTATTATCAGTAGTAGTA---AT-ATTATAAT--C--A---T-----TGGTGGTA------G--T--AG-T-A--TGAATAGTA---GCCA---A------AGA--A-----AAA---GTAGCTGTAGCAGTA-GT---A--------G---TAG-----------CAA---CAGTAGCAGCA---GCA---AT-T-G------------TA--GTATA-------AGTTA----T---------------A---AAA-GTA--GTAA-----TAATAGCAGAAATAA-----------TAGCAGCA----GCAGCT---GTTGCAG-TAGT-A---GTAGTGGTA-----GTAGTACTGAT-G-------TC---ATTATTA---TCAGT---AGTAG---T--AATAT---TATT---AGCATTGGTGGAAGTAGTATGGATAGTAACAG-AAGT---AAA------AGTAGTTGA-AGCAAT------AGTAGTAGTAGCAACA---GT-AGC-A---GCA-GTAATTGT---------AG---TATAAGTAATAAT----A-G------TAGTA---ATACTAGTAG---AAGTAGTAG---CA-----GC-AGCTGC--TG-TA---------G--CAGTAGTGGT---------A---GTAGTAGTGATG--TCA----TTA-T--AATCAGTAG-----TAGT--AATATTATTA--TCA---GT---GGTGG---TAGTAGT-A-TGGAT----A--GTAGCCAA--A--GAAAAAGTAGTT-GTAGCAGTA----GTAGTAGCAACAGTAG---CAGCAGCAATTGT---A---GT---ATAA------GTAAA--AATA-------GAAGCA-ATAG------AAGTAGAAGTA-ATAGCAG----CAGTAG-TAA--TGGCGGT-GTCG--GCGGT---------------G---GCGAT------------AGCGGCAGT---G----ACAGT---A---ATAGTA---GCA--------GAAA------CAGTAACGCTATCAGCAATA--AT-AG-TGAAA--GTA------G-CA-----GCAGCAAT-A------------ATAGT---AG-TA--GTTGTAGTC---GT---AG---------ATGCTGT------AGT-A-GTTGTTGTAGTAGTTACTTTAatgctggtggtggtggt
gi|31 : AAT--T--A---T-----TAATAATA------AAAT--AA-T-A--T-AATA-TA---AT-----A------AAATCA-----ATACAGGCACCAGTAACAGTA-GT---A--------G---AAG-----------C------AGCAGCAGAA---GTA---AT-A-A------------TA--GTA-------------A----T---------------A---GCA-GAC--GTAG-----TAGTAATAGACATAG-----------ACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaCAGTA---AC-AGT-A---GTA-GAAGCAGC---------AG---CAGAAGTAATAAT----A-G------TAATA---GCAGACGTAG---TAGTAATAGA--CATAGACGT-AGATGT--atgta
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacAGTAACAG------TAGTAGAAGCAGC------AGC---AGAAGTAA--TAAT------AGTAATAGCAGACGTAGT---------AGTAATAGa
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCA---GTATGAGT-T-GATTT--------TA--CTT-A-------AGTTA----T---------------AAAAGCA-GTG--GTAG-----TAGCAGTAGTACCAG-----------TAGTAACT----GTAGCA---ATATCAG-TAGC-A---ATAGCAATA-----CCGGTGCTGCA-A-------C----AGTAATA---TCATT---ATTAT---T--Aacatagacgtagatgta
gi|34 : tatGTTGAAAT---AATAATAGTTATTG------TAGTACAAGTAGTTATTATAGTCATAAGAGTAG--TAGT------AGTAGTAGTAGTAGAAGTTTTGGTTGAAGTAGTAGTTG---------TTt
gi|35 : tagttgttgcagtagttgttactAGTAGAAGTA---GTTA--ATA-T--T--A---T-----TATTAAAA------G--T--A--T-AATT-AGTAGAA---AT-----AGAAAAAAGA--A-----GTA---GTGGATATAGCAATA-GT---A--------G---CAG-----------CAG---TAg
gi|35 : aaAGTA---GA-A--GTAGT--T--AATAT-----TATTATTA------A--A--AG-T-A--T-AAT--TA---GT-----A-------GA--A-----ATA---GAAAAA--AGAAGTA-GT---G--------GATATAG-----------CAA---TAGTAGCAGCA---GTA----T-T-G------------TT--ATT-ATT-----ATT-A----T---------------A---AC---TA--GTAG-----AAATAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGTATTACTAGTAGT---------AGTAGTAATAG---------TAAAAGTTG---TAGTAGTATTA---AT-A--ATAAC--C--C---T-----TAGTAATA------G--T--AA-C-ACTT-AGTAGTA---G------A------AGA--A-----G
gi|37 : aaaaaagttgAGCATTA--GA-AG-TGTTG--GTA------C-TA-----GTAGCAAT-A------------ATGGT---AG-CC--GTGGTGGTA---GT---AG---------TTGTTAT------TTT-G-GTTGTTGTatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcatc-----TAGTAGTA------G--T--AG-T-A--A-AATAAGA---AT-----A------AGT--A-----TTG---GTGACAGTAGCAACA-TC---A--------C---TAG-----------CGG---TATTATCAGTA---GTG---GT-G-G------------Ttattgtac
gi|39 : gA--------ATAG------TGGTAATAGTATGAGAGGTG--GT-TG-TGGTA--GTA------G-TA-----GT---AGT-A------------GTAGA---GA-TG--GTGGAGGTA---GT---AG---------TTGTTGT------GGT-G-GTTGTCGTAGCAGTtacaacaacagaagaag
gi|40 : GTAAAAGTA---GT-ATT-A---ATA-GTTGTTGT---------GG---TATTAGTAATAGT----A-G------GAGTT---GTTACAGTAG---TTGTAGTTGACACA-----GT-AGTTGT--TG-TA---------G--TAGTAGTA
gi|41 : CAG-----------CAGCGGCA----GCGGCA---GTAGCAG-TAGT-A---GTAGTAGCG-----GCAATATCGAT-GGTAAATAT----AATGAT----GCAGT---AGTAG---TGAAATAA---TA
gi|42 : AGAAGTAC---------TTCGAGTAG---CAGTAGTAGTA---GT-T--GTAGTAGT--A---T-----CAGTAGCA------A--T--AG-T-A--C-AAT-GTA---GC-----A------A-A--A-----TCA---GTAGCAGTA
gi|43 : aGGTGGT---G----GTGGT---G---GTTATG---GTA--------GTTG------TGGTTACGGTGGTTACGGTG--GT-GG-TGGTA--GTA------G-AA-----GTAGTAGC-A------------GTAGT---AG-TA--
gi|44 : AG--TGGC--T--TTG--GCGGT---------------G---ACGAT------------GGCGATGGT---G----GTGGT---G---GTGGTG---GTGAC------ATAT------T--TAGCGGTAGTAACAGTG--GT-AG-
gi|45 : acAGTAGTAATAG------TAGTAGAAATAGT------AGT---AGAAACAG--TAGC------AGTGATAGAAGTGG
gi|46 : catgaaGTTGTAACA-TA---GT-AGC-A---ATT-GTAGTTGT---------AG---TAGT-GCAGTGGT----A-G------TAATA---GCAGTAGataagaata
gi|47 : AG-----CAGTAGTCGCAACAG-----------TAGTCCCA----GTAGTA---GTAGCAG-CAAT-A---GCAGTA
gi|5 : ATAGTAGTAGAAAT---AATAGTAATAATAG------TAGTGGTGGTGGT------A-T---GGTAGTAC--TTGT------AATATTA-TGGTGGTGGT---------AGTAGTAGTAG---------TT------G---TAGTAGTAGTG---AT-G--ATGGT-----G---T-----TAGAAGTA------G--TCGAG---G--T-GGTGGTG---AT-----G------ATA--ATGATGGTG---GTGGTAGTGGTAGTA-GT---A--------A---TAGAGGTNNNNNNNNNN---TAATAGAGGTA---GTA---GT-A-G------------TA--TTG-AT------AGA-AG---T---------------A---GCA-GTA--GTAG-----TGGTGGTAGTTATAG-----------TATTAGTA----ATGGTT---GTGGAAG-AAGT-A---TAAGTGTTG-----GTGATTGTGGT-G-------T------TAGT----TTAGT---AGTAG---T--AGTAA---TTGT---GGCAGTGGTAGAAGTAGTA---ATGGTAGTGG-TAGC---AAT------AGAAGTAGCGATTGGTGATTTAAGTA-TAGTAGAAGTA---GT-AGT-A---TAA-TTGGTTGT---------GG---TAGTAGTAGTAAT----A-G------TAGTA---TTATTAGTAG---TGGTAGTGG---CA-----GT-AGTTGT--TG-TG---------G--TGGCGGTGAT---------A---GAAGTACTAATG--GTG----GTG-TT-GG-CTGTGG-----TAGT--AGTAGTAGTG--GTG---GT---GCTGG---TGTTAGT-A--------------TAGT-----A--GTATTAGT-GTTGGTGGTGGTG----GTGGTGGcca
gi|7 : TAG------TAGTAAAAGGAGT------AA------AAGTAG--CAGT------AGAAGAAGTAGAAATA-----------AGAA--AATAG---------TTTTTGCAG---CAGTAA-A--A---GT-A--TCACT--T--A---T------AGCAGCA------G--A--AG-C----------GTA---AT-----A------AGA--A-----GTA---CTGACAGAAGCAAAA-GTTGAA--------G---AAG-----------CAG---CAGCAGTCGCAAACGTT---GT-T-G------------TA--GCA-ACATCAGAAGT-AGAAAC---------------A---GTA-GTA--GTAG-----CAGTAGCAGAAAAAG-----------TGATAGCA----CCAGCTTAAGTAGCAG-TCGT-A---ATAGTAGTAACAGAGAAGCA--GAA-G-------T----AGCAGTA---GCAGC---AGCAGACAC--AGTAAAAGTAGT---AGCAGAAATAGAAGTAGTAT---TAGCAGCAGATAA----AGT------AGTTGTAGC-ATCAGC------TGAAGAAGAAGCAGTA---GT-AGC-A-------------GC---------AG---CAGCAGTAGTAGT----A-G------TAGCA---GCAGAAGTAG---TAGTAATCG---CA-----GC-AGCTGA--AA-TA---------G--TAGCAGCAGA---------AAACGTAGTTGCAATG--GTAACATTTA-T--TA-CTGTAG-----AAAT--AACAGCAAGG--GAA---GT---A
gi|9 : GTAG--CAGT------AGTAGTAGTAGTAGTAGT---------ACTAGTAAAAG---------TTTCAGAAG---CAGCAGCAGTATACAT-A--ATAGT--T--A---T-----T-GTAGTA------G--T--AG-T-A--C-TG---------------------------------GTT---GTAGCTGCAGCAATATGT------------G---TAG-----------CAG---TATTAGAAGCA---
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 111 222222 111111111111 222222222 111111111111 111111111 333333333333333333333333333333 111111 111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 1111111 4444444444444444 1111111 11111111 11111111111 11111111111 111111111 111111 1111 11111 1111111 11111111111111 555555555555555555555 1111 2222222222222222222 111 111111 1111111 22222222222222 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333 222222222222222 333333333333333333333333333333333 111
lowQualScore : 111 1 000000 777 4 666666666666 1 1 333333333 6666 888888888888 777 1 3 0 777 4 3 666 3 44 55555 444444444 777777 33 5 111111111111111111111111111111 33 444 111111 555 333333 555 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 1 3 888888 6666 44 3 555 0 0000000 3 1111111111111111 2 0000000 666 8888 55555555 55555555555 0 4 9999 2 1 0 2 33333333333 2 2 2 2 77777 000000000 444 1 2 777777 5555 000000 444 2 6666 66666 2 3 33 88888888 11111 0000000 888888 3 555 44444444444444 44 66 333333 9999 2 1 222222222222222222222 1 888 888 0000 4 999 9999999999999999999 777 555 11 4 111111 1 3333333 11111111111111 1 555555 2 666666 555 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222 3 555 6666 888888 555 888888 888888 222222222222222 3 444 0 777777 2 2 2 66 2 000000000000000000000000000000000 2 33 5 555 555 000 1 6666 3 3 3 3 44 1 1 5
lowQualScore : ... . ...... ... . ............ . . ......... .... ............ ... . . . ... . . ... . .. ..... ......... ...... .. . .............................. .. ... ...... ... ...... ... ... .................................................................. ... . . ...... .... .. . ... . ....... . ................ . ....... ... .... ........ ........... . . .... . . . . ........... . . . . ..... ......... ... . . ...... .... ...... ... . .... ..... . . .. ........ ..... ....... ...... . ... .............. .. .. ...... .... . . ..................... . ... ... .... . ... ................... ... ... .. . ...... . ....... .............. . ...... . ...... ... . .................................................. . ... .... ...... ... ...... ...... ............... . ... . ...... . . . .. . ................................. . .. . ... ... ... . .... . . . . .. . . .
lowQualScore : 777 0 666666 888 4 111111111111 0 0 000000000 7777 666666666666 000 6 9 9 888 0 6 444 3 66 66666 666666666 777777 77 3 111111111111111111111111111111 22 444 111111 000 222222 000 000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 0 1 888888 4444 22 1 444 4 5555555 3 3333333333333333 2 5555555 444 8888 99999999 66666666666 7 0 6666 7 8 4 6 66666666666 1 9 7 7 66666 777777777 444 0 5 222222 3333 666666 444 5 0000 77777 7 6 77 44444444 11111 5555555 888888 1 888 00000000000000 66 11 444444 9999 5 6 000000000000000000000 8 888 888 6666 2 999 9999999999999999999 888 666 77 0 555555 0 0000000 11111111111111 0 222222 0 111111 888 8 66666666666666666666666666666666666666666666666666 8 444 1111 222222 000 222222 222222 444444444444444 1 444 1 222222 4 4 5 99 5 000000000000000000000000000000000 7 99 1 000 000 000 0 5555 8 1 1 1 66 5 0 7
consensus : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAG------TAGTAGAA---GT-AGT------AGC---AGNAGTAGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGT---------AGTA---GTA------------GT---AGTTTCAGCAG---CAGTAG-TA-GTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--T-AGTAGTA---GT--A------AG---A--AGTA---GTAGCAGTAGCAGTA------GT---AG------TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TA----GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTA--GTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGTAGCA-GTA------GCN---GTA--GCA-GTAGTA---GTAGTAGTA-----GNAG-TACT----G-T-GT----AGTAGTAGCAGT---A---GTAG---TAGTAN---TAGTNGCAGTAGTAGAAGTAGT----ATG-ATAGTAGCAG-TAGT---AGTAGTAGTAGCAGCGGTAGTAGTAGTAG-----------CAGTA-GT-A-G---TAGTAGTAGTTGT---------AG---TAGAA-GTAGT------AGT----AG------TAGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---NA-----GT-AGNTGT--TG-T------AGTAG-----TAGTAGTA---G---TAGTAG------TA-ATG--GTA----TT--A-TAA-CAGT--AGTAGT--AGTAGTAGTAGAAGT---AGTAGTAGTGG--T-A-TGG-TGGT-GT--AAGTAGTAG---TA---GTTGTAGTGGTA----GTAGTAGNAGTAGTANTGG------TA-GCGA--TTGT---AGT---ATAA-GT------ANAAGTAGT-------AG---CA---------GTAGTAGTAGNAGCAATAGCG----GCAGTAG-TAG--TG---GCGGT-GTTG--G-CG-GT---------------A---GCGGT------------AGCGG---TGGTG----GTG------GT---GG------TAGTG------GTA--------G------TAGTGG---TGGCG------GTAGTAGCGGTGGT-AGT-GGTA--GT-AGTA------GT---G------GTA-----G------TAGTAGTAG-TAGTG--GCGG---TA---GT---AGTNG----TNGT-AGT-G-G--TTGTGGTAGCA-GTAGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAG------TAGTAGAA---GT-AGT------AGC---AGNAGTAGCAGTAGTAGTAGTAGTNGTAGT---------AGTA---GTA------------GT---AGTTTCAGCAG---CAGTAG-TA-GTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--T-AGTAGTA---GT--A------AG---A--AGTA---GTAGCAGTAGCAGTA------GT---AG------TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TA----GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTA--GTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGTAGCA-GTA------GCN---GTA--GCA-GTAGTA---GTAGTAGTA-----GNAG-TANT----G-T-GT----AGTAGTAGCAGT---A---GTAG---TAGTAN---TAGTGGCAGTGGTAGAAGTAGT----ATG-ATAGTAGCAG-TAGT---AGTAGTAGTAGCAGTGGTAGTAGTAGTAG-----------CAGTA-GT-A-G---TAGTAGTAGTTGT---------AG---TAGNA-GTAGT------AGT----AG------TAGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---CA-----GT-AGNTGT--TG-T------AGTAG-----TAGTAGTA---G---TAGTAG------TA-ATG--GTA----TT--A-TAA-CAGT--AGTAGT--AGTAGTAGTAGAAGT---AGTGGTAGTGG--T-A-TGG-TGGTAGT--AAGTAGTAG---TA---GTTGTAGTGGTA----GTGGTAGCAGTAGTAGTGG------TA-GCGA--TTGT---AGT---ATAA-GT------ANAAGTAGT-------AG---CA---------GTAGTAGTAGNAGTAATAGCG----GCAGTAG-TAG--TG---GCGGT-GTCG--G-CG-GT---------------A---GCGGT------------AGCGG---TGGTG----GTG------GT---GG------TAGTG------GTA--------G------TAGTGG---TGGCG------GTAGTAGCGGTAGT-AGT-GGTA--GT-AGTA------GT---G------GTA-----G------TAGTAGTAG-TAGTG--GCGG---TA---GT---AGTNG----TTGT-AGT-G-G--TTGTNGTAGCA-GTAGCTTTA
gi|1 : TAT---ATT---ATAACAT------TAAATTAGT-------AGCAACA---------GCAGTAGTAGAAGCAGCAGCGAAACACAGTAG-AAG--TA---GCAGT----------A-GT---------------A---GCAGA------------AGAGG---TAG-GAAAAGTA------TT---TG------CAACA------GAA--------A------TAGTAG---TAGC---------AGCAGCTGAAGT-AGT-TGTA--AT-ATCA------GC---A------GCA-----GAAA---TAGTAGTAG-TAGCA--ACAGAAATA---GT---AGCAA----CAGA-AGT-A-G--TTATAGTAGCA-GCAGC
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattaAGTAGAAGT---AGCAGTAGTAGCAGAAGAGGTAGGAAAA---GT-ATT------TGC---AACAGAAATAGTAGTAGCAGCAGCTGAAGT---------AGTT---GTA------------AT---A---TCAGCAG---CAGAAA-TA-GTA---GT-A--GTAGC--A--A---CAGAAATAGTAGCAACAGAAG--TAGTTA--T-AGTAGCA---GC--AGC----AG---A--AGCA---GTAGCCGTAGCAGCA------GC---AG------GAGTAGCCATAGTAGCAGAA---GCA---GTCGATGTTTTG----TT----GT------------T-A----T---------------T---GTACT----TTATTGCTGTTGTTATAGTAGTAGTA-CTA------GTA---GAA--GAA-GTAGTA---GCAGCAGCA-----AAAT-TACT----A---GC----AATATCAGCAGTTAAA---GTAG---TAGTTG---TAGTTACAGCAATAAAAATAGA----ATA-A--GTATCTT-CAGC---AAAAGTAGTAGCAGTGGTAGTTTCATCAG-----------CATTA-AT-A-G---AAATAGTAGCAGC---------AG---CAAAA-GAAGT------CGT----AG------TAGTA---GCACCA-ATAGTAGTAGTAGAT-CA-----GCGAAAT-T--TA-T------AGTNN-----NNNNNNNN---N---NNNNNN------NN-NNN--NNN----NN--N-NNN-NNNN--NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN--N-N-NNN-NNNNNNN--NNNNNNNNN---NN---NNNNNNNNNNNNNACTGTCACAGCAGCAGTA----------TA---------AT---AGT---ATAA-GT------ACAAGAAGT-------AG---CA---------GCCGCAGCNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNN-NNN--NN---NNNNN-NNNN--N-NN-NN---------------N---NNNNN------------NNNNN---NNNNN----NNN------NN---NN------NNNNN------NNNNNNNNNNTG------TTGTTG---TGGTG------ATAGTAGTAGTAAT-AGA-AGTA--GT-AGTG------GT---G------TTT-----G------AAATAGTAA-TAGTG--GTAT---TA---ATATAAATAG----TAGT-AGTAG-A--ACATGG-AGCA-GTAGTTTTAagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacTACTAGTAGAAG------AAGTAGTAGCAG------CAGCAAAA---TT-ACT------AGC---AATATCAGCAGTTAAAGTAGTAGTTGTAGTTAC------AGCA---ATAAAAATAGAATAAGT---ATCTTCAGCAA---AAGTAG-TA-GCA---GT-G--GTAGT--TTCA---T-----CAGCATTA------A--TAGA-AA-T-AGTAGCA---GC--AGCAAA-AG---A--AGTC---GTAGTAGTAGCACCA------AT---AG------TAGTAG---TAG-ATCAGC----GAA---AT--------T------------TA-T-------AGT-N----N---------------N---NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN------NNN---NNN--NNN-NNNNNN---NNNNNNNNN-----NNNN-NNNN----N-N-NN----NNNNNNNNNNNN---N---NNNN---NNNNNN---NNNNNACTGTCACAGCAGCAGT----ATA-ATAGTATAAG-TACA---AGAAGTAGCAGCCGCAGCNNNNNNNNNNN-----------NNNNN-NN-N-N---NNNNNNNNNNNNN---------NN---NNNNN-NNNNN------NNN----NN------NNNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNN---NN-----NT--GTTGT--TG-TGGTGATAGTAG-----TAGTAATA---G---AAGTAG------TA-GTG--GTG----TTTGA--AA-TAGT--AATAGT--GGTATTAATATAAAT---AGTAGTAGTAGAAC-A-TGG--------------AGCAG---TA---GTTTTAGTAATA----TTAGTAGTTGTAGTATTAG------TA-GCAA--TTGT---CGTTGTACAA-GTTTTCGTATAAATATTTTTTTTTAG----A---------GTAGTAGTAACAGTAAAAGAA----GAAGTAG-T-------------T-AT-A--A-CA-GC---------------A---GCAGT------------AGTAG---TAGTA----ATA------TT---AT------TATTA------GTA--------G------TAATT----TAATA------GTAGTAGAAGTTGT-TGTTGATATGGT-TGTT------GT---T------GTA-----A------TAGTAGTAG-AAGTG--GTGG---TA---GT---Agtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagAGCA------G--CAGT-A--T-AATAGTATAAGT--ACA----AG---A--AGTA---GCAGCCGCAGCNNNN------NN---NN------NNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNN---NN--------NN----NN----NNN-N-------NNN-N----N---------------N---NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTT------GTT---GTG--GTG-ATAGTA---GTAGTAATA-----GAAG-TAGTAGTGG-T-GTTTGAAATAGTAATAGT---G---GTAT---TAATAT---AAATAGTAGTAGTAGAA----C----ATG-G----AGCAG-TAGTTTTAGTAATATTAGTAGTTGTAGTATTAGTAG-----------CAATT-GT-C-G---TTGTACAAGTTTT---------CG---TATAA-ATATT------TTTTTTTAG-------AGTA---GTAGTA-ACAGTAAAAGAAG---AA-----GT-AG---T--TA-T------AACAG-----CAGCAGTA---G---TAGTAG------TA-ATA--TTA----TT--A-T---TAGT--AGTAATTTAATAGTAGTAGAAGT---TGTTGT--TGA--T-A-TGG-TTGTTGT--T-GTAATAG---TA---GTAGAAGTGGTG----GTAGTAANNNNNNNNNNNN------NN-NNNN--NNNN---NNN---NNNN-NN------NNNNNNNNN-------NN---NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNN-NNN--NN---NNNNN-NNNN--N-NN-NN---------------N---NNNNN------------AGTAA---TGGTA----ATG------TT---GA------TAGTGTTAATCGTA--------GCATAAGTAGTAG---AGGAA------GTAGTGGTAGTAGT-AGT-TGTA--GT-AGAA------GCATAA------GCA-----GAATTTTTTGCATTAG-TAGTT--GCAG---TA---GT---ATGTG----TTGTAAGT-G-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacTGATGGTGGTAGTAG-----------AAGTA-G----G---T-GTAGTAGTTGT---------GT---TAGAA-GTAGTTGGAGAAGT----AG------TAACA---GTAGTG-GTGGTGGTAGTAG---TA-----GT--GATGA--TGAT------GGTGGAGATATAGTGGTA---G---TAGTAG------AA-GTA--GTA--------A-TAG-TAGT--AGTGGT--GGTGGTAATAGTCGT---AGTAATTGTGG--C-GGTGG-TGGTAGT--A-GTAGTAG---TGTTGGTTGCGGTTGTA----GTGGTGATGATGATTANNN------NN-NNNN--NNNN---NNN---NNNN-NN------NNNNNNNNN-------NN---NN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG----GTGGTGG-TGG--TGCAGGTGGT-GATA--G-TA-GT---------------A---GTGGG------------AGTGG---TGGTG----GTG------GT---GGAAATAATAGTA------GTA--------G------AAGAAG---TAGTAAATATAGTAGTAGCAGTAGA-AGT-GGTT--GT-GGTGGGT---GT---G------GTA-----T------TAtgcgtattgtattagagg
gi|12 : GTGGTA----TTTGTAAAACTGGTACTGG------TA-CTGA--TTGTGTTAGTGCCATAG-GT------ATAAGTAGT-------AG---TG---------GTAGTGGTAGCAGTAATTATG----ACAGTGGATGGGATG---GTGGTAGTCG--G-TG-GTAGTGTTGATGTTGGTA---GTGGTGTAAATGCTGATAGCGG---TAGTG----GTG------GTTGGGG------CGTTG------GTG--------T------TAGCAG---TGGAA------GTGTTGATGTTGGT-AGT-GGT---GTAAATG------TT---G------ATA-----G------CTGTAGTGT-TGGTG--G-GG---TC---TT---TGTTGTTATTTAT-AGT-G-G--TAGTGGTGG
gi|13 : attgctt--A-TAA-CATG--ATTAGT--AATAATAG-AGATGT---ACTAGTAGTTG--T-A---G-TGA------AAGTGGTAGCGTTA---GTTGTAATGGAA----ATGGTAG---TAGCAGTGGAACACATAAGGGAATTTGT---AGT---A----GT------ACATATAGT-------GG---TA---------GTGATAGTGGTAGCAGTAGTT----GTAATGG-AAA--TG---GAAGT-G--G--GACACGT---------------A---AGGGA------------ATTGG---TAGTA----GTATATACAGT---GG------TAGTG------A-A----------------AGGGG---TAGCG------GTAGTTGTAATGGA-AAT-GGTA--GT-GGTT------GT---GAAACATGTA-----AGGGAATTGGTAGTAGTTAATGCAGTGG---TA---GT---GATAA----TGGT-AGC-G-G--TAGTTGTAgggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aaca-------AGT-A----T--------------------CATTATTGTTGTAAT--TATCATCATTATTACTA-TTA------TCT---ATA--CCG-ATAGTATTTGTTATATTA-----GAGT-TGTT----G-TTGT----ACTAGTAG-AG--------GTAG---TAGTAT---TAGT--------T-GAAGTAGT----A---AT-GTAGCAG-CAGT---AGTATTAGTTGTAGTAGTAAT-GTAGTAG-----------CAGTA-AT-A-G---TAGTTGTTGTTGT---------AAGATCAGCA-GTAGT------GGT----GGCGATTCTAGTA---GTAGAA-GTAGTAATGGTAA---AA-----GT-AGATGG--AG-T------AGTAG-----TATTAGTA---G---TGGTatg
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgatGTAGTAGCA-GTATATAATGTA---ATG--ACATGT--TA---GTAATAAAA-----AAAGATATA----T-T-GT----TGTAGTAACAGT---A---GTTG---TCATAG---TAGTTGTAGTAGTA-AAGTAGT----A---GTAATAGAAG-TAGT---AGT--TAA-AGTTGTGGTTGTGGTAGTAG-----------TAGTATGT-A-----TAATAATGATTAT---------GA---TTGAA-GTAGT------AGT----AG------TAGTA---GAAGTA-GTATTA-----------A-----AT-AAATAT--TG-G------A-TA---------TAATA---C---TAGTAG------TATAT---GTAG---TC--A-TAT-CAGT--AAT
gi|18 : gtagtagatgtagttgctgttgtttttTAGTAGTAGTTGT---AACGGTAGTGATAGATG---TAGTGGAA---GTTAAT------A-T---GGTACTTGCAGTGGTAGTGGTAACAGTAAT---------GATAATTGTA------------GT---GGCTATGGCAG---AGGTAGATGTGTA---AT-T--GTAGT--G--G---C-----CAGTTGTA------G--TGAT-AA-T-TGTTGT----GT--A------AGCGGA--CGTG---GTAGTGGTTGCTGTACGATTTGT---AGCGGTCATGGAAG---TGGTAACTGTA---GTG---GTGG------TG----TATGTTGTA-TT------GGTGA----T---------------A---GCAGTG--GT
gi|19 : tgtgatggttg-A--GT-GT--T--A---TGTT--TAGTATTA------T--CATT-A--TCATTATTA---TT--A-------G---A--AGTA---GACAAAGTAGCAATA------GT---AG------TATCAT---AAGTAGCATCA---GTA---GA--------TG----TA----GTA-A-------TG--A----T---------------A---GAAGTG--GGAGTAGCAGTAGTAACAGCAGTAGCC-AAA------GCA---GTA--GCA-GTGGTA---GTATCAGAA-----GCAG-TAT----------C----AATAGTGACAGT---AGATGCAG---TAGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatcGTAGTAGAAG-----------CATTA-GC-AAG---T--TAGTAATTGT---------GG---TAGTATGT----------GT----TG------TA--A---GT-GTACGTATT-GTAGTAG---AA-----GT-AATCTT--TG-T------AGTAG-----CAGAAATA---G---TTGTAG------TA-Aa
gi|20 : tt-GT------AGAAGTAAT-------AG---TA----------TAGTAGTAGTAGCAATAGT-------AGTAA-AAG--TG---ACGGT-GGTG--A-TA-GT---------------A---GTAGT------------AGAAGAAATGGTG----GTG------GT---GG------TGGTA------GTA--------G------TAGTAG---TGGTG------ATGGTAACAGTAGA-AGT-AGTA--GT-AGTAATAACGGT---G------GTGATATTG------TAGTAGTAG-TAGTA--ACGG---TG---GTACAAGAAG----TAGT-AGT-G-GAATGGTGGTGGaatcaaatattttaactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : ggtggtggtg---------------A---GCAGT---GTATCATTAATAGCAACAGTA-TAG---ATA------GTT---GTA--GCA-GAAGTA---GTAGTAGAA-----ATAA-TACT--------------ACTACTAGTAGT---A---GTAA---TAGTAA---TAAT---AATAATAACAATAAT----ATA-ACAACATTAG-TAGA---AGTATTAATA
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaTAA-TTG--TG---GCGGT-GTTAATG-TG-GT---------------ACATGCGGT---------------TG---TGATG----GAG------AT---GG------TAGTG------TAA--------A------TGGTGG---TGGTG------GTAGTAGCGGTGGT-GGT-GGTG--GT-A--A------AC---A------TTA---------------TGGTGG-TAGTG--ACGA---AC---GT---CGTCG----TCGT-GGT-T-A--TTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAttaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : ttgagtaggtggtgt---TGACG------GTATT----GTAATTATT-TGAA--AT-AGTATGATT-GT---G------GCA-----G------TAGTAGTAG-TAGTA--GGAG---TA---GT---AGACG----GAGT-AGT-G-A--CGGTGATAGCA-acggtggttgttattgcggcggtggtgat
gi|23 : GAAATAGT----ATG-ATTGTGGCAG-TAGT---AGTAGTAGTAGGAGTAGTAGACGGAGTAG-----------TGACG-GT-G-A---TAGCAGAAAATGG---------AG---TAAAA-GCAGA------AAC----AC------CAGCA---GCAGTA-GTAGTAATAGTGA---AA-----GT-AAA-GG--TA-T------A--AG-----TATTAGTAAACA---TAGCA-------TA-ATG--aaaatggagtaaaagcagaaacaccagcagcagtagtagtaatagtgaaagtaaaggtataagtattagtaaacatagcataatgaaggtg
gi|25 : tgacggtattgtaattattt-A-G---AAATAATGGTTGT---------GG---TGGTG-ATGAT------GAT----GG------TGATG---GTGGTG-GTGGTGGTAATAAAATTA-----GT-AGTGGT--GG-G------CGTGG-----TAGTAGAA---G---TAGTAGTTGTATTA-GTA--GTA----CT--AGTAA-CAGT--AATATT--AGTAGTAGTAGCAGTTAAAGTAATAGTGG--TGA-TGG-TGGTGGT---AGTATTAG---CA---Gaaggtg
gi|25 : GTGGTGGTGG------TAATAAAATTAGT-AGT------GGT---GGGCGTGGTAGTAGAAGTAGTAGTTGTATT---------AGTA---GTA------------CT---AGTAACAGTAA---TATTAG-TA-GTA---GT-A--GCAGT--T--A---------AAGTAATA------G--TGGTGA--T-GGTGGTG---GT-----------------AGTA---TTAGCAGAAGaag
gi|27 : agaaataatggttgtggtggtgatgatgatggtgatggtgGTTGTTGTATAAGTAA-----------TAGTA-GTGA-G-----GTAGTAGTTGTTTCTGAATGAG---TAGCA-GTAGT------AGT----AGAT----TGGTAATTGTGGTT-GTAGCCGTAGTAT---AA-----GT-AGACGTGATG-T------AGTATAT---TAATAGTA---G---TAGTAG------TA-ATGATGCA----TT--A-CAAGCAGT--
gi|28 : tatt--AGCA---ATCGCAATCGCAATC------AT---AG------TCACAG---TCGTAGCAGTA---GTT---GC--------TG----TA----G---A-------AGT-A----TCATCAGCATAACATTA---GCAACA--TTAGCAGAAGAAGCAACAACATCAGCA-GTA------GCA---GTA--GCT-GCAACA---GTAGTAATA-----GAAG-T
gi|29 : agcatcGATA----GTG------GT---GG------TAGTG------ATA--------A------TGGTGG---TGGTG------ATAGTGACGGAGAT-GGT-GGTGTTGT-AATT------GT---G------GTG-----G------TAGTGACAA-TGGTA--GTGG---TATGTGT---AGTGG----TTGT-GGT-GTG--TT-TGATAGTG-GTA
gi|3 : ATAGTAGTATAAGTCATAATAGTAGTAATAA------TAGTAGAA---GT-AGA------AGC---AGCAGCAGCTGTAGCAGTGGTAGTAGTGGT---------AGTA---ATA------------GT---GATGTCATTATTATCAGTAG-TA-GTA---AT-ATTATAAT--C--A---T-----TGGTGGTA------G--TAGT-A--TGAATAGTA---GCCAA------AG---A--AAAA---GTAGCTGTAGCAGTA------GT---AG------TAGCAA---CAGTAGCAGCA---GCA---AT--------TG----TA----GTATA-------AGTTA----T---------------A---AAAGTA--GTAATAATAGCAGAAATAATAGCAGCA-GCA------GCT---GTT--GCA-GTAGTA---GTAGTGGTA-----GTAG-TACT----GAT-GTC---ATTATTATCAGT---A---GTAG---TAATAT---TATTAGCATTGGTGGAAGTAGT----ATGGATAGTAACAG-AAGT---AAAAGTAGTTGAAGCAATAGTAGTAGTAG-----------CAACA-GT-A-G---CAGCAGTAATTGT---------AG---TATAA-GTAAT------AAT----AG------TAGTA---ATACTA-GTAGAAGTAGTAG---CA-----GC-AGCTGC--TG-T------AGCAG-----TAGTGGTA---G---TAGTAG------TG-ATG--TCA----TT--A-TAATCAGT--AGTAGT--AATATTATTATCAGT---GGTGGTAGTAG--T-A-TGGATAGTAGCCAAAGAAAAAG---TA---GTTGTAGCAGTA----GTAGTAGCAACAGTAGCAG------CA-GCAA--TTGT---AGT---ATAA-GT------AAAAATAGA-------AG---CA---------ATAGAAGTAGAAGTAATAGCA----GCAGTAG-TAA--TG---GCGGT-GTCG--G-CG-GT---------------G---GCGAT------------AGCGG---CAGTG----ACA------GT---AA------TAGTA------GCA--------G------AAACAG---TAACG------CTATCAGCAATAAT-AGT-GAAA--GT-AGCA------GC---A------GCA-----A------TAATAGTAG-TAGTT--GTAG---TC---GT---AGATG----CTGT-AGT-A-G--TTGTTGTAGTA-GTTACTTTAatgctggtggtggtggt
gi|31 : AAT--T--A---T-----TAATAATA------AAATAAT-A--T-AATA-TA---AT--A------AA---ATCAATACAGGCACCAGTAACAGTA------GT---AG------AAGC------AGCAGCAGAA---GTA---AT--------AA----TA----GTA-------------A----T---------------A---GCAGAC--GTAGTAGTAATAGACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : ga-----------CAGTA-AC-A-G---TAGTAGAAGCAGC---------AG---CAGAA-GTAAT------AAT----AG------TAATA---GCAGAC-GTAGTAGTAATAGA--CATAGACGT-AGATGT--atgta
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacAGTAACAG------TAGTAGAA---GC-AGC------AGC---AGAAGTAATAATAGTAATAGCAGACGTAGT---------AGTA---ATA------------Ga
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccGCA---GTATGAGT--------TGATTTTA----CTT-A-------AGTTA----T---------------AAAAGCAGTG--GTAGTAGCAGTAGTACCAGTAGTAACT-GTA------GCA---ATA--TCA-GTAGCA---ATAGCAATA-----CCGG-TGCT----G-CAAC----AGTAATATCATT---A---TTAT---TAacatagacgtagatgta
gi|34 : tatGTTGAAAT---AATAATAGTTATTG------TAGTACAA---GT-AGTTATTATAGTCATAAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGAAGTTTTGGTTGAAGTA---GTA------------GT---TGTTt
gi|35 : tagttgttgcagtagttgttactAGTAG-AA-GTA---GTTA--ATA-T--T--A---T-----TATTAAAA------G--TA-T-AATT-AGTAGAA---AT--AGAAAAAAG---A--AGTA---GTGGATATAGCAATA------GT---AG------CAGCAG---TAg
gi|35 : aaA-GTA---GA-A--GTAGT--T--AATAT-----TATTATTA------A--AAGT-A--T-AAT--TA---GT--A-------G---A--AATA---GAAAAA--AGAAGTA------GT---GGATA---TAGCAA---TAGTAGCAGCA---GTA----T--------TG----TT----ATT-ATT-----ATT-A----T---------------A---AC--TA--GTAGAAATAttgttattattattataactagtagaaata
gi|36 : aaAGTATTACTAGTAGTAGT---------AGTA---ATA------------GTAAAAGTT------G---TAGTAG-TA-TTA---AT-A--ATAAC--C--C---T-----TAGTAATA------G--TAAC-ACTT-AGTAGTA---G---A------AG---A--AG
gi|37 : aaaaaagttgAGCATTAGA-AGT-GTTG--GT-ACTA------GT---A------GCA-----A------TAATGGTAG-CCGTG--GTGG---TA---GT---AGTTG----TTAT-TTT-G-G--TTGTTGTatgttataaca
gi|38 : gttatcgttatcatc-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--A-AATAAGA---AT--A------AG---T--ATTG---GTGACAGTAGCAACA------TC---AC------TAGCGG---TATTATCAGTA---GTG---GT--------GG----Ttattgtac
gi|39 : gA--------A------TAGTGG---TAATA------GTATGAGAGGTGGT-TGT-GGTA--GT-AGTA------GT------------A-----G------TAGTAGAGA-TGGTG--GAGG---TA---GT---AGTTG----TTGT-GGT-G-G--TTGTCGTAGCA-GTtacaacaacagaagaag
gi|40 : G---TAAAA-GTAGT------ATT----AA------TAGTT---GTTGTG-GTATTAGTAATAG---TA-----GG-AGTTGT--TA-C------AGTAG-----TTGTAGTT---GACACAGTAG------T--------TG----TT--G-TAG-TAGT--AGTA
gi|41 : --AGCA---GCGGCAGCGGCAGTA------GC---AG------TAGTAG---TAGTAGCGGCA---ATA----T--------CGA---TG----GTA-A-------A-T-A----T---------------A---ATGAT---GCAGTAGTAGT-GAAATAATA
gi|42 : cA---GAA------------GT---ACTTCGAGTAG---CAGTAG-TA-GTA---GT-T--GTAGTAGT--A---T-----CAGTAGCA------A--TAGT-A--C-AAT-GTA---GC--A------A----A--ATCA---GTAGCAGTA
gi|43 : aGG---TGGTG----GTG------GT---GG------TTATG------GTA--------G------TTGTGG---TTACG------GTGGTTACGGTGGT-GGT-GGTA--GT-AGAA------GT---A------GTA-----G------CAGTAGTAG-TA
gi|44 : AG--TG---GC--T--TTG--G-CG-GT---------------G---ACGAT------------GGCGA---TGGTG----GTG------GT---GG------TGGTG------GTGAC------A------TATT-----TAGCG------GTAGTAACAGTGGT-AG
gi|45 : acT---GAAAGTAGTAATAG------TAGTAGAA---AT-AGT------AGT---AGAAACAGTAGCAGTGATAGAAGTGG
gi|46 : caGTTGTAA-----------CA-TA-GT-A-G---CAATTGTAGTTGT---------AG---TAGT--GCAGT------GGT----AG------TAATA---GCAGTA-Gataagaata
gi|47 : AGCAGTAGTCGCAACAGTAGTCCCA-GTA------GTA---GTA--GCA-GCAATA---GCAGTA
gi|5 : AGTA--GTAGAAATAATAGTAATAATAGTAGTG-GTG------GTG---GTATGGTA-GTACTT---GTAATATTA------TGG-TGGT----G---GT----AGTAGTAGTAGT---T---GTAG---TAGTAG---TGATGATGGTGTTAGAAGTAGTCGAGGTG-GTGGTGATGA-TAAT---GATGGTGGTGGTAGTGGTAGTAGTAATAGAGGTNNNNNNNNNNTA-AT-A-GAGGTAGTAGTAGTATT---------GA---TAGAA-GTAGC------AGT----AG------TAGTG---GTGGTA-GTTATAGTATTAG---TA-----AT-GGTTGT--GG-A------AGAAG-----TATAAGTG---T---TGGTGA------TT-GTG--GTG----TT--A-------GTTTAGTAGT--AGTAGTAAT-----T----GTGGCAGTGG--T-----------------AGAAGTAG---TA---ATGGTAGTGGTA----GCAATAGAAGTAGCGAT--------TG-GTGA--TTTA---AGT---AT-A-GT------AGAAGTAGT-------AG---TATAATTGGTTGTGGTAGTAGTAGTAATAGTA----GTATTAT-TAG--TA---GTGGT-AGTG--G-CA-GT---------------A---GTTGT------------TGTGG---TGGCG----GTG------AT---AG------AAGTA------CTA--------A------TGGTGGTGTTGGCT------GTGGTAGTAGTAGT-AGT-GGTG--GT-GCTG------GT---G------TTA-----G------TA-TAGTAG-TATTA--GTGT---TG---GT---GGTGG----TGGT-GGT-G-G--cca
gi|7 : atTAG------TAGTAAAA---GG-AGT------AA------AAGTAGCAGTAGAAGAAGTAGAAATA-----------AGAA-----A------------AT---AGTTTTTGCAG---CAGTAA--A---A---GT-A--TCACT--T--A---T------AGCAGCA------G--AAGC----------GTA---AT--A------AG---A--AGTA---CTGACAGAAGCAAAA------GTTGAAG------AAGCAG---CAGCAGTCGCAAACGTT---GT--------TG----TA----GCA-ACATCAGAAGT-AGAAAC---------------A---GTAGTA--GTAGCAGTAGCAGAAAAAGTGATAGCA-CCA------GCTTAAGTA--GCA-GTCGTA---ATAGTAGTAACAGAGAAG-CAGA----A---GT----AGCAGTAGCAGC---A---GCAGACACAGTAAAAGTAGTAGCAGAAATAGAAGTAGT----AT---TAGCAGCAGATAA----AGTAGTTGTAGCATCAGCTGAAGAAGAAG-----------CAGTA-GT-A-G---CA---------GC---------AG---CAGCA-GTAGT------AGT----AG------TAGCA---GCAGAA-GTAGTAGTAATCG---CA-----GC-AGCTGA--AA-T------AGTAG-----CAGCAGAAAACG---TAGTTG------CA-ATG--GTAACATTT--A-TTA-CTGT--AGAAAT--AACAGCAAGGGAAGT---A
gi|9 : GTAGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGT---------ACTA---GTA------------AA---AGTTTCAGAAG---CAGCAG-CA-GTATACAT-A--ATAGT--T--A---T-----T-GTAGTA------G--TAGT-A--C-TG----------------------------GTT---GTAGCTGCAGCAATAT-----GT----G------TAGCAG---TATTAGAAGCA---
blockSeqs : CAT A ATG TTA T TATTATAGTCAT T T TTTGGTTGA ATTG AAAATAGAATAA AAA T T TAT A T TAC T TT TTC TGTT . AA G ATTAGTAGAAATAGAAAAAAG TC CAG CGATTT TGA CGGTCA . AAC GCTGTAGAAGTATCATCAGCATAACATTA ATT N T TATAAT TTAA TG T TTT ACAGAGA A GTAGTGGTGTTTGA N AGAT ACA AAAG NACTGTCA CGAGGTGGTG A TTTT C A N AGGTNNNNNNN N T G A AGGTA TTCTGAATG GAT N T TGGAGA TTTT CGATTC ATT C AATT TAGAC . T GA TGGTGAT AGATA AACA TTGTAT T GAT ACATTTATTA TT TT ATATAA TAAA A A TATGGATAGTAGCCAAA T CGT TTG . A TTG GTGGAACACATAAGGGAAT GTT TGT TA . TTTCGT C TTTTTTT TATAATTGGTT N NN N ATGGGA CAG AGTCGGTGGTAGTGTTGATGTTGGTAGTGGTGTAAATGCTGAT N AAA . TATACA TGG AAATAA TTAATC NNNNNNNTG T TGT AATATA A T T TG A GTGAAACATGTAAGGGAAT T CA T . TGT ATA A TTAT A A A T AA C G G
blockSeqs : . C . . . AGC T A TAC A . . G A . . . . . . AGT ATAT . . . ATAGTAGCAGCAGCAAAAG . . T . ATA . . TGAGTTGATTTTACTTAAGTTATAAAA N N . . N . . . NN . CTGATGTC A N . N AGTAGTAG ATGGATA . A T T A . A . . . NN . . A . . . AT . . AC . . A . AT AT GACA . . G TTTGAAA . . GTAGAA A T T CGGTGGTGGTAGTA T . . . A NNN TTAGTAGCAA . GCC CA . . T . CA C AA A NNN . GTTAATGTGGTACATGCGGT T . . . . . . GCATAAG T . . A . . TT . ATAACGGTGGTGATATTG . . T . . ACA T . T . . . . A G .
blockSeqs : . T . . . GGT G T . G . . G A . . . . . . G T . . . TAATAGTATAAGTACAAG . . . . . . . GTTGTAGCAACATCAGAAGTAGAAACA N C . . T . . . GA . TTGTTGT C G . T TGTAGTAG ATAATA . T T G G . G . . . TT . . A . . . . . . N . . A . T . AACG . . A GTCATAT . . ATAGTC T A A TGATGGTGGTGGTA T . . . G TGA NNNNNNNNNN . . NN . . N . NN N NN N NNN . NNNNNNNNNNNNNNN T . . . . . . ACA A . . A . . . . GCATAAGCAGAATTTT . . C . . . T . T . . . . A T .
blockSeqs : . T . . . AGC C A . A . . A T . . . . . . T C . . . ATTGTTGTGTAAGCGG . . . . . . . GTGGTGTATGTTGTATTGGTGATA G T . . T . . . GA . CTGCAAC G A . T AGCATTGG ATAACA . T T A G . G . . . TA . . C . . . . . . A . . A . T . G . . A CTAGTAA . . GTAGCA A A A TATGGTTGTTGTT T . . . T AAC ANNNNNNNNN . . NN . . N . NN N NG T TGG . NNNNNNNNNNNNNNN T . . . . . . G A . . A . . . . TGATTGTGGCAG . . T . . . A . G . . . . G G .
blockSeqs : . A . . . AGC A C . A . . G C . . . . . . T T . . . TGAATAGTAGCCAAAG . . . . . . . ATTGTAGTATAAGTTATA G C . . A . . . AA . NNNNNN A A . G GATGGTGT ATGATT . A G G A . G . . . TA . . A . . . . . . T . . T . G . G . . G TTACAAG . . TTATCA A A A TAGTGAAA A . . . G CAA CTGGTACTGA . . TA . . T . TG C TG C AAA . GATAGTAGTAGTGGG C . . . . . . G A . . G . . . . GGTGTGGTAT . . C . . . A . A . . . . T G .
blockSeqs : . . . AGT G A . G . . G T . . . . . . C T . . . CTTAGTAGTAGAAG . . . . . . . TTGTTATTATTATTATA A C . . A . . . GC . TATTGT C A . A AGCAGAAA ATGG . T A A C . T . . . TA . . T . . . . . . A . . A . T . G . . A TTATAAT . . AGGGAA G G A AACATGG A . . . A AAG GCAGCAGCAA . . TA . . C . TA T TT T AAG . GGGACACGTAAGGGA T . . . . . . T G . . A . . . . GTGTTTG . . C . . . C . C . . . . G G .
blockSeqs : . . . AT A A . A . . C T . . . . . . T T . . . TCATTATTATTAG . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNN A A . . T . . . AT . GTGGT T A . T AATAA AGTA . T T T A . A . . . AA . . A . . . . . . A . . T . T . G . . G TTGTAG . . GAGAT A G . TA . . . . A . ATTGGTGA . . T . . G . TA T CA C TTG . GGTGATAGTAGTAGT A . . . . . . G A . . A . . . . GTTGTAA . . G . . . C . A . . . . T G
blockSeqs : . . . AA A G . G . . G . . . . . . . T T . . . AAATAAGAATAAG . . . . . . . GATGTAGTAATGATA C A . . A . . . GA . GAAGT G T . G . ATTA . T C A A . G . . . CA . . T . . . . . . A . . A . G . C . . G TTAT . . AT . . . . . . A . CA A TA T TAA . GTCGGCGGTGGCGAT C . . . . . . A G . . G . . . . TTGATAG . . T . . . G . T . . . . T T
blockSeqs : A . G . . G . . . . . T T . . . TAATATAATAAA . . . . . . . TCGATGGTAAATATA G T . . T . . . GT . TC G A . AAT . . G A . A . . . TA . . C . . . . . . A . . C . T . G . . G ATAG . . . G . A T T . TAG . AGTGGCAGTAGTTGT C . . . . . . A G . . G . . . . GTGGTGG . . T . . . T . T . . . . T T
blockSeqs : A . . . . . . C T . . . CAATGTAGCAA . . . . . . . ATTTATAGTNNN A A . . A . . . CC . CT G . . A A . G . . . CA . . A . . . . . . C . . A . T . G . . . TTA . T . ATAACAGCAGCAGT T . . . . . . G A . . A . . . . GCAGCAA . . T . . . T . T . . . . T C
blockSeqs : . . T T . . . TGGTGGTGGT . . . . . . . ATAATAGTAATA A C . . A . . . T . . . N . . . CA . . A . . . . . . T . . T . C . G . . . . . TTGGCGGTGACGAT . . . . . . . A G . . A . . . . GTAGCAA . . A . . . T . T . . . .
blockSeqs : T . . . . TAATTAGTAG . . . . . . . A T . . G . . . . G . . . T . . A . . . . . . T . . T . A . G . . . . . . . . G G . . G . . . . GTAGTAG . . T . . . G . G . . .
blockSeqs : . . . GTAATAAG . . . . . . . . A . . . . . T . . T . . . . . . C . . C . T . T . . . . . A G . . G . . . . GTGTTAG . . . . . .
blockSeqs : . . . CTG . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . ACATTA .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . A . . . . GTAG
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ****** T******** ****** TTAGTAGTAGAAG***************** *** A** A****** ATGATA***** N*** TTATAA******** **** NTAGTAGCGA********* TA************ CG**** GGCGGCAGTAGTGGT*********************************** **** GTGGTAG************************** ***
originalCons : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAG------TAGTAGAA---GT-AGT------AGC---AGNAGTAGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGT---------AGTA---GTA------------GT---AGTTTCAGCAG---CAGTAG-TA-GTA---GT-A--GTAGT--T--A---T-----TAGTAGTA------G--TAGT-A--T-AGTAGTA---GT--A------AG---A--AGTA---GTAGCAGTAGCAGTA------GT---AG------TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TA----GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTA--GTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGTAGCA-GTA------GCN---GTA--GCA-GTAGTA---GTAGTAGTA-----GNAG-TACT----G-T-GT----AGTAGTAGCAGT---A---GTAG---TAGTAN---TAGTNGCAGTAGTAGAAGTAGT----ATG-ATAGTAGCAG-TAGT---AGTAGTAGTAGCAGCGGTAGTAGTAGTAG-----------CAGTA-GT-A-G---TAGTAGTAGTTGT---------AG---TAGAA-GTAGT------AGT----AG------TAGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAG---NA-----GT-AGNTGT--TG-T------AGTAG-----TAGTAGTA---G---TAGTAG------TA-ATG--GTA----TT--A-TAA-CAGT--AGTAGT--AGTAGTAGTAGAAGT---AGTAGTAGTGG--T-A-TGG-TGGT-GT--AAGTAGTAG---TA---GTTGTAGTGGTA----GTAGTAGNAGTAGTANTGG------TA-GCGA--TTGT---AGT---ATAA-GT------ANAAGTAGT-------AG---CA---------GTAGTAGTAGNAGCAATAGCG----GCAGTAG-TAG--TG---GCGGT-GTTG--G-CG-GT---------------A---GCGGT------------AGCGG---TGGTG----GTG------GT---GG------TAGTG------GTA--------G------TAGTGG---TGGCG------GTAGTAGCGGTGGT-AGT-GGTA--GT-AGTA------GT---G------GTA-----G------TAGTAGTAG-TAGTG--GCGG---TA---GT---AGTNG----TNGT-AGT-G-G--TTGTGGTAGCA-GTAGCTTTA
finalCons : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAG------TAGTAGAA---GT-AGT------AGC---AGNAGTAGCAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGT---------AGTA---GTA------------GT---AGTTTCAGCAG---CAGTAG-TA-GTA---GT-A--GTAGT--T--AT--------TAGTAGTA------G--TAGT-ATTAGTAGTAGAAG-----------------A--AGTA---GTAGCAGTAGCAGTA------GT---AG------TAGCAG---TAGTAGCAGCA---GTA---GT--------TG----TA----GTA-A-------AGT-A----T---------------A---GCAGTA--GTAGTAGTAGTAGNAACAGTAGTAGCA-GTA------GCN---GTA--GCA-GTAGTA---GTAGTAGTA-----GNAG-TACT----G-T-GT----AGTAGTAGCAGTA------GTAG---TAGTAN---TAGTNGCAGTAGTAGAAGTAGTATGATA-----GTAGCAG-TAGT---AGTAGTAGTAGCAGCGGTAGTAGTAGTAG-----------CAGTA-GT-A-G---TAGTAGTAGTTGT---------AG---TAGAA-GTAGT------AGT----AG------TAGTA---GTAGTA-GTAGTAGTAGTAGN---A-----GT-AGNTGT--TG-T------AGTAG-----TAGTAGTA---G---TAGTAG------TA-ATG--GTATTATAA--------CAGT--AGTAGT--AGTAGTAGTAGAAGT---AGTAGTAGTGG--T-A-TGG-TGGT-GT--AAGTAGTAG---TA---GTTGTAGTGGTA----GTAGTAGNAGTAGTANTAGTAGCGA---------TTGT---AGT---ATAA-GT------ANAAGTAGT-------AGTA------------GTAGTAGTAGNAGCAATAGCG----GCAGTAG-TAG--TG---GCGGTGGCGGCAGTAGTGGT-----------------------------------AGCGG---TGGTG----GTG------GT---GG------TAGTG------GTA--------G------TAGTGG---TGGCG------GTAGTAGCGGTGGT-AGT-GGTA--GT-AGTAGTGGTAG--------------------------TAGTAGTAG-TAGTG--GCGG---TA---GT---AGTNG----TNGT-AGT-G-G--TTGTGGTAGCA-GTAGCTTTA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG
Alignments
lowQualScore : 111111 1111 111111111 11111111111111 1111111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222222 111111111 111111 111111111111 111111111 111111 1111111111111 11111111111111 3333333333333333333333333 222222 1111111 222222222222222 111111 2222222222222 1111111 11111111111 1111111111111111111 111111111 11111111111 11111111 11111111111 1111111 111
lowQualScore : 777 1 000000 2222 1 666666 555 555 555 999999999 555 444 0 777 1 0 666 3 888 99999999999999 55555 4444 33 99999999 555 66666 0 444 444 33 0 444 33 555 555 3333333333333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444 33 0000000000 1 0 6666 555 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 1 5555 0000000000000 555 1 7777 1 444444444 2 3 2 111111 2 2 33 888888 444444444444 55 88 999999999 77 444 8888 99999 0 000000000 444 66 777777 000000 2 444 22 2 33 444 4444 1 777 99999999999999999 33 66666 7777777777777 444 33 33333333333333 0 555 1 999999 33 3 3 6666666666666666666666666 666 000000 555 55 2222222 222222222222222 1 777777 6666666 1111111111111 1 44 0000000 999999 0 44 1 2 3 44444444444 66 44 6666666 888888 9999999999999999999 44 222222222 77777777777 66666 2 444 444 777777 0 22222222 5555 1 22222222222 444 0 8888888888888 444 888 99999999999 3 77 555 2222222 555 000 1 6666 3 3 55 0 1 5
lowQualScore : ... . ...... .... . ...... ... ... ... ......... ... ... . ... . . ... . ... .............. ..... .... .. ........ ... ..... . ... ... .. . ... .. ... ... ............. ........................................................... ... .. .......... . . .... ... ........................................................... . . .... ............. ... . .... . ......... . . . ...... . . .. ...... ............ .. .. ......... .. ... .... ..... . ......... ... .. ...... ...... . ... .. . .. ... .... . ... ................. .. ..... ............. ... .. .............. . ... . ...... .. . . ......................... ... ...... ... .. ....... ............... . ...... ....... ............. . .. ....... ...... . .. . . . ........... .. .. ....... ...... ................... .. ......... ........... ..... . ... ... ...... . ........ .... . ........... ... . ............. ... ... ........... . .. ... ....... ... ... . .... . . .. . . .
lowQualScore : 888 0 555555 3333 0 111111 888 444 888 222222222 888 111 4 000 0 8 444 3 555 66666666666666 77777 6666 99 55555555 444 77777 7 777 777 33 1 777 99 000 000 3333333333333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 22 3333333333 0 5 4444 444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 5 3333 4444444444444 444 0 7777 0 555555555 2 3 3 777777 9 9 99 222222 666666666666 77 77 000000000 33 444 6666 33333 1 777777777 444 44 222222 666666 5 111 00 4 22 222 6666 0 444 55555555555555555 77 77777 7777777777777 777 77 44444444444444 3 444 2 333333 11 3 3 2222222222222222222222222 444 333333 888 00 5555555 111111111111111 1 444444 8888888 7777777777777 0 66 8888888 666666 9 66 0 2 3 77777777777 66 22 2222222 888888 7777777777777777777 22 333333333 44444444444 77777 7 777 777 777777 1 55555555 3333 1 22222222222 777 8 4444444444444 777 333 99999999999 7 33 000 5555555 444 888 0 8888 3 3 00 7 7 7
consensus : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAGTAGTAGAAGTAGT------AGC---AGNAGTA---G--CAGTAG---TAGTAGTA---GTAGT---AGT---------AGT---AGTAGTAGTTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTA------GT-----TAT---TAGTAGTA-G--TA--GT---A-T--TAGTAG---TAG---AAGAAGT---A---GTA-GCAGTAGCAGTAGT---AGTAGCAGTAGTAGCAG--CA---G---TA---GT-C-G----TAGTA-A-------AGT-A----T---------------A---GC---AGTA--G---------TA---GTA--GTA----------GTAGCAACAGTAGTAGCAGTAGCN---GTAGCAGTAGTA---GTAGT---------A---------GTA-----------GAAGTACTG-----T--------GC-AGTAGTAGC--AGT---A---------G---TAGTAGTAGTA----GTNGCAGT---------AGTAGAAG-TAGTATG-AT--AGTAGCA-G-TAGT--AGT------AGT------------AGTAGC-AGCGGT------A--GTAGTAGTAGCAGTA---GTAGTA---GTA-----GTAGTTGT---------AG---TAG-AAGTAGT------AGTAG------TA-GTA---GTAGTAGT-AGTAGT--AGTAG--NAGT-A--GNTGT---TG------TA---------G--TAG-----TAGTAGT---------A---G---TAGTAGTAATG--GTA----TT-AT--AA-CAGTAGTAGTGGT---AGTA----GTAGAAGTAGTAGT-AGT-GG--TA----TGG-TGGT-G-T--NAGTAGTAG---TAGT---TG-TAGTGG---TAGTA--GTAGN------AGTGG------T--A-G---TAGTAG-CGA--TTGT---A---GT---ANAA------GTANA--AGTA-------GTA------GTA--GTAGTAGTAGNAGC-AGTAGC--GG----TAGTAG-TAG--T---G---GCG------GTGG-CGGTA-------------GTA--GTG---------GTA---G------CGGTG-----G-TGGTG---G---TGG------TAGTGGTA--------GTAG----TGGTGG---CG------GT---AGTAGCGGTG------G------TAGTGG---TA--GTA---G-TA---GTGGTA--GTAGTAGT---AGTAGTGGC------GGTA---GT---AGTNGT---NGTAGT-G-G--TTGTGGTAGCA-GTAGCTTTA
Reference ( family-180 ) : ATAGTAGTAGAAGT---AANAGTAGTAATAGTAGTAGAAGTAGT------AGC---AGNAGTA---G--CAGTAG---TAGTAGTA---GTAGT---AGT---------AGT---AGTAGTAGTTTCAGCAG---CAGTAGTAGTA---GT-A--GTA------GT-----TAT---TAGTAGTA-G--TA--GT---A-T--TAGTAG---TAG---AAGAAGT---A---GTA-GCAGTAGCAGTAGT---AGTAGCAGTAGTAGCAG--CA---G---TA---GT-T-G----TAGTA-A-------AGT-A----T---------------A---GC---AGTA--G---------TA---GTA--GTA----------GTAGNAACAGTAGTAGCAGTAGCN---GTAGCAGTAGTA---GTAGT---------A---------GTA-----------GNAGTACTG-----T--------GT-AGTAGTAGC--AGT---A---------G---TAGTAGTANTA----GTNGCAGT---------AGTAGAAG-TAGTATG-AT--AGTAGCA-G-TAGT--AGT------AGT------------AGTAGC-AGCGGT------A--GTAGTAGTAGCAGTA---GTAGTA---GTA-----GTAGTTGT---------AG---TAG-AAGTAGT------AGTAG------TA-GTA---GTAGTAGT-AGTAGT--AGTAG--NAGT-A--GNTGT---TG------TA---------G--TAG-----TAGTAGT---------A---G---TAGTAGTAATG--GTA----TT-AT--AA-CAGTAGTAGTAGT---AGTA----GTAGAAGTAGTAGT-AGT-GG--TA----TGG-TGGT-G-T--AAGTAGTAG---TAGT---TG-TAGTGG---TAGTA--GTAGN------AGTAG------T--A-N---TAGTAG-CGA--TTGT---A---GT---ATAA------GTANA--AGTA-------GTA------GTA--GTAGTAGTAGNAGC-AATAGC--GG----CAGTAG-TAG--T---G---GCG------GTGG-CGGCA-------------GTA--GTG---------GTA---G------CGGTG-----G-TGGTG---G---TGG------TAGTGGTA--------GTAG----TGGTGG---CG------GT---AGTAGCGGTG------G------TAGTGG---TA--GTA---G-TA---GTGGTA--GTAGTAGT---AGTAGTGGC------GGTA---GT---AGTNGT---NGTAGT-G-G--TTGTGGTAGCA-GTAGCTTTA
gi|1 : A--TTAT---A---AC---AT---------TAAATTAGTA-------GCA------ACA--GCAGTAGTAGAAGC-AGCAGC--GAAACACAGTAG-AAG--T---A---GCA------GTAG-TAGCA-------------GAA--GAG---------GTA---G------GAAAA-----G-TATTT---G---CAA------CAGAAATA--------GTAG----TAGCAG---C---------------AGCTGAA------G------TAGTTG---TA--ATA---T-CA---GCAGCA--GAAATAGT---AGTAGTAGCAACAGAAATA---GT---AGCAAC---AGAAGT-A-G--TTATAGTAGCA-GCAGC
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatAGT---AGAAGTAGCAGTAGTAGCAGAAGAGGT------AGG---AAAAGTATTTG--CAACAGAAATAGTAGTA---GCAGC---AGCTGA------AGT---AGTTGTAATATCAGCAG---CAGAAATAGTA---GT-A--GTA------GC------------AACAGAA-A--TA--GT---A------GCAA---CAG---AAGTAGTTATA---GTA-GCAGCAGCAGAAGC---AGTAGCCGTAGCAGCAG--CA---GGAGTA---GC-C-A----TAGTA-GC------AG--A--------------------A---GC---AGTC--GATGTTTTGTTG---TTATTGTACTTTATTGCTGTTGTTATAGTAGTAGTACTAGTA---GAAGAAGTAGTA---GCAGC---------A---------GCA-----------AAATTACTA--------------GC-AATATCAGC--AGTTAAA---------G---TAGTAGTTGTA----GTTACAGC---------AATAAAAA-TAGAATA-A----GTATCT-T-CAGC--AAA------AGT------------AGTAGC-AGTGGT------A--GTTTCATCAGCATTA---ATAGAA---ATA-----GTAGCAGC---------AG---CAA-AAGAAGT------CGTAG------TA-GTA---GCACCAAT-AGTAGT--AGTAGATCAGCGA--AAT-T---TA------TA---------G--TNN-----NNNNNNN---------N---N---NNNNNNNNNNN--NNN----NN-NN--NN-NNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNNNNNNNNNNNNN-NNN-NN--NN----NNN-NNNN-N-N--NNNNNNNNN---NNNN---NN-NNNNNN---NNNNACTGTCAC------AGCAG------C--A-G---TA-TA---------AT---A---GT---ATAA------GTACA--AGAA-------GTA------GCA--GCCGCAGCNNNNNN-NNNNNN--NN----NNNNNN-NNN--N---N---NNN------NNNN-NNNNN-------------NNN--NNN---------NNN---N------NNNNN-----N-NNNNN---N---NNN------NNNNNNNNNNNNNNNTGTTG----TTGTGG---TG------AT---AGTAGTAGTA------A------TAGAAG---TA--GTA---G-TG---GTGTTT--GAAATAGT---AATAGTGGT------ATTA---ATATAAATAGT---AGTAGTAG-A--ACATGG-AGCA-GTAGTTTTAagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacT---AGTAGTAGTACTAGTAGAAGAAGTAGT------AGC---AGCAGCA---A--AATTAC---TAGCAATATCAGCAGTTAAAGT---------AGT---AGTTGTAGTTACAGCAA---TAAAAATAG-A---AT-AA-GTATCTTCAGCAAAAGTAG---TAGCAGTG-G--TA--GTTTCA-T--CAGCAT---TAA---TAGAAAT---A---GTA-GCAGCAGCAAAAGA---AGTCGTAGTAGTAGCAC--CA---A---TA---GT-A-G----TAGTA-G-------A-T------C---------------A---GCGAAATTT--A---------TA---GTN--NNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNN---NNNNN---------N---------NNN-----------NNNNNNNNN-----N--------NN-NNNNNNNNN--NNN---N---------N---NNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---------NNNNNNNN-NACTGTC-AC--AGCAGCA-G-TA-T--AAT------AGTATAAGTACAAGAAGTAGC-AGCCGC------A--GCNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN---NNN-----NNNNNNNN---------NN---NNN-NNNNNNN------NNNNN------NN-NNN---NNNNNNNN-NNNNNN--NNNNN--NNNN-NNTGTTGT---TGTGGTGATA---------G--TAG-----TAGTAAT---------A---G---AAGTAGTAGTG--GTG----TT--TGAAA-TAGTAATAGTGGT---ATTA----ATATAAATAGTAGT-AGT-AGAACA----TGG---------------AGCAG---TAGT---TT-TAGTAA---TATTA--GTAGT------TGTAG------T--A-T---TAGTAG-CAA--TTGT---CGTTGT---ACAAGTTTTCGTATA--AATATTTTTTTTTA------G-A--GTAGTAGTAACAGT-AAAAGA--AG----AAGTAG-TTA--T---A---ACA------GCAG-CAGTA-------------GTA--GTA---------GTA---A------TATTA-----T-TATTA---G---TAG------TAAT-TTA--------ATAG----TAGTAG---AA------GT---TGT--TGTTG------A------TA-TGG---T----T----G-TT---GTTGTA--ATAGTAGT---AGAAGTGGT------GGTA---GT---Agtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttaATAGTAGCAGCAGC---AAAAGAAGTCGTAGTAGTAGCACCAAT------AGT---AGTAGTA---GATCAGCGA---AATTTATA---GTNNN---NNN---------NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NN-N--NNN------NN-----NNN---NNNNNNNN-N--NN--NN---N-N--NNNNNN---NNN---NNNNNNN---N---NNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNACT-GTCACAG--CA---G---CA---GTATAA----TAGTATA-------AGT-A----C---------------A--------AGAA--G---------TA---GCA--GCC----------GCAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNN---NNNNN---------N---------NNN-----------NNNNNNNNN-----N--------NN-NNNNNNNNN--NNN---N---------N---NNNNNNNNNNNTGTTGTTGTGGT---------GATAGTAG-TAGTA---AT--AGAAGTA-G-TAGT--GGTGTTTGAAAT------------AGTAAT-AGTGGT------A--TTAATA-TA--AATA---GTAGTA---GTA-----GAACATGG---------AG---CAG-TAGTTTT------AGTAA------TA-TTA---GTAGTTGT-AGTATT--AGTAG--CAAT-T--GTCGT---TG------TACAAGTTTTCG--TAT-----AAATATTTTTTTTTAGA---G---TAGTAGTAACA--GTA-------AA--AG-AAGAAGTAGTTAT---AACA----GCAGCAGTAGTAGT-AGT-AA--TA----T------T-A-T--TATTAGTAG---TAAT---T--TAATAG---TAGTA--GAAGT------TGTTG------TTGATA---TGGTTG-TTG--TTGT---A---AT---AGTA------GTAGA--AGTG-------GTG------GTA--GTAANNNNNNNNNN-NNNNNN--NN----NNNNNN-NNN--N---N---NNN------NNNN-NNNNN-------------NNN--NNN---------NNN---N------NNNNN-----N-NNNNN---N---NNN------NNNNNNNN--------NNNN----NNNNNN---NN------NN---NNNNNNNNNA------G------TAATGG---TAATGTT---GATA---GTGTTA--ATCGTAGCATAAGTAGTAGA------GGAA---GT---AGTGGT---AGTAGT-A-G--TTGTAGTAGAA-GCAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgttgatagtgttaatcgtagcataagtagtagaggaagtagtggtagtagtagttgtagtagaagcataagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaATAATAGTATAAGT---ACAAGAAGTAGCAGCCGCAGCNNNNNN------NNN---NNNNNNN---N--NNNNNN---NNNNNNNN---NNNNN---NNN---------NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NN-N--NNNNT----GT-----TGT---T-GTGGTG-A--TA--GT---A-G--TAGTAA---TAG---AAGTAGT---A---GTG-GTGTTTGAAATAGT---AATAGTGGTATTAATAT--AA---A---TA---GT-A-G----TAGTA-G-------AAC-A----T---------------G---G----AGCA--G---------TA---GTT--TTA----------GTAATATTAGTAGTTGTAGTATTA---GTAGCAATTGTC---GTTGT---------ACAAGTTTTCGTA-----------TAAATATTT-----TTTTTTAGAGT-AGTAGTAAC--AGT---AAAAGAAGAAG---TAGTTATAACA----GCAGCAGT---------AGTAGTAG-TAATATT-ATT-ATTAGTA-G-TAATTTAAT------AGT------------AGTAGA-AGTTGT------T--GT--TGATA----TG---GTTGTT---GTT-----GTAATAGT---------AG---TAG-AAGTGGT------GGTAG------TAANNN---NNNNNNNN-NNNNNN--NNNNN--NNNN-N--NNNNN---NN------NN---------N--NNN-----NNNNNNN---------N---N---NNNNNNNNNNN--NNN----NN-NN--NN-NNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNNNNNNNNNNAGT-AAT-GG--TAATGTTGA-TAGT-G-T--TAATCGTAG---CA--------TAA--G---TAGTA--GAGGA------AGTAG------T--G-G---TAGTAG-TAG--TTGT---A---GT---AGAA------GCATA--AGCA-------GAATTTTTTGCA--TTAGTAGTTGCAGT-AGTAtaagcagaattttttgcattagtagttgcagtagtatgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|1 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtT---GATAGTGTTAATCGTAGCATAAGTAGT------AGA---GGAAGTA---G--TGGTAG---TAGTAGTT---GTAGT---AGA---------AGCATAAGCAGAATTTTTTGCAT---TAGTAGTTGCA---GT-A--GTATGT---GT-----TGT---AAGT-GTGCG--TATTGT---A-T--TAGtgtgttgtaagtgtgcgtattgtattagagg
gi|10 : taatttttttacttgaatctaccacatttgtattcctttttaccttaaatcatgtcatacaactaacaacaacaacacaatacatctcaattttaacactttgcagtgttttctatcagataatatattataacttgaatttcaatatttggcggccattttggatttgtgaccaaacgtcccaacaaccgttagtaagaaataaattttcgaactcagcatacattttacctcaagaaacaagcatttataaataaaaataaggcgaaagcattcaacaaaatgagtatatttgcagaaaaagtgtcatttttttcatatttttgcagccactttgtgcctcatttagattgtttatacttaattcgaccatatttttattattttttaccctaaaacatttcatacaactaacaacagcacaataaatctaaattgtaactctttgcagtcttctatatcaaattatatattataacattaaattagtagcaacagcagtagtagaagcagcagcgaaacacagtagaagtagcagtagtagcagaagaggtaggaaaagtatttgcaacagaaatagtagtagcagcagctgaagtagttgtaatatcagcagcagaaatagtagtagtagcaacagaaatagtagcaacagaagtagttatagtagcagcagcagaagcagtagccgtagcagcagcaggagtagccatagtagcagaagcagtcgatgttttgttgttattgtactttattgctgttgttatagtagtagtactagtagaagaagtagtagcagcagcaaaattactagcaatatcagcagttaaagtagtagttgtagttacagcaataaaaatagaataagtatcttcagcaaaagtagtagcagtggtagtttcatcagcattaatagaaatagtagcagcagcaaaagaagtcgtagtagtagcaccaatagtagtagtagatcagcgaaatttatagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtcacagcagcagtataatagtataagtacaagaagtagcagccgcagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttgtggtgatagtagtagtaatagaagtagtagtggtgtttgaaatagtaatagtggtattaatataaatagtagtagtagaacatggagcagtagttttagtaatattagtagttgtagtattagtagcaattgtcgttgtacaagttttcgtataaatatttttttttagagtagtagtaacagtaaaagaagaagtagttataacagcagcagtagtagtagtaatattattattagtagtaatttaatagtagtagaagttgttgttgatatggttgttgttgtaatagtagtagaagtggtggtagtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaatggtaatgtGAT------G--GTGGTAGTAGAAGTA---G--GT----GTA-----GTAGTTGT---------GT---TAG-AAGTAGTTGGAGAAGTAG------TA-ACA---GTAGTGGT-GGTGGT--AGTAG--TAGT----GATGA---TGA-----TG---------G--TGGAGATATAGTGGT---------A---G---TAGTAGAAGTA--GTA-------AT--AG-TAGTAGTGGTGGT---GGTA----ATAGTCGTAGTAAT-TGT-GG--C------GG-TGGT-G-G--TAGTAGTAG---TAGTGT-TGGTTGCGG---TTGTA--GTGGT------GATGA------TG-A-T---TANNNN-NNN--NNNN---N---NN---NNNN------NNNNN--NNNN-------NNN------NNN--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNGG----TGGTGG-TGG--T---GCAGGTG------GTGA-TAGTA-------------GTA--GTG---------GGA---G------TGGTG-----G-TGGTG---G---TGGAAATAATAGTAGTA--------GAAG----AAGTAG---TAAATATAGT---AGTAGCAGTA------G------AAGTGG---TT--GTG---G-TGGGTGTGGTA--TTAagg
gi|12 : tGTGG---TATTT--GTAAA------ACTGG------T--A-C---TGGTAC-TGA--TTGTGTTA---GTGCCATAG------GTATA--AGTA-------GTA------GTG--GTAGTGGTAGCAGT-AATTAT--GA----CAGTGGATGGGAT---G---GTG------GTAGTCGGTG-------------GTA--GTGTTGATGTTGGTA---G------TGGTGTAAATGCTGATA---G---CGG------TAGTGGTG--------GTTG----GGGCGT---TG------GT---GTTAGCAGTG------G------AAGTGT---TG--AT----G-T-----TGGTA--GTGGT-GT---A--AATGTT------GATA---GC---TGTAGT---GTTGGT-G-G--
gi|12 : attgcttTG--GTA----TTTGT--AA-AACTGGTACTGGT---ACT--------GA--TTGTGTT-AGT-GC--CA----TAG---GT-A-T--AAGTAGTAG---TGGT-------AGTGG---TAGCA--GTAATTATGACAGTGGATGGGAT--G-G---TGGTAGTCGG--TGGT---A---GT-------------GTTGA--TGT---------TG------GTA--GTGGT-GTAAATGCTGATAGC--GG----TAGTGG-TGG--TTGGG---GCG------TTGG-TGTTA-------------GCA--GTG---------GAA---G---------TG-----T-TGATG---T---TGG------TAGTGGT---------GTAAATGTTGATAG---CT------GT---AGTGTTGGTG------GGGTCTTTGTTGT---TA--TTT---A-TA---GTGGTA--GTGGTGGG---GGTGTTGAT------GTTG---GT---AGTGATGAAGGTAGT-G-G--AAGTGGTGGggtctttgttgttatttatagtggtagtggtgggggtgttgatgttggtagtgatgaaggtagtggaagtggtggtgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|13 : attgcttg-AT--AA-CATGATTAGTAAT---AATA----G-AGATGTACTAGT-AGT-TG--TA----------GT-G-A--AAGTGGTAGCGTTAGT---TG-TAATGGAAATGGTA--GTAGC------AGTGG------A--A-CACATA--AG-GGAATTTGT---A---GT---A---------GTACA--TATA-------GTG------GTA--GTGATAGTGGTAGC-AGTAGT--TG----TAATGG-AAA--T---G---GAA------GTGG--GACACGTAAGGGAATTGGTA--GTA---------GTATATA------CAGTG-----G-TAGTGAAAG---GGG------TAGCGGTA--------GTTG----TAATGGAAATG------GT---AGTGGTTGTGAAACATG------TAAGGGAATTG--GTA---G-TA---GT--TAATGCAGTGGT---AGTGATAAT------GGTA---GC---GGTAGT---TGTAAT-G-tgtgtgtgtgggggggacgtcggtgttattggtgatggtagtggtgatggt
gi|15 : aaca-------AGT-A----T--------------------C---ATTATTG---------TT---GTA--AT------------TATCATCATTATTACTATTATCT---ATACCGATAGTATTTGTTAT---------A---------TTA-----------GAGTTGTTG-----TT-------GT-ACTAGTAG---AG--------------G---TAGTAGTATTA----GTTGAAGT---------AGTA---------ATG--T--AGCAGCA-G-TAGT--ATT------AGT------------TGTAGT-AG---T------A--AT-GTAGTAGCAGTA---ATAGTA---GTT-----GTTGTTGT---------AAGATCAG-CAGTAGT------GGTGGCGATTCTA-GTA---GTAGAAGT-AGTAAT--GGTAA--AAGT-A--GATGG---AG------TA---------G--TAG-----TATTAGT---------A---G---TGGT
gi|17 : gctattagttgttataattataactacttaaattgat---------G---TAGTAGATGTA----GTTGCTGTTGTTTTTGTAGTAGCAG-TA-TATA-ATGTAATGACATG-T--T--AGT------AAT------------AAAAAA-AGATAT------ATTGTTGTAGTAACAGTA---GTTGTC---ATA-----GTAGTTGT---------AG---TAG----TAA-------AGTAG------TA-GTA---ATAGAAGT-AGTAGT----TA---AAGT-T--GTGGT---TG------TG---------G--TAG-----TAGTAGT---------AT--G---TA-TAATAATG----A----TT-AT--GA-TTGAAGTAGTAGT---AGTA----GTAGAAGTAGTATTAAATAAA--TA----TTG--GAT-A-T--AA-TACTAG---TAGTATATG-TAGTCA---TATCA--GTA
gi|18 : --------GT-TGTAGTAGT--AGT---T---------G---TAACGGTAGTG----ATAGATGT---------AGTGGAAGTTAATATG-GT--ACTTGCA-G-TGGT--AGT------GGT------------AACAGT-AATGAT------A--ATTGTAGTGGCTATG---GCAGAG---GTAGATGTGTAATTGT---------AG---TGGCCAGTTGT------AGTGA------TA-ATT---GTTGT-GTAAGCGGA--CGTGG--TAGT-G--GTTGC---TG------TA---------C--GAT-----TTGTAGC---------G---G---TCATGGAAGTG--G----------T--AA-CTGTAGTGGTGGT----GTATGTTGTATTGGTGATAGC-AGT-GG--Tat
gi|19 : tgtgatg-A--GT-------GT-----TATGTTTAGTATTA-T--CA--TT---A-T--CATTAT---TAT---TAGAAGT---A---GAC-AAAGTAGCAATAGT---AGTATCATAAGTAGCAT--CA---G---TA---GA-T-G----TAGTA-A-------TG--A----T---------------A---GA---AGTG--G---------GA---GTA--GCA----------GTAGTAACAGCAGTAGCCAAAGCA---GTAGCAGTGGTA---GTATC---------A---------GAA-----------GCAGTAT-----------------C-AATAGTGAC--AGT---AGAT------G---CAGTAGTAtatatt
gi|2 : gtataatcactattataatcaatatattactgttgttactattattgatattatcatc-G-TAGT--AGA------AGC------------ATTAGC-AA-GTT------A--GTAATTGTGGTAGTATGTGTTGTAAGTGTAC----GTA-TTGT---------AG---TAG-AAGTAAT------CTTTG------TA-GTA---GCAGAAAT-AGTTGT--AGTAA--AATC-A--AATAT---TT------TA---------a
gi|20 : tt------GTAGA--AGTA-------ATA------GTATAGTAGTAGT---AGC-AATA-----G----TAGTAA-AAG--T---G---ACG------GTGG-TGATA-------------GTA--GTA---------GTA---GAAGAAATGGTG-----G-TGGTG---G---TGG------TAGTAGTA--------GTAG----TGGTGA---TG------GTAACAGTAGAAGTA------G------TAGTAG---TA--ATAACGG-TG---GTGATATTGTAGTAGT---AGTAGTAAC------GGTG---GTACAAGAAGT---AGTAGT-G-GAATGGTGGTGGactttaagtacacttcgcaaataaaatatgtttactttccttgccccaaaatataaatccctaccctttttaaaaagattaatggcgaaaatgataataagccgcacaagtgttttataatataacatgccggaacaatatgtctaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgcaacaggatgtggaacataagaaggtggtgtcggtgtccaatatgtactttaaaagtatccactttatacttaactgttaagcaaattaaacacttgaaaaaagataatacaatgttaatactaaataaaaaccgtacgtctataataccattattataataagtagcaagtcatatcatattatcagaatatgtgccaaactcttctatgaaacttgatatttacgtggaacaaactgtataaatattgtataggatatcaattaaagtacatatatatatatataaagtgtaacgataatacattttataatctatttttctggtttatatgtccacagctgtacagattgcttttatagggaaacggctaaacgcgattttcggcattgtcgtatatccctttaaattgttatgaccgcgaggcattgacgtatactgattacaagaatacacacatagacataatcaaattatcatttacgagcatgcgctaaaatatgatagtgtttgtgaaaaactgtaataa
gi|21 : ggtggtggtg---------------A---GC---AGT---G---------TA---TCA--TTA----------ATAGCAACAGTA-TAG--ATAGTT---GTAGCAGAAGTA---GTAGT---------A---------GAA-----------ATAATACT---------------------ACTACT--AGT---A---------G---TAGTAATAGTA----ATAATAAT---------AATAACAA-TAATATA-AC--AACATTA-G-TAGA--AGT------ATT------------AATA
gi|22 : tagtacatgtaaaatctatataaatattcaaAGTAG---G--T---G---GTGTTAATTGTGG-CGGTG-------------TTAATGTG---------GTACATG------CGGTT-----G-TGATG---GAGATGG------TAGTGTAA--------ATGG----TGGTGG---TG------GT---AGTAGCGGTG------G------TGGTGG---TG--GTA------A---ACATTA------TGGT---GGTAGTGAC------GAAC---GT---CGTCGT---CGTGGT-T-A--TTGTGGTGGGAGGTAGTTGTAttaaagttggaaatactgatttgattagtaaacgtgtcagta
gi|23 : ttgGAAA-TAGTATG-AT--TGTGGCA-G-TAGT--AGT------AGT------------AGTAGG-AGTAGT------A--GACGGAGTAGTGACG---GTGATA---GCA-----GAAAATGG---------AG---TAA-AAGCAGA------AACAC------CA-GCA---GCAGTAGT-AGTAAT--AGTGA--AAGT-A--AA-GG---TA------TA-------------AG-----TATTAGT---------AAACA---TAGCA-TAATG--acggtggttgttattgcggcggtggtgat
gi|25 : tgacggtattgtaattatttAGAAATAATGGT-TGT-GG--T------GG-TGAT-GAT--GA-TGGTGA---TGGT---GG-TGGTGG---TGGTA--ATAAA------ATTAG------T--A-G---TGGTGGGCG---TGGT---A---GT---AGAA------GTAGT--AGTT-------GTA------TTA--GTAGTACTAGTAAC-AGTAAT--AT----TAGTAG-TAG--T---A---GCA------GT------TA-------------A-A--GTA---------ATA---G------TGGTG-----A-TGGTG---G---TGG------TAGTATTA--------GCAG----aaggtg
gi|27 : AGTAATA---GTAGTGAG-GTA-----GTAGTTGTTTCTGAATGAG---TAG-CAGTAGT------AGTAGAT----TG-GTAATTGTGGTTGT-AGCCGT--AGTAT--AAGT-A--GACGTGA-TG------TA---------GTATAT-----TAATAGT---------A---G---TAGTAGTAATGATGCA----TT-AC--AAGCAGTaag
gi|28 : tattgttgttgtataAGC---A---ATC-GCAATCGCAATCAT---AGTCACAGTCGTAGCAG--TA---G---TT---GC-T-G----TAG---A-------AGT-A----TCATCAGCATAACATTA---GC---AACA--T---------TA---GCA--GAA----------GAAGCAACAACATCAGCAGTAGCA---GTAGCTGCAACA---GTAGT---------A---------ATA-----------GAAGT
gi|29 : agcatcG-----A-TAGTG---G---TGG------TAGTGATA--------ATGG----TGGTGG---TG------AT---AGTGACGGAG------A------TGGTGG---TGTTGTA---A-TT---GTGGTG--GTAGTGAC---AATGGTAGT------GGTATGTGT---AGTGGT---TGTGGT-GTG--TT-TGATAGTG-GTA
gi|3 : ATAGTAGTATAAGTCATAATAGTAGTAATAATAGTAGAAGTAGA------AGC---AGCAGCA---G--CTGTAG---CAGTGGTA---GTAGT---GGT---------AGT---AATAGTGATGTCATTATTATCAGTAGTAGTA---AT-ATTATA------AT-----CAT---TGGTGGTA-G--TA--GT---A-T--GAATAG---TAGCCAAAGAAAA---A---GTA-GCTGTAGCAGTAGT---AGTAGCAACAGTAGCAG--CA---G---CA---AT-T-G----TAGTATA-------AGTTA----T---------------A---AA---AGTA--G---------TA---ATA--ATA----------GCAGAAATAATAGCAGCAGCAGCT---GTTGCAGTAGTA---GTAGT---------G---------GTA-----------GTAGTACTGA----T--------GTCATTATTATC--AGT---A---------G---TAGTAATATTA----TTAGCATT---------GGTGGAAG-TAGTATGGAT--AGTAACA-G-AAGT--AAA------AGT------------AGTTGA-AGCAAT------A--GTAGTAGTAGCAACA---GTAGCA---GCA-----GTAATTGT---------AG---TAT-AAGTAAT------AATAG------TA-GTA---ATACTAGT-AGAAGT--AGTAG--CAGC-A--GCTGC---TG------TA---------G--CAG-----TAGTGGT---------A---G---TAGTAGTGATG--TCA----TT-AT--AATCAGTAGTAGTAAT---ATTA----TTATCAGTGGTGGT-AGT-AG--TA----TGGATAGTAG-CCAAAGAAAAAG---TAGT---TG-TAGCAG---TAGTA--GTAGC------AACAG------T--A-G---CAGCAG-CAA--TTGT---A---GT---ATAA------GTAAA--AATA-------GAA------GCA--ATAGAAGTAGAAGT-AATAGC--AG----CAGTAG-TAA--T---G---GCG------GTGT-CGGCG-------------GTG--GCG---------ATA---G------CGGCA-----G-TGACA---G---TAA------TAGTAGCA--------GAAA----CAGTAA---CG------CT---ATCAGCAATA------A------TAGTGA---AA--GTA---G-CA---GCAGCA--ATAATAGT---AGTAGTTGT------AGTC---GT---AGATGC---TGTAGT-A-G--TTGTTGTAGTA-GTTACTTTAatgctggtggtggtggt
gi|31 : A------AT-----TAT---TAATAATA-AAATA--AT---A-TAATA-TAA---TAA---AATCAAT---ACAGGCA-CCAGTAACAGTAGT---AGAAGC---AGCAGCAG--AA---G---TA---AT-A-A----TAGTA-------------A----T---------------A---GC---AGAC--G---------TA---GTA--GTA----------ATAGACATAGACGTAGaaaaaataaaatcacccttatct
gi|31 : gaCAGTA---ACAGTA---GTA-----GAAGCAGC---------AG---CAG-AAGTAAT------AATAG------TA-ATA---GCAGACGT-AGTAGT--AATAG--ACAT-A--GACGTAGATG------TA---------atgta
gi|31 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcacAGTAACAGTAGTAGAAGCAGC------AGC---AGAAGTA---A--TAATAG---TAATAGCA---GACGT---AGT---------AGT---AATAG
gi|32 : gaaattattaataataaaataatataatataataaaatcaatacaggcaccG--CA---G---TATGAGT-T-GATTTTACTT-A-------AGTTA----T---------------AAAAGC---AGTG--G---------TA---GTA--GCA----------GTAGTACCAGTAGTAACTGTAGCA---ATATCAGTAGCA---ATAGC---------A---------ATA-----------CCGGTGCTG-----CA-------AC-AGTAATATC--ATT---A---------T---TATTAacatagacgtagatgta
gi|34 : tatGTTGAAAT---AATAATAGTTATTGTAGTACAAGTAGTTATTATAGTCATAAGAGTA---G--TAGTAG---TAGTAGTA---GTAGA---AGTTTTGGTTGAAGT---AGTAGTTGTTt
gi|35 : tagttgttgcagtagttgttactAGTAGAAGTA---GTTA--ATA-------T-----TAT---TATTAAAA-G--TA--TA---A-T--TAGTAGAAATAG---AAAAA-----------A-GAAGTAGTGG--AT---A-TAGCAATAGTAGCAG--CA---G---TA----T-T-G----TTATT-ATT-----ATT-A----T---------------A---AC-----TA--G---------TA---GAA--ATA----------g
gi|36 : aaAGTATTA---CTAGT---AGT---------AGT---AGTAATAGTAAAAGTTG---TAGTAGTATTA---AT-A--ATA------AC-----CCT---TAGTAATA-G--TA--AC---ACT--TAGTAG---TAG---AAGAAG
gi|37 : aaaaaagttg------GT-----TAT---CGTTATCA-T--CA--GC---A-T--TAGAAG---TGT---TGGTACT---A---GTA-GCAATAATGGTAGC---CGTGGTGGTAGTAGatgttataaca
gi|37 : AGCATTA------G------AAGTGT---TG--GTA---C-TA---GTAGCA--ATAATGGT---AGCCGTGGT------GGTA---GT---AGTTGT---TATTTT-G-G--TTGTTGTttgttattttggttgttgttattgtac
gi|38 : gttatcgttatcatc---GTAGTAGT-AGTAGTAAAATAA--GAAT-A--AGTAT---TG-----------------G--TGA-----CAGTAGC---------A---A---CATCACTAGCG--GTA----TT-AT-----CAGTAGTGGTGGTTACAACA----ACAGAAGAAGtattgtac
gi|39 : A--------ATAG----TGGTAA---TA------GT---ATGAGAGGTG------G------TTGTGG---TA--GTA---G-TA---GT---A--GTAGTAGA---GATGGTGGA------GGTA---GT---AGTTGT---TGTGGT-G-G--TTGTCGTAGCA-GT
gi|40 : G---TAA-AAGTAGT------ATTAA------TA-GTT---GTTGTGGT-ATTAGT--AATAG--TAGG-A--GTTGT---TA------CA---------G--TAG-----TTGTAGT---------T---GACACAGTAGT-------TG----TT-GT--AG-TAGTAGTA
gi|41 : AGC---A---GCG-GCAGCGGCAGTAGC---AGTAGTAGTAGTAGCGG--CA---A---TA----T-C-GA---TGGTA-A-------A-T-A----T---------------A---AT---GAT---G---------CA---GTA--GTA----------GT-GAAATAATA
gi|42 : c---AAGAAGT---A---CTT-CGAGTAGCAGTAGT---AGTAGTTGTAGTAGTAT--CA---G---TA---GC-A-A----TAGTA-C-------AAT-G----T---------------A---GC---AAAA--T---------CA---GTA--GCA----------GTA
gi|43 : GGTG-----G-TGGTG---G---TGG------TTATGGTA--------GTTG----TGGTTA---CG------GT---GGTTACGGTG------G------TGGTGG---TA--GTA---G-AA---GTAGTA--GCAGTAGT---AGTA
gi|44 : AG--T---G---GCT------TTGG-CGG----------------TG--ACG---------ATG---G------CGATG-----G-TGGTG---G---TGG------TGGTGGTGAC------ATAT----T--TAG---CG------GT---AGTAACAGTG------G------TAG
gi|45 : acT---GAAAGTAGTAATAGTAGTAGAAATAGT------AGT---AGAAACA---G--TAGCAG---TGATAGAA---GTGG
gi|46 : ca-AT--AGTAGCA-A-TTGT--AGT------TGT------------AGTAGT--GCAGT------G--GTAGTAATAGCAGTA---Gataagaata
gi|47 : gttgtaacA---GCA--GTA----------GTCGCAACAGTAGTCCCAGTAGTA---GTAGCAGCAATA---GCAGT---------A---------
gi|5 : ATAGTAGTAGAAAT---AATAGTAATAATAGTAGTGGTGGTGGT------A-T---GGTAGTA---C--TTGTAA---TATTA-TG---GTGGT---GGT---------AGT---AGTAGTAGTT------G---TAGTAGTAGTG---AT-G--ATG------GT------GT---TAGAAGTA-G--TC--GA---G-G--TGGTGG---T-G---ATGA--T---A---ATG-ATGGTGGTGGTAGT---GGTAGTAGTAATAGAGGTNNN---N---NN---NN-N-N----TAATA-G-------AG--G----T---------------A---GT---AGTA--G---------TATTGATA--GAA----------GTAGCAGTAGTAGTGGTGGTAGTT---ATAGTATTAGTA---ATGGTTGTGGAAGAA---------GTA-----------TAAGTGTTGGTGATT--------GT-GGTGTTAGTTTAGT---A---------G---TAGTAGTAATT----GTGGCAGT---------GGTAGAAG-TAGTA---AT--GGTAGTG-G-TAGC--AAT------AGA------------AGTAGCGATTGGTGATTTAA--GTA-TAGTAGAAGTA---GTAGTA---TAA-----TTGGTTGT---------GG---TAG-TAGTAGT------AATAG------TA-GTA---TTATTAGT-AGTGGT--AGTGG--CAGT-A--GTTGT---TG------TG---------G--TGG-----CGGTGAT---------A---G---AAGTACTAATG--GTG----GT-GTT-GG-CTGTGGTAGTAGT---AGTA----GTGGTGGTGCTGGT-GTT-AG--TA----TAG-TAGT-A-T--TAGTGTTGG---TGGT---GG-TGGTGG---TGGcca
gi|7 : TAGTAGTAAAAGGAGT------AA------AAGTA---G--CAGTAG---AAGAAGTA---GAAAT---A-----------AGA---A--AATAGTTTTTGCAG---CAGTAA-A--A---GT-A--TCA------CT-----TAT----AGCAGCA-G--AA--GC----------GTAA---TA-----AGAAGT---A---CTG-ACAGAAGCAAAAGTTGAAGAAGCAGCAGCAGTCG--CAAACG---TT---GT-T-G----TAGCA-ACATCAGAAGT-AGAAAC---------------A---GT---AGTA--G---------TA---GCA--GTA----------GCAGAAAAAGTGATAGCACCAGCTTAAGTAGCAGTCGTA---ATAGT---------A---------GTAACAGAGAAGCAGAAGTA-----------------GC-AGTAGCAGC--AGC---A---------GACACAGTAAAAGTA----GTAGCAGA---------AATAGAAG-TAGTAT---T--AGCAGCA-GATAA---AGT------AGT------------TGTAGC-ATCAGC------T--GAAGAAGAAGCAGTA---GTAGCA---GCA-----GCAGC----------------------AGTAGT------AGTAG------TA-GCA---GCAGAAGT-AGTAGT--AATCG--CAGC-A--GCTGA---AA------TA---------G--TAG-----CAGCAGA---------AAACG---TAGTTGCAATG--GTAACATTT-AT--TA-CTGTAGAAATAAC---AGCA----AGGGAAGTA
gi|9 : GTA---G--CAGTAG---TAGTAGTA---GTAGT---AGT---------ACT---AGTAAAAGTTTCAGAAG---CAGCAGCAGTATACAT-A--ATA------GT-----TAT---T-GTAGTA-G--TA--GT---A-C--TGGTTG---TAG---CTGCAGC---A---ATATGT-GTAGCAGTATT---AGAAGCA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CGACAAAATTGCTATGTTTTTTAAAAGAAAGTATATCACAACAACACAATAAATCTAAATTTTATTACTTTGCAGTGTTTTCTATCATATTATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACTAAACGCCCTAACAGCCGTTAGTAAGAAATATATTTTCATACAGTTTACCTCCAGACACAAACATTTATAAATAGATATACGGCCAAAGCATTCAGCAAATGTGTATCTTTACAGAAATAGTGTCATTTTCTTCATAATTTGGCTGTCATTTTGTCCATTATTTAGACTTTATGTACACGATTCAACTACATGTATATTTTACAACAACATAAAAAATCTGACTTTTTTATACTTTGCAGTTTATTTTATCAGATTATATATTATAACATGAATTTCATCTTGGATTTGTGACCAATTGCCCCAACAACCGTTATTAGGAAATAGATTTTCCGACTAAGAATACATTTGACCTCCAGAAACAAGCATTTATAAATAAAAATAAGGCCAAACCATACAACTAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTGTTTTTTTTCATATTTTGGCAGAAATTATGTCGCTTATTTAGACTTCTTTACTTGAATCAACCATGTTTCTCTTCTTTTTTACCCTAAAACATGTCATACAACTTAAAAAAACACAATAAATCGAAATTTTAACACTTTGCAGTTTTTTTCTATTAGTTTATATATTATAAACGTGTAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCCATCTTGGATTTGTGACCAAACG
Unaligned ( gi|6 ): TAGTTTACTAGAGCTTAAGTTTAACATATTCAGTTGTATTATTTCAAATTATACCTTAAAAATGGAACTTTCATATAAAATAAGGCCAGAACATTCAACAAAATGAGTATATTTGCAGAAAAAATTGTCATTTTTTTCATAATTTGGTGGCCATTTTGCCCTTATTTAGACCTTTTACTTGAATTAACCACATTTTATTCTGCTTTATCCTAAATTATGTCATACAACTTATAACAACGCAATAAATCTAATTTTTCACACTTTACAGTGTTTTCTATCAGACTTTATAATAATTATAACATGAATTTCAATATTTGGTGGCTATCTTGGATTTATGACCAAATGCTCCATCAGTCGTTAGTAAGAAATAGATTTTCGGACTCAGTATACATTTTACCTCTAGAAACAAGCCTTTATAAATAAAGATAAGGCCAAAGCATTCAACAAAATTATATTTTAAGTATATTTGCAGAAAAAAGTGTAATGTTTTCATATTTCGGCAGCCATTTTGTGCCTTATTTAGATTGTTT
Unaligned ( gi|8 ): GAATACACATATAACCATAGTCAAATTATGCGCAAAAATGTGATGGTGTTTGTGAAAAGCAGTTAAAGGGACCAAAATGTTTTAGGTATATTTCATAAAAAAATATATATCCAAAAAGATAAGATATTTTGTATTTGTAATTCACTTGCACAGAAATAACATTTTTTTGTTAAATGTGTTTACTTTGCTAATACAAATTTTGTTTGACTGATTTTTTTTCAATATTTACATAGAACATATAAGGAAACCAGGTCACTAACTATAATAATAAAAAAGAACCAAAATGTTTTATTTTTTAAATTATGAAACTTAACAATAAAACGAGAGAGGTTTTAAACTCCAATACCCCGTTCGCACAGAAAAAAATATTGTCATTTTTTTTTAAATTTATAATTGCAAAAGTAAATTGGTCCTTCTTAAAGAAATATCGGATTTTCCAGCGCGGTTGAAATTGAAAGTTGGAC
Unaligned ( gi|11 ): TTTAATTGTTTTACATGAATCAACCATCGTTTTACTTTATTGACCTTAAAACATGTCTTACAACAAATAACAACAGACTAGATCCGAGTTTATTTACAGTGTTTTCCCATCGGATTATTTGTATATAAGCCCTACTACTAGTATTAGTTATGAATAATTTCAATATTTGATGGTCATTTTGGCGGCCATCTTGAAATTGAGACAAAACGTCCAAACATACGTTAGTAAGAATTTGAATCTTGAACTCAGCATACGTTTTATATATAGAAGCAGATCTCAAACATTTTGGACATAAAANNNNNNNNNNGAATGGGCAACCAACGAATATATCTCCATAGGCATTGTGTCCATATTTGTGCCTTTCATCTTCTGCAGCAA
Unaligned ( gi|14 ): ACATGTTCAGTATCCAGTTTTACTTTACTAAGCTTTTATTAATCTATGGCCAAAAGCAGTATGTCATACAACATACAACAACACAATAAATCTCAATTTAAACACTGTGCTGTCTTTATTATCAGATTATATATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGACAAAACGCCCCAACAGCCGTTAGTAAGAAATGGATTTTCTGACTCAGTATACATTTTACATCTAGAAAAAAAGTCTCAAACCTTCCGTACATAAAATAACCGACTATAGCCATTGAATA
Unaligned ( gi|16 ): TTCAAATTTTGCGGTCAGTATATCCCTTACTTCAACTCTTTCACATGAATCAACCATAGTTCACTTGTATTTACCCTAAATCATGTCATATATTAAACAGGAACACAATATACCTAAATATAATATTTGCAGTGCTTTAACAGAATGTATACTAATATTGACGGTTATCTTGGATTTTTGGCAAAACTCCCCCAATAGCTGTTGGCAAGAAATTAACTTTTAAACATGGCATACACTTTACCACTAGAATCATTACTCAACGGTTGTATTCTTTTT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAATGGAATTTTCATAAACGTGTTTATTGTATTTCTTTGTTAGAGCAAAAGAAGTACACAATATATCTTAGTTTAAACATTTTGCAGCGTTTTTGTATCAGATGATATATTATAATATAAAATGAAATATTTGGCGGCCATCTTGGATTTGTGGCGGAACGCCTGAACACGTGTAAG
Unaligned ( gi|26 ): GAGTTGTTAGTGTATGTATTTCAATAGAAATAGCCGTGGAAGTAACAGAAACAGCGGTACTTGTAATAAAATCTGAAGTCCTTTAAATATTTTGACTCAAAGTAAACACCGCTATTAAAATATATTTTCTTTCGTTGCCCCAACATATTATAAACACTTACCTTTAAATAGA
Unaligned ( gi|30 ): ATTTTGTCCCTTATTAAAACTTATTGTACATGAATCAATCGTCTTTTTACTTATCTTAACATGCCATACAGCTTACAATTACGCAATTTATCTAAATTATAACACTTTGCAGTGTTTTGTCAGATTATGTA
Unaligned ( gi|33 ): AACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATAAGTAGCAGTAGAAGTAGCAG