lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222222222222 1 1 1 222222222222222 1 222 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 11
lowQualScore : 88 5 666666666666666666 5555 5 3333 3333 4 2 7777 22 2 555555 333 4444 999999999999999 1 1 222 1 33 22 44 1 3333 1 44 22 5555555 4444444 1 7777777777 2 1 55 000 2 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 3 3 7777 6 6 1 6 6 3 44
lowQualScore : .. . .................. .... . .... .... . . .... .. . ...... ... .... ............... . . ... . .. .. .. . .... . .. .. ....... ....... . .......... . . .. ... . . ...................................................................... . . . .... . . . . . . ..
lowQualScore : 33 7 222222222222222222 0000 0 9999 9999 6 2 4444 66 1 555555 333 0000 111111111111111 7 7 888 6 77 11 22 5 0000 5 00 11 0000000 8888888 5 5555555555 4 8 88 999 4 9 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 3 3 1111 9 3 0 5 0 6 99
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG----GA--AG--GG-C--A----CTCCCTATATCTTGGTTAGTACATA----TGTGC----CGCCGTTTTGACCC----CTCTT--TTTGGACA------TA---TG----ATGTAGA-G--TTTT-GA-CCC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-CGA--TGTA-------GA-------GCTTTG-ACCC----TC----CTTTCTGGAC-ACATAATGTAGACTTTTGA--CCCCTTGTTCAATCCTTAATAAAAATNNNNNGTTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTTAAACACAGAATTAATA----AAAT----ATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTTATGCCATTGTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTCAAGT-GCCTC
Reference ( gi|1 ) : ACTGTTGCACGTTGTCACCGGGG--TGG-GG----GA--AG--GG-G--A----CTCCCTCTATCTTGGTTAGTACATA----TGTGC----CGCCGTGTTGACCC----CTCTT--TTCGGACA------TA---TG----ATGTAGG-G--TCTG-GA-TCC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-TGA--TGTA-------GA-------GCTTTG-ACCC----TT----CTTTCTGCAC-ACATAATGTAGACTTTTGA--CTTATTGTTCAATCATTAATAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AACT----ATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTTATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTCAAGT-TCCTC
gi|22 : CCGGGGGTTGGTGG----GA------GG-C--A----CTCCCTATATCTTGGTAAGTATATA----GGTGC----CACCGTTTCGATCC----CTCTT--TTTGTACG------TA---TG----ATGTAGA-G--TTTT-GA-TCC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-CGA--TGCA-------GA-------GCTTTT-ACCC----TC----CTTTCTGAAC-AC
gi|8 : cCGGGG--TGG-GGTCGGGA--GG--AG-G--ATGCACTCCCTGTATCTAGGTTAATACATA----TGTGC----CGCCGTTTTGGACT----CTCTT--TTTGGATATCATTTTA---TG----ATGTAGG-G--------------------------T--T--T--T-G--C----------GA--TGCA-------GA-------ACTTTA-ACCT----TC----CTTTCTGGAC-ACATAGTGTAGATTTTTTA--CCCCTTATTCAATCCTTAATAAAAAT
gi|15 : gtgtgtgtggGG--TGG-GG----G----------T--A----CTCCCTATTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGC----CGCCGTTTATACCC----CTTTT--T--GGACA------TA---TA----ATATACA-G--TTTT-GA-CTC-CTAA-T---A-CT--T--T--T-G--C-ATA-GTG-CGA--TGTT-------GA-------GCTTTG-ACTC----TC----CTTTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|10 : GG-GG----GT--TG--GG-C--A----CTCCCTATAT----GTTAGTACATG----TGTGC----CACCTTTTTA--CC----CTCTT--TTTGGACA------TA---TA----ATGTAAA-G--T-TGTGA-CCC-CTTT-T---T-CA--T--T--T-G--C-ATA-ATC-CGA--TGTA-------TA-------GATTTG-ATCT----TC----CTTTCTGATT-ATATAATGTAGACTTTTGA--TCCCTTGTTCAATtgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|30 : tggtacgtgtgtgggtgtcccGG-GA----GAGTAG--GGCGTCA----CTCCCTATATCTAAGTTAGTACATA----TGTGA----CACTGTtcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|6 : gG-GG----GA--GGACGG-C--A----CACCCTATATCTTTGTTAGTACACA----TGTGC----CACGGTTTTGACCC----CTCGT--TTACGACA------TA---TG----ATGTAAG-AGTTTTG-G---CC-CCAT-T---T-TC--C--T--T--------A-ATG-CGA--TGTT-------GA-------GCTTTG-ACGC----TC----TTTTCTGGAC-ACATAATGTAGACTTTTGA--CCCCTTGTTCAATCt
gi|20 : gacatccca-GG----GA------GG-T--A----CTCCCTATATATTAGTTAGTACATA----TGTGC----CGCCGTTTTGACCC----CTCTT--TT-----------------TG----A-------------------CC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--T-ATA-ATG-TGA--TTCA-------GA-------ACTTTG-ACCC----TT----CTTTCTGGAC-ACATTTTGTAGACTTTTGA--CCCGTTGTTCAATCcggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|21 : --AG--GA-C--A----CATCCTATATCGTGGTTAATACATA----TGTGC----CGCCGTTTTGACCC----CTCTT--TT-GGACA------TA---TG----ATGTAGA-G--TTTT-GC-CCA-CTA--T---T-CT--T--T--T-GGAC-ATA-AT----A--TGTA-------GA-------GTTTTG-ACCC----TC----CTTTCTGTAC-ACATAAT-TATACTTTTcgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|4 : t--AG--GG-GT-A----CTCCCTATATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCTATATGTGGTTTTAACTCTAT-TTCTT--TT---GCA------TAATGCG----ATGTAGA-G--CTTT-GA-CCC----------T-CC--T--TAAT-G--G-AC--ACG-CAA--TGTA-------GA-------CTTTTG-ACCC----TT----GTTcaaaatgccaactgtt
gi|16 : G--GG-C--A----CTCCCAATATCTTGGATAGTACATA----TGAGA----CGCGGTTTTGACCT----CTCTT--TTTGGACA------TA---TG----ATATAGA-G--TTTT-GA--CC-CTAT-T---TATT--T--T--T-G--C-ATG-TTG-CGA--AGTA-------GA-------GCTTTG-ACCC----TC----CTTTCTGGAC-ACATAATGTAGACTTTTGA--CCCCTTGCTCAATCcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : gg--GG-G--A----CTCCCTATATCCTAGTTAGTACATA----TGTGC----CGCCGTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACA------CG---TA----ATGTAcgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|11 : --A----CTCCCTATATATTCGTTAGTACATA----CGTGC----CGCAATTTTGACCC----CTCCT--TTTAAACT------TA---CG----ATGTAAA-G--TTTT-TA-CCC-CTAT-T---T-CT--C--T--T-G--C-ATT-ATG-CGA--TGCATTTTTTTAA-------GCTTTG-ACCC----TC----CTTACTGAAC-ACATAACGTAGACTTTTGG--CCCCTTA-TCAATCCTTAATAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNAAAAA---TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTTATGCCATTGTaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|3 : c--A----CACCCTATATCATTGTAAGTACATACTTATGTAC----CACCGTTTTGACCC----CTCTT--TTTGGAAA------TA---TG----ATGTAAA-G--TTTT-GA-CCC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATT-ATA-CGA--TGTA-------GA-------GCCTTA-ACTC----TC----ATTTCAGGAC-ACATTATGTAGACCTTTGA--CCCCTTGTTCAATCgcaga
gi|12 : tc--A----CTTCCTATATCTTGGTTATTTCATA----TGTTC----CACCGTTTT-ACCC----CTATC--TTTGGACA------TA---TG----GTGTTGATA--TCTT--A-GCT-CTAG-T---T-AT--T--T--T-G--A-ATA-ATG-CGA--TGTA-------GA-------GTGTTG-ACCA----TC----CTTTCTGGAC-ACATACTGTAGACTTTTGA--CCACTTGTTCAATCGTTTATAAAAtggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|13 : gtggtaa--A----CTTCCTATATCTTGGTTATTTCATA----TGTTC----CACCGTTTT-ACCC----CTATC--TTTGGACA------TA---TG----GTGTTGATA--TCTT--A-GCT-CTAG-T---T-AT--T--T--T-G--A-ATA-ATG-CTA--TGTA-------GA-------GTGTTG-ACCA----TC----CTTTCTGGAC-ACATACTGTAGACTTTTGA--CCACTTGTTCAATCGTTTATAAAActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|29 : gtgtggtat--A----CTCCCTATATTTCAGTTCATACATC----TGTGC----CGCCATTTTGACCC----CTCctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|19 : gagggtatgac----CTCCCTATATTTTGGTTAGTACATA----TGTGC----CGCC
gi|27 : gaccCTATATTTTGGTTAGTACATA----AG-----------ATTTT-ACCC----GTCTT--TTTGGACA------TA---TG----ATGAAGA-G--TTTT-GA-CCC-CTAT-T---T-CT--T--T-------C-TTA-ATG-CGA--TGTA-------GA-------GCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|18 : acctaaTGGTACATA----CGTGC----CGGTGTATTGACCT----CTCTT--TTTGGACA------TA---TG----ATGTAGA-G--TTTT-GA-CCC-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-CGA--CGAA-------AA-------GCTTTG-ACAC----TC----CTTTCTGGAC-GCATAATCTAGACTTTTG---CCCCTTGTTCAATCcatatatgtttcgttttgggac
gi|9 : tctcTA----TATGC----CACTATTGTGATCC----CTCTT--TTTGGACA------TA---CG----ATGTA--------------CCC-CTAT-T---T-----T--T--T-G--C-ATA-ATG-CGA--TGTA-------AA-------GCTTTG-ATCC----TC----CTTTCTGGAC-ACATAATGTAGACTTTT-A--CCCCTTGTTCAATCcggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|23 : tccctaacatcttagA----TTTGG----CACCGTTTTGAACC----CTCTA--TTTGGACA------TA---TG----CTGTAAA-G--TTTT-GA-CCC-CTCA-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ACG-CGA--TGTA-------GA-------AATTTG-ACCC----TC----CTTcgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagatatttgttcataagaaacatgtattttattcttaatgaaatccaggagtttatgctattgtgtaaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
gi|2 : ----TGTGC----TGCCGTTTTTATTC----CTCTT--TTTGGACA------TA---TG----NNNNNNN-N--NNNN-NN-NNN-NNNN-N---N-NN--N--N--N-N--N-NNN-NNN-NNN--NNNN-------NN-------NNNNNN-NNNN----NN----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNTGTTCAATTCTTCATAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAT----ATTTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGTATGCCATTGTgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|7 : CGTTTTGATCC----ATCTT--GCTGGACA------TA---CA----ATGTAGA-A--TTTT-GA-CCCATTGT-TCAAT-CC--T--T--A-A--CAAAA-ATGTTGAATTGTA-------TA-------GTTGTG-GCgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|4 : tcttttgcataatgTCTTGGTTAGTACA------TA---TGTGCTATATGTG-G--TTTT-AA--CT-CTAT-T---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-CGA--TGTA-------GA-------GCTTTG-ACCC----TC----CTTAATGGAC-ACGCAATGTAGACTTTTGA--CCC-TTGTTCAATCaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|5 : aggggtactccctataG-GACTCC-CTATAT---C-CTAGT--TAGT-A--C-ATA--TG-TGC--CGCC-------G---------TTTTT-ACCC----TTATTTCTTTCTGGAC-ACGTAATGTAAACGTTCGA--CTTTTTGCTCAATCCTTAATAAAAAT-----GTTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTTAAACACAGAATTAATA----AAC-----AGTTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTTACGCCATTGTTTAcggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|22 : g-TCC-CTAT-A---T-CT--T-------G----GTA-A-G-T-A--TATA-------GGTGCCACCGTTTCG-ATCC----CT----CTTTTTGTAC-GTATGATGTAGAGTTTTGATCCCTATTgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|15 : cccgggggttggtgggaggcac-TCC-CTAT-T---T-CT--TGGT--TAG--T-ACATATG-TGC--CGCC-------G----------TTTATACCC----------CTTTTTGGAC-ATATAATATACAGTTTTGA--CTtcttttgcataatgcgatgcagagcttttaccctcctttctgaacac
gi|23 : ggtgggggtac---T-CTA-T--T--T-G--G-ACA--TA-TGC--TGTA-------AA-------GTTTTG-ACCCCTCATT----CTTT-TGCATAACGCGATGTAGAAATTTGACCCTCCTTGTTCAATCcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|7 : atttggcaccgttttgaaccc---T-CT--T--T--T-G--C-ATA-ATG-CG------------------------TTTTG-ATCC----AT----CTTGCTGGAC-ATACAATGTAGAATTTTGA--CCCATTGTTCAATCCTTAACAAAAATcggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|27 : T--T--T--T-G--G-ACA--TA-TGA--TGAA-------GA-------GTTTTG-ACCCCTATTT----CTTTCTTAAT-GC--GATGTAGAgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|27 : acctaactatattttggttagtacataagattttacccgtctA-------GATTTT-ACCC----GT----CTTTTTGGAC-ATATGATGAAGAGTTTTGA--Cgccatatatgtttcgttttgggac
gi|4 : acctaactatattttggttagtacata----AAAT----ATTTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTTATGACATTGTGTAccctatttctttcttaatgcgatgtagagccatatatgtttcgttttgggac
gi|14 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaa----ATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTTATGCCATTATTTAgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|15 : TTTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTTATGCAATGGTGTAgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|9 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagTTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTTATGCTATTGTGTAgacaaagtt
gi|26 : tccctaacatcttagtatatgccactattgtgatccctctttttggacatacgatgtacccctattttttgcataatgcgatgtaaagctttgatcctcctttctggacacataatgtagacttttaccccttgttcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagataTTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTTATGCCATGGTGTAaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
gi|3 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgTTGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAgacacagttt
gi|7 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaTGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|28 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTTATGTTATTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|17 : GTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTCATGCCATTGTATA
gi|18 : TTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTTATACCACTGTGTAgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|12 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTTATGCAATTATTTAgacaacgtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgcgatgtagagtgttgaccatcctttctggacacatactgtagacttttgaccacttgttcaatcgtttataaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTTATGCCATTATTTAgacaagtt
gi|16 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgctatgtagagtgttgaccatcctttctggacacatactgtagacttttgaccacttgttcaatcgtttataaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTTAATGAAATCCAAGAGCTTATACCATTGTGTAgacaag
gi|3 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTCAAGT-ACCgacaagg
gi|9 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGCAAGT-
gi|4 : tccctaacatcttagtatatgccactattgtgatccctctttttggacatacgatgtacccctattttttgcataatgcgatgtaaagctttgatcctcctttctggacacataatgtagacttttaccccttgttcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagatatttgttcataagaaacatgtattttattcttaatgaaatccaggagtttatgctattgtgtaaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGCAAGT-GCCg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaaGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCcg
gi|14 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTCAAGT-tcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|7 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTCAAGT-ACCTCgctcc
gi|24 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaGTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTCAAGT-GCCTCcctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gcctatgttttgaaTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTCATGT-ccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|2 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACCAAGT-GCCTCgc
gi|17 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaaTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTCAAGT-TCCctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|6 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTCAAGTGCCCTCc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 33333333333 333333333333333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 44 3333 1 3333 333 1 555555 1 3 666 1 22 22 5555555 3333 22 22 0 33333333333 3 5 6 2 555555555555555 66 2 2 6666 666666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... .. .... . .... ... . ...... . . ... . .. .. ....... .... .. .. . ........... . . . . ............... .. . . .... ...... .................................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 55 5555 1 5555 000 7 000000 7 6 111 7 44 44 7777777 7777 99 99 1 55555555555 4 8 7 1 444444444444444 77 9 9 1111 111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA--TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCG--ATGTA-------GAGCTTTGACCCTC----CTTTCTGGACACATAATGTAGACTTTTGACCCCT--TG--TTCAATCCTTAATAAAAAT----GNNGAG-TTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACANAATNNAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA--TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCG--ATGTA-------GAGCTTTGACCCTC----CTTTCTGGACACATAATGTAGACTTTTGACCCCT--TG--TTCAATCCTTAATAAAAAT----NNNNNG-TTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC--TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTT---TCGGAC-AT------ATGATGTA-GGGTCTGGATC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGTG--ATGTA-------GAGCTTTGACCCTT----CTTTCTGCACACATAATGTAGACTTTTGACTTAT--TG--TTCAATCATTAATAAAAAT----NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA--TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATAATGTA-AAGTTGTGACC-CCTTTT---T-CATTTG--CATAATCCG--ATGTA-------TAGATTTGATCTTC----CTTTCTGATTATATAATGTAGACTTTTGATCCCT--TG--TTCAATTC
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAG-TTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA--TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTT---TTAAAC-TT------ACGATGTA-AAGTTTTTACC-CCTATT---T-CTCTTG--CATTATGCG--ATGCATTTTTTTAAGCTTTGACCCTC----CTTACTGAACACATAACGTAGACTTTTGGCCCCT--TA---TCAATCCTTAATAAAAATNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA----TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA--TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCT---TTGGAC-AT------ATGGTGTT-GATATCTTAGC-TCTAGT---T-ATTTTG--AATAATGCG--ATGTA-------GAGTGTTGACCATC----CTTTCTGGACACATACTGTAGACTTTTGACCACT--TG--TTCAATCGTTTATAAAAga
gi|12 : gtggtaaGTGTTGACCA----TCCTTT---CTGGAC-AC------ATACTGTA-GACTTTTGACCACTTGTTCAAT-CGTTTA--TAAAACTNN--NNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNTTCTTAATAAAActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|12 : gtggtaaacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgcgatgtagaTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTAtccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgcgatgtagagtgttgaccatcctttctggacacatactgtagacttttgaccacttgttcaatcgtttataaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---ACTTCCTA--TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCT---TTGGAC-AT------ATGGTGTT-GATATCTTAGC-TCTAGT---T-ATTTTG--AATAATGCT--ATGTA-------GAGTGTTGACCATC----CTTTCTGGACACATACTGTAGACTTTTGACCACT--TG--TTCAATCGTTTATAAAAgacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCTCTAGTTATTTTGAATAATGC-TA----TGTA--GA-GTGTTGACCA----TCCTTT---CTGGAC-AC------ATACTGTA-GACTTTTGACCACTTGTTCAAT-CGTTTA--TAAAACTNN--NNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN--NNNNNTTCTTAATAAAATC----CAAGAGCTTATGCCATTATTTctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|13 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTAagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgctatgtagagtgttgaccatcctttctggacacatactgtagacttttgaccacttgttcaatcgtttataaaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA--TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TT---TTGGAC-AT------ATAATATA-CAGTTTTGACT-CCTAAT---A-CTTTTG--CATAGTGCG--ATGTT-------GAGCTTTGACTCTC----CTTTCTTGAtcc
gi|15 : T-TTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA--TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATGATATA-GAGTTTTGA-C-CCTATT---TATTTTTG--CATGTTGCG--AAGTA-------GAGCTTTGACCCTC----CTTTCTGGACACATAATGTAGACTTTTGACCCCT--TG--CTCAATCCgacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCG--ACGAA-------AAGCTTTGACACTC----CTTTCTGGACGCATAATCTAGACTTTTG-CCCCT--TG--TTCAATCCc
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA--TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTT---TTGGAC-AT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN---N-NNNNNN--NNNNNNNNN--NNNNN-------NNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TG--TTCAATTCTTCATAAAAAT----NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATAT-TTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA--TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTT---TTGA------------------------------C-CCTATT---T-CTTTTG--TATAATGTG--ATTCA-------GAACTTTGACCCTT----CTTTCTGGACACATTTTGTAGACTTTTGACCCGT--TG--TTCAATCCctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA--TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TT---TTGGAC-AT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCC-ACTA-T---T-CTTTTGGACATAAT-----ATGTA-------GAGTTTTGACCCTC----CTTTCTGTACACATAAT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA--TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTT---TTGTAC-GT------ATGATGTA-GAGTTTTGATC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCG--ATGCA-------GAGCTTTTACCCTC----CTTTCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTAT---TTGGAC-AT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACC-CCTCAT---T-CTTTTG--CATAACGCG--ATGTA-------GAAATTTGACCCTC----CTT
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaa-TTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA--TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTT---TTGGAC-AT------ATGATGAA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTT----CTTAATGCG--ATGTA-------GAGCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA--TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA--TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTT---TTGGAA-AT------ATGATGTA-AAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATTATACG--ATGTA-------GAGCCTTAACTCTC----ATTTCAGGACACATTATGTAGACCTTTGACCCCT--TG--TTCAATC
gi|3 : tGTTTTGACCC----CTATTTCTTTTGCATTAT------ACGATGTA-GAGCCTTAACT-CTCATT---T-C--------AGGACACATTATGTA-------GACCTTTGACCCCT----TGTTC---------AATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGC-----TAAAAAT----GNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT-----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAtggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|3 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaaGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA--TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA--TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT------------AT------ATG-TG-----GTTTTAACT-C-TATT---T-CTTTTG--CATAATGCG--ATGTA-------GAGCTTTGACCCTC----CTTAATGGACACGCAATGTAGACTTTTGA-CCCT--TG--TTCAATCC
gi|4 : ACTGCAATACAT-TTTCTTCAAATACAAAA----------A----AAATAT-TTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA--TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTT---CTGGAC-AC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : GTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACACGTAATGTAAACGTTCGACTTTT--TG--CTCAATCCTTAATAAAAAT---------G-TTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT----------AAACAG-TTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA--TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTT---TACGAC-AT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCC-CC-ATT---T-TCCTT------AATGCG--ATGTT-------GAGCTTTGACGCTC----TTTTCTGGACACATAATGTAGACTTTTGACCCCT--TG--TTCAATCCccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---T-CTTTTG--CATAATGCG-----------------TTTTGATCCAT----CTTGCTGGACATACAATGTAGAATTTTGACCCAT--TG--TTCAATCCTTAACAAAAAT----GTTGAA-TTGTAT-AGTctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------tgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG--TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTT---TTGGAT-ATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG------------------------------CG--ATGCA-------GAACTTTAACCTTC----CTTTCTGGACACATAGTGTAGATTTTTTACCCCT--TA--TTCAATCCTTAATAAAAAT----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAA-CATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTT---TTGGAC-AT------ACGATGTA----------CC-CCTATT---T---TTTG--CATAATGCG--ATGTA-------AAGCTTTGATCCTC----CTTTCTGGACACATAATGTAGACTTTT-ACCCCT--TG--TTCAATCC
gi|9 : AACATACAATACAT-----A----CAAGATATTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagatatttgttcataagaaacatgtattttattcttaatgaaatccaggagtttatgctattgtgtaaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
gi|9 : tccctaacatcttagtatatgccactattgtgatccctctttttggacatacgatgtacccctattttttgcataatgcgatgtaaagctttgatcctcctttctggacacataatgtagacttttaccccttgttcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggGTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 111111111111 333333333333333 1 1 11 222222222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 2 3333 2 3333 555555 0 33 1 1 333 1 55 5555555 3 3333 44 55 55 000000000000 888888888 555 222222222222222 0 1 0 0 3 33 0 44 5 1 888888888888888 55 2 2 5555 666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... . .... . .... ...... . .. . . ... . .. ....... . .... .. .. .. ............ ......... ... ............... . . . . . .. . .. . . ............... .. . . .... ...... .......................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 0 7777 1 9999 000000 3 33 0 8 000 7 99 7777777 3 7777 88 55 88 888888888888 444444444 888 888888888888888 0 8 0 9 4 88 2 99 0 0 333333333333333 88 5 5 3333 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAGT-GTTTATAA--CTGCAGTACACATTTCTT-AAACACANAATNNAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GNNGAGTTGTGTCAGT-GTTTGTCA--CTGCAGTACACATTTCTT-AAACACANAATNNAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTTTCGGACAT------ATGATGTA-GGGTCTGGATC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGTGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTT----CTT--TCTGCACACATA--ATGTAGACTTTTGACT--TATT------------GTTCAATCA---------TTAA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA-TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTTTTGGACAT------ATAATGTA-AAGTTGTGACC-CCTTTT---T-CATTTG--CATAATCCGATGTA-------TA-GATTTGATCTTC----CTT--TCTGATTATATA--ATGTAGACTTTTGATC--CCTT------------GTTCAATTC---------
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAG-TTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA-TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTTTTAAACTT------ACGATGTA-AAGTTTTTACC-CCTATT---T-CTCTTG--CATTATGCGATGCATTTTTTTAA-GCTTTGACCCTC----CTT--ACTGAACACATA--ACGTAGACTTTTGGCC--CCTT------------A-TCAATCC---------TTAA---TAAAAA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA----TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGC-TCTAGT---T-ATTTTG--AATAATGCGATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAga
gi|12 : gtggtaaCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACC-CCTAT------CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCGATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACTNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNT--TCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|12 : gtggtaaacttcctatatcttggttatttGTGTTGACCA----TCCTTTCTGGACAC------ATACTGTA-GACTTTTGACCACTTGTTCAAT-CGTTTA--TAAAACTNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------------NNNNNNTTC---------TTAA---TAAAAgacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttatttcatatgttccaccgttttacccctatctttggacatatggtgttgatatcttagctctagttattttgaataatgcgatgtaga---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGC-TCTAGT---T-ATTTTG--AATAATGCTATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAtccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACC-CCTAT------CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCTATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACTNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNT--TCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA-TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TTTTGGACAT------ATAATATA-CAGTTTTGACT-CCTAAT---A-CTTTTG--CATAGTGCGATGTT-------GA-GCTTTGACTCTC----CTT--TCTTGAtcc
gi|15 : T-TTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA-TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATATA-GAGTTTTGA-C-CCTATT---TATTTTTG--CATGTTGCGAAGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GCTCAATCC---------gacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCGACGAA-------AA-GCTTTGACACTC----CTT--TCTGGACGCATA--ATCTAGACTTTTG-CC--CCTT------------GTTCAATCC---------c
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTTTTGGACAT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN---N-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNT------------GTTCAATTC---------TTCA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATAT-TTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA-TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGA-----------------------------C-CCTATT---T-CTTTTG--TATAATGTGATTCA-------GA-ACTTTGACCCTT----CTT--TCTGGACACATT--TTGTAGACTTTTGACC--CGTT------------GTTCAATCC---------ctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA-TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCC-ACTA-T---T-CTTTTGGACATAAT---ATGTA-------GA-GTTTTGACCCTC----CTT--TCTGTACACATA--AT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTTTTGTACGT------ATGATGTA-GAGTTTTGATC-CCTATT---T-CTTTTG--CATAATGCGATGCA-------GA-GCTTTTACCCTC----CTT--TCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTATTTGGACAT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACC-CCTCAT---T-CTTTTG--CATAACGCGATGTA-------GA-AATTTGACCCTC----CTT--
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaa-TTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTTTTGGACAT------ATGATGAA-GAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTT----CTTAATGCGATGTA-------GA-GCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA-TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA-TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGAAAT------ATGATGTA-AAGTTTTGACC-CCTATT---T-CTTTTG--CATTATACGATGTA-------GA-GCCTTAACTCTC----ATT--TCAGGACACATT--ATGTAGACCTTTGACC--CCTTGTTCAATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGCTAAAAA----T----GNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT-----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGA
gi|3 : tGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA-TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT--------AT------ATG-TG-----GTTTTAACT-C-TATT---T-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--AATGGACACGCA--ATGTAGACTTTTGA-C--CCTT------------GTTCAATCC---------
gi|4 : A--CTGCAATACAT-TTTCTTCAAATACAAAA----------A----AAATAT-TTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA-TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACAC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : -GTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACACGTA--ATGTAAACGTTCGACT--TTTT------------GCTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----G-----TTGTGTCAGT-GTTTGTCA--CTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT----------AAACAG-TTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA-TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTTTACGACAT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCC-CC-ATT---T-TCCTT------AATGCGATGTT-------GA-GCTTTGACGCTC----TTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------ccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---T-CTTTTG--CATAATGCG----------------TTTTGATCCAT----CTT--GCTGGACATACA--ATGTAGAATTTTGACC--CATT------------GTTCAATCC---------TTAA---CAAAAA----T----GTTGAATTGTAT-AGT-ctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------tgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG-TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTTTTGGATATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG------------------------------CGATGCA-------GA-ACTTTAACCTTC----CTT--TCTGGACACATA--GTGTAGATTTTTTACC--CCTT------------ATTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAACATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTTTTGGACAT------ACGATGTA----------CC-CCTATT---T---TTTG--CATAATGCGATGTA-------AA-GCTTTGATCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTT-ACC--CCTT------------GTTCAATCC---------
gi|9 : AACATACAATACAT-----A----CAAGATATTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagatatttgttcataagaaacatgtattttattcttaatgaaatccaggagtttatgctattgtgtaaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
gi|9 : tccctaacatcttagtatatgccactattgtgatccctctttttggacatacgatgtacccctattttttgcataatgcgatgtaaagctttgatcctcctttctggacacataatgtagacttttaccccttgttcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggGTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 2 3333 2 4444 555555 33 1 1 55 0 5555555 3 3333 44 88 55 22 000000000000 888888888 555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 55 2 2 5555 666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... . .... . .... ...... .. . . .. . ....... . .... .. .. .. .. ............ ......... ... ................................................................................... . .. . . .... ...... .......................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 0 7777 7 0000 222222 99 0 7 99 7 7777777 3 7777 88 22 88 99 888888888888 444444444 888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 88 5 5 3333 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--C--CTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTT-CTT-A--AACACANAATNNAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--C--CTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAGT-GTTTAT--AACTGCAGTACACATTT-CTT-A--AACACANAATNNAT-----A----AAATAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTTTCGGACAT------ATGATGTA-GGGTCTGGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGTGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTT----CTT--TCTGCACACATA--ATGTAGACTTTTGACT--T--ATT------------GTTCAATCA---------TTAA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA-TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTTTTGGACAT------ATAATGTA-AAGTTGTGACCCCTTTTT-CATTTG--CATAATCCGATGTA-------TA-GATTTGATCTTC----CTT--TCTGATTATATA--ATGTAGACTTTTGATC--C--CTT------------GTTCAATTC---------
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAG-TTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA-TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTTTTAAACTT------ACGATGTA-AAGTTTTTACCCCTATTT-CTCTTG--CATTATGCGATGCATTTTTTTAA-GCTTTGACCCTC----CTT--ACTGAACACATA--ACGTAGACTTTTGGCC--C--CTT------------A-TCAATCC---------TTAA---TAAAAA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA----TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCGATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--A--CTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAga
gi|12 : gtggtaaCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCGATGTAGAGTGTTGACCATC--CTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttattt---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCTATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--A--CTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAgacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCTATGTAGAGTGTTGACCATC--CTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttAT-TTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA-TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TTTTGGACAT------ATAATATA-CAGTTTTGACTCCTAATA-CTTTTG--CATAGTGCGATGTT-------GA-GCTTTGACTCTC----CTT--TCTTGAtcc
gi|15 : T-TTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA-TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATATA-GAGTTTTGA-CCCTATTTATTTTTG--CATGTTGCGAAGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--C--CTT------------GCTCAATCC---------gacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGACGAA-------AA-GCTTTGACACTC----CTT--TCTGGACGCATA--ATCTAGACTTTTG-CC--C--CTT------------GTTCAATCC---------c
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTTTTGGACAT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--N--NNT------------GTTCAATTC---------TTCA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATAT-TTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA-TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGA-----------------------------CCCTATTT-CTTTTG--TATAATGTGATTCA-------GA-ACTTTGACCCTT----CTT--TCTGGACACATT--TTGTAGACTTTTGACC--C--GTT------------GTTCAATCC---------ctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA-TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCCACTA-TT-CTTTTGGACATAAT---ATGTA-------GA-GTTTTGACCCTC----CTT--TCTGTACACATA--AT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTTTTGTACGT------ATGATGTA-GAGTTTTGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGCA-------GA-GCTTTTACCCTC----CTT--TCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTATTTGGACAT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACCCCTCATT-CTTTTG--CATAACGCGATGTA-------GA-AATTTGACCCTC----CTT--
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaa-TTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTTTTGGACAT------ATGATGAA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTT----CTTAATGCGATGTA-------GA-GCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA-TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA-TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGAAAT------ATGATGTA-AAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATTATACGATGTA-------GA-GCCTTAACTCTC----ATT--TCAGGACACATT--ATGTAGACCTTTGACC--C--CTTGTTCAATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGCTAAAAA----T----GNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT-----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGA
gi|3 : tGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA-TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT--------AT------ATG-TG-----GTTTTAACTC-TATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--AATGGACACGCA--ATGTAGACTTTTGA-C--C--CTT------------GTTCAATCC---------
gi|4 : TTATG-AACTGCAATACAT-TTT-CTTCA--AATACAAAA----------A----AAATAT-TTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA-TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACAC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : -GTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACACGTA--ATGTAAACGTTCGACT--T--TTT------------GCTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----G-----TTGTGTCAGT-GTTTGT--CACTGCAGTACACATTT-CTT-A--AACACAGAATTAAT-----A----AA-CAG-TTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA-TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTTTACGACAT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCCCC-ATTT-TCCTT------AATGCGATGTT-------GA-GCTTTGACGCTC----TTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--C--CTT------------GTTCAATCC---------ccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-CTTTTG--CATAATGCG----------------TTTTGATCCAT----CTT--GCTGGACATACA--ATGTAGAATTTTGACC--C--ATT------------GTTCAATCC---------TTAA---CAAAAA----T----Gctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG-TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTTTTGGATATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG--------------------------CGATGCA-------GA-ACTTTAACCTTC----CTT--TCTGGACACATA--GTGTAGATTTTTTACC--C--CTT------------ATTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAACATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTTTTGGACAT------ACGATGTA----------CCCCTATTT---TTTG--CATAATGCGATGTA-------AA-GCTTTGATCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTT-ACC--C--CTT------------GTTCAATCC---------
gi|9 : TTGTGATCCCTCTTT----TTG--GACA-TACGATGTA-----------C-----CCCTA----TTT--TTTGCATA-ATGCGATGTAAAGCTTTGATC--CTCCTT------------TCTGGACAC---------ATAA---TGTAGACTT-T----TACCCCTTGT-TCAAT---CCGG--GATT-CAATCCCCTCCTGCCT-AGGAACATACAATACAT-----A----CAAGATATTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaacatacaatacatacaagatatttgttcataagaaacatgtattttattcttaatgaaatccaggagtttatgctattgtgtaaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
gi|9 : tccctaacatcttagtatatgccactaGTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 111111111111 111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 2 3333 2 4444 555555 33 1 1 66 5555555 3 3333 55 55 66 111111111111 444444444 555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666 2 2 5555 666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... . .... . .... ...... .. . . .. ....... . .... .. .. .. ............ ......... ... ................................................................................ .... . . .... ...... .......................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 0 7777 7 0000 222222 99 5 8 11 9999999 5 9999 00 88 11 444444444444 444444444 888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 5 5 3333 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATNNAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTTTCGGACAT------ATGATGTA-GGGTCTGGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGTGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTT----CTT--TCTGCACACATA--ATGTAGACTTTTGACT--TATT------------GTTCAATCA---------TTAA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA-TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTTTTGGACAT------ATAATGTA-AAGTTGTGACCCCTTTTT-CATTTG--CATAATCCGATGTA-------TA-GATTTGATCTTC----CTT--TCTGATTATATA--ATGTAGACTTTTGATC--CCTT------------GTTCAATTC---------
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAGTTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA-TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTTTTAAACTT------ACGATGTA-AAGTTTTTACCCCTATTT-CTCTTG--CATTATGCGATGCATTTTTTTAA-GCTTTGACCCTC----CTT--ACTGAACACATA--ACGTAGACTTTTGGCC--CCTT------------A-TCAATCC---------TTAA---TAAAAA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA---TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCGATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAga
gi|12 : gtggtaaCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCGATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttattt---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCTATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAgacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCTATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA-TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TTTTGGACAT------ATAATATA-CAGTTTTGACTCCTAATA-CTTTTG--CATAGTGCGATGTT-------GA-GCTTTGACTCTC----CTT--TCTTGAtcc
gi|15 : TTTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA-TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATATA-GAGTTTTGA-CCCTATTTATTTTTG--CATGTTGCGAAGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GCTCAATCC---------gacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGACGAA-------AA-GCTTTGACACTC----CTT--TCTGGACGCATA--ATCTAGACTTTTG-CC--CCTT------------GTTCAATCC---------c
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTTTTGGACAT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNT------------GTTCAATTC---------TTCA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATATTTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA-TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGA-----------------------------CCCTATTT-CTTTTG--TATAATGTGATTCA-------GA-ACTTTGACCCTT----CTT--TCTGGACACATT--TTGTAGACTTTTGACC--CGTT------------GTTCAATCC---------ctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA-TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCCACTA-TT-CTTTTGGACATAAT---ATGTA-------GA-GTTTTGACCCTC----CTT--TCTGTACACATA--AT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTTTTGTACGT------ATGATGTA-GAGTTTTGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGCA-------GA-GCTTTTACCCTC----CTT--TCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTATTTGGACAT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACCCCTCATT-CTTTTG--CATAACGCGATGTA-------GA-AATTTGACCCTC----CTT--
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaaTTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTTTTGGACAT------ATGATGAA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTT----CTTAATGCGATGTA-------GA-GCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA-TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA-TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGAAAT------ATGATGTA-AAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATTATACGATGTA-------GA-GCCTTAACTCTC----ATT--TCAGGACACATT--ATGTAGACCTTTGACC--CCTTGTTCAATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGCTAAAAA----T----GNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGA
gi|3 : tGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA-TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT--------AT------ATG-TG-----GTTTTAACTC-TATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--AATGGACACGCA--ATGTAGACTTTTGA-C--CCTT------------GTTCAATCC---------
gi|4 : TTATG-AACTGCAATACA-TTTTCTTCAAATACAAAA----------A----AAATATTTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA-TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACAC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : -GTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACACGTA--ATGTAAACGTTCGACT--TTTT------------GCTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----G-----TTGTGTCAGT-GTTTGT--CACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT-----A----AA-CAGTTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA-TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTTTACGACAT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCCCC-ATTT-TCCTT------AATGCGATGTT-------GA-GCTTTGACGCTC----TTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------ccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-CTTTTG--CATAATGCG----------------TTTTGATCCAT----CTT--GCTGGACATACA--ATGTAGAATTTTGACC--CATT------------GTTCAATCC---------TTAA---CAAAAA----T----Gctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG-TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTTTTGGATATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG--------------------------CGATGCA-------GA-ACTTTAACCTTC----CTT--TCTGGACACATA--GTGTAGATTTTTTACC--CCTT------------ATTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAACATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTTTTGGACAT------ACGATGTA----------CCCCTATTT---TTTG--CATAATGCGATGTA-------AA-GCTTTGATCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTT-ACC--CCTT------------GTTCAATCCGGGAT----TCAA---T----------------CCCCTCCTGCCTAG-G-------AAC----ATACA---------ATACATACAA--GAT-----A----------TTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTA
gi|9 : GTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 111111111111 111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 2 3333 2 4444 555555 33 1 1 66 5555555 3 3333 55 55 66 111111111111 444444444 555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6666 2 2 5555 666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... . .... . .... ...... .. . . .. ....... . .... .. .. .. ............ ......... ... ................................................................................ .... . . .... ...... .......................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 0 7777 7 0000 222222 99 5 8 11 9999999 5 9999 00 88 11 444444444444 444444444 888 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4444 5 5 3333 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTTTCGGACAT------ATGATGTA-GGGTCTGGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGTGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTT----CTT--TCTGCACACATA--ATGTAGACTTTTGACT--TATT------------GTTCAATCA---------TTAA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA-TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTTTTGGACAT------ATAATGTA-AAGTTGTGACCCCTTTTT-CATTTG--CATAATCCGATGTA-------TA-GATTTGATCTTC----CTT--TCTGATTATATA--ATGTAGACTTTTGATC--CCTT------------GTTCAATTC---------
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAGTTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA-TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTTTTAAACTT------ACGATGTA-AAGTTTTTACCCCTATTT-CTCTTG--CATTATGCGATGCATTTTTTTAA-GCTTTGACCCTC----CTT--ACTGAACACATA--ACGTAGACTTTTGGCC--CCTT------------A-TCAATCC---------TTAA---TAAAAA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA---TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCGATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAga
gi|12 : gtggtaaCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCGATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttattt---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCTATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAgacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCTATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA-TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TTTTGGACAT------ATAATATA-CAGTTTTGACTCCTAATA-CTTTTG--CATAGTGCGATGTT-------GA-GCTTTGACTCTC----CTT--TCTTGAtcc
gi|15 : TTTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA-TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATATA-GAGTTTTGA-CCCTATTTATTTTTG--CATGTTGCGAAGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GCTCAATCC---------gacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGACGAA-------AA-GCTTTGACACTC----CTT--TCTGGACGCATA--ATCTAGACTTTTG-CC--CCTT------------GTTCAATCC---------c
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTTTTGGACAT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNT------------GTTCAATTC---------TTCA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATATTTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA-TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGA-----------------------------CCCTATTT-CTTTTG--TATAATGTGATTCA-------GA-ACTTTGACCCTT----CTT--TCTGGACACATT--TTGTAGACTTTTGACC--CGTT------------GTTCAATCC---------ctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA-TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCCACTA-TT-CTTTTGGACATAAT---ATGTA-------GA-GTTTTGACCCTC----CTT--TCTGTACACATA--AT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTTTTGTACGT------ATGATGTA-GAGTTTTGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGCA-------GA-GCTTTTACCCTC----CTT--TCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTATTTGGACAT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACCCCTCATT-CTTTTG--CATAACGCGATGTA-------GA-AATTTGACCCTC----CTT--
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaaTTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTTTTGGACAT------ATGATGAA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTT----CTTAATGCGATGTA-------GA-GCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA-TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA-TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGAAAT------ATGATGTA-AAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATTATACGATGTA-------GA-GCCTTAACTCTC----ATT--TCAGGACACATT--ATGTAGACCTTTGACC--CCTTGTTCAATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGCTAAAAA----T----GNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGA
gi|3 : tGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA-TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT--------AT------ATG-TG-----GTTTTAACTC-TATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--AATGGACACGCA--ATGTAGACTTTTGA-C--CCTT------------GTTCAATCC---------
gi|4 : TTATG-AACTGCAATACA-TTTTCTTCAAATACAAAA----------A----AAATATTTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA-TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACAC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : -GTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACACGTA--ATGTAAACGTTCGACT--TTTT------------GCTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----G-----TTGTGTCAGT-GTTTGT--CACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT-----A----AA-CAGTTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA-TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTTTACGACAT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCCCC-ATTT-TCCTT------AATGCGATGTT-------GA-GCTTTGACGCTC----TTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------ccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-CTTTTG--CATAATGCG----------------TTTTGATCCAT----CTT--GCTGGACATACA--ATGTAGAATTTTGACC--CATT------------GTTCAATCC---------TTAA---CAAAAA----T----Gctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG-TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTTTTGGATATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG--------------------------CGATGCA-------GA-ACTTTAACCTTC----CTT--TCTGGACACATA--GTGTAGATTTTTTACC--CCTT------------ATTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAACATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTTTTGGACAT------ACGATGTA----------CCCCTATTT---TTTG--CATAATGCGATGTA-------AA-GCTTTGATCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTT-ACC--CCTT------------GTTCAATCCGGGAT----TCAA---T----------------CCCCTCCTGCCTAG-G-------AAC----ATACA---------ATACATACAA--GAT-----A----------TTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTA
gi|9 : GTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
blockSeqs : GT T TCGGGAGGAG AT GTC A CTTA A TTAT CATTTT AG G A GA TTTTTTT T ATTT AT CG AT GTTCAATCTGGA CCTCCTGCC GGC TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA ATAG C A TTTT TAAATA T TCATTTC
blockSeqs : . . GAGTAG . . . . G . . A T . A . T . AT CT AT . GGGAT . TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNN . . . . . .
blockSeqs : . . GAGGAC . . . . T . . A T . A . . . . . . . . . CTTTTGACCACTTGTTCAATCGTTTATAAAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNN . . . . . .
blockSeqs : . GTTG . . . . G . . G T . . . . . . . . . . . CTTTTGACCACTTGTTCAATCGTTTATAAAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN ATAT . . . . . .
blockSeqs : . GTAT . . . . G . . C G . . . . . . . . . . . TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN ATAT . . . . . .
blockSeqs : . GA . . . . T . . G G . . . . . . . . . . . TGTTGTGTCAGTGTTTGTCACTGCAGTACACATTTCTTAAACACAGAATTAATA AAA . . . . . .
blockSeqs : . GA . . . . G . . C G . . . . . . . . . . . CCCCTCCTGCCTAGGAACATACAATACATACAAGATA CAG . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . G . . C N . . . . . . . . . . . AT . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . N G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . G G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . G G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . G G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222222222222 111111111111 111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 33 4 00000000000000 44 444 2 3333 2 4444 555555 33 1 1 66 5555555 3 3333 55 55 66 111111111111 444444444 555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6666 2 2 5555 666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 0000000
lowQualScore : .. . .............. .. ... . .... . .... ...... .. . . .. ....... . .... .. .. .. ............ ......... ... ................................................................................ .... . . .... ...... .......................................................................................................................................... . .......
lowQualScore : 88 4 11111111111111 22 111 0 7777 7 0000 222222 99 5 8 11 9999999 5 9999 00 88 11 444444444444 444444444 888 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4444 5 5 3333 111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 8888888
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
Reference ( family-1429 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----GACCACTTGTGTCAAT-GTTTAT--AACTGCAATACACNTTTCTT-AAACACANAATTGAT-----A----AAATATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTC
gi|1 : CCGGGG--TGG-GG------GA--AG--G--GG---ACTCCCTC-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTGTTGACCC----CTCTTTTCGGACAT------ATGATGTA-GGGTCTGGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGTGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTT----CTT--TCTGCACACATA--ATGTAGACTTTTGACT--TATT------------GTTCAATCA---------TTAA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AACTATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTAAATGATATCCAAGAGTTT------ATGCCATTGTTTATTTGTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCACAGGGTACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCTC
gi|10 : actgttgcacgttgtcaGG-GG------GT--TG--G--GC---ACTCCCTA-TAT----GTTAGTACATG----TGTGCCACCTTTTTA--CC----CTCTTTTTGGACAT------ATAATGTA-AAGTTGTGACCCCTTTTT-CATTTG--CATAATCCGATGTA-------TA-GATTTGATCTTC----CTT--TCTGATTATATA--ATGTAGACTTTTGATC--CCTT------------GTTCAATTC---------
gi|10 : tggtacgtgtgtgggtgtccc-----A----AAATAGTTTGTTAATAAG-ACACA----------TTTAT-------------CAAGAGCCTTAAATAATGCCATTGTGTAggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaatagtttgttaataagacacatttatcaagagccttaaataatgccattgtgtagaaaaag
gi|11 : tggtacgtgtgtgggtgtcccgggggttgggcactccctatatgttagtacatgtgtgccacctttttaccctctttttggacatataatgtaaagttgtgacccctttttcatttgcataatccgatgtatagatttgatcttcctttctgattatataatgtagacttttgatcccttgttcaattcggggttcaatcccctcctgcctaggaacgccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaC---ACTCCCTA-TATATTCGTTAGTACATA----CGTGCCGCAATTTTGACCC----CTCCTTTTAAACTT------ACGATGTA-AAGTTTTTACCCCTATTT-CTCTTG--CATTATGCGATGCATTTTTTTAA-GCTTTGACCCTC----CTT--ACTGAACACATA--ACGTAGACTTTTGGCC--CCTT------------A-TCAATCC---------TTAA---TAAAAA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----AAAAA---TGTTCATAAG-ACACAT-TT----ATTTTATTCATGATGAAATCGAAGAGCTT------ATGCCATTGTGCAgaaaaag
gi|12 : ---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCGATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAga
gi|12 : gtggtaaCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCGATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCAATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgcaattatttagacaagtt
gi|13 : gtggtaaacttcctatatcttggttattt---ACTTCCTA-TATCTTGGTTATTTCATA----TGTTCCACCGTTTT-ACCC----CTATCTTTGGACAT------ATGGTGTT-GATATCTTAGCTCTAGTT-ATTTTG--AATAATGCTATGTA-------GA-GTGTTGACCATC----CTT--TCTGGACACATA--CTGTAGACTTTTGACC--ACTT------------GTTCAATCG---------TTTA---TAAAAgacaagtt
gi|13 : gtgtggtatCAT------ATGTTCCA-CCGTTTT-ACCCCTAT---CTTTGGA-CATA---TGGTGTT-------GATATCTTAGCTCTA----GTTATTTTGAATA-ATGCTATGTAGAGTGTTGACCATCCTT------------TCTGGACAC---------ATAC---TGTAGACTTTT----GACCACTTGT-TCAATCGTTTATAAAACT--NNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN----NNNNNNTTCTTAATAAAATCCAAGAGCTT------ATGCCATTATTTActnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcttaataaaatccaagagcttatgccattatttagacaag
gi|14 : gtgtggtatacttcctatatcttggttatttATTTTGTTCATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGTTT------ATGCCATTATTTAgacaag
gi|14 : GTTCACAGAGCATATATGTACCCA-TTTTTAGGTC-------AAGTGCgacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaagttcacagagcatatatgtacccatttttaggtcaagtgctcc
gi|15 : attttgttcataagacacatgtattttattcttaatgaaatccaagagtttatgccattatttagacaaagttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcttatgttttgaaGG--TGG-GG------G-----------T---ACTCCCTA-TTTCTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTATACCC----CT--TTTTGGACAT------ATAATATA-CAGTTTTGACTCCTAATA-CTTTTG--CATAGTGCGATGTT-------GA-GCTTTGACTCTC----CTT--TCTTGAtcc
gi|15 : TTTTGT-CATAAG-ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATAACATCCAAGAGTTT------ATGCAATGGTGTAttcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagttttgtcataagacacatgtattttattcttaataacatccaagagtttatgcaatggtgtagacaaagtt
gi|16 : ggtgggggtactccctatttcttggttagtacatatgtgccgccgtttatacccctttttggacatataatatacagttttgactcctaatacttttgcatagtgcgatgttgagctttgactctcctttcttgattcaattcagggatcaatcccctcctgccaaggaactttaggccaggagG--G--GC---ACTCCCAA-TATCTTGGATAGTACATA----TGAGACGCGGTTTTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATATA-GAGTTTTGA-CCCTATTTATTTTTG--CATGTTGCGAAGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GCTCAATCC---------gacaaagtt
gi|16 : ggTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ATACCATTGTGTAgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacatcttaatgaaatccaagagcttataccattgtgtagacaagg
gi|17 : gggggcactcccaatatcttggatagtacatatgagacgcggttttgacctctctttttggacatatgatatagagttttgaccctatttatttttgcatgttgcgaagtagagctttgaccctcctttctggacacataatgtagacttttgaccccttgctcaatccgggattcaatcccctcctgcctaggaactccaggctaggaacaGTTCATAAG-ACGGAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTC------ATGCCATTGTATAgacaagg
gi|17 : TTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTTCCgactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttacagggcacatatgtacccattttcaggtcaagttccc
gi|18 : gttcataagacggatgtattttattcttaatgaaatccaagagctcatgccattgtatagactaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGGTACATA----CGTGCCGGTGTATTGACCT----CTCTTTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGACGAA-------AA-GCTTTGACACTC----CTT--TCTGGACGCATA--ATCTAGACTTTTG-CC--CCTT------------GTTCAATCC---------c
gi|18 : tctcTTTATTCTTAATGAAATCCAAAAGCTT------ATACCACTGTGTAggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgtttattcttaatgaaatccaaaagcttataccactgtgtagacaacgtt
gi|19 : tctctggtacatacgtgccggtgtattgacctctctttttggacatatgatgtagagttttgacccctatttcttttgcataatgcgacgaaaagctttgacactcctttctggacgcataatctagacttttgccccttgttcaatccggtgttcaatcccttcctgcctagaaacttcagactaggaacttcttggcgCTCCCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----TGTGCCGCCgacaacgtt
gi|19 : gaccAAGAGCTT------ATGCCATTGTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactaggaaagagcttatgccattgtgtagacaaag
gi|2 : gaccctccctatattttggttagtacatatgtgccgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaatcccctcttgtccaggaactccagactagga----TGTGCTGCCGTTTTTATTC----CTCTTTTTGGACAT------ATGNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNNN----NNN--NNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNT------------GTTCAATTC---------TTCA---TAAAAA----T----NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNAAATATTTTGTTCATAAG-ACGCAG-GC----ATTTTACTTTTAATGAAATCCAAAAGCGT------ATGCCATTGTGgacaaag
gi|2 : TTCACACGGCACATATGTACCTA-TTTCCAGACC-------AAGTGCCTCaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaattcacacggcacatatgtacctatttccagaccaagtgcctcctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|20 : tgtgctgccgtttttattcctctttttggacatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttcaattcttcataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatattttgttcataagacgcaggcattttacttttaatgaaatccaaaagcgtatgccattgtgaggacaaagtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgaaa-GG------GA------G--GT---ACTCCCTA-TATATTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGA-----------------------------CCCTATTT-CTTTTG--TATAATGTGATTCA-------GA-ACTTTGACCCTT----CTT--TCTGGACACATT--TTGTAGACTTTTGACC--CGTT------------GTTCAATCC---------ctctggggcatcacttcacatacactactattaaaattacatacaagtgaaa
gi|21 : --AG--G--AC---ACATCCTA-TATCGTGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGACCC----CTC-TTTTGGACAT------ATGATGTA-GAGTTTTGCCCACTA-TT-CTTTTGGACATAAT---ATGTA-------GA-GTTTTGACCCTC----CTT--TCTGTACACATA--AT-TATACTTTTgggttcaatcctctcctatctactaagaactccagacta
gi|22 : tCCGGGGGTTGGTGG------GA------G--GC---ACTCCCTA-TATCTTGGTAAGTATATA----GGTGCCACCGTTTCGATCC----CTCTTTTTGTACGT------ATGATGTA-GAGTTTTGATCCCTATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGCA-------GA-GCTTTTACCCTC----CTT--TCTGAACACcaaaatgccaactgtt
gi|23 : cA----TTTGGCACCGTTTTGAACC----CTCTATTTGGACAT------ATGCTGTA-AAGTTTTGACCCCTCATT-CTTTTG--CATAACGCGATGTA-------GA-AATTTGACCCTC----CTT--
gi|24 : GTGCACAAGGCACATATGTATCCA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCTCgttcaatccggggttcaatcccctcctatctaggaactcaaggctaggaa
gi|26 : gcctatgttttgaaTTTGTTCATAAG-ACGCAA-GT----ATTTTATTCTTAATAAAATCCAAGAATTT------ATGCCATGGTGTAccccgaacaccaccttctctctccctaccaaaatacattgtctaatgaatctatatatttattgaatatacatgtatatct
gi|27 : ggggatcaatcccctcttacctaggaactctaggccaagggtctggaccccgCTA-TATTTTGGTTAGTACATA----AG-------ATTTT-ACCC----GTCTTTTTGGACAT------ATGATGAA-GAGTTTTGACCCCTATTT-CTTT----CTTAATGCGATGTA-------GA-GCgacacagttt
gi|28 : acctaaTGTTCAAAAG-ACACAT-TTTTTTATTTTATTTTTAGTGAATTCCAAGAGCTT------ATGTTATTGTcatatatgtttcgttttgggac
gi|29 : GA-GG------GT--AT--G--AC---ACTCCCTA-TATTTCAGTTCATACATC----TGTGCCGCCATTTTGACCC----CTC
gi|3 : C---ACACCCTA-TATCATTGTAAGTACATACTTATGTACCACCGTTTTGACCC----CTCTTTTTGGAAAT------ATGATGTA-AAGTTTTGACCCCTATTT-CTTTTG--CATTATACGATGTA-------GA-GCCTTAACTCTC----ATT--TCAGGACACATT--ATGTAGACCTTTGACC--CCTTGTTCAATCTGGAGTTTAATCCCCTCCTGCCTCCAGGCTAAAAA----T----GNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----AAAT----TGTCCA-----ACACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGA
gi|3 : tGTTCACAGGGCACATATGTATCCA--TTTCAGGTC-------AAGTACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcacagggcacatatgtatccatttcaggtcaagtacc
gi|30 : tcacaccctatatcattgtaagtacatacttatgtaccaccgttttgacccctctttttggaaatatgatgtaaagttttgacccctatttcttttgcattatacgatgtagagccttaactctcatttcaggacacattatgtagacctttgaccccttgttcaatctggagtttaatcccctcctgcctccaggctaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaattgtccaacacatgtattttattcttaatgaaatccaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG-GA------GAGTAG--G--GCGTCACTCCCTA-TATCTAAGTTAGTACATA----TGTGACACTGTT
gi|4 : gA--GG--G--GT---ACTCCCTA-TATCTTGGTTAGTACATA----TGTG---------------------CT--------AT------ATG-TG-----GTTTTAACTC-TATTT-CTTTTG--CATAATGCGATGTA-------GA-GCTTTGACCCTC----CTT--AATGGACACGCA--ATGTAGACTTTTGA-C--CCTT------------GTTCAATCC---------
gi|4 : TTATG-AACTGCAATACA-TTTTCTTCAAATACAAAA----------A----AAATATTTTGGTCATAAA-ACACATAGT----ATTTTATTCTCAACTAAATCCAAGAGTTT------ATGACATTGTGTAggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|4 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccGTTTACAGTGCACGTATGTATCCA-TTTTTATGGC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaagtttacagtgcacgtatgtatccatttttatggcaagtgcccg
gi|5 : aggggtactccctatatcttggttagtacatatgtgctatatgtggttttaactctatttcttttgcataatgcgatgtagagctttgaccctccttaatggacacgcaatgtagacttttgacccttgttcaatccggaggtcaatcccctcctgcccaggaactctaggctaggaacctcttggccaggaacctggccctcagcctggacccttatgaactgcaatacattttcttcaaatacaaaaaaaatattttggtcataaaacacatagtattttattctcaactaaatccaagagtttatgacattgtgtagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaattttagtttttgcctatgttttgaa--G--GG---ACTCCCTA-TATCCTAGTTAGTACATA----TGTGCCGCCGTTTTTACCCTTATTTCTTTCTGGACAC------GTAATGTA-AACGTTCGACcg
gi|5 : -GTTTTTACCCTTATTTCTT--TCTGGACACGTA--ATGTAAACGTTCGACT--TTTT------------GCTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----G-----TTGTGTCAGT-GTTTGT--CACTGCAGTACACATTTCTT-AAACACAGAATTAAT-----A----AA-CAGTTTGTTCACACG-ACACAT-GT----GTTTTCGTCTTAATGAAATCAAAGAGCTT------ACGCCATTGTTTAtttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|5 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccGTTTACAGGGCACATATGTACCCA-TTTCCAGGTCTCATTTCAAGTGTCCCgacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtttacagggcacatatgtacccatttccaggtctcatttcaagtgtcccccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gggactccctatatcctagttagtacatatgtgccgccgtttttacccttatttctttctggacacgtaatgtaaacgttcgactttttgctcaatccttaataaaaatgttgtgtcagtgtttgtcactgcagtacacatttcttaaacacagaattaataaacagtttgttcacacgacacatgtgttttcgtcttaatgaaatcaaagagcttacgccattgtttagacaaagttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG-GG------GA--GGACG--GC---ACACCCTA-TATCTTTGTTAGTACACA----TGTGCCACGGTTTTGACCC----CTCGTTTACGACAT------ATGATGTAAGAGTTTTGGCCCC-ATTT-TCCTT------AATGCGATGTT-------GA-GCTTTGACGCTC----TTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTTGACC--CCTT------------GTTCAATCC---------ccccccccgggagcaatagtttgacagacacttttttaattacaataacagtataaatataa
gi|6 : gacatcccaAAGAACTT------ATGCCATTGTATAggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|6 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaACAGGGCACATATGTACCTA-TTTTCAGGTC-------AAGTGCCgacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagggcacatatgtacctattttcaggtcaagtgccctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : gacatcccaggggaggacggcacaccctatatctttgttagtacacatgtgccacggttttgacccctcgtttacgacatatgatgtaagagttttggccccattttccttaatgcgatgttgagctttgacgctcttttctggacacataatgtagacttttgaccccttgttcaatccggggttctatcccctcctgccttagagccccaggctaggaaagaacttatgccattgtatagacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-CTTTTG--CATAATGCG----------------TTTTGATCCAT----CTT--GCTGGACATACA--ATGTAGAATTTTGACC--CATT------------GTTCAATCC---------TTAA---CAAAAA----T----Gctccaactacccgggtgacataataaaaaaa
gi|7 : TGTTCATAAACACACAG-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAAGAGCTT------ttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|7 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaaGTTCACAGGACACATATGTACTCA-ATTTCAGGTC-------AAGTACCTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaagttcacaggacacatatgtactcaatttcaggtcaagtacctccctcgggattgcaagaaata
gi|8 : tcttttgcataatgcgttttgatccatcttgctggacatacaatgtagaattttgacccattgttcaatccttaacaaaaatgttgaattgtatagttgtggcaaggaattatatatgtcggttgattctatacaagtcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaatgttcataaacacacaggtattttattcttaatgaaatccaagagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaaaCGGGG--TGG-GGTCGGGAGG--AG--GATGC---ACTCCCTG-TATCTAGGTTAATACATA----TGTGCCGCCGTTTTGGACT----CTCTTTTTGGATATCATTTTATGATGTA-GGGTTTTG--------------------------CGATGCA-------GA-ACTTTAACCTTC----CTT--TCTGGACACATA--GTGTAGATTTTTTACC--CCTT------------ATTCAATCC---------TTAA---TAAAAA----T----cctcgggattgcaagaaata
gi|8 : gtgtgtgtggTTCAAAGGGCACATATGTTCCCATTTTTCAGGTC-------ATGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaaagggcacatatgttcccatttttcaggtcatgtgc
gi|9 : gtgtgtgtggcggggtggggtcgggaggaggatgcactccctgtatctaggttaatacatatgtgccgccgttttggactctctttttggatatcattttatgatgtagggttttgcgatgcagaactttaaccttcctttctggacacatagtgtagattttttaccccttattcaatccttaataaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttagacaaagttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCCCTAACATCTTAGT--------A----TATGCCACTATTGTGATCC----CTCTTTTTGGACAT------ACGATGTA----------CCCCTATTT---TTTG--CATAATGCGATGTA-------AA-GCTTTGATCCTC----CTT--TCTGGACACATA--ATGTAGACTTTT-ACC--CCTT------------GTTCAATCCGGGAT----TCAA---T----------------CCCCTCCTGCCTAG-G-------AAC----ATACA---------ATACATACAA--GAT-----A----------TTTGTTCATAAG-AAACAT-GT----ATTTTATTCTTAATGAAATCCAGGAGTTT------ATGCTATTGTGTA
gi|9 : GTTTACATGGCACATATGTACCCA-TTTTCAGCGC-------AAGTGaacaaagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttacgtttacatggcacatatgtacccattttcagcgcaagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTGTTGAATCCGAGGTTCAATCCCCACTTACCTAGGAACTCCAGACTAGGAACCTGTTGGTAGATTGGAAAGAAGACACAGTGGCACAGACACATCATTCAACATGTGCTTATGCCATGGTGTAGACAAAGTTTT