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gi|8 : ACAAGAGGC----C----CA--AA--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTGCTGGCAACAAATGG-AC--AGATGAACA-TTTCAGAGGAAAAG---TTTTTT-GTAAattaa
gi|9 : AACAAGAGGC----T----CG--AG--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTAATGGCATCAAATGG-AA--GGATGGTCT-TTTCAAAGGAAATG---TTTTTT-GCAAg
blockSeqs : ACGT GTCT TT TT TTT AA GG T CA T TTT G
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originalCons : NAACAAGAGGC----C----CA--AG--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTACTGGCAACAAATGG-AC--AGATGAACA-TTTCAGAGGAAATG---TTTTTT-GTAA
finalCons : NAACAAGAGGC----C----CA--AG--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTACTGGCAACAAATGG-AC--AGATGAACA-TTTCAGAGGAAATG---TTTTTT-GTAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): CAAAAGGCCTCAGAGGGCCTGAAGTCTTTGGACTGAGGAGGCTTTACTAGCTTATAGTGGCCATACCATTT
Unaligned ( gi|34 ): AAGAGGACCGGAATCACTCTACAGGAAACAAACGCTAGAAGAAATATTTTTGGTAAGT
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Unaligned ( gi|39 ): GAATTGCTCTACTTAAAACAAATTGCTATTAGAGCAATATTTTTGGAAA
Alignments
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consensus : NAACAAGAGGC----C----CA--AG--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTACTGGCAACAAATGG-AC--AGATGAACA-TTTCAGAGGAAATG---TTTTTT-GTAA
Reference ( family-1381 ) : NAACAAGAGGC----C----CA--AG--A---GG-GCCT--GA--ATCGCTCTACTGGCAACAAATGG-AC--AGATGAACA-TTTCAGAGGAAATG---TTTTTT-GTAA
gi|1 : AACAAGAGGC----C----CA--AG--AA--GG-GCCT--GA--ATTGCTCTACTGACAACAAATAG-AC--AGATAAACA-CTTCAGAAGAAATA---TTTTTT-GTAA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): CAAAAGGCCTCAGAGGGCCTGAAGTCTTTGGACTGAGGAGGCTTTACTAGCTTATAGTGGCCATACCATTT
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