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Reference ( gi|5 ) : GGTACGAAACGAGTGCTTA--------T----CA-----T---------GC---------TTGTCATGCGTAATTTAAGT-TCTAAA-CA---AGTGTAATGTTCTTA--TCGT-GCA----TG-TAA---T--G-----------T--G-T-TC--TGTATA-ATTTA-T-ATA-C---AAC--C----GT---GT-----G-----CATA--TT---AAGCA-AT-TGGTG-----CT-TGA---CTTGTGTAAATTAGGTA-CCAA--A-C------GT-TTGT----TTCT----CATGGC--------GT---TAGTGCCT-----GTCTTGCGTATA--TT-C--G-G--------CAT-CA-A--ACG-----CATGGTTCT---CCTGCA--ATTAA-----TGC----T-T--GT-CTTGTGTAA--TT-TAAGTA-CCAA--A---C-----GTGT------A-----T-TT-CT----CA------TG--GC--------GT---TAG---TGC-C-T-----GTCTTGCGT-ATA--TT--C-G-G--------CAT-C--AAC--CGT-----GTG--GT-----TCT---C--CTGCA---AT-----TGATG-T----A-----T-GTC----TTG----TGTAATATAA-G-TA-CC--A----CA---C-----AC---GTG-------CTTATC--ATGCA--G-GTAG-G-GCTTT---TCGTG---------TGCAATTTATG----CATCAA--AA----GTG--T---G-GC-----T-ATC--ATGC------C-G----T----TTG-T---G-CTT---TA-AT--TGTGTAATT-T-A-G-T-ACCAG---ACGT---GT-----G----GTT--C---T--C--A------TGC------CG-T--TGGT-AC----A--T--GT-CTTG----TG-TATTTTAT--GT-AGCAAA---CGTGTG--GT--T----TG---CA-TGCA--G--TTGGTGCTTTTC-T-TCTCATGTAATTTTAGT-ACCAAATAA---GT---A-AG-T--TT-C----CATGC-TG--TTGGT-GCTTTA-ATC--GTCT-T-----A-TTT-----GGGTACCAA--ACG----A-G-T-G--------CA-------TATCA--TACATTTGGTGCT---TGTCCTT-TG--TAATTTAAGT-ACC-AATCA---ATCACGTGC--TTATCA
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gi|1 : catcaccaccactgctactacaactaccacATGTGCATA--TCAT-ACAGT--TGGTGA---T--------------T--G-T-CT--CGTGTA-GTTTA-G-GTA-CT--AAA--C----GT---GT-----G-----GATC--TC---ACGTC-GT-TGGTG-----CC-TGT---CTTGTGTCTTTTAGGTA-TCAA--A-C------GT-GCGC----TTAT----CATGCA--------GT---TGGTG-CT-----GTC-----TATA--T-------A--------CATACATA--ACG-----TGTTGTTCT---CATGCC--GCTTA-----TGC----G-T--AT--TTGTGTAA--GT-AAGGTA-CCGA--A---C-----GTGT------G-----C-TA-AT----CA------TG--TA--------GT---TTG---TG------------CTTGTGT-A----------G-G--------TAC-CA-AAA--CGA-----ATG--G------TCT---T--TTGGA---GT-----TGGTG-C----T-----T-GTC----TTA----TGTAATTTAA-A-CT-CC--T----AA---C-----AC---GTGCCACCTACTTATC--ATGCA--G-GTAA-C-CCTTG---TCTTG---------TATTCTTTATG----TACCAC--AC----CTG--T---G-CT-----T-ATC--ATAT------G-A----C----TGG-T---T-CTT---GT-CT--CGTTTAATT-TAA-A-T-ACCAA---ACGC---GT-----A----GTT--A---T--C--A------TGC------CG-T--TGGT-GA----T--T--GT-TTTG----TG-TAATTAAT--GT-ATCGACT--CG-GTG--GT--C----AT---CA-TTCA--A--TTTGTGCTTGTC-T-T---ATGT--T--------CTAAACAA---GT------G-T--TT-------ATAT-TG--CAGGTAGC---A-CTC--GTCT-T-----G-TGTAATAAAGATCTCAA--ACG----G-A-T-GATTTTTACCA-------TG-CAGGTACATGTAGCCAT---TGTCTTC-TG--TAAATTAAAT-ACC-AA---------ACGTGTAGTTATCAagatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattgggaaatggagaaagaataacagaactgttaaaaaaacgataaaagagaggagaaaatggagtaacgaaatagggatagtagagaaggtatccagacaaaagccccttggacaaaagccccttggagcatcaatacaatgaacaattcataaacatatttaagaaaaatcacaaatattatatgttcatgaata
gi|4 : attgatgcTCA--TTAT-GCA----GT-TAG---T--GCT---------T--G-C-CT--TGTGTT-ATTTA-G-GTA-CC--AAA--C----GT---GT-----T-----CATA--TC---ATGCA-GT-AAGTG-----CT-TGC---CTTGTGTTATTTAGGCA-CCAA--A-C------GT-GTGC----TTAT----CATGCA--------GT---TAATGCTT-----GCCATGTGT-TA--TT-TA-G-G--------TAT-AA-A--ACG-----CGTGCTTAC---CATGCA--GTTAG-----TGA----T-T--GC-CTTGTGTAA--TT-TAGGTA-CCAA--A---C-----GTG-------A-----T-GA-CC------------TG--ACACA-----GT---TGG---TGC-T-T-----GTCTTATCT-ATC--TT--A-A-G--------TAC-C--AAA--CGT-----TTG--TT-----TTT---T--ATTTC---GT-----TGGTG------A-----T--TCAA--CTG----TGTAACTTAG-G-TA-CC--A----TA---T-----AC---GTG-------CTTATC--ATGTA--A-GTAG-C-GCTTG---TCTTA---------TGTAATTAAGG----TACCAA--AA----GTA--T---T-AT-----T-CTC--ATGG------C-C----T----TGA-T---G-CT--------T--TGTGTTATT-C-AGG-T-AACAA---ACGT---CT-----G----TTT--A---T--C--A------TGC------AG-T--TGGT-GC----T--T--GT-CTAG----CG-TAATTTAG--GT-ACCAAA---CGCGTAT-GT--T----CT---CA-TGCA--G--TTGGTACTTGTCGT-TTT----TAATTTACCT-ACC---TAAC--GT---G-TGTT--TT-T----CATTC-CG--TTTAT-GCTTTT-ATT--GTAT-A-----A---T-----AGAGACCAA--ACatcatgtgatactttgtcttgtgtaattagggaaccaaacgtgtggttacccttcatgtgtagatttttgtgattatcttgtacgtagcgattgtcttttaagtgtcaaacgcgttaactacacaagaagactgtgtattttgatataaatt
gi|14 : accaagcgtgtgcatatcatgccgttggtgcatgtctttgatattttaagtatcaaatgtgttgttctcttatacgtttgatgactgtcgtgtgtattttaagtaccatacacgttttatcatgcaggtaaggcttgtcgtgtgttattaaggcaTTG--TCAT-GCA----TG-TAG---C--G-----------TTTG-C-CT--TGTATA-ATTAA-G-GTG-CC--AAA--C----AT---TT-----G-----GTTG--TC---ATACA-TA-TAGCG-----TT-TGC---CATATATAACTAAGGTA-CCAA--A-T------GT-GTGG----TTGT----CAT-GC--------ATG--TAGCGTTT-----GGCTTGTATA-A--TTAA--G-G--------TAC-CA-A--ACG-----TGTGGTTGT---CATGCA--at
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gi|6 : aaattttatgattatcacgtttgtggcgtttgcattgtatacttaagctatttaacaggtggtataattaaggcaccaactgtatggGT-GCA----TA-CAA---T--GAAGTCGGTGCTT--G-T-CT--TTTGTA-ATTTA-A-GTA-CC--AAT--CACGTGTCACGT-----G-----CTTA--TC---ACGCAGAT-T--TG-----TTATAT---CTTGTATAATTCAGACA-CTAA--A-C------GTGTTGT----T-CT----CATGCC--------TC---TTGTGCCT-----GTCTTGTGTA
gi|13 : ggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaacaagttaccatgctgttggtgcttcagtcgtcttttttgggtaccaaacga-----------T--G-T-CT--TGTGTA-ATTTA-G-GTA-CC--AAA--C----AT---GT-----G-----CATA--TC---ATGCC-GT-TGGTG-----CC-TGT---CTTGAGTGTTTTAGATA-TTAA--A-A------GT-GTGT----TTTTCTTACACG----------GT---TGTTGCCT-----GTCTTGTGTA-A--TT-T--ATG--------TAC-CA-T--ACA-----CGTGCTTAT---CATACA--GGTAA-----AGA----T-T---T-CGTGTGCAA--TT-TACGTA-TCAA--A---C-----ATAT------G-----G-TT-CT----CA------TA--CC--------GT---aacatctccgattttcttactttctatatttacacatcattccctaaatctacccaaactgtccgtgtgatgtacccttattggactatttatggatatacacaaagaactgaacagaaaaaaagagtataagaataaggttgtaaaggatccgcaaaacaagaatgaagtaataagtatggtaaggaaaacaagtatgaagtaaggattgaaaagaaaaataaagtaagatggaacggataag
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gi|19 : TA-CG--AAA--C----TT---GT-----G-----CTTA--TT---ATGCA-GC-TGGTG-----TT-TGC---TTTGCGTAATTTAAGTA-CCAA--A-
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gi|10 : -C---AAA--C----GA---GT-----G-----CATA--TC---A--TA-GT-TGGTG-----CT-TGT---CTTTTGCAATTTAAGTA-CCAATTA-C------GT---GTCACGTGCT----TATCGC--------GCAGATATTTTAT-----ATCTTATATA-A--TT-CA-G-G--------CAC-TA-A--ACC-----TGTGGTTCT---C-----------A-----TGC----C-T--GT-CTTGTATAaattgtgtaat
gi|6 : cgtctttttttggtacT-TGGTG-----CT-TCA---GTCGTCTTTTTTGGGTA-CCAA--A-C------GA-GTGC----ATAC----AATGAA--------GT---CGGTGCTT-----GTCTTTTGTA-A--TT-T--AAG--------TAC-CA-ATCACGTGTCACGTGCTTAT---CACGCAG-ATT-------TGT----TAT--AT-CTTGTATAA--TT-CAGACA-CTAA--A---C-----GTGT------T-----G-TT-CT----CA------TG--CC--------TC---TTG---TGC-C-T-----GTCTTGTGT-Atacatctccgattttggaaaactttctatgtttttaacacatcattccctatatctaccaaaactgtccgtgtgatgtattcttattggactatttaatttatggatatacacaaagaactgaaaagataaagagtttacaagaatataaggtcggaaaggatccgcaaaacaagaataaagtaagtattgaaaggataagaagaatttagtctgaaaagaagaatttagtctgaaaagaaagttaaagaag
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gi|14 : aaga-TAGCG-----TT-TGC---CTTGTATAATTAAGGTG-CCAA--A-C------AT-TTGG----TTGT----CATA-C--------ATA--TAGCGTTT-----GCCATATATA-A--CT-AA-G-G--------TAC-CA-A--ATG-----TGTGGTTGT---CATGCA--TGTAG-----CGT----T-T--GG-CTTGTATAA--TT-AAGGTA-CCAA--A---C-----GTGT------G-----G-TT-GT----CA------TG--
gi|9 : gttgtcatgcatg---CTTATGTAATTTAAGTA-CCAA--A-TAAACAAGT-T---------CC----CATGCA--------GT---TGGTGCTTTAATCGTCTT----AT---TT-G--G-G--------TAC-CA-A--ACG----------------------------AG-----TGC----T-T--TT-CTTTCGTAA--TT-TAAGTAACCAA--ATCAC-----GTGTC-----A-----CGTT-CT----TA------TC--ACACAGATTTGT---TA----------T-----ATCTTGTAT-A-A--TT--CAG-G--------CAC-T--AAA--CGT-----GGG--GT-----TCT---C--ATGCC---TT-----TAATG-T----C-----T-GTC----TTG----TGTAAcatg
gi|10 : TTTGGTA-CCAA--A-C------GA-GTGC----ATAT----CATAG----------T---TGGTGCTT-----GTCTTTTGCA-A--TT-T--AAG--------TAC-CA-ATTACGTGTCACGTGCTTAT---CGCGCA--GATAT-----TTT----A-T--AT-CTTATATAA--TT-CAGGCA-CTAA--A---C-----CTGT------G-----G-TT-CT----CA-------------------------------TGC-C-T-----GTCTTGTAT-ATA--accttcgattttggtaaactttctatattttttttacacatcattccctaaatctatcaaaactgtccgtgtgatgtatccttattggactatttatagatatacataagaactgaaaaaaaaaagtgtacaagaatataaggttggaaaggatcgacaaaccaagaataaaataataaggatggtaaggaaaacaagtatgaagtaaggattaaaaagaaaaca
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gi|15 : TA-CGAA--A-T------GT-GTGC----TTAT----CATG--------------------CTT-----GTCCTGCTTA-A--TT-T--A-AGAACTAAACAT-TA-A--GTG-----TAATGTTCTTATCATACA--GGTAA-----TG-------T--GT-CCTGTATAA--TT-TATGTA-C--A--A---CT----GTGT------G-----C-TT-AT----TA------T
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gi|6 : g----CATGCT--------GT---TGGTGCTTCAGTCGTCTT-----TT--TT-G--G-G--------TAC-CA-A--ACG-----AGTG--------CATACA--ATGAAGTCGGTGC----T-T--GT-CTTTTGTAA--TT-TAAGTA-CCAATCA---C-----GTGTC-----A-----C-GTGCT----TA------TC--AC--------GC----AGATTTGT-TAT-----ATCTTGTAT-A-A--TT--C-A-GA-------CAC-T--AAA--CGT-----GTT--GT-----TCT---C--ATGCC---TC-----TTGTG-C----C-----T-GTC----TTG----TGTAAtg
gi|13 : ggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaacaagttac---TGGTGCTT-----GTCTTGTGTA-A--TT-TA-G-G--------TAC-CA-A--ACA-----TGTGCATAT---CATGCC--GTTGG-----TGC----C-T--GT-CTTGAGTGT--TT-TAGATA-TTAA--A---A-----GTGT------G-----T-TT-TTCTTACA------CG------------GT---TGT---TGC-C-T-----GTCTTGTGT-A-A--TT--T-ATG--------TAC-C--ATA--CAC-----GTG--CT-----TAT---C--ATACA---GG-----TAAAG------A-----T-TTC----GTG----TGCAATTTAC-G-TA-TC--A----AA---C-----AT---ATG-------GTTCTC--ATAC---C-GT-----GTTTT---AATTG---------TGTAATTTAacatctccgattttcttactttctatatttacacatcattccctaaatctacccaaactgtccgtgtgatgtacccttattggactatttatggatatacacaaagaactgaacagaaaaaaagagtataagaataaggttgtaaaggatccgcaaaacaagaatgaagtaataagtatggtaaggaaaacaagtatgaagtaaggattgaaaagaaaaataaagtaagatggaacggataag
gi|3 : aagaTGTGTA-A--TT-T--A-GA-------TAC-CA-A--ACG-----CGTGTTTCT---CATGTC--GTAGG-----TGC----T-T--GT----GTGTAA--TT-TACGTA-CTAA--A---C-----GTTT------G-----G-TT-CC----CA------TA--TC--------GT---TGG---TGC-C-T-----CTCTTGATT-TTT--TT--A-G-G--------TAT-C--AAA--CCT-----GTG--CT-----TAT---C--AT-CA---AT-----TG-TG-C----T-----T-GTC----GTG----TATAATTTAG-G-TA-CC--A----AA---T-----GC---GTG-------GTTCTC--ATGCC--G-TTGG-T-GCTTG---TCGTT---------TGTAATTTACG----TTCTTA--AC----GTG--T---T-AT-----T-CTC--ATGC------C-G----T----TTA-T---G-CTT---TA-AT--TTTGTAACT-T-AGG-T-ACCAA---ACGT---TT-----G----CTT--A---T--C--A------TGC------AG-T--TCGT-GC----T--T--GT--TTA----TG-TAATGTAG--GT-ACCAAA---CGTGTG--GT--T----CT---CA-TTCC--G--TTGGTGCTTTTA-T-T---ATGTAATTTTGTT-ACCAAGTGC---TT-----GG-T--GC-C----CAAGT-AG--TTGGT-TATTGT-CTT--GTGT-T-----A-TTT-----AAGTACAAA--ACA----C-G-T-G--------CA-------gg
gi|11 : accatcacaacaacaactagtactactactaccatcaccaccaccacccctactactactacctctacgGTATAA-TT-T--A-G---------ATACA-A--AAG-----TGTGCTTAT---TATGCA--ATTGG-----TGC----T-T--GA-CTTGTGTAA--TT-TAGGTG-CCAA--G---C-----GTGT------G-----T-TT-CT----CA------TG--GC--------GT---TAG---TGC-C-T-----ATCTTGCGT-ATA--TT--C-G-T--------CAT-T--AAA--CGT-----GTG--GT-----TCT---C--CTGCA---AT-----CGATG-C----T-----T-GTG----TTG----TGTAATTTAA-G-TA-CC--A----AA---C-----AC---GTG-------CTTATC--ATGTA--G-GTTG-G-GCTTG---TCTTT---------TGTAATTAAGG----TACCTA--AC----GTG--T---G-CA-----T-ATC--ATGC------C-G----T----TGG-T---GACTG---TC-TT--TG-GTATTT-T-AGG-T-ATCAA---ACGT---GT-----G----GTT--C---T--CGTA------TGC------GG-G--TGTT-GC----C--T--GT-ATTG----TG-TAATTTAA--AT-ACCATA---CACGTG--CT--T----AT---CA-TGCA--G--GTACGGCTTGTC-G-T---GTGCAATTTaagtttgagatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatttggaaaagtagaaagaataacggaactgtgaaaaaacgataaaagcgaggagaacatggagtaacgaaatagggatagtagagaaggtatccggacaaaagccccttggacaaaagcccctttgagcatcaatacaatgatcaattcaaaaacatattaaagaaaaaatcacaaatattataattatgttcatgaatat
gi|12 : tGTATA--AT-TAAG-G--------CAC-CA-A--CTG-----TATGGTTAC---CATACA------------TGCAGAAT-T--GTGCTTGTGTAA--TTATGA-CA-TCAA--A---T-----TTGT------G-----G-TT-AT----CACGAATGTG--GC--------GT---T-----TGCAT-T-----GTATT--AT-ATA--------A-G--------TAC-C--GAA--TGT-----TTG--GT-----TGT---C--ATG-------------GATG-T----AGCATTT-GCT----TTG----TATAAC-TAA-GATA-CC--A----AA---T-----AA---GTG-------GT-------TGCA--T-GTAG------------CG----------------TTTAGG----TACCAA--AC----GTG--T---G-GT-----T-ACC--ATGCATGCAGC-G----T----TTG-T-----C---------T--TGTATAATT-A-A-GTT-ACAAA---ATGT---GT-----G----GTTACC---TTGC--A------TGCATGTGACG-T--T-------------T--GC-CTTG----TA-Ta
gi|10 : aaattttatgattatcacgtttgtggcgtttgcattgtatacttaagctatttaacaggtg--TT-T--G-G--------TAC-CA-A--ACG-----AGTGCATAT---CAT--A--GTTGG-----TGC----T-T--GT-CTTTTGCAA--TT-TAAGTA-CCAATTA---C-----GTGTC-----A-----CGTG-CT----TA------TC--GC--------GCAGATAT---TTT-A-T-----ATCTTATAT-A-A--TT--CAG-G--------CAC-T--AAA--CCT-----GTG--GT-----TCT---C-------------------ATG-C----C-----T-GTC----TTG----TATA
gi|8 : cgtctttt-CA-A--CCG-----TGTGCTTAT---AATGCA--ATTGG-----TGC----T-T--GA-CTTGTGTAA--TT-TAGGTA-CCAA--A---C-----GTGT------G-----T-TT-CT----CA------TG--GC--------TT---TAG---TGC-C-T-----GTCTTGTGT-ATA--TT--C-G-G--------CAT-C--AAA--CGT-----GTG--GC-----TCT---C--CTGCA---AT-----TGATA-C----T-----T-GTT----TTG----TGTAATTTCA-G-TA-CC--A----AA---C-----AC---CTG-------CTTATC--ATGCA--G-GTAA-A-GCTTG---TCTTT---------TGTAATTTAAG----TACCTA--AC----GTG--T---G-GT-----T-CTC--ATGT------T-G----T----TTG-T---G-CTT---GT-CT--TGCGCAATA-T-AGG-T-ACCAA---ACGT---GT-----G----CAT--A---T--C--A------TGC------CG-T--TCGTGAC-------T--GT-CTTT----TG-TATTTTAG--GT-ATCAAA---CGTGTG--ATTCT----CG---TA-TGCG--G--TTGTTGC---CC-G-TATTGTGTAATTTAAGT-ACCATACAC---GT------G-C--TTAT----CATGC-AG--GTACG-GC--TG-GTC--GTGTGTA----A-TTT-----AGGCATCAA--ACG----T-G-TAG--------C--------TAATA--TGCCGTTGGTGCT---T-TAATTGTG--TAATtacatctccgattttggaaaactttctatgtttttaacacatcattccctatatctaccaaaactgtccgtgtgatgtattcttattggactatttaatttatggatatacacaaagaactgaaaagataaagagtttacaagaatataaggtcggaaaggatccgcaaaacaagaataaagtaagtattgaaaggataagaagaatttagtctgaaaagaagaatttagtctgaaaagaaagttaaagaag
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gi|10 : TTTTGGT-ACCAAACGA---GT---G-CA-T--AT-C-----ATA---G--TTGGT-GCTT--------GTCT-TTTGCAA-TTT-----AAGTACCAATTACGTGTCACG-T-G--------CT-------TATCG--CGCA---GATATTTTATATCTTA-TA--TAATTCAGGC-ACT-AAcacagatttgttatatcttgtataattcaggcactaaacgtggggttctcatgcctttaatgtctgtcttgtgtaaaccttcgattttggtaaactttctatattttttttacacatcattccctaaatctatcaaaactgtccgtgtgatgtatccttattggactatttatagatatacataagaactgaaaaaaaaaagtgtacaagaatataaggttggaaaggatcgacaaaccaagaataaaataataaggatggtaaggaaaacaagtatgaagtaaggattaaaaagaaaaca
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|4 : accaagcgTCATTATGCAGTTAGTGCT-T-GCCTTGTGTTATTTAGGTACCAAAC-GTGTTCATATC--ATGCAGTAAGTGCTTGCCTTGTGTTATTTAGGCACCAAACGTGTGCTTATCATGCAGTTAATGCTTGCCATGTGT-TATTTAG-GTAT-AA-AACGC-GTGCTTACCATGCAGTTAGTGATTGCCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--TGATGACC------TGACA--CA-GTTGGTGC----TT-----GT-CTT--ATCTATC-T-T-A-AGTACC-AAACGTTTGTTTTT---TATTTC--GTTG---GT-GA--TTCAACTGTGTAACTTAGGTA-CCAT--A-TA-----CGTG-------CTTATC--ATGTAAGTAGCGC-T-TGTCTTATGTAATTAAGGTACCAAAAGTA-TTATTCTC--ATGGCCTTGATGCT----TTGTGTT-ATTC-AGGTAACAAACGTCTGTTTATCATGC-AGTTG--GTGCTTGTCTAGCGTAATTTAGGTACCAAA-CGCGTATGTTCT----CATGCAGTTGGTACTTGTCGT---TTTTAATTTACCTACCTAACGTGT-GTTT----TTCATTCCG--TTTATGCTTTTATTGTATAATAGAG--ACCAAACatgttctcatgcagttggtacttgtcgtttttaatttacctacctaacgtgtgtttttcattccgtttatgcttttattgtataatagagaccaaacat
gi|5 : accaagcgtgtgcatatcatgccgttggtgcatgtctttgatattttaagtatcaaatgtgttgttctcttatacgtttgatgactgtcgtgtgtattttaagtaccatacacgttttatcatgcaggtaaggcttgtcgtgtgttattaaggcaGGTAC-GAAACG--AGTG-CTTATCA--T---------GCTTGTCATGCGTAATTTAAGTTCTAAACAA---GTGTAATGTTCTTATCGTGCATGTAATG-T---GTTCTGTATAATTTATATAC-AACC-GTGTGCATATT--AAGCAATTGGTGCTTGACTTGTGTAAATTAGGTACCAAACGTTTGTTTCTCATGGCGTTAGTGCCTGTCTTGCGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGC-ATGGTTCTCCTGCAATTAATGCTTGTCTTGTGTAATTTAAGTACCAAACG--TG-TA-TT------TCTCATGGC-GTTAGTGC----CT-----GT-CTT--GCGTATA-T-T-C-GGCATC-AACCGTGTGGTTCT---CCTGCA--ATTG---AT-GT--ATGTCTTGTGTAATATAAGTA-CCAC--A-CA-----CGTG-------CTTATC--ATGCAGGTAGGGC-T-TTTCGTGTGCAATTTATGCATCAAAAGTG-TGGCTATC--ATGCCGTTTGTGCTTTAATTGTGTA-ATTT-A-GTACCAGACGTGTGGTTCTCATGC-CGTTG--GTACATGTCTTGTGTATTTTATGTAGCAAA-CGTGTG-GTTTG----CATGCAGTTGGTGCTTTTCTTCTCATGTAATTTTAGTACCAAATAAGTAAGTT----TCCATGCTG--TTGGTGCTTTAATCGTCTTATTTGGGTACCAAACGAGTGC---ATATCATACATTTGGTGC---------TTGTCCTTTGTAATTTAAGTACCAATCAATCACGTGCTTATCAat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-449 ) : GGTAC-GAAACGTGTG--CTTATCG--TT-----GGTGCTTGTCTTGCGTAATTTAAGTNCTAAACAC---GTGTAATGTNCTTATCATGCAGGTAGCG-T-T-GTCTTGTATAATTTAGGTACCAAAC-GTGTGCTTATC--ATGCGATTGGTGCTTGNCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTGTGTTTNTCATGNCGTTAGTGCCTGTCTTGCGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGC-GTGGTTCTCNTGCAGTTAGTGCTTGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--CG-TG-CT------TATCATGCA-GTTGGTGC----TT-----GT-CTT--GTGTA-A-T-T-A-GGTACCAAA-CGTGTGGTTNT---CATGCA--GTTG---GT-GC--TTGTCTTGTGTAATTTAGGTA-CCAA--A-CG-----CGTG-------C-------TTATC--ATGCAGGTAGCGC-T-TGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTG-TGGTTCTC--ATGCCGTTGGTGCTTGTCTTGTGTA-ATTT-A-G-TACCAAACGTGTGNTTATCATGC-CGTTG--GCGCTTGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGC-GTG-GTTAT----CATGCAGTTGGTGCTTGTCTT---GTGTAATTTAGGTACCAAACGTGT-GGTT----TTCATGCCG--TTGGTGCTTTTATTGTGTAATTNNGGTACCAAACGNNTGG---TTATCANGCATTTGGTGC---------TTGTCTTGTGTNATTTAAGTACCAA--A--CGCGTGCTTATCA
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gi|12 : TATGATTATCACGT-TTGTG--GCGTTTGCATTGTATACTTAAGCTAT-------------TTAA----CA-------GGTG-----------GTATAATTAAGGCACCAACTGTAT-GGTTACCATACATGCAGAATTG-TGCTT-----GTGTAATTATGACATCAAATTTGTGG---TTATCACGAATGTGGCGT---------TTGCATTGTATTATATAAGTACCGA--A--TGTTTGGTTGTCA
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gi|4 : accatcacaacaacaactagtactactactaccatcaccaccaccacccctactactactacctctacgTGTGCATATCATGCCGTTGGTG-CAT-GTCTTTGATATTTTAAGTATCAAAT-GTGTTGTTCTCTTATACGTTTGATGACTGTCGTGTGTATTTTAAGTACCATACACGT-TTTATCATGCAGGTAAGGCTTGTCGTGTGT-TATTAAG-GCAT-CA--------------TTATGCAGTTAGTGCTTGCCTTGTGTTATTTAGGTACCAAACG--TG-TT-CA------TATCATGCA-GTAAGTGC----TT-----GC-CTT--GTGTT-A-T-TTA-GGCACCAAA-CGTGTGCTTAT---CATGCA--GTTA---AT-GC--TTGCCATGTGTTATTTAGGTA-TAAA--A-CG-----CGTG-------C-------TTACC--ATGCAGTTAGTGA-T-TGCCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTGATGA-CCTG--ACACAGTTGGTGCTTGTCTTATCTA-TCTTAA-G-TACCAAACGTTTGTTTTTTATTT-CGTTG--GTGATTCAACTGTGTAACTTAGGTACCATATAC-GTG-CTTAT----CATGTAAGTAGCGCTTGTCTT---ATGTAATTAAGGTACCAAAAGTAT-TATT----CTCATGGCC--TTGATGCT----TTGTGTTATTCAGGTAACAAACGTCTGT---TTATCATGCAGTTGGTGC---------TTGTCTAGCGTAATTTAGGTACCAA--A--CGCGTaaagtttgagatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatttggaaaagtagaaagaataacggaactgtgaaaaaacgataaaagcgaggagaacatggagtaacgaaatagggatagtagagaaggtatccggacaaaagccccttggacaaaagcccctttgagcatcaatacaatgatcaattcaaaaacatattaaagaaaaaatcacaaatattataattatgttcatgaatat
gi|4 : accaagcgTCATTATGCAGTTAGTGCT-T-GCCTTGTGTTATTTAGGTACCAAAC-GTGTTCATATC--ATGCAGTAAGTGCTTGCCTTGTGTTATTTAGGCACCAAACGTGTGCTTATCATGCAGTTAATGCTTGCCATGTGT-TATTTAG-GTAT-AA-AACGC-GTGCTTACCATGCAGTTAGTGATTGCCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--TGATGACC------TGACA--CA-GTTGGTGC----TT-----GT-CTT--ATCTATC-T-T-A-AGTACCAAA-CGTTTGTTTTT---TATTTC--GTTG---GT-GA--TTCAACTGTGTAACTTAGGTA-CCAT--A-TA-----CGTG-------C-------TTATC--ATGTAAGTAGCGC-T-TGTCTTATGTAATTAAGGTACCAAAAGTA-TTATTCTC--ATGGCCTTGATGCT----TTGTGTT-ATTC-AGG-TAACAAACGTCTGTTTATCATGC-AGTTG--GTGCTTGTCTAGCGTAATTTAGGTACCAAACGC-GTATGTTCT----CATGCAGTTGGTACTTGTCGT---TTTTAATTTACCTACCTAACGTGT-GTTT----TTCATTCCG--TTTATGCTTTTATTGTATAATAGAG--ACCAAACatgttctcatgcagttggtacttgtcgtttttaatttacctacctaacgtgtgtttttcattccgtttatgcttttattgtataatagagaccaaacat
gi|5 : accaagcgtgtgcatatcatgccgttggtgcatgtctttgatattttaagtatcaaatgtgttgttctcttatacgtttgatgactgtcgtgtgtattttaagtaccatacacgttttatcatgcaggtaaggcttgtcgtgtgttattaaggcaGGTAC-GAAACGAGTG--CTTATCA--T---------GCTTGTCATGCGTAATTTAAGTTCTAAACAA---GTGTAATGTTCTTATCGTGCATGTAATG-T---GTTCTGTATAATTTATATAC-AACC-GTGTGCATATT--AAGCAATTGGTGCTTGACTTGTGTAAATTAGGTACCAAACGTTTGTTTCTCATGGCGTTAGTGCCTGTCTTGCGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGC-ATGGTTCTCCTGCAATTAATGCTTGTCTTGTGTAATTTAAGTACCAAACG--TG-TA-TT------TCTCATGGC-GTTAGTGC----CT-----GT-CTT--GCGTATA-T-T-C-GGCATCAAC-CGTGTGGTTCT---CCTGCA--ATTG---AT-GT--ATGTCTTGTGTAATATAAGTA-CCAC--A-CA-----CGTG-------C-------TTATC--ATGCAGGTAGGGC-T-TTTCGTGTGCAATTTATGCATCAAAAGTG-TGGCTATC--ATGCCGTTTGTGCTTTAATTGTGTA-ATTT-A-G-TACCAGACGTGTGGTTCTCATGC-CGTTG--GTACATGTCTTGTGTATTTTATGTAGCAAACGT-GTG-GTTTG----CATGCAGTTGGTGCTTTTCTTCTCATGTAATTTTAGTACCAAATAAGTAAGTT----TCCATGCTG--TTGGTGCTTTAATCGTCTTATTTGGGTACCAAACGAGTGC---ATATCATACATTTGGTGC---------TTGTCCTTTGTAATTTAAGTACCAATCAATCACGTGCTTATCAat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12 : TATGATTATCACGT-TTGTG--GCGTTTGCATTGTATACTTAAGCTAT-------------TTA--------ACAGGTGGTA--------------TAATTAAGGCACCAACTGTAT-GGTTACCATACATGCAGAATTG-TGCTT-----GTGTAATTATGACATCAAATTTGTGG---TTATCACGAATGTGGCGT---------TTGCATTGTATTATATAAGTACCGA--A--TGTTTGGTTGTCA
gi|12 : aaatttGTATAATTAAGGCACCAACTG--TA-TG-GT------TACCATACA------TGCAGAATT-----GTGCTT--GTGTA-A-T-T-ATGACATCAAA-TTTGTGGTTAT---CACGAA--TGTG---GC-GT--TTGCATTGTATTATATAAGTA-CCGA--A-TG-----TTTG-------G-------TTGTC--ATGGATGTAGCAT-T-TGCTTTGTATAACTAAGATACCAAATAAG-TGGTT-GC--ATG----TAGCG---------------TTT-AGG-TACCAAACGTGTGGTTACCATGC-A--TGCAGCGTTTGTCTTGTATAATTAAGTTACAAAATGT-GTG-GTTACCTTGCATGCATGTGACGTTTGCCTT---GTATtggatgtagcatttgctttgtataactaagataccaaataagtggttgcatgtagcgtttaggtaccaaacgtgtggttaccatgcatgcagcgtttgtcttgtataattaagttacaaaatgtgtggttaccttgcatgcatgtgacgtttgccttgtat
gi|13 : aaattttatgattatcacgtttgtggcgtttgcattgtatacttaagctatttaacaggtgAGATGGTGCTTGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACA--TG-TG-CA------TATCATGCC-GTTGGTGC----CT-----GT-CTTGAGTGT--T-T-T-A-GATATTAAA-AGTGTGTTTTT---CTTACACGGTTG---TT-GC--CTGTCTTGTGTAATTTATGTA-CCAT--A-CA-----CGTG-------C-------TTATC--ATACAGGTAAAGA-T-T-TCGTGTGCAATTTACGTATCAAACATA-TGGTTCTC--ATACC----GTGTTTTAATTGTGTA-ATTT-A-G-
gi|14 : aT------TGTCATGCA-TGTAGCGT----TT-----GC-CTT--GTATA-A-T-T-AAGGTGCCAAA-CATTTGGTTGT---CATACA--TATA---GC-GT--TTGCCATATATAACTAAGGTA-CCAA--A-TG-----TGTG-------G-------TTGTC--ATGCATGTAGCGT-T-TGGCTTGTATAATTAAGGTACCAAACGTG-TGGTTGTC--ATGCg
gi|15 : gTAC-GAAATGTGTG--CTTATCA--T---------GCTTGTCCTGCTTAATTTAAGAACTAAACATTAAGTGTAATGTTCTTATCATACAGGTAATG---T-GTCCTGTATAATTTATGTAC--AACTGTGTGCTTATT--ATACAAatg
gi|19 : GTACGAAAC-TTGTGCTTATT--ATGCAGCTGGTGTTTGCTTTGCGTAATTTAAGTACCAAA
gi|2 : CTATTGCAACTATTACGTTTCGTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--CG-TG-TT------TCTCATGTC-GTTGGTGC----TT-----G----T--GTGTA-A-TGT-A-CGTACTAAA-CGTTTGGTTCC---CATATC--GTTG---GT-GT--CTCTCTTGACTTTTTTAGGTA-TCAA--A-CC-----GGTG-------C-------TTATC--AT-CA-TTGGTGC-T-TGTCGTGTATAATTTAGGTACCAAATGCG-TGGTTCTC--ATGCCGTTGGTGCTTGTCGTTTGTA-ATTT-ACG-TTCTTAACGTGTTATTCTCATGC-CGTTT--ATGCTTTAATTTTGTAACTTAGGTACTAAACGT-TTG-CTTAT----CATACAGTGTGTGCTTGTTTT---ATGTAATGTAGGTACCAAACTTGT-GGTT----TTCGTTCCG--TTGGTGCTTTTATT-----ATT---GTACCAAGTGCTTGG---TTCTCAAGTATTTGGTTC---------TTGTCTTGTGTTATTTAATTACAAA--A--CCCGTGC
gi|3 : catcaccaccactgctactacaactaccactaatactattaTGTGTAATTTAGATACCAAACG--CG-TG-TT------TCTCATGTC-GTAGGTGC----TT-----GT------GTGTA-A-T-TTA-CGTACTAAA-CGTTTGGTTCC---CATATC--GTTG---GT-GC--CTCTCTTGATTTTTTTAGGTA-TCAA--A-CC-----TGTG-------C-------TTATC--AT-CAATT-GTGC-T-TGTCGTGTATAATTTAGGTACCAAATGCG-TGGTTCTC--ATGCCGTTGGTGCTTGTCGTTTGTA-ATTT-ACG-TTCTTAACGTGTTATTCTCATGC-CGTTT--ATGCTTTAATTTTGTAACTTAGGTACCAAACGT-TTG-CTTAT----CATGCAGTTCGTGCTTGT-TT---ATGTAATGTAGGTACCAAACGTGT-GGTT----CTCATTCCG--TTGGTGCTTTTATTATGTAATTTTGTTACCAAGTGCTTGG---TGCCCAAGTAGTTGGTTA---------TTGTCTTGTGTTATTTAAGTACAAA--A--CACGTGCggagtttgagatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaattgggaaatggagaaagaataacagaactgttaaaaaaacgataaaagagaggagaaaatggagtaacgaaatagggatagtagagaaggtatccagacaaaagccccttggacaaaagccccttggagcatcaatacaatgaacaattcataaacatatttaagaaaaatcacaaatattatatgttcatgaata
gi|4 : accatcacaacaacaactagtactactactaccatcaccaccaccacccctactactactacctctacgTGTGCATATCATGCCGTTGGTG-CAT-GTCTTTGATATTTTAAGTATCAAAT-GTGTTGTTCTCTTATACGTTTGATGACTGTCGTGTGTATTTTAAGTACCATACACGT-TTTATCATGCAGGTAAGGCTTGTCGTGTGT-TATTAAG-GCAT-CA--------------TTATGCAGTTAGTGCTTGCCTTGTGTTATTTAGGTACCAAACG--TG-TT-CA------TATCATGCA-GTAAGTGC----TT-----GC-CTT--GTGTT-A-T-TTA-GGCACCAAA-CGTGTGCTTAT---CATGCA--GTTA---AT-GC--TTGCCATGTGTTATTTAGGTA-TAAA--A-CG-----CGTG-------C-------TTACC--ATGCAGTTAGTGA-T-TGCCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTGATGA-CCTG--ACACAGTTGGTGCTTGTCTTATCTA-TCTTAA-G-TACCAAACGTTTGTTTTTTATTT-CGTTG--GTGATTCAACTGTGTAACTTAGGTACCATATAC-GTG-CTTAT----CATGTAAGTAGCGCTTGTCTT---ATGTAATTAAGGTACCAAAAGTAT-TATT----CTCATGGCC--TTGATGCT----TTGTGTTATTCAGGTAACAAACGTCTGT---TTATCATGCAGTTGGTGC---------TTGTCTAGCGTAATTTAGGTACCAA--A--CGCGTaaagtttgagatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatttggaaaagtagaaagaataacggaactgtgaaaaaacgataaaagcgaggagaacatggagtaacgaaatagggatagtagagaaggtatccggacaaaagccccttggacaaaagcccctttgagcatcaatacaatgatcaattcaaaaacatattaaagaaaaaatcacaaatattataattatgttcatgaatat
gi|4 : accaagcgTCATTATGCAGTTAGTGCT-T-GCCTTGTGTTATTTAGGTACCAAAC-GTGTTCATATC--ATGCAGTAAGTGCTTGCCTTGTGTTATTTAGGCACCAAACGTGTGCTTATCATGCAGTTAATGCTTGCCATGTGT-TATTTAG-GTAT-AA-AACGC-GTGCTTACCATGCAGTTAGTGATTGCCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--TGATGACC------TGACA--CA-GTTGGTGC----TT-----GT-CTT--ATCTATC-T-T-A-AGTACCAAA-CGTTTGTTTTT---TATTTC--GTTG---GT-GA--TTCAACTGTGTAACTTAGGTA-CCAT--A-TA-----CGTG-------C-------TTATC--ATGTAAGTAGCGC-T-TGTCTTATGTAATTAAGGTACCAAAAGTA-TTATTCTC--ATGGCCTTGATGCT----TTGTGTT-ATTC-AGG-TAACAAACGTCTGTTTATCATGC-AGTTG--GTGCTTGTCTAGCGTAATTTAGGTACCAAACGC-GTATGTTCT----CATGCAGTTGGTACTTGTCGT---TTTTAATTTACCTACCTAACGTGT-GTTT----TTCATTCCG--TTTATGCTTTTATTGTATAATAGAG--ACCAAACatgttctcatgcagttggtacttgtcgtttttaatttacctacctaacgtgtgtttttcattccgtttatgcttttattgtataatagagaccaaacat
gi|5 : accaagcgtgtgcatatcatgccgttggtgcatgtctttgatattttaagtatcaaatgtgttgttctcttatacgtttgatgactgtcgtgtgtattttaagtaccatacacgttttatcatgcaggtaaggcttgtcgtgtgttattaaggcaGGTAC-GAAACGAGTG--CTTATCA--T---------GCTTGTCATGCGTAATTTAAGTTCTAAACAA---GTGTAATGTTCTTATCGTGCATGTAATG-T---GTTCTGTATAATTTATATAC-AACC-GTGTGCATATT--AAGCAATTGGTGCTTGACTTGTGTAAATTAGGTACCAAACGTTTGTTTCTCATGGCGTTAGTGCCTGTCTTGCGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGC-ATGGTTCTCCTGCAATTAATGCTTGTCTTGTGTAATTTAAGTACCAAACG--TG-TA-TT------TCTCATGGC-GTTAGTGC----CT-----GT-CTT--GCGTATA-T-T-C-GGCATCAAC-CGTGTGGTTCT---CCTGCA--ATTG---AT-GT--ATGTCTTGTGTAATATAAGTA-CCAC--A-CA-----CGTG-------C-------TTATC--ATGCAGGTAGGGC-T-TTTCGTGTGCAATTTATGCATCAAAAGTG-TGGCTATC--ATGCCGTTTGTGCTTTAATTGTGTA-ATTT-A-G-TACCAGACGTGTGGTTCTCATGC-CGTTG--GTACATGTCTTGTGTATTTTATGTAGCAAACGT-GTG-GTTTG----CATGCAGTTGGTGCTTTTCTTCTCATGTAATTTTAGTACCAAATAAGTAAGTT----TCCATGCTG--TTGGTGCTTTAATCGTCTTATTTGGGTACCAAACGAGTGC---ATATCATACATTTGGTGC---------TTGTCCTTTGTAATTTAAGTACCAATCAATCACGTGCTTATCAat
gi|6 : T------TACCATGCT-GTTGGTGC----TTCAGTCGT-CTT--TT------T-T-G-GGTACCAAA-CGAGTGCATAC---AATGAA--GTCG---GT-GC--TTGTCTTTTGTAATTTAAGTA-CCAATCA-CGTGTCACGTG-------C-------TTATC--ACGCAGAT-TTGT-TATATCTTGTATAATTCAGACACTAAACGTG-TTGTTCTC--ATGCCTCTTGTGCCTGTCTTGTGTA-A
gi|7 : ggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaacaagGGTAC-GAAACTTGTG--GTTATCG--TTCAGCTGGTGCTTGCCTTGCTTAATTTAAATACTAAACAC---GTGTAATGTATTTATCATGTAGGTAACA-T-TTGTCTTGTATAATTTCGGTAG-AAGC-AGGTGCTTATC--AT-CGATTGGTGCTTGTCATGTGTAAATTAGGTACCAAACGTGTGGTTCTCATGGCGTTAGTGCCTGTCTATTGTATATTA-G-GCAT-CA-AACGT-GTGGTTCTCCTGCAGTTAGTGCTTGTCTTGTGTAATTTAAGTACAAAACA--CG-TT-CTTACATGTATCATGCA-GGTTGCGT----AT-----GT-CTT--TTATA-ATT-T-T-GGTACCAAT-CTTGTGATTCT---CGTGTT--GTCC---GT-GC--CTTAATTGTGCCATTTAGGTA-CCAA--T-CG-----TGTacatctccgattttcttactttctatatttacacatcattccctaaatctacccaaactgtccgtgtgatgtacccttattggactatttatggatatacacaaagaactgaacagaaaaaaagagtataagaataaggttgtaaaggatccgcaaaacaagaatgaagtaataagtatggtaaggaaaacaagtatgaagtaaggattgaaaagaaaaataaagtaagatggaacggataag
gi|8 : tattgagtatatattgattagaaaatcaaatctagtgcccattatgtaaaatcaatagtcatgtatggatgttgtgtatcaagtgagaaaaCAACC-GTGTGCTTATA--ATGCAATTGGTGCTTGACTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTGTGTTTCTCATGGCTTTAGTGCCTGTCTTGTGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGT-GTGGCTCTCCTGCAATTGATACTTGTTTTGTGTAATTTCAGTACCAAACA--CC-TG-CT------TATCATGCA-GGTAAAGC----TT-----GT-CTT--TTGTA-ATT-T-A-AGTACCTAA-CGTGTGGTTCT---CATGTT--GTTT---GT-GC--TTGTCTTGCGCAATATAGGTA-CCAA--A-CG-----TGTG-------C-------ATATC--ATGCCGTTCGTGA-C-TGTCTTTTGTATTTTAGGTATCAAACGTG-TGATTCTCGTATGCGGTTGTTGCCCGTATTGTGTA-ATTTAA-G-TACCATACACGTGCTTATCATGC-AGGTA--CGGCTGGTCGTGTGTAATTTAGGCATCAAACGT-GTA-GCTAA----TATGCCGTTGGTGCTTTAATT---GTGTAATagaatatcgagggtttggtgcgaaacggttgtaacttatgttttcatcaaaaa
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blockSeqs : C T T C . . A A C G C T . AG . . T C . . T . . . . . G G AATTTA . G G . ATC . . . . . . . C . AGC T . . C . GT G . AA . A T . T . T AA C G G A . TT . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . A T C G C T . CG . . . C . . T . . . . . G G TATTTA . G C . ATC . . . . . . . G . GGT C . . C . TC T . A . A T . G . T TC T G A . .
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blockSeqs : . . . . . . . . T G TTTA . C A . GTT . . . . . . . C . GT T . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . T . TTT . A C . GTT . . . . . . . C . TT A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . TTG . G C . A . . . . . . . C . TT T . . . .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GAAAAGAAAGTTAAAGAAGAATGAAGTAAGAAAAGATAGAAAAACAAAATTGAAATAAGGATGGAAAGGAAAACAAGTATGAACTAAGGATTGAAAATAAAACAAGATTGAAA
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Unaligned ( gi|18 ): TATTGAGTATATTTAGATTAGAAAATCTAGTTCCCAGTAAGAAAAATCTTTAGTCGTGTAAGGATGTGTATCGAGTGAGAAA
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Reference ( family-449 ) : GGTAC-GAAACGNGTG--CTTATC-----G--TT-----GGTGCTTGTCTTGCGTAATTTAAGTNCTAAACAC---GTGTAATGTNCTTATCATGCAGGTAGCG-T-T-GTCTTGTATAATTTAGGTACCAAAC-GTG-TG-CTTATC--ATGCGATTGGTGCTTGNCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTGTGTTTNTCATGNCGTTAGTGCCTGTCTTGCGTATATTC-G-GCAT-CA-AACGC-GTGGTTCTCNTGCAGTTAGTGCTTGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACG--CGTGCT------TATCATGCA-GTTGGTGC----TT-----GT-CTTGTGTA-ATTTAGGTACCAAA-CGTGTGGTTNT---CATGCA--GTTG---GT-GC--TTGTCTTGTGTAATTTAGGTA-CCAA--A-CG-----CGTG-------C-------TTATC--ATGCAGGTAGCGC-T-TGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAACGTG-TGGTTCTC--ATGCCGTTGGTGCTTGTCTTGTGTA-ATTTANGTACCAAACGTGTGNTTATCATGC-CGTTG--GCGCTTGTCTTGTGTAATTTAGGTACCAAA-CGTGTGGTTAT----CATGCAGTTGGTGCTTGTCTT---ATGTAATTTAGGTACCAAACGTGT-GGTT----TTCATGCCG--TTGGTGCTTTTATTGTGTAATTNNGGTACCAAACGNNTGG---TTATCANGCATTTGGTGC---------TTGTCTTGTGTNATTTAAGTACCAA--A--CGCGTGCTTATCA
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