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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-362 ) : TTGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCGCTGC---CACA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCGACCAG-A-C--CTA--GAACT-ATCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----CC--A---AG-----CGAGGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTNAAGT-CTTT-GGTATGACC--CGGCCGGGGATCGAACCCACGA--CCTTCCGCATGCG-AGGCGGAC-------GCTCTA---CCACTAGACCA-CGC
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-362 ) : TTGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCGCTGC---CACA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCGACCAG-A-C--CTA--GAACT-ATCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----CC--A---AG-----CGAGGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTCAAGT-CTTT-GGTATGACC--CGGCCGGGGATCGAACCCACGA--CCTTCCGCATGCG-AGGCGGAC-------GCTCTA---CCACTAGACCA-CGC
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTAGAAAAGGATTAATTGTAGCTTTTGGGATGAACTTTTCTTTACGATTAAAATAAACTATGGCCCCAGGATATGTTCGTAGCATGTGCTATGTCATTTTAATCCCAGTATCACCATAGCTCACCCAATTAGACATGTTTTATGACATGTTGTATGGTTATTGTTTGGAGTAATATTTTAACTACCTAATTGATTAAATTTGATTCAATGTATTTGTATTTGCGGGAGGGTTTTATTAACGGGGTGAAATGAGTTATTTTTCTAACTACATAATCATATACTAGGAGGATATAT
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Reference ( family-362 ) : TTGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCGCTGC---CACA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCGACCAG-A-C--CTA--GAACT-ATCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----CC--A---AG-----CGAGGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTCAAGT-CTTT-GGTATGACC--CGGCCGGGGATCGAACCCACGA--CCTTCCGCATGCG-AGGCGGAC-------GCTCTA---CCACTAGACCA-CGC
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gi|14 : ATGGTGATTAGCGTCACTTTCAACAAT--T-TTTTATTTATA----C------------------AT----GTATTAC----GA----------C-----TT--------TGC---CG-A---C---TTGA--AA--CAGTG---------------------TCGCTGA----TACCTGG----T----A-T--GAT----ACCCCC------------ACTCTATCATATTGCTCCGGCAC-A-AGATTGAACAA-A-T--TTA--AAGCT-GTCATTTAA---ACGTTA-A---GC-G----TC--A---AT-----CGATGA--TGACTATAGGACCA--TTACAAGTACTT----------------------ATT--ACCGACAA--CATTCCGCATGCA-AGACGGTC-------TCTCTA---CCACTTGACTA-t
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gi|21 : gaGA----------CA-GTATTCTAAGCTCTAC---AACA---C---TGGAGTTT--TA-TG---------------------CAGCAGA----CATATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATTCTAACAC-A-AGACTGACCAG-A-C--CTA--GAACT-ATCCTCTAA---ATGCTG-A---TC-T----CC--A---AG-----CGAAGA--AG------------------------TCT-GGTATGACC--CAACCAGGGACCGAACACATGA--CCTTCTGCATGCC-AGACGGTT-------GCTCAA---CCACTAGACTA-
gi|22 : TTGTATGGTGTTTAGCGTCG-TTTCAACACT--T-TTTCAGCCATG----TTGCG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGG----------CA-GTTCTCTGAGCGCTGC---CACA---C---TGGGGCAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGA----C----A-T--AAT----G-CCTA------------CCCCAGTCACTTTTTACTGACAt
gi|23 : tgttgTTGTATCATGTTTAGCAGTGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTTATA----CTGCA--AC---------AGT----GT-CTGCTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGGACAGC---CACA---T---CGGA-------A-TA---------------------CCGCAGA----CACATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCATATTATATTAACAC-
gi|24 : tatg---AG-----CCAGGA--AGCTTCTATTATCATTGTTCAAGT-CTTT-AATATGACC--CGGTTGGGGATCGAATCTACGA--CCTTCCGCATTCG-AAGCGAAT-------GCACTT---CCCCTAGACCt
gi|26 : ccttaactgagtttcgttgaaaaaaattaaat----A-T--GAG----A-CTCA------------ACCCAGTCACATTGTAATGATAC-T-GG-----TCAG-C-C--ATA--AAAC-------------------------GCAG----TC--A---AGCTTCTCGAGAA--AAGTTTTAGTATCA-TTTTAGAGT-ATTT-GGCTT--C----------GGATCGAATCAACTA--CCTT
gi|27 : acatacatttaTTTCTACAAT--C-TTTTAGTCCTA----TCATG--AC---------AATACATGT-CTACAC-AGA----------GA-ATATTATA-GTGCCAA---CACA---C---TGAAAAAC--TA-TG---------------------CC-C-GA----CACGTGA----C----A-T--G------A-CCTC------------A
gi|28 : atggttgacatttagaatttaT--T-TTTCAGTCATA----TCACA--AT---------GAT----GT-CTACTTGAGG----------CA-GTATCAT----GCTGCAGACACATGGC---TTGAGTAA--C------------------------------GA----CACATAG----C----A-TGAGAC----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTTTACTGACA
gi|29 : TCGAACTCACAA--CCTTCCGTATGCA-AAGCGGAC-------CTTCTA---CTCTTAGACCA-tttg
gi|3 : agccctcggttgcataaaccagTTGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTATGTTATA----TCGTG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCACTGT---CAGA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CATATGG----T----A-T--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCAACCAG-A-C--CTA--GAACT-CTCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----TC--A---AG-----CAAGGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTAAAGT-CTTT-GGTATGACT--CGGCCGGGGATTGAACCCACGA--CCCTCCGCATGCG-AGGCGGAC-------GCTCTA---CCACTAGACCA-CGCcgctatagtataggttgctttgtaaaca
gi|30 : tgtagATA----CAGCT--AT---------GGT----GT-TTGCATGAGA----------CA-GTTTTCTATGCGTGGT---CATA---C---CTGAGTAT--CA-TG---------------------T----------TACATGG----T----ACT--GAC----A-
gi|31 : aacattttttttggtttagtagatTG-A---GC-A----CC--A---AG-----CAAGAG--AGCTTCTAGTACCATTATACAAGA-CTTT-GGTAAGACC--CAGCCAAGGATTGAACCCATGA--CC
gi|32 : TGTGTTGTGTTCAGTGTTGCTTTCAACTTT--C-TTTCATTCATA----TCATATTAG---------GGT----AC-ATGTATG-TA----------CATGTATATT-AGTGCTGC---CACA---CAGATGGAatgttgtaccaccagactgcc
gi|33 : tgtaATGC----T----A-T--AAC----A-CCCC------------AACAAGTCATATGTTACTGACAT-C-TGGCTGATTTG-T-C--CTA--G-ACTAATATTCTAA---ATAC
gi|34 : gaagtatcctcttaAGA----------CA-GTATTC-GAGTGGTGC---CACA---T---TTGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACAAGG----T----A-C--GAT----A-
gi|35 : TTGTATGGTTCTGAGCATCGCTTTCAACAA---C-TTACAGTTGTA----TTGCG--A------------T----GT-CTGCTTAAGA----------CA-ATTTTtggagtcctcctgggcaaatta
gi|37 : gTTGTATGGTGTTTAGCGCTGCTTTTAAAAAA--A-AATCAGTTATA----TCCCG--AC-----------T----GT-CTACT
gi|38 : gGTCATATTATACTGACAC-A-TGACTGACTGG-T-T--CTA--GAACA-ATACCCTTA---ATGCTG-
gi|4 : TTGTATTGTGCTTAGCGCCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AC---------GGT----GT-CTACTTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCGCTGT---CACA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGG----T----A-C--GAT----A-CCCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCGACCAA-A-C--CTA--GAGCT-GTCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----TC--A---AG-----CGAGGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTAAAGT-ATTT-GTTATGACC--CGGCCGGGGATCGAACCCACGG--CCTTCCGCATGCG-AGGTGGAA-------TCTCTA---CAACTAGACCA-
gi|40 : gTTGTATGGTGTTTAGTGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCa
gi|42 : gCTCCTGGTACCATATTTCAAGT-C--T-GGTATAAAC--CAGCTGGGGATCAAtcaaatc
gi|43 : AACACTGC---CCCA---C---TGGCGTAT--CA-TG---------------------TCGCAGA----CACA
gi|45 : gATACG-ATGCAGAC-------GCTCTA---CCACTAGACCA-CGCcatcatattg
gi|5 : TTGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCAACAAT--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AC---------GGT----GT-CTACGTGAGA----------CA-GTATTCTAAGCGCTGT---CACA---C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CCGCAGA----GACATAG----T----A-T--GAT----A-ACCC------------ACCCAGTCACATTATACTGACAC-C-GGGCCGACCAG-A-C--CTA--GAACT-TTCCTCTAA---ATGCTG-A---GC-G----TC--A---AG-----CGAAGA--AGCTTCTAGTACCATTTTTAAAGT-CTTT-GGTATGACC--CGGTCGGAGATTGAACCCACGA--CCTTCCGCATGCG-AGGTGGAC-------GCTCTA---CTACTAGACCA-CGCtgc
gi|6 : TTTTATGGTACTTAGTCTCACTTTAAAAAAA--TATTTCAGTCATAAATATAGCC--AC---------GAT----GT-CTACTTGAGA----------CT-GTATCCTGAGTGCTGT---CACC---C---TAAAGTGTAGCA-TG---------------------CCGCAGA----CACATGG----TGTATA-T--AAC----A-CCCC------------ACCCAGTCAAATTATACTCACAA-C-GGGCAGACCAG-A-C--CTATAGAACT-ATCCGCTTA---ATGCTG-A---TC-C----CC--A---AG-----TGAGGA--AGCTTCTTGTACCAGTTGTCAAGT-ATTT-CATATGACC--CGGCCTTGGAT-GGACCCAC-A--CCTTCCTCACAAGTAGGC-CAC-------GCT
gi|8 : gGTATGGTGTTTAGCGTCGCTTTCTACAAG--T-TTTCAGTCATA----TCGCG--AA---------CGT----GT-CTACTTGAG---------------TATCATA-----------CAC----C---TGGAGTAT--CA-TG---------------------CATCAGA----CACATCA----T----A-T--AGT----A-CCCCCCCCCCCCCCCCACCCAGTCACA-TATACT-------------GACCAG-A-C--CTA--GAACT-ATCATCTAT---ATGCTG-A---GC-G----CA--G---AG-----CGAGGC--AGCTTTTAGTACCATTTTTTAAGT-ATTT-GCTATGATC--TGGCCGGAGATCGAACCCACGA--CCTTCCGCATGCG-AGATGGAC-------GCTCTA---TCACTATACCA-CGg
gi|9 : gtaTTGTATGGTGTTTATCGTCGCTTTCAACATT--T-TTTAAGTCAGA----TCCCG--ACCGTGTCTACGGT----GT-CTGCTTGAGA----------CA-GTATACTGAACGCTGC---TACA---C---T--------------------------------------------------------------A-C--GAT----A-CCCC------------AACTAGTCACATTATACCGACAC-A-TGGCCTACCAG-A-C--CTA--CATCT-ATCTTCTAC---AAGCTG-A---GC-A----CC--A---AAT----CGAGGA--AGCTTCTACTATCTTTTTTCAAGT-CTTA-GGTATGACC--CGGCCGGGAATTGAACCCATGA--TCCTCCATAAGCG-AGACGGAC-------GCTCTA---CCACTAGACC
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Unaligned ( gi|7 ): TTAGAAAAGGATTAATTGTAGCTTTTGGGATGAACTTTTCTTTACGATTAAAATAAACTATGGCCCCAGGATATGTTCGTAGCATGTGCTATGTCATTTTAATCCCAGTATCACCATAGCTCACCCAATTAGACATGTTTTATGACATGTTGTATGGTTATTGTTTGGAGTAATATTTTAACTACCTAATTGATTAAATTTGATTCAATGTATTTGTATTTGCGGGAGGGTTTTATTAACGGGGTGAAATGAGTTATTTTTCTAACTACATAATCATATACTAGGAGGATATAT
Unaligned ( gi|25 ): TATATTGACACGTTCTCAACAGAGATTGATCTTTAAGTGGCTTTCCTTAAATATAACGGAAACACATCAAAGATCTGCCAATCTGAAAATTTAGCATTCTTTTATCATTTGTTTATAATTGACACAGCGCGAGAG
Unaligned ( gi|36 ): GATGTGTCATCAATATTTTGTGGCATCCAAAATTCAAATGTAGAAAGGTACATAATGTTTTGCTATA
Unaligned ( gi|39 ): TGCAATACACTATCATTGTAGGTTTAGCAGAAAAGATTAGATAGTTTTACTATC
Unaligned ( gi|41 ): TTTAGATTACAAATTTCCAAAGGGGTAAACCATTTAATTTCCCATAAAAAT
Unaligned ( gi|44 ): TTCATTGATATTATCACTGTATACTGAGTAAGATTATATATGTT