lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222222222222222222222
lowQualScore : 1 1 1 1 1 333333 1 1 111 1 1 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4444 1 1 222222222222222222222 4444 4444444 11 11 1 33333333333 111111 1 1 2222 11 1 44444444444 1
lowQualScore : 2 0 7 2 3 0 2 5 4 1 4 5 888888 2 6 6 5 6 7 888 7 5 7 8 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 2222 3 4 6 444444444444444444444 6 8888 2222222 00 7 44 3 44444444444 7 222222 7 7 7 7 6 3 6666 6 8 88 6 7 6 77777777777 5
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . ...... . . . . . . ... . . . . . ........................................................................... . .... . . . ..................... . .... ....... .. . .. . ........... . ...... . . . . . . .... . . .. . . . ........... .
lowQualScore : 0 5 0 5 2 0 5 0 0 5 0 0 333333 5 0 0 5 0 0 000 0 0 0 3 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 5555 3 7 0 555555555555555555555 0 0000 0000000 77 3 33 3 77777777777 3 333333 3 3 3 0 0 3 7777 7 3 33 0 0 0 33333333333 0
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTANGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATTAAAANTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATNTTTNAGATTTTAGTACCNGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAGAANGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTGATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAATATAGTTGTT-------------TA-----------A-----------------------T------------------------ATTAAGACACCGATATAAACTGTCACGCGTTCTATTAACCAAAGAACC-CCCCNCCCCCCCCCCAC-------ACAC--CCTACACACACACACAC--ACGCTGNCTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGNTATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTAT-CCCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTT-ATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAAT-TT-TT-TATGTCGGAG--GGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TT-TTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
Reference ( gi|3 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAGAAGGTTTGCCTTTATAGTTAATTTGCGATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTGTT-------------GA-----------A-----------------------T------------------------ATTAAGACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACC----AACC-CCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCT---ACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTAT-TCCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTT-ATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAAT-TT-CT-TATGTCGGTG--GGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|1 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcGTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTG
gi|4 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccTGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAGAAGGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTAATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTGTT-------------TA-----------ATATATTATGGACATAACATTAGTT------------------------ATTAAGACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACC----AAAC-CCTTACCCCTCC-C----------------CCTACACACACACAC----ACGCTGAC---AGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATG-TTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAAT-TTGTT-TATATCGGAG--GATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAAgctcc
gi|9 : CTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
gi|8 : atactcataactctttgcgcggatcgtctgcttaaaatgcttaaaaatctatatttcgtctgctacaggtaatcgctatcgaaaatgtccggaatataatgagtgatactcgccgagactttcgtaacatatcgacagtttccagtattttgtttcgctttattgtttcactttatgaaatttaaaataaataaaacaattaatagaacttatttattaTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTGATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTGTT-------------TA-----------A-----------------------TATAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|6 : cAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAA
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGA-----------------------T------------------------ATTAAGCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACCATTCCTCCCCtcaaataatgtttgcatgttaattaacagttccagagaatatagttgtttaatatatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|10 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgCC-CCCCCCCCCCCCCCCAC-------ACAC-----ACACACACACACACtctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|6 : CTGCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTAT-CCCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTT-ATGACCTGTCGTATGCTATATTATTT--GT-------TA--TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAAT-TT-GTGTATGT--GTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAccaagttatgtttatagcatgtggtatatcattttatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgttgtatgctatatttttttggtaattttataacttcttaattgaataaatttggtataaataatgtttttatgtcggagggttccattttcggggtaaaatgcaaactacatatatattggaacgataa
gi|10 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgttaattaacagttccagagaatatagttgtttaatatatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctCCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTAT-CCCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTT-TT-TATGTCGGAG--GGTTCCATTTTCGGGGTAAAATGCA-----------AACTACATATATATTGGAACGAT
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 33333333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777 1 1 2 1 2 333333333
lowQualScore : 1 1 0 4 1 6 1 1 0 1 0 888888 66666666 1 3 0 7 0 4 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 2 2 0000 2 0 1 4 222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 3 1 3 0 0 3 0 0 4 3 2 3 3 3 0 0 333333333 4
lowQualScore : . . . . . . . . . . . ...... ........ . . . . . . .......................................................................... .... . . .... . . . . ................................................ . . . . . . . . . . . . . . . . . . ......... .
lowQualScore : 4 0 8 4 0 7 0 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 2 3 7 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 0 0 3333 5 2 0 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 5 0 2 0 2 0 0 2 8 2 2 2 5 2 2 2 0 0 222222222 2
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGCGATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTGT------------------------TTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAA-AACCCCCCNCCCCTCCCCC---------------CCC-CACACACACACAC--ACGCTG-CT--AGAGCGTTAACA-ATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAAT-TTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG--TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTANGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATTAAAANTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATNTTTNAGATTTTAGTACCNGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTGATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAATATAGTTGT------------------------TTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACCGATATAAACTGTCACGCGTTCTATTAACCAAAGAACCCCCCNCCCCCCCCCCA-------CACAC--CCTACACACACACACAC--ACGCTGNCTCGAGAGCGTTAACA-ATAAAATATGGCCCCAAGNTATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAAT-TT-TTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG--TT-TTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCCCCCCCC-----------------------CACACACAC--ACAC----------------ACACACA---------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTT-ATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTT-TTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA------------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAATTTGCGATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTGT------------------------TGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACC----AACCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTG-CT--ACAGCGTTAACA-ATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAAT-TT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG--TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTAATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTGT------------------------TTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAAA----CCCTTACCCCTCCCCC-------------------TACACACACACAC--ACGCTGAC---AGAGCGTTAACA-ATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATG-TTT-----------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAAT-TTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG--TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCAT-----GTTAATT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAAC----CATTCCTCC------------------CCT-------------------CTGCTTCGAGAGCGTTAACA-ATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAAT-TTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTT-TTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAaacagttccagagaatatagttgtttaatatatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAATTTGTGATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTGT------------------------TTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 222222 33333333 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 222222 1 1 555555555555 2222 1111 1 11111
lowQualScore : 1 0 1 6 1 0 888888 66666666 1 3 33 0 3 2 0 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 333333 8888 33 0 0 111111111111 22 0 1111 5555 2 3 1 3 0 3 3 0 0 4 3 2 3 3 3 8 55555 3 0
lowQualScore : . . . . . . ...... ........ . . .. . . . . . ........................................................................... .... ...... .... .. . . ............ .. . .... .... . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 4 8 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 88 0 2 5 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 333333 2222 88 0 0 222222222222 88 2 2222 0000 5 2 2 2 0 2 2 8 2 2 2 5 2 2 2 8 55555 5 8
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAAGA-CCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAAAACCCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCTAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACAC-------------ACA------------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTTTTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA-----------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATAActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTG------------------------TTGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACC---AACCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCTACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAATTT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-AATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTG------------------------TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAAA---CCCTTACCCCT----C-CC------------CCTACACACACACAC----ACGCTGACAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATGTTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCATGT-TAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTG--TTTAATAT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACC---ATTCCTCC-CC-TC------------T--------------------GCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAATTTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTG------------------------TTTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 222222 33333333 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 33 1 1 555555555555 2222 1111 1 11111
lowQualScore : 1 0 1 6 1 0 888888 66666666 1 3 33 0 3 2 0 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 00 777 33 0 0 111111111111 22 0 1111 2222 2 3 1 3 0 3 3 0 0 4 3 2 3 3 3 8 55555 3 0
lowQualScore : . . . . . . ...... ........ . . .. . . . . . ........................................................................... .... .. ... .. . . ............ .. . .... .... . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 4 8 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 88 0 2 5 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 33 888 88 0 0 222222222222 88 2 2222 8888 5 2 2 2 0 2 2 8 2 2 2 5 2 2 2 8 55555 5 8
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAA--ACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAAGACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACAC-------------ACA------------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTTTTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA-----------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATAActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTG------------------------TTGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAA--CCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCTACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAATTT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-AATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTG------------------------TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAA--ACCCTTACCCCT----C-CC------------CCTACACACACACAC----ACGCTGACAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATGTTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCATGT-TAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTG--TTTAATAT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACC--ATTCCTCC-CC-TC------------T--------------------GCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAATTTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTG------------------------TTTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 222222 33333333 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 1 1 555555555555 2222 1111 1 11111
lowQualScore : 1 0 1 6 1 0 888888 66666666 1 3 33 0 3 2 0 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1 33 0 0 111111111111 22 0 1111 2222 2 3 1 3 0 3 3 0 0 4 3 2 3 3 3 8 55555 3 0
lowQualScore : . . . . . . ...... ........ . . .. . . . . . ........................................................................... .... . .. . . ............ .. . .... .... . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 4 8 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 88 0 2 5 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 0 88 0 0 222222222222 88 2 2222 8888 5 2 2 2 0 2 2 8 2 2 2 5 2 2 2 8 55555 5 8
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACAC-------------ACA------------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTTTTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA-----------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATAActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTG------------------------TTGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAACCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCTACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAATTT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-AATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTG------------------------TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAAACCCTTACCCCT----C-CC------------CCTACACACACACAC----ACGCTGACAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATGTTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCATGT-TAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTG--TTTAATAT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACCATTCCTCC-CC-TC------------T--------------------GCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAATTTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTG------------------------TTTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 222222 33333333 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 1 1 555555555555 2222 1111 1 11111
lowQualScore : 1 0 1 6 1 0 888888 66666666 1 3 33 0 3 2 0 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1 33 0 0 111111111111 22 0 1111 2222 2 3 1 3 0 3 3 0 0 4 3 2 3 3 3 8 55555 3 0
lowQualScore : . . . . . . ...... ........ . . .. . . . . . ........................................................................... .... . .. . . ............ .. . .... .... . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 4 8 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 88 0 2 5 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 0 88 0 0 222222222222 88 2 2222 8888 5 2 2 2 0 2 2 8 2 2 2 5 2 2 2 8 55555 5 8
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACAC-------------ACA------------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTTTTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA-----------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATAActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTG------------------------TTGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAACCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCTACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAATTT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-AATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTG------------------------TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAAACCCTTACCCCT----C-CC------------CCTACACACACACAC----ACGCTGACAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATGTTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCATGT-TAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTG--TTTAATAT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACCATTCCTCC-CC-TC------------T--------------------GCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAATTTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTG------------------------TTTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
blockSeqs : T C C G TTTTTC AATCAAAT G A AG A T G A TTTAATATATACATGGACATACCATTTGATAT TTAA T AC A A ACCACCACACCA CC ACTT TGCT C A A A T T T T T G T T A G TGAGT A
blockSeqs : A A . T . . T A . . T G T TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT . A TC . . . CT . TGAC G A A A . T T C T G T T A G TGCG A
blockSeqs : T T . . T . . . . . T TTTAATATAAACATGGACATCACATTTG . A T . . . . . TTCG G A G A . . . . . . . . . . CGCG T
blockSeqs : A T
blockSeqCons :
originalCons : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
finalCons : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 222222 33333333 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 1 1 555555555555 2222 1111 1 11111
lowQualScore : 1 0 1 6 1 0 888888 66666666 1 3 33 0 3 2 0 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1 33 0 0 111111111111 22 0 1111 2222 2 3 1 3 0 3 3 0 0 4 3 2 3 3 3 8 55555 3 0
lowQualScore : . . . . . . ...... ........ . . .. . . . . . ........................................................................... .... . .. . . ............ .. . .... .... . . . . . . . . . . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 4 8 0 7 0 8 888888 22222222 0 2 88 0 2 5 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 0 88 0 0 222222222222 88 2 2222 8888 5 2 2 2 0 2 2 8 2 2 2 5 2 2 2 8 55555 5 8
consensus : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
Reference ( family-330 ) : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTAACGCCTGGTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATNATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTNAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AANGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGCGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAANATAGTTG------------------------TTTAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAAACCCCCNCCCCTCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACGCTGCNAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATGTCGGAGGGTTTCATTTTCGGGGTAAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATAAA
gi|1 : GTTGCTCCAACTGATCGATAACGGTTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCAATAATCGCTAACGCCTGG
gi|10 : ttcgtcaacagctgtacacttttctagtattgtagtttataataaatctcttcataaactaggatttttgtattcccgtatctagtgaatattaattttgataaaaaagttcacctaatttgatttagatatatttacataatgcacataggacattaaattgtatcggtatacaggccgttaaattgatacttttcctaaatagaagatagtgatagacaaaagttcagggtcaatacagttacctcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcactatagtttcttggtcaaaatcagtgtataggaaatcgaggaccatgagaaaattattaaaaaatgcagacacacataaaataggcatatttaattatatttacacgggtttttcgctaatataattaaaaaaagacgttttatctttagtttcaaaactagcgtgacctaatttgttttatgtaaatattttctgaaatatatctacatagtatcagataatggcacttggagatggttatgtattcataacagtaacgactgatccgatacttaaacataaaactcaatttcatgtgacaactgatcggtggctcctgctttacaaacgctttacattaatacttaaaaacttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgatggtaaaacaggagccaggtgaaatatttgtttgcccccaaaatgaatcgaagcagaaccaaagactttttacaagtatctgacactctttctcttgtccCCCCCCCCCC-CC-CC------------CCCACACACACACAC----ACAC-------------ACA------------CCCAAGTTATGTTTATAGCATGTGGTATATCATTTTA-TCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATGTTTTTATGTCGGAGGGTTCCATTTTCGGGGTAAAA-----------TGCAAACTACATATATATTGGAACGATAActcc
gi|3 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTAAAACTCCCCGTGAAGCAATCCAACGATTTTTAAGATTTTAGTATCAGAAAAGGATTAATTGGAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AAGGTTTGCCTTTATAGTTAAT--TTGC-GATAATTTTGTTAGTTTTAATGTCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATATAAATGTATGTGCAACAGGTAAAGCAATTGTATTCATTTAAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAATAATTG------------------------TTGAATA-----------------------T--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGTCACGTGTTCTATTAACCAACCCCCCTCCCCACCACCACCACCACCACACCACCCACACATACACACACTTACGCTGCTACAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAAATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATT-CCCATAAGTCACACAATTAGACATG-TTTATGGCCTATTGTATGCTATATTTTTTTGGTAATTTCATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTTTAAACAATTT-CTTATGTCGGTGGGTCTCAATTTCGGAGTAAAATGCG-TTATTTTGTTAACTACATATATACTGGAACGATCAA
gi|4 : TGCTCCTACTGGTCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTTACCGTTCAATAATCGTTAACGCCTGGTCTTTTTATGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATATGATGATCATAATTATTAAAACTCCTCATGAAGCAATCCAACAATATTTGAGATTTTAGTACCAGAAAAGGATTAATTGTAGTTTTTGGAATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAGAG--------AAGGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-AATAA-TTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAACTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATTTTAATTAATTAACAGTTCCAGTGAAAAAAGTTG------------------------TTTAATATATTATGGACATAACATTAGTTAT--------------------TAA----GACACTGATATAAACTGACACGTGTTCTATTAACCAAACCCTTACCCCT----C-CC------------CCTACACACACACAC----ACGCTGACAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGATATGTTCATAGCATGTGGTATATCATTTTAATCCCAGTATCTCTTTTAAGTCAAACAATTAGACATGTTT------------TATGCTTTATTTTTTTGGTAATTTTATAACTTCTTAATTGAATAAATTTGGTATAAATAATTTGTTTATATCGGAGGATTTCATTTTCGGGGTTAAACGCG-TTATTTTGCAAACTACATATATACTGGAACGATGAA
gi|5 : GTTGCTCCTACTGATCGATAACGGGTCACAAAAGGTGGATTGATCGTTCGATAATCGCTTACGCCTGTTCTTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATAATAATTATTA
gi|6 : caaaaaggacgttttatctttagtttcaaaactaacgtgacctaatttgttttttgtaaatatttctgaaatatatctacgtagtatgataatggaactttgagacggttatgtattcataaaagtaacgagtgatccgatgcttgaacataaaactcaatttcatgtgccaactgatcgatgacttctgctttacaaacgcttaacattaatacttaaaaatttaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatggtaaaacaggagccatgtgaaatatttgttggtcccaaaatgaatcgaagcagatccaaagactttttacaagtaactgattcacttcctcttgtgcAAATGAATAAATTGTAGATTTTGGGATGAATTTTTCTTTTTCTTTTACGATTTAAAGAATCAAATAATGTTTGCATGT-TAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTG--TTTAATAT
gi|6 : TTAATTAACAGTTCCAGAGAATATAGTTGTTTAATATATACATGGACATACCATTTGATA-----------------------T--------------------TAA----GCCACCGACATAAACTGTCATATGTTCTATTAACCAAAGAACCATTCCTCC-CC-TC------------T--------------------GCTTCGAGAGCGTTAACAATAAAATATGGCCCCAAGGTATGGTCATAGTATGGGGTATGTTATTTTAATCCCAGTATC-CCCATAAGTCACACAATTAGACATGTTTTATGACCTGTCGTATGCTATA-TTATTTG------TTA----TTC-TAATTG-ATAAATTTGGTACAAATAATTTGTGTATGTGTGAAAGTTTCATTTAAGGGGTAAAATGAGTTTTTTTTATAAACTATATTCATACTTGAACGATAAAatacatggacataccatttgatattaagccaccgacataaactgtcatatgttctattaaccaaagaaccattcctcccctctgcttcgagagcgttaacaataaaatatggccccaaggtatggtcatagtatggggtatgttattttaatcccagtatccccataagtcacacaattagacatgttttatgacctgtcgtatgctatattatttgttattctaattgataaatttggtacaaataatttgtgtatgtgtgaaagtttcatttaaggggtaaaatgagttttttttataaactatattcatacttgaacgataaa
gi|8 : aaatgaataaattgtagattttgggatgaatttttctttttcttttacgatttaaagaatcaaataatgtttgcatgTTTTAGGACCTATTTGACGATTTCAAGTAGTTCAAATGAGTTATCTCGTGATTATAATTATCAAAAATCCC-GTGAAGCAATCCAACGATTTTTTAAATTTTAGTATCTGAAAAGGATTAATTGCAGTTTTTGGGATGAA------CTTTTCTTTTACGATTTAAAG--------AATGTTTGCCTTTACAGTTAAT--TTGT-GATAATTTTGTTAGTTTTAATATCATCCTACACTTACTAAGCTCCTTTTATTTAAATGTATGTGTGGCAGGTTAAGCAATTTTATTCATCTTAATTTATTAACAGTTCCAGTGAATATAATTG------------------------TTTAATA-----------------------TAAACATGGACATCACATTTGTAATTAAGACACTGATATAAACTGTCACACGTTCT
gi|9 : cCTACTGAACGATAACAGGTCACATAAGGTGGATTGTTCGTTCAATAATCACTAACGGCTAGACTTTTTACGACTTATTTGAAAATT--GAGTAGTTCAAACGAGTTATCTCGTGATTATTATTAT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TCGTCAACAGCCGTACAGTATTCTAAGTTGTAGTTTATAATAAATCTCTTCATAAACTAGGATTTTGTATTCCCTTATCTAGTGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTCACTTTTTTAGATATATTTACACAATGCACATAGGACATTTAAATGTATCGGTATGCAGGTCGTTAAATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAGACTAAATTTCAGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACTATAGTTTCTTGGTCAAAATCATTATACAGGAAATCGAGGACCATGAGAATATTATTAAAAATGCAGACATTCATAATACAGGCATATTTAATCATATTTACGCGGGTTTTTCGCTAATTTAATCAAAAAGGACCTTTTATCTTTAGTTTCAAAACTACCGTGACCTTATTTGTTTTATTTAGATATTTTCTGAAATATATCTACATAGTATCAGATAATGGCACCTGGAGATGGCTATGTATTCATAACAGTAACGACTGGTCAGATGATTGAATATAAAACTCAATTTCATGTGCCAACTGATCGATGGCTTGTGCTTTACAAATGCTTTACATTAATACTTAAAAACATAACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGTAAAACAGAAGCCAGGTGAAATATTTGTTGGCCCCAAAATGAATCG
Unaligned ( gi|7 ): TTTTCTACGCAGTTTTAATGTAACATTTCTTCATTAACTAGGATTTTTGTATTCCTATATCTAATGAATATTAATTTTGATAAAAATGTTTTTTTTAGATATATCTACATAATGCCATAGGACAATAAAATGTATCGGTGTGCAGGCCGTTATATTGATACTTTTCCTAAATAAAAGATAGTGATAAACAATTTCAGGGTCAATAAAGAGACCTCAAATTTTGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCACTTCACTATAGTTTCTTGGTTAAAATCAGTGTATAGAAATCGAGAACCATGAGAGTATTGTTAAAAAGCAGACACACATGATATAGGCATATTTAATTATATTAAAGCGGGATTTTCGCTAAT
Unaligned ( gi|11 ): GGCTTCTGTTTCACCAACATTTTACTTAATTACTTAAAAACTTAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTGGTGAAACAGGAGC
Unaligned ( gi|12 ): GCATTTTTTTGTATTCCCGTATCTAGAGAATATTAATTTATATAAAAAAATGTTCATTTATTTTATTTTTTTACATATATCTACATAATGAACATTGCACATTAAAATTTATCGGTATGCAGGCCGTTAAATTG
Unaligned ( gi|13 ): CTGGCTTCGGTTTCAACAACATTTTACTAAAATACTTAAGCACTAAGCTT
Unaligned ( gi|14 ): GATGTATACTCTTAAATACTTCATGACTTAATTTAGACGAGTTATTT
Unaligned ( gi|15 ): ATCTGTTTCATCAACATTTTACTGGAATACTTAAAAACTTAA
Unaligned ( gi|16 ): GTACATGAGTTTTTATGAATTTCAATACAAATGAGTTGA