lowQualScore : 1 33333333333 11111111111 1 2222222 22222
lowQualScore : 4 4 1 555 6666 2 444 5 3 2 11111111111 5 2 44444444444 6 0 555 5555555 4 11111 6
lowQualScore : . . . ... .... . ... . . . ........... . . ........... . . ... ....... . ..... .
lowQualScore : 6 5 0 000 1111 6 555 2 9 4 00000000000 5 9 55555555555 1 5 444 1111111 5 00000 0
consensus : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCTT---AAGCAGCC----ACATTT--GCTATTTCCCATTTCTATGCTTT--CN-------GAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGT-CTTAA--A------AAGGCCACTTTTGCTCC---TTCCC------TTGACTGGCTGC----TTAAGACAGGTTTGACTGT
Reference ( gi|7 ) : TCAAACCTGTGTAAGCAGCCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCTT---AAGCAGCC----ACAGTT--GCTATTTTCCGTTTCTATACTTT--AT-------GAGCAAATTAACCTGCATTAAGCAACAACCTGT-CTTAA--A------AAGGCCAGTTTTGCTCC---TTCCC------ATGATTGGCTGG----TTAAGACAGGTTTGACCGT
gi|11 : TCAAACCTGTGCAAGCGGTCACCTCTGTTAAGCAGCCACTTGTCTT---AAGCAGCC----ACATTT--GTTATTTCCTGTTTCAATGCTTT--CA-------GAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAGCCTGT-CTT-A--A------AGGGCCACTTTTGCCCC---TTCCC------TTGA
gi|6 : cagTCAAACTTGTGAAAGAGATCACCTCTATAAGGCAACCCCCTGTCTT---A-GCAGCC----ACAATTTTGCTATTTCCCGTTTCTACACTTTCAGT-------AA--AAATTAACCTGTATTTAGCAACAACCTGT-CTT-A--A------GAGGCCAGTTTCGCTCC---TTCCA------TTGACTGACTG-------AAGACAAGTTTGACTGT
gi|12 : agTCAAACCTGTGTAAGTGGTCACCTCAATTAATCAGTCACCTGTCTT---TAGCAACC----ATATTT---CTATTTCCCATTTCTATGCTTT--CA-------GAGTAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGT-CTT-G--A------AAGGCCAGTTTTGCTCT---TTCCC------a
gi|3 : aatacagTCGAACCTGTACAAGTGTTCACCTCTGTTGGGCAGCCACTTGTCTT---AAGCACCC----ACCTTT--GCTATTTTCAATTTCTATGCTTT--CA-------GAACAAATTAACCCATATTAAGCAACAACCTGT-TTT-A--A------AGGGTCATTTTTGCCCCCCTTTCTT------GTGGTT---TAG----TAAATACAGGTTTGACTGTt
gi|10 : acagTCAAACCTGTATAAGCGGTCTCCTCTATTAAGCAGCCATTTGTCTT---ATGCGACC----ATATTT--GTTATTTTCCACTTCTATCTTCT--ATTCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGT-CTTAA--A------AA-GCCATTTTTCTTCC---TTCCa
gi|8 : atacagTCAAACTTATGTAAG-AGTCACCTCTATTGAGCAGTCACCTTTCTT---AAGCAGCC----ACATTT--GCTATTTCTCATTTCTCTACTTT--CA-------GAACAAATCAACCTGTATTGAGAAACAAC---T-TCTAATTA------AGGGTTACTTTTGT------------------TAACTGACTGC----TTAAGACAGGTTTGACTGTactg
gi|5 : cagTCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTTTTGAACAACCACTTATCAT---AAACAGCC----ATATTT--GTTATTTCC--TTTCTATACTTT--CA-------GAACAAATTAACCTGTATTAAGCATCAATCTGT-CTTAA--ATATCACAA---CAAATTTAATAT---TTCAT-------TGACCGGCTGC----TTCAGTCAGATTTGACtg
gi|13 : TCAGACCTGTGTAGGCGGCCATCTTT------------CTT---TT---GAACAGCT----AC-----------TTCCCATTTCTATGATTT--CT-------GAGTAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACC------TAA--A------AAGGCCACTTTTGCTAC---ATCCC------TTGACTGGCTGC----TTAAGACTGATTGGACTtaaaat
gi|2 : tacagAAACCCATGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCTTTAAAAGCAGCC----ACGTTT--ACTATTTTCCTTTTTAATGTTTC--A--------GAGCAAAGTAACTTGTGTTAAGCAACAACCTGT-CTT-A--G------AAGGCCACTTTTGCTTC---TGCCC------TTAACTGGCTGC----TAAAGACAGGTTTCACTGT
gi|4 : tacagtaAAACCTATGTAAGCGATCACCTCTGTTAAGCAGCCACCTGTCTT---AGGTAACC----ATATTT--TCTGTTTCCCATTTATATGCTTT--CA-------GAGTTGATTATCCTGTATTAAGCAACAACCTGT-CTTAA--A------AA-GCCACAATTACTCT---TTCCC------TTAACTTGCTGC----TTAAGACAGGTTTGACTGTa
gi|14 : cagtaCTGTGCAAGCGGTCACTTCAACTAAGCAGCCAGTTGTCTC---AAACAGTCTTAAACAGTC--AC-ATTT---GTTTTTTTA--TT--AT-------G-GTAAATTAACGTGCATTAAGCAACAACCTGT-TCTAA--A------AGGaa
gi|9 : agtaaCCTCTATTGAGCAGCCTCTTGTCTT---AAGCAGAC----ACGTTC--GCTTTATCCCATTTCTATGCTTT--CA-------GAGCAATGCAACCT---TTAAGATATTACCTGT-CTT-G--A------AATACCATTTTTGGTCA---TTCCC------TTTGCGGGTTGC----TTAAGGCAGGTTTtcgctt
gi|15 : tagtggTT---AAGCAGCT----AAATTT--ACTATTTCCCATTTCTATGCTTT--CG-------AAACAGA-TATCCTGTATTAAGC--------------AA--A------AATACCACTTATGTTTC---TTCCC------TTGACTGACTGC----TTCAGACAGGATTGACTGTttttactgta
gi|1 : gtTT---AAGCAGAC----ACATTT--GTTATTTCCCATTTCTATGCTAT--AC--------ATCAAATTGACTTGTACTAAACAAGAG---GTACT--------------------TTTCGTTCC---TTCCCTTGTATATAACTGACTGGGTCCTTAAGACAGGTTTTATTGT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CGATAATGAATTTATCAATTCTGAATATATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1
lowQualScore : 0 1111111111 444 33 8888888 1 2 33 3 66666 2 33 999999 7777 3
lowQualScore : . .......... ... .. ....... . . .. . ..... . .. ...... .... .
lowQualScore : 2 7777777777 777 77 7777777 9 2 77 3 77777 9 44 666666 7777 6
consensus : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
Reference ( family-470 ) : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCNGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|1 : T----------T---AAGCAGACACA--TTTGTTATTTCCCA-------TTTCTATGCTAT-ACATCAAATTGACTTGTACTAAAC--------------A--AGAGG-TAC-----TTTTCG-TTCCTTCCCTTGTATATAACTGACTGGGTCCTTAAG-ACAGGTTTTATTGT
gi|10 : acaatttagaaacaactacagtgtacatcatgattatacagtcaaaactcaagaaacagtaactccaTCAAACCTGTATAAGCGGTCTCCTCTATTAAGCAGCCATTTGTCT----------T---ATGCGACCATA--TTTGTTATTTTCCACTTCTATCTTCTATTCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAT-----TTTT-C-TTCCTTCCa
gi|11 : atacagTCAAACCTGTGCAAGCGGTCACCTCTGTTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGTTATTTCCTG-------TTTCAATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAGCCTGTCTT-A--AAGGGCCAC-----TTTT-G-CCCCTTCCCTTG------Aactg
gi|12 : cagTCAAACCTGTGTAAGTGGTCACCTCAATTAATCAGTCACCTGTCT----------T---TAGCAACCATA--TTT-CTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGTAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTT-G--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCTTTCCCT
gi|13 : aatacagTCAGACCTGTGTAGGCGGCCATCTTT------------CTT---T----------T---GAACAGCTAC-----------TTCCCA-------TTTCTATGATTTCTGAGTAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACC-----TAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTACATCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACTGATTGGACTG
gi|14 : tacagCTGTGCAAGCGGTCACTTCAACTAAGCAGCCAGTTGTCTCAAACAGTCTT---AAACAGTCACA--TTTGTTTTTTT--A-------TT---ATG--------GTAAATTAACGTGCATTAAGCAACAACCTGTTCT-A--AAAGGTCGC-----TT
gi|15 : agtaaT----------T---AAGCAGCTAAA--TTTACTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCGAAACAGA-TATCCTGTATTAAGC-------------AA--AAATACCAC-----TTAT-G-TTTCTTCCCTTG------ACTGACTG----CTTCAG-ACAGGATTGACTGT
gi|2 : gtAAACCCATGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------TTAAAAGCAGCCACG--TTTACTATTTTCCT-------TTTTAATG-TTTCAGAGCAAAGTAACTTGTGTTAAGCAACAACCTGTCTTAG--AA-GGCCAC-----TTTT-G-CTTCTGCCCTTA------ACTGGCTG----CTAAAG-ACAGGTTTCACTGT
gi|3 : tacagtaTCGAACCTGTACAAGTGTTCACCTCTGTTGGGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCACCCACC--TTTGCTATTTTCAA-------TTTCTATGCTTTCAGAACAAATTAACCCATATTAAGCAACAACCTGTTTT-A--AAGGGTCAT-----TTTT-GCCCCCCTTTCTTG--------TGGTTT----AGTAAATACAGGTTTGACTGTa
gi|4 : acagAAACCTATGTAAGCGATCACCTCTGTTAAGCAGCCACCTGTCT----------T---AGGTAACCATA--TTTTCTGTTTCCCA-------TTTATATGCTTTCAGAGTTGATTATCCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAC-----AATT-A-CTCTTTCCCTTA------ACTTGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGTa
gi|5 : cagtaTCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTTTTGAACAACCACTTATCA----------T---AAACAGCCATA--TTTGTTATTTCC---------TTTCTATACTTTCAGAACAAATTAACCTGTATTAAGCATCAATCTGTCTTAA--ATA--TCACAACAAATTT-A-AT-ATTTCATTG------ACCGGCTG----CTTCAG-TCAGATTTGACTaa
gi|6 : TCAAACTTGTGAAAGAGATCACCTCTATAAGGCAACCCCCTGTCT----------T---A-GCAGCCACAATTTTGCTATTTCCCG-------TTTCTACACTTTCAGTAAAAATTAACCTGTATTTAGCAACAACCTGTCTT-A--AGAGGCCAG-----TTTC-G-CTCCTTCCATTG------ACTGACTG-------AAG-ACAAGTTTGACTGTaaaat
gi|7 : agTCAAACCTGTGTAAGCAGCCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--GTTGCTATTTTCCG-------TTTCTATACTTTATGAGCAAATTAACCTGCATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCCTTCCCATG------ATTGGCTG----GTTAAG-ACAGGTTTGACCGTa
gi|8 : TCAAACTTATGTAAG-AGTCACCTCTATTGAGCAGTCACCTTTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCTCA-------TTTCTCTACTTTCAGAACAAATCAACCTGTATTGAGAAACAAC---TTCTAATTAAGGGTTAC-----TTTT-G----------TTA------ACTGACTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|9 : cagCCTCTATTGAGCAGCCTCTTGTCT----------T---AAGCAGACACG--TTCGCTTTATCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAATGCAACCT---TTAAGATATTACCTGTCTT-G--AAATACCAT-----TTTT-G-GTCATTCCCTTT------GCGGGTTG----CTTAAG-GCAGGTTTtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CGATAATGAATTTATCAATTCTGAATATATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1
lowQualScore : 0 1111111111 444 33 8888888 2 33 3 66666 2 33 999999 7777 3
lowQualScore : . .......... ... .. ....... . .. . ..... . .. ...... .... .
lowQualScore : 2 7777777777 777 77 7777777 2 77 3 77777 9 44 666666 7777 6
consensus : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
Reference ( family-470 ) : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|1 : T----------T---AAGCAGACACA--TTTGTTATTTCCCA-------TTTCTATGCTAT-ACATCAAATTGACTTGTACTAAAC--------------A--AGAGG-TAC-----TTTTCG-TTCCTTCCCTTGTATATAACTGACTGGGTCCTTAAG-ACAGGTTTTATTGT
gi|10 : acaatttagaaacaactacagtgtacatcatgattatacagtcaaaactcaagaaacagtaactccaTCAAACCTGTATAAGCGGTCTCCTCTATTAAGCAGCCATTTGTCT----------T---ATGCGACCATA--TTTGTTATTTTCCACTTCTATCTTCTATTCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAT-----TTTT-C-TTCCTTCCa
gi|11 : atacagTCAAACCTGTGCAAGCGGTCACCTCTGTTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGTTATTTCCTG-------TTTCAATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAGCCTGTCTT-A--AAGGGCCAC-----TTTT-G-CCCCTTCCCTTG------Aactg
gi|12 : cagTCAAACCTGTGTAAGTGGTCACCTCAATTAATCAGTCACCTGTCT----------T---TAGCAACCATA--TTT-CTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGTAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTT-G--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCTTTCCCT
gi|13 : aatacagTCAGACCTGTGTAGGCGGCCATCTTT------------CTT---T----------T---GAACAGCTAC-----------TTCCCA-------TTTCTATGATTTCTGAGTAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACC-----TAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTACATCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACTGATTGGACTG
gi|14 : tacagCTGTGCAAGCGGTCACTTCAACTAAGCAGCCAGTTGTCTCAAACAGTCTT---AAACAGTCACA--TTTGTTTTTTT--A-------TT---ATG--------GTAAATTAACGTGCATTAAGCAACAACCTGTTCT-A--AAAGGTCGC-----TT
gi|15 : agtaaT----------T---AAGCAGCTAAA--TTTACTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCGAAACAGA-TATCCTGTATTAAGC-------------AA--AAATACCAC-----TTAT-G-TTTCTTCCCTTG------ACTGACTG----CTTCAG-ACAGGATTGACTGT
gi|2 : gtAAACCCATGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------TTAAAAGCAGCCACG--TTTACTATTTTCCT-------TTTTAATG-TTTCAGAGCAAAGTAACTTGTGTTAAGCAACAACCTGTCTTAG--AA-GGCCAC-----TTTT-G-CTTCTGCCCTTA------ACTGGCTG----CTAAAG-ACAGGTTTCACTGT
gi|3 : tacagtaTCGAACCTGTACAAGTGTTCACCTCTGTTGGGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCACCCACC--TTTGCTATTTTCAA-------TTTCTATGCTTTCAGAACAAATTAACCCATATTAAGCAACAACCTGTTTT-A--AAGGGTCAT-----TTTT-GCCCCCCTTTCTTG--------TGGTTT----AGTAAATACAGGTTTGACTGTa
gi|4 : acagAAACCTATGTAAGCGATCACCTCTGTTAAGCAGCCACCTGTCT----------T---AGGTAACCATA--TTTTCTGTTTCCCA-------TTTATATGCTTTCAGAGTTGATTATCCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAC-----AATT-A-CTCTTTCCCTTA------ACTTGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGTa
gi|5 : cagtaTCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTTTTGAACAACCACTTATCA----------T---AAACAGCCATA--TTTGTTATTTCC---------TTTCTATACTTTCAGAACAAATTAACCTGTATTAAGCATCAATCTGTCTTAA--ATA--TCACAACAAATTT-A-AT-ATTTCATTG------ACCGGCTG----CTTCAG-TCAGATTTGACTaa
gi|6 : TCAAACTTGTGAAAGAGATCACCTCTATAAGGCAACCCCCTGTCT----------T---A-GCAGCCACAATTTTGCTATTTCCCG-------TTTCTACACTTTCAGTAAAAATTAACCTGTATTTAGCAACAACCTGTCTT-A--AGAGGCCAG-----TTTC-G-CTCCTTCCATTG------ACTGACTG-------AAG-ACAAGTTTGACTGTaaaat
gi|7 : agTCAAACCTGTGTAAGCAGCCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--GTTGCTATTTTCCG-------TTTCTATACTTTATGAGCAAATTAACCTGCATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCCTTCCCATG------ATTGGCTG----GTTAAG-ACAGGTTTGACCGTa
gi|8 : TCAAACTTATGTAAG-AGTCACCTCTATTGAGCAGTCACCTTTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCTCA-------TTTCTCTACTTTCAGAACAAATCAACCTGTATTGAGAAACAAC---TTCTAATTAAGGGTTAC-----TTTT-G----------TTA------ACTGACTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|9 : cagCCTCTATTGAGCAGCCTCTTGTCT----------T---AAGCAGACACG--TTCGCTTTATCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAATGCAACCT---TTAAGATATTACCTGTCTT-G--AAATACCAT-----TTTT-G-GTCATTCCCTTT------GCGGGTTG----CTTAAG-GCAGGTTTtg
blockSeqs : CAAACAGTCT TAA AT CTTCTAT A TT G AACAA . CC . . T
blockSeqs : . . . . A . G . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . G . . C . . .
blockSeqs : . . . . A . G . . C . . .
blockSeqs : . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . A . G . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . G . . C . . .
blockSeqs : . . . . A . G . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : ****** ****
originalCons : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
finalCons : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CGATAATGAATTTATCAATTCTGAATATATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1
lowQualScore : 0 1111111111 444 33 8888888 2 33 3 66666 2 33 999999 7777 3
lowQualScore : . .......... ... .. ....... . .. . ..... . .. ...... .... .
lowQualScore : 2 7777777777 777 77 7777777 2 77 3 77777 9 44 666666 7777 6
consensus : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
Reference ( family-470 ) : TCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTCCTTCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|1 : T----------T---AAGCAGACACA--TTTGTTATTTCCCA-------TTTCTATGCTAT-ACATCAAATTGACTTGTACTAAAC--------------A--AGAGG-TAC-----TTTTCG-TTCCTTCCCTTGTATATAACTGACTGGGTCCTTAAG-ACAGGTTTTATTGT
gi|10 : acaatttagaaacaactacagtgtacatcatgattatacagtcaaaactcaagaaacagtaactccaTCAAACCTGTATAAGCGGTCTCCTCTATTAAGCAGCCATTTGTCT----------T---ATGCGACCATA--TTTGTTATTTTCCACTTCTATCTTCTATTCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAT-----TTTT-C-TTCCTTCCa
gi|11 : atacagTCAAACCTGTGCAAGCGGTCACCTCTGTTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGTTATTTCCTG-------TTTCAATGCTTTCAGAGCAAATTAACCTGTATTAAGCAACAGCCTGTCTT-A--AAGGGCCAC-----TTTT-G-CCCCTTCCCTTG------Aactg
gi|12 : cagTCAAACCTGTGTAAGTGGTCACCTCAATTAATCAGTCACCTGTCT----------T---TAGCAACCATA--TTT-CTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGTAAATTAACCTGTATTAAACAACAACCTGTCTT-G--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCTTTCCCT
gi|13 : aatacagTCAGACCTGTGTAGGCGGCCATCTTT------------CTT---T----------T---GAACAGCTAC-----------TTCCCA-------TTTCTATGATTTCTGAGTAAATTAACCTGTATTAAGCAACAACC-----TAA--AAAGGCCAC-----TTTT-G-CTACATCCCTTG------ACTGGCTG----CTTAAG-ACTGATTGGACTG
gi|14 : tacagCTGTGCAAGCGGTCACTTCAACTAAGCAGCCAGTTGTCTCAAACAGTCTT---AAACAGTCACA--TTTGTTTTTTT--A-------TT---ATG--------GTAAATTAACGTGCATTAAGCAACAACCTGTTCT-A--AAAGGTCGC-----TT
gi|15 : agtaaT----------T---AAGCAGCTAAA--TTTACTATTTCCCA-------TTTCTATGCTTTCGAAACAGA-TATCCTGTATTAAGC-------------AA--AAATACCAC-----TTAT-G-TTTCTTCCCTTG------ACTGACTG----CTTCAG-ACAGGATTGACTGT
gi|2 : gtAAACCCATGTAAGCGGTCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------TTAAAAGCAGCCACG--TTTACTATTTTCCT-------TTTTAATG-TTTCAGAGCAAAGTAACTTGTGTTAAGCAACAACCTGTCTTAG--AA-GGCCAC-----TTTT-G-CTTCTGCCCTTA------ACTGGCTG----CTAAAG-ACAGGTTTCACTGT
gi|3 : tacagtaTCGAACCTGTACAAGTGTTCACCTCTGTTGGGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCACCCACC--TTTGCTATTTTCAA-------TTTCTATGCTTTCAGAACAAATTAACCCATATTAAGCAACAACCTGTTTT-A--AAGGGTCAT-----TTTT-GCCCCCCTTTCTTG--------TGGTTT----AGTAAATACAGGTTTGACTGTa
gi|4 : acagAAACCTATGTAAGCGATCACCTCTGTTAAGCAGCCACCTGTCT----------T---AGGTAACCATA--TTTTCTGTTTCCCA-------TTTATATGCTTTCAGAGTTGATTATCCTGTATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAA-GCCAC-----AATT-A-CTCTTTCCCTTA------ACTTGCTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGTa
gi|5 : cagtaTCAAACCTGTGTAAGCGGTCACCTCTTTTGAACAACCACTTATCA----------T---AAACAGCCATA--TTTGTTATTTCC---------TTTCTATACTTTCAGAACAAATTAACCTGTATTAAGCATCAATCTGTCTTAA--ATA--TCACAACAAATTT-A-AT-ATTTCATTG------ACCGGCTG----CTTCAG-TCAGATTTGACTaa
gi|6 : TCAAACTTGTGAAAGAGATCACCTCTATAAGGCAACCCCCTGTCT----------T---A-GCAGCCACAATTTTGCTATTTCCCG-------TTTCTACACTTTCAGTAAAAATTAACCTGTATTTAGCAACAACCTGTCTT-A--AGAGGCCAG-----TTTC-G-CTCCTTCCATTG------ACTGACTG-------AAG-ACAAGTTTGACTGTaaaat
gi|7 : agTCAAACCTGTGTAAGCAGCCACCTCTATTAAGCAGCCACTTGTCT----------T---AAGCAGCCACA--GTTGCTATTTTCCG-------TTTCTATACTTTATGAGCAAATTAACCTGCATTAAGCAACAACCTGTCTTAA--AAAGGCCAG-----TTTT-G-CTCCTTCCCATG------ATTGGCTG----GTTAAG-ACAGGTTTGACCGTa
gi|8 : TCAAACTTATGTAAG-AGTCACCTCTATTGAGCAGTCACCTTTCT----------T---AAGCAGCCACA--TTTGCTATTTCTCA-------TTTCTCTACTTTCAGAACAAATCAACCTGTATTGAGAAACAAC---TTCTAATTAAGGGTTAC-----TTTT-G----------TTA------ACTGACTG----CTTAAG-ACAGGTTTGACTGT
gi|9 : cagCCTCTATTGAGCAGCCTCTTGTCT----------T---AAGCAGACACG--TTCGCTTTATCCCA-------TTTCTATGCTTTCAGAGCAATGCAACCT---TTAAGATATTACCTGTCTT-G--AAATACCAT-----TTTT-G-GTCATTCCCTTT------GCGGGTTG----CTTAAG-GCAGGTTTtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CGATAATGAATTTATCAATTCTGAATATATA