lowQualScore                  :              111111                                                
lowQualScore                  :              ......                                                
lowQualScore                  :              222222                                                
consensus                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
Reference ( gi|123678 )       : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123679                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123681                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123682                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123687                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123695                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTCCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123694                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123691                     : TCTTAAAAGGGCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123690                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTG
gi|123689                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123688                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123699                     : TCTTAAAGGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123701                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123700                     : TCTTAAAAAGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123702                     : TCTTAAGAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|123705                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123704                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123706                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATGGTAT
gi|123716                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123714                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123713                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGCAT
gi|123712                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123711                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTAT
gi|123709                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123707                     : TCTTAAAAGGCCA------CTATTGCCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123721                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123719                     : TCTAAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123718                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123722                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGCTTGACTGTA
gi|123733                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123732                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTCCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123731                     : TCTTAAAAGGTCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123726                     : TCTTAAAAGGCTA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123725                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|123723                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGGTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123703                     : TCTTAAGAAGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTAT
gi|123735                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTAT
gi|123738                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123744                     : TCTTAAAAGGCCA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123745                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123747                     : TCTTAAACGGCCA------CTTTCACTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123746                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGGCTGGCCGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123755                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123754                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123751                     : TCTTAAAATGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTCAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123750                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123749                     : TCTTAAAAGGCGA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123748                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCGTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123717                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTAT
gi|123760                     : TCTTAAAAAGCCA------CTTTTGCTCCTACCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123759                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACCGTAT
gi|123758                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTCCCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123757                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGTTTTAGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123756                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTACTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123761                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTAGCTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123692                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123762                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTCCTCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123767                     : TCTTAAAATACCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123766                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123764                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCTCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123763                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGTTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTCAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123772                     : TCTTAAAAGGTCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123771                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123785                     : TCTTAAA-GGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACCGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123778                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCAGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123776                     : TCTTAAAAGACCA------GTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123775                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTGGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123773                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123780                     : TCTTAAAAGGTTA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123779                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123786                     : TCTTAAAAGGTCT------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123782                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACAGTAT
gi|123787                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTACTCCTTTCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123683                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCCT-GACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123790                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTCGGCCCCTTCCCTTGACTGGCTACTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123789                     : TCTCAAAAGGCCA------CTTTTTCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123793                     : TCTTAAAAGGCCAATTTCACTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTA
gi|123792                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTTCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTCTGACTGTA
gi|123791                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCGTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGAGTGTA
gi|123796                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTAATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123794                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|123768                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTTGCTTATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123696                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGTTTTGACTGTAT
gi|123797                     : TCTTAAAAGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAC
gi|123798                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTG-TTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123802                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTTGGACAGGTTTGACT
gi|123800                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTCGCGCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTA
gi|123799                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCATCCCTTTACTGGCTGCTTTAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123680                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTTCTTGACTGGCCTCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123805                     : TTTTAAAAGACCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTA
gi|123804                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123803                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTTCCTTGACAGGCTGCTCAAGTCATGTTTGACTGTA
gi|123994                     :  CTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTGAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124020                     :   TTAAAAGGCCT------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124021                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124017                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGCCAGGTTTGACTGTA
gi|124026                     :   TTAAATGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124043                     :    TAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124044                     :    TAAAAAGCCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124053                     :     AAAAGGCCA------CTTTTGCTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATAT





Alignments
lowQualScore                  :              111111                                                
lowQualScore                  :              ......                                                
lowQualScore                  :              222222                                                
consensus                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
Reference ( family-98 )       : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123678                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123679                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123680                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTTCTTGACTGGCCTCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123681                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123682                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123683                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCCT-GACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123687                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123688                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123689                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123690                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTG
gi|123691                     : TCTTAAAAGGGCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123692                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123694                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123695                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTCCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123696                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGTTTTGACTGTAT
gi|123699                     : TCTTAAAGGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123700                     : TCTTAAAAAGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123701                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123702                     : TCTTAAGAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|123703                     : TCTTAAGAAGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTAT
gi|123704                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123705                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123706                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATGGTAT
gi|123707                     : TCTTAAAAGGCCA------CTATTGCCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123709                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123711                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTAT
gi|123712                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123713                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGCAT
gi|123714                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123716                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123717                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTAT
gi|123718                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123719                     : TCTAAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123721                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123722                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGCTTGACTGTA
gi|123723                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGGTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123725                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|123726                     : TCTTAAAAGGCTA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123731                     : TCTTAAAAGGTCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123732                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTCCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123733                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123735                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTAT
gi|123738                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123744                     : TCTTAAAAGGCCA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123745                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123746                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGGCTGGCCGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123747                     : TCTTAAACGGCCA------CTTTCACTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123748                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCGTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123749                     : TCTTAAAAGGCGA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123750                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123751                     : TCTTAAAATGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTCAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123754                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123755                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123756                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTACTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123757                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGTTTTAGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123758                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTCCCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123759                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACCGTAT
gi|123760                     : TCTTAAAAAGCCA------CTTTTGCTCCTACCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123761                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTAGCTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123762                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTCCTCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123763                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGTTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTCAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123764                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCTCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123766                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123767                     : TCTTAAAATACCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123768                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTTGCTTATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123771                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123772                     : TCTTAAAAGGTCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123773                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123775                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTGGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123776                     : TCTTAAAAGACCA------GTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123778                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCAGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123779                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123780                     : TCTTAAAAGGTTA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123782                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACAGTAT
gi|123785                     : TCTTAAA-GGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACCGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123786                     : TCTTAAAAGGTCT------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123787                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTACTCCTTTCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123789                     : TCTCAAAAGGCCA------CTTTTTCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123790                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTCGGCCCCTTCCCTTGACTGGCTACTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123791                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCGTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGAGTGTA
gi|123792                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTTCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTCTGACTGTA
gi|123793                     : TCTTAAAAGGCCAATTTCACTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTA
gi|123794                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|123796                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTAATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123797                     : TCTTAAAAGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAC
gi|123798                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTG-TTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123799                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCATCCCTTTACTGGCTGCTTTAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123800                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTCGCGCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTA
gi|123802                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTTGGACAGGTTTGACT
gi|123803                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTTCCTTGACAGGCTGCTCAAGTCATGTTTGACTGTA
gi|123804                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123805                     : TTTTAAAAGACCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTA
gi|123994                     :  CTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTGAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124017                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGCCAGGTTTGACTGTA
gi|124020                     :   TTAAAAGGCCT------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124021                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124026                     :   TTAAATGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124043                     :    TAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124044                     :    TAAAAAGCCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124053                     :     AAAAGGCCA------CTTTTGCTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATAT





Alignments
lowQualScore                  :              111111                                                
lowQualScore                  :              ......                                                
lowQualScore                  :              222222                                                
consensus                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
Reference ( family-98 )       : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123678                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123679                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123680                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTTCTTGACTGGCCTCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123681                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123682                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123683                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCCT-GACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123687                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123688                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123689                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123690                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTG
gi|123691                     : TCTTAAAAGGGCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123692                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123694                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123695                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTCCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123696                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGTTTTGACTGTAT
gi|123699                     : TCTTAAAGGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123700                     : TCTTAAAAAGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123701                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123702                     : TCTTAAGAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|123703                     : TCTTAAGAAGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTAT
gi|123704                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123705                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123706                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATGGTAT
gi|123707                     : TCTTAAAAGGCCA------CTATTGCCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123709                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123711                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTAT
gi|123712                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123713                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGCAT
gi|123714                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123716                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123717                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTAT
gi|123718                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123719                     : TCTAAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123721                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123722                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGCTTGACTGTA
gi|123723                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGGTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123725                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|123726                     : TCTTAAAAGGCTA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123731                     : TCTTAAAAGGTCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123732                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTCCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123733                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123735                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTAT
gi|123738                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123744                     : TCTTAAAAGGCCA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123745                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123746                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGGCTGGCCGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123747                     : TCTTAAACGGCCA------CTTTCACTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123748                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCGTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123749                     : TCTTAAAAGGCGA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123750                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123751                     : TCTTAAAATGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTCAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123754                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123755                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123756                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTACTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123757                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGTTTTAGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123758                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTCCCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123759                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACCGTAT
gi|123760                     : TCTTAAAAAGCCA------CTTTTGCTCCTACCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123761                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTAGCTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123762                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTCCTCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123763                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGTTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTCAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123764                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCTCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123766                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123767                     : TCTTAAAATACCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123768                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTTGCTTATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123771                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123772                     : TCTTAAAAGGTCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123773                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123775                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTGGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123776                     : TCTTAAAAGACCA------GTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123778                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCAGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123779                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123780                     : TCTTAAAAGGTTA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123782                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACAGTAT
gi|123785                     : TCTTAAA-GGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACCGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123786                     : TCTTAAAAGGTCT------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123787                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTACTCCTTTCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123789                     : TCTCAAAAGGCCA------CTTTTTCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123790                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTCGGCCCCTTCCCTTGACTGGCTACTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123791                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCGTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGAGTGTA
gi|123792                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTTCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTCTGACTGTA
gi|123793                     : TCTTAAAAGGCCAATTTCACTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTA
gi|123794                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|123796                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTAATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123797                     : TCTTAAAAGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAC
gi|123798                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTG-TTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123799                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCATCCCTTTACTGGCTGCTTTAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123800                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTCGCGCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTA
gi|123802                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTTGGACAGGTTTGACT
gi|123803                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTTCCTTGACAGGCTGCTCAAGTCATGTTTGACTGTA
gi|123804                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123805                     : TTTTAAAAGACCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTA
gi|123994                     :  CTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTGAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124017                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGCCAGGTTTGACTGTA
gi|124020                     :   TTAAAAGGCCT------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124021                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124026                     :   TTAAATGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124043                     :    TAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124044                     :    TAAAAAGCCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124053                     :     AAAAGGCCA------CTTTTGCTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATAT


blockSeqs                     :              ATTTCA
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     
blockSeqs                     :              .     


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
finalCons                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT





Alignments
lowQualScore                  :              111111                                                
lowQualScore                  :              ......                                                
lowQualScore                  :              222222                                                
consensus                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
Reference ( family-98 )       : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123678                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123679                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123680                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTTCTTGACTGGCCTCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123681                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123682                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123683                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCCT-GACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123687                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123688                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGAATGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123689                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123690                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTG
gi|123691                     : TCTTAAAAGGGCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123692                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123694                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123695                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTCCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123696                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGTTTTGACTGTAT
gi|123699                     : TCTTAAAGGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123700                     : TCTTAAAAAGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123701                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123702                     : TCTTAAGAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGT
gi|123703                     : TCTTAAGAAGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTAACTGTAT
gi|123704                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123705                     : TCTTAAAAGGCCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123706                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATGGTAT
gi|123707                     : TCTTAAAAGGCCA------CTATTGCCCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123709                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123711                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAATACAGGTTTGACTGTAT
gi|123712                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123713                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCATGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGCAT
gi|123714                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123716                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123717                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTAT
gi|123718                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123719                     : TCTAAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123721                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123722                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGCTTGACTGTA
gi|123723                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCCCTTGACTGGCTGGTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123725                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAATGTA
gi|123726                     : TCTTAAAAGGCTA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123731                     : TCTTAAAAGGTCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123732                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTCCCCTTGACTAGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123733                     : TCTTAAAGGGCCA------TTTTTGCTCCTTCTCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123735                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTAT
gi|123738                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123744                     : TCTTAAAAGGCCA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123745                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123746                     : TCTTAAAAGGCCA------GTTTTGCTCCTTCCCTTGGCTGGCCGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123747                     : TCTTAAACGGCCA------CTTTCACTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123748                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCGTTAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123749                     : TCTTAAAAGGCGA------CTTT-GCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123750                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123751                     : TCTTAAAATGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTCAACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123754                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123755                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTCCCTTGACTGACTGCTGAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123756                     : TCTTAAAAGGCCA------ATTTTACTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123757                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGTTTTAGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123758                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCTCCCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123759                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTTGACTGGCTGCTAAAGACAGGTTTGACCGTAT
gi|123760                     : TCTTAAAAAGCCA------CTTTTGCTCCTACCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123761                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTAGCTCCTTCCCTTGATTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123762                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTCCTCTTGACTTGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123763                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGTTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTCAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123764                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCTCTTGACTGGCTGTTTAAGACAGGTTTGACTGTGT
gi|123766                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCATTAACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123767                     : TCTTAAAATACCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTA
gi|123768                     : TCTTAAAAGACCA------CTTTTGCTTATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123771                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTTCATCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123772                     : TCTTAAAAGGTCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123773                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGATTTGACTGTAT
gi|123775                     : TCTTTAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTCCTGGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123776                     : TCTTAAAAGACCA------GTTTTGCTCCTTCCATTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123778                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCTCCAGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123779                     : TCTTAAAAGGTCA------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTAT
gi|123780                     : TCTTAAAAGGTTA-------TTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123782                     : TCTTAAAAGACCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACAGTAT
gi|123785                     : TCTTAAA-GGCCA------CCTTTGCTCCTTCCCTTGACCGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123786                     : TCTTAAAAGGTCT------CTTTTGCACCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123787                     : TCTTAAAGGGCCA------CTTTTACTCCTTTCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123789                     : TCTCAAAAGGCCA------CTTTTTCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAGGACAGGTTTGGCTGTAT
gi|123790                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTCGGCCCCTTCCCTTGACTGGCTACTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123791                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCGTCCCTTGACTGACTGCTTAAGACAGGTTTGAGTGTA
gi|123792                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTTCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTCTGACTGTA
gi|123793                     : TCTTAAAAGGCCAATTTCACTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGGCTGTA
gi|123794                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTTCTTCACTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTTACTGTA
gi|123796                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTAATTCCCTTGACTGGTTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123797                     : TCTTAAAAGGCCA------TTTTTGCTCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGAC
gi|123798                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTTG-TTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123799                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCATCCCTTTACTGGCTGCTTTAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|123800                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTCGCGCCTTCCTTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGATTGTA
gi|123802                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTTGGACAGGTTTGACT
gi|123803                     : TCTTAAAAGGCCA------CTTTTGTTCCTTTCCTTGACAGGCTGCTCAAGTCATGTTTGACTGTA
gi|123804                     : TCTTAAAAGACCA------CCTTTGTTCCTTCCCTTGACTGGCAGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|123805                     : TTTTAAAAGACCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACATGTTTGACTGTA
gi|123994                     :  CTTAAAGGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTGAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124017                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCTTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGCCAGGTTTGACTGTA
gi|124020                     :   TTAAAAGGCCT------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124021                     :   TTAAAAGGCCA------CTTTTGCTCCTGCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTA
gi|124026                     :   TTAAATGGCCA------CTTTTGCTCCTTCCCTTGACAGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124043                     :    TAAAAGGCCA------CTTTTGCTCATTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124044                     :    TAAAAAGCCA------CATTTGCTCCTTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTGTAT
gi|124053                     :     AAAAGGCCA------CTTTTGCTTCCTCCCTTGACTGGCTGCTTAAGACAGGTTTGACTATAT