lowQualScore : 1
lowQualScore : 4 2 5
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 1 7 0
consensus : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
Reference ( gi|76512 ) : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTAATTAA
gi|76513 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76515 : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76514 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76518 : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76519 : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76516 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGAATTAA
gi|76517 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGATTTAA
gi|76520 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGAATTAA
gi|76521 : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGAATTAA
gi|76522 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGAATTA
gi|76523 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGAATAAA
gi|76524 : TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525 : TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGT
gi|76526 : TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTgatatt
gi|76527 : TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGAATTAAgattt
Alignments
lowQualScore : 3 2 2
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 2 5 7
consensus : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 ) : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515 : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518 : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519 : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521 : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524 : TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525 : TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526 : TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527 : TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA
Alignments
lowQualScore : 3 2 2
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 2 5 7
consensus : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 ) : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515 : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518 : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519 : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521 : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524 : TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525 : TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526 : TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527 : TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA
blockSeqs : T G T
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
finalCons : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Alignments
lowQualScore : 3 2 2
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 2 5 7
consensus : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 ) : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515 : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517 : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518 : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519 : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520 : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521 : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523 : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524 : TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525 : TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526 : TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527 : TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA