lowQualScore                  :                                                         1      
lowQualScore                  :                   4        2                            5      
lowQualScore                  :                   .        .                            .      
lowQualScore                  :                   1        7                            0      
consensus                     : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
Reference ( gi|76512 )        : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTAATTAA
gi|76513                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76515                      : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76514                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76518                      : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76519                      : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGAATTAA
gi|76516                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGAATTAA
gi|76517                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGATTTAA
gi|76520                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGAATTAA
gi|76521                      : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGAATTAA
gi|76522                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGAATTA
gi|76523                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGAATAAA
gi|76524                      :    TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525                      :        TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGT
gi|76526                      :         TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTgatatt
gi|76527                      :                TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGAATTAAgattt





Alignments
lowQualScore                  :                   3        2                              2     
lowQualScore                  :                   .        .                              .     
lowQualScore                  :                   2        5                              7     
consensus                     : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 )      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515                      : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518                      : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519                      : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521                      : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524                      :    TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525                      :        TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526                      :         TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527                      :                TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA





Alignments
lowQualScore                  :                   3        2                              2     
lowQualScore                  :                   .        .                              .     
lowQualScore                  :                   2        5                              7     
consensus                     : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 )      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515                      : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518                      : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519                      : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521                      : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524                      :    TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525                      :        TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526                      :         TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527                      :                TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA


blockSeqs                     :                   T        G                              T
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   T        .                              .
blockSeqs                     :                   .        .                              .
blockSeqs                     :                   .        .                              .
blockSeqs                     :                   .        .                              .
blockSeqs                     :                   .        .                               


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
finalCons                     : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA





Alignments
lowQualScore                  :                   3        2                              2     
lowQualScore                  :                   .        .                              .     
lowQualScore                  :                   2        5                              7     
consensus                     : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
Reference ( family-941 )      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76512                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA
gi|76513                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76514                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76515                      : TATTAAATTTTCAATTTTTAATGAAAG-CCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76516                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAGG-CCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA
gi|76517                      : TATTAAATTTTCCATTTTTGATAAAGG-CCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTTAA
gi|76518                      : TATTTAATTTTCAATATTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76519                      : TATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA
gi|76520                      : TATTAAATTTTCAATTTTTGATAAAAG-CCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA
gi|76521                      : TAATAACTTTTCAATTTT-AATAAAGG-CCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA
gi|76522                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTA
gi|76523                      : TAATAATTTTTCAATTTT-GATAAAGG-CCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA
gi|76524                      :    TAAATGTTCAATTTT-GATAAAGT-CCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT
gi|76525                      :        TTTTCA-TTTTTGATAAAGG-CCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT
gi|76526                      :         TTTCG-TTTTTGATCAAGG-TCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT
gi|76527                      :                TTTTGATAAAGG-CCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA