lowQualScore                  :                                                                                               55555555555555555555555555                     111111                                                                                                                             111111111     2222222222222222222                                        11               333333   111    111111111                                                      
lowQualScore                  :                               4                               5                               11111111111111111111111111              5   6  444444            0           1     66   2               55     4     4   2           55      2                                    444444444     8888888888888888888      666                         44    33            6  888888   000    333333333                                     3 3              
lowQualScore                  :                               .                               .                               ..........................              .   .  ......            .           .     ..   .               ..     .     .   .           ..      .                                    .........     ...................      ...                         ..    ..            .  ......   ...    .........                                     . .              
lowQualScore                  :                               0                               0                               99999999999999999999999999              0   0  444444            8           0     11   6               55     4     0   0           00      1                                    555555555     2222222222222222222      444                         66    88            9  999999   444    333333333                                     3 3              
consensus                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGGA--NT--TTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
Reference ( gi|95026 )        : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAATTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATAGA--A---TTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95027                      : TATTTTAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGAATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--CTGTACCTTTATGGATTT---TTT---ACGC---------ATCTAATCCAGTATAACAAATCTAACCACAATTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95028                      : TATTTCAAAATAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-AAACTA------TCCTCCATCTCAAATGCCGACAGTCTGGAA--ACAATTGTACGGCCGTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TG-TTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATTT---GAATTAATATTTAAGCATCA-TTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGGA--ATTTTTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95029                      : TATTTCAAAAGAGCCTAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCAATGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAATTT-TACGGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATAAATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTGGA--ATT-TTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATATAACCACGATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95030                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGGGTTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGATAAC--------------------------TGATGAAAAAAACAACAACTA------TCCTCCATATCAAATGTCGATAGTCTGGAA--AAGTTTGTACGGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TATTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTAAG-------------------ATCTCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGGA--ATCTTTT---ACTC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAA
gi|95031                      : TATTTCAAAAGAGCGCAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAGGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCGCAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAACCC-CAACTC------TCCTCCATTTCAATTGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGACTTCCA--TATTT-CCAAA-
gi|95032                      :   TTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAAGGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACATACACT--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTTTAGAA--AAAATTGTACGGCATTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAATCAGAAACATAGTCTATGTCTCTGGAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTTTA--T---TTTTTTACGC---------ATCTTATCCAGTAAAAGAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95033                      :             GCCGGACAGTGGCAGTCTAGTATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGGACAAA
gi|95034                      :                 AACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATGAAAATGG-AAATCTTTAGCCGTGGACACCCACAGACAACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTCACTGGTGAAGAAAAGT-CAACTACTAGTATCCTCCATCCCAAATGTTGACGGTCTGGAAGGAAATTTGTGCAGCCTTCCA--TATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTAA-----AAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTTAT---------CTGAT-------------------ATATCT---GAATTGATATATAGGCATCATTTTCAAAAAA--ATGTACCTTTATGGATTG---TTT---ACGCATTTTGTAGATCTTATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-CTTTTTCTTAAAAATA
gi|95035                      :                                                                             TGGATACCCACAGACAAC--------------------------TGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGCCTTCCA--TA
gi|95028                      :                                                                                                                                                                          GTTTGG----AAATATGGACGGCCGTACAATTGTTT-CCAGA-CTGTCGGCATTTG
gi|95036                      :                                                                           tatttcaaaatagcccaacagtggcagtctaggatcaaacggagttataaggattaaaatggcaaacttaagccatggatacccacagacaactgatgaagaaaaccaaactatcctccatctA--TATTTATTAAAGCAG---GAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCGTAAAAAAGAATAAATGTTTTCAT---------CTGAA-------------------TTATCT---GAATTAATGTATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTGGA--ATT-TTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATCTAACCACAATTTGAT-C-TTTTCTTAAAAagacggaatatgcttgttttcatgtttaagtcttaaaaaagaataaatgtattcatctgagatatttgaattaatatttaagcatcatttcaaaaatgtacctttatggaattttttacgcatctaatccaataaaacaaatctaaccacaattttatcttttcttaaaaata
gi|95037                      :                                                                                                                                                                                                                    -CAGCCTGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTAAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAAATAATATATAAGCATCATTTTA--AAAA--ATGCACCTTTATGGA--ATTTTTT---ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATTTAACCATAGTTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95039                      :                                                                                                                                                                                                                             ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCAT---------CTTGG-------------------ATATCT---ATACTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGCA--T---TTT---GTAG---------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95038                      :                                                                                                                                                                                                                             ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCAT---------CTTGG-------------------ATATCT---ATACTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGCA--T---TTT---GTAG---------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95040                      :                                                                                                                                                                                                                             ATACGCTAATGTT---CATGTCTAAGTCTTTAAAAAGGGTCAATGTATTCAT---------CTGGG-------------------ATATCT---GTTTTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGCA--T---TTT---GTAG---------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTA-----AT-C-TTTTCTTAA
gi|95041                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --AAAA--ATGTACCTTTTTGGA--A---TTTTT-ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTATAT-TTTTCTTAAAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                             44444444444444444444444444                       111111                                                                                                                           111111111     2222222222222222222                                        11                111           1111111111                                                      
lowQualScore                  :                                                               4                             66666666666666666666666666                4      222222                              66   1                    4     4               44      1                                    333333333     5555555555555555555      555                         44    22              6 666 3  9 77 1 3333333333                                     3 3              
lowQualScore                  :                                                               .                             ..........................                .      ......                              ..   .                    .     .               ..      .                                    .........     ...................      ...                         ..    ..              . ... .  . .. . ..........                                     . .              
lowQualScore                  :                                                               4                             11111111111111111111111111                4      888888                              11   0                    4     0               66      2                                    333333333     8888888888888888888      888                         22    77              2 888 1  2 33 5 8888888888                                     1 1              
consensus                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGG-A--TT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
Reference ( family-910 )      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGG-A--NT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95026                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAATTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATAG-A--A--TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95027                      : TATTTTAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGAATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--CTGTACCTTTATGG-AT-TT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAGTATAACAAATCTAACCACAATTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95028                      : TATTTCAAAATAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-AAACTA------TCCTCCATCTCAAATGCCGACAGTCTGGAA--ACAATTGTACGGCCGTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TG-TTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATTT---GAATTAATATTTAAGCATCA-TTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGG-AATTT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95029                      : TATTTCAAAAGAGCCTAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCAATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAATTT-TACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAATTAATAAATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTGGAA--TT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATATAACCACGATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95030                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGGGTTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGATA--------------------------ACTGATGAAAAAAACAACAACTA------TCCTCCATATCAAATGTCGATAGTCTGGAA--AAGTTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TATTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTAAG-------------------ATCTCT---GAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTATGG-AATCT-TT-T--ACTC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAA
gi|95031                      : TATTTCAAAAGAGCGCAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAGGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCGCAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAACCC-CAACTC------TCCTCCATTTCAATTGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGACTTCCATATTT-CCAAA-
gi|95032                      :   TTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAAGGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACATACA--------------------------CTTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTTTAGAA--AAAATTGTACGGCATTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAATCAGAAACATAGTCTATGTCTCTGGAATTAATATATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTTT-A--TT-TT-TTTACGC---------ATCTTATCCAGTAAAAGAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95033                      :             GCCGGACAGTGGCAGTCTAGTATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGGACAAA
gi|95034                      :                 AACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATGAAAATGG-AAATCTTTAGCCGTGGACACCCACAGACAACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTCACTGGTGAAGAAAAGT-CAACTACTAGTATCCTCCATCCCAAATGTTGACGGTCTGGAAGGAAATTTGTGCAGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTAA-----AAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTTAT---------CTGAT-------------------ATATCT---GAATTGATATATAGGCATCATTTTCAAAAAA--ATGTACCTTTATGG-A--TTGTT-T--ACGCATTTTGTAGATCTTATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-CTTTTTCTTAAAAATA
gi|95035                      :                                                                             TGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGCCTTCCATA
gi|95036                      :                                                                                                                                                                                                      ATATTTATTAAAGCAG---GAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCGTAAAAAAGAATAAATGTTTTCAT---------CTGAA-------------------TTATCT---GAATTAATGTATAAGCATCATTTTC--AAAA--ATGTACCTTTTTGGAA--TT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATCTAACCACAATTTGAT-C-TTTTCTTAAAA
gi|95037                      :                                                                                                                                                                                                                  -CAGCCTGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTAAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCAT---------CTGAG-------------------ATATCT---GAAATAATATATAAGCATCATTTTA--AAAA--ATGCACCTTTATGG-AATTT-TT-T--ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATTTAACCATAGTTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95038                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCAT---------CTTGG-------------------ATATCT---ATACTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGC-A--TT-TTGT--A-G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95039                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCAT---------CTTGG-------------------ATATCT---ATACTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGC-A--TT-TTGT--A-G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95040                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCTAATGTT---CATGTCTAAGTCTTTAAAAAGGGTCAATGTATTCAT---------CTGGG-------------------ATATCT---GTTTTAATATATAAGCATCATTTTA--AAAAATATGTATTTTTACGC-A--TT-TTGT--A-G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTA-----AT-C-TTTTCTTAA
gi|95041                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --AAAA--ATGTACCTTTTTGG-A--AT-TT-TT-ACGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTATAT-TTTTCTTAAAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                             44444444444444444444444444                       111111                                                                                                                                                                            11     1111111                 2222        11111111111111111111                                                      
lowQualScore                  :                                                               4                             66666666666666666666666666                4      222222                              66   1                    4     4               44      1                                                                 7777   3    88   44 22     0000000     888888    6 5555  3  9  88888888888888888888                                     3 3              
lowQualScore                  :                                                               .                             ..........................                .      ......                              ..   .                    .     .               ..      .                                                                 ....   .    ..   .. ..     .......     ......    . ....  .  .  ....................                                     . .              
lowQualScore                  :                                                               4                             11111111111111111111111111                4      888888                              11   0                    4     0               66      2                                                                 1111   3    55   22 77     0000000     888888    2 4444  1  2  55555555555555555555                                     1 1              
consensus                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
Reference ( family-910 )      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95026                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAATTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATAG-A-----A-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95027                      : TATTTTAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGAATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--CTGTA-------CCTTT------ATGG-AT---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAGTATAACAAATCTAACCACAATTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95028                      : TATTTCAAAATAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-AAACTA------TCCTCCATCTCAAATGCCGACAGTCTGGAA--ACAATTGTACGGCCGTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TG-TTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATTTGAATTAATATTTAAGCAT----CA--TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95029                      : TATTTCAAAAGAGCCTAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCAATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAATTT-TACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAATAAATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATATAACCACGATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95030                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGGGTTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGATA--------------------------ACTGATGAAAAAAACAACAACTA------TCCTCCATATCAAATGTCGATAGTCTGGAA--AAGTTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TATTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTAAGATCTCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--CT-TT-TA--------CTC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAA
gi|95031                      : TATTTCAAAAGAGCGCAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAGGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCGCAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAACCC-CAACTC------TCCTCCATTTCAATTGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGACTTCCATATTT-CCAAA-
gi|95032                      :   TTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAAGGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACATACA--------------------------CTTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTTTAGAA--AAAATTGTACGGCATTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAAT-CAGAAACATAGTCTATGTCTCTGGAATTA--ATATATAAGCATCATTTTCAAAAATGT-ACCTTTT-TT-TATTTTTTTACGC---------ATCTTATCCAGTAAAAGAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95033                      :             GCCGGACAGTGGCAGTCTAGTATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGGACAAA
gi|95034                      :                 AACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATGAAAATGG-AAATCTTTAGCCGTGGACACCCACAGACAACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTCACTGGTGAAGAAAAGT-CAACTACTAGTATCCTCCATCCCAAATGTTGACGGTCTGGAAGGAAATTTGTGCAGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTAA-----AAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTTATCTGATATATCTGAATTGATATATAGGCAT----CAT-TTTCAAAAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TTGTT-TA--------CGCATTTTGTAGATCTTATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-CTTTTTCTTAAAAATA
gi|95035                      :                                                                             TGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGCCTTCCATA
gi|95036                      :                                                                                                                                                                                                      ATATTTATTAAAGCAG---GAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCGTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAATTATCTGAATTAATGTATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATCTAACCACAATTTGAT-C-TTTTCTTAAAA
gi|95037                      :                                                                                                                                                                                                                  -CAGCCTGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTAAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAAATAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--A--ATGCA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATTTAACCATAGTTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95038                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95039                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95040                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCTAATGTT---CATGTCTAAGTCTTTAAAAAGGGTCAATGTATTCATCTGGGATATCTGTTTTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTA-----AT-C-TTTTCTTAA
gi|95041                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGG-AA---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTATAT-TTTTCTTAAAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                             44444444444444444444444444                       111111                                                                                                                                                                            11     1111111                 2222        11111111111111111111                                                      
lowQualScore                  :                                                               4                             66666666666666666666666666                4      222222                              66   1                    4     4               44      1                                                                 7777   3    88   44 22     0000000     888888    6 5555  3  9  88888888888888888888                                     3 3              
lowQualScore                  :                                                               .                             ..........................                .      ......                              ..   .                    .     .               ..      .                                                                 ....   .    ..   .. ..     .......     ......    . ....  .  .  ....................                                     . .              
lowQualScore                  :                                                               4                             11111111111111111111111111                4      888888                              11   0                    4     0               66      2                                                                 1111   3    55   22 77     0000000     888888    2 4444  1  2  55555555555555555555                                     1 1              
consensus                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
Reference ( family-910 )      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95026                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAATTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATAG-A-----A-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95027                      : TATTTTAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGAATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--CTGTA-------CCTTT------ATGG-AT---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAGTATAACAAATCTAACCACAATTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95028                      : TATTTCAAAATAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-AAACTA------TCCTCCATCTCAAATGCCGACAGTCTGGAA--ACAATTGTACGGCCGTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TG-TTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATTTGAATTAATATTTAAGCAT----CA--TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95029                      : TATTTCAAAAGAGCCTAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCAATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAATTT-TACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAATAAATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATATAACCACGATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95030                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGGGTTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGATA--------------------------ACTGATGAAAAAAACAACAACTA------TCCTCCATATCAAATGTCGATAGTCTGGAA--AAGTTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TATTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTAAGATCTCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--CT-TT-TA--------CTC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAA
gi|95031                      : TATTTCAAAAGAGCGCAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAGGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCGCAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAACCC-CAACTC------TCCTCCATTTCAATTGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGACTTCCATATTT-CCAAA-
gi|95032                      :   TTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAAGGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACATACA--------------------------CTTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTTTAGAA--AAAATTGTACGGCATTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAAT-CAGAAACATAGTCTATGTCTCTGGAATTA--ATATATAAGCATCATTTTCAAAAATGT-ACCTTTT-TT-TATTTTTTTACGC---------ATCTTATCCAGTAAAAGAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95033                      :             GCCGGACAGTGGCAGTCTAGTATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGGACAAA
gi|95034                      :                 AACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATGAAAATGG-AAATCTTTAGCCGTGGACACCCACAGACAACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTCACTGGTGAAGAAAAGT-CAACTACTAGTATCCTCCATCCCAAATGTTGACGGTCTGGAAGGAAATTTGTGCAGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTAA-----AAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTTATCTGATATATCTGAATTGATATATAGGCAT----CAT-TTTCAAAAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TTGTT-TA--------CGCATTTTGTAGATCTTATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-CTTTTTCTTAAAAATA
gi|95035                      :                                                                             TGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGCCTTCCATA
gi|95036                      :                                                                                                                                                                                                      ATATTTATTAAAGCAG---GAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCGTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAATTATCTGAATTAATGTATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATCTAACCACAATTTGAT-C-TTTTCTTAAAA
gi|95037                      :                                                                                                                                                                                                                  -CAGCCTGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTAAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAAATAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--A--ATGCA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATTTAACCATAGTTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95038                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95039                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95040                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCTAATGTT---CATGTCTAAGTCTTTAAAAAGGGTCAATGTATTCATCTGGGATATCTGTTTTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTA-----AT-C-TTTTCTTAA
gi|95041                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGG-AA---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTATAT-TTTTCTTAAAAATA


blockSeqs                     :                                                               A                             ACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTC                A      CTAGTA                              GG   T                    A     G               AA      T                                                                 AGTC   G    TG   TT AT     TAAGCAT     TCAAAA    A CCTT  G  G  CGCATTTTGTAG                                             A T
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    A                    .     .               .       T                                                                 .      .    AA   .  AT     .           .         A AT    .  G  TTTTTTTACGC                                              . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    T                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  AT     .           .         . AT    .  G  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    T                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . AT    .  .  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    A                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . T     .  .  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    A                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . A     .  .  CTC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    T                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . .     .  .  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                               .                             .                                         .      .                                   .    A                    .     .               .       T                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . .     .  .  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                  .               .       .                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . .     .  .  CGC                                                      . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                  .       .                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . .     .  .  G                                                        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                  .       .                                                                 .      .    .    .  .      .           .         . .     .  .  G                                                        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .  .      .           .         . .     .  .  G                                                        . .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
finalCons                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                             44444444444444444444444444                       111111                                                                                                                                                                            11     1111111                 2222        11111111111111111111                                                      
lowQualScore                  :                                                               4                             66666666666666666666666666                4      222222                              66   1                    4     4               44      1                                                                 7777   3    88   44 22     0000000     888888    6 5555  3  9  88888888888888888888                                     3 3              
lowQualScore                  :                                                               .                             ..........................                .      ......                              ..   .                    .     .               ..      .                                                                 ....   .    ..   .. ..     .......     ......    . ....  .  .  ....................                                     . .              
lowQualScore                  :                                                               4                             11111111111111111111111111                4      888888                              11   0                    4     0               66      2                                                                 1111   3    55   22 77     0000000     888888    2 4444  1  2  55555555555555555555                                     1 1              
consensus                     : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
Reference ( family-910 )      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTCTGGAA--AAANTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95026                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAATTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATAG-A-----A-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95027                      : TATTTTAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTGGGATCAAACGGAGTTATAAGAATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCAAATGTCGACAGTTTGGAA--AAATTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--CTGTA-------CCTTT------ATGG-AT---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAGTATAACAAATCTAACCACAATTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95028                      : TATTTCAAAATAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-AAACTA------TCCTCCATCTCAAATGCCGACAGTCTGGAA--ACAATTGTACGGCCGTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TG-TTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATTTGAATTAATATTTAAGCAT----CA--TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95029                      : TATTTCAAAAGAGCCTAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCAATGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAATTT-TACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAATAAATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATATAACCACGATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95030                      : TATTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGGGTTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACAGATA--------------------------ACTGATGAAAAAAACAACAACTA------TCCTCCATATCAAATGTCGATAGTCTGGAA--AAGTTTGTACGGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TATTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTAAGATCTCTGAATTAATATATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-AAT--CT-TT-TA--------CTC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAA
gi|95031                      : TATTTCAAAAGAGCGCAACAGTGACAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAGGGATTAAAATGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCGCAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAACCC-CAACTC------TCCTCCATTTCAATTGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGACTTCCATATTT-CCAAA-
gi|95032                      :   TTTCAAAAGAGCCCAACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAAGGG-CAAACTTAAGCCATGGATACCCACATACA--------------------------CTTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTTTAGAA--AAAATTGTACGGCATTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAGATATCTGAATTAAT-CAGAAACATAGTCTATGTCTCTGGAATTA--ATATATAAGCATCATTTTCAAAAATGT-ACCTTTT-TT-TATTTTTTTACGC---------ATCTTATCCAGTAAAAGAAATCTAACCACAATTTTAT-C-TTTTCTTAAAAATA
gi|95033                      :             GCCGGACAGTGGCAGTCTAGTATCAAACGGAGTTATAAGGATTAAAATGGACAAA
gi|95034                      :                 AACAGTGGCAGTCTAGGATCAAACGGAGTTATAAGGATGAAAATGG-AAATCTTTAGCCGTGGACACCCACAGACAACCGCCGCATATGTGACTGTCACTTCACTGGTGAAGAAAAGT-CAACTACTAGTATCCTCCATCCCAAATGTTGACGGTCTGGAAGGAAATTTGTGCAGCCTTCCATATTT-CCAAA-CAGACGGAATATGCT--TGTTTTTAA-----AAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTTATCTGATATATCTGAATTGATATATAGGCAT----CAT-TTTCAAAAA--A--ATGTA-------CCTTT------ATGG-A----TTGTT-TA--------CGCATTTTGTAGATCTTATCCAATAAAACAAATCTAACCATAATTTTAT-CTTTTTCTTAAAAATA
gi|95035                      :                                                                             TGGATACCCACAGACA--------------------------ACTGATGAAGAAAACC-CAACTA------TCCTCCATCTCATATGTCGACAGTCTGGAA--AAAATTGTACGGCCTTCCATA
gi|95036                      :                                                                                                                                                                                                      ATATTTATTAAAGCAG---GAATATGCT--TGTTTTTCATGTTTAAGTCGTAAAAAAGAATAAATGTTTTCATCTGAATTATCTGAATTAATGTATAAGCAT----CAT-TTTC--AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGGAA----TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAATAAATCTAACCACAATTTGAT-C-TTTTCTTAAAA
gi|95037                      :                                                                                                                                                                                                                  -CAGCCTGAATATGCT--TGTTTTTCATGTTAAAGTCTTAAAAAAGAATAAATGTATTCATCTGAGATATCTGAAATAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--A--ATGCA-------CCTTT------ATGG-AAT--TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATTTAACCATAGTTTTAT-A-TTTTCTTAAAAATA
gi|95038                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95039                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCT--TATGTT-CATATCTAAGTCTTTAAAAAGGGTAAATGTATCCATCTTGGATATCTATACTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTAATTTTAT-C-TTTTCTTAAACATA
gi|95040                      :                                                                                                                                                                                                                           ATACGCTAATGTT---CATGTCTAAGTCTTTAAAAAGGGTCAATGTATTCATCTGGGATATCTGTTTTAATATATAAGCAT----CAT-TTTA--AAA--AATATGTA-------TTTTT------ACGC-A----TT-TTGTA---------G----------ATCTAATCAAATAAAACGAATATAACCGTA-----AT-C-TTTTCTTAA
gi|95041                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --AAA--A--ATGTA-------CCTTT------TTGG-AA---TT-TT-TA--------CGC---------ATCTAATCCAATAAAACAAATCTAACCACAATTTTATAT-TTTTCTTAAAAATA