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lowQualScore                  :   .              .        .                        
lowQualScore                  :   3              1        6                        
consensus                     : CCCTACACTGCCCGTGCCTACACATCCAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
Reference ( gi|39901 )        : CCATACACTGCCCGTGCTTACACATCTAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
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gi|39903                      : CCCTAGACAGCCCGAGCCTACTCATCCAAACTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
gi|39905                      : CCCTAGACTGTCAGAGGTTACATATCGCACTTAAGCCAGCTACGCTCCCGA
gi|39910                      :    TACACTGCTCGTGCCTACACATCCAATTTAAGCCAGCTACGGCCC
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Alignments
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lowQualScore                  :      5                                             
consensus                     : CCCTACACTGCCCGTGCCTACACATCCAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
Reference ( family-902 )      : CCCTACACTGCCCGTGCCTACACATCCAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
gi|39901                      : CCATACACTGCCCGTGCTTACACATCTAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
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gi|39903                      : CCCTAGACAGCCCGAGCCTACTCATCCAAACTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
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gi|39914                      :       ACTGCCCGTGCCTACACATCCAACTTAAGCCAGCT
gi|39915                      :       ACAGCCTGTACCTACACACCCAACTTAAGTCAGCTACGCCCCTGA
gi|39916                      :        CTGCCCGTGCCTACATACCCAACTTAAGTCAGCTACACCCCTG
gi|39917                      :                GCCTACACACCCAACTTAAGTCAGCTACGCCTCTGA


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Alignments
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lowQualScore                  :      5                                             
consensus                     : CCCTACACTGCCCGTGCCTACACATCCAACTTAAGCCAGCTACGCCCCTGA
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