lowQualScore : 1 1111 1 1111 111 111111 1 1111111 1111111111 33333333333 33333333333333333333333333333333 222222222222222 11 111111 2222222222222222222222 111111 2 1111111 11111
lowQualScore : 1 2222 1 1 5 5 1 3 3 4 7777 111 44 99 2 000000 555 2 4 888 4444444 0 0 8888888888 666 555 11111111111 2 33 33 2 99 77 5 1 0 4 55 1 3 3 3 44 1 3 555 3 4 5 99999999999999999999999999999999 99999 3 111111111111111 888888888 11 999999 4 99 5555555555555555555555 4 444444 777 0 66 0 2 4 55 7777 111 88 5555555 2 4 3 444 99999 1 0 2 4 4
lowQualScore : . .... . . . . . . . . .... ... .. .. . ...... ... . . ... ....... . . .......... ... ... ........... . .. .. . .. .. . . . . .. . . . . .. . . ... . . . ................................ ..... . ............... ......... .. ...... . .. ...................... . ...... ... . .. . . . .. .... ... .. ....... . . . ... ..... . . . . .
lowQualScore : 0 1111 4 6 7 0 4 6 9 0 0000 444 66 22 7 666666 444 1 3 555 0000000 9 6 9999999999 888 000 66666666666 9 99 99 9 11 99 7 0 3 7 66 5 4 1 1 22 4 1 444 1 0 4 66666666666666666666666666666666 88888 2 444444444444444 777777777 00 000000 0 77 5555555555555555555555 0 222222 999 0 55 3 1 0 55 9999 999 66 2222222 9 6 3 111 11111 4 6 5 0 0
consensus : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATCCAAATC-AA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATATTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGTT---CTATT------CTAGGTTTCGG---A--A---TAAAGAC-ATT---TTTATTTGAGC-----N---T-GAACG--C--AA-C-GTG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTNACC-GAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTGCCGTT------T------G--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------NA--AAT--A--T---TC--AG-C---CTTT-CG-AATG-----AAAT--ATAAAGA-CTTTCA-TATT--NATTTCCTAAGATGATATTTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGNGGTTGNATGTANGCTTT
Reference ( gi|18295 ) : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTATA----ATTTCAATTTCCTTTTATCAAAATC-AA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGGT---CTATT------CTAGGTTTCGG---A--A---TAAAGAC-ATT---TTTATTTGAGC-----G---T-GAACG--C--AA-C-GTG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTCACC-AAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAATTTTGCCGTT------T------G--TAC---AT--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------TA--AAT--A--T---TC--AG-C---CTTT-CG-AATG-----AAAT--ATAAAGA-CTTTCA-TGTT--AATTTCCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18296 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATTTGTTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATCCAAATC-AA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GATCACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTC-A----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGTT---CTATT------CTAGGTTTCGG---A--A---TAAAGAC-ATT---TTTATTTGAGC-----G---T-GAACG--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTCACC-GAAGTTGAATAGTTTACATCAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTA-CT---AT-GTAATACATGAGTTTTGCCGTT------T------G--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------AA--AAT--A--G---TC--AG-T---CTTT-CG-AATG-----AAAT--ATAAAGA-CTTTCA-TATT--CATTTCCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTTCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAGTT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18297 : ATAACGGTATGGTATTTATCAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTTTTTCTA----CTTTCAATTTCTTTTTATCCAAATC-AA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAAAACTTTTCCA----A-AT---AAATGCACCTGAATATGATAGAC-ATTTTTAAACAGTT---CTATT------CTTGGTCTCGG---A--A---TAAAGAT-ATT---TTTATTTGAGC-----G---T-GAACG--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTCACT-GAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GAAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTGCCGTT------T------G--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------AA--AAT--A--T---TC--AG-T---CTTT-CA-AATG-----AAAT--ATAAAGA-CTTTCA-TTTT--CATTTTCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TA--TAT---TAACTTATTTATATTTTC-------A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18298 : ATAACGGTATGGTATTTATTAACCATATGGCTGTTGGAGGTACACGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATCCAAATC-AA-ACAAATACTTGCAAAAACATCTA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCTCAATATGATAGACTACCTTTAAACAGTT---CTATT------GTAGGTTTCGG---A--A---TATAGAC-ATT---TTTATTTGAGC-----T---T-GAACA--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTCACC-GAAGCTGAATAGTTCACACAAATATGGC-AGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTGCCGTT------T------G--TAG---AA--------AAACAG---TTCGATCGATAGA---T-------AA--AAT--A--T---TC--AG-T---GTTT-CG-AATG-----AAAT--ATAAAGA-CTTTTA-TATT--CATTTCCTAAAAT-ATATTTGTATGCTCGCATCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTGTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----CCAATAATTGAAATGTGGT
gi|18299 : ATAACGGTATGGTATTTATGAAGCATATAGGTCTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCCATTTCCTTTTATCCAAATC-AA-ACAATAACTTGCAGAAATATTAA-AC----GAACACTAGAT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCTA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGTT---CTATT------CTAGGTTTCGG---A--A---TAAAGAC-ATT---TTTAATTGAGC-----T---T-GAACG--C--AA-C-ACG--ATTGACG-TATTATTAATTAACTCACT-GAAGTTGAATAGTTCATACAGATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTGCCGTT------T------G--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAG----T-------CA--AAT--A--T---TC--AG-T---CTTT-CG-AATT-----AAAT--ATATAGA-C--TCA-TATT--CATTTCCTAAAAT-ATATTTACCTGCTCGCCTTTGCAGT-TG--AAT---TGACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTGGTTCCCCAAACT-TT-A-CG-----GCAATAATTGAAATGTGGCTGTATGTATACTTT
gi|18304 : ATAACGGATTGGTATTTATTAAGCATAT
gi|18305 : ttacaaaaactaACGGATTGGTATTTATTAAGCATATtattccaaataattgcatccgaatatgatagactactattaaacagttctatttaggtttcggaatagagacttttttatttgagcttgaagccttgaacgcaacatgatggatgtattattgattgactaaccgaagttgaatagttcacataaatatggtggagctgcaccatttgctatgttatacatgagttttaccgtttttagaaaaacagtttgatcgatagataaaata
gi|18300 : aactaatGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATCCAAATC-AA-ACAATTAATTGCAAAAACATTAA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----T-AT---AATTGCACCCGAATAAGATAGACTATCTTTAAACAGTT---CTATT------CTAGGTTTCGA---A--A---TAAAGAC-AAT---TTTATTTGAGC-----T---T-GAACG--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTCCCC-GAAGTTGAATTGTCCACACAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTGCCGTaattccaaataattgcatccgaatatgatagactacttttaaacagttctatttaggtttcggaatagagacttttttatttgagcttgaagccttgaacgcaacatgatggatgtattattgattgactaatcgaagttgaatagttcacataaatatggtggagccgcaccatttgctatgttatacatgagttttaccgtttttagaaaaacagtttgatcgatagataaaata
gi|18301 : TATTTATATTATATTTTAA---CATTTTACCCAATT---------TTATTTGTGAATGTGTCTA-AA----AAACA-GTATT--TTCA--ATTTCTAGTGGAATG--GCTTCA----ATAT---AATTACTCCAGAAAATGATAAAATCCCCTTAAATATTTA--ATATTTAATTATTAGGTTTCGG---T--A---TTAAAAC-GTT---TTTGTTTGA-C-----A---TCGACCT--C--AA-T-TTC--ATTTATG-TA-TGTTGCTTGaagtcaggtatacaatcccaaaaaatacaatttagatatgagaaaagtattttaaaataaattataaa
gi|18302 : TA----ATT-CA--TTCAGTTTATAACAATTTAACACAATTTGATGTAAAG-CTTTTG-ACTTTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAACTCATATACTATTCCA----T-ATTAAAGTT----CCAATTAGGACAAACTACCCTTGAATAATT---CTGTG------TTGGGTTTTGGTGTG--A---TAAAGTT-AAA---TTTATTTG--------T---T-GAACGTAC--AA-T-TCT--ATGAATGTTATCATAGGT--ATTAAAC-ATATCTG------TTATATA-------C-AAAAG-TGC--ATTGTTT--TT---ATAACTGTACATAAATTTTGCATTT------T------GGAGAA---AT--------AATC-----TTTGATCAATGGA------------A--AGTGCA--TTTATT--AA-C-----TT-CGTAGTGTCTGCAAAT--GTTGA--------A-TATC--GATCT-CTAAGATAATA-CGGCATGCTCTCCTTTGCAATATC--AAGAGATGGTTTATGTTTATCTTT-TTT-------GTATTACCCCAGATTAGT----T-----ACAATAATCTAGATGGGGTTGAATATAAGCTTTttctcattggaaacaattcgtttaacaataccgggtacattccatataaagggagtaaggcgcgttttatagacaaacaggttttg
gi|18303 : -ACAATTTGTTGTAAAG-C-TTTAGACTGTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAAATGGTATACTATTTCATTTTA-A----AGTT---CCAGAGTAGGACAGATTACCTTTGAATAATT---CTGTG------TTTGGTTTTGGTGTG--A---TACAG----TTTAATTCATTTG--------T---T-GAACG--TAGAA-T-TCT--ATGAACGTTATCATTGGT--ATTAAAC-ATATCTG------TTATATA-------C-GAAGG-TGC--ATTGTTTT-TTGAAAC-TCTGTACATAAATTTTGCTTTT------T------G--GAG---AA--------ATATTC---TTTGATCAATGGAAAGTGCATTTATA--AAT-----T---TCATAG-C---GTCTGCA-AATG--------------------TTGAA-TATT--GATCACCTAAGATAATA-CGGCACGCTCTCTTTTGCAAT-AT--TAT---GAGACGGCTTATGTTTTTTTTT-------GTATTACCCCATATT-AC-G-TT-----ACAATAATCTAGTTGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18304 : TTACAAAAACTAATA-AC----GGATTGGTATT--T-------ATTAAGC---ATATTATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTATTAAACAGTT---CTATT-------TAGGTTTCGG---A--A---TAGAGAC-TTT---TTTATTTGAGCTTGAAGCCTT-GAACG--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTAACC-GAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-TGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTACCGTT------T------T--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------AA--AAT--A--
gi|18305 : A-AC----TAATACGGATTGGTATT---TATTAAGC---ATATAATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTTTTAAACAGTT---CTATT-------TAGGTTTCGG---A--A---TAGAGAC-TTT---TTTATTTGAGCTTGAAGCCTT-GAACG--C--AA-C-ATG--ATGGATG-TATTATTGATTGACTAATC-GAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-CGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACATGAGTTTTACCGTT------T------T--TAG---AA--------AAACAG---TTTGATCGATAGA---T-------AA--AAT--A--
gi|18306 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTCCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATTT---CTTTT------TTCGGTTTAGGT--AGTA---TGAAG----------TTATTCGAA------------GAATT--T--GACC-GTGTTACAGGTG-CATTTTTATTTGTTTGTCT-GATATAAAACATTTCATTTACATATACT-GGGGT-TAT--AGACTTTG-CT---AT-TTTGTACATAAGTTTTGCTTTTCTAAGAT------A--TACTCTGTC-------AAATA-----TTG-TTAATATT---T-------TT--AAT-----T---TC--TG-CAAACTTT-CT-AATG-----AGTT--TTCAA-------CA-TTGT--AAT---CCAAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--TAT---TATTCTATTTAAG--TTGGTTTGACA--GGCGCCACCCCA---T-ATAA-CATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18307 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTTCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATTT---CTTTT------TTCGGTTTAGGT--A--G---TATGGA--ATT------ATTTGAA------------GAATT--T--GA-CCGTGTTACAGGTG-CATTTTTATTTGTTTGTCT-GATATAAAACATTTCATTTACGTATAGT-GGGGT-TAT--A------GACT---AT-TTTGTACATAAATTTTGCT-TT------T------C--TAAG--AT--------ATAC-----TCTG-TCAA-ATA---T-------TGTTAAT--A--T---TTTTAA------TTT-C----TGCA---AAATTTCTAATGAGTTTTCAATATTGTAAT---CTAAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--AA--------------ATATTCT-ATTTG--ACAGGCGCTACCCCA---T-AT-AACATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18308 : TGGAAGATTTTTCCA----T-TT---TACTGGACCATAGTATGTTATACTTTGTTGAAAT-GATACTTTGTT------C--GGTTTTGG---T--TGTTTGAAGA-----------ATTTGACC-----G---T-G---------------TA--ACAGGTG-TATT-TTCATTTGTTTGTCTGAAGTTAAACATTTCAT-TGATTTTGGCTGGGGT-TATTGAC--TTTG-CT---AT-TTTGTACATAAATTTTGT--TT------TCCAGAAA--TAC---ATCCTGTCAAAAACTG---TTAG-----TATG---T-------TT--AAC--ACCT---GC--AA-G---CTTT-CT-AGTG-----TGTT--TTAA-------TCA-T--T--GGTATCC-AAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGC-CT--AAA---TATTCTATCTATGTTC--ATTTG--A--CATGTGCCACC---CT-GT-A-CAACATTACAGTAATCTACATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18309 : TT------TTAAGTTT---------------AAAACTATT---TAAATTTGAGC-----T---T-GAACG--C--AA-G-ATG--ATAGATG-TA---------G------C-A---TTAAATATCTCACGCAAGTATAAC-GGGACATTT--ACTATT-G-C----AT-GT-ATAC--GA--TTTGTC-TT------G------G--TA----AG--------AAA-AGCTATTTGATAGAAAGA---C-------AA--AAC--A--T---TT--AGGC---TTTT-TC-TAT------AACT--ATTTAGA-CGTTCA-TAAT--GAGTCCCTGAAAT-ACATTTGTATGCTCGACTAAGCAGT-TTTGAAT---TTACAT-TTTTTATTTTCATT----A-----ATTGCCCCAAATT-G
gi|18311 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
gi|18310 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111 1111111 111111 11111111 33333333333333333333333333333 111111 11111111111111111111 2 111111 11111
lowQualScore : 0000 0 5 4 0 2 2 3 5555 8 2 44 88 1 999999 555 1 33 2 2222222 0 777777 4444 444 444 999 1 2 99999999 33 2 33 5 2 1 0 1 0 1 2 2 33 0 2 444 2 2 8888 0 2 2 2 444 2 33 44 88888 44 3 44 44444444444444444444444444444 88 555555 88888888888888888888 7 3 666 5 0 4 3 55 666 0 55 222222 1 3 3 3 3 77777 0 1 1 1
lowQualScore : .... . . . . . . . .... . . .. .. . ...... ... . .. . ....... . ...... .... ... ... ... . . ........ .. . .. . . . . . . . . . .. . . ... . . .... . . . . ... . .. .. ..... .. . .. ............................. .. ...... .................... . . ... . . . . .. ... . .. ...... . . . . . ..... . . . .
lowQualScore : 6666 1 0 4 1 3 6 6 5555 8 0 22 55 9 222222 000 2 99 9 4444444 3 999999 3333 777 777 333 0 7 33333333 77 9 77 3 7 9 5 1 5 7 7 7 77 5 7 777 7 7 5555 1 9 9 9 000 3 66 22 22222 22 1 22 44444444444444444444444444444 77 555555 44444444444444444444 3 6 000 0 2 4 6 00 444 6 44 888888 0 5 1 3 3 55555 4 0 0 0
consensus : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTT-GAA--------CG--CAACGTG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--ATT-----------CA---G-C---------CTTTCG-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTCA-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATATTTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
Reference ( family-874 ) : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATATTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CNT-GAA--------CG--CAACGTG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TNA--A-AT--ATT-----------CA---G-C---------CTTTCG-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTCA-T-ATTN--ATTTCCTAAGATGATATTTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGNGGTTGNATGTANGCTTT
gi|18295 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTATA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-AAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGG--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGT-GAA--------CG--CAACGTG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTCACCAAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAATTTTGC-CG-TTTGTA-CATA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TTA--A-AT--ATT-----------CA---G-C---------CTTTCG-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTCA-T-GTTA--ATTTCCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18296 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATTTGTTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GATCACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTC-A----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGT-GAA--------CG--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGTTGAATAGTTTACATCAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTA-CT---ATG-TAATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--AGT-----------CA---G-T---------CTTTCG-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTCA-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTTCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAGTT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18297 : ATAACGGTATGGTATTTATCAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTTTTTCTA----CTTTCAATTTCTTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAAAACTTTTCCA----A-AT---AAATGCACCTGAATATGATAGAC-ATTTTTAAACAGT--TC-TATTC------TTGGTCTCGG---A--ATAAAGAT-ATTT---TTATTT---GAG---CGT-GAA--------CG--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GAAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--ATT-----------CA---G-T---------CTTTCA-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTCA-T-TTTC--ATTTTCTAAAAT-ATATTTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TA--TAT---TAACTTATTTATATTTTC-------A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18298 : ATAACGGTATGGTATTTATTAACCATATGGCTGTTGGAGGTACACGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAAATACTTGCAAAAACATCTA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCTCAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTG------TAGGTTTCGG---A--ATATAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTT-GAA--------CA--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGCTGAATAGTTCACACAAATATGGC-AGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTCGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--ATT-----------CA---G-T---------GTTTCG-AATG-----AAAT---ATAAAGA-CT-------TTTA-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATATTTGTATGCTCGCATCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTGTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----CCAATAATTGAAATGTGGT
gi|18299 : ATAACGGTATGGTATTTATGAAGCATATAGGTCTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCCATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATAACTTGCAGAAATATTAA-AC----GAACACTAGAT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCTA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTAATT---GAG---CTT-GAA--------CG--CAACACG--ATTGACGT-ATTATTAATTA-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCATACAGATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--G----TCA--A-AT--ATT-----------CA---G-T---------CTTTCG-AATT-----AAAT---ATATAGA-C---------TCA-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATATTTACCTGCTCGCCTTTGCAGT-TG--AAT---TGACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTGGTTCCCCAAACT-TT-A-CG-----GCAATAATTGAAATGTGGCTGTATGTATACTTT
gi|18300 : GGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTAATTGCAAAAACATTAA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----T-AT---AATTGCACCCGAATAAGATAGACTATCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGA---A--ATAAAGAC-AATT---TTATTT---GAG---CTT-GAA--------CG--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTCCCCGAAGTTGAATTGTCCACACAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTGC-CG-T
gi|18301 : TATTTATATTATATTTTAA---CATTTTACC-CAATT--------TTATTTGTGAATGTGTCTA-AA----AAACA-GTATT--TTCA--ATTTCTAGTGGAATG--GCTTCA----ATAT---AATTACTCCAGAAAATGATAAAATCCCCTTAAATATT--TAATATTTAATTATTAGGTTTCGG---T--ATTAAAAC-GTTT---TTGTTT---GA----CATCGAC--------CT--CAATTTC--ATTTATGT-A-TGTTGCTTGTTCTCATTGGA----AACAATTCGTTTAACAATACC-GG-----GT--A-CATT---CC---A----TATAAAGGGAGTAAGGCGCGTTTTATA-GACA-AA-CAGGTTTTGaagtcaggtatacaatcccaaaaaatacaatttagatatgagaaaagtattttaaaataaattataaa
gi|18302 : TA----ATT-CA--TTCAGTTTATAACAATTTAACACAATTTGATGTAAAG-CTTTTG-ACTTTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAACTCATATACTATTCCA----T-ATTAAAGTT----CCAATTAGGACAAACTACCCTTGAATAAT--TC-TGTGT------TGGGTTTTGGTGTG--ATAAAGTT-AAAT---TTATTT---G------TT-GAA--------CGTACAATTCT--ATGAATGTTATCATAGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-AAAAG-TGC--ATTGTTT--TT---ATAACTGTACA-TAAATTTTGC-AT-TTTGGA-GAAATAATC----TTTGATCAA-TG--GA-----A--A-GTGCATT-----------TATTAA-C-----------TTCGTAGTGTCTGCAAAT---GTTGA---------------A-T-ATCG--ATCTC-TAAGATAATACG-GCATGCTCTCCTTTGCAATATC--AAGAGATGGTTTATGTTTATCTTT-TTTG-------TATTACCCCAGATTAGT-T--------ACAATAATCTAGATGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18303 : -ACAATTTGTTGTAAAG-C-TTTAGACTGTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAAATGGTATACTATTTCATTTTA-A----AGTT---CCAGAGTAGGACAGATTACCTTTGAATAAT--TC-TGTGT------TTGGTTTTGGTGTG--ATACAG----TTTAATTCATTT---G------TT-GAA--------CG--TAGAATTCTATGAACGTTATCATTGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-GAAGG-TGC--ATTGTTTT-TTGAAACT-CTGTACA-TAAATTTTGC-TT-TTTGGA-GAAA-TA-TTC--TTTGATCAA-TG--GA-----A--A-GT---------------------G-C---------ATTT----AT------AAATTTCATAGCGT-CTGCAAATGTTGAAT-ATTG--ATCACCTAAGATAATACG-GCACGCTCTCTTTTGCAAT-AT--TAT---GAGACGGCTTATGTTTTTTTTTG-------TATTACCCCATATT-AC-G-TT-----ACAATAATCTAGTTGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18304 : TTACAAAAACTAATA-AC----GGATTGGTATT--T-------ATTAAGC---ATATTATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTATTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTT-GAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTAACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-TGC--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--A
gi|18305 : A-AC----TAATACGGATTGGTATT---TATTAAGC---ATATAATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTTTTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTT-GAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATGT-ATTATTGATTG-ACTAATCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-CGC--ACCATTTG-CT---ATG-TTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTTA-GAAA-AA-CAG--TTTGATCGA-TA--GA---TAA--A-AT--A
gi|18306 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTCCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--AGTATGAAG----------TTATTCGAAGAA---TTT-GAC--------CG-----TGTT--ACAGGTGC-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACATATACT-GGGGT-TAT--AGACTTTG-CT---ATT-TTGTACA-TAAGTTTTGC-T--TTTCTA--AGA-TA-TAC--TCTG-TCAA--A--TA---TTGTTA-AT--ATTTTTAATTTCTGCA---A-A---------CTTTCT-AATG-----AGTT---TTCAA--------------CA-T-TGTA--AT---CCAAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--TAT---TATTCTATTTAAG--TTGGTTTGACA--GGCGCCACCCCA---T-ATAA-CATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18307 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTTCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--A--GTATGGA--ATT------ATTT---GAAGAATTT-GAC--------CG--T---GTT--ACAGGTGC-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACGTATAGT-GGGGT-TAT--A------GACT---ATT-TTGTACA-TAAATTTTGC-T--TTTCTA--AGA-TA-TAC--TCTG-TCAAATATTGT---TAA--T-AT--TTT-----------TA---A------------TTTC----TGCA---AAATTT-CTAATGAGTT-------TTCAAT-ATTGTAAT---CTAAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--AA--------------ATATTCT-ATTTG--ACAGGCGCTACCCCA---T-AT-AACATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18308 : TGGAAGATTTTTCCA----T-TT---TACTGGACCATAGTATGTTATACTTTGTTGAAATGATACTT-TGTTC--------GGTTTTGG----------------------TTGTTT---GAAGAATTT-GAC--------CG--T---GTA--ACAGGTGT-ATTTTCATTTG-TTTGTCTGAAGTTAAACATTTCAT-TGATTTTGGCTGGGGT-TATTGAC--TTTG-CT---ATT-TTGTACA-TAAATTTTGT----TTTCCA-GAAA-TA-CAT--CCTG-TCAA--A--AACTGTTA--GTAT--GTT-----------TA---A-CACCTGCAAGCTTTCT-AGTG--------T---GT-------T-------TTAA-TCATTG--GTATCC-AAGATGAT-TTTGCAAGCACGTTTTTGGAGC-CT--AAA---TATTCTATCTATG--TTCATTTG--A--CATGTGCCACC---CT-GT-A-CAACATTACAGTAATCTACATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18309 : TTT------TAAGTTT------------AAAACTATTT---AAATTT---GAG---CTT-GAA--------CG--CAAGATG--ATAGATGT-AGCATTAA-------------------ATATCTCACGCAAGTATAAC-GGGACATTT--ACTATT-G-C----ATG-T-ATAC---GA--TTTGT-C--TTGGTAAGAAA-AG-CTA--TTTGATAGA-AA--GA---CAA--A-AC--ATT-----------TA---GGC---------TTTTTC-TAT------AACT---ATTTAGA-CG-------TTCA-T-AATG--AGTCCCTGAAAT-ACATTTGTATGCTCGACTAAGCAGT-TTTGAAT---TTACAT-TTTTTATTTTCATT----A-----ATTGCCCCAAATT-G
gi|18310 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
gi|18311 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111 1111111 111111 11111111 111111111111111 11111111111111 333333333333333 11111 111 1 1111111 11111
lowQualScore : 0000 0 5 4 0 2 2 3 5555 8 2 44 88 1 999999 555 1 33 2 2222222 0 777777 4444 444 444 999 99999999 33 2 33 2 2 2 1 0 1 0 1 2 2 33 0 2 444 2 2 8888 666666666666666 2 333 2 444 2 1 2 2 2 77777777777777 2 33 555 000000000000000 3 99 66666 555 44 22 7 3 3 3 000 5 0 0 55 7 3 55 666 0 66 2222222 1 3 3 3 3 77777 0 1 1 1
lowQualScore : .... . . . . . . . .... . . .. .. . ...... ... . .. . ....... . ...... .... ... ... ... ........ .. . .. . . . . . . . . . . .. . . ... . . .... ............... . ... . ... . . . . . .............. . .. ... ............... . .. ..... ... .. .. . . . . ... . . . .. . . .. ... . .. ....... . . . . . ..... . . . .
lowQualScore : 6666 1 0 4 1 3 6 6 5555 8 0 22 55 9 222222 000 2 99 9 4444444 3 999999 3333 777 777 333 33333333 77 9 77 7 7 7 9 5 1 5 7 7 7 77 5 7 777 7 7 5555 777777777777777 7 333 7 111 7 5 9 9 9 99999999999999 9 99 888 333333333333333 3 88 22222 888 66 00 3 6 6 6 555 0 5 9 66 3 6 00 444 6 22 6666666 0 5 1 3 3 55555 4 5 0 0
consensus : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
Reference ( family-874 ) : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
gi|18295 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTATA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-AAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGG--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCAAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAATTTTGC-CG-TTTGT---------------A-CATA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TT-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-GTTA--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18296 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATTTGTTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GATCACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTC-A----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGTTGAATAGTTTACATCAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTA-CT---AT-GTAATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AG---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTTCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAGTT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18297 : ATAACGGTATGGTATTTATCAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTTTTTCTA----CTTTCAATTTCTTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAAAACTTTTCCA----A-AT---AAATGCACCTGAATATGATAGAC-ATTTTTAAACAGT--TC-TATTC------TTGGTCTCGG---A--ATAAAGAT-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GAAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CA-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-TTTC--ATTTTCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TA--TAT---TAACTTATTTATATTTTC-------A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18298 : ATAACGGTATGGTATTTATTAACCATATGGCTGTTGGAGGTACACGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAAATACTTGCAAAAACATCTA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCTCAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTG------TAGGTTTCGG---A--ATATAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACA--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGCTGAATAGTTCACACAAATATGGC-AGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTC-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------GTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTT-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGTATGCTCGCATCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTGTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----CCAATAATTGAAATGTGGT
gi|18299 : ATAACGGTATGGTATTTATGAAGCATATAGGTCTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCCATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATAACTTGCAGAAATATTAA-AC----GAACACTAGAT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCTA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTAATT---GAG---CTTG--------AACG--CAACACG--ATTGACG-T-ATTATTAATTA-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCATACAGATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---G----------TC-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATT-----AAA---T--ATATAGA-C--TC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTACCTGCTCGCCTTTGCAGT-TG--AAT---TGACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTGGTTCCCCAAACT-TT-A-CG-----GCAATAATTGAAATGTGGCTGTATGTATACTTT
gi|18300 : GGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTAATTGCAAAAACATTAA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----T-AT---AATTGCACCCGAATAAGATAGACTATCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGA---A--ATAAAGAC-AATT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCCCCGAAGTTGAATTGTCCACACAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TAAGTCAGGTATACAATCCCA-AAAA-ATA-CAA--TTTAGAT---A-TGA---GA----------A-AAGT--AT---------------------TTT-AA-AATA-----AAT---T--ATAAA
gi|18301 : TATTTATATTATATTTTAA---CATTTTACC-CAATT--------TTATTTGTGAATGTGTCTA-AA----AAACA-GTATT--TTCA--ATTTCTAGTGGAATG--GCTTCA----ATAT---AATTACTCCAGAAAATGATAAAATCCCCTTAAATATT--TAATATTTAATTATTAGGTTTCGG---T--ATTAAAAC-GTTT---TTGTTT---GAC---ATCG--------ACCT--CAATTTC--ATTTATG-T-A-TGTTGCTTGTTCTCATTGGA----AACAATTCGTTTAACAATACC-GG-----GT--A-CATT---CC---A----TATAAAGGGAGTAAGGCGCGTTTTAT---------------A-GACA-A-A-CAGGTTTT-G
gi|18302 : TA----ATT-CA--TTCAGTTTATAACAATTTAACACAATTTGATGTAAAG-CTTTTG-ACTTTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAACTCATATACTATTCCA----T-ATTAAAGTT----CCAATTAGGACAAACTACCCTTGAATAAT--TC-TGTGT------TGGGTTTTGGTGTG--ATAAAGTT-AAAT---TTATTT---G------TTG--------AACGTACAATTCT--ATGAATGTT-ATCATAGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-AAAAG-TGC--ATTGTTT--TT---ATAACTGTACA-TAAATTTTGC-AT-TTTGG---------------A-GAAATA-ATC----TTT-GATC-AA-T-G---G-----------A-AAGTGCATTTATTA--A-C-----------TT-CGTAGTGTCTGCAAA---T--GTTGA---------A-T-ATCG--ATCT-CTAAGAT-A-ATACGGCATGCTCTCCTTTGCAATATC--AAGAGATGGTTTATGTTTATCTTT-TTT-------GTATTACCCCAGATTAGT----T-----ACAATAATCTAGATGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18303 : -ACAATTTGTTGTAAAG-C-TTTAGACTGTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAAATGGTATACTATTTCATTTTA-A----AGTT---CCAGAGTAGGACAGATTACCTTTGAATAAT--TC-TGTGT------TTGGTTTTGGTGTG--ATACAG----TTTAATTCATTT---G------TTG--------AACG--TAGAATTCTATGAACG-TTATCATTGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-GAAGG-TGC--ATTGTTTT-TTGAAAC-TCTGTACA-TAAATTTTGC-TT-TTTGG---------------A-GAAA-T-A-TTC--TTT-GATC-AA-T-G---GAAAGTGCATTTATAAAT---T---TCATAG-C---------GTCTGCA-AATG-----------------------TTGA-A-T-ATTG--ATCACCTAAGAT-A-ATACGGCACGCTCTCTTTTGCAAT-AT--TAT---GAGACGGCTTATGTTTTTTTTT-------GTATTACCCCATATT-AC-G-TT-----ACAATAATCTAGTTGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18304 : TTACAAAAACTAATA-AC----GGATTGGTATT--T-------ATTAAGC---ATATTATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTATTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-TGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18305 : A-AC----TAATACGGATTGGTATT---TATTAAGC---ATATAATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTTTTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAATCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-CGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18306 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTCCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--AGTATGAAG----------TTATTCGAAGAA---TTTG--------ACCG-----TGTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACATATACT-GGGGT-TAT--AGACTTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAGTTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TCAAA-T-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGC----AAACTTT--CTAATGAGTTTTCAA-C-ATTGTAAT---CCAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--TAT---TATTCTATTTAAG--TTGGTTTGACA--GGCGCCACCCCA---T-ATAA-CATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18307 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTTCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--A--GTATGGA--ATT------ATTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACGTATAGT-GGGGT-TAT--A------GACT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TC-AAAT-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGCA---AAA---TTTCTAATGAGTTTTC-AAT-ATTGTAAT---CTAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--AA--------------ATATTCT-ATTTG--ACAGGCGCTACCCCA---T-AT-AACATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18308 : TGGAAGATTTTTCCA----T-TT---TACTGGACCATAGTATGTTATACTTTGTTGAAATGATACTT-TGTTC--------GGTTTTGG----------------------TTGTTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTA--ACAGGTG-T-ATTTTCATTTG-TTTGTCTGAAGTTAAACATTTCAT-TGATTTTGGCTGGGGT-TATTGAC--TTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGT----TTTCC---------------A-GAAA-T-A-CAT--CCT-G-TC-AA-A-AACTGT---------TA-GTAT--GT---TTA--A-CACCTGCAAGCTTT-CT-AGTG-----------T--GT-------TTTA-A-TCATTG--GTATCC-AAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGC-CT--AAA---TATTCTATCTATGTTC--ATTTG--A--CATGTGCCACC---CT-GT-A-CAACATTACAGTAATCTACATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18309 : TTT------TAAGTTT------------AAAACTATTT---AAATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAAGATG--ATAGATG-T-AGCATTAA-------------------ATATCTCACGCAAGTATAAC-GGGACATTT--ACTATT-G-C----AT-GT-ATAC---GA--TTTGT-C--TTGGT---------------AAGAAA-A-G-CTA--TTT-GATA-GA-A-A---GA---------CA-AAAC--AT---TTA--GGC---------TTTT-TC-TAT------AAC---T--ATTTAGA-CGTTC-A-T-AATG--AGTCCCTGAAAT-ACAT-TTGTATGCTCGACTAAGCAGT-TTTGAAT---TTACAT-TTTTTATTTTCATT----A-----ATTGCCCCAAATT-G
gi|18310 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
gi|18311 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111 1111111 111111 11111111 111111111111111 11111111111111 333333333333333 11111 111 1 1111111 11111
lowQualScore : 0000 0 5 4 0 2 2 3 5555 8 2 44 88 1 999999 555 1 33 2 2222222 0 777777 4444 444 444 999 99999999 33 2 33 2 2 2 1 0 1 0 1 2 2 33 0 2 444 2 2 8888 666666666666666 2 333 2 444 2 1 2 2 2 77777777777777 2 33 555 000000000000000 3 99 66666 555 44 22 7 3 3 3 000 5 0 0 55 7 3 55 666 0 66 2222222 1 3 3 3 3 77777 0 1 1 1
lowQualScore : .... . . . . . . . .... . . .. .. . ...... ... . .. . ....... . ...... .... ... ... ... ........ .. . .. . . . . . . . . . . .. . . ... . . .... ............... . ... . ... . . . . . .............. . .. ... ............... . .. ..... ... .. .. . . . . ... . . . .. . . .. ... . .. ....... . . . . . ..... . . . .
lowQualScore : 6666 1 0 4 1 3 6 6 5555 8 0 22 55 9 222222 000 2 99 9 4444444 3 999999 3333 777 777 333 33333333 77 9 77 7 7 7 9 5 1 5 7 7 7 77 5 7 777 7 7 5555 777777777777777 7 333 7 111 7 5 9 9 9 99999999999999 9 99 888 333333333333333 3 88 22222 888 66 00 3 6 6 6 555 0 5 9 66 3 6 00 444 6 22 6666666 0 5 1 3 3 55555 4 5 0 0
consensus : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
Reference ( family-874 ) : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
gi|18295 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTATA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-AAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGG--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCAAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAATTTTGC-CG-TTTGT---------------A-CATA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TT-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-GTTA--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18296 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATTTGTTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GATCACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTC-A----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGTTGAATAGTTTACATCAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTA-CT---AT-GTAATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AG---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTTCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAGTT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18297 : ATAACGGTATGGTATTTATCAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTTTTTCTA----CTTTCAATTTCTTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAAAACTTTTCCA----A-AT---AAATGCACCTGAATATGATAGAC-ATTTTTAAACAGT--TC-TATTC------TTGGTCTCGG---A--ATAAAGAT-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GAAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CA-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-TTTC--ATTTTCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TA--TAT---TAACTTATTTATATTTTC-------A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18298 : ATAACGGTATGGTATTTATTAACCATATGGCTGTTGGAGGTACACGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAAATACTTGCAAAAACATCTA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCTCAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTG------TAGGTTTCGG---A--ATATAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACA--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGCTGAATAGTTCACACAAATATGGC-AGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTC-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------GTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTT-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGTATGCTCGCATCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTGTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----CCAATAATTGAAATGTGGT
gi|18299 : ATAACGGTATGGTATTTATGAAGCATATAGGTCTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCCATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATAACTTGCAGAAATATTAA-AC----GAACACTAGAT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCTA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTAATT---GAG---CTTG--------AACG--CAACACG--ATTGACG-T-ATTATTAATTA-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCATACAGATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---G----------TC-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATT-----AAA---T--ATATAGA-C--TC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTACCTGCTCGCCTTTGCAGT-TG--AAT---TGACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTGGTTCCCCAAACT-TT-A-CG-----GCAATAATTGAAATGTGGCTGTATGTATACTTT
gi|18300 : GGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTAATTGCAAAAACATTAA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----T-AT---AATTGCACCCGAATAAGATAGACTATCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGA---A--ATAAAGAC-AATT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCCCCGAAGTTGAATTGTCCACACAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TAAGTCAGGTATACAATCCCA-AAAA-ATA-CAA--TTTAGAT---A-TGA---GA----------A-AAGT--AT---------------------TTT-AA-AATA-----AAT---T--ATAAA
gi|18301 : TATTTATATTATATTTTAA---CATTTTACC-CAATT--------TTATTTGTGAATGTGTCTA-AA----AAACA-GTATT--TTCA--ATTTCTAGTGGAATG--GCTTCA----ATAT---AATTACTCCAGAAAATGATAAAATCCCCTTAAATATT--TAATATTTAATTATTAGGTTTCGG---T--ATTAAAAC-GTTT---TTGTTT---GAC---ATCG--------ACCT--CAATTTC--ATTTATG-T-A-TGTTGCTTGTTCTCATTGGA----AACAATTCGTTTAACAATACC-GG-----GT--A-CATT---CC---A----TATAAAGGGAGTAAGGCGCGTTTTAT---------------A-GACA-A-A-CAGGTTTT-G
gi|18302 : TA----ATT-CA--TTCAGTTTATAACAATTTAACACAATTTGATGTAAAG-CTTTTG-ACTTTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAACTCATATACTATTCCA----T-ATTAAAGTT----CCAATTAGGACAAACTACCCTTGAATAAT--TC-TGTGT------TGGGTTTTGGTGTG--ATAAAGTT-AAAT---TTATTT---G------TTG--------AACGTACAATTCT--ATGAATGTT-ATCATAGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-AAAAG-TGC--ATTGTTT--TT---ATAACTGTACA-TAAATTTTGC-AT-TTTGG---------------A-GAAATA-ATC----TTT-GATC-AA-T-G---G-----------A-AAGTGCATTTATTA--A-C-----------TT-CGTAGTGTCTGCAAA---T--GTTGA---------A-T-ATCG--ATCT-CTAAGAT-A-ATACGGCATGCTCTCCTTTGCAATATC--AAGAGATGGTTTATGTTTATCTTT-TTT-------GTATTACCCCAGATTAGT----T-----ACAATAATCTAGATGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18303 : -ACAATTTGTTGTAAAG-C-TTTAGACTGTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAAATGGTATACTATTTCATTTTA-A----AGTT---CCAGAGTAGGACAGATTACCTTTGAATAAT--TC-TGTGT------TTGGTTTTGGTGTG--ATACAG----TTTAATTCATTT---G------TTG--------AACG--TAGAATTCTATGAACG-TTATCATTGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-GAAGG-TGC--ATTGTTTT-TTGAAAC-TCTGTACA-TAAATTTTGC-TT-TTTGG---------------A-GAAA-T-A-TTC--TTT-GATC-AA-T-G---GAAAGTGCATTTATAAAT---T---TCATAG-C---------GTCTGCA-AATG-----------------------TTGA-A-T-ATTG--ATCACCTAAGAT-A-ATACGGCACGCTCTCTTTTGCAAT-AT--TAT---GAGACGGCTTATGTTTTTTTTT-------GTATTACCCCATATT-AC-G-TT-----ACAATAATCTAGTTGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18304 : TTACAAAAACTAATA-AC----GGATTGGTATT--T-------ATTAAGC---ATATTATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTATTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-TGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18305 : A-AC----TAATACGGATTGGTATT---TATTAAGC---ATATAATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTTTTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAATCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-CGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18306 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTCCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--AGTATGAAG----------TTATTCGAAGAA---TTTG--------ACCG-----TGTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACATATACT-GGGGT-TAT--AGACTTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAGTTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TCAAA-T-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGC----AAACTTT--CTAATGAGTTTTCAA-C-ATTGTAAT---CCAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--TAT---TATTCTATTTAAG--TTGGTTTGACA--GGCGCCACCCCA---T-ATAA-CATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18307 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTTCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--A--GTATGGA--ATT------ATTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACGTATAGT-GGGGT-TAT--A------GACT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TC-AAAT-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGCA---AAA---TTTCTAATGAGTTTTC-AAT-ATTGTAAT---CTAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--AA--------------ATATTCT-ATTTG--ACAGGCGCTACCCCA---T-AT-AACATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18308 : TGGAAGATTTTTCCA----T-TT---TACTGGACCATAGTATGTTATACTTTGTTGAAATGATACTT-TGTTC--------GGTTTTGG----------------------TTGTTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTA--ACAGGTG-T-ATTTTCATTTG-TTTGTCTGAAGTTAAACATTTCAT-TGATTTTGGCTGGGGT-TATTGAC--TTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGT----TTTCC---------------A-GAAA-T-A-CAT--CCT-G-TC-AA-A-AACTGT---------TA-GTAT--GT---TTA--A-CACCTGCAAGCTTT-CT-AGTG-----------T--GT-------TTTA-A-TCATTG--GTATCC-AAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGC-CT--AAA---TATTCTATCTATGTTC--ATTTG--A--CATGTGCCACC---CT-GT-A-CAACATTACAGTAATCTACATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18309 : TTT------TAAGTTT------------AAAACTATTT---AAATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAAGATG--ATAGATG-T-AGCATTAA-------------------ATATCTCACGCAAGTATAAC-GGGACATTT--ACTATT-G-C----AT-GT-ATAC---GA--TTTGT-C--TTGGT---------------AAGAAA-A-G-CTA--TTT-GATA-GA-A-A---GA---------CA-AAAC--AT---TTA--GGC---------TTTT-TC-TAT------AAC---T--ATTTAGA-CGTTC-A-T-AATG--AGTCCCTGAAAT-ACAT-TTGTATGCTCGACTAAGCAGT-TTTGAAT---TTACAT-TTTTTATTTTCATT----A-----ATTGCCCCAAATT-G
gi|18310 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
gi|18311 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
blockSeqs : TTAT A C A A G TTTA C C GG TA A TTTTA TAA C AC A TAATTAT TGTG ACTA AAT GAA GAA AAGCCTTG TA A CT T T T C G A T A TG A GAA A G GCGT CAGGTATACAATCCC A AT T GGT A A A A G GAAAGTGCATT T GC TTA ACACCTGCAAGC G GT TCTGC CTT TT AA G A A C GTA T G TA A A TG AGA TA GACAG T A A A A ACATT T T T
blockSeqs : . . . A A . TGTA C C . TA A AT . T . . C TGTG ACA . . GAA AAGCCTTG . A . . . . C G A . . . . . . . CG . . TA . G . A . . . ACTGT . . . TAGCG . G CA . . AA G . . . GTA T G TA A . . . TA GACAG T A . . . TT T T T
blockSeqs : . . . A A . . T C . . A A . T . . C TAGT ATA . . . . . A . . . . C G A . . . . . . . CG . . A . G . A . . . TTGT . . . GGCT . A C . . AA . . . . C T G TA . . . . TA GAA T A . . . TT T T T
blockSeqs : . . . A A . . C A . . A A . C . . G TA ACA . . . . . A . . . . C G G . . . . . . . CG . . A . G . A . . . TTGT . . . GTC . G . . . AT . . . . C T . TA . . . . TT GAA T A . . . . T A A
blockSeqs : . . . A A . . T C . . A A . C . . C A ACA . . . . . A . . . . C G A . . . . . . . CG . . A . G . A . . . GA . . . GTC . G . . . AA . . . . C C . CA . . . . GG GAA A G . . . . G A A
blockSeqs : . . . G G . . G T . . A A . A . . C A ACA . . . . . T . . . . C A A . . . . . . . CG . . A . A . A . . . GA . . . GTG . A . . . TG . . . . C C . A . . . . CA GAC A T . . . . G A A
blockSeqs : . . . A T . . C T . . T T . C . . T A ACG . . . . . T . . . . A G A . . . . . . . AT . . A . C . A . . . GA . . . GTC . A . . . AA . . . . G A . A . . . . C AA A A . . . . A A A
blockSeqs : . . T . . . G . . T T . A . . T A TTA . . . . . A . . . . A G A . . . . . . . TT . . T . G . A . . . GA . . . AC . T . . . AA . . . . G T . T . . . . T A A A . . . . A A A
blockSeqs : . . . . . . . . T A . C . . T A ACT . . . . . A . . . . A T C . . . . . . . CG . . A . G . A . . . GA . . . A . C . . . TT . . . . G . . T . . . . A . C A . . . . A T T
blockSeqs : . . . . . . T A . C . . T T ACT . . . . . A . . . . A T C . . . . . . . CG . . A . C . A . . . GA . . . A . . . . . . . . . . G . . T . . . . A . G . . . . . T T T
blockSeqs : . . A T . A . . C A AA . . . . . G . . . . G T A . . . . . . . T . . T . C . . . . . GA . . . . . . . . . . T . . . . . T
blockSeqs : . . . T . A . . T A . . . . . . G . . . . G T A . . . . . . . T . . T . T . . . . . G . . T . .
blockSeqs : . T . A . . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . C . . T . A . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqCons : TA
originalCons : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
finalCons : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111 1111111 111111 11111111 111111111111111 11111111111111 333333333333333 11111 111 1 1111111 11111
lowQualScore : 0000 0 5 4 0 2 2 3 5555 8 2 44 88 1 999999 555 1 33 2 2222222 0 777777 4444 444 444 999 99999999 33 2 33 2 2 2 1 0 1 0 1 2 2 33 0 2 444 2 2 8888 666666666666666 2 333 2 444 2 1 2 2 2 77777777777777 2 33 555 000000000000000 3 99 66666 555 44 22 7 3 3 3 000 5 0 0 55 7 3 55 666 0 66 2222222 1 3 3 3 3 77777 0 1 1 1
lowQualScore : .... . . . . . . . .... . . .. .. . ...... ... . .. . ....... . ...... .... ... ... ... ........ .. . .. . . . . . . . . . . .. . . ... . . .... ............... . ... . ... . . . . . .............. . .. ... ............... . .. ..... ... .. .. . . . . ... . . . .. . . .. ... . .. ....... . . . . . ..... . . . .
lowQualScore : 6666 1 0 4 1 3 6 6 5555 8 0 22 55 9 222222 000 2 99 9 4444444 3 999999 3333 777 777 333 33333333 77 9 77 7 7 7 9 5 1 5 7 7 7 77 5 7 777 7 7 5555 777777777777777 7 333 7 111 7 5 9 9 9 99999999999999 9 99 888 333333333333333 3 88 22222 888 66 00 3 6 6 6 555 0 5 9 66 3 6 00 444 6 22 6666666 0 5 1 3 3 55555 4 5 0 0
consensus : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
Reference ( family-874 ) : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTNACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTG--ATTTCCTAAGAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTTTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--GGTATTNCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATCGAAATGTGGTTGNATGTANGCTTT
gi|18295 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTATTTATA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-AAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGG--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACGTG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCAAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAATTTTGC-CG-TTTGT---------------A-CATA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TT-AAAT--AT---TCA--G-C---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-GTTA--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18296 : ATAACGGTATGGTATTTATTAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATTTGTTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GATCACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTC-A----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGTTGAATAGTTTACATCAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTA-CT---AT-GTAATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AG---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTTCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAGTT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18297 : ATAACGGTATGGTATTTATCAAGCATATGGCTGTTGGAGGTACATGTTTTTCTA----CTTTCAATTTCTTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTACTTGCAAAAACATTTA-AC----GAACACGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAAAACTTTTCCA----A-AT---AAATGCACCTGAATATGATAGAC-ATTTTTAAACAGT--TC-TATTC------TTGGTCTCGG---A--ATAAAGAT-ATTT---TTATTT---GAG---CGTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGC-GAAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CA-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTC-A-T-TTTC--ATTTTCTAAAAT-ATAT-TTGCATGCTCGCCTCTGCAGT-TA--TAT---TAACTTATTTATATTTTC-------A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACAATAATTGAAATGTGGTTGTATGTATGCTTT
gi|18298 : ATAACGGTATGGTATTTATTAACCATATGGCTGTTGGAGGTACACGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAAATACTTGCAAAAACATCTA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----A-AT---AATTGCACCTCAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTG------TAGGTTTCGG---A--ATATAGAC-ATTT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACA--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCACCGAAGCTGAATAGTTCACACAAATATGGC-AGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTC-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--AT---TCA--G-T---------GTTT-CG-AATG-----AAA---T--ATAAAGA-CTTTT-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTGTATGCTCGCATCTGCAGT-TT--AAT---TAACTTATTTATATTTGTATTTG--A--AGTATTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----CCAATAATTGAAATGTGGT
gi|18299 : ATAACGGTATGGTATTTATGAAGCATATAGGTCTTGGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCCATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATAACTTGCAGAAATATTAA-AC----GAACACTAGAT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCTA----A-AT---AATTGCACCCGAATATGATAGACTACCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGG---A--ATAAAGAC-ATTT---TTAATT---GAG---CTTG--------AACG--CAACACG--ATTGACG-T-ATTATTAATTA-ACTCACTGAAGTTGAATAGTTCATACAGATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TTTGT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---G----------TC-AAAT--AT---TCA--G-T---------CTTT-CG-AATT-----AAA---T--ATATAGA-C--TC-A-T-ATTC--ATTTCCTAAAAT-ATAT-TTACCTGCTCGCCTTTGCAGT-TG--AAT---TGACTTATTTATATTTTTATTTG--A--AGTGGTTCCCCAAACT-TT-A-CG-----GCAATAATTGAAATGTGGCTGTATGTATACTTT
gi|18300 : GGAGGTACATGTATTTCTA----ATTTCAATTTCCTTTTATC-CAAATCAA-ACAATTAATTGCAAAAACATTAA-AC----GAACATGCGTT--TCTT--ATACTAAGTGGAATACTATTCCA----T-AT---AATTGCACCCGAATAAGATAGACTATCTTTAAACAGT--TC-TATTC------TAGGTTTCGA---A--ATAAAGAC-AATT---TTATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTCCCCGAAGTTGAATTGTCCACACAAATATGGC-GGAGC-TGT--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTGC-CG-TAAGTCAGGTATACAATCCCA-AAAA-ATA-CAA--TTTAGAT---A-TGA---GA----------A-AAGT--AT---------------------TTT-AA-AATA-----AAT---T--ATAAA
gi|18301 : TATTTATATTATATTTTAA---CATTTTACC-CAATT--------TTATTTGTGAATGTGTCTA-AA----AAACA-GTATT--TTCA--ATTTCTAGTGGAATG--GCTTCA----ATAT---AATTACTCCAGAAAATGATAAAATCCCCTTAAATATT--TAATATTTAATTATTAGGTTTCGG---T--ATTAAAAC-GTTT---TTGTTT---GAC---ATCG--------ACCT--CAATTTC--ATTTATG-T-A-TGTTGCTTGTTCTCATTGGA----AACAATTCGTTTAACAATACC-GG-----GT--A-CATT---CC---A----TATAAAGGGAGTAAGGCGCGTTTTAT---------------A-GACA-A-A-CAGGTTTT-G
gi|18302 : TA----ATT-CA--TTCAGTTTATAACAATTTAACACAATTTGATGTAAAG-CTTTTG-ACTTTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAACTCATATACTATTCCA----T-ATTAAAGTT----CCAATTAGGACAAACTACCCTTGAATAAT--TC-TGTGT------TGGGTTTTGGTGTG--ATAAAGTT-AAAT---TTATTT---G------TTG--------AACGTACAATTCT--ATGAATGTT-ATCATAGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-AAAAG-TGC--ATTGTTT--TT---ATAACTGTACA-TAAATTTTGC-AT-TTTGG---------------A-GAAATA-ATC----TTT-GATC-AA-T-G---G-----------A-AAGTGCATTTATTA--A-C-----------TT-CGTAGTGTCTGCAAA---T--GTTGA---------A-T-ATCG--ATCT-CTAAGAT-A-ATACGGCATGCTCTCCTTTGCAATATC--AAGAGATGGTTTATGTTTATCTTT-TTT-------GTATTACCCCAGATTAGT----T-----ACAATAATCTAGATGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18303 : -ACAATTTGTTGTAAAG-C-TTTAGACTGTAGTACA---GTT--TCTG--ATATTAAATGGTATACTATTTCATTTTA-A----AGTT---CCAGAGTAGGACAGATTACCTTTGAATAAT--TC-TGTGT------TTGGTTTTGGTGTG--ATACAG----TTTAATTCATTT---G------TTG--------AACG--TAGAATTCTATGAACG-TTATCATTGGT---ATTAAACATATCTG------TTATATA-------C-GAAGG-TGC--ATTGTTTT-TTGAAAC-TCTGTACA-TAAATTTTGC-TT-TTTGG---------------A-GAAA-T-A-TTC--TTT-GATC-AA-T-G---GAAAGTGCATTTATAAAT---T---TCATAG-C---------GTCTGCA-AATG-----------------------TTGA-A-T-ATTG--ATCACCTAAGAT-A-ATACGGCACGCTCTCTTTTGCAAT-AT--TAT---GAGACGGCTTATGTTTTTTTTT-------GTATTACCCCATATT-AC-G-TT-----ACAATAATCTAGTTGGGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18304 : TTACAAAAACTAATA-AC----GGATTGGTATT--T-------ATTAAGC---ATATTATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTATTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAACCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-TGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18305 : A-AC----TAATACGGATTGGTATT---TATTAAGC---ATATAATTCCA----A-AT---AATTGCATCCGAATATGATAGACTACTTTTAAACAGT--TC-TATT-------TAGGTTTCGG---A--ATAGAGAC-TTTT---TTATTT---GAG---CTTGAAGCCTTGAACG--CAACATG--ATGGATG-T-ATTATTGATTG-ACTAATCGAAGTTGAATAGTTCACATAAATATGGT-GGAGC-CGC--ACCATTTG-CT---AT-GTTATACA-TGAGTTTTAC-CG-TTTTT---------------A-GAAA-A-A-CAG--TTT-GATC-GA-T-A---GA---------TA-AAAT--A
gi|18306 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTCCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--AGTATGAAG----------TTATTCGAAGAA---TTTG--------ACCG-----TGTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACATATACT-GGGGT-TAT--AGACTTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAGTTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TCAAA-T-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGC----AAACTTT--CTAATGAGTTTTCAA-C-ATTGTAAT---CCAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--TAT---TATTCTATTTAAG--TTGGTTTGACA--GGCGCCACCCCA---T-ATAA-CATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18307 : TT--TCTTTAATATTTACTGGTAGATTATTTCA----T-AT---TATTGGACCAGAGTATGTTAAACTTTGTTTAAATATT--TC-TTTTT------TCGGTTTAGGT--A--GTATGGA--ATT------ATTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTT--ACAGGTG-C-ATTTTTATTTG-TTTGTCTGATATAAAACATTTCATTTACGTATAGT-GGGGT-TAT--A------GACT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGC-T--TTTCT---------------A--AGA-T-A-TAC--TCT-G-TC-AAAT-ATT-GT---------TA-ATAT--TT---TTA--A------------TTT-C----TGCA---AAA---TTTCTAATGAGTTTTC-AAT-ATTGTAAT---CTAAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGT-CT--AA--------------ATATTCT-ATTTG--ACAGGCGCTACCCCA---T-AT-AACATT---ACAATAATCTATATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18308 : TGGAAGATTTTTCCA----T-TT---TACTGGACCATAGTATGTTATACTTTGTTGAAATGATACTT-TGTTC--------GGTTTTGG----------------------TTGTTT---GAAGAATTTG--------ACCG--T---GTA--ACAGGTG-T-ATTTTCATTTG-TTTGTCTGAAGTTAAACATTTCAT-TGATTTTGGCTGGGGT-TATTGAC--TTTG-CT---AT-TTTGTACA-TAAATTTTGT----TTTCC---------------A-GAAA-T-A-CAT--CCT-G-TC-AA-A-AACTGT---------TA-GTAT--GT---TTA--A-CACCTGCAAGCTTT-CT-AGTG-----------T--GT-------TTTA-A-TCATTG--GTATCC-AAGATGAT-T-TTGCAAGCACGTTTTTGGAGC-CT--AAA---TATTCTATCTATGTTC--ATTTG--A--CATGTGCCACC---CT-GT-A-CAACATTACAGTAATCTACATGAGGTTGAATATAAGCTTT
gi|18309 : TTT------TAAGTTT------------AAAACTATTT---AAATTT---GAG---CTTG--------AACG--CAAGATG--ATAGATG-T-AGCATTAA-------------------ATATCTCACGCAAGTATAAC-GGGACATTT--ACTATT-G-C----AT-GT-ATAC---GA--TTTGT-C--TTGGT---------------AAGAAA-A-G-CTA--TTT-GATA-GA-A-A---GA---------CA-AAAC--AT---TTA--GGC---------TTTT-TC-TAT------AAC---T--ATTTAGA-CGTTC-A-T-AATG--AGTCCCTGAAAT-ACAT-TTGTATGCTCGACTAAGCAGT-TTTGAAT---TTACAT-TTTTTATTTTCATT----A-----ATTGCCCCAAATT-G
gi|18310 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT
gi|18311 : --A--GGTACTTCCCCAAACT-GT-A-CA-----ACACTAATTGAAATGTTGTTGTATGTATGCTTT