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Reference ( family-872 )      : ATAGCATGATAAGTAGCTGTGACAATTAAAATATGTACNAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATAAATN---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-GTCA-GT-T-CATTT------C--TACCANCAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTG-G-G-G-TTTTACGGCACACTNTAGTTTGTTGATGNTCTTACTATTGACAATTACTGNTGGTACGCTGGTATATACGGT------TACATAA-GATAA
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gi|28665                      :                                                             ATAGATA---CCTG-TGCAGCCA-CA---TTCATT-TTAA-GTCA-CC-TACAATA------C--CAGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTGCG-G-G-TTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTTA-TAGTGACAATTACTGTTTGTACG-TGGTATACACGGT------TGC-TAA-
gi|28666                      :                                                             ATAGATA---CCTG-TGTAGCCA-TATT-C-TTTT-T-AA-GTCACGTAC-CATAC------C---AGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTG-G-G-GGTTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTT-TTATTGACAATTACTGTTTGTGTG-TGGAATACACGGT------TGC-TAATGATA
gi|28667                      :                                                                 ATA---CCAT-TGCAGCAA-AATTTC-AATA-T-AG-GTCA-AT-T-AATTG------C--TACCACCAACCATATGAAATTA-----TG-----TTG--G-G-G-G-TTTTACGGCACACCTGAACTTGTTGATAGT-TTACTATTGACAGTTACTGGTGGAATGCTGG-ACATAAGGT------TACACAC-AATA
gi|28668                      :                                                                 ATA---CCAG-TGCAGCCA-AATATC-AATT-T-AC-GTCA-A-----ATTTAC----CA-TACCAACAA-------CAATAACTAAATA-----TTGTCA-A-G-A-GTTGATGGCATACGCTAGATTGTTGATATTCTTA-TATTGACAATTACTGATGATATAA-GGTAATTAAGGT------TATATAC-GATA
gi|28669                      :                                                                        CATGTACAGTTACAA---T-CATT-TTAA-GTCA------CACCTA-----CAATACCAGCAAGAA----AAATGA-----TA-----TTGTTG-A-GAG-TTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTTA-TATTGACAATTACTGTTGGTATG-TGGTATACACGGT------TA
gi|28670                      :                                                                             GCAGCCA--------CTTT-C-AT-TTTA-AT-T-CACCTACCATAC--CAGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTGCG-G-G-TTTTACGGCATACTCTAGTCTGTTGGTATTCTTA-TATTGACAATTACTGTTTGTATG-TGGTATACA


blockSeqs                     :            A                          A  TAT        T   C A       GATA  ATG        CA TTTC     A T AA    CGTAC    CTACCATACC      T   CCATATG    AACTAAA  AAATA      CC  A G              A             G T   C               G       C   T         TACATG   A   T
blockSeqs                     :            A                          A  A          .   C .       T     AT         A  TATC     A T G     AGTAC    TTACCAT         T   GAA        AC       .          CT  A .              A             G T   C               G       C   T         .        A   C
blockSeqs                     :            A                          T  A          .   C .       T     AT         A  TTC      A . G     CGTAC    CTACAAT         C   CA         AC       .          CC  . .              A             G C   C               G       C   T         .        A   T
blockSeqs                     :            .                          T  A          .   T .       A     AT         A  TT       A . G     CATT     GCCGC           C   CA         AA       .          CG  . .              A             G C   C               G       C   T         .        A   .
blockSeqs                     :                                       T  A          .   T .       T     AT         A  TT       . . A     CCTA     TTCT            G   CA         AA       .          CG  . .              C             T T   C               T       C   T         .        A   .
blockSeqs                     :                                       A  T          .   . .       A     TG         T  TT       . . A     GTT      TTCT            C   .          AA       .          G   . .              G             G C   C               A       T   A         .        A   .
blockSeqs                     :                                                           .       T     AT         A  C        . . G     GTT      TTTC            A   .          AA       .          G   . .              T             T C   T               A       C   T         .        A   .
blockSeqs                     :                                                                   A     TG         A  C        . . A     GTT      CACT            G   .          TA       .          G   . .              T             T C   C               T       C   T         .        A   .
blockSeqs                     :                                                                   A     TG         T  C        . . A     GTT      CTAT            A   .          AA       .          G   . .              C             T C   .               T       A   T         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                   T     TG         T  C        . . G     GTT      CTAT            C   .          AA       .          G   . .              G             G C   .               A       .   .         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                   A     AT         G  C        . . A     GTT      TACC            A   .          TA       .          A   . .              C             T C   .               T       .   .         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                   A     TG         C  T        . . A     ATT      TGCT            A   .          GA       .          G   . .              C             T .   .               T       .   .         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                   A     TG         T  C        . . G     ATT      TTT             C   .          AA       .          G   . .              T             G .   .               G       .   .         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                   A     AT         A  T        . . C     A        ACC             A   .          A        .          G   . .              C             T .   .               A       .   .         .        .   .
blockSeqs                     :                                                                         AG         A  .        . . A     .        .               G   .          .        .          A   . .              C             T .   .               T       .   .         .             
blockSeqs                     :                                                                                    .  .        . . T     .        .               A   .          .        .          A   . .              C             T .   .               T       .   .                       


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATAGCATGATAAGTAGCTGTGACAATTAAAATATGTACNAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATAAATN---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-GTCA-GT-T-CATTT------C--TACCANCAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTG-G-G-G-TTTTACGGCACACTNTAGTTTGTTGATGNTCTTACTATTGACAATTACTGNTGGTACGCTGGTATATACGGT------TACATAA-GATAA
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Reference ( family-872 )      : ATAGCATGATAAGTAGCTGTGACAATTAAAATATGTACNAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATAAATN---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-GTCA-GT-T-CATTT------C--TACCANCAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTG-G-G-G-TTTTACGGCACACTNTAGTTTGTTGATGNTCTTACTATTGACAATTACTGNTGGTACGCTGGTATATACGGT------TACATAA-GATAA
gi|28654                      : ATAGCATGATAGGTAGCTGTGACAATTAAAATATGTACAAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATAAATT---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-GTCA-GT-T-CATTT------C--TACCATC---------AAACAC-----TA-----TGATTG-G-G-C-TTTTACGGCACACCATAATTTGTTGATGGT-TTACTATTGACAATTATTGGTGGTACGCTGG-ATACATGGT------TACATAA-GATAA
gi|28655                      : ATAGCATGATAAGTAGCTGTGACAATTAAAATATGAACAAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATAAATT---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-CTCA-GT-T-CATTT------C--TACCATC---------AAACAC-----TA-----TGATTG-G-G-G-TTTTACGGCACACCATAATTTGTTGATGGT-TTACTATTGACAATTATTGGTGGTACGCTGG-ATACATGGT------TACATAA-GATAA
gi|28656                      : ATAGCATGATAAGTAGCTGTGACAATTAAAATATGTACAAA-A-ATAAGACA-CATCC-CATATATT---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATT-T-AG-GTCA-GT-T-CATTT------C--TACCATC---------AAACAC-----TA-----TGATTG-G-G-G-TTTTACGGCACACCATAAATTGTTGATGGT-TTACTATTGACAATTATTGGTGGTACGCTGG-ATACATGGT------TACATAA-GATAA
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gi|28658                      : ATAGCATGTTAA-TAGCTTTAACAATCAAAATACGTTCTAA-A-ATAAGCTA-TATTT-TATATATT---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATCAT-AA-GCCA-GT-T-CATCA------C--TACCACCGA-------ACAT-------TA-----TGATTG-G-G-A-TTTTACGGCACAATATAATCTGTCGATGGTTATACTATTGGCAATTATTGGTGGTACGCTGG-ATATATGGTTACATGTACATAA-GATAA
gi|28659                      :                       CAACTAAAA-ATAGACTAATATATAAAACTTCATTCACTTAAATA---CCTG-TGTAGCCA-TA---TTCTTT-T-AA-GTCACGTAC-CAT------------ACCAGCAACA-----AAATAA-----TA-----TTGTTG-CCG-G-TTTTACGGCATACTCTAGTTCGCTGATATTCTTA-TATTGACAATTACTGTCTGTATG-TGGTATATACGGT------TGC-TAATGATA
gi|28660                      :                                   GTA-AAA-T-ATAAAAAA-TAT----AGGAATT---CCAT-TGCAGCCA-AA---C-CATTAT-AG-GTCA-GT-T-TACCT------A--TACCACCAA-------ACATA------TG-----TT--TG-G-G-A-TTTTATGGCACATTGTAATTTGTTGATGGT-TTACTATTGACAATTACTGATGGTACGCTGG-ATATACGGT------GACATAA-
gi|28661                      :                                                             ATAAATGATACCTG-TGCAGCTA-AA-------TA-T-AA-GTCACAT-T-TACTT---------TACCAACAA-------CAATAA-----TAAAATATTGCCG-A-GAG-TTTTACGGCATACTTTAGTTTGTTGATATTCTTA-TATTGACAAGTACCGATGGTATGTT-GTATATAAGAT------TGC-TAACGATAA
gi|28662                      :                                      taaaaagataagatgatttaa-CATTAATA---CCTG-TGTAGCCA-TA---TTCTTT-T-AA-GTCAAGTAC-CAT------------ACCAGCAACA-----AAATAA-----TA-----TTGTTG-CTG-G-TTTTACGGCATACTTTAGTTTGTTGATATTTATA-TATTGACAATTACTTTCTGTATG-TGGTATATACGGT------TGC-TAA-
gi|28663                      :                                                             ATAAATA---CCTG-TGTAGCCA-TA---T-TCTT-T-AAAGTCA------CGTGC------CG-CGCCGACAACA-----AAATAA-----TA-----TTGTTG-CCG-G-TTTTGCGGCATACTCTAGTTTGTTGATGTTCTTA-TATTGACAATTACTGTCTGTGTG-TGGTATATACGGT------TGC-TAA-
gi|28664                      :                                                             ATAAATT---TCAT-TGCAGCCA-GA---C-CATTAT-AG-GTCA-GT-T-TACCT------A--TGCCACCAA-------ACATTA-----TG-----TT--TG-G-G-G-TTTTACAGCACATTGTAATTTGTTGATGGT-TTACTATTGACAATTACTGATGGTACGCTGG-ATATATGGT------TACATAA-GATAA
gi|28665                      :                                                             ATAGATA---CCTG-TGCAGCCA-CA---TTCATT-TTAA-GTCA-CC-TACAATA------C--CAGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTGCG-G-G-TTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTTA-TAGTGACAATTACTGTTTGTACG-TGGTATACACGGT------TGC-TAA-
gi|28666                      :                                                             ATAGATA---CCTG-TGTAGCCA-TATT-C-TTTT-T-AA-GTCACGTAC-CATAC------C---AGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTG-G-G-GGTTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTT-TTATTGACAATTACTGTTTGTGTG-TGGAATACACGGT------TGC-TAATGATA
gi|28667                      :                                                                 ATA---CCAT-TGCAGCAA-AATTTC-AATA-T-AG-GTCA-AT-T-AATTG------C--TACCACCAACCATATGAAATTA-----TG-----TTG--G-G-G-G-TTTTACGGCACACCTGAACTTGTTGATAGT-TTACTATTGACAGTTACTGGTGGAATGCTGG-ACATAAGGT------TACACAC-AATA
gi|28668                      :                                                                 ATA---CCAG-TGCAGCCA-AATATC-AATT-T-AC-GTCA-A-----ATTTAC----CA-TACCAACAA-------CAATAACTAAATA-----TTGTCA-A-G-A-GTTGATGGCATACGCTAGATTGTTGATATTCTTA-TATTGACAATTACTGATGATATAA-GGTAATTAAGGT------TATATAC-GATA
gi|28669                      :                                                                        CATGTACAGTTACAA---T-CATT-TTAA-GTCA------CACCTA-----CAATACCAGCAAGAA----AAATGA-----TA-----TTGTTG-A-GAG-TTTTACGGCATACTCTAGTTTGTTGATATTCTTA-TATTGACAATTACTGTTGGTATG-TGGTATACACGGT------TA
gi|28670                      :                                                                             GCAGCCA--------CTTT-C-AT-TTTA-AT-T-CACCTACCATAC--CAGCAACAA-------AAATAA-----TA-----TTGTTGCG-G-G-TTTTACGGCATACTCTAGTCTGTTGGTATTCTTA-TATTGACAATTACTGTTTGTATG-TGGTATACA