lowQualScore : 1 1 22222222222222 11 111 11 1111111 111111 111 222222222 1111
lowQualScore : 777 0 6 55555555555555 4 88 55 777 3 4 00 44 555 4 222 3 6 11 1111111 000000 55 3 33 99999 4 0 0 3 222 1 0 555 44 555 666666666 7777 44 555 3 3 1 44 3333 44 6 555 666 0
lowQualScore : ... . . .............. . .. .. ... . . .. .. ... . ... . . .. ....... ...... .. . .. ..... . . . . ... . . ... .. ... ......... .... .. ... . . . .. .... .. . ... ... .
lowQualScore : 000 2 7 44444444444444 0 66 55 000 7 0 00 66 888 6 999 3 5 22 8888888 555555 00 6 88 11111 3 5 1 6 777 5 2 888 22 888 777777777 1111 66 888 3 1 4 22 1111 22 2 222 444 2
consensus : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGGGCATATCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTT--AA-AATTAA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ATTACT-TTGATATCAATC-----AACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
Reference ( gi|89199 ) : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCATCACAAAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGGGCATATCTGTTAGG-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTA--AA-AATTAT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ATTACT-TTGATATCAATC-----AACAATATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89202 : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATGTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGGGCATATCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTT--AA-AAT-AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ATTACT-TTGATATCAATC-----AACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AACGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-G--T--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GTATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGG
gi|89203 : TCACTAAATGTGACAAAA---ATATCAGCACATAA--TGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AACTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGAGGATATCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTT--AA-AATTAT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ATTACT-TTGATATCATTC-----AACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTTAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GACCCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTTTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATATAACACGCCCTGCAGAGTAGCTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGttctttaa
gi|89200 : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTTGGCATATCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTT--AA-AATTAA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATA-ATTACT-ATGATATCAATC-----AACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTTCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAGtctttaa
gi|89201 : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATTTCCCTTCAAA--TTGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTTGGCATATCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTTT--AA-AATTAA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATA-ATTACT-ATGATATCAATC-----AACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACAAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAGgctttaa
gi|89204 : TCACTAAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT--------------------------T--GATTTCCCTTCAAA--TCGTACTTAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTGAATATAGGGACTTTGGGCATATCTGTTAGA-CTA--ATTATAAT---ACTTGAATTGTGGTTA--AA-AATTAT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ATTACT-TTGATATCAATC-----AACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TTATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTATAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGgctttaa
gi|89205 : TCACTTAAAGTGACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACATTCTTAATATTTATATCTATGTATTT-TT-AATTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGGT---TCATAATGGGCTAAACC-AACTTGAATATAGGGATATTGGGCATGCCTGTTAGA-ATG--ATAATAAT---GCTTGAATTGTGTTTTTTAA-AATGAA-TAGACA-------CACATGTTC------GTAT--ACATT-ATTACT-TTGATATCAATC-----AACAACATTATCTAATCACTTAAT-AGCGTTGACAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAC---------G----TGATA--TT---AA-CCCCA-GATT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATAACTGTTCTATTGTTAGACCATATGATACACTCCAT---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCAATAGTCTGATCGGATGTTTGGtctttaa
gi|89206 : TCACTAAAAGTGACAAAA---ACCTTAGCACATAACATGTATCAT--------------TCTTAATATTTGT--AAgctata
gi|89209 : AGTGTCAAAATACACACTATCACA---TATTTA---T-------------ATCTATGTATTT-TTTAATTTCCCTCCAAA--ATGTGCTAAATGATGATTCATAATGGGTTA-ACTTAACTTGAATATAGGGATATTGGGCATGTCTGTTAGAACTG--ATTATAAT---GCTTGAATTATGTTTT--AA-AATAAA-TAGACA-------TATACGTTC------ATAT--ACGTT-ATTACT-TCGATAGCAATC-----AACAACATTATCTAATCACGTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGGC---AGTTATTAATTAAAGACCCCGTATTCCCGAATGCTA--AAGT
gi|89210 : TAACAAAA---ATATCAGCACATAACATGTAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--AATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGGGCATATATGTTAGA-CTA--ATTATAAT---GCTTGAGTTGTGGTTT--AA-AATGAA-AAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATA-ACTACT-TCGATATCAATC-----AAAAACATTATCACATCTCTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTGATTATCTGAT---AATGATTAATTAAAGACGATGTAGTCCTTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACA--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACAATTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTAAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACT-------------TATTCTGATCGGATGCTG
gi|89211 : AA---ATAACCTCATAATATTCTTAATAT-------------TTATATCTATTT-T--AGTTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGAT---TCATAATGGGTTGAACC-AACTTGAATATAGGGATTTTGAACATGTCTGTTAGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGTTTT--AA-AATtggctttaa
gi|89212 : --AATTTCCTTTCAAAACTCGG--TAAAAGAT---CAATAATGGATTAAACC-AACTTAAATATAGACATATTGACTATGTATGTTAGA-CTGCCATGATAATTACGCTTGAATTATA-CTA--TATAATTAA-AAGGTA-------AATGTG--C------ATAT--ACAAT-ATGACT-TTAATATCAATC-----AAC--TAT-ATCATAT-----AATCAGTC-------AAC---AGT--TT---TGAT---AA-----AAG-AAAAACA--GTA------AATACCAGAAAGTTA---AAT---------A----TAAAA--CT---AA-CCCCAAGGGC--CAACATGTCTGTAGCAATAACAATACAA----ACCAATT-GACTGCATGGTTTTACAAGCagatag
gi|89207 : TG--ATTAAAAT---ACTTGAATTATTTATA--AA-AATGAAATAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACATA-ATTAAT---GATAT--ATA-----GAAAAAAGTA------CA-------AATGCTAATAAATCTGGAGTTGTTTCCAGAT---TAAAATAAATTAATGAACCTGCAGTCCCTTATGATA--AAATGG---GATCATGCCTGTG----TGATA--CT---AA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACAATGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTAC
gi|89208 : tcactaaaagtgacaaaataattttctgttcactcatttttgttaatgattttgttgtgataagtatttccctccagaatatggaaaatgactcatatgggtgaaaccaaattattaaaaacatttgcttttagaaggggtagtatacctttgtttccttttttaaaaaaaa--ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTA--TA-AA--AT-GAAATA-------AACATGTT---------AT--TCATATGTTTTTGTTAATATCAACCTAATTAATGATATAAAGAAA-CAAGTACA-AATGCTAATAAATCTGGAGTTATTTCCAGATTAAAATAAATAATTGAA---CTTGCAGTCTCTTATTATA--AAATGG---GATCATGCATGTG----TGATA--CT---GA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACACTGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTAC
gi|89214 : tcactaaaagtgacaaaataattttctgttcactcatttttgttaatgattttgttgtgataagtatttccctccagaatgtggaaaatgactcatatgggtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaTGAT---AATGATAAATTAAAGACCC
gi|89213 : taaaatagatagaTGTAGT---TGTTGCTA--AAGTGA---AAT---------G----TGATT--AT---GA-CCCCA-GGGT--CAACTTTCTTGTGTCAGTTACAATGTAA----ACC--GT-CT--GCATTGTTTTACAAACTGTTGGCTGTCTGCAATGTTTACTTTTCTATTTAAAGACAATAATATACACTCCCA---ATTGATAAAACACGCCCTGTAAAGTAACTAATTTTCATCCGAAAGTCTGATCGGATGTTGGGcagtgtcaacattcctgtatcggttacaatgtaaaccttctgcattgttttacaaacattctgctgtctgctattattactgttctatttttacaccatattatacactcctagtagataaaacatgccctgcagagtaactcatttacgtccgatagtctgatcggatgttggggctttaa
gi|89214 : TA--AAATAGATAGAT---------GATAATGATAAATTAAAGA-CCCCA-GTGT--CAACATTCCTGTATCGGTTACAATGTAA----ACC--TT-CT--GCATTGTTTTACAAACATTCTGCTGTCTGCTATTATTACTGTTCTATTTTTACACCATATTATACACTCCTA---GTAGATAAAACATGCCCTGCAGAGTAACTCATTTACGTCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGgctttaa
gi|89215 : A-AAGTGGCAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--AT-CT--GCATTGTTTTACACACAGTTTGCCGTCTGCTATGA------------TGTTAGACCATATTATACACTACCGGTTGTTGATAAAACACGTCCTGTAGAGTAACTAATT------------CCTGATTGGGTGTTGGGgctttaa
gi|89216 : ATTATTATTGAGCTACTTATAGACCGTATTTAACACTTCCA---CTAGATAAAACGTACCCTGTATTGTAACTCATTTACATTAGATAGTCTGATCGAATGTTTGGg
Alignments
lowQualScore : 1111 11111111111111 22222222222222 11111111111 1111111111111 2222222 111111 111 222222222 1111
lowQualScore : 3333 88 3 0 44 4 99999999999999 0 3 88888888888888 555 555 3 3 88888 55555555555 1 44 8888888888888 3 44 555 1 6 44 888 3 1111111 999999 99 3 1 1 3 111 0 555 33 555 444444444 6666 44 555 3 2 0 33 2222 33 5 444 555
lowQualScore : .... .. . . .. . .............. . . .............. ... ... . . ..... ........... . .. ............. . .. ... . . .. ... . ....... ...... .. . . . . ... . ... .. ... ......... .... .. ... . . . .. .... .. . ... ...
lowQualScore : 1111 55 1 4 22 3 88888888888888 4 1 11111111111111 222 444 8 3 33333 88888888888 6 66 3333333333333 3 22 444 5 2 22 555 1 7777777 222222 22 5 8 3 3 777 7 888 99 444 666666666 5555 22 444 1 9 6 99 1111 99 7 222 888
consensus : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
Reference ( family-868 ) : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89199 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAT--CAC-AAAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGG-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAATATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89200 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTTCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAG
gi|89201 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTTCAAA--TTGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACAAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAGgctttaa
gi|89202 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATGTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAAT---AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AACGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-G--T--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GTATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGgctttaa
gi|89203 : TCACTAAATGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAA--TG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ACTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAGGATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCATTCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTTAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GACCCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTTTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATATAACACGCCCTGCAGAGTAGCTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGttctttaa
gi|89204 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT--------------------------T--G-----------ATTTCCCTTCAAA--TCGTACTTAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGACTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---ACTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TTATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTATAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGtctttaa
gi|89205 : TCACTTAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACATTCTTAATATTTATATCTATGTATTT-TT-A-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGGT---TCATAATGGGCTAAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGCCT--GTT-------------AGA-ATG--ATAATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-TTTAAAATG--AA-TAGACA-------CACATGTTC------GTAT--ACATTATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCTAATCACTTAAT-AGCGTTGACAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAC---------G----TGATA--TT---AA-CCCCA-GATT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATAACTGTTCTATTGTTAGACCATATGATACACTCCAT---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCAATAGTCTGATCGGATGTTTGGtctttaa
gi|89206 : TCACTAAAAGTGACAAAAACC----TTAG--CAC-ATAACATG--TATCAT--------------TCTTAATATTTGT--A-----------Agctata
gi|89207 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATATGGAAAATGAC---TCATA-TGGGTGAAACC-AAATTATTAAAAACATTTGCTTTTAGAAGGGGT----AGTATACCTTTGTTTCCTTTTTTAAAAAAA-ATG--ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAAATGAAA-TAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACATAATTAAT--GATAT--ATAGAAAAAAGTA------CA-------AATGCTAATAAATCTGGAGTTGTTTCCAGAT---TAAAATAAATTAATGAACCTGCAGTCCCTTATGATA--AAATGG---GATCATGCCTGTG----TGATA--CT---AA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACAATGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTAC
gi|89208 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATGTGGAAAATGAC---TCAT-ATGGG
gi|89208 : --ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAATG--AAATAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACCTAATTAAT--GATATAAAGAAACAA----GT-ACA----------AATGCTAATAAATCTGGAGTTATTTCCAGATTAAAATAAATAATTGAA---CTTGCAGTCTCTTATTATA--AAATGG---GATCATGCATGTG----TGATA--CT---GA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACACTGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTACtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaattaaaatacttgaattatttataaaatgaaataaacatgttattcatatgtttttgttaatatcaacctaattaatgatataaagaaacaagtacaaatgctaataaatctggagttatttccagattaaaataaataattgaacttgcagtctcttattataaaatgggatcatgcatgtgtgatactgaccccaggatcaaaatgtatgtatcaattacactggaattccattttgctgcattgttttac
gi|89209 : tcactaaaagtgacaaaataattttctgttcactcatttttgttaatgattttgttgtgataagtatttccctccagaatgtggaaaatgactcatatgggtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaAGTGTCAAAA-TA-----CA---CACTATCACATA--TT-TAT-------------ATCTATGTATTT-TTTA-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTGCTAAATGATGATTCATAATGGGTTA-ACTTAACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGTCT--GTT-------------AGAACTG--ATTATAAT---GCTTGAATTATGTTT-T--AAAATA--AA-TAGACA-------TATACGTTC------ATAT--ACGTTATTACTTCGATAGCAATCAACAACATTATCTAATCACGTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGGC---AGTTATTAATTAAAGACCCCGTATTCCCGAATGCTA--AAGT
gi|89210 : TAACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATAT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---GCTTGAGTTGTGGTT-T--AAAATG--AA-AAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAACTACTTCGATATCAATCAAAAACATTATCACATCTCTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTGATTATCTGAT---AATGATTAATTAAAGACGATGTAGTCCTTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACA--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACAATTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTAAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACT-------------TATTCTGATCGGATGCTG
gi|89211 : AAATA------AC--CTC-ATAATATTCTTAATAT-------------TTATATCTATTT-T--A-----------GTTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGAT---TCATAATGGGTTGAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAACATGTCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-T--AAAATA--GA-TAGtggctttaa
gi|89212 : --A-----------ATTTCCTTTCAAAACTCGG--TAAAAGAT---CAATAATGGATTAAACC-AACTTA-----AATAT-----------AGACATATTGACTATGTAT--GTT-------------AGA-CTGCCATGATAATTACGCTTGAATTATACTA-T--ATAATT--AA-AAGGTA-------AATGTG--C------ATAT--ACAATATGACTTTAATATCAATCAACTA---TATCATAT-----AATCAGTC-------AAC---AGT--TT---TGAT---AA-----AAG-AAAAACA--GTA------AATACCAGAAAGTTA---AAT---------A----TAAAA--CT---AA-CCCCAAGGGC--CAACATGTCTGTAGCAATAACAATACAA----ACCAATT-GACTGCATGGTTTTACAAGC
gi|89213 : TGTAGT---TGTTGCTA--AAGTGA---AAT---------G----TGATT--AT---GA-CCCCA-GGGT--CAACTTTCTTGTGTCAGTTACAATGTAA----ACC--GT-CT--GCATTGTTTTACAAACTGTTGGCTGTCTGCAATGTTTACTTTTCTATTTAAAGACAATAATATACACTCCCA---ATTGATAAAACACGCCCTGTAAAGTAACTAATTTTCATCCGAAAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89214 : TA--AAATAGATAGAT---------GATAATGATAAATTAAAGA-CCCCA-GTGT--CAACATTCCTGTATCGGTTACAATGTAA----ACC--TT-CT--GCATTGTTTTACAAACATTCTGCTGTCTGCTATTATTACTGTTCTATTTTTACACCATATTATACACTCCTA---GTAGATAAAACATGCCCTGCAGAGTAACTCATTTACGTCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGgctttaa
gi|89215 : A-AAGTGGCAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--AT-CT--GCATTGTTTTACACACAGTTTGCCGTCTGCTATGA------------TGTTAGACCATATTATACACTACCGGTTGTTGATAAAACACGTCCTGTAGAGTAACTAATT------------CCTGATTGGGTGTTGGGgctttaa
gi|89216 : ATTATTATTGAGCTACTTATAGACCGTATTTAACACTTCCA---CTAGATAAAACGTACCCTGTATTGTAACTCATTTACATTAGATAGTCTGATCGAATGTTTGGg
Alignments
lowQualScore : 1111 11111111111111 22222222222222 11111111111 1111111111111 2222222 111111 111 222222222 1111
lowQualScore : 3333 88 3 0 44 4 99999999999999 0 3 88888888888888 555 555 3 3 88888 55555555555 1 44 8888888888888 3 44 555 1 6 44 888 3 1111111 999999 99 3 1 1 3 111 0 555 33 555 444444444 6666 44 555 3 2 0 33 2222 33 5 444 555
lowQualScore : .... .. . . .. . .............. . . .............. ... ... . . ..... ........... . .. ............. . .. ... . . .. ... . ....... ...... .. . . . . ... . ... .. ... ......... .... .. ... . . . .. .... .. . ... ...
lowQualScore : 1111 55 1 4 22 3 88888888888888 4 1 11111111111111 222 444 8 3 33333 88888888888 6 66 3333333333333 3 22 444 5 2 22 555 1 7777777 222222 22 5 8 3 3 777 7 888 99 444 666666666 5555 22 444 1 9 6 99 1111 99 7 222 888
consensus : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
Reference ( family-868 ) : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89199 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAT--CAC-AAAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGG-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAATATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89200 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTTCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAG
gi|89201 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTTCAAA--TTGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACAAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAGgctttaa
gi|89202 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATGTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAAT---AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AACGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-G--T--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GTATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGgctttaa
gi|89203 : TCACTAAATGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAA--TG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ACTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAGGATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCATTCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTTAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GACCCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTTTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATATAACACGCCCTGCAGAGTAGCTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGttctttaa
gi|89204 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT--------------------------T--G-----------ATTTCCCTTCAAA--TCGTACTTAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGACTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---ACTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TTATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTATAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGtctttaa
gi|89205 : TCACTTAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACATTCTTAATATTTATATCTATGTATTT-TT-A-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGGT---TCATAATGGGCTAAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGCCT--GTT-------------AGA-ATG--ATAATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-TTTAAAATG--AA-TAGACA-------CACATGTTC------GTAT--ACATTATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCTAATCACTTAAT-AGCGTTGACAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAC---------G----TGATA--TT---AA-CCCCA-GATT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATAACTGTTCTATTGTTAGACCATATGATACACTCCAT---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCAATAGTCTGATCGGATGTTTGGtctttaa
gi|89206 : TCACTAAAAGTGACAAAAACC----TTAG--CAC-ATAACATG--TATCAT--------------TCTTAATATTTGT--A-----------Agctata
gi|89207 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATATGGAAAATGAC---TCATA-TGGGTGAAACC-AAATTATTAAAAACATTTGCTTTTAGAAGGGGT----AGTATACCTTTGTTTCCTTTTTTAAAAAAA-ATG--ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAAATGAAA-TAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACATAATTAAT--GATAT--ATAGAAAAAAGTA------CA-------AATGCTAATAAATCTGGAGTTGTTTCCAGAT---TAAAATAAATTAATGAACCTGCAGTCCCTTATGATA--AAATGG---GATCATGCCTGTG----TGATA--CT---AA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACAATGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTAC
gi|89208 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATGTGGAAAATGAC---TCAT-ATGGG
gi|89208 : --ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAATG--AAATAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACCTAATTAAT--GATATAAAGAAACAA----GT-ACA----------AATGCTAATAAATCTGGAGTTATTTCCAGATTAAAATAAATAATTGAA---CTTGCAGTCTCTTATTATA--AAATGG---GATCATGCATGTG----TGATA--CT---GA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACACTGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTACtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaattaaaatacttgaattatttataaaatgaaataaacatgttattcatatgtttttgttaatatcaacctaattaatgatataaagaaacaagtacaaatgctaataaatctggagttatttccagattaaaataaataattgaacttgcagtctcttattataaaatgggatcatgcatgtgtgatactgaccccaggatcaaaatgtatgtatcaattacactggaattccattttgctgcattgttttac
gi|89209 : tcactaaaagtgacaaaataattttctgttcactcatttttgttaatgattttgttgtgataagtatttccctccagaatgtggaaaatgactcatatgggtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaAGTGTCAAAA-TA-----CA---CACTATCACATA--TT-TAT-------------ATCTATGTATTT-TTTA-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTGCTAAATGATGATTCATAATGGGTTA-ACTTAACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGTCT--GTT-------------AGAACTG--ATTATAAT---GCTTGAATTATGTTT-T--AAAATA--AA-TAGACA-------TATACGTTC------ATAT--ACGTTATTACTTCGATAGCAATCAACAACATTATCTAATCACGTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGGC---AGTTATTAATTAAAGACCCCGTATTCCCGAATGCTA--AAGT
gi|89210 : TAACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATAT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---GCTTGAGTTGTGGTT-T--AAAATG--AA-AAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAACTACTTCGATATCAATCAAAAACATTATCACATCTCTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTGATTATCTGAT---AATGATTAATTAAAGACGATGTAGTCCTTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACA--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACAATTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTAAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACT-------------TATTCTGATCGGATGCTG
gi|89211 : AAATA------AC--CTC-ATAATATTCTTAATAT-------------TTATATCTATTT-T--A-----------GTTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGAT---TCATAATGGGTTGAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAACATGTCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-T--AAAATA--GA-TAGtggctttaa
gi|89212 : --A-----------ATTTCCTTTCAAAACTCGG--TAAAAGAT---CAATAATGGATTAAACC-AACTTA-----AATAT-----------AGACATATTGACTATGTAT--GTT-------------AGA-CTGCCATGATAATTACGCTTGAATTATACTA-T--ATAATT--AA-AAGGTA-------AATGTG--C------ATAT--ACAATATGACTTTAATATCAATCAACTA---TATCATAT-----AATCAGTC-------AAC---AGT--TT---TGAT---AA-----AAG-AAAAACA--GTA------AATACCAGAAAGTTA---AAT---------A----TAAAA--CT---AA-CCCCAAGGGC--CAACATGTCTGTAGCAATAACAATACAA----ACCAATT-GACTGCATGGTTTTACAAGC
gi|89213 : TGTAGT---TGTTGCTA--AAGTGA---AAT---------G----TGATT--AT---GA-CCCCA-GGGT--CAACTTTCTTGTGTCAGTTACAATGTAA----ACC--GT-CT--GCATTGTTTTACAAACTGTTGGCTGTCTGCAATGTTTACTTTTCTATTTAAAGACAATAATATACACTCCCA---ATTGATAAAACACGCCCTGTAAAGTAACTAATTTTCATCCGAAAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89214 : TA--AAATAGATAGAT---------GATAATGATAAATTAAAGA-CCCCA-GTGT--CAACATTCCTGTATCGGTTACAATGTAA----ACC--TT-CT--GCATTGTTTTACAAACATTCTGCTGTCTGCTATTATTACTGTTCTATTTTTACACCATATTATACACTCCTA---GTAGATAAAACATGCCCTGCAGAGTAACTCATTTACGTCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGgctttaa
gi|89215 : A-AAGTGGCAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--AT-CT--GCATTGTTTTACACACAGTTTGCCGTCTGCTATGA------------TGTTAGACCATATTATACACTACCGGTTGTTGATAAAACACGTCCTGTAGAGTAACTAATT------------CCTGATTGGGTGTTGGGgctttaa
gi|89216 : ATTATTATTGAGCTACTTATAGACCGTATTTAACACTTCCA---CTAGATAAAACGTACCCTGTATTGTAACTCATTTACATTAGATAGTCTGATCGAATGTTTGGg
blockSeqs : ATTT TT T CT A TCTTAATATTTATA G GTTGTGATAAGT ACT GAT T T TTAAA TTGCTTTTAGA T TT TCCTTTTTTAAAA A CC TAC G A TT TGA A TGTTATT TTGTTA CA A C A C TGG TAA GA ATA CATGCCTGT ATAA AA AAA C A GG TTCC AA G ACT GTT
blockSeqs : ATTT TT . . A A . GTTGTGATAAGT T . T . . . T . . . . . G A . T . TGTTATT TTGTTA CA A C A . TGG . . . CATGCATGT . . . . . . TTCC . G A .
blockSeqs : . . . . A A . TTA T . T . . . T . . . . . G . . T . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . A A . TA T . T . . . T . . . . . G . . T . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . A A . A T . T . . . T . . . . . G . . T . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . A G . A T . A . . . A . . . . . T . . G . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . T G . A A . A . . . A . . . . . T . . G . . . . T A T . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . A A . A A . T . . . T . . . . . G . . A . . . . T C T . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . A A . G A . A . . . T . . . . . T . . G . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . A A . A . . . A . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . T
blockSeqCons :
originalCons : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
finalCons : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
Alignments
lowQualScore : 1111 11111111111111 22222222222222 11111111111 1111111111111 2222222 111111 111 222222222 1111
lowQualScore : 3333 88 3 0 44 4 99999999999999 0 3 88888888888888 555 555 3 3 88888 55555555555 1 44 8888888888888 3 44 555 1 6 44 888 3 1111111 999999 99 3 1 1 3 111 0 555 33 555 444444444 6666 44 555 3 2 0 33 2222 33 5 444 555
lowQualScore : .... .. . . .. . .............. . . .............. ... ... . . ..... ........... . .. ............. . .. ... . . .. ... . ....... ...... .. . . . . ... . ... .. ... ......... .... .. ... . . . .. .... .. . ... ...
lowQualScore : 1111 55 1 4 22 3 88888888888888 4 1 11111111111111 222 444 8 3 33333 88888888888 6 66 3333333333333 3 22 444 5 2 22 555 1 7777777 222222 22 5 8 3 3 777 7 888 99 444 666666666 5555 22 444 1 9 6 99 1111 99 7 222 888
consensus : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
Reference ( family-868 ) : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89199 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAT--CAC-AAAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGG-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAATATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89200 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTTCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAG
gi|89201 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTTCAAA--TTGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTTGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AA-TAGGCA-------CATATGTCC------ATAT--ACATAATTACTATGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTAAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCTCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TA---AA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATATAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATATTGTTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATAGTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACAAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGAGgctttaa
gi|89202 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATGTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAAT---AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AACGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-G--T--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GTATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGgctttaa
gi|89203 : TCACTAAATGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAA--TG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ACTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAGGATATCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGGTT-T--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCATTCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTTAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GACCCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTTTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATATAACACGCCCTGCAGAGTAGCTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGttctttaa
gi|89204 : TCACTAAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT--------------------------T--G-----------ATTTCCCTTCAAA--TCGTACTTAATGAT---TCATAATGGGCTGTACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGACTTTGGGCATATCT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---ACTTGAATTGTGGTT-A--AAAATT--AT-TAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCACATCACTTAAT-AATGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TTATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTATAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATCGCTGTTCTATTGTTAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGCAGAGCAACTAATTTACATCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGtctttaa
gi|89205 : TCACTTAAAGTGACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACATTCTTAATATTTATATCTATGTATTT-TT-A-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGGT---TCATAATGGGCTAAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGCCT--GTT-------------AGA-ATG--ATAATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-TTTAAAATG--AA-TAGACA-------CACATGTTC------GTAT--ACATTATTACTTTGATATCAATCAACAACATTATCTAATCACTTAAT-AGCGTTGACAAAAC---AGTAATTACCTGAT---AATGATTAATTAAAGACCCTGTAGTCCCTAATGCTA--AAGTGG---GAC---------G----TGATA--TT---AA-CCCCA-GATT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACATTTTGCTGTCTGCTATTATAACTGTTCTATTGTTAGACCATATGATACACTCCAT---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACTAATTTACATCCAATAGTCTGATCGGATGTTTGGtctttaa
gi|89206 : TCACTAAAAGTGACAAAAACC----TTAG--CAC-ATAACATG--TATCAT--------------TCTTAATATTTGT--A-----------Agctata
gi|89207 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATATGGAAAATGAC---TCATA-TGGGTGAAACC-AAATTATTAAAAACATTTGCTTTTAGAAGGGGT----AGTATACCTTTGTTTCCTTTTTTAAAAAAA-ATG--ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAAATGAAA-TAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACATAATTAAT--GATAT--ATAGAAAAAAGTA------CA-------AATGCTAATAAATCTGGAGTTGTTTCCAGAT---TAAAATAAATTAATGAACCTGCAGTCCCTTATGATA--AAATGG---GATCATGCCTGTG----TGATA--CT---AA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACAATGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTAC
gi|89208 : TCACTAAAAGTGACAAA-ATAATTTTCTGTTCAC--T--CATT--TT---T-------------GTTAATG-ATTT-T--GTTGTGATAAGTATTTCCCTCCAGA--ATGTGGAAAATGAC---TCAT-ATGGG
gi|89208 : --ATTAAAAT---ACTTGAATTAT--TTAT--AAAATG--AAATAAACATGTTATTCATATGTTTTTGTTAATATCAACCTAATTAAT--GATATAAAGAAACAA----GT-ACA----------AATGCTAATAAATCTGGAGTTATTTCCAGATTAAAATAAATAATTGAA---CTTGCAGTCTCTTATTATA--AAATGG---GATCATGCATGTG----TGATA--CT---GA-CCCCA-GGAT--CAAAATGTATGTATCAATTACACTGGAATTCCATT--TTGCT--GCATTGTTTTACtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaattaaaatacttgaattatttataaaatgaaataaacatgttattcatatgtttttgttaatatcaacctaattaatgatataaagaaacaagtacaaatgctaataaatctggagttatttccagattaaaataaataattgaacttgcagtctcttattataaaatgggatcatgcatgtgtgatactgaccccaggatcaaaatgtatgtatcaattacactggaattccattttgctgcattgttttac
gi|89209 : tcactaaaagtgacaaaataattttctgttcactcatttttgttaatgattttgttgtgataagtatttccctccagaatgtggaaaatgactcatatgggtgaaaacaaattattaaaaacacttgcttttagaaggggtagtatacctttgattcctttttttaaaaaaacaAGTGTCAAAA-TA-----CA---CACTATCACATA--TT-TAT-------------ATCTATGTATTT-TTTA-----------ATTTCCCTCCAAA--ATGTGCTAAATGATGATTCATAATGGGTTA-ACTTAACTTG-----AATAT-----------AGGGATATTGGGCATGTCT--GTT-------------AGAACTG--ATTATAAT---GCTTGAATTATGTTT-T--AAAATA--AA-TAGACA-------TATACGTTC------ATAT--ACGTTATTACTTCGATAGCAATCAACAACATTATCTAATCACGTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTAATTACCTGGC---AGTTATTAATTAAAGACCCCGTATTCCCGAATGCTA--AAGT
gi|89210 : TAACAAAAATA----TCAG--CAC-ATAACATG--TAACAT-------------ATCTATGTATTT-T--A-----------ATTTCCCTCCAAA--TCGTACTAAATGAT---TCATAATGGGCTATACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGGGCATATAT--GTT-------------AGA-CTA--ATTATAAT---GCTTGAGTTGTGGTT-T--AAAATG--AA-AAGGCA-------CATATGTTC------ATAT--ACATAACTACTTCGATATCAATCAAAAACATTATCACATCTCTTAAT-AGTGTTGATAAAAC---AGTGATTATCTGAT---AATGATTAATTAAAGACGATGTAGTCCTTAATGCTA--AAGTGG---GAT---------G----TGATA--TT---GA-CCCCA-GAGT--CAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACA--TT-CA--GCATTGTTTTACAAACAATTTGCTGTCTGCTATTATCACTGTTCTATTGTAAGACCATATTATACACTCCCA---GTTGATAAAACACGCCCTGTAGAGTAACT-------------TATTCTGATCGGATGCTG
gi|89211 : AAATA------AC--CTC-ATAATATTCTTAATAT-------------TTATATCTATTT-T--A-----------GTTTCCCTCCAAA--ATGTACTAAATGAT---TCATAATGGGTTGAACC-AACTTG-----AATAT-----------AGGGATTTTGAACATGTCT--GTT-------------AGA-CTG--ATTATAAT---GCTTGAATTGTGTTT-T--AAAATA--GA-TAGtggctttaa
gi|89212 : --A-----------ATTTCCTTTCAAAACTCGG--TAAAAGAT---CAATAATGGATTAAACC-AACTTA-----AATAT-----------AGACATATTGACTATGTAT--GTT-------------AGA-CTGCCATGATAATTACGCTTGAATTATACTA-T--ATAATT--AA-AAGGTA-------AATGTG--C------ATAT--ACAATATGACTTTAATATCAATCAACTA---TATCATAT-----AATCAGTC-------AAC---AGT--TT---TGAT---AA-----AAG-AAAAACA--GTA------AATACCAGAAAGTTA---AAT---------A----TAAAA--CT---AA-CCCCAAGGGC--CAACATGTCTGTAGCAATAACAATACAA----ACCAATT-GACTGCATGGTTTTACAAGC
gi|89213 : TGTAGT---TGTTGCTA--AAGTGA---AAT---------G----TGATT--AT---GA-CCCCA-GGGT--CAACTTTCTTGTGTCAGTTACAATGTAA----ACC--GT-CT--GCATTGTTTTACAAACTGTTGGCTGTCTGCAATGTTTACTTTTCTATTTAAAGACAATAATATACACTCCCA---ATTGATAAAACACGCCCTGTAAAGTAACTAATTTTCATCCGAAAGTCTGATCGGATGTTGGG
gi|89214 : TA--AAATAGATAGAT---------GATAATGATAAATTAAAGA-CCCCA-GTGT--CAACATTCCTGTATCGGTTACAATGTAA----ACC--TT-CT--GCATTGTTTTACAAACATTCTGCTGTCTGCTATTATTACTGTTCTATTTTTACACCATATTATACACTCCTA---GTAGATAAAACATGCCCTGCAGAGTAACTCATTTACGTCCGATAGTCTGATCGGATGTTGGGgctttaa
gi|89215 : A-AAGTGGCAACATTCCTGTATCAGTTACAATGTAA----ACC--AT-CT--GCATTGTTTTACACACAGTTTGCCGTCTGCTATGA------------TGTTAGACCATATTATACACTACCGGTTGTTGATAAAACACGTCCTGTAGAGTAACTAATT------------CCTGATTGGGTGTTGGGgctttaa
gi|89216 : ATTATTATTGAGCTACTTATAGACCGTATTTAACACTTCCA---CTAGATAAAACGTACCCTGTATTGTAACTCATTTACATTAGATAGTCTGATCGAATGTTTGGg