lowQualScore : 11111 22222 1 222 333333333333333333333333333 11 111 444444444444444444 11111 11111 1 1 1
lowQualScore : 22222 55555 4 7 1 5 2 1 3 1 5 5 000 444 666666666666666666666666666 2 1 0 3 44 22 7777 44 1 7777 555 3 3 000000000000000000 11111 11111 1 1 6 6 1 2 33 5
lowQualScore : ..... ..... . . . . . . . . . . ... ... ........................... . . . . .. .. .... .. . .... ... . . .................. ..... ..... . . . . . . .. .
lowQualScore : 55555 00000 7 5 5 0 5 3 2 0 0 0 666 111 000000000000000000000000000 5 1 5 1 55 44 1111 66 8 1111 888 3 3 999999999999999999 88888 88888 2 0 3 1 8 4 99 0
consensus : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTNAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAACCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACGCAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATAAATTA----AA--TAAAT-AA-TA------A-TAAGCNA-TGAAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Reference ( gi|112531 ) : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACGCAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATAAATTA----AA--TAAAT-AA-TA------A-TCAGCTATTTAAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112532 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-CGT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGTATGTATCGTCTCAATCATTCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACGCAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATAAATTT----AA--TAAAT-AA-TA------A-TAAGCTATTAAAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112535 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CG---C-----------------------AT-TAACGCAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATACATTA----AA--TAAAT-AA-TA------A-TAAGCTA-TTAAAATTAAATAG-----ACT-----TGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112537 : AAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACACAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATAAATTA----AA--TAAAT-AA-TA------A-TAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112538 : AAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCTTGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACACAACCAA-ACA-TAACTAC----TGT--AATAAATTA----AA--TAAAT-AA-TA------A-TAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGT
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAAT-TTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCAC-TTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGA---CACCTC-----------------------AT-TAACATAACCAA-
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAAT-TTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCAC-TTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGA---CACCTC-----------------------AT-TAACATAACCAA-
gi|112547 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACGCAACCA
gi|112536 : tactgtattaaattaaaaataaataagtgaAAATTAAATAG-----ACT-----TGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAAT-TTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCAC-TTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGA---CACCTC-----------------------AT-TAACATAACCAATAAA-TAAATAA----CGT---ATGGATCATCTCAA--CCAAT-CATTA------G-ACACCTCATTAACAT--AACAG-----GCA-----GTACAAAC
gi|112543 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CG---C-----------------------AT-TAACGCAACCA
gi|112544 : atctatatatataacaacaacttatactgtattaaattaaaaagaaaataagtgaAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-CGT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGTATGTATCGTCTCAATCATTCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACGCAACCA
gi|112540 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaataagtaaAAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAAT-TTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCAC-TACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGA---CACCTC-----------------------GT-TAACATAACCAG-GCAGTACCAACGCGGTGTCAAATAAG-TA----CG--TAGAC-AA-TG------A-T
gi|112545 : AAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGCTTGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACACAACCA
gi|112546 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaattataaataagtgaAAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAAT-TTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCAC-TACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---A---CA---C-----------------------AT-TAACACAACCA
gi|112542 : gcaacaacgtatactgtattaaattaaaaatcaataatgaataaaagaAAATCAAATAGTCTAAACT-----TTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112539 : acattcacacacacacacacacacacacacacatacattgtctcaaccaatcataagacacctcgttaacataaccaataaataattaacataaccaaacgtaacttctgtaataaattaaaaataaataatagattaaataagtaattaaAAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAAT-TTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCAC-TACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCAT---A---
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACT-----TTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112542 : TCACACACACACACACACACACACACACATACATTGTCTCAACCAATCAT---AAGACA---CCTCGTTAACATAACCAATAAATAAT-TAACATAACCAA-ACG-TAACTTC----TGT--AATAAATTA----AAAATAAAT-AA-TAGATTAAA-TAAGTAATTAAAAATCAAATAGTCTAAACT-----TTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112548 : acatTCACACACACACACACACACACACACACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGA---CACCTC-----------------------GT-TAACATAACCA
gi|112543 : acatATC-T---A---TA---T-----------------------ATATAAC--AAC--A-ACT-TA--TAC----TGT--ATTAAATTA----AA--AAGAA-AA-TA------A----G----TGAAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCATA------CGCATTAACGCAACCA
gi|112544 : GCAAC--A-ACT-TA--TAC----TGT--ATTAAATTA----AA----AAT-AA---------A-TAAG-TA---AAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTCAT---ACA---CATTAACGCAACCA
gi|112545 : GCAAC--A-ACT-TA--TAC----TGT--ATTAAATTA----AAAATAAAT-TA-TA------AATAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATCAT---ACA---CATTAACACAACCA
gi|112546 : GCAAC--A-ACG-TA--TAC----TGT--ATTAAATTA----AA----AATCAA-TA------A-TGAATAAAAGAAAATCAAATAG-----ACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---ACA---CATTAACACAACCA
gi|112547 : TAC----TGT--ATTAAATTA----AA----AAT-AA---------A-TAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCAT---ACA---CATTAACGCAACCA
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACT-----TTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112536 : AAATTAAATAG-----ACT-----TGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112540 : AAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAataaataaataacgtatggatcatctcaaccaatcattagacacctcattaacataacaggcagtacaaac
gi|112539 : AAATCAAATAG-----ACT-----TAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAggcagtaccaacgcggtgtcaaataagtacgtagacaatgat
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACT-----TTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112542 : ACATTCA---CACACACACACACACACACACA-CACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112548 : ACATTCA---CACACACACACACACACACACA-CACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAataaataattaacataaccaaacgtaacttctgtaataaattaaaaataaataatagattaaataagtaattaaaaatcaaatagtctaaactttacaaatctcatttagtttaatttgctatgttccctctttttatggcaaagtatttatcaatctttatatccatttcaataactcattttaccttgttgactatccaacgttcagctcacaaataaacgtagac
Alignments
lowQualScore : 44444 1111111111 2222222222 111111 3333 11111
lowQualScore : 00000 1 6 5 4 4 3 555 555 0 4444444444 5555555555 77 666666 0000 6 55555 2 5 3 3 0
lowQualScore : ..... . . . . . . ... ... . .......... .......... .. ...... .... . ..... . . . . .
lowQualScore : 00000 0 0 0 4 5 3 888 888 8 6666666666 0000000000 99 444444 0000 3 44444 7 2 0 5 7
consensus : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--AAATAAATAAT------AATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Reference ( family-858 ) : AAATCAAATAGACT-----TTACAAACCTCCTTNAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAACCAATC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--AAATAAATAAT------AATAAGCNA-TGAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112531 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--AAATAAATAAT------AATCAGCTATTTAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112532 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--TAATAAATAAT------AATAAGCTATTAAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112535 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACG---CATTAACGCAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATACATT--AAATAAATAAT------AATAAGCTA-TTAAAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112536 : AAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112536 : ACGTATGGATCATCTCAACCAATCATTAGACACCTCATTAACATAACataaataaataacgtatggatcatctcaaccaatcattagacacctcattaacataacaggcagtacaaac
gi|112537 : aaattaaatagacttgacaaacctcctttagtttaatttgctacgttccctctttctatggcaaagtatttatcaatttttatatccatttcaataactcattttacctcgttgactagccaacgttcagctcacaaatgaaaatacacgcacttcgtatgtattgtgtcaaccaatcataagacacctcattaacataaccaataaataaataAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACACAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--AAATAAATAAT------AATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAaggcagtacaaac
gi|112538 : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACACAACCA----------AACATAACTA----------CTGTAATAAATT--AAATAAATAAT------AATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGT
gi|112539 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATA
gi|112540 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGACggcagtaccaacgcggtgtcaaataagtacgtagacaatgat
gi|112542 : ACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATC-ATAAGACACCTCGTTAACATAACCAATAAATAATTAACATAACCAAACGTAACTTCTGTAATAAATTAAAAATAAATAATAGATTAAATAAGTAATTAAAAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112543 : ATCTAT---ATA---TAT-AAC--AAC------------AACTTA--TA----------CTGTATTAAATT--AAA--AAGAA-------AATAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCATA------CGCATTAACGCAACCA
gi|112543 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACG---CATTAACGCAACCA----------
gi|112544 : atctatatatataacaacaacttatactgtattaaattaaaaagaaaataagtgaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------
gi|112545 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaataagtaaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACACAACCA----------
gi|112546 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaattataaataagtgaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACACAACCA----------
gi|112547 : gcaacaacgtatactgtattaaattaaaaatcaataatgaataaaagaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-AT---ACA---CATTAACGCAACCA----------
gi|112548 : tactgtattaaattaaaaataaataagtgaACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Alignments
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333 111111 11111
lowQualScore : 11111 0 1 3 555 00000000000000000000000 0 77 666666 77 3 55555 1 1 1 1 0
lowQualScore : ..... . . . ... ....................... . .. ...... .. . ..... . . . . .
lowQualScore : 66666 6 0 3 888 88888888888888888888888 8 99 444444 00 9 44444 0 1 8 0 7
consensus : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Reference ( family-858 ) : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112531 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATCAGCTATTTAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112532 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTTAA--TAAATAATA------ATAAGCTATTAAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112535 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATACATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCTATT-AAAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112536 : AAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112536 : CGTATGGATCATCTCAACCAATCATTAGACACCTCATTAACATAACataaataaataacgtatggatcatctcaaccaatcattagacacctcattaacataacaggcagtacaaac
gi|112537 : aaattaaatagacttgacaaacctcctttagtttaatttgctacgttccctctttctatggcaaagtatttatcaatttttatatccatttcaataactcattttacctcgttgactagccaacgttcagctcacaaatgaaaatacacgcacttcgtatgtattgtgtcaaccaatcataagacacctcattaacataaccaataaataaataaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAaggcagtacaaac
gi|112538 : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGT
gi|112539 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATA
gi|112540 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGACggcagtaccaacgcggtgtcaaataagtacgtagacaatgat
gi|112542 : ACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATC-ATAAGACACCTCGTTAACATAACCAATAAATAATTAACATAACCAAACGTAACTTCTGTAATAAATTAAAAATAAATAATAGATTAAATAAGTAATTAAAAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112543 : ATCTATA---TAT-----------------------AT-AAC--AAC--AACTTA--TACTGTATTAAATTAAA----AAGAA-A------ATAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCATA------CGCATTAACGCAACCA
gi|112543 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112544 : atctatatatataacaacaacttatactgtattaaattaaaaagaaaataagtgaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112545 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaataagtaaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112546 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaattataaataagtgaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112547 : gcaacaacgtatactgtattaaattaaaaatcaataatgaataaaagaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112548 : tactgtattaaattaaaaataaataagtgaACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Alignments
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333 111111 11111
lowQualScore : 11111 0 1 3 555 00000000000000000000000 0 77 666666 77 3 55555 1 1 1 1 0
lowQualScore : ..... . . . ... ....................... . .. ...... .. . ..... . . . . .
lowQualScore : 66666 6 0 3 888 88888888888888888888888 8 99 444444 00 9 44444 0 1 8 0 7
consensus : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Reference ( family-858 ) : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112531 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATCAGCTATTTAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112532 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTTAA--TAAATAATA------ATAAGCTATTAAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112535 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATACATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCTATT-AAAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112536 : AAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112536 : CGTATGGATCATCTCAACCAATCATTAGACACCTCATTAACATAACataaataaataacgtatggatcatctcaaccaatcattagacacctcattaacataacaggcagtacaaac
gi|112537 : aaattaaatagacttgacaaacctcctttagtttaatttgctacgttccctctttctatggcaaagtatttatcaatttttatatccatttcaataactcattttacctcgttgactagccaacgttcagctcacaaatgaaaatacacgcacttcgtatgtattgtgtcaaccaatcataagacacctcattaacataaccaataaataaataaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAaggcagtacaaac
gi|112538 : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGT
gi|112539 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATA
gi|112540 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGACggcagtaccaacgcggtgtcaaataagtacgtagacaatgat
gi|112542 : ACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATC-ATAAGACACCTCGTTAACATAACCAATAAATAATTAACATAACCAAACGTAACTTCTGTAATAAATTAAAAATAAATAATAGATTAAATAAGTAATTAAAAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112543 : ATCTATA---TAT-----------------------AT-AAC--AAC--AACTTA--TACTGTATTAAATTAAA----AAGAA-A------ATAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCATA------CGCATTAACGCAACCA
gi|112543 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112544 : atctatatatataacaacaacttatactgtattaaattaaaaagaaaataagtgaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112545 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaataagtaaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112546 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaattataaataagtgaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112547 : gcaacaacgtatactgtattaaattaaaaatcaataatgaataaaagaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112548 : tactgtattaaattaaaaataaataagtgaACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
blockSeqs : AAACT A T AGA CTCGTTAACATAACCAATAAATA AA GATTAA CT A TCTAA T A G T
blockSeqs : AAACT G . . . . . CT A TCTAA T A G T
blockSeqs : AAACT T . . . . . TA A . T A G T
blockSeqs : AAACT T . . . . . TA A . G A G T
blockSeqs : . G . . . . . TA G . G A G T
blockSeqs : . A . . . . . . . . A G T A
blockSeqs : . T . . . . A G T A
blockSeqs : . T . . . . A G T A
blockSeqs : . A . . . . A G T A
blockSeqs : . . . . T A T A
blockSeqs : . . . . T A A A
blockSeqs : . T A
blockSeqCons :
originalCons : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
finalCons : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Alignments
lowQualScore : 44444 33333333333333333333333 111111 11111
lowQualScore : 11111 0 1 3 555 00000000000000000000000 0 77 666666 77 3 55555 1 1 1 1 0
lowQualScore : ..... . . . ... ....................... . .. ...... .. . ..... . . . . .
lowQualScore : 66666 6 0 3 888 88888888888888888888888 8 99 444444 00 9 44444 0 1 8 0 7
consensus : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
Reference ( family-858 ) : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTNTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCNATTAAAAATCAAATAG-----ACTTNACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTNCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112531 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATCAGCTATTTAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112532 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTTAA--TAAATAATA------ATAAGCTATTAAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112533 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGACAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112534 : AAATCAAATAG-----ACTTTACAAACCTCCTTGAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACGCACTTCGTATGTATTGTATCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112535 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCAAACATAACTACTGTAATACATTAAA--TAAATAATA------ATAAGCTATT-AAAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCAa
gi|112536 : AAATTAAATAG-----ACTTGACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTACGTTCCCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTCGTTGACTAGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACGCACTTCGTATGTATTGTGTCAACCAATCATAAGACACCTCATTAACATAACCA
gi|112536 : CGTATGGATCATCTCAACCAATCATTAGACACCTCATTAACATAACataaataaataacgtatggatcatctcaaccaatcattagacacctcattaacataacaggcagtacaaac
gi|112537 : aaattaaatagacttgacaaacctcctttagtttaatttgctacgttccctctttctatggcaaagtatttatcaatttttatatccatttcaataactcattttacctcgttgactagccaacgttcagctcacaaatgaaaatacacgcacttcgtatgtattgtgtcaaccaatcataagacacctcattaacataaccaataaataaataaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCAaggcagtacaaac
gi|112538 : AAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCAAACATAACTACTGTAATAAATTAAA--TAAATAATA------ATAAGTAATTAAAAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGT
gi|112539 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTACCTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGATCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTTTTGTCTCAACCAATCATA
gi|112540 : AAATCAAATAG-----ACTTAACAAACCTCCTTTAGTTTAATTTGCTATGTTCACTCTTTCTATGGCAAAGTATTTATCAATTTTTATATCCGTTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTTGCCAACGTTCAGCTCACAAATGAAAATACACTCACTACGTATGTATTGTCTAAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA
gi|112541 : AAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGACggcagtaccaacgcggtgtcaaataagtacgtagacaatgat
gi|112542 : ACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATC-ATAAGACACCTCGTTAACATAACCAATAAATAATTAACATAACCAAACGTAACTTCTGTAATAAATTAAAAATAAATAATAGATTAAATAAGTAATTAAAAATCAAATAGTCTAAACTTTACAAATCTCATTTAGTTTAATTTGCTATGTTCCCTCTTTTTATGGCAAAGTATTTATCAATCTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTGACTATCCAACGTTCAGCTCACAAATAAACGTAGAC
gi|112543 : ATCTATA---TAT-----------------------AT-AAC--AAC--AACTTA--TACTGTATTAAATTAAA----AAGAA-A------ATAAG----TGAAAATCAAATAG-----ACTTTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTT-ATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATCATA------CGCATTAACGCAACCA
gi|112543 : AAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCAATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGGCTGTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CGC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112544 : atctatatatataacaacaacttatactgtattaaattaaaaagaaaataagtgaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATCGTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAATGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGTATGTATCGTCTCAATCATTC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112545 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaataagtaaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCCTCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCTTGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112546 : gcaacaacttatactgtattaaattaaaaataaattataaataagtgaAAATCAAATAGACTAAACTTTACAAACTTCCTTCAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTGTGAAAGAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTCAATAACTCATTTTACCTTGTTAACTTTCCAACGTTCAGCTCACATATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACACAACCA
gi|112547 : gcaacaacgtatactgtattaaattaaaaatcaataatgaataaaagaAAATCAAATAGACT-----TTACAAATCTCCTTAAGTTTAATTTACTATGTTCCATCTTTCTATGAAAAAGTATTTATCAATTTTATATCCATTTTAATAACTCATTTTACCTCGTTGATTATCCAACGTTCGGCTCACAAATGAACATACACTCACTACGCATGTATCGTCTCAATCAATC-ATA---CAC-----------------------ATTAACGCAACCA
gi|112548 : tactgtattaaattaaaaataaataagtgaACATTCA---CACACACACACACACACACAC-ACACATACATTGTCTCAACCAATCATAAGACACCTCGTTAACATAACCA