lowQualScore : 1 5555555555555 2222222222222222222 2 1 1
lowQualScore : 3 1 6 88888 1 0 0 44 999 6 888 3 555 6 7 0 33 6666 8888888888888 444 444 66666 0000000000000000000 8 1 2 2 5 7 2 1 2 4
lowQualScore : . . . ..... . . . .. ... . ... . ... . . . .. .... ............. ... ... ..... ................... . . . . . . . . . .
lowQualScore : 6 2 7 33333 8 2 8 22 666 0 555 1 444 5 0 8 66 5555 9999999999999 777 777 77777 7777777777777777777 0 4 9 9 0 9 9 7 0 1
consensus : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTNATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACA--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT-AAAAA----AANA-GTGTGACGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAGCAAATTATATTATT-------------------ACCCC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAAAAACAGACAGGCGNGGG
Reference ( gi|86949 ) : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACA--TTT---GAAAACCACTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATTAAATTGCTAATTTT-AAAAA----AATATGTGTGATGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAACAAATTATATTATT-------------------ACCCCACAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGCTAGTTGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTACATTGTTTGAGATTTGAAAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86950 : AACAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AAAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATATTTGAGTAATACATACA--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTACTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGCTATCAATTTATCTGAATATTTATGTTAAATCAAATAGCTAA-TTA-AAAAA----AAAAAGTGTGATTCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAACAAATTATATTATT-------------------ACCCCCCAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAA-AAACGCTGGCTTATTCCATTGATTGAGATTTGAAAAACAGACAGGCGTGGG
gi|86951 : AAAAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATGCATACA--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAA----AAAATGTGTGATGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATAACTCAACCA-----CATCTTAACACATTATATTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTA---------AT-AAAAAAACGCTGGCTTATTCAATTGTTTGAGATTTGAAAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86952 : AAAAACTTAAAACGGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACA--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCATCC-CATTCTATTATCTG-TTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAG-TTT-AAAAG----AA-ATGTATGATGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTATTCAACTA-----CATCCCAACAAATTATATTATT-------------------ACCCCCCAATAAAATTACAAGTTTTGCGTAC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACT---TTA-AACA---TTTGA-----AAGAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86953 : AAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACA--TTT---GAAAACGGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTAGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTTATTTT-AAAAA----AA-ATGTGTGATGCCAAATTTGTGTTAAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAACAAATTATATTATT-------------------ACCACCCAACAAATTTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAAAAACAGACAGGGGCGGG
gi|86954 : AAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGCTTAAAGAATCATTACCAATATATTTAATTAATAAAGTCATCGTATAATTGAAAAATACATACA--TTT---GAATACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATAACTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT-AAAAA----AA-ATGTGTGATGCCAAACTTGTGATGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAACAAATTATATTATT-------------------ACCCC-CAATAAAATTACAAGCTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTTAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTAAAAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86955 : AAACTTAAAACTGCACGTAAGTTA-A----AATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCGATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAA-ACACAAT--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATGATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTATATTAAATAGCTAATTTT-AAAAA----AAAA---GTAA---CAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTATACTA-----CATCCTAGCAAATTATATTATT-------------------ACCCC-CAATAA------AAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGG-------GGTAAT----GTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAAAAACAGACAGGCGGGGG
gi|86957 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACA--TTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86956 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACA--TTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86958 : TACACAAATTACATGAACATATGA-ATATACGTTGTTTAAACAATTATTACCAACACATTTAATTAATAAAGCAATGGCATAAT
gi|86959 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACAGT--TTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTACCTGTTTATAAAC---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAA-AAAATAGCTAACTTT-AAAAA----ATTA------A---CAAACTTGTGTTGAAATATATTA---ATTACTTAACTA-----CATCCTAGCAAATTATATTATT-------------------ATCCT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAAGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAAAAACAGACAGTCAGGGG
gi|86960 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATA--TACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAGAC---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAAAAAAATAGCTAACTTT-AAAAA----ATTA------A---CAATCTTGTGTTGAAATA---TATTAATTACTTTACTA-----CATCCTAGCAAATTATATTATT-------------------ATCCT-CAATAAA--T----GTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAAAAACAGACAGTCAGGGG
gi|86961 : TA-A-----GTTGTTTAAATTATTATTACCAACACATTTGATTAATAAAGCAATCGCATATTTAAGAAATACACAAA--TTTTTAGAAAACCGCTAATATTTCTTTTTTTCC-CGCTTTATTATCTGTTCATAAAA---TTTTAATTTAATATCAATTTATCTGAATATCGATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT-AAAAA----GCTG-----AACAACAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACCCAACTA-----CATTCTAGCAGATTATATTATG-------------------ACCTC
gi|86962 : AATACATTTAATTAATAAAACCATCGCATAATTGAGAAATACACA-A--TTTTT-GAAAACCGCTTACGTTT---GTCCTCC-CGTTCTATCATCTGTTGATGAAA---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTTTGCTAAATCAAATAGATAATTTT-AAAAA----A----CTGAGA-AACAAACTTGTGATGAAATA---TA---ATTACTC----------------AACAAATTATATTATT-------------------ACCCC-CAATAAAATT---AGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGATAGTCGGTAATTAAGGTAAT-AAATAAACATTGGCTTATTCCATTGTTTGAGACTTGAAAAACAGACAGGTAAGGGc
gi|86963 : ATATA--TTT------ATTCGCTAATATTTC--TTTTTCCTCGCTTTATTATCTGTTTACAAAAAAGTTTGAATTCATTATCAATTTATCTGAATATCAGTGTTAAATCAAACAGCTAATTTT-AAAAAGCTGAACA-----AA----AAACTTGTGTTAAAATA---TA---ATTATTCAATTACATTCCATTCTAGCAGATTATATTATA-------------------ACACC-CAATAAAATTACAATTTTTGCCTCC-GGGACAGGGGTAGGGGGTAATTTAGTTCAT-AAATAAACACTGGCTTATCGCATTGTTTGAGACTTGAAACACAGACAGGCGGGGG
gi|86965 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATTA--AAAAA----AAGA------ACAACAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAGCAAATTATATCATT-------------------ACCCCG-AATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAAAAACAGACAAG
gi|86964 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATTA--AAAAA----AAGA------ACAACAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTAGCAAATTATATCATT-------------------ACCCCG-AATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAAAAACAGACAAG
gi|86966 : TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TA---ATTACTCAACTA-----CATCCTCACAAATTATATTATT-------------------ACCTCCCAATAAAATTACAA-TTTCACCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCATGAAAAAAACGCTGGCTTATTCCATTGTATGAGATTTGAAAAACAGACAGG
gi|86967 : TTGAAATA---TA---ATTACTCAATTA-----CATTCTAGCAGATTATGTTATA-------------------ACCCC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCCGGGG-CAGGGGTAGGGGGTAAATAAGTTCAT-AAA-AGACACTGGCTTATCGTATTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 333333333333333 1111111111111111111
lowQualScore : 3 0 6 77777 1 1 999 777 2 555 000000000000000 888 66666 9999999999999999999 5 5 2 2 2 2 1 33 1
lowQualScore : . . . ..... . . ... ... . ... ............... ... ..... ................... . . . . . . . .. .
lowQualScore : 3 2 2 77777 0 5 666 999 9 000 888888888888888 888 22222 4444444444444444444 0 0 5 7 7 7 0 99 0
consensus : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAAAA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
Reference ( family-849 ) : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTNATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAANA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGNGGG
gi|86949 : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCACTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATTAAATTGCTAATTTTAAAAAAATAT-G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CCACAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGCTAGTTGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTACATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86950 : AACAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AAAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATATTTGAGTAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTACTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGCTATCAATTTATCTGAATATTTATGTTAAATCAAATAGCTAATTAAAAAAAAAAA--G-TGTGA-TTCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAA-AAACGCTGGCTTATTCCATTGATTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGTGGG
gi|86951 : AAAAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATGCATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAAAAATG-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATAACTCAACCACATCT-----TAACACATTATATTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTA---------AT-AAAAAAACGCTGGCTTATTCAATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86952 : AAAAACTTAAAACGGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCATCC-CATTCTATTATCTG-TTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAG-TTTAAAAGAAAT--G-TATGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTATTCAACTACATCC-----CAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCGTAC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACT---TTA-----------AACATTTGAAAGAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86953 : AAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACGGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTAGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTTATTTTAAAAAAAAT--G-TGTGA-TGCCAAATTTGTGTTAAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CCACC-CAACAAATTTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGGGCGGG
gi|86954 : AAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGCTTAAAGAATCATTACCAATATATTTAATTAATAAAGTCATCGTATAATTGAAAAATACATACATTT---GAATACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATAACTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAAAT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGCTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTTAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTAAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86955 : AAACTTAAAACTGCACGTAAGTTA-A----AATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCGATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAA-ACACAATTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATGATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTATATTAAATAGCTAATTTTAAAAAAAAA-----GTAA----CAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTATACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAA------AAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAAT-----------GTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGGGGG
gi|86956 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86957 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86958 : TACACAAATTACATGAACATATGA-ATATACGTTGTTTAAACAATTATTACCAACACATTTAATTAATAAAGCAATGGCATAAT
gi|86959 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTACCTGTTTATAAAC---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAA-AAAATAGCTAACTTTAAAAAATTA--A----------CAAACTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAAGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86960 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATATACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAGAC---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAAAAAAATAGCTAACTTTAAAAAATTA--A----------CAATCTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTTACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86961 : TA-A-----GTTGTTTAAATTATTATTACCAACACATTTGATTAATAAAGCAATCGCATATTTAAGAAATACACAAATTTTTAGAAAACCGCTAATATTTCTTTTTTTCC-CGCTTTATTATCTGTTCATAAAA---TTTTAATTTAATATCAATTTATCTGAATATCGATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAA----A--GCTG-AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACCCAACTACATTC-----TAGCAGATTATATTATG-------------------A-CC-TC-C
gi|86962 : AATACATTTAATTAATAAAACCATCGCATAATTGAGAAATACACA-ATTTTT-GAAAACCGCTTACGTTT---GTCCTCC-CGTTCTATCATCTGTTGATGAAA---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTTTGCTAAATCAAATAGATAATTTTAAAAA---A--C-TGAGA--AACAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAA----------------CAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATT---AGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGATAGTCGGTAATTAAGGTAAT-AAATAAACATTGGCTTATTCCATTGTTTGAGACTTGAA--AAACAGACAGGTAAGGG
gi|86963 : CGCTAATATTTC--TTTTTCCTCGCTTTATTATCTGTTTACAAAAAAGTTTGAATTCATTATCAATTTATCTGAATATCAGTGTTAAATCAAACAGCTAATTTTAAAAA------G-C-TGAACAAAAAACTTGTGTTAAAATA---TAATTATTCAATTACATTCCATTCTAGCAGATTATATTATA-------------------A-CA-CC-CAATAAAATTACAATTTTTGCCTCC-GGGACAGGGGTAGGGGGTAATTTAGTTCAT-AAATAAACACTGGCTTATCGCATTGTTTGAGACTTGAA--ACACAGACAGGCGGGGG
gi|86964 : atatatttattTGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAAAA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86965 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAAAA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86966 : GCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TCACAAATTATATTATT-------------------A-CCTCC-CAATAAAATTACAA-TTTCACCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCATGAAAAAAACGCTGGCTTATTCCATTGTATGAGATTTGAA--AAACAGACAGG
gi|86967 : tTTGAAATA---TAATTACTCAATTACATTC-----TAGCAGATTATGTTATA-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCCGGGG-CAGGGGTAGGGGGTAAATAAGTTCAT-AAA-AGACACTGGCTTATCGTATTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 1111111111111111111
lowQualScore : 3 0 6 77777 1 1 999 777 2 555 1 2 22222222222222 888 66666 9999999999999999999 5 5 2 2 2 2 1 33 2
lowQualScore : . . . ..... . . ... ... . ... . . .............. ... ..... ................... . . . . . . . .. .
lowQualScore : 3 2 2 77777 1 5 666 999 9 000 4 9 55555555555555 888 22222 4444444444444444444 0 0 5 7 7 7 0 99 8
consensus : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
Reference ( family-849 ) : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86949 : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCACTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATTAAATTGCTAATTTTAAAAAAATAT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CCACAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGCTAGTTGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTACATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86950 : AACAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AAAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATATTTGAGTAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTACTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGCTATCAATTTATCTGAATATTTATGTTAAATCAAATAGCTAATTAAAAAAAAA-AA--G-TGTGA-TTCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAA-AAACGCTGGCTTATTCCATTGATTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGTGGG
gi|86951 : AAAAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATGCATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AAATG-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATAACTCAACCACATCT-----TAACACATTATATTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTA---------AT-AAAAAAACGCTGGCTTATTCAATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86952 : AAAAACTTAAAACGGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCATCC-CATTCTATTATCTG-TTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAG-TTTAAAAGAA-AT--G-TATGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTATTCAACTACATCC-----CAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCGTAC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACT---TTA-----------AACATTTGAAAGAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86953 : AAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACGGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTAGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTTATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAATTTGTGTTAAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CCACC-CAACAAATTTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGGGCGGG
gi|86954 : AAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGCTTAAAGAATCATTACCAATATATTTAATTAATAAAGTCATCGTATAATTGAAAAATACATACATTT---GAATACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATAACTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGCTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTTAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTAAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86955 : AAACTTAAAACTGCACGTAAGTTA-A----AATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCGATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAA-ACACAATTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATGATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTATATTAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA-----GTAA----CAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTATACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAA------AAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAAT-----------GTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGGGGG
gi|86956 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86957 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86958 : TACACAAATTACATGAACATATGA-ATATACGTTGTTTAAACAATTATTACCAACACATTTAATTAATAAAGCAATGGCATAAT
gi|86959 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTACCTGTTTATAAAC---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAA-AAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAAACTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAAGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86960 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATATACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAGAC---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAAAAAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAATCTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTTACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86961 : TA-A-----GTTGTTTAAATTATTATTACCAACACATTTGATTAATAAAGCAATCGCATATTTAAGAAATACACAAATTTTTAGAAAACCGCTAATATTTCTTTTTTTCC-CGCTTTATTATCTGTTCATAAAA---TTTTAATTTAATATCAATTTATCTGAATATCGATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT----AAA-AA--GCTG-AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACCCAACTACATTC-----TAGCAGATTATATTATG-------------------A-CC-TC-C
gi|86962 : AATACATTTAATTAATAAAACCATCGCATAATTGAGAAATACACA-ATTTTT-GAAAACCGCTTACGTTT---GTCCTCC-CGTTCTATCATCTGTTGATGAAA---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTTTGCTAAATCAAATAGATAATTTT---AAAA-AA--C-TGAGA--AACAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAA----------------CAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATT---AGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGATAGTCGGTAATTAAGGTAAT-AAATAAACATTGGCTTATTCCATTGTTTGAGACTTGAA--AAACAGACAGGTAAGGG
gi|86963 : CGCTAATATTTC--TTTTTCCTCGCTTTATTATCTGTTTACAAAAAAGTTTGAATTCATTATCAATTTATCTGAATATCAGTGTTAAATCAAACAGCTAATTTTAAAAA-------G-C-TGAACAAAAAACTTGTGTTAAAATA---TAATTATTCAATTACATTCCATTCTAGCAGATTATATTATA-------------------A-CA-CC-CAATAAAATTACAATTTTTGCCTCC-GGGACAGGGGTAGGGGGTAATTTAGTTCAT-AAATAAACACTGGCTTATCGCATTGTTTGAGACTTGAA--ACACAGACAGGCGGGGG
gi|86964 : atatatttattTGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86965 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86966 : GCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TCACAAATTATATTATT-------------------A-CCTCC-CAATAAAATTACAA-TTTCACCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCATGAAAAAAACGCTGGCTTATTCCATTGTATGAGATTTGAA--AAACAGACAGG
gi|86967 : tTTGAAATA---TAATTACTCAATTACATTC-----TAGCAGATTATGTTATA-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCCGGGG-CAGGGGTAGGGGGTAAATAAGTTCAT-AAA-AGACACTGGCTTATCGTATTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 1111111111111111111
lowQualScore : 3 0 6 77777 1 1 999 777 2 555 1 2 22222222222222 888 66666 9999999999999999999 5 5 2 2 2 2 1 33 2
lowQualScore : . . . ..... . . ... ... . ... . . .............. ... ..... ................... . . . . . . . .. .
lowQualScore : 3 2 2 77777 1 5 666 999 9 000 4 9 55555555555555 888 22222 4444444444444444444 0 0 5 7 7 7 0 99 8
consensus : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
Reference ( family-849 ) : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86949 : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCACTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATTAAATTGCTAATTTTAAAAAAATAT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CCACAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGCTAGTTGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTACATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86950 : AACAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AAAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATATTTGAGTAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTACTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGCTATCAATTTATCTGAATATTTATGTTAAATCAAATAGCTAATTAAAAAAAAA-AA--G-TGTGA-TTCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAA-AAACGCTGGCTTATTCCATTGATTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGTGGG
gi|86951 : AAAAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATGCATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AAATG-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATAACTCAACCACATCT-----TAACACATTATATTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTA---------AT-AAAAAAACGCTGGCTTATTCAATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86952 : AAAAACTTAAAACGGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCATCC-CATTCTATTATCTG-TTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAG-TTTAAAAGAA-AT--G-TATGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTATTCAACTACATCC-----CAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCGTAC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACT---TTA-----------AACATTTGAAAGAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86953 : AAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACGGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTAGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTTATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAATTTGTGTTAAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CCACC-CAACAAATTTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGGGCGGG
gi|86954 : AAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGCTTAAAGAATCATTACCAATATATTTAATTAATAAAGTCATCGTATAATTGAAAAATACATACATTT---GAATACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATAACTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGCTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTTAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTAAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86955 : AAACTTAAAACTGCACGTAAGTTA-A----AATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCGATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAA-ACACAATTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATGATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTATATTAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA-----GTAA----CAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTATACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAA------AAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAAT-----------GTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGGGGG
gi|86956 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86957 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86958 : TACACAAATTACATGAACATATGA-ATATACGTTGTTTAAACAATTATTACCAACACATTTAATTAATAAAGCAATGGCATAAT
gi|86959 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTACCTGTTTATAAAC---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAA-AAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAAACTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAAGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86960 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATATACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAGAC---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAAAAAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAATCTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTTACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86961 : TA-A-----GTTGTTTAAATTATTATTACCAACACATTTGATTAATAAAGCAATCGCATATTTAAGAAATACACAAATTTTTAGAAAACCGCTAATATTTCTTTTTTTCC-CGCTTTATTATCTGTTCATAAAA---TTTTAATTTAATATCAATTTATCTGAATATCGATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT----AAA-AA--GCTG-AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACCCAACTACATTC-----TAGCAGATTATATTATG-------------------A-CC-TC-C
gi|86962 : AATACATTTAATTAATAAAACCATCGCATAATTGAGAAATACACA-ATTTTT-GAAAACCGCTTACGTTT---GTCCTCC-CGTTCTATCATCTGTTGATGAAA---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTTTGCTAAATCAAATAGATAATTTT---AAAA-AA--C-TGAGA--AACAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAA----------------CAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATT---AGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGATAGTCGGTAATTAAGGTAAT-AAATAAACATTGGCTTATTCCATTGTTTGAGACTTGAA--AAACAGACAGGTAAGGG
gi|86963 : CGCTAATATTTC--TTTTTCCTCGCTTTATTATCTGTTTACAAAAAAGTTTGAATTCATTATCAATTTATCTGAATATCAGTGTTAAATCAAACAGCTAATTTTAAAAA-------G-C-TGAACAAAAAACTTGTGTTAAAATA---TAATTATTCAATTACATTCCATTCTAGCAGATTATATTATA-------------------A-CA-CC-CAATAAAATTACAATTTTTGCCTCC-GGGACAGGGGTAGGGGGTAATTTAGTTCAT-AAATAAACACTGGCTTATCGCATTGTTTGAGACTTGAA--ACACAGACAGGCGGGGG
gi|86964 : atatatttattTGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86965 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86966 : GCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TCACAAATTATATTATT-------------------A-CCTCC-CAATAAAATTACAA-TTTCACCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCATGAAAAAAACGCTGGCTTATTCCATTGTATGAGATTTGAA--AAACAGACAGG
gi|86967 : tTTGAAATA---TAATTACTCAATTACATTC-----TAGCAGATTATGTTATA-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCCGGGG-CAGGGGTAGGGGGTAAATAAGTTCAT-AAA-AGACACTGGCTTATCGTATTGTTTG
blockSeqs : C T TATAC A C TTA CTT T AAG A . AATGTGTGATGC TAT CATTC CCCCCCCCCCCCCCCCCCC C A . G A G A AG T
blockSeqs : . T . A C TT C . . A . AGTGTGATTC TAT . . C T . . . . T . C
blockSeqs : . . . A C . . . . A . TGTATGATGC . . . . . . . . . T . C
blockSeqs : . . . A C . . . . A . TGTGTGATGC . . . . . . . . . T . C
blockSeqs : . . . A C . . . . A . TGTGTGATGC . . . . . . . . . T . C
blockSeqs : . . . T A . . . . A . AGCTGAACAA . . . . . . . . . T . G
blockSeqs : . . . T C . . . . A . ACTGAGAAA . . . . . . . . . T . G
blockSeqs : . . . T C . . . . A . GCTGAACAA . . . . . . . . . T . G
blockSeqs : . . . A G . . . . A . AGAACAA . . . . . . . . . T . A
blockSeqs : . . . C G . . . . . . AGAACAA . . . . . . . . . T . G
blockSeqs : . . . C A . . . . . . AGTAA . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . . . . TTAA . . . . . . . . . A .
blockSeqs : A . . . . . TTAA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
finalCons : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 1111111111111111111
lowQualScore : 3 0 6 77777 1 1 999 777 2 555 1 2 22222222222222 888 66666 9999999999999999999 5 5 2 2 2 2 1 33 2
lowQualScore : . . . ..... . . ... ... . ... . . .............. ... ..... ................... . . . . . . . .. .
lowQualScore : 3 2 2 77777 1 5 666 999 9 000 4 9 55555555555555 888 22222 4444444444444444444 0 0 5 7 7 7 0 99 8
consensus : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
Reference ( family-849 ) : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA--G-TGTGA-CGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86949 : AAAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCACTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATTAAATTGCTAATTTTAAAAAAATAT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CCACAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGCTAGTTGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTACATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86950 : AACAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AAAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATATTTGAGTAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTACTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGCTATCAATTTATCTGAATATTTATGTTAAATCAAATAGCTAATTAAAAAAAAA-AA--G-TGTGA-TTCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAA-AAACGCTGGCTTATTCCATTGATTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGTGGG
gi|86951 : AAAAACTTAAAACTGTAGGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATGCATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AAATG-TGTGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATAACTCAACCACATCT-----TAACACATTATATTATTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTCGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTA---------AT-AAAAAAACGCTGGCTTATTCAATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86952 : AAAAACTTAAAACGGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCATCC-CATTCTATTATCTG-TTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTAG-TTTAAAAGAA-AT--G-TATGA-TGCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTATTCAACTACATCC-----CAACAAATTATATTATT-------------------ACCC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCGTAC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACT---TTA-----------AACATTTGAAAGAAACAGACAGGCGCGGG
gi|86953 : AAAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTAATTAATAAAGTCATCGCATAATTGAGAAATACATACATTT---GAAAACGGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTAGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAATCAAATAGCTTATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAATTTGTGTTAAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CCACC-CAACAAATTTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGGGCGGG
gi|86954 : AAACTTAAAACTGTACGTAAGTTA-AGAAAAATATTA-A-----GTTGCTTAAAGAATCATTACCAATATATTTAATTAATAAAGTCATCGTATAATTGAAAAATACATACATTT---GAATACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATAACTATGTTAAATCAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AT--G-TGTGA-TGCCAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAACAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGCTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTTAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTAAA--AAACAGACAGGCGCGGG
gi|86955 : AAACTTAAAACTGCACGTAAGTTA-A----AATATTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCGATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAA-ACACAATTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATGATTTGTTTATAAAA---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTATATTAAATAGCTAATTTTAAAAAAA-AA-----GTAA----CAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTATACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAA------AAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAAT-----------GTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTGAGATTTGAA--AAACAGACAGGCGGGGG
gi|86956 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86957 : AAACTTCAAACTGTACGTAAGTTA-TGAAAAATATTATA-----GTTGTTTAAAGAATTATTACCAATACATTTTATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACACATTT---GAAAACCGGTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTAATATGTATTTATAAAA---TT
gi|86958 : TACACAAATTACATGAACATATGA-ATATACGTTGTTTAAACAATTATTACCAACACATTTAATTAATAAAGCAATGGCATAAT
gi|86959 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATACACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTACCTGTTTATAAAC---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAA-AAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAAACTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTAACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAAGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86960 : AAATTA-AAACAA---TTA-A-----GTTGTTTAAAGAATTATCGCCAATACATTTCATTAATAAAGCCATCGCATAATTGAGAAATATACAGTTTT---GAAAACCGCTAACATTT---TTCCTCC-CGTTCTATTATCTGTTTATAGAC---TTTGAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTATGTTAAAAAAAATAGCTAACTTTAAAAAA--------T-TAA----CAATCTTGTGTTGAAATATATTAATTACTTTACTACATCC-----TAGCAAATTATATTATT-------------------A-TC-CT-CAAT-AAAT-----GTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTTGTCGTAAATTAAGGTCAT-AGATAAACACTGGCTTATTCCAT------AGATTAGAA--AAACAGACAGTCAGGGG
gi|86961 : TA-A-----GTTGTTTAAATTATTATTACCAACACATTTGATTAATAAAGCAATCGCATATTTAAGAAATACACAAATTTTTAGAAAACCGCTAATATTTCTTTTTTTCC-CGCTTTATTATCTGTTCATAAAA---TTTTAATTTAATATCAATTTATCTGAATATCGATGTTAAATCAAATAGCTAATTTT----AAA-AA--GCTG-AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACCCAACTACATTC-----TAGCAGATTATATTATG-------------------A-CC-TC-C
gi|86962 : AATACATTTAATTAATAAAACCATCGCATAATTGAGAAATACACA-ATTTTT-GAAAACCGCTTACGTTT---GTCCTCC-CGTTCTATCATCTGTTGATGAAA---TTTAAATTTGTTATCAATTTATCTGAATATCTTTGCTAAATCAAATAGATAATTTT---AAAA-AA--C-TGAGA--AACAAACTTGTGATGAAATA---TAATTACTCAA----------------CAAATTATATTATT-------------------A-CC-CC-CAATAAAATT---AGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGATAGTCGGTAATTAAGGTAAT-AAATAAACATTGGCTTATTCCATTGTTTGAGACTTGAA--AAACAGACAGGTAAGGG
gi|86963 : CGCTAATATTTC--TTTTTCCTCGCTTTATTATCTGTTTACAAAAAAGTTTGAATTCATTATCAATTTATCTGAATATCAGTGTTAAATCAAACAGCTAATTTTAAAAA-------G-C-TGAACAAAAAACTTGTGTTAAAATA---TAATTATTCAATTACATTCCATTCTAGCAGATTATATTATA-------------------A-CA-CC-CAATAAAATTACAATTTTTGCCTCC-GGGACAGGGGTAGGGGGTAATTTAGTTCAT-AAATAAACACTGGCTTATCGCATTGTTTGAGACTTGAA--ACACAGACAGGCGGGGG
gi|86964 : atatatttattTGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86965 : TGTTAA-TCAAAAAGATAATT---AAAAAA-AA--G----AA-CAACAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TAGCAAATTATATCATT-------------------A-CC-CC-GAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCAT-AAATAAACACTGGCTTATTCCATTGTTTAAGATTTGAA--AAACAGACAAG
gi|86966 : GCCAAACTTGTGTTGAAATA---TAATTACTCAACTACATCC-----TCACAAATTATATTATT-------------------A-CCTCC-CAATAAAATTACAA-TTTCACCTCC-GGG-CAGGGGTAGTCGGTAATTAAGGTCATGAAAAAAACGCTGGCTTATTCCATTGTATGAGATTTGAA--AAACAGACAGG
gi|86967 : tTTGAAATA---TAATTACTCAATTACATTC-----TAGCAGATTATGTTATA-------------------A-CC-CC-CAATAAAATTACAAGTTTTGCCTCCGGGG-CAGGGGTAGGGGGTAAATAAGTTCAT-AAA-AGACACTGGCTTATCGTATTGTTTG