lowQualScore : 1
lowQualScore : 7 7 4 2 66 7 4 6
lowQualScore : . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 3 4 11 6 1 0
consensus : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
Reference ( gi|136435 ) : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCCCAAGCAAGAATTCCAACAATTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCAATCATATACTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136427 : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATCTCAACGTTTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCACTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAAGTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136428 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAATAT--TATGTTTTAACTTCAAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCCTCTTCAGTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136430 : aaATGGGTCATCTGAACTCCTAACTTGTCCAATTCCTCAAGCAAGAATTTCGACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAATTTC-AACTCCAGATTTTATTTTTCCATGAATCATCTCCAGTCTGGCAAACATATATTTTGTGCTACATCTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136431 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACCTGTCCAACTTCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTCCAGATATATATACTATAATTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTACCATGAATCATCTTCAATCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136429 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTTAAGCAGGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCAAA-TCCAGATTTTGTTTTTTCGTGAATCATCTCCAGTCTGGAAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCGATTTTAACATCTCGAGTTC
gi|136433 : aaATGGGTCATTTAAACTCTTAACTAGTCCAACTCCTAAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCTTGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTATAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136432 : aaATGAGTCATCTTAACTCTTAACTTGTCCAACTC---AAGCAAGAATTATAGTGATTCAGTTCCAGATATATAT--TATATTTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCACATATTTTGTACTACAACTCCAGTCAATTTCAATATCTCCAGTTC
gi|136434 : aaATGAGTCACCTGAACTC-------ATCCAACTCCTTAAGCATGAATTTCAATGATTCAGCTCCAGATATATAT--AATGTTTTAAATT-AAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCGATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136436 : aaAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACAATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTC-AACTCCAGCTTTTGTTTTTCCATGAATC
gi|136442 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136441 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136440 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136439 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136438 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136437 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136443 : TACAACTCCAGCCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136445 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAATTC
gi|136444 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCTAGTTC
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 55 4
lowQualScore : .. .
lowQualScore : 55 8
consensus : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
Reference ( family-847 ) : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136427 : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATCTCAACGTTTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCACTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAAGTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136428 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAATAT--TATGTTTTAACTTCAAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCCTCTTCAGTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136429 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTTAAGCAGGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCAAA-TCCAGATTTTGTTTTTTCGTGAATCATCTCCAGTCTGGAAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCGATTTTAACATCTCGAGTTC
gi|136430 : aaATGGGTCATCTGAACTCCTAACTTGTCCAATTCCTCAAGCAAGAATTTCGACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAATTTC-AACTCCAGATTTTATTTTTCCATGAATCATCTCCAGTCTGGCAAACATATATTTTGTGCTACATCTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136431 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACCTGTCCAACTTCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTCCAGATATATATACTATAATTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTACCATGAATCATCTTCAATCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136432 : aaATGAGTCATCTTAACTCTTAACTTGTCCAACTC---AAGCAAGAATTATAGTGATTCAGTTCCAGATATATAT--TATATTTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCACATATTTTGTACTACAACTCCAGTCAATTTCAATATCTCCAGTTC
gi|136433 : aaATGGGTCATTTAAACTCTTAACTAGTCCAACTCCTAAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCTTGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTATAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136434 : aaATGAGTCACCTGAACTC-------ATCCAACTCCTTAAGCATGAATTTCAATGATTCAGCTCCAGATATATAT--AATGTTTTAAATT-AAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCGATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136435 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCCCAAGCAAGAATTCCAACAATTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCAATCATATACTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136436 : AACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACAATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTC-AACTCCAGCTTTTGTTTTTCCATGAATC
gi|136437 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136438 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136439 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136440 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136441 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136442 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136443 : TACAACTCCAGCCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136444 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCTAGTTC
gi|136445 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAATTC
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 55 4
lowQualScore : .. .
lowQualScore : 55 8
consensus : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
Reference ( family-847 ) : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136427 : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATCTCAACGTTTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCACTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAAGTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136428 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAATAT--TATGTTTTAACTTCAAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCCTCTTCAGTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136429 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTTAAGCAGGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCAAA-TCCAGATTTTGTTTTTTCGTGAATCATCTCCAGTCTGGAAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCGATTTTAACATCTCGAGTTC
gi|136430 : aaATGGGTCATCTGAACTCCTAACTTGTCCAATTCCTCAAGCAAGAATTTCGACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAATTTC-AACTCCAGATTTTATTTTTCCATGAATCATCTCCAGTCTGGCAAACATATATTTTGTGCTACATCTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136431 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACCTGTCCAACTTCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTCCAGATATATATACTATAATTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTACCATGAATCATCTTCAATCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136432 : aaATGAGTCATCTTAACTCTTAACTTGTCCAACTC---AAGCAAGAATTATAGTGATTCAGTTCCAGATATATAT--TATATTTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCACATATTTTGTACTACAACTCCAGTCAATTTCAATATCTCCAGTTC
gi|136433 : aaATGGGTCATTTAAACTCTTAACTAGTCCAACTCCTAAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCTTGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTATAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136434 : aaATGAGTCACCTGAACTC-------ATCCAACTCCTTAAGCATGAATTTCAATGATTCAGCTCCAGATATATAT--AATGTTTTAAATT-AAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCGATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136435 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCCCAAGCAAGAATTCCAACAATTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCAATCATATACTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136436 : AACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACAATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTC-AACTCCAGCTTTTGTTTTTCCATGAATC
gi|136437 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136438 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136439 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136440 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136441 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136442 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136443 : TACAACTCCAGCCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136444 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCTAGTTC
gi|136445 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAATTC
blockSeqs : AC A
blockSeqs : . A
blockSeqs : . G
blockSeqs : . A
blockSeqs : . G
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
finalCons : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 55 4
lowQualScore : .. .
lowQualScore : 55 8
consensus : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
Reference ( family-847 ) : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136427 : ATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATCTCAACGTTTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCACTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAAGTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136428 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAATAT--TATGTTTTAACTTCAAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCCTCTTCAGTCTGGCAGTCATATATTTTGTGCTACAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136429 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTTAAGCAGGAATTTCAACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTCAAA-TCCAGATTTTGTTTTTTCGTGAATCATCTCCAGTCTGGAAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCGATTTTAACATCTCGAGTTC
gi|136430 : aaATGGGTCATCTGAACTCCTAACTTGTCCAATTCCTCAAGCAAGAATTTCGACGATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAATTTC-AACTCCAGATTTTATTTTTCCATGAATCATCTCCAGTCTGGCAAACATATATTTTGTGCTACATCTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136431 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACCTGTCCAACTTCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTCCAGATATATATACTATAATTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTACCATGAATCATCTTCAATCTGGCAATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136432 : aaATGAGTCATCTTAACTCTTAACTTGTCCAACTC---AAGCAAGAATTATAGTGATTCAGTTCCAGATATATAT--TATATTTTAACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCACATATTTTGTACTACAACTCCAGTCAATTTCAATATCTCCAGTTC
gi|136433 : aaATGGGTCATTTAAACTCTTAACTAGTCCAACTCCTAAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTCCAGATAAACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCTTGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTTGTGCTATAACTCCATTAAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136434 : aaATGAGTCACCTGAACTC-------ATCCAACTCCTTAAGCATGAATTTCAATGATTCAGCTCCAGATATATAT--AATGTTTTAAATT-AAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCGATCATATATTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136435 : aaATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCCCAAGCAAGAATTCCAACAATTCAGCTCCAGATATACAT--TATGTTTTAACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATTTTCAGTCTGGCAATCATATACTTTGTGCTACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136436 : AACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACAATTCAGCTCCAGATATATAT--TATGTTTTAACTTC-AACTCCAGCTTTTGTTTTTCCATGAATC
gi|136437 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136438 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136439 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136440 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136441 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136442 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136443 : TACAACTCCAGCCAATTTTAATATCTCCAGTTC
gi|136444 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCTAGTTC
gi|136445 : TACAACTCCAGTCAATTTTAATATCTCCAATTC