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lowQualScore                  :            .    ..  .           ..    ..... ..  .    .            .. .    . .                       .       .  .   . ....             .             ..  ..    ..       .  .   . .       ............           .     .     ...               .        .       .      .                 .      .     .    
lowQualScore                  :            0    22  3           99    11111 55  0    2            99 6    6 2                       7       1  3   8 5555             1             66  99    22       0  6   2 6       333333333333           5     4     777               2        7       7      7                 5      1     9    
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Reference ( gi|15227 )        : TTTATTGTCTCCAACA--CATTATACATCACA--TCAA-----A--AC-GTTTTACCTACGTTTTT--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCTAT-AATAA---GCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCTAGATTCTAAAATGGTGG-ATGTA-GTAAACAGCTGGTTCATCTGATTCATGCCTACGGATTATAGACAGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGTGTGCGGTTTATAATTGG
gi|15226                      : TTTATTGTCTCTAACA--CACTATACATCACA--TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTTT--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCAT-AATAA---GCCAATCAAAATTCATATTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG-ATGTA-GTAAACAGCTGG-------G--TCATGCCTGCGGATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTAATAAATCC-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCAGTTTATAATTAG
gi|15228                      : TTTATTGTCTCTAACT--CATTATACATCACA--ACAT-----A--AC-GTTTCACCTACGTTTTT--A-CAAAGTTATGCAGTACACCAGTCTATATTTCATTACTACAT-AATTA---GCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGT--TCCGGATTC-AAAATGGCGG-ATGTA-GTAAACAACTGATTCATTTGATTCATGCCTGCAGATTATAGAGGTATACTAGCCTTTTTTGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGTGGATTATACTTGAGTGCAGTGTATA
gi|15224                      : TTTATTGTCTCTAACA--CACAATATATCACA--TCAA-----A--AC-GTCTAACCTACATTTTTT-A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGCAACTCCATAAATAA----CCAATCAAAATTCGTCTTTCACTTTGG--TCTTGATTTCAAAATGGCAG-ATGAA-GTAA----------CGACTGATTCATGCCTGCGGGTTTTAGACATATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGTTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATA-TCAAGTGCGGATTATACTTGG
gi|15225                      : TTTATTGTCTCTAACA--CACTATATATCGCT--TCAA-----A--AC-GTTTAATCTACATTTTTT-A-CAAAATCAAGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGTTACTCCATAAATAA----CCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCAG-ATGCA-GTAAACAA---------CTGATTCATGCCTGCGGATAATAATTGTATACTAGTTTTTTTCCACTAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-ACTGTGTGTTATACTCGAGTGCGGGTTATACTTAG
gi|15229                      : TTTATTGCCTTTAATATACAACACACATAAAAAATTAC-----A--AC-ATTTAATATATGTTTTT--A-CAAAATTATACAGTACTCCAATCTAGATTTTGAAACTTGAT-AGCCA---GCCAATCAATATTTGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGACTTCAAGATCGCAGCACAT--GTAAACATCCAATT--------TTACGCCT---GAGTA-------ATACAAGCTTTTTTCCACCTGTTT-GGCTTCA-AATTCAGCCTGCAGATTATACTCG
gi|15230                      :   TATTGTCTCTAACA--CGCTATATATTACA--TTTATATATATTAC-GTTTTACCTACGTTTT---A-CAAAGTTATGCAATACACCAGTCTAGATTACGTTACTCCAT-AGTTA---GCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCGG-ATGTA-GTAAACAG---------CTAATACATGCCTGCGTATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCAACCATTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGGGGATTATACTCGGGTGCGGTTTATAATTGGgg
gi|15231                      :                      TATATATCACA--TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTTTG-A-CAAAATTATGCAGCACACCAGTCTAGATTGTGTTACTCCATAAATAA----CCAATCAAAATTGATCTTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCAG-AAAAA-GTAAACAA---------CTGATTCATGTCTACAGATAATAGATGTATACTAGCTTTATTCTACTAGTTTTGACTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCAGATTATACTTGG
gi|15232                      :                                A--CCAA-----A--ATTGTTTCTGATACATTTTT--A-CAAAATTATCCAGAACACCAGTCTAA--CTCGTTA-------GAT-A---GCCAATCACAATACGTCTTTCGCTTAGAATTTTGGACTTCAAAACGG
gi|15233                      :                                       -----A--AT-GTTTCACATGTGTTTTTTTA-CAAAAT--TGCA---CACTGGTCTATATATTGTAACTCAAC-AACTG---GCCAATCTAAATTCGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGATTTCAAACTAGTca
gi|15234                      :                                             --AT-GTTTTATATACATTTT---A-CAAAATAATACAGTAC--CAGTCTAGATTTTGTAATT---T-AACAACTTGCAGATAAAAATTT-TCTTGC-TTTTG---------CTCCAAAATGGTGG-CAGCATGCAAATAACTGATT--------TCAAGCCTGCTTGTCATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTGGGTTATACaaaaattatatgtcagctg
gi|15235                      :                                                     TTACCTACATTTTT--TTCAACATTATGCAGTACACCAGTGTAGATTTTGTTACTCAATAAATAA----CCAATCAAAATTCACCTTTGACTT
gi|15236                      :                                                                                              TAAAATTTGTTACTCCAT-AATTA---GCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCGGATGTCAAAATGGCAG-ATGTA-GTTAACAACTGATTCATCTGATTCATGCCTGCAGATTATGAACGGATATTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTTA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCGGTTTATAcaggggtttca
gi|15237                      :                                                                                                                                         CTGTCACTTTGG--TCAGGATTTCAAAATGGGGG-ATGAG-GTAACCAACTG---------AATCATGCCTGCAGATAATAGACGTATACTTACTTGTTTCCACCAATTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATAATACGCGAGTGTGGATTATACTTGG
gi|15238                      :                                                                                                                                                          AGATTTCAAAATGGTGG-ATGAA-GTAAACAACTG---------ATTCATGCCTGTGGATAATAGTCGTAACCTAGCTTTTTTCAATCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCAGATCATTCTTGAGTGCGGATTATACTTGG
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gi|15241                      :                                                                                                                                                                                                                  GGATAATAGTCGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGAGTGTAGATTATACTTG
gi|15242                      :                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGCGGGTTATACTCAATTGTGGCTTATATTT





Alignments
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lowQualScore                  :                               11111    00000 55  3    1           3333 3                                      0    66               3      1      33   1                555   2 3       1111111111111                0     0 2               1        8       2      0                        1          
lowQualScore                  :                               .....    ..... ..  .    .           .... .                                      .    ..               .      .      ..   .                ...   . .       .............                .     . .               .        .       .      .                        .          
lowQualScore                  :                               11111    00000 00  6    0           8888 3                                      8    55               7      4      99   1                888   2 3       7777777777777                7     5 2               9        5       5      0                        0          
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Reference ( family-835 )      : TTTATTGTCTCTAACACACTATACATCACA-----TCAA-----A--AC-GTTTNACCTACGTTTT-T--A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCATAATNAGCCAATCAAAATTCGTCTTTCGCTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG---ATGNA-GTAAACAACTGA-----CTGATTCATGCCTGCGGATTATAGACGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCGGNTTATACTTGG
gi|15224                      : TTTATTGTCTCTAACACACAATATATCACA-----TCAA-----A--AC-GTCTAACCTACATTTTTT--A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGCAACTCCATAAATAACCAATCAAAATTCGTCTTTCACTTTGG--TCTTGATTTCAAAATGGCAG---ATGAA-GTAA-----CGA-----CTGATTCATGCCTGCGGGTTTTAGACATATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGTTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATA-TCAAGTGCGGATTATACTTGG
gi|15225                      : TTTATTGTCTCTAACACACTATATATCGCT-----TCAA-----A--AC-GTTTAATCTACATTTTTT--A-CAAAATCAAGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGTTACTCCATAAATAACCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCAG---ATGCA-GTAAACA----A-----CTGATTCATGCCTGCGGATAATAATTGTATACTAGTTTTTTTCCACTAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-ACTGTGTGTTATACTCGAGTGCGGGTTATACTTAG
gi|15226                      : TTTATTGTCTCTAACACACTATACATCACA-----TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCATAATAAGCCAATCAAAATTCATATTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACAGCTGG-------G--TCATGCCTGCGGATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTAATAAATCC-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCAGTTTATAATTAG
gi|15227                      : TTTATTGTCTCCAACACATTATACATCACA-----TCAA-----A--AC-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCTATAATAAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCTAGATTCTAAAATGGTGG---ATGTA-GTAAACAGCTGGTTCATCTGATTCATGCCTACGGATTATAGACAGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGTGTGCGGTTTATAATTGG
gi|15228                      : TTTATTGTCTCTAACTCATTATACATCACA-----ACAT-----A--AC-GTTTCACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTTATGCAGTACACCAGTCTATATTTCATTACTACATAATTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGT--TCCGGA-TTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACAACTGATTCATTTGATTCATGCCTGCAGATTATAGAGGTATACTAGCCTTTTTTGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGTGGATTATACTTGAGTGCAGTGTATA
gi|15229                      : TTTATTGCCTTTAATATACAACACA-CATAAAAAATTAC-----A--AC-ATTTAATATATGTTTT-T--A-CAAAATTATACAGTACTCCAATCTAGATTTTGAAACTTGATAGCCAGCCAATCAATATTTGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGACTTCAAGATCGCAGCACAT----GTAAACATCCAA-----T---TTTACGCCTGAG---TA-------ATACAAGCTTTTTTCCACCTGTTT-GGCTTCA-AATTCAGCCTGCAGATTATACTCGGG
gi|15230                      :   TATTGTCTCTAACACGCTATATATTACA-----TTTATATATATTAC-GTTTTACCTACGTTTT----A-CAAAGTTATGCAATACACCAGTCTAGATTACGTTACTCCATAGTTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACA----G-----CTAATACATGCCTGCGTATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCAACCATTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGGGGATTATACTCGGGTGCGGTTTATAATTGG
gi|15231                      :                    TATATATCACA-----TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTT-TG-A-CAAAATTATGCAGCACACCAGTCTAGATTGTGTTACTCCATAAATAACCAATCAAAATTGATCTTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCAG---AAAAA-GTAAACA----A-----CTGATTCATGTCTACAGATAATAGATGTATACTAGCTTTATTCTACTAGTTTTGACTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCAGATTATACTTGG
gi|15232                      :                              A-----CCAA-----A--ATTGTTTCTGATACATTTT-T--A-CAAAATTATCCAGAACACCAGTCTAA--CTCGTTA------GAT-AGCCAATCACAATACGTCTTTCGCTTAGAATTTTGGACTTCAAAACGGC
gi|15233                      :                                        -----A--AT-GTTTCACATGTGTTTT-TTTA-CAAAATT-----GCACACTGGTCTATATATTGTAACTCAACAACTGGCCAATCTAAATTCGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGATTTCAAAa
gi|15234                      :                                              --AT-GTTTTATATACATTTT----A-CAAAATAATACAGTAC--CAGTCTAGATTTTGTAATTTAACAACTTGCAGATAAAAATTT-TCTT--GCTTTTG--CTC------CAAAATGGTGG---CAGCATGCAAATAACTGA-----TT---TCAAGCCTGCTTGTCATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTGGGTTATACctagtaaaaattatatgtcagctg
gi|15235                      :                                                      TTACCTACATTTT-T--TTCAACATTATGCAGTACACCAGTGTAGATTTTGTTACTCAATAAATAACCAATCAAAATTCACCTTTGACTTCAG-----GGGTTTCA
gi|15236                      :                                                                                                TAAAATTTGTTACTCCATAATTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCGGATGTCAAAATGGCAG---ATGTA-GTTAACAACTGATTCATCTGATTCATGCCTGCAGATTATGAACGGATATTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTTA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCGGTTTATA
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gi|15238                      :                                                                                                                                                         GATTTCAAAATGGTGG---ATGAA-GTAAACAACTG---------ATTCATGCCTGTGGATAATAGTCGTAACCTAGCTTTTTTCAATCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCAGATCATTCTTGAGTGCGGATTATACTTGG
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gi|15240                      :                                                                                                                                                                                                     cacTCA-GCCTGTTGGTTATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTTGGTTATAC
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Alignments
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lowQualScore                  :                               11111    00000 00  6    2           8888 3                              8  8    8    0                7      4      99   1                888   2 3       7777777777777                7     5 2               9        5       5      0                        0          
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Reference ( family-835 )      : TTTATTGTCTCTAACACACTATACATCACA-----TCAA-----A--AC-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCATAANTAGCCAATCAAAATTCGTCTTTCGCTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG---ATGNA-GTAAACAACTGA-----CTGATTCATGCCTGCGGATTATAGACGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCGGNTTATACTTGG
gi|15224                      : TTTATTGTCTCTAACACACAATATATCACA-----TCAA-----A--AC-GTCTAACCTACATTTTTT--A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGCAACTCCATAAATAACCAATCAAAATTCGTCTTTCACTTTGG--TCTTGATTTCAAAATGGCAG---ATGAA-GTAA-----CGA-----CTGATTCATGCCTGCGGGTTTTAGACATATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGTTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATA-TCAAGTGCGGATTATACTTGG
gi|15225                      : TTTATTGTCTCTAACACACTATATATCGCT-----TCAA-----A--AC-GTTTAATCTACATTTTTT--A-CAAAATCAAGCAGTACACCAGTCTAGATTTTGTTACTCCATAAATAACCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCAG---ATGCA-GTAAACA----A-----CTGATTCATGCCTGCGGATAATAATTGTATACTAGTTTTTTTCCACTAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-ACTGTGTGTTATACTCGAGTGCGGGTTATACTTAG
gi|15226                      : TTTATTGTCTCTAACACACTATACATCACA-----TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCATAATAAGCCAATCAAAATTCATATTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACAGCTGG-------G--TCATGCCTGCGGATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTAATAAATCC-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCAGTTTATAATTAG
gi|15227                      : TTTATTGTCTCCAACACATTATACATCACA-----TCAA-----A--AC-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTAATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCTATAATAAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCTAGATTCTAAAATGGTGG---ATGTA-GTAAACAGCTGGTTCATCTGATTCATGCCTACGGATTATAGACAGATACTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGTGTGCGGTTTATAATTGG
gi|15228                      : TTTATTGTCTCTAACTCATTATACATCACA-----ACAT-----A--AC-GTTTCACCTACGTTTT-T--A-CAAAGTTATGCAGTACACCAGTCTATATTTCATTACTACATAATTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGT--TCCGGA-TTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACAACTGATTCATTTGATTCATGCCTGCAGATTATAGAGGTATACTAGCCTTTTTTGACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGTGGATTATACTTGAGTGCAGTGTATA
gi|15229                      : TTTATTGCCTTTAATATACAACACA-CATAAAAAATTAC-----A--AC-ATTTAATATATGTTTT-T--A-CAAAATTATACAGTACTCCAATCTAGATTTTGAAACTTGATAGCCAGCCAATCAATATTTGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGACTTCAAGATCGCAGCACAT----GTAAACATCCAA-----T---TTTACGCCTGAG---TA-------ATACAAGCTTTTTTCCACCTGTTT-GGCTTCA-AATTCAGCCTGCAGATTATACTCGGG
gi|15230                      :   TATTGTCTCTAACACGCTATATATTACA-----TTTATATATATTAC-GTTTTACCTACGTTTT----A-CAAAGTTATGCAATACACCAGTCTAGATTACGTTACTCCATAGTTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCAGATTTCAAAATGGCGG---ATGTA-GTAAACA----G-----CTAATACATGCCTGCGTATTATGGACGGATACTAGCTTTTTTCAACCATTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGGGGATTATACTCGGGTGCGGTTTATAATTGG
gi|15231                      :                    TATATATCACA-----TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTT-TG-A-CAAAATTATGCAGCACACCAGTCTAGATTGTGTTACTCCATAAATAACCAATCAAAATTGATCTTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCAG---AAAAA-GTAAACA----A-----CTGATTCATGTCTACAGATAATAGATGTATACTAGCTTTATTCTACTAGTTTTGACTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCAGATTATACTTGG
gi|15232                      :                              A-----CCAA-----A--ATTGTTTCTGATACATTTT-T--A-CAAAATTATCCAGAACACCAGTCTA---------ACTCGTTAGATAGCCAATCACAATACGTCTTTCGCTTAGAATTTTGGACTTCAAAACGGC
gi|15233                      :                                        -----A--AT-GTTTCACATGTGTTTT-TTTA-CAAAATT-----GCACACTGGTCTATATATTGTAACTCAACAACTGGCCAATCTAAATTCGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGATTTCAAAa
gi|15234                      :                                              --AT-GTTTTATATACATTTT----A-CAAAATAATACAGTAC--CAGTCTAGATTTTGTAATTTAACAACTTGCAGATAAAAATTT-TCTT--GCTTTTG--CTC------CAAAATGGTGG---CAGCATGCAAATAACTGA-----TT---TCAAGCCTGCTTGTCATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTGGGTTATACctagtaaaaattatatgtcagctg
gi|15235                      :                                                      TTACCTACATTTT-T--TTCAACATTATGCAGTACACCAGTGTAGATTTTGTTACTCAATAAATAACCAATCAAAATTCACCTTTGACTTCAG-----GGGTTTCA
gi|15236                      :                                                                                                TAAAATTTGTTACTCCATAATTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCGGATGTCAAAATGGCAG---ATGTA-GTTAACAACTGATTCATCTGATTCATGCCTGCAGATTATGAACGGATATTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTTA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCGGTTTATA
gi|15237                      :                                                                                                                                       CTGTCACTTTGG--TCAGGATTTCAAAATGGGGG---ATGAG-GTAACCAACTGA--------AT-CATGCCTGCAGATAATAGACGTATACTTACTTGTTTCCACCAATTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATAATACGCGAGTGTGGATTATACTTGG
gi|15238                      :                                                                                                                                                         GATTTCAAAATGGTGG---ATGAA-GTAAACAACTG---------ATTCATGCCTGTGGATAATAGTCGTAACCTAGCTTTTTTCAATCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCAGATCATTCTTGAGTGCGGATTATACTTGG
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gi|15240                      :                                                                                                                                                                                                     cacTCA-GCCTGTTGGTTATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTTGGTTATAC
gi|15241                      :                                                                                                                                                                                                                  GGATAATAGTCGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGAGTGTAGATTATACTTG
gi|15242                      :                                                                                                                                                                                                                                          TTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGCGGGTTATACTCAATTGTGGCTTATATTT


blockSeqs                     :                               AAAAA    TATAT TT  T    A           TTT  T                              T            A                A      A      AT   A                CAC   C T       GCTGGTTCATCTG                        T               C        T       T      G                        G
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blockSeqs                     :                               .        .     .   .    T           TG   .                              C            T                A      A      .    A                .     T .       ACTGATTCATCTG                        G               G        C       .      G                        T
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Reference ( family-835 )      : TTTATTGTCTCTAACACACTATACATCACA-----TCAA-----A--AC-GTTTTACCTACGTTTT-T--A-CAAAATTATGCAGTACACCAGTCTAGATTTCGTTACTCCATAANTAGCCAATCAAAATTCGTCTTTCGCTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCGG---ATGNA-GTAAACAACTGA------T------GATTCATGCCTGCGGATTATAGACGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCGGNTTATACTTGG
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gi|15231                      :                    TATATATCACA-----TCAA-----A--AT-GTTTTACCTACGTTTT-TG-A-CAAAATTATGCAGCACACCAGTCTAGATTGTGTTACTCCATAAATAACCAATCAAAATTGATCTTTCACTTTGG--TCCGGATTTCAAAATGGCAG---AAAAA-GTAAACAAC---------T------GATTCATGTCTACAGATAATAGATGTATACTAGCTTTATTCTACTAGTTTTGACTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTCGAGTGCAGATTATACTTGG
gi|15232                      :                              A-----CCAA-----A--ATTGTTTCTGATACATTTT-T--A-CAAAATTATCCAGAACACCAGTCTA---------ACTCGTTAGATAGCCAATCACAATACGTCTTTCGCTTAGAATTTTGGACTTCAAAACGGC
gi|15233                      :                                        -----A--AT-GTTTCACATGTGTTTT-TTTA-CAAAATT-----GCACACTGGTCTATATATTGTAACTCAACAACTGGCCAATCTAAATTCGTCTTTTGCTTTTG--CCCAGATTTCAAAa
gi|15234                      :                                              --AT-GTTTTATATACATTTT----A-CAAAATAATACAGTAC--CAGTCTAGATTTTGTAATTTAACAACTTGCAGATAAAAATTT-TCTT--GCTTTTG--CTC------CAAAATGGTGG---CAGCATGCAAATAACTGA------T--------TTCAAGCCTGCTTGTCATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTGGGTTATACctagtaaaaattatatgtcagctg
gi|15235                      :                                                      TTACCTACATTTT-T--TTCAACATTATGCAGTACACCAGTGTAGATTTTGTTACTCAATAAATAACCAATCAAAATTCACCTTTGACTTCAG-----GGGTTTCA
gi|15236                      :                                                                                                TAAAATTTGTTACTCCATAATTAGCCAATCAAAATTCATCTTTCACTTTGG--TCCGGATGTCAAAATGGCAG---ATGTA-GTTAACAACTGA------TTCATCTGATTCATGCCTGCAGATTATGAACGGATATTAGCTTTTTTCGACCAGTTTCGGCTTTA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGGGTGCGGTTTATA
gi|15237                      :                                                                                                                                       CTGTCACTTTGG--TCAGGATTTCAAAATGGGGG---ATGAG-GTAACCAACTGA--------------AT-CATGCCTGCAGATAATAGACGTATACTTACTTGTTTCCACCAATTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATAATACGCGAGTGTGGATTATACTTGG
gi|15238                      :                                                                                                                                                         GATTTCAAAATGGTGG---ATGAA-GTAAACAACTGA------T---------TCATGCCTGTGGATAATAGTCGTAACCTAGCTTTTTTCAATCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCAGATCATTCTTGAGTGCGGATTATACTTGG
gi|15239                      :                                                                                                                                                                                             a------T------GATTCATGCCTGCGGTTTATAGAGGTATACTAGCTTTTTTCAACCAGTTTCGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTCAGTGCGGTTCATA
gi|15240                      :                                                                                                                                                                                                          caccTCA-GCCTGTTGGTTATACAAAGATACAAGCCTATTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGTTGGTTATAC
gi|15241                      :                                                                                                                                                                                                                        GGATAATAGTCGTATACTAGCTTTTTTCCACCAGTTTTGGCTTCA-AAATCA-CCTGCGGATTATACTTGAGTGTAGATTATACTTG
gi|15242                      :                                                                                                                                                                                                                                                TTTCCACCAGTTT-GGTTTCA-AAATCAGCCTGCGGGTTATACTCAATTGTGGCTTATATTT