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gi|28635                      : tttatttTGTTTTTTA-GCAAAT-A--AATATCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATATCACAGCCTTCAATTAAAACCACTTAGTGCTATATAGGTGGCATTGGATGTATGTGTATGCACCGTGTACTAGTTTCAAAACACAACTTGGCATAATTTAGATCTTGGTTGGTTCAATATTCTTTGC-TTTT-GTT-ATTACATAATTAAGTAGGAACCAAACTCCTACATTTGAAAACATATTCCAGTATTTTCTGTAT-----CTA-----CGTTTTGGTAAATGACTGTTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCCAAAACTGATGTTGAAATGTTTTAAACGGACATGAAAACAATATCCA--------------------CATTTATTTTCATCA---TCATCATCA---GCATCAATAATCATGTTATCATTTTCCCCATCTGTGCCTCAATTTTTGTCCTGATTGCCATCTGACAATAAATATTCCTGCAAGTATGTTCTGTTTCTAACTATAGTTATTTTCATCAACATTAATTGACCAGTCTGGTGTAACTAAATGATCCTCAAAATCACA--CATTA-----TAATCAAATAAATGGAATA
gi|28636                      :      ttTGTGTTTTA-GCAAATGA--A-TGTCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATGTCACAGCCTTCAATTAAAAACACTTAGTGCTATATAGGTGGCCTTAGATGTTTCTGTATAAACCATGTACTAGGTTCAAAACACAACTTGGCATAATTTAGATC----TTGNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNN-----NNNNNNNNNN---GACTGTTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCCAAAACTGATGTTGAAATA-----AACGGACATGAAAACAATATCCATAACTGTTCTACAGGAAT-GTATTTATTTTCATG---GTCATCATCA---ACATC-ATAATCACGTCATCATTTTCCCCATCTGTGCTTCTATTTT-GTCCTCACTGCTATCTGACAATAAATATTCCT----TTATGTTCTGTGTCTAACTATAGTTATTTTCATCAACATTAATTGACCAGT
gi|28637                      :      ttTGTGTTTTA-GCAAATGA--A-TGTCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATGTCACAGCCTTCAATTAAAAACACTTAGTGCTATATAGGTGGCCTTGGATGTTTGTGTATGAACCATGTACTAGGTTCAAAACAAAACTTAGCATAATTTAGGTCTTGGTTGGTTTAATATTCTTTGCTTTTT-TTTTCTAACATAATGAAGTAGGAACCGAACTCCTACATTTGAAAACATATTTCAGTATTGTCTGTAT-----CTA-----CGTTTTGGTAAATGACTGTTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCCAAAACGGA
gi|28638                      :          ttTTTTAAGCAAA-----AATGCCATTTTATTGTTTATACATTTCTTATATCAAAGCCTTAAATTTAAAACGCTTAGTGTTATTTAGGTGACCTTTGAGGTTTGTATATGAACCATGTACTAGGTTTAAA----------GCATAATTTAGATCTTGGTTGGTTCAACATTCTTCGT-TTTT-TTTTCTTATATAATTGAGAAGAAGCCAAACTCCTACATTTGAAAAAATATTCCAGTATTTTCTGTAT-----CTA-----CATTTT------TGG-TGTTTTTTTTATGAGGAAATGAACATTCACCTAGCCGAAACTGATGTTGAGTTGTTATAAACAGACATGAAAACAACATCCATAACTGTTCTACAGGAAT-GTATTTATTTTCATCATC------ATCA---TCATC-AT--------------TTTCCCTTTCTGTGCCTCAATATTT-TCCTGATTTCCATGTGA
gi|28639                      :    tttgatttTTTTA-GCAAAT-A--CATGTCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATATCACAGCCTTCAATTTAAAACA----ATGCTATATAGGTGGCCTTGAAGGTTTATGTATGAACCATGTACTAGGTTCAAAACACAACCTGGCATAATTTAGATCTTGATTGGTTCAATATTCTTTGC--ATT-TTTTCTTACGTAGTTAAG
gi|28640                      : tttgtttTGTGTTTTA-GCAAATGA--AATGTCATTTTATTGTTTATACAGTT
gi|28641                      :      ttTGTGTTTTA-GCAAATGA--AATGTCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATGTCACAGCCTTCAATTAAAAACACTTAGTGCTATATAGGTGGCCTTGGGTGTTTGTGTATGAACCATGTACTAGGTTCAGAACACAAATTGGCATAATTTAGATCTTGGTTGGTTTAATATTCTTTGC-TTTT-TTTTCTTACATAATGAAGTAGGAACCAAACTCCTACATTTGAAAACATATTCCAATATTGTCTGTAT-----CTA-----CGTTTTGGTAAATGACTGTTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCAAAAACTGATGTTGAAATGTTATTAACGGACATG-AAACAATATCCATAATTGTTCTACAGGAAT-GTATTTATTTTCATCATCATCATCATCA---GCATC-ATAATCACTTCCCCACTTTCCCCATCTGTGCCTCAATTTTTGTCCTGAATGCCATCTGACAATAAATATTCCT----TTAAGTTCTGTGTCTAACTATAGTTATTTTCATCAACATTAATTGACCAGTCTGGTGAAACTAAATGAT-CTTGAAATCACAATCATTA-----TAATCAAATAAATGAAATA
gi|28642                      :            TTTTAAGCAAAT-A--AATGTCATTTTATTGTTTTTACAGTTCTTATATCACAGCCTTCAATGAAAACCACTTAGTGCTATATAGGCGGCATTGGATGTTTGTGTATGAACCATGAACTAGGTTCAAA-CACAACTTGGCATGATTTAGATCTTGGTTGATTCAATATTCTTTGC-TTTT-TTTTCTTACATAATTAAGTAGGAACCAAACTCCTACATTTGAAAACAAATTCCAGTATTTTCTGTAT-----CTAGCCTACATTTTGGTAAATGACTGGTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCCAAAACTGATGTTGTAATGTTATTAACGGACATGAAA-CAATATCCATAACTGTTCTACAGGAAT-GTATTTATTTTCATCAT------CATCA---GCATC-ATAATCACTTCCCCACTTTCCCCATCTGTGCCCCAATTTTTGTCCTGAATGCCATCTGACAATAAAAATTCCT----TTAAGTTCTGTGTCTAACTATAGTTATTTTCATCAACATTAATTGACCAGTCTGGTGTAACTAAATGAT-CTTGAAATCACACTCATTA-----TAATCAAATAAATGAAATA
gi|28643                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTGTCTAACTACAGTTATTTTCATCAACATTTATTGACCAGTCTGGTGTAACTAAATGAT-CTTGAAATCACACTCATTA-----TAATCAAATAAATGAAATA


blockSeqs                     :                 A      G CA A                                                                                                                                                             TT   T   T                                                       G       CTAGC   GCCTA                                                                      TTATT          A                              C          T     TCA         TCA     A        T  C                        T           A                        GCAA   A                                                                 C                   TACCC
blockSeqs                     :                 A      G .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       G       .       GCCTA                                                                      TTATT          A                              .          T     TCA         .       A        T  C                        T           A                        GCAA   A                                                                 C                   .    
blockSeqs                     :                 A      G .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       T       .       .                                                                          TTATT          A                              .          T     TCA         .       .        T  C                        T           A                        .      A                                                                 T                   .    
blockSeqs                     :                 A      C .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       T       .       .                                                                          TTATT          A                              .          T     TCG         .       .        T  C                        T           A                        .      A                                                                 C                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             A    .   T                                                       T       .       .                                                                          TTATA          A                              .          T     TGG         .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 C                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       G       .       .                                                                          TTATA          A                              .          T     TCG         .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 C                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             T    .   N                                                       T       .       .                                                                          TTTTA          A                              .          T     TCA         .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 C                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       T       .       .                                                                          TTATA          A                              .          T     TCG         .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       G       .       .                                                                          TTATT          A                              .          T     TCA         .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      G .  A                                                                                                                                                             N    .   T                                                       T       .       .                                                                          TTATT          A                              .          T     TC          .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      . .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       T       .       .                                                                          .              A                              .          T     G           .       .        G  A                        T           T                        .      T                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      . .  A                                                                                                                                                             T    .   T                                                       N       .       .                                                                          .              A                              .          .     T           .       .        G  A                        .           C                        .      T                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                             T    .   .                                                       G       .       .                                                                          .              .                              .          .     .           .       .        T  C                        .           T                        .      A                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                             .    .   .                                                       T       .       .                                                                          .              .                              .          .     .           .       .        T  C                        .           A                        .      A                                                                 .                   .    
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                             .    .   .                                                       G       .       .                                                                          .              .                              .          .     .           .       .        .  .                        .           A                                                                                                                          
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                             .    .   .                                                       T       .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                             .    .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                 .      . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :        
originalCons                  :        TGTGTTTTA-GCAAATGA--AATGTCATTTTATTGTTTATACAGTTCTTATGTCACAGCCTTCAATTAAAAACACTTAGTGCTATATAGGTGGCCTTGGATGTTTGTGTATGAACCATGTACTAGGTTCAAAACACAACTTGGCATAATTTAGATCTTGGTTGGTTCAATATTCTTTGC-TTTT-TTTTCTTACATAATGAAGTAGGAACCAAACTCCTACATTTGAAAACATATTCCAGTATTTTCTGTAT-----CTA-----CGTTTTGGTAAATGACTGTTTCTTTGATTAGGAAATGAAAATTCACCTAGCCAAAACTGATGTTGAAATGTTATTAACGGACATGAAAACAATATCCATAACTGTTCTACAGGAAT-GTATTTATTTTCATCATCGTCATCATCA---GCATC-ATAATCACGTCNCCACTTTCCCCATCTGTGCCTCAATTTTTGTCCTGANTGCCATCTGACAATAAATATTCCT----TTANGTTCTGTGTCTAACTATAGTTATTTTCATCAACATTAATTGACCAGTCTGGTGTAACTAAATGATCCTCGAAATCACACTCATTA-----TAATCAAATAAATGAAATA
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