lowQualScore                  :       1     1                                                                                1                   
lowQualScore                  :       1     5                  555     3               2      2                              3 2     2           
lowQualScore                  :       .     .                  ...     .               .      .                              . .     .           
lowQualScore                  :       8     0                  000     1               7      2                              2 4     4           
consensus                     :  ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
Reference ( gi|143489 )       :  ATTTAAAGGAACATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143490                     :  ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTAATGAA-AGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAGCTTAT
gi|143493                     :  ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTAAATTTTCGATAAA-
gi|143491                     :   TTTAA--GAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAGTATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143494                     : attTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143495                     :     TATAGGGAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTTAATTTTCAATATTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAA
gi|143496                     :        AGTAAAATGGACGTTACCAAGCTT---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-AGCCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA-ATTGAATTTGT
gi|143497                     :         atAAAATGGATGTTACCTAGCTG---CAATATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-G-TGAACTTGT
gi|143498                     :           AAAATGGACGTTACCTAGCTG---TTATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA-ATTGAACTTGT
gi|143499                     :           AAAATGGATGTTACTTAGCTG---TGATAATATCTTTTCA-TTTTTGATAAA-GGCCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT----TTGAACTT
gi|143492                     :           AAAATGGAGGGTACCGAGCTG---TAATTATAAATGTTCAATTTT-GATAAA-GTCCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT--TCCA-ATTAGTATTGAA
gi|143500                     :  attaatattAAAATGGATGTTTCTTAGGTAGGACAATATCA---TTTCA--TTTTAATAAA-GGGTAGGTGGCCGAAAATTAAATTATGAGT
gi|143501                     :              ATGGACGTTACTTAGCTG---TTATAATGAAGTTTCAA-TTTTGGT-AA-GGCCAGTAGGCCGAAAATTAAA---TGAGTGA-ATTAT-TTTGAACTTgatatt
gi|143502                     :               aGGTCGTTACCTGGCTG---TAATAATAACTTTTCAATTTT-AATAAA-GGCCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA-TTTGAACTTAT
gi|143503                     :                            GCTG---TAATA--ACATTTC--GTTTTTGATCAA-GGTCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT---CTTGAACTTAT
gi|143504                     :                                     ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143505                     :                                     ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAG-TG-ATTTA-ATTGAACTTGT
gi|143506                     :                                     ATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTAT-TTTGAACTTAT
gi|143507                     :                                                     TTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143508                     :                                                                    AGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTAA-ATTAA-ATTGAACTTGT

lowQualScore                  :                               444     2               2      2                                4     2           
lowQualScore                  :                               ...     .               .      .                                .     .           
lowQualScore                  :                               777     4               1      1                                2     2           
consensus                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
Reference ( family-826 )      : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143489                     : ATTTAAAGGAACATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143490                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTAATGAA-AGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAGCTTAT
gi|143491                     : ATTTTTAAGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAGTATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143492                     : ATTAATATTAAAATGGAGGGTACCGAGCTG---TAATTATAAATGTTCAATTTT-GATAAA-GTCCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT--TCCA-ATTAGTATTGAA
gi|143493                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTAAATTTTCGATAAA-
gi|143494                     :   TTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143495                     :    TATAGGGAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTTAATTTTCAATATTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAA
gi|143496                     :     ATAGTAAAATGGACGTTACCAAGCTT---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-AGCCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA-ATTGAATTTGT
gi|143497                     :          AAAATGGATGTTACCTAGCTG---CAATATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-G-TGAACTTGT
gi|143498                     :          AAAATGGACGTTACCTAGCTG---TTATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA-ATTGAACTTGT
gi|143499                     :          AAAATGGATGTTACTTAGCTG---TGATAATATCTTTTCA-TTTTTGATAAA-GGCCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT----TTGAACTT
gi|143500                     :          AAAATGGATGTTTCTTAGGTAGGACAATATCA---TTTCA--TTTTAATAAA-GGGTAGGTGGCCGAAAATTAAATTATGAGTGATATT
gi|143501                     :            AATGGACGTTACTTAGCTG---TTATAATGAAGTTTCAA-TTTTGGT-AA-GGCCAGTAGGCCGAAAATTAAA---TGAGTGA-ATTAT-TTTGAACTT
gi|143502                     :               GGTCGTTACCTGGCTG---TAATAATAACTTTTCAATTTT-AATAAA-GGCCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA-TTTGAACTTAT
gi|143503                     :                           GCTG---TAATA--ACATTTC--GTTTTTGATCAA-GGTCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT---CTTGAACTTAT
gi|143504                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143505                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTG--ATTTA-ATTGAACTTGT
gi|143506                     :                                    ATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTAT-TTTGAACTTAT
gi|143507                     :                                                    TTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143508                     :                                                                   AGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTAA-ATTAA-ATTGAACTTGT

lowQualScore                  :                               444     2               2      2                                4     2           
lowQualScore                  :                               ...     .               .      .                                .     .           
lowQualScore                  :                               777     4               1      1                                2     2           
consensus                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
Reference ( family-826 )      : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143489                     : ATTTAAAGGAACATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143490                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTAATGAA-AGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAGCTTAT
gi|143491                     : ATTTTTAAGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAGTATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143492                     : ATTAATATTAAAATGGAGGGTACCGAGCTG---TAATTATAAATGTTCAATTTT-GATAAA-GTCCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT--TCCA-ATTAGTATTGAA
gi|143493                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTAAATTTTCGATAAA-
gi|143494                     :   TTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143495                     :    TATAGGGAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTTAATTTTCAATATTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAA
gi|143496                     :     ATAGTAAAATGGACGTTACCAAGCTT---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-AGCCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA-ATTGAATTTGT
gi|143497                     :          AAAATGGATGTTACCTAGCTG---CAATATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-G-TGAACTTGT
gi|143498                     :          AAAATGGACGTTACCTAGCTG---TTATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA-ATTGAACTTGT
gi|143499                     :          AAAATGGATGTTACTTAGCTG---TGATAATATCTTTTCA-TTTTTGATAAA-GGCCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT----TTGAACTT
gi|143500                     :          AAAATGGATGTTTCTTAGGTAGGACAATATCA---TTTCA--TTTTAATAAA-GGGTAGGTGGCCGAAAATTAAATTATGAGTGATATT
gi|143501                     :            AATGGACGTTACTTAGCTG---TTATAATGAAGTTTCAA-TTTTGGT-AA-GGCCAGTAGGCCGAAAATTAAA---TGAGTGA-ATTAT-TTTGAACTT
gi|143502                     :               GGTCGTTACCTGGCTG---TAATAATAACTTTTCAATTTT-AATAAA-GGCCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA-TTTGAACTTAT
gi|143503                     :                           GCTG---TAATA--ACATTTC--GTTTTTGATCAA-GGTCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT---CTTGAACTTAT
gi|143504                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143505                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTG--ATTTA-ATTGAACTTGT
gi|143506                     :                                    ATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTAT-TTTGAACTTAT
gi|143507                     :                                                    TTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143508                     :                                                                   AGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTAA-ATTAA-ATTGAACTTGT


blockSeqs                     :                               GGA     T               T      G                                T     T
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                T     .
blockSeqs                     :                               .       A               C      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       A               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       A               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       A               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       A               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                               .       T               T      .                                .     .
blockSeqs                     :                                       T               .      .                                .     .
blockSeqs                     :                                       A               .      .                                .     .
blockSeqs                     :                                       .               .      .                                .     .
blockSeqs                     :                                                       .      .                                .      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
finalCons                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT

lowQualScore                  :                               444     2               2      2                                4     2           
lowQualScore                  :                               ...     .               .      .                                .     .           
lowQualScore                  :                               777     4               1      1                                2     2           
consensus                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
Reference ( family-826 )      : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143489                     : ATTTAAAGGAACATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTTA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143490                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTAATGAA-AGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAGCTTAT
gi|143491                     : ATTTTTAAGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAGTATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTGGTCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143492                     : ATTAATATTAAAATGGAGGGTACCGAGCTG---TAATTATAAATGTTCAATTTT-GATAAA-GTCCAGGTGGCCGAAAACTAAATATT--TCCA-ATTAGTATTGAA
gi|143493                     : ATTTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTAAATTTTCGATAAA-
gi|143494                     :   TTATAGGAAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-GGCCAGGTAGCTGAAAATAAAATACTGAATGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143495                     :    TATAGGGAAATGGACGTTACCTAGCTG---CAATATTTAATTTTCAATATTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAA
gi|143496                     :     ATAGTAAAATGGACGTTACCAAGCTT---CAATATTAAATTTTCAATTTTTGATAAA-AGCCAGGTTGCCGGAAATTAAATATTATGTGA-ATTAA-ATTGAATTTGT
gi|143497                     :          AAAATGGATGTTACCTAGCTG---CAATATTCAATTTTCAATGTTTGATAAAGGGCCAGGTGGCCGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-G-TGAACTTGT
gi|143498                     :          AAAATGGACGTTACCTAGCTG---TTATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCAGGTGGTCGTAAATAAGATGGTGAGTGA-ATAAA-ATTGAACTTGT
gi|143499                     :          AAAATGGATGTTACTTAGCTG---TGATAATATCTTTTCA-TTTTTGATAAA-GGCCAGATGGCCAAAAATTAAA---TGAGTGATATT----TTGAACTT
gi|143500                     :          AAAATGGATGTTTCTTAGGTAGGACAATATCA---TTTCA--TTTTAATAAA-GGGTAGGTGGCCGAAAATTAAATTATGAGTGATATT
gi|143501                     :            AATGGACGTTACTTAGCTG---TTATAATGAAGTTTCAA-TTTTGGT-AA-GGCCAGTAGGCCGAAAATTAAA---TGAGTGA-ATTAT-TTTGAACTT
gi|143502                     :               GGTCGTTACCTGGCTG---TAATAATAACTTTTCAATTTT-AATAAA-GGCCCGATGGCCGAAAATTAAGTATTAAGTGA-ATTAA-TTTGAACTTAT
gi|143503                     :                           GCTG---TAATA--ACATTTC--GTTTTTGATCAA-GGTCAGGTGACCGAAAATTAAATATTGAGTGA-TTT---CTTGAACTTAT
gi|143504                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143505                     :                                    ATATTAAATTTTCCATTTTTGATAAA-GGCCAGGTTGCTGAAAATTAAATATTGAGTG--ATTTA-ATTGAACTTGT
gi|143506                     :                                    ATAATAATTTTTCAATTTT-GATAAA-GGCCGGGTGGCCGAAAATTAAATTATAAGTGA-ATTAT-TTTGAACTTAT
gi|143507                     :                                                    TTTTGATAAA-GGCCAGGTGGCCGAAAAATAAATATTGAGTGA-ATTAA-ATTGAACTTGT
gi|143508                     :                                                                   AGGTGGCCAAAAATTAAATATTGAGTAA-ATTAA-ATTGAACTTGT