lowQualScore                  :     2            6 2            1        5                       
lowQualScore                  :     .            . .            .        .                       
lowQualScore                  :     1            3 1            3        2                       
consensus                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
Reference ( gi|144459 )       : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144460                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCT
gi|144462                     : CCTGGGCTGGAAGGATT-T-CACCTCATGTGACCCTAACATGCCACTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144464                     : CCTGGGCTGGGAACATT-T-CACCTTATGTGACCCTAACATGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCACC
gi|144465                     : CCCGGGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACGTGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCTCC
gi|144461                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCAAACGTGCTCCTGTGACCCAAACAAGCTCC
gi|144466                     : CCTGAGCTGAAAACATT-T-CACCCCGTGTGATCCCAACATGCTCCTGTGACTCCAAAAAGCCCC
gi|144469                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGA-CCCAACATGCTCCTGACATCTGAACATGCTCC
gi|144467                     : CCTGAGATGTGAGCGTT-G-CATCTCATGTGACCCAAACATGCTTCTGTGACCCCAACAACCT
gi|144470                     : CCTGAACTCGGAGCATT-T-CACCTCAAGTGATCCCATCATGCTCTTGTGACCCAAATAATCTCC
gi|144468                     : CCTGAGCTGGCAGCATT-T-CACATCGTATGATCCCAGCATGCTCCTGTTACTCCAGTAAGCCCC
gi|144472                     : CCTAAGCTGGGAGCATA-T-CACTTTATGTGACCCTAATATGCCACTG
gi|144463                     : CCTGTGCTGGGACCGTTGT-CACCTTGTATGAGCCCAACATGCTCCTGTCGCCACAATATACTCC
gi|144473                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144471                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144475                     :  CTGAGCTGGGAGCATTGT-CACCTTTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACAATAAGCTCC
gi|144474                     :  CTGAGCTGGGAGCATTAT-CACCTCTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACATTAAGCTCC
gi|144476                     :  CTGGGCTGGGAGCATT-TTCACCCCGTGTGAGTCCAACATGCTCATTGGACCACAATAAGCTCC
gi|144477                     :    GAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGATCCCCACATGCTCCTGTGACTCCAATAAGCCCC
gi|144478                     :      GCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACATGCCACTG

lowQualScore                  :                  6 2      2     0                                
lowQualScore                  :                  . .      .     .                                
lowQualScore                  :                  0 0      9     7                                
consensus                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
Reference ( family-820 )      : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144459                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144460                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCT
gi|144461                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCAAACGTGCTCCTGTGACCCAAACAAGCTCC
gi|144462                     : CCTGGGCTGGAAGGATT-T-CACCTCATGTGACCCTAACATGCCACTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144463                     : CCTGTGCTGGGACCGTTGT-CACCTTGTATGAGCCCAACATGCTCCTGTCGCCACAATATACTCC
gi|144464                     : CCTGGGCTGGGAACATT-T-CACCTTATGTGACCCTAACATGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCACC
gi|144465                     : CCCGGGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACGTGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCTCC
gi|144466                     : CCTGAGCTGAAAACATT-T-CACCCCGTGTGATCCCAACATGCTCCTGTGACTCCAAAAAGCCCC
gi|144467                     : CCTGAGATGTGAGCGTT-G-CATCTCATGTGACCCAAACATGCTTCTGTGACCCCAACAACCT
gi|144468                     : CCTGAGCTGGCAGCATT-T-CACATCGTATGATCCCAGCATGCTCCTGTTACTCCAGTAAGCCCC
gi|144469                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGA-CCCAACATGCTCCTGACATCTGAACATGCTCC
gi|144470                     : CCTGAACTCGGAGCATT-T-CACCTCAAGTGATCCCATCATGCTCTTGTGACCCAAATAATCTCC
gi|144471                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144472                     : CCTAAGCTGGGAGCATA-T-CACTTTATGTGACCCTAATATGCCACTG
gi|144473                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144474                     :  CTGAGCTGGGAGCATTAT-CACCTCTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACATTAAGCTCC
gi|144475                     :  CTGAGCTGGGAGCATTGT-CACCTTTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACAATAAGCTCC
gi|144476                     :  CTGGGCTGGGAGCATT-TTCACCCCGTGTGAGTCCAACATGCTCATTGGACCACAATAAGCTCC
gi|144477                     :    GAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGATCCCCACATGCTCCTGTGACTCCAATAAGCCCC
gi|144478                     :     AGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACATGCCACTG

lowQualScore                  :                  6 2      2     0                                
lowQualScore                  :                  . .      .     .                                
lowQualScore                  :                  0 0      9     7                                
consensus                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
Reference ( family-820 )      : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144459                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144460                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCT
gi|144461                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCAAACGTGCTCCTGTGACCCAAACAAGCTCC
gi|144462                     : CCTGGGCTGGAAGGATT-T-CACCTCATGTGACCCTAACATGCCACTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144463                     : CCTGTGCTGGGACCGTTGT-CACCTTGTATGAGCCCAACATGCTCCTGTCGCCACAATATACTCC
gi|144464                     : CCTGGGCTGGGAACATT-T-CACCTTATGTGACCCTAACATGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCACC
gi|144465                     : CCCGGGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACGTGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCTCC
gi|144466                     : CCTGAGCTGAAAACATT-T-CACCCCGTGTGATCCCAACATGCTCCTGTGACTCCAAAAAGCCCC
gi|144467                     : CCTGAGATGTGAGCGTT-G-CATCTCATGTGACCCAAACATGCTTCTGTGACCCCAACAACCT
gi|144468                     : CCTGAGCTGGCAGCATT-T-CACATCGTATGATCCCAGCATGCTCCTGTTACTCCAGTAAGCCCC
gi|144469                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGA-CCCAACATGCTCCTGACATCTGAACATGCTCC
gi|144470                     : CCTGAACTCGGAGCATT-T-CACCTCAAGTGATCCCATCATGCTCTTGTGACCCAAATAATCTCC
gi|144471                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144472                     : CCTAAGCTGGGAGCATA-T-CACTTTATGTGACCCTAATATGCCACTG
gi|144473                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144474                     :  CTGAGCTGGGAGCATTAT-CACCTCTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACATTAAGCTCC
gi|144475                     :  CTGAGCTGGGAGCATTGT-CACCTTTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACAATAAGCTCC
gi|144476                     :  CTGGGCTGGGAGCATT-TTCACCCCGTGTGAGTCCAACATGCTCATTGGACCACAATAAGCTCC
gi|144477                     :    GAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGATCCCCACATGCTCCTGTGACTCCAATAAGCCCC
gi|144478                     :     AGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACATGCCACTG


blockSeqs                     :                  G T      A
blockSeqs                     :                  A .      A
blockSeqs                     :                  G .      A
blockSeqs                     :                  . .      G
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      G
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      G
blockSeqs                     :                  . .      G
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      T
blockSeqs                     :                  . .      T
blockSeqs                     :                  . .      G
blockSeqs                     :                  . .      A
blockSeqs                     :                  . .      A


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
finalCons                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC

lowQualScore                  :                  6 2      2     0                                
lowQualScore                  :                  . .      .     .                                
lowQualScore                  :                  0 0      9     7                                
consensus                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
Reference ( family-820 )      : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGACCCCAACATGCCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144459                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144460                     : CCTGGGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCCAACATACCCCTGTGACCCCAACAAGCT
gi|144461                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGACCCAAACGTGCTCCTGTGACCCAAACAAGCTCC
gi|144462                     : CCTGGGCTGGAAGGATT-T-CACCTCATGTGACCCTAACATGCCACTGTGACCCCAACAAGCTCC
gi|144463                     : CCTGTGCTGGGACCGTTGT-CACCTTGTATGAGCCCAACATGCTCCTGTCGCCACAATATACTCC
gi|144464                     : CCTGGGCTGGGAACATT-T-CACCTTATGTGACCCTAACATGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCACC
gi|144465                     : CCCGGGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACGTGCCCCTGTGACCCCAGCAAGCTCC
gi|144466                     : CCTGAGCTGAAAACATT-T-CACCCCGTGTGATCCCAACATGCTCCTGTGACTCCAAAAAGCCCC
gi|144467                     : CCTGAGATGTGAGCGTT-G-CATCTCATGTGACCCAAACATGCTTCTGTGACCCCAACAACCT
gi|144468                     : CCTGAGCTGGCAGCATT-T-CACATCGTATGATCCCAGCATGCTCCTGTTACTCCAGTAAGCCCC
gi|144469                     : CCTGAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCGTGTGA-CCCAACATGCTCCTGACATCTGAACATGCTCC
gi|144470                     : CCTGAACTCGGAGCATT-T-CACCTCAAGTGATCCCATCATGCTCTTGTGACCCAAATAATCTCC
gi|144471                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144472                     : CCTAAGCTGGGAGCATA-T-CACTTTATGTGACCCTAATATGCCACTG
gi|144473                     : CTTGAGCTAGGAGCATT-T-CACCTCATGTAACCTCAATAAGCTCC
gi|144474                     :  CTGAGCTGGGAGCATTAT-CACCTCTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACATTAAGCTCC
gi|144475                     :  CTGAGCTGGGAGCATTGT-CACCTTTAGTGAGCCCAACATGCCTCTGTTACCACAATAAGCTCC
gi|144476                     :  CTGGGCTGGGAGCATT-TTCACCCCGTGTGAGTCCAACATGCTCATTGGACCACAATAAGCTCC
gi|144477                     :    GAGCTGGGAGCATT-T-CACCTCATGTGATCCCCACATGCTCCTGTGACTCCAATAAGCCCC
gi|144478                     :     AGCTGGGAGCATT-T-CACTTTATGTGACCCTAACATGCCACTG