lowQualScore : 1 1 3 22 111 11 111 1111111111 11 1
lowQualScore : 0 0 0 0 1 5 1 3 2 4 5 6 4 8 3 3 0 3 6 4 1 2 5 1 99 3 222 66 44 33 33 2 2 77 777 0000000000 6 5555 8888888 99999999 999 7777777 2 3 2 2 00 2
lowQualScore : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . ... .. .. .. .. . . .. ... .......... . .... ....... ........ ... ....... . . . . .. .
lowQualScore : 8 8 0 8 8 4 0 1 1 8 4 8 1 0 3 3 0 3 0 8 7 7 5 3 11 1 888 77 99 99 44 5 5 11 222 9999999999 0 3333 1111111 11111111 666 1111111 7 7 7 7 44 7
consensus : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGACACA-A-TTAA-CTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAA-ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAGGGACCGAAA-AACAGAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-A-----AAAAA-CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Reference ( gi|30561 ) : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCTCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTATTTGTATCATAACAATTTGATGGCCCA-A-T-AA-CCTACCTACCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-ATATGGAGGGACCGAAG-AACGAAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCCAGAGT--AAATTA----------ATGTA----GA-------AATA--------GAAGG--AG-A-----AAAAA-CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTAACAACTGTA
gi|30563 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCACTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CTTTGTTTGCCTAACTGGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGGCCCA-A-TTAA-CTTACCTGCCAGAACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCAGTGATAAAA-AATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATATAT-ATTA-ATAGAGAGGGACCGAAG-AACGAAT--TCGAAATAGTGAATAATTTGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCCGGAGT--TAGTTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--AG-A-----AAACA-CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCGAAAAT-AAAAGAGTTTGAGTTTGTGAGTAACAACTGTA
gi|30562 : TACTCAAATATGTTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGTTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATAAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGTCCCATT-T-AA-CTTACCTGCCAGTACAGATACATGAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTG-TTAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-ATATGGAGGGACTGAAA-AATGAAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAGTTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--AGAA-----AAAAA-CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTTGAGTTGTTGAATAACAACTGTA
gi|30564 : TACTCAAATATGCTAAA---------GTGTTTGATTTCTTTAACTCAATTTTCCATGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CATTGTTTGCCTAATTAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCATGACTCA-A-TTAA-CTTATCTGCCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACACGATGATAAAA-AATTCGAAATAACAAGTAATAAATTAATAGAT-TTTA-ATATTGAGGGACAGAAG-AACGAAT--TTGAAATAGTGAATACCACGAATTAATGG--AATTT-GATATA-TCCGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AAT-----------AGG--AG-A-----TAAAA-CAGGACTGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAATAAAAAGAGTTTGAGTTAGTGAGTATCAACTGTA
gi|30565 : TACTCAAGTATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTCATTTTGTTCACTCAATTTTCTGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAACA-----------CCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGACCCA-ATT-AG-CTTACCTACCAGTACAGATACATAAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTTGGCGGTTTACCTATC
gi|30566 : ACTCAAACATGCTAGATTTAAATTAGTGCTCGA-CTCGTCCACACA----------TTATTGTTTTTACCCAACCAAGCAGCGGTCGTTACCTGGCT
gi|30567 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCATGTGTATTGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGACACA-A-TTAA-CTTACCGGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAAGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTACACGCGGTG-TAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAGGGACCGAAA-AACAGAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAAT--TAATTG----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-G-----GAAAA-CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30568 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTTTTTGTATCTTAACAATTTGATGACACA-A-TTAA-CTTACCTGCCAGTACAGACACACAAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAA--TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCTATAGATATTTG-A-ATGGAGGGCCCAAA--AACAGAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--AAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-G-----AAAAA-CGGGACCGAACTTCAAATTTGAATTAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30569 : CGG-CGTTGTTTGTATAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGATGGCACA-A-TTAA-CTTACCTGCCAGTACCGACACATGAAGCGATAAA-TTACAG------------CAATTATCACCTTTGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAAACAATAGAT-TTTA-GGATGAAGGGACCCAAA-AACAGAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-A-----AAAAA-CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30570 : CGG-CGTTCTTTGTCTAATTAGCATGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAGTAATATGATGAAACA-A-TTAA-TTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGATGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAA--TTTGAAATAACGAGTGAGAAATAAATACAT-ATTA-GGCTGGAGGGACGGAAA-AACAGAT--TCCAAAAAGTGAATAATTCGAATTATTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------AAAGG--GG-A-----ACAAA-GGGGACTGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAATTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30571 : CGG-CGTTGTTTGTCTAAATAGCGTGTGTATCGCTCATGTTTGTATCATAACAATTTGATGACACA-A-TTAA-CTTACCTGCCAGTACAGTCACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATTAACAATTATCACCTTCGACAGTTTCCCTTTCACATTTACGTGGTGTTAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAAAAATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAGGGACTGAAA-AACAGAT--TCGAAATAGTGAAAAACTCAAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TATTTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG---G-G-----GAAAA-TGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCAGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTTGAGTTGATGAATATCAACTGTA
gi|30572 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTCGCGCGTGTATTTCTTGTGCT-GTATCATAACAATTTGATGATACA-A-TTAA-CTAACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACTGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTAACGCGATGAT--AAAAATTCGAAATAACGAGTGAG-AATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAGGGATCGAAA-AACAGAT--TCAAAGAAGTGAATAATTTGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTG----------ATATA----GA-------AATA--------GA--G--GG-G-----AAAAA-CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTT-G-AAAT-A
gi|30573 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATAAGCGTGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTAATGACACA-A-T-AAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATCAA-TTACAGGTATTGGATCAACAATTATCACCATCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCAGCCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-GGATTGAGGGACCGAAA-AACAGAT--TTGAAATAGTGAATTATTCACTTTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TTATTA----------ATATA----GA-------ACTA--------
gi|30574 : -CGTTGTATGTTTAATTATCGTGTGTATCGCTCGTGTCTGTACCATAACAATTTGA
gi|30575 : TTGTTTGTCTAATTAGCGAGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCATGACACA-A-TTAA-CTTAGCTGCCAGTTCTGACATAAGAAGCGATAAA-T-ACAGGTATGGGATCAGCAATTACCACCTTCGAAGGTTTGCCTTTCATCTTCACGTGGTGAT--GAAAATTCGAAATAACGAGagcgataaattacaggtatgggatcaacaattatcaccttcgacggtttccctttcatcttcacgcggtgataagaattcgaaataacgagtgagaaatcaatagattttaggatggagggaccgaaaaacagattcgaaatagtgaataattcgaattactggaatttgatatatcaggagttaattaatatagaaatagaaggggtaaaaacgggaccgaactttaaatttgagataaccggtaattcgaaatatcagagttcgagttggtgagtatcaactgta
gi|30576 : CCAGGACAGACACATGAAGCGATAAAATTACAGGTATGGGATCAGCAGTTATCACTTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAAGGACAGAAG-AACAGAT--TTGAAATAGTGAATAATTCAAAATAGTGAATAGTTT-TAAATAGTTAATAGTTCAAATTACTGGAATTTCATATATCAGGAGTTAATTAATAAAGAAATAGAAGG--GG-G-----GAAAA-CTGGACCGAACTTCAAATTTGAGTTAACAGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTAGCCAGTATCAACTGTA
gi|30577 : gCCAGGACA--CACATGAAGTGATAAA-TTACGGGTATGGGATAAGCAATTATCACCTTCACCAGTTTGCCTTTCATCTTCATGTGGTGATAAAAA--TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA-----ACATAT-------TCGAAATAGTAAATATTCGAAATAGTAAATAAT-CGAATTACTGG--AATTT-AATATA-GCTGGAGT--TAATTA----------ACATA----GA-------AATA--------GAAGGGAAA-A-----AAAAA-CAGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACAGGAATTTTG-AAAT-ATACGAGTTCGAGTTAG
gi|30574 : gTGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTCCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAGAA--TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAT-TTTA-GGATGGAGGGACCGAAA-AACAGAT--TCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-T-----AAAAA-CGGGACCGAACTTTAAATTTGAGATAACCGGTAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30578 : cgttgtatgtttaattatcgtgtgtatcgctcgtgtctgtaccataacaattGGGACCGGAG-AAATGGT--TCGAAACAGTAAA-AAT-CGAATTAAATG--AATTT-TAAATA-ACAGGAGT--TGATTT----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-AAGGGGAAAAA-CAGGACCGAAATTCAACTTC------AC--GAATTTTG-AGAT-ATGCTCGTTCGAGTTATTGTGTTTCGACTGTA
gi|30579 : GTGAATAATTCGCTTAACTGG--AATTT-GATATA-TCAGGAGT--TAATTA----------ATATA----GA-------AATA--------GAAGG--GG-A-----AAAAAACGGGCCCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTTGAGTTGGTGAGTATCAACTTTA
gi|30580 : --AGTTTAGATATA-TAATGAGT--TAATTC----------ATATA----AA-------TAGA--------GAAGGG-AA-A-----AAAAA-CATGACAGATCTTCAACTTAGAATTAACAGGAATCTCA-AAAT-
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 2 1 0 33 2 5 444 0 5555 000000000 33 2 7777777 222222222222 33 33 2 2 66666 55 2 2 00
lowQualScore : . . . . .. . . ... . .... ......... .. . ....... ............ .. .. . . ..... .. . . ..
lowQualScore : 2 9 3 3 99 5 8 333 1 7777 000000000 22 4 6666666 111111111111 22 22 5 5 22222 99 5 5 99
consensus : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGACCGAAA----AACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Reference ( family-816 ) : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGACCGAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30561 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCTCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTATTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAAT-AACCTACCTACCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAATATGGAGGGACCGAAG----AACGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------AGAGTA------------AATTAAT--GT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTAACAACTGTA
gi|30562 : TACTCAAATATGTTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGTTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATAAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGTCCCATTTAACTTACCTGCCAGTACAGATACATGAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGTTAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAATATGGAGGGACTGAAA----AATGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGGAG-AA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTTGAGTTGTTGAATAACAACTGTA
gi|30563 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCACTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CTTTGTTTGCCTAACTGGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAATTAACTTACCTGCCAGAACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCAGTGATAAAA-AATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATATATATTAATAGAGAGGGACCGAAG----AACGAATTCGAAATAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAACA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCGAAAAT-AAAAGAGTTTGAGTTTGTGAGTAACAACTGTA
gi|30564 : TACTCAAATATGCTAAA---------GTGTTTGATTTCTTTAACTCAATTTTCCATGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CATTGTTTGCCTAATTAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACTCAATTAACTTATCTGCCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACACGATGATAAAA-AATTCGAAATAACAAGTAATAAATTAATAGATTTTAATATTGAGGGACAGAAG----AACGAATTTGAAATAGTGAATACCACGAATTAATG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAAT---AGG-A-GA-----TAAAA--CAGGACTGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAATAAAAAGAGTTTGAGTTAGTGAGTATCAACTGTA
gi|30565 : TACTCAAGTATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTCATTTTGTTCACTCAATTTTCTGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAACA-----------CCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACCCAATTAGCTTACCTACCAGTACAGATACATAAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTTGGCGGTTTACCTATC
gi|30566 : ACTCAAACATGCTAGATTTAAATTAGTGCTCGA-CTCGTCCACACA----------TTATTGTTTTTACCCAACCAAGCAGCGGTCGTTACCTGGCT
gi|30567 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCATGTGTATTGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCGGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAAGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTACACGCGGTG-TAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGACCGAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAATT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30568 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTTTTTGTATCTTAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACACAAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCTATAGATATTTGAATGGAGGG-CCCAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTA------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAATTAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30569 : CGG-CGTTGTTTGTATAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCACAATTAACTTACCTGCCAGTACCGACACATGAAGCGATAAA-TTACAG------------CAATTATCACCTTTGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAAACAATAGATTTTAGGATGAAGGGACCCAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30570 : CGG-CGTTCTTTGTCTAATTAGCATGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAGTAATATGA--TGAAACAATTAATTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGATGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-A-TTTGAAATAACGAGTGAGAAATAAATACATATTAGGCTGGAGGGACGGAAA----AACAGATTCCAAAAAGTGAATAATTCGAATTATTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAAAAGG-G-GA-----ACAAA--GGGGACTGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAATTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30571 : CGG-CGTTGTTTGTCTAAATAGCGTGTGTATCGCTCATGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGTCACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATTAACAATTATCACCTTCGACAGTTTCCCTTTCACATTTACGTGGTG-TTAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAAAAATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGACTGAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAAAAACTCAAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------ATTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-G------GAAAA--TGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCAGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTTGAGTTGATGAATATCAACTGTA
gi|30572 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTCGCGCGTGTATTTCTTGTGCT-GTATCATAACAATTTGA--TGATACAATTAACTAACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACTGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTAACGCGATGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAG-AATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGATCGAAA----AACAGATTCAAAGAAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGA--G-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTT-G-AAAT-
gi|30573 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATAAGCGTGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTAA--TGACACAATAAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATCAA-TTACAGGTATTGGATCAACAATTATCACCATCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCAGCCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATTGAGGGACCGAAA----AACAGATTTGAAATAGTGAATTATTCACTTTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------TATTAAT--AT--AGAACTA
gi|30574 : -CGTTGTATGTTTAATTATCGTGTGTATCGCTCGTGTCTGTACCATAACAATTTGAAGCGATA-AATTA
gi|30574 : TGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTCCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAGA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATGGAGGGACCGAAA----AACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GT-----AAAAA--CGGGACCGAACTTTAAATTTGAGATAACCGGTAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTAcaggtatgggatcaacaattatcaccttcgacggtttccctttcatcttcacgcggtgataagaattcgaaataacgagtgagaaatcaatagattttaggatggagggaccgaaaaacagattcgaaatagtgaataattcgaattactggaatttgatatatcaggagttaattaatatagaaatagaaggggtaaaaacgggaccgaactttaaatttgagataaccggtaattcgaaatatcagagttcgagttggtgagtatcaactgta
gi|30575 : cgttgtatgtttaattatcgtgtgtatcgctcgtgtctgtaccataacaattTTGTTTGTCTAATTAGCGAGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACACAATTAACTTAGCTGCCAGTTCTGACATAAGAAGCGATAAA--TACAGGTATGGGATCAGCAATTACCACCTTCGAAGGTTTGCCTTTCATCTTCACGTGGTGAT-GAA-AATTCGAAATAACGAG
gi|30576 : GCCAGGACAGACACATGAAGCGATAAAATTACAGGTATGGGATCAGCAGTTATCACTTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATAGATTTTAGGATGGAAGGACAGAAG----AACAGATTTGAAATAGTGAATAATTCAAAATAGTGAATAGTTTTAAATAGTT-AATAGTTCAAATTACTGGAATTTCATATATCAGGAGTTAATTAATAAAGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CTGGACCGAACTTCAAATTTGAGTTAACAGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTAGCCAGTATCAACTGTA
gi|30577 : GCCAGGACA--CACATGAAGTGATAAA-TTACGGGTATGGGATAAGCAATTATCACCTTCACCAGTTTGCCTTTCATCTTCATGTGGTGATAAAA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAACATA---T-------TCGAAATAGTAA-ATATTCGAAATAGTAAATAAT-CGAATTACTG---------GAAT--TT-AATATAGCT-------GGAGTT------------AATTAAC--AT--AGAAATAGAAGG-G-AA-----AAAAAAACAGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACAGGAATTTTG-AAAT-ATACGAGTTCGAGTTAG
gi|30578 : GGGACCGGAG----AAATGGTTCGAAACAGTAAA-AAT-CGAATTAAAT---------GAAT--TT-TAAATAACA-------GGAGTT------------GATTTAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GAAGGGGAAAAA--CAGGACCGAAATTCAACTTC------AC--GAATTTTG-AGAT-ATGCTCGTTCGAGTTATTGTGTTTCGACTGTA
gi|30579 : GTGAATAATTCGCTTAACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAAA-CGGGCCCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTTGAGTTGGTGAGTATCAACTTTA
gi|30580 : AGT--TTAGATATATAA-------TGAGTT------------AATTCAT--AT--AAATAGAGAAGG-GAAA-----AAAAA--CATGACAGATCTTCAACTTAGAATTAACAGGAATCTCA-AAAT-
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 2 1 0 33 2 5 444 555 2 1 000000000 33 2 7777777 222222222222 33 33 2 2 66666 55 2 2 00
lowQualScore : . . . . .. . . ... ... . . ......... .. . ....... ............ .. .. . . ..... .. . . ..
lowQualScore : 2 9 3 3 99 5 8 333 000 7 3 000000000 22 4 6666666 111111111111 22 22 5 5 22222 99 5 5 99
consensus : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Reference ( family-816 ) : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30561 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCTCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTATTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAAT-AACCTACCTACCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------AGAGTA------------AATTAAT--GT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTAACAACTGTA
gi|30562 : TACTCAAATATGTTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGTTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATAAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGTCCCATTTAACTTACCTGCCAGTACAGATACATGAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGTTAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACTGAA-AAATGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGGAG-AA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTTGAGTTGTTGAATAACAACTGTA
gi|30563 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCACTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CTTTGTTTGCCTAACTGGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAATTAACTTACCTGCCAGAACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCAGTGATAAAA-AATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATATA---TATTAATAGAGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAACA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCGAAAAT-AAAAGAGTTTGAGTTTGTGAGTAACAACTGTA
gi|30564 : TACTCAAATATGCTAAA---------GTGTTTGATTTCTTTAACTCAATTTTCCATGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CATTGTTTGCCTAATTAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACTCAATTAACTTATCTGCCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACACGATGATAAAA-AATTCGAAATAACAAGTAATAAATTAATAGA---TTTTAATATTGAGGGACAGAA-GAACGAATTTGAAATAGTGAATACCACGAATTAATG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAAT---AGG-A-GA-----TAAAA--CAGGACTGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAATAAAAAGAGTTTGAGTTAGTGAGTATCAACTGTA
gi|30565 : TACTCAAGTATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTCATTTTGTTCACTCAATTTTCTGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAACA-----------CCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACCCAATTAGCTTACCTACCAGTACAGATACATAAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTTGGCGGTTTACCTATC
gi|30566 : ACTCAAACATGCTAGATTTAAATTAGTGCTCGA-CTCGTCCACACA----------TTATTGTTTTTACCCAACCAAGCAGCGGTCGTTACCTGGCT
gi|30567 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCATGTGTATTGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCGGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAAGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTACACGCGGTG-TAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAATT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30568 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTTTTTGTATCTTAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACACAAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCTATAGA---TATTTGAATGGAGGG-CCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTA------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAATTAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30569 : CGG-CGTTGTTTGTATAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCACAATTAACTTACCTGCCAGTACCGACACATGAAGCGATAAA-TTACAG------------CAATTATCACCTTTGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAAACAATAGA---TTTTAGGATGAAGGGACCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30570 : CGG-CGTTCTTTGTCTAATTAGCATGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAGTAATATGA--TGAAACAATTAATTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGATGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-A-TTTGAAATAACGAGTGAGAAATAAATACA---TATTAGGCTGGAGGGACGGAA-AAACAGATTCCAAAAAGTGAATAATTCGAATTATTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAAAAGG-G-GA-----ACAAA--GGGGACTGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAATTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30571 : CGG-CGTTGTTTGTCTAAATAGCGTGTGTATCGCTCATGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGTCACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATTAACAATTATCACCTTCGACAGTTTCCCTTTCACATTTACGTGGTG-TTAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAAAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACTGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAAAAACTCAAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------ATTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-G------GAAAA--TGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCAGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTTGAGTTGATGAATATCAACTGTA
gi|30572 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTCGCGCGTGTATTTCTTGTGCT-GTATCATAACAATTTGA--TGATACAATTAACTAACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACTGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTAACGCGATGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAG-AATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGATCGAA-AAACAGATTCAAAGAAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGA--G-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTT-G-AAAT-
gi|30573 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATAAGCGTGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTAA--TGACACAATAAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATCAA-TTACAGGTATTGGATCAACAATTATCACCATCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCAGCCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATTGAGGGACCGAA-AAACAGATTTGAAATAGTGAATTATTCACTTTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------TATTAAT--AT--AGAACTA
gi|30574 : -CGTTGTATGTTTAATTATCGTGTGTATCGCTCGTGTCTGTACCATAACAATTTGAAGCGATA-AATTA
gi|30574 : TGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTCCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAGA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GT-----AAAAA--CGGGACCGAACTTTAAATTTGAGATAACCGGTAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTAcaggtatgggatcaacaattatcaccttcgacggtttccctttcatcttcacgcggtgataagaattcgaaataacgagtgagaaatcaatagattttaggatggagggaccgaaaaacagattcgaaatagtgaataattcgaattactggaatttgatatatcaggagttaattaatatagaaatagaaggggtaaaaacgggaccgaactttaaatttgagataaccggtaattcgaaatatcagagttcgagttggtgagtatcaactgta
gi|30575 : cgttgtatgtttaattatcgtgtgtatcgctcgtgtctgtaccataacaattTTGTTTGTCTAATTAGCGAGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACACAATTAACTTAGCTGCCAGTTCTGACATAAGAAGCGATAAA--TACAGGTATGGGATCAGCAATTACCACCTTCGAAGGTTTGCCTTTCATCTTCACGTGGTGAT-GAA-AATTCGAAATAACGAG
gi|30576 : GCCAGGACAGACACATGAAGCGATAAAATTACAGGTATGGGATCAGCAGTTATCACTTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAAGGACAGAA-GAACAGATTTGAAATAGTGAATAATTCAAAATAGTGAATAGTTTTAAATAGTT-AATAGTTCAAATTACTGGAATTTCATATATCAGGAGTTAATTAATAAAGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CTGGACCGAACTTCAAATTTGAGTTAACAGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTAGCCAGTATCAACTGTA
gi|30577 : GCCAGGACA--CACATGAAGTGATAAA-TTACGGGTATGGGATAAGCAATTATCACCTTCACCAGTTTGCCTTTCATCTTCATGTGGTGATAAAA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAACATATTCGAA-------ATAGTA-AA---TATTCGAAATAGTAAATAAT-CGAATTACTG---------GAAT--TT-AATATAGCT-------GGAGTT------------AATTAAC--AT--AGAAATAGAAGG-G-AA-----AAAAAAACAGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACAGGAATTTTG-AAAT-ATACGAGTTCGAGTTAG
gi|30578 : GGGACCGGAGAAATGG-TTCGAAACAGTAAA-AAT-CGAATTAAAT---------GAAT--TT-TAAATAACA-------GGAGTT------------GATTTAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GAAGGGGAAAAA--CAGGACCGAAATTCAACTTC------AC--GAATTTTG-AGAT-ATGCTCGTTCGAGTTATTGTGTTTCGACTGTA
gi|30579 : GTGAATAATTCGCTTAACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAAA-CGGGCCCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTTGAGTTGGTGAGTATCAACTTTA
gi|30580 : AGT--TTAGATATATAA-------TGAGTT------------AATTCAT--AT--AAATAGAGAAGG-GAAA-----AAAAA--CATGACAGATCTTCAACTTAGAATTAACAGGAATCTCA-AAAT-
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 2 1 0 33 2 5 444 555 2 1 000000000 33 2 7777777 222222222222 33 33 2 2 66666 55 2 2 00
lowQualScore : . . . . .. . . ... ... . . ......... .. . ....... ............ .. .. . . ..... .. . . ..
lowQualScore : 2 9 3 3 99 5 8 333 000 7 3 000000000 22 4 6666666 111111111111 22 22 5 5 22222 99 5 5 99
consensus : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Reference ( family-816 ) : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30561 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCTCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTATTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAAT-AACCTACCTACCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------AGAGTA------------AATTAAT--GT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTAACAACTGTA
gi|30562 : TACTCAAATATGTTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGTTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATAAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGTCCCATTTAACTTACCTGCCAGTACAGATACATGAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGTTAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACTGAA-AAATGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGGAG-AA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTTGAGTTGTTGAATAACAACTGTA
gi|30563 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCACTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CTTTGTTTGCCTAACTGGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAATTAACTTACCTGCCAGAACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCAGTGATAAAA-AATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATATA---TATTAATAGAGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAACA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCGAAAAT-AAAAGAGTTTGAGTTTGTGAGTAACAACTGTA
gi|30564 : TACTCAAATATGCTAAA---------GTGTTTGATTTCTTTAACTCAATTTTCCATGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CATTGTTTGCCTAATTAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACTCAATTAACTTATCTGCCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACACGATGATAAAA-AATTCGAAATAACAAGTAATAAATTAATAGA---TTTTAATATTGAGGGACAGAA-GAACGAATTTGAAATAGTGAATACCACGAATTAATG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAAT---AGG-A-GA-----TAAAA--CAGGACTGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAATAAAAAGAGTTTGAGTTAGTGAGTATCAACTGTA
gi|30565 : TACTCAAGTATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTCATTTTGTTCACTCAATTTTCTGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAACA-----------CCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACCCAATTAGCTTACCTACCAGTACAGATACATAAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTTGGCGGTTTACCTATC
gi|30566 : ACTCAAACATGCTAGATTTAAATTAGTGCTCGA-CTCGTCCACACA----------TTATTGTTTTTACCCAACCAAGCAGCGGTCGTTACCTGGCT
gi|30567 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCATGTGTATTGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCGGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAAGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTACACGCGGTG-TAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAATT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30568 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTTTTTGTATCTTAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACACAAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCTATAGA---TATTTGAATGGAGGG-CCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTA------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAATTAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30569 : CGG-CGTTGTTTGTATAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCACAATTAACTTACCTGCCAGTACCGACACATGAAGCGATAAA-TTACAG------------CAATTATCACCTTTGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAAACAATAGA---TTTTAGGATGAAGGGACCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30570 : CGG-CGTTCTTTGTCTAATTAGCATGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAGTAATATGA--TGAAACAATTAATTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGATGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-A-TTTGAAATAACGAGTGAGAAATAAATACA---TATTAGGCTGGAGGGACGGAA-AAACAGATTCCAAAAAGTGAATAATTCGAATTATTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAAAAGG-G-GA-----ACAAA--GGGGACTGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAATTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30571 : CGG-CGTTGTTTGTCTAAATAGCGTGTGTATCGCTCATGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGTCACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATTAACAATTATCACCTTCGACAGTTTCCCTTTCACATTTACGTGGTG-TTAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAAAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACTGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAAAAACTCAAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------ATTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-G------GAAAA--TGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCAGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTTGAGTTGATGAATATCAACTGTA
gi|30572 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTCGCGCGTGTATTTCTTGTGCT-GTATCATAACAATTTGA--TGATACAATTAACTAACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACTGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTAACGCGATGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAG-AATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGATCGAA-AAACAGATTCAAAGAAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGA--G-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTT-G-AAAT-
gi|30573 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATAAGCGTGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTAA--TGACACAATAAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATCAA-TTACAGGTATTGGATCAACAATTATCACCATCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCAGCCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATTGAGGGACCGAA-AAACAGATTTGAAATAGTGAATTATTCACTTTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------TATTAAT--AT--AGAACTA
gi|30574 : -CGTTGTATGTTTAATTATCGTGTGTATCGCTCGTGTCTGTACCATAACAATTTGAAGCGATA-AATTA
gi|30574 : TGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTCCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAGA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GT-----AAAAA--CGGGACCGAACTTTAAATTTGAGATAACCGGTAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTAcaggtatgggatcaacaattatcaccttcgacggtttccctttcatcttcacgcggtgataagaattcgaaataacgagtgagaaatcaatagattttaggatggagggaccgaaaaacagattcgaaatagtgaataattcgaattactggaatttgatatatcaggagttaattaatatagaaatagaaggggtaaaaacgggaccgaactttaaatttgagataaccggtaattcgaaatatcagagttcgagttggtgagtatcaactgta
gi|30575 : cgttgtatgtttaattatcgtgtgtatcgctcgtgtctgtaccataacaattTTGTTTGTCTAATTAGCGAGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACACAATTAACTTAGCTGCCAGTTCTGACATAAGAAGCGATAAA--TACAGGTATGGGATCAGCAATTACCACCTTCGAAGGTTTGCCTTTCATCTTCACGTGGTGAT-GAA-AATTCGAAATAACGAG
gi|30576 : GCCAGGACAGACACATGAAGCGATAAAATTACAGGTATGGGATCAGCAGTTATCACTTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAAGGACAGAA-GAACAGATTTGAAATAGTGAATAATTCAAAATAGTGAATAGTTTTAAATAGTT-AATAGTTCAAATTACTGGAATTTCATATATCAGGAGTTAATTAATAAAGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CTGGACCGAACTTCAAATTTGAGTTAACAGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTAGCCAGTATCAACTGTA
gi|30577 : GCCAGGACA--CACATGAAGTGATAAA-TTACGGGTATGGGATAAGCAATTATCACCTTCACCAGTTTGCCTTTCATCTTCATGTGGTGATAAAA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAACATATTCGAA-------ATAGTA-AA---TATTCGAAATAGTAAATAAT-CGAATTACTG---------GAAT--TT-AATATAGCT-------GGAGTT------------AATTAAC--AT--AGAAATAGAAGG-G-AA-----AAAAAAACAGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACAGGAATTTTG-AAAT-ATACGAGTTCGAGTTAG
gi|30578 : GGGACCGGAGAAATGG-TTCGAAACAGTAAA-AAT-CGAATTAAAT---------GAAT--TT-TAAATAACA-------GGAGTT------------GATTTAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GAAGGGGAAAAA--CAGGACCGAAATTCAACTTC------AC--GAATTTTG-AGAT-ATGCTCGTTCGAGTTATTGTGTTTCGACTGTA
gi|30579 : GTGAATAATTCGCTTAACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAAA-CGGGCCCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTTGAGTTGGTGAGTATCAACTTTA
gi|30580 : AGT--TTAGATATATAA-------TGAGTT------------AATTCAT--AT--AAATAGAGAAGG-GAAA-----AAAAA--CATGACAGATCTTCAACTTAGAATTAACAGGAATCTCA-AAAT-
blockSeqs : C T C AG A A AA ACA G G AATAGTTTT AG A AATTACT TCATATATCAGG TA AA A A AGGGG AA A A
blockSeqs : T . C . . A AA . . G . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : C . C . . A AA . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . C . . A AA . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . A AA . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A AA . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . T AA . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A AA . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A A . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A A . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . A . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . A . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . A . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : AA*
originalCons : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
finalCons : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAA-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 2 1 0 33 2 5 444 555 2 1 000000000 33 2 7777777 222222222222 33 33 2 2 66666 55 2 2 00
lowQualScore : . . . . .. . . ... ... . . ......... .. . ....... ............ .. .. . . ..... .. . . ..
lowQualScore : 2 9 3 3 99 5 8 333 000 7 3 000000000 22 4 6666666 111111111111 22 22 5 5 22222 99 5 5 99
consensus : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
Reference ( family-816 ) : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACGGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30561 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCTCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTATTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAAT-AACCTACCTACCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAAAAATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------AGAGTA------------AATTAAT--GT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTCGAGTTGGTGAGTAACAACTGTA
gi|30562 : TACTCAAATATGTTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGTTCACTCAATTTTCCGTGTTATCGTTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CGTTGTTTGCCTAATAAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGTCCCATTTAACTTACCTGCCAGTACAGATACATGAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGTTAAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAATATGGAGGGACTGAA-AAATGAATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGGAG-AA-----AAAAA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAGTTTGAGTTGTTGAATAACAACTGTA
gi|30563 : TACTCAAATATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTGATTTCGGTCACTCAATTTTCTGTGTTATCACTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CTTTGTTTGCCTAACTGGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCCCAATTAACTTACCTGCCAGAACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGGTCAGCAATTATCACCTTCGGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCAGTGATAAAA-AATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATATA---TATTAATAGAGAGGGACCGAA-GAACGAATTCGAAATAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AGTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-A-GA-----AAACA--CGGGACCGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCGAAAAT-AAAAGAGTTTGAGTTTGTGAGTAACAACTGTA
gi|30564 : TACTCAAATATGCTAAA---------GTGTTTGATTTCTTTAACTCAATTTTCCATGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAGCAG-CATTGTTTGCCTAATTAGCGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACTCAATTAACTTATCTGCCAGTACAGATACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACACGATGATAAAA-AATTCGAAATAACAAGTAATAAATTAATAGA---TTTTAATATTGAGGGACAGAA-GAACGAATTTGAAATAGTGAATACCACGAATTAATG---------GAAT--TT-GATATATCC-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAAT---AGG-A-GA-----TAAAA--CAGGACTGAATTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAATAAAAAGAGTTTGAGTTAGTGAGTATCAACTGTA
gi|30565 : TACTCAAGTATGCTAAATGTCAATTAGTGTTTCATTTTGTTCACTCAATTTTCTGTGTTATCGCTTTAACCCAAACAAGCAACA-----------CCTAATTAGTGTGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACCCAATTAGCTTACCTACCAGTACAGATACATAAAGCAATAAA-TTACAGGTATGGGATCAGCAATTATCACCTTTGGCGGTTTACCTATC
gi|30566 : ACTCAAACATGCTAGATTTAAATTAGTGCTCGA-CTCGTCCACACA----------TTATTGTTTTTACCCAACCAAGCAGCGGTCGTTACCTGGCT
gi|30567 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCATGTGTATTGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCGGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAAGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTACACGCGGTG-TAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAATT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30568 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTTTTTGTATCTTAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGACACACAAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCTATAGA---TATTTGAATGGAGGG-CCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTA------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAATTAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30569 : CGG-CGTTGTTTGTATAATTAGCGTGTGTATCGCTCGTGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGGCACAATTAACTTACCTGCCAGTACCGACACATGAAGCGATAAA-TTACAG------------CAATTATCACCTTTGACGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAACGAGTGAGAAAACAATAGA---TTTTAGGATGAAGGGACCCAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAAATACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30570 : CGG-CGTTCTTTGTCTAATTAGCATGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAGTAATATGA--TGAAACAATTAATTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGATGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA-A-TTTGAAATAACGAGTGAGAAATAAATACA---TATTAGGCTGGAGGGACGGAA-AAACAGATTCCAAAAAGTGAATAATTCGAATTATTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAAAAGG-G-GA-----ACAAA--GGGGACTGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-AAAAGAATTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTA
gi|30571 : CGG-CGTTGTTTGTCTAAATAGCGTGTGTATCGCTCATGTTTGTATCATAACAATTTGA--TGACACAATTAACTTACCTGCCAGTACAGTCACATGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATTAACAATTATCACCTTCGACAGTTTCCCTTTCACATTTACGTGGTG-TTAAA-AATTCGAAATAACGAGTGAAAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACTGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAAAAACTCAAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------ATTTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-G------GAAAA--TGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCAGAAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTTGAGTTGATGAATATCAACTGTA
gi|30572 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATTCGCGCGTGTATTTCTTGTGCT-GTATCATAACAATTTGA--TGATACAATTAACTAACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATAAA-TTACTGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTGCCTTTCATCTTAACGCGATGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAG-AATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGATCGAA-AAACAGATTCAAAGAAGTGAATAATTTGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTGAT--AT--AGAAATAGA--G-G-GG-----AAAAA--CGGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTT-G-AAAT-
gi|30573 : CGG-CGTTGTTTGTCTAATAAGCGTGTGTATCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTAA--TGACACAATAAACTTACCTGCCAGTACAGACACATGAAGCGATCAA-TTACAGGTATTGGATCAACAATTATCACCATCGACGGTTTGCCTTTCATCTTCAGCCGGTGAT-AAA-AATTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATTGAGGGACCGAA-AAACAGATTTGAAATAGTGAATTATTCACTTTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------TATTAAT--AT--AGAACTA
gi|30574 : -CGTTGTATGTTTAATTATCGTGTGTATCGCTCGTGTCTGTACCATAACAATTTGAAGCGATA-AATTA
gi|30574 : TGAAGCGATAAA-TTACAGGTATGGGATCAACAATTATCACCTTCGACGGTTTCCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAGA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAGGGACCGAA-AAACAGATTCGAAATAGTGAATAATTCGAATTACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GT-----AAAAA--CGGGACCGAACTTTAAATTTGAGATAACCGGTAATTCG-AAAT-ATCAGAGTTCGAGTTGGTGAGTATCAACTGTAcaggtatgggatcaacaattatcaccttcgacggtttccctttcatcttcacgcggtgataagaattcgaaataacgagtgagaaatcaatagattttaggatggagggaccgaaaaacagattcgaaatagtgaataattcgaattactggaatttgatatatcaggagttaattaatatagaaatagaaggggtaaaaacgggaccgaactttaaatttgagataaccggtaattcgaaatatcagagttcgagttggtgagtatcaactgta
gi|30575 : cgttgtatgtttaattatcgtgtgtatcgctcgtgtctgtaccataacaattTTGTTTGTCTAATTAGCGAGTGTCTCGCTTGTGTTTGTATCATAACAATTTCA--TGACACAATTAACTTAGCTGCCAGTTCTGACATAAGAAGCGATAAA--TACAGGTATGGGATCAGCAATTACCACCTTCGAAGGTTTGCCTTTCATCTTCACGTGGTGAT-GAA-AATTCGAAATAACGAG
gi|30576 : GCCAGGACAGACACATGAAGCGATAAAATTACAGGTATGGGATCAGCAGTTATCACTTTCAGCGGTTTGCCTTTCATCTTCACGCGGTGATAAAA--ATTCGAAATAATGAGTGAGAAATCAATAGA---TTTTAGGATGGAAGGACAGAA-GAACAGATTTGAAATAGTGAATAATTCAAAATAGTGAATAGTTTTAAATAGTT-AATAGTTCAAATTACTGGAATTTCATATATCAGGAGTTAATTAATAAAGAAATAGAAGG-G-GG-----GAAAA--CTGGACCGAACTTCAAATTTGAGTTAACAGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTCGAGTTAGCCAGTATCAACTGTA
gi|30577 : GCCAGGACA--CACATGAAGTGATAAA-TTACGGGTATGGGATAAGCAATTATCACCTTCACCAGTTTGCCTTTCATCTTCATGTGGTGATAAAA-A-TTCGAAATAACGAGTGAGAAATCAATAGAACATATTCGAA-------ATAGTA-AA---TATTCGAAATAGTAAATAAT-CGAATTACTG---------GAAT--TT-AATATAGCT-------GGAGTT------------AATTAAC--AT--AGAAATAGAAGG-G-AA-----AAAAAAACAGGACCGAACTTCAAATTTGAGATAACAGGAATTTTG-AAAT-ATACGAGTTCGAGTTAG
gi|30578 : GGGACCGGAGAAATGG-TTCGAAACAGTAAA-AAT-CGAATTAAAT---------GAAT--TT-TAAATAACA-------GGAGTT------------GATTTAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GAAGGGGAAAAA--CAGGACCGAAATTCAACTTC------AC--GAATTTTG-AGAT-ATGCTCGTTCGAGTTATTGTGTTTCGACTGTA
gi|30579 : GTGAATAATTCGCTTAACTG---------GAAT--TT-GATATATCA-------GGAGTT------------AATTAAT--AT--AGAAATAGAAGG-G-GA-----AAAAAA-CGGGCCCGAACTTCAAATTTGAGATAACCGGAATTTCG-AAAT-ATAAGAGTTTGAGTTGGTGAGTATCAACTTTA
gi|30580 : AGT--TTAGATATATAA-------TGAGTT------------AATTCAT--AT--AAATAGAGAAGG-GAAA-----AAAAA--CATGACAGATCTTCAACTTAGAATTAACAGGAATCTCA-AAAT-