lowQualScore : 1
lowQualScore : 00 3 0 7 0 1 4 00 0 00 7 0
lowQualScore : .. . . . . . . .. . .. . .
lowQualScore : 66 6 8 7 5 6 0 66 4 66 6 4
consensus : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Reference ( gi|56078 ) : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56128 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAGGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTTACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56129 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCGTG
gi|56085 : TGTGTGGTGTATCCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56134 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCGTAATT
gi|56150 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GATT-AG--TACTGGTTCTAACCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56147 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCATGATT
gi|56162 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56161 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56184 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AGTATACTGGTTGTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56126 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGGTT
gi|56116 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAA-TTCGAGCATGATT
gi|56186 : TGTGTGGTGT--TATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56080 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56076 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56163 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-CT-T-T-C-CCGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAGGAC-TTCGAGTGTGATT
gi|56197 : TGTTTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-G-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTTGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56198 : TGTGGGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-ATAGAGCGTGATT
gi|56072 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56112 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56164 : TGTGAGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCATGATT
gi|56174 : TGTGTGGTGC--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCATGATT
gi|56081 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56195 : TGTGTGGTGT--ACTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--AACTGGTTCTAATCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56189 : TGTGTGGTTT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56143 : TGTGAGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TGC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56113 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTCT-T-C-C-GTATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGACT
gi|56082 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTTGAGCGTGATT
gi|56074 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56122 : TGTGTG-TGT--CCTTGAGCAAGATAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56087 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56169 : TGTGTGGTGT--CCTACAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAATAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56101 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56191 : TGTGTGGAGT--CCTTGGGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56135 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTGT-T-C-C-ATATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56120 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TAC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56109 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56108 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56106 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56104 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56070 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--ACTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGTGCGTGATT
gi|56090 : TGTGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-A-T-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56207 : TGTGTGGTAT--CCTTGATCAAGACAT-CT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56124 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GTATAT--GCTTAAG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56185 : TGTGTGGTGT--CCTTGCGAAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56133 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTCATACCCATGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56132 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGAT
gi|56079 : TGTGTGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGGAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56141 : TGTGCGGTGT--CCATGAGCTAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56121 : TGTGTGGTGT--CCATGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGCTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56210 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCATGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCTGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56084 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCGGGAAGAC-TTCGAGCCTGA
gi|56201 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACGC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TAATGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAACGTTATT
gi|56119 : TGTGTGATGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GTGTTT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56083 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--ACTT-AG--AACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56155 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-C-T-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56096 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGTTTCTACCCGGGAAGAC-ATCGAGCGTGATT
gi|56202 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGAAAGACACCTT-T-T-C-T-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56144 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAG--ACTT-TG--TATTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56142 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGTCAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAGGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56139 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAATAC-TCCGAGCGTGATT
gi|56137 : TGTGTGGTGC--CCTTGAGCATGACAT-TT-T-TTC-C-GCATAT--TCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56151 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56148 : TGTGTGGTGT--CCTTGTGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ATATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56099 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCTGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56165 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATATATGCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56170 : TGTATGTTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCGTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56075 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACGT-TT-TAC-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCAACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56179 : TGTGTGGTGT--CCTTGAACAAGACAC-TT-T-T-TTC-TCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56175 : TGTATAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCACAT--GCTT-TG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56118 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-ATCGAACGTGATT
gi|56115 : TGTGTGATGT--CATTCAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCACAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGTGTGATT
gi|56111 : TGTGTTGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTAATT
gi|56190 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGAGATT
gi|56131 : TATGTGGTGT--CCTTAAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCGT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56205 : TGTGTTGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTGCCAAGGAAGAC-TTCAAGCGTGATT
gi|56203 : TGTGTGGTGT--TCTTGAGCAAGAAAC-TT-T-TTC-C-ACACAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56178 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAATGAGGAAAAC-TTTAAGCATGATT
gi|56206 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGCGCA-GATT
gi|56157 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCAAATGTGATT
gi|56212 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGGATGATT
gi|56149 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56172 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGAAAGAC-TTTGAGCGTAA
gi|56199 : TGTCTGGTGT--CCTTCAGCAAGAC-C-TT-T-T-C-C-TCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAA-TTCGAGCGTGATT
gi|56097 : TGTGTGATAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGGAAAAC-TTTGAGCATGATT
gi|56127 : TATGTAGTGG--CCTTAAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-GCTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56153 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCTTAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACTCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56196 : TATGTTGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCAAGCATGACT
gi|56094 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGATAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GTTT-AG--TACTAGTTCTACCCAGGAAGAT-TTGGAGCGTGATT
gi|56103 : TGTGTGGTTT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-T-GCATGA--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCCTGATT
gi|56412 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGAGCGTGATT
gi|56413 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56410 : GTGTGATGT--TCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTATCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56407 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-GG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56409 : GTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-AT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56436 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56435 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGGGCATGATT
gi|56437 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56433 : TGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCCACCCAGGAAAACTTTTGAGGGTGATT
gi|56466 : GTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 00 3 0 7 0 1 4 00 0 00 0
lowQualScore : .. . . . . . . .. . .. .
lowQualScore : 66 6 8 6 4 6 0 55 4 55 4
consensus : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Reference ( family-80 ) : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56070 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--ACTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGTGCGTGATT
gi|56072 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56074 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56075 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACGT-TT-TAC-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCAACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56076 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56078 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56079 : TGTGTGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGGAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56080 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56081 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56082 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTTGAGCGTGATT
gi|56083 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--ACTT-AG--AACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56084 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCGGGAAGAC-TTCGAGCCTGA
gi|56085 : TGTGTGGTGTATCCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56087 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56090 : TGTGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-A-T-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56094 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGATAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GTTT-AG--TACTAGTTCTACCCAGGAAGAT-TTGGAGCGTGATT
gi|56096 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGTTTCTACCCGGGAAGAC-ATCGAGCGTGATT
gi|56097 : TGTGTGATAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGGAAAAC-TTTGAGCATGATT
gi|56099 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCTGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56101 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56103 : TGTGTGGTTT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-T-GCATGA--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCCTGATT
gi|56104 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56106 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56108 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56109 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56111 : TGTGTTGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTAATT
gi|56112 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56113 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTCT-T-C-C-GTATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGACT
gi|56115 : TGTGTGATGT--CATTCAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCACAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGTGTGATT
gi|56116 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAA-TTCGAGCATGATT
gi|56118 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-ATCGAACGTGATT
gi|56119 : TGTGTGATGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GTGTTT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56120 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TAC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56121 : TGTGTGGTGT--CCATGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGCTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56122 : TGTGTG-TGT--CCTTGAGCAAGATAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56124 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GTATAT--GCTTAAG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56126 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGGTT
gi|56127 : TATGTAGTGG--CCTTAAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-GCTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56128 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAGGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTTACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56129 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCGTG
gi|56131 : TATGTGGTGT--CCTTAAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCGT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56132 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGAT
gi|56133 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTCATACCCATGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56134 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCGTAATT
gi|56135 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTGT-T-C-C-ATATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56137 : TGTGTGGTGC--CCTTGAGCATGACAT-TT-T-TTC-C-GCATAT--TCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56139 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAATAC-TCCGAGCGTGATT
gi|56141 : TGTGCGGTGT--CCATGAGCTAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56142 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGTCAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAGGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56143 : TGTGAGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TGC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56144 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAG--ACTT-TG--TATTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56147 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCATGATT
gi|56148 : TGTGTGGTGT--CCTTGTGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ATATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56149 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56150 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GATT-AG--TACTGGTTCTAACCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56151 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56153 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCTTAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACTCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56155 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-C-T-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56157 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCAAATGTGATT
gi|56161 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56162 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56163 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-CT-T-T-C-CCGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAGGAC-TTCGAGTGTGATT
gi|56164 : TGTGAGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCATGATT
gi|56165 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATATATGCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56169 : TGTGTGGTGT--CCTACAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAATAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56170 : TGTATGTTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCGTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56172 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGAAAGAC-TTTGAGCGTAA
gi|56174 : TGTGTGGTGC--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCATGATT
gi|56175 : TGTATAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCACAT--GCTT-TG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56178 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAATGAGGAAAAC-TTTAAGCATGATT
gi|56179 : TGTGTGGTGT--CCTTGAACAAGACAC-TT-T-T-TTC-TCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56184 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AGTATACTGGTTGTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56185 : TGTGTGGTGT--CCTTGCGAAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56186 : TGTGTGGTGT--TATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56189 : TGTGTGGTTT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56190 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGAGATT
gi|56191 : TGTGTGGAGT--CCTTGGGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56195 : TGTGTGGTGT--ACTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--AACTGGTTCTAATCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56196 : TATGTTGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCAAGCATGACT
gi|56197 : TGTTTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-G-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTTGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56198 : TGTGGGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-ATAGAGCGTGATT
gi|56199 : TGTCTGGTGT--CCTTCAGCAAGAC-C-TT-T-T-C-C-TCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAA-TTCGAGCGTGATT
gi|56201 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACGC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TAATGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAACGTTATT
gi|56202 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGAAAGACACCTT-T-T-C-T-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56203 : TGTGTGGTGT--TCTTGAGCAAGAAAC-TT-T-TTC-C-ACACAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56205 : TGTGTTGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTGCCAAGGAAGAC-TTCAAGCGTGATT
gi|56206 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGCGCA-GATT
gi|56207 : TGTGTGGTAT--CCTTGATCAAGACAT-CT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56210 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCATGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCTGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56212 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGGATGATT
gi|56407 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-GG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56409 : GTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-AT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56410 : GTGTGATGT--TCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTATCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56412 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGAGCGTGATT
gi|56413 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56433 : TGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCCACCCAGGAAAACTTTTGAGGGTGATT
gi|56435 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGGGCATGATT
gi|56436 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56437 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56466 : GTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 00 3 0 7 0 1 4 00 0 00 0
lowQualScore : .. . . . . . . .. . .. .
lowQualScore : 66 6 8 6 4 6 0 55 4 55 4
consensus : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Reference ( family-80 ) : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56070 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--ACTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGTGCGTGATT
gi|56072 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56074 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56075 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACGT-TT-TAC-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCAACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56076 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56078 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56079 : TGTGTGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGGAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56080 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56081 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56082 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTTGAGCGTGATT
gi|56083 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--ACTT-AG--AACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56084 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCGGGAAGAC-TTCGAGCCTGA
gi|56085 : TGTGTGGTGTATCCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56087 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56090 : TGTGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-A-T-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56094 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGATAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GTTT-AG--TACTAGTTCTACCCAGGAAGAT-TTGGAGCGTGATT
gi|56096 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGTTTCTACCCGGGAAGAC-ATCGAGCGTGATT
gi|56097 : TGTGTGATAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGGAAAAC-TTTGAGCATGATT
gi|56099 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCTGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56101 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56103 : TGTGTGGTTT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-T-GCATGA--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCCTGATT
gi|56104 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56106 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56108 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56109 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56111 : TGTGTTGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTAATT
gi|56112 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56113 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTCT-T-C-C-GTATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGACT
gi|56115 : TGTGTGATGT--CATTCAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCACAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGTGTGATT
gi|56116 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAA-TTCGAGCATGATT
gi|56118 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-ATCGAACGTGATT
gi|56119 : TGTGTGATGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GTGTTT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56120 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TAC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56121 : TGTGTGGTGT--CCATGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGCTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56122 : TGTGTG-TGT--CCTTGAGCAAGATAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56124 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GTATAT--GCTTAAG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56126 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGGTT
gi|56127 : TATGTAGTGG--CCTTAAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-GCTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56128 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAGGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTTACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56129 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCGTG
gi|56131 : TATGTGGTGT--CCTTAAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCGT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56132 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGAT
gi|56133 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTCATACCCATGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56134 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCGTAATT
gi|56135 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTGT-T-C-C-ATATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56137 : TGTGTGGTGC--CCTTGAGCATGACAT-TT-T-TTC-C-GCATAT--TCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56139 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAATAC-TCCGAGCGTGATT
gi|56141 : TGTGCGGTGT--CCATGAGCTAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56142 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGTCAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAGGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56143 : TGTGAGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TGC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56144 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAG--ACTT-TG--TATTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56147 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCATGATT
gi|56148 : TGTGTGGTGT--CCTTGTGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ATATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56149 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56150 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GATT-AG--TACTGGTTCTAACCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56151 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56153 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCTTAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACTCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56155 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-C-T-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56157 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCAAATGTGATT
gi|56161 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56162 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56163 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-CT-T-T-C-CCGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAGGAC-TTCGAGTGTGATT
gi|56164 : TGTGAGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCATGATT
gi|56165 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATATATGCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56169 : TGTGTGGTGT--CCTACAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAATAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56170 : TGTATGTTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCGTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56172 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGAAAGAC-TTTGAGCGTAA
gi|56174 : TGTGTGGTGC--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCATGATT
gi|56175 : TGTATAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCACAT--GCTT-TG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56178 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAATGAGGAAAAC-TTTAAGCATGATT
gi|56179 : TGTGTGGTGT--CCTTGAACAAGACAC-TT-T-T-TTC-TCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56184 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AGTATACTGGTTGTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56185 : TGTGTGGTGT--CCTTGCGAAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56186 : TGTGTGGTGT--TATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56189 : TGTGTGGTTT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56190 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGAGATT
gi|56191 : TGTGTGGAGT--CCTTGGGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56195 : TGTGTGGTGT--ACTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--AACTGGTTCTAATCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56196 : TATGTTGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCAAGCATGACT
gi|56197 : TGTTTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-G-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTTGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56198 : TGTGGGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-ATAGAGCGTGATT
gi|56199 : TGTCTGGTGT--CCTTCAGCAAGAC-C-TT-T-T-C-C-TCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAA-TTCGAGCGTGATT
gi|56201 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACGC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TAATGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAACGTTATT
gi|56202 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGAAAGACACCTT-T-T-C-T-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56203 : TGTGTGGTGT--TCTTGAGCAAGAAAC-TT-T-TTC-C-ACACAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56205 : TGTGTTGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTGCCAAGGAAGAC-TTCAAGCGTGATT
gi|56206 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGCGCA-GATT
gi|56207 : TGTGTGGTAT--CCTTGATCAAGACAT-CT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56210 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCATGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCTGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56212 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGGATGATT
gi|56407 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-GG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56409 : GTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-AT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56410 : GTGTGATGT--TCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTATCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56412 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGAGCGTGATT
gi|56413 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56433 : TGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCCACCCAGGAAAACTTTTGAGGGTGATT
gi|56435 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGGGCATGATT
gi|56436 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56437 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56466 : GTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
blockSeqs : A A T T T
blockSeqs : C A T A T
blockSeqs : C A T T T
blockSeqs : C A T T T
blockSeqs : C A T . T
blockSeqs : C A T . T
blockSeqs : A A T . T
blockSeqs : C A T . C
blockSeqs : C A T . T
blockSeqs : . A T . T
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A G . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . A T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
finalCons : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 00 3 0 7 0 1 4 00 0 00 0
lowQualScore : .. . . . . . . .. . .. .
lowQualScore : 66 6 8 6 4 6 0 55 4 55 4
consensus : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
Reference ( family-80 ) : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56070 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--ACTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGTGCGTGATT
gi|56072 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56074 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56075 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACGT-TT-TAC-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCAACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56076 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56078 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56079 : TGTGTGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGGAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56080 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56081 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56082 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTTGAGCGTGATT
gi|56083 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--ACTT-AG--AACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56084 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCGGGAAGAC-TTCGAGCCTGA
gi|56085 : TGTGTGGTGTATCCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56087 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56090 : TGTGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-A-T-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56094 : TGTGTGGTGT--CCTTTAGCAAGATAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GTTT-AG--TACTAGTTCTACCCAGGAAGAT-TTGGAGCGTGATT
gi|56096 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGTTTCTACCCGGGAAGAC-ATCGAGCGTGATT
gi|56097 : TGTGTGATAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGGAAAAC-TTTGAGCATGATT
gi|56099 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCTGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56101 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56103 : TGTGTGGTTT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-T-GCATGA--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCCTGATT
gi|56104 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56106 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56108 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56109 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56111 : TGTGTTGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTAATT
gi|56112 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56113 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTCT-T-C-C-GTATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGACT
gi|56115 : TGTGTGATGT--CATTCAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GCACAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGTGTGATT
gi|56116 : TGTGTGGCGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAA-TTCGAGCATGATT
gi|56118 : TGTGCGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-ATCGAACGTGATT
gi|56119 : TGTGTGATGT--CCTTTAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-GTGTTT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56120 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TAC-ACATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56121 : TGTGTGGTGT--CCATGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGCTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56122 : TGTGTG-TGT--CCTTGAGCAAGATAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56124 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GTATAT--GCTTAAG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56126 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGGTT
gi|56127 : TATGTAGTGG--CCTTAAGCAAGACAC-TT-TAT-T-C-GCTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56128 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAGGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTTACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56129 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCGTG
gi|56131 : TATGTGGTGT--CCTTAAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCGT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56132 : TGTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGAT
gi|56133 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTCATACCCATGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56134 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCGTAATT
gi|56135 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TTGT-T-C-C-ATATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56137 : TGTGTGGTGC--CCTTGAGCATGACAT-TT-T-TTC-C-GCATAT--TCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56139 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAATAC-TCCGAGCGTGATT
gi|56141 : TGTGCGGTGT--CCATGAGCTAGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56142 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGTCAC-TT-T-TTC-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAGGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56143 : TGTGAGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TGC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56144 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAG--ACTT-TG--TATTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56147 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCAAGCATGATT
gi|56148 : TGTGTGGTGT--CCTTGTGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ATATAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56149 : TGTGTGGTGT--CCTTAAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56150 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GATT-AG--TACTGGTTCTAACCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGAT
gi|56151 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACTTAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAAAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56153 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCTTAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACTCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56155 : TGTATGGTGT--CCTTGAGCAAGACAT-TT-T-T-C-T-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTTGAGTGTGATT
gi|56157 : TGTGTAGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-T-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCAGGAAGAC-TTCAAATGTGATT
gi|56161 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56162 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGACCGTGATT
gi|56163 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-CT-T-T-C-CCGCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAGGAC-TTCGAGTGTGATT
gi|56164 : TGTGAGGTGT--CATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTTGAGCATGATT
gi|56165 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-ACATATATGCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56169 : TGTGTGGTGT--CCTACAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAA--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAATAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56170 : TGTATGTTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCGTAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCTAGAAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56172 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACACCTT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGAAAGAC-TTTGAGCGTAA
gi|56174 : TGTGTGGTGC--CCTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-CTCGAGCATGATT
gi|56175 : TGTATAGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCACAT--GCTT-TG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56178 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAATGAGGAAAAC-TTTAAGCATGATT
gi|56179 : TGTGTGGTGT--CCTTGAACAAGACAC-TT-T-T-TTC-TCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56184 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AGTATACTGGTTGTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56185 : TGTGTGGTGT--CCTTGCGAAAGACACATT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56186 : TGTGTGGTGT--TATTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56189 : TGTGTGGTTT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAT-TTCGAGCGTGATT
gi|56190 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGAGATT
gi|56191 : TGTGTGGAGT--CCTTGGGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGATTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56195 : TGTGTGGTGT--ACTTTAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--AACTGGTTCTAATCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56196 : TATGTTGTGT--CCTTGAGCAAAACAC-TT-TAT-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCAAGCATGACT
gi|56197 : TGTTTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-G-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTTGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56198 : TGTGGGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-ATAGAGCGTGATT
gi|56199 : TGTCTGGTGT--CCTTCAGCAAGAC-C-TT-T-T-C-C-TCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAA-TTCGAGCGTGATT
gi|56201 : TGTGTGATGT--CCTTGAGCAAGACGC-TT-TAT-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TAATGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAACGTTATT
gi|56202 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGAAAGACACCTT-T-T-C-T-ACATAT--GCTT-AG--TACTCGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56203 : TGTGTGGTGT--TCTTGAGCAAGAAAC-TT-T-TTC-C-ACACAT--GCTT-AG--TACTGGTTATACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56205 : TGTGTTGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-TTC-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTGCCAAGGAAGAC-TTCAAGCGTGATT
gi|56206 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTA-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGCGCA-GATT
gi|56207 : TGTGTGGTAT--CCTTGATCAAGACAT-CT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTTTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56210 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGCATGACACCTT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTATCCTGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56212 : TGTGTGGTGT--CCTTGAGTAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAGGATGATT
gi|56407 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-T-CTGCATAT--GCTT-GG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGAACGTGATT
gi|56409 : GTGTGGTAT--CCTTGAGCAAGACAC-AT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTACCCAGGAAAAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56410 : GTGTGATGT--TCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGATTCTATCCAGGAAGAC-TTTGAGCGTGATT
gi|56412 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGTC-TTCGAGCGTGATT
gi|56413 : GTGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GTTT-TG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56433 : TGTGGTGT--CCTTCAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCCACCCAGGAAAACTTTTGAGGGTGATT
gi|56435 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTTCTACCCAGGAAGAC-TTCGGGCATGATT
gi|56436 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-ACATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCATGATT
gi|56437 : TGTGGTGT--CCTTGAGCAAGGCAC-TT-T-TTC-C-GCATAT--GCTT-TG--TACTGGTACTACCCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT
gi|56466 : GTGT--CCTTGAGCAAGACAC-TT-T-T-C-C-GCATAT--GCTT-AG--TACTGGTTCTAACCAGGAAGAC-TTCGAGCGTGATT