lowQualScore                  :                            1111                   111111            11111                     111                            1          11                                                                 222222                                                          11111         11111                     444444444       111111     2222  1 111 1     1      
lowQualScore                  :                 99   66  0 7777       2   3    2  555555            77777 4 444               333 333     66666     3  333   6          33        1   1     5555555  555     5555                    3     111111 33333 44  33 4444   2     1    2     11   9       11  1  22222 22222   99999  22      2 4444 0   222222222       444444     2222  0 777 0     3      
lowQualScore                  :                 ..   ..  . ....       .   .    .  ......            ..... . ...               ... ...     .....     .  ...   .          ..        .   .     .......  ...     ....                    .     ...... ..... ..  .. ....   .     .    .     ..   .       ..  .  ..... .....   .....  ..      . .... .   .........       ......     ....  . ... .     .      
lowQualScore                  :                 22   11  8 0000       5   4    5  888888            00000 0 777               999 333     11111     0  333   8          55        1   3     6666666  555     7777                    1     000000 22222 55  11 1111   8     9    3     88   2       99  9  88888 99999   11111  11      8 4444 7   444444444       999999     5555  0 555 0     3      
consensus                     :            ACACCNACTANACTACNTGCATGTACCNTCTNCACCCAC-ACTACCAACTATAGTACCA-GNTGT---ACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTCT-ACACCCACCATA-CCAAC-----TACAC--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACCATACC-----GA-----CTACAC-TA---CCAACTGTACCCTCNACATC--CGCCATACCAA--CTACAN----T-A-C-CAGC----TGT-ACCCTCNA---CATCCA-C-AC----ACCAACT--ACATCACCAGCCGTA-C---C-TCTAC-ACCCAC
Reference ( gi|20698 )        :            ATACCCATTACACTACATG-ATGTACCCTCTACACCCAC-ACTATCAACTATAGTACCA-GATAT---ACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCATCTGTACCCTCA-ACACCCACCATA-CCAAC-----TACAT--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACTATACC-----CA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTATCCTCTACATC--CACAATACCAA--CTACAG----T-A-C-CAGA----TGT-ACCCTCTA---CACCCA-C-ACA---ACCAACT--ATAGTACCAGATGTA-C---C-TCTAC-ACCCAC
gi|20701                      :            ATACCCATTACACTACATG-ATGTACCCTCTACACCCAC-ACTACCAACTATAGTACAA-GATGT---ACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCA-ACACCCACCATA-CCAAC-----TACAT--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACCATACC-----CA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTATCCTCTACATC--CACAATACCAA--CTACAG----T-A-C-CAGA----TGT-ACC
gi|20700                      :  tacatctaccATACCAACAGCACTACCAG-CTGTACCATCTACACTCAC-AACACCAACAACGCTACCA-GCTGT---ACCCTTTACACCCAC---T--ATACCA--A--CTATACTA---CCTGCTGTAACCTCT-ACACCCACTATA-CCAAC-----AACGC--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACCATATC-----GA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTACTGTCTACACC--AATGATAGCAT--TTTCAC----T-A-C-AAGC----TGT-ACTCTCCT---CACCCA-C--CAT--ACCAACT--ACACTACCa
gi|20692                      : cttcattcacaACACCTTTTAGTCTTCATACATGTACCAACTCCACC-----------ACCATGGTAC-----TGT---ACCCTTTACACCCAC---AAACTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGTACCCTAT-ACAACCACCATA-CCA--------ACAT--CATCA----ACTTTACATTCTACATCTAGTATACTAG---CA-----C--CAT-TT---TCAACTACATCCTCAACATC--GGCCAAACCAAATCTATAA----G-A-CACTGA----T-----CCTTTA---TATTCA-
gi|20694                      :           aACACCTTTTAGTCTTCATACATGTACCAACTCCACC-----------ACCATGGTAC-----TGT---ACTCTTTACACCCACCAGA--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGGACCCTAT-ACAACCACCATA-CCAAC--------GT--CATCA----ACTTTACACTCTACATCTAGTATACTAG---CA-----C--CAT-TT---TCAGCTACATCCTCAACATC-------TGCCAA----ACAAAATTT-A-T-CAGACAC-TG--ATCCTTTA---TATTCATT-ACATGTATCGACT--CCATCACCA----TA-CCAAC-TCAACTATCCACttacatgtatccactccatcgccataccaactcaactatccac
gi|20693                      :           aACACCTTTTAGTCTTCATACATGTACCAACTCCACC-----------ACCATGGTAC-----TGT---ACCCTTTACACCCACAA-A--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGTACCCTAT-ACAACCACCATA--CAA-------ACAT--CATCA----ACTTTACATTCTACATCTAGTATACTAG---CA-----C--CAT-TT---TCAACTACATCCTCAACATCGTC-CAA-ACCAA--ATCCA-----T-A----AGACAC-TG--ATCCTTTA---TATTCA-
gi|20705                      :            aTACCAACTATAGTACCAG-ATGTACCCTCTACACCCAC-AATATCAACTATAGTACCA-GCTGT---ACCCTCAACACCCAC---C--ATACCA--A--CTACATTA---CCAGCTGTACCCTCT-ACACCCACCATA-CCCAC-----TACAC--TACCA----GCTGTATCCTCTACATCCACAATACC-----ttacatgtatccactccatcgccataccaactcaactatccac
gi|20702                      :        ctaacTACCAACTATACTACTTA-CTGTAACCTCTACACCCACAATTA-CAACTACACTGCAA-GCTGT---ACTGTCTACACCCAT---G--ATACCA--T--CTACACTA---CCAGCTGTACTCTCT-TCACCTACCATA-CCAAC-----TACAC--TACCA----GCTGTATCCTCAACACCCACAATACC-----AA-----CTATAT-TA---CAAACTGTACCCTaa
gi|20699                      :              ACCAACTATAGTACCAG-ATGTACCCTCTACACCCAC-ACGACCAACTATAGTTCCA-GATGT---ACCCTCTACACCCAC---A--TTACCA--A--CTATAGTA---CCAACTGTACCCTCA-ACACCCACTCTA-CCAAC-----TACAT--TACCA----GCTGTACCATCTACACCCACCATAC
gi|20699                      :                          tcttcacccacataTCTTCACCCAC-ATAACCAACTATAGTACCA-GATGT---ACCCTCTACACCCAC---A--CGACCA--A--CTATAGTT---CCAGATGTACCCTCT-ACACCCACATTA-CCAAC-----TATAG--TACCA----ACTGTACCCTCAACACCCACTCTACC-----AA-----CTACAT-TA---CCAGCTGTACCATCTACACC--CACCATAC
gi|20696                      :                                        TCTTCATCCAT-G-TACCAACTCCACCACCATGGTATTGTACCTTTAACACCCACCAAA--CTAACACCA--CTATAC-----CCA-CTGTACCCTAT-ACAACCACCATA-CCAAC-----ATCAT--AACCT----TCTCCACACTCTACATCTAGTATACTAG---CA-----C--CAT-TT---TCAACTACATCCTCAATATC--TGCCAAACCAA--ATCCA-----T-A----AGACACTTGT---CCTTTA---TATTCA-CTACATGTATCAGCT--CCATCACCA
gi|20704                      :                                aacacccttatagACCCAC-ACTACCAACTATAGTACAA-GATGT---ACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCA-ACACCCACCATA-CCAAC-----TACAT--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACCATACC-----CA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTATCCTCTACATC--CACAATACCAA--taccaacccaacaatccac
gi|20703                      :                                             ACCCAC-TATATCATCTATGCTACAA-GCCAT---ACCCTCTACACCCAC---C--ATACCA--A--CTACACTT---CCAGCTGTACCCTCA-ACAACCACCATA-CTAAC-----TACAC--TACCA----GCTGTACCCTCAACATCCACCATACC-----AA-----CTATGC-TT---TAAACTGTACCCTCAACACC--CACCATACCAA--CTAT-G----C-ATC-CAGT----TGT-ACCATCCA---CACCCA-CTAT----ATCATGT--ATGCTACGAGCCATACC---C-TCTAC-ACTCAC
gi|20705                      :                                                   -ACTACCAACTATAGTACCA-GATGT---ACCCTCTACACCCAC---A--ATATCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCA-ACACCCACCATA-CCAAC-----TACAT--TACCA----GCTGTACCCTCTACACCCACCATACC-----CA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTATCCTCTACATC--CACAATACCAA--cataccaactgcactacc
gi|20702                      :                                                   ctaTACCAACTATACTACTT-ACTGT---AACCTCTACACCCAC---A--ATTACA--A--CTACACTG---CAAGCTGTACTGTCT-ACACCCATGATA-CCATC-----TACAC--TACCA----GCTGTACTCTCTTCACCTACCATACC-----AA-----CTACAC-TA---CCAGCTGTATCCTCAACACC--CACAATACCAA--CTATAT----T-A-C-AAAC----TGT-ACCCT
gi|20695                      :                                                           ACCATGGTAC-----TGT---ACACTTTAAACCCACCAAA--CTAACATTAGCCTACATTATACCCA-CTGTAGCCTAT-ACAACCACCATA-CCA--------ACAT--CATCA----ACTCTACACTCTAAATCTAGTATATT-----AG-----CATCAT-TT---TCAACTACATTCTCAACATC--TGCCAAACCAA--
gi|20711                      :                                            aacaccttttagtcttcatacatgtgccaactccaccCCCACTATACCAAC---A--TCACTA------CAT-GTA---ACAACTGTACCATCT-ACATTCGTCATA-CTAAC-----TCCAG--TTCCA----ACTGCACCTTCAAAATCCATCATACC-----atccataagacactgatcctttatatacatgtatcgactccatcaccataccaactcaactatccac
gi|20699                      :                                                                     actgtgccccatgggTCTTCACCCAC---A--TAACCA--A--CTATAGTA---CCAGATGTACCCTCT-ACACCCACACGA-CCAAC-----TATAG--TTCCA----GATGTACCCTCTACACCCACATTACC-----AA-----CTATAG-TA---CCAACTGTACCCTCAACACC--CACTCTACCAA--CTACAT----T-A-C-CAGC----TGT-ACCATCTA---CACCCA-C-aaattaattaaacacttttcagtcttcaaacatgtaccaactccaccacaatggtacca
gi|20704                      :                                                                                         ACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CAAGATGTACCCTCT-ACACCCACACTA-CCAAC-----TATAG--TACCA----GCTGTACCCTCAACACCCACCATACC-----AA-----CTACAT-TA---CCAGCTGTACCCTCTACACC--CACCATACCCA--CTACAC----T-A-C-CAGC----TGT-ATCCTCTA---CATCCA-C-AAT---ACCAAcatac
gi|20705                      :                                                                                               ---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGATGTACCCTCT-ACACCCACAATA-TCAAC-----TATAG--TACCA----GCTGTACCCTCAACACCCACCATACC-----AA-----CTACAT-TA---CCAGCTGTACCCTCTACACC--CACCATACCCA--CTACAC----T-A-C-CAGC----TGT-ATCCTCTA---CATCCA-C-AAT---ACCAA
gi|20702                      :                                                                                                   ctaTACCA--A--CTATACTA---CTTACTGTAACCTCT-ACACCCACAATT-ACAAC-----TACAC--TGCAA----GCTGTACTGTCTACACCCATGATACC-----AT-----CTACAC-TA---CCAGCTGTACTCTCTTCACC--TACCATACCAA--CTACAC----T-A-C-CAGC----TGT-ATCCTCAA---CACCCA-C-AAT---ACCAACT--ATATTACAAACTGTA-C---C-
gi|20697                      :                                                                                                      TACCA--A--CTCCACCA---CAATG-GTACCATTT-ACACCCACCAAA-CTAAC-----ATCATTATACCC----ACTTTACCCTATACAACCACCATA--------A-----CAACGT-CA---TCACTTCTACACTCTACATC--TAGTATACTAG--Cct
gi|20711                      :                                                                                                       aacacttttcagtcttcaaacatgCTGTGCCC-CATGGGCCCACTATA-CCAACATCACTACATG-TAACA----ACTGTACCATCTACATTCGTCATACT-----AA-----CTCCAG-TT---CCAACTGCACCTTCAAAATC--CATCATACCAA--accattttcaactacatccttaa
gi|20710                      :                                                                                                                              aCTGTGCCC-CATGCGCCCACTATA-CTAAC-----ATCAC--TAACA----ACTGTACCATCTACATTCGTCATACT-----TA-----CTCCAA-TT---CCAACTGCACGTTCAAAATC--CATCATACCAA--attaattaaacacttttcagtcttcaaacatgtaccaactccaccacaatggtacca
gi|20707                      :                                                                                                                              aCTGTGCCC-CATGGGCCCACTATA-CCAAC-----ATCAC--TAACA----ACTGTACCATCTACATTTGTCATACT-----GA-----CTCCAA-TT---CCAACTGCACCTTCAAAATC--CATCATACCAA--attaattaaacaccttttagtcttcatacatgtgccaactccaccaccat
gi|20708                      :                                                                                                                              aCTGTGCCCTAT-GGGCCGACTATA-CCAAC-----ATCAC--TAACA----ACTGTACCATCTACATTTGTCATACT-----GC-----CTCCAA-TT---CCAACTGCACCTTCAAAATC--CATCATACCAA--attaataacaccttttagtcttcatacatgtaccaactccaccaccat
gi|20699                      :                                                                                                                                           aCACCCAC-ATAACCAAC-----TATAG--TACCA----GATGTACCCTCTACACCCACACGACC-----AA-----CTATAG-TT---CCAGATGTACCCTCTACACC--CACATTACCAA--CTATAG----T-A-C-CAAC----TGT-ACCCTCAA---CACCCA-C-TCT---ACCAACT--ACATTACCAGCTGTA-C---CATCTAC-ACCCACattaataacaccttttagtcttcatacatgtaccaactccaccaccat
gi|20709                      :                                                                                                                                          tcttCCCACTATA-CCAAC-----ATCAC--TGACA----ACTGTACTATCTACATTCCTCATACT-----GA-----TTCCAA-TT---CCAACTGCACCTTCAAAATC--CATCATACCAA--catac
gi|20706                      :                                                                                                                                actgtgccccgtgggCCACCATA-CCAAC-----ATCAC--TACCC----ACTGTACTCTCTACAattaattaaacaccttttagtcttcatacatgtaccaactccaccaccat
gi|20694                      :                                                                                                                                    cactttgccccatatgaTA-CCAAC-----TCCAC--CACCATGGTACTGTACTCTTTACACCCACCAGACTAACATCA-----TTATAC------CCA-CTGGACCCTATACAAC--CACCATACCAA--C----G----TCA-T-CAAC----TTT-ACACTCTA---CATCTA-tttgtaatactagctccaattcaaacatcaccctcaaagtcactcataacaaatccatttaacacccttatagtcttcatccatgtaccaactccaccaccat
gi|20695                      :                                                                                                                             aacaccttttagtcttcatacatgTG-CCAAC-----TCCAC--CACCATGGTACTGTACACTTTAAACCCACCAAACTAA---CATTAGCCTACAT-TATACCCA-CTGTAGCCTATACAAC--CACCATACCA-----ACAT----C-A-T-CAAC----TCT-ACACTCTA---AATCTA-gtatactagcaccattttcagctacatcctcaacatctgccaaacaaaatttatcagacactgatcctttatattcattacatgtatcgactccatcaccataccaactcaactatccac
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-795 )      :                     ACACCNACTANA--CTACNTGCATGTACCNTCTNCACCCACACTACCAACTATAGTACCAGNTGTACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCAACTACACTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCGACTACACTAC------CAACTGTACCCTCNACATCCGCCATACCAA--CTA--CA-NT-ACCAG---C-TGTACCCTCNA-----CATCC---A-C-A--C----A-----CCAACTACATCACCA-GCCGTA-C---CTCTAC-ACCCAC
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gi|20697                      :                                         aCATGTACCAACTCCACC-ACA---------ATGGTACCA---------TTTACACCCACCAAA--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTTTACCCTATACAACCACCATAACAACGTCATCAC---------TTCTACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTT------CAACTACATCCTTAAtaccaacccaacaatccac
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gi|20700                      :                     ATACCAACAGCA--CTACCAGC-TGTACCATCTACACTCACAACACCAACAACGCTACCAGCTGTACCCTTTACACCCAC---T--ATACCA--A--CTATACTA---CCTGCTGTAACCTCTACACCCACTATACCAACAACGCTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATATCGACTACACTAC------CAGCTGTACTGTCTACACCAATGATAGCAT--TTT--CA-CT-ACAAG---C-TGTACTCTCCT-----CACCC---ACC-A--T----A-----CCAACTACACTACC
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gi|20703                      :                                                        ACCCACTATATCATCTATGCTACAAGCCATACCCTCTACACCCAC---C--ATACCA--A--CTACACTT---CCAGCTGTACCCTCAACAACCACCATACTAACTACACTAC------CAGCTGTACCCTCAACATCCACCATACCAACTATGCTTT------AAACTGTACCCTCAACACCCACCATACCAA--CTATGCA-T---CCAG---T-TGTACCATCCA-----CACCC---A-CTA--T----A-----TCATGTATGCTACGA-GCCATACC---CTCTAC-ACTCAC
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gi|20706                      :                                                                                                                                  ctaCTTTGCCCCATATGACCACCATACCAACATCACTAC------CCACTGTACTCTCTACATTTGTAATACTAGCTCCAATTC------AAACATCACCCTCAAAGTCACTCATAACAA--ATC--CATTT-AACAC---C-CTTATAGTCTT-----CATCC---A-T-G--T----A-----CCAACTCCACCACCA-
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Unaligned ( gi|20712 ): TTAACATCCGCCAAACCAAATCCATAAGACACTGATCCTTTATATGCATTACATGTATCGACTCCGTCACCATACCAACTCAACTATACAC






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Reference ( family-795 )      :                                                                                                                                            ACACCCTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACCCAC-A-TA-CCAACTATGGTACC-AG-T-GTACCCTCTACACCCAC---A--CTANCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTATACGCCCACCATACCAAC-ATCACTAC------CAACTGTACCCTCTACATCCACCATACCAACTCCACTTCCAGCTGCACCCTCAACATCCGCCATACCAA--ATNCATTANNAACTGTACCCT--T-TA-----CA-----TACAC-GT-ACCAACTCCACCACCA-GCCGT-AC---CTCAACTATCCAC
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Reference ( family-795 )      :                                                                                                                                            ACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACCCAC-A-TA-CCAACTATGGTACC-AG-T-GTACCCTCTACACCCAC---A--CTANCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTATACGCCCACCATACCAAC-ATCACTAC------CAACTGTACCCTCTACATCCACCATACCAACTCCACTTCCAGCTGCACCCTCAACATCCGCCATACCAA--ATNCATTANAAAC---TGTACCCT--TTA-----CA-----TACAC-GT-ACCAACTCCACCACCA-GCCGT-AC---CTCAACTATCCAC
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gi|20696                      :                                                                                                                                           aACACCCTTATAGTCTTCATCCA--TGTACCAACTCCACC------------ACCATGGTAT-----T-GTACCTTTAACACCCACCAAA--CTAACACCA--CTATAC-----CCA-CTGTACCCTATACAACCACCATACCAAC-ATCATAAC------CTTCTCCACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTCAATATCTGCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---T-TGTCCT--TTA-----TATTCACTACAT-GT-ATCAGCTCCATCACCATACCA--AC---C-CAACAATCCAC
gi|20697                      :                                                                                                                                           aACACTTTT-CAGTCTTCAAACA--TGTACCAACTCCA-CCAC-A----------ATGGTACC-A----------TTTACACCCACCAAA--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTTTACCCTATACAACCACCATAACAAC-GTCATCAC---------TTCTACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTTAA
gi|20698                      :                                                                                                                                           aATACCCAT-TACACTACATG-A--TGTACCCTCTACACCCAC-ACTA-TCAACTATAGTACC-AGAT-ATACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCATCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACTATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--CTACAGTACCAGA---TGTACCCT--CTA-----CA-----CCCAC-ACAACCAACTATAGTACCA-GATGT-AC---CTCTAC-ACCCAC
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gi|20700                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tCTTCATTCACAATACCAACAGCACTACCAGCTGTACCATCTACACTCACAACACCAA--CAACGCTACCAGC---TGTACCCT--TTA-----CA-----CCCACTAT-ACCAACTATACTACCT-GCTGTAAC---CTCTAC-ACCCAC
gi|20700                      :                                                                                                                                                                  --TGTACCATCTACACTCAC-AACA-CCAACAACGCTACC-AGCT-GTACCCTTTACACCCAC---T--ATACCA--A--CTATACTA---CCTGCTGTAACCTCTACACCCACTATACCAAC-AACGCTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATATCGACTACACTACCAGCTGTACTGTCTACACCAATGATAGCAT--TTTCACTACAAGC---TGTACTCTCCTCA-----CC-----CAC-C-AT-ACCAACTACACTACCtataccaacaacgctaccagctgtaccctctacacccaccatatcgactacactaccagctgtactgtctacaccaatgatagcattttcactacaagctgtactctcctcacccaccataccaactacactacc
gi|20701                      :                                                                                                             cttcattcacaataccaacagcactaccagcATACCCAT-TACACTACATG-A--TGTACCCTCTACACCCAC-ACTA-CCAACTATAGTACA-AGAT-GTACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--CTACAGTACCAGA---TGTACC
gi|20702                      :                                                                                                                                                                              tacatctacc-TA-CCAACTATACTACTTAC-T-GTAACCTCTACACCCAC---A--ATTACA--A--CTACACTG---CAAGCTGTACTGTCTACACCCATGATACCATC-TACACTAC------CAGCTGTACTCTCTTCACCTACCATACCAACTACACTACCAGCTGTATCCTCAACACCCACAATACCAA--CTATATTACAAAC---TGTACCCT--a
gi|20703                      :                                                                                                                                                                                ACCCACTA-TA-TCATCTATGCTACA-AG-CCATACCCTCTACACCCAC---C--ATACCA--A--CTACACTT---CCAGCTGTACCCTCAACAACCACCATACTAAC-TACACTAC------CAGCTGTACCCTCAACATCCACCATACCAACTATGCTTTAAACTGTACCCTCAACACCCACCATACCAACTATGCAT--CCAGT---TGTACCAT--CCA-----CA-----CCCACTAT-ATCATGTATGCTACGA-GCCAT-AC---C
gi|20703                      :                                                                                                                                                            CATCCAGTTGTACCATCCACACCCACTA-TA-TCATGTATGCTACG-AG-CCATACCCTCTACACTCAC---C--ATACCA--A--CTGCACTA---CCctctacactcaccataccaactgcactacc
gi|20704                      : acccactatatcatctatgctacaagccataccctctacacccaccataccaactacacttccagctgtaccctcaacaaccaccatactaactacactaccagctgtaccctcaacatccaccataccaactatgctttaaactgtaccctcaacacccaccataccaactatgACCCAC-ACTA-CCAACTATAGTACA-AGAT-GTACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--
gi|20705                      :                                                                                                                                                                                        -TA-CCAACTATAGTACC-AGAT-GTACCCTCTACACCCAC---A--ATATCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--
gi|20706                      :                                                                                                                                                                                                                                                            ctaacCTTTGCCCCATATGACCACCATACCAAC-ATCACTAC------CCACTGTACTCTCTACATTTGTAATACTAGCTCCAATTCAAACATCACCCTCAAAGTCACTCATAACAA--ATCCATTTAACACCCTTATAGTCT--T-------CA-----TCCAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-
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Reference ( family-795 )      :                                                                                                                                            ACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACCCAC-A-TA-CCAACTATGGTACC-AG-T-GTACCCTCTACACCCAC---A--CTANCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTATACGCCCACCATACCAAC-ATCACTAC------CAACTGTACCCTCTACATCCACCATACCAACTCCACTTCCAGCTGCACCCTCAACATCCGCCATACCAA--ATNCATTANAAAC---TGTACCCT--TTA-----CA-----TACAC-GT-ACCAACTCCACCACCA-GCCGT-AC---CTCAACTATCCAC
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gi|20705                      :                                                                                                                                                                                        -TA-CCAACTATAGTACC-AGAT-GTACCCTCTACACCCAC---A--ATATCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--
gi|20706                      :                                                                                                                                                                                                                                                            ctaacCTTTGCCCCATATGACCACCATACCAAC-ATCACTAC------CCACTGTACTCTCTACATTTGTAATACTAGCTCCAATTCAAACATCACCCTCAAAGTCACTCATAACAA--ATCCATTTAACACCCTTATAGTCT--T-------CA-----TCCAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-
gi|20707                      :                                                                                                                                                                                                                                                               caCTGTGCCCCATGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTTGTCATACTGACTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAAT----AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20708                      :                                                                                                                                                                                                                                                                aCTGTGCCCTATGGGCCGACTATACCAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTTGTCATACTGCCTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAAT----AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20709                      :                                                                                                                                                                                                                                                                aCTGTGCCCCGTGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTGA------CAACTGTACTATCTACATTCCTCATACTGATTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATT--AAAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20710                      :                                                                                                                                                                                                                                                                aCTGTGCCCCATGCGCCCACTATACTAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTCGTCATACTTACTCCAATTCCAACTGCACGTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATTA--AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-GCCAACTCCACCACCA-t
gi|20711                      :                                                                                                                                                                                                                                                                aCTGTGCCCCATGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTACATGTAACAACTGTACCATCTACATTCGTCATACTAACTCCAGTTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATTAAACAC---TTTTCAGT--CTT-----CA-----AACAT-GT-ACCAACTCCACCA-CA-ATGGT-AC---Ct
gi|20712                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTTAACATCCGCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TATGCATTACAT-GT-ATCGACTCCGTCACCATACC---AA---CTCAACTATACACa


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .           C .        A       CACATAACCA            CAGA  C                 CAAA     A  CCA   T   A  .     A         A   A              AT    C  .                          G          C  T                       G         .   T   TACCAGATGT        .    TATTCAT         CT  .                T   GTAAC         T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .           C .        A       CACAACACCA            CAGC  .                 CAAA     A  T     T   T  .     A         A   A              GT    T  .                          G          T  T                       G         .   C   TACCAGCTGT        .    TATTCAC         T   .                T   GTAC          T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .           C .        A       CACACTACCA            AAGA  .                 CAAA     A  T     T   C  .     T         A   A              AT    T  .                          G          C  T                       G         .   C   TACAAGCTGT        .    GTCTTCA         T   .                T   ATAC          A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .           C .        A       CACTATATCA            TTAC  .                 AAA      A  T     T   A  .     G         A   A              AT    T  .                          G          C  T                       A         .   A   TACCAGATGT        .    GTCTTCA         T   .                .   GTAC          T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .           C .        T       CACTATATCA            AAGA  .                 A        C  A     T   G  .     G         C   A              GT    T  .                          C          A  C                       A         .   A   TACAAACTGT        .    GTCTTCA         T   .                .   AAC           .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                . .        T       CACA                  AAG   .                 T        C  A     T   C  .     G         C   A              AA    T  .                          C          G  C                       A         .   A   AAGACACTG         .    TATGCAT         C   .                .   AA             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .        T       .                     GAG   .                 A        C  A     T   G  .     G         C   A              TA    T  .                          C          A  C                       A         .   A   CAGACACTG         .    TA              T   .                .   AA             
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Reference ( family-795 )      :                                                                                                                                            ACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACCCACA---NTACCAACTATGGTACNAGATGTACCCTCTACACCCAC---A--CTANCA--A--CTATANTA---CCAGCTGTACCCTATACGCCCACCATACCAAC-ATCACTAC------CAACTGTACCCTCTACATCCACCATACCAACTCCACTTCCAGCTGCACCCTCAACATCCGCCATACCAA--ATNCATTANAAAC---TGTACCCT--TTA-----CA-----TACAC-GT-ACCAACTCCACCACCA-GCCAT-AC---CTCAACTATCCAC
gi|20692                      :                                                                                                                                            ACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACC-------------ACCATGGTAC----TGTACCCTTTACACCCAC---AAACTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGTACCCTATACAACCACCATACCAAC-ATCAT---------CAACTTTACATTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTCAACATCGGCCAAACCAA--ATCTATAAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TATTCATTACAT-GT-ATCCACTCCATC-----GCCAT-ACCAACTCAACTATCCAC
gi|20693                      :                                                                                                                                           aACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACC-------------ACCATGGTAC----TGTACCCTTTACACCCAC---AAACTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGTACCCTATACAACCACCATACAAAC-ATCAT---------CAACTTTACATTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTCAACATCGTCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TATTCATTACAT-GT-ATCCACTCCATC-----GCCAT-ACCAACTCAACTATCCAC
gi|20694                      :                                                                                                                                           aACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTACCAACTCCACC-------------ACCATGGTAC----TGTACTCTTTACACCCACCAGA--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTGGACCCTATACAACCACCATACCAAC-GTCAT---------CAACTTTACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAGCTACATCCTCAACATCTGCCAAACAAA--ATTTATCAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TATTCATTACAT-GT-ATCGACTCCATCACCATACCA--A----CTCAACTATCCAC
gi|20695                      :                                                                                                                                           aACACCTTT-TAGTCTTCATACA--TGTGCCAACTCCACC-------------ACCATGGTAC----TGTACACTTTAAACCCACCAAA--CTAACATTAGCCTACATTATACCCA-CTGTAGCCTATACAACCACCATACCAAC-ATCAT---------CAACTCTACACTCTAAATCTAGTATATTAGCATCATTTTCAACTACATTCTCAACATCTGCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TA-----TACAT-GT-ATCGACTCCATCACCATACCA--A----CTCAACTATCCAC
gi|20696                      :                                                                                                                                           aACACCCTTATAGTCTTCATCCA--TGTACCAACTCCACC-------------ACCATGGTAT----TGTACCTTTAACACCCACCAAA--CTAACACCA--CTATAC-----CCA-CTGTACCCTATACAACCACCATACCAAC-ATCATAAC------CTTCTCCACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTCAATATCTGCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---T-TGTCCT--TTA-----TATTCACTACAT-GT-ATCAGCTCCATCACCATACCA--AC---C-CAACAATCCAC
gi|20697                      :                                                                                                                                           aACACTTTT-CAGTCTTCAAACA--TGTACCAACTCCA-CCACA------------ATGGTACCA---------TTTACACCCACCAAA--CTAACA--T--C-ATTATA---CCCACTTTACCCTATACAACCACCATAACAAC-GTCATCAC---------TTCTACACTCTACATCTAGTATACTAGCACCATTTTCAACTACATCCTTAA
gi|20698                      :                                                                                                                                           aATACCCAT-TACACTACATG-A--TGTACCCTCTACACCCACA---CTATCAACTATAGTACCAGATATACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCATCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACTATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--CTACAGTACCAGA---TGTACCCT--CTA-----CA-----CCCAC-ACAACCAACTATAGTACCA-GATGT-AC---CTCTAC-ACCCAC
gi|20699                      :                                                                                                                                                                            CTTCACCCACA---TAACCAACTATAGTACCAGATGTACCCTCTACACCCAC---A--CGACCA--A--CTATAGTT---CCAGATGTACCCTCTACACCCACATTACCAACTAT-AGTAC------CAACTGTACCCTCAACACCCACTCTACCAACTACATTACCAGCTGTACCATCTACACCCACCATAC
gi|20700                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tCTTCATTCACAATACCAACAGCACTACCAGCTGTACCATCTACACTCACAACACCAA--CAACGCTACCAGC---TGTACCCT--TTA-----CA-----CCCACTAT-ACCAACTATACTACCT-GCTGTAAC---CTCTAC-ACCCAC
gi|20700                      :                                                                                                                                                                  --TGTACCATCTACACTCACA---ACACCAACAACGCTACCAGCTGTACCCTTTACACCCAC---T--ATACCA--A--CTATACTA---CCTGCTGTAACCTCTACACCCACTATACCAAC-AACGCTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATATCGACTACACTACCAGCTGTACTGTCTACACCAATGATAGCAT--TTTCACTACAAGC---TGTACTCTCCTCA-----CC-----CAC-C-AT-ACCAACTACACTACCtataccaacaacgctaccagctgtaccctctacacccaccatatcgactacactaccagctgtactgtctacaccaatgatagcattttcactacaagctgtactctcctcacccaccataccaactacactacc
gi|20701                      :                                                                                                             cttcattcacaataccaacagcactaccagcATACCCAT-TACACTACATG-A--TGTACCCTCTACACCCACA---CTACCAACTATAGTACAAGATGTACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--CTACAGTACCAGA---TGTACC
gi|20702                      :                                                                                                                                                                                 tacatctaccTACCAACTATACTACTTACTGTAACCTCTACACCCAC---A--ATTACA--A--CTACACTG---CAAGCTGTACTGTCTACACCCATGATACCATC-TACACTAC------CAGCTGTACTCTCTTCACCTACCATACCAACTACACTACCAGCTGTATCCTCAACACCCACAATACCAA--CTATATTACAAAC---TGTACCCT--a
gi|20703                      :                                                                                                                                                                                ACCCACT---ATATCATCTATGCTACAAGCCATACCCTCTACACCCAC---C--ATACCA--A--CTACACTT---CCAGCTGTACCCTCAACAACCACCATACTAAC-TACACTAC------CAGCTGTACCCTCAACATCCACCATACCAACTATGCTTTAAACTGTACCCTCAACACCCACCATACCAACTATGCAT--CCAGT---TGTACCAT--CCA-----CA-----CCCACTAT-ATCATGTATGCTACGA-GCCAT-AC---C
gi|20703                      :                                                                                                                                                            CATCCAGTTGTACCATCCACACCCACT---ATATCATGTATGCTACGAGCCATACCCTCTACACTCAC---C--ATACCA--A--CTGCACTA---CCctctacactcaccataccaactgcactacc
gi|20704                      : acccactatatcatctatgctacaagccataccctctacacccaccataccaactacacttccagctgtaccctcaacaaccaccatactaactacactaccagctgtaccctcaacatccaccataccaactatgctttaaactgtaccctcaacacccaccataccaactatgACCCACA---CTACCAACTATAGTACAAGATGTACCCTCTACACCCAC---A--CTACCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--
gi|20705                      :                                                                                                                                                                                      A---CTACCAACTATAGTACCAGATGTACCCTCTACACCCAC---A--ATATCA--A--CTATAGTA---CCAGCTGTACCCTCAACACCCACCATACCAAC-TACATTAC------CAGCTGTACCCTCTACACCCACCATACCCACTACACTACCAGCTGTATCCTCTACATCCACAATACCAA--
gi|20706                      :                                                                                                                                                                                                                                                             ctaCTTTGCCCCATATGACCACCATACCAAC-ATCACTAC------CCACTGTACTCTCTACATTTGTAATACTAGCTCCAATTCAAACATCACCCTCAAAGTCACTCATAACAA--ATCCATTTAACACCCTTATAGTCT--T-------CA-----TCCAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-
gi|20707                      :                                                                                                                                                                                                                                                              caCTGTGCCCCATGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTTGTCATACTGACTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAAT----AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20708                      :                                                                                                                                                                                                                                                               aCTGTGCCCTATGGGCCGACTATACCAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTTGTCATACTGCCTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAAT----AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20709                      :                                                                                                                                                                                                                                                               aCTGTGCCCCGTGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTGA------CAACTGTACTATCTACATTCCTCATACTGATTCCAATTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATT--AAAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-ACCAACTCCACCACCA-t
gi|20710                      :                                                                                                                                                                                                                                                               aCTGTGCCCCATGCGCCCACTATACTAAC-ATCACTAA------CAACTGTACCATCTACATTCGTCATACTTACTCCAATTCCAACTGCACGTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATTA--AAC------ACCTT--TTAGTCTTCA-----TACAT-GT-GCCAACTCCACCACCA-t
gi|20711                      :                                                                                                                                                                                                                                                               aCTGTGCCCCATGGGCCCACTATACCAAC-ATCACTACATGTAACAACTGTACCATCTACATTCGTCATACTAACTCCAGTTCCAACTGCACCTTCAAAATCCATCATACCAA--ATTAATTAAACAC---TTTTCAGT--CTT-----CA-----AACAT-GT-ACCAACTCCACCACt
gi|20711                      :                                                                                                                                           aACACTTTT-CAGTCTTCAAACA--TGTACCAACTCCA-CCACAATGGTACCAaatggtacca
gi|20712                      :                                                                                                                                                                                                                                    actgtgccccatgggcccactataccaacatcactacatgtaacaactgtaccatctacattcgtcatactaactccagttccaactgcaccttcaaaatccatcataccaaattaattaaTTAACATCCGCCAAACCAA--ATCCATAAGACAC---TG-ATCCT--TTA-----TATGCATTACAT-GT-ATCGACTCCGTCACCATACCA--A----CTCAACTATACAC