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Alignments
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lowQualScore                  :             .  ..  ... . .    ..      .               .  .....         ...                          .   ...    .    
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Alignments
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blockSeqs                     :             T  .   C   . .    .       A               G  .             .                            T   .      .
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blockSeqs                     :             C  .   T   . .    .       T               T  .             .                            T   .      .
blockSeqs                     :             .  .   C   . .    .       T               T  .             .                            A   .      .
blockSeqs                     :             .  .   T   . .    .       A               T  .             .                            A   .      .
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blockSeqs                     :             .  .   .   . .    .       A               C  .             .                            T   .      .
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lowQualScore                  :             .  ..  ... . .    ..      .               .  .....         ...                          .   ...    .    
lowQualScore                  :             4  11  888 2 1    99      0               9  88888         333                          1   111    4    
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