lowQualScore : 111 11111 2222222222222222 11 111 666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111 2222222222222222222222222 444444444444444444444444444444 1111111 1111111111111 3333333333333333333333333333 33333333333333333333333 1 1111 444444444444444444444444444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 111 111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111 222222222222 11111 11 1111111111111111 11 1111 111111
lowQualScore : 4 22 9 77 777 555 33333 44 7777777777777777 1 99 77 999999 7 44 3 555 11 3 99999999 33 444 0 2 5555 000 2 2 2 66 33 777777 222222222222222222222222222222222222222222222222 33 2 44 5555 55 88 2 4 5555555 4444 0 2 2 2 1111111111111111111111111 444 33 222222222222222222222222222222 33 1 3 77 7 77 33 33 3333333 1111111111111 2 77777777 1 3333333333333333333333333333 33 8 2 44 33333333333333333333333 44 0 444 1 1 77 6 8888 333333333333333333333333333333 5555 66 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 7 3333 2 2 88 33 0 111111 33 33 2 222 000000 33 777777 5 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 2 1111111111 555 1 555 333333333333 555 77 555 999 6666 88888 7 5 6 11 1 3 4444444444444444 66 11 4 0000 0 66 2 4 222222 0 4 0 4 55 55 3 3
lowQualScore : . .. . .. ... ... ..... .. ................ . .. .. ...... . .. . ... .. . ........ .. ... . . .... ... . . . .. .. ...... ................................................ .. . .. .... .. .. . . ....... .... . . . . ......................... ... .. .............................. .. . . .. . .. .. .. ....... ............. . ........ . ............................ .. . . .. ....................... .. . ... . . .. . .... .............................. .... .. . ................................................................................. .. . .... . . .. .. . ...... .. .. . ... ...... .. ...... . ................................................................ .... . .......... ... . ... ............ ... .. ... ... .... ..... . . . .. . . ................ .. .. . .... . .. . . ...... . . . . .. .. . .
lowQualScore : 0 55 3 00 555 888 55555 66 0000000000000000 2 33 44 666666 2 66 3 888 22 1 44444444 99 777 7 7 7777 333 7 7 7 44 77 222222 555555555555555555555555555555555555555555555555 44 5 44 0000 66 11 4 2 2222222 2222 2 6 4 4 1111111111111111111111111 111 22 777777777777777777777777777777 22 9 0 44 0 11 22 22 0000000 2222222222222 4 22222222 2 5555555555555555555555555555 44 1 5 77 44444444444444444444444 66 3 111 3 0 11 8 7777 222222222222222222222222222222 0000 55 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 6 4444 2 2 77 11 2 000000 11 11 2 888 999999 77 888888 6 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8888 5 7777777777 111 0 444 999999999999 444 88 444 666 5555 55555 7 7 3 44 2 6 8888888888888888 55 00 0 4444 7 77 3 0 222222 8 0 3 6 00 00 6 6
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATA----A--AAGAGGCGA-TTATGACAAAC--T---GAATGANATG-AT-A--------AATA----AC----TT-TGA---TTGG--GA---GTTT--AT-TTN-CN----A--CA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGT-GAAC--GTT--TT--NCAG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAG-A-NG------TAACAATT----C-GACC-NAATGA---CAAACCATGGTACGACTC-NGAAATTAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GAC--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAATA-C--A-AA-CA-NTTAA--GAAACAAAGTN-----AATA--AT--TT-GAAAANA-CATGCTAAAGAACAN-----TATTTTAATAAT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAGA----CA--GCA-G-AA--ATA---CA----AAT-C--CGAAA----CTTTACTGGAAAC--TTCTTA---AAC------AGNTTATT---AAGGAAA---A---CAA----A-----AATNCTGAAACNATNCC-TCCCT-TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTT-CTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( gi|137868 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATA----A--AAGAGATGA-TTATGACAAAC--T---GAATGACATG-AT-A--------AATA----AC----TT-TGA---TTGG--GA---GTTT--AT-TTC-CT----A--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGT-AAAC--GTT--TT--TCAG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAA-A-TA------TAACAAAT----A-GACC-TACTGA---CAAGCCATGGTACGACTC-TGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GAC--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAATA-C--A-AA-CA-GTTAA--GAAACAAAGTT-----AATA--AT--TT-GAAAACG-CATGCTAAAGAACAG-----TACTTTAATAAT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAGA----CA--GCA-G-AA--ATA---CA----AAT-C--CAAAA----CTTTACTGGAAAC--TTCTTA---AAC------AAATCATT---AAGGAAA---A---CAA----A-----AATACTGAAACCATACC-CCCCT-TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTT-CTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATA----A--AAGAGGTGA-TTATGACAAAC--T---GAATGACATG-AT-A--------AATA----AC----TT-TGA---TTGG--GA---GTTT--AT-TTC-CT----A--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGT-AAAC--GTT--TT--TCAG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GTATTCCCTC-CAAAA-A-TA------TAACCAAT----A-GACC-TACTGA---CAAGCCATGGTACGACTC-TGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GAC--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAATA-C--A-AA-CA-GTTAA--GAAACAAAGTT-----AATA--AT--TT-GAAAACG-CATGCTAAAGAACAG-----TACTTTAATAAT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAGA----CA--GCA-G-AA--ATA---CA----AAT-C--CAAAA----CTTTACTGGAAAC--TTCTTA---AAC------AAATCATT---AAGGAAA---A---CAA----A-----AATACTGAAACCATACC-CCCCT-TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTT-CTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATA----A--AAGAGGTGA-TTATGACAAAC--T---GAATGACATG-AT-A--------AATA----AC----TT-TGA---TTGA--GA---GTTT--AT-TTC-CT----A--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGT-AAAT--GTT--TT--TCAG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAG-A-CA------TAACCATC----A-GACC-TACTGA---CAAGCCATGGTACGACTC-TGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GAC--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAATTA-C--A-AA-CA-GTTAA--GAAACAAAGTT-----AATA--AT--TT-GAAAACG-CATGCTAAAGAACAG-----TACTTTAATAAT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAGA----CA--GCA-G-AA--ATA---CA----AAT-C--CAAAA----CTTTACTGGAAAC--TTCTTA---AAC------AAATTATT---AAGAAGA---A---CAA----A-----AATACTGAAACCATACC-TTCCT-TTA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTA-CTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATA----A--AAGAAGCGA-TTATGACAATT--T---GAATGACATG-AT-A--------TATA----AC----TT-TGA---TTGG--GA---GTGT--AT-TTC-CA----C--CA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137872 : ACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----TAA--TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATA----A--TCGGGGTAC-TTATAAGAAAA--T---AAATTAACCG-AT-A--------ATCA----AT----TA-TAA---TTGG--GA-----TG--AT-TTA-C-----A--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGT-GAGC--GTT--TT--ACTA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATA----A--TCGGGGTGA-TTATGAGAAAA--T---GAACGAATTG-AT-A--------ACCA----AT----TT-TAA---CTGG--GA---TTTT---T-TGA-AC----A--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGT-GAGC--GTT--TT--ACTG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAG-A-AG------TA-CAAATT---C-GACC-AAATGA---CAAACCATGGTATGACTC-AGAAATAAGACG--ACA-TT----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GAC--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAATA-C--A-AA-CA-ATTAA--GGAATAAAGTT-----AATA--AT--TT-GAAAACA-CATGCTAAAGAACAA-----TATTTTAATAAT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAGA----T---GCG-A-AT--GTGT--CA----AAT-T--CTAAA----TTATATTGGAAAC--TACTTA---AAC------AGTTTATT---AAATCTA---A---CAA----A-----AACTCAGAAATAATTCC-TCCAC-TAA------AA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGT-CTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATA----A--TCGGGGTGA-TTATGAGAAAA--T---GAACGAATTG-AT-A--------ATCA----AT----TT-TAA---CTGG--G----GTTT--TT-TGA-AC----A--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGC-GAGC--GTT--TT--ACTG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAG-A-AG------TA-CAAATT---C-GACC-AAATGA---CAAACCATGGTATGACTC-AGAAATAAGACG--ACA-TT----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GAC--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAATA-C--A-AA-CA-ATTAA--GGAATAAAGTT-----AATA--AT--TT-GAAAACA-CATGCTAAAGAACAA-----TATTTTAATAAT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAGA----T---GCG-A-AT--GTGT--CA----AAT-T--CTAAA----TTATATTGGAAAC--TACTTA---AAC------AGTTTATT---AAATCTA---A---CAA----A-----AACTCAGAAATAATTCC-TCCAC-TAA------AA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGT-CTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGA----A--AAGAGGGAA-TTATTATATCT--T---GAGTGACATG-AT-G--------CATA----GT----TT-AGA---TTGG--G----GTTA--GT-ATC-CA----C--CT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGT-AAACGTGTT--TT--TTA--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CTATTCTCTC-TAAAG-A-TG------TAACGATC----A-GACC-GACTGA---CAAACCATGGTATGATTC-TGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACA----C--AAAAGGTGA-CTATGA--AACGTT---AAACCGCATG-AT-A--------TTCA----AC----CA-AGA---CTGG--GA---CTTT--AT-TGA-AG----A---A--------CATAAATGACTCATGT-TCAC--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GTATCCCATC-TAGAA-A-AG------TAACAATT----C-GACG-TAATAA---CAAACCCTGGTACGACTC-ACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GAC--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-TGGACATAATA-C--A-AA-CG-TTTAA--GGAACAAGATT-----AACA--AC--TT-GAAAAAG-CATGCAAAAGAAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCC---AGTTATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGG--TTATATTACA--AAGCAA--A-TTTCGACTTGC--T---CAATAATAAA-AT-ATC------AGAA----AC----T---GA---TTGG---A---GC----ATGCTG-CT----AAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAAT--GTT--CT--CTA--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GTATTCCGTCTCAAAC-A--A------TAAC---T------GTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATTC-AGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTTA-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-TGAGCCAAGTA-T--A-AA-CA-TGCAC--GCAACAAAGTA-----AATA--AT--CTAAAAAAAA-AATGCTAAAGAGAAC-----TTTTTTAATAAT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAGACCTTCACTGTA-A-CG--ATA----A----AA------GAGG----CTTT--TGGAAAG--TTGTTC---GAC------ATTTTGTT-------AAATCTA---CAG----ACC---AATG-TGGTTTTATTCC-GCCTT-TGT------GT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTT-TTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CAT--TC----C-C---GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTTATACA----ACGAAGCAA--A-TTTTAATATCC--T---TTATGTTAAA-ATCG--------AATC----A-----TA-TGA---TTGG--GACT-GCTT--AA-TTAACT----G--C-------TCTATTTATGAAGCATGT-GACA--GGT--TT--TCAT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GCATAGCATC-TAAAT-A-AG------TAACTGTT----C-GTCC-AAACGA---CAGGCCTTGGTTCGATTC-AGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GAC--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-TGGTATAAATA-T--A-AG-CAAGTTA---GAAACAAAGTA-----AATAACAT--AT-AAAAA---CAAGCTAAAGAAAAC-----TTTTTTAATAAT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T---A----CA--GTT-G-AACGATA---GA----A-------AAGA----TTTT--TGAAAAA--TTATTA---GAC------ATTTTGTT---A---AAA---ATT-CAG----ACTCTTCAT-CTACAATTCCACC-TCTTTGTAA------AA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT-TAAG------ATTTT-CTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATA----A--ACGAGCTAA-TT-----------T---GAAT-ACTT---T-G--------AATA----ATCTTATT-TCA---TCGACAGACAGGTCA--AT-TTT-ATTAA-A--CA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCC---AAAA--ATC--TT--TCAATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GTAT-------CACAA-A-CAGTCTCTTCACAATC----C-GGCC-AAAAGA---TAAACCATGGTACGACTC-TGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GAC--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-TGG-CAAAATAAC--A-AA-AA-CCTCA--GAAATAAGATT-----AATA--TC--AT-GAAAAAA-CATGCTTAAGAACTT-----TTTTATAATAAT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTGA----CAT-GCA-C-TA--AT----CT----TAT-CAACGAAA------TTATTGGAAAG--CTATCA---AAA------TGTTAATT---AAGGAAA---ATTCTAA----A-----AGCTGTGAGACAGTACCACCACT-CA----------------------TTA---AC-GCT-G----ACA-ATTCGT-ATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATG----A--TAAAGCTGA-TT-T--CCAAC--TTCTAAATGAAAAG-AT-AC-------AAT------C----TTATGA---TTGG--GACT-GTTTGAAT-G-------------A-T-T-----ATA--------GTAT-TAAT--GTTGCTT--GCAG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GTATTCCTTT-TAAGC---TG------TTACAG-T----ACAACC-TGACGA---CAAACCCTGGTTTGACTC-TAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GACTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-TGGATAAAATA-T--AGAA-AA-GTTA---GAAATAAAGTA-----AATA--AC--CT-TATAAAA-CATGCAAAAGAAAAC-----TTTTTTAATAAT----T-TTGAA------TT-------AA----A---TA--TTA-----------CA-G-AA--TTA---CAGTGTAATGA--CAAAAGAGGGTTT--TGGAAGA--TAGTGA---AAT------A---CTTT---ATGAAAA---A---TAC----A-----AATAC
gi|137882 : aAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACA----C--AAAAGGTGA-CTATGA--AACGTT---TAACCGCATG-AT-A--------TCCG----AC----CA-AGA---CTGG--GA---CATT--AT-TGA-AG----A--AC-T-T--GACATAAATGACTCATGT-TCAC--GAT--TT--ACTG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GTATCCCATC-CAAAG-A-AG------TAGTAATT----C-GACC-TAATGA---CAAACCCTGGTACGACTC--------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G-C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-TGGACAAAACA-C--A-AA-CG-TTTAA--GGAACAAGATT-----AACA--AC--TT-GAAAAAG-CATGCAAAAGAACGC-----CTTTTCAACAGCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTGA----CA--G-----------A---C-----AAT-C--CAAAT----CAATACTGGAAAA---TCATAAGGAACTTGGTTAAAAC-TT---AA--AAA---A---TAATAGTA-----AAT-CCGAAACAAT-------CC-TAATACTGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TATGTT--TCTCA-----GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACActcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATA----A--AAAAAGCAAATTTTGAGTTAT--T---AAATAGTA------A--------AATATCGTAT----TT-TAA---ATGG--GACT-GTCT--AT-T---------A--AA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTGAAAT--GTT-------CAC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GTGTACCATT-CAAAA-AATG------TATGTGAT----A-GACA-TGACGA---TGAACCATGGTATGATTC-AGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-----------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-TGGTCTAGATA-CCAA-AA-AA-ATC----GTAAAAAAGTA-----AACA--AC--TT-AAAATAT-CATGCAAACGAAT-------TATTTTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAG--TCATA----A--AAATGGCAA-TTATGTTTCAT--T---AAATGATATGGAT-ATT------AATACAT-AT----TT-TGA--------------------AT-TTC-TTGAAAA--TA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGT-GAAC--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--ATAGTT--TC-AAAAG-A-CG------TCACAATT----C-GACC-TAATGA---CAAACGACGGCATGATTCCTGAA--TAAATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGAC--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-TGGACAAAATA-G--A-AATCA-ATTAA--GAAAAAGAGTTAAAAAAACA--AA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--AACAA-----TACAATAGCAAT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AGA----CG--ATA-GTGA--AT----CC----AAT-C--CTAAG----CTT-----AAAACCATTC-------AC------AAGT-ATTTAAAAAGCGA---G---CGA----A-----AATATT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACG----AT-AAGGGCGAA-TT-TGATAAGT--T---AAATAAAATG-AT-A--------AGTG----A--------TGAAAATTGG--GA---TTAT--AT-AAA-CG----A--AA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGT-TTAC--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GTATTCCTTC-AAAAG-A-AA------TTACTATT----C-GACC-TAATTA---CAAACCTTGGTATGACTC-CGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GGC--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-TGGACAAAATT-T--A-AA-CA-TTTAA--GAAATAAAGTA-----AATA--ATCTTT-AAAAAT----TGCTAAAGAAAAG-----TTTTTTAATAAC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAGA----CT--CTACG-------A---CC----AAC-C--CGAAA----CAATATTGGAAAT--TACTT------CG-----AAAT--TT---GACAAAG---A---CAA----ACAGT-AAAACTGAGACTGTGCCGATCCT-TAA------GACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGT-TACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTAT
gi|137886 : TTAGTTTCATA----A--ACCGGGTAG-TTATGACAAAA--T---GGATGAACTG-AT-ATTTTGGATAATA----AA----TCATAA---TTG----------TT--GT-TTT-AC----A--CATT-T--TTTGCAAACATGACATGT-GAGC--GTT--TT--
gi|137887 : T-AAAG--ATT--TT--ATTG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GTATTC---C-CACAA-A-TCTTT---TAATAATT----C-GTCC-AAGAGA---CAAGCCATGGTACAACTC-CGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GAC--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-----AT------AT-CGAAGT--TTT-T--A-AA-CA-TTTAA--GAAACAAGATA-----AATA--AC--AT-GAAAAAA-CA--CTCAAACATAGAAACTTAATTTGATAAT----aataaaacttttaaatgacaaaccaaggtatgattccgaaataagacgacatccgagacaacataagagacaactgacaaagaacagagacatgaacaaaatacaaacaattaaggatcaaagtaaataatttagaaacacatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137888 : AA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGTATTGCG-C-CAAAACA-TA------TTAC---TCTCCA-GACT-GA-TGG---CAAACCTTGGTACGACTT-TGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GGC--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-TGGAATAAAAA-T--A-AA-TA---TGATTGTAACAAAGTA-----AATA--AT--TT-AAAAAAG-CACGTTAAAGAA
gi|137886 : TGA---CAAACCAAGGTATGATTC-CGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----AC--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACATGAACAAAATA-C--A-AA-CA-ATTAA--GGATCAAAGTA-----AATA--AT--TT-AGAAACA-CATGCTAAAG
gi|137871 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaaaCGTGGTACGACTC-TGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GAC--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TTGACTAAATG-C--A-AA-CA-GTTAA--GAA-CAAAGTA-----AATA--AT--TT-GAAAACA-CATGCCAAAGAATAG-----TACTTTAATAAT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAGA----TA--GCA-G-AA--ATA---CA----AAT-C--CAAAA----CTTGACTGGAAAC--TTCTTA---AAC--------ATTATT---AAGGAAA---A---CAT----A-----TATACTGAAACCATAAG-CCCTT-TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTT-CTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137889 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagGGAC-AAATA-A--A-AA-CA-ATAAA--GGAATAATGTA-----AATA--AT--TT-AAAAAAAACATGCTAAAGAACAA-----TATTTTGATAAT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAATA----TG--AAA-A-AA--ATGTTTCA----AAT-T--CTAAA----TAATATTTGAAAC--TACTTA---AAC------AGTTTATT---AAGACAA---A---CAA----A-----AACTCGGAAATAATTTC-TCCAC-TAA------AA------
gi|137881 : AAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-
Alignments
lowQualScore : 111 11111 22222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111111111111 1111111111111 111111111111111 1111111 1111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111 1111 333333333333333333333333333333 1111 22222222222222222222222222 1111111111111111111111 3333333333333333333333333 11111111111111111111111111 1111 111111 111111 1111111111111111 11 111
lowQualScore : 3 0 99 666 555 11111 44 22222222222 99 0 77 66 888888 2 44 3 555 99 2 8888888 33 444 2 5555 999 2 2 2 55 33 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 0 1 2 2 4 2 9999999 33 666 1 33 2 2 999999999999999999999 333 9999999999999 2 2 999999999999999 33 33 99 1 1 4 33 33 0000000 0000000000000 2 55 0 22 0 6666666666666666666666666666 33 2 1 44 1 33333333333 3 1 2 3 4 7777 666666666666666666666666666666 4444 22 22 2 2222 55555 333 55555555555555555555555555 77777 22 9999999999999999999999 2 22 3 333 2222 2 2 333 1 666666 22 2 1 4 333 888888888 3 0 2 8888888 555555 1 1111111111111111111111111 33 1 5555 77777777777777777777777777 1 1111 0 44 0 1 333333 6666 44 3 555 555 6666 44 1 1 555 1 1 88 000000 0000000000000000 55 00 3 66 2 0 55 11 1 111 3 1 44 44 3 3
lowQualScore : . . .. ... ... ..... .. ........... .. . .. .. ...... . .. . ... .. . ....... .. ... . .... ... . . . .. .. ...... ............................................... .. . . . . . . . ....... .. ... . .. . . ..................... ... ............. . . ............... .. .. .. . . . .. .. ....... ............. . .. . .. . ............................ .. . . .. . ........... . . . . . .... .............................. .... .. .. . .... ..... ... .......................... ..... .. ...................... . .. . ... .... . . ... . ...... .. . . . ... ......... . . . ....... ...... . ......................... .. . .... .......................... . .... . .. . . ...... .... .. . ... ... .... .. . . ... . . .. ...... ................ .. .. . .. . . .. .. . ... . . .. .. . .
lowQualScore : 6 5 00 222 444 77777 22 33333333333 22 2 77 00 888888 1 22 1 444 55 9 7777777 77 444 5 3333 111 5 5 5 44 44 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 22 4 8 6 2 6 4 2 6666666 11 999 0 11 2 2 777777777777777777777 999 2222222222222 2 2 777777777777777 11 44 66 8 1 7 22 11 2222222 9999999999999 1 00 9 99 9 5555555555555555555555555555 11 2 0 55 9 55555555555 0 8 0 6 8 6666 888888888888888888888888888888 5555 99 99 1 0000 33333 777 77777777777777777777777777 77777 99 9999999999999999999999 1 88 0 555 9999 0 0 888 8 333333 99 1 0 2 777 444444444 3 2 4 1111111 666666 0 6666666666666666666666666 77 5 7777 77777777777777777777777777 8 3333 9 22 8 0 222222 5555 77 1 444 444 5555 22 0 4 888 0 0 44 222222 3333333333333333 00 00 6 55 3 5 33 55 0 444 6 0 66 66 3 3
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNCNA--CA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTGAA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GT-ATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACT-CNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-T--GGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACA----GTTTA----TTAAGGA-AA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCCN-CC-CT---TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( family-776 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNCNA--CA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTGAA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GT-ATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCNAATGACAAACCATGGTACGACT-CNGAAATTAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-T--GGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----NAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACA----GNTTA----TTAAGGA-AA---A---CAA----A--AATNCTGAA---ACNATNCCT-CC-CT---TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137868 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGATGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCCTA--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTAAA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GT-ATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACAAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACT-CTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-T--GGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACA----AATCA----TTAAGGA-AA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACCC-CC-CT---TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCCTA--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTAAA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GT-ATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACCAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACT-CTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-T--GGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACA----AATCA----TTAAGGA-AA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACCC-CC-CT---TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGAGA--G----------TTTA-T-T---TCCTA--CA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTAAA-T--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GT-ATTCCCTC-CAAAGAC-----A----TAACCATCAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACT-CTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-T--GGACTAAT---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACA----AATTA----TTAAGAA-GA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACCT-TC-CT---TTA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTACTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATAAAA-GAAGCGA-TTATGACA-----ATT--T---GAATGACAT--G-AT-A--------TATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TGTA-T-T---TCCAC--CA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137871 : CGTGGTACGACT-CTGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-T--TGACTAAA---TG-C--A-AA-CAG--TTAAG-AACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCCAA---AG---------AATAGTACT-TTAATA-------AT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAG----A----TA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTGACTGGAAACTTCTTAAACA------TTA----TTAAGGA-AA---A---CAT----A--TATACTGAA---ACCATAAGC-CC-TT---TAA------AA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTTCTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137872 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TAT
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----T-AA-TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTAC-TTATAAGA-----AAA--T---AAATTAACC--G-AT-A--------ATCA----ATTA-TAA---TTGGGA--------------TGA-T-T---TAC-A--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTGAG-C--GTT--TTAC--TA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ACCA----ATTT-TAA---CTGGGA--T----------TTT--T-T---GAACA--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTGAG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GT-ATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACT-CAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-T--GGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACA----GTTTA----TTAAATC-TA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCCT-CC-AC---TAA------AA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ATCA----ATTT-TAA---CTGGG---G----------TTTT-T-T---GAACA--CA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGCGAG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GT-ATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACT-CAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-T--GGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACA----GTTTA----TTAAATC-TA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCCT-CC-AC---TAA------AA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGAAAA-GAGGGAA-TTATTATA-----TCT--T---GAGTGACAT--G-AT-G--------CATA----GTTT-AGA---TTGGG---G----------TTAG-T-A---TCCAC--CT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGTAAA-CGTGTT--TTTT--A--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CT-ATTCTCTC-TAAAGAT-----G----TAACGATCAGACCGACTGACAAACCATGGTATGATT-CTGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGA-------AACGTT---AAACCGCAT--G-AT-A--------TTCA----ACCA-AGA---CTGGGA--C----------TTTA-T-T---GAAGA---A--------CATAAATGACTCATGTTCA-C--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GT-ATCCCATC-TAGAAAA-----G----TAACAATTCGACGTAATAACAAACCCTGGTACGACT-CACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GA--C--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-T--GGACATAA---TA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCCAGT---TATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGGTTATATTACA-AAGCAAA-TTTCGACT-----TGC--T---CAATAATAA--A-AT-ATC------AGAA----ACT---GA---TTGG-A--G----------C--A-TGC---TGCTAAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAAT--GTT--CTCT--A--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GT-ATTCCGTCTCAAACAA----------TAACTGTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATT-CAGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTT--A-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-T--GAGCCAAG---TA-T--A-AA-CAT--GCACGCAACAAAGT-----AAATAAT--CTAAAAAAAA-AATGCTAA---AG---------AGAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAG----ACCTTCACTG-TA-A-CG--AT-A----AAA-----GAGGCTTT--TGGAAAGTTGTTCGACA----TTTTG----TT----A-AATCTA---CAG----ACCAATG-TGGT---TTTATTCCG-CC-TT---TGT------GT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTTTTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CATTCCC----------GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTT--ATACAACGAAGCAAATTTTAATA-----TCC--T---TTATGTTAA--A-ATCG--------AATC----A-TA-TGA---TTGGGACTG----------CTTAAT-TAACTGCTC--TA-T-T--T------ATGAAGCATGTGAC-A--GGT--TTTC--AT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GC-ATAGCATC-TAAATAA-----G----TAACTGTTCGTCCAAACGACAGGCCTTGGTTCGATT-CAGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GA--C--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-T--GGTATAAA---TA-T--A-AG-CAA--GTTAGAAACAAAGT-----AAATAAC--AT-ATAAAAA-CAAGCTAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T-------A----CA--G-TT-G-AACGAT-A---GAAA------AGATTTT--TGAAAAATTATTAGACA----TTTTG----TTA---A-AA---A---TTC----A--GACTCTTCATCTACAATTCCA-CCTCTTTGTAA------AA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT---TAAG----ATTTTCTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATAAAC-GAGCTAA-TT-TGA-A-----TAC--TTT-GAATAATCT------------------TA------TT-TCA---TCGACA--GACAGGTCAATTTTA-T-T-----AAA--CA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCCA--AA-A--ATC--TTTC--AATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GT-AT--CA---CAAACAG-----TCTCTTCACAATCCGGCCAAAAGATAAACCATGGTACGACT-CTGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GA--C--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-T--GG-CAAAA---TAAC--A-AA-AAC--CTCAGAAATAAGAT-----TAATATC--AT-GAAAAAA-CATGCTTA---AG---------AACTTTTTT-ATAATA-------AT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTG----A----CAT-G-CA-C-TA--AT-----CTTATCAACGAAA--TTATTGGAAAGCTATCAAAAT----GTTAA----TTAAGGA-AA---ATTCTAA----A--AGCTGTGAG---ACAGTACCA-CCACT---CA----------------------TTA---AC-GCT-GAC----A-ATTCGTATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATGATA-AAGCTGA-TT-T--CC-----AAC--TTCTAAATGAAAA--G-AT-AC-------AAT------CTTATGA---TTGGGA--------------CTG-T-T---TGAAT--GA-T-T-----ATAG--------TATTAA-T--GTTGCTTGC--AG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GT-ATTCCTTT-TAA-GCT-----G----TTACAGTACAACCTGACGACAAACCCTGGTTTGACT-CTAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GA--CTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-T--GGATAAAA---TA-T--AGAA-AAG--TTA-GAAATAAAGT-----AAATAAC--CT-TATAAAA-CATGCAAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TTGAA-------T-------TAAAT-A---TT--ACAGAATTA----CA--G-T--G-TA--ATGA---CAAA----AGAGGGTTT--TGGAAGATAGTGAAATA----CTTTA----T---GAA-AA---A---TAC----A--AATAC
gi|137881 : aAAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-ctcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137882 : attcgggtattatagatatctccagacatattagcgaccataaagcaacaattattattttaccttttcattatcagcttcatagcacttatgaaagaaatatttggttatatgataaagctgatttccaacttctaaatgaaaagatacaatcttatgattgggactgtttgaatgattatagtattaatgttgcttgcagaaaattgactgatatttttatatctatggtttaacaatgtattccttttaagctgttacagtacaacctgacgacaaaccctggtttgactctaaacttagaaaacatttacgaataagagatagacttaaaaaattgcatcgaaaagttggaagtcgaatgattggataaaatatagaaaagttagaaataaagtaaataaccttataaaacatgcaaaagaaaacttttttaataattttgaattaaatattacagaattacagtgtaatgacaaaagagggttttggaagatagtgaaatactttatgaaaaatacaaatacctcatcgactatataaaaaatactacatttcAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGAAACGTTTAAC--C---GCATGATATCCG-AC-C--------AA------------GA---CTGGGA--C----------ATTA-T-T---GAAGA--AC-T-T--GACATAAATGACTCATGTTCA-C--GAT--TTAC--TG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GT-ATCCCATC-CAAAGAA-----G----TAGTAATTCGACCTAATGACAAACCCTGGTACGACT-C-------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G---C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-T--GGACAAAA---CA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AACGCCTTT-TCAACA-------GCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTG----A----CA--GAC-----A--AT-C---CAAATC----AA----TACTGGAAAA-TCATAAGGAACTTGGTTAAAACTTAA--A-AA---A---TAATAGTA--AATCC-GAA---ACAATCC-----------TAATACTGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TA---TGTTTCTCA---GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACA
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATAAAA-AAAGCAAATTTTGAGT-----TAT--T---AAATAGTA--------A--------AATATCGTATTT-TAA---ATGGGACTG----------TCTA-T-T-------A--AA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTGAAAT--GTT-----C--AC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GT-GTACCATT-CAAAAAATGTATG----TGATA----GACATGACGATGAACCATGGTATGATT-CAGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-------------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-T--GGTCTAGA---TA-CCAA-AA-AAA--TC--GTAAAAAAGT-----AAACAAC--TT--AAAATATCATGCAAA---CG---------A--ATTATT-TTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAGTC--ATAAAA-ATGGCAA-TTATGTTT-----CAT--T---AAATGATAT--GGAT-ATT------AATACAT-ATTT-TGA-----------A----------TTTC-T-T---GAAAA--TA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGTGAA-C--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--AT-AGT--TTC-AAAAGAC-----G----TCACAATTCGACCTAATGACAAACGACGGCATGATTCCTGAA--TAAATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGA--C--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-T--GGACAAAA---TA-G--A-AATCAA--TTAAGAAAAAGAGTTAAAAAAACAAA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--------------AACAATACA-ATAGCA-------AT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AG----A----CG--A-TA-GTGA--AT-----CCAATC--CTAAGCTT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACGATA-AGGGCGA-ATTTGATA-----AGT--T---AAATAAAAT--G-AT-A--------AGTG----A----TGAAAATTGGGA--T----------TATA-T-A---AACGA--AA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGTTTA-C--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GT-ATTCCTTC-AAAAGAA-----A----TTACTATTCGACCTAATTACAAACCTTGGTATGACT-CCGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GG--C--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-T--GGACAAAA---TT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAATAAAGT-----AAATAATCTTT-AAAAAT----TGCTAA---AG---------AAAAGTTTT-TTAATA-------AC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAG----A----CT--C-TACG--------A---CCAACC--CGAAACAATATTGGAAATTACTTCGA-A----ATTTG----ACAAAGACAA---A---CAG----T--AAAACTGAG---ACTGTGCCGATC-CT---TAA------GACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGTTACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTATaaaaccattcacaagtatttaaaaagcgagcgaaaatatt
gi|137886 : TTAGTTTCATAAAC-CGGGTAG-TTATGACA-----AAA--T---GGATGAACT--G-AT-ATTTTGGATAATA----AATCATAA---TTG-----------------TTG-T-T---TTACA--CATT-T--TTTGCAAACATGACATGTGAG-C--GTT--TTAA--TA-AAA---------C---TTT-TA--AATG--ACAA------A---CC-----AAG--G-----T--ATGATTCCG----AAATAA-----GA---CGAC-ATCCGA------GACAA--CATA-----------------AGA---GACA-A-----CT----------GA--C-----------------------A-AA--G-AAC-----A---GA-----G---ACATG-----A--A----CAAAA----TA--C---------AA----AC-----AAT-TAAGGATCAAA----G-T--A-AA-TAA--TTTAGAAACA
gi|137886 : AATGACAAACCAAGGTATGATT-CCGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----A--C--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACAT--GAACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGATCAAAGT-----AAATAAT--TT-AGAAACA-CATGCTAA---AGTGCCACATAAACA-TATCGTTGATATATGCACAT----A-GTGAA---A--TT-------TA----T---CT--TT-----------TA--G-CA---AT--TT-A---CAAATC-----GACTTTcatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137887 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaTT--TTAT--TG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GT-ATTCCCAC-AAATCTT-----T----TAATAATTCGTCCAAGAGACAAGCCATGGTACAACT-CCGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GA--C--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-------------AT------ATCGAAGTTTT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAACAAGAT-----AAATAAC--AT-GAAAAAA-CACTCAAACATAG---------AAACTTAAT-TTGATA-------AT----
gi|137888 : taaagaAA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGT-ATTGCGCC-AAAACAT-----A----TTACTCTCCAGACTGATGGCAAACCTTGGTACGACT-TTGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GG--C--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-T--GGAATAAA---AA-T--A-AA-TATGATT--GTAACAAAGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAG-CACGTTAA---AG---------AA
gi|137889 : --GGAC-AAA---TA-A--A-AA-CAA--TAAAGGAATAATGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAAACATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTGATA-------AT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAAT----A----TG--A-AA-A-AA--AT-GTTTCAAATT--CTAAATAATATTTGAAACTACTTAAACA----GTTTA----TTAAGAC-AA---A---CAA----A--AACTCGGAA---ATAATTTCT-CC-AC---TAA------AA------
Alignments
lowQualScore : 111 11111 22222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222 1111111111111 222222222 1111111 1111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111 1111 333333333333333333333333333333 1111 22222222222222222222222222 2222222222222222222222 3333333333333333333333333 11111111111111111111111111 1111 1111111 11111111 11 111
lowQualScore : 3 0 99 666 555 11111 44 22222222222 99 0 77 66 888888 2 44 3 555 99 2 8888888 33 444 2 5555 999 2 2 2 55 33 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 0 1 2 2 4 2 9999999 33 666 1 33 2 2 111111111111111111111 333 9999999999999 2 2 000000000 0 888 33 33 99 1 33 2 33 33 0000000 0000000000000 2 5555 33 0 7777777777777777777777777777 33 1 33 1 22222222222 0 0 0 3 3 6666 555555555555555555555555555555 4444 33 33 2 3333 555555555 44444444444444444444444444 7777 33 2222222222222222222222 22 3 333 2 22 2 2 333 777777 22 2 1 4 333 888888888 3 0 2 8888888 555555 1 1111111111111111111111111 33 1 5555 77777777777777777777777777 1 1111 2 44 0 1 5 3 3333333 3 888 555 6666 44 22 555 1 1 44 999999 00000000 55 00 3 66 2 0 55 11 1 111 3 1 44 44 3 3
lowQualScore : . . .. ... ... ..... .. ........... .. . .. .. ...... . .. . ... .. . ....... .. ... . .... ... . . . .. .. ...... ............................................... .. . . . . . . . ....... .. ... . .. . . ..................... ... ............. . . ......... . ... .. .. .. . .. . .. .. ....... ............. . .... .. . ............................ .. . .. . ........... . . . . . .... .............................. .... .. .. . .... ......... .......................... .... .. ...................... .. . ... . .. . . ... ...... .. . . . ... ......... . . . ....... ...... . ......................... .. . .... .......................... . .... . .. . . . . ....... . ... ... .... .. .. ... . . .. ...... ........ .. .. . .. . . .. .. . ... . . .. .. . .
lowQualScore : 6 5 00 222 444 77777 22 33333333333 22 2 77 00 888888 1 22 1 444 55 9 7777777 77 444 5 3333 111 5 5 5 44 44 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 22 4 8 6 2 6 4 2 6666666 11 999 0 11 2 2 111111111111111111111 999 2222222222222 2 2 555555555 1 111 11 44 66 8 55 4 22 11 2222222 9999999999999 1 2222 11 6 7777777777777777777777777777 22 0 99 1 55555555555 8 1 5 1 8 2222 888888888888888888888888888888 7777 11 11 2 2222 888888888 00000000000000000000000000 8888 11 3333333333333333333333 66 1 777 1 99 1 1 999 222222 99 1 0 2 777 444444444 3 2 4 1111111 666666 0 6666666666666666666666666 77 5 7777 77777777777777777777777777 8 3333 6 22 8 0 8 1 6666666 1 555 444 5555 22 99 888 0 0 33 555555 00000000 00 00 6 55 3 5 33 55 0 444 6 0 66 66 3 3
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGA-AA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( family-776 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAGTTT-ATTAA-----GGA-AA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137868 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGATGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACAAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGA-AA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACCAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGA-AA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGAGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-T--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAGAC-----A----TAACCATCAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAT---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATT-ATTAA-----GAA-GA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-TTC-CT---TTAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTACTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATAAAA-GAAGCGA-TTATGACA-----ATT--T---GAATGACAT--G-AT-A--------TATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TGTA-T-T---TCC--ACCA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137871 : CGTGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TTGACTAAA---TG-C--A-AA-CAG--TTAAGAA-CAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCCAA---AG---------AATAGTACT-TTAATA-------AT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAG----A----TA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTGACTGGAAACTTCTTAAACA--TT-ATTAA-----GGA-AA---A---CAT----A--TATACTGAA---ACCATAAG-CCC-TT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTTCTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137872 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TAT
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----T-AA-TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTAC-TTATAAGA-----AAA--T---AAATTAACC--G-AT-A--------ATCA----ATTA-TAA---TTGGGA--------------TGA-T-T---TAC---ACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ACCA----ATTT-TAA---CTGGGA--T----------TTT--T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATC-TA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ATCA----ATTT-TAA---CTGGG---G----------TTTT-T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGCG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATC-TA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGAAAA-GAGGGAA-TTATTATA-----TCT--T---GAGTGACAT--G-AT-G--------CATA----GTTT-AGA---TTGGG---G----------TTAG-T-A---TCC--ACCT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGTA-AA-CGTGTT--TTTT--A--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CTATTCTCTC-TAAAGAT-----G----TAACGATCAGACCGACTGACAAACCATGGTATGATTCTGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGA-------AACGTT---AAACCGCAT--G-AT-A--------TTCA----ACCA-AGA---CTGGGA--C----------TTTA-T-T---GAA--GA-A--------CATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GTATCCCATC-TAGAAAA-----G----TAACAATTCGACGTAATAACAAACCCTGGTACGACTCACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GA--C--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-TGGACATAA---TA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCCAGT---TATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGGTTATATTACA-AAGCAAA-TTTCGACT-----TGC--T---CAATAATAA--A-AT-ATC------AGAA----AC---TGA---TT-GGA--G------------CA-TGC---TGCTAAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAA-T--GTT--CTCT--A--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GTATTCCGTCTCAAACAA----------TAACTGTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATTCAGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTT--A-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-TGAGCCAAG---TA-T--A-AA-CAT--GCACGCAACAAAGT-----AAATAAT--CTAAAAAAAA-AATGCTAA---AG---------AGAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAG----ACCTTCACTG-TA-A-CG--AT-A----AAA-----GAGGCTTT--TGGAAAGTTGTTCGACATTTT-GTT---------A-AATCTA---CAG----ACCAATG-TGGT---TTTATTCC-GCC-TT---TGTGT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTTTTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CATTCCC----------GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTT--ATACAACGAAGCAAATTTTAATA-----TCC--T---TTATGTTAA--A-ATCG--------AATC----A-TA-TGA---TTGGGACTG----------CTTAAT-TAACTGC--TCTA-T-T--T------ATGAAGCATGTG-AC-A--GGT--TTTC--AT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GCATAGCATC-TAAATAA-----G----TAACTGTTCGTCCAAACGACAGGCCTTGGTTCGATTCAGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GA--C--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-TGGTATAAA---TA-T--A-AG-CAA--GTTAGAAACAAAGT-----AAATAAC--AT-ATAAAAA-CAAGCTAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T-------A----CA--G-TT-G-AACGAT-A---GAAA------AGATTTT--TGAAAAATTATTAGACATTTT-GTTA--------A-AA---A---TTC----A--GACTCTTCATCTACAATTCC-ACCTCTTTGTAAAA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT---TAAG----ATTTTCTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATAAAC-GAGCTAA-TT-TGA-A-----TAC--TTT-GAATAATCT------------------TA------TT-TCA---TCGACA--GACAGGTCAATTTTA-T-T-----A--AACA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCCA---AA-A--ATC--TTTC--AATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GTAT--CA---CAAACAG-----TCTCTTCACAATCCGGCCAAAAGATAAACCATGGTACGACTCTGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GA--C--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-TGG-CAAAA---TAAC--A-AA-AAC--CTCAGAAATAAGAT-----TAATATC--AT-GAAAAAA-CATGCTTA---AG---------AACTTTTTT-ATAATA-------AT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTG----A----CAT-G-CA-C-TA--AT-----CTTATCAACGAAA--TTATTGGAAAGCTATCAAAATGTTA-ATTAA-----GGA-AA---ATTCTAA----A--AGCTGTGAG---ACAGTACC-ACCACT---CA----------------TTA---AC-GCT-GAC----A-ATTCGTATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATGATA-AAGCTGA-TT-T--CC-----AAC--TTCTAAATGAAAA--G-AT-AC-------AAT------CTTATGA---TTGGGA--------------CTG-T-T---TGA--ATGA-T-T-----ATAG--------TATT-AA-T--GTTGCTTGC--AG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GTATTCCTTT-TAA-GCT-----G----TTACAGTACAACCTGACGACAAACCCTGGTTTGACTCTAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GA--CTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-TGGATAAAA---TA-T--AGAA-AAG--TTA-GAAATAAAGT-----AAATAAC--CT-TATAAAA-CATGCAAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TTGAA-------T-------TAAAT-A---TT--ACAGAATTA----CA--G-T--G-TA--ATGA---CAAA----AGAGGGTTT--TGGAAGATAGTGAAATACTTT-ATGAA-------A-AAT--A---CAA----A--TAC
gi|137881 : aAAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-ctcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137882 : attcgggtattatagatatctccagacatattagcgaccataaagcaacaattattattttaccttttcattatcagcttcatagcacttatgaaagaaatatttggttatatgataaagctgatttccaacttctaaatgaaaagatacaatcttatgattgggactgtttgaatgattatagtattaatgttgcttgcagaaaattgactgatatttttatatctatggtttaacaatgtattccttttaagctgttacagtacaacctgacgacaaaccctggtttgactctaaacttagaaaacatttacgaataagagatagacttaaaaaattgcatcgaaaagttggaagtcgaatgattggataaaatatagaaaagttagaaataaagtaaataaccttataaaacatgcaaaagaaaacttttttaataattttgaattaaatattacagaattacagtgtaatgacaaaagagggttttggaagatagtgaaatactttatgaaaaatacaaatacctcatcgactatataaaaaatactacatttcAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGAAACGTTTAAC--C---GCATGATATCCG-AC-C--------AA------------GA---CTGGGA--C----------ATTA-T-T---GAA--GAAC-T-T--GACATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TTAC--TG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GTATCCCATC-CAAAGAA-----G----TAGTAATTCGACCTAATGACAAACCCTGGTACGACTC-------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G---C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-TGGACAAAA---CA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AACGCCTTT-TCAACA-------GCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTG----A----CA--GACA-------AT-C---CAAATC-----AA---TACTGGAAAA-TCATAAGGAACTTGGTTAAAACTTAAA-AA---A---TAATAGTA--AA-TCCGAA---ACAATCCT-AAT-AC---TGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TA---TGTTTCTCA---GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACA
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATAAAA-AAAGCAAATTTTGAGT-----TAT--T---AAATAGTA--------A--------AATATCGTATTT-TAA---ATGGGACTG----------TCTA-T-T---------AAA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTG-AAAT--GTT-----C--AC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GTGTACCATT-CAAAAAATGTATG----TGATA----GACATGACGATGAACCATGGTATGATTCAGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-------------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-TGGTCTAGA---TA-CCAA-AA-AAA--TC--GTAAAAAAGT-----AAACAAC--TT--AAAATATCATGCAAA---CG---------A--ATTATT-TTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAGTC--ATAAAA-ATGGCAA-TTATGTTT-----CAT--T---AAATGATAT--GGAT-ATT------AATACAT-ATTT-TGA-----------A----------TTTC-T-T---GAA--AATA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGTG-AA-C--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--ATAGT--TTC-AAAAGAC-----G----TCACAATTCGACCTAATGACAAACGACGGCATGATTCCTGAATAA-ATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGA--C--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-TGGACAAAA---TA-G--A-AATCAA--TTAAGAAAAAGAGTTAAAAAAACAAA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--------------AACAATACA-ATAGCA-------AT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AG----A----CG--A-TA-GTGA--AT-----CCAATC--CTAAGCTT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACGATA-AGGGCGA-ATTTGATA-----AGT--T---AAATAAAAT--G-AT-A--------AGTG----A----TGAAAATTGGGA--T----------TATA-T-A---AAC--GAAA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGTT-TA-C--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GTATTCCTTC-AAAAGAA-----A----TTACTATTCGACCTAATTACAAACCTTGGTATGACTCCGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GG--C--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-TGGACAAAA---TT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAATAAAGT-----AAATAATCTTT-AAAAAT----TGCTAA---AG---------AAAAGTTTT-TTAATA-------AC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAG----A----CT--C-TACG--------A---CCAACC--CGAAACAATATTGGAAATTACTTCGA-AATTT-GACAA-----AGACAA---A---CAG----T--AAAACTGAG---ACTGTGCCGATC-CT---TAAGACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGTTACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTATaaaaccattcacaagtatttaaaaagcgagcgaaaatatt
gi|137886 : TTAGTTTCATAAAC-CGGGTAG-TTATGACA-----AAA--T---GGATGAACT--G-AT-ATTTTGGATAATA----AATCATAA---TTG-----------------TTG-T-T---TTA--CACATT-T--TTTGCAAACATGACATGTG-AG-C--GTT--TTAA--TA-AAA---------C---TTT-TA--
gi|137886 : AATGACAAACCAAGGTATGATTCCGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----A--C--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACATGAACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGATCAAAGT-----AAATAAT--TT-AGAAACA-CATGCTAA---AGTGCCACATAAACA-TATCGTTGATATATGCACAT----A-GTGAA---A--TT-------TA----T---CT--TT-----------TA--G-CA---AT--TT-A---CAAATC-----GACTTTaatgacaaaccaaggtatgattccgaaataagacgacatccgagacaacataagagacaactgacaaagaacagagacatgaacaaaatacaaacaattaaggatcaaagtaaataatttagaaacacatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137887 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaTT--TTAT--TG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GTATTCCCAC-AAATCTT-----T----TAATAATTCGTCCAAGAGACAAGCCATGGTACAACTCCGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GA--C--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-------------AT----ATCGAAGTTTT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAACAAGAT-----AAATAAC--AT-GAAAAAA-CACTCAAACATAG---------AAACTTAAT-TTGATA-------AT----
gi|137888 : taaagaAA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGTATTGCGCC-AAAACAT-----A----TTACTCTCCAGACTGATGGCAAACCTTGGTACGACTTTGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GG--C--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-TGGAATAAA---AA-T--A-AA-TATGATT--GTAACAAAGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAG-CACGTTAA---AG---------AA
gi|137889 : GGAC-AAA---TA-A--A-AA-CAA--TAAAGGAATAATGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAAACATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTGATA-------AT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAAT----A----TG--A-AA-A-AA--AT-GTTTCAAATT--CTAAATAATATTTGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----GAC-AA---A---CAA----A--AACTCGGAA---ATAATTTC-TCC-AC---TAAAA------
Alignments
lowQualScore : 111 11111 22222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222 1111111111111 222222222 1111111 1111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111 1111 333333333333333333333333333333 1111 22222222222222222222222222 2222222222222222222222 3333333333333333333333333 11111111111111111111111111 1111 1111111 11111111 11 111
lowQualScore : 3 0 99 666 555 11111 44 22222222222 99 0 77 66 888888 2 44 3 555 99 2 8888888 33 444 2 5555 999 2 2 2 55 33 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 0 1 2 2 4 2 9999999 33 666 1 33 2 2 111111111111111111111 333 9999999999999 2 2 000000000 0 888 33 33 99 1 33 2 33 33 0000000 0000000000000 2 5555 33 0 7777777777777777777777777777 33 1 33 1 22222222222 0 0 0 3 3 6666 555555555555555555555555555555 4444 33 33 2 3333 555555555 44444444444444444444444444 7777 33 2222222222222222222222 22 3 333 2 22 2 2 333 777777 22 2 1 4 333 888888888 3 0 2 8888888 555555 1 1111111111111111111111111 33 1 5555 77777777777777777777777777 1 1111 2 44 0 1 4 3 3333333 888 555 6666 44 22 555 1 1 44 999999 00000000 55 00 3 66 2 0 55 11 1 111 3 1 44 44 3 3
lowQualScore : . . .. ... ... ..... .. ........... .. . .. .. ...... . .. . ... .. . ....... .. ... . .... ... . . . .. .. ...... ............................................... .. . . . . . . . ....... .. ... . .. . . ..................... ... ............. . . ......... . ... .. .. .. . .. . .. .. ....... ............. . .... .. . ............................ .. . .. . ........... . . . . . .... .............................. .... .. .. . .... ......... .......................... .... .. ...................... .. . ... . .. . . ... ...... .. . . . ... ......... . . . ....... ...... . ......................... .. . .... .......................... . .... . .. . . . . ....... ... ... .... .. .. ... . . .. ...... ........ .. .. . .. . . .. .. . ... . . .. .. . .
lowQualScore : 6 5 00 222 444 77777 22 33333333333 22 2 77 00 888888 1 22 1 444 55 9 7777777 77 444 5 3333 111 5 5 5 44 44 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 22 4 8 6 2 6 4 2 6666666 11 999 0 11 2 2 111111111111111111111 999 2222222222222 2 2 555555555 1 111 11 44 66 8 55 4 22 11 2222222 9999999999999 1 2222 11 6 7777777777777777777777777777 22 0 99 1 55555555555 8 1 5 1 8 2222 888888888888888888888888888888 7777 11 11 2 2222 888888888 00000000000000000000000000 8888 11 3333333333333333333333 66 1 777 1 99 1 1 999 222222 99 1 0 2 777 444444444 3 2 4 1111111 666666 0 6666666666666666666666666 77 5 7777 77777777777777777777777777 8 3333 6 22 8 0 0 1 6666666 555 444 5555 22 99 888 0 0 33 555555 00000000 00 00 6 55 3 5 33 55 0 444 6 0 66 66 3 3
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( family-776 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137868 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGATGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACAAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACCAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGAGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-T--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAGAC-----A----TAACCATCAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAT---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATT-ATTAA-----GAAGA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-TTC-CT---TTAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTACTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATAAAA-GAAGCGA-TTATGACA-----ATT--T---GAATGACAT--G-AT-A--------TATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TGTA-T-T---TCC--ACCA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137871 : CGTGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TTGACTAAA---TG-C--A-AA-CAG--TTAAGAA-CAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCCAA---AG---------AATAGTACT-TTAATA-------AT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAG----A----TA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTGACTGGAAACTTCTTAAACA--TT-ATTAA-----GGAAA---A---CAT----A--TATACTGAA---ACCATAAG-CCC-TT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTTCTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137872 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TAT
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----T-AA-TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTAC-TTATAAGA-----AAA--T---AAATTAACC--G-AT-A--------ATCA----ATTA-TAA---TTGGGA--------------TGA-T-T---TAC---ACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ACCA----ATTT-TAA---CTGGGA--T----------TTT--T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ATCA----ATTT-TAA---CTGGG---G----------TTTT-T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGCG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGAAAA-GAGGGAA-TTATTATA-----TCT--T---GAGTGACAT--G-AT-G--------CATA----GTTT-AGA---TTGGG---G----------TTAG-T-A---TCC--ACCT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGTA-AA-CGTGTT--TTTT--A--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CTATTCTCTC-TAAAGAT-----G----TAACGATCAGACCGACTGACAAACCATGGTATGATTCTGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGA-------AACGTT---AAACCGCAT--G-AT-A--------TTCA----ACCA-AGA---CTGGGA--C----------TTTA-T-T---GAA--GA-A--------CATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GTATCCCATC-TAGAAAA-----G----TAACAATTCGACGTAATAACAAACCCTGGTACGACTCACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GA--C--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-TGGACATAA---TA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCCAGT---TATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGGTTATATTACA-AAGCAAA-TTTCGACT-----TGC--T---CAATAATAA--A-AT-ATC------AGAA----AC---TGA---TT-GGA--G------------CA-TGC---TGCTAAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAA-T--GTT--CTCT--A--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GTATTCCGTCTCAAACAA----------TAACTGTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATTCAGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTT--A-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-TGAGCCAAG---TA-T--A-AA-CAT--GCACGCAACAAAGT-----AAATAAT--CTAAAAAAAA-AATGCTAA---AG---------AGAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAG----ACCTTCACTG-TA-A-CG--AT-A----AAA-----GAGGCTTT--TGGAAAGTTGTTCGACATTTT-GTT---------AAATCTA---CAG----ACCAATG-TGGT---TTTATTCC-GCC-TT---TGTGT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTTTTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CATTCCC----------GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTT--ATACAACGAAGCAAATTTTAATA-----TCC--T---TTATGTTAA--A-ATCG--------AATC----A-TA-TGA---TTGGGACTG----------CTTAAT-TAACTGC--TCTA-T-T--T------ATGAAGCATGTG-AC-A--GGT--TTTC--AT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GCATAGCATC-TAAATAA-----G----TAACTGTTCGTCCAAACGACAGGCCTTGGTTCGATTCAGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GA--C--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-TGGTATAAA---TA-T--A-AG-CAA--GTTAGAAACAAAGT-----AAATAAC--AT-ATAAAAA-CAAGCTAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T-------A----CA--G-TT-G-AACGAT-A---GAAA------AGATTTT--TGAAAAATTATTAGACATTTT-GTTA--------AAA---A---TTC----A--GACTCTTCATCTACAATTCC-ACCTCTTTGTAAAA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT---TAAG----ATTTTCTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATAAAC-GAGCTAA-TT-TGA-A-----TAC--TTT-GAATAATCT------------------TA------TT-TCA---TCGACA--GACAGGTCAATTTTA-T-T-----A--AACA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCCA---AA-A--ATC--TTTC--AATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GTAT--CA---CAAACAG-----TCTCTTCACAATCCGGCCAAAAGATAAACCATGGTACGACTCTGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GA--C--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-TGG-CAAAA---TAAC--A-AA-AAC--CTCAGAAATAAGAT-----TAATATC--AT-GAAAAAA-CATGCTTA---AG---------AACTTTTTT-ATAATA-------AT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTG----A----CAT-G-CA-C-TA--AT-----CTTATCAACGAAA--TTATTGGAAAGCTATCAAAATGTTA-ATTAA-----GGAAA---ATTCTAA----A--AGCTGTGAG---ACAGTACC-ACCACT---CA----------------TTA---AC-GCT-GAC----A-ATTCGTATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATGATA-AAGCTGA-TT-T--CC-----AAC--TTCTAAATGAAAA--G-AT-AC-------AAT------CTTATGA---TTGGGA--------------CTG-T-T---TGA--ATGA-T-T-----ATAG--------TATT-AA-T--GTTGCTTGC--AG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GTATTCCTTT-TAA-GCT-----G----TTACAGTACAACCTGACGACAAACCCTGGTTTGACTCTAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GA--CTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-TGGATAAAA---TA-T--AGAA-AAG--TTA-GAAATAAAGT-----AAATAAC--CT-TATAAAA-CATGCAAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TTGAA-------T-------TAAAT-A---TT--ACAGAATTA----CA--G-T--G-TA--ATGA---CAAA----AGAGGGTTT--TGGAAGATAGTGAAATACTTT-ATGAA-------AAAT--A---CAA----A--TAC
gi|137881 : aAAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-ctcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137882 : attcgggtattatagatatctccagacatattagcgaccataaagcaacaattattattttaccttttcattatcagcttcatagcacttatgaaagaaatatttggttatatgataaagctgatttccaacttctaaatgaaaagatacaatcttatgattgggactgtttgaatgattatagtattaatgttgcttgcagaaaattgactgatatttttatatctatggtttaacaatgtattccttttaagctgttacagtacaacctgacgacaaaccctggtttgactctaaacttagaaaacatttacgaataagagatagacttaaaaaattgcatcgaaaagttggaagtcgaatgattggataaaatatagaaaagttagaaataaagtaaataaccttataaaacatgcaaaagaaaacttttttaataattttgaattaaatattacagaattacagtgtaatgacaaaagagggttttggaagatagtgaaatactttatgaaaaatacaaatacctcatcgactatataaaaaatactacatttcAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGAAACGTTTAAC--C---GCATGATATCCG-AC-C--------AA------------GA---CTGGGA--C----------ATTA-T-T---GAA--GAAC-T-T--GACATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TTAC--TG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GTATCCCATC-CAAAGAA-----G----TAGTAATTCGACCTAATGACAAACCCTGGTACGACTC-------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G---C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-TGGACAAAA---CA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AACGCCTTT-TCAACA-------GCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTG----A----CA--GACA-------AT-C---CAAATC-----AA---TACTGGAAAA-TCATAAGGAACTTGGTTAAAACTTAAAAA---A---TAATAGTA--AA-TCCGAA---ACAATCCT-AAT-AC---TGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TA---TGTTTCTCA---GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACA
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATAAAA-AAAGCAAATTTTGAGT-----TAT--T---AAATAGTA--------A--------AATATCGTATTT-TAA---ATGGGACTG----------TCTA-T-T---------AAA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTG-AAAT--GTT-----C--AC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GTGTACCATT-CAAAAAATGTATG----TGATA----GACATGACGATGAACCATGGTATGATTCAGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-------------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-TGGTCTAGA---TA-CCAA-AA-AAA--TC--GTAAAAAAGT-----AAACAAC--TT--AAAATATCATGCAAA---CG---------A--ATTATT-TTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAGTC--ATAAAA-ATGGCAA-TTATGTTT-----CAT--T---AAATGATAT--GGAT-ATT------AATACAT-ATTT-TGA-----------A----------TTTC-T-T---GAA--AATA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGTG-AA-C--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--ATAGT--TTC-AAAAGAC-----G----TCACAATTCGACCTAATGACAAACGACGGCATGATTCCTGAATAA-ATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGA--C--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-TGGACAAAA---TA-G--A-AATCAA--TTAAGAAAAAGAGTTAAAAAAACAAA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--------------AACAATACA-ATAGCA-------AT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AG----A----CG--A-TA-GTGA--AT-----CCAATC--CTAAGCTT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACGATA-AGGGCGA-ATTTGATA-----AGT--T---AAATAAAAT--G-AT-A--------AGTG----A----TGAAAATTGGGA--T----------TATA-T-A---AAC--GAAA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGTT-TA-C--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GTATTCCTTC-AAAAGAA-----A----TTACTATTCGACCTAATTACAAACCTTGGTATGACTCCGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GG--C--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-TGGACAAAA---TT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAATAAAGT-----AAATAATCTTT-AAAAAT----TGCTAA---AG---------AAAAGTTTT-TTAATA-------AC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAG----A----CT--C-TACG--------A---CCAACC--CGAAACAATATTGGAAATTACTTCGAAATTTG-ACAAA-----GACAA---A---CAG----T--AAAACTGAG---ACTGTGCCGATC-CT---TAAGACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGTTACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTATaaaaccattcacaagtatttaaaaagcgagcgaaaatatt
gi|137886 : TTAGTTTCATAAAC-CGGGTAG-TTATGACA-----AAA--T---GGATGAACT--G-AT-ATTTTGGATAATA----AATCATAA---TTG-----------------TTG-T-T---TTA--CACATT-T--TTTGCAAACATGACATGTG-AG-C--GTT--TTAA--TA-AAA---------C---TTT-TA--
gi|137886 : AATGACAAACCAAGGTATGATTCCGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----A--C--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACATGAACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGATCAAAGT-----AAATAAT--TT-AGAAACA-CATGCTAA---AGTGCCACATAAACA-TATCGTTGATATATGCACAT----A-GTGAA---A--TT-------TA----T---CT--TT-----------TA--G-CA---AT--TT-A---CAAATC-----GACTTTaatgacaaaccaaggtatgattccgaaataagacgacatccgagacaacataagagacaactgacaaagaacagagacatgaacaaaatacaaacaattaaggatcaaagtaaataatttagaaacacatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137887 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaTT--TTAT--TG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GTATTCCCAC-AAATCTT-----T----TAATAATTCGTCCAAGAGACAAGCCATGGTACAACTCCGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GA--C--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-------------AT----ATCGAAGTTTT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAACAAGAT-----AAATAAC--AT-GAAAAAA-CACTCAAACATAG---------AAACTTAAT-TTGATA-------AT----
gi|137888 : taaagaAA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGTATTGCGCC-AAAACAT-----A----TTACTCTCCAGACTGATGGCAAACCTTGGTACGACTTTGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GG--C--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-TGGAATAAA---AA-T--A-AA-TATGATT--GTAACAAAGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAG-CACGTTAA---AG---------AA
gi|137889 : GGAC-AAA---TA-A--A-AA-CAA--TAAAGGAATAATGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAAACATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTGATA-------AT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAAT----A----TG--A-AA-A-AA--AT-GTTTCAAATT--CTAAATAATATTTGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----GACAA---A---CAA----A--AACTCGGAA---ATAATTTC-TCC-AC---TAAAA------
Alignments
lowQualScore : 111 11111 22222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222 1111111111111 222222222 1111111 1111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111 1111 333333333333333333333333333333 1111 22222222222222222222222222 2222222222222222222222 3333333333333333333333333 11111111111111111111111111 1111 1111111 11111111 11 111
lowQualScore : 3 0 99 666 555 11111 44 22222222222 99 0 77 66 888888 2 44 3 555 99 2 8888888 33 444 2 5555 999 2 2 2 55 33 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 0 1 2 2 4 2 9999999 33 666 1 33 2 2 111111111111111111111 333 9999999999999 2 2 000000000 0 888 33 33 99 1 33 2 33 33 0000000 0000000000000 2 5555 33 0 7777777777777777777777777777 33 1 33 1 22222222222 0 0 0 3 3 6666 555555555555555555555555555555 4444 33 33 2 3333 555555555 44444444444444444444444444 7777 33 2222222222222222222222 22 3 333 2 22 2 2 333 777777 22 2 1 4 333 888888888 3 0 2 8888888 555555 1 1111111111111111111111111 33 1 5555 77777777777777777777777777 1 1111 2 44 0 1 4 3 3333333 888 555 6666 44 22 555 1 1 44 999999 00000000 55 00 3 66 2 0 55 11 1 111 3 1 44 44 3 3
lowQualScore : . . .. ... ... ..... .. ........... .. . .. .. ...... . .. . ... .. . ....... .. ... . .... ... . . . .. .. ...... ............................................... .. . . . . . . . ....... .. ... . .. . . ..................... ... ............. . . ......... . ... .. .. .. . .. . .. .. ....... ............. . .... .. . ............................ .. . .. . ........... . . . . . .... .............................. .... .. .. . .... ......... .......................... .... .. ...................... .. . ... . .. . . ... ...... .. . . . ... ......... . . . ....... ...... . ......................... .. . .... .......................... . .... . .. . . . . ....... ... ... .... .. .. ... . . .. ...... ........ .. .. . .. . . .. .. . ... . . .. .. . .
lowQualScore : 6 5 00 222 444 77777 22 33333333333 22 2 77 00 888888 1 22 1 444 55 9 7777777 77 444 5 3333 111 5 5 5 44 44 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 22 4 8 6 2 6 4 2 6666666 11 999 0 11 2 2 111111111111111111111 999 2222222222222 2 2 555555555 1 111 11 44 66 8 55 4 22 11 2222222 9999999999999 1 2222 11 6 7777777777777777777777777777 22 0 99 1 55555555555 8 1 5 1 8 2222 888888888888888888888888888888 7777 11 11 2 2222 888888888 00000000000000000000000000 8888 11 3333333333333333333333 66 1 777 1 99 1 1 999 222222 99 1 0 2 777 444444444 3 2 4 1111111 666666 0 6666666666666666666666666 77 5 7777 77777777777777777777777777 8 3333 6 22 8 0 0 1 6666666 555 444 5555 22 99 888 0 0 33 555555 00000000 00 00 6 55 3 5 33 55 0 444 6 0 66 66 3 3
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( family-776 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137868 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGATGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACAAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACCAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGAGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-T--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAGAC-----A----TAACCATCAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAT---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATT-ATTAA-----GAAGA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-TTC-CT---TTAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTACTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATAAAA-GAAGCGA-TTATGACA-----ATT--T---GAATGACAT--G-AT-A--------TATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TGTA-T-T---TCC--ACCA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137871 : CGTGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TTGACTAAA---TG-C--A-AA-CAG--TTAAGAA-CAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCCAA---AG---------AATAGTACT-TTAATA-------AT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAG----A----TA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTGACTGGAAACTTCTTAAACA--TT-ATTAA-----GGAAA---A---CAT----A--TATACTGAA---ACCATAAG-CCC-TT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTTCTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137872 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TAT
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----T-AA-TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTAC-TTATAAGA-----AAA--T---AAATTAACC--G-AT-A--------ATCA----ATTA-TAA---TTGGGA--------------TGA-T-T---TAC---ACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ACCA----ATTT-TAA---CTGGGA--T----------TTT--T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ATCA----ATTT-TAA---CTGGG---G----------TTTT-T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGCG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGAAAA-GAGGGAA-TTATTATA-----TCT--T---GAGTGACAT--G-AT-G--------CATA----GTTT-AGA---TTGGG---G----------TTAG-T-A---TCC--ACCT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGTA-AA-CGTGTT--TTTT--A--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CTATTCTCTC-TAAAGAT-----G----TAACGATCAGACCGACTGACAAACCATGGTATGATTCTGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGA-------AACGTT---AAACCGCAT--G-AT-A--------TTCA----ACCA-AGA---CTGGGA--C----------TTTA-T-T---GAA--GA-A--------CATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GTATCCCATC-TAGAAAA-----G----TAACAATTCGACGTAATAACAAACCCTGGTACGACTCACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GA--C--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-TGGACATAA---TA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCCAGT---TATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGGTTATATTACA-AAGCAAA-TTTCGACT-----TGC--T---CAATAATAA--A-AT-ATC------AGAA----AC---TGA---TT-GGA--G------------CA-TGC---TGCTAAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAA-T--GTT--CTCT--A--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GTATTCCGTCTCAAACAA----------TAACTGTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATTCAGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTT--A-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-TGAGCCAAG---TA-T--A-AA-CAT--GCACGCAACAAAGT-----AAATAAT--CTAAAAAAAA-AATGCTAA---AG---------AGAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAG----ACCTTCACTG-TA-A-CG--AT-A----AAA-----GAGGCTTT--TGGAAAGTTGTTCGACATTTT-GTT---------AAATCTA---CAG----ACCAATG-TGGT---TTTATTCC-GCC-TT---TGTGT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTTTTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CATTCCC----------GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTT--ATACAACGAAGCAAATTTTAATA-----TCC--T---TTATGTTAA--A-ATCG--------AATC----A-TA-TGA---TTGGGACTG----------CTTAAT-TAACTGC--TCTA-T-T--T------ATGAAGCATGTG-AC-A--GGT--TTTC--AT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GCATAGCATC-TAAATAA-----G----TAACTGTTCGTCCAAACGACAGGCCTTGGTTCGATTCAGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GA--C--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-TGGTATAAA---TA-T--A-AG-CAA--GTTAGAAACAAAGT-----AAATAAC--AT-ATAAAAA-CAAGCTAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T-------A----CA--G-TT-G-AACGAT-A---GAAA------AGATTTT--TGAAAAATTATTAGACATTTT-GTTA--------AAA---A---TTC----A--GACTCTTCATCTACAATTCC-ACCTCTTTGTAAAA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT---TAAG----ATTTTCTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATAAAC-GAGCTAA-TT-TGA-A-----TAC--TTT-GAATAATCT------------------TA------TT-TCA---TCGACA--GACAGGTCAATTTTA-T-T-----A--AACA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCCA---AA-A--ATC--TTTC--AATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GTAT--CA---CAAACAG-----TCTCTTCACAATCCGGCCAAAAGATAAACCATGGTACGACTCTGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GA--C--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-TGG-CAAAA---TAAC--A-AA-AAC--CTCAGAAATAAGAT-----TAATATC--AT-GAAAAAA-CATGCTTA---AG---------AACTTTTTT-ATAATA-------AT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTG----A----CAT-G-CA-C-TA--AT-----CTTATCAACGAAA--TTATTGGAAAGCTATCAAAATGTTA-ATTAA-----GGAAA---ATTCTAA----A--AGCTGTGAG---ACAGTACC-ACCACT---CA----------------TTA---AC-GCT-GAC----A-ATTCGTATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATGATA-AAGCTGA-TT-T--CC-----AAC--TTCTAAATGAAAA--G-AT-AC-------AAT------CTTATGA---TTGGGA--------------CTG-T-T---TGA--ATGA-T-T-----ATAG--------TATT-AA-T--GTTGCTTGC--AG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GTATTCCTTT-TAA-GCT-----G----TTACAGTACAACCTGACGACAAACCCTGGTTTGACTCTAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GA--CTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-TGGATAAAA---TA-T--AGAA-AAG--TTA-GAAATAAAGT-----AAATAAC--CT-TATAAAA-CATGCAAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TTGAA-------T-------TAAAT-A---TT--ACAGAATTA----CA--G-T--G-TA--ATGA---CAAA----AGAGGGTTT--TGGAAGATAGTGAAATACTTT-ATGAA-------AAAT--A---CAA----A--TAC
gi|137881 : aAAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-ctcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137882 : attcgggtattatagatatctccagacatattagcgaccataaagcaacaattattattttaccttttcattatcagcttcatagcacttatgaaagaaatatttggttatatgataaagctgatttccaacttctaaatgaaaagatacaatcttatgattgggactgtttgaatgattatagtattaatgttgcttgcagaaaattgactgatatttttatatctatggtttaacaatgtattccttttaagctgttacagtacaacctgacgacaaaccctggtttgactctaaacttagaaaacatttacgaataagagatagacttaaaaaattgcatcgaaaagttggaagtcgaatgattggataaaatatagaaaagttagaaataaagtaaataaccttataaaacatgcaaaagaaaacttttttaataattttgaattaaatattacagaattacagtgtaatgacaaaagagggttttggaagatagtgaaatactttatgaaaaatacaaatacctcatcgactatataaaaaatactacatttcAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGAAACGTTTAAC--C---GCATGATATCCG-AC-C--------AA------------GA---CTGGGA--C----------ATTA-T-T---GAA--GAAC-T-T--GACATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TTAC--TG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GTATCCCATC-CAAAGAA-----G----TAGTAATTCGACCTAATGACAAACCCTGGTACGACTC-------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G---C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-TGGACAAAA---CA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AACGCCTTT-TCAACA-------GCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTG----A----CA--GACA-------AT-C---CAAATC-----AA---TACTGGAAAA-TCATAAGGAACTTGGTTAAAACTTAAAAA---A---TAATAGTA--AA-TCCGAA---ACAATCCT-AAT-AC---TGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TA---TGTTTCTCA---GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACA
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATAAAA-AAAGCAAATTTTGAGT-----TAT--T---AAATAGTA--------A--------AATATCGTATTT-TAA---ATGGGACTG----------TCTA-T-T---------AAA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTG-AAAT--GTT-----C--AC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GTGTACCATT-CAAAAAATGTATG----TGATA----GACATGACGATGAACCATGGTATGATTCAGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-------------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-TGGTCTAGA---TA-CCAA-AA-AAA--TC--GTAAAAAAGT-----AAACAAC--TT--AAAATATCATGCAAA---CG---------A--ATTATT-TTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAGTC--ATAAAA-ATGGCAA-TTATGTTT-----CAT--T---AAATGATAT--GGAT-ATT------AATACAT-ATTT-TGA-----------A----------TTTC-T-T---GAA--AATA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGTG-AA-C--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--ATAGT--TTC-AAAAGAC-----G----TCACAATTCGACCTAATGACAAACGACGGCATGATTCCTGAATAA-ATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGA--C--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-TGGACAAAA---TA-G--A-AATCAA--TTAAGAAAAAGAGTTAAAAAAACAAA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--------------AACAATACA-ATAGCA-------AT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AG----A----CG--A-TA-GTGA--AT-----CCAATC--CTAAGCTT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACGATA-AGGGCGA-ATTTGATA-----AGT--T---AAATAAAAT--G-AT-A--------AGTG----A----TGAAAATTGGGA--T----------TATA-T-A---AAC--GAAA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGTT-TA-C--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GTATTCCTTC-AAAAGAA-----A----TTACTATTCGACCTAATTACAAACCTTGGTATGACTCCGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GG--C--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-TGGACAAAA---TT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAATAAAGT-----AAATAATCTTT-AAAAAT----TGCTAA---AG---------AAAAGTTTT-TTAATA-------AC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAG----A----CT--C-TACG--------A---CCAACC--CGAAACAATATTGGAAATTACTTCGAAATTTG-ACAAA-----GACAA---A---CAG----T--AAAACTGAG---ACTGTGCCGATC-CT---TAAGACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGTTACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTATaaaaccattcacaagtatttaaaaagcgagcgaaaatatt
gi|137886 : TTAGTTTCATAAAC-CGGGTAG-TTATGACA-----AAA--T---GGATGAACT--G-AT-ATTTTGGATAATA----AATCATAA---TTG-----------------TTG-T-T---TTA--CACATT-T--TTTGCAAACATGACATGTG-AG-C--GTT--TTAA--TA-AAA---------C---TTT-TA--
gi|137886 : AATGACAAACCAAGGTATGATTCCGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----A--C--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACATGAACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGATCAAAGT-----AAATAAT--TT-AGAAACA-CATGCTAA---AGTGCCACATAAACA-TATCGTTGATATATGCACAT----A-GTGAA---A--TT-------TA----T---CT--TT-----------TA--G-CA---AT--TT-A---CAAATC-----GACTTTaatgacaaaccaaggtatgattccgaaataagacgacatccgagacaacataagagacaactgacaaagaacagagacatgaacaaaatacaaacaattaaggatcaaagtaaataatttagaaacacatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137887 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaTT--TTAT--TG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GTATTCCCAC-AAATCTT-----T----TAATAATTCGTCCAAGAGACAAGCCATGGTACAACTCCGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GA--C--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-------------AT----ATCGAAGTTTT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAACAAGAT-----AAATAAC--AT-GAAAAAA-CACTCAAACATAG---------AAACTTAAT-TTGATA-------AT----
gi|137888 : taaagaAA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGTATTGCGCC-AAAACAT-----A----TTACTCTCCAGACTGATGGCAAACCTTGGTACGACTTTGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GG--C--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-TGGAATAAA---AA-T--A-AA-TATGATT--GTAACAAAGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAG-CACGTTAA---AG---------AA
gi|137889 : GGAC-AAA---TA-A--A-AA-CAA--TAAAGGAATAATGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAAACATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTGATA-------AT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAAT----A----TG--A-AA-A-AA--AT-GTTTCAAATT--CTAAATAATATTTGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----GACAA---A---CAA----A--AACTCGGAA---ATAATTTC-TCC-AC---TAAAA------
blockSeqs : G AC ATC TAT CGCC AT ATCTTTAACAC AG AC GA TGAAAT A AA C TAG TG C CATCAGA AG TTA A AAGT ACT C T A AA GA AGAAAG TTAATATTTTACCCACTATTGTTACT GT C T C T A A AACGTTT GT TCT C CC G C TTTTGGATAATAAATCA AAA GACAGGTCAAT A G AACTGCT TG GA CA CA G GA A GT GC ACTCAG ATTGACTGATAT A TCGA AC TCCTCAGTATAGTTAACA TT C TC A ATGTATG T C CGCG AATGTTCTTGAGTGA ACAT TT TT T TCG GCTTTA TACATGTATTTGCTCTCAGCT TTGG GT TGGCAAATTAAAT CA T GTT A CA G T TGA TAAAAA CT A C T CAT TGCCACATA G G TATGCAC TTGGA A GTTTCATAAAATGA AA C AATT CCTTCACTGTAACGATA T AACG C AC T A G AACTTAA TCT TTC TAGT CC TA TCT C A GA TCTTTG CCATTGAG AC AT G CC G TG CC A TCT A A TT GG A T
blockSeqs : . AC ATC . AC . CT AG AT G . A . . . G . . . . . . AAT . . . A . CC ACGATTTCAAACAAACATATTCAAAG . . T . T A A CA . TT C . . . TTAATACATATTT . CTG . . TGCTAA TG . CA CA G A . . . TCAAT TAAA . CGA . GGTTTAACAA . C C G GTCTCT T C CGG TTTTTCTCGTAAAAC . . . . GA ATTT TTGCAATTTAATCAGG AT . AGGAAAACTTGCT C T . . . . . G T . . C A . . G . . AC A ATATTACCACA . C . TGAAAAAAATGTTT T CA C AC T A . GG T . . . TA . C A C ACT AG C CC . G G A TC A AC . A . . . .
blockSeqs : . AC ATT . GC . A . C A . A . . . G . . . . . . T . . . A . CC ATTATCAGCTTCATAGCACTTATGAA . . T . C . A CA . . C . . . AATATCGTATTT . CTG . . TCCT TG . CA CA G A . . . TCAG CAA . GA . AAAAATTA . T C G TA T C CGG GCTTCAAGACAAA . . . . G A GCTATCCGAACGG . . ATATCG C T . . . . . G T . . C . . . G . . A G TTTAACAC . C . CAGTTGAACGATA T CA C AC T G . GA . . . . TA . C A T CT AG C . . G G A CC A AC . A . . . .
blockSeqs : . AC . . C . A . C G . T . . . T . . . . . . T . . . A . CC ACGATTTTAAACAAACATGTTCAAAA . . T . T . A CA . . A . . . AATAACTT . G . . TCCT TT . TG TG C G . . . TCAG CAA . GA . GCAAAAA . T T G CA A A CGG TATTAAAGAATAA . . . . G A TCAATACGAACG . . AGAC T A . . . . . G A . . C . . . A . . A T ACTTTAG . T . CAGCAGAAATA T CA T AT A G . GG . . . . CT . A T C CT AG C . . A T A CA T AT . T . . . .
blockSeqs : . AA . . C . A . C A . T . . . A . . . . . . T . . . G . CC TCTGTTTACACCTCCTGCTTTAACT . . T . T . A GA . . A . . . AATAACTT . G . . TCCA T . TG TG C G . . . ACTA CTA . GC . GCAATCT . C T G AG A A CAA TATTAAAAAATA . . . . G A TCAATACGAACG . . AGAC A A . . . . . A T . . C . . . A . . A T ACTTTAG . T . CAGCAGAAATA T CT T AT A T . AT . . . . CT . A T T TT TA A . . G T T CA T AT . T . . . .
blockSeqs : . AC . . T . A . G A . T . . . A . . . . . . A . . . T . CC TCTGTTTACACCTCCTGCTTTAACT . . T . T . A GA . . A . . . TATAACTT . G . . GAAC T . TG TG C G . . . ACTG CTA . GT . GCAATCT . A T A AG T T TTG TTCAAGACAAC . . . . A A GCAATACGAACG . . AGAC A A . . . . . A T . . A . . . C . . A A ACTGTAG . C . TAGCAGAAATA T CT C AT T T . AT . . . . TG . T T T AC TA A . . G T T TT C AT . C . . . .
blockSeqs : . TA . . C . G . G G . A . . . A . . . . . . A . . . T . CC TCTGTTTACAACTCCTGCTTTAACT . . T . G . A GA . . C . . . ATCAATTA . T . . GAAC T . CA CA T A . . . ACTG CTA . GT . GCAAAAA . G T C TG A C AAG TTCAAGACAAC . . . . A A GCCGTAAGGACT . . AGAA T C . . . . . T T . . A . . . C . . A G AACACTG . G . TGCGAATGTGT T AG T AC T G . GG . . . . CT . A T G AC AA C . . G T A TT T CT . T . . . .
blockSeqs : . CA . . C . A . C C . G . . . G . . . . . . A . . . A . TT TAATATTTCACCCACTATTGTTACT . . T . T . A TA . . C . . . ACCAATTT . G . . TCCA T . CA AC A T . . . TCAT CAA . GA . GACTAAA . A T T AG A T CGA TTTACGAATAA . . . . A A GCCGTAAGGACT . . AGAA T T . . . . . T A . . A . . . T . . T T AACACTG . C . TGCGAATGTGT T CT G AT T C . GA . . . . CT . A A A TT CA A . . G C T TC A TT . A . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . A A . T . . . A . . . . . . T . . . A . AC TAATATTTTACCCACTATTGTTACT . . A . A . T CT . . T . . . ATCAATTT . G . . GAAG G . AG AT T G . . . GCAG TAT . CA . CAAAATG . A C C AG A T CG ATAAATGTCGC . . . . G C TAAAACGAATAG . . AAAA T A . . . . . A A . . A . . . C . . C T TATTCAA . C . CATGCACTAAT C CG C AT A A . GA . . . . AA . A C A AC AC G . . . A A CT T CT . C . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . T A . T . . . . . . . . . . A . . . A . AC GTACGAGCTAAATTCTACATATAAA . . T . C . T TA . . T . . . CATAGTTT . C . . TGAA T . TC AA A T . . . ACTG AAA . AG . GACCAAA . T T G TG T T CG ACTAGACTAC . . . . G A GCTGTAAGGACT . . AAAT T A . . . . . C T . . A . . . C . . C G TTAAATA . C . CAGTGTAATGA T CT C . T T . . . . . . CT . T G A CT . . . . . . . . T . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . T . AC TTATGAACTCAACTCATCATATGAA . . A . T . A CC . . T . . . TTCAACCA . G . . GAAG G . CA CT C T . . . AATA CAT . AA . CATACTA . A C G AG T T CG ACTAGACTAC . . . . . A GCGACCAAAAG . . GAAT T A . . . . . G A . . A . . . T . . T A ATCACTA . T . CGATAGTGAAT T G C . A G . . . . . . T . A T T AC C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . CT TTTACAATTATTCATGCTTTAAGT . . T . T . T GT . . A . . . TCAGAAAC . C . . GAAA T . AG AC A G . . . ATTG TAT . GA . GACGCCT . A C A CG A A AA ATTAGACTAC . . . . . A AGTACAAAC . . AGAG T T . . . . . T T . . T . . . A . . A T ACTTTA . A . TAGCAATTTA . . T . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . A . C ATACCGTTTACATTCTACATACA . . A . T . A TT . . T . . . CAATCTTA . A . . AACG T . TA AA T G . . . TTA TCA . TA . GTAATAA . T A G AA C T CG ACTAAAAAAA . . . . . A TTGCATCG . . AAC T A . . . . . A A . . C . . . G . . A T ATTTAT . . . CAGACAATC . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . TATACAAACACACCATTCAAA . . C . C . T TA . . T . . . AATCATA . T . . TTAC T . TA AA T T . . . CTA CAT . TC . GCAAAA . T A G TT C A CG ACTCGTTAGC . . . . . A TCTTCGCG . . CTG C A . . . . . A A . . T . . . T . . A G AATTT . . . CTCTACGA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTCC . . T . C . A CA . . T . . . AGTGA . . . . TAC A . TG AA T G . . . CAC TAG . GA . GAAATT . C A C TA C T . AAAGA . . . . . . TCACTTG . . AGA A A . . . . . T A . . C . . . A . .
blockSeqs : . . . . C . . A . . A . . . TATT . . . . AA G . A TG A . . . . AG CA . G . GACAG . G A C A C A . TTC . . . . . . TCAG . . AT T C . . . . . A A . . A . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . A . . . AA . . . . . . . . . . . . CA . . . T . . TCC . . . . . . CTGA . . A C T . . . . . T A . . A . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . A A . . A . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
finalCons : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Alignments
lowQualScore : 111 11111 22222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222 1111111111111 222222222 1111111 1111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111 1111 333333333333333333333333333333 1111 22222222222222222222222222 2222222222222222222222 3333333333333333333333333 11111111111111111111111111 1111 1111111 11111111 11 111
lowQualScore : 3 0 99 666 555 11111 44 22222222222 99 0 77 66 888888 2 44 3 555 99 2 8888888 33 444 2 5555 999 2 2 2 55 33 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 0 1 2 2 4 2 9999999 33 666 1 33 2 2 111111111111111111111 333 9999999999999 2 2 000000000 0 888 33 33 99 1 33 2 33 33 0000000 0000000000000 2 5555 33 0 7777777777777777777777777777 33 1 33 1 22222222222 0 0 0 3 3 6666 555555555555555555555555555555 4444 33 33 2 3333 555555555 44444444444444444444444444 7777 33 2222222222222222222222 22 3 333 2 22 2 2 333 777777 22 2 1 4 333 888888888 3 0 2 8888888 555555 1 1111111111111111111111111 33 1 5555 77777777777777777777777777 1 1111 2 44 0 1 4 3 3333333 888 555 6666 44 22 555 1 1 44 999999 00000000 55 00 3 66 2 0 55 11 1 111 3 1 44 44 3 3
lowQualScore : . . .. ... ... ..... .. ........... .. . .. .. ...... . .. . ... .. . ....... .. ... . .... ... . . . .. .. ...... ............................................... .. . . . . . . . ....... .. ... . .. . . ..................... ... ............. . . ......... . ... .. .. .. . .. . .. .. ....... ............. . .... .. . ............................ .. . .. . ........... . . . . . .... .............................. .... .. .. . .... ......... .......................... .... .. ...................... .. . ... . .. . . ... ...... .. . . . ... ......... . . . ....... ...... . ......................... .. . .... .......................... . .... . .. . . . . ....... ... ... .... .. .. ... . . .. ...... ........ .. .. . .. . . .. .. . ... . . .. .. . .
lowQualScore : 6 5 00 222 444 77777 22 33333333333 22 2 77 00 888888 1 22 1 444 55 9 7777777 77 444 5 3333 111 5 5 5 44 44 555555 55555555555555555555555555555555555555555555555 22 4 8 6 2 6 4 2 6666666 11 999 0 11 2 2 111111111111111111111 999 2222222222222 2 2 555555555 1 111 11 44 66 8 55 4 22 11 2222222 9999999999999 1 2222 11 6 7777777777777777777777777777 22 0 99 1 55555555555 8 1 5 1 8 2222 888888888888888888888888888888 7777 11 11 2 2222 888888888 00000000000000000000000000 8888 11 3333333333333333333333 66 1 777 1 99 1 1 999 222222 99 1 0 2 777 444444444 3 2 4 1111111 666666 0 6666666666666666666666666 77 5 7777 77777777777777777777777777 8 3333 6 22 8 0 0 1 6666666 555 444 5555 22 99 888 0 0 33 555555 00000000 00 00 6 55 3 5 33 55 0 444 6 0 66 66 3 3
consensus : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
Reference ( family-776 ) : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGNACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGCGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGANAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TNC--NACA-T-T--TCCGTAGACGCGGCNTGTG-AA-C--GTT--TTNC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCNTC-CAAAGAN-----G----TAACAATTCGACCTAATGACAAACCATGGTACGACTCNGAAATNAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TGGACNAAA---TA-C--A-AA-CAN--TTAAGAAACAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAANA-CATGCTAA---AG---------AACANTATT-TTAATA-------AT----A-TNGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CGAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACANTTT-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AACNCTGAA---ACNATNCC-NCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGNGAGGA-AACCTTCTTTTNTAAC-GACGAAG-AAAAGGCNAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137868 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGATGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACAAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137869 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCGATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTT--AAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGGTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-C--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--------T--GTATTCCCTC-CAAAAAT-----A----TAACCAATAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAA---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATC-ATTAA-----GGAAA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-CCC-CT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AACCTTCTTTTATAAC-GACGAAG-AAAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137870 : ACTACATCAACT-CTGATAGATCCAATACTTATA---TCA---GATA-C---A--TATAA----------ACC--TCT-CAA-TT------CTTGAACTT--TAGATGT-TC---C-GAA-TAC-------AA--TAA---GCGACAA-TAAAGCTA----C--TAA-T-AT-TTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---CCTCCTGCT-T-TAACTAAA--AAAG-TTTGGTTTTATAAAA-GAGGTGA-TTATGACA-----AAC--T---GAATGACAT--G-AT-A--------AATA----ACTT-TGA---TTGAGA--G----------TTTA-T-T---TCC--TACA-T-T--TCCATAAACGCAGCGTGTA-AA-T--GTT--TTTC--AG-AAA---------CAA-TTT-TA--GATG--TTAT------G---CA-----AAA--A-----T--GTATTCCCTC-CAAAGAC-----A----TAACCATCAGACCTACTGACAAGCCATGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----CT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAC-----A---AAAT--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAC-TGGACTAAT---TA-C--A-AA-CAG--TTAAGAAACAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACG-CATGCTAA---AG---------AACAGTACT-TTAATA-------AT----A-TAGAA---A-CTT-------TA----G---TT--TCAG----A----CA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTTACTGGAAACTTCTTAAACAAATT-ATTAA-----GAAGA---A---CAA----A--AATACTGAA---ACCATACC-TTC-CT---TTAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-GGGGAGGA-AATCTACTTTTATAAC-GACGAAG--AAAGGCAAATTGTTTGAA--CGACTATTTCATT--TCTAT-TTC-AACAAT
gi|137871 : ACTACATAAACT-CTG-TAGATCCTATACTTATA---TCA---GATA-T---A--TATAA----------ACC--TCTACA--TT------CTGGAACTT--TAGATGT-TC---T-TAA-TAC-------AA--TAA---GTGACCA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-CTA-T--ATCC----CATTTTC----T-C--TGT-----TT---AC--A---ACTCCTGCT-T-TAACTAGA--AAAG-TTTGGTTTAATAAAA-GAAGCGA-TTATGACA-----ATT--T---GAATGACAT--G-AT-A--------TATA----ACTT-TGA---TTGGGA--G----------TGTA-T-T---TCC--ACCA-T-T--TCCATAAATGCAGCGTG
gi|137871 : CGTGGTACGACTCTGAAATCAGACG-GACA-A-----TT-------A--GA--C--TA-CGAGACA----GA--C--A-AA--G-GAA-----A---AAAG--CA---ATACG-----A--AC-G-CAAAG----AA--C---------AG----AC-----GAT-TTGACTAAA---TG-C--A-AA-CAG--TTAAGAA-CAAAGT-----AAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCCAA---AG---------AATAGTACT-TTAATA-------AT----A-TGGAA---A-CTG-------TA----G---TT--TCAG----A----TA--G-CA-G-AA--AT-A---CAAATC--CAAAACTTGACTGGAAACTTCTTAAACA--TT-ATTAA-----GGAAA---A---CAT----A--TATACTGAA---ACCATAAG-CCC-TT---TAAAA------AGAAC-CTCA--GAC-GCT-AGGGAGGA-AACCTTCTTTCATAAT-GACGAAGAAAAAGGCAAATTGTTGGAC--TGACTATTTCATT--TCTGT-TTC-AACAATgtacgactctgaaatcagacggacaattagactacgagacagacaaaggaaaaaagcaatacgaacgcaaagaacagacgatttgactaaatgcaaacagttaagaacaaagtaaataatttgaaaacacatgccaaagaatagtactttaataatatggaaactgtagtttcagatagcagaaatacaaatccaaaacttgactggaaacttcttaaacattattaaggaaaacatatatactgaaaccataagccctttaaaaagaacctcagacgctagggaggaaaccttctttcataatgacgaagaaaaaggcaaattgttggactgactatttcatttctgtttcaacaat
gi|137872 : actacataaactctgtagatcctatacttatatcagatatatataaacctctacattctggaactttagatgttcttaatacaataagtgaccataaagctacttatatctatatcccattttctctgtttacaactcctgctttaactagaaaagtttggtttaataaaagaagcgattatgacaatttgaatgacatgatatataactttgattgggagtgtatttccaccatttccataaatgcagACTACATCAACC-CTGATAGATTCAGTACTTATA---TCA---GATA-C---A--TAT
gi|137873 : ACATAAA----TGA-AGATCAAATAAATATA---TTA---AATAAC---AATTATAATCTTTAACACACA--TGC-CAG-TTTGAAATCTGGTTCTT--TAGATGG-TC---C---A-CAC-------GAAGTCA---GTGAGCA-TAAAACTA----C--ATA-T--T-TTG-T--ATCC----CATTTGT----T-AA-TAT-----TT----C--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGA-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTAC-TTATAAGA-----AAA--T---AAATTAACC--G-AT-A--------ATCA----ATTA-TAA---TTGGGA--------------TGA-T-T---TAC---ACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TA-AAG---------CTA-TTT-TA--GCTT--TTAT------
gi|137874 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----CCTTTGT----T-AA-TAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ACCA----ATTT-TAA---CTGGGA--T----------TTT--T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGTG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TTAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137875 : CATCAACT-CTTATTGACCCAAT---TATAATCTCA---GACA-C---A--TATA------------CCAGTTT-GAA-TT------CTGGTACTT--TAGATGT-CC---C-AAA-CGA-------AA--TAA---GTGATCA-TAAAGCTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATCC----C-TTTTG----T-TAATAT-----TT----T--A---CCCACTATT-G-TTACTCGA--CAGG-TTTGGTTTTATAATC-GGGGTGA-TTATGAGA-----AAA--T---GAACGAATT--G-AT-A--------ATCA----ATTT-TAA---CTGGG---G----------TTTT-T-T---GAA--CACA-TGT--TCTGTAGACTTGGCCTGCG-AG-C--GTT--TTAC--TG-AAT---------CTA-TTT-TA--GTTT--TGAT------G---CA-----ATC--T-----T--GTATTCCTTC-TAAAGAA-----G----TACAAATTCGACCAAATGACAAACCATGGTATGACTCAGAAATAAGAC--GACATT-----CA-------A--GA--C--AA-CGTGACA----GA--C--A-AA--A-GAC-----A---AAGG--CC---GTAAG-----G--AC-T-CAAAA----GA--C---------AG----AA-----GCA-TGGACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGAATAAAGT-----TAATAAT--TT-GAAAACA-CATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTAATA-------AT----A-TTGAAAACA-CT--------------G---TT--TTAG----A----T---G-CG-A-AT--GT-GT--CAAATT--CTAAATTATATTGGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----ATCTA---A---CAA----A--AACTCAGAA---ATAATTCC-TCC-AC---TAAAA------TATAC-ATCT--GTT-AAT-GGTGAGGA-TTCAGTCTATTTTAAT-GATGCAG-ATAAAGCTAACTGCTTAAA--CGACTATTTCGTC--TCCAT-CTC-AACAAT
gi|137876 : CATTAACTGTTCATAGATCTAATACTCATA---TAA---AATA-T---A--TATAA----------ACC--TCT-CAG-TT------CTGGAACTA--CAAATGT-TC---C-AAA-TAC-------GA--TAA---GTGACTA-TAAAGCTA----C--TTA-T-AT-TT--T--ATTT----CATT--------------T-----TT---AC--AATTATTCATGCT-T-TAAGTAGA--AGAGCTTCGGGATAAGAAAA-GAGGGAA-TTATTATA-----TCT--T---GAGTGACAT--G-AT-G--------CATA----GTTT-AGA---TTGGG---G----------TTAG-T-A---TCC--ACCT-T-T--TCCATCAACGCAGCTTGTA-AA-CGTGTT--TTTT--A--AAA---------CAA-TGT-TA--GATT--TTAT------G---CA-----AAA--A-----G--CTATTCTCTC-TAAAGAT-----G----TAACGATCAGACCGACTGACAAACCATGGTATGATTCTGAAATTAGACGCGACA-G-----AC-------A--GA--
gi|137877 : CAGCAACC-TTACTTGACCCTATTATCATA---TCC---GACA-----G--TATACT---------ACC--TTT-AAC-CT------CTG--ACGTAATAGACAT-T-------AA-TAG-------AA--TAATTAGCGACCAACAAAGCTA----CACTCT-T-AA-TAA-T--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTCAAAC--AAA-CATA----T-T-CAAAGCGA--AAAG-TCTTGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGA-------AACGTT---AAACCGCAT--G-AT-A--------TTCA----ACCA-AGA---CTGGGA--C----------TTTA-T-T---GAA--GA-A--------CATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TT----AG-AGG---------CA---TT-TC--CATCACTTAT------G---AC-----TAA--A-----T--GTATCCCATC-TAGAAAA-----G----TAACAATTCGACGTAATAACAAACCCTGGTACGACTCACAGCTC---CA-AACA-G-----CTTCA----A--GA--C--AA-AGAGACA----GA--C--A-AA--A-GAA-----A---ATAG--CG---AC-CA-----A--AA-G-TACAA----AC--C---------AA----AA-----AAT-TGGACATAA---TA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AAC
gi|137878 : CT-CTTTTAGATCCAGT---TATAATTCCA---GATGGC---A--TGT-------------CT--TATATAGATT------CTGGGATTT--TA-------C---C--AG-TACCATCAGAAA--TTA---GTGATCA-TTGTGCTA----C----A-T-AT-TTA-AGAATAC----CGTTCCCA---TAC--CGT-----TT---AC--A-----TTCTACA-T---ACAAGCGTAACG-TTTGGTTATATTACA-AAGCAAA-TTTCGACT-----TGC--T---CAATAATAA--A-AT-ATC------AGAA----AC---TGA---TT-GGA--G------------CA-TGC---TGCTAAACG-G-T--TCAGTTGATGATGCTTGTGAAA-T--GTT--CTCT--A--AAA---------TAT-TTA-TA--AGTT--TAAT----------CA-----AAAT-G-----T--GTATTCCGTCTCAAACAA----------TAACTGTCCGTACTGATGACAAGCCGTGGTATGATTCAGAAATTAGA------A-AATGTTCT-------T--GA--G--TG-AGAGAAA----GATTT--A-AATCG-CACGCTTTA---AAAT--CA-------------------G-GAAAG----GA--T---------A-----AC-----GAT-TGAGCCAAG---TA-T--A-AA-CAT--GCACGCAACAAAGT-----AAATAAT--CTAAAAAAAA-AATGCTAA---AG---------AGAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TAGA-------TT-------TA----ACACTT--TCAG----ACCTTCACTG-TA-A-CG--AT-A----AAA-----GAGGCTTT--TGGAAAGTTGTTCGACATTTT-GTT---------AAATCTA---CAG----ACCAATG-TGGT---TTTATTCC-GCC-TT---TGTGT------AAAAC-CTCT--GAC-ACA-GGTGAAAATGATTTTTTTTTCT--CTGATGAAG-AAAAAGCCAATTGTCTGAATTCG--TACTTTACT--TCTATATCC-AACA
gi|137879 : GATCCAATCATTGTA---CCATATGATA-CGCCA--TATAG----------A---------AA-TG------CTGGTACTA--TAGAAGA-TCTAGC-GAACT-------------TAA---GTGATCA-TAAAGCAA----C--ATA-T-ATACTA-T---TAC----CATTCCC----------GTACGAGCT---AA--A-----TTCTACA-TATAAA-AGA--CAAA-TATGGTT--ATACAACGAAGCAAATTTTAATA-----TCC--T---TTATGTTAA--A-ATCG--------AATC----A-TA-TGA---TTGGGACTG----------CTTAAT-TAACTGC--TCTA-T-T--T------ATGAAGCATGTG-AC-A--GGT--TTTC--AT-ATA---------CA------TA--AATG--GT-T------G----A-----AAT--T-----T--GCATAGCATC-TAAATAA-----G----TAACTGTTCGTCCAAACGACAGGCCTTGGTTCGATTCAGAAGTTAGA----ACATA-----TT-------A--AA--AAATA--GGGACA----GA--C--T-AA--G-GA----------AAATTGCA---ATTTA-----ATCAG-G-CAAGG--------C---------AA----AT-----TAT-TGGTATAAA---TA-T--A-AG-CAA--GTTAGAAACAAAGT-----AAATAAC--AT-ATAAAAA-CAAGCTAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----C-TGGAA---G-TTTCATAAAATG----A---TT--T-------A----CA--G-TT-G-AACGAT-A---GAAA------AGATTTT--TGAAAAATTATTAGACATTTT-GTTA--------AAA---A---TTC----A--GACTCTTCATCTACAATTCC-ACCTCTTTGTAAAA------CAAAT-ATAAATGGC-ACT---TAAG----ATTTTCTTATTTATT-G-CAAAG-AAAAGGCTGAGCACCTTAA--CGACTATTTTAAA--TCTAT-ATC-GAC
gi|137880 : CTCAAA---TCA---GATA-----------AA----------ATG--TCT-TAA-TT------CGGGTGTTT--TTGAAAC-AC---CTGCC-CAC-------A---TAA---GTGACCA-TTACGGTA----C--ATA-T-GT-TTT-T--ATAGAAAGTATTTTT----T-A--TAC-----AA---AC--A---CACCAT----T-CAAA-AGA--AGAG-TTTTGAATTATAAAC-GAGCTAA-TT-TGA-A-----TAC--TTT-GAATAATCT------------------TA------TT-TCA---TCGACA--GACAGGTCAATTTTA-T-T-----A--AACA-G-C--TCTCTAGATTCTGCCCA---AA-A--ATC--TTTC--AATACA---------AAA-TTTATC--GAGT--TGAT------A----A-----AAATTA-----T--GTAT--CA---CAAACAG-----TCTCTTCACAATCCGGCCAAAAGATAAACCATGGTACGACTCTGAGAT---ACG--ACA-T-----TTTTCTCGTA--AA------A-CGGGACA----GA--C--A-AA----------------AAATA-CATGTATTTGCTCTCA--GC-T-CAGGT----AA--T---------AT----ATCG---GAT-TGG-CAAAA---TAAC--A-AA-AAC--CTCAGAAATAAGAT-----TAATATC--AT-GAAAAAA-CATGCTTA---AG---------AACTTTTTT-ATAATA-------AT----C-TTGAA---T-ATT-------CA----A---TA--TGTG----A----CAT-G-CA-C-TA--AT-----CTTATCAACGAAA--TTATTGGAAAGCTATCAAAATGTTA-ATTAA-----GGAAA---ATTCTAA----A--AGCTGTGAG---ACAGTACC-ACCACT---CA----------------TTA---AC-GCT-GAC----A-ATTCGTATTCTATATCTGATGTAG-ATAAAGTAAAAACTTTAAA--TGACTTTTTCATA--TTAAT-TTC-
gi|137881 : -TT------CGGGTATTA--TAGATATCTC---C-AGA-CAT-------AT--TA----GCGACCA-TAAAGCAA----CAATTA-TTAT-TT--T--ACC-------TTTTCATTAT-C--AGC-----TTC--AT--A---GCACTTA---T-GAA--AGA--AATA-TTTGGTTATATGATA-AAGCTGA-TT-T--CC-----AAC--TTCTAAATGAAAA--G-AT-AC-------AAT------CTTATGA---TTGGGA--------------CTG-T-T---TGA--ATGA-T-T-----ATAG--------TATT-AA-T--GTTGCTTGC--AG-AAAATTGACTGATAT-TTT-TA--TATC--T-AT------GGTTTA-----ACA--A-----T--GTATTCCTTT-TAA-GCT-----G----TTACAGTACAACCTGACGACAAACCCTGGTTTGACTCTAAACTTAGA-A-AACA-T-----TT-------AC-GA--A--TA-AGAGATA----GA--CTTA-AA----------------AAAT--------TGC------A--TC-G-AAAAGTTGGAAGTC---------GA----AT-----GAT-TGGATAAAA---TA-T--AGAA-AAG--TTA-GAAATAAAGT-----AAATAAC--CT-TATAAAA-CATGCAAA---AG---------AAAACTTTT-TTAATA-------AT----T-TTGAA-------T-------TAAAT-A---TT--ACAGAATTA----CA--G-T--G-TA--ATGA---CAAA----AGAGGGTTT--TGGAAGATAGTGAAATACTTT-ATGAA-------AAAT--A---CAA----A--TAC
gi|137881 : aAAAGGCCAATTTTTTGAA--CGACTGCTTTATT--TCTAT-ATC-ctcatcgactatataaaaaatactacatttcaaaggccaattttttgaacgactgctttatttctatatca
gi|137882 : attcgggtattatagatatctccagacatattagcgaccataaagcaacaattattattttaccttttcattatcagcttcatagcacttatgaaagaaatatttggttatatgataaagctgatttccaacttctaaatgaaaagatacaatcttatgattgggactgtttgaatgattatagtattaatgttgcttgcagaaaattgactgatatttttatatctatggtttaacaatgtattccttttaagctgttacagtacaacctgacgacaaaccctggtttgactctaaacttagaaaacatttacgaataagagatagacttaaaaaattgcatcgaaaagttggaagtcgaatgattggataaaatatagaaaagttagaaataaagtaaataaccttataaaacatgcaaaagaaaacttttttaataattttgaattaaatattacagaattacagtgtaatgacaaaagagggttttggaagatagtgaaatactttatgaaaaatacaaatacctcatcgactatataaaaaatactacatttcAA-TAT-------AA--TTA---GCGACCA-CAAAGCTAAAGTC--TT-----T-TTAAT--A-------AAGTTTC----A-C--GAT-----TTTAAAC--A---AA-CATG-T-T-CAAAACGA--TAAG-TCTGGAATTACACAA-AAGGTGA-CTATGAAACGTTTAAC--C---GCATGATATCCG-AC-C--------AA------------GA---CTGGGA--C----------ATTA-T-T---GAA--GAAC-T-T--GACATAAATGACTCATGTT-CA-C--GAT--TTAC--TG-AGA---------CAT-TTC-TA--TCAC--TTGT------G---AC-----CAA--A-----C--GTATCCCATC-CAAAGAA-----G----TAGTAATTCGACCTAATGACAAACCCTGGTACGACTC-------AAACG--ACA-A-----A--------A--GA----------AAATA----G---C----------GAC-----C---AAA----A---GTACA-----A--AC---CAAA-------------------------AT-----GAT-TGGACAAAA---CA-C--A-AA-CGT--TTAAGGAACAAGAT-----TAACAAC--TT-GAAAAAG-CATGCAAA---AG---------AACGCCTTT-TCAACA-------GCTTGGA-GGGAA---A-TAT-------TACCACA---TC--TCTG----A----CA--GACA-------AT-C---CAAATC-----AA---TACTGGAAAA-TCATAAGGAACTTGGTTAAAACTTAAAAA---A---TAATAGTA--AA-TCCGAA---ACAATCCT-AAT-AC---TGCAA------ACAACACTTACCGACGGCTCCGAGAGTA-TA---TGTTTCTCA---GAC--AA-TAAAGGCAAATTGTTTAAA--CGAGT-TTT--TTGGTCTAT-CTCTAACA
gi|137883 : -------AA--TAA---GTGACCA-TAGTGCAA----C--TTA-T-AT-ATA-T--TTAC----CATTTAC----T----TAT-----GA---ACTCA---ACTCATCATAT-GAA--AGA--ACCG-TCTGGTTATATAAAA-AAAGCAAATTTTGAGT-----TAT--T---AAATAGTA--------A--------AATATCGTATTT-TAA---ATGGGACTG----------TCTA-T-T---------AAA-T-GGATCAGTACACGAAGCTTGTG-AAAT--GTT-----C--AC-AGA---------TAT-TTT-TATCGAAT--TTGT----------CA-----TACT-A-----T--GTGTACCATT-CAAAAAATGTATG----TGATA----GACATGACGATGAACCATGGTATGATTCAGAAATT--------CA-A------T-------A--AATGT--CG-CGAAAAA----GA-------------GAC-----A---AGAT--AA---A-ACG-----A--ATAG-CAAAAAT--AA--CTGGCAAATTAA----AT-----GAT-TGGTCTAGA---TA-CCAA-AA-AAA--TC--GTAAAAAAGT-----AAACAAC--TT--AAAATATCATGCAAA---CG---------A--ATTATT-TTA
gi|137884 : AA---GTGAACA-CAAAGCTA----G--TTACT-AC-C-A-T--ATCT----CATTTTC----------GT---------------------CC-------------GG--AGAG-TTTAGTC--ATAAAA-ATGGCAA-TTATGTTT-----CAT--T---AAATGATAT--GGAT-ATT------AATACAT-ATTT-TGA-----------A----------TTTC-T-T---GAA--AATA-A-T--TCTATTGATGAAACTTGTG-AA-C--ATT-----------AAA---------TCA-TAT-CA--G--------T------G----------ACA--G-----T--ATAGT--TTC-AAAAGAC-----G----TCACAATTCGACCTAATGACAAACGACGGCATGATTCCTGAATAA-ATT-GACA--------------------------TT-CGAAACAACATGA--C--A-------GAC-----A---AAAG--CT---GTAAG-----G--AC-T-CAACG----GT--C---------AG----AG-----GAC-TGGACAAAA---TA-G--A-AATCAA--TTAAGAAAAAGAGTTAAAAAAACAAA--TT-AAAAACA--ATTCTAA--------------AACAATACA-ATAGCA-------AT----ACCAAAA---A-CTT-------TA--------------AG----A----CG--A-TA-GTGA--AT-----CCAATC--CTAAGCTT
gi|137885 : GG--AAAA-TTTGGAACTACGATA-AGGGCGA-ATTTGATA-----AGT--T---AAATAAAAT--G-AT-A--------AGTG----A----TGAAAATTGGGA--T----------TATA-T-A---AAC--GAAA-G-T--ACTACTGACGAATCTTGTT-TA-C--GTT--TTACTCAG-ACA---------TAAATTT-CA-----T--TTAT------G---------------ACGCCTT--GTATTCCTTC-AAAAGAA-----A----TTACTATTCGACCTAATTACAAACCTTGGTATGACTCCGAAATTTGAAA-GTTC-A-----CT-------A--AA--A--AA-AGGGACA----GG--C--A-AC--G-TAC-----A---AAAG--CT---ATCCG-----A--AC-GGCGAAT----AA--C----------------CTG---GAA-TGGACAAAA---TT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAATAAAGT-----AAATAATCTTT-AAAAAT----TGCTAA---AG---------AAAAGTTTT-TTAATA-------AC----A-TTGAA---ATCAC-------TA--------TT--TCAG----A----CT--C-TACG--------A---CCAACC--CGAAACAATATTGGAAATTACTTCGAAATTTG-ACAAA-----GACAA---A---CAG----T--AAAACTGAG---ACTGTGCCGATC-CT---TAAGACCATTGAGACC-GACA---AC-ACT-------GA-AACTTTACATGTTACT-GACAACG-ACAAAGCCAATTGCTTAAA--CGATTATTTCACT--TCAAT-TTC-AACTATaaaaccattcacaagtatttaaaaagcgagcgaaaatatt
gi|137886 : TTAGTTTCATAAAC-CGGGTAG-TTATGACA-----AAA--T---GGATGAACT--G-AT-ATTTTGGATAATA----AATCATAA---TTG-----------------TTG-T-T---TTA--CACATT-T--TTTGCAAACATGACATGTG-AG-C--GTT--TTAA--TA-AAA---------C---TTT-TA--
gi|137886 : AATGACAAACCAAGGTATGATTCCGAAATAAGACG--ACA--------------------------TC-CGAGACA-----A--C--ATAA--GAGAC-----A---A-----C-------TG-----A-------CAAAG----AA--C---------AG----A------GACATGAACAAAA---TA-C--A-AA-CAA--TTAAGGATCAAAGT-----AAATAAT--TT-AGAAACA-CATGCTAA---AGTGCCACATAAACA-TATCGTTGATATATGCACAT----A-GTGAA---A--TT-------TA----T---CT--TT-----------TA--G-CA---AT--TT-A---CAAATC-----GACTTTaatgacaaaccaaggtatgattccgaaataagacgacatccgagacaacataagagacaactgacaaagaacagagacatgaacaaaatacaaacaattaaggatcaaagtaaataatttagaaacacatgctaaagtgccacataaacatatcgttgatatatgcacatagtgaaatttatcttttagcaatttacaaatcgacttt
gi|137887 : ttagtttcataaaccgggtagttatgacaaaatggatgaactgatattttggataataaatcataattgttgttttacacattttttgcaaacatgacatgtgagcgttttaataaaacttttaTT--TTAT--TG-CAA---------CAT-TTA-TT--GACT--TAGT------G---TA-----ATA--A-----T--GTATTCCCAC-AAATCTT-----T----TAATAATTCGTCCAAGAGACAAGCCATGGTACAACTCCGAAATTAGACG-AACA-A-----CT-------C--G---T--TAGCGCGATA----GA--C--A-AA----AAC-----ATTTAGCT--C-----TTCG---------C-G-C-AGG----AA--C---------A-------------AT----ATCGAAGTTTT-T--A-AA-CAT--TTAAGAAACAAGAT-----AAATAAC--AT-GAAAAAA-CACTCAAACATAG---------AAACTTAAT-TTGATA-------AT----
gi|137888 : taaagaAA---------TAG-TTT-TAC-GATT--TTATTCCTCAG---TATAGTTAAC--A-----TTTGTATTGCGCC-AAAACAT-----A----TTACTCTCCAGACTGATGGCAAACCTTGGTACGACTTTGAAATAAGA----ACATA-----TT-------AAAGA--A--TA-AGAGACG----GG--C--A-AA------C-----A------T--CA---CT------------T-G-CACAA----AA--C---------AGGAAAACTTGCTGAC-TGGAATAAA---AA-T--A-AA-TATGATT--GTAACAAAGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAG-CACGTTAA---AG---------AA
gi|137889 : GGAC-AAA---TA-A--A-AA-CAA--TAAAGGAATAATGT-----AAATAAT--TT-AAAAAAAACATGCTAA---AG---------AACAATATT-TTGATA-------AT----A-TGGAA---A-ATT-------T---------TTAATAAT----A----TG--A-AA-A-AA--AT-GTTTCAAATT--CTAAATAATATTTGAAACTACTTAAACAGTTT-ATTAA-----GACAA---A---CAA----A--AACTCGGAA---ATAATTTC-TCC-AC---TAAAA------