lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :                                                                                     1111111                                                                                           11                                                            1                                  1                                            1                  222222222222222                                                                         11                                                     1                                                                         1                                 111     11                                                         1                                               44444444444444444                                                                                                                                                     11             11                                                           22222                        22     22222222             1                                      1                                                                                   22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222         1111  22222222222                                        1                              11111                              1            2       111111         111                                                                                  1         1       
lowQualScore                  :                                                       2                             6666666      4     33      7     8888888        4        3    3    2                   2          22           0    2      88  1                0             6 5                    66 5          1           3          7                     0                  222222222222222      9    7         66                                66       3      0 11           5                 7    3  2               0 66         9999                                                         6                            4    666  4  22                1                   8    5               5                      8             4          33333333333333333       7                           0                              4   0           0                         7       3          6                     11             22       5              4             3                3 3 1 99999     3   55     555  0  55     66666666     9       0 3    7777 7777                       6      1   55                                                                  888  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   5     1111  99999999999                                        5             7     6          22222   0             0      66    3    3       0       444444    5    333          4                                           7            3  0           7         5       
lowQualScore                  :                                                       .                             .......      .     ..      .     .......        .        .    .    .                   .          ..           .    .      ..  .                .             . .                    .. .          .           .          .                     .                  ...............      .    .         ..                                ..       .      . ..           .                 .    .  .               . ..         ....                                                         .                            .    ...  .  ..                .                   .    .               .                      .             .          .................       .                           .                              .   .           .                         .       .          .                     ..             ..       .              .             .                . . . .....     .   ..     ...  .  ..     ........     .       . .    .... ....                       .      .   ..                                                                  ...  ...........................................................   .     ....  ...........                                        .             .     .          .....   .             .      ..    .    .       .       ......    .    ...          .                                           .            .  .           .         .       
lowQualScore                  :                                                       7                             2222222      4     22      3     3333333        8        1    1    3                   5          22           9    3      11  0                4             0 0                    99 0          9           2          0                     0                  444444444444444      6    0         99                                99       1      1 99           0                 1    1  5               2 99         4444                                                         8                            7    444  4  22                7                   3    4               0                      3             4          55555555555555555       0                           4                              1   4           4                         6       5          0                     00             00       6              4             6                6 6 6 99999     6   00     555  5  77     44444444     6       8 9    7777 7777                       8      9   88                                                                  888  55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   0     0000  22222222222                                        0             2     0          55555   4             1      99    9    6       0       444444    0    888          7                                           0            2  8           0         0       
consensus                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTCGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCATATTTTTTT--ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----G-----A-----TTGAAACNTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-GAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GATGTAAAACAGTTAC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--TTTTT--CAAGAATATGTAT--------TGCGGNTGTAAATGACCTTA----T----TGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GN---------A-----------TTT-AGCTC---CGG----TG-----ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATA-----TGAGGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAAAAGCTACTGACCCAAAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATNTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
Reference ( gi|93564 )        :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAATAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATATGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAAAATGTAAAAAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTCCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCACATTTTTTT--ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCAATTCAAGGAGAAATAACAATTACAA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATAACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTT-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCGAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----G-----A-----TTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTTAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATACTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-TAGCAAAATATTACTAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTCATTTCAGTCGGAA-GATGTAAAACAGTTAC-A-CCGCTTATGAGTG-ATA--TTTTT--CAAAAAAGTGTAT--------TGCGGCTGTAAATTATCTTA----T----TGCGTCCGAAGTAAAATACATTCAAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GC---------A-----------TTT-AGCTC---TGG----TG-----ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCCGGTATTAAATCAGACTGTTTCAAGCAAATA-----TGAAGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAACAGCTACTGACCC-AAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGAATACTTATAAAGGAAAG
gi|93557                      :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTTCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTGAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAACATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTAC--GAGTTGAAAGTTCAATAAGTACATTAAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTCCAATTTGTTAT-AACCTTGAATTTTATGCATATCTTTGAAGATA-AATACTAAACTTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCATATTTTTTT--ATCATGTATTC-TTTTCCGATTGAAATGCGATTCAAGTAGAAATAGCAATTACGA--ATATATATA----CCTTTGATTAAAAGTAAATGTAAACGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACATAAAACTAATAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGATATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTTAT-CGCGACACTT-----G-----A-----TTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTTTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTATA-CAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCCGTCGGAA-GATGTAAAACAGTTAC-A-CCGTTTATGAGTG-ATA--TTTTT--CAAGAATATGTGT--------TGCGGCTGTAAATGATCTTA----T----TGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGAGACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------G---------G----------A-----------TTT-AGCTA---CGG----TG-----ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATTTTACGAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATA-----TGAAGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAGAAGCTACTGACCC-AAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93556                      : aaACATCTCAAAAACAAACTTTGCCAGCTTGATTATCTTGTCAAAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGGAGCATGT--CTGGCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAGAATGTAGACAATTTCAGAAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTAGACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTCGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATGCGATAATACAC--TGGTGCATATTTT--T--ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGAATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCTGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----G-----A-----TTGAAACTTTTCATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATATCCTGGCCCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGAGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-TAGCAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GATATAAAACAGTTAC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--TTTTT--CAAGAATATGAAT--------TGCGGCTGTAAATGAACTTC----T----TGCGTCCGAAGTAAAATA-ATTCTAAAATGTCTGTCTCAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GG---------A-----------TTT-AGCTC---CGG----TG-----TTTATTGGTGGAGACTGGAGTAGCTATATTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATA-----TGAGGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAAAAGCTTCTGACTC-AAAGC-C------AGTT-TATA---AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTAGCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93558                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCGAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTTTTCGTAA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAACCATGT--CTGTCTTTATGCTTGTTTTTATACGAGTCGACAGTTCAATAAGTACATTTAAAGTGTAGACAATATCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATATTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTACGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATACGATAATACAC--TGATGCATATTTTTTT--ATCATGTATTC-TTTCCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAATAGAGTTTATGCTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAGAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGCTTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----G-----A-----TT-AAACGTTGTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCAAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCAAAGAAAAGTTGAAAGATGTTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-TAGAAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GGTATAAAACAGTTAC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--GTTTT--CACGAATATGTAT--------TGCGGCTGTAAATGAACTTC----T----TGCGTCAGAAGTAAAATACATTCTAAAATG--TG--TAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------AT---------A-----------TTT-AGCTC---CGG----TG-----ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATATGACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCAAAGCAAATA-----TGAGGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAAAAGCTACTGACCC-AAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTCATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAGG
gi|93560                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93559                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93561                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGTCAGAATTGGATGTACTCATCAAATTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGTTCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93562                      : aaACATCTCAATTACAAACTT---------GATTATCTTGTCAGAATTGACTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATCC----------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGCTAA-----TAAT
gi|93563                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGT
gi|93565                      :                                                                          aaATATATATTTTCTGTAATGACA--TT----TTGTTAATAGTCTA-----T--TGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAACATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGT--CTGTCTTTCCG--------------AGCCGAAAGTTCAATTGGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGTAATTTATTATTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAC--GTCTGTATGTTCTACACATTACGATAATACACAGTGGTGCGGGTTTTTTTTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATGACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAAATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTGTGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGATGTCACCA-C---ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTAGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAAAAATTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTT-----GGCGAGA-----TTGAAACATTTTATGGCATAAAAGTTGTTATAGTGCATTCAATTCCAAAAACAAAATTAATAAACCCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTTGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCTTTCAGCAACTT-GAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGGTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GATGTAAAACAGTTAC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--TTTTT--CAAGAATATGTAT--------TGCGGCTGTAAATGACCTTA----T----TGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCAAAGTTT---AAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGGTACACTAATGACAGAATT---AT-----------GATTTGATCTGGAAAA---------GG---------G-----------TTT-AGCTC---CGG----TG-----ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGATATTTTACAAGAAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGTAAATA-----TGAGGATCGTTCTATGA--ACATC--AAAAAAGCTACTGACCCAAAAGCAC------AGTT-TATT---AGATCACCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTATTCTAGAGTCATATGAAAGTATACTTATACAGGAA
gi|93566                      :                                                                                             TGACATGTTGT-----TTA-TAGTC-------TAATGAAACAGTGTAAA-TGGC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGCAATTCGTACTTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAAGTAACTCT-----TA--------AGGTCAAGTGTACGCTTTGAC--GTCCGTATGTTCTACAC-----------------TGGTGCTTATTTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCCTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAACTACCTTAATTGTATGTAAAACTAGTAAAAATTGTC---A-CCCTATATATAAAGATACCATACAAAGTATCTGAGATTCATAGAAAATTACTTGTCACCTCCAGTATAGAAGTATTTGACAGAATTGATAGTTTTGAT-CGAGACACTT-----GGCGAGA-----TTGAAA-TATTTATGACATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAACACAAAATTAATACTATCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTTGACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-GAGCAAAATATTTCCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GATGTAAAACAGTTGC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--TTTTTTCCAAAATA-TGTAT--------TGCGGATGTAAATGACCTTA----T----TGCGTCCTAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGATGATACTATCGAAGATGATACGATAATGACAGAATA---AT-----------G--------------ATTTGAACTGGA---------AAATGG------TTT-AGCTC---CTG----TA-----ATTATTGGTGGCAACTAGAGTAGCTATTTTACAAAGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATA-----TGAGGATCGTTCTATGAAGACGTCAAAAAAAAGCTTCTGGTCCAAAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTACTATAGAGCCATGT
gi|93567                      :                                                                                                          TTGTTAATAGTC-------TAATGAAACAATGTTGG-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCGTTCTGTTAGTACTTTTACTAGCTGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAATTTTGGACATTTACAGTATTT-TTATTTTAA-TTCCAAATATACGATTTATTATTAACCTTAAATATTATACCTATCTTTGAAGATACAATACTTAAACTAATTCT-----AATTAAAAAAAAGTTGCGTGTAAGTTTGAATATGTCCGTATGTTTTACACAAGACGATAATACAC--TGATGCACGTTTTT----ATCATAATTTT-TTTTCCAATTGAAATGAGATTCCAGTAGAAATAATAATTACGA--ATATATATATGTACCTTAGATTAAAATTAAATGTAAAAGAAAGACAGCTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGAACATAAAATTAGTAAAATTTGT--CTC-CC--TTA---------------CAACGTATCTGAAATTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAATATAGAAATTCTTGAAAAAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTT-----G-----ACAAGATTGAAACACTTTATGGCATAAAATGTGTTATAGTGCATTCACTTCCGAAAACTAAATTAATAATCTTAATGTAAAACTAGCACCTCCTAGACCGTCTACTAGTAGTGT-----------TGAAAGATGATCCTGTCCGTTCAATAACTT-GAGACAAATACTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGACAAAA-GATGTAAAACAGTTTC-A-TTGTGTAAGAATG-ATC--TTTTT--AAGAATAG-GTAT--------TGCGGGTGTAAATGACCTTA----T----TGCGTCCGAAGTAAAATGCAATCTTAAATGTCTGTCTAAGTTTATAAGACAAACTGTGAAGTATAAGGATAGTATCAAAGATGAAACAGTAATAACAAAATT---ATTATTTTAACTGG--------------A---------AT---------AGG---------TTTAAGCTCATGTGGGACATGTGTATGTTATTGGTGGTGATTGGACTAACCATTCTAAAAGGAAGCAGGTATTTAAGCCGTCCA-TCCAAGCAAATATTTTTTAAAG--CTTTGTA-----ATTTC--CAAATATCT--TG--CT-AAAGCATATCAAAAGTTACATTCTGAGGCT------TATGCGTCTGATTTCGGGTCATATACTGATACATCTCATACTGATTCAAGTATTCT------ATACGAAAGTACACTTCTACAGGAAAG
gi|93568                      :                                                                                                               A-TAGTC-------TAATTAAACAATGTAGG-GGAC-AATGAAGCATCTTGTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCTTGCTGTTCGTACTAATACTAGCTGAAAGTTCAATAA
gi|93569                      :                                                                                                                   GTTAACAGTCTAATTAAACATTGAAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATGT--CTGTATTTCTGTTCGTATTTATACAAGCTGAAATTTCAGTAAGTGCATTTAACATGTGGGCAGTTTCAGTATTTGCTGTTT--ATTTGCAAATATGCGATTTGTTATTAACCTTAAATGGTATACCTTTCTTTGAAGAAATAATACTAAAATTAACTCTTATTAAA--------AAGTTA------CG--TGAAC--GTCCGTATGTTCTACACAAGACGATAATACAC--TGATGTACA--TTTTT--ATCA--AATTCATTTTCCAAT---------AGTC-----GAAATAATAATTAT-G--ACATATAAA----CCTTAGATTTAAAGTGAATGTAAAATAAAGAAATTTTATATTATGATGGAATCAAATTACCTTAATTCTAGGCAAAACTAGTAAAATGTG-T-CTACCC--ATATAAAAAAATGTCATACAAAGTATCTGGGACTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAGTAGTTCTTGACAAAATTGACAGTTTTGAT-CATGACACTTGGTGAG-----A-----TTGAAACATTTTATGTCATAAACCGTATTATAGTGCATTCACTTCCTAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGCACCTCCTAGACCTTCTGCTAGTAG--------------TGAAAGATGCTCCTGTCCATTCAACAACTT-GAGCAAAATACCACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTTAGTCGGAA----GTAAAACAGTTAC-A-TTGTGTA-AAAAA-ATATTTTTTT--TAAGAATATGTAT--------TGCGGGTGTAAATGACCCTA----T----TGTGTCCGCAGTAAAATACAATCCAAAATGTCTGTGTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAGTTGCAGAATTCTAAT-----------G--------------A---------GCTGGAACAGGA-----------TTT-TGCTC---TGGGACATGTGTATGTTATTTGTGGTGTTTAGAGTAGCCATTTTAAGAGAAAGCAGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATA-----AGAAGAGCGCTCGATGAAA----------------ACTGACCTAAAAACAC------AGTT-TATTA--AAACCATCAT
gi|93570                      :                                                                                                                        -----TAATGACATGTTGTGAATAGTCTAATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAGTAGGTGCATTTAAAATGTAGACAAATTCAGTAGTTGTTGTTT--A-TTGCAAATCTGCAATTTGTTAT-AAACTTAAATATTATACATATCTTTGAATATA-ACTACTAAAATTAACACT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAT--GTCAGTATTTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGTATATATTTTT--ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTCAGTAGAAATAACAATAACGA--ATATATAAA----CCTTAGATTAAAAGTAAACGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTAACTGAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGTTGT---CA-CCCGATATATAAAGATGCCGTACAAAGTATCTGAGATTCATAGAATATTAATTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCAAG-----A-----TTGAAACATTTTATGACGTAAACTTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTT-GAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAA-GATTTAAAACAGTTAC-A-CTGTATAAGAGTG-ATA--TTTTT--CAAGAATATGTAT--------TACGGTTGTAAATGACATTA----T----TGCGTCTGAAGTGAAATACGTTCTAACATG--TG--TAAGTTTAATAG-------GTGAAGTATGAAGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------ATTT------GG---------ACTGGAAAAAGGTTT-AGCTC---CGG----TG-----ATTATTGGTGACGACTGGAGTAGCTGTTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATA-----TGTGGATCGTTCTATGAAGACGTC--AAAAAAGCTACTGACCCAAAAGCAC------AGTT-TATT---AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATTTACTGATTTATCTGATAATGGTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93571                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93572                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93573                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93574                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-AAAT-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93575                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATA----CTTTGGATTAAA-GTAAATGTAAATGATAGAGAGTTTATGTTA----------------CCTAAATTGTACACCATACTAGTAAAAGTTGTC-TCC-CC--TTATATAGATATGCCATACGGAGCATCTGAGATTCGTAGAATATTATTTGATACCTCCAGTATAGAAGTAATTGACAAAATTAACAGTTTTTATAAATGACA
gi|93570                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTATTTCACTTCAGACGCAATAATGT----CATTTACAA-CCGT-----AATACATA--TTCTT--GAAAAA----TATCACTCTTATACAG-TGT-AACTGTTTTAAATCT----TCCGACTGAAATAAAATACA
gi|93556                      :                                                                                                                                                                                taatgacatgttgtgaatagtctaatgaagcatctatttaaaggatattgaagcatgcctgtctttctgcttgtttttatacgagccgaaagttcagtaggtgcatttaaaatgtagacaaattcagtagttgttgtttattgcaaatctgcaatttgttataaacttaaatattatacatatctttgaatataactactaaaattaacacttaaggttatgtgtacgcttgaatgtcagtattttctacacaatacgataatacactggtgtatatatttttatcatgtattcttttccaattgaaatgcgatttcagtagaaataacaataacgaatatataaaccttagattaaaagtaaacgtaaaagaaagagagtttatgttatgatgtaatcaaattaactgaattgtacgtaaaactagtaaaagttgtcacccgatatataaagatgccgtacaaagtatctgagattcatagaatattaattgttacctccagtatagaagttcttgacagaattgacagttttgatcgtgacacttggcaagattgaaacattttatgacgtaaactttgttatagtgcattcacttccaaaaacaaaattaataaactcaaagaaaaaatgggacctcctgaaccttctactagtagtgtcgaagaagtgttgaaagatgctcctgtccgttcagcaacttgagcaaaatattacccactgattggagttgtTATTTTACTTCGGACGCAA-GAAGTT---CATTTAC-AGCCGC----AATTC-ATA--TTCTT--GAAAAA----TATCACTCTTATACAG-TGTAA-CTGTTTTA----TATCTTCCGACTGAAATAAAATACAgttctaacatgtgtaagtttaataggtgaagtatgaagatactatcgaagatgatacagtaatgacagaattatgatttggactggaaaaaggtttagctccggtgattattggtgacgactggagtagctgttttacaaggaagcgggtattaaatcagtctgttccaagcaaatatgtggatcgttctatgaagacgtcaaaaaagctactgacccaaaagcacagtttattagaccatcatctatgcgtctgattttgggtcatttactgatttatctgataatggttcaagtattctagaaccatatgaaagtatacttatacaggaaag
gi|93576                      :                                                                                    aaacatctcaaaaacaaactttgccagcttgattatcttgtcaaaattggctgtgctcatcaaactgtagaattcatatacattatgatagttgtgatcgttatagttaataatgaaacagtgtaaaggacaatggagcatctatttaaaggatattggagcatgtctggctttctgcttgtttttatacgagtcgaaagttcaataagtacatttagaatgtagacaatttcagaagttgttgtttattgcaaatctgcaatttgttattaaccttgaattttagacatatctttgaagataaatactaaaattaactctaaaagttaagtgttcgctcggacgtccgtatgttcttcacaatgcgataatacactggtgcatatttttatcatgtattcttttccaattgaaatgcgatttaaggagaaataacaattacgaatatatataccttagattaaaagtaaatgtaaaagaaagagagtttatgttatgatgtaatcaaattaccttaattgtacgtaaaactagtaaaacttgtcctaccatatataaagatgccacacaaagaatctgagattcgaagaaaattacttgttacctcctgtatagaagttcttgacagaaatgacagttttgatcgtgacacttgattgaaacttttcatggcataaaatttgttatagtgtattcacttccaaaaacaaaattaataaactcaaaagaaaaatgggatatcctggcccttctactagtagtgtcgaagaagagttgaaagatgctcctgtccgttcagcaactttagcaaaatattaccaactgattcgagttgtCAGTCACAA-GATGTAAAACAGTTGC-A-TTGTGTAAAAATT-ATA--TTTTT--AAAGAATATGTAT--------TGTGGGTGT-TATAACCTTA----T----TGCGTAGGAAGGAAAATACAATCTAAAATGTCTAT-TAAGTTAAAAAAACAAATTGTGAAGGATGGGTATACTATCATAGGTGAattctaaaatgtctgtctcagtttaaaaaacaaattgtgaagtatgaggatactatcaaagatgatacagtaatgacagaattatgaggatttagctccggtgtttattggtggagactggagtagctatattacaaggaagcgggtattaaatcagactgttccaagcaaatatgaggatcgttctatgaagacgtcaaaaaagcttctgactcaaagccagtttataagaccatcatatatgcgtctgattttgggtcatatactgatttagctgataatgtttcaagtattctagaaccatatgaaagtatacttatacaggaaag
gi|93577                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGTGTCTGATTTAGGGTCATATACTGATCCATCTGATTATGATTCAAGTATTCT------ATATGAAAGTATACTTCTACAGGAAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                     1111111                                                                                           11                                                                                                                                                               111111111111111                                                                                                                                                                                                                                              11111111                                                                                                          44444444444                                                                                                                                                                                                                                               11111                                                                                                                                            00000000000000000000000000000000000000000000                  333333333333                                                                                          1111111                              1                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                                                     4444444      4      1      6     6666666                 2    2                        1          11             4  1                                                                66   4                    1          1                     8                  777777777777777      1    2         66                                66       66       555           4                      1  1                 66         8888                                                                                      1     77777777                                    1    1                                      1             4           66666666666       1                                                                                                    5       2                                0              1       1                                                 0                00000                 1                                                  5           0                                                      777  22222222222222222222222222222222222222222222   4        9999  333333333333                                                      2                                   4444444     66        4      66 777  2    4           4          5                                           1            1                                
lowQualScore                  :                                                                                     .......      .      .      .     .......                 .    .                        .          ..             .  .                                                                ..   .                    .          .                     .                  ...............      .    .         ..                                ..       ..       ...           .                      .  .                 ..         ....                                                                                      .     ........                                    .    .                                      .             .           ...........       .                                                                                                    .       .                                .              .       .                                                 .                .....                 .                                                  .           .                                                      ...  ............................................   .        ....  ............                                                      .                                   .......     ..        .      .. ...  .    .           .          .                                           .            .                                
lowQualScore                  :                                                                                     4444444      0      0      7     4444444                 9    9                        5          00             6  2                                                                11   4                    9          0                     9                  999999999999999      0    6         11                                11       11       333           4                      8  1                 11         5555                                                                                      0     66666666                                    4    0                                      4             0           66666666666       0                                                                                                    7       1                                1              1       1                                                 7                11111                 0                                                  0           5                                                      888  66666666666666666666666666666666666666666666   4        4444  999999999999                                                      6                                   4444444     11        4      11 888  8    4           4          9                                           0            9                                
consensus                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGA-----TTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GGA-----TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
Reference ( family-772 )      :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTCGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----A-----TTGAAACNTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGTATTGCGGNTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GNA-----TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATNTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93556                      :   ACATCTCAAAAACAAACTTTGCCAGCTTGATTATCTTGTCAAAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGGAGCATGT--CTGGCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAGAATGTAGACAATTTCAGAAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTAGACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTCGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATGCGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTT--T-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGAATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCTGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----A-----TTGAAACTTTTCATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATATCCTGGCCCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGAGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGAATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCCGAAGTAAAATA-ATTCTAAAATGTCTGTCTCAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GGA-----TTT-AGCTCCGG----TG------------TTTATTGGTGGAGACTGGAGTAGCTATATTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TTCTGA--C---TC-AAAG-C-CAGTTTATA-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTAGCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93557                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTTCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTGAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAACATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTA--CGAGTTGAAAGTTCAATAAGTACATTAAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTAT-AACCTTGAATTTTATGCATATCTTTGAAGATA-AATACTAAACTTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCGATTGAAATGCGATTCAAGTAGAAATAGCAATTACGA--ATATATATA----CCTTTGATTAAAAGTAAATGTAAACGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACATAAAACTAATAAAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGATATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTTAT-CGCGACACTTG-----A-----TTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTTTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTATACAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCCGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGTTTATGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGTGTTGCGGCTGTAAATGATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGAGACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G------------------------GGA-----TTT-AGCTACGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATTTTACGAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAGAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93558                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCGAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTTTTCGTAA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAACCATGT--CTGTCTTTATGCTTGTTTTTATACGAGTCGACAGTTCAATAAGTACATTTAAAGTGTAGACAATATCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATATTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTACGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATACGATAATACAC--TGATGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTCCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAATAGAGTTTATGCTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAGAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGCTTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----A-----TT-AAACGTTGTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCAAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCAAAGAAAAGTTGAAAGATGTTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGAAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGGTATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATAGTTTT--C--ACGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCAGAAGTAAAATACATTCTAAAATG--TG--TAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------ATA-----TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATATGACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCAAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTCATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAGG
gi|93559                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93560                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93561                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGTCAGAATTGGATGTACTCATCAAATTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGTTCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93562                      : aaACATCTCAATTACAAACTT---------GATTATCTTGTCAGAATTGACTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATCC----------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGCTAA-----TAAT
gi|93563                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGT
gi|93564                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAATAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATATGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAAAATGTAAAAAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--CATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCAATTCAAGGAGAAATAACAATTACAA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATAACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTT-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCGAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----A-----TTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTTAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATACTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACTAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTCATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGCTTATGAGTGATATTTTT--C--AAAAAAGTGTATTGCGGCTGTAAATTATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCAAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------A---------GCA-----TTT-AGCTCTGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCCGGTATTAAATCAGACTGTTTCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAACAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGAATACTTATAAAGGAAAG
gi|93565                      :                                                                            ATATATATTTTCTGTAATGACA--TT----TTGTTAATAGTCTA-----T--TGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAACATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGT--CTGTCTTTC--------------CGAGCCGAAAGTTCAATTGGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGTAATTTATTATTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAC--GTCTGTATGTTCTACACATTACGATAATACACAGTGGTGCGGGTTTTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATGACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAAATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTGTGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGATGTCACCAC---ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTAGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAAAAATTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGGCGAGA-----TTGAAACATTTTATGGCATAAAAGTTGTTATAGTGCATTCAATTCCAAAAACAAAATTAATAAACCCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTTGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCTTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGGTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCAAAGTTTAA---ACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGGTACACTAATGACAGAATT---AT-----------GATTTGATCTGGAAAA---------GGG-----TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGATATTTTACAAGAAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGTAAATATGAGGATCGTTCTATGA---------ACATC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGATCACCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTATTCTAGAGTCATATGAAAGTATACTTATACAGGAA
gi|93566                      :                                                                                             TGACATGTTGT-----TTA-TAGTC-------TAATGAAACAGTGTAAA-TGGC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTCGTACTTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAAGTAACTCT-----TA--------AGGTCAAGTGTACGCTTTGAC--GTCCGTATGTTCTACAC-----------------TGGTGCT--TATTTTTTTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCCTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAACTACCTTAATTGTATGTAAAACTAGTAAAAATTGTC---ACCCTATATATAAAGATACCATACAAAGTATCTGAGATTCATAGAAAATTACTTGTCACCTCCAGTATAGAAGTATTTGACAGAATTGATAGTTTTGAT-CGAGACACTTGGCGAGA-----TTGAAATATTT-ATGACATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAACACAAAATTAATACTATCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTTGACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTTCCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTGCACTGTATAAGAGTGATATTTTTTCC--AA-AATATGTATTGCGGATGTAAATGACCTTATTGCGTCCTAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGATGATACTATCGAAGATGATACGATAATGACAGAATA---AT-----------G--------------ATTTGAACTGGAAAATGGTTT-AGCTCCTG----TA------------ATTATTGGTGGCAACTAGAGTAGCTATTTTACAAAGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTCAAAAAAAAGC-TTCTGG--T---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTACTATAGAGCCATGT
gi|93567                      :                                                                                                          TTGTTAATAGTC-------TAATGAAACAATGTTGG-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCGTTCTGTTAGTACTTTTACTAGCTGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAATTTTGGACATTTACAGTATTT-TTATTTTAATT-CCAAATATACGATTTATTATTAACCTTAAATATTATACCTATCTTTGAAGATACAATACTTAAACTAATTCT-----AATTAAAAAAAAGTTGCGTGTAAGTTTGAATATGTCCGTATGTTTTACACAAGACGATAATACAC--TGATGCA--CGTTTTT---ATCATAATTTT-TTTTCCAATTGAAATGAGATTCCAGTAGAAATAATAATTACGA--ATATATATATGTACCTTAGATTAAAATTAAATGTAAAAGAAAGACAGCTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGAACATAAAATTAGTAAAATTTGTC-------------------TCCCTTACAACGTATCTGAAATTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAATATAGAAATTCTTGAAAAAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTG-----ACAAGATTGAAACACTTTATGGCATAAAATGTGTTATAGTGCATTCACTTCCGAAAACTAAATTAATAATCTTAATGTAAAACTAGCACCTCCTAGACCGTCTACTAGTAGTGT-----------TGAAAGATGATCCTGTCCGTTCAATAACTTGAGACAAATACTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGACAAAAGATGTAAAACAGTTTCATTGTGTAAGAATGATCTTTTT-----AAGAATAGGTATTGCGGGTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATGCAATCTTAAATGTCTGTCTAAGTTTATAAGACAAACTGTGAAGTATAAGGATAGTATCAAAGATGAAACAGTAATAACAAAATT---ATTATTTTAACTGG--------------A---------ATAGG---TTTAAGCTCATG----TGGGACATGTGTATGTTATTGGTGGTGATTGGACTAACCATTCTAAAAGGAAGCAGGTATTTAAGCCGTCCA-TCCAAGCAAATAT--------TTTT-TAAAGCTTTGTAATTTC--CAAATATCTTGCTAAAGCATATCAAAAGTTACA--TTCTG-AGGC--TTAT----GCGTCTGATTTCGGGTCATATACTGATACATCTCATACTGATTCAAGTATTCT------ATACGAAAGTACACTTCTACAGGAAAG
gi|93568                      :                                                                                                               A-TAGTC-------TAATTAAACAATGTAGG-GGAC-AATGAAGCATCTTGTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCTTGCTGTTCGTACTAATACTAGCTGAAAGTTCAATAA
gi|93569                      :                                                                                                                   GTTAACAGTCTAATTAAACATTGAAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATGT--CTGTATTTCTGTTCGTATTTATACAAGCTGAAATTTCAGTAAGTGCATTTAACATGTGGGCAGTTTCAGTATTTGCTGTTT--ATTTGCAAATATGCGATTTGTTATTAACCTTAAATGGTATACCTTTCTTTGAAGAAATAATACTAAAATTAACTCTTATTAAA--------AAGTTACGTG--------AAC--GTCCGTATGTTCTACACAAGACGATAATACAC--TGATGTA--CATTTTT---ATCAA--ATTCATTTTCCAAT---------AGTC-----GAAATAATAATTATGA---CATATAAA----CCTTAGATTTAAAGTGAATGTAAAATAAAGAAATTTTATATTATGATGGAATCAAATTACCTTAATTCTAGGCAAAACTAGTAAAATGTGTC--TACCC-ATATAAAAAAATGTCATACAAAGTATCTGGGACTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAGTAGTTCTTGACAAAATTGACAGTTTTGAT-CATGACACTTGGTGAGA-----TTGAAACATTTTATGTCATAAACCGTATTATAGTGCATTCACTTCCTAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGCACCTCCTAGACCTTCTGCTAGTAGTG--------------AAAGATGCTCCTGTCCATTCAACAACTTGAGCAAAATACCACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTTAGTCGGAAG---TAAAACAGTTACATTGTGTAAAAA-AATATTTTT--TTTAAGAATATGTATTGCGGGTGTAAATGACCCTATTGTGTCCGCAGTAAAATACAATCCAAAATGTCTGTGTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAGTTGCAGAATTCTAAT-----------GAGCTGGAAC-----A---------GGA-----TTT-TGCTCTGGGACATGTGTAT-------GTTATTTGTGGTGTTTAGAGTAGCCATTTTAAGAGAAAGCAGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATAAGAAGAGCGCTCGATGAAA------------------------ACTGA--C---CTAAAAA-CACAGTTTATTAAAACCATCAT
gi|93570                      :                                                                                                                        -----TAATGACATGTTGTGAATAGTCTAATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAGTAGGTGCATTTAAAATGTAGACAAATTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTAT-AAACTTAAATATTATACATATCTTTGAATATA-ACTACTAAAATTAACACT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAT--GTCAGTATTTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGTA--TATATTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTCAGTAGAAATAACAATAACGA--ATATATAAA----CCTTAGATTAAAAGTAAACGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTAACTGAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGTTGTC---ACCCGATATATAAAGATGCCGTACAAAGTATCTGAGATTCATAGAATATTAATTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCAAGA-----TTGAAACATTTTATGACGTAAACTTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATTTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATATTTTT--C--AAGAATATGTATTACGGTTGTAAATGACATTATTGCGTCTGAAGTGAAATACGTTCTAACATGT--GT--AAGTTTAATAG-------GTGAAGTATGAAGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---AT-----------G--------------ATTTGGACTGGAAAAAGGTTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGACGACTGGAGTAGCTGTTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGTGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATTTACTGATTTATCTGATAATGGTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93571                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93572                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93573                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93574                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-AAAT-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93575                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATA----CTTTGGATTAAA-GTAAATGTAAATGATAGAGAGTTTATGTTA----------------CCTAAATTGTACACCATACTAGTAAAAGTTGTC-TCCCC--TTATATAGATATGCCATACGGAGCATCTGAGATTCGTAGAATATTATTTGATACCTCCAGTATAGAAGTAATTGACAAAATTAACAGTTTTTATAAATGACA
gi|93576                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGTCACAAGATGTAAAACAGTTGCATTGTGTAAAAATTATATTTTT--A--AAGAATATGTATTGTGGGTGT-TATAACCTTATTGCGTAGGAAGGAAAATACAATCTAAAATGTCTAT-TAAGTTAAAAAAACAAATTGTGAAGGATGGGTATACTATCATAGGTGA
gi|93577                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGTGTCTGATTTAGGGTCATATACTGATCCATCTGATTATGATTCAAGTATTCT------ATATGAAAGTATACTTCTACAGGAAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                     1111111                                                                                           11                                                                                                                                                               111111111111111                                                                                                                                                                                                                                              111111111                                                                                                         22222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0000000000000000000000000000000000000                  333333333333                                                                                          1111111                              1                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      4      1      6     6666666                 2    2                        1          11                1                                                                66   4                    1          1                     8                  777777777777777      1    2         66                                66       66       1 4           4                      1  1                 66         8888                                                                                      1     222222222                                    1    1                                      1             4          44444         1                                                                                                    2                                        0              1       1                                                 0           55     55                  1                                             0   33           0                                                      777   5555555555555555555555555555555555555   4        9999  333333333333                                                      1                                   4444444     66        4      66 777  2    4           4          6                                           1            1                                
lowQualScore                  :                                                       .                             .......      .      .      .     .......                 .    .                        .          ..                .                                                                ..   .                    .          .                     .                  ...............      .    .         ..                                ..       ..       . .           .                      .  .                 ..         ....                                                                                      .     .........                                    .    .                                      .             .          .....         .                                                                                                    .                                        .              .       .                                                 .           ..     ..                  .                                             .   ..           .                                                      ...   .....................................   .        ....  ............                                                      .                                   .......     ..        .      .. ...  .    .           .          .                                           .            .                                
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      0      0      7     4444444                 9    9                        5          00                2                                                                11   4                    9          0                     9                  999999999999999      0    6         11                                11       11       9 4           4                      8  1                 11         5555                                                                                      0     666666666                                    4    0                                      4             0          33333         3                                                                                                    9                                        1              1       1                                                 7           55     55                  6                                             8   33           5                                                      888   3333333333333333333333333333333333333   4        4444  999999999999                                                      0                                   4444444     11        4      11 888  8    4           4          1                                           0            9                                
consensus                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
Reference ( family-772 )      :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93556                      :   ACATCTCAAAAACAAACTTTGCCAGCTTGATTATCTTGTCAAAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGGAGCATGT--CTGGCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAGAATGTAGACAATTTCAGAAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTAGACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTCGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATGCGATAATACAC--TGGTGCA--TA--TTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGAATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCTGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATTGAAACTTTTCATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATATCCTGGCCCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGAGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGAATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCCGAAGTAAAATA-ATTCTAAAATGTCTGTCTCAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------TTTATTGGTGGAGACTGGAGTAGCTATATTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TTCTGA--C---TC-AAAG-C-CAGTTTATA-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTAGCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93557                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTTCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTGAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAACATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTA--CGAGTTGAAAGTTCAATAAGTACATTAAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTAT-AACCTTGAATTTTATGCATATCTTTGAAGATA-AATACTAAACTTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCGATTGAAATGCGATTCAAGTAGAAATAGCAATTACGA--ATATATATA----CCTTTGATTAAAAGTAAATGTAAACGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACATAAAACTAATAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGATATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTTAT-CGCGACACTT-----GATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTTTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTATACAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCCGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGTTTATGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTGTTGCGGCTGTAAATGATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGAGACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG-----------------------GGA-----------TTT-AGCTACGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATTTTACGAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAGAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93558                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCGAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTTTTCGTAA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAACCATGT--CTGTCTTTATGCTTGTTTTTATACGAGTCGACAGTTCAATAAGTACATTTAAAGTGTAGACAATATCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATATTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTACGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATACGATAATACAC--TGATGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTCCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAATAGAGTTTATGCTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAGAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGCTTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATT-AAACGTTGTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCAAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCAAAGAAAAGTTGAAAGATGTTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGAAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGGTATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--GTTTT--CACGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCAGAAGTAAAATACATTCTAAAATG--TG--TAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------ATA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATATGACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCAAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTCATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAGG
gi|93559                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93560                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93561                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGTCAGAATTGGATGTACTCATCAAATTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGTTCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93562                      : aaACATCTCAATTACAAACTT---------GATTATCTTGTCAGAATTGACTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATCC----------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGCTAA-----TAAT
gi|93563                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGT
gi|93564                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAATAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATATGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAAAATGTAAAAAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--CATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCAATTCAAGGAGAAATAACAATTACAA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATAACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTT-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCGAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTTAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATACTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACTAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTCATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGCTTATGAGTGATA--TTTTT--CAAAAAAGTGTATTGCGGCTGTAAATTATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCAAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GCA-----------TTT-AGCTCTGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCCGGTATTAAATCAGACTGTTTCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAACAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGAATACTTATAAAGGAAAG
gi|93565                      :                                                                            ATATATATTTTCTGTAATGACA--TT----TTGTTAATAGTCTA-----T--TGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAACATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGT--CTGTCTTTC--------------CGAGCCGAAAGTTCAATTGGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGTAATTTATTATTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAC--GTCTGTATGTTCTACACATTACGATAATACACAGTGGTGCGGGTTTTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATGACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAAATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTGTGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGATGTCACCA--C--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTAGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAAAAATTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAAGTTGTTATAGTGCATTCAATTCCAAAAACAAAATTAATAAACCCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTTGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCTTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGGTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCAAAGTTTAA---ACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGGTACACTAATGACAGAATT---ATGATTTGATCTGGAAAA--------GGG-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGATATTTTACAAGAAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGTAAATATGAGGATCGTTCTATGA---------ACATC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGATCACCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTATTCTAGAGTCATATGAAAGTATACTTATACAGGAA
gi|93566                      :                                                                                             TGACATGTTGT-----TTA-TAGTC-------TAATGAAACAGTGTAAA-TGGC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTCGTACTTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAAGTAACTCT-----TA--------AGGTCAAGTGTACGCTTTGAC--GTCCGTATGTTCTACAC-----------------TGGTGCT--TATTTTTTTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCCTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAACTACCTTAATTGTATGTAAAACTAGTAAAAATTGTC---A-CCCTATATATAAAGATACCATACAAAGTATCTGAGATTCATAGAAAATTACTTGTCACCTCCAGTATAGAAGTATTTGACAGAATTGATAGTTTTGAT-CGAGACACTTGGCGAGATTGAAATATTT-ATGACATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAACACAAAATTAATACTATCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTTGACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTTCCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTGCACTGTATAAGAGTGATA--TTTTTTCCAA-AATATGTATTGCGGATGTAAATGACCTTATTGCGTCCTAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGATGATACTATCGAAGATGATACGATAATGACAGAATA---ATG--------------ATTTGAACTGGAAAATGG-----TTT-AGCTCCTG----TA------------ATTATTGGTGGCAACTAGAGTAGCTATTTTACAAAGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTCAAAAAAAAGC-TTCTGG--T---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTACTATAGAGCCATGT
gi|93567                      :                                                                                                          TTGTTAATAGTC-------TAATGAAACAATGTTGG-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCGTTCTGTTAGTACTTTTACTAGCTGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAATTTTGGACATTTACAGTATTT-TTATTTTAATT-CCAAATATACGATTTATTATTAACCTTAAATATTATACCTATCTTTGAAGATACAATACTTAAACTAATTCT-----AATTAAAAAAAAGTTGCGTGTAAGTTTGAATATGTCCGTATGTTTTACACAAGACGATAATACAC--TGATGCA--CGTTTTT---ATCATAATTTT-TTTTCCAATTGAAATGAGATTCCAGTAGAAATAATAATTACGA--ATATATATATGTACCTTAGATTAAAATTAAATGTAAAAGAAAGACAGCTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGAACATAAAATTAGTAAAATTTGTC--------------------TCCCTTACAACGTATCTGAAATTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAATATAGAAATTCTTGAAAAAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGACAAGATTGAAACACTTTATGGCATAAAATGTGTTATAGTGCATTCACTTCCGAAAACTAAATTAATAATCTTAATGTAAAACTAGCACCTCCTAGACCGTCTACTAGT-----------AGTGTTGAAAGATGATCCTGTCCGTTCAATAACTTGAGACAAATACTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGACAAAAGATGTAAAACAGTTTCATTGTGTAAGAATGATC--TTTTT---AAGAATAGGTATTGCGGGTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATGCAATCTTAAATGTCTGTCTAAGTTTATAAGACAAACTGTGAAGTATAAGGATAGTATCAAAGATGAAACAGTAATAACAAAATT---ATT--------------ATTTTAACTGGAATAGG------TTTAAGCTCATG----TGGGACATGTGTATGTTATTGGTGGTGATTGGACTAACCATTCTAAAAGGAAGCAGGTATTTAAGCCGTCCA-TCCAAGCAAATAT--------TTTT-TAAAGCTTTGTAATTTC--CAAATATCTTGCTAAAGCATATCAAAAGTTACA--TTCTG-AGGC--TTAT----GCGTCTGATTTCGGGTCATATACTGATACATCTCATACTGATTCAAGTATTCT------ATACGAAAGTACACTTCTACAGGAAAG
gi|93568                      :                                                                                                               A-TAGTC-------TAATTAAACAATGTAGG-GGAC-AATGAAGCATCTTGTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCTTGCTGTTCGTACTAATACTAGCTGAAAGTTCAATAA
gi|93569                      :                                                                                                                   GTTAACAGTCTAATTAAACATTGAAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATGT--CTGTATTTCTGTTCGTATTTATACAAGCTGAAATTTCAGTAAGTGCATTTAACATGTGGGCAGTTTCAGTATTTGCTGTTT--ATTTGCAAATATGCGATTTGTTATTAACCTTAAATGGTATACCTTTCTTTGAAGAAATAATACTAAAATTAACTCTTATTAAA--------AAGTTACGTG--------AAC--GTCCGTATGTTCTACACAAGACGATAATACAC--TGATGTA--CATTTTT---ATCAA--ATTCATTTTCCAAT---------AGTC-----GAAATAATAATTATGA---CATATAAA----CCTTAGATTTAAAGTGAATGTAAAATAAAGAAATTTTATATTATGATGGAATCAAATTACCTTAATTCTAGGCAAAACTAGTAAAATGTGT--CTACCC--ATATAAAAAAATGTCATACAAAGTATCTGGGACTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAGTAGTTCTTGACAAAATTGACAGTTTTGAT-CATGACACTTGGTGAGATTGAAACATTTTATGTCATAAACCGTATTATAGTGCATTCACTTCCTAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGCACCTCCTAGACCTTCTGCTAGTAG--------------TGAAAGATGCTCCTGTCCATTCAACAACTTGAGCAAAATACCACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTTAGTCGGAA---GTAAAACAGTTACATTGTGTAAAAA-AATATTTTTTT--TAAGAATATGTATTGCGGGTGTAAATGACCCTATTGTGTCCGCAGTAAAATACAATCCAAAATGTCTGTGTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAGTTGCAGAATTCTAATGAGCTGGAAC-----A--------GGA-----------TTT-TGCTCTGGGACATGTGTAT-------GTTATTTGTGGTGTTTAGAGTAGCCATTTTAAGAGAAAGCAGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATAAGAAGAGCGCTCGATGAAA------------------------ACTGA--C---CTAAAAA-CACAGTTTATTAAAACCATCAT
gi|93570                      :                                                                                                                        -----TAATGACATGTTGTGAATAGTCTAATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAGTAGGTGCATTTAAAATGTAGACAAATTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTAT-AAACTTAAATATTATACATATCTTTGAATATA-ACTACTAAAATTAACACT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAT--GTCAGTATTTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGTA--TATATTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTCAGTAGAAATAACAATAACGA--ATATATAAA----CCTTAGATTAAAAGTAAACGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTAACTGAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGTTGTC---A-CCCGATATATAAAGATGCCGTACAAAGTATCTGAGATTCATAGAATATTAATTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCAAGATTGAAACATTTTATGACGTAAACTTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATTTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTACGGTTGTAAATGACATTATTGCGTCTGAAGTGAAATACGTTCTAACATG--TG--TAAGTTTAATAG-------GTGAAGTATGAAGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------ATTT-----GGACTGGAAAAAGGTTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGACGACTGGAGTAGCTGTTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGTGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATTTACTGATTTATCTGATAATGGTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93571                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93572                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93573                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93574                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-AAAT-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93575                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATA----CTTTGGATTAAA-GTAAATGTAAATGATAGAGAGTTTATGTTA----------------CCTAAATTGTACACCATACTAGTAAAAGTTGTC-TCC-CC--TTATATAGATATGCCATACGGAGCATCTGAGATTCGTAGAATATTATTTGATACCTCCAGTATAGAAGTAATTGACAAAATTAACAGTTTTTATAAATGACA
gi|93576                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAGTCACAAGATGTAAAACAGTTGCATTGTGTAAAAATTATA--TTTTT--AAAGAATATGTATTGTGGGTGT-TATAACCTTATTGCGTAGGAAGGAAAATACAATCTAAAATGTCTAT-TAAGTTAAAAAAACAAATTGTGAAGGATGGGTATACTATCATAGGTGA
gi|93577                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTGTCTGATTTAGGGTCATATACTGATCCATCTGATTATGATTCAAGTATTCT------ATATGAAAGTATACTTCTACAGGAAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                     1111111                                                                                           11                                                                                                                                                               111111111111111                                                                                                                                                                                                                                              111111111                                                                                                         22222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0000000000000000000000000000000000000                  333333333333                                                                                          1111111                              1                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      4      1      6     6666666                 2    2                        1          11                1                                                                66   4                    1          1                     8                  777777777777777      1    2         66                                66       66       1 4           4                      1  1                 66         8888                                                                                      1     222222222                                    1    1                                      1             4          44444         1                                                                                                    2                                        0              1       1                                                 0           55     55                  1                                             0   33           0                                                      777   5555555555555555555555555555555555555   4        9999  333333333333                                                      1                                   4444444     66        4      66 777  2    4           4          6                                           1            1                                
lowQualScore                  :                                                       .                             .......      .      .      .     .......                 .    .                        .          ..                .                                                                ..   .                    .          .                     .                  ...............      .    .         ..                                ..       ..       . .           .                      .  .                 ..         ....                                                                                      .     .........                                    .    .                                      .             .          .....         .                                                                                                    .                                        .              .       .                                                 .           ..     ..                  .                                             .   ..           .                                                      ...   .....................................   .        ....  ............                                                      .                                   .......     ..        .      .. ...  .    .           .          .                                           .            .                                
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      0      0      7     4444444                 9    9                        5          00                2                                                                11   4                    9          0                     9                  999999999999999      0    6         11                                11       11       9 4           4                      8  1                 11         5555                                                                                      0     666666666                                    4    0                                      4             0          33333         3                                                                                                    9                                        1              1       1                                                 7           55     55                  6                                             8   33           5                                                      888   3333333333333333333333333333333333333   4        4444  999999999999                                                      0                                   4444444     11        4      11 888  8    4           4          1                                           0            9                                
consensus                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
Reference ( family-772 )      :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93556                      :   ACATCTCAAAAACAAACTTTGCCAGCTTGATTATCTTGTCAAAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGGAGCATGT--CTGGCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAGAATGTAGACAATTTCAGAAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTAGACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTCGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATGCGATAATACAC--TGGTGCA--TA--TTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGAATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCTGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATTGAAACTTTTCATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATATCCTGGCCCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGAGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGAATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCCGAAGTAAAATA-ATTCTAAAATGTCTGTCTCAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------TTTATTGGTGGAGACTGGAGTAGCTATATTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TTCTGA--C---TC-AAAG-C-CAGTTTATA-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTAGCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93557                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTTCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTGAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAACATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTA--CGAGTTGAAAGTTCAATAAGTACATTAAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTAT-AACCTTGAATTTTATGCATATCTTTGAAGATA-AATACTAAACTTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCGATTGAAATGCGATTCAAGTAGAAATAGCAATTACGA--ATATATATA----CCTTTGATTAAAAGTAAATGTAAACGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACATAAAACTAATAAAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGATATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTTAT-CGCGACACTT-----GATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTTTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTATACAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCCGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGTTTATGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTGTTGCGGCTGTAAATGATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGAGACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG-----------------------GGA-----------TTT-AGCTACGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATTTTACGAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAGAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93558                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCGAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTTTTCGTAA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAACCATGT--CTGTCTTTATGCTTGTTTTTATACGAGTCGACAGTTCAATAAGTACATTTAAAGTGTAGACAATATCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATATTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTACGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATACGATAATACAC--TGATGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTCCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAATAGAGTTTATGCTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAGAACTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGCTTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATT-AAACGTTGTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCAAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCAAAGAAAAGTTGAAAGATGTTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGAAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGGTATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--GTTTT--CACGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCAGAAGTAAAATACATTCTAAAATG--TG--TAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------ATA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATATGACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCAAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTCATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAGG
gi|93559                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93560                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93561                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGTCAGAATTGGATGTACTCATCAAATTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGTTCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93562                      : aaACATCTCAATTACAAACTT---------GATTATCTTGTCAGAATTGACTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATCC----------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGCTAA-----TAAT
gi|93563                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGT
gi|93564                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAATAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATATGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAAAATGTAAAAAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--CATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCAATTCAAGGAGAAATAACAATTACAA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATAACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTT-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCGAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTTAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATACTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACTAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTCATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGCTTATGAGTGATA--TTTTT--CAAAAAAGTGTATTGCGGCTGTAAATTATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCAAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GCA-----------TTT-AGCTCTGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCCGGTATTAAATCAGACTGTTTCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAACAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGAATACTTATAAAGGAAAG
gi|93565                      :                                                                            ATATATATTTTCTGTAATGACA--TT----TTGTTAATAGTCTA-----T--TGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAACATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGT--CTGTCTTTC--------------CGAGCCGAAAGTTCAATTGGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGTAATTTATTATTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAC--GTCTGTATGTTCTACACATTACGATAATACACAGTGGTGCGGGTTTTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATGACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAAATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTGTGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGATGTCACCA--C--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTAGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAAAAATTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAAGTTGTTATAGTGCATTCAATTCCAAAAACAAAATTAATAAACCCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTTGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCTTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGGTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCAAAGTTTAA---ACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGGTACACTAATGACAGAATT---ATGATTTGATCTGGAAAA--------GGG-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGATATTTTACAAGAAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGTAAATATGAGGATCGTTCTATGA---------ACATC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGATCACCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTATTCTAGAGTCATATGAAAGTATACTTATACAGGAA
gi|93566                      :                                                                                             TGACATGTTGT-----TTA-TAGTC-------TAATGAAACAGTGTAAA-TGGC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTCGTACTTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAAGTAACTCT-----TA--------AGGTCAAGTGTACGCTTTGAC--GTCCGTATGTTCTACAC-----------------TGGTGCT--TATTTTTTTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCCTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAACTACCTTAATTGTATGTAAAACTAGTAAAAATTGTC---A-CCCTATATATAAAGATACCATACAAAGTATCTGAGATTCATAGAAAATTACTTGTCACCTCCAGTATAGAAGTATTTGACAGAATTGATAGTTTTGAT-CGAGACACTTGGCGAGATTGAAATATTT-ATGACATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAACACAAAATTAATACTATCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTTGACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTTCCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTGCACTGTATAAGAGTGATA--TTTTTTCCAA-AATATGTATTGCGGATGTAAATGACCTTATTGCGTCCTAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGATGATACTATCGAAGATGATACGATAATGACAGAATA---ATG--------------ATTTGAACTGGAAAATGG-----TTT-AGCTCCTG----TA------------ATTATTGGTGGCAACTAGAGTAGCTATTTTACAAAGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTCAAAAAAAAGC-TTCTGG--T---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTACTATAGAGCCATGT
gi|93567                      :                                                                                                          TTGTTAATAGTC-------TAATGAAACAATGTTGG-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCGTTCTGTTAGTACTTTTACTAGCTGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAATTTTGGACATTTACAGTATTT-TTATTTTAATT-CCAAATATACGATTTATTATTAACCTTAAATATTATACCTATCTTTGAAGATACAATACTTAAACTAATTCT-----AATTAAAAAAAAGTTGCGTGTAAGTTTGAATATGTCCGTATGTTTTACACAAGACGATAATACAC--TGATGCA--CGTTTTT---ATCATAATTTT-TTTTCCAATTGAAATGAGATTCCAGTAGAAATAATAATTACGA--ATATATATATGTACCTTAGATTAAAATTAAATGTAAAAGAAAGACAGCTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGAACATAAAATTAGTAAAATTTGTC--------------------TCCCTTACAACGTATCTGAAATTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAATATAGAAATTCTTGAAAAAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGACAAGATTGAAACACTTTATGGCATAAAATGTGTTATAGTGCATTCACTTCCGAAAACTAAATTAATAATCTTAATGTAAAACTAGCACCTCCTAGACCGTCTACTAGT-----------AGTGTTGAAAGATGATCCTGTCCGTTCAATAACTTGAGACAAATACTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGACAAAAGATGTAAAACAGTTTCATTGTGTAAGAATGATC--TTTTT---AAGAATAGGTATTGCGGGTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATGCAATCTTAAATGTCTGTCTAAGTTTATAAGACAAACTGTGAAGTATAAGGATAGTATCAAAGATGAAACAGTAATAACAAAATT---ATT--------------ATTTTAACTGGAATAGG------TTTAAGCTCATG----TGGGACATGTGTATGTTATTGGTGGTGATTGGACTAACCATTCTAAAAGGAAGCAGGTATTTAAGCCGTCCA-TCCAAGCAAATAT--------TTTT-TAAAGCTTTGTAATTTC--CAAATATCTTGCTAAAGCATATCAAAAGTTACA--TTCTG-AGGC--TTAT----GCGTCTGATTTCGGGTCATATACTGATACATCTCATACTGATTCAAGTATTCT------ATACGAAAGTACACTTCTACAGGAAAG
gi|93568                      :                                                                                                               A-TAGTC-------TAATTAAACAATGTAGG-GGAC-AATGAAGCATCTTGTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCTTGCTGTTCGTACTAATACTAGCTGAAAGTTCAATAA
gi|93569                      :                                                                                                                   GTTAACAGTCTAATTAAACATTGAAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATGT--CTGTATTTCTGTTCGTATTTATACAAGCTGAAATTTCAGTAAGTGCATTTAACATGTGGGCAGTTTCAGTATTTGCTGTTT--ATTTGCAAATATGCGATTTGTTATTAACCTTAAATGGTATACCTTTCTTTGAAGAAATAATACTAAAATTAACTCTTATTAAA--------AAGTTACGTG--------AAC--GTCCGTATGTTCTACACAAGACGATAATACAC--TGATGTA--CATTTTT---ATCAA--ATTCATTTTCCAAT---------AGTC-----GAAATAATAATTATGA---CATATAAA----CCTTAGATTTAAAGTGAATGTAAAATAAAGAAATTTTATATTATGATGGAATCAAATTACCTTAATTCTAGGCAAAACTAGTAAAATGTGT--CTACCC--ATATAAAAAAATGTCATACAAAGTATCTGGGACTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAGTAGTTCTTGACAAAATTGACAGTTTTGAT-CATGACACTTGGTGAGATTGAAACATTTTATGTCATAAACCGTATTATAGTGCATTCACTTCCTAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGCACCTCCTAGACCTTCTGCTAGTAG--------------TGAAAGATGCTCCTGTCCATTCAACAACTTGAGCAAAATACCACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTTAGTCGGAA---GTAAAACAGTTACATTGTGTAAAAA-AATATTTTTTT--TAAGAATATGTATTGCGGGTGTAAATGACCCTATTGTGTCCGCAGTAAAATACAATCCAAAATGTCTGTGTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAGTTGCAGAATTCTAATGAGCTGGAAC-----A--------GGA-----------TTT-TGCTCTGGGACATGTGTAT-------GTTATTTGTGGTGTTTAGAGTAGCCATTTTAAGAGAAAGCAGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATAAGAAGAGCGCTCGATGAAA------------------------ACTGA--C---CTAAAAA-CACAGTTTATTAAAACCATCAT
gi|93570                      :                                                                                                                        -----TAATGACATGTTGTGAATAGTCTAATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAGTAGGTGCATTTAAAATGTAGACAAATTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTAT-AAACTTAAATATTATACATATCTTTGAATATA-ACTACTAAAATTAACACT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAT--GTCAGTATTTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGTA--TATATTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTCAGTAGAAATAACAATAACGA--ATATATAAA----CCTTAGATTAAAAGTAAACGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTAACTGAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGTTGTC---A-CCCGATATATAAAGATGCCGTACAAAGTATCTGAGATTCATAGAATATTAATTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCAAGATTGAAACATTTTATGACGTAAACTTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATTTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTACGGTTGTAAATGACATTATTGCGTCTGAAGTGAAATACGTTCTAACATG--TG--TAAGTTTAATAG-------GTGAAGTATGAAGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------ATTT-----GGACTGGAAAAAGGTTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGACGACTGGAGTAGCTGTTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGTGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATTTACTGATTTATCTGATAATGGTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93571                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93572                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93573                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93574                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-AAAT-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93575                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATA----CTTTGGATTAAA-GTAAATGTAAATGATAGAGAGTTTATGTTA----------------CCTAAATTGTACACCATACTAGTAAAAGTTGTC-TCC-CC--TTATATAGATATGCCATACGGAGCATCTGAGATTCGTAGAATATTATTTGATACCTCCAGTATAGAAGTAATTGACAAAATTAACAGTTTTTATAAATGACA
gi|93576                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAGTCACAAGATGTAAAACAGTTGCATTGTGTAAAAATTATA--TTTTT--AAAGAATATGTATTGTGGGTGT-TATAACCTTATTGCGTAGGAAGGAAAATACAATCTAAAATGTCTAT-TAAGTTAAAAAAACAAATTGTGAAGGATGGGTATACTATCATAGGTGA
gi|93577                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTGTCTGATTTAGGGTCATATACTGATCCATCTGATTATGATTCAAGTATTCT------ATATGAAAGTATACTTCTACAGGAAAG


blockSeqs                     :                                                       T                             TTCTGTA      T      A      A     AACAGTC                 T    T                        T          AT                T                                                                TA   T                    T          T                     C                  AATTAAAAAA           A    T         AT                                AG       GG       T T           A                      A  T                 AT         TGTA                                                                                      C     CTACCC                                       A    A                                      A             A          GGCGA         T                                                                                                    A                                                       A       C                                                             TT     TC                  C                                                 TC                                                                  CTA   ATTTGATCTGGAAAAGGG                      A        GACA  GGACATGTGTAT                                                      A                                   CTTTGTA     AA        T      AG ATA  A    T           A          A                                           T            A
blockSeqs                     :                                                       G                             .            .      T      A     AA                      .    .                        T          AT                T                                                                .    .                    T          T                     T                  TATTAAA              C    T         .                                 .        .        T .           .                      A  G                 .          .                                                                                         C     CTACC                                        A    A                                      A             .          GGCGA         G                                                                                                    C                                                       A       C                                                             .      .                   C                                                 TC                                                                  .     ATTTGAACTGGAAAATGG                      .        .     TGTAT                                                             A                                   .           .         .      .  .    A    .           .          A                                           T            A
blockSeqs                     :                                                       A                             .            .      A      .     AA                      .    .                        T          .                 T                                                                .    .                    T          T                     .                  AA                   A    T         .                                 .        .        T .           .                      A  G                 .          .                                                                                         C     CTACC                                        A    A                                      A             .          GACAA         T                                                                                                    C                                                       A       C                                                             .      .                   C                                                 TC                                                                  .     ATTTGGACTGGAAAAAGG                      .        .     .                                                                 A                                   .           .         .      .  .    A    .           .          A                                           T            A
blockSeqs                     :                                                       A                             .            .      A      .     AA                      .    .                        T          .                 T                                                                .    .                    T          A                     .                  AA                   T    A         .                                 .        .        T .           .                      A  G                 .          .                                                                                         G     CTACC                                        T    T                                      T             .          GGTGA         A                                                                                                    T                                                       C       G                                                             .      .                   C                                                 TC                                                                  .     ATTTTAACTGGAATAGG                       .        .     .                                                                 T                                   .           .         .      .  .    A    .           .          C                                           A            A
blockSeqs                     :                                                       A                             .            .      T      .     AA                      .    .                        T          .                 A                                                                .    .                    T          A                     .                  AA                   A    A         .                                 .        .        T .           .                      A  G                 .          .                                                                                         A     ACCAC                                        T    A                                      T             .          GGCAA         A                                                                                                    A                                                       C       G                                                             .      .                   A                                                 TC                                                                  .     AGCTGGAACAGGA                           .        .     .                                                                 T                                   .           .         .      .  .    A    .           .          C                                           A            A
blockSeqs                     :                                                       A                             .            .      A      .     AA                      .    .                        A          .                 A                                                                .    .                    T          A                     .                  TA                   C    A         .                                 .        .        T .           .                      C  T                 .          .                                                                                         T     ACCCT                                        T    T                                      T             .          .             A                                                                                                    C                                                       C       G                                                             .      .                   G                                                 TG                                                                  .     AATA                                    .        .     .                                                                 T                                   .           .         .      .  .    .    .           .          C                                           A            A
blockSeqs                     :                                                       G                             .            .      A      .     AA                      .    .                        A          .                 A                                                                .    .                    .          G                     .                  TA                   C    A         .                                 .        .        . .           .                      C  T                 .          .                                                                                         T     ACCCG                                        T    T                                      T             .          .             A                                                                                                    .                                                       C       G                                                             .      .                   G                                                 T                                                                   .     AGCA                                    .        .     .                                                                 T                                   .           .         .      .  .    .    .           .          .                                           G            .
blockSeqs                     :                                                                                     .            .      .      .     AA                      .    .                        A          .                 T                                                                .    .                    .          A                     .                  TA                   T    .         .                                 .        .        . .           .                      .  .                 .          .                                                                                         G     TCCCC                                        T    T                                      T             .          .             A                                                                                                    .                                                       C       G                                                             .      .                   T                                                 .                                                                   .     GGA                                     .        .     .                                                                 T                                   .           .         .      .  .    .    .           .                                                      A            .
blockSeqs                     :                                                                                                  .      .      .     TA                      .    .                        T          .                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                                                                                         G     .                                            T    T                                      T             .                                                                                                                                                                                                                                                           .      .                   G                                                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                .     .                       .    .                        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                .     .                       .    .                        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                      .                       .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTTCTGGAAAGG************************
originalCons                  :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG--------------A--------GGA-----------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
finalCons                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTTTTT-ATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGA--ATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTA-CC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA--TTTTT--CAAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGATTTCTGGAAAGG------------------------TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                     1111111                                                                                           11                                                                                                                                                               111111111111111                                                                                                                                            1111                                                                                            11111111                                                                                                         11111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   888888888888888888888888                  333333333333                                                                                          1111111                              1                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      4      1      6     6666666                 2    2                        1          11                1                                                                66   4                    1          1                     8                  777777777777777      1    2         66                                66       66      4 1            4                      1  1                          4444                                                                                      1     77777777                                    1    1                                      1             4          88888         1                                                                                                    2                                        0              1       1                                                 0           4      55                 1                                                  5           0                                                      777    111111111111111111111111   4        9999  333333333333                                                      1                                   4444444     66        4      66 777  2    4           4          6                                           1            1                                
lowQualScore                  :                                                       .                             .......      .      .      .     .......                 .    .                        .          ..                .                                                                ..   .                    .          .                     .                  ...............      .    .         ..                                ..       ..      . .            .                      .  .                          ....                                                                                      .     ........                                    .    .                                      .             .          .....         .                                                                                                    .                                        .              .       .                                                 .           .      ..                 .                                                  .           .                                                      ...    ........................   .        ....  ............                                                      .                                   .......     ..        .      .. ...  .    .           .          .                                           .            .                                
lowQualScore                  :                                                       1                             4444444      0      0      7     4444444                 9    9                        5          00                2                                                                11   4                    9          0                     9                  999999999999999      0    6         11                                11       11      4 9            4                      8  1                          0000                                                                                      0     66666666                                    4    0                                      4             0          88888         3                                                                                                    9                                        1              1       1                                                 7           0      55                 6                                                  0           5                                                      888    999999999999999999999999   4        4444  999999999999                                                      0                                   4444444     11        4      11 888  8    4           4          1                                           0            9                                
consensus                     :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGATT---T---CTGG--AA-A--GG-TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
Reference ( family-772 )      :   ACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATNTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTANGTGTNCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTCAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAANTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTCGTAGAANATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGATT---T---CTGG--AA-A--GG-TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGNCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGNTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93556                      :   ACATCTCAAAAACAAACTTTGCCAGCTTGATTATCTTGTCAAAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGGAGCATGT--CTGGCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAGAATGTAGACAATTTCAGAAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTAGACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTCGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATGCGATAATACAC--TGGTGCA--TA--TT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGAATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCTGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTT-----GATTGAAACTTTTCATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATATCCTGGCCCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGAGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGAATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCCGAAGTAAAATA-ATTCTAAAATGTCTGTCTCAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGA-----------GG--A--------TTT-AGCTCCGG----TG------------TTTATTGGTGGAGACTGGAGTAGCTATATTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TTCTGA--C---TC-AAAG-C-CAGTTTATA-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTAGCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93557                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTTCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTGAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAACATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTA--CGAGTTGAAAGTTCAATAAGTACATTAAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTAT-AACCTTGAATTTTATGCATATCTTTGAAGATA-AATACTAAACTTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--TATTTT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCGATTGAAATGCGATTCAAGTAGAAATAGCAATTACGAATATATATA----CCTTTGATTAAAAGTAAATGTAAACGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACATAAAACTAATAAAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGATATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTTAT-CGCGACACTT-----GATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTTTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTATACAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCCGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGTTTATGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGTGTTGCGGCTGTAAATGATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGAGACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATG------------GG--A--------TTT-AGCTACGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATTTTACGAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAGAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93558                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCGAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTTTTCGTAA-TAGTTAA-----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAACCATGT--CTGTCTTTATGCTTGTTTTTATACGAGTCGACAGTTCAATAAGTACATTTAAAGTGTAGACAATATCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATATTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTACGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTTCACAATACGATAATACAC--TGATGCA--TATTTT-TTTATCATGTATTC-TTTCCCAATTGAAATGCGATTTAAGGAGAAATAACAATTACGAATATATATATA--CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAATAGAGTTTATGCTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAGAACTTGTC-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGCTTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----ATT-AAACGTTGTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCAAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCAAAGAAAAGTTGAAAGATGTTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGAAAAATATTACCAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGGTATAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-GTTTTC--ACGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGAACTTCTTGCGTCAGAAGTAAAATACATTCTAAAATGT--GT--AAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGA------------------A--TA-TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGCTATATGACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGACTGTTCAAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTCATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAGG
gi|93559                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93560                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGTTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGGTA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93561                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGTCAGAATTGGATGTACTCATCAAATTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGTTCGTTA-TAGTTAA-----TAAT
gi|93562                      : aaACATCTCAATTACAAACTT---------GATTATCTTGTCAGAATTGACTGTACTCATCAAACTGTAGAATTCATATCC----------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGCTAA-----TAAT
gi|93563                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTTTCTTGT
gi|93564                      : aaACATCTCAAATACAAACTTTGCCAGTTTGATTATCTTGTCAGAATTGGCTGTGCTCATCAAACTGTAGAATTCATATACATT-------ATGATA-GTTGTGATCGTTA-TAGTTAA-----TAATGAAATAGTGTAAA-GGAC-AATGGAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATATGAGTCGAAAGTTCAATAAGTACATTTAAAATGTAAAAAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTCCAATTTGTTATTAACCTTGAATTTTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----AA--------AAGTTAAGTGTTCGCTTGGAC--GTCCGTATGTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGCA--CATTTT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCAATTCAAGGAGAAATAACAATTACAAATATATATA----CCTTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATAACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAACTTGTT-CTACC--ATATATAAAGATGCCACACAAAGTATCTGAGATTCGAAGAAAATTACTTGTTACCTCGAGTATAGAAGTTCTTGACAGAAATGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTG-----ATTGAAACTTTTTATGGCATAAAATTTGTTATAGTGTATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTTAAAAGAAAAATGGGATCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATACTCCTGTCCGTTCAGCAACTTTAGCAAAATATTACTAACTGATTCGAGTTGTTGTATTTCATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACCGCTTATGAGTGATA-TTTTTC--AAAAAAGTGTATTGCGGCTGTAAATTATCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCAAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAAACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGA------------G--CA-------TTT-AGCTCTGG----TG------------ATTATTGGTGGCGACTGGAGTAGCTATTTTACAAGGAAGCCGGTATTAAATCAGACTGTTTCAAGCAAATATGAAGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAACAGC-TACTGA--C---CC-AAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATATATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGTTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGAATACTTATAAAGGAAAG
gi|93565                      :                                                                            ATATATATTTTCTGTAATGACA--TT----TTGTTAATAGTCTA-----T--TGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAACATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGT--CTGTCTTTC--------------CGAGCCGAAAGTTCAATTGGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGTAATTTATTATTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAATTAACTCT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAC--GTCTGTATGTTCTACACATTACGATAATACACAGTGGTGCGGGTTTTTT-TTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATGACAATTACGAATATATATA----CCTTAAATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTGTGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGATGTCACCA-C--ATATATAAAGATGCCATACAAAGTATCTGAGATTAGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAAAAATTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGGCGAGATTGAAACATTTTATGGCATAAAAGTTGTTATAGTGCATTCAATTCCAAAAACAAAATTAATAAACCCAAAGGAAAAATGGGACCTCCTGGACCTTCTACTAGTAGTGTTGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCTTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGGTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGTATTGCGGCTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCAAAGTTTAA---ACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCAAAGATGGTACACTAATGACAGAATT---ATGATTTGAT---CTGG--AA-AAGGG-TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTAGCGACTGGAGTAGATATTTTACAAGAAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGTAAATATGAGGATCGTTCTATGA---------ACATC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGATCACCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTATTCTAGAGTCATATGAAAGTATACTTATACAGGAA
gi|93566                      :                                                                                             TGACATGTTGT-----TTA-TAGTC-------TAATGAAACAGTGTAAA-TGGC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAAATGTAGACAATTTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTCGTACTTAACCTTGAATATTATACATATCTTTGAAGATA-AATACTAAAAGTAACTCT-----TA--------AGGTCAAGTGTACGCTTTGAC--GTCCGTATGTTCTACAC-----------------TGGTGCT--TATTTTTTTTATCATGTATTC-TTTTCAAATTGAAATGCGATTCAAGGAAAAATAACAATTACGAATATATATA----CCCTAGATTAAAAGTAAATGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAACTACCTTAATTGTATGTAAAACTAGTAAAAATTGTC---ACCCTATATATAAAGATACCATACAAAGTATCTGAGATTCATAGAAAATTACTTGTCACCTCCAGTATAGAAGTATTTGACAGAATTGATAGTTTTGAT-CGAGACACTTGGCGAGATTGAAATA-TTTATGACATAAAATTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAACACAAAATTAATACTATCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTTGACCTTCTACTAGTAGTGTAGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTTCCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATGTAAAACAGTTGCACTGTATAAGAGTGATATTTTTTC--CAAAATATGTATTGCGGATGTAAATGACCTTATTGCGTCCTAAGTAAAATACATTCTAAAATGTCTGTCTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGATGATACTATCGAAGATGATACGATAATGACAGAATA---ATGATT---TGAACTGG--AA-AATGG-TTT-AGCTCCTG----TA------------ATTATTGGTGGCAACTAGAGTAGCTATTTTACAAAGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGAGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTCAAAAAAAAGC-TTCTGG--T---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATATACTGATTTATCTGATAATGATTCAAGTACTATAGAGCCATGT
gi|93567                      :                                                                                                          TTGTTAATAGTC-------TAATGAAACAATGTTGG-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCGTTCTGTTAGTACTTTTACTAGCTGAAAGTTCAATAAGTGCATTTAAATTTTGGACATTTACAGTATTT-TTATTTTAATT-CCAAATATACGATTTATTATTAACCTTAAATATTATACCTATCTTTGAAGATACAATACTTAAACTAATTCT-----AATTAAAAAAAAGTTGCGTGTAAGTTTGAATATGTCCGTATGTTTTACACAAGACGATAATACAC--TGATGCA--CGTTTT-T--ATCATAATTTT-TTTTCCAATTGAAATGAGATTCCAGTAGAAATAATAATTACGAATATATATATGTACCTTAGATTAAAATTAAATGTAAAAGAAAGACAGCTTATGTTATGATGTAATCAAATTACCTTAATTGAACATAAAATTAGTAAAATTTGTC-------------------TCCCTTACAACGTATCTGAAATTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAATATAGAAATTCTTGAAAAAATTGACAGTTTTGAT-TGTGACACTTGACAAGATTGAAACACTTTATGGCATAAAATGTGTTATAGTGCATTCACTTCCGAAAACTAAATTAATAATCTTAATGTAAAACTAGCACCTCCTAGACCGTCTACTAGT-----------AGTGTTGAAAGATGATCCTGTCCGTTCAATAACTTGAGACAAATACTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGACAAAAGATGTAAAACAGTTTCATTGTGTAAGAATGATC-TTTTT---AAGAATAGGTATTGCGGGTGTAAATGACCTTATTGCGTCCGAAGTAAAATGCAATCTTAAATGTCTGTCTAAGTTTATAAGACAAACTGTGAAGTATAAGGATAGTATCAAAGATGAAACAGTAATAACAAAATT---ATTATT---TTAACTGG--AATA--GG-TTTAAGCTCATG----TGGGACATGTGTATGTTATTGGTGGTGATTGGACTAACCATTCTAAAAGGAAGCAGGTATTTAAGCCGTCCA-TCCAAGCAAATAT--------TTTT-TAAAGCTTTGTAATTTC--CAAATATCTTGCTAAAGCATATCAAAAGTTACA--TTCTG-AGGC--TTAT----GCGTCTGATTTCGGGTCATATACTGATACATCTCATACTGATTCAAGTATTCT------ATACGAAAGTACACTTCTACAGGAAAG
gi|93568                      :                                                                                                               A-TAGTC-------TAATTAAACAATGTAGG-GGAC-AATGAAGCATCTTGTTAAAGGATAATGAAGCATACATCTGTCTTGCTGTTCGTACTAATACTAGCTGAAAGTTCAATAA
gi|93569                      :                                                                                                                   GTTAACAGTCTAATTAAACATTGAAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAAAGGATAATGAAGCATGT--CTGTATTTCTGTTCGTATTTATACAAGCTGAAATTTCAGTAAGTGCATTTAACATGTGGGCAGTTTCAGTATTTGCTGTTT--ATTTGCAAATATGCGATTTGTTATTAACCTTAAATGGTATACCTTTCTTTGAAGAAATAATACTAAAATTAACTCTTATTAAA--------AAGTTACGTG--------AAC--GTCCGTATGTTCTACACAAGACGATAATACAC--TGATGTA--CATTTT-T--ATCAA--ATTCATTTTCCAAT---------AGTC-----GAAATAATAATTATGA-CATATAAA----CCTTAGATTTAAAGTGAATGTAAAATAAAGAAATTTTATATTATGATGGAATCAAATTACCTTAATTCTAGGCAAAACTAGTAAAATGTGTC--TACCC-ATATAAAAAAATGTCATACAAAGTATCTGGGACTCGTAGAATATTACTTGTTACCTCCAGTATAGTAGTTCTTGACAAAATTGACAGTTTTGAT-CATGACACTTGGTGAGATTGAAACATTTTATGTCATAAACCGTATTATAGTGCATTCACTTCCTAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGGAAAAATGGCACCTCCTAGACCTTCTGCTAGTAGTG--------------AAAGATGCTCCTGTCCATTCAACAACTTGAGCAAAATACCACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTTAGTCGGAAG---TAAAACAGTTACATTGTGTAAAAA-AATA-TTTTTTTTAAGAATATGTATTGCGGGTGTAAATGACCCTATTGTGTCCGCAGTAAAATACAATCCAAAATGTCTGTGTAAGTTTAAAAGACAAATTGTGAAGTATGAGGATACTATCGAAGATGATACAGTAGTTGCAGAATTCTAATGA-----G---CTGG--AACA--GGATTT-TGCTCTGGGACATGTGTAT-------GTTATTTGTGGTGTTTAGAGTAGCCATTTTAAGAGAAAGCAGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATAAGAAGAGCGCTCGATGAAA------------------------ACTGA--C---CTAAAAA-CACAGTTTATTAAAACCATCAT
gi|93570                      :                                                                                                                        -----TAATGACATGTTGTGAATAGTCTAATGAAGCATCTATTTAAAGGATATTGAAGCATGC--CTGTCTTTCTGCTTGTTTTTATACGAGCCGAAAGTTCAGTAGGTGCATTTAAAATGTAGACAAATTCAGTAGTTGTTGTTT--ATT-GCAAATCTGCAATTTGTTAT-AAACTTAAATATTATACATATCTTTGAATATA-ACTACTAAAATTAACACT-----TA--------AGGTTATGTGTACGCTTGAAT--GTCAGTATTTTCTACACAATACGATAATACAC--TGGTGTA--TATATT-TTTATCATGTATTC-TTTTCCAATTGAAATGCGATTTCAGTAGAAATAACAATAACGAATATATAAA----CCTTAGATTAAAAGTAAACGTAAAAGAAAGAGAGTTTATGTTATGATGTAATCAAATTAACTGAATTGTACGTAAAACTAGTAAAAGTTGTC---ACCCGATATATAAAGATGCCGTACAAAGTATCTGAGATTCATAGAATATTAATTGTTACCTCCAGTATAGAAGTTCTTGACAGAATTGACAGTTTTGAT-CGTGACACTTGGCAAGATTGAAACATTTTATGACGTAAACTTTGTTATAGTGCATTCACTTCCAAAAACAAAATTAATAAACTCAAAGAAAAAATGGGACCTCCTGAACCTTCTACTAGTAGTGTCGAAGAAGTGTTGAAAGATGCTCCTGTCCGTTCAGCAACTTGAGCAAAATATTACCCACTGATTGGAGTTGTTGTATTTTATTTCAGTCGGAAGATTTAAAACAGTTACACTGTATAAGAGTGATA-TTTTTC--AAGAATATGTATTACGGTTGTAAATGACATTATTGCGTCTGAAGTGAAATACGTTCTAACATG--TG--TAAGTTTAATAG-------GTGAAGTATGAAGATACTATCGAAGATGATACAGTAATGACAGAATT---ATGATT---TGGACTGGAAAA-A--GG-TTT-AGCTCCGG----TG------------ATTATTGGTGACGACTGGAGTAGCTGTTTTACAAGGAAGCGGGTATTAAATCAGTCTGTTCCAAGCAAATATGTGGATCGTTCTATGAAG-------ACGTC--AAAAAAGC-TACTGA--C---CCAAAAG-CACAGTTTATT-AGACCATCATCTATGCGTCTGATTTTGGGTCATTTACTGATTTATCTGATAATGGTTCAAGTATTCTAGAACCATATGAAAGTATACTTATACAGGAAAG
gi|93571                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-GGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93572                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATGAAGCATCTATTTAA
gi|93573                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-TGAC-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93574                      :                                                                                                                        -----TAATGAAACAGTGTAAA-AAAT-AATAAAGCATCTATTTAA-------TGAAACAT
gi|93575                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATATA----CTTTGGATTAAA-GTAAATGTAAATGATAGAGAGTTTATGTTA----------------CCTAAATTGTACACCATACTAGTAAAAGTTGTC-TCCCC--TTATATAGATATGCCATACGGAGCATCTGAGATTCGTAGAATATTATTTGATACCTCCAGTATAGAAGTAATTGACAAAATTAACAGTTTTTATAAATGACA
gi|93576                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGTCACAAGATGTAAAACAGTTGCATTGTGTAAAAATTATA-TTTTTA--AAGAATATGTATTGTGGGTGT-TATAACCTTATTGCGTAGGAAGGAAAATACAATCTAAAATGTCTAT-TAAGTTAAAAAAACAAATTGTGAAGGATGGGTATACTATCATAGGTGA
gi|93577                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTGTCTGATTTAGGGTCATATACTGATCCATCTGATTATGATTCAAGTATTCT------ATATGAAAGTATACTTCTACAGGAAAG