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Reference ( gi|123643 )       : ATTGACGTTTTGAGTGATGTATTTATCAAGCTCATCGATTGATGCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGAGACTCGGA----TTAAAGTCTTCCGTTATTCCCCATAATTCGTTTTCTTTTATCTAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACCTTTTCAAACTTTT-CTGGATAAG-TTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTAT-----CTTCGTTTTTTTATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACA---CAG-AAACTATCATGATC--TGC-TGGGGAAAACA-----TGAAAGACAAGTT--------AGGGTAACGTGA--ATACCTGCAAG--T--ATACTAATGATTCTGGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCC-A-C-C----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCTTGTATTCATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATC-ATTTG-A--AAGG---GAAAAAG-ATGTAGTAATGATATC-T--TATATATAGGCTCTACTCAGC---AAAA-A---AGAA-A----CGTCCCT-C--TTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGTC----TGT-------T-T------CATGTC-CAATGTA-----CATG-T--ATTTTTTACCCTGACGATGTTGAGAAT
gi|123644                     : ATTTACGTTTTCAGTGATGTATTTATCCAGCTCATCGATTGAGTCATGTCTTGTCCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGAGAATCAGA----TTAAAATCTTCCGTTATTCTCCATTATTCGTTTTCTTTTATCTAACAAATAAGAAATCTAAT--TAAGATTTGAACTTGTAACTTTTTCAAGCTTTT-CTGGA-----TTAATGAAACACAACATATATGGTAACGTTAG-----ATTTG-TTTTTTATGAAATAAT-AAAACAAATTGTACA---CAA-AAACTATCATAATC--TGC-AGGGGAAAACA-----TGAAAGACAAGTT--------AGGGTAACGTGA--AAACCTGCAAG--T--ATACTTGGGATTCTGGAGATGTGCTTTTTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTTGACCC-ATC-C----T-------CAC-A--C---AAAAATAAATCTTGTATTTATGTGTTTGATACATTTTATA--TGAGTA----TATGATC-ATTTG----AAGG---GAAAAAT-ATGTTGTAATGTTATT-T--TATATATAGGCCCTACTCAGC---AAAA-A-----AA-A----CGTCCCT-CTTTTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGTCTT--TGT-------T-T------CATGCC-AAATGTA-----CATGTT--TTTTTTTACCCTGACGATGTTGAGA
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gi|123646                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTAACGTTTTGAGTGATATATTTATCCAGCCCTTCGAATGGTGCATGTTTTGGTCTCAATTAACTGTCCAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATCTTCCGTTATTCTCCATTATTCGTTTT--TTTATCTAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATCTGAACTTGAAACTTTTTCGAACTTTT-CAAGAT----TAATAAAACACAAAAGAAATGGTAACTTTATA-----TTCGTTTT-----TTTATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACACA--A-AAACTATAATGATCTGCA-GGGGAAAACATGAAACACAAGTTAGGG-AACGCGA--ATTCTCGCAAG--TATACTTGGGGTTCTTGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCC-ATC-C----T-------CAC-A--A---AAAAG-A----TTGTATTTATCTGTTGTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATCACTTGAAGGG------AAACAT-A-TGTTGTAATGATA---TC-T--TATATATATGCCCTACTCAGCAA-AAAA-A---AGAA-A----CGTCCCT-C----TGTTATAACTGATGTAGC--TCTGTC----TGTGTT-T------CATGTC-CAATGTA-----CGTG-T--ATTTTTTACCTTGGCGATGTTTAGAAT
gi|123647                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTTACGTTTTGAGTGATGTATTTATCCAGCTCATCGACTGAGTCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCAAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATATTCCGTTACTCTCCATTATTTATTTTCTTTTATCTAACAAATAAGAAAATTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACTTTTTCAAACTTTT-CTGGA----TTAATAAAACACAACACATATGGTAACATTATA-----TTCG-TTT-----TTTATGAAATAATAAAAACAAAATGTACACA--A-AAGCTATCATGATCTGCA-GGGGAAAACA
gi|123647                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGGATTCTGTAGATGTACTTATTTACACACGTCA--ATATATCGTACATTTGACCC-A-CAC----T-------CAC-A--A---AAAATTAAATCTTGTATTCATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----T--------TTGAAGGG---A--AAAAAG-A-TGTTGTAATGTTA---TA-T--TATATATTGGCCCTACTCAGC---AAAA-A---AAAACC----CGTCCCTCC--TTTTTTATAACTGATGTAGC--TCTGTC----TGTGTT-T------CATTCC-CAATGTA-----CATG-T--A-TTTTTACCCTGGCGATGTTGAGAagggattctgtagatgtacttatttacacacgtcaatatatcgtacatttgacccacactcacaaaaaattaaatcttgtattcatgtgttttatacgttttatatgattatttgaagggaaaaaagatgttgtaatgttatattatatattggccctactcagcaaaaaaaaacccgtccctccttttttataactgatgtagctctgtctgtgtttcattcccaatgtacatgtatttttaccctggcgatgttgaga
gi|123648                     : atttacgttttgagtgatgtatttatccagctcatcgactgagtcatgtcttgttctcaattaactgccaaagtttgagactcggattaaaatattccgttactctccattatttattttcttttatctaacaaataagaaaattaattaagatttgaacttggaactttttcaaacttttctggattaataaaacacaacacatatggtaacattatattcgttttttatgaaataataaaaacaaaatgtacacaaaagctatcatgatctgcaggggaaaacaaATTTACGTTTTCAGTGATGTATGTATCCAGCTCATCGATTGAGTCATGTCTTGTTCTCGATTAACTGCCCAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATCTTCCGTTATTCTTCATTATTCGTTTACTTTTATCTAACAAATAAG-AATTTAAT--TAAGATTTGAACTTTGAACTTTTTCAAACTTTT-CTGG----GTTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATA-----TTCG-TTT-----TTTATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACACA--ATAAACTATCATGACCTGCA-GGGGAAAACATGAAAGATAA-------------------ATCCGTAAG--TATACTGGGGATTCTGAAGTTGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTTGACCC-A-CAC----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCCTGTATTTATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATCATTTGGAGGGAAAA--AAAAAG-A-TGTTTTATTATTA---TC-T--CAT-T-TAGGCCCTACTCAGCAAAAAAA-A---AGAA-A----CGTCCCT-CT-TTTTTTATAACTGATGTAGG--TCTGTC-
gi|123649                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTAACATTTTGAGTGATGTGTTTATCCAGCCCATCGAATGATGCATGTCTTGCTCTCAATCAACTTCCAACGTTGGAGATTTGGAA----TTCAAACTTTtg
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gi|123651                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGTATTTATCAAGCTCATCGATTGAGTCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGTGACTAGG-A----TTAAAGTCTTCCATTTCCCCCCATTATTCGTTTTCTTTTATCCAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACATTTTCAAACTTTT-CTGGATAAGTTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATC-----TTCGTTTT-----TTCATGAAATAAT-AAAACAAAATGTATACA--A-AAACTATCATGATCTGCT-GGGGAAAACATGAAAGACAAGTTAGGGTAACGTGA--ATACCTGCAAG--TATACTTGGGATTCTGGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCC-A-C-A----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCTTGTATTCATGTGTTTTATACGTTTTATA--CGATTA----TATGATCATTTGAAAGG---A--AAACAG-A-TGTAGTAATGATA---TC-TTATATATATAGGCTCTATTCAGC---AAAA-A---AGAA-A----CCTCCCT-C--TTTTTTATAACTGATGTAGC--TCTGTC----TGTGTT-T------CATGTC-CAATGTA-----CATG-T--ATTTTTTACCCTGGCGATTTTGAGAAT
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gi|123647                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGGATTCTGTAGATGTACTTATTTACACACGTCA--ATATATCGTACATTTGACCC-A-CAC----T-------CAC-A--A---AAAATTAAATCTTGTATTCATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----T---------TTGAAGGG---A--AAAAAG-A-TGTTGTAATGTTA---TA-T--TATATATTGGCCCTACTCAGC---AAAA-A---A-AAACC----CGTCCCTCC--TTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGT--CTGTGT--T-T------CATTCC-CAATGTA-----CA--TG-TA-TTTTTACCCTGGCGATGTTGAGAagggattctgtagatgtacttatttacacacgtcaatatatcgtacatttgacccacactcacaaaaaattaaatcttgtattcatgtgttttatacgttttatatgattatttgaagggaaaaaagatgttgtaatgttatattatatattggccctactcagcaaaaaaaaacccgtccctccttttttataactgatgtagctctgtctgtgtttcattcccaatgtacatgtatttttaccctggcgatgttgaga
gi|123648                     : atttacgttttgagtgatgtatttatccagctcatcgactgagtcatgtcttgttctcaattaactgccaaagtttgagactcggattaaaatattccgttactctccattatttattttcttttatctaacaaataagaaaattaattaagatttgaacttggaactttttcaaacttttctggattaataaaacacaacacatatggtaacattatattcgttttttatgaaataataaaaacaaaatgtacacaaaagctatcatgatctgcaggggaaaacaaATTTACGTTTTCAGTGATGTATGTATCCAGCTCATCGATTGAGTCATGTCTTGTTCTCGATTAACTGCCCAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATCTTCCGTTATTCTTCATTATTCGTTTACTTTTATCTAACAAATAAG-AATTTAAT--TAAGATTTGAACTTTGAACTTTTTCAAACTTTT-CTGG----GTTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATA-----TTCG-TTT-----TTTATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACACA--ATAAACTATCATGACCTGCA-GGGGAAAACATGAAAGATAA-------------------ATCCGTAAG--TATACTGGGGATTCTGAAGTTGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTTGACCC-A-CAC----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCCTGTATTTATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATC-ATTTGGAGGGAAAA--AAAAAG-A-TGTTTTATTATTA---TC-T--CAT-T-TAGGCCCTACTCAGCAAAAAAA-A---A-GAA-A----CGTCCCT-CT-TTTTTTAT-AACTGATGTAGG--TCTGT--CTG
gi|123649                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTAACATTTTGAGTGATGTGTTTATCCAGCCCATCGAATGATGCATGTCTTGCTCTCAATCAACTTCCAACGTTGGAGATTTGGAA----TTCAAACTTT
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gi|123651                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGTATTTATCAAGCTCATCGATTGAGTCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGTGACTAGG-A----TTAAAGTCTTCCATTTCCCCCCATTATTCGTTTTCTTTTATCCAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACATTTTCAAACTTTT-CTGGATAAGTTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATC-----TTCGTTTT-----TTCATGAAATAAT-AAAACAAAATGTATACA--A-AAACTATCATGATCTGCT-GGGGAAAACATGAAAGACAAGTTAGGGTAACGTGA--ATACCTGCAAG--TATACTTGGGATTCTGGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCC-A-C-A----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCTTGTATTCATGTGTTTTATACGTTTTATA--CGATTA----TATGATC-ATTTGAAAGG---A--AAACAG-A-TGTAGTAATGATA---TC-TTATATATATAGGCTCTATTCAGC---AAAA-A---A-GAA-A----CCTCCCT-C--TTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGT--CTGTGT--T-T------CATGTC-CAATGTA-----CA--TG-TATTTTTTACCCTGGCGATTTTGAGAAT
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Reference ( family-741 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTTACGTTTTGAGTGATGTATTTATCCAGCTCATCGATTGATGCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATCTTCCGTTATTCTCCATTATTCGTTTTCTTTTATCTAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACTTTTTCAAACTTTT-CTGGAT--GTTAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATA-----TTCGTTTT-----TTTATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACACA--A-AAACTATCATGATCTGCA-GGGGAAAACATGAAAGACAAGTTAGGGTAACGTGA--ATACCCGCAAG--TATACTTGGGATTCTGGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCC-A-C-C----T-------CAC-A--A---AAAAATAAATCTTGTATTTATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATC-ATTTGAAGGG---A--AAAAAG-A-TGTCGTAATGATA---TC-T--TATATATAGGCCCTACTCAGC---AAAA-A---A-GAA-A----CGTCCCT-C--TTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGT--CTGTGT--T-T------CATGTC-CAATGTA-----CA--TG-TATTTTTTACCCTGGCGATGTTGAGAAT
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gi|123666                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C--TCTGT--CTGTGT--T-T------CATGTC-CAATGTA-----CA--TG-TATTTTTTACCTTGGCAATGTTGAGAAT


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T   GT                                         . .                                                                 .                                  . T   T                                    .        T   .                 .                 A          C          .                         T .       .            .                                          .            A        . CACT               . .  .       T                         C T      .       .       A  .          .   .      G  .   TT        .    . .                      .      . .   .   . .          . .     TT  .            .      .       .  . .           .       .      .   .  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A   TG                                         . .                                                                 .                                  . T   T                                    .        .   .                 .                 A          C          .                         G .       .            .                                          .            A        . CACT               . .  .       T                         C T      .       .       T  .          .   .      G  .   AG        .    . .                      .      . .   .   . .          . .     TT  .            .      .       .  . .           .       .      .   .  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A   TG                                         . .                                                                 .                                  . G   T                                    .        .   .                 .                 A          A          .                         . .       .            .                                          .            T        . CCCT               . .  .       T                         C T      .       .       T  .          .   .      G  .   CA        .    . .                      .      . .   .   . .          . .     TT  .            .      .       .  . .           .       .      .   .  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T   GT                                         . .                                                                 .                                  . T   T                                    .        .   .                 .                 C          G          .                         . .       .            .                                          .            C        . CAT                . .  .       T                         T T      .       .       A  .          .   .      G  .   AA        .    . .                      .      . .   .   . .          . .     TT  .            .      .       .  . .           .       .      .   .  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .                                                                                                    . .   T                                    .        .   .                 .                 C          G          .                                                                                           .            A        . CCC                . .  .       T                         T T      .       .       T  .          .   .      G  .   TG        .    . .                      .      . .   .   . .          . .     C   .            .      .       .  . .           .       .      .   .  A
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Reference ( family-741 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTTACGTTTTGAGTGATGTATTTATCCAGCTCATCGATTGATGCATGTCTTGTTCTCAATTAACTGCCCAAGTTTGAGACTCGG-A----TTAAAATCTTCCGTTATTCTCCATTATTCGTTTTCTTTTATCTAACAAATAAGAAATTTAAT--TAAGATTTGAACTTGGAACTTTTTCAAACTTTT-CTGGAT----TAATAAAACACAACACATATGGTAACGTTATATTCGTTTT-----TTT-----ATGAAATAAT-AAAACAAAATGTACACA--A-AAACTATCATGATCTGCA-GGGGAAAACATGAAAGACAAGTTAGGGTAACGTGA--ATACCCGCAAG--TATACTTGGGATTCTGGAGATGTGCTTATTTACACATGTCA--ATATATCGTACATTGGACCCACC-------CT-------CACA--AAAAAATAAATCTTGTATTTATGTGTTTTATACGTTTTATA--TGATTA----TATGATC-ATTTGAAGGG---A--AAAAAG-A-TGTCGTAATGATA---TC-T--TATATATAGGCCCTACTCAGC---AAAA-A---AGAA-A----CGTCCCT-C--TTTTTTAT-AACTGATGTAGC--TCTGT--CTGTGT--T-T------CATGTC-CAATGTA-----CA--TG-TATTTTTTACCCTGGCGATGTTGAGAAT
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