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Reference ( family-740 )      :      TATATTTGTTT-A-TTAGACTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAANCAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTNTGANNTTAAGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACANGNTNNTATACA-TACCGAGGAATGACGTTAT-GGTATTGANGCCAAATTCTACTNAAAN-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAG-GG-TC-TTTTNCTTG--GTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
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gi|123566                     :          tcTGTTTCAATAGACTATTAACAAAATGTCATTACAGAAAATAT--ATATATAAAGCAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTTA-TATTT---------------TGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATGATGTTATG-GTACTAAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TTGC---CTACTAT
gi|123567                     :     tttacacTGTTTCATTAGACTATAAACAACATGTCACTACAGAAAA-A---ATATATAAATCAACATAATTGTAACAT--A---------AGT-GACAATTAT-C--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCA-------TCACACGATGCTATACA-TATTGAGGAATGATGTTATG-GTACTTAAAC--AATTCTACT-AAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123568                     :     tttacacTGTTTCATTAGCCTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAAGCAACATAATTGTAATAT--T---------TGT-AACAATGAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTAA-TATTT---------------TGCACCTGATTAACCTTTGACCTCAACTGTGATCTTAAAACGCAATTTCATGAATGGCATCCATCATCACACGATGCTAAACATTTTTGGGGAATGATGTTATG-GTATTGAAAC--AATTGTACTAAAAA-TTGCCACCGTCAAAAGTTAAAATAAGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTTCTGT
gi|123569                     :    tttacaaTTGTTTAATTAGACTATTAAAAACATTGAATTACAGACAA-A---ATATAAAAATCAACATAATCATAATAT--T---------AGT-AACAATAAT-T--TATAT-ACACTACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCTGATCGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTTATAAGTGGCATCCATCATCACATGAT-TTATACA-TCTTAAGGAATGTTATTATG-GTATTGAAAC--AATTCTACTGAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAAGG-ACATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123570                     : ctacaTATATTTGTCT-ATAAGACTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAAACAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATAATGTTATG-GTACTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123571                     :           TTGTTTCATTAGACTATTAACAACATGGCATTACAGAAAA-A---A-----AAAGCAACATAATTATAACAT--T---------AGT-AACAATAAC-T--TATAT-ACACTACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACCGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCACCATCACACGATGCTATACA-TCTTAGGGAATGTTGTTATG-GTACTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TTGC---CTACTA
gi|123572                     :         acaTGTTTAATTAGACTGTTAACAACATGTCCTTACAGAAAA-A---ATATATAAAGCAACATAATTGTAGCAT--TTATTAATTTGAT-AACAATAAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTTA-T-TTT---------------AGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATACTATACA-TCTTGGACAATGTTGCTTTG-GTATTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGTCA---TCAAAAGTTAAAATAAGGGATA-TTTTGCTT----TTCGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123573                     :                  ATTAGACTATTCACAACATGTCATTACAGAAAAAA---ATATATAAATCAATATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------GGCATCTGATTGACCTTAGACCTCAACTGTGACCTTAAAATGCAATTTCATGAGTGGTATCCATCATCGCACG-TGCTATACA-TATTGGGGAATGATGTTATG-ATACTAAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGGG-TCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123574                     :                                          TAAAGAAAA-A---ATATATAGAACAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACTGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCAACTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTCAAAACGCAATTTCAAGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATAGGGAAATAATGTTATG-GTACTAAAAC--AATTCTACTAGAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAA--G-TT-TTTTTTTTGCTTTTTGG
gi|123575                     :                                                   -A---ATAAATAAA-CAA-ATA-TTTTAACAAGAC---------AGT-TTCCATAAT-TC-TATAT-A--------------TCAA-T-TAC---------------TGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTA
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gi|123578                     :                                                   -A---ATAAATAAATAAATAT--TT-TAACA-------------AG---ACAGTATTCT--TA-AT-TCTATA-------TATCAA-T-TAC---------------TGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGAGGCGATTTCAT---TGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GAAATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCAACTCAAAT-TTGCCA---TTAAAAGTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
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gi|123581                     :                                                                                                    ATAATTAT-T--T-TAT--CAAGACAGT-ATTCTTAA-T-TCTATATATATATATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGACTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTCCATG-TAGTTGGA-----TGGC---CTACTA
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blockSeqs                     :            T    C                                 . .           T          G     TT              .         . .   T  .      CC  .        . . T .                                     C    G   CC   A  C                        A     C A GC      .   T      T       T .    T  A  CA         A   A       .           AAAATAAAGGACA     G   GTG       .        .  
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blockSeqs                     :                                                   . .           A          G     TT              .         . .   T  .      CT  .        . . T .                                     C    G   CC   A  C                        C     C T TG      .   A      T       T .    T  A  CA         C   A       .           AAAATAAGTT        T   GTG       .        .  
blockSeqs                     :                                                   . .           T          T     TT              .         . .   T  .      CA  .        . . A .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   T      C       T .    G  T  CA         C   A       .           G                 T   GTG       .        .  
blockSeqs                     :                                                   . .           T          T     TT              .         . .   A  .      CA  .        . . A .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 T   T         .        .  
blockSeqs                     :                                                   . .           .          .     .               .         . .   A  .      CA  .        . . A .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    T  T  .          C   T       .           .                 T   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                   . .           .          .     .               .         . .   C  .      .   .        . . A .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          A   T       .           .                 T   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                  .               .         . .   T  .      .   .        . . C .                                     .    T   GA   T  G                        C     G C TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 C   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                            . .   T  .      .   .        . . C .                                     .    T   GA   A  T                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 C   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                            . .   .  .      .   .        . . C .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 T   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                            . .   .  .      .   .        . . A .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 T   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                                  .  .      .   .        . . . .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 C   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .                                     .    T   GA   T  G                        C     G T TG      .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 C   .         .        .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .                                     .    T   GA   T  G                        .     G . T       .   C      .       . .    G  T  .          C   T       .           .                 T   .                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                 .   .      .       . .    G  T  .          .   T       .                                                       


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Reference ( family-740 )      :      TATATTTGTTTNATTAGACTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAANCAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACGTTATG-GCACGGANGCCAAATTCTACTNAAAN-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG-CATTTTNCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
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gi|123565                     :    tcTATATT-GTCTAATT-GTCTATTAACAACATGTCATTACAGTAAA-A---ATATATAAAACAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACTGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGAATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGAAATAATGTTATG-GTACTAAAAC--AATTCTACTAGAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGT----TTTTTTTTGCTTTTTGCA-----TGGC---CTACTAT
gi|123566                     :          tcTGTTTCAATAGACTATTAACAAAATGTCATTACAGAAAATAT--ATATATAAAGCAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTTA-TATTT---------------TGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATGATGTTATG-GTACTAAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AGGGT-CATTTTGCTT----TTTGGA-----TTGC---CTACTAT
gi|123567                     :     tttacacTGTTTCATTAGACTATAAACAACATGTCACTACAGAAAA-A---ATATATAAATCAACATAATTGTAACAT--A---------AGT-GACAATTAT-C--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCA-------TCACACGATGCTATACA-TATTGAGGAATGATGTTATG-GTACTTAAAC--AATTCTACT-AAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123568                     :     tttacacTGTTTCATTAGCCTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAAGCAACATAATTGTAATAT--T---------TGT-AACAATGAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTAA-TATTT---------------TGCACCTGATTAACCTTTGACCTCAACTGTGATCTTAAAACGCAATTTCATGAATGGCATCCATCATCACACGATGCTAAACATTTTTGGGGAATGATGTTATG-GTATTGAAAC--AATTGTACTAAAAA-TTGCCACCGTCAAAAGTTAAAAT-AAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTTCTGT
gi|123569                     :    tttacaaTTGTTTAATTAGACTATTAAAAACATTGAATTACAGACAA-A---ATATAAAAATCAACATAATCATAATAT--T---------AGT-AACAATAAT-T--TATAT-ACACTACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCTGATCGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTTATAAGTGGCATCCATCATCACATGAT-TTATACA-TCTTAAGGAATGTTATTATG-GTATTGAAAC--AATTCTACTGAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAAGGA-CATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123570                     : ctacaTATATTTGTCT-ATAAGACTATTAACAACATGTCATTACAGAAAA-A---ATATATAAAACAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATAATGTTATG-GTACTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123571                     :           TTGTTTCATTAGACTATTAACAACATGGCATTACAGAAAA-A---A-----AAAGCAACATAATTATAACAT--T---------AGT-AACAATAAC-T--TATAT-ACACTACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACCGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCACCATCACACGATGCTATACA-TCTTAGGGAATGTTGTTATG-GTACTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGA-----TTGC---CTACTA
gi|123572                     :         acaTGTTTAATTAGACTGTTAACAACATGTCCTTACAGAAAA-A---ATATATAAAGCAACATAATTGTAGCAT--TTATTAATTTGAT-AACAATAAT-T--TATAT-ACATTACCGT-TTTGTTTA-T-TTT---------------AGCACCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATACTATACA-TCTTGGACAATGTTGCTTTG-GTATTGAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGTCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGGATATTTTGCTT----TTCGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123573                     :                  ATTAGACTATTCACAACATGTCATTACAGAAAAAA---ATATATAAATCAATATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACCGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------GGCATCTGATTGACCTTAGACCTCAACTGTGACCTTAAAATGCAATTTCATGAGTGGTATCCATCATCGCACG-TGCTATACA-TATTGGGGAATGATGTTATG-ATACTAAAAC--AATTCTACTAAAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123574                     :                                          TAAAGAAAA-A---ATATATAGAACAACATAATTGTAACAT--T---------AGT-GACAATAAT-T--TATAT-ACAATACTGT-TTTGTTAA-T-TTT---------------TGCAACTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTCAAAACGCAATTTCAAGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATAGGGAAATAATGTTATG-GTACTAAAAC--AATTCTACTAGAAA-TTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAG-----TTTTTTTTT-TGCTT
gi|123575                     :                                                   -A---ATAAATAAA-CAA-ATA-TTTTAACAAGAC---------AGT-TTCCATAAT-TC-TATAT-A--------------TCAA-T-TAC---------------TGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAtttgg
gi|123576                     :                                                   -A---ATAAATAAATAAATAT--TT-TAACA-------------AG---ACAGTGTT-T--TTAAT-TCTATA-------TATCAA-T-TAC---------------TGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACATCA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGCCTGGC---CTACTAT
gi|123577                     :                                                   -A---ATAAATAAA-CAA-ATA-TTTTAACA-------------AG---ACAGT--T-TCCTAAAT-TCTATA-------TATCAA-T-TAC---------------TGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GGCATTA-A-GCATTGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123578                     :                                                   -A---ATAAATAAATAAATAT--TT-TAACA-------------AG---ACAGTATTCT--TA-AT-TCTATA-------TATCAA-T-TAC---------------TGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGAGGCGATTTCAT---TGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GAAATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCAACTCAAAT-TTGCCA---TTAAAAGTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123579                     :                                                                                                                                               ---------------TGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATTAGTGGCATCCACCCTAACAGGTTTGTATATA-TAC-----------ATTA-A-GCATGGATGCCAA-TTCTACTAAAAAATTTCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTCCCTG-T-----GA-----TGGC---CTATTA
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gi|123581                     :                                                                                                    ATAATTAT-T--T-TAT--CAAGACAGT-ATTCTTAA-T-TCTATATATATATATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGACTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTCCATG-TAGTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123582                     :                                                                                                      AATATT-T--TA----ACAAGACAGT-TTCCTTAA-T-TCTATATATCAATTAC--TGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTAT
gi|123583                     :                                                                                                      AATATT-T--TA----ACAAGACAGT-TTCCTTAA-T-TCTATATATCAATTAC--TGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAATTT--------------TTTTTCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTA
gi|123584                     :                                                                                                                  TATCACAATA--GT-CT-----A-T-TAC---------------TGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGATGATTTCGTGATTGGCATTCACCCCCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGAAA-GACGTTA-A-GCATGGATGCCAAGTTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGT--------------GTTTTCCCTG-TGTTCGGA-----TGGCCATCTACTA
gi|123585                     :                                                                                                                                               ---------------TGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATGAGTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATAAA-TACCAAGGAA-GACATTA-A-GCATGGATGCCAAATTCTACTCAAAT-TTGCCA---TCAAAAGTT--------------TTTTCCCTG-TGTTTGGA-----TGGC---CTACTA
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