lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                              1   11    5555                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                              3   33  0 1111                                000 0     111111111   0000      0       0  000  00    00            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                              .   ..  . ....                                ... .     .........   ....      .       .  ...  ..    ..            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                              7   44  9 9999                                777 4     666666666   8888      4       4  777  66    66            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                          CTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
Reference ( gi|124862 )       :                                                                                                                                                                                                          CTGACTGA-CTG-A-TATATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124861                     :                                                                                                                                                                                                          CTGACTAA-ATG-A----ATTAATGAATTGATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124885                     :                                                                                                                                                                                                           TGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125078                     :                                                                                                                                                            tgatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124992                     :                                                                                                                                                             agtgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGA
gi|125113                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAA
gi|125066                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAA
gi|124963                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAA
gi|124903                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAA
gi|124902                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAA
gi|125253                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125251                     :                                                                                                                                                               tgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125235                     :                                                                                                                                                               tgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125221                     :                                                                                                                                                              atgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125076                     :                                                                                                                                                              atgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125075                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125074                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125065                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125062                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125061                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125060                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125059                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125058                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125057                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125056                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125055                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125051                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125050                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125049                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125048                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125047                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125046                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125045                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124962                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124961                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124900                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124899                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124898                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124964                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAACGAAT
gi|124854                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTAATTAA-TTG-A-TTAATGGGTGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAAT
gi|125121                     :                                                                                                                                                                                                     aattatTGAATGA-ATG-A----ACGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124966                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAACGAATGAATGAAT
gi|124965                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAACGAATGAAT
gi|125034                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATGGA-TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----T
gi|125038                     :                                                                                                                                                                                     aatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAAT
gi|125021                     :                                                                                                                                                         aatgaataaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AAT
gi|124876                     :                                                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-T
gi|124884                     :                                                                                                                                                                            ctaagaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGCATGAATGAAT
gi|124979                     :                                                                                                                                                            taatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGCATGAATGAATGAATGAAT
gi|124978                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATGCATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-T
gi|124977                     :                                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATGCATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAAT
gi|124976                     :                                                                                                                                                                                         aatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAAT
gi|124975                     :                                                                                                                                                         aatgaatgcatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATGCATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AAT
gi|124993                     :                                                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124991                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgattgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125077                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgattgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATGTATGAATGAATGAATGAAT
gi|125018                     :                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATAAATGAATGAATGAATGAATAAATGAATGAATGA---A-TGA
gi|125017                     :                                                                                                                                                                                 aatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATAAATGAATGAATGAATGAATAAATGAATGAATGA---A-T
gi|124897                     :                                                                                                                                                                             aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAAT
gi|124873                     :                                                                                                                                                         aatgaataaatgaataaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-AATAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TAAATG-AAT
gi|125094                     :                                                                                                                                                                                          tcaaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGATAGA-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAAT
gi|124845                     :                                                                                                                                                                                                         aaTAATTAA-TTG-A-TTAATGGGTGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAAT
gi|124952                     :                                                                                                                                                                                  ctatagccgccaatgatttaattatTGAATGAACAG-A-TAGATGAATGAATAGATGAATGAATAGATGAAT
gi|124951                     :                                                                                                                                                                         aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaaTGAATGAACAG-A-TAGATGAATGAATAGATGAATGAATAGATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----T
gi|124853                     :                                                                                                                                                                                         aatgaatgaatgaatgaaTGAATGA-ATGGA-TGAATGAATGAATAAATGAACGGATGGATGGATGG---A-TGGAT---------GGA----TAAA
gi|124826                     :                                                                                                                                                                        caattaatcaataaatccatgaatgaatgaatgagTGAATGA-ATG-A-AAGATGAATGAATGAATGAAT
gi|124859                     : aaatcaaaagcagcaactgatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcgtatcgactatatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgttgaacgcattggacaactttcgtatcttactataactctatccattaccctaactctaatgaatagatgaattaatgaatgaatatatggatgagtgaatagaGAATGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAANNNNNNNNNNGAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAAT
gi|124834                     :                                                                                                                                                                                               ttacttgaatctgGAATGA-TTG-A----ATGAATGAAT--ATGAATGGATGAGTGAATTT---A-TAGAT---------GAA----TCAATGGAATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAAT
gi|124842                     :               aatcaaaagcagcaaatattgtaaatcaaatattttattcaacgggaaatactcgcttcgactctatgtactataaatgaagtacaagtaacttctattgttgacagcatctgaaaaaatttcgtatcttactataaccctaacccaaacccttaccctagcccaaaccctaatgaataaattaatgaaaACAGA-GTG-A-CA-ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--
gi|124870                     :                                                                                                                                                                    catatctcacatttcagtataaaaagtatatcctaaatagacCTAA-TTG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125236                     :                                                                                                                                                                                                             ctTGA-ATT-A-TAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGGAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAAT
gi|124856                     :                                                                                                                                                                                                              aTGA-ATG-A----ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---T-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAAT
gi|124841                     :                                                                                                                                                                                               atcatnnnnnnnnnnaTGA--TG-A-TTT-TAAATAAATGAATGAATGAATGAATAAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124971                     :                                                                                                                                                                                   acaagtttcttatattgcgaatccctaaTGA-ATG-A-TAAA--AATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--
gi|124830                     :                                                                                                                                                                                                             aaTGA-ATG-A-T---TGAATGAATGAATGAATGAATGGATGGATGG---A-TGGAT---------GGA----TGGATG-GATGGAT-GG---AT--GGAT--GGATGAGTGA
gi|124847                     :                                                                                                  aaatcaaaagcagcaacttatcatttcaaggggaaatactctcatcgactctatgtactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacaactttcgta-CTG-A-TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---AATGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124869                     :                                                                                                                                                                                            taattgttccaacaatactatc-CTG-A----ATGAATGATCGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124832                     :                                                                                                                                                                                                               att-CTA-A-TGAATAGATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAATGAGAATGGATGAATgaat
gi|124828                     :                                               aaatcaaaagcagcaactgatgtaaatcaaattttatattcaaggggaattacttgcatcgactctgtgcactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacgacttttgtatattactaaaacccagactctaacccgaaccctaatc-CTA-A-TGAATAAATGAATTAATGAATAAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATAAAT-AA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124831                     :                                                       aaatcaaaagcagcaactaatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcctatcgactctatgcactataaacaaagtagaaattacttcccatgttgactgcatcggacaactttcgtatcttacaataactctatccattaccctaacc-CTA-A-TGAATAGATGAATTAATGAATGAATATATGGATGA---A-TGAAT---------AGA----TGAATG-AATGAATGGA---AT--AGAT--GAATGAATGAAT
gi|124825                     :                                                 aaaacaaaaccagcaactgatgtgaatcacatattattcaagggttaggtatttcactcgcattcaccctatgcacaataaacgaagtacacattatttctgttgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataactgtaaccattactctaacc-CTA-A-TGAATGGATGAATTAATAAATGAATATATGGATGA---A-TGAAT---------AGA----TGAATG-AATAAAT-AG---AT--AAAT--GAGTGAATGAATggat
gi|124885                     :                                                         aaatcaaaagcaacaactgatgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactataaacgaagtacaaattacttcccatgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataaccataacaattaccctaaccTG-A-TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124846                     :                                                                                                                                                                                                                    TA-A-TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA---A-TAAAT---------AAA----TAAATA-AATAAAT-AA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124836                     :                                                                                                                                                                                           ataatgctttaaccatgattacacttG-A-TTTATGGATGGATGGATTGATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TATATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--
gi|124867                     :                                atcaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcattgactatatgcactataaacgtagtacaagtttcttcccttgttgactgcactagacaactttcgtatattactaaaaccctaaccctaacatttaccctaatcctaatgaatagatgaatgtatg-A-TA-ATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAGTCAATGAAT
gi|124829                     :                                                                                                                                                                                                               aactcaa-A-TAGACGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-AT---ATGAGAAT--TAATGAATGAAT
gi|125078                     :                                                   aaatgaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcatcgactctatgcactctaaacggagtacaagttacttcccttgttgacagcaccggacaacattcgtatattacaaaaaccttaactttaatccttacccttatccaaatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124992                     :                                                                                                                                                                                                                       agtgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125113                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATga
gi|125066                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|124963                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|124903                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|124902                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|125253                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|125251                     :                                                                                                                                                                                                                         tgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125235                     :                                                                                                                                                                                                                         tgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125221                     :                                                                                                                                                                                                                        atgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125076                     :                                                                                                                                                                                                                        atgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125075                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125074                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125065                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125062                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125061                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125060                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125059                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125058                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125057                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125056                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125055                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125051                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125050                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125049                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125048                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125047                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125046                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125045                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124962                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124961                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124900                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124899                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124898                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124964                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAA
gi|125121                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAC-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATcgaat
gi|124966                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAC--GAATGAATGAAT
gi|124965                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAACGAATGAAT
gi|125034                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGGATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124896                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGGATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125023                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATAAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125090                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATAAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125022                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATAAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124901                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATAAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125038                     :                                                                                                                                                                                                                           aATAAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATg
gi|125021                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATAAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124876                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------AAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124884                     :                                                                                                                                                                                                                      ctaagaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GCATGAATGAAT
gi|124979                     :                                                                                                                                                                                                                      taatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GC---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124978                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GCA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124977                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGCATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124976                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGCATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124975                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGCATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124993                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGATTGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124991                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGATTGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125077                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GT---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|125018                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------AAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--AAAT--GAATGAATGAAT
gi|125017                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------AAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--AAAT--GAATGAATGAATga
gi|125016                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATAAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-AA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124897                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATAAATGAATAAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124873                     :                                                                                                                                                                                                                       aatgaATGAATGAATGAATGAATGAATAAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATAAATGAAT
gi|125028                     :                                                                                                                                                                                                                    tcaaatgaATGAATGAATGAATGAATGAATGAAT-AATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124883                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATTGATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATgaa
gi|125042                     :                                                                                                                                                                                                                          taATGAATAGATAAATGAATGAATGTATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-GA---AT--GAAT--GAATGAATGAATaa
gi|125116                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATAAATGAATAAATGAATAAATAAATGA---A-TAAAT---------GAA----TAAATG-AATAAAT-GA---AT--AAAT--GAATGAATGAA
gi|124951                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAATGAATGAATGAATGAATGAACAGATAG---A-TGAAT---------GAA----TAGATG-AATGAAT-AG---AT--GAAT--GAATGAATGAATcgaa
gi|124857                     :                                                                                                                                                                                                                           aATGAACGAATGAATAAATGAACAAATGTACGA---A-AGAAT---------GAA----TGAATG-AATGAAT-AA---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124853                     :                                                                                                                                                                                                                attactccatcaATGAATGAATGAATGAGTGAATGAATGGATGA---A-TGAAT---------GAA----TAAATG-AACGGAT-GG---AT--GGAT--GGATGGATGGATgaat
gi|124826                     :                                                                                                                                                                                                          caattaatcaataaatccATGAATAGATGAATTAATGAATGAATATATGG---A-TGAGT---------GAA----TAGATG-AATGAAT-GAAAGAT--GAAT--GAATGAATGAATaaa
gi|124827                     :                                                              aaatcaaaagcagcaactgatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcgtatcgactatatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgttgaacgcattggacaactttcgtatcttactataactctatccattaccctaactctaATGAATAAATGAATTAATGAATGAATTTATGG---A-TGAAT---------GAAAAGATGAATT-AATGAAT-AG---AT--GAAT--GAATGAATGAAT
gi|124952                     :                                                                 aaatcaaaagcaacaactggtgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgtggaccgcatcggacaactttcgtatcttactgtaactctaaccattaccctaaccctaAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGA---A-TGAAT---------GAA----TGAACA-GATAGAT-GA---AT--GAAT--AGATGAATGAAT

Unaligned ( gi|124837 ): CAAAAGTAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATAAAGGGGAAATACTCGCATCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTTACTTCCCTTAATGACCGCACCGGACAACTTTCGTATCTTGCTATATCCTAACA
Unaligned ( gi|124835 ): AATCAAAAGCAGCACATATTGTAAATCAAATATTTTATTCAACGGAAAATACTCGCTTCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTAACTTCTCTTGTTGACGGCATCGGATAAAATCATATTTTACTATAAC
Unaligned ( gi|124833 ): AAATCAAACGCAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATTAAGGGGAAATACTCTTATCGGTTCTATGCACTAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         000                        00     0        11111   11111111          0                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         ...                        ..     .        .....   ........          .                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         777                        66     4        00000   55555555          8                        
consensus                     :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
Reference ( family-74 )       :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124825                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGG---ATGAATTAATAAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAAAT-AGATAAATGAGTGAATGAAT
gi|124826                     :                   aaatcaaaagcaacaactgatgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactataaacgaagtacaaattacttcccatgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataaccataacaattaccctaaccctAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAG-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAAA-G-ATGAATGAATGAATGAAT
gi|124827                     :                   aaatcaaaagcagcaactgatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcgtatcgactatatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgttgaacgcattggacaactttcgtatcttactataactctatccattaccctaactctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATGAATTTATGG--ATGAA-TGAAAAGA-----TGA--------ATTAATGAAT-AGATGAATGAATGAATGAAT
gi|124828                     :                   aaatcaaaagcaacaactggtgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgtggaccgcatcggacaactttcgtatcttactgtaactctaaccattaccctaaccctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124829                     :                 aaatcaaaagcagcaactaatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcctatcgactctatgcactataaacaaagtagaaattacttcccatgttgactgcatcggacaactttcgtatcttacaataactctatccattaccctaaccctTGAATAGACGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-ATATGA--GAATTAATGAATGAAT
gi|124830                     :           aaatgaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcatcgactctatgcactctaaacggagtacaagttacttcccttgttgacagcaccggacaacattcgtatattacaaaaaccttaactttaatccttacccttatccaaaATGAATGA---TTGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGGA-TGGATGGA-----TGG--------ATGGATGGAT-GGATGGATGGATGGATGAGTGA
gi|124831                     :                                                                 aaatcaaaagcagcaacttatcatttcaaggggaaatactctcatcgactctatgtactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacaactttcgtAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAATGGAATAGATGAATGAATGAATGGAT
gi|124832                     :             aaaacaaaaccagcaactgatgtgaatcacatattattcaagggttaggtatttcactcgcattcaccctatgcacaataaacgaagtacacattatttctgttgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataactgtaaccattactctaaccctAATGAATAG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGA--GAATGGATGAAT
gi|124834                     :         aaatcaaaagcagcaactgatgtaaatcaaattttatattcaaggggaattacttgcatcgactctgtgcactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacgacttttgtatattactaaaacccagactctaacccgaaccctaatcctTGAATAAATTA---ATGAAAGAATGATTGAATGAATGAATATGAA-TGGATGAG-----TGAATTTATAGATGAATCAATGGAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124836                     : aatcaaaagcagcaaatattgtaaatcaaatattttattcaacgggaaatactcgcttcgactctatgtactataaatgaagtacaagtaacttctattgttgacagcatctgaaaaaatttcgtatcttactataaccctaacccaaacccttaccctagcccaaaccctaaTGAATAGATGA---ATGTATGGATTTATGGATGGATGG--ATTGA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATATATGAATGAATGAATGAAT
gi|124841                     :          atcaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcattgactatatgcactataaacgtagtacaagtttcttcccttgttgactgcactagacaactttcgtatattactaaaaccctaaccctaacatttaccctaatcctaaTAAATAAATGA---ATGAATGAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAAT
gi|124842                     :                                                                                                                                           acaagtttcttatattgcgaatccctaatgatgatttAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAAT
gi|124845                     :                                                                                                                            catatctcacatttcagtataaaaagtatatcctaaatagacacagagtgacAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124847                     :                                                                                                                                                   ctatagccgccaatgatttaattattCTGA-TGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAAATGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124853                     :                                                                                                                                                          taattgttccaacaatactatcAATCAATAA---ATCCATGAATGAATGAATGAGTGA--ATGAA-TGGATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-GAACGGATGGATGGATGGATGGAT
gi|124854                     :                                                                                                                                                                           caattAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAATggataaa
gi|124856                     :                                                                                                                                                                          aattattATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGATTGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124857                     :                                                                                                                                                                  atcatnnnnnnnnnnATCAATGA---ACGAATGAATAAATGAACAAATGT--ACGAA-AGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124859                     :                                                                                                                                                                       attactccGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAANNNNNNNN--------NNGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124861                     :                                                                                                                                                                ttacttgaatctgCTGACTAAATGA---ATTAATGAATTGATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124862                     :                                                                                                                                                                             CTGACTGACTGATATATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124867                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAGTCAATGAAT
gi|124869                     :                                                                                                                                                                    aactcaaatCTGAATGAATGA---TCGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124870                     :                                                                                                                                                                          attCTAATTGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124873                     :                                                                                                                                                                              ctAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATAAATGAAT
gi|124876                     :                                                                                                                                                                            tcaGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124883                     :                                                                                                                                                                                    ctaaA---ATGAATTGATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124884                     :                                                                                                                                                                               tAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGCATGAATGAATaa
gi|124885                     :                                                                                                                                                                                tATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124896                     :                                                                                                                                                                              tgAATGAATGG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124897                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124898                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124899                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124900                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124901                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATG
gi|124902                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124903                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124951                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAACAGATAG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAGAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124952                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAACAGA-----TAG--------ATGAATGAAT-AGATGAATGAATAGATGAAT
gi|124961                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124962                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124963                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124964                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAACGAAT
gi|124965                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAACGAATGAAT
gi|124966                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAACGAATGAATGAAT
gi|124971                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA----TAAA--AATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124975                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGCATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124976                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGC---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124977                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGC--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124978                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGCA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124979                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GCATGAATGAATGAATGAAT
gi|124991                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124992                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGA
gi|124993                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125016                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125017                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATAAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATAAATGAATGAATGAAT
gi|125018                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGA
gi|125021                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125022                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125023                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATAAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125028                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAAT-AATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125034                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125038                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125042                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAG---ATAAATGAATGAATGTATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125045                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125046                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125047                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125048                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125049                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125050                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125051                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125055                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125056                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125057                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125058                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125059                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125060                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125061                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125062                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125065                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125066                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125074                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125075                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125076                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125077                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GTATGAATGAATGAATGAAT
gi|125078                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125090                     :                                                                                                                                                                              agAATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125094                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATG-A-----TAG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125113                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125116                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATAAATAAATGA--ATAAA-TGAATAAA-----TGA--------ATAAATGAAT-AAATGAATGAATGAACGAA
gi|125121                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAC-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125221                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125235                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125236                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATTA----TAAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125251                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125253                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT

Unaligned ( gi|124837 ): CAAAAGTAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATAAAGGGGAAATACTCGCATCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTTACTTCCCTTAATGACCGCACCGGACAACTTTCGTATCTTGCTATATCCTAACA
Unaligned ( gi|124835 ): AATCAAAAGCAGCACATATTGTAAATCAAATATTTTATTCAACGGAAAATACTCGCTTCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTAACTTCTCTTGTTGACGGCATCGGATAAAATCATATTTTACTATAAC
Unaligned ( gi|124833 ): AAATCAAACGCAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATTAAGGGGAAATACTCTTATCGGTTCTATGCACTAT
Unaligned ( gi|124846 ): ATAATGCTTTAACCATGATTACACTTTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATGAATGAATGAAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         000                        00     0        11111   11111111          0                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         ...                        ..     .        .....   ........          .                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         777                        66     4        00000   55555555          8                        
consensus                     :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
Reference ( family-74 )       :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124825                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGG---ATGAATTAATAAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAAAT-AGATAAATGAGTGAATGAAT
gi|124826                     :                   aaatcaaaagcaacaactgatgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactataaacgaagtacaaattacttcccatgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataaccataacaattaccctaaccctAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAG-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAAA-G-ATGAATGAATGAATGAAT
gi|124827                     :                   aaatcaaaagcagcaactgatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcgtatcgactatatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgttgaacgcattggacaactttcgtatcttactataactctatccattaccctaactctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATGAATTTATGG--ATGAA-TGAAAAGA-----TGA--------ATTAATGAAT-AGATGAATGAATGAATGAAT
gi|124828                     :                   aaatcaaaagcaacaactggtgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgtggaccgcatcggacaactttcgtatcttactgtaactctaaccattaccctaaccctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124829                     :                 aaatcaaaagcagcaactaatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcctatcgactctatgcactataaacaaagtagaaattacttcccatgttgactgcatcggacaactttcgtatcttacaataactctatccattaccctaaccctTGAATAGACGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-ATATGA--GAATTAATGAATGAAT
gi|124830                     :           aaatgaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcatcgactctatgcactctaaacggagtacaagttacttcccttgttgacagcaccggacaacattcgtatattacaaaaaccttaactttaatccttacccttatccaaaATGAATGA---TTGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGGA-TGGATGGA-----TGG--------ATGGATGGAT-GGATGGATGGATGGATGAGTGA
gi|124831                     :                                                                 aaatcaaaagcagcaacttatcatttcaaggggaaatactctcatcgactctatgtactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacaactttcgtAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAATGGAATAGATGAATGAATGAATGGAT
gi|124832                     :             aaaacaaaaccagcaactgatgtgaatcacatattattcaagggttaggtatttcactcgcattcaccctatgcacaataaacgaagtacacattatttctgttgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataactgtaaccattactctaaccctAATGAATAG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGA--GAATGGATGAAT
gi|124834                     :         aaatcaaaagcagcaactgatgtaaatcaaattttatattcaaggggaattacttgcatcgactctgtgcactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacgacttttgtatattactaaaacccagactctaacccgaaccctaatcctTGAATAAATTA---ATGAAAGAATGATTGAATGAATGAATATGAA-TGGATGAG-----TGAATTTATAGATGAATCAATGGAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124836                     : aatcaaaagcagcaaatattgtaaatcaaatattttattcaacgggaaatactcgcttcgactctatgtactataaatgaagtacaagtaacttctattgttgacagcatctgaaaaaatttcgtatcttactataaccctaacccaaacccttaccctagcccaaaccctaaTGAATAGATGA---ATGTATGGATTTATGGATGGATGG--ATTGA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATATATGAATGAATGAATGAAT
gi|124841                     :          atcaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcattgactatatgcactataaacgtagtacaagtttcttcccttgttgactgcactagacaactttcgtatattactaaaaccctaaccctaacatttaccctaatcctaaTAAATAAATGA---ATGAATGAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAAT
gi|124842                     :                                                                                                                                           acaagtttcttatattgcgaatccctaatgatgatttAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAAT
gi|124845                     :                                                                                                                            catatctcacatttcagtataaaaagtatatcctaaatagacacagagtgacAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124847                     :                                                                                                                                                   ctatagccgccaatgatttaattattCTGA-TGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAAATGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124853                     :                                                                                                                                                          taattgttccaacaatactatcAATCAATAA---ATCCATGAATGAATGAATGAGTGA--ATGAA-TGGATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-GAACGGATGGATGGATGGATGGAT
gi|124854                     :                                                                                                                                                                           caattAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAATggataaa
gi|124856                     :                                                                                                                                                                          aattattATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGATTGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124857                     :                                                                                                                                                                  atcatnnnnnnnnnnATCAATGA---ACGAATGAATAAATGAACAAATGT--ACGAA-AGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124859                     :                                                                                                                                                                       attactccGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAANNNNNNNN--------NNGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124861                     :                                                                                                                                                                ttacttgaatctgCTGACTAAATGA---ATTAATGAATTGATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124862                     :                                                                                                                                                                             CTGACTGACTGATATATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124867                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAGTCAATGAAT
gi|124869                     :                                                                                                                                                                    aactcaaatCTGAATGAATGA---TCGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124870                     :                                                                                                                                                                          attCTAATTGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124873                     :                                                                                                                                                                              ctAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATAAATGAAT
gi|124876                     :                                                                                                                                                                            tcaGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124883                     :                                                                                                                                                                                    ctaaA---ATGAATTGATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124884                     :                                                                                                                                                                               tAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGCATGAATGAATaa
gi|124885                     :                                                                                                                                                                                tATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124896                     :                                                                                                                                                                              tgAATGAATGG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124897                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124898                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124899                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124900                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124901                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATG
gi|124902                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124903                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124951                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAACAGATAG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAGAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124952                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAACAGA-----TAG--------ATGAATGAAT-AGATGAATGAATAGATGAAT
gi|124961                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124962                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124963                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124964                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAACGAAT
gi|124965                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAACGAATGAAT
gi|124966                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAACGAATGAATGAAT
gi|124971                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA----TAAA--AATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124975                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGCATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124976                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGC---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124977                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGC--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124978                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGCA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124979                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GCATGAATGAATGAATGAAT
gi|124991                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124992                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGA
gi|124993                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125016                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125017                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATAAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATAAATGAATGAATGAAT
gi|125018                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGA
gi|125021                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125022                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125023                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATAAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125028                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAAT-AATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125034                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125038                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125042                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAG---ATAAATGAATGAATGTATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125045                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125046                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125047                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125048                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125049                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125050                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125051                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125055                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125056                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125057                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125058                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125059                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125060                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125061                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125062                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125065                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125066                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125074                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125075                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125076                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125077                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GTATGAATGAATGAATGAAT
gi|125078                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125090                     :                                                                                                                                                                              agAATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125094                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATG-A-----TAG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125113                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125116                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATAAATAAATGA--ATAAA-TGAATAAA-----TGA--------ATAAATGAAT-AAATGAATGAATGAACGAA
gi|125121                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAC-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125221                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125235                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125236                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATTA----TAAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125251                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125253                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    NNNNN   ATTTATAG
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                    .       .       


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                             
originalCons                  :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
finalCons                     :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT

Unaligned ( gi|124837 ): CAAAAGTAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATAAAGGGGAAATACTCGCATCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTTACTTCCCTTAATGACCGCACCGGACAACTTTCGTATCTTGCTATATCCTAACA
Unaligned ( gi|124835 ): AATCAAAAGCAGCACATATTGTAAATCAAATATTTTATTCAACGGAAAATACTCGCTTCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTAACTTCTCTTGTTGACGGCATCGGATAAAATCATATTTTACTATAAC
Unaligned ( gi|124833 ): AAATCAAACGCAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATTAAGGGGAAATACTCTTATCGGTTCTATGCACTAT
Unaligned ( gi|124846 ): ATAATGCTTTAACCATGATTACACTTTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATGAATGAATGAAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         000                        00     0        11111   11111111          0                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         ...                        ..     .        .....   ........          .                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         777                        66     4        00000   55555555          8                        
consensus                     :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
Reference ( family-74 )       :                                                                                                                                                                             CTGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124825                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGG---ATGAATTAATAAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAAAT-AGATAAATGAGTGAATGAAT
gi|124826                     :                   aaatcaaaagcaacaactgatgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactataaacgaagtacaaattacttcccatgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataaccataacaattaccctaaccctAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAG-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAAA-G-ATGAATGAATGAATGAAT
gi|124827                     :                   aaatcaaaagcagcaactgatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcgtatcgactatatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgttgaacgcattggacaactttcgtatcttactataactctatccattaccctaactctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATGAATTTATGG--ATGAA-TGAAAAGA-----TGA--------ATTAATGAAT-AGATGAATGAATGAATGAAT
gi|124828                     :                   aaatcaaaagcaacaactggtgtgaatcacgcattattcaaggggaaatactcgtatcgactctatgcactttaaacgaagtacaaattacttcccttgtggaccgcatcggacaactttcgtatcttactgtaactctaaccattaccctaaccctAATGAATAA---ATGAATTAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124829                     :                 aaatcaaaagcagcaactaatgtgaatcacgtattattcaaggggaaatactcctatcgactctatgcactataaacaaagtagaaattacttcccatgttgactgcatcggacaactttcgtatcttacaataactctatccattaccctaaccctTGAATAGACGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-ATATGA--GAATTAATGAATGAAT
gi|124830                     :           aaatgaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcatcgactctatgcactctaaacggagtacaagttacttcccttgttgacagcaccggacaacattcgtatattacaaaaaccttaactttaatccttacccttatccaaaATGAATGA---TTGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGGA-TGGATGGA-----TGG--------ATGGATGGAT-GGATGGATGGATGGATGAGTGA
gi|124831                     :                                                                 aaatcaaaagcagcaacttatcatttcaaggggaaatactctcatcgactctatgtactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacaactttcgtAATGAATAG---ATGAATTAATGAATGAATATATGG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATGAATGGAATAGATGAATGAATGAATGGAT
gi|124832                     :             aaaacaaaaccagcaactgatgtgaatcacatattattcaagggttaggtatttcactcgcattcaccctatgcacaataaacgaagtacacattatttctgttgttgaccgcatcggacaactttcgtatcttactataactgtaaccattactctaaccctAATGAATAG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGA--GAATGGATGAAT
gi|124834                     :         aaatcaaaagcagcaactgatgtaaatcaaattttatattcaaggggaattacttgcatcgactctgtgcactataaacgaagtacaagttacttcccttgttgaccgcaccggacgacttttgtatattactaaaacccagactctaacccgaaccctaatcctTGAATAAATTA---ATGAAAGAATGATTGAATGAATGAATATGAA-TGGATGAG-----TGAATTTATAGATGAATCAATGGAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124836                     : aatcaaaagcagcaaatattgtaaatcaaatattttattcaacgggaaatactcgcttcgactctatgtactataaatgaagtacaagtaacttctattgttgacagcatctgaaaaaatttcgtatcttactataaccctaacccaaacccttaccctagcccaaaccctaaTGAATAGATGA---ATGTATGGATTTATGGATGGATGG--ATTGA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATATATGAATGAATGAATGAAT
gi|124841                     :          atcaaaagcagcaactaatgtaaatcaaatattatttcaaggggaaatactcgcattgactatatgcactataaacgtagtacaagtttcttcccttgttgactgcactagacaactttcgtatattactaaaaccctaaccctaacatttaccctaatcctaaTAAATAAATGA---ATGAATGAATGAATAAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAAT
gi|124842                     :                                                                                                                                           acaagtttcttatattgcgaatccctaatgatgatttAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAAT
gi|124845                     :                                                                                                                            catatctcacatttcagtataaaaagtatatcctaaatagacacagagtgacAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124847                     :                                                                                                                                                   ctatagccgccaatgatttaattattCTGA-TGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAAATGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124853                     :                                                                                                                                                          taattgttccaacaatactatcAATCAATAA---ATCCATGAATGAATGAATGAGTGA--ATGAA-TGGATGAA-----TGA--------ATGAATAAAT-GAACGGATGGATGGATGGATGGAT
gi|124854                     :                                                                                                                                                                           caattAATTAATTG---ATTAATGGGTGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAATggataaa
gi|124856                     :                                                                                                                                                                          aattattATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGATTGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124857                     :                                                                                                                                                                  atcatnnnnnnnnnnATCAATGA---ACGAATGAATAAATGAACAAATGT--ACGAA-AGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124859                     :                                                                                                                                                                       attactccGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAANNNNNNNN--------NNGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124861                     :                                                                                                                                                                ttacttgaatctgCTGACTAAATGA---ATTAATGAATTGATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124862                     :                                                                                                                                                                             CTGACTGACTGATATATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124867                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAGTCAATGAAT
gi|124869                     :                                                                                                                                                                    aactcaaatCTGAATGAATGA---TCGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124870                     :                                                                                                                                                                          attCTAATTGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124873                     :                                                                                                                                                                              ctAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATAAATGAAT
gi|124876                     :                                                                                                                                                                            tcaGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124883                     :                                                                                                                                                                                    ctaaA---ATGAATTGATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124884                     :                                                                                                                                                                               tAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGCATGAATGAATaa
gi|124885                     :                                                                                                                                                                                tATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124896                     :                                                                                                                                                                              tgAATGAATGG---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124897                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124898                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124899                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124900                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124901                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATG
gi|124902                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124903                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124951                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAACAGATAG--ATGAA-TGAATAGA-----TGA--------ATGAATAGAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124952                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAACAGA-----TAG--------ATGAATGAAT-AGATGAATGAATAGATGAAT
gi|124961                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124962                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124963                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|124964                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAACGAAT
gi|124965                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAACGAATGAAT
gi|124966                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAACGAATGAATGAAT
gi|124971                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA----TAAA--AATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|124975                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGCATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124976                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGC---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124977                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGC--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124978                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGCA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124979                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GCATGAATGAATGAATGAAT
gi|124991                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|124992                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGA
gi|124993                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGATTGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125016                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125017                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATAAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATAAATGAATGAATGAAT
gi|125018                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TAAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-AAATGAATGAATGAATGA
gi|125021                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATAAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125022                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125023                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATAAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125028                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAAT-AATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125034                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGG--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125038                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125042                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAG---ATAAATGAATGAATGTATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125045                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125046                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125047                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125048                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125049                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125050                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125051                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125055                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125056                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125057                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125058                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125059                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125060                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125061                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125062                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125065                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125066                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125074                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125075                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125076                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125077                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GTATGAATGAATGAATGAAT
gi|125078                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125090                     :                                                                                                                                                                              agAATGAATGA---ATGAATAAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125094                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATG-A-----TAG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125113                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAA
gi|125116                     :                                                                                                                                                                                AATGAATAA---ATGAATAAATGAATAAATAAATGA--ATAAA-TGAATAAA-----TGA--------ATAAATGAAT-AAATGAATGAATGAACGAA
gi|125121                     :                                                                                                                                                                                AATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAC-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125221                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125235                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125236                     :                                                                                                                                                                                 ATGAATTA----TAAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGG--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAATGAATGAAT
gi|125251                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT
gi|125253                     :                                                                                                                                                                              TGAATGAATGA---ATGAATGAATGAATGAATGAATGA--ATGAA-TGAATGAA-----TGA--------ATGAATGAAT-GAATGAATGAATGAAT

Unaligned ( gi|124837 ): CAAAAGTAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATAAAGGGGAAATACTCGCATCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTTACTTCCCTTAATGACCGCACCGGACAACTTTCGTATCTTGCTATATCCTAACA
Unaligned ( gi|124835 ): AATCAAAAGCAGCACATATTGTAAATCAAATATTTTATTCAACGGAAAATACTCGCTTCGACTCTATGCACTATAAATGAAGTACAAGTAACTTCTCTTGTTGACGGCATCGGATAAAATCATATTTTACTATAAC
Unaligned ( gi|124833 ): AAATCAAACGCAGCAACCAATGTAAATCAAATATTATAATTAAGGGGAAATACTCTTATCGGTTCTATGCACTAT
Unaligned ( gi|124846 ): ATAATGCTTTAACCATGATTACACTTTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATGAATGAATGAAT