lowQualScore : 1111111111 111 222 2222222222 1 1 111 1
lowQualScore : 3 2 3 33 55 5 2 3 1 2 1 2 4444 4444 3333333333 2 2 22 999 2 2 111 2 2 3333333333 2 9999999999 8 1 2 7 2 2 2 2 222 2 2 2 2 5 0 5 0 6 5 6 3
lowQualScore : . . . .. .. . . . . . . . .... .... .......... . . .. ... . . ... . . .......... . .......... . . . . . . . . ... . . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 0 4 2 11 88 7 0 2 9 0 9 0 2222 2222 6666666666 1 1 99 777 1 1 444 1 1 7777777777 1 2222222222 0 0 1 8 4 5 9 9 111 9 9 9 9 7 8 5 6 2 5 0 7
consensus : AAATAAACCAAT-AGT--GATG--GTCAAAACA-ATTAACANA-TATCTTAAATATGAA-TGTT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAAT--TT-T-GC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAA-A-G-GTC-AAATA-T-T-T-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
Reference ( gi|13211 ) : AGATAAACCAAT-AAT--GATG--GCCAAAACA-ATTAACAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-T-G-T-TAAAATG-TT-T-GC----------TTG-TG----------GTGACCTATGACCTTAT-AACTCAGTC-AA-A-G-GTC-AAACA-T-T-T-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATACTGGTAAATTCATTCAGCCCGGTCGCCGTTCATGAACACGC
gi|13209 : AAATAAACCAAT-AGT--GATG--TTCAAAACA-ATTAACAAA-TATCTTAAATAGGAA-TGCT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-T----TT-TT-T-GC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTC-AA-A-ATGTC-AAATATT-T-T-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTCATGTAGGATATAGTGGTAAACTCATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAACATGC
gi|13210 : AAACAAACCAAT-AGT--GATG--GTCAAAACA-ATCAGCACA-TGTCTTTAATATGAA-TACT-AT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAATA-TT-T-GC----------TTG-TG----------ATGACCTTTGACTTTAT-AACTCAGTCAAA-A-A-GTC-AAATATT-T-T-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGATATAGTGGTAAACTTATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAAGACGC
gi|13212 : AAATAAACCAAT-AGT--GATG--GTCAAAACA-ATTAACAGA-TGTCTTAAATATGAA-TGAT-TT----TG----GTTT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAA-A-TT-T-GC----------TTG-TG----------AAGACCTTTGACCTTAT-AACACAGTCAAA-A-G-GTC-AACTA-T-T-T-T-TGGGCAACCGATTGTTTCCAA--TAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGTCAGTTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13214 : AAATAAACCAAT-AAT--GATG--GTCAAAACA-ATTAACATA-TATATTGAATATGAA-TATT-TT----TG----GTAC----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-A-TAAAA---TT-T-GT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TACTCAGTCAAA-A-G-GTC-AAATA-TAT-T-T-T-GGCAACTGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTCAACTTATTTAGCCCTGATGCCGTCCAAGAACACGC
gi|13218 : AGATAGATCAAT-AGT--GATG--GTCAAAACA-ATTAACAAA-TGTCTTAAATATGGA-TGCT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--ACC-A-G-T-T-AAATGTTT-T-GC----------TTG-TG----------G-------TGACCTTAT-AACTCAGTCAAA-A-G-GTC-AAAT--T-T-T-T-T-GGCAACCAATTGTTTCTTATGTAGGATATATAGGTTAATTCATCTAGCCCGGTTGCCGTCCATGGACACGC
gi|13215 : AAATAAACAAAT-TAT--GGTG--GTCAAAACA-ATTAACAAA-TATCTTAAATATGAA-TGTT-AT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TGT-A-G-T-TAAAA---------A----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAA-A-G-GTC-AACTA-T-T-T-TCT-GGCAACATATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTTATCTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAAC
gi|13216 : AAATAAACCGAT-AGA--GATG--ATCAAAACA-ATTTACAGA-TATATTGAATATGTA-TGGT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAACAC--TA-T-GC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TATTCAGTCAAA-A-G-GTC-AAATA-T-T-T-T-T-AGCAACCGATTGTTTCTTACATAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCTGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13219 : AAATAAACCAAT-A----------GTCAAAACA-ATTAACAGA-TATCTTCAAAATAAA-TGTT-TT----TG----GTAT----------T-GTCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAAAG-TT-T-GC----------TAT-TG----------GCGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAA-A-G-GTCTATATA-T-T-TGT-T-GGCAGCCGATTGTTTCTAATGTAGATTATAGCAGTTAACTTATTCAGCCCGGTTGCCGTCCATGAGCA
gi|13220 : AAATAAACCAAT-AAT--GATG--GTGAAAACA-ATCAACAGA-TATCTTAAATATGAA-TATT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-C-T-TTAA-TG-TT-TTGC----------TTG-T---------------------------C-AACTTAGGC-AA-AAG-GTC-AAATA-T-T-T-T-T-GACAACCGATTGTTTTGAATGTAGGTTATAGTGGCAAACTCATTTAGTCCGGTTGCCGTCAATGAACACGC
gi|13222 : AAATAAATCATT-AAA--GATG--GTCAAAACA-ATTAACAAA-TATCTTAAACATGAA-TATT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAACTT-TT-T-GT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AGCTCATTCAAA-A-G-GTC-AAATACT-T-T-T-T-GGAAACAGATTGTTTCGAATGTAG
gi|13221 : AAATAAACCAAT-AAT--GATG--GTCAAAACA-ATCAATAGA-TATCTTAAAAATGAA-TATT-TT----TG----GTAG----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAAAT-TT-T-GC----------TTA-TA----------GTGACCTTTGACCTTTT-AACT
gi|13223 : AAATAAACCAAG-AGT--GATG--GTCAAAACA-ACTAAAAGA-TATCTTAACTATGAA-TGTT-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAATG-TT-T-GC----------TCG-TG----------GTGAC
gi|13224 : AAATAAACCAAT-AAT--GATG--GTCAAAACA-ATTAACATA-TATCTT
gi|13226 : AGATAAACCAAT-AGT--GATTATGC----ACA-ATTAGCACA-TGTCTTAAATATGAA-TG---CA----TG----GTAT----------
gi|13225 : AGATAAACCAAT-AGT--GATTATGC----ACA-ATTAGCACA-TGTCTTAAATATGAA-TG---CA----TG----GTAT----------
gi|13217 : AAATGAGTCAGT-TCT--GTTG--G--AAAATA-TATAACAAA-CATCTTAAATCTAAA-TATT-GT----TA----TTATA---------T-ATCAT-T--TCCTT-C-T-TAACAT--TT-T-GCACATGACACTTTT-TG----------GTGACATTTGACCTT-T-AATTCCGTC-AA-
gi|13227 : AAACAAATCAGTTCGATT--GGTAAAACATATGAAAAAAACATCTTGAATATGAA-TATT-GT----TATTCTATAT----------TTATATTAG--TTC-AAG-C-TTAACTT-TC-T-GCGCAACTA---TT--TG----------GTGACCTTTGGCCTTGT-AAGTCAGTC-A
gi|13228 : T--GATG--GTTAAAATG-GTTAACATT-TTTTTTAAACACAAAATATA-AT----TA-----TAT----------T-ATCTC-T--TCC-A-G-C-CAAAATAATTGT-GT----------TGG-TG----------GTGACCTTTGTCCTTAT-AACTCAGTC-AA-G-A-AAC-AA--A-T-TAT-T-T-GACAAACA------TATGATAT-GGTGATA--GGCA----CATTTCGCCCGGTTGGCGTCAATGAACACGC
gi|13230 : --GCCAAAACA-ATCAACAGA-TATCTTAAGTATGAA-TAGA-TT----TG----GTAT----------T-ATCTC-G--TCC-A-G-T-TAAAGTT-AT-T-GC----------TTA-TG----------TTGACCT---------T-AA-----TC-AA-A-G-GTC-AAATA-T-T-T-T-TCGGCAACCGATTGTTTCGATTGTAGGTTATAGTGACAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAACACGC
gi|13213 : AAAATA-TATAACAAA-TATCTTAAATATGAA-TATTGTTATTATA----GTATAATATATATAT-ATCAC-T--TCC-A-G-CATAACAT--TT-T-GCGCATGATA--CTGATG----------GTGACCTTTGGCCTTTTAAACCCA-TC-AA-A-
gi|13229 : aaataaaacatttctattggtCAAA-CATCTTAAATATAAA-TATT-GT----TA----TTATGTA-------T-ATATT-AGTTCC-A-GCT-TAACAT--TT-T-GC----------GCA-TGATACTATTTTGTGACCTTTGGCCTTTT-AAGTCCGTC-AA-A-
gi|13231 : tggtaaaatgtaaat----------T-ATCTC-T--GCC-G-G-T-CGGGAAC-TT-T-GC----------TCG-TG-------------ACCTTTAAC-TAAC-AAGTCAGTC-TATA-G-ATC-A-----T-T-T-T-T-GGCAGCAG-TGGTTTCTAATTTAGG--ATATTTGT------------CCTGGTTGCTGTCCACGAACACGC
gi|13232 : ATCTTTGAACTTAT-AAC-------AA-A-A-GTT-AAATA-T-T-T-T-T-GCCAACCAATTGTTTCGAATGTAGATTATAATTACAAACTCAATTAGTCCGGTTGTCGTCGATGAACACGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111 11111111 2222222222
lowQualScore : 2 22 1 3 1 22 1 1 1 1 4444 1 4444 3333333333 2 333 2 22 44 2 2 33333333 2 2 2222222222 2 8888888888 2 2 2 2 2 8 5 1
lowQualScore : . .. . . . .. . . . . .... . .... .......... . ... . .. .. . . ........ . . .......... . .......... . . . . . . . .
lowQualScore : 1 88 9 6 8 55 0 8 9 3 0000 9 0000 0000000000 0 555 0 88 88 0 0 88888888 0 0 5555555555 0 8888888888 0 7 7 7 7 0 3 9
consensus : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
Reference ( family-737 ) : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CANA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13209 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GTT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATAGGAA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-T------T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAATGTCAA-ATA-T-TT-TTT-GGCAACCGATTGTTTCTCATGTAGGATATAGTGGTAAACTCATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAACATGC
gi|13210 : AAACAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAG--CACA-TGTCTTTAATATGAA-TACT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TA-T-T-TGC----------TTG-TG----------ATGACCTTTGACTTTAT-AACTCAGTCAAAAAGTCAA-ATA-T-TT-TTT-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGATATAGTGGTAAACTTATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAAGACGC
gi|13211 : AGATAAACCAAT-AAT--GAT-GGC-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCTG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTATGACCTTAT-AACTCAGTC-AAAGGTCAA-ACA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATACTGGTAAATTCATTCAGCCCGGTCGCCGTTCATGAACACGC
gi|13212 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TGTCTTAAATATGAA-TGAT----TT-TG----GTTT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-A--T-T-TGC----------TTG-TG----------AAGACCTTTGACCTTAT-AACACAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-T-TGGGCAACCGATTGTTTCCAA--TAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGTCAGTTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13213 : AAATAAAACATT-TCT--ATT-GGT--AAAATA-TATAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TATTGTTATTATA----GTATAATATATATAT-ATC---AC-T--TCCAG--CAT-AA-C-A-T--T-T-TGCGCATGATA--CTGATG----------GTGACCTTTGGCCTTTTAAACCCA-TCAAA
gi|13214 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATATTGAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAC----------T-ATC---TC-G--TCCAG--A-T-AA-A-A----T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-TATT-T-T-GGCAACTGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTCAACTTATTTAGCCCTGATGCCGTCCAAGAACACGC
gi|13215 : AAATAAACAAAT-TAT--GGT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TGTAG--T-T-AA-A-A----------A----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-TCT-GGCAACATATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTTATCTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAAC
gi|13216 : AAATAAACCGAT-AGA--GAT-GAT-CAAAACA-ATTTA--CAGA-TATATTGAATATGTA-TGGT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-C-A-C--T-A-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TATTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-AGCAACCGATTGTTTCTTACATAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCTGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13217 : AAATGAGTCAGT-TCT--GTT-GG---AAAATA-TATAA--CAAA-CATCTTAAATCTAAA-TATT----GT-TA----TTATA---------T-ATCATTTC-C--TTC----T-T-AA-C-A-T--T-T-TGCACATGACACTTTT-TG----------GTGACATTTGACCTT-T-AATTCCGTCAA
gi|13218 : AGATAGATCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TGTCTTAAATATGGA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--ACCAG--T-T-AA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------G-------TGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-AT--T-TT-T-T-GGCAACCAATTGTTTCTTATGTAGGATATATAGGTTAATTCATCTAGCCCGGTTGCCGTCCATGGACACGC
gi|13219 : AAATAAACCAAT-AGT----------CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTCAAAATAAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-GTC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-AAG--T-T-TGC----------TAT-TG----------GCGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCTATATA-T-TTGT-T-GGCAGCCGATTGTTTCTAATGTAGATTATAGCAGTTAACTTATTCAGCCCGGTTGCCGTCCATGAGCA
gi|13220 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-GAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAC--T-T-TA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-T---------------------------C-AACTTAGGCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GACAACCGATTGTTTTGAATGTAGGTTATAGTGGCAAACTCATTTAGTCCGGTTGCCGTCAATGAACACGC
gi|13221 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAA--TAGA-TATCTTAAAAATGAA-TATT----TT-TG----GTAG----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-TAAA-A-A-T--T-T-TGC----------TTA-TA----------GTGACCTTTGACCTTTT-AACT
gi|13222 : AAATAAATCATT-AAA--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAACATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-CTT--T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AGCTCATTCAAAAGGTCAA-ATACT-TT-T-T-GGAAACAGATTGTTTCGAATGTAG
gi|13223 : AAATAAACCAAG-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ACTAA--AAGA-TATCTTAACTATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TCG-TG----------GTGAC
gi|13224 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATCTT
gi|13225 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13226 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13227 : AAACAAATCAGTTCGATTGGT--AAAACATATGAA--AAAAACATCTTGAATATGAA-TATT----GT-TATTCTATAT----------TTATA---TTAG--TTCAAGCT-T-AA-C-T-T--T-C-TGCGCAACTA---TT--TG----------GTGACCTTTGGCCTTGT-AAGTCAGTCA
gi|13228 : T--GAT-GGT-TAAAATG-GTTAA--CATT-TTTTTTAAACACAAAATATA----AT-TA-----TAT----------T-ATC---TC-T--TCCAG--C-C-AA-A-A-TAAT-TGTGT----------TGG-TG----------GTGACCTTTGTCCTTAT-AACTCAGTCAAGAAA-CAA-AT--T-AT-T-T-GACA-------------AACATATGATATGGTGATAGGCACATTTCGCCCGGTTGGCGTCAATGAACACGC
gi|13229 : T-GGT--AAAATG---TAAATCAAA-CATCTTAAATATAAA-TATT----GT-TA----TTATGTA-------T-ATA---TT-AGTTCCAGC-T-T-AA-C-A-T--T-T-TGC----------GCA-TGATACTATTTTGTGACCTTTGGCCTTTT-AAGTCCGTCAAA
gi|13230 : GC-CAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAGTATGAA-TAGA----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-G-T--TAT-TGC----------TTA-TG-----------------TTGACCTTA--------ATCAAA-GGTCAA-ATA-T-TT-T-TCGGCAACCGATTGTTTCGATTGTAGGTTATAGTGACAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAACACGC
gi|13231 : ----------T-ATC---TC-T--GCCGG--T-C-GGGA-A-C--T-T-TGC----------TCG-TG-------------ACCTTTAAC-TAAC-AAGTCAGTCTATAGATCA------T-TT-T-T-GGCAGCAG-TGGTTTCTAATTTAGG--AT------------ATTTGTCCTGGTTGCTGTCCACGAACACGC
gi|13232 : ATCTTTGAACTTAT-AAC-------AAAAGTTAA-ATA-T-TT-T-T-GCCAACCAATTGTTTCGAATGTAGATTATAATTACAAACTCAATTAGTCCGGTTGTCGTCGATGAACACGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111 11111111 2222222222
lowQualScore : 2 22 1 3 1 22 2 1 1 1 4444 1 4444 3333333333 2 333 2 22 44 2 2 33333333 2 2 2222222222 2 8888888888 2 2 5 2 2 5 5 1
lowQualScore : . .. . . . .. . . . . .... . .... .......... . ... . .. .. . . ........ . . .......... . .......... . . . . . . . .
lowQualScore : 1 88 9 6 8 55 6 8 9 3 0000 9 0000 0000000000 0 555 0 88 88 0 0 99999999 0 0 5555555555 0 8888888888 0 7 3 7 7 3 3 9
consensus : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
Reference ( family-737 ) : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13209 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GTT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATAGGAA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T------T-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAATGTCAA-ATATT-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTCATGTAGGATATAGTGGTAAACTCATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAACATGC
gi|13210 : AAACAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAG--CACA-TGTCTTTAATATGAA-TACT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TA-T-T-TGC----------TTG-TG----------ATGACCTTTGACTTTAT-AACTCAGTCAAAAAGTCAA-ATA-T-TT-TTT-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGATATAGTGGTAAACTTATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAAGACGC
gi|13211 : AGATAAACCAAT-AAT--GAT-GGC-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCTG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTATGACCTTAT-AACTCAGTC-AAAGGTCAA-ACA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATACTGGTAAATTCATTCAGCCCGGTCGCCGTTCATGAACACGC
gi|13212 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TGTCTTAAATATGAA-TGAT----TT-TG----GTTT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-A--T-T-TGC----------TTG-TG----------AAGACCTTTGACCTTAT-AACACAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-T-TGGGCAACCGATTGTTTCCAA--TAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGTCAGTTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13213 : AAATAAAACATT-TCT--ATT-GGT--AAAATA-TATAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TATTGTTATTATA----GTATAATATATATAT-ATC---AC-T--TCCAG--CAT-AA-C-A-T--T-T-TGCGCATGATA--CTGATG----------GTGACCTTTGGCCTTTTAAACCCA-TCAAA
gi|13214 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATATTGAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAC----------T-ATC---TC-G--TCCAG--A-T-AA-A-A----T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-TATT-T-T-GGCAACTGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTCAACTTATTTAGCCCTGATGCCGTCCAAGAACACGC
gi|13215 : AAATAAACAAAT-TAT--GGT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TGTAG--T-T-AA-A-A----------A----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-TCT-GGCAACATATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTTATCTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAAC
gi|13216 : AAATAAACCGAT-AGA--GAT-GAT-CAAAACA-ATTTA--CAGA-TATATTGAATATGTA-TGGT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-C-A-C--T-A-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TATTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-AGCAACCGATTGTTTCTTACATAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCTGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13217 : AAATGAGTCAGT-TCT--GTT-GG---AAAATA-TATAA--CAAA-CATCTTAAATCTAAA-TATT----GT-TA----TTATA---------T-ATCATTTC-C--TTC----T-T-AA-C-A-T--T-T-TGCACATGACACTTTT-TG----------GTGACATTTGACCTT-T-AATTCCGTCAA
gi|13218 : AGATAGATCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TGTCTTAAATATGGA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--ACCAG--T-T-AA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------G-------TGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-AT--T-TT-T-T-GGCAACCAATTGTTTCTTATGTAGGATATATAGGTTAATTCATCTAGCCCGGTTGCCGTCCATGGACACGC
gi|13219 : AAATAAACCAAT-AGT----------CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTCAAAATAAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-GTC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-AAG--T-T-TGC----------TAT-TG----------GCGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCTATATA-T-TTGT-T-GGCAGCCGATTGTTTCTAATGTAGATTATAGCAGTTAACTTATTCAGCCCGGTTGCCGTCCATGAGCA
gi|13220 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-GAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAC--T-T-TA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-T---------------------------C-AACTTAGGCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GACAACCGATTGTTTTGAATGTAGGTTATAGTGGCAAACTCATTTAGTCCGGTTGCCGTCAATGAACACGC
gi|13221 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAA--TAGA-TATCTTAAAAATGAA-TATT----TT-TG----GTAG----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-TAAA-A-A-T--T-T-TGC----------TTA-TA----------GTGACCTTTGACCTTTT-AACT
gi|13222 : AAATAAATCATT-AAA--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAACATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-CTT--T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AGCTCATTCAAAAGGTCAA-ATACT-TT-T-T-GGAAACAGATTGTTTCGAATGTAG
gi|13223 : AAATAAACCAAG-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ACTAA--AAGA-TATCTTAACTATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TCG-TG----------GTGAC
gi|13224 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATCTT
gi|13225 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13226 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13227 : AAACAAATCAGTTCGATTGGT--AAAACATATGAA--AAAAACATCTTGAATATGAA-TATT----GT-TATTCTATAT----------TTATA---TTAG--TTCAAGCT-T-AA-C-T-T--T-C-TGCGCAACTA---TT--TG----------GTGACCTTTGGCCTTGT-AAGTCAGTCA
gi|13228 : T--GAT-GGT-TAAAATG-GTTAA--CATT-TTTTTTAAACACAAAATATA----AT-TA-----TAT----------T-ATC---TC-T--TCCAG--C-C-AA-A-A-TAAT-TGTGT----------TGG-TG----------GTGACCTTTGTCCTTAT-AACTCAGTCAAGAAA-CAA-AT--T-AT-T-T-GACA-------------AACATATGATATGGTGATAGGCACATTTCGCCCGGTTGGCGTCAATGAACACGC
gi|13229 : T-GGT--AAAATG---TAAATCAAA-CATCTTAAATATAAA-TATT----GT-TA----TTATGTA-------T-ATA---TT-AGTTCCAGC-T-T-AA-C-A-T--T-T-TGC----------GCA-TGATACTATTTTGTGACCTTTGGCCTTTT-AAGTCCGTCAAA
gi|13230 : GC-CAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAGTATGAA-TAGA----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-G-T--TAT-TGC----------TTA-TG-----------------TTGACCTTA--------ATCAAA-GGTCAA-ATA-T-TT-T-TCGGCAACCGATTGTTTCGATTGTAGGTTATAGTGACAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAACACGC
gi|13231 : ----------T-ATC---TC-T--GCCGG--T-C-GGGA-A-C--T-T-TGC----------TCG-TG-------------ACCTTTAAC-TAAC-AAGTCAGTCTATAGATCA------T-TT-T-T-GGCAGCAG-TGGTTTCTAATTTAGG--AT------------ATTTGTCCTGGTTGCTGTCCACGAACACGC
gi|13232 : ATCTTTGAACTTAT-AAC-------AAAAGTTAA-ATA-T-TT-T-T-GCCAACCAATTGTTTCGAATGTAGATTATAATTACAAACTCAATTAGTCCGGTTGTCGTCGATGAACACGC
blockSeqs : C TC T G T AT C A A C GTTA A TTCT AATATATATA T ATT A GT GC A A AATAA A G ACATGACACT A ATACTATTTT A T C A G T G A
blockSeqs : . . . G . . G . . T . . . GTA . . . . C . . AATA . . GCATGATA . . . . . . . C C T
blockSeqs : . . . . . . G . . A . . . A . . . . . . . AATG . . GCAACTA . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . ATGT . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . AAAG . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . ATGT . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . ACTT . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . AATG . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . GAAC . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . CAC . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . CTT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . AGT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . AA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . .
blockSeqCons : AAT*****
originalCons : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
finalCons : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AAAAT-----T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111 11111111 2222222222
lowQualScore : 2 22 1 3 1 22 2 1 1 1 4444 1 4444 3333333333 2 333 2 22 44 2 2 33333333 2 2 2222222222 2 8888888888 2 2 5 2 2 5 5 1
lowQualScore : . .. . . . .. . . . . .... . .... .......... . ... . .. .. . . ........ . . .......... . .......... . . . . . . . .
lowQualScore : 1 88 9 6 8 55 6 8 9 3 0000 9 0000 0000000000 0 555 0 88 88 0 0 99999999 0 0 5555555555 0 8888888888 0 7 3 7 7 3 3 9
consensus : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
Reference ( family-737 ) : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13209 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GTT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATAGGAA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T------T-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAATGTCAA-ATATT-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTCATGTAGGATATAGTGGTAAACTCATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAACATGC
gi|13210 : AAACAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAG--CACA-TGTCTTTAATATGAA-TACT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TA-T-T-TGC----------TTG-TG----------ATGACCTTTGACTTTAT-AACTCAGTCAAAAAGTCAA-ATA-T-TT-TTT-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGATATAGTGGTAAACTTATTTAGCCTGGTTGCCGTCCATGAAGACGC
gi|13211 : AGATAAACCAAT-AAT--GAT-GGC-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCTG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTATGACCTTAT-AACTCAGTC-AAAGGTCAA-ACA-T-TT-T-T-GGCAACCGATTGTTTCTAATGTAGGTTATACTGGTAAATTCATTCAGCCCGGTCGCCGTTCATGAACACGC
gi|13212 : AAATAAACCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAGA-TGTCTTAAATATGAA-TGAT----TT-TG----GTTT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-A--T-T-TGC----------TTG-TG----------AAGACCTTTGACCTTAT-AACACAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-T-TGGGCAACCGATTGTTTCCAA--TAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGTCAGTTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13213 : AAATAAAACATT-TCT--ATT-GGT--AAAATA-TATAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TATTGTTATTATA----GTATAATATATATAT-ATC---AC-T--TCCAG--CAT-AA-C-A-T--T-T-TGCGCATGATA--CTGATG----------GTGACCTTTGGCCTTTTAAACCCA-TCAAA
gi|13214 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATATTGAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAC----------T-ATC---TC-G--TCCAG--A-T-AA-A-A----T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TACTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-TATT-T-T-GGCAACTGATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTCAACTTATTTAGCCCTGATGCCGTCCAAGAACACGC
gi|13215 : AAATAAACAAAT-TAT--GGT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAATATGAA-TGTT----AT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TGTAG--T-T-AA-A-A----------A----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-CTA-T-TT-TCT-GGCAACATATTGTTTCTAATGTAGGTTATAGTGGTAAACTTATCTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAAC
gi|13216 : AAATAAACCGAT-AGA--GAT-GAT-CAAAACA-ATTTA--CAGA-TATATTGAATATGTA-TGGT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-C-A-C--T-A-TGC----------TTG-TG----------GTGACCTTTGGCCTTAT-TATTCAGTCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-AGCAACCGATTGTTTCTTACATAGGTTATAGTGGTAAACTCATTTAGCCCTGTTGCCGTCCATGAACACGC
gi|13217 : AAATGAGTCAGT-TCT--GTT-GG---AAAATA-TATAA--CAAA-CATCTTAAATCTAAA-TATT----GT-TA----TTATA---------T-ATCATTTC-C--TTC----T-T-AA-C-A-T--T-T-TGCACATGACACTTTT-TG----------GTGACATTTGACCTT-T-AATTCCGTCAA
gi|13218 : AGATAGATCAAT-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TGTCTTAAATATGGA-TGCT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--ACCAG--T-T-AA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-TG----------G-------TGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCAA-AT--T-TT-T-T-GGCAACCAATTGTTTCTTATGTAGGATATATAGGTTAATTCATCTAGCCCGGTTGCCGTCCATGGACACGC
gi|13219 : AAATAAACCAAT-AGT----------CAAAACA-ATTAA--CAGA-TATCTTCAAAATAAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-GTC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-AAG--T-T-TGC----------TAT-TG----------GCGACCTTTGACCTTAT-AACTCAGTCAAAAGGTCTATATA-T-TTGT-T-GGCAGCCGATTGTTTCTAATGTAGATTATAGCAGTTAACTTATTCAGCCCGGTTGCCGTCCATGAGCA
gi|13220 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-GAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAATATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAC--T-T-TA-ATG-T--T-T-TGC----------TTG-T---------------------------C-AACTTAGGCAAAAGGTCAA-ATA-T-TT-T-T-GACAACCGATTGTTTTGAATGTAGGTTATAGTGGCAAACTCATTTAGTCCGGTTGCCGTCAATGAACACGC
gi|13221 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATCAA--TAGA-TATCTTAAAAATGAA-TATT----TT-TG----GTAG----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-TAAA-A-A-T--T-T-TGC----------TTA-TA----------GTGACCTTTGACCTTTT-AACT
gi|13222 : AAATAAATCATT-AAA--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CAAA-TATCTTAAACATGAA-TATT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-CTT--T-T-TGT----------TTG-TG----------GTGACCTTTGACCTTAT-AGCTCATTCAAAAGGTCAA-ATACT-TT-T-T-GGAAACAGATTGTTTCGAATGTAG
gi|13223 : AAATAAACCAAG-AGT--GAT-GGT-CAAAACA-ACTAA--AAGA-TATCTTAACTATGAA-TGTT----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-A-TG-T-T-TGC----------TCG-TG----------GTGAC
gi|13224 : AAATAAACCAAT-AAT--GAT-GGT-CAAAACA-ATTAA--CATA-TATCTT
gi|13225 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13226 : AGATAAACCAAT-AGT--GAT-TATGCA---CA-ATTAG--CACA-TGTCTTAAATATGAA-TG------CA-TG----GTAT----------
gi|13227 : AAACAAATCAGTTCGATTGGT--AAAACATATGAA--AAAAACATCTTGAATATGAA-TATT----GT-TATTCTATAT----------TTATA---TTAG--TTCAAGCT-T-AA-C-T-T--T-C-TGCGCAACTA---TT--TG----------GTGACCTTTGGCCTTGT-AAGTCAGTCA
gi|13228 : T--GAT-GGT-TAAAATG-GTTAA--CATT-TTTTTTAAACACAAAATATA----AT-TA-----TAT----------T-ATC---TC-T--TCCAG--C-C-AA-A-A-TAAT-TGTGT----------TGG-TG----------GTGACCTTTGTCCTTAT-AACTCAGTCAAGAAA-CAA-AT--T-AT-T-T-GACA-------------AACATATGATATGGTGATAGGCACATTTCGCCCGGTTGGCGTCAATGAACACGC
gi|13229 : T-GGT--AAAATG---TAAATCAAA-CATCTTAAATATAAA-TATT----GT-TA----TTATGTA-------T-ATA---TT-AGTTCCAGC-T-T-AA-C-A-T--T-T-TGC----------GCA-TGATACTATTTTGTGACCTTTGGCCTTTT-AAGTCCGTCAAA
gi|13230 : GC-CAAAACA-ATCAA--CAGA-TATCTTAAGTATGAA-TAGA----TT-TG----GTAT----------T-ATC---TC-G--TCCAG--T-T-AA-A-G-T--TAT-TGC----------TTA-TG-----------------TTGACCTTA--------ATCAAA-GGTCAA-ATA-T-TT-T-TCGGCAACCGATTGTTTCGATTGTAGGTTATAGTGACAAACTCATTTAGCCCGGTTGCCGTTCATGAACACGC
gi|13231 : ----------T-ATC---TC-T--GCCGG--T-C-GGGA-A-C--T-T-TGC----------TCG-TG-------------ACCTTTAAC-TAAC-AAGTCAGTCTATAGATCA------T-TT-T-T-GGCAGCAG-TGGTTTCTAATTTAGG--AT------------ATTTGTCCTGGTTGCTGTCCACGAACACGC
gi|13232 : ATCTTTGAACTTAT-AAC-------AAAAGTTAA-ATA-T-TT-T-T-GCCAACCAATTGTTTCGAATGTAGATTATAATTACAAACTCAATTAGTCCGGTTGTCGTCGATGAACACGC