lowQualScore : 11111111111111111111 111111111 22222 111 2222222222222 1 1111 22222222222222222222222 2222222 1111111 44444444444444444444444444444
lowQualScore : 3 99 7 44 3 2 55555555555555555555 444444444 3 11111 444 3 2 3333333333333 5 0 777 5 2 2 5 99 5 66 2 444 2222 1 66 33 8 4 7 2 999999 33 1 6 777 6 33 2 4 66666 3 666 1 666666 666 33 33333333333333333333333 2 5 333 8888888 444 55 0 4 77 33 3 6 333 7777 22 888 22 55555 2 44 7 44 22 1 2 4 4 3 44 44444 1 9999999 2 6666666 22 22 1111111 2 3 6 66666666666666666666666666666 5 66
lowQualScore : . .. . .. . . .................... ......... . ..... ... . . ............. . . ... . . . . .. . .. . ... .... . .. .. . . . . ...... .. . . ... . .. . . ..... . ... . ...... ... .. ....................... . . ... ....... ... .. . . .. .. . . ... .... .. ... .. ..... . .. . .. .. . . . . . .. ..... . ....... . ....... .. .. ....... . . . ............................. . ..
lowQualScore : 3 22 5 66 3 3 88888888888888888888 666666666 5 99999 000 1 1 3333333333333 9 7 555 3 2 5 1 33 2 33 7 000 7777 7 77 55 5 5 4 2 888888 11 1 7 111 6 11 2 4 11111 1 111 8 444444 999 11 11111111111111111111111 4 4 999 1111111 888 33 7 4 88 11 3 7 999 9999 99 666 99 33333 1 66 9 44 99 6 7 7 6 6 88 88888 3 2222222 0 7777777 88 88 8888888 0 5 6 33333333333333333333333333333 4 55
consensus : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCA---GC---T---G-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNA--N--AT-GCTT-TTAAATCGA------------CTGGGNTTTGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATTTNCCCA-T-G-TTN---AAACAAAGAATTCGT-GATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATACANC-TNT--TCAA-AATA--TGCCNA--A-A-TTA--G--ACTATT-TNAGAAAAT------TTA---A--AACA-------TG-TT-----------T-TGAATAT---GAA---N--NTTACTTG--GAT--TTTA-TTTCAAATGA--AACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGN-AGA-----TATAC----N--AATG-T-----AGA--AAGGGA--AAAT--CG-NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---G--GAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTN-TTATGTT
Reference ( gi|91364 ) : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCA---GC---T---G-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCA--C--AT-GCTT-TTAAATCGG------------CTGGGTTTTGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTACAATTTAAACGCAAATTATTTCCCCA-T-G-TTA---AAACAAAGGATTTGT-GATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATACAGC-TCT--TCAA-AATA--TGCCCA--A-A-TTA--G--ACTATT-TAAGAAAAT------TTA---A--AACA-------TG-TC-----------T-TGAATAT---GAA---T--TTTACTTG--GAT--TTTA-TTCCAAATGA--AACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGG-AGA-----TACAC----A--AATG-T-----ACA--AAGGGA--AAAT--CG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---G--GAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTA-TTATGTT
gi|91366 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCA---GC---T---G-------TTGGGCGGG-TA--GTATGCA--C--AT-GCTT-TTAAATCGG------------CTGGGTTTTGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATTTCCCCA-T-G-TTA---AAACAAAGGATTTGT-GATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATACATC-TCT--TCAA-AATA--TGCCCA--A-A-TTA--G--ACTATT-TAAGAAAAT------TTA---A--AACA----------TC-----------T-TGAATAT---GAA---T--TTTACTTG--GAT--TTTA-TTCCAAATGA--AACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGCACGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGG-AGA-----TACAC----A--AATG-T-----ACA--AAGGGA--AAAT--CG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---G--GGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTA-TTATGTT
gi|91363 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCA---GC---T---G-------TTGGGGTGG-TA--GTATGCA--C--AT-GCTT-TTAAATCGA------------CTGGGTTTTGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTTAGTTTAAACGCAAATTATTTCTCCA-T-G-TTA---AAACAAAGGATTTGT-GATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATACATT-TCT--TCAA-AATA--TGCCCA--A-A-TTA--G--ACTATT-TAAGAAAAT------TTA---A--AACA-------TG-TT-----------T-TGAATAT---GAA---T--TTTACTTG--GAT--TTCA-TTCCAAATGA--AACAA-A---CCGT---A--AA-A-AA--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGG-AGA-----TACAC----A--AATG-T-----ACA--AAGGGA--AAAT--CG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---G--GGGGC--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTA-TTATGTT
gi|91365 : AGGTTTTTAATGAACGATGC-A-CTTTACAAA--AT-ACCA---GC---T---G-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCG--C--AT-GCTT-TTAAATCGA------------CTGGGTTTTGGAAA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATTTCTCCA-T-G-TTA---AAACAAAGGATTTGT-GATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATACATC-TCT--TGAA-AATA--TGCCCA--A-A-TTA--G--ACTATT-TAAGAAAAT------TTA---A--AACA-------TG-TT-----------T-TGAATAT---GAA---T--TTTACTTG--GAT--TTTA-TTCCAAATGA--AACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTC-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACAGGG-AGA-----TACAC----A--AATG-T-----ACA--AAGGGA--AAAT--CG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---G--GGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTA-TTATGTT
gi|91367 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCT---GC---T---G-------TTGGGCAGG-AA--GTATGCA--C--AT-ACTT-TTAAATCGA------------CTTAGTTTTGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTAAAACGCAAATTATTCTTCTA-T-G-TTA----------GGATTTGT-GATCAGTATTTACAAAGC-TTGAATACATC-TCT--TCAA-AATG--T------------------------T-TGATAAAAT------TTA---A--AACA-------TG-TT-----------T-TGAATAT---GAA---T--ATTACTTG--GAT--TATA-TTTCAAATGA--AACAA-A---TCGT---A--AA-A-AA--A-----TA-ACAAGATTTC-G--GCTGCGTGTGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGG-AGA-----TACGC----A--AATA-T-----AAAACAAGGGA--AAAG--CA--TTC-TACAGAGTATGC------A-AT-G---G--G-GGT--TG-GTTGAATCGGAGTATTATTTTCTC-TTAT
gi|91368 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--AT-ACCT---GC---T---G-------TTGGGCTGG-TAGTGTATGCA--C--AT-GCTT-TGAAATCGA------------CTGGGATTTGGGGA--TATT-TGGTTGA-A
gi|91369 : TTTTATTGATCAATGTGA-ATCTAT------C-ACTG---GTAAAT---G-------TTGGGCAAG-TA--ATGTGAA--GGAAT-A--T-TTGGATAGA------------CTAGGATTTGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACAGACGTAAATTATCTACCCA-T-G-TTT---AGACAAAGAATACGT-GATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATACTGG-CAT--TGAAGAAT---TGCCTA--A-A-TTG--G--AATATT-TTAGGAAAT------TCA---AGAAACAGTT----TA-TT-----------T-T-----T---GAA---G--ATTATTTA--GAT--GTTA-T---AAA--A--AATAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TA-ACATGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGA-AGA-----TTTAA----T--AATA-T-----AGA--TAGAGA--AAAT--AG-GCTA-TGTAAATTATGTTC----C-AT-----G--AAAGT--T--GTTGAAACTGAGTATCATTTCTTA-CTATGTT
gi|91370 : TTTTAATGAACAATGT-A-ATTTTCAAT--AT-AATG---AA---T---G-------TTGGAC-------------CA--A--AT---TTATTGAATCGATCTAAAAATAACCTAGGATTTGGAGA--CATT-TGGCAAA-ATTTCAATCCAAATATAAACTATT----CA-T-C-TTATTTGAACAAAGAATCAGA-GACCAATACATGCAAACT-TGGACTAT---------------ATA--TGACGA--A-A-CTA--A--AATATTATAAT-AAGT------TTA---A--AGTT-------GG-TT-----------T-TAAATAT---GAA---G--ATTAGTTA--GAT--TTTA-TTTCAAATGA--AAAGA-G---TCGC---A--AA-T-AT--T-----TA-ACACGTTTTC-G--TCTCAGTGCCCATATGCTAGACATATAATCAGGT-AGA-----TATAC----T--AGAG-TAGAAAAGA--AAGAGA--AAA--------CT-TGTGAATTATATTCCATAA-AT-----------GT--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTTGT-TTATGTT
gi|91372 : TTTTACTGATCAATGT-G-------AAA--CT-ATCACTGGTAAAT---G-------TTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGA--AT-A--T-TTGGATAGA------------CTGGGATTTGGTGT--TCTG-TGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATCTACCAA-T-G-TTT---AGACAAAGAATACAT-GATAAGTATATCCAGAGT-TGCAATACTGG-CAT--TGAAGAAT---TGCCTA--A-A-TTG--G--AATATT-TAGGAAA--------TTAAAGA--AACAGTT----TA-TT-----------T-T-----T---GAA---G--ATTATTTA--GAT--GTTA-T---AAA--A--ATTAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TT-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCTCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGA-AGA-----TTTAA----T--AATA-T-----AGA--TAGAGA--AAAT--AG-GCTA-TGTAAATTGTGTTC----C-AT-----G--AAAGT--T--GTTGAAACTGA-TATCATTTCTTA-CTATGTT
gi|91371 : TTTTATTGATCAATGT-G-------AAA--CT-ATCA----C---T---GGTAAATATTGGGCGAG-TA--ATGTGAA--GGAAT-A--T-TTGAATTGA------------CTAGGATTTGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATCTACCCA-T-G-TTC---AGACCAAGAAAACGT-GATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATACTGG-CAT--TGAAGAAT---TGCTTA--A-A-TTG--G--AATATT-TTAGTAAAT------TCAAG-A--AACAGTTTGTTTG-TT-----------T-T---T-T---TAA---G--ATTATTTA--GAT--GTAA-T-----ATAA--AATAATG---CCAT---AAGAA-A-ACAGT-----TA-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGA-AGA-----T
gi|91373 : TTTTAATAAACATTGT-AACTTT-CAAA--AT-AATA---AA---T---G-------TTGGGCCAA-AT--GTATGGA-----ATCGTTC-CTAAATAAC------------CTAAGATTTGGAGA--CA---TGGCTTA-GTTCCAATCAAAATGCAATTTATTATATCT-T-A-TTT---AAACAAAGAGTTAGA-GACCAATAC--------------ATGCATC-TGT--TCAG-ACTA--TGCCGA--A-A-ttaataatat
gi|91374 : AATGAGCAATTT-AACTTT-CAGA--ATGATAA---AT---TACGG-------TTCAACTG-------TATGGG-----ATCGTTT-TTAAATTAC------------AAAGGATTTGAAGA--CA---------ACATTTCAATCCAAATA-AAACT-TTTCTATC-T-GATTT---AAACATTGAATT-ATAGACCAATACATACAAACTGTTAAATACTGCATCTGTTCAA-ACTA--TGCCGA--A-A-CTA--C--ACCATT-ACAATAAGT------TTA---A--AGTA-------GA-TT-----------T-TAAAAAT---GAAGATTA-TTTACTTATTGGT--TTTAATTTCAAATGA--CAAGA-A---TCGA---A--AA-G-AT--T-----TG-ACACG-TTTA----AC--------CATACTTTATCAATAGAATCAGGC-AGA-----TAGAC----G--AATG-T-----AGA--AAGGGA--TCATTATG-TTCT-T-TA--------------A-AT-G---G------------------TCAGAGTATCATTTTCTT-TTATATT
gi|91376 : -A-CTTTTCAAATGAT-A--A---AT---T-----------TTGGGCCAA-AT--GTATGGA--A--AA-GATC-TTAAATAAC------------CTAGGATTTGGAGACATATT-TGGCTAA-ATTTCAATCCATATGTAAACTATTCTCTCT-T-A-CTT---AAACAAAGAATTAGT-
gi|91377 : ---T---G-------TTGGGCCAAATA---TATGGA--A--TT-GTTT-TTAAATAAC------------CAAGACTTCGGAGA---ATA-TGGCAAA-ATTTCGATCCAAATGTAAAGTATTCTATCT-T-A-TTT---AAACAAAGAGTTTGA-GATCAATATATGCAAACT-TTGACTGCATC-TGT--CCAT-AATA--TGCCGA--A-A-CTA--A--A-TATT-ACAATAAGT------TTA---A--Attaaacatattttactgctttttaacaaagaataagggaccaatacatgtaaactaggactgcatctgttcagaccatgccgaatattacaggctatgtcgaaactacagcattacaatatgttaagagtagattttaaatatgaagattagtttacttagatttcatttcaaaagaaaataatcgcaaagatttgacatgtttacgtcttagtgtccatactttagaaatagtatcaggcagctatacgtatgtaaaaagagaaaatcaaatgtgtaaatcacgttcctgaagtattattgaatcagagtgtcgttttatttta
gi|91378 : TGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAATTATTTGCCCATT-A-TT----AAACAACGACTTCGA-GATCAAGACATCCAATTT-TGGAGAGGAAG-TAT--TCAT-GCAA--TGCCAA--A-A-CTT--A--ATTATT-ACTGTAAAT------CTA---A--AAC--------TGATT-----------T-TATATATGAGGAA---TA-TTTATC------T--TTAA-TTACAGATGA--TACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTA-G--ATTAAGTTTACATAATCTTGCGATTGAATCCGGA-AGA-----TATAC----T--AGTG-T-----CGA--AAGACA--GAAT--AG-AATT-TGCCAAATGTGT--------AC-G---AACAATGC--T--ATAGAGTCCGAATACAATTTTTTACTTATATgtagattt
gi|91375 : ttagacgattTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAACTATTTGCCCA-TTA-TTA---AA-CAACGACTGCGG-GATCAATACATCCAATTT-TGGAGAGGAAA-TAT--TCAT-GCAA--TGCCAA--A-A-CTT--A--ATTATT-ACTGTAAAT------TTA---A--AAC--------TGATT-----------T-TATATAT---GAG---G--AATATTT----ATC-TTTAGTTACAGATGA--TACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTT-G--ATTAAATTCACATAATCTTGCGATTGAATCCGGA-AGA-----TATAC----T--GGTG-T-----CGA--AAGACA--GAAT--AG-AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91376 : atgaataatcaacaacaaaaacaaagctgggctcaaagaatttaaacaatattagacgattGA-ATTA--GTTTAAACA-----TATTTTACTG-C-T-TTT---TAACAAAGAATAAGG-GACCAATACATGTAAACT-AGGACTGCATC-TGT--TCAG-ACCA--TGCCGA--ATA-TTACAG--GCTATG-TC-GAAACTACAGCATTA---C--AATA-------TG-TTAAGAGTAGATTT-TAAATAT---GAAGATTAGTTTACTTA--GAT--TTCA-TTTCAAAAGA--AAATA-A---TCGC---A--AA-G-AT--T-----TG-ACATG-TTTACG--TCTTAGTGTCCATACTTTAGAAATAGTATCAGGC-AGC-----TATAC----G--TATG-T-----AAA--AAGAGA--AAAT--CA-AATG-TGTAAATCACGT------T-CC-T---G--AAGTA--TT-ATTGAATCAGAGTGTCGTTTTATT-TTAcgaacaatacaatagagtccgaataccatttttt
gi|91379 : acttttcaaatgataaattttgggccaaatgtatggaaaagatcttaaataacctaggatttggagacatatttggctaaatttcaatccatatgtaaactattctctcttacttaaacaaa-GACCAATATTATCAAAAC-TGGTATTCAAC-TCT--T----AATACTTCTCCA--A-AATTA--GTAAC-ATA-TAAGATAAT--------A---A--AAAA-------TA-CC-----------TATAAAGAT---GAA---A--AGTATATA--GAC--TGTA-TTTAAAATAA--AA--A-A---C------A--AA-G-AT--TGGCTTTA-ATTAGATTTA-GTTACTCAG--CACACAATCTTGTTATTAAAAATGGA-AGG-----TATAA----G--AATG-T-----GCC--CAGGGA--AAAT--AG-GATT-TGTACCTTTTGC------A-AT-A---T--GA-AT--TGTATTGAAAATGAATACCATTTCCTG-TTA
gi|91380 : -GATCAATATCTACAAGAC-TGGAATGGAAC-TGT--TCGA-AA------CTCAGTA-C-TTA------CTAT----ATAAAGT------TTG---A--ACAA-------TG-TT-----------T-TGCATAT---GAA---A--AGTATCTC--GA-----TG-TGCTAAATAT--CAGAA-AATTTCGT------CA-T-AT--C-----TATGCAAGCTTCA-G--ATCGAGTTCTCATGACCTGGAAAATGAAAGAGGT-TGT-----TACAG----A--AATA-T-----AGA--AAGAGATCGAA----G-GTTA-TGTACATTGTGT------G-AT-GT--A--AATGT--T--GTAGAAAATGAGTTTCACTTTCTA-CTGTGTT
gi|91381 : AGTAGTAGCAAA---TGGAATACCTC-TAT--TAAA-AGTA--TGCCAA--A-AATTA--G--ATTATT-TGAGAAAAC------TTA---A--AACA-------TG-TT-----------T-TGATTAT---GAA---A--ATTACTTG--AAT--T----------AT------CAT-A---CTGT---G--AA-G-AT--T-----TA-ACAAGATTTT-C--ACGGAGTGCACATAACTTAGAAATTGAAACTGTG-AGA-----TACAC----A--CATA-T-----ACA--AAGAGA--AACT--CG-TTCT-TGCAGGGTATGT------G-AT-
gi|91382 : AAGT-TGGAAAACATC-TCT--TCAA-AAT----------------TA--G--ACAATT-TGATAAAAT------TTT---A--AACA-------TG-TT-----------T-TAAATAT---GAA---A--ATTATTTG--GAT--TATA-TTTCAAATGA--AACAA-A---ATGT---A--AA-C-AT--T-----TA------ATT--------TGAGTGCGTATTACTTAGAAATT---ACTTTG-AGG-----TATAA----A--AATG-T-----ACA--AATGG-----AT--TT-TATT-TGCAGAGAATAT------A-AT-G---G--GAGAA--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTCTatg
gi|91383 : AGAAACA------TAA---A--GACA-------AA-CT-----------T-TGAATCT---GAG---C--CTTACTTG--GATAAAATA-TTGAAACTGAAGAATAG-A---C---------AA-G-CT--T-----TA-ACAAAATTGA-G--ACTAAATTCACATAATTTAAGAATTG-AACAGGGCAGACATTGTAGTC----C--AGTGAT-----TCC--AAGGAA--TGAA--CG-TGTT-TGTATGTTATGT------ACAT-GC--G--GAGAT-----ATTGAAGACGAGTTTCATTTtt
gi|91384 : AT---GAA---A--CTTAATTG---AT--TTTA-TTTCATATGA--AAAGA-A---TCGC---A--AA-A-GT--T-----TC-ACACG-TTTACG--TCTTAGTGCCCATACTTTAGAAATAGAATCAGGC-AGA-----TATACTATTAGTAATG-T-----A--------GA--AAAT--CG-ACTT-TGCAAATTATGTTCCTTAA-AT-G----------T--TG--TTGAATTAGAGTATCATTTTCTT-TTATGTTcgtttta
gi|91385 : ---A--AA-C-AG--T-----TA-ACAAGATTTT-G--ACTGTGTGCGTATAATTTAGAAATTGAAACTGGG-AGA-----TACAC----A--AATG-T-----ACA--AAGGAA--AAAT--CATTTTT-TGCAGATTATGT------G-ATGG---G--GAGGTGGTG-GTTAAATCAGAGTATCA-TTTCTC-TTATATT
gi|91386 : CATACTTTAGAAATAGAATCAGTC-AGA-----TATAC----A--AATG-T-----AGA--AAGAGA--GAAT---G-TTTTGTGTAAATTATGTTTCTTAA-AT-G----------C--TG--TTGAACCAGAATATCATTTTCTT-TTAT
gi|91387 : ATACTATAGAAATAGATTCAGGC-AGA-----TATAA----T--AATG-T-----AGA--AGGAGA--AAAT--CG-AGTT-TGTAAGTTATGT---------T-GCTTA--AATGT--TG--TTGAATCAGAGTATCATTTTCTG-TTATGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111 22222222222222222222 444444444444444444444444444444
lowQualScore : 2 66 5 33 1 66666666 8888888 55555555 1 222 8 33 2 1 1 5 0 666 5 1 2 22 2 1 1 444 3 3 2 3 1 3 2 333 1 1 0 6 3 333 2 22 2 2 33 33 2 3 0 666666 22 55 33333333333333333333 2 4 55555 22 0 6666666 2 0 2 6666 2 22 2 6 333 777 22 666 22 55555 2 1 7 4 22 1 2 4 1 1 1 1 333 1 6666 22 0 777 1 0 1 444444444444444444444444444444 55555 4 1
lowQualScore : . .. . .. . ........ ....... ........ . ... . .. . . . . . ... . . . .. . . . ... . . . . . . . ... . . . . . ... . .. . . .. .. . . . ...... .. .. .................... . . ..... .. . ....... . . . .... . .. . . ... ... .. ... .. ..... . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . ... . . . .............................. ..... . .
lowQualScore : 9 44 1 99 2 00000000 7777777 22222222 0 000 2 44 5 7 0 0 1 444 0 5 4 22 5 0 3 444 4 8 1 2 8 8 1 777 7 0 5 3 4 777 5 99 1 1 11 11 4 9 8 111111 99 88 55555555555555555555 1 6 33333 00 2 7777777 1 2 1 8888 1 99 6 3 777 000 88 555 88 00000 0 7 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 222 0 7777 66 3 111 9 4 5 888888888888888888888888888888 66666 1 0
consensus : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGA-----AGATTACTTG------GAT-TTTA-T-TT-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG-NNTT-TGTAGATTATGT------A----AT-G---GGAGGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
Reference ( family-731 ) : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTNAAACAAAGAATTCGTGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGA-----ANNTTACTTG------GAT-TTTA-T-TT-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG-NNTT-TGTAGATTATGT------A----AT-G---GGAGGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
gi|91363 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGGTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTTAGTTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATTTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGA-----ATTTTACTTG------GAT-TTCA-T-TC-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AA--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A----AT-G---GGGGGC---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91364 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTACAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---AGCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TCT-TGAATATGA-----ATTTTACTTG------GAT-TTTA-T-TC-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A----AT-G---GGAGGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91365 : AGGTTTTTAATGAACGATGC-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCGC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAAA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTGAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGA-----ATTTTACTTG------GAT-TTTA-T-TC-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTC-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACAGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A----AT-G---GGGGGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91366 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCGGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA--------------------TCT-TGAATATGA-----ATTTTACTTG------GAT-TTTA-T-TC-CAAA-TGA--AACAA-A---CCGT---AA--A-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGCACGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG-TTTT-TGTAGAGTATGT------A----AT-G---GGGGGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91367 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCAGG-AA--GTATGCAC--ATACTTTTAAAT--CGAC-TTAGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTAAAACGCAAATTATT-CTTCTAT---GTT-------AGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAGC-TTGAATAC---ATCTCTTCAA-AATGT---------------------------TTGATAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGA-----ATATTACTTG------GAT-TATA-T-TT-CAAA-TGA--AACAA-A---TCGT---AA--A-A-AA--A-----TA-ACAAGATTTC-G--GCTGCGTGTGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACGCAAAT---ATAAAAC--AAGG--GAAAAGC--ATTC-TACAGAGTATGC------A----AT-G---GG-GGT---TG-GTTG-----AATCGGAGTATTATTTTCTCTTAT
gi|91368 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCTGG-TAGTGTATGCAC--ATGCTTTGAAAT--CGAC-TGGGATT-TGGGGA--TATT-TGGTTGA-A
gi|91369 : TTTTATTGATCAATGTGA-ATCTAT------CACTG---GTAAATG-------TTGGGCAAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACAGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTTAGACAAAGAATACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGGAAAT------TCA--AGAAACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGA-----AGATTATTTA------GAT-GTTA-T-----AAA---A--AATAATG---CCATTAGAA--A-ACAG--T-----TA-ACATGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG-GCTA-TGTAAATTATGTTC----C----AT-----GAAAGT---T--GTTG-----AAACTGAGTATCATTTCTTACTATGTT
gi|91370 : TTTTAATGAACAATGT-A-ATTTTCAAT--ATAATG---AA---TG-------TTGGACCAA-AT--TTATTGAA--TCGATCTAAAAA--TAACCTAGGATT-TGGAGA--CATT-TGGCAAA-ATTTCAATCCAAATATAAACTATT-CATCT-T---ATTTGAACAAAGAATCAGAGACCAATACATGCAAACT-TGGA---------CTAT------ATATG---ACGA--A-A-CT--AA--AATATTATAATAAGT------TTA--A--AGTT-------GG-----------TTT-TAAATATGA-----AGATTAGTTA------GAT-TTTA-T-TT-CAAA-TGA--AAAGA-G---TCGC---AA--A-T-AT--T-----TA-ACACGTTTTC-G--TCTCAGTGCCCATATGCTAGACATATAATCAGGTAGATATACTAGA---GTAGA----AAAG--AAAGAGAA-AACT-TGTGAATTATATTCCATAA----AT---------GT---T--GTTG-----AATCAGAGTATCATTTTTGTTTATGTT
gi|91371 : TTTTATTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCA----C---TGGTAAATATTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGAAT--TGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTCAGACCAAGAAAACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CTTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGTAAAT------TCA--AGAAACAGTTTGTTTG-----------TTT-T---T-TTA-----AGATTATTTA------GAT-GTAA-T-------A-TAA--AATAATG---CCAT---AAGAA-A-ACAGT-----TA-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---AT
gi|91372 : TTTTACTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCACTGGTAAATG-------TTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TGGGATT-TGGTGT--TCTG-TGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCAAT---GTTTAGACAAAGAATACATGATAAGTATATCCAGAGT-TGCAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTT-AGGAAAT------TAAAGA--AACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGA-----AGATTATTTA------GAT-GTTA-T-----AAA---A--ATTAATG---CCATTAGAA--A-ACAG--T-----TT-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCTCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG-GCTA-TGTAAATTGTGTTC----C----AT-----GAAAGT---T--GTTG-----AAACTGA-TATCATTTCTTACTATGTT
gi|91373 : TTTTAATAAACATTGT-AACTTT-CAAA--ATAATA---AA---TG-------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--TCGTTCCTAAAT--AACC-TAAGATT-TGGAGA--CA---TGGCTTA-GTTCCAATCAAAATGCAATTTATTATATCT-T---ATTTAAACAAAGAGTTAGAGACCAATAC--------------ATGC---ATCTGTTCAG-ACTATG---CCGA--A-A-
gi|91374 : AATGAGCAATTT-AACTTT-CAGA--ATGATA---AA---TT-------ACGGTTCAA-CT--GTATGGGA--TCGTTTTTAAATTACAA---AGGATT-TGAAGA--CA---------ACATTTCAATCCAAA--TAAA--ACT-TTTCTATCTGATTTAAACATTGAATTATAGACCAATACATACAAACTGTTAAATACTGCATCTGTTCAA-ACTATG---CCGA--A-A-CT--AC--ACCATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-TAAAAATGA-----AGATTATTTACTTATTGGT-TTTAAT-TT-CAAA-TGA--CAAGA-A---TCGA---AA--A-G-AT--T-----TG-ACACG-TTTA----AC--------CATACTTTATCAATAGAATCAGGCAGATAGACGAAT---GTAGA----AAGG--G---ATC------------ATTATGTTCTTTAA----AT-G---G----------------------TCAGAGTATCATTTTCTTTTATATT
gi|91375 : ATGAATAATCA-A-CA--ACAAA--A-ACAA---A-----G-------CTGGGCTCA-AA--GAATTTAA--ACAATATTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAACTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTGCGGGATCAATACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAATATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------TTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGA-----GGAATATTT--------ATCTTTA-G-TTACAGA-TGA--TACCA-A---ACGA---AA--ACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTT-G--ATTAAATTCACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTGGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG-AATT-TGCCAAATGTGT------A----
gi|91376 : -A-CTTTTCAAATGATA--A---AT---T--------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--AAGATCTTAAAT--AACC-TAGGATT-TGGAGACATATT-TGGCTAA-ATTTCAATCCATATGTAAACTATT-CTCTCTT---ACTTAAACAAAGAATTAGTcgaacaatacaatagagtccgaataccatttttt
gi|91376 : GA-ATT--AGTTTAAACATA-----TT-TTACTGC---TTTTTAACAAAGAATAAGGGACCAATACATGTAAACT-AGGACTGC---ATCTGTTCAG-ACCATG---CCGA--ATA-TTACAG--GCTATGTC-GAAACTACAGCATTA--C--AATA-------TGTTAAGAGTAGATTT-TAAATATGAAGATTAGTTTACTTA------GAT-TTCA-T-TT-CAAA-AGA--AAATA-A---TCGC---AA--A-G-AT--T-----TG-ACATG-TTTACG--TCTTAGTGTCCATACTTTAGAAATAGTATCAGGCAGCTATACGTAT---GTAAA----AAGA--GAAAATCA-AATG-TGTAAATCACGT------T----CC-T---GAAGTA---TT-ATTG-----AATCAGAGTGTCGTTTTATTTTAttaaacatattttactgctttttaacaaagaataagggaccaatacatgtaaactaggactgcatctgttcagaccatgccgaatattacaggctatgtcgaaactacagcattacaatatgttaagagtagattttaaatatgaagattagtttacttagatttcatttcaaaagaaaataatcgcaaagatttgacatgtttacgtcttagtgtccatactttagaaatagtatcaggcagctatacgtatgtaaaaagagaaaatcaaatgtgtaaatcacgttcctgaagtattattgaatcagagtgtcgttttatttta
gi|91377 : acttttcaaatgataaattttgggccaaatgtatggaaaagatcttaaataacctaggatttggagacatatttggctaaatttcaatccatatgtaaactattctctcttacttaaacaaa---TG-------TTGGGCCAAATA---TATGGAA--TTGTTTTTAAAT--AACC-AAGACTT-CGGAGA---ATA-TGGCAAA-ATTTCGATCCAAATGTAAAGTATT-CTATCTT---ATTTAAACAAAGAGTTTGAGATCAATATATGCAAACT-TTGACTGC---ATCTGTCCAT-AATATG---CCGA--A-A-CT--AA--A-TATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-
gi|91378 : TTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAATTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTTCGAGATCAAGACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAGTATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------CTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGA-----GGAATATTTA------TCT-TTAA-T-TA-CAGA-TGA--TACCA-A---ACGA---AA--ACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTA-G--ATTAAGTTTACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTAGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG-AATT-TGCCAAATGTGT------A----
gi|91379 : GACCAATATTATCAAAAC-TGGTATTC---AACTCTT----AATACTTCTCCAA--A-A-TT--AGTAAC-ATATAAGATAAT--------A--A--AAAA-------TA-----------CCTATAAAGATGA-----AAAGTATATA------GAC-TGTA-T-TT-AAAA-TAA--AA--A-A---C------AA--A-G-AT--TGGCTTTA-ATTAGATTTA-GTTACTCAG--CACACAATCTTGTTATTAAAAATGGAAGGTATAAGAAT---GTGCC----CAGG--GAAAATAG-GATT-TGTACCTTTTGC------A----AT-A---TGA-AT---TGTATTG-----AAAATGAATACCATTTCCTGTTAcgaacaatgctatagagtccgaatacaattttttacttatat
gi|91380 : GATCAATATCTACAAGAC-TGGAATGG---AACTGTTCGA-AA-------CTCAGTA-C-TT--A----CTAT---ATAAAGT------TTG--A--ACAA-------TG-----------TTT-TGCATATGA-----AAAGTATCTC------GAT----G-T-GC-TAAA-TAT--CAGAA-AATTTCGT---CA--T-A--T--C-----TATGCAAGCTTCA-G--ATCGAGTTCTCATGACCTGGAAAATGAAAGAGGTTGTTACAGAAAT---ATAGA----AAGA--GA---TCG-A-------AGGTTATGT------ACATTGT-G---TGATGTAAAT--GTTGTAGAAAAT--GAGTTTCACTTTCTACTGTGTT
gi|91381 : AGTAGTAGCAAA---TGGAATAC---CTCTATTAAA-AGTATG---CCAA--A-AATT--AG--ATTATTTGAGAAAAC------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGATTATGA-----AAATTACTTG------AAT-T------------A-T------CAT-A---CTGT---GA--A-G-AT--T-----TA-ACAAGATTTT-C--ACGGAGTGCACATAACTTAGAAATTGAAACTGTGAGATACACACAT---ATACA----AAGA--GAAACTCG-TTCT-TGCAGGGTATGT------G----AT-
gi|91382 : AAGT-TGGAAAAC---ATCTCTTCAA-AAT-----------------T--AG--ACAATTTGATAAAAT------TTT--A--AACA-------TG-----------TTT-TAAATATGA-----AAATTATTTG------GAT-TATA-T-TT-CAAA-TGA--AACAA-A---ATGT---AA--A-C-AT--T-----TA------ATT--------TGAGTGCGTATTACTTAGAAATT---ACTTTGAGGTATAAAAAT---GTACA----AATG--G---ATTT-TATT-TGCAGAGAATAT------A----AT-G---GGAGAA---T--GTTG-----AATCAGAGTATCATTTTCTTatg
gi|91383 : AGAAACA------TAA--A--GACA-------AA-----------CTT-TGAATCTGA-----GCCTTACTTG------GAT-AAAA-TATT-GAAACTGAAGAATAG-A---C-------A--A-G-CT--T-----TA-ACAAAATTGA-G--ACTAAATTCACATAATTTAAGAATTGAACAGGGCAGACATTGTAGTCCAGT-GATTCCAAGG--AATGAACG-TGTT-TGTATGTTATGT------AC---AT-GC--GGAGAT------ATTG-----AAGACGAGTTTCATTTCGTTTTA
gi|91384 : ATGA-----AACTTAATTG-------AT-TTTA-T-TT-CATA-TGA--AAAGA-A---TCGC---AA--A-A-GT--T-----TC-ACACG-TTTACG--TCTTAGTGCCCATACTTTAGAAATAGAATCAGGCAGATATACT-AT----TAGT----AATGTAGAAAATCG-ACTT-TGCAAATTATGTTCCTTAA----AT---------GT---T--GTTG-----AATTAGAGTATCATTTTCTTTTATGTT
gi|91385 : ---AA--A-C-AG--T-----TA-ACAAGATTTT-G--ACTGTGTGCGTATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--AAAAATCATTTTT-TGCAGATTATGT------G----ATGG---GGAGGTGG-TG-GTTA-----AATCAGAGTATCA-TTTCTCTTATATT
gi|91386 : CATACTTTAGAAATAGAATCAGTCAGATATACAAAT---GTAGA----AAGA--GAGAAT-G-TTTTGTGTAAATTATGTTTCTTAA----AT---------GC---T--GTTG-----AACCAGAATATCATTTTCTTTTAT
gi|91387 : ATACTATAGAAATAGATTCAGGCAGATATAATAAT---GTAGA----AGGA--GAAAATCG-AGTT-TGTAAGTTATGT------------T-GCTTAAATGT---TG--TTG-----AATCAGAGTATCATTTTCTGTTATGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111 22222222222222222222 33333333333333333333333333
lowQualScore : 2 66 5 33 1 66666666 8888888 55555555 1 222 8 33 2 1 1 5 0 666 5 1 2 22 2 1 1 444 1 3 1 3 1 3 2 333 1 1 0 6 3 333 2 22 2 2 33 33 2 3 0 666666 55 22 33333333333333333333 2 4 6666666 0 6666666 2 0 2 6666 2 22 2 6 333 777 22 777 22 55555 2 1 7 4 22 1 2 4 1 1 1 1 333 1 6666 22 0 7777 3 1 1 99999999999999999999999999 4 1
lowQualScore : . .. . .. . ........ ....... ........ . ... . .. . . . . . ... . . . .. . . . ... . . . . . . . ... . . . . . ... . .. . . .. .. . . . ...... .. .. .................... . . ....... . ....... . . . .... . .. . . ... ... .. ... .. ..... . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . .... . . . .......................... . .
lowQualScore : 9 44 1 99 2 00000000 7777777 22222222 0 000 2 44 5 7 0 0 1 444 0 5 4 22 5 0 3 444 5 1 0 2 8 8 1 777 7 0 5 3 4 777 5 99 1 1 11 11 4 9 8 111111 88 99 55555555555555555555 1 6 4444444 2 7777777 1 2 1 8888 1 99 6 3 777 000 88 888 88 00000 0 7 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 222 0 7777 66 3 9999 8 6 5 44444444444444444444444444 1 0
consensus : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
Reference ( family-731 ) : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
gi|91363 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGGTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTTAGTTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATTTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTC-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AA--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGC--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91364 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTACAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---AGCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91365 : AGGTTTTTAATGAACGATGC-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCGC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAAA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTGAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTC-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACAGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91366 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCGGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA--------------------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGCACGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91367 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCAGG-AA--GTATGCAC--ATACTTTTAAAT--CGAC-TTAGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTAAAACGCAAATTATT-CTTCTAT---GTT-------AGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAGC-TTGAATAC---ATCTCTTCAA-AATGT---------------------------TTGATAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATA-----TTACTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---TCGT---A--AA-A-AA--A-----TA-ACAAGATTTC-G--GCTGCGTGTGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACGCAAAT---ATAAAAC--AAGG--GAAAAGC---ATTC-TACAGAGTATGC------A-AT-G---GG-GGT--TG-GTTGAATCGGAGTATTATTTTCTCTTAT
gi|91368 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCTGG-TAGTGTATGCAC--ATGCTTTGAAAT--CGAC-TGGGATT-TGGGGA--TATT-TGGTTGA-A
gi|91369 : TTTTATTGATCAATGTGA-ATCTAT------CACTG---GTAAATG-------TTGGGCAAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACAGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTTAGACAAAGAATACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGGAAAT------TCA--AGAAACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--ATAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TA-ACATGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTATGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGAGTATCATTTCTTACTATGTT
gi|91370 : TTTTAATGAACAATGT-A-ATTTTCAAT--ATAATG---AA---TG-------TTGGACCAA-AT--TTATTGAA--TCGATCTAAAAA--TAACCTAGGATT-TGGAGA--CATT-TGGCAAA-ATTTCAATCCAAATATAAACTATT-CATCT-T---ATTTGAACAAAGAATCAGAGACCAATACATGCAAACT-TGGA---------CTAT------ATATG---ACGA--A-A-CT--AA--AATATTATAATAAGT------TTA--A--AGTT-------GG-----------TTT-TAAATATGAAGA-----TTAGTTA------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--AAGA-G---TCGC---A--AA-T-AT--T-----TA-ACACGTTTTC-G--TCTCAGTGCCCATATGCTAGACATATAATCAGGTAGATATACTAGA---GTAGA----AAAG--AAAGAGAA--AACT-TGTGAATTATATTCCATAA-AT---------GT--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTTGTTTATGTT
gi|91371 : TTTTATTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCA----C---TGGTAAATATTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGAAT--TGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTCAGACCAAGAAAACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CTTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGTAAAT------TCAAGA--AACAGTTTGTTTG-----------TTT-T---T-TTAAGA-----TTATTTA------GAT-GTA-AT-------A-TAAA--ATAATG---CCAT---AAGAA-A-ACAGT-----TA-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---AT
gi|91372 : TTTTACTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCACTGGTAAATG-------TTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TGGGATT-TGGTGT--TCTG-TGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCAAT---GTTTAGACAAAGAATACATGATAAGTATATCCAGAGT-TGCAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTT-AGGAAAT------TAAAGA--AACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--TTAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TT-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCTCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTGTGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGA-TATCATTTCTTACTATGTT
gi|91373 : TTTTAATAAACATTGT-AACTTT-CAAA--ATAATA---AA---TG-------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--TCGTTCCTAAAT--AACC-TAAGATT-TGGAGA--CA---TGGCTTA-GTTCCAATCAAAATGCAATTTATTATATCT-T---ATTTAAACAAAGAGTTAGAGACCAATAC--------------ATGC---ATCTGTTCAG-ACTATG---CCGA--A-A-
gi|91374 : AATGAGCAATTT-AACTTT-CAGA--ATGATA---AA---TT-------ACGGTTCAA-CT--GTATGGGA--TCGTTTTTAAATTACAA---AGGATT-TGAAGA--CA---------ACATTTCAATCCAAA--TAAA--ACT-TTTCTATCTGATTTAAACATTGAATTATAGACCAATACATACAAACTGTTAAATACTGCATCTGTTCAA-ACTATG---CCGA--A-A-CT--AC--ACCATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-TAAAAATGAAGA-----TTATTTACTTATTGGT-TTTAAT-TT-CAAA-TGAC--AAGA-A---TCGA---A--AA-G-AT--T-----TG-ACACG-TTTA----AC--------CATACTTTATCAATAGAATCAGGCAGATAGACGAAT---GTAGA----AAGG--G---ATC-------------ATTATGTTCTTTAA-AT-G---G----------------TCAGAGTATCATTTTCTTTTATATT
gi|91375 : ATGAATAATCA-A-CA--ACAAA--A-ACAA---A-----G-------CTGGGCTCA-AA--GAATTTAA--ACAATATTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAACTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTGCGGGATCAATACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAATATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------TTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTT--------ATCTTT-AG-TTACAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTT-G--ATTAAATTCACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTGGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91376 : -A-CTTTTCAAATGATA--A---AT---T--------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--AAGATCTTAAAT--AACC-TAGGATT-TGGAGACATATT-TGGCTAA-ATTTCAATCCATATGTAAACTATT-CTCTCTT---ACTTAAACAAAGAATTcgaacaatacaatagagtccgaataccatttttt
gi|91376 : GA-ATT--AGTTTAAACATA-----TT-TTACTGC---TTTTTAACAAAGAATAAGGGACCAATACATGTAAACT-AGGACTGC---ATCTGTTCAG-ACCATG---CCGA--ATA-TTACAG--GCTATGTC-GAAACTACAGCATTA--C--AATA-------TGTTAAGAGTAGATTT-TAAATATGAAGATTAGTTTACTTA------GAT-TTC-AT-TT-CAAA-AGAA--AATA-A---TCGC---A--AA-G-AT--T-----TG-ACATG-TTTACG--TCTTAGTGTCCATACTTTAGAAATAGTATCAGGCAGCTATACGTAT---GTAAA----AAGA--GAAAATCA--AATG-TGTAAATCACGT------T-CC-T---GAAGTA--TT-ATTGAATCAGAGTGTCGTTTTATTTTAagtttaaacatattttactgctttttaacaaagaataagggaccaatacatgtaaactaggactgcatctgttcagaccatgccgaatattacaggctatgtcgaaactacagcattacaatatgttaagagtagattttaaatatgaagattagtttacttagatttcatttcaaaagaaaataatcgcaaagatttgacatgtttacgtcttagtgtccatactttagaaatagtatcaggcagctatacgtatgtaaaaagagaaaatcaaatgtgtaaatcacgttcctgaagtattattgaatcagagtgtcgttttatttta
gi|91377 : acttttcaaatgataaattttgggccaaatgtatggaaaagatcttaaataacctaggatttggagacatatttggctaaatttcaatccatatgtaaactattctctcttacttaaacaaa---TG-------TTGGGCCAAATA---TATGGAA--TTGTTTTTAAAT--AACC-AAGACTT-CGGAGA---ATA-TGGCAAA-ATTTCGATCCAAATGTAAAGTATT-CTATCTT---ATTTAAACAAAGAGTTTGAGATCAATATATGCAAACT-TTGACTGC---ATCTGTCCAT-AATATG---CCGA--A-A-CT--AA--A-TATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-
gi|91378 : TTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAATTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTTCGAGATCAAGACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAGTATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------CTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTTA------TCT-TTA-AT-TA-CAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTA-G--ATTAAGTTTACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTAGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91379 : GACCAATATTATCAAAAC-TGGTATTC---AACTCTT----AATACTTCTCCAA--A-A-TT--AGTAAC-ATATAAGATAAT--------A--A--AAAA-------TA-----------CCTATAAAGATGAAAA-----GTATATA------GAC-TGT-AT-TT-AAAA-TAAA--A--A-A---C------A--AA-G-AT--TGGCTTTA-ATTAGATTTA-GTTACTCAG--CACACAATCTTGTTATTAAAAATGGAAGGTATAAGAAT---GTGCC----CAGG--GAAAATAG--GATT-TGTACCTTTTGC------A-AT-A---TGA-AT--TGTATTGAAAATGAATACCATTTCCTGTTAcgaacaatgctatagagtccgaatacaattttttacttatat
gi|91380 : GATCAATATCTACAAGAC-TGGAATGG---AACTGTTCGA-AA-------CTCAGTA-C-TT--A----CTAT---ATAAAGT------TTG--A--ACAA-------TG-----------TTT-TGCATATGAAAA-----GTATCTC------GA----T-GT-GC-TAAA-TATC--AGAA-AATTTCGT------CA-T-AT--C-----TATGCAAGCTTCA-G--ATCGAGTTCTCATGACCTGGAAAATGAAAGAGGTTGTTACAGAAAT---ATAGA----AAGA--G---ATCGAAGGTTATGTACATTGTGT------G-AT-GT--AAATGT--T--GTAGAAAATGAGTTTCACTTTCTACTGTGTT
gi|91381 : AGTAGTAGCAAA---TGGAATAC---CTCTATTAAA-AGTATG---CCAA--A-AATT--AG--ATTATTTGAGAAAAC------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGATTATGAAAA-----TTACTTG------AAT-T------------A-T------CAT-A---CTGT---G--AA-G-AT--T-----TA-ACAAGATTTT-C--ACGGAGTGCACATAACTTAGAAATTGAAACTGTGAGATACACACAT---ATACA----AAGA--GAAACTCG--TTCT-TGCAGGGTATGT------G-AT-
gi|91382 : AAGT-TGGAAAAC---ATCTCTTCAA-AAT-----------------T--AG--ACAATTTGATAAAAT------TTT--A--AACA-------TG-----------TTT-TAAATATGAAAA-----TTATTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---ATGT---A--AA-C-AT--T-----TA------ATT--------TGAGTGCGTATTACTTAGAAATT---ACTTTGAGGTATAAAAAT---GTACA----AATG--G---ATTT--TATT-TGCAGAGAATAT------A-AT-G---GGAGAA--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTCTTatg
gi|91383 : AGAAACA------TAA--A--GACA-------AA-----------CTT-TGAATCTGAGCC-----TTACTTG------GAT-AAA-ATATT-GAAACTGAAGAATAG-A---C---------AA-G-CT--T-----TA-ACAAAATTGA-G--ACTAAATTCACATAATTTAAGAATTGAACAGGGCAGACATTGTAGTCCAGT-GATTCCAAGG--AATGAACG--TGTT-TGTATGTTATGT------ACAT-GC--GGAGAT-----ATTGAAGACGAGTTTCATTTCGTTTTA
gi|91384 : ATGAAAC-----TTAATTG-------AT-TTT-AT-TT-CATA-TGAA--AAGA-A---TCGC---A--AA-A-GT--T-----TC-ACACG-TTTACG--TCTTAGTGCCCATACTTTAGAAATAGAATCAGGCAGATATACT-AT----TAGT----AATGTAGAAAATCG--ACTT-TGCAAATTATGTTCCTTAA-AT---------GT--T--GTTGAATTAGAGTATCATTTTCTTTTATGTT
gi|91385 : ---A--AA-C-AG--T-----TA-ACAAGATTTT-G--ACTGTGTGCGTATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--AAAAATCAT-TTTT-TGCAGATTATGT------G-ATGG---GGAGGTGGTG-GTTAAATCAGAGTATCA-TTTCTCTTATATT
gi|91386 : CATACTTTAGAAATAGAATCAGTCAGATATACAAAT---GTAGA----AAGA--GAGAAT-G--TTTTGTGTAAATTATGTTTCTTAA-AT---------GC--T--GTTGAACCAGAATATCATTTTCTTTTAT
gi|91387 : ATACTATAGAAATAGATTCAGGCAGATATAATAAT---GTAGA----AGGA--GAAAATCG--AGTT-TGTAAGTTATGT---------T-GCTTAAATGT--TG--TTGAATCAGAGTATCATTTTCTGTTATGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111 22222222222222222222 33333333333333333333333333
lowQualScore : 2 66 5 33 1 66666666 8888888 55555555 1 222 8 33 2 1 1 5 0 666 5 1 2 22 2 1 1 444 1 3 1 3 1 3 2 333 1 1 0 6 3 333 2 22 2 2 33 33 2 3 0 666666 55 22 33333333333333333333 2 4 6666666 0 6666666 2 0 2 6666 2 22 2 6 333 777 22 777 22 55555 2 1 7 4 22 1 2 4 1 1 1 1 333 1 6666 22 0 7777 3 1 1 99999999999999999999999999 4 1
lowQualScore : . .. . .. . ........ ....... ........ . ... . .. . . . . . ... . . . .. . . . ... . . . . . . . ... . . . . . ... . .. . . .. .. . . . ...... .. .. .................... . . ....... . ....... . . . .... . .. . . ... ... .. ... .. ..... . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . .... . . . .......................... . .
lowQualScore : 9 44 1 99 2 00000000 7777777 22222222 0 000 2 44 5 7 0 0 1 444 0 5 4 22 5 0 3 444 5 1 0 2 8 8 1 777 7 0 5 3 4 777 5 99 1 1 11 11 4 9 8 111111 88 99 55555555555555555555 1 6 4444444 2 7777777 1 2 1 8888 1 99 6 3 777 000 88 888 88 00000 0 7 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 222 0 7777 66 3 9999 8 6 5 44444444444444444444444444 1 0
consensus : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
Reference ( family-731 ) : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
gi|91363 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGGTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTTAGTTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATTTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTC-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AA--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGC--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91364 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTACAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---AGCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91365 : AGGTTTTTAATGAACGATGC-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCGC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAAA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTGAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTC-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACAGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91366 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCGGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA--------------------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGCACGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91367 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCAGG-AA--GTATGCAC--ATACTTTTAAAT--CGAC-TTAGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTAAAACGCAAATTATT-CTTCTAT---GTT-------AGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAGC-TTGAATAC---ATCTCTTCAA-AATGT---------------------------TTGATAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATA-----TTACTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---TCGT---A--AA-A-AA--A-----TA-ACAAGATTTC-G--GCTGCGTGTGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACGCAAAT---ATAAAAC--AAGG--GAAAAGC---ATTC-TACAGAGTATGC------A-AT-G---GG-GGT--TG-GTTGAATCGGAGTATTATTTTCTCTTAT
gi|91368 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCTGG-TAGTGTATGCAC--ATGCTTTGAAAT--CGAC-TGGGATT-TGGGGA--TATT-TGGTTGA-A
gi|91369 : TTTTATTGATCAATGTGA-ATCTAT------CACTG---GTAAATG-------TTGGGCAAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACAGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTTAGACAAAGAATACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGGAAAT------TCA--AGAAACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--ATAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TA-ACATGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTATGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGAGTATCATTTCTTACTATGTT
gi|91370 : TTTTAATGAACAATGT-A-ATTTTCAAT--ATAATG---AA---TG-------TTGGACCAA-AT--TTATTGAA--TCGATCTAAAAA--TAACCTAGGATT-TGGAGA--CATT-TGGCAAA-ATTTCAATCCAAATATAAACTATT-CATCT-T---ATTTGAACAAAGAATCAGAGACCAATACATGCAAACT-TGGA---------CTAT------ATATG---ACGA--A-A-CT--AA--AATATTATAATAAGT------TTA--A--AGTT-------GG-----------TTT-TAAATATGAAGA-----TTAGTTA------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--AAGA-G---TCGC---A--AA-T-AT--T-----TA-ACACGTTTTC-G--TCTCAGTGCCCATATGCTAGACATATAATCAGGTAGATATACTAGA---GTAGA----AAAG--AAAGAGAA--AACT-TGTGAATTATATTCCATAA-AT---------GT--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTTGTTTATGTT
gi|91371 : TTTTATTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCA----C---TGGTAAATATTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGAAT--TGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTCAGACCAAGAAAACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CTTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGTAAAT------TCAAGA--AACAGTTTGTTTG-----------TTT-T---T-TTAAGA-----TTATTTA------GAT-GTA-AT-------A-TAAA--ATAATG---CCAT---AAGAA-A-ACAGT-----TA-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---AT
gi|91372 : TTTTACTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCACTGGTAAATG-------TTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TGGGATT-TGGTGT--TCTG-TGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCAAT---GTTTAGACAAAGAATACATGATAAGTATATCCAGAGT-TGCAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTT-AGGAAAT------TAAAGA--AACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--TTAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TT-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCTCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTGTGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGA-TATCATTTCTTACTATGTT
gi|91373 : TTTTAATAAACATTGT-AACTTT-CAAA--ATAATA---AA---TG-------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--TCGTTCCTAAAT--AACC-TAAGATT-TGGAGA--CA---TGGCTTA-GTTCCAATCAAAATGCAATTTATTATATCT-T---ATTTAAACAAAGAGTTAGAGACCAATAC--------------ATGC---ATCTGTTCAG-ACTATG---CCGA--A-A-
gi|91374 : AATGAGCAATTT-AACTTT-CAGA--ATGATA---AA---TT-------ACGGTTCAA-CT--GTATGGGA--TCGTTTTTAAATTACAA---AGGATT-TGAAGA--CA---------ACATTTCAATCCAAA--TAAA--ACT-TTTCTATCTGATTTAAACATTGAATTATAGACCAATACATACAAACTGTTAAATACTGCATCTGTTCAA-ACTATG---CCGA--A-A-CT--AC--ACCATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-TAAAAATGAAGA-----TTATTTACTTATTGGT-TTTAAT-TT-CAAA-TGAC--AAGA-A---TCGA---A--AA-G-AT--T-----TG-ACACG-TTTA----AC--------CATACTTTATCAATAGAATCAGGCAGATAGACGAAT---GTAGA----AAGG--G---ATC-------------ATTATGTTCTTTAA-AT-G---G----------------TCAGAGTATCATTTTCTTTTATATT
gi|91375 : ATGAATAATCA-A-CA--ACAAA--A-ACAA---A-----G-------CTGGGCTCA-AA--GAATTTAA--ACAATATTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAACTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTGCGGGATCAATACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAATATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------TTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTT--------ATCTTT-AG-TTACAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTT-G--ATTAAATTCACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTGGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91376 : -A-CTTTTCAAATGATA--A---AT---T--------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--AAGATCTTAAAT--AACC-TAGGATT-TGGAGACATATT-TGGCTAA-ATTTCAATCCATATGTAAACTATT-CTCTCTT---ACTTAAACAAAGAATTcgaacaatacaatagagtccgaataccatttttt
gi|91376 : GA-ATT--AGTTTAAACATA-----TT-TTACTGC---TTTTTAACAAAGAATAAGGGACCAATACATGTAAACT-AGGACTGC---ATCTGTTCAG-ACCATG---CCGA--ATA-TTACAG--GCTATGTC-GAAACTACAGCATTA--C--AATA-------TGTTAAGAGTAGATTT-TAAATATGAAGATTAGTTTACTTA------GAT-TTC-AT-TT-CAAA-AGAA--AATA-A---TCGC---A--AA-G-AT--T-----TG-ACATG-TTTACG--TCTTAGTGTCCATACTTTAGAAATAGTATCAGGCAGCTATACGTAT---GTAAA----AAGA--GAAAATCA--AATG-TGTAAATCACGT------T-CC-T---GAAGTA--TT-ATTGAATCAGAGTGTCGTTTTATTTTAagtttaaacatattttactgctttttaacaaagaataagggaccaatacatgtaaactaggactgcatctgttcagaccatgccgaatattacaggctatgtcgaaactacagcattacaatatgttaagagtagattttaaatatgaagattagtttacttagatttcatttcaaaagaaaataatcgcaaagatttgacatgtttacgtcttagtgtccatactttagaaatagtatcaggcagctatacgtatgtaaaaagagaaaatcaaatgtgtaaatcacgttcctgaagtattattgaatcagagtgtcgttttatttta
gi|91377 : acttttcaaatgataaattttgggccaaatgtatggaaaagatcttaaataacctaggatttggagacatatttggctaaatttcaatccatatgtaaactattctctcttacttaaacaaa---TG-------TTGGGCCAAATA---TATGGAA--TTGTTTTTAAAT--AACC-AAGACTT-CGGAGA---ATA-TGGCAAA-ATTTCGATCCAAATGTAAAGTATT-CTATCTT---ATTTAAACAAAGAGTTTGAGATCAATATATGCAAACT-TTGACTGC---ATCTGTCCAT-AATATG---CCGA--A-A-CT--AA--A-TATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-
gi|91378 : TTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAATTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTTCGAGATCAAGACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAGTATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------CTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTTA------TCT-TTA-AT-TA-CAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTA-G--ATTAAGTTTACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTAGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91379 : GACCAATATTATCAAAAC-TGGTATTC---AACTCTT----AATACTTCTCCAA--A-A-TT--AGTAAC-ATATAAGATAAT--------A--A--AAAA-------TA-----------CCTATAAAGATGAAAA-----GTATATA------GAC-TGT-AT-TT-AAAA-TAAA--A--A-A---C------A--AA-G-AT--TGGCTTTA-ATTAGATTTA-GTTACTCAG--CACACAATCTTGTTATTAAAAATGGAAGGTATAAGAAT---GTGCC----CAGG--GAAAATAG--GATT-TGTACCTTTTGC------A-AT-A---TGA-AT--TGTATTGAAAATGAATACCATTTCCTGTTAcgaacaatgctatagagtccgaatacaattttttacttatat
gi|91380 : GATCAATATCTACAAGAC-TGGAATGG---AACTGTTCGA-AA-------CTCAGTA-C-TT--A----CTAT---ATAAAGT------TTG--A--ACAA-------TG-----------TTT-TGCATATGAAAA-----GTATCTC------GA----T-GT-GC-TAAA-TATC--AGAA-AATTTCGT------CA-T-AT--C-----TATGCAAGCTTCA-G--ATCGAGTTCTCATGACCTGGAAAATGAAAGAGGTTGTTACAGAAAT---ATAGA----AAGA--G---ATCGAAGGTTATGTACATTGTGT------G-AT-GT--AAATGT--T--GTAGAAAATGAGTTTCACTTTCTACTGTGTT
gi|91381 : AGTAGTAGCAAA---TGGAATAC---CTCTATTAAA-AGTATG---CCAA--A-AATT--AG--ATTATTTGAGAAAAC------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGATTATGAAAA-----TTACTTG------AAT-T------------A-T------CAT-A---CTGT---G--AA-G-AT--T-----TA-ACAAGATTTT-C--ACGGAGTGCACATAACTTAGAAATTGAAACTGTGAGATACACACAT---ATACA----AAGA--GAAACTCG--TTCT-TGCAGGGTATGT------G-AT-
gi|91382 : AAGT-TGGAAAAC---ATCTCTTCAA-AAT-----------------T--AG--ACAATTTGATAAAAT------TTT--A--AACA-------TG-----------TTT-TAAATATGAAAA-----TTATTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---ATGT---A--AA-C-AT--T-----TA------ATT--------TGAGTGCGTATTACTTAGAAATT---ACTTTGAGGTATAAAAAT---GTACA----AATG--G---ATTT--TATT-TGCAGAGAATAT------A-AT-G---GGAGAA--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTCTTatg
gi|91383 : AGAAACA------TAA--A--GACA-------AA-----------CTT-TGAATCTGAGCC-----TTACTTG------GAT-AAA-ATATT-GAAACTGAAGAATAG-A---C---------AA-G-CT--T-----TA-ACAAAATTGA-G--ACTAAATTCACATAATTTAAGAATTGAACAGGGCAGACATTGTAGTCCAGT-GATTCCAAGG--AATGAACG--TGTT-TGTATGTTATGT------ACAT-GC--GGAGAT-----ATTGAAGACGAGTTTCATTTCGTTTTA
gi|91384 : ATGAAAC-----TTAATTG-------AT-TTT-AT-TT-CATA-TGAA--AAGA-A---TCGC---A--AA-A-GT--T-----TC-ACACG-TTTACG--TCTTAGTGCCCATACTTTAGAAATAGAATCAGGCAGATATACT-AT----TAGT----AATGTAGAAAATCG--ACTT-TGCAAATTATGTTCCTTAA-AT---------GT--T--GTTGAATTAGAGTATCATTTTCTTTTATGTT
gi|91385 : ---A--AA-C-AG--T-----TA-ACAAGATTTT-G--ACTGTGTGCGTATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--AAAAATCAT-TTTT-TGCAGATTATGT------G-ATGG---GGAGGTGGTG-GTTAAATCAGAGTATCA-TTTCTCTTATATT
gi|91386 : CATACTTTAGAAATAGAATCAGTCAGATATACAAAT---GTAGA----AAGA--GAGAAT-G--TTTTGTGTAAATTATGTTTCTTAA-AT---------GC--T--GTTGAACCAGAATATCATTTTCTTTTAT
gi|91387 : ATACTATAGAAATAGATTCAGGCAGATATAATAAT---GTAGA----AGGA--GAAAATCG--AGTT-TGTAAGTTATGT---------T-GCTTAAATGT--TG--TTGAATCAGAGTATCATTTTCTGTTATGTT
blockSeqs : G AC A TG C CTGGTAAA GTAAATA TGGTAGT C GGA C TA C G T A CAT A G C TT A C A CTG A T T T A A G TGC G C G A TCT C GT T A AC TA C A ACAGCA AG GA TGTTAAGAGTAGA A G GATTAGT ACTTATT C A TTA C GA C T ATT TAG AG AC AG GGCTT T A A C TT G G G A T G A CCA C TTCC TA AAGG A G G GATGGGGAGGTGGTG G A
blockSeqs : . AC A . C GTAAA . CAAATA C GGA C . . G T A T A G . TT . C A . A T T T A A . . T C G A . C . . . . . C A . AG . GTTTGTTTG . G TT G . . ATT . . C T . TAG . AC . . . A A C . G G G A A G A . C AC . TTT G G G TGCTTAAATGTTG G A
blockSeqs : . C A . C GC . TGGTA C GGA C . . G T . T . G . TT . C A . A T T T A A . . T C G A . C . . . . . C A . . . GTTTA . G TT G . . TC . . C T . . . CA . . . A A . . G A G A T G A . C . . TT . G G AATGGGAGGTTG G A
blockSeqs : . C A . C GC . TGGTA C C C . . T T . T . G . TA . T A . T T T T A G . . T C . G . T . . . . . A G . . . GTTTA . G TT G . . TC . . C . . . . CA . . . A A . . G G G A T G A . A . . TT . G G AATGGGGGGTTG G C
blockSeqs : . C A . C GC . GGGTA C C C . . G A . T . G . AC . A A . T C T A C G . . G A . A . G . . . . . A T . . . TGA . A TA G . . TC . . T . . . . A . . . T C . . A T C T T A T . G . . TT . A T AATGGGGGGTTG T A
blockSeqs : . C A . C GC . AGGAA A C A . . A A . T . A . CC . A A . C A A A G C . . G A . A . T . . . . . A T . . . TGA . A GA A . . TT . . A . . . . A . . . C T . . C G C T A T T . G . . AT . A T TCCATGAAAGTT A T
blockSeqs : . C T . A GC . AAGTA G C T . . A A . C . A . AC . A A . T C T A C G . . G A . A . T . . . . . A T . . . TG . A GA A . . TT . . T . . . . A . . . T C . . A T C T T A T . G . . GC . A T TCCATAAATGTT T A
blockSeqs : . A A . T AA . CAAAT A C T . . A A . T . A . AC . A A . T C T A C G . . T A . A . G . . . . . C C . . . TG . A GA A . . TT . . T . . . . A . . . T C . . A T T T T A T . G . . AA . A T TCCATGAAAGTT A T
blockSeqs : . A T . T AA . GAGTA A A A . . G A . C . A . CA . A A . T A A A A C . . T G . A . G . . . . . T C . . . TG . A GA A . . TT . . A . . . . T . . . C T . . A T A T A C G . G . . GC . A A TCCTGAAGTATT A T
blockSeqs : . C . . A AA . GAGTA G A A . . A A . C . T . CC . T T . T A A A C T . . A G . A . A . . . . . C C . . . GG . A GA A . . TA . . C . . . . A . . . T T . . T G C T C A T . A . . AA . A T AATATGAATTGT T G
blockSeqs : . C . . A AT . CAAAT G A T . . A A . T . T . AG . G G . T C G A G C . . T A . A . G . . . . . T C . . . GA . G GA A . . TT . . A . . . . G . . . T A . . A T A T A C G . G . . AA . C A GATGTAAATGTT T A
blockSeqs : . . . . C C . CAACT T A . . . T G . T . A . CC . T T . T A G A G C . . T G . A . G . . . . . C C . . . GA . G GA A . . GC . . C . . . . G . . . T C . . C T A T C A T . C . . AA . C T ACATGCGGAGAT A T
blockSeqs : . . . . . A . TCAAA G A . . . A A . . . G . TT . T A . T T A A C T . . A G . A . A . . . . . C A . . . TA . A AA C . . TT . . G . . . . G . . . A A . . G G T A T A G . G . . GA . G T TCCTTAAATGTT C T
blockSeqs : . CAAAT G A . . . A C . . . A . CC . T . . T C A T T A . . A A . . . A . . . . . T G . . . TG . G AA G . . TT . . C . . . . T . . . A A . . G G A A A T A . C . . TT . G G TTCTTAAATGCT A T
blockSeqs : . . T G . . . T . AG . G . . . C A A . . A C . . . C . . . . . C G . . . TG . . AA G . . . . . C . . . . G . . . A A . . G T G A T G A . C . . TA . T G AATGGGGGTTG A C
blockSeqs : . . T G G . . T G . . . A . . . . . . . . . . TG . . AA G . . . . . T . . . . C . . . A A . . A G A A T G A . G . . TG . A T TCTTTAAATGG A T
blockSeqs : . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . AA . . CC G . . . . . A . . . . G . . . C . . . T G C C G C T . G . . AC . G T AATGGGAGAAT A G
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . A . . . A . . . G . G T A C T . C . . TT . A T
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . A T G A . G . . AG . A T
blockSeqs : T A C A . G . . . . . T
blockSeqs : T A C T .
blockSeqCons :
originalCons : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
finalCons : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111 22222222222222222222 33333333333333333333333333
lowQualScore : 2 66 5 33 1 66666666 8888888 55555555 1 222 8 33 2 1 1 5 0 666 5 1 2 22 2 1 1 444 1 3 1 3 1 3 2 333 1 1 0 6 3 333 2 22 2 2 33 33 2 3 0 666666 55 22 33333333333333333333 2 4 6666666 0 6666666 2 0 2 6666 2 22 2 6 333 777 22 777 22 55555 2 1 7 4 22 1 2 4 1 1 1 1 333 1 6666 22 0 7777 3 1 1 99999999999999999999999999 4 1
lowQualScore : . .. . .. . ........ ....... ........ . ... . .. . . . . . ... . . . .. . . . ... . . . . . . . ... . . . . . ... . .. . . .. .. . . . ...... .. .. .................... . . ....... . ....... . . . .... . .. . . ... ... .. ... .. ..... . . . . .. . . . . . . . ... . .... .. . .... . . . .......................... . .
lowQualScore : 9 44 1 99 2 00000000 7777777 22222222 0 000 2 44 5 7 0 0 1 444 0 5 4 22 5 0 3 444 5 1 0 2 8 8 1 777 7 0 5 3 4 777 5 99 1 1 11 11 4 9 8 111111 88 99 55555555555555555555 1 6 4444444 2 7777777 1 2 1 8888 1 99 6 3 777 000 88 888 88 00000 0 7 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 222 0 7777 66 3 9999 8 6 5 44444444444444444444444444 1 0
consensus : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
Reference ( family-731 ) : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCCGG-TA--GTATGNAN--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGNTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATNCAAACGTAAATTATT-TNCCCAT---GTTTAAACAAAGAATTCGNGATCAGTATNTNCAAANT-TGGAATAC---ANCTNTTCAA-AATATG---CCNA--A-A-TT--AG--ACTATTTNAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAAGA-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACANGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAANCNGGNAGATATACNAAT---GTAGA----AAGG--GAAAATCG--NNTT-TGTAGATTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTNTTATGTT
gi|91363 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGGTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTTAGTTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATTTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTC-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AA--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGC--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91364 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTACAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---AGCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGAGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91365 : AGGTTTTTAATGAACGATGC-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCTGG-TA--GTATGCGC--ATGCTTTTAAAT--CGAC-TGGGTTT-TGGAAA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCTCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTGAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTC-G--ACTGAGTGCGCATAATTTAGAAATTGAAACAGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91366 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCA---GC---TG-------TTGGGCGGG-TA--GTATGCAC--ATGCTTTTAAAT--CGGC-TGGGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTTAAACGCAAATTATT-TCCCCAT---GTTAAAACAAAGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAAT-TGGAATAC---ATCTCTTCAA-AATATG---CCCA--A-A-TT--AG--ACTATTTAAGAAAAT------TTA--A--AACA--------------------TCT-TGAATATGAATT-----TTACTTG------GAT-TTT-AT-TC-CAAA-TGAA--ACAA-A---CCGT---A--AA-A-AT--T-----TA-ACAAGATTTA-G--ACTGAGCACGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--GAAAATCG--TTTT-TGTAGAGTATGT------A-AT-G---GGGGGT--TG-GTTGAATCGGAGTATCATTTTCTATTATGTT
gi|91367 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCAGG-AA--GTATGCAC--ATACTTTTAAAT--CGAC-TTAGTTT-TGGAGA--TATT-TGGTTGA-ATTTCAATTAAAACGCAAATTATT-CTTCTAT---GTT-------AGGATTTGTGATCAGTATTTACAAAGC-TTGAATAC---ATCTCTTCAA-AATGT---------------------------TTGATAAAAT------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGAATATGAATA-----TTACTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---TCGT---A--AA-A-AA--A-----TA-ACAAGATTTC-G--GCTGCGTGTGCATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACGCAAAT---ATAAAAC--AAGG--GAAAAGC---ATTC-TACAGAGTATGC------A-AT-G---GG-GGT--TG-GTTGAATCGGAGTATTATTTTCTCTTAT
gi|91368 : AAGTTTTTAATGAACAATGT-A-CTTTACAAA--ATACCT---GC---TG-------TTGGGCTGG-TAGTGTATGCAC--ATGCTTTGAAAT--CGAC-TGGGATT-TGGGGA--TATT-TGGTTGA-A
gi|91369 : TTTTATTGATCAATGTGA-ATCTAT------CACTG---GTAAATG-------TTGGGCAAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACAGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTTAGACAAAGAATACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGGAAAT------TCA--AGAAACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--ATAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TA-ACATGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTATGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGAGTATCATTTCTTACTATGTT
gi|91370 : TTTTAATGAACAATGT-A-ATTTTCAAT--ATAATG---AA---TG-------TTGGACCAA-AT--TTATTGAA--TCGATCTAAAAA--TAACCTAGGATT-TGGAGA--CATT-TGGCAAA-ATTTCAATCCAAATATAAACTATT-CATCT-T---ATTTGAACAAAGAATCAGAGACCAATACATGCAAACT-TGGA---------CTAT------ATATG---ACGA--A-A-CT--AA--AATATTATAATAAGT------TTA--A--AGTT-------GG-----------TTT-TAAATATGAAGA-----TTAGTTA------GAT-TTT-AT-TT-CAAA-TGAA--AAGA-G---TCGC---A--AA-T-AT--T-----TA-ACACGTTTTC-G--TCTCAGTGCCCATATGCTAGACATATAATCAGGTAGATATACTAGA---GTAGA----AAAG--AAAGAGAA--AACT-TGTGAATTATATTCCATAA-AT---------GT--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTTGTTTATGTT
gi|91371 : TTTTATTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCA----C---TGGTAAATATTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGAAT--TGAC-TAGGATT-TGGTGA---ACTATGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCCAT---GTTCAGACCAAGAAAACGTGATCAGTATATCCAGAGT-TGGAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CTTA--A-A-TT--GG--AATATTTTAGTAAAT------TCAAGA--AACAGTTTGTTTG-----------TTT-T---T-TTAAGA-----TTATTTA------GAT-GTA-AT-------A-TAAA--ATAATG---CCAT---AAGAA-A-ACAGT-----TA-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCCCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---AT
gi|91372 : TTTTACTGATCAATGT-G-------AAA--CTATCACTGGTAAATG-------TTGGGCGAG-TA--ATGTGAAGGAATA--TTTGGAT--AGAC-TGGGATT-TGGTGT--TCTG-TGGTTAA-ACTTTAATACTGACGTAAATTATC-TACCAAT---GTTTAGACAAAGAATACATGATAAGTATATCCAGAGT-TGCAATAC---TGGCATTGAAGAAT-TG---CCTA--A-A-TT--GG--AATATTT-AGGAAAT------TAAAGA--AACAGTT----TA-----------TTT-T-----TGAAGA-----TTATTTA------GAT-GTT-AT-----AAA---AA--TTAATG---CCATTAGA--AA-ACAG--T-----TT-ACGTGCCTTA-G--ATTAAGCTCTCACGATTTAGAAATTGAGTTTGGAAGATTTAATAAT---ATAGA----TAGA--GAAAATAG--GCTA-TGTAAATTGTGTTC----C-AT-----GAAAGT--T--GTTGAAACTGA-TATCATTTCTTACTATGTT
gi|91373 : TTTTAATAAACATTGT-AACTTT-CAAA--ATAATA---AA---TG-------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--TCGTTCCTAAAT--AACC-TAAGATT-TGGAGA--CA---TGGCTTA-GTTCCAATCAAAATGCAATTTATTATATCT-T---ATTTAAACAAAGAGTTAGAGACCAATAC--------------ATGC---ATCTGTTCAG-ACTATG---CCGA--A-A-
gi|91374 : AATGAGCAATTT-AACTTT-CAGA--ATGATA---AA---TT-------ACGGTTCAA-CT--GTATGGGA--TCGTTTTTAAATTACAA---AGGATT-TGAAGA--CA---------ACATTTCAATCCAAA--TAAA--ACT-TTTCTATCTGATTTAAACATTGAATTATAGACCAATACATACAAACTGTTAAATACTGCATCTGTTCAA-ACTATG---CCGA--A-A-CT--AC--ACCATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-TAAAAATGAAGA-----TTATTTACTTATTGGT-TTTAAT-TT-CAAA-TGAC--AAGA-A---TCGA---A--AA-G-AT--T-----TG-ACACG-TTTA----AC--------CATACTTTATCAATAGAATCAGGCAGATAGACGAAT---GTAGA----AAGG--G---ATC-------------ATTATGTTCTTTAA-AT-G---G----------------TCAGAGTATCATTTTCTTTTATATT
gi|91375 : ATGAATAATCA-A-CA--ACAAA--A-ACAA---A-----G-------CTGGGCTCA-AA--GAATTTAA--ACAATATTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAACTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTGCGGGATCAATACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAATATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------TTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTT--------ATCTTT-AG-TTACAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTT-G--ATTAAATTCACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTGGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91376 : -A-CTTTTCAAATGATA--A---AT---T--------TTGGGCCAA-AT--GTATGGAA--AAGATCTTAAAT--AACC-TAGGATT-TGGAGACATATT-TGGCTAA-ATTTCAATCCATATGTAAACTATT-CTCTCTT---ACTTAAACAAAGAATTcgaacaatacaatagagtccgaataccatttttt
gi|91376 : GA-ATT--AGTTTAAACATA-----TT-TTACTGC---TTTTTAACAAAGAATAAGGGACCAATACATGTAAACT-AGGACTGC---ATCTGTTCAG-ACCATG---CCGA--ATA-TTACAG--GCTATGTC-GAAACTACAGCATTA--C--AATA-------TGTTAAGAGTAGATTT-TAAATATGAAGATTAGTTTACTTA------GAT-TTC-AT-TT-CAAA-AGAA--AATA-A---TCGC---A--AA-G-AT--T-----TG-ACATG-TTTACG--TCTTAGTGTCCATACTTTAGAAATAGTATCAGGCAGCTATACGTAT---GTAAA----AAGA--GAAAATCA--AATG-TGTAAATCACGT------T-CC-T---GAAGTA--TT-ATTGAATCAGAGTGTCGTTTTATTTTAagtttaaacatattttactgctttttaacaaagaataagggaccaatacatgtaaactaggactgcatctgttcagaccatgccgaatattacaggctatgtcgaaactacagcattacaatatgttaagagtagattttaaatatgaagattagtttacttagatttcatttcaaaagaaaataatcgcaaagatttgacatgtttacgtcttagtgtccatactttagaaatagtatcaggcagctatacgtatgtaaaaagagaaaatcaaatgtgtaaatcacgttcctgaagtattattgaatcagagtgtcgttttatttta
gi|91377 : acttttcaaatgataaattttgggccaaatgtatggaaaagatcttaaataacctaggatttggagacatatttggctaaatttcaatccatatgtaaactattctctcttacttaaacaaa---TG-------TTGGGCCAAATA---TATGGAA--TTGTTTTTAAAT--AACC-AAGACTT-CGGAGA---ATA-TGGCAAA-ATTTCGATCCAAATGTAAAGTATT-CTATCTT---ATTTAAACAAAGAGTTTGAGATCAATATATGCAAACT-TTGACTGC---ATCTGTCCAT-AATATG---CCGA--A-A-CT--AA--A-TATTACAATAAGT------TTA--A--AGTA-------GA-----------TTT-
gi|91378 : TTAGA---CGAT-TTGGGTTATAGTTA--TATT-TGGGATA-ATTTTAATAGAAATGTCAATTATT-TGCCCAT---TATTAAACAACGACTTCGAGATCAAGACATCCAATTT-TGGAGAGG---AAGTATTCAT-GCAATG---CCAA--A-A-CT--TA--ATTATTACTGTAAAT------CTA--A--AAC--------TGA----------TTT-TATATATGAGGA-----ATATTTA------TCT-TTA-AT-TA-CAGA-TGAT--ACCA-A---ACGA---A--AACA-AT--T-----GA-GC-TGTTTTA-G--ATTAAGTTTACATAATCTTGCGATTGAATCCGGAAGATATACTAGT---GTCGA----AAGA--CAGAATAG--AATT-TGCCAAATGTGT------A-
gi|91379 : GACCAATATTATCAAAAC-TGGTATTC---AACTCTT----AATACTTCTCCAA--A-A-TT--AGTAAC-ATATAAGATAAT--------A--A--AAAA-------TA-----------CCTATAAAGATGAAAA-----GTATATA------GAC-TGT-AT-TT-AAAA-TAAA--A--A-A---C------A--AA-G-AT--TGGCTTTA-ATTAGATTTA-GTTACTCAG--CACACAATCTTGTTATTAAAAATGGAAGGTATAAGAAT---GTGCC----CAGG--GAAAATAG--GATT-TGTACCTTTTGC------A-AT-A---TGA-AT--TGTATTGAAAATGAATACCATTTCCTGTTAcgaacaatgctatagagtccgaatacaattttttacttatat
gi|91380 : GATCAATATCTACAAGAC-TGGAATGG---AACTGTTCGA-AA-------CTCAGTA-C-TT--A----CTAT---ATAAAGT------TTG--A--ACAA-------TG-----------TTT-TGCATATGAAAA-----GTATCTC------GA----T-GT-GC-TAAA-TATC--AGAA-AATTTCGT------CA-T-AT--C-----TATGCAAGCTTCA-G--ATCGAGTTCTCATGACCTGGAAAATGAAAGAGGTTGTTACAGAAAT---ATAGA----AAGA--G---ATCGAAGGTTATGTACATTGTGT------G-AT-GT--AAATGT--T--GTAGAAAATGAGTTTCACTTTCTACTGTGTT
gi|91381 : AGTAGTAGCAAA---TGGAATAC---CTCTATTAAA-AGTATG---CCAA--A-AATT--AG--ATTATTTGAGAAAAC------TTA--A--AACA-------TG-----------TTT-TGATTATGAAAA-----TTACTTG------AAT-T------------A-T------CAT-A---CTGT---G--AA-G-AT--T-----TA-ACAAGATTTT-C--ACGGAGTGCACATAACTTAGAAATTGAAACTGTGAGATACACACAT---ATACA----AAGA--GAAACTCG--TTCT-TGCAGGGTATGT------G-AT-
gi|91382 : AAGT-TGGAAAAC---ATCTCTTCAA-AAT-----------------T--AG--ACAATTTGATAAAAT------TTT--A--AACA-------TG-----------TTT-TAAATATGAAAA-----TTATTTG------GAT-TAT-AT-TT-CAAA-TGAA--ACAA-A---ATGT---A--AA-C-AT--T-----TA------ATT--------TGAGTGCGTATTACTTAGAAATT---ACTTTGAGGTATAAAAAT---GTACA----AATG--G---ATTT--TATT-TGCAGAGAATAT------A-AT-G---GGAGAA--T--GTTGAATCAGAGTATCATTTTCTTatg
gi|91383 : AGAAACA------TAA--A--GACA-------AA-----------CTT-TGAATCTGAGCC-----TTACTTG------GAT-AAA-ATATT-GAAACTGAAGAATAG-A---C---------AA-G-CT--T-----TA-ACAAAATTGA-G--ACTAAATTCACATAATTTAAGAATTGAACAGGGCAGACATTGTAGTCCAGT-GATTCCAAGG--AATGAACG--TGTT-TGTATGTTATGT------ACAT-GC--GGAGAT-----ATTGAAGACGAGTTTCATTTCGTTTTA
gi|91384 : ATGAAAC-----TTAATTG-------AT-TTT-AT-TT-CATA-TGAA--AAGA-A---TCGC---A--AA-A-GT--T-----TC-ACACG-TTTACG--TCTTAGTGCCCATACTTTAGAAATAGAATCAGGCAGATATACT-AT----TAGT----AATGTAGAAAATCG--ACTT-TGCAAATTATGTTCCTTAA-AT---------GT--T--GTTGAATTAGAGTATCATTTTCTTTTATGTT
gi|91385 : ---A--AA-C-AG--T-----TA-ACAAGATTTT-G--ACTGTGTGCGTATAATTTAGAAATTGAAACTGGGAGATACACAAAT---GTACA----AAGG--AAAAATCAT-TTTT-TGCAGATTATGT------G-ATGG---GGAGGTGGTG-GTTAAATCAGAGTATCA-TTTCTCTTATATT
gi|91386 : CATACTTTAGAAATAGAATCAGTCAGATATACAAAT---GTAGA----AAGA--GAGAAT-G--TTTTGTGTAAATTATGTTTCTTAA-AT---------GC--T--GTTGAACCAGAATATCATTTTCTTTTAT
gi|91387 : ATACTATAGAAATAGATTCAGGCAGATATAATAAT---GTAGA----AGGA--GAAAATCG--AGTT-TGTAAGTTATGT---------T-GCTTAAATGT--TG--TTGAATCAGAGTATCATTTTCTGTTATGTT