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lowQualScore                  :                  0 0 8                 777            666               9                        4    8        55    1     5       99  0       4                   3     4     4                 0     9   4                                     3 0   22  6666  111111      9999            1  00000000000  66666   2       0                 6           7    0   000              0                       2        5  000   44 8888  4  2 8888888   44     66666666666  1 1111  77       88               8    1   77   2  66            7           0     1 1 000      7   66     3333    33  9999999    3   333333  7777       999   9      000        44444444444444444444444    2   0000          222      
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Reference ( gi|89554 )        : ATCATTAGCTTTCTTTG-TGGAGCAATATCAGAGAATAT---TAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTGATATGTTTAATTTCTCACAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATATGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATT-TG-----------AC-----AACACAATTTT-TAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTCTAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAATATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTTT-----CCTTA--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATACA-TACCAAGGAA-G--ACAT--TA----AGCATGGATGCC---A-AA----TTCTACT--CAAATTTGCCA---TCAAAAGT---------T-------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89555                      : ATCATTAGCTTTCTTTG-TTGAGCAATATCAGAGAATAT---TAGCTATTTCTATGTACCGCTAATAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTAATTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATT-TG-----------AC-----AACACAATTTT-TAACATATTTTTTTCATTTTCCTTGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAATATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTTT-----CCTTA--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATACA-TACCAAGGAA-G--ACAT--TA----AGCATGGATGCC---A-AA----TTCTACT--CAAATTTGCCA---TCAAAATT---------T-------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89556                      : ATCATTAGTTTTCTTTG-TTGAGCAATATCAGAGAATAG---TAACTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATG--GCTATTTCCTTCTATTTTAATATGTTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCGCTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATT-ATATATTTTACCGAC--TT----TT------CGACCT----TTGACCTCAATT-TG-----------AC-----AACACAATTTT-TAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ATA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAATATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTGT-----TTTTA--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATACA-TACCAAGGAA-G--ACAT--CA----AGCATGGATGCC---A-AA----TTCTACT--CAAATTTGCCA---TCAAAAGT---------T-------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CT
gi|89557                      : ATCATTATCTTTCTTTG-TTGGGCAATATTAAAGATTAT---TATCTATTTCTTA--ATCGCTATTAATGTTGTCCGACCGCTGTTGTCACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATAAACTTAATTCATCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATA-AAAAAATAATTGCCTGTTTTTATGTACTG--AGTCTTGCATTTCACAAAAAATTCAAAATTCATCAATTTTGCACACATTTGACCTT------TGACCTCAATTTGACCTCAGTT-TG-----------AC-----AACACAATGTT-TAACATATTTTATTCATATTCCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAGTTATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTGT-----TCTAC--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ACAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGTGATTTCATGAGTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATAAA-TACCAAGGAA-G--ACAT--TA----AGCATGGATGCC---A-AA----TTCTACT--CAAATTTGCCA---TCAAAAGT---------T-------------TTTTCCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89558                      : ACCATTAGCTTTTTTTAATGG-GCAATATTAGAGAATAT---TAACTATTTCTAT--AC-GCTATTAAGTTTGTCCGACCTCTGTTGTGACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATATGCTTAATTTACCATCAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTTTTATGTATTGGAAT-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAATTTCATCAATTTTGCACAC--TT----TTGACCTTTGACCTCAGTTTGACCTCAGTT-TG-----------AC-----AACACAATTTT--AACATAATTTATTCATATTTCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAATAATTATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTGT-----TCTTT--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGTGATTTCATTAGTGGCATCCACCCTAACAGGTTTG-TATATA-T-------------ACAT--TA----AGCATGGATGCC-----AA----TTCTACTAAAAAATTT-CCA---TCAAAAGT---------T-------------TTTTCCCTG-T-----GATGGC---CTATTA
gi|89559                      :  TCATTAGCTTTCTTTG-TTGAGCAATATCAGAGAATAT---TAGCTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTCTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCT-TTTTAATATGCTTAATTT-----AAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAGA-TACTTGCCTGGTCTTATGTACTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGGAATTCAAAATTCATAAATTTTACTGAC--TT----TT------CGACCT----T-GACCTTAATT-TG-----------AC-----AACACAATTTT-TAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAATATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTAT-----TCTTA--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGA-GGCGATTTC---ATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATACA-TACCAAGGAA-G--AAAT--TA----AGCATGGATGCC---A-AA----TTCAACT--CAAATTTGCCA---TTAAAAGT---------T-------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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gi|89563                      :                                                                                                                             TTGATTTC-CTTAAAGTTAAGATTATGTAAGAAATACATCTAATC-TGAAA-AAGTTCCCTGTTTTTATGCAATGTAAG-CTTGTATTTCACAGAACATTCATAATTAACAAGTTTG---CAT--TC----TT------TGACCA----TTCACCTCAATT-TG-----------AC-----A-----------TAA-----TTTATTCATATTCAAAGCAATCTTTT-ATATGAACAAGCAGCTTTCTATAGTTTTTAGTTCAATTAATAGATAATTATTT-TC---ATA--A-A--ACAG-------------------------------TA-T-CC-ATTACTTCATCCAGCTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATT-TAATTGCAACTTTATGATTGACATCCACCCTCACAGACTTG-TGTACA-TGCCAA-GAA-GCCACGTTATA----AGCATGGTTGCC---A-AA----TTCTATT--CACATTTGCCG---TCAAAAG------------------------TTTTCCCTG-TGGTTGGATAGC---TTATTA
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gi|89573                      :                                                                                                                                                                                                                                       tgtTAATTTTTGCAC-C--TG----AT------TGACCT----TTGACCTCAACCGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTgtggcatccatcatcacatgatttatacatcttaaggaatgttattatggtattgaaacaattctactgaaaattgccatcaaaagttaaaataaaggacattttgctttttggatggcctacta
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gi|89575                      :                                                                                                                                                                                                                                     aataatttatatacaatactgttttgttT------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcaagagtggcatccatcatcacacgatgctatacatatagggaaataatgttatggtactaaaacaattctactagaaattgccatcaaaagtt
gi|89576                      :                                                                                                                                                                                                                                                   aattttgcatctgaT------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcatgagtggcatccatcatcacacgatgctatacatattggggaataatgttatggtactaaaacaattctactaaaaattgccatcaaaagttaaaataagggtctttttgctttttggatggcctacta
gi|89567                      :                                                                                                                                                                                                                                                        tgcacctgaT------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcatgagtggcatccatcatcacacgatgctatacatattggggaatgatgttatggtactaaaacaattctactaaaaattgccatcaaaagttaaaatagggtcattttgctttttggattgcctacta
gi|89568                      :                                                                                                                                                                                                                      aataatttatatacaataccgttttgttaatttttgcatctgaT------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcatgagtggcatccatcatcacacgatgctatacatattggggaataatgttatggtactgaaacaattctactaaaaattgccatcaaaagttaaaataagggtcattttgctttttggatggcctacta
gi|89577                      :                                                                                                                                                                                                                      aataatttatatacaatactgttttgttaatttttgaatctgaT------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcatgagtggcatccatcatcacacgatgctatacatattgggaaataatgttatggtactaaaacaattctactagaaattgccatcaaaagttaaaataagtttttttttgctttttgcatggcctacta
gi|89571                      :                                                                                                                                                                                                                                                          gcacctga------TGACCT----TTGACCTCAACTGTG-----------ACCTTAAAACGCAATTTcatgagtggcatccatcatcacacgatactatacatcttggacaatgttgctttggtattgaaacaattctactaaaaattgtcatcaaaagttaaaataagggatattttgcttttcggatggcctacta
gi|89564                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actgttttgttaattttttacatctgacCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAACAAATATTT-TA---ACA--A-G--ACAGTTT-----CCTAA--ATTCTAT--A------TA-T-CA-ATTACTGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGA-GGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTG-TATACA-TACCAAGGAA-G--GCAT--TA----AGCATTGATGCC---A-AA----TTCTACT--CAAATTTGCCA---TCAAAAGT---------T-------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTAcatgagtggcatccatcatcacatgatgctatacatattggggaataatgttatggtacttaaacaattctactaaaaattgccatcaaaagttaaaataagggtcattttgctttttggatggcctacta
gi|89566                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAAATCAACATA-ATTG-TA---ACATAA-GTGACAATTA-----TCTAT--ATACAAT--ACCGTTTTG-T-TA-ATTTTTGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAA-CGCAATTTCATGAGTGGCATC-------ACACGATGC-TATACA-TATTGAGGAATG--ATGT--TA--------TGG-TACTTAAACAA----TTCTACT--AAAATT-GCCA---TCAAAAGT---------TAAAATAAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89567                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatAATAATT-TATATACA--A-T--ACCGTTT-----TGTTA--ATTTT------------------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAA-CGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGC-TATACA-TATTGGGGAATA--ATGT--TAT---GGTACTGAAAC------AA----TTCTACT--AAAAATTGCCA---TCAAAAGT---------TAAAATAAGGGTCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
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consensus                     :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCACTT-TTTGACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG-----TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTGTTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTGCNCACTT-TTTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAA------AACGCAATTTTTAACATATTTTATTCATNTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTANAACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTTNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--C--TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89554                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTGGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTGATATGTTTAATTTCTCACAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATATGAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCACTT-TTTGACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTCTAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89555                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTATGTACCGCTAATAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTCTTAATTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCACTT-TTTGACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTTTTCATTTTCCTTGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAATTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89556                      :                         ATCATTAGTTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-AGTAACTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATG--GCTATTTCCTTCTATTTTAATATGTTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCGCTTCATTTGAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATT-ATATATTTTACCGACTT-TTCGACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ATA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTTTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--CA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CT
gi|89557                      :                         ATCATTATCTTTCTTTGTTGGGCAATATTAAAGATT-ATTATCTATTTCTTA--ATCGCTATTAATGTTGTCCGACCGCTGTTGTCACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATAAACTTAATTCATCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATAA-AAAAATAATTGCCTGTTTTTATGTACTG--AGTCTTGCATTTCACAAAAAATTCAAAATTCATCAATTTTGCACAC-A-TTTGACCTTTGACCTCAATT-TGACCTCAGTTTGACAACACAATGTTTAACATATTTTATTCATATTCCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAGTT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTACATTCTATA------TA-T-CA-ACAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATGAGTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATAAA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89558                      :                         ACCATTAGCTTTTTTTAATGGGCAATATTAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--AC-GCTATTAAGTTTGTCCGACCTCTGTTGTGACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATATGCTTAATTTACCATCAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAAT-T-TAAAATACTTGCCTGTTTTTATGTATTGGAAT-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAATTTCATCAATTTTGCACACTT-TT-GACCTTTGACCTCAGTT-TGACCTCAGTTTGACAACACAATTTT-AACATAATTTATTCATATTTCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAATAATT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTTTATTCTATA------TA-T-CA-ATAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATTAGTGGCATCCACCCTAACAGGTTTGTATATA-TAC-----------A-T--TA-AGCATGGATGC-C-----AATTCTACTAAAAAATTTCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCCTG-T-----GATGGC---CTATTA
gi|89559                      :                          TCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTCTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCT-TTTTAATATGCTTAATTT-----AAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-TAAGATACTTGCCTGGTCTTATGTACTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGGAATTCAAAATTCATAAATTTTACTGACTT-TTCGACCTT-GACCTTAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGAGGCGATTTCAT---TGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GAAA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCAACT-CAAATTTGCCA---TTAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89560                      :                                                                 AACGATTATTA---ATCATTATTGATTTTGTCCGACCTATATTGTGACCTCATATAGCTATTTCCTTCAGTTTTATTGTGATTAATTTCTTATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTCAATTT-AT-TATAAAATATTTGCCTGTTGTT-----TT------------TTTTGTAAGAAATTCAAAATTCATCAATTTT--TCACTTGTTTGACCTTTGACCTCAATT-TGACCTCAACCTAACAACATAATTTTTAACGTGTTTTATTCACATTCCTAGCAGTGGCTTAACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTTAGTTCAATAAATGTATAATT-AT--TT-TA---TCA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-TATATATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGACTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCATG-TAGTTGGATGGC---CTACTA
gi|89561                      : tctttattatgtagcaacttattaactagtgtatactataaTTGA-CATTTTCTGAGTATGAGTAACTATTTCTAT--ACCGATATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-TAAAACACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTTCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAACTTTACCCACTT-TTTGACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------AACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCATAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGT-----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89562                      :                                                                                                     TTCTATTGGGGAATCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTTATATGCCTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGAT-T-GAAAATACTTGCCAGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAACAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCACTT-TTATACCTTTGACCTCAATT-TGAC-----------ACCACAA-CTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-GCA---GCATATATATTTCTATAGTTTTCAGTTATATAAATAAATAAAT-AT--TT-TAT--ACA--
gi|89563                      :                                                                                                                                                 CTTGATTTC-CTTAAAGTTAAGATTATGTAAGAAATACATCTAAT-C-TGAAAAAGTTCCCTGTTTTTATGCAATGTAAG-CTTGTATTTCACAGAACATTCATAATTAACAAGTTT---GCATTC-TTTGACCATTCACCTCAA---------------------------TTTGACATAATTTATTCATATTCAAAGCAATCTTTT-ATATGAACAAGCAGCTTTCTATAGTTTTTAGTTCAATTAATAGATAATT-AT--TT-TC---ATA--AA--ACAG----------------------TA-T-CC-ATTACTTCATCCAGCTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTTAATTGCAACTTTATGATTGACATCCACCCTCACAGACTTGTGTACA-TGCCAAGAAGCCACG-TTATA-AGCATGGTTGC-CA----AATTCTATT-CACATTTGCCG---TCAAAAG------------------TTTTCCCTG-TGGTTGGATAGC---TTATTA
gi|89564                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTAAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GGCA-T--TA-AGCATTGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89565                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTTG----------------------GCATCTGATTGACCTTAGACCTCAACTGTGACCTTAAAATGCAATTTCATGAGTGGTATCCATCATCGCACG-TGCTATACA-TATTGGGGAATGATG-T--T-----AT-GATAC-TAAAACAATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89566                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatatataaatcaatataattgtaacattagtgacAATATATAAATCAAC-ATAATTGTA---ACATAAGTGACAATTATCTATATACAATACCGTTTTG-T-TA-ATTTTTGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCA-------TCACACGATGCTATACA-TATTGAGGAATGATG-T--T-----ATGG-TACTTAAAC-AATTCTACT--AAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89567                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTT----------------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATAATG-T--TATGGTACTGAAAC-------AATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89568                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACTGTTTTGTTAATTTT----------------------TGAATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGAAATAATG-T--T-----ATGG-TAC-TAAAACAATTCTACT-AGAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AA--G--T--TTTTTTTTGCTTTTTGCATGGC---CTACTA
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--G---TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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lowQualScore                  :                                                             7              222                                                       4                              0                         0     0                           0                                     8 7   55  5555  555555      0000              00000000000                              4                6   444                                           4  22  7  222   22  22        2        44444444444444444   0                        9    0   00   0  3            5           6     3 7 66      7   1      0  1 7 33 222 3    3   0000000         33   0      999         0000000000000000    0   8888          000      
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--C--TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89554                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTGGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTGATATGTTTAATTTCTCACAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATATGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTCTAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--G---TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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gi|89561                      : tctttattatgtagcaacttattaactagtgtatactataaTTGA-CATTTTCTGAGTATGAGTAACTATTTCTAT--ACCGATATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-CACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTTCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAACTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCATAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89562                      :                                                                                                     TTCTATTGGGGAATCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTTATATGCCTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-GAAAA-TACTTGCCAGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAACAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------ATACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACACCACAA-CTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-GCA---GCATATATATTTCTATAGTTTTCAGTTATATAAATAAATAAAT-AT--TT-TAT--ACA--
gi|89563                      :                                                                                                                                                 CTTGATTTC-CTTAAAGTTAAGATTATGTAAGAAATACATCTAATC-TGAAA-AAGTTCCCTGTTTTTATGCAATGTAAG-CTTGTATTTCACAGAACATTCATAATTAACAAGTTTG---CAT--TC----TT------TGACCA----TTCACCTCAATTTG-----------ACA----------TAA-----TTTATTCATATTCAAAGCAATCTTTT-ATATGAACAAGCAGCTTTCTATAGTTTTTAGTTCAATTAATAGATAATT-AT--TT-TC---ATA--AA--ACAG----------------------TA-T-CC-ATTACTTCATCCAGCTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTTAATTGCAACTTTATGATTGACATCCACCCTCACAGACTTGTGTACA-TGCCAAGAAGCCACG-TTATA-AGCATGGTTGC-CA----AATTCTATT-CACATTTGCCG---TCAAAA--------------G---TTTTCCCTG-TGGTTGGATAGC---TTATTA
gi|89564                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTAAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GGCA-T--TA-AGCATTGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--C--TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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gi|89555                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTATGTACCGCTAATAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTAATTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTTTTCATTTTCCTTGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAATTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89556                      :                         ATCATTAGTTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-AGTAACTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATG--GCTATTTCCTTCTATTTTAATATGTTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCGCTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATT-ATATATTTTACCGAC--TT----TT------CGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ATA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTTTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--CA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CT
gi|89557                      :                         ATCATTATCTTTCTTTGTTGGGCAATATTAAAGATT-ATTATCTATTTCTTA--ATCGCTATTAATGTTGTCCGACCGCTGTTGTCACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATAAACTTAATTCATCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATA-AAAAAATAATTGCCTGTTTTTATGTACTG--AGTCTTGCATTTCACAAAAAATTCAAAATTCATCAATTTTGCACACATTTGACCTT------TGACCTCAATTTGACCTCAGTTTG-----------ACAACACAATGTTTAACATATTTTATTCATATTCCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAGTT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTACATTCTATA------TA-T-CA-ACAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATGAGTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATAAA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89558                      :                         ACCATTAGCTTTTTTTAATGGGCAATATTAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--AC-GCTATTAAGTTTGTCCGACCTCTGTTGTGACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATATGCTTAATTTACCATCAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTTTTATGTATTGGAAT-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAATTTCATCAATTTTGCACAC--TT----TTGACCTTTGACCTCAGTTTGACCTCAGTTTG-----------ACAACACAATTTT-AACATAATTTATTCATATTTCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAATAATT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTTTATTCTATA------TA-T-CA-ATAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATTAGTGGCATCCACCCTAACAGGTTTGTATATA-TAC-----------A-T--TA-AGCATGGATGC-C-----AATTCTACTAAAAAATTTCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCCTG-T-----GATGGC---CTATTA
gi|89559                      :                          TCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTCTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCT-TTTTAATATGCTTAATTT-----AAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAGA-TACTTGCCTGGTCTTATGTACTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGGAATTCAAAATTCATAAATTTTACTGAC--TT----TT------CGACCT----T-GACCTTAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGAGGCGATTTCAT---TGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GAAA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCAACT-CAAATTTGCCA---TTAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89560                      :                                                                 AACGATTATTA---ATCATTATTGATTTTGTCCGACCTATATTGTGACCTCATATAGCTATTTCCTTCAGTTTTATTGTGATTAATTTCTTATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTCAATTT-ATTATAAAA-TATTTGCCTGTTGTT-----TT------------TTTTGTAAGAAATTCAAAATTCATCAATTTT--TCAC--TTG---TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTGACCTCAACCTAACAACATAATTTTTAACGTGTTTTATTCACATTCCTAGCAGTGGCTTAACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTTAGTTCAATAAATGTATAATT-AT--TT-TA---TCA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-TATATATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGACTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTCCATG-TAGTTGGATGGC---CTACTA
gi|89561                      : tctttattatgtagcaacttattaactagtgtatactataaTTGA-CATTTTCTGAGTATGAGTAACTATTTCTAT--ACCGATATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-CACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTTCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAACTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCATAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGT-----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89562                      :                                                                                                     TTCTATTGGGGAATCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTTATATGCCTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-GAAAA-TACTTGCCAGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAACAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------ATACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACACCACAA-CTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-GCA---GCATATATATTTCTATAGTTTTCAGTTATATAAATAAATAAAT-AT--TT-TAT--ACA--
gi|89563                      :                                                                                                                                                 CTTGATTTC-CTTAAAGTTAAGATTATGTAAGAAATACATCTAATC-TGAAA-AAGTTCCCTGTTTTTATGCAATGTAAG-CTTGTATTTCACAGAACATTCATAATTAACAAGTTTG---CAT--TC----TT------TGACCA----TTCACCTCAATTTG-----------ACA----------TAA-----TTTATTCATATTCAAAGCAATCTTTT-ATATGAACAAGCAGCTTTCTATAGTTTTTAGTTCAATTAATAGATAATT-AT--TT-TC---ATA--AA--ACAG----------------------TA-T-CC-ATTACTTCATCCAGCTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTTAATTGCAACTTTATGATTGACATCCACCCTCACAGACTTGTGTACA-TGCCAAGAAGCCACG-TTATA-AGCATGGTTGC-CA----AATTCTATT-CACATTTGCCG---TCAAAAG------------------TTTTCCCTG-TGGTTGGATAGC---TTATTA
gi|89564                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTAAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GGCA-T--TA-AGCATTGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89565                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTTG----------------------GCATCTGATTGACCTTAGACCTCAACTGTGACCTTAAAATGCAATTTCATGAGTGGTATCCATCATCGCACG-TGCTATACA-TATTGGGGAATGATG-T--T-----AT-GATAC-TAAAACAATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89566                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatatataaatcaatataattgtaacattagtgacAATATATAAATCAAC-ATAATTGTA---ACATAAGTGACAATTATCTATATACAATACCGTTTTG-T-TA-ATTTTTGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCA-------TCACACGATGCTATACA-TATTGAGGAATGATG-T--T-----ATGG-TACTTAAAC-AATTCTACT--AAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89567                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTT----------------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATAATG-T--TATGGTACTGAAAC-------AATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--TCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--G---TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89554                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTGGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTGATATGTTTAATTTCTCACAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATATGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTCTAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89555                      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTATGTACCGCTAATAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTAATTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTTTTCATTTTCCTTGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAATTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89556                      :                         ATCATTAGTTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-AGTAACTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATG--GCTATTTCCTTCTATTTTAATATGTTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCGCTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATT-ATATATTTTACCGAC--TT----TT------CGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ATA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTTTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--CA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CT
gi|89557                      :                         ATCATTATCTTTCTTTGTTGGGCAATATTAAAGATT-ATTATCTATTTCTTA--ATCGCTATTAATGTTGTCCGACCGCTGTTGTCACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATAAACTTAATTCATCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATA-AAAAAATAATTGCCTGTTTTTATGTACTG--AGTCTTGCATTTCACAAAAAATTCAAAATTCATCAATTTTGCACACATTTGACCTT------TGACCTCAATTTGACCTCAGTTTG-----------ACAACACAATGTTTAACATATTTTATTCATATTCCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAGTT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTACATTCTATA------TA-T-CA-ACAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATGAGTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATAAA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTCCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89558                      :                         ACCATTAGCTTTTTTTAATGGGCAATATTAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--AC-GCTATTAAGTTTGTCCGACCTCTGTTGTGACCTCATCAAGCTATTTCCTTCAGTTTTAATATGCTTAATTTACCATCAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTAATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTTTTATGTATTGGAAT-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAATTTCATCAATTTTGCACAC--TT----TTGACCTTTGACCTCAGTTTGACCTCAGTTTG-----------ACAACACAATTTT-AACATAATTTATTCATATTTCTAGTAGTGGCTT-ACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAATAATT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTGTTCTTTATTCTATA------TA-T-CA-ATAACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGATTTCATTAGTGGCATCCACCCTAACAGGTTTGTATATA-TAC-----------A-T--TA-AGCATGGATGC-C-----AATTCTACTAAAAAATTTCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTCCCTG-T-----GATGGC---CTATTA
gi|89559                      :                          TCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAGCTATTTCTAT--ACCACTATTAGTTCTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCT-TTTTAATATGCTTAATTT-----AAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAGA-TACTTGCCTGGTCTTATGTACTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGGAATTCAAAATTCATAAATTTTACTGAC--TT----TT------CGACCT----T-GACCTTAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTACCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAGTTGACCTCTGACCT-AATTTTGAGATTGTGAGGCGATTTCAT---TGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GAAA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCAACT-CAAATTTGCCA---TTAAAAGTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89560                      :                                                                 AACGATTATTA---ATCATTATTGATTTTGTCCGACCTATATTGTGACCTCATATAGCTATTTCCTTCAGTTTTATTGTGATTAATTTCTTATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTCAATTT-ATTATAAAA-TATTTGCCTGTTGTT-----TT------------TTTTGTAAGAAATTCAAAATTCATCAATTTT--TCAC--TTG---TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTGACCTCAACCTAACAACATAATTTTTAACGTGTTTTATTCACATTCCTAGCAGTGGCTTAACA---ACAAACATATTTCTATAGTTTTTAGTTCAATAAATGTATAATT-AT--TT-TA---TCA--AG--ACAGTATTCTTAATTCTATA------TA-TATATATTACTGCACCCAGTTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGTGACTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTCCATG-TAGTTGGATGGC---CTACTA
gi|89561                      : tctttattatgtagcaacttattaactagtgtatactataaTTGA-CATTTTCTGAGTATGAGTAACTATTTCTAT--ACCGATATTAGTTTTATCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTCTTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-CACTTGCCTGTTCTTATTTATTGGAAG-CTTTCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAACTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCATAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACTAAGGAA-GACA-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGT----------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89562                      :                                                                                                     TTCTATTGGGGAATCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTTATATGCCTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-GAAAA-TACTTGCCAGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAACAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------ATACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACACCACAA-CTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-GCA---GCATATATATTTCTATAGTTTTCAGTTATATAAATAAATAAAT-AT--TT-TAT--ACA--
gi|89563                      :                                                                                                                                                 CTTGATTTC-CTTAAAGTTAAGATTATGTAAGAAATACATCTAATC-TGAAA-AAGTTCCCTGTTTTTATGCAATGTAAG-CTTGTATTTCACAGAACATTCATAATTAACAAGTTTG---CAT--TC----TT------TGACCA----TTCACCTCAATTTG-----------ACA----------TAA-----TTTATTCATATTCAAAGCAATCTTTT-ATATGAACAAGCAGCTTTCTATAGTTTTTAGTTCAATTAATAGATAATT-AT--TT-TC---ATA--AA--ACAG----------------------TA-T-CC-ATTACTTCATCCAGCTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTTAATTGCAACTTTATGATTGACATCCACCCTCACAGACTTGTGTACA-TGCCAAGAAGCCACG-TTATA-AGCATGGTTGC-CA----AATTCTATT-CACATTTGCCG---TCAAAA--------------G---TTTTCCCTG-TGGTTGGATAGC---TTATTA
gi|89564                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGATCAATAAATAAACAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTCCTAAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCTAATTGACCTTTGACCT-AATTTTGAGATTATGAGGCGATTTCATGATTGGCATCCACCCTCACAGGTTTGTATACA-TACCAAGGAA-GGCA-T--TA-AGCATTGATGC-CA----AATTCTACT-CAAATTTGCCA---TCAAAAGTT---------------TTTTTCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
gi|89565                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTTG----------------------GCATCTGATTGACCTTAGACCTCAACTGTGACCTTAAAATGCAATTTCATGAGTGGTATCCATCATCGCACG-TGCTATACA-TATTGGGGAATGATG-T--T-----AT-GATAC-TAAAACAATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--GTCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89566                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatatataaatcaatataattgtaacattagtgacAATATATAAATCAAC-ATAATTGTA---ACATAAGTGACAATTATCTATATACAATACCGTTTTG-T-TA-ATTTTTGCATATTATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCA-------TCACACGATGCTATACA-TATTGAGGAATGATG-T--T-----ATGG-TACTTAAAC-AATTCTACT--AAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--GTCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
gi|89567                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAT-AA--TT-TATATACA--AT--ACCGTTTTGTTAATTTT----------------------TGCATCTGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGACCTTAAAACGCAATTTCATGAGTGGCATCCATCATCACACGATGCTATACA-TATTGGGGAATAATG-T--TATGGTACTGAAAC-------AATTCTACT-AAAAATTGCCA---TCAAAAGTTAAAATAAGG--GTCATTTTGCTT----TTTGGATGGC---CTACTA
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Reference ( family-727 )      :                         ATCATTAGCTTTCTTTGTTGAGCAATATCAGAGAAT-ATTAACTATTTCTAT--ACCGCTATTAGTTTTGTCCGACTTCTATTGTGACCTCATGAAGCTATTTCCTTCTATTTTAATATGCTTAATTTCTCATAAGGTTT-GTTTATGTATTCACTTCATTTGATT-TAAAA-TACTTGCCTGTTCTTATGTATTGGAAG-CTTGCATTTCACAAGAAATTCAAAATTCATAAATTTTACCCAC--TT----TT------TGACCT----TTGACCTCAATTTG-----------ACAACACAATTTTTAACATATTTTATTCATTTTCCTAGTAGTTGCTT-ACA---ACAGACATATTTCTATAGTTTTCAGTTCAATAAATAAATAAAT-AT--TT-TA---ACA--AG--ACAGTTTTCTTAATTCTATA------TA-T-CA-ATTACTGCACCCGATTGACCTTTGACCTCAACTGTGANCTTANGACGCGATTTCATGAGTGGCATCCACCNTCACACGNTNNTATACA-TACCGGGGAATGACG-T--TA-AGCATGGATGC-CA----AATTCTACT-NAAANTTGCCA---TCAAAAGTTAAAAT-AAGGG--C--TTTTNCCTG-TGTTTGGATGGC---CTACTA
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