lowQualScore : 222222222222222 11 333333 11 111 1111111 2 222
lowQualScore : 0 0 1 0 8 777777777777777 3 11 111111 33 1 33 0 1 0 7 7777 1 7 000 6666 5 4444444 44 7 1 1 3 666 000 1 1 22 3
lowQualScore : . . . . . ............... . .. ...... .. . .. . . . . .... . . ... .... . ....... .. . . . . ... ... . . .. .
lowQualScore : 8 2 9 9 1 111111111111111 1 55 999999 88 2 99 4 1 9 5 0000 8 0 444 7777 2 9999999 88 1 7 9 4 999 111 8 2 66 1
consensus : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--GGCC---CCG-GGAATG-AC--CTTGA--CCGAGTGNACTCGGG--TCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCT-GCCGAACG--ACA---CCAAGATC-A----T-NAAAT-TCCG-ACAAGAAATGGCCTCT-N-GGCAAGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
Reference ( gi|28602 ) : CGTGGCTCTCAGAATGGTGCACGTGCCAGGATGACCACATCAGTTCTA--GGCT---CCG-GGAATG-AC--CTTGA--CAGTGTGCCCTCGGG--TCAGTGAGGTACAGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCT-GCCCAACA--ACG---CCAAGATC-A----T-AAAAT-TCTG-ACTAGAAATGGCCTCT-G-GGCAAGGGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28598 : CGTGGCTCTCAGAATAGCGCACGTGCCAGGGTGTCCACCTCAGTTCTA--GGTC---CAA-GGAATG-AT--CTTGA--CCGAGTGTCCATGGG--TCATTGAGGTACAACAACCTTAAGATATATTCAAT----ACCT-GCCCAACG--ACA---TCAAGATC-A----T-CAAAT-TCCG-ACAAGAAATGACCTCT-T-GGCAAGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28606 : CATGGCTCTCAGAATGGTGCACGTG------TGACCACCTCAGTTCTA--GGCC---CTG-GGAATG-AC--CTTTAG-CAA-GTGCTCTCGGG--TCAGTGAGGTATGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----AATT-GCCCAACG--ACA---CCAAGATC-A----T-CAAAT-TCTG-ACAAAAAATGGCCCTT-G-GGCAA-GGGT-TTGGACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28603 : CGTGGATCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--AGCC---ACG-GGAATG-AC--CTTGA--TCGAGTGCATTCAGG--TCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCT-GTTGAACG--ACA---CCAAGATT-A----T-AAAAT-TTTG-AAAAGAAATGGCCTCT-G-GGCAA-GGGT-TTGAACATGGCA--CAT-ATAATAGACCAAAT
gi|28600 : CGTGGCTCTCAGAATCGCGCACGTGCCATGGTGACCACCTCAGTTCTA--GGC----CCA-GTGATG-AC--CTTGA--CCGGGTACCCTCGGG--TCAGTGAGGTACGGCAATCTCAAGATCTATTTAAT----ACCT-ACCCAACG--ACA---TAAAGATC-A----T-CAAAT-TTCG-ATAAGAATTGGCCTCT-G-GGCAA-GGGT-TTGAACATGGCA--CCTCATAATTGACAAAAT
gi|28599 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGCCACCTTAGTTCTA--GGCC---CTT-GGAATG-AC--CTTGA--CCGAGTGCCCTCGGG--AAAATGAGGTATGGCAACCTTTATATCTATTCAAT----ATCT-GTCCAACA--ACA---TCAAGATC-A----T-CAAAT-TCCG-ACAAGAATTGGCCTCT-G-GGC-AGGAGT-TTGAACATGGCA--CCT-A-AATTTGCCAAA
gi|28605 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--AGCC---ACG-GGAATG-AC--CTTGA--TCGAGTGCATTCAGG--TCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCT-GTTGAACG--ACA---CCAAGATT-A----T-at
gi|28604 : CGTGGTTCTCAGAATGGCGCATG-GT-------ACC---TCGGTTCTA--TCCC---CCG-G-AATG-AC--ATTGA--ACGAGTGAATTCGGG--TCAATTGAGTACGGCAACCTTAAGACCTATTTAAT----ACAT-GTCGAACA--ACA---TCAAGATC-A----T-CAAAT-TTCG-ACAAGAAATGGCATCT-G-GGC-ATAGGT-TTGAACATGTCA--CCT--TAA
gi|28607 : CGTGGTTCTCAAAATGACGCTCGTGCCAGGAGGATTACCTTAGTTCTA--GGC----CCA-GGAATG-AC--CTTGAACCAGCGAA--CTCCGG--CCAATTAAATACGACAACCTTGAGATCTTGTCAAT----ACCT-GTCGAACA--ACA---TCGAGGTC-A----T-CAGAT-TCCG-ACAAGAAATGGCTTCgttaaaat
gi|28601 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTACTAACC---CT----AATG-ACATTTTAA--C-GAGTAAACTCCGG--TATGTACTGTATGGCTACCTTTAGATCTATTCAAT----ATCT-ACCGAACG--ACA---CCAAGATC-A----G-CAAAA-TCGG-AA-AGAAATGGTCTCT-C-GGCA--GAGTATCGAACATGACA--CC
gi|28608 : CGTGCTTCTCAGAATCGTGCACGTGCCAAAATGACCAAAAAAACTCTACTAACC---CT----AATG-ACATTTTAA--C-GAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTACCTTTAGATTTATTCAAT----ACCT-ACCGAACG--ACA---CCAAGATC-AA---C-AAAAT--CGG-AA-AGAAATGGCCTCT-C-GAC-AGAGTC-TCGAACATGACA--CCcccataaatg
gi|28609 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCATAATGACCACATCAACTCTACTAACC---CT----AATG-ACA-TTTGA--ACGAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTACCT--------A--CAAT----ACCT-ACCGAACG--ACA---CCAAGATCAA----C-AAAA--TCGG-AA-AGAAATGGCCTCG-T-GAC-AGAGTC-TCGAACATGACA--CCccaataaatg
gi|28610 : TGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGC-AGGGTGACCACCTCAGTTCTA--GGCC---CTG-GCAATccaataaatg
gi|28611 : CAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTA----CTTACCCT---AATGCAT--TTTAA--C-GAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTTCCTTTAGATCTATTCAAT----ACCT-ACCGAACG--ACA---CCAAGATCAA----C-AAAA--TCGG-AA-AGAAATGGCCTCT-C-GAC-AGAGTC-CCGATCATGCCA--CC
gi|28612 : AGGAGAACTACCTTAGTTCTA--GAC-----CGAGGAATG-AC--CTTGAACCAGGGCATTCTTG----CTAATTAAGTACGGCAACCTTAGAAGCTATTCGATCGATACCT-GTCGAACA--ATA---CCAAGATC-A----TCAAAAT-TCCG-ACAAGAAATCGCCTCT-G-GTC-AGGGTT-TTGAACATGGCA--CCT-ACAcccataaatg
gi|28613 : TCGGGAATCATTAAAGT-C-GCTTCCTCAACATATAGTCAAT----ATCT-GACGAATG--GCA---CTAAAATA-A----T-TAAAT-TCTG-ACAAGGAATGAACTCTCA-GG--AGGGGT-TCAAGCttttccaaaat
gi|28614 : GGTAC--CAACCCCAAGAGCTCCTCAAT----ACCT-GTCGAACCCTATG---CTCTGGTT-A----A-AAACG-TC---ACAAG-AATGACATGA-G-TGC-TGGGAT-TTGAACATGACA--CC
gi|28615 : CAACCTCAAGAACTCTTCAAT----ACCT-GCCGAAC---------CCTGTGTC-ATTGTT-AAAAA-CATC-ACAAG-AATGACGTCA-G-TACCA-GGGT-TTGAACATGGCA--CC
gi|28616 : CAACCCCAAGAGCTTCTCAAT----ACCT-GTCGAACCCTGTG---CCCTGGTT-A------AAAA---CGGCACAAG-AATGACGTCA-GTGGC--GGGGT-TTGAACACGGCA--CCccaaattggca
gi|28617 : CAACCTCAAGAGCTACTCAAT----ACCT-GTCGAACC--CTGTGTCCGGGTT-------T-GAAACGTC---ACAAG-AATGACGTCA-G-TAC-CGTGGT-TTGAACATGGAA--CC
gi|28618 : AACCCTA-GATCCCTTCAAT----ACCT-ACACAGTG--TTA---TTAAGTTC-AA---C-AAAAT--CGG-TCAAAGAATGAACTCT-T-GGCA-GCGAT-TTGAACATGACA--CTT-ATccaaattggca
gi|28619 : TCAATACCTACACAATGGT-ACCAAGTTCAACA--AAG---TCAAGCTC-AAGG-T-CAATT-CCTG-A---GGAATGAGCTCT-T-GGCA-GTGAT-TTGAACATGACA--CGT-ATA
gi|28620 : AGATCCCATCAAT----ACCT-ACACAATG--ATA---CCAAGTTCAA----C-AAAAT-T-GG-TCAAGGAATAAACTCT-T-GGC-AGCGAT-TTGAACATGGCAGTCTT-ATtgtacaa
gi|28621 : AAT----ACCT-ATCGAATG--ATA---CCAAATTC-A----T-CCAGT-TCTG-TCAAAGAATGAGGTCA-C-GG-AAGAGAC-TTGAACATGACA--CCT-A-AAT
gi|28622 : ATC-A----C-CAAATCTCCA-AC---GAATGAGCTCT-C-AGCA-GAGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATA
gi|28623 : AAT-TCTG-ACAAGAAATGGCCTCT-T-GGCAAGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCAACCAAAT
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 111111 1111
lowQualScore : 0 1 33333 555 1 2 8 4 1 3 3333 666 22 7777777 33333 000000 22 3333 5555555 1 222 8888 1 22 2
lowQualScore : . . ..... ... . . . . . . .... ... .. ....... ..... ...... .. .... ....... . ... .... . .. .
lowQualScore : 1 1 33333 666 7 9 6 8 0 0 9999 444 44 0000000 33333 999999 44 5555 7777777 0 333 6666 8 55 9
consensus : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATG-AC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--AT-----CAAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
Reference ( family-718 ) : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATG-AC-CTTGACCGAGTGNACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--AT-----NAAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28598 : CGTGGCTCTCAGAATAGCGCACGTGCCAGGGTGTCCACCTCAGTTCTA--G--GTCCAA-GGAATG-AT-CTTGACCGAGTGTCCATGGGTCATTGAGGTACAACAACCTTAAGATATATTCAAT----ACCTGCCCAAC---GACATCAAGATC--AT-----CAAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGACCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28599 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGCCACCTTAGTTCTA--G--GCCCTT-GGAATG-AC-CTTGACCGAGTGCCCTCGGGAAAATGAGGTATGGCAACCTTTATATCTATTCAAT----ATCTGTCCAAC---AACATCAAGATC--AT-----CAAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAATTGGCCTC-TGGGC--AGGAGT-TTGAACATGGCA--CCT-A-AATTTGCCAAA
gi|28600 : CGTGGCTCTCAGAATCGCGCACGTGCCATGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCAG-TGA-TG-AC-CTTGACCGGGTACCCTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAATCTCAAGATCTATTTAAT----ACCTACCCAAC---GACATAAAGATC--AT-----CAAA---T-TT-----CG--A---TAA-------GAATTGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CCTCATAATTGACAAAATat
gi|28601 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTACTA--ACCCT----AATG-ACATTTTAACGAGTAAACTCCGGTATGTACTGTATGGCTACCTTTAGATCTATTCAAT----ATCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AG-----CAAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGTCTC-TCGGCA---GAGTATCGAACATGACA--CC
gi|28602 : CGTGGCTCTCAGAATGGTGCACGTGCCAGGATGACCACATCAGTTCTA--G--GCTCCG-GGAATG-AC-CTTGACAGTGTGCCCTCGGGTCAGTGAGGTACAGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATC--AT-----AAAA---T-TC-----TG--A---CTA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-AGGGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATAATCGACCAAATcccataaatg
gi|28603 : CGTGGATCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATG-AC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--AT-----AAAA---T-TT-----TG--A---AAA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CAT-ATAATAGACCAAAT
gi|28604 : CGTGGTTCTCAGAATGGCGCATG-------GT----ACCTCGGTTCTA--T--CCCCCG-G-AATG-AC-ATTGAACGAGTGAATTCGGGTCAATTGAGTACGGCAACCTTAAGACCTATTTAAT----ACATGTCGAAC---AACATCAAGATC--AT-----CAAA---T-TT-----CG--A---CAA-------GAAATGGCATC-TGGGC--ATAGGT-TTGAACATGTCA--CCT--TAA
gi|28605 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATG-AC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--AT-----gttaaaat
gi|28606 : CATGGCTCTCAGAATGGTGCACGTG------TGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GGAATG-AC-CTTTAGCAAGTGCTCTCGGGTCAGTGAGGTATGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----AATTGCCCAAC---GACACCAAGATC--AT-----CAAA---T-TC-----TG--A---CAA-------AAAATGGCCCT-TGGGCA-A-GGGT-TTGGACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28607 : CGTGGTTCTCAAAATGACGCTCGTGCCAGGAGGATTACCTTAGTTCTA--G--GCCC-A-GGAATG-AC-CTTGAACCAGCGAACTCCGGCCAATTAAATACGACAACCTTGAGATCTTGTCAAT----ACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTC--AT-----CAGA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCTTC-
gi|28608 : CGTGCTTCTCAGAATCGTGCACGTGCCAAAATGACCAAAAAAACTCTACTA--ACCCT----AATG-ACATTTTAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCTTTAGATTTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AA-----CAAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CC
gi|28609 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCATAATGACCACATCAACTCTACTA--ACCCT----AATG-ACATTTGAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCT--------A--CAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AA-----CAAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-GTGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CCccaataaatg
gi|28610 : TGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGC-AGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GCAATccaataaatg
gi|28611 : CAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTA--CTTACCCT----AATGCAT-TTTAAC-GAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTTCCTTTAGATCTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AA-----CAAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-CCGATCATGCCA--CC
gi|28612 : AGGAGAACTACCTTAGTTCTA--G--ACC--GAGGAATG-AC-CTTGAACCAGGGCATTCTTGCTAATTAAGTACGGCAACCTTAGAAGCTATTCGATCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATC--AT-----CAAAA--T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATCGCCTC-TGGTCA--GGGTT-TTGAACATGGCA--CCT-ACAcccataaatg
gi|28614 : GGTAC--CAACCCCAAGAGCTCCTCAAT----ACCTGTCGAAC-----C-CTATGCTCTGGT-----TAAAAACG-TC---------A---CAA-------G-AATGACATG-AGTGC--TGGGAT-TTGAACATGACA--CCttttccaaaat
gi|28615 : CAACCTCAAGAACTCTTCAAT----ACCTGCCGAAC-------CCTGTGTC--ATTGTTAAAAA---CATC---------A---CAA-------G-AATGACGTC-AGTACC-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CC
gi|28616 : CAACCCCAAGAGCTTCTCAAT----ACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTT--A------AAAA------------CGGCA---CAA-------GAA-TGACGTCAGTGGC---GGGGT-TTGAACACGGCA--CCccaaattggca
gi|28617 : CAACCTCAAGAGCTACTCAAT----ACCTGTCGAACCCTGTGTCCGGGTT----T-----GAAA---CGTC---------A---CAA-------G-AATGACGTC---AGTACCGTGGT-TTGAACATGGAA--CC
gi|28618 : AACCCTA-GATCCCTTCAAT----ACCTACACAGT---GTTATTAAGTTC--AA-----CAAA---A-TC-----GG--T---CAA-------AGAATGAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGACA--CTT-ATccaaattggca
gi|28619 : TCAAT----ACCTACACAAT---GGTACCAAGTTC--AA-----CAAA---G-TCAAGCTCA--AGGTCAATTCCTGAGGAATGAGCTC-TTGGCA--GTGAT-TTGAACATGACA--CGT-ATA
gi|28620 : AGATCCCATCAAT----ACCTACACAAT---GATACCAAGTTC--AA-----CAAA---A-TT-----GG--T---CAA-------GGAATAAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGGCAGTCTT-ATtgtacaa
gi|28621 : AAT----ACCTATCGAAT---GATACCAAATTC--AT-----CCAG---T-TC-----TG--T---CAA-------AGAATGAGGTC-ACGG-A-AGAGAC-TTGAACATGACA--CCT-A-AAT
gi|28622 : ATC--AC-----CAAA---TCTC-----CA--A---CGA----------ATGAGCTC-TCAGCA--GAGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATA
gi|28623 : AA---T-TC-----TG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCAACCAAAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28613 ): TCGGGAATCATTAAAGTCGCTTCCTCAACATATAGTCAATATCTGACGAATGGCACTAAAATAATTAAATTCTGACAAGGAATGAACTCTCAGGAGGGGTTCAAGC
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 111111 1111
lowQualScore : 0 1 33333 555 1 8 1 1 3 3333 666 22 1 44444 33333 000000 22 3333 5555555 3 222 8888 1 22 2
lowQualScore : . . ..... ... . . . . . .... ... .. . ..... ..... ...... .. .... ....... . ... .... . .. .
lowQualScore : 1 1 33333 666 7 6 0 9 0 9999 444 44 6 55555 33333 999999 44 5555 7777777 2 333 6666 8 55 9
consensus : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
Reference ( family-718 ) : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28598 : CGTGGCTCTCAGAATAGCGCACGTGCCAGGGTGTCCACCTCAGTTCTA--G--GTCCAA-GGAATGAT-CTTGACCGAGTGTCCATGGGTCATTGAGGTACAACAACCTTAAGATATATTCAAT----ACCTGCCCAAC---GACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGACCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28599 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGCCACCTTAGTTCTA--G--GCCCTT-GGAATGAC-CTTGACCGAGTGCCCTCGGGAAAATGAGGTATGGCAACCTTTATATCTATTCAAT----ATCTGTCCAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAATTGGCCTC-TGGGC--AGGAGT-TTGAACATGGCA--CCT-A-AATTTGCCAAA
gi|28600 : CGTGGCTCTCAGAATCGCGCACGTGCCATGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCAG-TGA-TGAC-CTTGACCGGGTACCCTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAATCTCAAGATCTATTTAAT----ACCTACCCAAC---GACATAAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---TAA-------GAATTGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CCTCATAATTGACAAAATat
gi|28601 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAACTCCGGTATGTACTGTATGGCTACCTTTAGATCTATTCAAT----ATCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AGC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGTCTC-TCGGCA---GAGTATCGAACATGACA--CC
gi|28602 : CGTGGCTCTCAGAATGGTGCACGTGCCAGGATGACCACATCAGTTCTA--G--GCTCCG-GGAATGAC-CTTGACAGTGTGCCCTCGGGTCAGTGAGGTACAGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATC--ATA-----AAA---T-TC-----TG--A---CTA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-AGGGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATAATCGACCAAATcccataaatg
gi|28603 : CGTGGATCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATA-----AAA---T-TT-----TG--A---AAA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CAT-ATAATAGACCAAAT
gi|28604 : CGTGGTTCTCAGAATGGCGCATG-------GT----ACCTCGGTTCTA--T--CCCCCG-G-AATGAC-ATTGAACGAGTGAATTCGGGTCAATTGAGTACGGCAACCTTAAGACCTATTTAAT----ACATGTCGAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---CAA-------GAAATGGCATC-TGGGC--ATAGGT-TTGAACATGTCA--CCT--TAA
gi|28605 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATgttaaaat
gi|28606 : CATGGCTCTCAGAATGGTGCACGTG------TGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GGAATGAC-CTTTAGCAAGTGCTCTCGGGTCAGTGAGGTATGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----AATTGCCCAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----TG--A---CAA-------AAAATGGCCCT-TGGGCA-A-GGGT-TTGGACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28607 : CGTGGTTCTCAAAATGACGCTCGTGCCAGGAGGATTACCTTAGTTCTA--G--GCCC-A-GGAATGAC-CTTGAACCAGCGAACTCCGGCCAATTAAATACGACAACCTTGAGATCTTGTCAAT----ACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTC--ATC-----AGA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCTTC-
gi|28608 : CGTGCTTCTCAGAATCGTGCACGTGCCAAAATGACCAAAAAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCTTTAGATTTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CC
gi|28609 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCATAATGACCACATCAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTGAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCT--------A--CAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-GTGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CCccaataaatg
gi|28610 : TGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGC-AGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GCAATccaataaatg
gi|28611 : CAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTA--CTTACCCT----AATGCA-TTTTAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTTCCTTTAGATCTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-CCGATCATGCCA--CC
gi|28612 : AGGAGAACTACCTTAGTTCTA--G--ACC--GAGGAATGAC-CTTGAACCAGGGCATTCTTGCTAATTAAGTACGGCAACCTTAGAAGCTATTCGATCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATC--ATC-----AAAA--T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATCGCCTC-TGGTCA--GGGTT-TTGAACATGGCA--CCT-ACAcccataaatg
gi|28614 : GGTAC--CAACCCCAAGAGCTCCTCAAT----ACCTGTCGAAC-----C-CTATGCTCTGGTT-----AAAAACG-TC---------A---CAA-------G-AATGACATG-AGTGC--TGGGAT-TTGAACATGACA--CCttttccaaaat
gi|28615 : CAACCTCAAGAACTCTTCAAT----ACCTGCCGAAC-------CCTGTGTC--ATTGTTAAAAA---CATC---------A---CAA-------G-AATGACGTC-AGTACC-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CC
gi|28616 : CAACCCCAAGAGCTTCTCAAT----ACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTT--A-------AAA------A-----CGGCA---CAA-------G-AATGACGTCAGTGGC---GGGGT-TTGAACACGGCA--CCccaaattggca
gi|28617 : CAACCTCAAGAGCTACTCAAT----ACCTGTCGAACCCTGTGTCCGGGTT----TG-----AAA---CGTC---------A---CAA-------G-AATGACGTC---AGTACCGTGGT-TTGAACATGGAA--CC
gi|28618 : AACCCTA-GATCCCTTCAAT----ACCTACACAGT---GTTATTAAGTTC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--T---CAA-------AGAATGAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGACA--CTT-ATccaaattggca
gi|28619 : TCAAT----ACCTACACAAT---GGTACCAAGTTC--AAC-----AAA---G-TCAAGCTCA--AGGTCAATTCCTGAGGAATGAGCTC-TTGGCA--GTGAT-TTGAACATGACA--CGT-ATA
gi|28620 : AGATCCCATCAAT----ACCTACACAAT---GATACCAAGTTC--AAC-----AAA---A-TT-----GG--T---CAA-------GGAATAAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGGCAGTCTT-ATtgtacaa
gi|28621 : AAT----ACCTATCGAAT---GATACCAAATTC--ATC-----CAG---T-TC-----TG--T---CAA-------AGAATGAGGTC-ACGG-A-AGAGAC-TTGAACATGACA--CCT-A-AAT
gi|28622 : ATC--ACC-----AAA---TCTC-----CA--A---CGA----------ATGAGCTC-TCAGCA--GAGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATA
gi|28623 : AA---T-TC-----TG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCAACCAAAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28613 ): TCGGGAATCATTAAAGTCGCTTCCTCAACATATAGTCAATATCTGACGAATGGCACTAAAATAATTAAATTCTGACAAGGAATGAACTCTCAGGAGGGGTTCAAGC
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 111111 1111
lowQualScore : 0 1 33333 555 1 8 1 1 3 3333 666 22 1 44444 33333 000000 22 3333 5555555 3 222 8888 1 22 2
lowQualScore : . . ..... ... . . . . . .... ... .. . ..... ..... ...... .. .... ....... . ... .... . .. .
lowQualScore : 1 1 33333 666 7 6 0 9 0 9999 444 44 6 55555 33333 999999 44 5555 7777777 2 333 6666 8 55 9
consensus : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
Reference ( family-718 ) : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28598 : CGTGGCTCTCAGAATAGCGCACGTGCCAGGGTGTCCACCTCAGTTCTA--G--GTCCAA-GGAATGAT-CTTGACCGAGTGTCCATGGGTCATTGAGGTACAACAACCTTAAGATATATTCAAT----ACCTGCCCAAC---GACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGACCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28599 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGCCACCTTAGTTCTA--G--GCCCTT-GGAATGAC-CTTGACCGAGTGCCCTCGGGAAAATGAGGTATGGCAACCTTTATATCTATTCAAT----ATCTGTCCAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAATTGGCCTC-TGGGC--AGGAGT-TTGAACATGGCA--CCT-A-AATTTGCCAAA
gi|28600 : CGTGGCTCTCAGAATCGCGCACGTGCCATGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCAG-TGA-TGAC-CTTGACCGGGTACCCTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAATCTCAAGATCTATTTAAT----ACCTACCCAAC---GACATAAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---TAA-------GAATTGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CCTCATAATTGACAAAATat
gi|28601 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAACTCCGGTATGTACTGTATGGCTACCTTTAGATCTATTCAAT----ATCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AGC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGTCTC-TCGGCA---GAGTATCGAACATGACA--CC
gi|28602 : CGTGGCTCTCAGAATGGTGCACGTGCCAGGATGACCACATCAGTTCTA--G--GCTCCG-GGAATGAC-CTTGACAGTGTGCCCTCGGGTCAGTGAGGTACAGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATC--ATA-----AAA---T-TC-----TG--A---CTA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-AGGGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATAATCGACCAAATcccataaatg
gi|28603 : CGTGGATCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATA-----AAA---T-TT-----TG--A---AAA-------GAAATGGCCTC-TGGGCA-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CAT-ATAATAGACCAAAT
gi|28604 : CGTGGTTCTCAGAATGGCGCATG-------GT----ACCTCGGTTCTA--T--CCCCCG-G-AATGAC-ATTGAACGAGTGAATTCGGGTCAATTGAGTACGGCAACCTTAAGACCTATTTAAT----ACATGTCGAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---CAA-------GAAATGGCATC-TGGGC--ATAGGT-TTGAACATGTCA--CCT--TAA
gi|28605 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGGTCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATgttaaaat
gi|28606 : CATGGCTCTCAGAATGGTGCACGTG------TGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GGAATGAC-CTTTAGCAAGTGCTCTCGGGTCAGTGAGGTATGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----AATTGCCCAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----TG--A---CAA-------AAAATGGCCCT-TGGGCA-A-GGGT-TTGGACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28607 : CGTGGTTCTCAAAATGACGCTCGTGCCAGGAGGATTACCTTAGTTCTA--G--GCCC-A-GGAATGAC-CTTGAACCAGCGAACTCCGGCCAATTAAATACGACAACCTTGAGATCTTGTCAAT----ACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTC--ATC-----AGA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCTTC-
gi|28608 : CGTGCTTCTCAGAATCGTGCACGTGCCAAAATGACCAAAAAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCTTTAGATTTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CC
gi|28609 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCATAATGACCACATCAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTGAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTACCT--------A--CAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-GTGAC--AGAGTC-TCGAACATGACA--CCccaataaatg
gi|28610 : TGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGC-AGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GCAATccaataaatg
gi|28611 : CAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTA--CTTACCCT----AATGCA-TTTTAACGAGTAAATTCCGGCCTGTACTGTATGGCTTCCTTTAGATCTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC--AGAGTC-CCGATCATGCCA--CC
gi|28612 : AGGAGAACTACCTTAGTTCTA--G--ACC--GAGGAATGAC-CTTGAACCAGGGCATTCTTGCTAATTAAGTACGGCAACCTTAGAAGCTATTCGATCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATC--ATC-----AAAA--T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATCGCCTC-TGGTCA--GGGTT-TTGAACATGGCA--CCT-ACAcccataaatg
gi|28614 : GGTAC--CAACCCCAAGAGCTCCTCAAT----ACCTGTCGAAC-----C-CTATGCTCTGGTT-----AAAAACG-TC---------A---CAA-------G-AATGACATG-AGTGC--TGGGAT-TTGAACATGACA--CCttttccaaaat
gi|28615 : CAACCTCAAGAACTCTTCAAT----ACCTGCCGAAC-------CCTGTGTC--ATTGTTAAAAA---CATC---------A---CAA-------G-AATGACGTC-AGTACC-A-GGGT-TTGAACATGGCA--CC
gi|28616 : CAACCCCAAGAGCTTCTCAAT----ACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTT--A-------AAA------A-----CGGCA---CAA-------G-AATGACGTCAGTGGC---GGGGT-TTGAACACGGCA--CCccaaattggca
gi|28617 : CAACCTCAAGAGCTACTCAAT----ACCTGTCGAACCCTGTGTCCGGGTT----TG-----AAA---CGTC---------A---CAA-------G-AATGACGTC---AGTACCGTGGT-TTGAACATGGAA--CC
gi|28618 : AACCCTA-GATCCCTTCAAT----ACCTACACAGT---GTTATTAAGTTC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--T---CAA-------AGAATGAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGACA--CTT-ATccaaattggca
gi|28619 : TCAAT----ACCTACACAAT---GGTACCAAGTTC--AAC-----AAA---G-TCAAGCTCA--AGGTCAATTCCTGAGGAATGAGCTC-TTGGCA--GTGAT-TTGAACATGACA--CGT-ATA
gi|28620 : AGATCCCATCAAT----ACCTACACAAT---GATACCAAGTTC--AAC-----AAA---A-TT-----GG--T---CAA-------GGAATAAACTC-TTGGC--AGCGAT-TTGAACATGGCAGTCTT-ATtgtacaa
gi|28621 : AAT----ACCTATCGAAT---GATACCAAATTC--ATC-----CAG---T-TC-----TG--T---CAA-------AGAATGAGGTC-ACGG-A-AGAGAC-TTGAACATGACA--CCT-A-AAT
gi|28622 : ATC--ACC-----AAA---TCTC-----CA--A---CGA----------ATGAGCTC-TCAGCA--GAGGT-TTGAACATGACA--CCT-ATA
gi|28623 : AA---T-TC-----TG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TTGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCAACCAAAT
blockSeqs : G CTA TT G A C C G CGAT CCT TG T GTTAA AACG AAGCTC GC GGTC TTCCTGA A AGT ACCG A GT C
blockSeqs : T CTA AG G A C C G . CCT . T . AT C . C . A TG AAG . . .
blockSeqs : C CTA CG G A A A C . . . G . CA C . T . A TG AAG . . .
blockSeqs : G CTT CG G . C C G . . . T . CG G . C . A TC AAG . . .
blockSeqs : G G CG G . T C A . . . T . TC T . A . A TG AG . . .
blockSeqs : G G CG G . A A G . . . T . T T . C . A TG AA . . .
blockSeqs : G G TG G . T C A . . . T . T C . C . A TG AA . . .
blockSeqs : A A TG C . G C G . . . T . A T . C . A TG AT . . .
blockSeqs : T T GA G . A A C . . . T . T C . C . A TC AA . . .
blockSeqs : G A T . . A A C . . . A . T G . C . A GT AG . . .
blockSeqs : C G A . . A A C . . . A . T G . C . A TC AG . . .
blockSeqs : G G T . . A A C . . . A . T G . C . A TG AG . . .
blockSeqs : . G T . . A C T . . . T . T C . C . G AG AG . . .
blockSeqs : . G T . . . . T . A C . C . G AG TG . .
blockSeqs : . . . T . A G . C . G TT CA . .
blockSeqs : . . . T . A G . C . G TT AG . .
blockSeqs : . . . A . A T . C . A TT AG . .
blockSeqs : . . . A . G C . C . . AC AG . .
blockSeqs : . . . A . A T . . . . TC AG . .
blockSeqs : . . . T . T . . . . . TT A . .
blockSeqs : . . . C . T . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : AG**
originalCons : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCA-AGGGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
finalCons : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGGTCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGCAG--GGGT-TTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28613 ): TCGGGAATCATTAAAGTCGCTTCCTCAACATATAGTCAATATCTGACGAATGGCACTAAAATAATTAAATTCTGACAAGGAATGAACTCTCAGGAGGGGTTCAAGC
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 111111
lowQualScore : 0 1 33333 555 1 8 1 1 2 33 0 0 3333 666 22 1 44444 22222 000000 22 3333 5555555 1 1 1 3 1 22 2
lowQualScore : . . ..... ... . . . . . .. . . .... ... .. . ..... ..... ...... .. .... ....... . . . . . .. .
lowQualScore : 1 1 33333 666 7 6 0 9 1 77 3 2 7777 111 33 2 33333 44444 777777 33 0000 4444444 2 7 0 5 7 55 9
consensus : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGG--TCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGC-A-GGGGTTTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
Reference ( family-718 ) : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCCG-GGAATGAC-CTTGANCGAGTGCACTCGGG--TCAGTGAGGTACGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCGAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TNGGC-A-GGGGTTTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28598 : CGTGGCTCTCAGAATAGCGCACGTGCCAGGGTGTCCACCTCAGTTCTA--G--GTCCAA-GGAATGAT-CTTGACCGAGTGTCCATGGG--TCATTGAGGTACAACAACCTTAAGATATATTCAAT----ACCTGCCCAAC---GACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGACCTC-TTGGCAA-GGGGTTTGAACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28599 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGCCACCTTAGTTCTA--G--GCCCTT-GGAATGAC-CTTGACCGAGTGCCCTCGGG--AAAATGAGGTATGGCAACCTTTATATCTATTCAAT----ATCTGTCCAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAATTGGCCTC-TGGGC-A-GGAGTTTGAACATGGCA--CCT-A-AATTTGCCAAA
gi|28600 : CGTGGCTCTCAGAATCGCGCACGTGCCATGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCAG-TGA-TGAC-CTTGACCGGGTACCCTCGGG--TCAGTGAGGTACGGCAATCTCAAGATCTATTTAAT----ACCTACCCAAC---GACATAAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---TAA-------GAATTGGCCTC-TGGGC-A-AGGGTTTGAACATGGCA--CCTCATAATTGACAAAATat
gi|28601 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAACTCCGG--TATGTACTGTATGGCTACCTTTAGATCTATTCAAT----ATCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AGC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGTCTC-TCGGC-A-GAGTATCGAACATGACA--CC
gi|28602 : CGTGGCTCTCAGAATGGTGCACGTGCCAGGATGACCACATCAGTTCTA--G--GCTCCG-GGAATGAC-CTTGACAGTGTGCCCTCGGG--TCAGTGAGGTACAGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----ACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATC--ATA-----AAA---T-TC-----TG--A---CTA-------GAAATGGCCTC-TGGGCAA-GGGGTTTGAACATGACA--CCT-ATAATCGACCAAATcccataaatg
gi|28603 : CGTGGATCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGG--TCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATA-----AAA---T-TT-----TG--A---AAA-------GAAATGGCCTC-TGGGC-A-AGGGTTTGAACATGGCA--CAT-ATAATAGACCAAAT
gi|28604 : CGTGGTTCTCAGAATGGCGCATG-------GT----ACCTCGGTTCTA--T--CCCCCG-G-AATGAC-ATTGAACGAGTGAATTCGGG--TCAATTGAGTACGGCAACCTTAAGACCTATTTAAT----ACATGTCGAAC---AACATCAAGATC--ATC-----AAA---T-TT-----CG--A---CAA-------GAAATGGCATC-TGGGC-A-TAGGTTTGAACATGTCA--CCT--TAA
gi|28605 : CGTGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGCCAGGGTGGTCACCTCAGTTCTA--A--GCCACG-GGAATGAC-CTTGATCGAGTGCATTCAGG--TCAATGAGGTACAGCAAGATTAAGATCTATTCAAT----ACCTGTTGAAC---GACACCAAGATT--ATgttaaaat
gi|28606 : CATGGCTCTCAGAATGGTGCACGTG------TGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GGAATGAC-CTTTAGCAAGTGCTCTCGGG--TCAGTGAGGTATGGCAACCTTAAGATCTATTCAAT----AATTGCCCAAC---GACACCAAGATC--ATC-----AAA---T-TC-----TG--A---CAA-------AAAATGGCCCT-TGGGC-A-AGGGTTTGGACATGGCA--CCT-ATAATCGACCAAAT
gi|28607 : CGTGGTTCTCAAAATGACGCTCGTGCCAGGAGGATTACCTTAGTTCTA--G--GCCC-A-GGAATGAC-CTTGAACCAGCGAACTCCGG--CCAATTAAATACGACAACCTTGAGATCTTGTCAAT----ACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTC--ATC-----AGA---T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATGGCTTC-
gi|28608 : CGTGCTTCTCAGAATCGTGCACGTGCCAAAATGACCAAAAAAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTTAACGAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTACCTTTAGATTTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC-A-GAGTCTCGAACATGACA--CC
gi|28609 : CGTGCTTCCCAGAATCGTGCACGTGCCATAATGACCACATCAACTCTACTA--ACCCT----AATGACATTTGAACGAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTACCT--------A--CAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-GTGAC-A-GAGTCTCGAACATGACA--CCccaataaatg
gi|28610 : TGGCTCTCAGAATGGCGCACGTGC-AGGGTGACCACCTCAGTTCTA--G--GCCCTG-GCAATccaataaatg
gi|28611 : CAGAATCGTGCACGTGCCACAATGACCACATAAACTCTA--CTTACCCT----AATGCA-TTTTAACGAGTAAATTCCGG--CCTGTACTGTATGGCTTCCTTTAGATCTATTCAAT----ACCTACCGAAC---GACACCAAGATC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--A----AA-------GAAATGGCCTC-TCGAC-A-GAGTCCCGATCATGCCA--CC
gi|28612 : AGGAGAACTACCTTAGTTCTA--G--ACC--GAGGAATGAC-CTTGAACCAGGGCATTCTTG--CTAATTAAGTACGGCAACCTTAGAAGCTATTCGATCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATC--ATC-----AAAA--T-TC-----CG--A---CAA-------GAAATCGCCTC-TGGTC-A-GGGTTTTGAACATGGCA--CCT-ACAcccataaatg
gi|28613 : TCGGGAATCATTAAAGT-CG-CTTCCTCAACATATAGTCAAT----ATCTGACGAAT---GGCACTAAAATA--ATT-----AAA---T-TC-----TG--A---CAA-------GGAATGAACTC-TCAGG-A-GGGGTTCAAGCttttccaaaat
gi|28614 : GGTAC--CAACCCCAAGAGCTCCTCAAT----ACCTGTCGAAC-----C-CTATGCTCTGGTT-----AAAAACG-TC---------A---CAA-------G-AATGACATG-AGTGC-T-GGGATTTGAACATGACA--CC
gi|28615 : CAACCTCAAGAACTCTTCAAT----ACCTGCCGAAC-------CCTGTGTC--ATTGTTAAAAA---CATC---------A---CAA-------G-AATGACGTC-AGTAC-C-AGGGTTTGAACATGGCA--CC
gi|28616 : CAACCCCAAGAGCTTCTCAAT----ACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTT--A-------AAA------A-----CGGCA---CAA-------GAA-TGACGTCAGTGGC---GGGGTTTGAACACGGCA--CCccaaattggca
gi|28617 : CAACCTCAAGAGCTACTCAAT----ACCTGTCGAACCCTGTGTCCGGGTT----TG-----AAA---CGTC---------A---CAA-------G-AATGACGTC-AGTAC-C-GTGGTTTGAACATGGAA--CC
gi|28618 : AACCCTA-GATCCCTTCAAT----ACCTACACAGT---GTTATTAAGTTC--AAC-----AAA---A-TC-----GG--T---CAA-------AGAATGAACTC-TTGGC-A-GCGATTTGAACATGACA--CTT-ATccaaattggca
gi|28619 : TCAAT----ACCTACACAAT---GGTACCAAGTTC--AAC-----AAA---G-TCAAGCTCA--AGGTCAATTCCTGAGGAATGAGCTC-TTGGC-A-GTGATTTGAACATGACA--CGT-ATA
gi|28620 : AGATCCCATCAAT----ACCTACACAAT---GATACCAAGTTC--AAC-----AAA---A-TT-----GG--T---CAA-------GGAATAAACTC-TTGGC-A-GCGATTTGAACATGGCAGTCTT-ATtgtacaa
gi|28621 : AAT----ACCTATCGAAT---GATACCAAATTC--ATC-----CAG---T-TC-----TG--T---CAA-------AGAATGAGGTC-ACGGA-A-GAGACTTGAACATGACA--CCT-A-AAT
gi|28622 : ATC--ACC-----AAA---TCTC-----CA--A---CGA----------ATGAGCTC-TCAGC-A-GAGGTTTGAACATGACA--CCT-ATA
gi|28623 : AA---T-TC-----TG--A---CAA-------GAAATGGCCTC-TTGGC-AAGGGGTTTGAACATGGCA--CCT-ATAATCAACCAAAT