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Reference ( gi|95078 )        : TTATCCCCC-GCCACCGCTC-GTA------GAGCAG-AGC-A--G-G-G-G-A-TATAGAAATG---TGC-TG-CA----TCT----G----TC--CGTGCGTCC
gi|95075                      : TTATCCCCT-GCCACCGCTC-ACA------GAGCGG-AGC-G--G-G-G-A-A-TATAGAAATG---GGC-TG-CG----TCT----G----TC--CGTGCGACC
gi|95076                      : TTATCCACT-GTCACCGCTC-ATA------GAGCGG-AGC-G--G-G-G-G-A-TATAGAAATG---GGC-TG-CA----TCC----G----TG--CGTGCGTC
gi|95081                      : TTATCCCCC-GCCACAGCTC-GTA------GAGCCA-AGC-A--G-G-G-G-A-TATAGAAATG---GGC-TG-CG----TCC----G----TC--TGTCTGTCCtgt
gi|95077                      : TTATCCCCC-GCCACATCTC-GTA------GAGCGG-AGC-A--G-GAG-G-A-TATAGAAATG---GGC-TG-CG----TCC----G----TG--CGTGTGTCCgt
gi|95079                      : TTATCCCCT-GCCACCGCTC-GCA------GAGCGG-AGC----G-G-G-G-A-TATAGAAATG---GGC-TG-CG----TCT----G----TT--CGTgt
gi|95080                      : TTATCCCCC-TCCACCGCTC-GTA------GAGCGA-AGC-G--G-G-G-G-A-TATAGAAATG---GAC-TG-C------------G----TC--CGTGCGT
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gi|95097                      :           tCCAGCGCTT-GTA------GAGCGA-AGC-A--A-G-GTG-A-TATAGAAATGGCCCGCGTC-CG----TCC----G----TC--CGTGCGTCCtagaaatggactgcgttcatgcatgcatccgt
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Reference ( family-713 )      : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
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Reference ( family-713 )      : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
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gi|95077                      : TTATCCCCCGCCACATCTCGTAGA------GCG--GAGC--A-GGAG-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTG--CGTGTGTCCtgt
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gi|95099                      :                       GA------GCGTTG-GC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGTGT
gi|95100                      :                                     AGC--A-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----TGTC--TGTGTGTgcgt


blockSeqs                     :                         CTACGA   TT    AAG   A T  T               CGTC TTTT TTCT  AGTG    TG
blockSeqs                     :                         .        .     AG    . T  .               C    .    .     TGTG    . 
blockSeqs                     :                         .        .     AG    . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     AG    . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     AG    . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     AA    . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     AG    . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     G     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     A     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     .     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     .     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     .     . .  .               .    .    .     .       . 
blockSeqs                     :                         .        .     .     . .  .               .    .    .     .         
blockSeqs                     :                                        .     . .  .               .    .    .     .         


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
finalCons                     : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC





Alignments
lowQualScore                  :                                        1111                                                          
lowQualScore                  :                         444444   22    3333  1 3  1               4444 3333 3333  6666    22         
lowQualScore                  :                         ......   ..    ....  . .  .               .... .... ....  ....    ..         
lowQualScore                  :                         666666   22    0000  5 1  5               8888 3333 3333  5555    33         
consensus                     : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
Reference ( family-713 )      : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
gi|95075                      : TTATCCCCTGCCACCGCTCACAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-AA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----TGTC--CGTGCGACC
gi|95076                      : TTATCCACTGTCACCGCTCATAGA------GCG--GAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----A----TC----CGTG--CGTGCGTC
gi|95077                      : TTATCCCCCGCCACATCTCGTAGA------GCG--GAGC--A-GGAG-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTG--CGTGTGTCCtgt
gi|95078                      : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAGA------GCA--GAGC--A-GG-G-GA-TATAGAAATGTGCTG----C----A----TC----TGTC--CGTGCGTCCgt
gi|95079                      : TTATCCCCTGCCACCGCTCGCAGA------GCG--GAGC----GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----TGTT--CGT
gi|95080                      : TTATCCCCCTCCACCGCTCGTAGA------GCG--AAGC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGACTG----C----G----TC----CGTG--CGTATGT
gi|95081                      : TTATCCCCCGCCACAGCTCGTAGA------GCC--AAGC--A-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--TGTCTGTCCgcgt
gi|95082                      : TTATCCCCTGCCACCGCTTGTAGA------G-------------G-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----AGTCTGCGTGTGTCCgt
gi|95083                      : TTATCCCCCGCCATCGCTCGTATA------GCG--GAGC--A-GG-GTGA-TATA-AAATGGGCTG----C----G----CCAGTGCGTC--CGTATGTCCgt
gi|95084                      : TTATCCCCTGCCACTGCTCAAAGA------GCA--TAGC----GG-G-GA-TATAGAAAT-GGCTG----C----G----CC----CGTC--GGTGTGTCCgt
gi|95085                      : TTATCCCCTTCCACCATTCGTAGA------GCA--GAGC--G-GG-A-AA-TATAGAAATGGGCTG----C----A----TC----TGTC--CAT
gi|95086                      : TTATCCCCTGCCACTGCTCGTAGACTACGAGTG--GAGCA-G-GG-G-GA-TATAGAAATGGACTG----C----G----TT----CATG--CATGCATCC
gi|95087                      : TTATTCCCCGCCACTGTTCGTAGA------GCG--GAGCAAG-GG-G-GA-TATGGAAATGGGCTG----CTTTTG----TG----CTTC--CGTGCGTCCgt
gi|95088                      : TCATCCCCCGCCACAGCTGGTAGA------GCG--GAGCA-G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGATG----C----C----CC----CATC--TGTGCGTCat
gi|95089                      : TTATCTCCCGTCACCGCTCGTAGA------GCG--GAGCA-G-AG-G-GG-TATAGAAATTGGCTG----C----G----TC----CGTtgt
gi|95090                      : TTATCCCTTGCCATCGCTCATAGA------GCG--TAGC--A-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTGC---C----G----T-----CGTC--AATGCATC
gi|95091                      : TTATCCCCCGCCACCCCTTGTAGA------GTG--CAGCA-G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----G----G----TC----CGTtg
gi|95092                      : TTATCCCACGACACCACTCGTGCA------GCG--GAGC--G-GG-A-TA-TATAGAAATGGGCTG----C----GTTCTTC----CGTC--CACCCGTCCatgtcagt
gi|95093                      : TTATCCCCCGCCACCTCTCATAGA------GCC--AATC--G-GG-G-GATTTTAGAAATTGGCAG----C----G----TC----CTTC--CGTGTGTgt
gi|95094                      : TTATGCCCCACCACCACTCGTATA------GCA--GAGT--AAGG-G-GG-TATAGAAATCGGCTG----T----G----TC----CATC--AGT
gi|95095                      : TTATCCCCCGCCACCGCTCGTAG-------------------------------AGAAATGGACTG----C----G----TG----CGTC--CGTTCGT
gi|95096                      : TTATCTCCCGCCACCG-----AGA--------------------G-G-AA-TAAAGAAATGGGCTG----C----A----TC----TGTC--CGTGCATCCgtgtcc
gi|95097                      :           CCAGCGCTTGTAGA------GCG--AAGC--A-AG-GTGA-TATAGAAATGGCCCGCGTCC----G----TC----CGTC--CGTGCGTCC
gi|95098                      :                  TCGTAGA------GCG--GAGCA-G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TCTGTGCGTC--CGTGCGTgt
gi|95099                      :                       GA------GCGTTG-GC--G-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----CGTC--CGTGTGT
gi|95100                      :                                     AGC--A-GG-G-GA-TATAGAAATGGGCTG----C----G----TC----TGTC--TGTGTGTgcgt