lowQualScore : 111111111 2222 111 111 1111 111111 1111 222222222222222222222222222 22222222 1 1 1111 1 11 22 11111 1111 22222222
lowQualScore : 5 7 1 3 222222222 66 0 777 4 66 3 0 222 222 33 6666666 1 22 1111 666 4 1 666 22 22 1 1 3333 44444 66666666 22 44 3333 888 1 0 3 22 99999999999 999 777777 000000 1 3333 1 7 1 555555555555555555555555555 444 5 99 44 00000000 333 1 22 0 4 3333 6 11 2 6 6 6 2 4 333 77 2 55555 0 99999 33333 2 4 1111 5 44444444
lowQualScore : . . . . ......... .. . ... . .. . . ... ... .. ....... . .. .... ... . . ... .. .. . . .... ..... ........ .. .. .... ... . . . .. ........... ... ...... ...... . .... . . . ........................... ... . .. .. ........ ... . .. . . .... . .. . . . . . . ... .. . ..... . ..... ..... . . .... . ........
lowQualScore : 0 6 2 6 111111111 11 1 000 0 22 9 2 666 666 44 1111111 5 11 4444 222 1 5 222 11 00 4 9 0000 55555 66666666 99 33 3333 333 9 3 1 11 22222222222 666 444444 333333 6 0000 3 5 7 888888888888888888888888888 333 7 44 88 22222222 666 8 55 0 5 6666 8 77 4 0 0 5 1 0 555 88 0 00000 3 00000 77777 0 7 7777 3 44444444
consensus : TTAATTA-TTAAGANTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AA--A-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTA-TGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCA---GA---CACTTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCT--TGCGATAT---CANAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN--ATTTCTGT-T--GA---------T-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACTAA-TTGTGTNCGGTTACNA-TGGTAAAAT----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACAGT--ATC--GT-TA-G--TAACCGTATA--TACCAGCGTACCG-NCAGTAATTGTCAATAGTAAG-ANCATCAACAAACTANAGT-GTGCCGTAAAA-C---CCCC-AAC--A--ATATT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Reference ( gi|132457 ) : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AA--A-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTA-TGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCT--TGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GA---------T-TGT-A-TATC------TG-CG---CACACTAA-TTGTGCTCAGTTGCTA-TGGTAAAAT----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACAGT--ATC--AT-TA-G--CAACCGTATA--TACCA-CATACAG-ACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AATATCAGCGAACTAGAGT-ATGCCGTAAAA-C---CGGC-AAC--A--ATATT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132458 : TTATTTA-TTTAGACTTTAATTATTTTATTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAATTA---AA--A-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATAAGTGTTATTA-TGGTACTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCT--TGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------AGACTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GA---------T-TGT-A-TATC------AG-TG---CACACTAA-TTGTGCTCAGTTGCTA-TGGTAAAA-----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACGGT--ATC--AT-TA-G--CAACCGTGTA--TTCCA-CACACAA-ACAGTAATTGTCAATA-AAAG-AATATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAA-C---CCCC-AAC--A--ATATT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132460 : TTAATTA-TTAAGACTCCAGGCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AA--A-TAGT--AGTACCAAGTGT---ACGAGCGTTATTA-TGGCTCTTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCC--AGAGATAT---CATAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTCCCGC-T--GA---------C-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACCAA-CCGTGCCCAGTTGCTA-TGGTAATAT----TT-----TTAT--T-TG-----TAT--G-ACAGT--ACC--GT-TA-G--CAACCGTATA--TACCA-CACACAG-ACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AACATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGCAAAA-C---CGGC-AAC--A--ATATT---A-T-T---TTGTTGTCGGC----GC-GGC--A--CGTGACTTTAAA
gi|132459 : TTAATTA-TTGAGACTCCAGGCATTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AA--AATATT--AGTACCGATTGT---ACTAGCATTACTA-TGGTTCTTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCT--TGAGATAT---CATAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTCCCGC-T--GA---------T-TGT-T-TATC------TG-TG---CACACTAA-TTGTGCTCAGTTGCTA-TGGTAATA-----TT-----TTAT--T-TG-----TAT--G-ACAGT--ACC--GT-TA-G--CAACCGTATA--TACCA-CATACAG-AAAGTAATTGTCAATA-TATA-AATATCAACAAACTAAAGT-ATGCCGTAAAA-C---CAGC-AAC--A--ATATT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CTTGACTTAAAA
gi|132462 : TTAATTA-CCAAGAATTTAATCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATTTTGAGTCA---AA--A-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTA-TGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAGTGCAAATAAA-TTTGCT--TGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GA---------T-TTT-G-TATC------TG-TG---CACACTAA-TTGTGCTCAGTTGCTA-TGGTAATAT----TT-----TTAT--T-TG-----TAT--G-ACAGT--ATC--GT-TA-G--CAACCGTATA--TACCA-CATACAG-ACAGTAATT
gi|132461 : TTGATGA-TTAAGAATTTAATTATTTT-CTCTACCTTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTA---AA----CAGT--TATGTTGTGTGG---ATGAATATTCCTA-TGATAATTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCA---GA---CACTTTCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCT--AATGGTAT---CAAAAGT-G---TC--CG--A-TCCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATG--ATTTCTAT-T--GA---------T-TGC-A-TATC------TG-TG---CACACTAA-TTGTGCTCGGTTGCTC-TGGT-AAGT----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACAAT--ATT--GT-TA-C--TAACCGTGTA--TACCA-CATACCA-ACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AATATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAA-C---TCTC-AAC--A--ATATC---ATT-T---TTCTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTGTGACTTAAAA
gi|132463 : TTAATCA-TTAAGATTTGAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTT----AA--A-CAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGTGTTATTA-TGGTAGTTTACTATATGTAATA-CTATATGTAAGGCCA---GA---CAATTTTTCT----TATAGCGCAAA-AAA-TTTGCT--AATGATAT---CAAAAGT-A---TC--CG--A-CTCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACA--GA----ATG--A------T-T--GA-----------TGT-A-TACCACA---TA-CA---AACAGTAA-TTGT
gi|132464 : TAACTA-ATCAGAATTTGTTTATATTTCTTTACCTTGTTCAGCCTAGTGAT-ACT-----AT--A-TGCC--ACTATTAAGTGTTTAATGAACGCAACAA-CGGTTATTTACTATATG-------------TTAA-CCA---AA---AGCCTCCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTCCT--TATAGTAT---CAAAAGT-A---TC--TG--G-CTCAACC----A-----AA--------ACTTTCAACAGAAA----ATA--ATTTCTAT-T--AA---------T-CGT-A-AATC------TG-TA---CACACTAA-TTGTGCTAGGTTACCA-TG
gi|132465 : ATTAGTTACGA-TTTGTTTATATTTCTTTACCTTTTGCAGCTTAGTGATAACATATGCGACTA-TAAG--ATGGTTAA--------TGAATGTGACTA-TGGTTATTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCA---AA---CGCCCCCGCT----TATAGAGCAAATAAA-TTTGCT--TCTAGTAT---TAAAAGA-A---TC--TG--G-CTAAACC----T-----TA--------ACCACCAACA---A----ATC--ATTTCTAT-T--GA---------T-TGT-A-TATA------TA-C-----ACACTAA-TTGTGTTAGGTTACCA-TGGCGAAAT----TT-----T-AT--T-AA-----TAA--G-ATATT--ATC--GT-TA-G--CAATCTTATA--TACAA-CATACCA-TCGGTACTTGTCAATA-TAAG-AATATCAACAAACTAAAGT-ATGCCGTAAAA-CTCTCGGC-AAT-----ATTTT---A-T-TA--TTGTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TGTGACTTA
gi|132466 : AGTTA---------TGGTGAAATGTTAAAT------TGAGTGCAAATA-TGGCTATTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTA---AA---
gi|132467 : tcaaT---ATGTGTGATATTAATA-----TTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAA---CAC-----CG----TATAGCGCAAA-AGA--TTACT--T------------TTAGC-G---TCAGCGAAA-CTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT--AATTCTAC-T--GA---------G-AGTGG-TATC------TG-TA---CACTCTAA-TTGTGTATGGATACCA-TTGTATAAC----TC-----Taataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaa
gi|132468 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCT----TATAACGCAAATAAA-TTTACT--TATGGTAT---CAAAAGT-A---TC--CG--A-TACAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----TTG--ATTTCTGT-T--GA---------T-TGT-A-TATC------TG-TG---AACACTAA-TTGTGCTTGGTTGCTA-TGGTAAAA-----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACAAT--ATT--GT-TA-G--CAACCGTGTA--TACCA-CGTACAA-ACAGTAATTGTCACTA-TAAG-AATATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAA-C---CCGC-AAC--A--ATATT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GGTGACTTAAAAgt
gi|132469 : AAATCAATACATAAGGCCA----A---CACATT-GCTCTTATATAGGGCAAATTCA-TTTGCTAATAATAT-T---TATAAAT-G----------------AAGT----T-------------------TTAATCG-GT----ATGT-AAGCC--T-T--AA---------T-AGA-A-TA--------TA-AG---TACATTCATTTGTGTATGGTTACGA-TAAT-ATAT----CA-----TTATAAC-CG-----TAA--T-GC--T--ATC--GT-AT-G--TAATCTTATA--AACAG-CGTATCG-ACTGTAATGGTCATTA-T--GCACTATTAACAAACTA-ACTGATGCCATGAAT-C---C--CAAAC--A--ACATTTAAA-T-A---TTGTTGGTAGT----A
gi|132471 : ACCAATATTTTAAGTTA---AA---CAACGCTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCT--T---ATAT---TGTCAGC-GATATT--CG--A-CCTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AA----ATTT-AATTCTATCT--AA---------GGTGT---TATC------TG-AA---CACATTAA-TTGTGTGTGGTTACAA-TGGTAAAAT--------------------A-----TAA--GTAC-TT--ATC---T-TATG--TAACCATGTA--T-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA--ACCATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAA-C---C-CC-AAT--C--ATAGT---G-T-T---T
gi|132470 : ACCAATATTTTAAGCCA---AATTACACT---GCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCT--T---ATAT---TGTCAGC-AAGATT--CG--A-CCTAGATA---T-----GA--------ACTTTCGATAA-AA----TTT--AATTCTATCT--AA---------A-GAG-G-TGTC------TG-TA---CACACTAA-TTGTGTGTGGTTACAA-TGGTAGAAT----AC-----A-AT--T-------------G-ATAGTT-ATC---T-TATG--TAACCATATA--T-CCAGCGTACCA-TCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACCATCAACAAATTACAAT-GTGCTGTAAAA-C---C-CC-A----A--ACATA---A-T-G---T--TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132472 : ACCAATATTATAAGTCA---AA---CAACGCTGCT----CATAGCACAAATCGC-TTGGCT--TG---TAT---TGTCAGC-GATATT--CG--A-CTTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT--ATATCTA-----AA---------A-TGT---TATC------TG-TA---CATACTAA-TTCTGTATAGTTACAA-TGGTAAAATATAATTGGTAGTTATC-T-TA-----T---------GT--A-C--AT----G--TAACCATATA--T-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGCCAATAGTATA-ACCATCGACAGATTATATT-GTGCCGTAAAATC---C--C-AAT--C--ATA-----A-TGT---TCGGTGGTAGTG---AT-GA---A--C-TGGCTTA
gi|132473 : ACCAATATTTTAAGCCA---AA---TAACACTGCT----CATAGTGCAAATTAC-TTTGCT--T---ATAT---TGTCAGC-AAGATT--CG--A-CCTAAATA---T-----GA--------TTTTTCGATA---A----A----ATTT-----T--AA---------T-TCT-A-TCTAAAGAGGTGTCGTTACACATTAA-TTGTATGTGGTTAGAA-TGGTGAAAT---------------------------------ACAATTGATA--AT-TATG--TCACCGTATA--T-CCAGCGTACCA-TCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACCATCAACAAATTACAAT-GTGCCATAAAA-T---CCCA-AAC--A------T---A-T-G---T--TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132474 : ATATTTTAAGCC---------TACT---GCT----TATAGC--ATATTTA-TTTGCT--T---ATAT---TACCAGT-GAGATT--CG--G-CCTAAATATTGT-----GA--------ACCTCCAATAG-AA----TTT--AATTCTGT-C--GA---------A-ACT-AGTATC------TG-T-------ACTAA-TTGTGTATGGTTACAA-TGGTAAA-T----TA-----TTCT--T-T------CAA--G-AGA-T--ATT--GT-GT-G--TAACCTTATG--T-CCAGCATTCCA-CCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGT-GTGCCGTAAAA-C---CCCC-AACATA--ATTTC---A-T-A---TGGTTGGTGGT----A
gi|132475 : TATATCAAGCCA---GA---CGCCTCCGCT----TTTAGCGCAAAAAAAATGTGCG--TATAATAT---TAAAAGC-A---AC--TG--G-CTCAAAC----T-----AA--------ACCTTCAACAG-AA----ATC--ATTTCTAT-T--GA---------T-TGT-A-TATT------TA-TG---TACACAAA-TTGTGAAAGGTTACAA-TGGTGA
gi|132458 : GTTGAGTCG---GA---CACTTATG-------ATATCTCAAGCAAA-TTTATT--TGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACctatattatgccgtaaaac
gi|132460 : ttatttatttagactttaattattttattctaccttgtgcagccaaatgatgaattaaaatagtagtgttgagtgtataagtgttattatggtactttactatatgtaaaacctatatGTTGGGTCG---GA---CGCTTATG-------ATATCTCTGGCAAA-TTTATT--TGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACttgaagactcaacaggaatgatttctgttgattgtatatcagtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacggtatcattagcaaccgtgtattccacacacaaacagtaattgtcaataaaagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccccaacaatattatttttgttgctggtatggtacgtgacttaaaa
gi|132459 : ttaattattaagactccaggcactctactctaccttgtgcagccaaaatatgagttaaaatagtagtaccaagtgtacgagcgttattatggctctttgctatatgtaaaaactatatGTTGGGTCG---GA---CGCTTATG-------ATATCTCAAGCAAA-TTTATT--TGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-Cttgaaccctcaacaggaatgattcccgctgactgtatatctgtgcacaccaaccgtgcccagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtaccgttagcaaccgtatataccacacacagacagtaattgtcaatataagaacatcaacaaactagagtatgccgcaaaaccggcaacaatattattttgttgtcggcgcggcacgtgactttaaa
gi|132462 : ttaattattgagactccaggcattctactctaccttgtgcagccaaaatatgagttaaaaatattagtaccgattgtactagcattactatggttctttaatatgtgtaaaacctatatattacGTTGAGTCG---GA---CACTTATG-------ATATCTCAAGCAAA-TTTATT--TGCACTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACttgaaccctcaacaggaatgattcccgctgattgtttatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatattttatttgtatgacagtaccgttagcaaccgtatataccacatacagaaagtaattgtcaatatataaatatcaacaaactaaagtatgccgtaaaaccagcaacaatattattttgttgctggtatggtacttgacttaaaa
gi|132461 : ttaattaccaagaatttaatcactctactctaccttgtgcagccaaattttgagtcaaaatagtagtgttaagtgtatgagtgttattatggttctttactatatgtaaaacctgtatGTTGGATCG---GA---CACTTTTG-------ATACCATTAGCAAA-TTTATT--TGCGCTATAAGCGAAAGT-G---TC--TG--G-CCCAACttgaaccctcaacaggaatgatttctgttgattttgtatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtatcgttagcaaccgtatataccacatacagacagtaatt
gi|132464 : ttgatgattaagaatttaattattttctctaccttgtgcagccaagtgatgagttaaacagttatgttgtgtggatgaatattcctatgataatttactatatgtgatacctatatGTTGAGCCA---GA---TACTTTTG-------ATACTATAAGGAAA-TTTATT--TGCGCTAT---ctgaaccttcaacagaaatgatttctattgattgcatatctgtgcacactaattgtgctcggttgctctggtaagtttttatttgtaagacaatattgttactaaccgtgtataccacataccaacagtaattgtcaatataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaactctcaacaatatcatttttcttgctggtattgtaggtgtgacttaaaa
gi|132476 : taactaatcagaatttgtttatatttctttaccttgttcagcctagtgatactatatgccactattaagtgtttaatgaacgcaacaacggttatttactatatgttaaccaaaagcctccgcttTAAGTCA---AA---CAACGCTGCT----CATAGCGCAAATCGC-TTTGCT--TG---TAT---TGTCAGT-GATATT--CG--A-CCTAACTA---T-----AA--------ACTTGAGATAA-AA----TTT--AATTCTAT-CTAAA---------G-TGT---TATC------TG-TA---CATACTAA-TTGTGTATAGTTACAA-TGGTAAAAT----GTAA---TTAG--T-AG-----T----------T--ATC---T-TATG--TAACCATATA--T-CCAGCATGCCA-CCAATAATTGTCAATAGTATA-ACCATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAA-C---C-CC-AAT--C--ATAAT---G-T-T---TGGTcaaaactttcaacagaaaataatttctattaatcgtaaatctgtacacactaattgtgctaggttaccatg
gi|132477 : AGGCCA---AA---C-CCACTGTT----TATAGCGCAAATAAA-TCTGCT-----AATAG---TATCGAT-G--------G--AGTTTAACT----T-----AA--------AT----------------ATGTAAATTCTAT-T--GA---------T-TGTGG-TATT------TG-TG--------TAA---------GGTTACAA-CGGTATAA-----CT-----TTAC--T-AC-----TAT--G-ACAAT--AT----------------CGTATG--TA--A-CCTACAGTACAGTAAggtg
gi|132468 : CG---GA---TACTTTTG-------ATACCATAAGTAAA-TTTATT--TGCGTTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAAC
gi|132478 : atgtaatacctacAAGTTG---AC--CA--A-CTCGACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----TTG--ATCTCTGT-T--GA---------T-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACTAA-TTGTGCTCAGTTGATA-TGGTAAAA-----TT-----TTAT--T-TG-----TAA--G-ACAatacaacttgaaccttcaacagaattgatttctgttgattgtatatctgtgaacactaattgtgcttggttgctatggtaaaattttatttgtaagacaatattgttagcaaccgtgtataccacgtacaaacagtaattgtcactataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccgcaacaatattatttttgttgctggtattgtaggtgacttaaaa
gi|132466 : aactttctttgatgactaaaG--A-C-CAACG----T-----AT--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG--AATTCCAT-T--GA---------A-AGT-G-TATC------TG-TA---CACACTAT-TTGTGTTAGGTTACAA-TGGTATA-C----TT-----TTAT--C-AA-----TAA--A-ACAAT--ATC--GTATA----TAACCTTAAT--TACCT-TATATCA-TCAGTAATTGTCAATA-TAAG-AATATCAACAATCTAGCGT-ATGCCAT-CAA-C---TCTT-GAC--A--ATATTTA-G-T-TA--TTGTTGTTGGT----AT-GGTAAA--TTTGACGTAAA
gi|132479 : tcaaagttatggtgaaatgttaaattgagtgcaaatatggctattttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaaG--A-TTCAACT----T-----GAGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT--AATCATAA-T--GG---------T-TGT-A-T--C------TG-TA---CACGCTAG-TTGTGTTAAGT-ACAA-TGGTATAGT----TT-----TTATGATATA-----TGC--G-ATTAT--ATCGTAT-T-----TAATCTTATA---AACG-CATGCCG-TCAGAAATTGCCAATA-TAAT-AATATTAACAAACTAAAGT-ATGCCGTAAAA-C---CTT----C--A--ATACT---A-T-TTAATTGTTGTCGGT----TT-GGT--A--
gi|132458 : TCAACAG-AA----ATC--ATTCCTGT-T--GA---------
gi|132462 : ttatttatttagactttaattattttattctaccttgtgcagccaaatgatgaattaaaatagtagtgttgagtgtataagtgttattatggtactttactatatgtaaaacctatatgttaggccagacacttttgcttatagcgcaaataaatttgcttgagatatcataagtgtccgactcaacttgaagacTCAACAG-AA----ATC--ATTCCTGT-T--GA---------ttgtatatcagtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacggtatcattagcaaccgtgtattccacacacaaacagtaattgtcaataaaagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccccaacaatattatttttgttgctggtatggtacgtgacttaaaa
gi|132461 : ttaattaccaagaatttaatcactctactctaccttgtgcagccaaattttgagtcaaaatagtagtgttaagtgtatgagtgttattatggttctttactatatgtaaaacctgtatgttaggccagacacttttgcttatagtgcaaataaatttgcttgagatatcataagtgtccgactcaacttgaacccTCAATAG-AA----ATC--ATTTCTGT-T--GAAGGTTCAGGT-TGG-A-T------------CG---GACACT---TT-TG---A--TACCATTAGCAAA-------T-----TTAT--T-TGCGCTATAAGCG-AAAGT--GTC-----TG-GCCCAA-CATATAGGTATCA-CATATAG--TA--AATTATC---A-TAGG-AATATttttgtatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtatcgttagcaaccgtatataccacatacagacagtaatt
gi|132475 : ttgatgattaagaatttaattattttctctaccttgtgcagccaagtgatgagttaaacagttatgttgtgtggatgaTCAATAG-AA----ATG--ATTTCTGT-T--GA---------ttgcatatctgtgcacactaattgtgctcggttgctctggtaagtttttatttgtaagacaatattgttactaaccgtgtataccacataccaacagtaattgtcaatataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaactctcaacaatatcatttttcttgctggtattgtaggtgtgacttaaaa
gi|132480 : tatatcaagccagacgcctccgcttttagcgcaaaaaaaatgtgcgtataatattaaaagcaactggctcaaactaaacct-TGT---TATC------TG-AA---CACATTAA-TTGTGTGTGGTTACAA-TGGTAAAAT--------------------A-----TAA--GTAC-TT--ATC---T-TATG--TAACCATGTA--T-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA--ACCATCAACAATTTATGGT-GTGCCGTAAAA-C---C-CC-AAT--C--ATAGT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAAttgtatatttatgtacacaaattgtgaaaggttacaatggtgactatattatgccgtaaaac
gi|132481 : -TGT---TATC------TG-AA---CACATTAA-TTGTGTGTGGTAACAA-TGGTAAAAT--------------------A-----TAA--GTAC-TT--ATC---T-TATG--TAACCATGTA--T-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA--ACCATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAAGC---C--C-AAT--C--ATAGT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132463 : TGTA--TACCA-CATACAA-ACAGTAATTGT
gi|132482 : ttaatcattaagatttgaattattttactctaccttgtgcagccaaatgatgagttaaacagtagtgttgagtgtatgagtgttattatggtagtttactatatgtaatactatatgtaaggccagacaatttttcttatagcgcaaaaaatttgctaatgatatcaaaagtatccgactcaacctgaaccttcaacagaatgattgaTGTA--TACCA-CATACAA-ACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AATACCAACAGACTAGAGT-ATGCCGTAAAA-C---CCGC-AAC--A--ATATT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GGTGAATTAAAA
gi|132483 : ACTATATT-ATGCCGTAAAA-C---CCTC-AAC--ATTTTTTT---A-T-TA--TTGTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TGTGTCTTAAA
gi|132459 : A-C---CAGC-AAC--A--AAATA---A-T-A---TTGTTGCTGGT----
Alignments
lowQualScore : 1111 111111 1111 111 11111 111 1111111 1 1 11 1 111111111111111 1111 22222222
lowQualScore : 4 5 0 2 777 44 55 777 1 0 1 3 2 1 333 33 4444 2 9999 2 55 666666 22 22 1 2222 44444 66666666 1 55555 44 666 1 5 22 55 000 1 3 22 44 1 66666 666666 2 5 111 44 7 2 8888888 1 1 2 22 66 0 1 3 2 4 0 55555 666666666666666 1 1111 5 00000000
lowQualScore : . . . . ... .. .. ... . . . . . . ... .. .... . .... . .. ...... .. .. . .... ..... ........ . ..... .. ... . . .. .. ... . . .. .. . ..... ...... . . ... .. . . ....... . . . .. .. . . . . . . ..... ............... . .... . ........
lowQualScore : 4 3 1 2 000 77 55 000 2 5 0 3 9 6 333 11 2222 0 7777 0 77 666666 66 55 7 4444 33333 33333333 7 55555 44 666 2 2 44 22 222 6 3 22 66 0 99999 000000 9 7 444 88 4 0 5555555 6 9 0 22 66 9 0 0 0 1 2 00000 111111111111111 0 7777 0 33333333
consensus : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGA---CACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATATC-AN-AAGCG----TC--CG--ACCCA-ACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Reference ( family-699 ) : TTAATTA-TTAAGANTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGA---CACTTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGCGATATC-AN-AAGCG----TC--CG--ACCCA-ACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132457 : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATC-AT-AAGTG----TC--CG--ACTCA-ACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132458 : TTATTTA-TTTAGACTTTAATTATTTTATTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAATTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATAAGTGTTATTATGGTACTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATC-AT-AAGTG----TC--CG--ACTCA-ACT----T-----GA--------AGACTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATA-A-AAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132459 : TTAATTA-TTGAGACTCCAGGCATTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAAATATT--AGTACCGATTGT---ACTAGCATTACTATGGTTCTTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATC-AT-AAGCG----TC--CG--ACCCA-ACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAT-TGT-T-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATA-TT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA--TATAAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCAGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CTTGACTTAAAA
gi|132460 : TTAATTA-TTAAGACTCCAGGCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTACCAAGTGT---ACGAGCGTTATTATGGCTCTTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATATC-AT-AAGCG----TC--CG--ACCCA-ACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAC-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAACATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGCAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGTCGGC----GC-GGC--A--CGTGACTTTAAA
gi|132461 : TTGATGA-TTAAGAATTTAATTATTTT-CTCTACCTTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTA---AA--CAGT--TATGTTGTGTGG---ATGAATATTCCTATGATAATTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGA---CACTTTCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTATC-AA-AAGTG----TC--CG--ATCCA-ACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTAT-T--GAT-TGC-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACTCTCAAC--A--ATA--TC---ATT-T---TTCTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTGTGACTTAAAA
gi|132462 : TTAATTA-CCAAGAATTTAATCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATTTTGAGTCA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATC-AT-AAGTG----TC--CG--ACTCA-ACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TTT-G-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|132463 : TTAATCA-TTAAGATTTGAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTT----AAA-CAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTAGTTTACTATATGTAATA-CTATATGTAAGGCCAGA---CAATTTTTCT----TATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATATC-AA-AAGTA----TC--CG--ACTCA-ACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG--A----ATG-A--------T-T--GA--TGT-A-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|132464 : TAACTA-ATCAGAATTTGTTTATATTTCTTTACCTTGTTCAGCCTAGTGAT-ACT-----ATA-TGCC--ACTATTAAGTGTTTAATGAACGCAACAACGGTTATTTACTATATGTTAA-CCAA------AAGCC----------TCCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTATC-AA-AAGTA----TC--TG--GCTCA-ACC----A-----AA--------ACTTTCAACAGAAA----ATA-AT--TTCTAT-T--AAT-CGT-A-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATG
gi|132465 : ATTAGTTACGA-TTTGTTTATATTTCTTTACCTTTTGCAGCTTAGTGATAACATATGCGAC-TA-T--AA-GATG-GTTA---ATGAATGTGACTATGGTTATTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAA---CGCCCCCGCT----TATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTATT-AA-AAGAA----TC--TG--GCTAA-ACC----T-----TA--------ACCACCAAC---AA----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACTCTCGGC--A--ATATTTT---A-T-TA--TTGTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TGTGACTTA
gi|132466 : AGTTA-------TGGTGAAATGTTAAAT------TGAGTGCAAATATGGCTATTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTAAA---
gi|132466 : tcaaCCA-ACG----T-----AT--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG-AA--TTCCAT-T--GAA-AGT-G-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGT-ATACTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAATCTAGCGTA-TGCCAT-CAACTCTTGAC--A--ATA--TTTA-G-T-TA--TTGTTGTTGGT----AT-GGTAAA--TTTGACGTAAAaataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaa
gi|132467 : tcaaagttatggtgaaatgttaaattgagtgcaaatatggctattttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAG---CAACACCG------TATAGCGCAAA-AGA--TTACTT------TT-----AGCG----TCAGCGAAACTCA-GCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT-AA--TTCTAC-T--GAG-AGTGG-TATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|132468 : tatgtgtgatattaataATGTAATACC--TACGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCT----TATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTATC-AA-AAGTA----TC--CG--ATACA-ACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----TTG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GGTGACTTAAAAgt
gi|132469 : AAATCAATACATAAGGCCA-A---CACAT-TGCTCTTATATAGGGCAAATTCA-TTTGCTAATAATATTTAT-AAATGAAGTTT--TA--ATCGGTATG----T-----AA--------GCCTT-AATAG-AAT---ATA-A------------------GT-A-CATT-CAT-----------TTGTGTATGGTTACGATAATATA-TCA--TTATAAC-CGTAAT-GC---T--ATCGT-AT-------GTAATCTTATA-AACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTATGC---ACTATTAACAAACTA-ACTGATGCCAT-GAATCCCAAAC--A--ACA--TTTAAA-T-A---TTGTTGGTAGT----A
gi|132470 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACT---GCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTGTC-AGCAAG-A----TT--CG--ACCTA-GATA---T-----GA--------ACTTTCGATAA-AA----TTT-AA--TTCTATCT--AAA-GAG-G-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCTGTAAAACCCCAAAC-----ATA--AT---G-T--------TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132471 : ACCAATATTTTAAGTTAAA---CAACGCTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATATT-GT-CAGCGATA-TT--CG--ACCTA-ACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T-T---T
gi|132472 : ACCAATATTATAAGTCAAA---CAACGCTGCT----CATAGCACAAATCGC-TTGGCTTG---TATT-GT-CAGCGATA-TT--CG--ACTTA-ACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT-AT--ATCTA-----AAA-TGT---TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATA-GTATAACCATCGACAGATTATATTG-TGCCGTAAAA-TCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TCGGTGGTAGTG---AT-GA---A--C-TGGCTTA
gi|132473 : ACCAATATTTTAAGCCAAA---TAACACTGCT----CATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTGTC-AGCAAG-A----TT--CG--ACCTA-AATA---T-----GA--------TTTTTCGATA--AA----ATT-TTAATTCTATCT--AAA-GAG-G-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCCATAAAATCCCAAAC--A--------T---A-T-G---T--TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132474 : ATATTTTAAGCC---------TACTGCT----TATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATATT-AC-CAGTGAGA-TT--CG--GCCTA-AATATTGT-----GA--------ACCTCCAATAG-AA----TTT-AA--TTCTGT-C--GAA-ACT-AGTATC-TGT------ACTAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATA-GTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTG-TGCCGTAAAACCCCCAACATA--ATT--TC---A-T-A---TGGTTGGTGGT----A
gi|132475 : TATATCAAGCCAGA---CGCCTCCGCT----TTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATATT-AA-AAGCA----AC--TG--GCTCA-AAC----T-----AA--------ACCTTCAACAG-AA----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGA
gi|132476 : TAAGTCAAA---CAACGCTGCT----CATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTGTC-AG-TGATA----TT--CG--ACCTA-ACTA---T-----AA--------ACTTGAGATAA-AA----TTT-AA--TTCTAT-CTAAAG-TGT---TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATA-GTATAACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TTGGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|132477 : AGGCCAAA---C-CCACTGTT----TATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTATC-GA-TGGAG----TT--T-------A-ACT----T-----AA--------AT-----ATGT-AA----AT-------TCTAT-T--GAT-TGT-GGTAT----------------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACC
gi|132478 : C--CA--ACTCG-ACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----TTG-AT--CTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAtacagtacagtaa
gi|132479 : aactttctttgatgactaaaaagttgaG--ATTCA-ACT----T-----GAGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT-AA--TCATAA-T--GGT-TGT-A-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA--TAATAATATTAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCTT---C--A--ATA--CT---A-T-TTAATTGTTGTCGGT----TT-GGT--A--
gi|132480 : -TGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAATTTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132481 : -TGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-GCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132482 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATACCAACAGACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GGTGAATTAAAA
gi|132483 : ACTATATTA-TGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTTTT--TT---A-T-TA--TTGTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TGTGTCTTAAA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111 11111 111 1111111 1 1 11 1 111111111111111 1111 22222222
lowQualScore : 4 5 0 2 777 44 55 777 1 0 1 4 2 1 222 4444 1 8888 22 1 55 444444 22 22 0 2222 44444 66666666 1 33333 555555 3333 5 22 44 88 1 22 44 1 66666 666666 2 5 111 44 7 2 8888888 1 1 2 22 66 0 1 3 2 4 0 55555 666666666666666 1 1111 5 00000000
lowQualScore : . . . . ... .. .. ... . . . . . . ... .... . .... .. . .. ...... .. .. . .... ..... ........ . ..... ...... .... . .. .. .. . .. .. . ..... ...... . . ... .. . . ....... . . . .. .. . . . . . . ..... ............... . .... . ........
lowQualScore : 4 7 1 2 000 77 55 000 2 5 0 1 9 2 000 2222 9 1111 66 9 55 555555 66 55 5 4444 33333 33333333 7 77777 222222 7777 2 44 22 66 6 22 66 0 99999 000000 9 7 444 88 4 0 5555555 6 9 0 22 66 9 0 0 0 1 2 00000 111111111111111 0 7777 0 33333333
consensus : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Reference ( family-699 ) : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132457 : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132458 : TTATTTA-TTTAGACTTTAATTATTTTATTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAATTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATAAGTGTTATTATGGTACTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATA-A-AAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132459 : TTAATTA-TTGAGACTCCAGGCATTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAAATATT--AGTACCGATTGT---ACTAGCATTACTATGGTTCTTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCG----C-T--GAT-TGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATA-TT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA--TATAAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCAGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CTTGACTTAAAA
gi|132460 : TTAATTA-TTAAGACTCCAGGCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTACCAAGTGT---ACGAGCGTTATTATGGCTCTTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCG----C-T--GAC-TGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAACATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGCAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGTCGGC----GC-GGC--A--CGTGACTTTAAA
gi|132461 : TTGATGA-TTAAGAATTTAATTATTTT-CTCTACCTTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTA---AA--CAGT--TATGTTGTGTGG---ATGAATATTCCTATGATAATTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTA--TC-AA-AAGT-G---TC--CGA--TCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACTCTCAAC--A--ATA--TC---ATT-T---TTCTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTGTGACTTAAAA
gi|132462 : TTAATTA-CCAAGAATTTAATCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATTTTGAGTCA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|132463 : TTAATCA-TTAAGATTTGAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTT----AAA-CAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTAGTTTACTATATGTAATA-CTATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCT----TATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--CTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----ATG---------A----T-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|132464 : TAACTA-ATCAGAATTTGTTTATATTTCTTTACCTTGTTCAGCCTAGTGAT-ACT-----ATA-TGCC--ACTATTAAGTGTTTAATGAACGCAACAACGGTTATTTACTATATGTTAA--------------CCAAAAGCCTCCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--TGG--CTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----ATA-AT--TTCTA----T-T--AAT-CGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATG
gi|132465 : ATTAGTTACGA-TTTGTTTATATTTCTTTACCTTTTGCAGCTTAGTGATAACATATGCGAC-TA-T--AA-GATG-GTTA---ATGAATGTGACTATGGTTATTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCT----TATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTA--TT-AA-AAGA-A---TC--TGG--CTAAACC----TT-----A--------ACCACCAAC---AA----ATC-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACTCTCGGC--A--ATATTTT---A-T-TA--TTGTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TGTGACTTA
gi|132466 : AGTTA-------TGGTGAAATGTTAAAT------TGAGTGCAAATATGGCTATTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTAAA
gi|132466 : tcaaCCAACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG-AA--TTCCA----T-T--GAA-AGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGT-ATACTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAATCTAGCGTA-TGCCAT-CAACTCTTGAC--A--ATA--TTTA-G-T-TA--TTGTTGTTGGT----AT-GGTAAA--TTTGACGTAAAaataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaa
gi|132467 : tcaaagttatggtgaaatgttaaattgagtgcaaatatggctattttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG------TATAGCGCAAA-AGA-TT-ACTTTT-------------AGC-G---TCAGCGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT-AA--TTCTA----C-T--GAG-AGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|132468 : tatgtgtgatattaataATGTAATACC--TACGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--TACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----TTG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GGTGACTTAAAAgt
gi|132469 : AAATCAATACATAAGGCCA-ACACAT-TGCTCTTATATAGGGCAAATTCA-TTTGCTAATAATA--TTTAT-AAA--------------------------TG-----A--------AGTTTTAATCG-GT----ATG--------TAAGCCT-T--AAT-AGAA-TATA-AGTAC--ATTC-ATTTGTGTATGGTTACGATAATATA-TCA--TTATAAC-CGTAAT-GC---T--ATCGT-AT-------GTAATCTTATA-AACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTATGC---ACTATTAACAAACTA-ACTGATGCCAT-GAATCCCAAAC--A--ACA--TTTAAA-T-A---TTGTTGGTAGT----A
gi|132470 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----TTT-AA--TTCTA----TCT--AAA-GAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCTGTAAAACCCCAAAC-----ATA--AT---G-T--------TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132471 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATA--TT-GT-CAGC-GATATT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTA----TCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T-T---T
gi|132472 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCACAAATCGC-TTGGCTTGTATTG--TC-AG-CGAT-A---TT--CGA--CTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT-AT--ATCTA---------AAA-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATA-GTATAACCATCGACAGATTATATTG-TGCCGTAAAA-TCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TCGGTGGTAGTG---AT-GA---A--C-TGGCTTA
gi|132473 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCT----CATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----ATT-TTAATTCTA----TCT--AAA-GAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCCATAAAATCCCAAAC--A--------T---A-T-G---T--TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132474 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCT----TATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATA--TT-AC-CAGT-GAGATT--CGG--CCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----TTT-AA--TTCTG----T-C--GAA-ACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATA-GTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTG-TGCCGTAAAACCCCCAACATA--ATT--TC---A-T-A---TGGTTGGTGGT----A
gi|132475 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCT----TTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATA--TT-AA-AAGC-A---AC--TGG--CTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATC-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGA
gi|132476 : TAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTG--TC-AG-TGAT-A---TT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----TTT-AA--TTCTA----T-CTAAAG-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATA-GTATAACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TTGGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|132477 : AGGCCAAAC-CCACTGTT----TATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTA--TC-GA-TGGA-G---T---------TTAACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTA----T-T--GAT-TGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACC
gi|132478 : AA-CTTTCTT-TGATGACTA-AA-AAGTTG---AC--CAA--CTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----TTG-AT--CTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAtacagtacagtaa
gi|132479 : GA--TTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT-AA--TCATA----A-T--GGT-TGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA--TAATAATATTAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCTT---C--A--ATA--CT---A-T-TTAATTGTTGTCGGT----TT-GGT--A--
gi|132480 : -TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAATTTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132481 : -TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-GCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132482 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATACCAACAGACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GGTGAATTAAAA
gi|132483 : ACTATATTA-TGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTTTT--TT---A-T-TA--TTGTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TGTGTCTTAAA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111 11111 111 1111111 1 1 11 1 111111111111111 1111 22222222
lowQualScore : 4 5 0 2 777 44 55 777 1 0 1 4 2 1 222 4444 1 8888 22 1 55 444444 22 22 0 2222 44444 66666666 1 33333 666666 3333 5 22 44 88 1 22 44 1 66666 666666 2 5 111 44 7 2 8888888 1 1 2 22 66 0 1 3 2 4 0 55555 666666666666666 1 1111 5 00000000
lowQualScore : . . . . ... .. .. ... . . . . . . ... .... . .... .. . .. ...... .. .. . .... ..... ........ . ..... ...... .... . .. .. .. . .. .. . ..... ...... . . ... .. . . ....... . . . .. .. . . . . . . ..... ............... . .... . ........
lowQualScore : 4 7 1 2 000 77 55 000 2 5 0 1 9 2 000 2222 9 1111 66 9 55 555555 66 55 5 4444 33333 33333333 7 77777 333333 7777 2 44 22 66 6 22 66 0 99999 000000 9 7 444 88 4 0 5555555 6 9 0 22 66 9 0 0 0 1 2 00000 111111111111111 0 7777 0 33333333
consensus : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Reference ( family-699 ) : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132457 : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132458 : TTATTTA-TTTAGACTTTAATTATTTTATTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAATTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATAAGTGTTATTATGGTACTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATA-A-AAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132459 : TTAATTA-TTGAGACTCCAGGCATTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAAATATT--AGTACCGATTGT---ACTAGCATTACTATGGTTCTTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCG----C-T--GAT-TGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATA-TT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA--TATAAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCAGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CTTGACTTAAAA
gi|132460 : TTAATTA-TTAAGACTCCAGGCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTACCAAGTGT---ACGAGCGTTATTATGGCTCTTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCG----C-T--GAC-TGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAACATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGCAAAACCGGCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGTCGGC----GC-GGC--A--CGTGACTTTAAA
gi|132461 : TTGATGA-TTAAGAATTTAATTATTTT-CTCTACCTTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTA---AA--CAGT--TATGTTGTGTGG---ATGAATATTCCTATGATAATTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTA--TC-AA-AAGT-G---TC--CGA--TCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACTCTCAAC--A--ATA--TC---ATT-T---TTCTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTGTGACTTAAAA
gi|132462 : TTAATTA-CCAAGAATTTAATCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATTTTGAGTCA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|132463 : TTAATCA-TTAAGATTTGAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTT----AAA-CAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTAGTTTACTATATGTAATA-CTATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCT----TATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--CTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----ATG---------A----T-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|132464 : TAACTA-ATCAGAATTTGTTTATATTTCTTTACCTTGTTCAGCCTAGTGAT-ACT-----ATA-TGCC--ACTATTAAGTGTTTAATGAACGCAACAACGGTTATTTACTATATGTTAA--------------CCAAAAGCCTCCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--TGG--CTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----ATA-AT--TTCTA----T-T--AAT-CGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATG
gi|132465 : ATTAGTTACGA-TTTGTTTATATTTCTTTACCTTTTGCAGCTTAGTGATAACATATGCGAC-TA-T--AA-GATG-GTTA---ATGAATGTGACTATGGTTATTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCT----TATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTA--TT-AA-AAGA-A---TC--TGG--CTAAACC----TT-----A--------ACCACCAAC---AA----ATC-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACTCTCGGC--A--ATATTTT---A-T-TA--TTGTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TGTGACTTA
gi|132466 : AGTTA-------TGGTGAAATGTTAAAT------TGAGTGCAAATATGGCTATTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTAAA
gi|132466 : tcaaCCAACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG-AA--TTCCA----T-T--GAA-AGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGT-ATACTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAATCTAGCGTA-TGCCAT-CAACTCTTGAC--A--ATA--TTTA-G-T-TA--TTGTTGTTGGT----AT-GGTAAA--TTTGACGTAAAaataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaa
gi|132467 : tcaaagttatggtgaaatgttaaattgagtgcaaatatggctattttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG------TATAGCGCAAA-AGA-TT-ACTTTT-------------AGC-G---TCAGCGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT-AA--TTCTA----C-T--GAG-AGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|132468 : tatgtgtgatattaataATGTAATACC--TACGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--TACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----TTG-AT--TTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GGTGACTTAAAAgt
gi|132469 : AAATCAATACATAAGGCCA-ACACAT-TGCTCTTATATAGGGCAAATTCA-TTTGCTAATAATA--TTTAT-AAA--------------------------TG-----A--------AGTTTTAATCG-GT----ATG--------TAAGCCT-T--AAT-AGAA-TATA-AGTAC--ATTC-ATTTGTGTATGGTTACGATAATATA-TCA--TTATAAC-CGTAAT-GC---T--ATCGT-AT-------GTAATCTTATA-AACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTATGC---ACTATTAACAAACTA-ACTGATGCCAT-GAATCCCAAAC--A--ACA--TTTAAA-T-A---TTGTTGGTAGT----A
gi|132470 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----TTT-AA--TTCTA----TCT--AAA-GAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCTGTAAAACCCCAAAC-----ATA--AT---G-T--------TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132471 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATA--TT-GT-CAGC-GATATT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTA----TCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T-T---T
gi|132472 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCACAAATCGC-TTGGCTTGTATTG--TC-AG-CGAT-A---TT--CGA--CTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT-AT--ATCTA---------AAA-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATA-GTATAACCATCGACAGATTATATTG-TGCCGTAAAA-TCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TCGGTGGTAGTG---AT-GA---A--C-TGGCTTA
gi|132473 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCT----CATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----ATT-TTAATTCTA----TCT--AAA-GAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCCATAAAATCCCAAAC--A--------T---A-T-G---T--TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132474 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCT----TATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATA--TT-AC-CAGT-GAGATT--CGG--CCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----TTT-AA--TTCTG----T-C--GAA-ACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATA-GTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTG-TGCCGTAAAACCCCCAACATA--ATT--TC---A-T-A---TGGTTGGTGGT----A
gi|132475 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCT----TTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATA--TT-AA-AAGC-A---AC--TGG--CTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATC-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGA
gi|132476 : TAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTG--TC-AG-TGAT-A---TT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----TTT-AA--TTCTA----T-CTAAAG-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATA-GTATAACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA-------A-TGT---TTGGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|132477 : AGGCCAAAC-CCACTGTT----TATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTA--TC-GA-TGGA-G---T---------TTAACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTA----T-T--GAT-TGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACC
gi|132478 : AA-CTTTCTT-TGATGACTA-AA-AAGTTG---AC--CAA--CTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----TTG-AT--CTCTG----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAtacagtacagtaa
gi|132479 : GA--TTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT-AA--TCATA----A-T--GGT-TGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA--TAATAATATTAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCTT---C--A--ATA--CT---A-T-TTAATTGTTGTCGGT----TT-GGT--A--
gi|132480 : -TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAATTTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132481 : -TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-GCCCAAT--C--ATA--GT---G-T--------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132482 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATACCAACAGACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAAC--A--ATA--TT---ATT-T---TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GGTGAATTAAAA
gi|132483 : ACTATATTA-TGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTTTT--TT---A-T-TA--TTGTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TGTGTCTTAAA
blockSeqs : G C A TGC AA GA TTA T C T G G TTT CTTA A GAGA AC T GC CGATA AG AA ATTG GATGA GTGTATAA A TTTAA TTTAA AGCC C TA GG GG A AA TC T TGTAA GATATA A T AGT TG A A TGTACAT G T A AA TG G A G A C ATA TTTTATTA C AGAA A TAGGTG
blockSeqs : . C A . A . . C C T A G TTT . . GAGA . . GC TGAGA . . A . . . A TTAA . C . T AG . . TC T TTT AACCG T T GG T G . T G A T GA A A A A . C ATT TTTAGTTA C AGAA A TAAATG
blockSeqs : . C A . A . . C C T G G TTT . . GAGA . . T TTG . . A . . . A GAT . C . T A . . CC T TTT TTG T T AG . G . T G A G GA G G A G . C A TTTAAATA T G . TAAATT
blockSeqs : . A A . A . . T A T G G TTT . . ATGG . . T TG . . A . . . A GAT . . . C T . . TC T TTT TTG A . AG . G . T G A G AA G G A G . C A CTATTTAA C . . TAAATG
blockSeqs : . A A . A . . T C T G G TTT . . GAGA . . T CG . . A . . . A GAT . . . T A . . TC T CTT TTG T . AA . G . T G A G GA G G A A . C A TTATTT T . . TAAAC
blockSeqs : . T T . A . . T G T G G TTT . . ATGA . . A CG . . A . . . A GAT . . . T A . . TA C CTC TTG A . AG . G . T T A G AT G G A G . C A TCATTT T . . TAAAC
blockSeqs : . A T . C . . C A T A A CTC . . ATAG . . T TG . . . . . . A GAT . . . T G . . TA C TCA TTG A . AT . G . T T A G AT G G A G . C A TTATTT C . . TACG
blockSeqs : . . . . . . . T A A A A CCC . . CTAG . . A TG . . . . . . A AAT . . . T A . . TA A TAT TAA A . AA . G . . G A G AA G A C C . T A TTATTT G . . TACT
blockSeqs : . . . . T A A A A CAC . . ATGG . . A TA . . . . . . A CAT . . . A A . . AT C TTA CAA A . AA . G . . T A G GA G A C T . C A TTATTA G . . CACG
blockSeqs : A G A TTT . . ATAA . . A TA . . . . . . T GAA . . . G A . . TT T TTT TTG A . AA . A . . A A G AT G T C T . T A TTATT G . . TAGG
blockSeqs : A A G CAC . . ATAT . . A AA . . . . . . T TAA . . . T G . . AT G TT TGG A . AA . G . . A A G AC . G C C . C C TTATT G . . TAGG
blockSeqs : A T A CGC . . GTAT . . T CG . . . . . . T GAT . . . T A . . GT A TT TAG T . TA . G . . A . G AC . . C A . C C GTGTT G . . AC
blockSeqs : A T A CGC . . ATAT . . T TA . . . . . . A TAA . . . A A . . GT A TT TAC A . T . G . . G . . AT . . C T . C A TCATA G . . AC
blockSeqs : A T A CAC . . ATAA . . G TA . . . . . . T TAT . . . A G . . AT A TT TTG C . G . . . . T . . AC . . C A . C C ATGT T . . AC
blockSeqs : . T A CTC . . GTAT . . C CA . . . . . . A TAA . . . A G . . GT A TA TA A . A . . . . A . . AC . . A T . . A ATGT A . .
blockSeqs : . T G CGC . . ATAG . . A TA . . . . . . A CAT . . . A A . . AT A CT TT A . T . . . . T . . GT . . C T . . C TATG A .
blockSeqs : A A CAC . . TGA . . G AG . . . . . . T TAA . . . T G . . AA A TT TA . . T . . . . A . . AC . . C G . . C ATGT C .
blockSeqs : . A AT . . TT . . A A . . . . . . A GAT . . . G A . . AT A T TA . . . . . . . A . . AC . . A T . . A GTGT G
blockSeqs : . . . . A . . A A . . . . . . T TAA . . . T A . . AA A . T . . . . . . . . . AA . . . . GTGT
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . A G . . . T . . . TC T . . . .
blockSeqs : . . . . . T G . . . T . . . TA A .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . GT A
blockSeqs : . . . GT A
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : G* TTATTT*********
originalCons : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATA--TT---A-T-T---TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
finalCons : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTA----T-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATAG-TAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC--A--ATATTATTT---------TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111 11111 111 1111111 1 1 11 1 11111111111111 1111 22222222
lowQualScore : 4 5 0 2 777 44 55 777 1 0 1 4 2 1 222 4444 1 8888 22 1 55 444444 22 22 0 2222 44444 66666666 1 555555 44444 3333 5 22 44 88 1 22 44 1 66666 666666 2 5 111 44 7 2 8888888 1 1 2 22 66 0 1 3 2 4 0 444 22222222222222 1 1111 5 00000000
lowQualScore : . . . . ... .. .. ... . . . . . . ... .... . .... .. . .. ...... .. .. . .... ..... ........ . ...... ..... .... . .. .. .. . .. .. . ..... ...... . . ... .. . . ....... . . . .. .. . . . . . . ... .............. . .... . ........
lowQualScore : 4 7 1 2 000 77 55 000 2 5 0 1 9 2 000 2222 9 1111 66 9 55 555555 66 55 5 4444 33333 33333333 7 555555 55555 7777 2 44 33 66 6 22 66 0 99999 000000 9 7 444 88 4 0 5555555 6 9 0 22 66 9 0 0 0 1 2 777 00000000000000 0 7777 0 33333333
consensus : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTA----T-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAACA--ATA--TT--ATTT----TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
Reference ( family-699 ) : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGCGTTACTATGGTTNTTTACTATATGTAAAACCNATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATA--TC-AN-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTA----T-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCGNCAGTAATTGTCAATA-GTAAGANCATCAACAAACTANAGTG-TGCCGTAAAACCCCCAACA--ATA--TT--ATTT----TTGTTGNTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132457 : TTAATTA-TTAAGACTTTAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTG----T-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCGGCAACA--ATA--TT--A-TT----TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132458 : TTATTTA-TTTAGACTTTAATTATTTTATTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAATTA---AAA-TAGT--AGTGTTGAGTGT---ATAAGTGTTATTATGGTACTTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTG----T-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATA-A-AAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCCCAACA--ATA--TT--ATTT----TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CGTGACTTAAAA
gi|132459 : TTAATTA-TTGAGACTCCAGGCATTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAAATATT--AGTACCGATTGT---ACTAGCATTACTATGGTTCTTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCG----C-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATA-TT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA--TATAAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCAGCAACA--ATA--TT--A-TT----TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--CTTGACTTAAAA
gi|132460 : TTAATTA-TTAAGACTCCAGGCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAAATATGAGTTA---AAA-TAGT--AGTACCAAGTGT---ACGAGCGTTATTATGGCTCTTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATA--TC-AT-AAGC-G---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCG----C-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA--TAAGAACATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGCAAAACCGGCAACA--ATA--TT--A-TT----TTGTTGTCGGC----GC-GGC--A--CGTGACTTTAAA
gi|132461 : TTGATGA-TTAAGAATTTAATTATTTT-CTCTACCTTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTA---AA--CAGT--TATGTTGTGTGG---ATGAATATTCCTATGATAATTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTA--TC-AA-AAGT-G---TC--CGA--TCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTA----T-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACTCTCAACA--ATA--TC--ATTT----TTCTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTGTGACTTAAAA
gi|132462 : TTAATTA-CCAAGAATTTAATCACTCTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATTTTGAGTCA---AAA-TAGT--AGTGTTAAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTTCTTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATA--TC-AT-AAGT-G---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTG----T-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|132463 : TTAATCA-TTAAGATTTGAATTATTTTACTCTACCTTGTGCAGCCAAATGATGAGTT----AAA-CAGT--AGTGTTGAGTGT---ATGAGTGTTATTATGGTAGTTTACTATATGTAATA-CTATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCT----TATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--CTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----A-TG--------A----T-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|132464 : TAACTA-ATCAGAATTTGTTTATATTTCTTTACCTTGTTCAGCCTAGTGAT-ACT-----ATA-TGCC--ACTATTAAGTGTTTAATGAACGCAACAACGGTTATTTACTATATGTTAA--------------CCAAAAGCCTCCGCT----TATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--TGG--CTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTA----T-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATG
gi|132465 : ATTAGTTACGA-TTTGTTTATATTTCTTTACCTTTTGCAGCTTAGTGATAACATATGCGAC-TA-T--AA-GATG-GTTA---ATGAATGTGACTATGGTTATTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCT----TATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTA--TT-AA-AAGA-A---TC--TGG--CTAAACC----TT-----A--------ACCACCAAC---AA----A-TCAT--TTCTA----T-T--GA-TTGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA--TAAGAATATCAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACTCTCGGCA--ATATTTT--ATTA----TTGTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TGTGACTTA
gi|132466 : AGTTA-------TGGTGAAATGTTAAAT------TGAGTGCAAATATGGCTATTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTAAA
gi|132466 : tcaaCCAACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCA----T-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGT-ATACTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA--TAAGAATATCAACAATCTAGCGTA-TGCCAT-CAACTCTTGACA--ATA--TTTAGTTA----TTGTTGTTGGT----AT-GGTAAA--TTTGACGTAAAaataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaa
gi|132467 : tcaaagttatggtgaaatgttaaattgagtgcaaatatggctattttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG------TATAGCGCAAA-AGA-TT-ACTTTT-------------AGC-G---TCAGCGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTA----C-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|132468 : tatgtgtgatattaataATGTAATACC--TACGTTAGGCCAGACACTTTTGCT----TATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTA--TC-AA-AAGT-A---TC--CGA--TACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTG----T-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA--TAAGAATATCAACAAACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAACA--ATA--TT--ATTT----TTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GGTGACTTAAAAgt
gi|132469 : AAATCAATACATAAGGCCA-ACACAT-TGCTCTTATATAGGGCAAATTCA-TTTGCTAATAATA--TTTAT-AAA--------------------------TG-----A--------AGTTTTAATCG-GT----A-TG-------TAAGCCT-T--AA-TAGAA-TATA-AGTAC--ATTC-ATTTGTGTATGGTTACGATAATATA-TCA--TTATAAC-CGTAAT-GC---T--ATCGT-AT-------GTAATCTTATA-AACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTATGC---ACTATTAACAAACTA-ACTGATGCCAT-GAATCCCAAACA--ACA--TTTAAATA----TTGTTGGTAGT----A
gi|132470 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTA----TCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--GT---------TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132471 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATA--TT-GT-CAGC-GATATT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTA----TCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAATC--ATA--GT--GTTT----
gi|132472 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCACAAATCGC-TTGGCTTGTATTG--TC-AG-CGAT-A---TT--CGA--CTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA---------AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATA-GTATAACCATCGACAGATTATATTG-TGCCGTAAAA-TCCCAATC--ATA------ATGT----TCGGTGGTAGTG---AT-GA---A--C-TGGCTTA
gi|132473 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCT----CATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTG--TC-AGCAAG--A---TT--CGA--CCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTA----TCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTACAATG-TGCCATAAAATCCCAAACA--------T--ATGT-------TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C-TGACCTATAA
gi|132474 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCT----TATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATA--TT-AC-CAGT-GAGATT--CGG--CCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTG----T-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATA-GTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTG-TGCCGTAAAACCCCCAAC---ATA------ATTTCATATGGTTGGTGGT----A
gi|132475 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCT----TTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATA--TT-AA-AAGC-A---AC--TGG--CTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTA----T-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGA
gi|132476 : TAAGTCAAACAACGCTGCT----CATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTG--TC-AG-TGAT-A---TT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTA----T-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATA-GTATAACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAATC--ATA------ATGT----TTGGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|132477 : AGGCCAAAC-CCACTGTT----TATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTA--TC-GA-TGGA-G---T---------TTAACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTA----T-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACC
gi|132478 : AA-CTTTCTT-TGATGACTA-AA-AAGTTG---AC--CAA--CTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTG----T-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACAtacagtacagtaa
gi|132479 : GA--TTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATA----A-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA--TAATAATATTAACAAACTAAAGTA-TGCCGTAAAACCTT---CA--ATA--CT--ATTTAA--TTGTTGTCGGT----TT-GGT--A--
gi|132480 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAATTTATGGTG-TGCCGTAAAA-CCCCAATC--ATA--GT--GT---------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132481 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATA-GTAA-ACCATCAACAAATTATGGTG-TGCCGTAAAA-GCCCAATC--ATA--GT--GT---------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C-TGACCTAAA
gi|132482 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA--TAAGAATACCAACAGACTAGAGTA-TGCCGTAAAACCCGCAACA--ATA--TT--ATTT----TTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GGTGAATTAAAA
gi|132483 : ACTATATTA-TGCCGTAAAACCCTCAACATTTTT--TT--ATTA----TTGTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TGTGTCTTAAA