lowQualScore : 22 3333333333333333 111111111 1 111111111111 11111111 1 11111111111 111111111 111111111111 22222222 1 4444444444444444444444444
lowQualScore : 1 4 33 2 2 5555 2 00 1 2 6666666666666666 0 555555555 33 22 4444 0 333 9999999999 55 4 444444444444 4 3 11111111 1 7 4 8 1 1 77777777777 5 1 444 000000000 666666666666 333 22222222 666 1 333 1 3 55 666 4444 1 4 2 0 5 0 4 2 55 7 5 7777 8888 2222222222222222222222222
lowQualScore : . . .. . . .... . .. . . ................ . ......... .. .. .... . ... .......... .. . ............ . . ........ . . . . . . ........... . . ... ......... ............ ... ........ ... . ... . . .. ... .... . . . . . . . . .. . . .... .... .........................
lowQualScore : 5 2 77 1 5 3333 5 77 7 5 2222222222222222 3 333333333 11 99 5555 9 777 2222222222 00 8 666666666666 4 2 00000000 6 6 1 6 4 5 66666666666 7 9 111 111111111 888888888888 555 66666666 000 9 333 1 1 22 666 2222 7 9 1 3 5 5 7 9 55 1 0 7777 5555 4444444444444444444444444
consensus : AAAGAGAGTAGAGAAGG--AGCA-A----AGAT-AAGA-AAGTAGAAAT-TTACAG---NT---GAGAAGACGA---------GA--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TCGTTA-TTATAGTT-T------ACATGTTTCCCCATTT-ANTTTCGTGTGAC-----CTA---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATAAGT-------C-TTTC----T---A---TTTGC---TTG--N----TTTT---T-T---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TNCAATA--C-TGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAAT-ATT-ATACAGTTNAGTA----AA----TTAAN----------TGATGA---A-GAGTTATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Reference ( gi|80625 ) : AAAAAGAGTAGAAAAAA--AGCA-A----AGAT-AAGGCAAGTAGAAAT-TTATAG---TT---GAGAAGATGA---------GA--AGCTGTAT--G----CACT---A----------T--AGTTT-------TCCTTA-TTATAGTT-T------ACATGTTTCCCCATTT-ATTTGCATGTGAC-----ATA---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATAAGT-------T-TTTC----T---T---TTTGC---TTG--G----TTTT---T-T---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATA--C-TGGGAACTGTCTTCGTGTATTTAT-TCTTAAATATGAAATATTAAGCAAGTAAT-ATT-ATACAGTTAAGTA----AA----TCTAC----------TGATGG---A-GAGTTATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80624 : AAAGAGAGTAGAGAAAG--AGCA-A----AGAT-AAGATACGTAAAAAT-TTACAG---TT---GAGAAGATGA---------GA--AGATGTAT--G----CAGT---A----------T--AATTT-------GCGTTA-TTATAGTT-T------ACATGTTTCCCCATTT-ATTTTCGTGTGAT-----CTA---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAAAAAGT-------T-TT-C----T---A---TTTGC---TTG--T----TTTTTTTT-T---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATA--C-TGGGAACTGTCTTCATGTATTGAT-TCTTAAATATGAAGTATTTAGCAAGTAAT-ATT-ATACAGTGAAGTA----AA----TTAAC----------TGATGA---A-GAGTTATATAACCCGAACGATTAATTTTGA
gi|80627 : AAAGAGAGTACAGAAAG--AGCA-T----AGAT-AATACAAGTAGAAAT-TTACAG---AC---AGGAAGATGA---------GA--AGCTATAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TC---G-TTATAGTT-T------ACATGTTTTCCCATTT-ATTTTCGAGTGAC-----CTA---AGTTTGT-TTTTTGTTTATTGCAATACGT-------T-TTTC----T---A---TTTGC---TTG--T----TTCT---T-T---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCATTA--C-TGGGAACTGCCTTTGTGTATTTAT-TCTGAAATATGAAGTATTTATTAAGTAAT-ATT-ATACAGTTAAGTA----AA----TGAAA----------TGATGA---A-GGGTTATATAACCCAAACGATATATTTTGA
gi|80626 : AAAAAGAGTAGAGAAGG--AGCA-A----AGAT-AAGACGAGTAGAAAT-TTATAA---AT---GAGAAGATGA---------GA--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TCATTA-TTATAGTT-T------ACATGTTTCCCGATTT-ATTTTC-TGCGAC-----CTA---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATATGT-------TATTCC----T---A---TTTGC---TT---G----TTTT---T-T---ATAGATATGTTATGAA--TGC-TTCAATC--C-AAGGAACTATTGTCGTGTATTTGT-TCGTAAATATGAAATATTTAGCTAGTAAT-ATT-TTACTGATCAGTG----AA----TTAAA----------TGATGA---A-GAGTTATATAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80628 : AAAGGGAGTAAAGAAGG--AGCA-A----AGGT-AAGAGAAATAGAAAT-TTACGG---AT---GAGAAGATGA---------GA--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TTGTTA-TTTTGCTT-T------ACACGTTTCCCCATTT-ATCTTCGTGTGAC-----TTA---AGTTTGT-TTT-TGTTAATTGCAATATTT-------A-TTTC----T---A---TTTGC---TTGTTGTTGTTTTT---T-T---GTAAATATGGTATG-----------AATA--T-TGGGAACACTTCTCGTGTATTTAT-TCTTTAATATAAAGTATTTAGCAAATAAC-ATT-ATACAGTTCAGTA----AA----TTAAC----------TGA------------TATAAAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80629 : AAGGAGAGAACAGAAAG--AGCA-A----AGAT-AAGACAAGTAGAAAT-GTACAG---TT---GAGAAGATGA---------AA--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TCGTTA-TTATAATT-A------ACATGTTTCTCCATTT-ATTTTCGTGCAAC-----ATC---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAAT---T-------T-TTTC----T---G---TGTGC---TTG--T----TTTT---T-T---GTAGATATGGTATTAA--TGC-TTCAATA--
gi|80641 : AACAAGAG-AGGAGAAA--AG----------AT-AAGAAAAAT---AAT-TT-T----------------ACGA---------GA--AGGTGTAT--G----CATT---A----------T--A-TTT-------TTCGTATTTTTAGTT-T------ACATATTTTCCCATTT-AATTTCA--------------------TTGG-TTT-TGTTTATTGCAATACGT-------C-TTTT----T---A---CTTGC---TTT--G----TTTTTG-T-T---GTAAGTAAGGCATGAA--TGC-TGCAATA--C-TGGGAATTGTTTTC-TGTATTTATGTTTTAAA
gi|80632 : tagagaaattAAAGAGAGTAGAGAAGG--AGCAGA----AGATTAAGACAAGTAGAAAT-ATACAGAAATT---TACA-GATGA---------GA--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TCATTA-TTATAGTT-T------Aaaaa
gi|80631 : AAAGAGGGTGAAGAAGG--AGCA-A----AGAT-AAGAGAAGTAGAAGT-TTACAG---CT---G------T-----------GA--AGTTATAT--G----CAGT---A----------T--aaatg
gi|80635 : AAAAGAGTACAAAAGG--AGAA-A----AGAT-AAG--AGACAGAAGG-CAACAG---T-----------CGA---------GG--AGCTGTAT--G----CAGT---A----------T--ATTTT-------TCGTAG-TTTTAGTT-T------ACATGTTTCCCCATTT-AATAGAATGTGACCTGCAATACTGGGATTGT-TAT-TGTGTATT
gi|80636 : AAAGAATAAATAAGG--AGCA-A----TGAT-AA--CAGATA-------TATAA---CT---GTATAGACGA---------TA--AGTTATAA--A----CAGT---A----------T--A-TTT-------TAGAAA-TT-TAATT-A------ACATGTTCCTCCATTTTATTT-CGTCTGAC-----CTC---TGTATAT-ATT-TGTTTATTGCAATAAGT-------T-TTTC----T---G---TTTGC---TTG--T----TTTT---T-TTTTGTAAGTATGGTATGAA--TGC-TGCAATA--C-TGGGAACTGTTTTCGTGTCTTTAT-TCTTAAATATAAAATATTTAGCAAGTAAT-AGT-ATACAGTTTAGTA----AG----TAAAA----------TGTTGG---T-TAGTTATATAACACG
gi|80633 : AAAGAGTGTAAAGAATGAGCA-A----AGAT-AAGAGAAACAGAAAT-TTAC--------------AGATGA---------GA--AGCTGTAT--G----C--------------------AGTTT-------TCATAACTTA-AATT-T------GCATGTTTTCCCA
gi|80630 : AAGAGTGGAGAAAA-------------GAT-AAG--AAATAG-AAT-TT------------------ACGA---------GA--AACTGTAT--G----CATT---A----------T--A-TTT-------TTCGTA-TTTTCTCT-TA-----ACATATTTCCCCATTT-AATTTCATGTGAC-----CTG---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATAAGT-------C-TTTC----T---A---TTTGC---TTT--G----TTTT---T-T---GTAAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATA--C-T
gi|80639 : aaagacggtttagagaaagtatcAGAGTAGATAAGA--AATA-A----AAA---AGG-AAAT-GAAGG-TTAAGA---TA---AAGAAGAGGA---------AT--A-CTCGAT--A----CTCT---AAGTCTGAAATC--AGTTTGATGACGTCATTA-ATAAAGTTGT------A-AT-TTTCCCCATTT-GCCGTTATGTTGT-----TCA---AGTTTATATTT-TG-TCGTTGCTATTATT-------C-TTTC----T---A---TATTT---TCA--A----TATG---T-T---TTAAATATTTTATAAAATTGA--TAAATA----TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTAAGCA--TAA--ATCAATATAGT
gi|80637 : agacagtagataatggAGAGTGTAAAGAA--AG-A-ATAGTAGAT-AAG---AGTAGGAGGGTTA-AG---ATAAAGAGAAGAAGA---------AATTAGCACTCT--GGAATCAGT---A----------T---GTTG-------TCATTA-ATTTAGTT--------ATA-ATTTGCCCATTT-GCCGTTATGTTGT-----ACA---AGTTTTTCTTT-TGCT-GTTGCTATTATT-------C-TTTC----TATAT---TTT-C---TAT--G----TATT---T-T-----AAATATTTTTTAAA--A----TTAATAAACATGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--T-AT-ATCAATATAGT
gi|80638 : AGTGTAGATAAGA--AATA-A----AAA--AAGG-AAAT-GAAGG-TTAAGA---TA---AAGAAGAGGAATACTC---GA--CACTCTAA--G----C-CTGAAA----------TC-AGTTTGATGACGTCATTA-ATACAGTTGT------A-AT-TTTTCCCATTT-GCCGTTATGTTGT-----TCA---AGTTTATCTTT-TG-TCGTTGCTATTATT-------C-TTTC----T---A---TGTTT---TCA--A----TATG---T-T---TTAAATATTTTATAAAATTGA--TAAATA----TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTTAGCA--TAA--ATCAATATAGTatttaacaaatt
gi|80644 : agacagtagataatgg-A----AGAT-AAGAAAAG--GAATT-TTA-A-----------------GA---------GA--AGCTGTAT--G------GT---A----------TGCAG-TG-------TACATA-TCGTAGTT-TTAATTAACATGTTTCCCCATTT-AATTTCATGTGAC-----CCG---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATAAGTATTTCTAT-TTCC----T---T---TTTG----TTG--T----TTTT---T-T---GTAAGTAAGGTATGAA--TGG-TGCAATA--C-TTAG-TTTGTTTTCGTGTATATAT---TTAA--ACGAAAAAT--AGCAAGTAAA-ATT-ATACACTTAAGTA----AG----T-TGCAAGTTGTAGGTAATTGTTTATGAGTTATATAACCCGAACT-TATATTTTGA
gi|80642 : agatATAG---AT---GAGAAGATGACTTTTGCGAGA--AACTGTATTCG----TATT---A----------T--A-TTT-------TCGTAA-TTAT--TT-T------ACATGTTTTTCCATTT-AATTTCATGTGAC-----CTG---AGTTTGT-TAG-TGT--------ATA------------CTTC----T---A---TTTGC---ATT--G----TTTT---T-T---GTGAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATA--C-TGGGAGTTGT-TTCGTATATCTAC-ATTTAAAAATTAAATATTGAGCAAGTAAA-ATT-ATACAGTTAAGTC----AA----TTAAA----------TGTTGA---T-GAGTTGTGTAACCCATACTATACATTTTGA
gi|80643 : agataaagtagtaaagacgagataaagaaagtgtcatatgtggaggtgggGA---------GT--AGCTGTTT--A----CAAT---A----------T--ATTTT-------TCGTAG-TTTTAGTT-G------GCAT-TTTCCCCATTT-AATTTCGTGTGAC-----ATC---AGTTTGT-TTT-TGTTTATTGCAATAAAT-------A-TTTC----T---A---TTTGC---TTGT-T----TTTT---T-T---GTAAGTAT-GTA-AAG--TAC-TACAAAA--C-TGGGAATTGTTCTCGTGTATTTAT-TTTAAAAGATTAATTACTTAGCAAG-AATAATT-ATACAATTTAGTAGGTTAACATTTCTTC----------------------AGTTATATAACCCGAATGATAGATGTTAAAA
gi|80645 : gagaaatcgtgcaaagacaatacataatgatcaccactcatacagtcT--G----CAGT---A----------T--AGTTT-------TCAT-A-TCATAGTT-T------ACAAGTTTCCCCATTT-ATTTTC----GA-----------------GT-TTT-T-TTTATTGCAATTAGT-------T-TTTC----T---A---TTTGCAAGTT--------TTTT---T-T---GTAAATAGTGTATGAA--CGA-TTCAATA--C-TGGGAACTGTCTTTGTATATTTAT-TCTTAAGTATAAAGCATTTAGCAAGTAAT-ACT-
gi|80640 : TTTTCCCATTTCAGTT-CATGT-AT-----ATGC--AGTTTAT-CTT-TGTTTAGAGCTATTAAT-------C-TTTCAA--T---T---TCTA-----TA--C----CTTT---A-T---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACA--A-TGGGA-CTGTTTTTATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAAT-ATT-ATAAAGTTGA
gi|80646 : agagaggaaggaagaaagaagagggatgtagaataagtatagaatttggacattgcttttccctttttttaaaaaattaaaacggcatttttttcgacatttattaggtttaaacatttatagaaaaaTCCCCATTTCAGTT-CATGT-AT-----ATGC--AGTTTAT-CTT-TATTTAGAGCTATTAAT-------C-TTTCAA--T---T---TCTA-----TA--C----CTTT---A-T---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACA--A-TGGGA-CTGTTTT-ATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAAT-ATT-ATAAAGTTGA
gi|80647 : ttatagaaaaatgCCATTTGATTT-CATGTTGT-----GTA---AGTTTGT-TTT-TG-TCAGTGCAATTAAT-------C-TTTCGAGGT---T---TT--C---ATG--G----TTTT---T-T---ATTTCTTTTTTGTAAT--TGG-T--AAAA--G-TTGGTGTTGTTTTTGTATATTTGT-TTTTAAAGATAAAATATTTTGCATATGTC-AAT-AAACAGTTTAATA----A
gi|80648 : ATTT-AATTCTGTGTGAC-----CTA---AGTTTGT-TTT-TCTTTATTGCAATAATT-------C-TTTC----T---A---TCTAC---TTGCTT----TTTT---T-T---GTAACCATGGTATCAT--TGC-TGCAATA--C-TGGGA-------------ATTTAT-TTTAAAGAATGAAATATTTACCAATTAAA-ATT-ATACAGTTTAGTA----AG----TTAAA----------TAATGG---C-GATTTATATGACCAAAACAATATATTT
gi|80649 : T-ATTTTCGTGTGAC-----CTT---AGTTT---TAT-T-TTTATTGCAATAAGT-------T-TTTT----T---TATATTTGC---TT--------TTTT---TGT---GTAAATATGGCATGAA--TGC-TTCAGTA--C-CGGGAACCGTCTTCGTCT-TTTAT-
gi|80650 : ----TTTT---T-T---GTAGATATGGTATGAA--TGT-TTCAATA--C-TGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAC-TCTTAAATATGAAATATTTAGCAAGTAAT-ATT-ATACAGTTAAGTA----AA----TCAAT----------TCATGA---A-GAGTTATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|80634 ): AAAAAGAGTAGTAGATAAGAGTAGGAGAGTTAAGATAAAGAGAAGAAGAAAGTTTAATTAACACTTAATTAAAAAAGTCTGAAATCAGTATGTTGATGTCATTAATTTAGTTGTAATTTGTCCCATTTGCCGTTATGTTGTCCAAGTTTTTCTATTGCTGTTGCTATTATTCTTTCTATATTTTCTATGTATTTTGATATTTTTTAAAATTAATAAACATGGGAATTGTTTTTGCATATTTGTTTTTGTAAATGAAATATTTAGCATAAATCATTATAGTATTTAACAAATTTGAATAAAAGTTCCATTCAGTACAACCAAGAGATATA
Alignments
lowQualScore : 2 3333333333333333333333333333333333333 111111 1111111 11111111111 222222222222222222222222222 1111111111111 1111111
lowQualScore : 2 333 2 7777777 2 2 2 2 2 7 2 2 2222222222222222222222222222222222222 111111 22 2 4444 4444 22 88888 2 2222222 4444 2 1 6666 555 22 11111111111 1 1 0 1 777777 555555 1 5 1 22 333 33 333 22 55 2 555555555555555555555555555 1 333 1 3 77 44 55 3 1 1 1 4 7777 6 33 1 6666666666666 8888 0 3 0000000
lowQualScore : . ... . ....... . . . . . . . . ..................................... ...... .. . .... .... .. ..... . ....... .... . . .... ... .. ........... . . . . ...... ...... . . . .. ... .. ... .. .. . ........................... . ... . . .. .. .. . . . . . .... . .. . ............. .... . . .......
lowQualScore : 5 333 4 6666666 2 2 2 2 2 4 2 2 4444444444444444444444444444444444444 555555 88 0 2222 0000 66 88888 1 4444444 0000 7 9 5555 888 66 99999999999 0 2 6 9 888888 000000 1 2 7 44 555 77 222 55 00 1 111111111111111111111111111 7 000 2 0 22 00 99 2 8 9 0 3 6666 3 11 0 9999999999999 0000 4 5 8888888
consensus : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------G---TTTTT-TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Reference ( family-691 ) : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------G---NTTTT-TT---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80624 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GATACGTAAAAA-T-TTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-AT----GTA----T--G-----CAGTATAATTT-------GCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTTCGTGTGATCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAAAAGT--TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------G---TTTTT-TTTTTGTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCATGTATTGAT-TCTTAAATATGAAGTATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TGAAGTAAATT-------------AA---CTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATTAATTTTGA
gi|80625 : AAAAAG-AGTA--GAAAA-A-------AAGCA-A-AGAT-AA-GGCAAGTAGAAA-T-TTA-----TAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CACTATAGTTT-------TCC----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTGCATGTGACAT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---T--T--TTGC------T--------T------G---GTTTT-TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCGTGTATTTAT-TCTTAAATATGAAATATTAAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------TA---CTGATGGAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80626 : AAAAAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACGAGTAGAAA-T-TTA-----TAAAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCGATTTATTTTC-TGCGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATATGTTATTCCT---A--T--TTGC------T--------T------G----TTTT-TT---ATAGATATGTTATGAA--TGC-TTCAATCCAAGGAACTATTGTCGTGTATTTGT-TCGTAAATATGAAATATTTAGCTAGTAA--T-ATT-TTACTG--ATCAGTGAATT-------------AA---ATGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80627 : AAAGAG-AGTA--CAGAA-A-------GAGCA-T-AGAT-AA-TACAAGTAGAAA-T-TTA-----CAGAC---AG-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----ATA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-T------AGTT-T-A--CAT----------GTTTTCCCATTTATTTTCGAGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTTTTGTT--TATTGCAATACGTT-TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------G---TTTCT-TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCATTACTGGGAACTGCCTTTGTGTATTTAT-TCTGAAATATGAAGTATTTATTAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATG-------------AA---ATGATGAAGGGTT-------ATATAACCCAAACGATATATTTTGA
gi|80628 : AAAGGG-AGTA--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGGT-AA-GAGAAATAGAAA-T-TTA-----CGGAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TTG----TTA-TTT---TGCTT-T-A--CAC----------GTTTCCCCATTTATCTTCGTGTGACTT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--AATTGCAATATTTA-TTTCT---A--T--TTGCTTGTTGT--------T------G---TTTTT-TT---GTAAATATGGTATG-----------AATATTGGGAACACTTCTCGTGTATTTAT-TCTTTAATATAAAGTATTTAGCAAATAA--C-ATT-ATACAG--TTCAGTAAATT-------------AA---CTGA--------T-------ATAAAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80629 : AAGGAG-AGAA--CAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACAAGTAGAAA-T-GTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------AA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCTCCATTTATTTTCGTGCAACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAT---TT-TTTCT---G--T--GTGC------T--------T------G---TTTTT-TT---GTAGATATGGTATTAA--TGC-TTCAATA
gi|80630 : AGAGAA-AGTATCAAGAGTG-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA-TAG-AA-T-TT---------------------------A---------CGA------GA--AA-CT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG-----TA-TTT---TCTCT-TAA--CAT----------ATTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------T---GTTTT-TT---GTAAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACT
gi|80631 : aaagacggtttAAAGAG-GGTG--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAGTAGAAG-T-TTA-----CAGCT---------------------------GT------GA--AG-TT----ATA----T--G-----CAGTAT
gi|80632 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCAGA-AGATTAA-GACAAGTAGAAA-T-ATA-----CAG------A-A-ATTTACAGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--
gi|80633 : AAAGAG-TGTA--AAGAA-T-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAACAGAAA-T-TTA-----CAGAT---------------------------GA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----C-----AGTTT-------TCA----TAACTTA----AATT-T-G--CAT----------GTTTTCCCAaaatg
gi|80634 : AAAGAGTAGTA--GATAA-GAGTAGGAGAGTT-A-AGAT-AAAGAGAAGAAGAAAGT-TTAATTAACACTT---AA-TTA-----AAA-------------------A--AGTCT----GAA----A--T-----CAGTAT-GTTG-------ATG----TCA-TTAATTTAGTTGT-A---AT-----------TTGTCCCATTTGCCGTTATGTTGTCC--A---A------GTTT---TTC-TATTGCTGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTTTC------TATGTATTTT------G---ATATT-TT---TTAAA------ATTAA--TA-----AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--TAAATC-ATT-ATAGTA--TTTAACAAATT-------------------TGAATAAAAGTTCCATTCAGTACAA-CCAAGAGATATA
gi|80635 : aaAAAAG-AGTA--CAAAA-G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-GA-CAGAAG-G-CAA-----CAGT---------------------------CGA------GG--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATAGAATGTGACCTGCA---ATACTGGGATTGT-TAT-TGTG--TATT
gi|80636 : AAAG-AATA--AATAA-G-------GAGCA-A-TGAT-AA-CA-GA-TA--------TA-----TAACT---GT-A-T-----AGA---------CGA------TA--AG-TT----ATA----A--A-----CAGTATA-TTT-------TAG----AAA-TT----TAATT-A-A--CAT----------GTTCCTCCATTTTATTTCGTCTGACCT--C---T------GTATAT-ATT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---G--T--TTGC------T--------T------GTTTTTTTT-TT---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTCTTTAT-TCTTAAATATAAAATATTTAGCAAGTAA--T-AGT-ATACAG--TTTAGTAAGTA-------------AA---ATGTTGGTTAGTT-------ATATAACACG
gi|80637 : AGAG-TGTA--AAGAA-A-------GAATA-GTAGAT-AA-GA---GTAGGAG-GGTTA------AGATAAAGA-G-A-----AGA---------AGA------AATTAG-CA----CTC----T--GGAAT-CAGTAT-GTTG-------TCA----TTA-ATT---TAGTT---A--TA-----------ATTTGCCCATTTGCCGTTATGTTGTAC--A---A------GTTTTTCTTT-TGCT---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTTTC------TA-------T------G---TATTT-T------AAATATTTTTTAAAATTAA-TA-AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--T-A--T-ATCAATATAGTATTTAACAAATT-------------
gi|80638 : GAG-TGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA--AA-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--CA-CT----CTAAGCCT--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---CAGTTGT-A---AT-----------TTTTCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATCTTT-TGTC---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T--GTTT------T--------C------A---ATATG-TT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTTAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80639 : agacagtagataatgGAG-AGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA---A-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--TA-CTCTAAGTC----T--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---AAGTTGT-A---AT-----------TTTCCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATATTT-TG-T--CGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T--ATTT------T--------C------A---ATATG-TT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTAAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80640 : agacagtagataatgTTT-------TCGACATTTA-TTA----GGTT-T-AAACATTTATAGAAAAATTTTCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TGTT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT-C------TA-------T------A---CCTTT-AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTTTATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80641 : agagaggaaggaagaaagaagagggatgtagaataagtatagaatttggacattgcttttccctttttttaaaaaattaaaacggcatttA--GAGA--G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA--AATAA-T-TT----------T----------------A---------CGA------GA--AG-GT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG----TAT-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------ATTTTCCCATTTAATTTCA-----------------------TTGG-TTT-TGTT--TATTGCAATACGTC-TTTTT---A--C--TTGCT-----T--------T------G---TTTTTGTT---GTAAGTAAGGCATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAATTGTTTTC-TGTATTTATGTTTTAAAAA
gi|80642 : tagagaaattaacaA-----TAGAT---GA-G-A-----AGATGACTTTTGCGA------GA--AA-CT----GTA----TTCG-----TATTATA-TTT-------TCG----TAA-TTA---T--TT-T-A--CAT----------GTTTTTCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TAG-TGT----------ATA-----CTTCT---A--T--TTGCA-----T--------T------G----TTTT-TT---GTGAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAGTTGTTT-CGTATATCTAC-ATTTAAAAATTAAATATTGAGCAAGTAA--A-ATT-ATACAG--TTAAGTCAATT-------------AA---ATGTTGATGAGTT-------GTGTAACCCATACTATACATTTTGAaa
gi|80643 : agataaagtagtaaagacgagataaagaaagtgtcatatgtggaggtggg-----AGT---------CGA------GT--AG-CT----GTT----T--A-----CAATATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-G-G--CAT-----------TTTCCCCATTTAATTTCGTGTGACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAATA-TTTCT---A--T--TTGC------T--------T------GT--TTTTT-TT---GTAAGTAT-GTA-AAG--TAC-TACAAAACTGGGAATTGTTCTCGTGTATTTAT-TTTAAAAGATTAATTACTTAGCAAG-AA--TAATT-ATACAA--TTTAGTAGGTT-------------AACATTTCTT---CAGTT-------ATATAACCCGAATGATAGATGTTAAAA
gi|80644 : gagaaatcgtgcaaagacaatacataatgatcaccactcatac-A-AGAT-AA-GA-AA--AGGAA-T-TT----------T---AA-G-A--------------------------GA--AG-CT----GTA----T--GGTATGCAGTGTACATA-------TCG----TAG-TTT---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCC--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTA-TTTCT---A--T--TTCC------T--------TTTTGTTG---TTTTT-TT---GTAAGTAAGGTATGAA--TGG-TGCAATACTTAGT-TTGTTTTCGTGTATATAT-TT----AAACGAAAAAT--AGCAAGTAA--A-ATT-ATACAC--TTAAGTAAGTTGCAAGTTGTAGGTAA---TTGTTTATGAGTT-------ATATAACCCGAACT-TATATTTTGA
gi|80645 : agat----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----T-A-TCA---TAGTT-T-A--CAA----------GTTTCCCCATTTATTTTCG--------------A------GTTT-T-T-----TT--TATTGCAATTAGTT-TTTCT---A--T--TTGCAAG---T--------T-----------TTTT-TT---GTAAATAGTGTATGAA--CGA-TTCAATACTGGGAACTGTCTTTGTATATTTAT-TCTTAAGTATAAAGCATTTAGCAAGTAA--T-ACT-
gi|80646 : TCCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TATT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT-C------TA-------T------A---CCTTT-AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTT-ATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80647 : ttatagaaaaatgCCATTTGATTTCATGTTGTGT--A---A------GTTTGT-TTT-TG-T--CAGTGCAATTAATC-TTTCG---AGGT--TTTC------A--------T------G---GTTTT-TT---ATTTCTTTTTTGTAAT--TGG-T--AAAAGTTGGTGTTGTTTTTGTATATTTGT-TTTTAAAGATAAAATATTTTGCATATGT--C-AAT-AAACAG--TTTAATAA
gi|80648 : ATTTAATTCTGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TCTT--TATTGCAATAATTC-TTTCT---A--T--CTAC------T--------T------GCT-TTTTT-TT---GTAACCATGGTATCAT--TGC-TGCAATACTGGGA-------------ATTTAT-TTTAAAGAATGAAATATTTACCAATTAA--A-ATT-ATACAG--TTTAGTAAGTT-------------AA---ATAATGGCGATTT-------ATATGACCAAAACAATATATTT
gi|80649 : TATTTTCGTGTGACCT--T---A------GTTT---TAT-T-TT--TATTGCAATAAGTT-TTTTTTATA--T--TTGC------T--------T----------TTTTT-GT---GTAAATATGGCATGAA--TGC-TTCAGTACCGGGAACCGTCTTCGTCT-TTTAT-
gi|80650 : TTTT-TT---GTAGATATGGTATGAA--TGT-TTCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAC-TCTTAAATATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------AA---TTCATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2 3333333333333333333333333333333333333 111111 1111111 11111111111 1111111111111111111111111111 1111111111111 1111111
lowQualScore : 2 333 2 7777777 2 2 2 2 2 7 2 2 2222222222222222222222222222222222222 111111 22 2 4444 4444 22 88888 2 2222222 4444 2 1 6666 555 22 11111111111 1 1 0 1 777777 555555 1 5 1 22 333 33 333 22 55 555555 9999999999999999999999999999 44444 666666 333 2 77 33 55 3 1 1 1 4 7777 6 33 1 6666666666666 8888 0 3 0000000
lowQualScore : . ... . ....... . . . . . . . . ..................................... ...... .. . .... .... .. ..... . ....... .... . . .... ... .. ........... . . . . ...... ...... . . . .. ... .. ... .. .. ...... ............................ ..... ...... ... . .. .. .. . . . . . .... . .. . ............. .... . . .......
lowQualScore : 5 333 4 6666666 2 2 2 2 2 4 2 2 4444444444444444444444444444444444444 555555 88 0 2222 0000 66 88888 1 4444444 0000 7 9 5555 888 66 99999999999 0 2 6 9 888888 000000 1 2 7 44 555 77 222 55 00 555555 7777777777777777777777777777 33333 777777 000 0 22 66 99 2 8 9 0 3 6666 3 11 0 9999999999999 0000 4 5 8888888
consensus : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Reference ( family-691 ) : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80624 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GATACGTAAAAA-T-TTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-AT----GTA----T--G-----CAGTATAATTT-------GCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTTCGTGTGATCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAAAAGT--TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TTTTTGTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCATGTATTGAT-TCTTAAATATGAAGTATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TGAAGTAAATT-------------AA---CTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATTAATTTTGA
gi|80625 : AAAAAG-AGTA--GAAAA-A-------AAGCA-A-AGAT-AA-GGCAAGTAGAAA-T-TTA-----TAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CACTATAGTTT-------TCC----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTGCATGTGACAT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---T--T--TT-----GC------T---T------G---G------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCGTGTATTTAT-TCTTAAATATGAAATATTAAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------TA---CTGATGGAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80626 : AAAAAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACGAGTAGAAA-T-TTA-----TAAAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCGATTTATTTTC-TGCGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATATGTTATTCCT---A--T--TT-----GC------T---T------G----------TTT-----T------TT---ATAGATATGTTATGAA--TGC-TTCAATCCAAGGAACTATTGTCGTGTATTTGT-TCGTAAATATGAAATATTTAGCTAGTAA--T-ATT-TTACTG--ATCAGTGAATT-------------AA---ATGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80627 : AAAGAG-AGTA--CAGAA-A-------GAGCA-T-AGAT-AA-TACAAGTAGAAA-T-TTA-----CAGAC---AG-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----ATA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-T------AGTT-T-A--CAT----------GTTTTCCCATTTATTTTCGAGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTTTTGTT--TATTGCAATACGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTC-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCATTACTGGGAACTGCCTTTGTGTATTTAT-TCTGAAATATGAAGTATTTATTAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATG-------------AA---ATGATGAAGGGTT-------ATATAACCCAAACGATATATTTTGA
gi|80628 : AAAGGG-AGTA--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGGT-AA-GAGAAATAGAAA-T-TTA-----CGGAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TTG----TTA-TTT---TGCTT-T-A--CAC----------GTTTCCCCATTTATCTTCGTGTGACTT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--AATTGCAATATTTA-TTTCT---A--T--TT-----GCTTGTTGT---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATG-----------AATATTGGGAACACTTCTCGTGTATTTAT-TCTTTAATATAAAGTATTTAGCAAATAA--C-ATT-ATACAG--TTCAGTAAATT-------------AA---CTGA--------T-------ATAAAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80629 : AAGGAG-AGAA--CAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACAAGTAGAAA-T-GTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------AA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCTCCATTTATTTTCGTGCAACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAT---TT-TTTCT---G--T--GT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATTAA--TGC-TTCAATA
gi|80630 : AGAGAA-AGTATCAAGAGTG-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA-TAG-AA-T-TT---------------------------A---------CGA------GA--AA-CT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG-----TA-TTT---TCTCT-TAA--CAT----------ATTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------T---G------TTT-----T------TT---GTAAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACT
gi|80631 : aaagacggtttAAAGAG-GGTG--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAGTAGAAG-T-TTA-----CAGCT---------------------------GT------GA--AG-TT----ATA----T--G-----CAGTAT
gi|80632 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCAGA-AGATTAA-GACAAGTAGAAA-T-ATA-----CAG------A-A-ATTTACAGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--
gi|80633 : AAAGAG-TGTA--AAGAA-T-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAACAGAAA-T-TTA-----CAGAT---------------------------GA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----C-----AGTTT-------TCA----TAACTTA----AATT-T-G--CAT----------GTTTTCCCAaaatg
gi|80634 : AAAGAGTAGTA--GATAA-GAGTAGGAGAGTT-A-AGAT-AAAGAGAAGAAGAAAGT-TTAATTAACACTT---AA-TTA-----AAA-------------------A--AGTCT----GAA----A--T-----CAGTAT-GTTG-------ATG----TCA-TTAATTTAGTTGT-A---AT-----------TTGTCCCATTTGCCGTTATGTTGTCC--A---A------GTTT---TTC-TATTGCTGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TATGT------A---T------TTTGATATT------TT---TTAAA------ATTAA--TA-----AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--TAAATC-ATT-ATAGTA--TTTAACAAATT-------------------TGAATAAAAGTTCCATTCAGTACAA-CCAAGAGATATA
gi|80635 : aaAAAAG-AGTA--CAAAA-G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-GA-CAGAAG-G-CAA-----CAGT---------------------------CGA------GG--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATAGAATGTGACCTGCA---ATACTGGGATTGT-TAT-TGTG--TATT
gi|80636 : AAAG-AATA--AATAA-G-------GAGCA-A-TGAT-AA-CA-GA-TA--------TA-----TAACT---GT-A-T-----AGA---------CGA------TA--AG-TT----ATA----A--A-----CAGTATA-TTT-------TAG----AAA-TT----TAATT-A-A--CAT----------GTTCCTCCATTTTATTTCGTCTGACCT--C---T------GTATAT-ATT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---G--T--TT-----GC------T---T------GTTTT------TTT-----T------TT---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTCTTTAT-TCTTAAATATAAAATATTTAGCAAGTAA--T-AGT-ATACAG--TTTAGTAAGTA-------------AA---ATGTTGGTTAGTT-------ATATAACACG
gi|80637 : AGAG-TGTA--AAGAA-A-------GAATA-GTAGAT-AA-GA---GTAGGAG-GGTTA------AGATAAAGA-G-A-----AGA---------AGA------AATTAG-CA----CTC----T--GGAAT-CAGTAT-GTTG-------TCA----TTA-ATT---TAGTT---A--TA-----------ATTTGCCCATTTGCCGTTATGTTGTAC--A---A------GTTTTTCTTT-TGCT---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TA--T------G---T------ATT-----T------T------AAATATTTTTTAAAATTAA-TA-AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--T-A--T-ATCAATATAGTATTTAACAAATT-------------
gi|80638 : GAG-TGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA--AA-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--CA-CT----CTAAGCCT--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---CAGTTGT-A---AT-----------TTTTCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATCTTT-TGTC---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T----------------------------G---T------TTT-----CAATATGTT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTTAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80639 : agacagtagataatgGAG-AGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA---A-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--TA-CTCTAAGTC----T--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---AAGTTGT-A---AT-----------TTTCCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATATTT-TG-T--CGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T--AT-----TT------T---C------A---A------TAT-----G------TT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTAAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80640 : agacagtagataatgTTT-------TCGACATTTA-TTA----GGTT-T-AAACATTTATAGAAAAATTTTCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TGTT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTTTATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80641 : agagaggaaggaagaaagaagagggatgtagaataagtatagaatttggacattgcttttccctttttttaaaaaattaaaacggcatttA--GAGA--G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA--AATAA-T-TT----------T----------------A---------CGA------GA--AG-GT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG----TAT-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------ATTTTCCCATTTAATTTCA-----------------------TTGG-TTT-TGTT--TATTGCAATACGTC-TTTTT---A--C--TT-----GCT-----T---T------G---T------TTT-----TG-----TT---GTAAGTAAGGCATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAATTGTTTTC-TGTATTTATGTTTTAAAAA
gi|80642 : tagagaaattaacaA-----TAGAT---GA-G-A-----AGATGACTTTTGCGA------GA--AA-CT----GTA----TTCG-----TATTATA-TTT-------TCG----TAA-TTA---T--TT-T-A--CAT----------GTTTTTCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TAG-TGT----------ATA-----CTTCT---A--T--TT-----GCA-----T---T------G---T------TTT-----T------T----GTGAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAGTTGTTT-CGTATATCTAC-ATTTAAAAATTAAATATTGAGCAAGTAA--A-ATT-ATACAG--TTAAGTCAATT-------------AA---ATGTTGATGAGTT-------GTGTAACCCATACTATACATTTTGAaa
gi|80643 : agataaagtagtaaagacgagataaagaaagtgtcatatgtggaggtggg-----AGT---------CGA------GT--AG-CT----GTT----T--A-----CAATATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-G-G--CAT-----------TTTCCCCATTTAATTTCGTGTGACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAATA-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAGTAT-GTA-AAG--TAC-TACAAAACTGGGAATTGTTCTCGTGTATTTAT-TTTAAAAGATTAATTACTTAGCAAG-AA--TAATT-ATACAA--TTTAGTAGGTT-------------AACATTTCTT---CAGTT-------ATATAACCCGAATGATAGATGTTAAAA
gi|80644 : gagaaatcgtgcaaagacaatacataatgatcaccactcatac-A-AGAT-AA-GA-AA--AGGAA-T-TT----------T---AA-G-A--------------------------GA--AG-CT----GTA----T--GGTATGCAGTGTACATA-------TCG----TAG-TTT---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCC--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTA-TTTCT---A--T--TT-----CC------T---TTTTGTTG---T------TTT-----T------TT---GTAAGTAAGGTATGAA--TGG-TGCAATACTTAGT-TTGTTTTCGTGTATATAT-TT----AAACGAAAAAT--AGCAAGTAA--A-ATT-ATACAC--TTAAGTAAGTTGCAAGTTGTAGGTAA---TTGTTTATGAGTT-------ATATAACCCGAACT-TATATTTTGA
gi|80645 : agat----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----T-A-TCA---TAGTT-T-A--CAA----------GTTTCCCCATTTATTTTCG--------------A------GTTT-T-T-----TT--TATTGCAATTAGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------A---A------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAATAGTGTATGAA--CGA-TTCAATACTGGGAACTGTCTTTGTATATTTAT-TCTTAAGTATAAAGCATTTAGCAAGTAA--T-ACT-
gi|80646 : TCCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TATT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTT-ATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80647 : ttatagaaaaatgCCATTTGATTTCATGTTGTGT--A---A------GTTTGT-TTT-TG-T--CAGTGCAATTAATC-TTTCG---AGGT--TTTCATGGT------T---T------T---TTATTTCTTT-----T------TT---GT-AAT-TGGTA--AA--AGT-T---------GGTGTTGTTTTTGTATATTTGT-TTTTAAAGATAAAATATTTTGCATATGT--C-AAT-AAACAG--TTTAATAA
gi|80648 : ATTTAATTCTGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TCTT--TATTGCAATAATTC-TTTCT---A--T--CT-----AC------T---T------GCT-T------TTT-----T------TT---GTAACCATGGTATCAT--TGC-TGCAATACTGGGA-------------ATTTAT-TTTAAAGAATGAAATATTTACCAATTAA--A-ATT-ATACAG--TTTAGTAAGTT-------------AA---ATAATGGCGATTT-------ATATGACCAAAACAATATATTT
gi|80649 : TATTTTCGTGTGACCT--T---A------GTTT---TAT-T-TT--TATTGCAATAAGTT-TTTTTTATA--T--TT-----GC------T---T----------T------TTT-----T------GT---GTAAATATGGCATGAA--TGC-TTCAGTACCGGGAACCGTCTTCGTCT-TTTAT-
gi|80650 : ------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGT-TTCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAC-TCTTAAATATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------AA---TTCATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2 3333333333333333333333333333333333333 111111 1111111 11111111111 1111111111111111111111111111 1111111111111 1111111
lowQualScore : 2 333 2 7777777 2 2 2 2 2 7 2 2 2222222222222222222222222222222222222 111111 22 2 4444 4444 22 88888 2 2222222 4444 2 1 6666 555 22 11111111111 1 1 0 1 777777 555555 1 5 1 22 333 33 333 22 55 555555 9999999999999999999999999999 44444 666666 333 2 77 33 55 3 1 1 1 4 7777 6 33 1 6666666666666 8888 0 3 0000000
lowQualScore : . ... . ....... . . . . . . . . ..................................... ...... .. . .... .... .. ..... . ....... .... . . .... ... .. ........... . . . . ...... ...... . . . .. ... .. ... .. .. ...... ............................ ..... ...... ... . .. .. .. . . . . . .... . .. . ............. .... . . .......
lowQualScore : 5 333 4 6666666 2 2 2 2 2 4 2 2 4444444444444444444444444444444444444 555555 88 0 2222 0000 66 88888 1 4444444 0000 7 9 5555 888 66 99999999999 0 2 6 9 888888 000000 1 2 7 44 555 77 222 55 00 555555 7777777777777777777777777777 33333 777777 000 0 22 66 99 2 8 9 0 3 6666 3 11 0 9999999999999 0000 4 5 8888888
consensus : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Reference ( family-691 ) : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80624 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GATACGTAAAAA-T-TTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-AT----GTA----T--G-----CAGTATAATTT-------GCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTTCGTGTGATCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAAAAGT--TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TTTTTGTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCATGTATTGAT-TCTTAAATATGAAGTATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TGAAGTAAATT-------------AA---CTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATTAATTTTGA
gi|80625 : AAAAAG-AGTA--GAAAA-A-------AAGCA-A-AGAT-AA-GGCAAGTAGAAA-T-TTA-----TAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CACTATAGTTT-------TCC----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTGCATGTGACAT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---T--T--TT-----GC------T---T------G---G------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCGTGTATTTAT-TCTTAAATATGAAATATTAAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------TA---CTGATGGAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80626 : AAAAAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACGAGTAGAAA-T-TTA-----TAAAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCGATTTATTTTC-TGCGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATATGTTATTCCT---A--T--TT-----GC------T---T------G----------TTT-----T------TT---ATAGATATGTTATGAA--TGC-TTCAATCCAAGGAACTATTGTCGTGTATTTGT-TCGTAAATATGAAATATTTAGCTAGTAA--T-ATT-TTACTG--ATCAGTGAATT-------------AA---ATGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80627 : AAAGAG-AGTA--CAGAA-A-------GAGCA-T-AGAT-AA-TACAAGTAGAAA-T-TTA-----CAGAC---AG-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----ATA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-T------AGTT-T-A--CAT----------GTTTTCCCATTTATTTTCGAGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTTTTGTT--TATTGCAATACGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTC-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCATTACTGGGAACTGCCTTTGTGTATTTAT-TCTGAAATATGAAGTATTTATTAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATG-------------AA---ATGATGAAGGGTT-------ATATAACCCAAACGATATATTTTGA
gi|80628 : AAAGGG-AGTA--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGGT-AA-GAGAAATAGAAA-T-TTA-----CGGAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TTG----TTA-TTT---TGCTT-T-A--CAC----------GTTTCCCCATTTATCTTCGTGTGACTT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--AATTGCAATATTTA-TTTCT---A--T--TT-----GCTTGTTGT---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATG-----------AATATTGGGAACACTTCTCGTGTATTTAT-TCTTTAATATAAAGTATTTAGCAAATAA--C-ATT-ATACAG--TTCAGTAAATT-------------AA---CTGA--------T-------ATAAAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80629 : AAGGAG-AGAA--CAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACAAGTAGAAA-T-GTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------AA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCTCCATTTATTTTCGTGCAACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAT---TT-TTTCT---G--T--GT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATTAA--TGC-TTCAATA
gi|80630 : AGAGAA-AGTATCAAGAGTG-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA-TAG-AA-T-TT---------------------------A---------CGA------GA--AA-CT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG-----TA-TTT---TCTCT-TAA--CAT----------ATTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------T---G------TTT-----T------TT---GTAAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACT
gi|80631 : aaagacggtttAAAGAG-GGTG--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAGTAGAAG-T-TTA-----CAGCT---------------------------GT------GA--AG-TT----ATA----T--G-----CAGTAT
gi|80632 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCAGA-AGATTAA-GACAAGTAGAAA-T-ATA-----CAG------A-A-ATTTACAGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--
gi|80633 : AAAGAG-TGTA--AAGAA-T-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAACAGAAA-T-TTA-----CAGAT---------------------------GA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----C-----AGTTT-------TCA----TAACTTA----AATT-T-G--CAT----------GTTTTCCCAaaatg
gi|80634 : AAAGAGTAGTA--GATAA-GAGTAGGAGAGTT-A-AGAT-AAAGAGAAGAAGAAAGT-TTAATTAACACTT---AA-TTA-----AAA-------------------A--AGTCT----GAA----A--T-----CAGTAT-GTTG-------ATG----TCA-TTAATTTAGTTGT-A---AT-----------TTGTCCCATTTGCCGTTATGTTGTCC--A---A------GTTT---TTC-TATTGCTGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TATGT------A---T------TTTGATATT------TT---TTAAA------ATTAA--TA-----AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--TAAATC-ATT-ATAGTA--TTTAACAAATT-------------------TGAATAAAAGTTCCATTCAGTACAA-CCAAGAGATATA
gi|80635 : aaAAAAG-AGTA--CAAAA-G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-GA-CAGAAG-G-CAA-----CAGT---------------------------CGA------GG--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATAGAATGTGACCTGCA---ATACTGGGATTGT-TAT-TGTG--TATT
gi|80636 : AAAG-AATA--AATAA-G-------GAGCA-A-TGAT-AA-CA-GA-TA--------TA-----TAACT---GT-A-T-----AGA---------CGA------TA--AG-TT----ATA----A--A-----CAGTATA-TTT-------TAG----AAA-TT----TAATT-A-A--CAT----------GTTCCTCCATTTTATTTCGTCTGACCT--C---T------GTATAT-ATT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---G--T--TT-----GC------T---T------GTTTT------TTT-----T------TT---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTCTTTAT-TCTTAAATATAAAATATTTAGCAAGTAA--T-AGT-ATACAG--TTTAGTAAGTA-------------AA---ATGTTGGTTAGTT-------ATATAACACG
gi|80637 : AGAG-TGTA--AAGAA-A-------GAATA-GTAGAT-AA-GA---GTAGGAG-GGTTA------AGATAAAGA-G-A-----AGA---------AGA------AATTAG-CA----CTC----T--GGAAT-CAGTAT-GTTG-------TCA----TTA-ATT---TAGTT---A--TA-----------ATTTGCCCATTTGCCGTTATGTTGTAC--A---A------GTTTTTCTTT-TGCT---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TA--T------G---T------ATT-----T------T------AAATATTTTTTAAAATTAA-TA-AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--T-A--T-ATCAATATAGTATTTAACAAATT-------------
gi|80638 : GAG-TGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA--AA-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--CA-CT----CTAAGCCT--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---CAGTTGT-A---AT-----------TTTTCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATCTTT-TGTC---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T----------------------------G---T------TTT-----CAATATGTT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTTAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80639 : agacagtagataatgGAG-AGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA---A-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--TA-CTCTAAGTC----T--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---AAGTTGT-A---AT-----------TTTCCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATATTT-TG-T--CGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T--AT-----TT------T---C------A---A------TAT-----G------TT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTAAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80640 : agacagtagataatgTTT-------TCGACATTTA-TTA----GGTT-T-AAACATTTATAGAAAAATTTTCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TGTT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTTTATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80641 : agagaggaaggaagaaagaagagggatgtagaataagtatagaatttggacattgcttttccctttttttaaaaaattaaaacggcatttA--GAGA--G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA--AATAA-T-TT----------T----------------A---------CGA------GA--AG-GT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG----TAT-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------ATTTTCCCATTTAATTTCA-----------------------TTGG-TTT-TGTT--TATTGCAATACGTC-TTTTT---A--C--TT-----GCT-----T---T------G---T------TTT-----TG-----TT---GTAAGTAAGGCATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAATTGTTTTC-TGTATTTATGTTTTAAAAA
gi|80642 : tagagaaattaacaA-----TAGAT---GA-G-A-----AGATGACTTTTGCGA------GA--AA-CT----GTA----TTCG-----TATTATA-TTT-------TCG----TAA-TTA---T--TT-T-A--CAT----------GTTTTTCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TAG-TGT----------ATA-----CTTCT---A--T--TT-----GCA-----T---T------G---T------TTT-----T------T----GTGAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAGTTGTTT-CGTATATCTAC-ATTTAAAAATTAAATATTGAGCAAGTAA--A-ATT-ATACAG--TTAAGTCAATT-------------AA---ATGTTGATGAGTT-------GTGTAACCCATACTATACATTTTGAaa
gi|80643 : agataaagtagtaaagacgagataaagaaagtgtcatatgtggaggtggg-----AGT---------CGA------GT--AG-CT----GTT----T--A-----CAATATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-G-G--CAT-----------TTTCCCCATTTAATTTCGTGTGACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAATA-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAGTAT-GTA-AAG--TAC-TACAAAACTGGGAATTGTTCTCGTGTATTTAT-TTTAAAAGATTAATTACTTAGCAAG-AA--TAATT-ATACAA--TTTAGTAGGTT-------------AACATTTCTT---CAGTT-------ATATAACCCGAATGATAGATGTTAAAA
gi|80644 : gagaaatcgtgcaaagacaatacataatgatcaccactcatac-A-AGAT-AA-GA-AA--AGGAA-T-TT----------T---AA-G-A--------------------------GA--AG-CT----GTA----T--GGTATGCAGTGTACATA-------TCG----TAG-TTT---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCC--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTA-TTTCT---A--T--TT-----CC------T---TTTTGTTG---T------TTT-----T------TT---GTAAGTAAGGTATGAA--TGG-TGCAATACTTAGT-TTGTTTTCGTGTATATAT-TT----AAACGAAAAAT--AGCAAGTAA--A-ATT-ATACAC--TTAAGTAAGTTGCAAGTTGTAGGTAA---TTGTTTATGAGTT-------ATATAACCCGAACT-TATATTTTGA
gi|80645 : agat----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----T-A-TCA---TAGTT-T-A--CAA----------GTTTCCCCATTTATTTTCG--------------A------GTTT-T-T-----TT--TATTGCAATTAGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------A---A------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAATAGTGTATGAA--CGA-TTCAATACTGGGAACTGTCTTTGTATATTTAT-TCTTAAGTATAAAGCATTTAGCAAGTAA--T-ACT-
gi|80646 : TCCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TATT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTT-ATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80647 : ttatagaaaaatgCCATTTGATTTCATGTTGTGT--A---A------GTTTGT-TTT-TG-T--CAGTGCAATTAATC-TTTCG---AGGT--TTTCATGGT------T---T------T---TTATTTCTTT-----T------TT---GT-AAT-TGGTA--AA--AGT-T---------GGTGTTGTTTTTGTATATTTGT-TTTTAAAGATAAAATATTTTGCATATGT--C-AAT-AAACAG--TTTAATAA
gi|80648 : ATTTAATTCTGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TCTT--TATTGCAATAATTC-TTTCT---A--T--CT-----AC------T---T------GCT-T------TTT-----T------TT---GTAACCATGGTATCAT--TGC-TGCAATACTGGGA-------------ATTTAT-TTTAAAGAATGAAATATTTACCAATTAA--A-ATT-ATACAG--TTTAGTAAGTT-------------AA---ATAATGGCGATTT-------ATATGACCAAAACAATATATTT
gi|80649 : TATTTTCGTGTGACCT--T---A------GTTT---TAT-T-TT--TATTGCAATAAGTT-TTTTTTATA--T--TT-----GC------T---T----------T------TTT-----T------GT---GTAAATATGGCATGAA--TGC-TTCAGTACCGGGAACCGTCTTCGTCT-TTTAT-
gi|80650 : ------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGT-TTCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAC-TCTTAAATATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------AA---TTCATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
blockSeqs : T TCA T AGTAGGA G T T A C G G G TAGATGAGAAGATGACTTTTGC ATACTC TT T CTAA AGCC TC GTATG G GATGACG ACAT T C AATT TA AA TTATAGAAAAA T A A ATGC TACTGG G C T GC AAG TA TAT GG AT TCATGG TTGTTGTTGT GATAT AATATG . G AT CA TC C A G T A ATC A TA A GCAAGTTGTAGGT CATT A CCATTCA
blockSeqs : . G . . . . . . C G . . ATTAACACTTAATTAAAA ATACTC . . . . . GAAT G GATGACG . T . A GT . G T G C ATGC . G C . . ATG T . . AT G TTTTTGTTGT . G . G AT CA TC C A . T A TA A . C . C A .
blockSeqs : . G . . . . . . C G . . CAGAAATTTACAGAT . . . . . . . G . . T . A GT . G T G C GCA . G A . . ACG T . . . G TTTTTATTTC . . . G AT C TC C A . T A T A . A . A A .
blockSeqs : . C . . . . . . G A . . AGATAAAGAGAAGAA . . . . . . . G . . T . T GT . G T G T A . G . . . ATT A . . . G TATGTAT . . . G . C TC T A . T A T . . C . A A .
blockSeqs : . A . . . . . . C G . . TAGTTGAGAAGAT . . . . . . . G . . T . A T . G T A A A . G . . . AAG T . . . G TTGTTTT . . . G . C GC C A . A A T . . T . C T .
blockSeqs : . C . . . . . . G G . . TAAATGAGAAGAT . . . . . . . T . . T . T T . G A A C A . G . . . TAT C . . . G TTGCTT . . . T . C GC C A . T G C . . T . A T .
blockSeqs : . A . . . . . . C G . . CAGACAGGAAGAT . . . . . . . G . . T . A T . A C A C A . G . . . AAG C . . . G TATGT . . . G . C GA A A . A A T . . T . A T .
blockSeqs : . G . . . . . . G A . . CGGATGAGAAGAT . . . . . . . G . . A . A T . G A G C C . A . . . TAT T . . . T TATAC . . . T . C GC C A . G A T . . G . T C .
blockSeqs : . A . . . . . . G G . . CAGTTGAGAAGAT . . . . . . . G . . C . T A . G A A C G . T . . . TAT C . . . G TTTGT . . . T . A GC C A . G A T . . A . A A .
blockSeqs : . G . . . . . . . G . . TAACTGTATAGAC . . . . . . . T . . A . T T . G C A A A . A . . . TAT C . . . T ATTGT . . . T . A AC C A . G A A . . T . T . .
blockSeqs : . C . . . . . . . A . . AGATAAAGAAGAG . . . . . . . G . . A . A T . A C A T C . A . . . TAA C . . . T TTGTT . . . T . A GC C G . A G A . . A . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . A . . AGATAAAGAAGAG . . . . . . . G . . T . A T . A C A T A . A . . . ACG C . . . G AAGTT . . . G . C TC C A . A T T . . G .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . CAGCT . . . . . . . G . . T . A A . G A A C A . G . . . AAA C . . . G TATAC . . . T . C GA A A . G A T . . T
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . CAGAT . . . . . . . T . . T . T T . G A A A A . G . . . AAG A . . . G TTGG . . . G . C GC C G . A A C . . T
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . CAGTC . . . . . . . T . . T . A T . G A G C G . G . . . TAG A . . . C TTGT . . . T . G TC C A . T . A . . A
blockSeqs : G . . . . . . . . . . TAAGA . . . . . . . C . . A . T T . . A A G C . G . . . TAA T . . . G TTGT . . . T . A TC C A . G . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . TAC . . . . . . . G . . A . T G . . A G C G . A . . . TAA C . . . A TTTG . . . G . T A . . . G . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . A . A A . . T A C A . G . . . AAT C . . . G TCAA . . . G . C A . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . T . . A A . A . G . . . AAG C . . . . TTG . . . G . C A . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . A G . T . . . . . A T . . . . TTT . . . G . T . . . .
blockSeqs : A G . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : C* TTGT************************ ***
originalCons : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
finalCons : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GCTTGT------------------------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2 3333333333333333333333333333333333333 111111 1111111 11111111111 1111111111111111111111111111 1111111111111 1111111
lowQualScore : 2 333 2 7777777 2 2 2 2 2 7 2 2 2222222222222222222222222222222222222 111111 22 2 4444 4444 22 88888 2 2222222 4444 2 1 6666 555 22 11111111111 1 1 0 1 777777 555555 1 5 1 22 333 33 333 22 55 555555 9999999999999999999999999999 44444 666666 333 2 77 33 55 3 1 1 1 4 7777 6 33 1 6666666666666 8888 0 3 0000000
lowQualScore : . ... . ....... . . . . . . . . ..................................... ...... .. . .... .... .. ..... . ....... .... . . .... ... .. ........... . . . . ...... ...... . . . .. ... .. ... .. .. ...... ............................ ..... ...... ... . .. .. .. . . . . . .... . .. . ............. .... . . .......
lowQualScore : 5 333 4 6666666 2 2 2 2 2 4 2 2 4444444444444444444444444444444444444 555555 88 0 2222 0000 66 88888 1 4444444 0000 7 9 5555 888 66 99999999999 0 2 6 9 888888 000000 1 2 7 44 555 77 222 55 00 555555 7777777777777777777777777777 33333 777777 000 0 22 66 99 2 8 9 0 3 6666 3 11 0 9999999999999 0000 4 5 8888888
consensus : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
Reference ( family-691 ) : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GA-AAGTAGAAA-T-TTA-----CAGNT---GA-G-A-----AGA---------CGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTANTTTCGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATGAA--TGC-TNCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAT-TTTTAAANATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTNAGTAAATT-------------AA---NTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80624 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GATACGTAAAAA-T-TTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-AT----GTA----T--G-----CAGTATAATTT-------GCG----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTTCGTGTGATCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAAAAGT--TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TTTTTGTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCATGTATTGAT-TCTTAAATATGAAGTATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TGAAGTAAATT-------------AA---CTGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATTAATTTTGA
gi|80625 : AAAAAG-AGTA--GAAAA-A-------AAGCA-A-AGAT-AA-GGCAAGTAGAAA-T-TTA-----TAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CACTATAGTTT-------TCC----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTATTTGCATGTGACAT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---T--T--TT-----GC------T---T------G---G------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCAATACTGGGAACTGTCTTCGTGTATTTAT-TCTTAAATATGAAATATTAAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------TA---CTGATGGAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA
gi|80626 : AAAAAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACGAGTAGAAA-T-TTA-----TAAAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCGATTTATTTTC-TGCGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATATGTTATTCCT---A--T--TT-----GC------T---T------G----------TTT-----T------TT---ATAGATATGTTATGAA--TGC-TTCAATCCAAGGAACTATTGTCGTGTATTTGT-TCGTAAATATGAAATATTTAGCTAGTAA--T-ATT-TTACTG--ATCAGTGAATT-------------AA---ATGATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80627 : AAAGAG-AGTA--CAGAA-A-------GAGCA-T-AGAT-AA-TACAAGTAGAAA-T-TTA-----CAGAC---AG-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----ATA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-T------AGTT-T-A--CAT----------GTTTTCCCATTTATTTTCGAGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTTTTGTT--TATTGCAATACGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------G---T------TTC-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGC-TTCATTACTGGGAACTGCCTTTGTGTATTTAT-TCTGAAATATGAAGTATTTATTAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATG-------------AA---ATGATGAAGGGTT-------ATATAACCCAAACGATATATTTTGA
gi|80628 : AAAGGG-AGTA--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGGT-AA-GAGAAATAGAAA-T-TTA-----CGGAT---GA-G-A-----AGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TTG----TTA-TTT---TGCTT-T-A--CAC----------GTTTCCCCATTTATCTTCGTGTGACTT--A---A------GTTTGT-TTT-TGTT--AATTGCAATATTTA-TTTCT---A--T--TT-----GCTTGTTGT---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAAATATGGTATG-----------AATATTGGGAACACTTCTCGTGTATTTAT-TCTTTAATATAAAGTATTTAGCAAATAA--C-ATT-ATACAG--TTCAGTAAATT-------------AA---CTGA--------T-------ATAAAACCCGAACGATATATTTTGA
gi|80629 : AAGGAG-AGAA--CAGAA-A-------GAGCA-A-AGAT-AA-GACAAGTAGAAA-T-GTA-----CAGTT---GA-G-A-----AGA---------TGA------AA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCG----TTA-TTA---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCTCCATTTATTTTCGTGCAACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAAT---TT-TTTCT---G--T--GT-----GC------T---T------G---T------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATTAA--TGC-TTCAATA
gi|80630 : AGAGAA-AGTATCAAGAGTG-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA-TAG-AA-T-TT---------------------------A---------CGA------GA--AA-CT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG-----TA-TTT---TCTCT-TAA--CAT----------ATTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTC-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------T---G------TTT-----T------TT---GTAAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACT
gi|80631 : aaagacggtttAAAGAG-GGTG--AAGAA-G-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAGTAGAAG-T-TTA-----CAGCT---------------------------GT------GA--AG-TT----ATA----T--G-----CAGTAT
gi|80632 : AAAGAG-AGTA--GAGAA-G-------GAGCAGA-AGATTAA-GACAAGTAGAAA-T-ATA-----CAG------A-A-ATTTACAGA---------TGA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----TTA-TTA---TAGTT-T-A--
gi|80633 : AAAGAG-TGTA--AAGAA-T-------GAGCA-A-AGAT-AA-GAGAAACAGAAA-T-TTA-----CAGAT---------------------------GA------GA--AG-CT----GTA----T--G-----C-----AGTTT-------TCA----TAACTTA----AATT-T-G--CAT----------GTTTTCCCAaaatg
gi|80634 : AAAGAGTAGTA--GATAA-GAGTAGGAGAGTT-A-AGAT-AAAGAGAAGAAGAAAGT-TTAATTAACACTT---AA-TTA-----AAA-------------------A--AGTCT----GAA----A--T-----CAGTAT-GTTG-------ATG----TCA-TTAATTTAGTTGT-A---AT-----------TTGTCCCATTTGCCGTTATGTTGTCC--A---A------GTTT---TTC-TATTGCTGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TATGT------A---T------TTTGATATT------TT---TTAAA------ATTAA--TA-----AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--TAAATC-ATT-ATAGTA--TTTAACAAATT-------------------TGAATAAAAGTTCCATTCAGTACAA-CCAAGAGATATA
gi|80635 : aaAAAAG-AGTA--CAAAA-G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-GA-CAGAAG-G-CAA-----CAGT---------------------------CGA------GG--AG-CT----GTA----T--G-----CAGTATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATAGAATGTGACCTGCA---ATACTGGGATTGT-TAT-TGTG--TATT
gi|80636 : AAAG-AATA--AATAA-G-------GAGCA-A-TGAT-AA-CA-GA-TA--------TA-----TAACT---GT-A-T-----AGA---------CGA------TA--AG-TT----ATA----A--A-----CAGTATA-TTT-------TAG----AAA-TT----TAATT-A-A--CAT----------GTTCCTCCATTTTATTTCGTCTGACCT--C---T------GTATAT-ATT-TGTT--TATTGCAATAAGTT-TTTCT---G--T--TT-----GC------T---T------GTTTT------TTT-----T------TT---GTAAGTATGGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTCTTTAT-TCTTAAATATAAAATATTTAGCAAGTAA--T-AGT-ATACAG--TTTAGTAAGTA-------------AA---ATGTTGGTTAGTT-------ATATAACACG
gi|80637 : AGAG-TGTA--AAGAA-A-------GAATA-GTAGAT-AA-GA---GTAGGAG-GGTTA------AGATAAAGA-G-A-----AGA---------AGA------AATTAG-CA----CTC----T--GGAAT-CAGTAT-GTTG-------TCA----TTA-ATT---TAGTT---A--TA-----------ATTTGCCCATTTGCCGTTATGTTGTAC--A---A------GTTTTTCTTT-TGCT---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--TATTT-----TC------TA--T------G---T------ATT-----T------T------AAATATTTTTTAAAATTAA-TA-AACA-TGGGAATTGTTTTTGCATATTTGT-TTTTGTAAATGAAATATTTAGCA--T-A--T-ATCAATATAGTATTTAACAAATT-------------
gi|80638 : GAG-TGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA--AA-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--CA-CT----CTAAGCCT--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---CAGTTGT-A---AT-----------TTTTCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATCTTT-TGTC---GTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T----------------------------G---T------TTT-----CAATATGTT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTTAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80639 : agacagtagataatgGAG-AGTA--GATAA-G-------AAATA-A-AAA---A-GG-AAAT-GAAG-G-TTA------AGAT---AAAG-A-----AGA---------GGAATACTCGA--TA-CTCTAAGTC----T--G-----AAAT-CAGTTTGATGACGTCA----TTA-ATA---AAGTTGT-A---AT-----------TTTCCCCATTTGCCGTTATGTTGTTC--A---A------GTTTATATTT-TG-T--CGTTGCTATTATTC-TTTCT---A--T--AT-----TT------T---C------A---A------TAT-----G------TT---TTAAATATTTTATAAAATTGA-TA-AATA-TGGGAATTGTTTTTGCATACTTAT-TTTTATAGATAAAATATTAAGCA--TAA----ATCAATATAG--T
gi|80640 : agacagtagataatgTTT-------TCGACATTTA-TTA----GGTT-T-AAACATTTATAGAAAAATTTTCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TGTT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTTTATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80641 : agagaggaaggaagaaagaagagggatgtagaataagtatagaatttggacattgcttttccctttttttaaaaaattaaaacggcatttA--GAGA--G-------GAGAA-A-AGAT-AA-GA-AA--AATAA-T-TT----------T----------------A---------CGA------GA--AG-GT----GTA----T--G-----CATTATATTTT-------TCG----TAT-TTT---TAGTT-T-A--CAT----------ATTTTCCCATTTAATTTCA-----------------------TTGG-TTT-TGTT--TATTGCAATACGTC-TTTTT---A--C--TT-----GCT-----T---T------G---T------TTT-----TG-----TT---GTAAGTAAGGCATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAATTGTTTTC-TGTATTTATGTTTTAAAAA
gi|80642 : tagagaaattaacaA-----TAGAT---GA-G-A-----AGATGACTTTTGCGA------GA--AA-CT----GTA----TTCG-----TATTATA-TTT-------TCG----TAA-TTA---T--TT-T-A--CAT----------GTTTTTCCATTTAATTTCATGTGACCT--G---A------GTTTGT-TAG-TGT----------ATA-----CTTCT---A--T--TT-----GCA-----T---T------G---T------TTT-----T------T----GTGAGTAATGTATGAA--TGC-TGCAATACTGGGAGTTGTTT-CGTATATCTAC-ATTTAAAAATTAAATATTGAGCAAGTAA--A-ATT-ATACAG--TTAAGTCAATT-------------AA---ATGTTGATGAGTT-------GTGTAACCCATACTATACATTTTGAaa
gi|80643 : agataaagtagtaaagacgagataaagaaagtgtcatatgtggaggtggg-----AGT---------CGA------GT--AG-CT----GTT----T--A-----CAATATATTTT-------TCG----TAG-TTT---TAGTT-G-G--CAT-----------TTTCCCCATTTAATTTCGTGTGACAT--C---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAATA-TTTCT---A--T--TT-----GC------T---T------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAGTAT-GTA-AAG--TAC-TACAAAACTGGGAATTGTTCTCGTGTATTTAT-TTTAAAAGATTAATTACTTAGCAAG-AA--TAATT-ATACAA--TTTAGTAGGTT-------------AACATTTCTT---CAGTT-------ATATAACCCGAATGATAGATGTTAAAA
gi|80644 : gagaaatcgtgcaaagacaatacataatgatcaccactcatac-A-AGAT-AA-GA-AA--AGGAA-T-TT----------T---AA-G-A--------------------------GA--AG-CT----GTA----T--GGTATGCAGTGTACATA-------TCG----TAG-TTT---TAATT-A-A--CAT----------GTTTCCCCATTTAATTTCATGTGACCC--G---A------GTTTGT-TTT-TGTT--TATTGCAATAAGTA-TTTCT---A--T--TT-----CC------T---TTTTGTTG---T------TTT-----T------TT---GTAAGTAAGGTATGAA--TGG-TGCAATACTTAGT-TTGTTTTCGTGTATATAT-TT----AAACGAAAAAT--AGCAAGTAA--A-ATT-ATACAC--TTAAGTAAGTTGCAAGTTGTAGGTAA---TTGTTTATGAGTT-------ATATAACCCGAACT-TATATTTTGA
gi|80645 : agat----T--G-----CAGTATAGTTT-------TCA----T-A-TCA---TAGTT-T-A--CAA----------GTTTCCCCATTTATTTTCG--------------A------GTTT-T-T-----TT--TATTGCAATTAGTT-TTTCT---A--T--TT-----GC------A---A------GT--T------TTT-----T------TT---GTAAATAGTGTATGAA--CGA-TTCAATACTGGGAACTGTCTTTGTATATTTAT-TCTTAAGTATAAAGCATTTAGCAAGTAA--T-ACT-
gi|80646 : TCCCCATTTCAGTTCATGTA---T--ATGCA------GTTTAT-CTT-TATT--TAGAGCTATTAATC-TTTCA---A--T--TT------C------TA--T------A---C------CTT-----T------AT---ATAGGTTCTGTTCAAA--TACATGAAACAATGGGA-CTGTTTT-ATACATTTAC-ATTTAAAGACAAAATATTTAGCAGAAAA--T-ATT-ATAAAG--TTGA
gi|80647 : ttatagaaaaatgCCATTTGATTTCATGTTGTGT--A---A------GTTTGT-TTT-TG-T--CAGTGCAATTAATC-TTTCG---AGGT--TTTCATGGT------T---T------T---TTATTTCTTT-----T------TT---GT-AAT-TGGTA--AA--AGT-T---------GGTGTTGTTTTTGTATATTTGT-TTTTAAAGATAAAATATTTTGCATATGT--C-AAT-AAACAG--TTTAATAA
gi|80648 : ATTTAATTCTGTGTGACCT--A---A------GTTTGT-TTT-TCTT--TATTGCAATAATTC-TTTCT---A--T--CT-----AC------T---T------GCT-T------TTT-----T------TT---GTAACCATGGTATCAT--TGC-TGCAATACTGGGA-------------ATTTAT-TTTAAAGAATGAAATATTTACCAATTAA--A-ATT-ATACAG--TTTAGTAAGTT-------------AA---ATAATGGCGATTT-------ATATGACCAAAACAATATATTT
gi|80649 : TATTTTCGTGTGACCT--T---A------GTTT---TAT-T-TT--TATTGCAATAAGTT-TTTTTTATA--T--TT-----GC------T---T----------T------TTT-----T------GT---GTAAATATGGCATGAA--TGC-TTCAGTACCGGGAACCGTCTTCGTCT-TTTAT-
gi|80650 : ------TTT-----T------TT---GTAGATATGGTATGAA--TGT-TTCAATACTGGGAACTGTTTTCGTGTATTTAC-TCTTAAATATGAAATATTTAGCAAGTAA--T-ATT-ATACAG--TTAAGTAAATC-------------AA---TTCATGAAGAGTT-------ATATAACCCGAACGATATATTTTGAAA