lowQualScore                  :              1                                                       1                                                                                 2222222222222222222           111                                                    111111                          111111111     11111111111111111111111111111                                                                    11111111                              222222222222                11       3333333333333333333333333333333333333                                                    11111111111     22222222                   22222222222       2222222222222222             11111111                                                               111111                11111                                                                                         111111111111            111           22222222                  1111    1111                    11     1                                      1111    111                                                          22            111            
lowQualScore                  :              5                               3 1     99   3    4     2  4        1     2  3   33  3 33    1         5    777777  444 2 888  66      9  6666666666666666666  555      222  9999 555      2     1    77 77 2 7  7777777  4    444444     33     3    55555    888888888   0 66666666666666666666666666666 1    22              3 66666  5  55555     333  88888 22   1 2  1  55555555     3  1  4  33 333 8888  0  111111111111   33 11 33     66   33  4444444444444444444444444444444444444 5555 33 2 1  33 2 5555   2 33     0         6666   33333333333 2   00000000 0   3 555  44     77777777777     6 3333333333333333 2 33    555 33333333   0     5        88 2      33  1  4    3      555   99     33 333333  7  3      7   11111      66  7777 7777 0  8              6  2     1    3 999            6   44  5  1    3   333333333333  0  777    222  777   66 00000000           4      3333    7777   4 2   2  777     33  0  0                     66  1      55    4444    000             99                               6  1        00            444 1          
lowQualScore                  :              .                               . .     ..   .    .     .  .        .     .  .   ..  . ..    .         .    ......  ... . ...  ..      .  ...................  ...      ...  .... ...      .     .    .. .. . .  .......  .    ......     ..     .    .....    .........   . ............................. .    ..              . .....  .  .....     ...  ..... ..   . .  .  ........     .  .  .  .. ... ....  .  ............   .. .. ..     ..   ..  ..................................... .... .. . .  .. . ....   . ..     .         ....   ........... .   ........ .   . ...  ..     ...........     . ................ . ..    ... ........   .     .        .. .      ..  .  .    .      ...   ..     .. ......  .  .      .   .....      ..  .... .... .  .              .  .     .    . ...            .   ..  .  .    .   ............  .  ...    ...  ...   .. ........           .      ....    ....   . .   .  ...     ..  .  .                     ..  .      ..    ....    ...             ..                               .  .        ..            ... .          
lowQualScore                  :              4                               2 7     22   7    4     3  7        8     8  8   44  4 11    3         2    222222  444 5 222  11      1  1111111111111111111  000      444  1111 000      9     6    99 99 9 2  6666666  4    555555     11     4    66666    222222222   9 11111111111111111111111111111 8    44              3 33333  0  33333     000  33333 33   7 9  6  00000000     0  6  7  11 222 5555  8  666666666666   22 88 44     88   77  1111111111111111111111111111111111111 7777 77 7 3  77 7 7777   9 66     6         1111   66666666666 9   44444444 2   8 888  88     22222222222     2 0000000000000000 9 99    000 99999999   9     9        00 7      99  4  6    2      000   99     99 000000  8  1      2   22222      77  1111 1111 8  0              0  2     8    3 111            5   66  6  8    6   666666666666  6  000    222  888   11 66666666           4      8888    2222   4 7   6  444     88  8  8                     99  0      55    2222    222             22                               7  8        22            000 0          
consensus                     : GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGA--TGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTA---G--CC---A-TG--TANNACAATTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAATAT--TG-CACTG--TCATCNGCAT-----ATAA---NATTA-TTTAC----A-NT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-AA-A---AACAA-A-AG-N---G--GGC-CNAGAAT-ACTT---CCTTGNGGTACGCC-GC---A---NGTAAC---TTGGGT-AGATT--TCGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T-T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TC-GAGAGCTT-A------------CTACATA--GAAT---AA---C---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCC-GGTATAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----T----CAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGANAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT----AGA-ACTTTNGA--TATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGNACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
Reference ( gi|141957 )       : GAATTTCATGACCTTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAACAACATACATTCGGTTTTGCCTAGA--TGAAGGGACAATTTATTATCAACTA---A--CC---A-TG--TAGAACAATTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAATAT--TA-CACTG--TCATCTGCAT-----ATAA---TATTAATTTAC----A-AT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-AA-A---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CCAGGAT-GCTT---CCCTGTGGTACGCC-GC---A---AGTAAC---TTGGGT-AAATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T-T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TCAGAGAGCTT-A------------TTATATA--GAAT---AA---C---GTGGTCAACGGTATCAAACACCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCC-GGTATAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----T----CAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACACTCT----AGA-ACTTTTGA--TATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-GGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141958                     : GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--TTAAAAGAGCCAAAGAACATACATTCGGTTTTGCCTAGA--TGAAGGGACAGTTTATTGTCAACTA---G--CC---A-TG--TAGAACAATTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAACAT--GA-CACTG--TCGTCTGCAT-----ATAA---TAATAATTTAC----A-AT-CGGAGTCGA--TAC-GC--GT-AGGC--ATATCATTGCCATA-AC----AT-AG-A---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CAAGGAT-GCTT---CCCTGTGGTACGCC-GC---A---AGTAAC---TGGGGT-AGATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T-T----TCG-GTTAAATTAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TAAGAGAGCGT-A------------TTTCATA--AACT---AA---C---GTGGTCAACGATATCAGACGCCTTCTGT--AGATCGAGTAAAACCAT---TCA-GGTATAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTAATG---TTTAGTAAAA----T----CAAAAAGGTGAATAATACATGTATCAGTGG-GTAATTTACTCCTAAAACCGGAC--TTAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCG-AAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT----AGA-ACTTTTGA--TATGAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAC--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATAA-AGTACAATGCC-TGATTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141959                     : GGATTTTATGACCATTGTATGTTACCGTAATTGTCTGAACTTTTTTAAATCTT--CTAGAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGA--TGAAAGGACAGTTTATTAGCAACTA---G--CC---A-TG--TAGAACAATTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CA---AACAATTT--TA-CACTG--TCGTCTGCAT-----ATAA---TAATAATTTAC----A-AT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-AA-A---AATAA-A-AG-A---G--CGC-ACAGGAT-GTTT---CCCTGTGTTACGCC-GC---A---AGTAAC---TTGGGT-AGATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T-T----ACG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGGCGC---GACTCCCAT---T-TCAGAGAGCTT-A------------ATA-AGAGTGAAT---AA---C---GTGGTCAACGGTATCAAACGC------T--AGATCGAGTAAAACCAT---TCC-GGT-TAA-A-AG-A-CCATT-TGTATTGTTATG---TTTAATAAAA----T----CAATAAGGTGAATAAGACATGTATGAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---CCCGCAAATTGGTTAT-ATACAAAACGCTCT----AGA-AGTTTTGA--TTTAAC--ATTAAGTATTCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAA--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTAACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-CGAGTCAATAAAC---AAAATAATAATA
gi|141960                     : GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTT----GGTTTTGCCTAGATGA
gi|141961                     : GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACTGTAAATGACTGCACTTTTT-AAGGCTT--CTAGAA-AGGCAAA-AATATACATTCGGTTTTGCCTAGA--TAAAGGGACAGTTTATTATCAACTA---G--CC---T-TG--CAGAACTAT-ATC-----CA--T-GAT-TCGACT---AAGCCT--ATTTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TTAG--CG---AACAATTT--TA-CATTG--TCGTCTGCAT-----ATAA---TAATAATTTAC----A-AT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-AA-A---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CATGGAT-GCTT---CCCTGTGGTACGCC-GC---A---AGTCAC---TTGGGT-ATATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------AT-TGTCACT--TA------C---T----G--T-GATC--T-T----TCG-GTGAGATATGATTGGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGT---GACTCCCAT---T-TCAGAGAACTT-A------------TTGCATA--GAAT---AA---C---GTGGTCAATGGTATCAAACACCTTCTGT--AGATCGAGTTAAACCAT---TCC-GGTATAT-A-G--A-TCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----T----CGAAAAGATGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAACACCGGAA--TGAAACTCAT-ACAGAAGTGAA----TGTTT---ATCTTAAAA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTAT----AAA-ACTTTTGA--TATAAC--ATTAAGTATGCTTACTGGCCTGAAATT--ACTAACTTACAAAGG----CCTAG--ATATTTTGTAAAT--CCGGCTGACTATTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGTGTCAATGGAC---ATATTAATAATagggacagtttattatcaactagccatgtagaacaattatccattatgcgactaagtctatctgcaataacattagggtctttgtcagcgaacaatattacactgtcatctgcatataataataatcggagtcgatgcacgtaggcatatcattgacataacataacaataaaagagggcccaggtttcttccctgtggtacgctgcaagtaactttggtagattttgatgaaactttgtttatcttcacttactgtgatctttcggttagataagatttgaaccaatttatcgacgcgactcccatttcagagagcctattacatagaataacgtggtcaacggtatcaaacgccttctgtaggtcgagtaaaaccattccggtataaagaccatttgcattgttatgtttaacaaaatcaaaaaggtgaataagacatgtatcagtggagtatttactcctaaaaccggactggaactcatacagaagagagtttttatctaaaaaaatctgcaaattagttatatacagaacgctctagaacttttgatataacattaagtatgctaactggcctataattaccaacttcccaaggactagactttttgtaaatcgggctgacttttgcagttttcatttcatcaggaacaatgcctgagtcaatagacatattaataata
gi|141962                     : GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAA-TTTTTTAAGACTT--CCAAAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGA--TGAAGGGACAGTTTATTATCAACTA---G--CC---A-TG--TAGAACAATTTTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAATAT--TA-CACTG--TCATCTGCAT-----ATAA---TAATAATTTAC----A-AT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-TA-A---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CCAGGAT-GCTT---TTCTGTGGTACGCC-GC---A---AGTAAC---TTGGGT-AGATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T-T----
gi|141963                     :                                          TTTTTA--TCTT--TTA-AAGA---AAA-AACATAGCTTCGGTTTTGT-TAGGGTTGAA------ATTTACTAGCCATTGTTTAGCCC---A-C---TGGGATA-TTATT-----AA--AAGATCATGATT---AATTAA--ACCTTC-A---ATATCACTTA------C--T--GATGAGGCTG---AATAGTATAATG-AACTG--TCGTCAGCAT-----ACAAACGTGT-------C----A-AA-CTGAGTAAA--T----T--GTTAGCT--ATATCATTAACATA-AA----TT-AA-G---AATAA-T-AA-A---G--GTC-CAAGAACGGC-----ACTTGTGGCACTCCTGCATTA---AGAGAT---TT---T-AAATT--
gi|141964                     :                                                             AGAACCAAATACAATGCATTCAGTTTTACCAAGA--TGCAACGATAATTTGTTGTCAGCTA---A--CC---A-TT--TACTACAATT-TT-----TA--A-GTTCATTTCT---AAGTAC--ATTTTCTA---ATAACA-TCAGGATCTT--T--G-T--G--CG---AG-AATAggaa
gi|141966                     :                                                              GAGCCAAAAATAACGCACTCGGTTAAACCAAGA--TGTATG-ACAGCTTATTATATTCTA---G--CCGAGA-TGAGCAAGACA-----C-----CA-----AC-AC-ACTTCAAAATTT--AGAAGA-A---ATAACA-CTATATTAGT--T--A-TAAG--CT---ATAAGAAT--CG-TGCTG--TCATCAGCAT-----ATAG---AATTA-TTTAC----A-TT-CGGGGTCAA--TGCTAC---T-AACC--ATGTCATTTACATG-GT----A--AC-A---AATAG-A-AG-C---G--GGC-CTAAGAT-GCTA---CCCTGTGGAACGCC-AC---A---TGTTACAGATT---T-ATACT--TTGA--AAATACATCG--TT-----A-------A-----CACT--AA------C---T----GGTT-G-TT--T-T----TCGTGTTAAATAAGACATGAACAAATCAA-----------TATTA--------T-AAC-C---AATT--GAT---T-TT----AGTTT-A------------CTACATA--AAAT---AT---G---ATGATCAGCTGTTTCAAAGGATGTTTGT--AAATCTAACATAACCAT---GCC-TGTATAA-A-A--T-CCTTT-AGCACTATTGCT---TTCAAT---A----T----CTATAAATTGGACAAGGCAATTTTCAGTTGAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TCCAATTCATCCCATA----AA----TTGTTGCAATCT---TA---GAT--G---TTCTCAAGTTGAGTAT-ATACAGACCTTTCT----AGA-ATTTTAGA--
gi|141968                     :                                                              GACCCAAATAATATACATTCTGTCTGTCCCAGA--TGCAATGACGGTTTGTTGTCTATTA---A--CC---A-TT--TATTACAATTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAATA----G-CACTA--TCATCGGCAT-----AGAG---AATGATTTTAC----A-TT-T----TTGACTTAT-ACTAAT-ACTC--ATATCATTAACATA-GC----AT-AA-A---AACAA-T-AA-T---G--GCC-CCAAAAT-ACTT---CTTTGAGGAACTCC-AC---ATACAATATT---TT---C-AAAGT--CGGA--CATAGTATTG--TT-----A-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--TAC----TTG-ACAAG-TACGATTTAAAC----CAT-----------T-AGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-TC---TAACTT-A------------CGACATA--AAAT---GT---T---GTGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCC-AGTAAAT-A-G--G-CCTTT-TACCTTTTGATT---TTTA-TGTGA----T----CTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCAGCCGAGT-AGGTCCCTCGGAATCCACTC--TGAAGATCAT-ATAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAG----CTCTTTCAAGA-ATTTAAGA--AACAATTGATAAA--ATACTAAATGGTCTATAGTT--A
gi|141967                     :                                                              GACCCAAATAATATACATTCTGTCTTTCCCAGA--TGCAATGACAGTTTGTTGTCTATTA---A--CC---A-TT--TATTACAATTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGAATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAATA----G-CACTA--TCATAGGCAT-----AGAG---AATGATTTTAC----A-TT-T----TTTACTTAT-AC--TA-ATGCTCATATCATTTACATA-GC----AT-AA-A---CACAA-T-AA-T---G--GCC-CCAAAAT-ACTT---CCTTGAGGAACTCC-AC---ATACAATATT---TT---C-AAAGT--CGGACATGGTA--TTG--TT-----A-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--T-A----CCT-GACAAGTACGATTGAAAC----CAC-----------T-CGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-TC---TAACTT-A------------CGACATA--AAAT---GT---T---ATGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCC-AGTAAAT-A-G--G-CGTTT-TGCCTTTTGATT---TTTTATGTGA----T----CTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCGGTCGAGT-A---GCCTCGGAATCCATTC--TGAAGATCAT-ACAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCT----AGA-ATTTTAGA--AACAATTGATAAA--ATACTAACTGGTCTATAGTT--A
gi|141969                     :                                                              GAACCGGATAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAA--TGCAGGGATAATTTATTATCCACTA---G--CC---ACTG--ACTAACAA----------------GAT-G----T---AGGTCC---TC------------CG-TCAGAACCTC--C----TCAG--CATGCAACAAGAA--TA-CAA-GAATCATCTGCAT-----ATAA---CAATAGTTTGT-------T-T----TTAA--CAC-AG--AT--GAC--ATGGCATTTACATA-A-----ATCAA-G---AACAG-A-AG-T---G--GTC-CAATAAT-TCAA---CCTTGTGGCACTCC-AC---A---TGCGAT---TGGGGC-A---T--TCGA--AGAAA--GTG--TCCCCGAC-------ACATG-AACA--AG------C---T----G--C-TGTC--T-G----TCC-GAAAGGTAGGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATG---TCATCGCCTAGA--CCTAT---TGTCTG-GAGTTTCA------------CGAGA-A--GAAC---AG---T---GTGATCTACAGTATCGTAGGCTTTTTGT--AGATCTAATAAAATCATACCTAC-AGTAT---T-A--T-CCGTA-TCCATTTCCA-G---CTTTATATAATCTGT----CAAA----TGGATGAGACACGTGTCAATTGAAA-ATACACTTCTGAACCCTGAC--TGAAATTTAT-A
gi|141970                     :                                                              GATCCGAATAAAATGGATTCAGTTTTACCCAAA--TGCAGGAATAATTTATTGTCCACTA---G--CC---A-
gi|141971                     :                                                              GAACCGAAAAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAA--TGAAGAGATAATTTATTGTCAACTA---G--CC---A-ctgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaatcatctgcatatagcaacagtttgtgtttaaccacagctgacatgtcatttttataaatcaagaacagtagtggtccaagaattgaaccttgtggcactccacatgtaatagggacatttgaagaatgtgtcccagacacatcaacaagctgtggtctgtccgaaaggtaagacttaaaccattttaaaatgccatcgcctagacctgattcctgaagttccatgagaagaacaatgtgatccacagtttcgaaaaccttttgtagatctaatagaatcatacctacaacataacccttatccatttccagccttatataatttgtcaaatggatgagacacgtcagttgaaaaaccacttctgaaccctgattgaaatttttataacaacttgtttttatttgaagtaagattcaactcgttcatagacaactttttcaaatatcttagacacaattcttaatatagaaacagggcgattattcccaactgaggttttatcatttttcttataaaggggaacaaatctttctgccttgaggtcatctgggaccgcgccttgaattaaagactaaagattaataata
gi|141972                     :                                                                 CTAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAAGA--TGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTA---A--CT---A-TT--TATTACACTTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--T--A-TGTG--AG---AAAAAGAA--TAGCACTA--TCATCGGCAT-----AGAG---AATAATTTTAC----ATTT-TTGACTT-A--TAC-TC--AT-GCTC--ATATCATTTACAT---------T-AA-A---AACAG-T-TA-T---G--GCC-CCATAAT-ACTT---CCTTGAGGAACTCC-AC---A---ctgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaatcatctgcatctaacaataatttgtttttaaccacagcttacatttcattcacataaataaagaacagtagtggtccaaaaattaaaccttgtggcactccacatgtgatattatgatgaa
gi|141973                     :                                                                 CCAAATAATATATATTATGTCTTTCCAAGA--TGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTA---A--CC---A-TT--TATTACAATTTTCTAGTTCA--T---T-AC--CT---AAACCT---TCACT-A---ATGACA-TTAGGATCTTCAT--G-TGAG--AA---AAGAATA----G-CACTA--TCATCGGCATAGAGAATAA---TATC--TTT-C----A-AC-CG
gi|141974                     :                                                                  CAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAGGA--TGAAAAGAAAGTTTGTTGTCTATTT---A--TC---A-TT--TATAACAATTTTC---------T-GGT-TC-ATT-----GCCTTAAACTTC-ACTTATAGCA-TTAGGATATTTAT--G-TGAG--AA---AAGAATA----G-CACTA--TCATCGGCAT-----AGAG---AATAACTTTAC----ATTT-TTGACTT-A--TGC-TA--AT-GCTC--ATATCATTTACATA-GC----AT-AA-A---AACAG-A-A--A---T--GGCACCAAAAT-ACTT---CCTTGAGGAACTCC-AC---A---
gi|141960                     :                                                                               TTTGGTTTTGCCTAGA--TGAAGGGACAGTTTATTATCAACTA---G--CC---A-TG--TAGAACAATTATC-----CA--T-TAT-GCGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAATAT--TA-CACTG--TCATCTGCAT-----ATAA---TA-------AT----A-AT-CGGAGTCGA--TGC-AC--GT-AGGC--ATATCATTGACATA-AC----AT-AA-C---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CCAGGTT-TCTT---CCCTGTGGTACGCT-GC---A---AGTAAC---TTTGGT-AGATT--TTGA--TGAAACTTTG--TT-----T-------ATCTT-CACT--TA------C---T----G--T-GATC--T-T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TCAGAGAGCCT-A------------TTACATA--GAAT---AA---C---GTGGTCAACGGTATCAAACGCCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCC-GGTATAA-A-G--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAACAAAA----T----CAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAG----TTTTT---ATCTA--AA---AAA--A---TCTGCAAATTAGTTAT-ATACAGAACGCTCT----AGA-ACTTTTGA--TATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCCAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTTTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141975                     :                                                                                                                                                                                               gaatttcatgaccgttgcatgtaaccgtaaatgactgaacACAATGT--TG-TA-----TCATCTGCAT-----ATAA----ATCAGTTT-C----A-G--CAGTGTCAG--TGT-AAA-GT--GGT--AAATCATTAATA-A-AC----AG-AAGA---AATAA-A-AG-A---G--GGC-CTAAAAT-AGAA---CCTTGAGGTACACC-AT---C---TGTCAC---T--GTT-TGATTGGTTGA--TAATACGTCA--TT-----T-------AGGGA-AATT--TT------C---T----G--T-------T-T----TCG-GTTATGTAAG-TATGAAG----AGA---------------A--------CC-ATGC---TAATACCTT---G-TCTGAAAGTTT-ATAGACTTTCAACTTTTGCA--AAAG---AATTTT---ATGGTCCACTAGATCAAACGCTTTCTTG--AAATCAACCATAACTAC---TCC-TAT-TAA-A-G--ATCCATT-
gi|141976                     :                                                                                                                                                                                                                                                  -CACTA--TCATCAGCAT-----ATAA---GATTA-TTTAC----A-TT------------TTT-AC--TT-ATGC--AG--CATTGACACG-AC----AT-AA-A-----CAA-A-AGCA---ACTGAC-CCAGTAT-ACTT---CTT-------------C---A---AGCAAAA--TCGTATGAAATG--TTCA--TGAAA-TCTGACTT-----T-------GTATG--ATT--AA------CATTT----A--TAGATTGTT-TATGATCA-GTCAAATAAGATAGAAAC----CGC-----------T-CAA--------TTGACTC---CATCCCCAT---T-T-----ATTTT-A------------GTTTACA--ACATTCAAG---C---AT---CAACTGTGTCAAAAGCCTCCTATTAAGGTCCAACATAACCAT---TCC-TGTATAA-A-G--A-CCTTT-TGAACT--TA-A---TTTGGTCCG-----T----CA----GATGAATAAGGCAGGCGTCAATGGAGC-AGTTACATCTAAAACC--ACTTTGTAGTTCAT-ATAAAAGACCT----TGTTT---AACT---AA---GAATGA---TTCT--AGTTGGCTGTGACACAGCTCTTTCT----AAA-AGACTTGAATCAT-AC--ATAAA--ATGCTAACAGGTCTATAGTTTGAT--ACATC----AG----ATTTGCCATTTTTCTTAAATAATGGTTTGATTTTAACACTTTTAAGTTCA-CATGGCACAATGTT-ACAGGTGATAGA
gi|141977                     :                                                                                                                                                                                                                                                       G--TCATCAGCAC-----ACA----TGTTCATTTTCG---A-ATACTGAGT------GC-A----T-AAG-----------GGCATA-ACATTGAT-AA-AGATAATAA-ATAG-AAGTG--GGC-CTAAAAC-AGAT---CCTTGGGGTACACC-AC---A---TGTTAC----TGATT-TACTT--TC----TGAAA----G--TG-----T-------ACCAGATATT--GAACCTTTC---T----G--T-GAAT--A-T----TCA-CATCAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                        --TCATCTGCAT-----ATAG---CA-------AC----A-GT-TTGTGTTTA--ACC-ACA-GC-TGAC--ATGTCATTTTTATA-A-----ATCAA-G---AACAG-T-AG-T---G--GTC-CAAGAAT----TGAACCTTGTGGCACTCC-AC---A---TGTAA-----TAGGG-ACATT--T-GA--AGAA--TGTG--TC-----CCAGACACATCAA-CA----AG------C---T----G--T-GGTC--T-G----TCC-GAAAGGTAAGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATGCCATCGCCTA---GAC-CTGAT---T-CCTGA-AGTTCCA------------TGAGA-A--GAAC---AA---T---GTGATCCACAGTTTCGAAAACCTTTTGT--AGATCTAATAGAATCAT---ACC---TACAACATA--A-CCCTTATCCATTTCCA-G---CCTTATATAA----TTTGTCAAA----TGGATGAGACACGT--CAGTTGAAA-AACCACTTCTGAACCCTGAT--TGAAATTTTT-ATA----ACAACTTGTTTTT---ATTT---GAAGTAAG--A---TT--CAACTCGTTCAT-AGACA----ACTTTTTC-AAATATCTTAGA--CACAAT--TCTTAATATAGAAACAGGGCGATTATT--CCCAACT----GAGGTTTTATCAT--TTTTCTTATAAAG--GGGAACAAATCTTTCTGCCTTGAGGTCATCT-GGGACCGCGCCTTGAATTAA-AGACTAAAGATTAATAATA
gi|141971                     :                                                                                                                     gatccgaataaaatggattcagttttacccaaatgcaggaataatttattgtccactagccactgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaa--TCATCTGCAT-----CTAA---CAATAATTTGTTTTTA-AC-CACAG-----------C--TT-A--C--ATTTCATTCACATA-A-----AT-AA-AG--AACAG-T-AG-T---G--GTC-CAAAAAT----TAAACCTTGTGGCACTCC-AC---A---TGTGAT------------ATT--ATGA--TGAA
gi|141978                     :                                                                                                                                                        gaaccgaaaaagatggattcagttttacccaaatgaagagataatttattgtcaactagccactgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaaGGAG--GA--TAC-ACAAGT-AGGC--ATGTCATTGATGTACAC-----T-AA-G---AACAA-T-AA-C---G--GTC-CGAGGAC-AGTA---CCTTGGGGTACACC-AG---A---AGTAAC---T
gi|141979                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgtctgcaaacagtctgtcagtGA--TAC-ACAAGT-AGGC--ATGTCATTGATGTACAC-----T-AA-G---AACAA-T-AA-C---G--GTC-CCAGGAC-AGTA---CCCTGGGGTACGCC-AG---A---AGTAAC---GTGggtgcttacgatga
gi|141980                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --TGC-AT--AA-GGGC--CTATCATTGGTA-A-AG----AT-AATA---AATAG-A-AG-T---G--GGC-CTAAAAC-AGAT---CCTTGAGGTACACC-AC---A---TGTTAC---T-GATT-TACTT--TC----TGAAA----G--TG-----T-------ATCAGATATTGAAA------C---TTTTTG--T-GAGC--T-T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141981                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --TGC-AT--AA-GGGC--ATATCATTGATA-A-AG----AT-AATA---AATAG-A-AG-T---G--GGC-CTAAAAC-AGAT---CCTTGGGGTACACC-AC---A---TGTTAC----TGATT-TACTT--TC----TGAAA----G--TG-----T-------ACCAGATATT--GAAATTTTT---T----G--T-GAAT--G-T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAAATTTGTACATCT-TTA--------TGGAAAT---GGTATACAT---T-T-----AGTTT-T------------TCAAACA--GTA----AA---CT--ATGATCAACCAGATCAAATGCTTTAGAT--AGGTCAAGAAATATGGT---TCCAGATAT
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --GC-AGAC--ATATCATTGACAT--AT----ATCAA-A---AATAACA-AA-A---G--GG
gi|141982                     :                                                                                                                                                              agacccaaaaagaattgattctgtcttcccaagatgcaatgaaagtgtattgtttacctatgattcagtaacatgttcaagctttgcattgtgatttatatttcccagtaattaggattccggaatcatcagcatataaaagaaatgtgttgtttacaaa--ATATCATTAATATA-AA----CT-AA-G---AAAAG-A-AG-A---G--GGC-CTAATAT-AGAT---CCCTGTGGCACACC-tgggggctagtatagacgcttgagggaccccacacgagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaataacataattctgtgattgacagtgtcgaaggttttctctaggtcaagtaacaccattcctaccaggttacctttattcatatggaactaaatgaaatcagataggtgaataagacaactacctgtggaaaaaacgcgtctaaaacaaaattggaa
gi|141983                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCATTGATGTA-GC----AG-AG-A---AATGA-A-AG-C---G--GGC-CGAGCAT-CGTT---CCCTGTGGCACACC-GG---A---GCTAAC---
gi|141984                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTTT-A------------CCACATC--AAAT---AT---G---ATAATCAACTGAATCAAAAGCTTTCTGT--TAATCTAACATAACCAT---GCC-AGTATAT-A-G--T-CCTTT-GGTACTATTGCT---TCTAACATGA----T----TCATTAAGTAGACAAGGCAAGTATCAGAACAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TGCAATTCAT-ACAATA---AA----TTGTT---ATC
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------------TTA-ATA--ACAT---AA---TTCTGTGATTGACAGTGTCGAAGGTTTTCTCT--AGGTCAAGTAACACCAT---TCC---TACCA-G-GTTA-CC-TT-T--ATTCATATGGAACTAAATGAAA----T----CAGATAGGTGAATAAGACAACTACCTGTGGAAA-AAACGCGTCTAAAACAAAAT--TGGAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111                           222222222222222222                                                                    1111                      222222222222222222222222222222222222222222222222222                                   1111111                                                               2222222222222                111       2222222222222222222222222222222                                                     11111111111     11111111                   111   222222222       1111111111    1111111                                                                                                                 1111                                                                                                             111   11                                               11                                            1111                                                                               111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1 0     77   1    4     3  1        1     1  1     1 22              1       333 2 22222222 33 22 5555  8888888 2  2  000000000000000000   444      888   1 5 444      2     1    66 66 2 4  5555555  5   2 2222      22     1        444444444444444444444444444444444444444444444444444     22              1 666666 3 3  0000000 3        3333 222 0  1  0  4444444444 1    1  1  4  1   1     1111111111111  33 77777      222  33   6666666666666666666666666666666 5555 33 2 0  33 33 5555  33 1  0             5555   22222222222 2   88888888     2 555   5     000 3 777777777     2 3333333333    4444444  33    99999         1     0  3         33     3  0 1      444   8   2   2 2 5555  1  2      1   88888   1  44  3333  3  6              1        0    3 444            5   44  0  0    3   555555  7777     666    777  777   55 888   22           4       1 4    4   99     1   4     22     8                     66         22    2222     77             77                               5  1        6             111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .     ..   .    .     .  .        .     .  .     . ..              .       ... . ........ .. .. ....  ....... .  .  ..................   ...      ...   . . ...      .     .    .. .. . .  .......  .   . ....      ..     .        ...................................................     ..              . ...... . .  ....... .        .... ... .  .  .  .......... .    .  .  .  .   .     .............  .. .....      ...  ..   ............................... .... .. . .  .. .. ....  .. .  .             ....   ........... .   ........     . ...   .     ... . .........     . ..........    .......  ..    .....         .     .  .         ..     .  . .      ...   .   .   . . ....  .  .      .   .....   .  ..  ....  .  .              .        .    . ...            .   ..  .  .    .   ......  ....     ...    ...  ...   .. ...   ..           .       . .    .   ..     .   .     ..     .                     ..         ..    ....     ..             ..                               .  .        .             ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4 1     99   7    1     6  0        9     0  0     0 88              8       999 2 55555555 44 00 3333  1111111 5  8  666666666666666666   444      222   0 0 444      5     1    99 99 5 3  8888888  6   4 4444      66     0        777777777777777777777777777777777777777777777777777     33              6 666666 2 2  0000000 2        8888 888 6  0  5  8888888888 6    0  8  1  6   0     8888888888888  22 88888      555  44   6666666666666666666666666666666 3333 44 5 7  44 44 3333  66 0  2             7777   77777777777 7   88888888     8 444   4     888 1 444444444     9 3333333333    3333333  77    44444         0     7  2         77     7  2 0      777   7   7   9 9 5555  0  9      0   99999   9  11  1111  8  7              0        8    1 888            2   22  2  8    3   111111  7777     444    000  000   55 000   55           0       2 1    0   55     0   4     22     4                     11         00    1111     99             99                               7  0        7             777            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTT---C-CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
Reference ( family-682 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCNAGAAT---ACTT---C-CTTGNGGTACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGANAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGNACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141957                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCTTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAACAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAATTTATTATCAACTAACC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA--------T--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTT---C-CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAAA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----TT----ATAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACACCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACACTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-GGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141958                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--TTAAAAGAGCCAAAGAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTGTCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAC-AT--GACACTG--TCGTCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-AC-GC--GTAGGC--ATATCATTGCCATA-A-C----A-T-AG-------A-AATAAAAG---AG---GGCCAAGGAT---GCTT---C-CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TGGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAAATTAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TAA-GAG---AGCGT-A----TT----TCAT-------AA--ACTAAC---GTGGTCAACGATATCAGACGCCTTCTGT--AGATCGAGTAAAACCAT---TCAGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTAATG---TTTAGTAAAA----TCAAAAAGGTGAATAATACATGTATCAGTGG-GTAATTTACTCCTAAAACCGGAC--TTAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCG-AAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATGAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAC--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATAA-AGTACAATGCC-TGATTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141959                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGATTTTATGACCATTGTATGTTACCGTAATTGTCTGAACTTTTTTAAATCTT--CTAGAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAAGGACAGTTTATTAGCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CA---AACAAT-TT--TACACTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---CGCACAGGAT---GTTT---C-CCTGTGTTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----ACG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGGCGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----AT----A-AG-------AGTGAATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCT--------AGATCGAGTAAAACCAT---TCCGGTT-AAA-A-G--A-CCATT-TGTATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAATAAGGTGAATAAGACATGTATGAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---CCCGCAAATTGGTTAT-ATACAAAACGCTCT-AGA--AGTTTTGAT-TTAAC--ATTAAGTATTCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAA--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTAACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-CGAGTCAATAAAC---AAAATAATAATA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTT----GGTTTTGCCTAGATGA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-TAT-GCGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA-------------------AT-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------C-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGTT---TCTT---C-CCTGTGGTACGCT-GCAAGTAAC---TTTGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCCT-A----TT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAACAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAG----TTTTT---ATCT---AA---AAA--AA--TCTGCAAATTAGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCCAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTTTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATAagggacagtttattatcaactagccatgtagaacaattatccattatgcgactaagtctatctgcaataacattagggtctttgtcagcgaacaatattacactgtcatctgcatataataataatcggagtcgatgcacgtaggcatatcattgacataacataacaataaaagagggcccaggtttcttccctgtggtacgctgcaagtaactttggtagattttgatgaaactttgtttatcttcacttactgtgatctttcggttagataagatttgaaccaatttatcgacgcgactcccatttcagagagcctattacatagaataacgtggtcaacggtatcaaacgccttctgtaggtcgagtaaaaccattccggtataaagaccatttgcattgttatgtttaacaaaatcaaaaaggtgaataagacatgtatcagtggagtatttactcctaaaaccggactggaactcatacagaagagagtttttatctaaaaaaatctgcaaattagttatatacagaacgctctagaacttttgatataacattaagtatgctaactggcctataattaccaacttcccaaggactagactttttgtaaatcgggctgacttttgcagttttcatttcatcaggaacaatgcctgagtcaatagacatattaataata
gi|141961                     :                                                                                                                                                                                                                                                          gaatttcatgaccgttgcatgtaaccgtaaatgactgaacGAATTTCATGACCGTTGCATGTAACTGTAAATGACTGCACTTTTT-AAGGCTT--CTAGAA-AGGCAAA-AATATACATTCGGTTTTGCCTAGATAAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---T-T-G------C--AGAA----CT-------A-T-ATC-----CA--T-GAT-TCGACT---AAGCCT--ATTTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TTAG--CG---AACAAT-TT--TACATTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCATGGAT---GCTT---C-CCTGTGGTACGCC-GCAAGTCAC---TTGGGTATA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------AT-TGTCACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTGAGATATGATTGGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGT---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AACTT-A----TT----GCAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAATGGTATCAAACACCTTCTGT--AGATCGAGTTAAACCAT---TCCGGTA-TAT-A-G--A-TCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCGAAAAGATGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAACACCGGAA--TGAAACTCAT-ACAGAAGTGAA----TGTTT---ATCTTAAAA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTAT-AAA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTTACTGGCCTGAAATT--ACTAACTTACAAAGG----CCTAG--ATATTTTGTAAAT--CCGGCTGACTATTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGTGTCAATGGAC---ATATTAATAAT
gi|141962                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAA-TTTTTTAAGACTT--CCAAAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTTTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-TA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTT---T-TCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----
gi|141963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTTA--TCTT--TTA-AAGA---AAA-AACATAGCTTCGGTTTTGTTAGGGTTGA-----AATTTA-------CTAGCC---A-TTG------TTTAGCC----CACTGGGATA-TTATT-----AA--AAGATCATGATT---AATTAA--ACCTTC-A---ATATCACTTA------C--T--GATGAGGCTG---AATAGT-ATAATGAACTG--TCGTCAGCATACAA-AC--------G--TG-T-----C-A-AA-CTGAGTAAA--TTGT------TAGCT--ATATCATTAACATA-A-A----T-T-AA-------G-AATAATAA---AG---GTCCAAGA-----ACGG---CACTTGTGGCACTCCTGCAT-TAA
gi|141964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGAACCAAATACAATGCATTCAGTTTTACCAAGATGCAACGATAATTTGTTGTCAGCTAACC---A-T-T------T--ACTA----CA-------A-TTTTT-----AAGTT-CAT-TT--CT---AAGTAC--ATTTTCTA---ATAACA-TCAGGATCTT--T--G-T--G--CG---AG-AAT-Agagattttaaattggaa
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACCCAAAAAGAATTGATTCTGTCTTCCCAAGATGCAATGAAAGTGTATTGTTTAC---CT---A-T-GATTCAGT--AACATGTTCA-------AGCTTTG-----CA--T---T-GTGATT------TAT--ATTTCCCA---GTAA---TTAGGAT-TC--C--G--------G---AA------------------TCATCAGCATATAA-AAGAAATGTGT--TG-T-TT-AC-A--------------------AA--GCAGAC--ATATCATTGACATATATC----A-A-AA-------ATAACAAAAGGGTGG---GGGCTAGTAT---AGAC---G-CTTGAGGGACCCC-ACACG
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-------AA--CATAATTCTGTGATTGACAGTGTCGAAGGTTTTCTCT--AGGTCAAGTAACACCAT---TCC--TA-CCA-G-GTTA-CCTTT----ATTCATATGGAACTAAATGAAA----TCAGATAGGTGAATAAGACAACTACCTGTGGAAA-AAACGCGTCTAAAACAAAAT--TGGAAagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaataacataattctgtgattgacagtgtcgaaggttttctctaggtcaagtaacaccattcctaccaggttacctttattcatatggaactaaatgaaatcagataggtgaataagacaactacctgtggaaaaaacgcgtctaaaacaaaattggaa
gi|141966                     : agacccaaaaagaattgattctgtcttcccaagatgcaatgaaagtgtattgtttacctatgattcagtaacatgttcaagctttgcattgtgatttatatttcccagtaattaggattccggaatcatcagcatataaaagaaatgtgttgtttacaaagcagacatatcattgacatatatcaaaaataacaaaagggtgggggctagtatagacgcttgagggaccccacacgagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaGAGCCAAAAATAACGCACTCGGTTAAACCAAGATGTATG-ACAGCTTATTATATTCTAGCCGAGA-T-GAG----C--AAGA----CA-------------C-----CA-----AC-AC-ACTTCAAAATTT--AGAAGA-A---ATAACA-CTATATTAGT--T--A-TAAG--CT---ATAAGA-AT--CGTGCTG--TCATCAGCATATAG-AA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT-CGGGGTCAA--T-GCTAC---TAACC--ATGTCATTTACATG-G-T----A---AC-------A-AATAGAAG---CG---GGCCTAAGAT---GCTA---C-CCTGTGGAACGCC-ACATGTTACAGATT---TATA-CT--TTG---AAAATACATCG--TTA-------A-----CACT--AA------C---T----GGTT-G-TT--T--T----TCGTGTTAAATAAGACATGAACAAATCAA-----------TATTA--------T-AAC-C---AATTG--AT---T-T-T-------AGTTT-A----CT----ACAT-------AA--AATATG---ATGATCAGCTGTTTCAAAGGATGTTTGT--AAATCTAACATAACCAT---GCCTGTA-TAA-A-A--T-CCTTT-AGCACTATTGCT---TTCAAT---A----TCTATAAATTGGACAAGGCAATTTTCAGTTGAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TCCAATTCATCCCATA----AA----TTGTTGCAATCT---TA---GAT--G---TTCTCAAGTTGAGTAT-ATACAGACCTTTCT-AGA--ATTTTAGA
gi|141967                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTTTCCCAGATGCAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGAATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATAGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTTACTT-AT-AC--TAATGCTCATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-CACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTT---C-CTTGAGGAACTCC-ACATACAATAT-TTTCAAAG------TCGGACATGGTA--TTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--T--A----CCT-GACAAGTACGATTGAAAC----CAC-----------T-CGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---ATGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CGTTT-TGCCTTTTGATT---TTTTATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCGGTCGAGT-A---GCCTCGGAATCCATTC--TGAAGATCAT-ACAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCT-AGA--ATTTTAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAACTGGTCTATAGTT--A
gi|141968                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTGTCCCAGATGCAATGACGGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTGACTT-AT-ACTAATACTC--ATATCATTAACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTT---C-TTTGAGGAACTCC-ACATACAATATTTT---CAAA-GT--CGG---ACATAGTATTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--TACT----T---GACAAGTACGATTTAAAC----CAT-----------T-AGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---GTGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CCTTT-TACCTTTTGATT---TTT-ATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCAGCCGAGT-AGGTCCCTCGGAATCCACTC--TGAAGATCAT-ATAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCA-AGA--ATTTAAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAAATGGTCTATAGTT--A
gi|141969                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAACCGGATAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGGATAATTTATTATCCACTAGCC---ACT-G------A--CTAA----CA-------A-----------------GAT-G----T---AGGTC-----CTCC-G----------TCAGAACCTC--C----TCAG--CATGCAACAAG-AA--TACAA-GAATCATCTGCATATAA-CA--------A--TA-G-TT--T-G-TT-T----TTAA--C-AC-AG--AT-GAC--ATGGCATTTACATA-A------A-TCAA-------G-AACAGAAG---TG---GTCCAATAAT---TCAA---C-CTTGTGGCACTCC-ACATGCGAT---TGGGGCA----T--TCG---AAGAAAGT--G--TCCCCGAC--ACATG-AACA--AG------C---T----G--C-TGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAGGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATG---TCATCGCCTAGAC--CTAT---TGT-C-TGG---AGTTTCA----CG----AGA--------AG--AACAGT---GTGATCTACAGTATCGTAGGCTTTTTGT--AGATCTAATAAAATCATACCTACAGTA-TTA------T-CCGTA-TCCATTTCCA-G---CTTTATATAATCTGTCAAA----TGGATGAGACACGTGTCAATTGAAA-ATACACTTCTGAACCCTGAC--TGAAATTTAT-A
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCCGAATAAAATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGAATAATTTATTGTCCACTAGCC---A-
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCATCTGCATATAG-CA-------------------AC-A-GT-TTGTGTTTA--A-CC-ACA-GCTGAC--ATGTCATTTTTATA-A------A-TCAA-------G-AACAGTAG---TG---GTCCAAGAATTGAAC-------CTTGTGGCACTCC-ACATGTAA-----TAGGGACA-TT--T-G---AAGAA--TGTG--TCCCAGACACATCAA-CA----AG------C---T----G--T-GGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAAGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATGCCATCGCCTA---GAC-CTGAT---T-C-C-TGA---AGTTC-------------CATGAGA---AG--AACAAT---GTGATCCACAGTTTCGAAAACCTTTTGT--AGATCTAATAGAATCAT---ACC--TA-CAACATA--A-CCCTTATCCATTTCCA-G---CCTTATATAATTTGTCAAA----TGGATGAGACACG--TCAGTTGAAA-AACCACTTCTGAACCCTGAT--TGAAATTTTT-ATA----ACAACTTGTTTTT---ATTT---GAAGTAAG--A---TT--CAACTCGTTCAT-AGAC--AACTTTTTCAAAT-ATCTTAGAC-ACAAT--TCTTAATATAGAAACAGGGCGATTATT--CCCAACT----GAGGTTTTATCAT--TTTTCTTATAAAG--GGGAACAAATCTTTCTGCCTTGAGGTCATCT-GGGACCGCGCCTTGAATTAA-AGACTAAAGATTAATAATActgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaatcatctgcatatagcaacagtttgtgtttaaccacagctgacatgtcatttttataaatcaagaacagtagtggtccaagaattgaaccttgtggcactccacatgtaatagggacatttgaagaatgtgtcccagacacatcaacaagctgtggtctgtccgaaaggtaagacttaaaccattttaaaatgccatcgcctagacctgattcctgaagttccatgagaagaacaatgtgatccacagtttcgaaaaccttttgtagatctaatagaatcatacctacaacataacccttatccatttccagccttatataatttgtcaaatggatgagacacgtcagttgaaaaaccacttctgaaccctgattgaaatttttataacaacttgtttttatttgaagtaagattcaactcgttcatagacaactttttcaaatatcttagacacaattcttaatatagaaacagggcgattattcccaactgaggttttatcatttttcttataaaggggaacaaatctttctgccttgaggtcatctgggaccgcgccttgaattaaagactaaagattaataata
gi|141971                     :                                                                                                                                                                                                                            gatccgaataaaatggattcagttttacccaaatgcaggaataatttattgtccactagccactgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaaGAACCGAAAAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGAAGAGATAATTTATTGTCAACTAGCC---A-
gi|141971                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCATCTGCATCTAA-CAATAAT---T--TG-T-TT-TT-A-AC-CACAG------------C--TTA--C--ATTTCATTCACATA-A------A-T-AA-------AGAACAGTAG---TG---GTCCAAAAA------TTAAAC-CTTGTGGCACTCC-ACATGTGActgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaatcatctgcatctaacaataatttgtttttaaccacagcttacatttcattcacataaataaagaacagtagtggtccaaaaattaaaccttgtggcactccacatgtgatattatgatgaa
gi|141972                     :                                                                                                                                                                                                                     gaaccgaaaaagatggattcagttttacccaaatgaagagataatttattgtcaactagccactgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaaCTAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACT---A-T-T------T--ATTA----CA-------C-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--T--A-TGTG--AG---AAAAAGAAT--AGCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AATT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-AC-TC--ATGCTC--ATATCATTTACAT-----------T-AA-------A-AACAGTTA---TG---GCCCCATAAT---ACTT---C-CTTGAGGAACTCC-ACAtattatgatgaa
gi|141973                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCAAATAATATATATTATGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTCTAGTTCA--T---T-AC--CT---AAACCT---TCACT-A---ATGACA-TTAGGATCTTCAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAATA-TCTT-TC-A-AC-CG
gi|141974                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAGGATGAAAAGAAAGTTTGTTGTCTATTTATC---A-T-T------T--ATAA----CA-------A-TTTTC---------T-GGT-TC-ATT-----GCCTTAAACTTC-ACTTATAGCA-TTAGGATATTTAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AACT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-GC-TA--ATGCTC--ATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAGAAA---TG---GCACCAAAAT---ACTT---C-CTTGAGGAACTCC-ACA
gi|141975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAT-GT--TGTA-----TCATCTGCATATAA--A--------T--CA-G-TT-TC-A-G--CAGTGTCAG--T-GT-AAA-GT-GGT--AAATCATTAATA-A-A-C----A-G-AAG------A-AATAAAAG---AG---GGCCTAAAAT---AGAA---C-CTTGAGGTACACC-ATCTGTCAC---T--GTTTGA-TTGGTTG---ATAATACGTCA--TTT-------AGGGA-AATT--TT------C---T----G--T-------T--T----TCG-GTTATGTAAG-TATGAAG----AGA---------------A--------CC-ATGC---TAATACCTT---G-T-CTGAA---AGTTT-ATAGACTTTCAACTTTTGCAAAAG--AATTTT---ATGGTCCACTAGATCAAACGCTTTCTTG--AAATCAACCATAACTAC---TCC--TATTAA-A-G--ATCCATT-
gi|141976                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTA--TCATCAGCATATAA-GA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT------------T-TT-AC--TTATGC--AG--CATTGACACG-A-C----A-T-AA-------A---CAAAAG---CAACTGACCCAGTAT---ACTT---C-TTCAAGCAAAATC-GTATGAAA-----TG--------T--TC----ATGAAA-TCTGACTTT-------GTATG--ATT--AA------CATTT----A--TAGATTGTT--TATGATCA-GTCAAATAAGATAGAAAC----CGC-----------T-CAA--------TTGACTC---CATCCCCAT---T-T----ATTTTAGTTT-A----CA----ACAT-------------TCAA---GC-ATCAACTGTGTCAAAAGCCTCCTATTAAGGTCCAACATAACCAT---TCCTGTA-TAA-A-G--A-CCTTT-TGAA--CTTA-A---TTTGGT-CCG----TC----AGATGAATAAGGCAGGCGTCAATGGAGC-AGTTACATCTAAAACC--ACTTTGTAGTTCAT-ATAAAAGACCT----TGTTT---AACT---AA---GAATGA---TTCT--AGTTGGCTGTGACACAGCTCTTTCT-AAAAGAC-TTGAATCAT-AC--ATAAA--ATGCTAACAGGTCTATAGTTTGAT--ACATC----AG----ATTTGCCATTTTTCTTAAATAATGGTTTGATTTTAACACTTTTAAGTTCA-CATGGCACAATG
gi|141977                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--TCATCAGCACACAT-GT--------T--CA-T-TT-TCGA-ATACTGAGT-------GC-A----TAAG-----------GGCATA-A-CATTGA-T-AAAGATAATA-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGAT---C-CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAACCTTTC---T----G--T-GAAT--A--T----TCA-CATCAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TTttacaggtgataga
gi|141978                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCGTCTGCA---AA-CA--------G--TC-T-GT--C-A-GT--GGAG--GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCGAGGAC---AGTA---C-CTTGGGGTACACC-AGAAGTAAC---T--GGT-GC-TT--ACG---ATGA
gi|141979                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCCAGGAC---AGTA---C-CCTGGGGTACGCC-AGAAGTAAC---GTG
gi|141980                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--CTATCATTGGTA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGAT---C-CTTGAGGTACACC-ACATGTTAC---T--GATTTACTT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ATCAGATATTGAAA------C---TTTTTG--T-GAGC--T--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141981                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--ATATCATTGATA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGAT---C-CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAAATTTTT---T----G--T-GAAT--G--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAAATTTGTACATCT-TTA--------TGGAAAT---GGTATACAT---T-T---------AGTTT-T----TC----AAAC-------AG--TA-AACT--ATGATCAACCAGATCAAATGCTTTAGAT--AGGTCAAGAAATATGGT---TCCAG-A-TA
gi|141982                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --ATATCATTAATATA-A-A----C-T-AA-------G-AAAAGAAG---AG---GGCCTAATAT---AGAT---C-CCTGTGGCACACC-t
gi|141983                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCATTGATGTA-G-C----A-G-AG-------A-AATGAAAG---CG---GGCCGAGCAT---CGTT---C-CCTGTGGCACACC-GGAGCTAAC---
gi|141984                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---AGTTT-A----CC----ACAT-------CA--AATATG---ATAATCAACTGAATCAAAAGCTTTCTGT--TAATCTAACATAACCAT---GCCAGTA-TAT-A-G--T-CCTTT-GGTACTATTGCT---TCTAACATGA----TTCATTAAGTAGACAAGGCAAGTATCAGAACAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TGCAATTCAT-ACAATA---AA----TTGTT---ATC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111                           222222222222222222                                                                    1111                      22222222222222222         111111111111111       111                                   1111111                                                              2222222222222                111       2222222222222222222222222222222                                                     11111111111     11111111                   111   222222222       1111111111    1111111                                                                                                                 1111                                                                                               111           111   11                                               11                                            1111                                                                               111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1 0     77   1    4     3  1        1     1  1     1 22              1       333 2 22222222 33 22 5555  8888888 2  2  000000000000000000   444      888   1 5 444      2     1    66 66 2 4  5555555  5   2 2222      22     1        11111111111111111 2  55 2 444444444444444 1  1  222     22              1 555555 3 3  0000000 1        3333 222       1  222 11  444    1  1  3  1   1     1111111111111  33 77777      222  33   6666666666666666666666666666666 5555 33 2 0  33 33 5555  33 1  0             5555   22222222222 2   88888888     2 555   5     000 3 777777777     2 3333333333    4444444  33    99999         1     0  3         33     3  0 1      444   8   2   2 2 5555  1  2      1   88888   1  44  3333  3  6              1        0    3 444            5   44  0  0    3   555555  7777     666    111  777   55 444   22           4       1 1    4   99     1   4     22     8                     66         22    2222     77             77                               5  0        6             111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .     ..   .    .     .  .        .     .  .     . ..              .       ... . ........ .. .. ....  ....... .  .  ..................   ...      ...   . . ...      .     .    .. .. . .  .......  .   . ....      ..     .        ................. .  .. . ............... .  .  ...     ..              . ...... . .  ....... .        .... ...       .  ... ..  ...    .  .  .  .   .     .............  .. .....      ...  ..   ............................... .... .. . .  .. .. ....  .. .  .             ....   ........... .   ........     . ...   .     ... . .........     . ..........    .......  ..    .....         .     .  .         ..     .  . .      ...   .   .   . . ....  .  .      .   .....   .  ..  ....  .  .              .        .    . ...            .   ..  .  .    .   ......  ....     ...    ...  ...   .. ...   ..           .       . .    .   ..     .   .     ..     .                     ..         ..    ....     ..             ..                               .  .        .             ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4 1     99   7    1     6  0        9     0  0     0 88              8       999 2 55555555 44 00 3333  1111111 5  8  666666666666666666   444      222   0 0 444      5     1    99 99 5 3  8888888  6   4 4444      88     0        33333333333333333 0  00 0 222222222222222 8  8  333     44              7 333333 3 3  4444444 7        9999 999       2  999 66  666    0  0  7  7   0     8888888888888  22 88888      555  44   6666666666666666666666666666666 3333 44 5 7  44 44 3333  66 0  2             7777   77777777777 7   88888888     8 444   4     888 1 444444444     9 3333333333    3333333  77    44444         0     7  2         77     7  2 0      777   7   7   9 9 5555  0  9      0   99999   9  11  1111  8  7              0        8    1 888            2   22  2  8    3   222222  7777     444    000  000   55 000   55           0       2 0    0   55     0   4     22     4                     11         00    1111     99             99                               7  3        7             777            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
Reference ( family-682 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141957                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCTTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAACAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAATTTATTATCAACTAACC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA--------T--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAAA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----TT----ATAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACACCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACACTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-GGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141958                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--TTAAAAGAGCCAAAGAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTGTCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAC-AT--GACACTG--TCGTCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-AC-GC--GTAGGC--ATATCATTGCCATA-A-C----A-T-AG-------A-AATAAAAG---AG---GGCCAAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TGGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAAATTAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TAA-GAG---AGCGT-A----TT----TCAT-------AA--ACTAAC---GTGGTCAACGATATCAGACGCCTTCTGT--AGATCGAGTAAAACCAT---TCAGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTAATG---TTTAGTAAAA----TCAAAAAGGTGAATAATACATGTATCAGTGG-GTAATTTACTCCTAAAACCGGAC--TTAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCG-AAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATGAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAC--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATAA-AGTACAATGCC-TGATTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141959                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGATTTTATGACCATTGTATGTTACCGTAATTGTCTGAACTTTTTTAAATCTT--CTAGAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAAGGACAGTTTATTAGCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CA---AACAAT-TT--TACACTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---CGCACAGGAT---GTTTC---CCTGTGTTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----ACG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGGCGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----AT----A-AG-------AGTGAATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCT--------AGATCGAGTAAAACCAT---TCCGGTT-AAA-A-G--A-CCATT-TGTATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAATAAGGTGAATAAGACATGTATGAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---CCCGCAAATTGGTTAT-ATACAAAACGCTCT-AGA--AGTTTTGAT-TTAAC--ATTAAGTATTCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAA--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTAACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-CGAGTCAATAAAC---AAAATAATAATA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTT----GGTTTTGCCTAGATGA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-TAT-GCGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA-------------------AT-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------C-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGTT---TCTTC---CCTGTGGTACGCT-GCAAGTAAC---TTTGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCCT-A----TT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAACAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAG----TTTTT---ATCTA--AA---AAA--A---TCTGCAAATTAGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCCAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTTTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATAagggacagtttattatcaactagccatgtagaacaattatccattatgcgactaagtctatctgcaataacattagggtctttgtcagcgaacaatattacactgtcatctgcatataataataatcggagtcgatgcacgtaggcatatcattgacataacataacaataaaagagggcccaggtttcttccctgtggtacgctgcaagtaactttggtagattttgatgaaactttgtttatcttcacttactgtgatctttcggttagataagatttgaaccaatttatcgacgcgactcccatttcagagagcctattacatagaataacgtggtcaacggtatcaaacgccttctgtaggtcgagtaaaaccattccggtataaagaccatttgcattgttatgtttaacaaaatcaaaaaggtgaataagacatgtatcagtggagtatttactcctaaaaccggactggaactcatacagaagagagtttttatctaaaaaaatctgcaaattagttatatacagaacgctctagaacttttgatataacattaagtatgctaactggcctataattaccaacttcccaaggactagactttttgtaaatcgggctgacttttgcagttttcatttcatcaggaacaatgcctgagtcaatagacatattaataata
gi|141961                     :                                                                                                                                                                                                                                                          gaatttcatgaccgttgcatgtaaccgtaaatgactgaacGAATTTCATGACCGTTGCATGTAACTGTAAATGACTGCACTTTTT-AAGGCTT--CTAGAA-AGGCAAA-AATATACATTCGGTTTTGCCTAGATAAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---T-T-G------C--AGAA----CT-------A-T-ATC-----CA--T-GAT-TCGACT---AAGCCT--ATTTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TTAG--CG---AACAAT-TT--TACATTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCATGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTCAC---TTGGGTATA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------AT-TGTCACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTGAGATATGATTGGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGT---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AACTT-A----TT----GCAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAATGGTATCAAACACCTTCTGT--AGATCGAGTTAAACCAT---TCCGGTA-TAT-A-G--A-TCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCGAAAAGATGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAACACCGGAA--TGAAACTCAT-ACAGAAGTGAA----TGTTT---ATCTTAAAA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTAT-AAA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTTACTGGCCTGAAATT--ACTAACTTACAAAGG----CCTAG--ATATTTTGTAAAT--CCGGCTGACTATTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGTGTCAATGGAC---ATATTAATAAT
gi|141962                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAA-TTTTTTAAGACTT--CCAAAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTTTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-TA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTT---TCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----
gi|141963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTTA--TCTT--TTA-AAGA---AAA-AACATAGCTTCGGTTTTGTTAGGGTTGA-----AATTTA-------CTAGCC---A-TTG------TTTAGCC----CACTGGGATA-TTATT-----AA--AAGATCATGATT---AATTAA--ACCTTC-A---ATATCACTTA------C--T--GATGAGGCTG---AATAGT-ATAATGAACTG--TCGTCAGCATACAA-AC--------G--TG-T-----C-A-AA-CTGAGTAAA--TTGT------TAGCT--ATATCATTAACATA-A-A----T-T-AA-------G-AATAATA----AA---GGTCCAAGA----ACGGCA--CTTGTGGCACTCCTGCAT-TAA
gi|141964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGAACCAAATACAATGCATTCAGTTTTACCAAGATGCAACGATAATTTGTTGTCAGCTAACC---A-T-T------T--ACTA----CA-------A-TTTTT-----AAGTT-CAT-TT--CT---AAGTAC--ATTTTCTA---ATAACA-TCAGGATCTT--T--G-T--G--CG---AG-AAT-Agagattttaaattggaa
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACCCAAAAAGAATTGATTCTGTCTTCCCAAGATGCAATGAAAGTGTATTGTTTAC---CT---A-T-GATTCAGT--AACATGTTCA-------AGCTTTG-----CA--T---T-GTGATT------TAT--ATTTCCCA---GTAA---TTAGGAT-TC--C--G--------G---AA------------------TCATCAGCATATAA-AAGAAATGTGT--TG-T-TT-AC-A--------------------AA--GCAGAC--ATATCATTGACATATATC----A-A-AA-------ATAACAAAAGGGTGG---GGGCTAGTAT---AGACG---CTTGAGGGACCCC-ACACG
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT-------AA--CATAATTCTGTGATTGACAGTGTCGAAGGTTTTCTCT--AGGTCAAGTAACACCAT---TCC--TA-CCA-G-GTTA-CCTTT----ATTCATATGGAACTAAATGAAA----TCAGATAGGTGAATAAGACAACTACCTGTGGAAA-AAACGCGTCTAAAACAAAAT--TGGAAagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaataacataattctgtgattgacagtgtcgaaggttttctctaggtcaagtaacaccattcctaccaggttacctttattcatatggaactaaatgaaatcagataggtgaataagacaactacctgtggaaaaaacgcgtctaaaacaaaattggaa
gi|141966                     : agacccaaaaagaattgattctgtcttcccaagatgcaatgaaagtgtattgtttacctatgattcagtaacatgttcaagctttgcattgtgatttatatttcccagtaattaggattccggaatcatcagcatataaaagaaatgtgttgtttacaaagcagacatatcattgacatatatcaaaaataacaaaagggtgggggctagtatagacgcttgagggaccccacacgagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaGAGCCAAAAATAACGCACTCGGTTAAACCAAGATGTATG-ACAGCTTATTATATTCTAGCCGAGA-T-GAG----C--AAGA----CA-------------C-----CA-----AC-AC-ACTTCAAAATTT--AGAAGA-A---ATAACA-CTATATTAGT--T--A-TAAG--CT---ATAAGA-AT--CGTGCTG--TCATCAGCATATAG-AA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT-CGGGGTCAA--T-GCTAC---TAACC--ATGTCATTTACATG-G-T----A---AC-------A-AATAGAAG---CG---GGCCTAAGAT---GCTAC---CCTGTGGAACGCC-ACATGTTACAGATT---TATA-CT--TTG---AAAATACATCG--TTA-------A-----CACT--AA------C---T----GGTT-G-TT--T--T----TCGTGTTAAATAAGACATGAACAAATCAA-----------TATTA--------T-AAC-C---AATTG--AT---T-T-T-------AGTTT-A----CT----ACAT-------AA--AATATG---ATGATCAGCTGTTTCAAAGGATGTTTGT--AAATCTAACATAACCAT---GCCTGTA-TAA-A-A--T-CCTTT-AGCACTATTGCT---TTCAAT---A----TCTATAAATTGGACAAGGCAATTTTCAGTTGAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TCCAATTCATCCCATA----AA----TTGTTGCAATCT---TA---GAT--G---TTCTCAAGTTGAGTAT-ATACAGACCTTTCT-AGA--ATTTTAGA
gi|141967                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTTTCCCAGATGCAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGAATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATAGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTTACTT-AT-AC--TAATGCTCATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-CACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACATACAATAT-TTTCAAAG------TCGGACATGGTA--TTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--T--A----CCT-GACAAGTACGATTGAAAC----CAC-----------T-CGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---ATGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CGTTT-TGCCTTTTGATT---TTTTATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCGGTCGAGT-A---GCCTCGGAATCCATTC--TGAAGATCAT-ACAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCT-AGA--ATTTTAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAACTGGTCTATAGTT--A
gi|141968                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTGTCCCAGATGCAATGACGGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTGACTT-AT-ACTAATACTC--ATATCATTAACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---TTTGAGGAACTCC-ACATACAATATTTT---CAAA-GT--CGG---ACATAGTATTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--TACT----T---GACAAGTACGATTTAAAC----CAT-----------T-AGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---GTGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CCTTT-TACCTTTTGATT---TTT-ATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCAGCCGAGT-AGGTCCCTCGGAATCCACTC--TGAAGATCAT-ATAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCA-AGA--ATTTAAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAAATGGTCTATAGTT--A
gi|141969                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAACCGGATAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGGATAATTTATTATCCACTAGCC---ACT-G------A--CTAA----CA-------A-----------------GAT-G----T---AGGTC-----CTCC-G----------TCAGAACCTC--C----TCAG--CATGCAACAAG-AA--TACAA-GAATCATCTGCATATAA-CA--------A--TA-G-TT--T-G-TT-T----TTAA--C-AC-AG--AT-GAC--ATGGCATTTACATA-A------A-TCAA-------G-AACAGAAG---TG---G-TCCA--AT---AATTCAACCTTGTGGCACTCC-ACATGCGAT---TGGGGCA----T--TCG---AAGAAAGT--G--TCCCCGAC--ACATG-AACA--AG------C---T----G--C-TGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAGGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATG---TCATCGCCTAGAC--CTAT---TGT-C-TGG---AGTTTCA----CG----AGA--------AG--AACAGT---GTGATCTACAGTATCGTAGGCTTTTTGT--AGATCTAATAAAATCATACCTACAGTA-TTA------T-CCGTA-TCCATTTCCA-G---CTTTATATAATCTGTCAAA----TGGATGAGACACGTGTCAATTGAAA-ATACACTTCTGAACCCTGAC--TGAAATTTAT-A
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCCGAATAAAATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGAATAATTTATTGTCCACTAGCC---A-
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCATCTGCATATAG-CA-------------------AC-A-GT-TTGTGTTTA--A-CC-ACA-GCTGAC--ATGTCATTTTTATA-A------A-TCAA-------G-AACAGTAG---TG---GTCCAAGAATTGAAC------CTTGTGGCACTCC-ACATGTAA-----TAGGGACA-TT--T-G---AAGAA--TGTG--TCCCAGACACATCAA-CA----AG------C---T----G--T-GGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAAGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATGCCATCGCCTA---GAC-CTGAT---T-C-C-TGA---AGTTC-------------CATGAGA---AG--AACAAT---GTGATCCACAGTTTCGAAAACCTTTTGT--AGATCTAATAGAATCAT---ACC--TA-CAACATA--A-CCCTTATCCATTTCCA-G---CCTTATATAATTTGTCAAA----TGGATGAGACACG--TCAGTTGAAA-AACCACTTCTGAACCCTGAT--TGAAATTTTT-ATA----ACAACTTGTTTTT---ATTT---GAAGTAAG--A---TT--CAACTCGTTCAT-AGAC--AACTTTTTCAAAT-ATCTTAGAC-ACAAT--TCTTAATATAGAAACAGGGCGATTATT--CCCAACT----GAGGTTTTATCAT--TTTTCTTATAAAG--GGGAACAAATCTTTCTGCCTTGAGGTCATCT-GGGACCGCGCCTTGAATTAA-AGACTAAAGATTAATAATActgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaatcatctgcatatagcaacagtttgtgtttaaccacagctgacatgtcatttttataaatcaagaacagtagtggtccaagaattgaaccttgtggcactccacatgtaatagggacatttgaagaatgtgtcccagacacatcaacaagctgtggtctgtccgaaaggtaagacttaaaccattttaaaatgccatcgcctagacctgattcctgaagttccatgagaagaacaatgtgatccacagtttcgaaaaccttttgtagatctaatagaatcatacctacaacataacccttatccatttccagccttatataatttgtcaaatggatgagacacgtcagttgaaaaaccacttctgaaccctgattgaaatttttataacaacttgtttttatttgaagtaagattcaactcgttcatagacaactttttcaaatatcttagacacaattcttaatatagaaacagggcgattattcccaactgaggttttatcatttttcttataaaggggaacaaatctttctgccttgaggtcatctgggaccgcgccttgaattaaagactaaagattaataata
gi|141971                     :                                                                                                                                                                                                                            gatccgaataaaatggattcagttttacccaaatgcaggaataatttattgtccactagccactgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaaGAACCGAAAAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGAAGAGATAATTTATTGTCAACTAGCC---A-
gi|141972                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACT---A-T-T------T--ATTA----CA-------C-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--T--A-TGTG--AG---AAAAAGAAT--AGCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AATT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-AC-TC--ATGCTC--ATATCATTTACAT-----------T-AA-------A-AACAGTTA---TG---GCCCCATAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACActgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaatcatctgcatctaacaataatttgtttttaaccacagcttacatttcattcacataaataaagaacagtagtggtccaaaaattaaaccttgtggcactccacatgtgatattatgatgaa
gi|141973                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCAAATAATATATATTATGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTCTAGTTCA--T---T-AC--CT---AAACCT---TCACT-A---ATGACA-TTAGGATCTTCAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAATA-TCTT-TC-A-AC-CG
gi|141974                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAGGATGAAAAGAAAGTTTGTTGTCTATTTATC---A-T-T------T--ATAA----CA-------A-TTTTC---------T-GGT-TC-ATT-----GCCTTAAACTTC-ACTTATAGCA-TTAGGATATTTAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AACT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-GC-TA--ATGCTC--ATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAGAAA---TG---GCACCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACA
gi|141975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAT-GT--TGTA-----TCATCTGCATATAA--A--------T--CA-G-TT-TC-A-G--CAGTGTCAG--T-GT-AAA-GT-GGT--AAATCATTAATA-A-A-C----A-G-AAG------A-AATAAAAG---AG---GGCCTAAAAT---AGAAC---CTTGAGGTACACC-ATCTGTCAC---T--GTTTGA-TTGGTTG---ATAATACGTCA--TTT-------AGGGA-AATT--TT------C---T----G--T-------T--T----TCG-GTTATGTAAG-TATGAAG----AGA---------------A--------CC-ATGC---TAATACCTT---G-T-CTGAA---AGTTT-ATAGACTTTCAACTTTTGCAAAAG--AATTTT---ATGGTCCACTAGATCAAACGCTTTCTTG--AAATCAACCATAACTAC---TCC--TATTAA-A-G--ATCCATT-
gi|141976                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTA--TCATCAGCATATAA-GA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT------------T-TT-AC--TTATGC--AG--CATTGACACG-A-C----A-T-AA-------A---CAAAAG---CAACTGACCCAGTAT---ACTTC---TTCAAGCAAAATC-GTATGAAA-----TG--------T--TC----ATGAAA-TCTGACTTT-------GTATG--ATT--AA------CATTT----A--TAGATTGTT--TATGATCA-GTCAAATAAGATAGAAAC----CGC-----------T-CAA--------TTGACTC---CATCCCCAT---T-T----ATTTTAGTTT-A----CA----ACAT-------------TCAA---GC-ATCAACTGTGTCAAAAGCCTCCTATTAAGGTCCAACATAACCAT---TCCTGTA-TAA-A-G--A-CCTTT-TGAA--CTTA-A---TTTGGT-CCG----TC----AGATGAATAAGGCAGGCGTCAATGGAGC-AGTTACATCTAAAACC--ACTTTGTAGTTCAT-ATAAAAGACCT----TGTTT---AACT---AA---GAATGA---TTCT--AGTTGGCTGTGACACAGCTCTTTCT-AAAAGAC-TTGAATCAT-AC--ATAAA--ATGCTAACAGGTCTATAGTTTGAT--ACATC----AG----ATTTGCCATTTTTCTTAAATAATGGTTTGATTTTAACACTTTTAAGTTCA-CATGGCACAATG
gi|141977                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--TCATCAGCACACAT-GT--------T--CA-T-TT-TCGA-ATACTGAGT-------GC-A----TAAG-----------GGCATA-A-CATTGA-T-AAAGATAATA-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAACCTTTC---T----G--T-GAAT--A--T----TCA-CATCAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TTttacaggtgataga
gi|141978                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCGTCTGCA---AA-CA--------G--TC-T-GT--C-A-GT--GGAG--GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCGAGGAC---AGTAC---CTTGGGGTACACC-AGAAGTAAC---T--GGT-GC-TT--ACG---ATGA
gi|141979                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCCAGGAC---AGTAC---CCTGGGGTACGCC-AGAAGTAAC---GTG
gi|141980                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--CTATCATTGGTA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGAGGTACACC-ACATGTTAC---T--GATTTACTT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ATCAGATATTGAAA------C---TTTTTG--T-GAGC--T--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141981                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--ATATCATTGATA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAAATTTTT---T----G--T-GAAT--G--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAAATTTGTACATCT-TTA--------TGGAAAT---GGTATACAT---T-T---------AGTTT-T----TC----AAAC-------AG--TA-AACT--ATGATCAACCAGATCAAATGCTTTAGAT--AGGTCAAGAAATATGGT---TCCAG-A-TA
gi|141982                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --ATATCATTAATATA-A-A----C-T-AA-------G-AAAAGAAG---AG---GGCCTAATAT---AGATC---CCTGTGGCACACC-t
gi|141983                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCATTGATGTA-G-C----A-G-AG-------A-AATGAAAG---CG---GGCCGAGCAT---CGTTC---CCTGTGGCACACC-GGAGCTAAC---
gi|141984                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---AGTTT-A----CC----ACAT-------CA--AATATG---ATAATCAACTGAATCAAAAGCTTTCTGT--TAATCTAACATAACCAT---GCCAGTA-TAT-A-G--T-CCTTT-GGTACTATTGCT---TCTAACATGA----TTCATTAAGTAGACAAGGCAAGTATCAGAACAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TGCAATTCAT-ACAATA---AA----TTGTT---ATC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111                           222222222222222222                                                                    1111                      22222222222222222         111111111111111       111                                   1111111                                                              2222222222222                111       2222222222222222222222222222222                                                     11111111111     11111111                   111   222222222       1111111111    1111111                                                                                                                 1111                                                                                               111           111   11                                               11                                            1111                                                                               111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1 0     77   1    4     3  1        1     1  1     1 22              1       333 2 22222222 33 22 5555  8888888 2  2  000000000000000000   444      888   1 5 444      2     1    66 66 2 4  5555555  5   2 2222      22     1        11111111111111111 2  55 2 444444444444444 1  1  222     22              1 555555 3 3  0000000 1        3333 222       1  222 11  444    1  1  3  1   1     1111111111111  33 77777      222  33   6666666666666666666666666666666 5555 33 2 0  33 33 5555  33 1  0             5555   22222222222 2   88888888     2 555   5     000 3 777777777     2 3333333333    4444444  33    99999         1     0  3         33     3  0 1      444   8   2   2 2 5555  1  2      1   88888   1  44  3333  3  6              1        0    3 444            5   44  0  0    3   555555  7777     666    111  777   55 444   22           4       1 1    4   99     1   4     22     8                     66         22    2222     77             77                               5  0        6             111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .     ..   .    .     .  .        .     .  .     . ..              .       ... . ........ .. .. ....  ....... .  .  ..................   ...      ...   . . ...      .     .    .. .. . .  .......  .   . ....      ..     .        ................. .  .. . ............... .  .  ...     ..              . ...... . .  ....... .        .... ...       .  ... ..  ...    .  .  .  .   .     .............  .. .....      ...  ..   ............................... .... .. . .  .. .. ....  .. .  .             ....   ........... .   ........     . ...   .     ... . .........     . ..........    .......  ..    .....         .     .  .         ..     .  . .      ...   .   .   . . ....  .  .      .   .....   .  ..  ....  .  .              .        .    . ...            .   ..  .  .    .   ......  ....     ...    ...  ...   .. ...   ..           .       . .    .   ..     .   .     ..     .                     ..         ..    ....     ..             ..                               .  .        .             ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4 1     99   7    1     6  0        9     0  0     0 88              8       999 2 55555555 44 00 3333  1111111 5  8  666666666666666666   444      222   0 0 444      5     1    99 99 5 3  8888888  6   4 4444      88     0        33333333333333333 0  00 0 222222222222222 8  8  333     44              7 333333 3 3  4444444 7        9999 999       2  999 66  666    0  0  7  7   0     8888888888888  22 88888      555  44   6666666666666666666666666666666 3333 44 5 7  44 44 3333  66 0  2             7777   77777777777 7   88888888     8 444   4     888 1 444444444     9 3333333333    3333333  77    44444         0     7  2         77     7  2 0      777   7   7   9 9 5555  0  9      0   99999   9  11  1111  8  7              0        8    1 888            2   22  2  8    3   222222  7777     444    000  000   55 000   55           0       2 0    0   55     0   4     22     4                     11         00    1111     99             99                               7  3        7             777            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
Reference ( family-682 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141957                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCTTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAACAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAATTTATTATCAACTAACC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA--------T--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAAA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----TT----ATAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACACCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACACTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-GGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141958                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--TTAAAAGAGCCAAAGAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTGTCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAC-AT--GACACTG--TCGTCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-AC-GC--GTAGGC--ATATCATTGCCATA-A-C----A-T-AG-------A-AATAAAAG---AG---GGCCAAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TGGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAAATTAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TAA-GAG---AGCGT-A----TT----TCAT-------AA--ACTAAC---GTGGTCAACGATATCAGACGCCTTCTGT--AGATCGAGTAAAACCAT---TCAGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTAATG---TTTAGTAAAA----TCAAAAAGGTGAATAATACATGTATCAGTGG-GTAATTTACTCCTAAAACCGGAC--TTAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCG-AAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATGAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAC--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATAA-AGTACAATGCC-TGATTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141959                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGATTTTATGACCATTGTATGTTACCGTAATTGTCTGAACTTTTTTAAATCTT--CTAGAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAAGGACAGTTTATTAGCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CA---AACAAT-TT--TACACTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---CGCACAGGAT---GTTTC---CCTGTGTTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----ACG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGGCGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----AT----A-AG-------AGTGAATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCT--------AGATCGAGTAAAACCAT---TCCGGTT-AAA-A-G--A-CCATT-TGTATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAATAAGGTGAATAAGACATGTATGAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---CCCGCAAATTGGTTAT-ATACAAAACGCTCT-AGA--AGTTTTGAT-TTAAC--ATTAAGTATTCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAA--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTAACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-CGAGTCAATAAAC---AAAATAATAATA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTT----GGTTTTGCCTAGATGA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-TAT-GCGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA-------------------AT-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------C-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGTT---TCTTC---CCTGTGGTACGCT-GCAAGTAAC---TTTGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCCT-A----TT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAACAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAG----TTTTT---ATCTA--AA---AAA--A---TCTGCAAATTAGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCCAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTTTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATAagggacagtttattatcaactagccatgtagaacaattatccattatgcgactaagtctatctgcaataacattagggtctttgtcagcgaacaatattacactgtcatctgcatataataataatcggagtcgatgcacgtaggcatatcattgacataacataacaataaaagagggcccaggtttcttccctgtggtacgctgcaagtaactttggtagattttgatgaaactttgtttatcttcacttactgtgatctttcggttagataagatttgaaccaatttatcgacgcgactcccatttcagagagcctattacatagaataacgtggtcaacggtatcaaacgccttctgtaggtcgagtaaaaccattccggtataaagaccatttgcattgttatgtttaacaaaatcaaaaaggtgaataagacatgtatcagtggagtatttactcctaaaaccggactggaactcatacagaagagagtttttatctaaaaaaatctgcaaattagttatatacagaacgctctagaacttttgatataacattaagtatgctaactggcctataattaccaacttcccaaggactagactttttgtaaatcgggctgacttttgcagttttcatttcatcaggaacaatgcctgagtcaatagacatattaataata
gi|141961                     :                                                                                                                                                                                                                                                          gaatttcatgaccgttgcatgtaaccgtaaatgactgaacGAATTTCATGACCGTTGCATGTAACTGTAAATGACTGCACTTTTT-AAGGCTT--CTAGAA-AGGCAAA-AATATACATTCGGTTTTGCCTAGATAAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---T-T-G------C--AGAA----CT-------A-T-ATC-----CA--T-GAT-TCGACT---AAGCCT--ATTTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TTAG--CG---AACAAT-TT--TACATTG--TCGTCTGCATATAA-TA--------A--TAAT-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCATGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTCAC---TTGGGTATA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------AT-TGTCACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTGAGATATGATTGGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGT---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AACTT-A----TT----GCAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAATGGTATCAAACACCTTCTGT--AGATCGAGTTAAACCAT---TCCGGTA-TAT-A-G--A-TCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCGAAAAGATGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAACACCGGAA--TGAAACTCAT-ACAGAAGTGAA----TGTTT---ATCTTAAAA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTAT-AAA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTTACTGGCCTGAAATT--ACTAACTTACAAAGG----CCTAG--ATATTTTGTAAAT--CCGGCTGACTATTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGTGTCAATGGAC---ATATTAATAAT
gi|141962                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAA-TTTTTTAAGACTT--CCAAAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTTTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAATAA--------T--AA-T-TT-AC-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-TA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTT---TCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----
gi|141963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTTA--TCTT--TTA-AAGA---AAA-AACATAGCTTCGGTTTTGTTAGGGTTGA-----AATTTA-------CTAGCC---A-TTG------TTTAGCC----CACTGGGATA-TTATT-----AA--AAGATCATGATT---AATTAA--ACCTTC-A---ATATCACTTA------C--T--GATGAGGCTG---AATAGT-ATAATGAACTG--TCGTCAGCATACAA-AC--------G--TG-T-----C-A-AA-CTGAGTAAA--TTGT------TAGCT--ATATCATTAACATA-A-A----T-T-AA-------G-AATAATA----AA---GGTCCAAGA----ACGGCA--CTTGTGGCACTCCTGCAT-TAA
gi|141964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGAACCAAATACAATGCATTCAGTTTTACCAAGATGCAACGATAATTTGTTGTCAGCTAACC---A-T-T------T--ACTA----CA-------A-TTTTT-----AAGTT-CAT-TT--CT---AAGTAC--ATTTTCTA---ATAACA-TCAGGATCTT--T--G-T--G--CG---AG-AAT-Agagattttaaattggaa
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACCCAAAAAGAATTGATTCTGTCTTCCCAAGATGCAATGAAAGTGTATTGTTTAC---CT---A-T-GATTCAGT--AACATGTTCA-------AGCTTTG-----CA--T---T-GTGATT------TAT--ATTTCCCA---GTAA---TTAGGAT-TC--C--G--------G---AA------------------TCATCAGCATATAA-AAGAAATGTGT--TG-T-TT-AC-A--------------------AA--GCAGAC--ATATCATTGACATATATC----A-A-AA-------ATAACAAAAGGGTGG---GGGCTAGTAT---AGACG---CTTGAGGGACCCC-ACACG
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT-------AA--CATAATTCTGTGATTGACAGTGTCGAAGGTTTTCTCT--AGGTCAAGTAACACCAT---TCC--TA-CCA-G-GTTA-CCTTT----ATTCATATGGAACTAAATGAAA----TCAGATAGGTGAATAAGACAACTACCTGTGGAAA-AAACGCGTCTAAAACAAAAT--TGGAAagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaataacataattctgtgattgacagtgtcgaaggttttctctaggtcaagtaacaccattcctaccaggttacctttattcatatggaactaaatgaaatcagataggtgaataagacaactacctgtggaaaaaacgcgtctaaaacaaaattggaa
gi|141966                     : agacccaaaaagaattgattctgtcttcccaagatgcaatgaaagtgtattgtttacctatgattcagtaacatgttcaagctttgcattgtgatttatatttcccagtaattaggattccggaatcatcagcatataaaagaaatgtgttgtttacaaagcagacatatcattgacatatatcaaaaataacaaaagggtgggggctagtatagacgcttgagggaccccacacgagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaGAGCCAAAAATAACGCACTCGGTTAAACCAAGATGTATG-ACAGCTTATTATATTCTAGCCGAGA-T-GAG----C--AAGA----CA-------------C-----CA-----AC-AC-ACTTCAAAATTT--AGAAGA-A---ATAACA-CTATATTAGT--T--A-TAAG--CT---ATAAGA-AT--CGTGCTG--TCATCAGCATATAG-AA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT-CGGGGTCAA--T-GCTAC---TAACC--ATGTCATTTACATG-G-T----A---AC-------A-AATAGAAG---CG---GGCCTAAGAT---GCTAC---CCTGTGGAACGCC-ACATGTTACAGATT---TATA-CT--TTG---AAAATACATCG--TTA-------A-----CACT--AA------C---T----GGTT-G-TT--T--T----TCGTGTTAAATAAGACATGAACAAATCAA-----------TATTA--------T-AAC-C---AATTG--AT---T-T-T-------AGTTT-A----CT----ACAT-------AA--AATATG---ATGATCAGCTGTTTCAAAGGATGTTTGT--AAATCTAACATAACCAT---GCCTGTA-TAA-A-A--T-CCTTT-AGCACTATTGCT---TTCAAT---A----TCTATAAATTGGACAAGGCAATTTTCAGTTGAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TCCAATTCATCCCATA----AA----TTGTTGCAATCT---TA---GAT--G---TTCTCAAGTTGAGTAT-ATACAGACCTTTCT-AGA--ATTTTAGA
gi|141967                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTTTCCCAGATGCAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGAATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATAGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTTACTT-AT-AC--TAATGCTCATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-CACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACATACAATAT-TTTCAAAG------TCGGACATGGTA--TTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--T--A----CCT-GACAAGTACGATTGAAAC----CAC-----------T-CGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---ATGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CGTTT-TGCCTTTTGATT---TTTTATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCGGTCGAGT-A---GCCTCGGAATCCATTC--TGAAGATCAT-ACAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCT-AGA--ATTTTAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAACTGGTCTATAGTT--A
gi|141968                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTGTCCCAGATGCAATGACGGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--GA-T-TTTAC-A-TT-T----TTGACTT-AT-ACTAATACTC--ATATCATTAACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---TTTGAGGAACTCC-ACATACAATATTTT---CAAA-GT--CGG---ACATAGTATTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--TACT----T---GACAAGTACGATTTAAAC----CAT-----------T-AGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---GTGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CCTTT-TACCTTTTGATT---TTT-ATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCAGCCGAGT-AGGTCCCTCGGAATCCACTC--TGAAGATCAT-ATAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCA-AGA--ATTTAAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAAATGGTCTATAGTT--A
gi|141969                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAACCGGATAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGGATAATTTATTATCCACTAGCC---ACT-G------A--CTAA----CA-------A-----------------GAT-G----T---AGGTC-----CTCC-G----------TCAGAACCTC--C----TCAG--CATGCAACAAG-AA--TACAA-GAATCATCTGCATATAA-CA--------A--TA-G-TT--T-G-TT-T----TTAA--C-AC-AG--AT-GAC--ATGGCATTTACATA-A------A-TCAA-------G-AACAGAAG---TG---G-TCCA--AT---AATTCAACCTTGTGGCACTCC-ACATGCGAT---TGGGGCA----T--TCG---AAGAAAGT--G--TCCCCGAC--ACATG-AACA--AG------C---T----G--C-TGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAGGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATG---TCATCGCCTAGAC--CTAT---TGT-C-TGG---AGTTTCA----CG----AGA--------AG--AACAGT---GTGATCTACAGTATCGTAGGCTTTTTGT--AGATCTAATAAAATCATACCTACAGTA-TTA------T-CCGTA-TCCATTTCCA-G---CTTTATATAATCTGTCAAA----TGGATGAGACACGTGTCAATTGAAA-ATACACTTCTGAACCCTGAC--TGAAATTTAT-A
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCCGAATAAAATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGAATAATTTATTGTCCACTAGCC---A-
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCATCTGCATATAG-CA-------------------AC-A-GT-TTGTGTTTA--A-CC-ACA-GCTGAC--ATGTCATTTTTATA-A------A-TCAA-------G-AACAGTAG---TG---GTCCAAGAATTGAAC------CTTGTGGCACTCC-ACATGTAA-----TAGGGACA-TT--T-G---AAGAA--TGTG--TCCCAGACACATCAA-CA----AG------C---T----G--T-GGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAAGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATGCCATCGCCTA---GAC-CTGAT---T-C-C-TGA---AGTTC-------------CATGAGA---AG--AACAAT---GTGATCCACAGTTTCGAAAACCTTTTGT--AGATCTAATAGAATCAT---ACC--TA-CAACATA--A-CCCTTATCCATTTCCA-G---CCTTATATAATTTGTCAAA----TGGATGAGACACG--TCAGTTGAAA-AACCACTTCTGAACCCTGAT--TGAAATTTTT-ATA----ACAACTTGTTTTT---ATTT---GAAGTAAG--A---TT--CAACTCGTTCAT-AGAC--AACTTTTTCAAAT-ATCTTAGAC-ACAAT--TCTTAATATAGAAACAGGGCGATTATT--CCCAACT----GAGGTTTTATCAT--TTTTCTTATAAAG--GGGAACAAATCTTTCTGCCTTGAGGTCATCT-GGGACCGCGCCTTGAATTAA-AGACTAAAGATTAATAATActgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaatcatctgcatatagcaacagtttgtgtttaaccacagctgacatgtcatttttataaatcaagaacagtagtggtccaagaattgaaccttgtggcactccacatgtaatagggacatttgaagaatgtgtcccagacacatcaacaagctgtggtctgtccgaaaggtaagacttaaaccattttaaaatgccatcgcctagacctgattcctgaagttccatgagaagaacaatgtgatccacagtttcgaaaaccttttgtagatctaatagaatcatacctacaacataacccttatccatttccagccttatataatttgtcaaatggatgagacacgtcagttgaaaaaccacttctgaaccctgattgaaatttttataacaacttgtttttatttgaagtaagattcaactcgttcatagacaactttttcaaatatcttagacacaattcttaatatagaaacagggcgattattcccaactgaggttttatcatttttcttataaaggggaacaaatctttctgccttgaggtcatctgggaccgcgccttgaattaaagactaaagattaataata
gi|141971                     :                                                                                                                                                                                                                            gatccgaataaaatggattcagttttacccaaatgcaggaataatttattgtccactagccactgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaaGAACCGAAAAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGAAGAGATAATTTATTGTCAACTAGCC---A-
gi|141972                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACT---A-T-T------T--ATTA----CA-------C-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--T--A-TGTG--AG---AAAAAGAAT--AGCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AATT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-AC-TC--ATGCTC--ATATCATTTACAT-----------T-AA-------A-AACAGTTA---TG---GCCCCATAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACActgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaatcatctgcatctaacaataatttgtttttaaccacagcttacatttcattcacataaataaagaacagtagtggtccaaaaattaaaccttgtggcactccacatgtgatattatgatgaa
gi|141973                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCAAATAATATATATTATGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTCTAGTTCA--T---T-AC--CT---AAACCT---TCACT-A---ATGACA-TTAGGATCTTCAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAATA-TCTT-TC-A-AC-CG
gi|141974                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAGGATGAAAAGAAAGTTTGTTGTCTATTTATC---A-T-T------T--ATAA----CA-------A-TTTTC---------T-GGT-TC-ATT-----GCCTTAAACTTC-ACTTATAGCA-TTAGGATATTTAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------T--AACT-TT-AC-ATTT-TTGACTT-A--T-GC-TA--ATGCTC--ATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAGAAA---TG---GCACCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACA
gi|141975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAT-GT--TGTA-----TCATCTGCATATAA--A--------T--CA-G-TT-TC-A-G--CAGTGTCAG--T-GT-AAA-GT-GGT--AAATCATTAATA-A-A-C----A-G-AAG------A-AATAAAAG---AG---GGCCTAAAAT---AGAAC---CTTGAGGTACACC-ATCTGTCAC---T--GTTTGA-TTGGTTG---ATAATACGTCA--TTT-------AGGGA-AATT--TT------C---T----G--T-------T--T----TCG-GTTATGTAAG-TATGAAG----AGA---------------A--------CC-ATGC---TAATACCTT---G-T-CTGAA---AGTTT-ATAGACTTTCAACTTTTGCAAAAG--AATTTT---ATGGTCCACTAGATCAAACGCTTTCTTG--AAATCAACCATAACTAC---TCC--TATTAA-A-G--ATCCATT-
gi|141976                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTA--TCATCAGCATATAA-GA--------T--TA-T-TT-AC-A-TT------------T-TT-AC--TTATGC--AG--CATTGACACG-A-C----A-T-AA-------A---CAAAAG---CAACTGACCCAGTAT---ACTTC---TTCAAGCAAAATC-GTATGAAA-----TG--------T--TC----ATGAAA-TCTGACTTT-------GTATG--ATT--AA------CATTT----A--TAGATTGTT--TATGATCA-GTCAAATAAGATAGAAAC----CGC-----------T-CAA--------TTGACTC---CATCCCCAT---T-T----ATTTTAGTTT-A----CA----ACAT-------------TCAA---GC-ATCAACTGTGTCAAAAGCCTCCTATTAAGGTCCAACATAACCAT---TCCTGTA-TAA-A-G--A-CCTTT-TGAA--CTTA-A---TTTGGT-CCG----TC----AGATGAATAAGGCAGGCGTCAATGGAGC-AGTTACATCTAAAACC--ACTTTGTAGTTCAT-ATAAAAGACCT----TGTTT---AACT---AA---GAATGA---TTCT--AGTTGGCTGTGACACAGCTCTTTCT-AAAAGAC-TTGAATCAT-AC--ATAAA--ATGCTAACAGGTCTATAGTTTGAT--ACATC----AG----ATTTGCCATTTTTCTTAAATAATGGTTTGATTTTAACACTTTTAAGTTCA-CATGGCACAATG
gi|141977                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--TCATCAGCACACAT-GT--------T--CA-T-TT-TCGA-ATACTGAGT-------GC-A----TAAG-----------GGCATA-A-CATTGA-T-AAAGATAATA-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAACCTTTC---T----G--T-GAAT--A--T----TCA-CATCAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TTttacaggtgataga
gi|141978                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCGTCTGCA---AA-CA--------G--TC-T-GT--C-A-GT--GGAG--GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCGAGGAC---AGTAC---CTTGGGGTACACC-AGAAGTAAC---T--GGT-GC-TT--ACG---ATGA
gi|141979                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCCAGGAC---AGTAC---CCTGGGGTACGCC-AGAAGTAAC---GTG
gi|141980                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--CTATCATTGGTA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGAGGTACACC-ACATGTTAC---T--GATTTACTT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ATCAGATATTGAAA------C---TTTTTG--T-GAGC--T--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141981                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --T-GC-AT--AAGGGC--ATATCATTGATA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAAATTTTT---T----G--T-GAAT--G--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAAATTTGTACATCT-TTA--------TGGAAAT---GGTATACAT---T-T---------AGTTT-T----TC----AAAC-------AG--TA-AACT--ATGATCAACCAGATCAAATGCTTTAGAT--AGGTCAAGAAATATGGT---TCCAG-A-TA
gi|141982                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --ATATCATTAATATA-A-A----C-T-AA-------G-AAAAGAAG---AG---GGCCTAATAT---AGATC---CCTGTGGCACACC-t
gi|141983                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCATTGATGTA-G-C----A-G-AG-------A-AATGAAAG---CG---GGCCGAGCAT---CGTTC---CCTGTGGCACACC-GGAGCTAAC---
gi|141984                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---AGTTT-A----CC----ACAT-------CA--AATATG---ATAATCAACTGAATCAAAAGCTTTCTGT--TAATCTAACATAACCAT---GCCAGTA-TAT-A-G--T-CCTTT-GGTACTATTGCT---TCTAACATGA----TTCATTAAGTAGACAAGGCAAGTATCAGAACAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TGCAATTCAT-ACAATA---AA----TTGTT---ATC


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T       GC   A    G     G  C        G     G  T     A GG              A       GAG C GATTCAG  TT GA TGTT  CTGGGAT G  A  AAAAGATCATG          TCA      TAA   G T CTT      C     G    CA AT A C  CATGC    C   A TAAT      AA     T        AAGAAATGTGTTG     C  TA G ATCGGAGTCGA     T  T  TAA     TC              T CATTG  C C  AGATAAT T        GGTG ACT       G  TGA CT  AAC    T  T  G  T   A     ATTTTCAAAG     GG CGGAC      CTT  AC   ACCAGATATTGAACCTTTC             TTTT GT A    GT AC ATGA  GT T                AAAT   ATTTGTACATC A   AAATGCCA     G CTA   T     CAG G AAGAG         C TAGACTTTCA    TTGCAAA  TG    ATTCT         G        C         TA     G    A      ACC   G   T   C T TTA   A  A      G   TGGAA   A  AA  TCTG  A  A              T             A TTT            G   TT          C   GAAGAG  CTTG     GCA    TAA  AGT   TG GAT   GC           G       A G    C   AG     T   C     TG     G                     TG         CA    TTTT     CC             AA                               T           T             TAA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T       .    G    G     T  C        G     G  T     A AG              A       .   . GAG      .  GA .     .       .  A  TAGTTCATTAC          .        A     G C .        .     G    TA AT . C  GCTG     C   . TG        .      T        AATAATA           .  TA . ATCGGAGTCGA     .  .  AAG     .               . TC     C C  G       .        A    .         G  .   TT  A      T  T  G  .   A     TGGGGTAGA      .  TG         CTT  .    ACCAGATATTGAAATTTTT             .    .  .    .  .  .     G  T                .      .           .   AAATG        G .     T     CAG . CAGAG         . TT            GAGA     .     ACT           G        C         .      G    A      .     G   .   . . AT    A  .      G   TG      A  AA  TTTG  A  A              T             . TTT            G   .           .   GAAGAG  .        .      A    .     .  GAT   GC           .       A G    .   T      T   .     TG     G                     .          CA    .        .              .                                .           .             .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T       .    G    G     T  T        G     G  T     A GG              A       .   . TG       .  GA .     .       .  A  AAGTTCATTT           .        A     G . .        .     G    .  .  . C  CG       C   . TT        .      T        TAATAA            .  A  . ATCGGAGTCGA     .  .  AAG     .               . C      . .  T       .        A    .         G  .   CT  .      T  T  G  .   A     TTGGGTAGA      .  TG         CTT  .    CCGACACATGAACAAGC               .    .  .    .  .  .     G  T                .      .           .   .            G .     T     .   . CAGAG         . AT            .        .     AC            G        C         .      G    A      .     G   .   . . A     A  .      G   TG      A  AA  .     A  A              T             . TTT            G   .           .   GAAGAG  .        .      .    .     .  .     GC           .       A G    .   .      T   .     .      G                     .          CC    .        .              .                                .           .             .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T       .    G    G     T  C        G     G  T     A GG              A       .   . G        .  GA .     .       .  A  TAGTTCATTG           .        A     G . .        .     G    .  .  . T  CA       C   . TT        .      T        TAATAA            .  A  . ATCGGAGTCGA     .  .  AG      .               . C      . .  T       .        A    .         G  .   CT  .      T  T  G  .   A     TTTGGTAGA      .  TG         CTT  .    CAGACACATCAACAAGC               .    .  .    .  .  .     G  T                .      .           .   .            G .     T     .   . CAGAG         . TT            .        .     AC            G        C         .      G    A      .     G   .   . . A     A  .      G   TG      A  AA  .     G  A              T             . TTT            G   .           .   GAAGTG  .        .      .    .     .  .     TC           .       A G    .   .      T   .     .      G                     .          CA    .        .              .                                .           .             .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .       .    A    A     A  C        G     G  T     A GG              A       .   . G        .  GA .     .       .  T  TAGTTCATTG           .        A     G . .        .     G    .  .  . C  CG       C   . TT        .      T        TAATAA            .  A  . ATCGGAGTCGA     .  .  AG      .               . C      . .  .       .        A    .         G  .   CT  .      T  T  G  .   A     TTGGGTATA      .  TG         CTT  .    ATCAGATATTGAAAC                 .    .  .    .  .  .     G  T                .      .           .   .            T .     T     .   . CTGAA         . TT            .        .     AC            A        G         .      A    A      .     T   .   . . A     T  .      C   TG      A  GA  .     A  T              A             . AAC            A   .           .   ACATAT  .        .      .    .     .  .     G            .       C T    .   .      A   .     .      A                     .          .     .        .              .                                .           .             .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .       .    .    C     A  A        G     G  A     G AC              A       .   . G        .  GC .     .       .  A  TAGTTCATTG           .        A     T . .        .     A    .  .  . G  CG       T   . TT        .      A        TAATAA            .  A  . AACTGAGTAAA     .  .  G       .               . C      . .  .       .        A    .         G  .   CG  .      T  C  T  .   T     TTGGGTAGA      .  TG         CAT  .    GTATGATTAACATT                  .    .  .    .  .  .     T  A                .      .           .   .            T .     G     .   . ATTTT         . CT            .        .     AC            T        G         .      T    T      .     A   .   . . A     T  .      A   CT      A  GT  .     T  A              A             . TGA            T   .           .   ACATAT  .        .      .    .     .  .     C            .       T T    .   .      A   .     .      .                     .          .     .        .              .                                .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G     T  A        A     A  A     C AT              T       .   . G        .  CT .     .       .  T  CATGATACG            .        A     T . .        .     A    .  .  . A  CG       A   . TC        .      A        AATAAT            .  A  . TTCGGGGTCAA     .  .  G       .               . C      . .  .       .        A    .         T  .   GA  .      A  G  C  .   C     AGATTTATA      .  TG         TAT  .    ATCTTCACTAAC                    .    .  .    .  .  .     C  A                .      .           .   .            G .     G     .   . CTAA          . CG            .        .     TG            T        T         .      A    T      .     A   .   . . T     T  .      T   TT      T  GT  .     T  G              G             . GGT            A   .           .   AAAGAC  .        .      .    .     .  .     T            .       T T    .   .      A   .     .      .                     .                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C     T  A        T     C  A     C TG              T       .   . G        .  AC .     .       .  T  CATGATACG            .        A     C . .        .     T    .  .  . G  CG       G   . AT        .      A        AATAAC            .  A  . GTTTGTGTTTA     .  .  G       .               . A      . .  .       .        C    .         G  .   CT  .      T  A  G  .   T     ATTTTCAAA      .  GG         CGT  .    ATCTTCACTAAC                    .    .  .    .  .  .     C  A                .      .           .   .            T .     T     .   . CTAA          . CG            .        .     TT            T        T         .      A    T      .     A   .   . . G     T  .      T   TT      T  AT  .     T  G              G             . TAC            A   .           .   ATA     .        .      .    .     .  .     .            .       A T    .   .      A   .     .      .                     .                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C     T  T        G     A  A     T AT              T       .   . T        .  AG .     .       .  T  CATTATGCG            .        A     G . .        .     A    .  .  . G  CT       G   . TA        .      G        ACGTG             .  A  . TTTTTGACTTA     .  .  G       .               . T      . .  .       .        T    .         A  .   CT  .      A  A  T  .   T     TAGGGACA       .  CG         GT   .    ATCTTCACTTAC                    .    .  .    .  .  .     G  A                .      .           .   .            G .     C     .   . CTGG          . CG            .        .     TT            A        G         .      T    A      .     T   .   . . G     G  .      T   CT      T  AT  .     A  T              C             . ACC            T   .           .   TA      .        .      .    .     .  .     .            .       T T    .   .      G                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A     T  T        T     T  C     C AT              T       .   . T        .  TT .     .       .  T  CATGATTCG            .        A     C . .        .     A    .  .  . C  AA       C   . TT        .      G        AATTA             .  A  . TTTTTGACTTA     .  .  G       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   CT  .      A  A  T  .   T     TGATTTAC       .  TG         TG   .    ATTGTCACTTAC                    .    .  .    .  .  .     A  T                .      .           .   .            T .     A     .   . CTGA          . CA            .        .     GT            A        A         .      T    G      .     A   .   . . T     C  .      T   G       G  AT  .     A  .              C             . GTT            T   .           .   AC      .        .                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T     A  G        T     T  C     C GG              C       .   . T        .  TT .     .       .  T  CATGATACG            .        .     C . .        .     A    .  .  . G  AA       A   . .         .      T        AATGA             .  A  . GCAGTGTCAG      .  .  G       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   AT  .      T  C  T  .   T     TGATTTAC       .  CG         TC   .    ATCTTCACTAAC                    .    .  .    .  .  .     A  T                .      .           .   .            A .     .     .   . T             . TC            .        .     AT            T        C         .      A    T      .     A   .   . . A     A  .      C   G       A  C   .     C  .              G             . TGA            T   .           .                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A     T  A        A     A  C     C GG              C       .   . G        .  TA .     .       .  T  CATTGTG              .        .     C . .        .     A    .  .  . G  AG       G   . .         .      T        AATGA             .  T  . TTTTTTACT       .  .  T       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   CT  .      T  C  T  .   T     TGATTTAC       .  G          T    .    ATATAAACACCT                    .    .  .    .  .  .     A  A                .      .           .   .            . .     .     .   . .             . CC            .        .     TT            T        A         .      C    T      .     .   .   . . A     T  .      A   A       .  .   .     .  .              A             . .              .   .                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .     T  G        A     A  C     C GA              A       .   . T        .  TT .     .       .  T  CAACAC               .        .     C . .        .     A    .  .  . G  AA       G   . .         .      G        CAATA             .  A  . TTTTTGACT       .  .  A       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   CT  .      A  A  T  .   T     TGGGGCA        .  C          .    .    ATATAAACACCT                    .    .  .    .  .  .     A  A                .      .           .                                                  . .             .        .     AA            C        T         .      A    A      .     .   .   . . T     T  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T  T        A     A  C     A AT              T       .   . T        .  TT .     .       .  .  TGGTTC               .        .     C . .        .     A    .  .  . .  AA       C   . .         .      G        GATTA             .  T  . ATACTGAGT       .  .  A       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   GA  .      A  A  T  .   T     TGTTTGA        .  C          .    .    AGGGAAATTTTC                    .    .  .    .  .  .     .  A                .      .           .                                                                  .        .     TG            T        A         .      T    T      .     .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  T        T     T  A     T AT              T       .   . T        .  TA .     .       .  .  GATG                 .        .     T . .        .     .    .  .  . .  G        .   . .         .      G        GTTCA             .  A  . GTGGAGGA        .  .  A       .               . C      . .  .       .        A    .         T  .   CT  .      A  T  A  .   T     TGGTGC         .  C          .    .    ACACTAAC                        .    .  .    .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  T        T     T  A     T AA              T       .   .                                                                                                                    .   .           .      T        CAGTC             .  T  . TTTTTAA         .  .  T       .               . C      . .  .       .        C    .         A  .   GA  .      A  A  A  .   A     TG             .  C                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T     T  A     A .               .       .   .                                                                                                                                    .      A        ATCA              .  .  . TT              .  .  A       .               . G      . .  .       .        T    .         G  .   GT  .      G  T  A  .   A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .      A        TA                .  .  . .               .  .  A       .               . G      . .  .       .        C    .         G  .   GT  .      G  T  A  .   T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .      T        CA                .  .  .                 .  .  .       .               . A      . .  .       .        C    .         A  .   GA  .      G  T  G  .   T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  .  .       .               . C      . .  .       .        T    .         A  .   GA  .      A  T  A  .   G                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .  .  .       .               . .      . .  .       .        T    .         T  .   GA  .      G  T  A  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .               . .      . .  .       .        A    .         C  .   GT  .      T  C  A  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .      . .  .       .        C    .         .  .   C   .      T  C  A  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATNA************
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-NA--------T--TA-T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAAAATNA------------T-TT-AC-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111                           222222222222222222                                                                    1111                      11111111111             111111111111111       111                                   1111111                                                              2222222222222                111       2222222222222222222222222222222                                                     11111111111     11111111                   111   222222222       1111111111    1111111                                                                                                                 1111                                                                                               111           111   11                                               11                                            1111                                                                               111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1 0     77   1    4     3  1        1     1  1     1 22              1       333 2 22222222 33 22 5555  8888888 2  2  000000000000000000   444      888   1 5 444      2     1    66 66 2 4  5555555  5   2 2222      22     1        33333333333 1 6   555 2 666666666666666 1  1  222     22              1 555555 3 3  0000000 1        3333 222       1  222 11  444    1  1  3  1   1     1111111111111  33 77777      222  33   6666666666666666666666666666666 5555 33 2 0  33 33 5555  33 1  0             5555   22222222222 2   88888888     2 555   5     000 3 777777777     2 3333333333    4444444  33    99999         1     0  3         33     3  0 1      444   8   2   2 2 5555  1  2      1   88888   1  44  3333  3  6              1        0    3 444            5   44  0  0    3   555555  7777     666    111  777   55 444   22           4       1 1    4   99     1   4     22     8                     66         22    2222     77             77                               5  0        6             111            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .     ..   .    .     .  .        .     .  .     . ..              .       ... . ........ .. .. ....  ....... .  .  ..................   ...      ...   . . ...      .     .    .. .. . .  .......  .   . ....      ..     .        ........... . .   ... . ............... .  .  ...     ..              . ...... . .  ....... .        .... ...       .  ... ..  ...    .  .  .  .   .     .............  .. .....      ...  ..   ............................... .... .. . .  .. .. ....  .. .  .             ....   ........... .   ........     . ...   .     ... . .........     . ..........    .......  ..    .....         .     .  .         ..     .  . .      ...   .   .   . . ....  .  .      .   .....   .  ..  ....  .  .              .        .    . ...            .   ..  .  .    .   ......  ....     ...    ...  ...   .. ...   ..           .       . .    .   ..     .   .     ..     .                     ..         ..    ....     ..             ..                               .  .        .             ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4 1     99   7    1     6  0        9     0  0     0 88              8       999 2 55555555 44 00 3333  1111111 5  8  666666666666666666   444      222   0 0 444      5     1    99 99 5 3  8888888  6   4 4444      88     0        11111111111 7 0   555 1 111111111111111 8  8  333     44              7 333333 3 3  4444444 7        9999 999       2  999 66  666    0  0  7  7   0     8888888888888  22 88888      555  44   6666666666666666666666666666666 3333 44 5 7  44 44 3333  66 0  2             7777   77777777777 7   88888888     8 444   4     888 1 444444444     9 3333333333    3333333  77    44444         0     7  2         77     7  2 0      777   7   7   9 9 5555  0  9      0   99999   9  11  1111  8  7              0        8    1 888            2   22  2  8    3   222222  7777     444    000  000   55 000   55           0       2 0    0   55     0   4     22     4                     11         00    1111     99             99                               7  3        7             777            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-AA--------TNA-TTT-A-C-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
Reference ( family-682 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAATAANATACATTCGGTTTTNCCNAGATGNAGGGACAGTTTATTGTCNACTAGCC---A-T-G------T--ANNA----CA-------A-TTNTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTNC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TNAG--CG---AACAAT-AT--TGCACTG--TCATCNGCATATAA-AA--------TNA-TTT-A-C-A-NT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AACAAAAG---NG---GGCCCAGGAT---ACTTC---CTTGNGGNACGCC-GCANGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TCG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GNTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-C-GAG---AGCTT-A----CT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGATCAACNGTATCGAACGCTTTCTGT--AGATCGAGCANAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCNTT-TGCATTNTTATG---TTTAATANAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACANGTATCAGTGGAGT-ATNTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACNCTCT-AGA--ACTTTNGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141957                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCTTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--CTAGAAGAGCCAAACAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAATTTATTATCAACTAACC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-TA--------TTAATTT-A-C-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAAA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTG-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----TT----ATAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACACCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACACTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-GGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141958                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTTTTTAAGTCTT--TTAAAAGAGCCAAAGAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTGTCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAC-AT--GACACTG--TCGTCTGCATATAATAA--------TAA-TTT-A-C-A-AT-CGGAGTCGA--T-AC-GC--GTAGGC--ATATCATTGCCATA-A-C----A-T-AG-------A-AATAAAAG---AG---GGCCAAGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TGGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAAATTAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-TAA-GAG---AGCGT-A----TT----TCAT-------AA--ACTAAC---GTGGTCAACGATATCAGACGCCTTCTGT--AGATCGAGTAAAACCAT---TCAGGTA-TAA-A-A--A-CCATT-TGCATTGTAATG---TTTAGTAAAA----TCAAAAAGGTGAATAATACATGTATCAGTGG-GTAATTTACTCCTAAAACCGGAC--TTAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---TCCG-AAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATGAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAC--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTCTTGCAGTTTTCATTTCATAA-AGTACAATGCC-TGATTCAATAGAC---ATATTAATAATA
gi|141959                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGATTTTATGACCATTGTATGTTACCGTAATTGTCTGAACTTTTTTAAATCTT--CTAGAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAAGGACAGTTTATTAGCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CA---AACAAT-TT--TACACTG--TCGTCTGCATATAATAA--------TAA-TTT-A-C-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---CGCACAGGAT---GTTTC---CCTGTGTTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----ACG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGGCGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCTT-A----AT----A-AG-------AGTGAATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCT--------AGATCGAGTAAAACCAT---TCCGGTT-AAA-A-G--A-CCATT-TGTATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCAATAAGGTGAATAAGACATGTATGAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGAAACTCAT-ACAGAAGAGAA----TTTTT---ATCT---AA---AAA--A---CCCGCAAATTGGTTAT-ATACAAAACGCTCT-AGA--AGTTTTGAT-TTAAC--ATTAAGTATTCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCAAAGG----ACTAA--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTAACTCTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-CGAGTCAATAAAC---AAAATAATAATA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAACTTT----GGTTTTGCCTAGATGA
gi|141960                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTATC-----CA--T-TAT-GCGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAA-----------TAA-T-------A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------C-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGTT---TCTTC---CCTGTGGTACGCT-GCAAGTAAC---TTTGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTTAGATAAGATTTGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGC---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AGCCT-A----TT----ACAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAACGGTATCAAACGCCTTCTGT--AGGTCGAGTAAAACCAT---TCCGGTA-TAA-A-G--A-CCATT-TGCATTGTTATG---TTTAACAAAA----TCAAAAAGGTGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAAAACCGGAC--TGGAACTCAT-ACAGAAGAGAG----TTTTT---ATCTA--AA---AAA--A---TCTGCAAATTAGTTAT-ATACAGAACGCTCT-AGA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTAACTGGCCTATAATT--ACCAACTTCCCAAGG----ACTAG--ACTTTTTGTAAAT--CGGGCTGACTTTTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGAGTCAATAGAC---ATATTAATAATAagggacagtttattatcaactagccatgtagaacaattatccattatgcgactaagtctatctgcaataacattagggtctttgtcagcgaacaatattacactgtcatctgcatataataataatcggagtcgatgcacgtaggcatatcattgacataacataacaataaaagagggcccaggtttcttccctgtggtacgctgcaagtaactttggtagattttgatgaaactttgtttatcttcacttactgtgatctttcggttagataagatttgaaccaatttatcgacgcgactcccatttcagagagcctattacatagaataacgtggtcaacggtatcaaacgccttctgtaggtcgagtaaaaccattccggtataaagaccatttgcattgttatgtttaacaaaatcaaaaaggtgaataagacatgtatcagtggagtatttactcctaaaaccggactggaactcatacagaagagagtttttatctaaaaaaatctgcaaattagttatatacagaacgctctagaacttttgatataacattaagtatgctaactggcctataattaccaacttcccaaggactagactttttgtaaatcgggctgacttttgcagttttcatttcatcaggaacaatgcctgagtcaatagacatattaataata
gi|141961                     :                                                                                                                                                                                                                                                          gaatttcatgaccgttgcatgtaaccgtaaatgactgaacGAATTTCATGACCGTTGCATGTAACTGTAAATGACTGCACTTTTT-AAGGCTT--CTAGAA-AGGCAAA-AATATACATTCGGTTTTGCCTAGATAAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---T-T-G------C--AGAA----CT-------A-T-ATC-----CA--T-GAT-TCGACT---AAGCCT--ATTTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TTAG--CG---AACAAT-TT--TACATTG--TCGTCTGCATATAATAA--------TAA-TTT-A-C-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-AA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCATGGAT---GCTTC---CCTGTGGTACGCC-GCAAGTCAC---TTGGGTATA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------AT-TGTCACT--TA------C---T----G--T-GATC--T--T----TCG-GTGAGATATGATTGGAAC----CAA-----------T-TTA--------TCGACGT---GACTCCCAT---T-T-CAGAG---AACTT-A----TT----GCAT-------AG--AATAAC---GTGGTCAATGGTATCAAACACCTTCTGT--AGATCGAGTTAAACCAT---TCCGGTA-TAT-A-G--A-TCATT-TGCATTGTTATG---TTTAATAAAA----TCGAAAAGATGAATAAGACATGTATCAGTGGAGT-ATTTACTCCTAACACCGGAA--TGAAACTCAT-ACAGAAGTGAA----TGTTT---ATCTTAAAA---AAA--A---TCCGCAAATTGGTTAT-ATACAGAACGCTAT-AAA--ACTTTTGAT-ATAAC--ATTAAGTATGCTTACTGGCCTGAAATT--ACTAACTTACAAAGG----CCTAG--ATATTTTGTAAAT--CCGGCTGACTATTGCAGTTTTCATTTCATCA-GGAACAATGCC-TGTGTCAATGGAC---ATATTAATAAT
gi|141962                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATTTCATGACCGTTGCATGTAACCGTAAATGACTGAA-TTTTTTAAGACTT--CCAAAAGAGCCAAATAACATACATTCGGTTTTGCCTAGATGAAGGGACAGTTTATTATCAACTAGCC---A-T-G------T--AGAA----CA-------A-TTTTC-----CA--T-GAT-ACGACT---AAGTCT--ATCTGC-A---ATAACA-TTAGGGTCTT--T--G-TCAG--CG---AACAAT-AT--TACACTG--TCATCTGCATATAATAA--------TAA-TTT-A-C-A-AT-CGGAGTCGA--T-GC-AC--GTAGGC--ATATCATTGACATA-A-C----A-T-TA-------A-AATAAAAG---AG---GGCCCAGGAT---GCTTT---TCTGTGGTACGCC-GCAAGTAAC---TTGGGTAGA-TT--TTG---ATGAAACTTTG--TTT-------ATCTT-CACT--AA------C---T----G--T-GATC--T--T----
gi|141963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTTA--TCTT--TTA-AAGA---AAA-AACATAGCTTCGGTTTTGTTAGGGTTGA-----AATTTA-------CTAGCC---A-TTG------TTTAGCC----CACTGGGATA-TTATT-----AA--AAGATCATGATT---AATTAA--ACCTTC-A---ATATCACTTA------C--T--GATGAGGCTG---AATAGT-ATAATGAACTG--TCGTCAGCATACAA-A----------CG-TGT---C-A-AA-CTGAGTAAA--TTGT------TAGCT--ATATCATTAACATA-A-A----T-T-AA-------G-AATAATA----AA---GGTCCAAGA----ACGGCA--CTTGTGGCACTCCTGCAT-TAA
gi|141964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGAACCAAATACAATGCATTCAGTTTTACCAAGATGCAACGATAATTTGTTGTCAGCTAACC---A-T-T------T--ACTA----CA-------A-TTTTT-----AAGTT-CAT-TT--CT---AAGTAC--ATTTTCTA---ATAACA-TCAGGATCTT--T--G-T--G--CG---AG-AAT-Agagattttaaattggaa
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACCCAAAAAGAATTGATTCTGTCTTCCCAAGATGCAATGAAAGTGTATTGTTTAC---CT---A-T-GATTCAGT--AACATGTTCA-------AGCTTTG-----CA--T---T-GTGATT------TAT--ATTTCCCA---GTAA---TTAGGAT-TC--C--G--------G---AA------------------TCATCAGCATATAA-AAGAAATGTGTTG-TTT-A-C-A--------------------AA--GCAGAC--ATATCATTGACATATATC----A-A-AA-------ATAACAAAAGGGTGG---GGGCTAGTAT---AGACG---CTTGAGGGACCCC-ACACG
gi|141965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AT-------AA--CATAATTCTGTGATTGACAGTGTCGAAGGTTTTCTCT--AGGTCAAGTAACACCAT---TCC--TA-CCA-G-GTTA-CCTTT----ATTCATATGGAACTAAATGAAA----TCAGATAGGTGAATAAGACAACTACCTGTGGAAA-AAACGCGTCTAAAACAAAAT--TGGAAagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaataacataattctgtgattgacagtgtcgaaggttttctctaggtcaagtaacaccattcctaccaggttacctttattcatatggaactaaatgaaatcagataggtgaataagacaactacctgtggaaaaaacgcgtctaaaacaaaattggaa
gi|141966                     : agacccaaaaagaattgattctgtcttcccaagatgcaatgaaagtgtattgtttacctatgattcagtaacatgttcaagctttgcattgtgatttatatttcccagtaattaggattccggaatcatcagcatataaaagaaatgtgttgtttacaaagcagacatatcattgacatatatcaaaaataacaaaagggtgggggctagtatagacgcttgagggaccccacacgagacagtggcttgataagaatagataaccaacataacgatgtctatcaggggcagatattacctacacgatcagacagaatgttagttgagacaaatagcctaagtttcatttaGAGCCAAAAATAACGCACTCGGTTAAACCAAGATGTATG-ACAGCTTATTATATTCTAGCCGAGA-T-GAG----C--AAGA----CA-------------C-----CA-----AC-AC-ACTTCAAAATTT--AGAAGA-A---ATAACA-CTATATTAGT--T--A-TAAG--CT---ATAAGA-AT--CGTGCTG--TCATCAGCATATAG-AA--------TTA-TTT-A-C-A-TT-CGGGGTCAA--T-GCTAC---TAACC--ATGTCATTTACATG-G-T----A---AC-------A-AATAGAAG---CG---GGCCTAAGAT---GCTAC---CCTGTGGAACGCC-ACATGTTACAGATT---TATA-CT--TTG---AAAATACATCG--TTA-------A-----CACT--AA------C---T----GGTT-G-TT--T--T----TCGTGTTAAATAAGACATGAACAAATCAA-----------TATTA--------T-AAC-C---AATTG--AT---T-T-T-------AGTTT-A----CT----ACAT-------AA--AATATG---ATGATCAGCTGTTTCAAAGGATGTTTGT--AAATCTAACATAACCAT---GCCTGTA-TAA-A-A--T-CCTTT-AGCACTATTGCT---TTCAAT---A----TCTATAAATTGGACAAGGCAATTTTCAGTTGAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TCCAATTCATCCCATA----AA----TTGTTGCAATCT---TA---GAT--G---TTCTCAAGTTGAGTAT-ATACAGACCTTTCT-AGA--ATTTTAGA
gi|141967                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTTTCCCAGATGCAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGAATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATAGGCATAGAG-AA--------TGA-TTTTA-C-A-TT-T----TTTACTT-AT-AC--TAATGCTCATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-CACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACATACAATAT-TTTCAAAG------TCGGACATGGTA--TTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--T--A----CCT-GACAAGTACGATTGAAAC----CAC-----------T-CGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---ATGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CGTTT-TGCCTTTTGATT---TTTTATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCGGTCGAGT-A---GCCTCGGAATCCATTC--TGAAGATCAT-ACAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCT-AGA--ATTTTAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAACTGGTCTATAGTT--A
gi|141968                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GACCCAAATAATATACATTCTGTCTGTCCCAGATGCAATGACGGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--TATG-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TGA-TTTTA-C-A-TT-T----TTGACTT-AT-ACTAATACTC--ATATCATTAACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAATAA---TG---GCCCCAAAAT---ACTTC---TTTGAGGAACTCC-ACATACAATATTTT---CAAA-GT--CGG---ACATAGTATTG--TTA-------ATATA-AAC----A------CCT-T----G--T-GTTC--TACT----T---GACAAGTACGATTTAAAC----CAT-----------T-AGA--------TTGACTC---CACGCCCATCAGT-T-C-TAA-----CTT-A----CG----ACAT-------AA--AATGTT---GTGATCAACTGTATCGAATGCTTTTTGC--AGATCAAGCATAATCAT---GCCAGTA-AAT-A-G--G-CCTTT-TACCTTTTGATT---TTT-ATGTGA----TCTGAGAGGTGAGTAAGGCAGGAGTCAGCCGAGT-AGGTCCCTCGGAATCCACTC--TGAAGATCAT-ATAACATATTA----TTGTT---AGTT---AA---AAA--AGATTCT---AACTGATTAT-ATACAGCTCTTTCA-AGA--ATTTAAGAA-ACAATTGATAAA--ATACTAAATGGTCTATAGTT--A
gi|141969                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAACCGGATAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGGATAATTTATTATCCACTAGCC---ACT-G------A--CTAA----CA-------A-----------------GAT-G----T---AGGTC-----CTCC-G----------TCAGAACCTC--C----TCAG--CATGCAACAAG-AA--TACAA-GAATCATCTGCATATAACAA--------TAG-TTT-G-T---TT------TTAA--C-AC-AG--AT-GAC--ATGGCATTTACATA-A------A-TCAA-------G-AACAGAAG---TG---G-TCCA--AT---AATTCAACCTTGTGGCACTCC-ACATGCGAT---TGGGGCA----T--TCG---AAGAAAGT--G--TCCCCGAC--ACATG-AACA--AG------C---T----G--C-TGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAGGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATG---TCATCGCCTAGAC--CTAT---TGT-C-TGG---AGTTTCA----CG----AGA--------AG--AACAGT---GTGATCTACAGTATCGTAGGCTTTTTGT--AGATCTAATAAAATCATACCTACAGTA-TTA------T-CCGTA-TCCATTTCCA-G---CTTTATATAATCTGTCAAA----TGGATGAGACACGTGTCAATTGAAA-ATACACTTCTGAACCCTGAC--TGAAATTTAT-A
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCCGAATAAAATGGATTCAGTTTTACCCAAATGCAGGAATAATTTATTGTCCACTAGCC---A-
gi|141970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCATCTGCATATAG-CA----------------A-C-A-GT-TTGTGTTTA--A-CC-ACA-GCTGAC--ATGTCATTTTTATA-A------A-TCAA-------G-AACAGTAG---TG---GTCCAAGAATTGAAC------CTTGTGGCACTCC-ACATGTAA-----TAGGGACA-TT--T-G---AAGAA--TGTG--TCCCAGACACATCAA-CA----AG------C---T----G--T-GGTC--T--G----TCC-GAAAGGTAAGACTTAAAC----CAT-----------T-TTAAAATGCCATCGCCTA---GAC-CTGAT---T-C-C-TGA---AGTTC-------------CATGAGA---AG--AACAAT---GTGATCCACAGTTTCGAAAACCTTTTGT--AGATCTAATAGAATCAT---ACC--TA-CAACATA--A-CCCTTATCCATTTCCA-G---CCTTATATAATTTGTCAAA----TGGATGAGACACG--TCAGTTGAAA-AACCACTTCTGAACCCTGAT--TGAAATTTTT-ATA----ACAACTTGTTTTT---ATTT---GAAGTAAG--A---TT--CAACTCGTTCAT-AGAC--AACTTTTTCAAAT-ATCTTAGAC-ACAAT--TCTTAATATAGAAACAGGGCGATTATT--CCCAACT----GAGGTTTTATCAT--TTTTCTTATAAAG--GGGAACAAATCTTTCTGCCTTGAGGTCATCT-GGGACCGCGCCTTGAATTAA-AGACTAAAGATTAATAATActgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaatcatctgcatatagcaacagtttgtgtttaaccacagctgacatgtcatttttataaatcaagaacagtagtggtccaagaattgaaccttgtggcactccacatgtaatagggacatttgaagaatgtgtcccagacacatcaacaagctgtggtctgtccgaaaggtaagacttaaaccattttaaaatgccatcgcctagacctgattcctgaagttccatgagaagaacaatgtgatccacagtttcgaaaaccttttgtagatctaatagaatcatacctacaacataacccttatccatttccagccttatataatttgtcaaatggatgagacacgtcagttgaaaaaccacttctgaaccctgattgaaatttttataacaacttgtttttatttgaagtaagattcaactcgttcatagacaactttttcaaatatcttagacacaattcttaatatagaaacagggcgattattcccaactgaggttttatcatttttcttataaaggggaacaaatctttctgccttgaggtcatctgggaccgcgccttgaattaaagactaaagattaataata
gi|141971                     :                                                                                                                                                                                                                            gatccgaataaaatggattcagttttacccaaatgcaggaataatttattgtccactagccactgattaacaagatgtaggtcctttgtcagaacattctcaacctgcaactttttttcctgacacaagaaGAACCGAAAAAGATGGATTCAGTTTTACCCAAATGAAGAGATAATTTATTGTCAACTAGCC---A-
gi|141972                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACT---A-T-T------T--ATTA----CA-------C-TTTTC-----TAGTT-CAT--TGCCT---AAAACT---TCACT-A---ATTACA-TCAGGATCTT--T--A-TGTG--AG---AAAAAGAAT--AGCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAATTTT-A-C-ATTT-TTGACTT-A--T-AC-TC--ATGCTC--ATATCATTTACAT-----------T-AA-------A-AACAGTTA---TG---GCCCCATAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACActgactaacagtaggtaggccctctgtcagaaccttctcaacatgcaacttattttttcctgacacaaaaatacaagaatcatctgcatctaacaataatttgtttttaaccacagcttacatttcattcacataaataaagaacagtagtggtccaaaaattaaaccttgtggcactccacatgtgatattatgatgaa
gi|141973                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCAAATAATATATATTATGTCTTTCCAAGATGTAATGACAGTTTGTTGTCTATTAACC---A-T-T------T--ATTA----CA-------A-TTTTCTAGTTCA--T---T-AC--CT---AAACCT---TCACT-A---ATGACA-TTAGGATCTTCAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAA-T
gi|141974                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATAATATACATTCTGTCTTTCCAGGATGAAAAGAAAGTTTGTTGTCTATTTATC---A-T-T------T--ATAA----CA-------A-TTTTC---------T-GGT-TC-ATT-----GCCTTAAACTTC-ACTTATAGCA-TTAGGATATTTAT--G-TGAG--AA---AAGAAT-A----GCACTA--TCATCGGCATAGAG-AA--------TAACTTT-A-C-ATTT-TTGACTT-A--T-GC-TA--ATGCTC--ATATCATTTACATA-G-C----A-T-AA-------A-AACAGAAA---TG---GCACCAAAAT---ACTTC---CTTGAGGAACTCC-ACAatctttcaaccg
gi|141975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAT-GT--TGTA-----TCATCTGCATATAA-A---------TCA-GTT-T-C-A-G--CAGTGTCAG--T-GT-AAA-GT-GGT--AAATCATTAATA-A-A-C----A-G-AAG------A-AATAAAAG---AG---GGCCTAAAAT---AGAAC---CTTGAGGTACACC-ATCTGTCAC---T--GTTTGA-TTGGTTG---ATAATACGTCA--TTT-------AGGGA-AATT--TT------C---T----G--T-------T--T----TCG-GTTATGTAAG-TATGAAG----AGA---------------A--------CC-ATGC---TAATACCTT---G-T-CTGAA---AGTTT-ATAGACTTTCAACTTTTGCAAAAG--AATTTT---ATGGTCCACTAGATCAAACGCTTTCTTG--AAATCAACCATAACTAC---TCC--TATTAA-A-G--ATCCATT-
gi|141976                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTA--TCATCAGCATATAA-GA--------TTA-TTT-A-C-A-TT------------T-TT-AC--TTATGC--AG--CATTGACACG-A-C----A-T-AA-------A---CAAAAG---CAACTGACCCAGTAT---ACTTC---TTCAAGCAAAATC-GTATGAAA-----TG--------T--TC----ATGAAA-TCTGACTTT-------GTATG--ATT--AA------CATTT----A--TAGATTGTT--TATGATCA-GTCAAATAAGATAGAAAC----CGC-----------T-CAA--------TTGACTC---CATCCCCAT---T-T----ATTTTAGTTT-A----CA----ACAT-------------TCAA---GC-ATCAACTGTGTCAAAAGCCTCCTATTAAGGTCCAACATAACCAT---TCCTGTA-TAA-A-G--A-CCTTT-TGAA--CTTA-A---TTTGGT-CCG----TC----AGATGAATAAGGCAGGCGTCAATGGAGC-AGTTACATCTAAAACC--ACTTTGTAGTTCAT-ATAAAAGACCT----TGTTT---AACT---AA---GAATGA---TTCT--AGTTGGCTGTGACACAGCTCTTTCT-AAAAGAC-TTGAATCAT-AC--ATAAA--ATGCTAACAGGTCTATAGTTTGAT--ACATC----AG----ATTTGCCATTTTTCTTAAATAATGGTTTGATTTTAACACTTTTAAGTTCA-CATGGCACAATG
gi|141977                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--TCATCAGCACACAT-GT--------TCA-TTT-T-CGA-ATACTGAGT-------GC-A----TAAG-----------GGCATA-A-CATTGA-T-AAAGATAATA-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAACCTTTC---T----G--T-GAAT--A--T----TCA-CATCAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TTttacaggtgataga
gi|141978                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TCGTCTGCA------AA--------CAG-TCT-GTC-A-GT--GGAG--GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCGAGGAC---AGTAC---CTTGGGGTACACC-AGAAGTAAC---T--GGT-GC-TT--ACG---ATGA
gi|141979                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GA--T-AC-ACAAGTAGGC--ATGTCATTGATGT--A-C----ACT-AA-------G-AACAATAA---CG---GTCCCAGGAC---AGTAC---CCTGGGGTACGCC-AGAAGTAAC---GTG
gi|141980                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-GC-AT--AAGGGC--CTATCATTGGTA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGAGGTACACC-ACATGTTAC---T--GATTTACTT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ATCAGATATTGAAA------C---TTTTTG--T-GAGC--T--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAA-----------T-TT
gi|141981                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-GC-AT--AAGGGC--ATATCATTGATA-A-A-G----A-T-AAT------A-AATAGAAG---TG---GGCCTAAAAC---AGATC---CTTGGGGTACACC-ACATGTTAC----TGATTTAC-TT--TC-----TGAAA----G--TGT-------ACCAGATATT--GAAATTTTT---T----G--T-GAAT--G--T----TCA-CATAAATAGGATTTAAAC----CAAATTTGTACATCT-TTA--------TGGAAAT---GGTATACAT---T-T---------AGTTT-T----TC----AAAC-------AG--TA-AACT--ATGATCAACCAGATCAAATGCTTTAGAT--AGGTCAAGAAATATGGT---TCCAG-A-TA
gi|141982                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --ATATCATTAATATA-A-A----C-T-AA-------G-AAAAGAAG---AG---GGCCTAATAT---AGATC---CCTGTGGCACACC-t
gi|141983                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCATTGATGTA-G-C----A-G-AG-------A-AATGAAAG---CG---GGCCGAGCAT---CGTTC---CCTGTGGCACACC-GGAGCTAAC---
gi|141984                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---AGTTT-A----CC----ACAT-------CA--AATATG---ATAATCAACTGAATCAAAAGCTTTCTGT--TAATCTAACATAACCAT---GCCAGTA-TAT-A-G--T-CCTTT-GGTACTATTGCT---TCTAACATGA----TTCATTAAGTAGACAAGGCAAGTATCAGAACAAT-ATGAATTCCTAAAACCTGAC--TGCAATTCAT-ACAATA---AA----TTGTT---ATC