lowQualScore : 1 33333 22222 11111 1 2 111 1111 111111 11111 333333333333333333333333 11111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111
lowQualScore : 1 0 77 5 4 3 6 2 66666 77777 77777 99 7 8 0 5 1 0 6 4 111 4 888 5 66 5 0000 2 5 1 5 0 0 000000 88888 6 3 22222 999999 000000000000000000000000 666 0 22 8 7777777 1 11111111111 0 555 333333333333333333333333333333333333333333333333333 555 88 5555 222 222 1 333333333333333333 44444 5 1 1 22 22 1 1 88 1 66 55 2
lowQualScore : . . .. . . . . . ..... ..... ..... .. . . . . . . . . ... . ... . .. . .... . . . . . . ...... ..... . . ..... ...... ........................ ... . .. . ....... . ........... . ... ................................................... ... .. .... ... ... . .................. ..... . . . .. .. . . .. . .. .. .
lowQualScore : 4 7 99 9 7 0 6 0 66666 77777 55555 22 0 3 0 0 4 4 6 0 777 3 888 0 99 0 6666 4 0 4 0 2 4 777777 33333 7 3 88888 666666 777777777777777777777777 999 7 88 0 8888888 9 00000000000 1 888 777777777777777777777777777777777777777777777777777 888 55 8888 999 999 7 222222222222222222 88888 0 7 7 55 55 8 8 11 8 44 66 4
consensus : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAATTCTAGATTTGCCGATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGATTTAATANTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTNTTGA---AATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CTN-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
Reference ( gi|7880 ) : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAATTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGA---AATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CTT-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7879 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAATTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGA---AATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CTT-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7881 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAATTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATACAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATAATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGA---AATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CTT-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7882 : TTAAAAGATGAGAAA-GTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TCTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAATTCTAGATTTGCCAATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTATTTAT-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTTATA-TCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATAAAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTACTGA---AATGTTTAAACCTGAAATTATCTAACACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTGTA-T----TCACTTGAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTGGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T---TG-T-----------GTCGC---TC-----------T-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TTGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CTT-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7883 : TTAAAAGATAA-AAAAGTATTGTCAGTATTGTTATATATC--TTTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAATTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTGTTAATTTATTAAGTGTT-AATATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTTGATTTATATAAAGCTTCATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ACGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTATCGA---AATGCTTAAACCTTAAACTATTTAACACAAATTTA---AT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTATCAGCTTGTA-T----TCACTTTGA-----TA-TGCA-CATT---CTGTG------ATACT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AC---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------C-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAG-TT-TG
gi|7884 : TTAAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCAAGATATC--TTTTTAATGCTTTTACACGAAGAAGAGAAATTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAAGAAGAGTAAACTACCTCATGTATTACCAATTTATAAAGTAT--TT-ATATTGTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGACATGATTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAAACTTGGTTTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATTTCTTCAAACATA-ATGTTATATCTGTTACTTTAGTAAACTATTGA---AATGCTTAAACCTGAAAATATCTAATACAAATGTT---GT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTGTTAGCTTGTA-T----TCACTTTAA-----TA-TGCG-GATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGT
gi|7885 : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTATCAGTATTACTGTATATC--GTTTTAATGCTTTTAAAAGAGGAACTT---TTCTAAATTTGTCGATTTAAAGAACTATTAACAAGAGTAAACTAC--------------------------T--AA-ATA--GTTCCACTTAATTTTTAATGTCATTATTCATGATGT
gi|7886 : TTAAAATATGAAACAAGTATAGTCAGTATTGCTATAAATTCATTTTATGTTTTTTTTCAAGAAGAAGAGAATTCCTAGATATACCTATTC-AAGAAAT----ACAAGAGTAAGCAAC----CTTAT
gi|7887 : AAACTTATGGTATGATGCTTTAAACTGGAATTGTTCAATGCAGATGTT---AT-TG--TTT-T-----GGAC-------------------AACTT----------TACTTAAA-----TA-TGAG-GATT---CCGTA------ACCTT--G--TCATGCA-----------GTAATGTAT-A-----T--A-CT---T---T--T-----------GTCAT---TC-----------T-----A----T---T---------T-G------------T---T--G----T---A---T-T---T-----G-CA-----T-G---TT-GTAT-TA-TGGGCCGGGG
gi|7888 : TAAAATGAAATAATAGAAATATTGAAATGTAGCTTTAT----TATATTTATTAT---ATG-TAATAACCTTAAAATGAAATCA-TATAAATGATTA-TATG-AA---------A------ATATTTAA--ACT-GTAGAAGAAATAACTAACTGTAT-AATCTTTGTA-AT---TGTATAAT-----------GTCAC---TC-----------T-----G----T---A---------G-A------------A---T--G----T---G---TGT---T-----AACA-----TTG---AT-GTGT-TT-TCGGTCGGAGACT--T--TTA-TTA-CTT-AATAAA-TTA--TGTCTA--T-GTCCA
gi|7889 : T---AT-TA--CTT-TACAATGAAATCAT-ATAAAATGATTATATG--TAAA-T----TAAACTAAA-----TA-TGT--AATTAACCTGAAGAAGAAATA-------ACT----------------AAATGTAT-TAT-TTT--A-AT---T---TG-TAATTGTATAATGTCAC---TC-----------T-----G----T---G---------A-G------------A---T--GAA--T---G---T-T---A-----A-TA-----TTG---CT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTA-TCC-CTG-AATCAA-CTA--TGTATA--T-GTCT
gi|7890 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACC----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A---TT-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---T-TGTTT-----G-CA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CCA-AATAAA-ATA--T
gi|7891 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACT----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A---TT-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----TTGTA---------T-A------------A---TT-G----T---A---T-TGTTT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGGGGCC--T--ATA-TTA-CCA-AAAAAA-ATA--T
gi|7892 : AA-----TA-TGTGTAATG---C----------ATATT------------------------AAATGTAT-AATATGA--A-AT--------G-T-----------ACCAC---AT-----------C-----A--------A---------T-G------------A---TCAA----C---A---A-T---T-----A--A-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCTGGAGACCCTT--AT--TTA-CTC-AATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCTA
gi|7893 : -----TA-T-TG-AAAT----TATA------ATGTT--------CGTA-----------T-----TATGAATGTTT--A--T---T---TG-T-----------TAGAT---TC-----------C-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----T------T-GTAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--GCA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTCTAT-T-GTCTA
gi|7894 : TTTTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AT---T---TG-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CTT-AATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7895 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT---TG-T-----------AACACAACTT-----------T-----G----T---AAAACATCAAT-G------------A---TCAA----T---A---A-T---T-----A-C------T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTATTTA-CTC-AATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCT
gi|7896 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT---TG-T-----------AACACAACTT-----------TGAAAAA----C---A---------TCG------------A---T--G--------A---T-C---A-----A-CAATTAGT-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--TTCAT--TTA-CTC-AATAAA-ACA--T
gi|7897 : TAC-AACATGT--ATAT---T---TG-T-------------CAC---TC-----------T-----A--------A---------T-GTCA---------A---TTAA----T---ACTTT-T---T-----G-TA-----T-T---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTACCTT-AATAAA-A
gi|7898 : TATGAATGTTT--A--T---T---TG-T-----------TAGAT---TC-----------C-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----A-A---T--ATAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--ACA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTTTATTT-GTCTA
gi|7899 : AT-ACTATTT--G-AT---T------------------GTAAC---TCCAGTGTTTGTTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCTAGTGACC--T--ATA-TTA-CTG-AATAAA-CTA--TGTCTA--CAGTCT
gi|7900 : TATTT--GTAT---A---TT-T-----------GTCAC---TC-----------T-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---C-TGTCT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--CTA-TTA-CCA-AATAAA-ATA--
gi|7901 : TCT--A-CT---T---TG-TT----------GTCGC---TC-----------C-----A--------A---------T-GTTTGTTTACAAAA---T--G----T---A---T-TA--T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGTGGCC--T--ATA-TTA-CTG-AATAAA-CTA--AGTCTA--T-GT
gi|7902 : TT--A-TT---T---TG-T-----------A-CAT---TT-----------T-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----TCGCA---T-T---TGTTGAA-CA-----T-T---CT-GTAT-TA-TGTACCGGAGGCC--T--AAA-TTG-CTT-AATAAAGAAA--TGTTTT--T-
gi|7903 : G-T-----------TTCAC---TA-----------G-----A----T---A---------T-G------------A---T--A----T---A---------------A--A-----T-GGAATT-ATATATTATGGGCCAGAGGCC--T--AGA-TTG-CTT-AATAAA-ACATTTGTCAT--T-GTC
gi|7904 : ---TT-----------T-----A----C---A---------T-A------------A---T--GAAAAT---A---T-T---T-----A--------------TT-GTAT-TT-TGGGCCAGGGGAC--T--ATA-TTA-CTG-AATAAA-CTA--TGTCAA--T-GTCT
gi|7905 : ---TT-----------T-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGTCAGTGACC--T--A-A-TTA-CTG-AATAAA-CTA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7906 : ---TT-----------T-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGTAGCC--T--ATA-CTA-CTG-AATAAA-CTA--TGTCTA--C-GTGTA
Alignments
lowQualScore : 2222 11111 11 1 11111 22222222222222222222222 111111111 11111111111 222222222222222222222222222222222 111111111111111111
lowQualScore : 66 1 22 888 4 9 5555 77777 33 5 77 0 2 7 2 5 4 1 6 777 4 66 4 9999 1 4 0 4 888888 77777 6 3 00000 888888 22222222222222222222222 555 0 22 7 111111111 333 1 00000000000 555 44444 000000000000000000000000000000000 555 88 5555 222 222 1 111111111111111111 44444 4 1 1 22 22 1 1 44 1 66 55 2
lowQualScore : .. . .. ... . . .... ..... .. . .. . . . . . . . . ... . .. . .... . . . . ...... ..... . . ..... ...... ....................... ... . .. . ......... ... . ........... ... ..... ................................. ... .. .... ... ... . .................. ..... . . . .. .. . . .. . .. .. .
lowQualScore : 99 0 99 888 5 4 5555 44444 66 7 99 7 1 5 5 5 0 0 1 888 4 11 4 4444 1 4 1 4 999999 77777 2 1 33333 888888 77777777777777777777777 555 2 66 6 888888888 222 8 55555555555 666 00000 666666666666666666666666666666666 666 22 6666 888 888 6 222222222222222222 22222 8 6 6 44 44 7 7 55 7 11 33 2
consensus : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
Reference ( family-674 ) : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGATTTAATANTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7879 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7880 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7881 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATACAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATAATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7882 : TTAAAAGATGAGAAA-GTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TCTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCAATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTATTTAT-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTTATA-TCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATAAAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTACTGAAATGTTTAAACCTGAAATTATCTAACACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTGTA-T----TCACTTGAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTGGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCGC---TCT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TTGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7883 : TTAAAAGATAA-AAAAGTATTGTCAGTATTGTTATATATC--TTTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTGTTAATTTATTAAGTGTT-AATATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTTGATTTATATAAAGCTTCATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ACGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTATCGAAATGCTTAAACCTTAAACTATTTAACACAAATTTA---AT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTATCAGCTTGTA-T----TCACTTTGA-----TA-TGCA-CATT---CTGTG------ATACT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AC---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------C-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAG-TT-TG
gi|7884 : TTAAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCAAGATATC--TTTTTAATGCTTTTACACGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAAGAAGAGTAAACTACCTCATGTATTACCAATTTATAAAGTAT--TT-ATATTGTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGACATGATTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAAACTTGGTTTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATTTCTTCAAACATA-ATGTTATATCTGTTACTTTAGTAAACTATTGAAATGCTTAAACCTGAAAATATCTAATACAAATGTT---GT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTGTTAGCTTGTA-T----TCACTTTAA-----TA-TGCG-GATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGT
gi|7885 : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTATCAGTATTACTGTATATC--GTTTTAATGCTTTT------AAAAGAGGAACTTTTCTAAATTTGTCGATTTAAAGAACTATTAACAAGAGTAAACTAC--------------------------T--AA-ATA--GTTCCACTTAATTTTTAATGTCATTATTCATGATGT
gi|7886 : TTAAAATATGAAACAAGTATAGTCAGTATTGCTATAAATTCATTTTATGTTTTTTTTCAAGAAGAAGAGAAT---TCCTAGATATACCTATTC-AAGAAAT----ACAAGAGTAAGCAACCTTAT
gi|7887 : ATGCTTTAAACTGGAATTGTTCAATGCAGATGTT---AT-TG--TTT-T-----GGAC-------------------AACTT----------TACTTAAA-----TA-TGAG-GATT---CCGTA------ACCTT--G--TCATGCA-----------GTAATGTAT-A-----T--A-CT---T-----T-----T-----------GTCAT---TCT-----A----T---T---------T-G------------T---T--G----T---A---T-T---T-----G-CA-----T-G---TT-GTAT-TA-TGGGCCGGGG
gi|7888 : aaacttatggtatgTGAAAT-----AATAGAAATATTGAAATGTAGCTTTAT----TATATTTATTAT---ATG-TAATAACCTTAAAATGAAATCA-TATAAATGATTA-TATG-AA---------A------ATATTTAA--ACT-GTAGAAGAAATAACTAACTGTAT-AATCTTTGTA-AT---TGTA--T---AAT-----------GTCAC---TCT-----G----T---A---------G-A------------A---T--G----T---G---TGT---T-----AACA-----TTG---AT-GTGT-TT-TCGGTCGGAGACT--T--TTA-TTA-CT-TAATAAA-TTA--TGTCTA--T-GTCCA
gi|7889 : taaaaT---AT-TA--CTT-TACAATGAAATCAT-ATAAAATGATTATATG--TAAA-T----TAAACTAAA-----TA-TGT--AATTAACCTGAAGAAGAAATA-------ACT----------------AAATGTAT-TAT-TTT--A-AT---T-----T---G-TAATTGTATAATGTCAC---TCT-----G----T---G---------A-G------------A---T--GAA--T---G---T-T---A-----A-TA-----TTG---CT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTA-TCC-CT-GAATCAA-CTA--TGTATA--T-GTCT
gi|7890 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACC----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---T-TGTTT-----G-CA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--T
gi|7891 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACT----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TTGTA---------T-A------------A---TT-G----T---A---T-TGTTT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGGGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAAAAAA-ATA--T
gi|7892 : AA-----TA-TGTGTAATG---C----------ATATT------------------------AAATGTAT-AATATGA--A-AT-------------G-T-----------ACCAC---ATC-----A--------A---------T-G------------A---TCAA----C---A---A-T---T-----A--A-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCTGGAGACCCTT--AT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCTA
gi|7893 : -----TA-T-TG-AAAT----TATA------ATGTT--------CGTA-----------T-----TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----T------T-GTAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--GCA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTCTAT-T-GTCTA
gi|7894 : TTTTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7895 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTT-----G----T---AAAACATCAAT-G------------A---TCAA----T---A---A-T---T-----A-C------T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTATTTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCT
gi|7896 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTTGAAAAA----C---A---------TCG------------A---T--G--------A---T-C---A-----A-CAATTAGT-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--TTCAT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--T
gi|7897 : TAC-AACATGT--ATAT---T-----T---G-T-------------CAC---TCT-----A--------A---------T-GTCA---------A---TTAA----T---ACTTT-T---T-----G-TA-----T-T---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTACCT-TAATAAA-A
gi|7898 : TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----A-A---T--ATAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--ACA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTTTATTT-GTCTA
gi|7899 : AT-ACTATTT--G-AT---TGTAACTCCAG-T-----------GTTTG---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCTAGTGACC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--CAGTCT
gi|7900 : TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---C-TGTCT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--CTA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--
gi|7901 : TCT--A-CT---T-----T---G-TT----------GTCGC---TCC-----A--------A---------T-GTTTGTTTACAAAA---T--G----T---A---T-TA--T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGTGGCC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--AGTCTA--T-GT
gi|7902 : TT--A-TT---T-----T---G-T-----------A-CAT---TTT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----TCGCA---T-T---TGTTGAA-CA-----T-T---CT-GTAT-TA-TGTACCGGAGGCC--T--AAA-TTG-CT-TAATAAAGAAA--TGTTTT--T-
gi|7903 : ---G-T-----------TTCAC---TAG-----A----T---A---------T-G------------A---T--A----T---A---------------A--A-----T-GGAATT-ATATATTATGGGCCAGAGGCC--T--AGA-TTG-CT-TAATAAA-ACATTTGTCAT--T-GTC
gi|7904 : ---TTT-----A----C---A---------T-A------------A---T--GAAAAT---A---T-T---T-----A--------------TT-GTAT-TT-TGGGCCAGGGGAC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCAA--T-GTCT
gi|7905 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGTCAGTGACC--T--A-A-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7906 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGTAGCC--T--ATA-CTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--C-GTGTA
Alignments
lowQualScore : 2222 1 11 1 11111 22222222222222222222222 111111111 11111111111 222222222222222222222222222222222 111111111111111111
lowQualScore : 66 1 22 888 1 9 5555 5 444 33 5 77 0 1 6 1 5 1 1 6 777 4 66 4 9999 1 4 0 4 888888 77777 6 3 00000 888888 22222222222222222222222 555 0 22 7 111111111 333 1 00000000000 555 44444 000000000000000000000000000000000 555 88 5555 222 222 1 111111111111111111 44444 4 1 1 22 22 1 1 44 1 66 55 2
lowQualScore : .. . .. ... . . .... . ... .. . .. . . . . . . . . ... . .. . .... . . . . ...... ..... . . ..... ...... ....................... ... . .. . ......... ... . ........... ... ..... ................................. ... .. .... ... ... . .................. ..... . . . .. .. . . .. . .. .. .
lowQualScore : 99 0 99 888 0 4 5555 4 111 66 7 99 7 0 7 0 5 0 0 1 888 4 11 4 4444 1 4 1 4 999999 77777 2 1 33333 888888 77777777777777777777777 555 2 66 6 888888888 222 8 55555555555 666 00000 666666666666666666666666666666666 666 22 6666 888 888 6 222222222222222222 22222 8 6 6 44 44 7 7 55 7 11 33 2
consensus : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
Reference ( family-674 ) : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7879 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7880 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7881 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATACAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATAATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7882 : TTAAAAGATGAGAAA-GTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TCTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCAATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTATTTAT-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTTATA-TCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATAAAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTACTGAAATGTTTAAACCTGAAATTATCTAACACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTGTA-T----TCACTTGAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTGGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCGC---TCT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TTGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7883 : TTAAAAGATAA-AAAAGTATTGTCAGTATTGTTATATATC--TTTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTGTTAATTTATTAAGTGTT-AATATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTTGATTTATATAAAGCTTCATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ACGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTATCGAAATGCTTAAACCTTAAACTATTTAACACAAATTTA---AT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTATCAGCTTGTA-T----TCACTTTGA-----TA-TGCA-CATT---CTGTG------ATACT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AC---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------C-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAG-TT-TG
gi|7884 : TTAAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCAAGATATC--TTTTTAATGCTTTTACACGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAAGAAGAGTAAACTACCTCATGTATTACCAATTTATAAAGTAT--TT-ATATTGTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGACATGATTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAAACTTGGTTTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATTTCTTCAAACATA-ATGTTATATCTGTTACTTTAGTAAACTATTGAAATGCTTAAACCTGAAAATATCTAATACAAATGTT---GT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTGTTAGCTTGTA-T----TCACTTTAA-----TA-TGCG-GATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGT
gi|7885 : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTATCAGTATTACTGTATATC--GTTTTAATGCTTTT------AAAAGAGGAACTTTTCTAAATTTGTCGATTTAAAGAACTATTAACAAGAGTAAACTAC--------------------------T--AA-ATA--GTTCCACTTAATTTTTAATGTCATTATTCATGATGT
gi|7886 : TTAAAATATGAAACAAGTATAGTCAGTATTGCTATAAATTCATTTTATGTTTTTTTTCAAGAAGAAGAGAAT---TCCTAGATATACCTATTC-AAGAAAT----ACAAGAGTAAGCAACCTTAT
gi|7887 : ATGCTTTAAACTGGAATTGTTCAATGCAGATGTT---AT-TG--TTT-T-----GGAC-------------------AACTT----------TACTTAAA-----TA-TGAG-GATT---CCGTA------ACCTT--G--TCATGCA-----------GTAATGTAT-A-----T--A-CT---T-----T-----T-----------GTCAT---TCT-----A----T---T---------T-G------------T---T--G----T---A---T-T---T-----G-CA-----T-G---TT-GTAT-TA-TGGGCCGGGG
gi|7888 : aaacttatggtatgTGAAAT-----AATAGAAATATTGAAATGTAGCTTTAT----TATATTTATTAT---ATG-TAATAACCTTAAAATGAAATCA-TATAAATGATTA-TATG-AA---------A------ATATTTAA--ACT-GTAGAAGAAATAACTAACTGTAT-AATCTTTGTA-AT---TGTA--T---AAT-----------GTCAC---TCT-----G----T---A---------G-A------------A---T--G----T---G---TGT---T-----AACA-----TTG---AT-GTGT-TT-TCGGTCGGAGACT--T--TTA-TTA-CT-TAATAAA-TTA--TGTCTA--T-GTCCA
gi|7889 : taaaaT---AT-TA--CTT-TACAATGAAATCAT-ATAAAATGATTATATG--TAAA-T----TAAACTAAA-----TA-TGT--AATTAACCTGAAGAAGAAATA-------ACT----------------AAATGTAT-TAT-TTT--A-AT---T-----T---G-TAATTGTATAATGTCAC---TCT-----G----T---G---------A-G------------A---T--GAA--T---G---T-T---A-----A-TA-----TTG---CT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTA-TCC-CT-GAATCAA-CTA--TGTATA--T-GTCT
gi|7890 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACC----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---T-TGTTT-----G-CA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--T
gi|7891 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACT----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TTGTA---------T-A------------A---TT-G----T---A---T-TGTTT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGGGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAAAAAA-ATA--T
gi|7892 : AA-----TA-TGTGTAATG---C----------ATATT------------------------AAATGTAT-AATATGA--A-AT-------------G-T-----------ACCAC---ATC-----A--------A---------T-G------------A---TCAA----C---A---A-T---T-----A--A-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCTGGAGACCCTT--AT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCTA
gi|7893 : -----TA-T-TG-AAAT----TATA------ATGTT--------CGTA-----------T-----TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----T------T-GTAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--GCA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTCTAT-T-GTCTA
gi|7894 : TTTTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7895 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTT-----G----T---AAAACATCAAT-G------------A---TCAA----T---A---A-T---T-----A-C------T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTATTTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCT
gi|7896 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTTGAAAAA----C---A---------TCG------------A---T--G--------A---T-C---A-----A-CAATTAGT-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--TTCAT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--T
gi|7897 : TAC-AACATGT--ATAT---T-----T---G-T-------------CAC---TCT-----A--------A---------T-GTCA---------A---TTAA----T---ACTTT-T---T-----G-TA-----T-T---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTACCT-TAATAAA-A
gi|7898 : TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----A-A---T--ATAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--ACA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTTTATTT-GTCTA
gi|7899 : AT-ACTATTT--G-AT---TGTAACTCCAG-T-----------GTTTG---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCTAGTGACC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--CAGTCT
gi|7900 : TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---C-TGTCT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--CTA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--
gi|7901 : TCT--A-CT---T-----T---G-TT----------GTCGC---TCC-----A--------A---------T-GTTTGTTTACAAAA---T--G----T---A---T-TA--T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGTGGCC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--AGTCTA--T-GT
gi|7902 : TT--A-TT---T-----T---G-T-----------A-CAT---TTT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----TCGCA---T-T---TGTTGAA-CA-----T-T---CT-GTAT-TA-TGTACCGGAGGCC--T--AAA-TTG-CT-TAATAAAGAAA--TGTTTT--T-
gi|7903 : ---G-T-----------TTCAC---TAG-----A----T---A---------T-G------------A---T--A----T---A---------------A--A-----T-GGAATT-ATATATTATGGGCCAGAGGCC--T--AGA-TTG-CT-TAATAAA-ACATTTGTCAT--T-GTC
gi|7904 : ---TTT-----A----C---A---------T-A------------A---T--GAAAAT---A---T-T---T-----A--------------TT-GTAT-TT-TGGGCCAGGGGAC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCAA--T-GTCT
gi|7905 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGTCAGTGACC--T--A-A-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7906 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGTAGCC--T--ATA-CTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--C-GTGTA
blockSeqs : CA A AA CTT C A CTCA T GAC TT T TT A G G T A T G GAA G GC A ACAA T T A ATGAAA ATGAT A T AACCT GAAGAA TAAACTGTAGAAGAAATAAC GAA GT T TGTAAC CCA A AATTGTATAAT AAC GAAAA ATGTTTGTTTACAAA AAT CA AAAA CGC CTT G AACAATTAG GGAA T A A CT TC T C CA G TT TT A
blockSeqs : . A AA . C A CTCA T GAC T . . A G G T A T G . . . . . T . . T . A . CT . GACTTGTA GAA . T TGTA . . T AAC . TAAAACATCAATG AAT CA AA . . . TGTTGAACA TG T . . . . . . CA . T T .
blockSeqs : . T AC . A A CTCA T TAA . . . T T C . T A T . . . . . T . . T . . . CT . GACTTGTA AA . T ATAT . . . . . CGTTTACC . TA . . . . GTTTGCA TG T . . . . . . T . T . .
blockSeqs : . T AC . G A CTTA . TTA . . . T T C . T A T . . . . . A . . T . . . CT . GACTGGTA AA . T ATAT . . . . . CGTTTACC . T . . . . GTTTGTA G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . T AC . G . . . TAA . . . T . C . T A T . . . . . A . . T . . . CT . GACTTGTA AA . . T . . . . . TTGTATA . . . . . . GTCTGTA G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . T TC . G . . . . . . . T T . . . . . T . . T . . . CT . GACTTGTA AA . . T . . . . . ATGTCA . . . . . . TAACA G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . A . . T . . . . . . . . C . . T . . . CC . GTCATGCA AA . . T . . . . . TTGTA . . . . . . ATGTT G . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . C . ACAACC TA . . T . . . . . CATCG . . . . . . TACA G . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : G . . . T . ACAACT AA . . T . . . . . TTGTA . . . . . . TACA G . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . CGTA AA . . T . . . . . TATG . . . . . . TACA G . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . ACT AA . . A . . . . . TATG . . . . . . TACA G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . AC . . A . . . . . TATG . . . . . . TGCA G . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : A . . T . . . . . TACG . . . . . . AATA G . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : A . . T . . . . . TTTG . . . . . . TAAA G . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : A . . T . . . . . TAGA . . . . . . TACA T . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . TGAG . . . . . . TGTA A . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . TATG . . . . . . TAAA A . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . CAAA . . . . . . TGTT G . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . . . . . TATG . . . . . . TGTT A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . TATG . . . . . . TGTT T . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . CATA . . . . . . TAA A . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . CAAA . . . . . . TAC A . . . . . . . G .
blockSeqs : . . CAAA . . . . . . AA . . . .
blockSeqs : . . ATG . . . . . . TA . . . .
blockSeqCons : CTCA
originalCons : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
finalCons : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
Alignments
lowQualScore : 2222 1 11 1 11111 22222222222222222222222 111111111 11111111111 222222222222222222222222222222222 111111111111111111
lowQualScore : 66 1 22 888 1 9 5555 5 444 33 5 77 0 1 6 1 5 1 1 6 777 4 66 4 9999 1 4 0 4 888888 77777 6 3 00000 888888 22222222222222222222222 555 0 22 7 111111111 333 1 00000000000 555 44444 000000000000000000000000000000000 555 88 5555 222 222 1 111111111111111111 44444 4 1 1 22 22 1 1 44 1 66 55 2
lowQualScore : .. . .. ... . . .... . ... .. . .. . . . . . . . . ... . .. . .... . . . . ...... ..... . . ..... ...... ....................... ... . .. . ......... ... . ........... ... ..... ................................. ... .. .... ... ... . .................. ..... . . . .. .. . . .. . .. .. .
lowQualScore : 99 0 99 888 0 4 5555 4 111 66 7 99 7 0 7 0 5 0 0 1 888 4 11 4 4444 1 4 1 4 999999 77777 2 1 33333 888888 77777777777777777777777 555 2 66 6 888888888 222 8 55555555555 666 00000 666666666666666666666666666666666 666 22 6666 888 888 6 222222222222222222 22222 8 6 6 44 44 7 7 55 7 11 33 2
consensus : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
Reference ( family-674 ) : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTNAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCNATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTANANAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCANTATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTGTAGTNTTAATCTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATNAAACTNTTGAAATGCTTAAACCTGAAATTATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-NAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7879 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7880 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATATAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATTATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7881 : TTGAAAGATGAGAAAAGCATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TTTTAAATGCTTTTAAAAGAAGAAAAGAAA---TTCTAGATTTGCCCATTTAAAGAAATATTAACAAGAGTAAACTAC----TGTATTATTAATT-AGACAGTAT--AA-ATA--GTTTCACTTTATTTTGAATACAAATATTCATGATATGATTTAATAGTCTTGTTCATAATAGTGTTAATTTTGGATTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATATATGTCACATCTGTTACTTTATAAAACTTTTGAAATGCTTAAACCTGAAATGATCTAATACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTATA-T----TCACTTTAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7882 : TTAAAAGATGAGAAA-GTATTGTCAGTATTGCTAGATATC--TCTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCAATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTATTAATTTATAAAGTATTTAT-ATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTTATA-TCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTGGATTTATATAAAGCTACATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ATGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTACTGAAATGTTTAAACCTGAAATTATCTAACACAAATGTT---AT-TA--TTT-T----TGGATTTAT-ATGGCATG-TTATAAGCTTGTA-T----TCACTTGAA-----TA-TGTG-AATT---CTGTA------ATATT--G--ACTGGTA-----------TAAATGTAT-AATATTT--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCGC---TCT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-TT-TTGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7883 : TTAAAAGATAA-AAAAGTATTGTCAGTATTGTTATATATC--TTTTTAATGCTTTTACAAGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAACAAGAGTAAACTACCTCATGTATTGTTAATTTATTAAGTGTT-AATATA--GTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGATATGGTTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAATCTTTGATTTATATAAAGCTTCATTTATTTCAAATCATATATCTTCAAAAATA-ACGTTATATCTGTTACTTTATTAAACTATCGAAATGCTTAAACCTTAAACTATTTAACACAAATTTA---AT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTATCAGCTTGTA-T----TCACTTTGA-----TA-TGCA-CATT---CTGTG------ATACT--G--ACTTGTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AC---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------C-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAG-TT-TG
gi|7884 : TTAAAAGATGAGAAAAGTATTGTCAGTATTGCAAGATATC--TTTTTAATGCTTTTACACGAAGAAGAGAAA---TTCTAGATTTGCCGATTTAA-GAAATATTAAGAAGAGTAAACTACCTCATGTATTACCAATTTATAAAGTAT--TT-ATATTGTTTCACTTTGTTTTGAATATCATTATTCATGACATGATTTAATATTCTTGTTCATTGTAGTCTTAAACTTGGTTTTATATATAGCTACATTTATTTCAAATCATATTTCTTCAAACATA-ATGTTATATCTGTTACTTTAGTAAACTATTGAAATGCTTAAACCTGAAAATATCTAATACAAATGTT---GT-TA--TTT-T----TGGATTAAT-GTGGCATG-TTGTTAGCTTGTA-T----TCACTTTAA-----TA-TGCG-GATT---CTGTA------ATATT--G--ACTTGTA-----------TAAATGT
gi|7885 : TTGAAAGATGAGAAAAGTATTATCAGTATTACTGTATATC--GTTTTAATGCTTTT------AAAAGAGGAACTTTTCTAAATTTGTCGATTTAAAGAACTATTAACAAGAGTAAACTAC--------------------------T--AA-ATA--GTTCCACTTAATTTTTAATGTCATTATTCATGATGT
gi|7886 : TTAAAATATGAAACAAGTATAGTCAGTATTGCTATAAATTCATTTTATGTTTTTTTTCAAGAAGAAGAGAAT---TCCTAGATATACCTATTC-AAGAAAT----ACAAGAGTAAGCAACCTTAT
gi|7887 : ATGCTTTAAACTGGAATTGTTCAATGCAGATGTT---AT-TG--TTT-T-----GGAC-------------------AACTT----------TACTTAAA-----TA-TGAG-GATT---CCGTA------ACCTT--G--TCATGCA-----------GTAATGTAT-A-----T--A-CT---T-----T-----T-----------GTCAT---TCT-----A----T---T---------T-G------------T---T--G----T---A---T-T---T-----G-CA-----T-G---TT-GTAT-TA-TGGGCCGGGG
gi|7888 : aaacttatggtatgTGAAAT-----AATAGAAATATTGAAATGTAGCTTTAT----TATATTTATTAT---ATG-TAATAACCTTAAAATGAAATCA-TATAAATGATTA-TATG-AA---------A------ATATTTAA--ACT-GTAGAAGAAATAACTAACTGTAT-AATCTTTGTA-AT---TGTA--T---AAT-----------GTCAC---TCT-----G----T---A---------G-A------------A---T--G----T---G---TGT---T-----AACA-----TTG---AT-GTGT-TT-TCGGTCGGAGACT--T--TTA-TTA-CT-TAATAAA-TTA--TGTCTA--T-GTCCA
gi|7889 : taaaaT---AT-TA--CTT-TACAATGAAATCAT-ATAAAATGATTATATG--TAAA-T----TAAACTAAA-----TA-TGT--AATTAACCTGAAGAAGAAATA-------ACT----------------AAATGTAT-TAT-TTT--A-AT---T-----T---G-TAATTGTATAATGTCAC---TCT-----G----T---G---------A-G------------A---T--GAA--T---G---T-T---A-----A-TA-----TTG---CT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTA-TCC-CT-GAATCAA-CTA--TGTATA--T-GTCT
gi|7890 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACC----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---T-TGTTT-----G-CA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--T
gi|7891 : TATA-G----TTACTTTAA-----TAATATC-CATT-----GTA------ATGCT--ACAACT----------------ACATTTAT---TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TTGTA---------T-A------------A---TT-G----T---A---T-TGTTT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGGGGCC--T--ATA-TTA-CC-AAAAAAA-ATA--T
gi|7892 : AA-----TA-TGTGTAATG---C----------ATATT------------------------AAATGTAT-AATATGA--A-AT-------------G-T-----------ACCAC---ATC-----A--------A---------T-G------------A---TCAA----C---A---A-T---T-----A--A-----T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCTGGAGACCCTT--AT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCTA
gi|7893 : -----TA-T-TG-AAAT----TATA------ATGTT--------CGTA-----------T-----TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----T------T-GTAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--GCA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTCTAT-T-GTCTA
gi|7894 : TTTTA-----------TAAATGTAT-AATATTC--A-AT---T-----T---G-T-----------GTCAC---TCT-----A----T---A---------T-G------------A---T--G----T---A---T-T---T-----A-CA-----T-G---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTA-CT-TAATAAA-ATA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7895 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTT-----G----T---AAAACATCAAT-G------------A---TCAA----T---A---A-T---T-----A-C------T-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--T--TTATTTA-CT-CAATAAA-ACA--TCT-TG--T-ATCT
gi|7896 : AAATGTAT-A---TTT--A-ATATAT-----T---G-T-----------AACACAACTTTGAAAAA----C---A---------TCG------------A---T--G--------A---T-C---A-----A-CAATTAGT-G---TT-GTAT-TT-TGGGCCGGAGGCC--TTCAT--TTA-CT-CAATAAA-ACA--T
gi|7897 : TAC-AACATGT--ATAT---T-----T---G-T-------------CAC---TCT-----A--------A---------T-GTCA---------A---TTAA----T---ACTTT-T---T-----G-TA-----T-T---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--ATA-TTACCT-TAATAAA-A
gi|7898 : TATGAATGTTT--A--T---T-----T---G-T-----------TAGAT---TCC-----ACGTTT---A---------C-C------------A---T--G----T---G---T-T---T-----A-AA-----A-A---T--ATAT-TA-TGGGCCGGAGGCC--T--ACA-TTA-CTCAAATAAA-ATAT-TGTTTATTT-GTCTA
gi|7899 : AT-ACTATTT--G-AT---TGTAACTCCAG-T-----------GTTTG---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCTAGTGACC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--CAGTCT
gi|7900 : TATTT--GTAT---A-----T---T-T-----------GTCAC---TCT-----A----TT--G---------T-A------------AAATT--G----T---A---C-TGTCT-----G-TA-----T-G---TTTGTAT-TT-TGGGCCAGAGGCC--T--CTA-TTA-CC-AAATAAA-ATA--
gi|7901 : TCT--A-CT---T-----T---G-TT----------GTCGC---TCC-----A--------A---------T-GTTTGTTTACAAAA---T--G----T---A---T-TA--T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-AT-TGGGCCAGTGGCC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--AGTCTA--T-GT
gi|7902 : TT--A-TT---T-----T---G-T-----------A-CAT---TTT-----G----T---A---------T-G------------A---T--G----TCGCA---T-T---TGTTGAA-CA-----T-T---CT-GTAT-TA-TGTACCGGAGGCC--T--AAA-TTG-CT-TAATAAAGAAA--TGTTTT--T-
gi|7903 : ---G-T-----------TTCAC---TAG-----A----T---A---------T-G------------A---T--A----T---A---------------A--A-----T-GGAATT-ATATATTATGGGCCAGAGGCC--T--AGA-TTG-CT-TAATAAA-ACATTTGTCAT--T-GTC
gi|7904 : ---TTT-----A----C---A---------T-A------------A---T--GAAAAT---A---T-T---T-----A--------------TT-GTAT-TT-TGGGCCAGGGGAC--T--ATA-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCAA--T-GTCT
gi|7905 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGTCAGTGACC--T--A-A-TTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--T-GTCTA
gi|7906 : ---TTT-----A----C---A---------A-A------------A---T--G----T---A---T-A---T-----G-TT-----T-A---TT-GTAT-TT-TGGGCCAGTAGCC--T--ATA-CTA-CT-GAATAAA-CTA--TGTCTA--C-GTGTA