lowQualScore : 1 222222222222222 111111 1 1111 11 111111111 2222222222222 5555555555555555555555555555555555555555555555 111 22 111 1 2222 1111111 1111 11 1111111 333333333333 111 111111 1 11 1
lowQualScore : 2 5 1 99 0 3 0 44 9999 33 3 1 555 0 44 11 888 3 111111111111111 6 333333 8 1 5 33 555 3333 4 555 0 3 11 33 55555 0 444 555555555 444 9999999999999 55555 99 4 2 2 1 2 4 6 4 3 5 33 6666666666666666666666666666666666666666666666 444 4 33 444 0 1 5555 0 7 1 4444 6666666 3 7777 77 00 8888888 777777777777 4 4 55 2 111 2 0 555 111111 11 88888 55 3 0 99 44 5 8 2 6 3 4 8 7 999 2 2 3
lowQualScore : . . . .. . . . .. .... .. . . ... . .. .. ... . ............... . ...... . . . .. ... .... . ... . . .. .. ..... . ... ......... ... ............. ..... .. . . . . . . . . . . .. .............................................. ... . .. ... . . .... . . . .... ....... . .... .. .. ....... ............ . . .. . ... . . ... ...... .. ..... .. . . .. .. . . . . . . . . ... . . .
lowQualScore : 5 5 4 55 8 1 2 22 2222 66 1 8 444 8 22 00 888 1 444444444444444 2 999999 3 4 1 99 000 1111 3 000 1 6 00 77 99999 4 777 999999999 777 5555555555555 99999 55 1 2 3 0 9 7 7 6 7 4 22 7777777777777777777777777777777777777777777777 888 0 00 000 7 1 6666 7 9 4 3333 6666666 0 9999 99 77 6666666 000000000000 8 4 00 6 000 5 6 888 333333 44 44444 11 6 9 55 11 9 2 9 0 0 6 8 2 777 8 1 2
consensus : TGCGGNGTNCCACAGGGAAGCATCCTGG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-TTTATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAN-TGT-AAA------TTATTATTATATGCNGATGA--CAGT---G-CAATATTGTT---CGCTNAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTAT---CA--TG-----GAAAATTGTNNTAAA-TGGCTAGTNGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAATGTATNTTA--TTTGG------CT-----------C---------T---------TTTG--GAAGN-CTTAAAAA-A--TTCAGT---CATTTACGGTTACATGCAACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTG-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTT-A-A--------AAAAAGTTAA-TTCGAGGATNGC-NTTTTTATATCGAAACNGNCGCTACTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-A-ACT--TTAGTAAGTGCCTTAGTACAGTGTCATTTTGATTATNCNTGTTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( gi|18369 ) : TGCGGCGTACCACAGAAAAGCATCCTGG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-TTAATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGT---G-TAATATTGTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTAT---CA--TG-----GAAAATTGTTCTACA-TGGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTA--TTTGG------CT-----------C---------T---------TTTG--GAAGT-CTTAAAAA-A--TTCAGT---CATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTG-GGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTTAA-A--------AAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGC-TTTTTTATATCGAAACTGTCGTTACTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-A-ACT--TTAATAAGTGCCTTAGTACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18368 : TGCGGCGTACCACAGGGAAGCATCCTGG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-TTTATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAT-TGT-AAA------TTAATATTATATGCAGATGA--CAGT---G-TAATATTGTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTAT---CA--TG-----GATAATTGTTCTACA-TGGTTAGTTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTG--TTTGG------CT-----------C---------T---------TCTA--GAAGA-CTTAAAAA-AG-TTCAGT---CATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTG-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTT---A--------AAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGC-TTTTTTATACCGAAACTTTCGTTATTT---T--AACCT-TCAAACT-AATAG-A-ACT--TTAATAAGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGGAAGCATCCATG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-TTTATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAAT---G-TAAAATTGTT---CGCTAAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAAT---CA--TG-----G-ATATAGTTCTGCA-AGGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAATGTATATT---TTTGC------CT---------------------T---------TCTA--GAAGC-CTTAAAAA-G--TGCAGT---CATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTG-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTT---A--------AAATAGTTAA-TTCGCGGATTGC-ATTTTTATATCAAAACTGTCGTTATTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-T-ACT--TTAATAAGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGGAAGCATCCTTG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-TCTATGTTA---TGGCAATGATAT--GCCTAC--GC-GTA--TCGACTC-CGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGT---G-TCATGTTGTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTAT---CA--TG-----GATAATTGTTCTACA-TGGCTAGTTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTC--TTTGG------CT-----------C---------T---------TTTA--AAAGA-CTTAAAAA-AG-TTCAGT---CATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTA-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTT---A--------AAAAAGTTAA-TTCGAGGATTGCATTTTTTATATGGAAAATGTCGTTATTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-A-ACT--TTAAAAAGTGCCTTAGTACAAAGTCATTTTGATTA-TCCTGTTC-----------CAGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGGAAGAAACCTGG-GCC--C-T--CTTTTA-TT-GTTATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAT-T--------------ATTATTATATGCAGATGA--CAGT---G-TAATATTGTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCAT---AA--TG-----GATAATTGTTCTACA-TGGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAA
gi|18359 : TGTGGAGTTCCTCAAAGAAGTATTTTGG-GGC--C-A--TTATTG-TT-TTTATGCTA---TGTTAATGATAT--GAGTATTAGT-ATAAGTCAA-----AAA-TGTAAAA------TCATT-CTCTATGCCGATGA--TAGT---G-C--TATTCTT---TTCTCACATA--AAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-AT---GAACTA-----GAAAATTGTAATAAA-TGGTTAATAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAATGTATATTA--TTTGG------GT-----------CAAAACGCAGG---------CTTGCTAAAG---TGAAACA-ATTTTCAGT----------GCTTA---GTAATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAATGATTTGTC---TGCTACATCCATTGTGAACAATAAT-----------------GTT---A--------AAAAGGTTAA-TTCTAGAATAAA-ATTTTTGTACAGACACAAACACTACTT---A--AATTTATC--CCT-TAGAA-AGACTC-TTTGTAA-TTCTTTGATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAgttcagtcatttacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGGAAGTATTTTGGTGCC--A-T---TTCTG-TT-TTTATGCTA---TGTAAATGATAT--GAGCAT--TA-GCA--T-AAGTCAAAAA-TGT-AAAG-----TTATT-CTCTATGCCGATGA--TAGT---G-C--TATTCTT---TTCTCACATA--AATAT----CCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAAC---CA---------GAAAATTGTTATAAA-TGATAAATAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAATGTATATTA--TTTGg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGGTAGCATCTTAG-GCC--C-G--CTTCTA-TT-T----GTTACCATGTAAATGACAT--GGTTA---GTAGCA--TTGACCC-CGAA-TGT-AAA------TAATT-CTATATGCTGATGA--CAGC---A-CGATTCTTAT---AGCTTAT--A--ACTAA----TATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT-------TG-----GTGTCTTGCTCATCT-CGGCTAGAATATAATAAGCTGT-CATACATCTTGGTTTAACCGA--GTGCGTTATTTTTGG------CT-----------C---------agtcaaaacgcaagcttgctaaagtgaaacagttttcagtgctttataatggtcacaccatacaagcacaaccatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagctaatgatttgtctgctacatccattgtgaacaatattgttaaaatggtaaattttagaataacatttttgtatagacatgaagactacttaaatttatacagtgtcattttgattatgcatattcttcatggtatagtcttacaaaaacgttaaag
gi|18358 : attttcaaagtataaatctgtaacaTGTGGAGTTCCTCAAGGAAGTATTTTGG-GGC--C-A--TTATTG-TG-TTTATGCTA---TGTAAATGATATGAGCATTA--GT-ATAAGTAAA-----AAA-TGTAAAA------TCATT-CTCTATGCCTATGA--TAGT---G-C--TATTCTT---TTCTCACATA--AAGAT----TCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-AT---GAACTA-----GAAAATTGTAATAAA-TGGTTAATAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAATGTATATTA--TTTGG------GT-----------C---------aaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGGAAGTATTATGG-GGC--CATAACTGTT---T-TTAATGT-A-------AATGATAT--GAGCAT--GA-GTA--T-AAGTC-AAAAATGT-AAAA-----TTATT-CTCTATGCCGATGA--TAGT---GCTATTCTTTTT---CTCACAT--A--AAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-AT---GAACTA-----GAAAAGTGTAATAAA-TAGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAATGTATATTA--TTTAG------aaaatgcaggcttgctaaagtgaaacaattttcagtgcttagtaatggtcacaccatacaagcacaaacatcagtcaaatatcttggtgcaatgttagataatgatttttctgctacatccattgtgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaatttttgtatagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttaattatgcatgttcttcatggtatagtagtcttacagaaacgttaaag
gi|18367 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATTATTG-GAC--C-A--CTTCTG-TTCTTGAT-TTA---TGTAAATGCCAT--GTC-AT--CT-GTG--TTAA-----AA---AC-AAA------CTATTGTTATATGCAGATGATTC-TT---G-TATTCTTGTTGCATGCTGA---G--GAGGT----TCTGACG------------GA---GGACCT---A----CAT---C---------------TTGTTAGTCAGTGGCTAGTGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAATCCATCTTA--TCCGG------TT-----------C---------gacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18376 : atcgcaCAGGGAAACATCCTGT-GCG--C-T--CTTTTA-TT-TTTATGTTA---TGTCAATGATAT--GCCTAC--GT-GCA--TCGACTC-CGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGT---G-TAAAATTGTT---TGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTAT---CA--TG-----GATAATTGTTCTACA-TGGCTAGTTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTA--TTTGG------CT-----------C---------T---------TCTA--GAAGA-TTTAAAAA-AG-TTCAGA---CAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CGGTG-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGCT---A--------AAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGC-ATTTTTATGTCGAAACTGTTGTTATTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-A-ACT--TTAATAAGTGCCTTAGTACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18375 : AGAAGTATACTGG-GTCAGT-TG-CTTTTG-TT-T--ATGTCG---TGTCAATGCT----GCATAA--GT-AAA------------AA-TGT-AAA------TAATC-TTATATGCTGATGA--TAGT---G-
gi|18366 : ttgcttgaATACTAG-GTC--C-T--ATT--AGTT-TTAATAT-A---TGTCAATG--AT--GTCT---------G--TCG--------T-TGT-AAAAAAAACTTCTT-TCATATGCTAATGA--C--TTCCG-AAATTCCGGT---TACTGGG--A--AATACAAATCCCAA----AT---T-G-------AAACTT----GTTTTATCTACA--TG-----TAAA-------TGAA-TGGTTGGTTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAATCAATTCCT--TTTGGATATAACC-----------C---------TAGG------TTTA--GA--T-CTC----A-G--TCCAGT---CAT-----ATTACATGTAATGGctatcct
gi|18378 : tatttcatatggggtccctcaaggatctA------TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGT---G-C--TATTCTT---TTCTCAC--ATGAAGAT----CCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A--TGAACTAGAAAATTGTAATAAA-TGGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAATATATATTA--TTTGG------GTAAAAACGCAGGC---------T---------TGCT--AAAG---TGAAACA-ATTTTCAGT----------GCTT---TGTAATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATGGA-AGGTGCAATGTTAAA--TAAT------GAT--TTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTTAAAAAGGTAACTTCTAGAATAAA-TATTTTGTATAGACATAAACACTACTT---TAGAAC------GACT----------CT--TT-GTAA-TTCTTTAATACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAAggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18379 : TATT-CT---CGC--AC--A--AAGAT----CCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAAT---GAACTT-----AAAAATTGTAGTAAA-TGGTTAGCTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAATGCATTGTA--TTTGG------TT-----------C---------T---------g
gi|18374 : atgattgtgctatccAT--A--AAGAT----CCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG---------CA--TG-----GAAaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18380 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaG-----AAAAATTGTAGTAAA-TGTTTAGTTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAATGCATAGTA--TTTGG------TG-----------C---------TAAGAATGAGTTAG--CGAGT-GTTGAAAG-A--TTCAATGTACATTcttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18381 : aatgtactta-----GAAAAGTGTAGTAAA-TGGTTAGTTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAATGCACTTTA--TTTGG------TT-----------C---------TAAACGTAAGTTAG--CAAATATTTAAAAATA--TTCAATGAACATTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18364 : atgtactt-TGGCTAGTTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAATCCATCTTT--TTCGG------TT-----------CAAAAT----T---------TTTGCTTAAGT-C-TAAAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcag-TGGCTAGTGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAATCCATTTTA--TTCGG------AT-----------C---------tataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18372 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagAAA-G--TTCAGT---CATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGAAAAGT----TACTAAA--CGGTG-AGGCGATAGTTGACT-------CCATTGTTTA-A--------AA-AAGTTAA-TTCGCGGATTGC-TTTTTTATATCGAAACTGTCGTTACTT---T--AACCT-TCAAACT-AAGAG-A-ACT--TTAATAAGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18358 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccATTGTTAA-A--------AAG--GTAAA-TTCTAGAATAAA-ATTTTTGTATAGACACAAACACTACTT---A--AATTTATCC--CT-TAGAA-AGACTC-TTTGTAATT-CTTTGATACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattttggggccattattgtgtttatgctatgtaaatgatatgagcattagtataagtaaaaaatgtaaaatcattctctatgcctatgatagtgctattcttttctcacataaagattctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaattgtaataaatggttaatagacaacaaactgtcattgcatctgggaaagacagaatgtatattatttgggtcaaaatgcaggcttgctaaagtgaaacaattttcagtgcttagtaatggtcacaccatacaagcacaaacatcagtcaaatatcttggtgcaatgttagataatgatttttctgctacatccattgtgaacaatATTGTTAA-A--------AAG--GTAAA-TTCTAGAATAAA-AAGTTTGTATAGACATAAACACTACTT---A--AA--T-TTATCCTTAAGAC-AGACTA-TTTGTAATT-CTTTAATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAg
gi|18382 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTTTCTATACCGAAAAAGCCAGTACTTGACT--AAGCA-T---AC--AAGAA-A-ACTA-TTGGTA---GCATC-------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAAg
gi|18365 : tattaagtggttggttgacaacaaacttttattgcatcttgggaagacagaatcaattattttcggatctaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagGAGCA-ACTCCTTATCATGT-CTTTGATTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGAC
gi|18361 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccTTA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAA
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18373 ): GTTCCTGGAGGAAGTAGCCATTGCTTTCTTTTATGCTACATCAATGATAGGAGTGTCAGTATAAGTAAAAAATGTACAATAATTTTACATGCAAATGCTAGTACTATCCTTTTCTTGTATAAAGATCTTGATGTTGTTAATAATGTACTTGGCATGGAACTTGAAAATAAGAAGTCATCAAAGGCTGATAG
Unaligned ( gi|18383 ): GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAATATTTTTAATTTGGTTCTAACAGGACGCTAGCAAAGGTTGATAGTTTCAAAGAACATTGTAATAGACTCACTACAGAGCCTCAATGATCTGTTAAGTGTTTTGGAAGTGTTTTGGATAATGATATGTCTGCCAAATTTAGCACTTACAACATTGTTGAATAATAAATCATTTCTAAGTCGAAATTTCTGTATAGACAAAACATTTGTTTATATGTAATTCTTTAATACAATGATGTTAGGATTATTCAT
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Unaligned ( gi|18363 ): GAAAATGATTGTGAAATCTGGTGTTCCACAAGAATCTATTCTCAGGCCACTTTTGTTTCTTATATATATAAATGACATGCCAATTATAACGAGGACAAATAATATATATAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTATATGAATCTAATCGAGATTGATCAATAATTGAATCTATACTACAAATTAGATTGAAAAATATTGATGATTGGTGCAAACTTAATAACATGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAATGTATGATATTAAGTACAAATTATAAAACAAAACATGCAATGAATATTAAATTGCAAATTGGTAACACTTCAATTGAAAATGTAACAGGACAGACTATATTAGGCGTATATGTTGACAATAATCTAACTTGGCACAACCATGTAAAAATGTTATTGACAAAATCAATTCGAAAATAGCACTTTTG
Unaligned ( gi|18377 ): TTAAAAAGCAAATTTCTTTTATATGTTGGTGAATACGGAATTCTGTTTACTGGGAAATGCAAATCTTAAATTGAAACTATTTTATATAGGGAACTAAAAGTGAATGATTTGTAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAATCAATTATTTTTTGGATC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 111111 1 1 11 2222222222222 444444444444444444444444444444444444 11111 111 1111 222222 1111 1111111 11 111111 1111 1111 11
lowQualScore : 1 1 2 444 1 33 2 1 33 44 2 2 2 0 33 33 999 2 2 2 44444444444444 2 444444 1 4 1 33 1 2 5555 77777 1 33 00 5555 444 2 1 999 444 2222222222222 55555 777 22 333 1 11 1 1 1 3 1 22 8888888 55555 555555555555555555555555555555555555 1 44 555 3 88888 111 6 777 777 4 0 7777 1 1 8 8888 555555 1 8888 66 66 3333333 777 777 88 88 3 33 1 22 3 2 2 444 0 33 222222 0000 222 33 4444 0000 88 666 66 6 8 0 1 1 3 4 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... . .. . . .. .. . . . . .. .. ... . . . .............. . ...... . . . .. . . .... ..... . .. .. .... ... . . ... ... ............. ..... ... .. ... . .. . . . . . .. ....... ..... .................................... . .. ... . ..... ... . ... ... . . .... . . . .... ...... . .... .. .. ....... ... ... .. .. . .. . .. . . . ... . .. ...... .... ... .. .... .... .. ... .. . . . . . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 1 444 7 44 5 4 44 66 5 5 5 4 44 22 666 7 7 0 99999999999999 7 777777 1 8 0 22 5 5 7777 11111 0 44 33 3333 444 5 0 777 444 9999999999999 66666 444 88 555 0 88 0 0 0 7 0 88 7777777 33333 999999999999999999999999999999999999 0 66 444 3 33333 777 7 000 000 0 7 1111 1 1 9 9999 666666 9 3333 11 11 9999999 000 000 77 77 1 77 0 55 1 5 9 222 9 99 555555 9999 444 99 6666 1111 22 222 88 1 3 8 3 0 6 0 0 222 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCNCAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTGTT-TTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTATTATATGCNGATGA--CAGTGCNAT-ATT---GTT---CGCTNAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAATGCATNTTATTT--GG------NT-----C-----T---------T---T----TA--G--A----AGNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCATTTTT-GTATNGA-AACNGNCGTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTA--AGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGCCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-TTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTATTATATGCNGATGA--CAGTGCAAT-ATT---GTT---CGCTNAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTNGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAATGTATNTTATTT--GG------CT-----C-----T---------T---T----TG--G--A----AGNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCGAGGATNGCNTTTTT-ATATCGA-AACNGNCGCTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTA--AGTGCCTTAGTACAGTGTCATTTTGATTATNCNTGTTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGG-GGC--CA-TTATTGTG-TTT-A-TGCTATGTAAATGATATGAGCATTA--G-T-ATAAGTAAA----AAA-TGTAAAA------TCATT-CTCTATGCCTATGA--TAGTGC--T-ATT---CTT---TTCTCACATA--AAGAT----TCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAATGTATATTATTT--GG------GT-----C-----
gi|18358 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAATTTTT-GTATAGA-CACAAACACTACT--T---A--AATTTATCC--C--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTA--ATT-CTTTGATACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAAaaaatgcaggcttgctaaagtgaaacaattttcagtgcttagtaatggtcacaccatacaagcacaaacatcagtcaaatatcttggtgcaatgttagataatgatttttctgctacatccattgtgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaatttttgtatagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttaattatgcatgttcttcatggtatagtagtcttacagaaacgttaaag
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattttggggccattattgtgtttatgctatgtaaatgatatgagcattagtataagtaaaaaatgtaaaatcattctctatgcctatgatagtgctattcttttctcacataaagattctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaattgtaataaatggttaatagacaacaaactgtcattgcatctgggaaagacagaatgtatattatttgggtcaaaatgcaggcttgctaaagtgaaacaattttcagtgcttagtaatggtcacaccatacaagcacaaacatcagtcaaatatcttggtgcaatgttagataatgatttttctgctacatccattgtgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGTATT--TTGG-GGC--CA-TTATTGTT-TTT-A-TGCTATGTTAATGATAT--GAGTATTAG-T-ATAAGTCAA----AAA-TGT-AAAA-----TCATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGC--T-ATT---CTT---TTCTCAC--ATAAAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAATGTATATTATTT--GG------GT-----C-------------------------A--A--AACGCAGGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAATTT---TCAGTGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAATGATTTGTC---TGCTACATCCATTGTGA-------ACAATA---AT-------------GTT--AAAAAGGTTAA-TTCTAGAATAAAATTTTT-GTACAGA-CACAAACACTACT--T---A--AATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTA--A-TTCTTTGATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--ATGG-GGC--CA-TAACTGTT-TTT-A-----ATGTAAATGATAT--GAGCAT--G-A-GTA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAA-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCTATTCTT---TTT---CTCACAT--A--AAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAAGTGTAA-TA--AAT---AGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAATGTATATTATTT--AG------g
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAAAGTTT-GTATAGA-CATAAACACTACT--T---A--AA--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTA--ATT-CTTTAATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGGTGCC--AT--TTCTGTT-TTT-A-TGCTATGTAAATGATAT--GAGCAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAG-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGC--T-ATT---CTT---TTCTCAC--ATAAATAT----CCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A---------GAAAATTGTTA-TA--AAT---GATAAATAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAATGTATATTATTT--GA------GT-----C--------------------AAAACG--C--A----AGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-CTTTATAATGG---TCACAC-CATACAAGCACAA----CCATC--------------AGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAATGATTTGTC---TGCTACA--T---------------CCATT---GTGA---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAA-TTTTAGAATAACATTTTT-GTATAGA-CATGAAGACTACT--T--------------AAA----------------T--TTA--TAC-AGTG-------------TCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGCATC--TTAG-GCC--CG-CTTCTATT-TGT---TACCATGTAAATGACAT--GGTTA---G-TAGCA--TTGACCCCGAA-TGT-AAA------TAATT-CTATATGCTGATGA--CAGCACGAT-TCT---TAT---AGCTTAT--A--ACTAA----TATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT-------TG-----G-----TGTCT-TGCTCATCTCGGCTAGAATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAGTGCGTTATTTTT--GG------CT-----C-----g
gi|18362 : attttcaaagtataaatctgtaacaTGCTCTGATTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18364 : attttcaaagtataaatctgtaacatgtggcgttccacagggtagcatcttaggcccgcttctatttgttaccatgtaaatgacatggttagtagcattgaccccgaatgtaaataattctatatgctgatgacagcacgattcttatagcttataactaatatagtgttatttcttctaaattttgaagtgtgttggtgtcttgctcatctcggctagaatataataagctgtcatacatcttggtttaaccgagtgcgttatttttggctcaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttcTGTGGAGTGCCACAAGGTTTAA---TT--TTTG-GAC--CA-CTACTGTTCTTT-A-T-TTATGTGAATGAAAT--G--TAA--GCT-G-----TGGTT--AAA-AAC-AAA------TTATTGTTAGATGCAGATGA--
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---GGCTAGTTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAATCCATCTTTTTC--GG------TT-----CAAAATT---------T---T----TGCTT--A----AGTC---TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtTTGTTAATC--AGT---GGCTAGTGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAATCCATTTTATTC--GG------AT-----C-----tataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAATTCTT-GTAGCGT-AAGAAGAATTACC--T------AAC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCA--TGT-CTTTGATTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCTATA--CTAG-GTC--CT-ATT--AGT-TTT-AATAT-ATGTCAATGAT----GTCTG------------TCG-------T-TGT-AAAAAAAACTTCTT-TCATATGCTAATGA--C-TTCCGAA-ATTCCGGTT----ACTGGG--A--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA--TG-----TAAA--------TG--AAT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAATCAATTCCTTTT--GGATATAACC-----C-----TAGG------T---T----TA--G--A------TCT--C-------A-G-----TCCAGT---C-AT--------A---TTACATGTA-ATGG
gi|18366 : tatttcatatTACCGA-AAAAGCCAGTACT--TGACT--AAGCA-T---AC--C-AG-GA--A-ATTG-TTG-GTATCA-TCTCTTATT-CAGTGTCACTTCGATTGTTCATGTTCTTTCAGGTTTTCTAGTTTGACTCAAAggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18367 : tatttcatatggggtccctcaaggatctatactaggtcctattagttttaatatatgtcaatgatgtctgtcgttgtaaaaaaaacttctttcatatgctaatgacttccgaaattccggttactgggaaatacaaatcccaaattgaaacttgttttatctacatgtaaatgaatggttggttgacaacaaactttcatttgatcttgggaagacagaatcaattccttttggatataaccctaggtttagatctcagtccagtcatattacatgtaatggggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggTGTGGAGTGCCACAAGG---TTGAATT--ATTG-GAC--CA-CTTCTGTT-CTTGA-T-TTATGTAAATGCCAT--GTC-AT--C-T-GTG--TTAA-----AA--AC-AAA------CTATTGTTATATGCAGATGATTC-TTGTATT-CTT---GTTGCATGCTGA---G--GAGGT----TCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC------------------TTGTTAGTC--AGT---GGCTAGTGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAATCCATCTTATCC--GG------TT-----C-----acctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-TTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTAATATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGTTAGTTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTGTTT--GG------CT-----C-----T---------T---C----TA--G--A----AGACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-AAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTTTTTT-ATACCGA-AACTTTCGTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATA--AGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-TTA-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTATTT--GG------CT-----C-----T---------T---T----TG--G--A----AGTCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGG---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTTTTTT-ATATCGA-AACTGTCGTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA--AGTGCCTTAGTACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTTG-GCC--CT-CTTTTATT-TCT-A-TGTTATGGCAATGATAT--GCCTAC--G-C-GTA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTCAT-GTT---GTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTCTTT--GG------CT-----C-----T---------T---T----TA--A--A----AGACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTAA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAA-TTCGAGGATTGCATTTTTTATATGGA-AAATGTCGTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAA--AGTGCCTTAGTACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CATG-GCC--CT-CTTTTATT-TTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAATGTAAA-ATT---GTT---CGCTAAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A--TG-----G-ATATAGTTC-TG--CAA---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAATGTATATT-TTT--GC------CT-----------T---------T---C----TA--G--A----AGCCT--TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-ATTT---ACAG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCATTTTT-ATATCAA-AACTGTCGTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATA--AGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGAAAC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-GTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGA---------------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAA
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATTGAAAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTTTTTT-ATATCGA-AACTGTCGTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA--AGTGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAgttcagtcatttacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18374 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccGTTCCTCGAGG---AAGTATCAATTG-----------CTTTATT-TT--A-TGCTACGTCAATGATAT--G
gi|18374 : AT--A--AAGAT----CCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A--TG-----GAAagagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaG---AAGTATA--CTGG-GTCAGTTGCTTTTGTT-T---A-TGTCGTGTCAATGCT----GCATAA--G-T-AAA-----------AA-TGT-AAA------TAATC-TTATATGCTGATGA--TAGTGCTAT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgaaCAGGG---AAACATC--CTGT-GCG--CT-CTTTTATT-TTT-A-TGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTAAA-ATT---GTT---TGCTGAC--A--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAATGTATGTTATTT--GG------CT-----C-----T---------T---C----TA--G--A----AGATT--TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-AATT---ACGG---TAACATACA-ATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATTGACAAGT----TACTAAA--CG--GTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCATTTTT-ATGTCGA-AACTGTTGTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA--AGTGCCTTAGTACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAcct
gi|18378 : A------TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGC--T-ATT---CTT---TTCTCAC--ATGAAGAT----CCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A--TGAACTAGAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAATATATATTATTT--GG------GTAAAAAC----------------------------G--C----AGGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAATTT---TCAG---TGCTTTGTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATGGA-AGGTGCAATGTTAAA--TA--ATGATTTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAATAAATATTTT-GTATAGA-CATAAACACTACT--T---TAGAAC------GAC--T-----------CT--TT--GTA--A-TTCTTTAATACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA--TTGTGCTAT-CCT---ATT---CTCGCAC--A--AAGAT----CCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AACTT-----AAAAATTGTAG-TA--AAT---GGTTAGCTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAATGCATTGTATTT--GG------TT-----C-----T---------g
gi|18380 : G-----AAAAATTGTAG-TA--AAT---GTTTAGTTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAATGCATAGTATTT--GG------TG-----C-----TAAGAATGAGT---T----AG--C--G----AGTGT--TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-ATTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAAAAGTGTAG-TA--AAT---GGTTAGTTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAATGCACTTTATTT--GG------TT-----C-----TAAACG----TAAGT----TA--GCAA----ATATT--TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-ATTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAGTTTCT-GTGTAGACAACA-CCGTAATTGTT---T--AAATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCA--ACT-CTTTAATACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAAT-CA-ATTATTTTCGG------AT-----C-----T---------cagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAATATTTTTAATTT--GG------TT-----C-----T---------aaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18373 ): GTTCCTGGAGGAAGTAGCCATTGCTTTCTTTTATGCTACATCAATGATAGGAGTGTCAGTATAAGTAAAAAATGTACAATAATTTTACATGCAAATGCTAGTACTATCCTTTTCTTGTATAAAGATCTTGATGTTGTTAATAATGTACTTGGCATGGAACTTGAAAATAAGAAGTCATCAAAGGCTGATAG
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Unaligned ( gi|18363 ): GAAAATGATTGTGAAATCTGGTGTTCCACAAGAATCTATTCTCAGGCCACTTTTGTTTCTTATATATATAAATGACATGCCAATTATAACGAGGACAAATAATATATATAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTATATGAATCTAATCGAGATTGATCAATAATTGAATCTATACTACAAATTAGATTGAAAAATATTGATGATTGGTGCAAACTTAATAACATGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAATGTATGATATTAAGTACAAATTATAAAACAAAACATGCAATGAATATTAAATTGCAAATTGGTAACACTTCAATTGAAAATGTAACAGGACAGACTATATTAGGCGTATATGTTGACAATAATCTAACTTGGCACAACCATGTAAAAATGTTATTGACAAAATCAATTCGAAAATAGCACTTTTG
Unaligned ( gi|18377 ): TTAAAAAGCAAATTTCTTTTATATGTTGGTGAATACGGAATTCTGTTTACTGGGAAATGCAAATCTTAAATTGAAACTATTTTATATAGGGAACTAAAAGTGAATGATTTGTAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAATCAATTATTTTTTGGATC
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 111111 1 2222222222222 444444444444444444444444444444444 11111 111 11111 1 2222 2222222 1111111111 1111 1111111 11 11 1111 11 1
lowQualScore : 1 1 1 888 2 33 2 2 33 55 2 4 2 1 33 22 000000000000000000000000 2 333333 0 3 1 33 3 66 5555 444 1 1 0 33 5555 444 2 1 999 444 2222222222222 55555 777 22 333 1 11 1 1 1 3 1 1 1 22 22 1 666666 999999999999999999999999999999999 1 44 555 3 66666 000 6 3 0 666 666 666 0 3 55555 2 2 2 5555 4444444 4 2 7777777777 6666 4 4 4444444 666 666 0 11 00 2 1 444 2 2 1 2 555 33 555 555 4444 2 33 3333 33 8 55 666 7 1 33 1 5 4 2 888 1 1
lowQualScore : . . . ... . .. . . .. .. . . . . .. .. ........................ . ...... . . . .. . .. .... ... . . . .. .... ... . . ... ... ............. ..... ... .. ... . .. . . . . . . . .. .. . ...... ................................. . .. ... . ..... ... . . . ... ... ... . . ..... . . . .... ....... . . .......... .... . . ....... ... ... . .. .. . . ... . . . . ... .. ... ... .... . .. .... .. . .. ... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 0 222 5 22 4 2 22 44 4 7 2 2 22 88 444444444444444444444444 5 888888 8 9 0 11 4 22 7777 777 1 0 7 44 3333 444 5 0 777 444 9999999999999 66666 444 88 555 2 88 0 0 0 7 9 5 0 66 66 0 111111 000000000000000000000000000000000 0 22 000 1 99999 888 2 1 3 444 444 444 5 6 55555 5 5 0 5555 5555555 0 3 5555555555 5555 0 1 0000000 444 444 3 22 55 9 0 444 9 9 0 9 222 99 777 000 4444 1 99 6666 44 6 44 999 2 4 33 0 9 9 0 555 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CN-CTTTTGTT-TTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTNTTATATGCNGATGA--CAGTGCNAT-NTT---GTT---CGCTNACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCATNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCAT-TTTT-GTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCNTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCNCAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTGTT-TTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTATTATATGCNGATGA--CAGTGCNAT-ATT---GTT---CGCTNACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCATNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCAT-TTTT-GTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGCCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGG-GGC--CA-TTATTGTG-TTT-ATGCTATGTAAATGATATGAGCATTA--G-T-ATAAGTAAA----AAA-TGTAAAA------TCATT-CTCTATGCCTATGA--TAGTGCTAT-TCT---TTT---CTCACATA--AAGAT----TCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTATATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AATGC-A-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AGTGCT---TA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTCTGC----TACATCCATTGTGA-------ACAATA----TTG------------TT-A-AAAAGGTAAA-TTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTATAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA-TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGTATT--TTGG-GGC--CA-TTATTGTT-TTT-ATGCTATGTTAATGATAT--GAGTATTAG-T-ATAAGTCAA----AAA-TGT-AAAA-----TCATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCTAT-TCT---TTT---CTCACATA--AAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTATATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ACGCA-GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---C-AATTTTC---AG---TGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATAATGTT-AAAAAG-GTTAA-TTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTACAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATCC--C--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAATT-CTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--ATGG-GGC--CA-TAACTGTT-TTT-A----ATGTAAATGATAT--GAGCAT--G-A-GTA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAA-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCTATTCTT---TTT---CTCACATA--AAGAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAAAAGTGTAA-TA--AAT---AGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTATATT--ATTT--AGg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTATAGA-CATAAACACTACT--TA--A---A--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTAATT-CTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGGTGCC--AT--TTCTGTT-TTT-ATGCTATGTAAATGATAT--GAGCAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAG-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCTAT-TCT---TTT---CTCACATA--AATAT----CCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A---------GAAAATTGTTA-TA--AAT---GATAAATAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTATATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---A-----ACGCAAGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-C-TTTATAATGG---T---CACAC-CATACAAGCACAA----CCATC--------------AGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATATTGTT-AAAATG-GTAAA-TTTTAGAATAACAT-TTTT-GTATA-------GACATGA-------------------AGAC--T-A---------CT--T-----AAAT---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGCATC--TTAG-GCC--CG-CTTCTATT-TGT--TACCATGTAAATGACAT--GGTTA---G-TAGCA--TTGACCCCGAA-TGT-AAA------TAATT-CTATATGCTGATGA--CAGCACGAT-TCT---TAT---AGCTTATA--ACTAA----TATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT-------TG-----G-----TGTCT-TGCTCATCTCGGCTAGAATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCGTTAT--TTTT--GGCT------C----g
gi|18364 : attttcaaagtataaatctgtaacaTGTGGAGTGCCACAAGGTTTAA---TT--TTTG-GAC--CA-CTACTGTTCTTT-AT-TTATGTGAATGAAAT--G--TAA--GCT-G-----TGGTT--AAA-AAC-AAA------TTATTGTTAGATGCAGATGA--aaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---GGCTAGTTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCATCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A-----GTC---TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtA-TGCCAGGTTGAAAT-TCTT-GTATCGT-AAGAAGGATTACC--TT--ACAAA----TCATAC--C-AA-GAC-A-CTC--CTT-GTCA-TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAGGTTCAA---TT--CTTG-GAC--CA-CTACTGTT-CTTGAT-TTATAAAAATGACAT--GTCAGCT-G-T-GGT--TAAACAC---------AAA------CTGTTGCTATATGCAGATGA--
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---GGCTAGTGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCATTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAAT-TCTT-GTAGCGT-AAGAAGAATTACC--T---A---AC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATGT-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCTATA--CTAG-GTC--CT-ATTA-GTT-TTA-ATAT-ATGTCAATGAT----GTCTG------------TCG-------T-TGT-AAAAAAAACTTCTT-TCATATGCTAATGA--C-TTCCGAA-ATTCCGGTT----ACTGGGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA--TG-----TAAA--------TG--AAT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAATTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A------------TCT--C-------A-G-----TCCAGT---C-A-T--------A---T---TACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGG---TTGAATT--ATTG-GAC--CA-CTTCTGTT-CTTGAT-TTATGTAAATGCCAT--GTC-AT--C-T-GTG--TTAA-----AA--AC-AAA------CTATTGTTATATGCAGATGATTC-TTGTATT-CTT---GTTGCATGCTGA-G--GAGGT----TCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC------------------TTGTTAGTC--AGT---GGCTAGTGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCATCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-TTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTAATATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGTTAGTTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTATGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-AAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATACCGA-AACTTTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGCATC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-TTA-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAAAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTATGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A-----GTCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGG---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTTG-GCC--CT-CTTTTATT-TCT-ATGTTATGGCAATGATAT--GCCTAC--G-C-GTA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTCAT-GTT---GTT---CGCTGACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTATGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTAA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAA-TTCGAGGATTGCAT-TTTTTATATGGA-AAATGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAAAGTGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC-----------CAGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CATG-GCC--CT-CTTTTATT-TTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAATGTAAA-ATT---GTT---CGCTAACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A--TG-----G-ATATAGTTC-TG--CAA---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTATATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A-----GCCT--TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-A-TTTAC---AG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATATCAA-AACTGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGAAAC--CTGG-GCC--CT-CTTTTATT-GTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGA---------------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTAAT-ATT---GTT---CGCTGACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA-GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18374 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccGTTCCTCGAGG---AAGTATCAATTG----------CTTTA--T-TTT-ATGCTACGTCAATGATAT--G
gi|18374 : ATA--AAGAT----CCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A--TG-----GAAagagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaG---AAGTATA--CTGG-GTCAGTTGCTTTTGTT-T---ATGTCGTGTCAATGCT----GCATAA--G-T-AAA-----------AA-TGT-AAA------TAATC-TTATATGCTGATGA--TAGTGCTAT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgaaCAGGG---AAACATC--CTGT-GCG--CT-CTTTTATT-TTT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTAAA-ATT---GTT---TGCTGACA--AAGAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GATAATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTATGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GATT--TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-A-ATTAC---GG---T---AACATACA-ATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGTCGA-AACTGTTGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAcct
gi|18378 : A------TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGC--T-ATT---CTT---TTCTCACATGAAGAT----CCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A--TGAACTAGAAAATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATATATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AG---T---GCTTTGTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG----------GTGCAATGT-TAAATAATGATTTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAATAA-ATATTTT-GTATAGA-CATAAACACTACT--TTAGA---AC------GAC--T-----------CT--TT--GTAA-TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA--TTGTGCTAT-CCT---ATT---CTCGCACA--AAGAT----CCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AACTT-----AAAAATTGTAG-TA--AAT---GGTTAGCTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCATTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAAAATTGTAG-TA--AAT---GTTTAGTTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCATAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A-----GTGT--TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-A-TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAAAAGTGTAG-TA--AAT---GGTTAGTTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCACTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A-----TATT--TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-A-TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAACA-CCGTAATTGTTT--A---AATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCAACT-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA-ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--ATTTTTAATTT--GGTT------C----T-----aaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18373 ): GTTCCTGGAGGAAGTAGCCATTGCTTTCTTTTATGCTACATCAATGATAGGAGTGTCAGTATAAGTAAAAAATGTACAATAATTTTACATGCAAATGCTAGTACTATCCTTTTCTTGTATAAAGATCTTGATGTTGTTAATAATGTACTTGGCATGGAACTTGAAAATAAGAAGTCATCAAAGGCTGATAG
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Unaligned ( gi|18363 ): GAAAATGATTGTGAAATCTGGTGTTCCACAAGAATCTATTCTCAGGCCACTTTTGTTTCTTATATATATAAATGACATGCCAATTATAACGAGGACAAATAATATATATAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTATATGAATCTAATCGAGATTGATCAATAATTGAATCTATACTACAAATTAGATTGAAAAATATTGATGATTGGTGCAAACTTAATAACATGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAATGTATGATATTAAGTACAAATTATAAAACAAAACATGCAATGAATATTAAATTGCAAATTGGTAACACTTCAATTGAAAATGTAACAGGACAGACTATATTAGGCGTATATGTTGACAATAATCTAACTTGGCACAACCATGTAAAAATGTTATTGACAAAATCAATTCGAAAATAGCACTTTTG
Unaligned ( gi|18377 ): TTAAAAAGCAAATTTCTTTTATATGTTGGTGAATACGGAATTCTGTTTACTGGGAAATGCAAATCTTAAATTGAAACTATTTTATATAGGGAACTAAAAGTGAATGATTTGTAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAATCAATTATTTTTTGGATC
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 111111 2222222222222 444444444444444444444444444444444 11111 111 11111 1 2222 2222222 1111111111 1111 1111111 11 1111 11 1
lowQualScore : 1 1 0 777 2 33 0 4 333 1 2 2 4 2 2 33 1 000000000000000000000000 2 333333 3 4 1 22 5555 33 0 444 2 1 1 33 5555 5555 0 444 2 1 888 444 2222222222222 55555 333 777 22 333 2 22 1 1 1 4 1 3 22 1 22 22 1 555555 888888888888888888888888888888888 1 44 555 3 66666 000 6 3 0 666 666 666 0 3 55555 2 2 2 5555 4444444 4 2 7777777777 6666 4 4 4444444 666 666 0 44 66 2 1 44444 2 1 2 555 33 555 555 4444 2 33 3333 33 8 55 666 7 0 33 3 1 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... . .. . . ... . . . . . . .. . ........................ . ...... . . . .. .... .. . ... . . . .. .... .... . ... . . ... ... ............. ..... ... ... .. ... . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ................................. . .. ... . ..... ... . . . ... ... ... . . ..... . . . .... ....... . . .......... .... . . ....... ... ... . .. .. . . ..... . . . ... .. ... ... .... . .. .... .. . .. ... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 888 7 11 1 3 999 8 2 2 4 4 0 11 6 444444444444444444444444 4 111111 2 6 0 99 1111 44 4 444 9 0 5 22 0000 0000 7 111 4 0 666 111 0000000000000 33333 777 111 66 333 0 00 0 0 0 2 8 2 55 0 55 55 0 888888 777777777777777777777777777777777 0 22 000 1 99999 888 2 1 3 444 444 444 5 6 55555 5 5 0 5555 5555555 0 3 5555555555 5555 0 1 0000000 444 444 3 99 77 9 0 99999 9 0 9 222 99 777 000 4444 1 99 6666 44 6 44 999 2 0 55 3 0 6 0 222 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGCATC--CTGGGNC---CNCTTTTGTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTNTTATATGCNGATGA--CAGTGCN---ATN-CTGTT---CGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCA-T-TTTTGTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAGGG---AAGCATC--CTGGGCC---CNCTTTTGTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-AAA------TTATTNTTATATGCNGATGA--CAGTGCN---ATN-TTGTT---CGCTNACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCA-T-TTTTGTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCNTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGGGGC---CATTATTGTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATATGAGCATTA--G-T-ATAAGTAAA----AAA-TGTAAAA------TCATTCTC-TATGCCTATGA--TAGTGCT---ATT-CTTTT---CTCACATA--AA----GAT----TCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AATGC-A-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AGTGCT---TA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTCTGC----TACATCCATTGTGA-------ACAATA----TTG------------TT-A-AAAAGGTAAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTATAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA-TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGTATT--TTGGGGC---CATTATTGTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATAT--GAGTATTAG-T-ATAAGTCAA----AAA-TGT-AAAA-----TCATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCT---ATT-CTTTT---CTCACATA--AA----GAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ACGCA-GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---C-AATTTTC---AG---TGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATAATGTT-AAAAAG-GTTAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTACAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATCC--C--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAATT-CTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--ATGGGGC---CATAACTGTT-T-TT-A----ATGTAAATGATAT--GAGCAT--G-A-GTA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAA-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCT---ATTCTTTTT---CTCACATA--AA----GAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---AGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAA-A-GTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--TA--A---A--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTAATT-CTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATT--TTGGTGC---CATTTCTGTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATAT--GAGCAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAAAATGT-AAAG-----TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCT---ATT-CTTTT---CTCACATA--AA----TAT----CCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A---------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---GATAAATAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---A-----ACGCAAGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-C-TTTATAATGG---T---CACAC-CATACAAGCACAA----CCATC--------------AGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATATTGTT-AAAATG-GTAAA-TTTTAGAATAACA-T-TTTTGTATA-------GACATGA-------------------AGAC--T-A---------CT--T-----AAAT---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGCATC--TTAGGCC---CGCTTCTATT-T-GT--TACCATGTAAATGACAT--GGTTA---G-TAGCA--TTGACCCCGAA-TGT-AAA------TAATTC-TATATGCTGATGA--CAGCACG---ATT-CTTAT---AGCTTATA--AC----TAA----TATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT-------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCGGCTAGAATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C----g
gi|18362 : attttcaaagtataaatctgtaacaTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacatgtggcgttccacagggtagcatcttaggcccgcttctatttgttaccatgtaaatgacatggttagtagcattgaccccgaatgtaaataattctatatgctgatgacagcacgattcttatagcttataactaatatagtgttatttcttctaaattttgaagtgtgttggtgtcttgctcatctcggctagaatataataagctgtcatacatcttggtttaaccgagtgcgttatttttggctcaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttcGGTGTTCCACAAGA---ATCTATT--CTCAGGC---CACTTTTGTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACAT--GCC
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAGGTTTAA---TT--TTTGGAC---CACTACTGTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAAT--G--TAA--GCT-G-----TGGTT--AAA-AAC-AAA------TTATTGTTAGATGCAGATGA--aattataacgaggacaaataatatatataataatgacctctatgcggatgattccactgtatatgaatctaatcgagattgatcaataattgaatctatactacaaattagattgaaaaatattgatgattggtgcaaacttaataacatgtcactacaacccggaaaatcaaaatgtatgatattaagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---GGCTAGTTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A-----GTC---TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtA-TGCCAGGTTGAAA-T-TCTTGTATCGT-AAGAAGGATTACC--TT--ACAAA----TCATAC--C-AA-GAC-A-CTC--CTT-GTCA-TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAGGTTCA---ATT--CTTGGAC---CACTACTGTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACAT--GTCAGCT-G-T-GGT--TAAACAC---------AAA------CTGTTGCTATATGCAGATGA--
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---GGCTAGTGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAA-T-TCTTGTAGCGT-AAGAAGAATTACC--T---A---AC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATGT-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCTATA--CTAGGTC---CTATTA-GTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT----GTCTG------------TCG-------T-TGT-AAAAAAAACTTCTT-TCATATGCTAATGA--C--TTCCGAAATT-CCGGT---TACTGGGA--AA----TACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA--TG-----TAA---A--------TG--AAT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A------------TCT--C-------A-G-----TCCAGT---C-A-T--------A---T---TACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGG---TTGAATT--ATTGGAC---CACTTCTGTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCAT--GTC-AT--C-T-GTG--TTAA-----AA--AC-AAA------CTATTGTTATATGCAGATGATTC-TTGTA---TTC-TTGTTGCATGCTGA-G--GA----GGT----TCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC---------------------TTGTTAGTC--AGT---GGCTAGTGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTGGGCC---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTAATATTATATGCAGATGA--CAGTGTA---ATA-TTGTT---CGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGTTAGTTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-AAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATACCGA-AACTTTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGCATC--CTGGGCC---CTCTTTTATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTA---ATA-TTGTT---CGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A-----GTCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGG---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CTTGGCC---CTCTTTTATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATAT--GCCTAC--G-C-GTA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTC---ATG-TTGTT---CGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTAA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGAGGATTGCATT-TTTTATATGGA-AAATGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAAAGTGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTAT-CCTGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATC--CATGGCC---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAATGTA---AAA-TTGTT---CGCTAACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A--TG-----G-A---TATAGTTC-TG--CAA---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A-----GCCT--TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-A-TTTAC---AG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCA-T-TTTTATATCAA-AACTGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGAAAC--CTGGGCC---CTCTTTTATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGA---------------TTATTATTATATGCAGATGA--CAGTGTA---ATA-TTGTT---CGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18374 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccGTTCCTCGAGG---AAGTATCAATTG---------CTTTA--T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATAT--G
gi|18374 : ATA--AA----GAT----CCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A--TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaG---AAGTATA--CTGGGTCAGTTGCTTTTGTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT----GCATAA--G-T-AAA-----------AA-TGT-AAA------TAAT-CTTATATGCTGATGA--TAGTGCT---ATC-CTcttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgaaCAGGG---AAACATC--CTGTGCG---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATAT--GCCTAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-AAA------TTATTATTATATGCAGACGA--CAGTGTA---AAA-TTGTT---TGCTGACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GATT--TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-A-ATTAC---GG---T---AACATACA-ATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCA-T-TTTTATGTCGA-AACTGTTGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : GC-AAA------TTTCTTTTATATGTTGGTGA--ATACGGA---ATT-CTGTT---TACTGGGA--AATGCAAAT----CTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A--GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---GATTTGTAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaaaaA------TTATTCTC-TATGCCGATGA--TAGTGCT---ATT-CTTTT---C--TCACATGAA----GAT----CCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A--TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AG---T---GCTTTGTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG----------GTGCAATGT-TAAATAATGATTTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAATAA-A-TATTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--TTAGA---AC------GAC--T-----------CT--TT--GTAA-TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA--TTGTGCT---ATC-CTATT---CTCGCACA--AA----GAT----CCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AACTT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---GGTTAGCTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---GTTTAGTTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A-----GTGT--TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-A-TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---GGTTAGTTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A-----TATT--TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-A-TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAG-T-TTCTGTGTAGACAACA-CCGTAATTGTTT--A---AATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCAACT-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----aaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18373 ): GTTCCTGGAGGAAGTAGCCATTGCTTTCTTTTATGCTACATCAATGATAGGAGTGTCAGTATAAGTAAAAAATGTACAATAATTTTACATGCAAATGCTAGTACTATCCTTTTCTTGTATAAAGATCTTGATGTTGTTAATAATGTACTTGGCATGGAACTTGAAAATAAGAAGTCATCAAAGGCTGATAG
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 111111 2222222222222 444444444444444444444444444444444 11111 111 11111 1 2222 2222222 1111111111 1111 1111111 11 1111 11 1
lowQualScore : 1 1 0 777 0 2 2 1 333 1 1 2 2 4 1 1 4444 22 555555 888888888888888888888888 2 2 222222 5 3 1 4444 1 33 55555 33 0 66 4444 55555 0 333 2 1 777 333 6666666666666 55555 333 777 22 333 2 22 1 1 1 4 1 3 22 1 22 22 1 555555 888888888888888888888888888888888 1 44 555 3 66666 000 6 3 0 666 666 666 0 3 55555 2 2 2 5555 4444444 4 2 7777777777 6666 4 4 4444444 666 666 0 44 66 2 1 44444 2 1 2 555 33 555 555 4444 2 33 3333 33 8 55 666 7 1 33 2 1 4 1 888 1 1
lowQualScore : . . . ... . . . . ... . . . . . . . .... .. ...... ........................ . . ...... . . . .... . .. ..... .. . .. .... ..... . ... . . ... ... ............. ..... ... ... .. ... . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ................................. . .. ... . ..... ... . . . ... ... ... . . ..... . . . .... ....... . . .......... .... . . ....... ... ... . .. .. . . ..... . . . ... .. ... ... .... . .. .... .. . .. ... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 444 3 8 2 0 777 0 2 1 1 2 7 4 5555 99 888888 111111111111111111111111 2 2 444444 1 9 0 9999 0 55 44444 55 9 11 7777 00000 2 999 2 0 666 999 1111111111111 00000 555 111 66 333 0 00 0 0 0 2 8 2 55 0 55 55 0 888888 777777777777777777777777777777777 0 22 000 1 99999 888 2 1 3 444 444 444 5 6 55555 5 5 0 5555 5555555 0 3 5555555555 5555 0 1 0000000 444 444 3 99 77 9 0 99999 9 0 9 222 99 777 000 4444 1 99 6666 44 6 44 999 2 4 33 5 0 9 0 222 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGTATCCTGGGNC---CGCTTTTGTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAA-TGT-A-AA------TTATTNTTATATGCNGATGACAGTGCN---ATNCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAT----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCA-T-TTTTGTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCNTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGCATCCTGGGNC---CNCTTTTGTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAN-TGT-A-AA------TTATTNTTATATGCNGATGACAGTGCN---ATNCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---GGCTAGTTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A-----GNCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCA-T-TTTTGTATNGA-AACNGNCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATTTTGGGGC---CATTATTGTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA----AAA-TGTAA-AA------TCATTCTC-TATGCCTATGATAGTGCT---ATTCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GAT----TCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AATGC-A-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AGTGCT---TA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTCTGC----TACATCCATTGTGA-------ACAATA----TTG------------TT-A-AAAAGGTAAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTATAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA-TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGTATTTTGGGGC---CATTATTGTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----T--GAG----TATTAG-T-ATAAGTCAA----AAA-TGT-A-AAA-----TCATTCTC-TATGCCGATGATAGTGCT---ATTCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ACGCA-GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---C-AATTTTC---AG---TGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATAATGTT-AAAAAG-GTTAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTACAGA-CACAAACACTACT--TA--A---ATTTATCC--C--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAATT-CTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATTATGGGGC---CATAACTGTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTCAAAAATGT-A-AAA-----TTATTCTC-TATGCCGATGATAGTGCT---ATTCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GAT----CCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AACTA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---AGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAA-A-GTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--TA--A---A--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTAATT-CTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGTATTTTGGTGC---CATTTCTGTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAAAATGT-A-AAG-----TTATTCTC-TATGCCGATGATAGTGCT---ATTCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TAT----CCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A---------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---GATAAATAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---A-----ACGCAAGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-C-TTTATAATGG---T---CACAC-CATACAAGCACAA----CCATC--------------AGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATATTGTT-AAAATG-GTAAA-TTTTAGAATAACA-T-TTTTGTATA-------GACATGA-------------------AGAC--T-A---------CT--T-----AAAT---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGCATCTTAGGCC---CGCTTCTATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----T--GGT----TA---G-TAGCA--TTGACCCCGAA-TGT-A-AA------TAATTC-TATATGCTGATGACAGCACG---ATTCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAA----TATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT-------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCGGCTAGAATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C----g
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCTATTCTCAGGC---CACTTTTGTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----T--GCC----aaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAGGTTTA---ATTTTTGGAC---CACTACTGTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----T--G------TAA--GCT-G-----TGGTT--AAA-AAC-A-AA------TTATTGTTAGATGCAGATGAaattataacgaggacaaataatatatataataatgacctctatgcggatgattccactgtatatgaatctaatcgagattgatcaataattgaatctatactacaaattagattgaaaaatattgatgattggtgcaaacttaataacatgtcactacaacccggaaaatcaaaatgtatgatattaagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---GGCTAGTTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A-----GTC---TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtA-TGCCAGGTTGAAA-T-TCTTGTATCGT-AAGAAGGATTACC--TT--ACAAA----TCATAC--C-AA-GAC-A-CTC--CTT-GTCA-TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAGGTTCA---ATTCTTGGAC---CACTACTGTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----T--GTC----AGCT-G-T-GGT--TAAACAC---------A-AA------CTGTTGCTATATGCAGATGA
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---GGCTAGTGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAA-T-TCTTGTAGCGT-AAGAAGAATTACC--T---A---AC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATGT-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCTATACTAGGTC---CTATTA-GTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT--------GTC----TG------------TCG-------T-TGT-A-AAAAAAACTTCTT-TCATATGCTAATGAC--TTCCGAAATTCC-GGT---TACTG-GGA--AA----TACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA--TG-----TAA---A--------TG--AAT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A------------TCT--C-------A-G-----TCCAGT---C-A-T--------A---T---TACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGG---TTGAATTATTGGAC---CACTTCTGTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----T--GTC-----AT--C-T-GTG--TTAA-----AA--AC-A-AA------CTATTGTTATATGCAGATGATTCTTGT---ATTCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGT----TCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC---------------------TTGTTAGTC--AGT---GGCTAGTGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATCCTGGGCC---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-A-AA------TTAATATTATATGCAGATGACAGTGTA---ATATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGTTAGTTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-AAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATACCGA-AACTTTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGCATCCTGGGCC---CTCTTTTATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-A-AA------TTATTATTATATGCAGATGACAGTGTA---ATATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A-----GTCT--TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGG---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATCCTTGGCC---CTCTTTTATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----T--GCC----TAC--G-C-GTA--TCGACTCCGAT-TGT-A-AA------TTATTATTATATGCAGACGACAGTGTC---ATGTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A-----GACT--TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTAA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGAGGATTGCATT-TTTTATATGGA-AAATGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAAAGTGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTAT-CCTGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGCATCCATGGCC---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-A-AA------TTATTATTATATGCAGACGACAATGTA---AAATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A--TG-----G-A---TATAGTTC-TG--CAA---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A-----GCCT--TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-A-TTTAC---AG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCA-T-TTTTATATCAA-AACTGTCGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGAAACCTGGGCC---CTCTTTTATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGA----------------TTATTATTATATGCAGATGACAGTGTA---ATATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-A-TTTAC---GG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGTAGCC----AT---TGCTTTC--T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGT--GTCAGTATAA--G-T-AAA----------AAA-TGT-ACAA------TAATT-TTACATGCAAATGCTAGTACT---ATCCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GAT----CTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A--TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGTATC----AAT---TGCTTTA--T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----T--Gcttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GAT----CCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A--TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGTATACTGGGTCAGTTGCTTTTGTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT--------GCA----TAA--G-T-AAA-----------AA-TGT-A-AA------TAAT-CTTATATGCTGATGATAGTGCT---ATCCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAACATCCTGTGCG---CTCTTTTATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTCCGAT-TGT-A-AA------TTATTATTATATGCAGACGACAGTGTA---AAATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GAC----CCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A--TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---GGCTAGTTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A-----GATT--TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-A-ATTAC---GG---T---AACATACA-ATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCA-T-TTTTATGTCGA-AACTGTTGTTATT--TT--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAGTGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : GC-A-AA------TTTCTTTTATATGTTGGTGAATACGGA---ATTCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAAT----CTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A--GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---GATTTGTAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaaaaA------TTATTCTC-TATGCCGATGATAGTGCT---ATTCT-TTT---CTC---ACATGAA----GAT----CCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A--TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---GGTTAATAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA-----GGCT--TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-TTTTC---AG---T---GCTTTGTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG----------GTGCAATGT-TAAATAATGATTTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAATAA-A-TATTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--TTAGA---AC------GAC--T-----------CT--TT--GTAA-TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGATTGTGCT---ATCCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GAT----CCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AACTT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---GGTTAGCTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---GTTTAGTTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A-----GTGT--TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-A-TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---GGTTAGTTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A-----TATT--TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-A-TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAG-T-TTCTGTGTAGACAACA-CCGTAATTGTTT--A---AATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCAACT-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---GGTTGGTTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----aaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 555555555555555555555555555 11111 11111 111 11111 1 2222 2222222 1111111111 1111 1111111 22 111111111111111 11
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 22 111111111111111111111111111111111 333 4 2 4 2 4444 4 1 333 66666 4444 2 1 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 1 555 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 222222222222222222222222222 1 555 555 3 66666 11111 6666 222 0 3 55555 2 2 2 5555 4444444 4 2 7777777777 6666 4 4 4444444 666 666 0 00 1 2 11 66666 2 1 2 444 33 555555555555555 222 44444 2 33 8 77 666 2 8 4 0 333 4 1 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... .. ................................. ... . . . . .... . . ... ..... .... . . ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... . ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ........................... . ... ... . ..... ..... .... ... . . ..... . . . .... ....... . . .......... .... . . ....... ... ... . .. . . .. ..... . . . ... .. ............... ... ..... . .. . .. ... . . . . ... . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 99 333333333333333333333333333333333 555 2 1 0 9 2222 4 0 333 88888 7777 1 5 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 8 111 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 888888 888888888888888888888888888 0 444 000 1 99999 99999 6666 777 5 6 55555 5 5 0 5555 5555555 0 3 5555555555 5555 0 1 0000000 444 444 3 22 6 7 77 55555 7 0 7 555 77 888888888888888 111 11111 7 66 0 00 333 7 3 1 1 444 1 0 4 0 000 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TC-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTG-TNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----AGNCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNANA-T-TTTTGTATCGA-AACNGNCGTTACT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTA-AGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---NC-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTG-TNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----AGNCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNGCA-T-TTTTGTATNGA-AACNGNCGTTACT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTA-AGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCNTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TC-TTTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTG-TAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AATGC-AGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAATTT---TCAGTGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTCTGC----TACATCCATTGTGA-------ACAATA----TTG------------TT-A-AAAAGGTAAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTATAGA-CACAAACACTACT--T---A--A---ATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTA-A-TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----T--GAG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TC-TTTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTG-TAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-AGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAATTT---TCAGTGCTTA---GTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTACAGA-CACAAACACTACT--T---A--A---ATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTA-A-TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TC-TTTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTG-TAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAA-A-GTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--T---A--A---A--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTA-ATT-CTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TC-TTTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTG-TTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-AAGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-CTTTATAATGG---TCACAC-CATACAAGCACAA----CCATC--------------AGTCAAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT-------------CCATT---GTGA---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAA-TTTTAGAATAACA-T-TTTTGTATAGA-CATGAAGACTACT--T-----------------AAA----------------T--TTA--TACAGTG--------------TCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----T--GGT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TC-TTAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TG-TCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C----g
gi|18362 : attttcaaagtataaatctgtaacaTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttctgctctgattcgatgtcatttggtctattcatgttcttcttggtaccttagcttaaacaaagggttaa
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacatgtggcgttccacagggtagcatcttaggcccgcttctatttgttaccatgtaaatgacatggttagtagcattgaccccgaatgtaaataattctatatgctgatgacagcacgattcttatagcttataactaatatagtgttatttcttctaaattttgaagtgtgttggtgtcttgctcatctcggctagaatataataagctgtcatacatcttggtttaaccgagtgcgttatttttggctcaaaacgtagattaaagcaagttaacgattttaaaattgtttgaaatggacctattatttagtcgacacagtctgtgaaatatctaggtcttactcttgaaatttctttgtcaggtgaaactaatgtaaacagtaatgtgagtaaggtaaatttacgtcttaaagttttgtatatacaagcaaggttcatagatattaaaactagaaaatatatatgttcGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----T--GCC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATC-TAAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATAT-TGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----T--G------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcaca-TAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----AGTC----TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtA-TGCCAGGTTGAAA-T-TCTTGTATCGT-AAGAAGGATTACC--T---T--ACAAA----TCATAC--C-AA-GAC-A-CTC--CTT-GTC-A-TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----T--GTC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---
gi|18365 : tattacaTTG-TTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAA-T-TCTTGTAGCGT-AAGAAGAATTACC--T------A---AC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCA-TGT-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT--------GTC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TC-CGGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A---------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-------TCT---C-------A-G-----TCCAGT---C-AT--------A---TTACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----T--GTC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGA---------C-GGAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---AT-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTG-TTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----AGACT---TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-AAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATACCGA-AACTTTCGTTATT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATA-AGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---AT-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTG-TTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----AGTCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGG---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA-AGTGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----T--GCC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GT-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTG-TTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----AGACT---TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTAA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGAGGATTGCATT-TTTTATATGGA-AAATGTCGTTATT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAA-AGTGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTAT-CCTGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---AT-TGTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----G-A---TATAG-TTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----AGCCT---TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-ATTT---ACAG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCA-T-TTTTATATCAA-AACTGTCGTTATT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATA-AGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---AT-TGTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTG-TTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-ATTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTCAAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTCGTTACT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA-AGTGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGT--GTCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CC-TTTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----T--Gcttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT--------GCA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CC-Tcttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---AT-TGTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTG-TTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----AGATT---TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-AATT---ACGG---TAACATACA-ATGGTCATAAAA-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATCAAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAACGGTGA---G---GCGATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCA-T-TTTTATGTCGA-AACTGTTGTTATT--T---T--A---ACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATA-AGTGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TC-TGTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA-----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TC-TTTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTG-TAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCAGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAATTT---TCAG---TGCTTTGTA-ATGGTCACA-----CCATACAAGCACAAACATCAGTCAAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG----------GTGCAATGT-TAAATAATGATTTGTCTGCTACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAATAA-A-TATTTTGTATAGA-CATAAACACTACT--T---TAGA---AC------GAC--T-----------CT--TT--GTA-A-TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CC-TATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTG-TAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTG-TAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----AGTGT---TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-ATTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTG-TAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----ATATT---TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-ATTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAG-T-TTCTGTGTAGACAACA-CCGTAATTGTT---T--A---AATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCA-ACT-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataa-TAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18382 : T-AATAAAGGCAAA-TGCTTGGTTAAAG-T-TTCTATACCGA-AAAAGCCAGTACT--TGACT--A---AGCA-T---AC----AA-GAA-A-ACTA-TTG-GTA----GCATC--------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
gi|18383 : tattaagtggttggttgacaacaaacttttattgcatcttgggaagacagaatcaattattttcggatctaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattcGACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 555555555555555555555555555 11111 11111 111 111111 1 2222 2222222 1111111111 1111 1111111 11 111111 1111 11 111111
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 22 111111111111111111111111111111111 333 4 2 4 2 4444 4 1 333 66666 5555 33 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 666 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 666666666666666666666666666 1 555 888 2 55555 11111 77777 555 111 1 3 0 777777 55 1 0 3333 7777 3333333 3 5 5555555555 5555 3 66 3333333 3 6666 555 22 99 1 2 33 3 1 2 2 6 33 333 444 33 111111 1111 33 33 88 2 33 8 77 777 111111 0 2 5 1 4 1 888 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... .. ................................. ... . . . . .... . . ... ..... .... .. ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ........................... . ... ... . ..... ..... ..... ... ... . . . ...... .. . . .... .... ....... . . .......... .... . .. ....... . .... ... .. .. . . .. . . . . . .. ... ... .. ...... .... .. .. .. . .. . .. ... ...... . . . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 99 333333333333333333333333333333333 555 2 1 0 9 2222 4 0 333 88888 2222 66 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 999 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 888888 666666666666666666666666666 0 000 333 9 77777 55555 11111 888 777 0 3 1 666666 00 4 9 2222 7777 8888888 6 7 9999999999 0000 6 55 3333333 6 5555 888 11 33 9 7 33 6 0 7 7 7 44 444 777 77 111111 0000 55 77 55 7 00 0 00 888 777777 8 5 0 0 0 0 111 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----AGNCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AAATATCTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAA-TTCNNGGATNANA-T-TTTTGTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----AGNCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCACGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAAGTTAA-TTCNAGGATNANA-T-TTTTGTATCGA-AACNGNC---GTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATGCNTGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AATGC-AGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-----TTT---TCAGTGCTTA---GTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTCTGC----TACATCCAT-TGTGA-------AC-AATA----TTG------------TT-A-AAAAGGTAAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTATAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A--AATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGATACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----T--GAG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-AGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-----TTT---TCAGTGCTTA---GTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT--------------C-CATT---GTGA---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAA-TTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTACAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A--AATTTATC--CC--T-TA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaATTGTT-AAAAAG-GTAAA-TTCTAGAATAAAA-A-GTTTGTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---A--AA--T-TTATCC--TTAA-GAC-AGACTA-TTT-GTAAT---T-CTTTAATACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAgacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatattgttaaaaaggtaaattctagaataaaaagtttgtatagacataaacactacttaaatttatccttaagacagactatttgtaattctttaatacagtgtcattttgattatgcatgtccttcatggtaaagtggtatacaaaaacgtttaag
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtatgtggagttcctcaaggaagtattatggggccataactgtttttaatgtaaatgatatgagcatgagtataagtcaaaaatgtaaaattattctctatgccgatgatagtgctattctttttctcacataaagatcctgatgtaattagtgaagttttaggcaatgaactagaaaagtgtaataaatagttaatagacaacaaactgtcattacatcttggaaagacagaatgtatattatttaggacaaaacgcaggcttgcttaagtgaaacaatttttagtgctttgtaatggtcacatcatacaagcacaaacatcagtcaaatatctcggtgcaatgttagataatgatttgtctgctacatccactttgaacaatTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----T--GAG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-AAGCTTGCTAAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-C-----TTTATAATGG---TCACAC-CATACAAGCACAA------CCATC--------------AGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT----------GTC---TGC-TACAT--------------C-CATT---GTGA---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAA-TTTTAGAATAACA-T-TTTTGTAT-------AGAC---ATGA-------------------AGAC--T----------ACT-------TAAA---T---TTA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----T--GGT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C---------------------A-----AAACG---TAGATT-AA-A-----GCAAGT---T-AACGATTTT---AAAA---TTGTTTGAA-ATGG--ACCTATTATTTAGTC----GA-CAC----AGTCTGTGAAATATCTAGG------TCTTACTCTT-GA-AA----------TT----TCT-TTGTCAGGTGA---A---ACTAAT----GTAA---ACAGTAATG-T-GAGTAAGGTAAA-TTTACGTCTTAAA-G-TTTTGTAT--A-TACAAGCAAGGTT-CA--T---A--GATAT-TAAAAC--T--A-GAA-A-A-T--ATA--TATGTTCTGCTCTGATTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAg
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----T--GCC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATCT-AAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATATTGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----T--G------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----AGTC----TAAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----T--GTC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---tataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAA-TGCCACGTTGAAA-T-TCTTGTAGCGT-AAGAAGA---ATTACC--T------AAC-----AAATCGT-ACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATG---T-CTTTGATTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT--------GTC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TCC-GGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A--------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-------TCT---C-------A-G-----TCCAGT---C-A-----T--------A---TTACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----T--GTC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAGTC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----AGACT---TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-AAGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATACCGA-AACTTTC---GTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-TAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----AGTCT---TAAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGG---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAGTACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----T--GCC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----AGACT---TAAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTAA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAAAAGTTAA-TTCGAGGATTGCATT-TTTTATATGGA-AAATGTC---GTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-AAAAG---TGCCTTAGTACAAAGTCATTTTGATTAT-CCTGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---ATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----GAT---A-TAGTTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----AGCCT---TAAA---AA-G-----TGCAGT---C-A-----TTT---ACAG---TTACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT--AAAATAGTTAA-TTCGCGGATTGCA-T-TTTTATATCAA-AACTGTC---GTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-T-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-A-----TTT---ACGG---TTACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAA-TTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAGTACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGT--GTCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----T--Gcttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT--------GCA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----T--GCC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---ATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----AGATT---TAAA---AA-AG----TTCAGA---C-A-----ATT---ACGG---TAACATACA-ATGGTCATAAA--A-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATC----AAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA----------GT----TAC-TAAAC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGCT--AAAAAAGTTAA-TTTGCGGATTGCA-T-TTTTATGTCGA-AACTGTT---GTTATT--T---T--AACCT-TCAAAC--T-AA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAGTACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCAGGCT---TGCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-----TTT---TCAG---TGCTTTGTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG----------GTGCAATGT-TAAAT-AATGATTTGTCTGC-TACACCCATTGTGAACAATATTGTT---AAAAAGGTAACTTCTAGAAT-AAA-TATTTTGTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---TAGAAC------GAC--T-----------CT--TT--GTAA----TTCTTTAATACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----AGTGT---TGAA---AG-A-----TTCAATGTAC-A-----TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----ATATT---TAAA---AATA-----TTCAATGAAC-A-----TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAA-TTCCAGGCTGAAG-T-TTCTGTGTAGACAACA-CC---GTAATTGTT---T--AAATA-TGAACC--T-CA-GAA-A-AAGG-TTATGCAAC---T-CTTTAATACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18382 : T-AATAAAGGCAAA-TGCTTGGTTAAAG-T-TTCTATACCGA-AAAAGCC---AGTACT--TGACT--AAGCA-T---AC----AA-GAA-A-ACTA-TTG-GTA------GCATC-------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
gi|18383 : tattaagtggttggttgacaacaaacttttattgcatcttgggaagacagaatcaattattttcggatctaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattcGACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 555555555555555555555555555 111111111111111 11111 11111111111 22222222 1 22222 3333333 11111111111 1111111111111 1111111111111 11 1111
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 44444444444444444444444444444444444 333 2 2 6 2 4444 4 1 333 66666 5555 33 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 666 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 777777777777777777777777777 5555 1 444 222222222222222 2 44444 22222222222 77777 555 555 22 3 0 33333333 55 2 3 88888 7777 1111111 0 3 5 3 88888888888 77777 5555555555555 44 7777 0 555 44 99 7 1 22 3 1 2 2 5 22 333 444 33 4444444444444 222 55 4 2 33 7 55 777 4444 5 0 44 1 4 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... ................................... ... . . . . .... . . ... ..... .... .. ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ........................... .... . ... ............... . ..... ........... ..... ... ... .. . . ........ .. . . ..... .... ....... . . . . ........... ..... ............. .. .... . ... .. .. . . .. . . . . . .. ... ... .. ............. ... .. . . .. . .. ... .... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 22222222222222222222222222222222222 555 1 1 0 9 2222 4 0 333 88888 2222 66 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 999 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 555555 666666666666666666666666666 7777 0 777 555555555555555 7 77777 66666666666 33333 444 444 66 1 5 22222222 00 5 3 44444 1111 9999999 4 3 8 3 99999999999 44444 2222222222222 33 3333 4 444 44 55 1 4 00 4 0 5 5 6 66 444 444 44 9999999999999 777 99 9 5 88 5 99 888 1111 6 1 22 0 0 2 0 000 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNCT---T---------AAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAA--ATTCCGTCCNAGGA-AAA----GGTC----AAATATCTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TGCTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAA-T-TTTTGTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNCT---T---------AAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-ACGGTCACGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AAATATCTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNNGGATNANA-T-TTTTGTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGT-A-AAATCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ATGCAGGCT---T---------GCT---AA-A-----GTGAAA---C-AA----TTT---T-CAG---TGCTTA---GTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTTGG------TGCAA-TGTTAGATAATGATTTTTC----TGCTA-C---AT--------------C-CATT---GTGA---ACAATATTGTT-AAAAA-GGTAAATTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTATAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TTA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----TG--AG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-A----GGCT---T---------GCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-----TTT---T-CAGTGCT---TA---GTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT-G------TC---TGCTA-C---AT--------------C-CATT---GTGA---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAATTCTAGAATAAAA-T-TTTTGTACAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TTA-GAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGGA------C----------------AA---AACGC-A----GGCT---TGCTTAAGTGAAA---CA-A-----TT---------------TTT---AGTGC---T---T---TGTA-ATGGTCAC-----AT--CATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTAGATAAT-GATTT-G------TC---TGCTACATCCAC-TTTGA-------AC-AATA----------------TTGTT--AAAAAGGTAAATTCTAGAATAAAA-A-GTTTGTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---A---AA--T-TTATCCT-TAA-GAC-AGACTA-TTT-GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAg
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-A----AGCTTGCT---------AAAGTGAA-ACAGTTTTCAGT---G-C-----TTTATAA-TGG---T---CACAC-CATACAAGCACAA------CCATC--------------AGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTAGCTAAT-GATTT-G------TC---TGCTA-C---AT--------------C-CATT---GTGA---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAATTTTAGAATAACA-T-TTTTGTAT-------AGAC---ATGA--------------------AGAC--T---------ACT-------TAAA---T---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----TG--GT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C---------------------A-----A----AACG---T---------AGATT-AA-A-----GCAAGT---T-AACGATTTT---A-AAA---T---TGTTTGAA-ATGG--ACCTATTATTTAGTC----GA-CAC----AGTCTGTGAAATATCTAGG------TCTTACTCTT-GA-AA-T------T----TCTTT-G---TCAGGTGA---A---ACTAAT----GTAA---ACAGTAATG-T-GAGTAAGGTAAATTTACGTCTTAAA-G-TTTTGTAT--A-TACAAGCAAGGTT-CA--T---A---GATAT-TAAAAC--T-A-GAA-A-A-T--ATA--TATGTTCTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAg
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----TG--CC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATCT-AAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATATTGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----TG--------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A----GTC----T---------AAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtATGCCAGGTTGAAA-T-TCTTGTATCGT-AAGAAGG---ATTACC--T---TACAAA----TCATAC--CAA-GAC-A-CTC--CTT-GTCA----TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----TG--TC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----ttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18365 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcATG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAATGCCACGTTGAAA-T-TCTTGTAGCGT-AAGAAGA---ATTACC--T-------AAC-----AAATCGTACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATG---T-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT------G--TC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TCC-GGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A--------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-----------TCT---C----------------A-G-----TCCAGT---C-A-----T---------A---T---TACATGTA-ATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----TG--TC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAGTC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GACT---T---------AAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-AAGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AACTATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAATTCGCGGATTGCT-T-TTTTATACCGA-AACTTTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-TAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A----GTCT---T---------AAA---AA-A-----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGCA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGG---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----TG--CC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A----GACT---T---------AAA---AA-AG----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCATGGA-AAA----TGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTAA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAATTCGAGGATTGCATT-TTTTATATGGA-AAATGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-AAAAG---TGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---ATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----GAT---A-TAGTTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A----GCCT---T---------AAA---AA-G-----TGCAGT---C-A-----TTT---A-CAG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCACAGGA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAATA-GTTAATTCGCGGATTGCA-T-TTTTATATCAA-AACTGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-T-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---AA-G-----TTCAGT---C-A-----TTT---A-CGG---T---TACATGCA-ACGGTCATGAA--ATTCCGTCCCAGGA-AAA----GGTC----AAATATTTAGG------ATTAACTATT-GAAAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCT-T-TTTTATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGTG--TCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----TG--cttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT------G--CA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---ATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GATT---T---------AAA---AA-AG----TTCAGA---C-A-----ATT---A-CGG---T---AACATACA-ATGGTCATAAA--A-TCCGTCCCAGGA-AAA----GATC----AAATATTTAGG------ATAAACTATT-GACAA-G------T----TACTA-A---AC-GGTGA---G---GC-GATA---GTTG---ACTCCATTGCT-AAAAAA-GTTAATTTGCGGATTGCA-T-TTTTATGTCGA-AACTGTT---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TAA-GAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA----GGCT---T---------GCT---AA-A-----GTGAAA---CAA-----TTT---T-CAG---T---GCTTTGTA-ATGGTCACA-------CCATACAAGCACAAACATCAGTC----AAATATCTAGG--------TGCATATG-GA-AG-G------TGCAATGTTA-A---AT-AATGATTTGTCTGC-TACACCCATTGTGAACAATATTGTT--AAAAAGGTAACTTCTAGAAT-AAA-TATTTTGTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---TAG-AAC------GAC--T----------CT--TT--GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A----GTGT---T---------GAA---AG-A-----TTCAATGTAC-A-----TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A----TATT---T---------AAA---AATA-----TTCAATGAAC-A-----TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAATTCCAGGCTGAAG-T-TTCTGTGTAGACAACA-CC---GTAATTGTT---T---AAATA-TGAACC--TCA-GAA-A-AAGG-TTATGCAAC---T-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T-----cagt
gi|18382 : T-AATAAAGGCAAATGCTTGGTTAAAG-T-TTCTATACCGA-AAAAGCC---AGTACT--TGACT---AAGCA-T---AC---AA-GAA-A-ACTA-TTG-GTA------GCATC--------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattctaataaaggcaaatgcttggttaaagtttctataccgaaaaagccagtacttgactaagcatacaagaaaactattggtagcatctgtcacttcgattattcattttctttctggtatctcagtttgactcaaaa
gi|18383 : tattaagtggttggttgacaacaaacttttattgcatcttgggaagacagaatcaattattttcggatctaaacctcggttaatatctcaatccagtttgaatagtatatgtaaagtgactattattcaggcagccaagtcagttaaatatcttggtgctacactcgagctgtatctatcttatggcgaattagctaggataattcGACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111 222222222 1 333333 3333333 11111111111 2222222222222222222222 1111 1111111 1111 11 1111
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 44444444444444444444444444444444444 333 2 2 6 2 4444 4 1 333 66666 5555 33 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 666 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 7 0 2 777777777777 7777 777777777777 2 3 444444444 555 0 0 3 4 1 333333 6666 1111111 2 0 5 2 2 99999999999 555 3333333333333333333333 5555 555 0000 6666 777 99 3 1 22 3 1 2 2 5 22 333 444 33 1111111 9999 0 88888 33 7 55 777 4444 5 0 44 1 4 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... ................................... ... . . . . .... . . ... ..... .... .. ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ........................................................... .... . . . . ............ .... ............ . . ......... ... . . . . . ...... .... ....... . . . . . ........... ... ...................... .... ... .... .... ... .. . . .. . . . . . .. ... ... .. ....... .... . ..... .. . .. ... .... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 22222222222222222222222222222222222 555 1 1 0 9 2222 4 0 333 88888 2222 66 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 999 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 555555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000 4 1 3 4 555555555555 4444 555555555555 5 5 888888888 000 4 7 0 3 4 000000 1111 1111111 9 7 7 9 9 55555555555 000 7777777777777777777777 1111 000 1111 7777 444 55 8 4 66 4 5 5 5 6 66 444 444 44 2222222 2222 8 44444 88 5 99 888 1111 6 1 22 0 0 2 0 000 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCACGA-A--ATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----GGTC----AAATATCTAGG------GTTA-ACTATT-GACAA-G------T----TG---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCACGA-A--ATTC---CGTCCNAGGA-AAA-----GGTC----AAATATCTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TG---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGT-A-AAATCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ATGCAGGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---C-AA----TTT--T-CAG---TGCTTA----GTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-AGTC----AAATATCTTGG------TGCA-A-TGTTAGATAATGATTTTTC----TG---CTA---C---AT--------------C---CA---TT---GTGA---ACAATATTGTT-AAAAA-GGTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTATAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----TG--AG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAGTGCT---TA----GTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-AGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTT-G------TC---TG---CTA---C---AT--------------C---CA---TT---GTGA---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTACAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGGA------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---TGCTTAAGTGAAA---C----A-A-TT----------------TTT--AGTGC---T---T----TGTAATGGTCAC------AT-----CATACAAGCACAAACATC-AGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTT-G------TC---TG---CTAC--ATCCACTTT-GA-------AC---AA---T----------------ATTGTT--AAAAAGGTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---A---AA--T-TTATCCT-TA-AGAC-AGACTA-TTT-GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAg
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-A----AGC----TTGCT---------AAAGTGA----A-A---CA-GT-----------TTT----CAG---T---GCTT-TATAATGGTCACA--------C---CATACAAGCA-CAACCATCAGTC----AAATATCTCGGTGCAATGTTA-GCTAAT-GATTT-G------TC---TG---CTA---C---AT--------------C---CA---TT---GTGA---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAATTTTAGAATAACAT-TTTT-GTAT-------AGAC---ATGA--------------------AGAC--T---------ACT-------TAAA---T---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----TG--GT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C---------------------A-----A----AAC----G---T---------AGATT-A----A-A-GCAA-GT---T-AACGATTTT--A-AAA---T---TGTT-TGAAATGG--ACCT-ATTATTT---AGTC----GA-CAC-----AGTCTGTGAAATATCTAGG------TCTT-ACTCTT-G--AA-A------T----TT---CT---------TTGT-CA---G---GT---GAAACTAAT-GTAA---ACAGTAATG-T-GAGTAAGGTAAATTTACGTCTTAAAG-TTTT-GTAT--A-TACAAGCAAGGTT-CA--T---A---GATAT-TAAAAC--T--AGAA-A-A-T--ATA--TATGTTCTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAg
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----TG--CC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATCT-AAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATATTGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----TG--------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A----GTC--------T---------AAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtATGCCAGGTTGAAAT-TCTT-GTATCGT-AAGAAGG---ATTACC--T---TACAAA----TCATAC--CA-AGAC-A-CTC--CTT-GTCA----TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----TG--TC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----------------AA---A-----A----TAC------------------------A----A-A-TTAAGGT---C-------TTA--A-TGG-------TACAGTG-ATCGGACCCAC-A--CTTT---C------------------AGTT----AAATATC-ATG------GTGC-AATATTGGATCA-G-----------TG---TTT---A---TCTTTCGA---T---GT---CA---TG---GTTC---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAATGCCACGTTGAAAT-TCTT-GTAGCGT-AAGAAGA---ATTAC---C---T---AA-----CAAATCGTACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATG---T-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT------G--TC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TCC-GGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A--------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-----------TC----T---C--------------------A-G-TCCA-GT---C-A-----T--------A---T---TACA-TGTAATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----TG--TC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAGTC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAAAGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----GGTC----AACTATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATACCGA-AACTTTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-ATAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A----GTC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGCA-AAA-----GGTC----AAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-GG---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----TG--CC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCATGGA-AAA-----TGTC----AAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-AA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAAAAG-TTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATATGGA-AAATGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-AAAAG---TGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---ATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----G-A---TATAGTTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A----GCC----T---T---------AAA---A----A-G-TGCA-GT---C-A-----TTT--A-CAG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCACAGGA-AAA-----GGTC----AAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-AAAATA-GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATATCAA-AACTGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-T-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---A----A-G-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----GGTC----AAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GAAAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGTG--TCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----TG--cttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT------G--CA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---ATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAT----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GA---C-A-----ATT--A-CGG---T---AACA-TACAATGGTCATAA-A--A-TC---CGTCCCAGGA-AAA-----GATC----AAATATTTAGG------ATAA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA---A---ACGGT-GA---G---GC---GA---TA---GTTG---ACTCCATTGCT-AAAAAA-GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGTCGA-AACTGTT---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAG---T---GCTT-TGTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-AGTC----AAATATCTAGG--------TG-CATATG-GA-AG-G------TGCAATG---TTA---A---ATAAT-GATTTGTCTGC---TA---CACCCATTGTGAACAATATTGTT--AAAAAGGTAACTTCTAGAAT-AAATATTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---TAG-AAC------GAC--T----------CT--TT--GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A----GTG----T---T---------GAA---A----G-A-TTCA-ATGTAC-A-----TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A----TAT----T---T---------AAA---A----ATA-TTCA-ATGAAC-A-----TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAACA-CC---GTAATTGTT---T---AAATA-TGAACC--TC-AGAA-A-AAGG-TTATGCAAC---T-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T----------------A-----A----ACCTCGGT---T---------AAT---ATCTCA-A-TCCA-G------------TTTGAA-TAG-------TATA-TGTAA-AGTGACTATT--ATTCAGGCAGCCAAGTC-A--------GTT----AAATATCTTGGT-----GCTACACT------CGA-G------C----TGTATCTATCTT---ATGGC-GAATTA---GCTAGGA---TA---ATT-----CT---------AATAAAGGCAAATGCTTGGTTAAAGT-TTCT-ATACCGA-AAAAGCC---AGTACT--TGACT---AA----GCATAC---A-AGAA-A-ACTA-TTG-GTA------GCATC--------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAcagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111 222222222 1 333333333 3333333 1111 1111111111111 11111111 1111111 1111 11 1111
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 44444444444444444444444444444444444 333 2 2 6 2 4444 4 1 333 66666 5555 33 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 666 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 7 0 2 777777777777 7777 777777777777 2 3 444444444 555 0 0 3 2 1 666666666 7777777 2 0 2 44 7777 555 77777 9999999999999 0 11111111 777777 666 99 3 1 22 3 1 2 2 5 22 333 444 33 1111111 9999 0 88888 33 7 55 777 4444 5 0 44 1 4 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... ................................... ... . . . . .... . . ... ..... .... .. ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ........................................................... .... . . . . ............ .... ............ . . ......... ... . . . . . ......... ....... . . . .. .... ... ..... ............. . ........ ...... ... .. . . .. . . . . . .. ... ... .. ....... .... . ..... .. . .. ... .... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 22222222222222222222222222222222222 555 1 1 0 9 2222 4 0 333 88888 2222 66 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 999 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 555555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000 4 1 3 4 555555555555 4444 555555555555 5 5 888888888 000 4 7 0 0 4 999999999 9999999 9 1 9 11 5555 000 44444 1111111111111 1 11111111 111111 666 55 8 4 66 4 5 5 5 6 66 444 444 44 2222222 2222 8 44444 88 5 99 888 1111 6 1 22 0 0 2 0 000 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCACGA-A--ATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----G---GTCAAATATCTAGG------GTTA-ACTATT-GACAAGT----TG---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCACGA-A--ATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----G---GTCAAATATCTAGG------GTTA-ACTATT-GACAAGT----TG---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGT-A-AAATCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ATGCAGGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---C-AA----TTT--T-CAG---TGCTTA----GTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTTGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTTTTC---TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATATTGTT-AAAAA-GGTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTATAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----TG--AG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAGTGCT---TA----GTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTTGTC---TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTACAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGGA------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---TGCTTAAGTGAAA---C----A-A-TT----------------TTT--AGTGC---T---T----TGTAATGGTCAC------AT-----CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTTGTC---TG---CTACATCCACTTT-GA-------ACAA---T------------------ATTGTT--AAAAAGGTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---A---AA--T-TTATCCT-TA-AGAC-AGACTA-TTT-GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAg
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-A----AGC----TTGCT---------AAAGTGA----A-A---CA-GT-----------TTT----CAG---T---GCTT-TATAATGGTCACA--------C---CATACAAGCA-CAACCATCA---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GCTAAT-GATTTGTC---TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAATTTTAGAATAACAT-TTTT-GTAT-------AGAC---ATGA--------------------AGAC--T---------ACT-------TAAA---T---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----TG--GT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C---------------------A-----A----AAC----G---T---------AGATT-A----A-A-GCAA-GT---T-AACGATTTT--A-AAA---T---TGTT-TGAAATGG--ACCT-ATTATTT---AGTC---GAC-ACA-----GTCTGTGAAATATCTAGG------TCTT-ACTCTT-G--AAAT----TT---CT-------TTGT-CA---G---GTGAAACTAAT-GTA--A---ACAGTAATG-T-GAGTAAGGTAAATTTACGTCTTAAAG-TTTT-GTAT--A-TACAAGCAAGGTT-CA--T---A---GATAT-TAAAAC--T--AGAA-A-A-T--ATA--TATGTTCTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAg
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----TG--CC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATCT-AAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATATTGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----TG--------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A----GTC--------T---------AAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtATGCCAGGTTGAAAT-TCTT-GTATCGT-AAGAAGG---ATTACC--T---TACAAA----TCATAC--CA-AGAC-A-CTC--CTT-GTCA----TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----TG--TC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----------------AA---A-----A----TAC------------------------A----A-A-TTAAGGT---C-------TTA--A-TGG-------TACAGTG-ATCGGACCCAC-A--CTTT---C------------------A---GTTAAATATC-ATG------GTGC-AATATTGGATCAG-----TG---TTT-A---TCTTTCGA---T---GTCA---TG---GTT--C---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAATGCCACGTTGAAAT-TCTT-GTAGCGT-AAGAAGA---ATTAC---C---T---AA-----CAAATCGTACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATG---T-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT------G--TC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TCC-GGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A--------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-----------TC----T---C--------------------A-G-TCCA-GT---C-A-----T--------A---T---TACA-TGTAATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----TG--TC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAGTC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAAAGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---GTCAACTATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATACCGA-AACTTTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-ATAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A----GTC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGCA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-GG---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----TG--CC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCATGGA-AAA-----T---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-AA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAG-TTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATATGGA-AAATGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-AAAAG---TGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---ATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----G-A---TATAGTTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A----GCC----T---T---------AAA---A----A-G-TGCA-GT---C-A-----TTT--A-CAG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCACAGGA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAATA-GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATATCAA-AACTGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-T-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---A----A-G-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCATGA-A--ATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GAAAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGTG--TCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----TG--cttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT------G--CA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---ATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAT----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GA---C-A-----ATT--A-CGG---T---AACA-TACAATGGTCATAA-A--A-TC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---ATCAAATATTTAGG------ATAA-ACTATT-GACAAGT----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGCT-AAAAAA-GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGTCGA-AACTGTT---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAG---T---GCTT-TGTAATGGTCACA--------C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTAGG--------TG-CATATG-GA-AGGTGCAATG---TTA-A---ATAAT-GATTTGTCTGCTA---CACCCATT--GTGAACAATATTGTT--AAAAAGGTAACTTCTAGAAT-AAATATTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---TAG-AAC------GAC--T----------CT--TT--GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A----GTG----T---T---------GAA---A----G-A-TTCA-ATGTAC-A-----TTaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A----TAT----T---T---------AAA---A----ATA-TTCA-ATGAAC-A-----TTgtaatggacacactatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAACA-CC---GTAATTGTT---T---AAATA-TGAACC--TC-AGAA-A-AAGG-TTATGCAAC---T-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T----------------A-----A----ACCTCGGT---T---------AAT---ATCTCA-A-TCCA-G------------TTTGAA-TAG-------TATA-TGTAA-AGTGACTATT--ATTCAGGCAGCCAAGTC-A-----------GTTAAATATCTTGGT-----GCTACACT------CGAGC----TGTATCT------ATCTT-AT---G---GCGAAT-TA---GCTAGG---A--TAATT-CT-AATAAAGGCAAATGCTTGGTTAAAGT-TTCT-ATACCGA-AAAAGCC---AGTACT--TGACT---AA----GCATAC---A-AGAA-A-ACTA-TTG-GTA------GCATC--------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAcagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
blockSeqs : A T TTG TTA G G AGT A AG C C G G T GGAG CCAATTATAACGAGGACAAAT AAT A C A C GACC A C TTC CGAA GAAT TG GCA T TGT T TA TACA AAG A G TTA TGA TTTTATCTACA AACTA CTA TAA CT CTC GT C A AT G G A A G G AT A TA TC G ATAACC TAAACGTAAGTTAGCAAATATTTAAA TCTC T G G TTAACGAT GAA TGCTTA T T CTATTATT AGG A C C CCATCA TGCAATG C G TT GCAA TAT CATCC AATGATTTGTCT AACTAAT GTGA AAT AA G T TA A A A T A CA AAA AAG GT TACA TTTA CGTAC GC G CC ATG GTTC T GA G A T A AGT A C
blockSeqs : A T . TCA G G . A G . . G G A . AGTATTAGTATAAGTCAAA AT . . G C . C C . AT T T . T AC C TG TGCA . . G T . CAAATTAGAT . . TAG . . . . A AT A T A A . G . A . . G . AAAACGCAGGCTTGCTTAAGTGAAA . . G . TGTACA AG TGCTT T T TATTATT . A C C CATCA TGCAATG . . TT C . C TTTCGAT CACCC AGG AAT G G A TA A A . . A C AAA . . GACT TAT TTA A G C TG A T A G A T A AGT A C
blockSeqs : A T . . G G . A G . . . A A . AGCATTAGCATAAGTCAAA AT . . . C . A C . T T T . G TC T . TT . . A T . GCAATGAAC . . AA . . . . A TT T T A A . G . A . . G . TAAGAATGAGTTAGCGAGTGTTGAA . . G . TGAACA T TTGTT T T ACACTT . A C C CATCA TGCAATG . . TT C . C TGTCAG ATTA A AGT A G A TA A C . . C C AGA . . TAG CCT TT C . A TG G G A G A T A CTT A C
blockSeqs : C T . . A C . G G . . . A A . GTTAGTAGCATTGACCCCG AT . . . C . A T . T T T . G AC T . . . . C T . GCAATGAAC . . AA . . . . A AC A T T C . G . T . . C . AAAACGCAAGCTTGCTAAAGTG . . . . ACAA A TACAG A T GAAATT . C A . CATCA TG . . TC C . A GGTGAG TT A TCA A G A AC T A . . C T AAG . . A CCT CA A . G TG G G A T A T T TAT C G
blockSeqs : T T . . C G . A A . . . A A . CCTACGTGCATCGACTCCG AT . . . A . A G . T T T . A TT G . . . . A T . TCGTATCA . . TA . . . . T TC A C A A . G . G . . T . AAAATTTTTGCTTAAGTCTAAA . . . . ACAA A TTACA T C GAAATT . C G . GTCT T . . CA . . A GGTGGG TT A TCC A G T CA G A . . C A AAG . . A CCT TA C . A AT G G A G C T A AAC T A
blockSeqs : A G . . T A . A G . . . G G . CCTACGTGCATCGACTCCG AA . . . G . A A . G T A . G TG C . . . . A T . TCGTATCA . . CT . . . . T CC T G T T . C . C . . A . TAAAAACGCAGGCTTGCT . . . . TCA A TTACA C T GAAATT . A C . A G . . CA . . A GGTAAG TG C TCC A A T CA G A . . C A AAG . . A CCT TA G . . AA G G G G C T A GCC T A
blockSeqs : A G . . T A . A G . . . G A . CCTACGCGTATCGACTCCG AC . . . G . A A . T T G . G TG C . . . . G T . TCGTATCA . . GA . . . . G AT G G T T . C . T . . A . AAAACGCAGGCTTGCT . . . . TCA A TTACA C A GAAATT . C G . G A . . CA . . A GGTGAG TA G TCC T G T GC T C . . G A TTT . . T CCT TA G . . AA G G G T C G T GCC T A
blockSeqs : G C . . A T . A G . . . G C . CCTACGTGCATCGACTCCG TT . . . T . A T . A A G . G TG C . . . . C T . TCGAATCA . . AG . . . . T CC T T G A . C . T . . T . TTCTAGAAGACTTAAA . . . . TCA A TTACA C C GAAATT . C G . G A . . CA . . A GGTGAG TA G TCC A A T GC T C . . C A TGT . . T CCT TA G . . AA G G G T C G T GCT T A
blockSeqs : A G . . G A . T G . . . G A . CCTACGTGCATCGACTCCG TT . . . G . A A . A A G . G TG C . . . . C T . TCGCATAA . . TC . . . . G CC G G T T . C . C . . C . TTTTGGAAGTCTTAAA . . . . TCA A TTACA C C AAAAT . C G . T A . . AA . . A GGTGAG TA G TCC A G T GA T C . . C A TGT . . T ATA TA G . . AA G G G C G G A GCC T A
blockSeqs : C A . . G C . T A . . . G C . CCTACGTGCATCGACTCCG TT . . . A . A A . C G G . G TG C . . . . C T . TCGTATCA . . TC . . . . T CC T A C C . G . G . . C . TTTTAAAAGACTTAAA . . . . TCA A TTACA C C AT . A G . G A . . CA . . A CTTATG TA G TCC A G T GC T C . . C A TGT . . T T TA G . . AA C G G T C G T GCC T A
blockSeqs : C A . . T C . T A . . . G C . AGCATGAGTATAAGTCAA TT . . . A . A A . A A G . G TA T . . . . C T . AAATGAAC . . TC . . . . T CC T A C C . G . G . . C . TTCTAGAAGCCTTAAA . . . . TCA A TAACA C C A . A C . G A . . CG . . A TTTGA TA G AAT . . T GC T C . . A A TGT . . T C TC G . . AA . T G T C G T AGT A T
blockSeqs : C A . . T C . T A . . . G C . TCAGTATAAGTAAAA AT . . . A . A A . A A G . G TG T . . . . C T . TGAACCA . . TC . . . . T CC T A C C . G . G . . C . TTCTAGAAGATTTAAA . . . . ACA T TGCTT T T A . . T . G A . . A . . . . TA G TA . . A GC T C . . A A TGT . . T . T A . . GG . G A T A T T CTC T
blockSeqs : C A . . G C . T A . . . G C . TCTGTCGTTGTAAA AT . . . A . A A . T C T . A TG C . . . . A T . TTATATA . . TC . . . . T CC T A C C . G . A . . C . TAAACCTCGGTTAAT . . . . TC . TATA T T A . . . . . . . . A . . . . T . . . . T TA G A . . C C AAA . . T . T A . . A . . A G A A A .
blockSeqs : C A . . G C . G A . . . G C . TAAGCTGTGGTTA TT . . . A . A A . T C G . T TG G . . . . G . . TGTGT . . TC . . . . T CT T A C C . T . G . . A . TAGGTTTAGATCTC . . . . T . TT . . . . A CA A A . . . A AGC . . T . T . . . G . . . G A T T .
blockSeqs : T . . G A . G G . . . . C . TCAGCTGTGGTTA AA . . . C . A A . A A G . T GC C . . . . C . . CATC . . AG . . . . T AT T A C C . G . G . . G . AAAACGTAGATT . . . . . TT . A . . . . AC . . . . A . . . . . . . T . . C
blockSeqs : . . . A . G A . . . . C . TCATCTGTGTTAA A . . . A . . T . A T T . . . C . . . . A . . GTAA . . AA . . . . A AT G T G A . A . A . . T . AAAATAC . . . . .
blockSeqs : . . . T . T . . . . . C . CATAAGTAAA A . . . T . . A . T T A . . . . . . . . G . . CA . . AG . . . . A GT A T A A . G . A . . T .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . C . . . . . C . . T . T C . . . . . A . . CA . . AG . . . . T GT G T T T . G . T . . T .
blockSeqs : . . . . C . . . AG . . . . T GC G T T T . G . A . . A .
blockSeqs : . . . AT . . . . T AT G T T T . . . T . . T .
blockSeqs : . . . . . T TT G T G A . . . A . .
blockSeqs : A G T T T . . . T .
blockSeqCons : T** TCGTATCA****** TCA********* TTACA******* AAAATT*** G******** A****** **** GGTGAG******* CCT* ** G***
originalCons : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCACGA-A--ATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----G---GTCAAATATCTAGG------GTTA-ACTATT-GACAAGT----TG---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
finalCons : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATCA------TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GTCA---------TTT--A-CGGTTACA-------TGCAACGGTCACAAAATT---C---CGTCCAAGNA-AAAG--------GTCAAATATCTAGGA------TTA-ACTATT-GACAAGT----TG---CTA-A---ACGGTGAG-------GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333 1111 22222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222 1 333333333 3333333 11111111111 1111111111111 11111111 1111111 1111 11 1111
lowQualScore : 1 1 0 333 777 0 2 1 333 7 33 2 2 4 1 1 4444 44444444444444444444444444444444444 333 2 2 6 2 4444 4 1 333 66666 5555 33 333 4 444 1 55 1111 0 333 2 1 666 0 333 88888888888888 44444 333 666 22 333 22 1 1 11 1 1 1 4 1 2 22 1 22 22 1 555555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666 888888888888 2 3 2 1111 555 0 0 3 2 1 666666666 1111111 2 0 5 2 2 99999999999 555 77777 9999999999999 0 11111111 777777 666 99 3 1 22 3 1 2 2 5 22 333 444 33 1111111 9999 0 88888 33 7 55 777 4444 5 0 44 1 4 3 1 999 1 1
lowQualScore : . . . ... ... . . . ... . .. . . . . . .... ................................... ... . . . . .... . . ... ..... .... .. ... . ... . .. .... . ... . . ... . ... .............. ..... ... ... .. ... .. . . .. . . . . . . .. . .. .. . ...... ...................................................................................... .... ............ . . . .... ... . . . . . ......... ....... . . . . . ........... ... ..... ............. . ........ ...... ... .. . . .. . . . . . .. ... ... .. ....... .... . ..... .. . .. ... .... . . .. . . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 8 777 444 8 2 0 777 3 33 1 1 2 7 4 5555 22222222222222222222222222222222222 555 1 1 0 9 2222 4 0 333 88888 2222 66 999 3 888 6 88 8888 9 777 1 0 777 1 777 88888888888888 88888 333 999 55 222 55 8 5 55 0 0 0 7 7 7 44 0 44 55 0 555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444 222222222222 7 7 7 6666 000 4 7 0 0 4 999999999 1111111 9 7 7 9 9 55555555555 000 44444 1111111111111 1 11111111 111111 666 55 8 4 66 4 5 5 5 6 66 444 444 44 2222222 2222 8 44444 88 5 99 888 1111 6 1 22 0 0 2 0 000 0 0
consensus : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCAC-GAAATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----G---GTCAAATATCTAGG------GTTA-ACTATT-GACAA-G------T----TG---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
Reference ( family-672 ) : TGCGGNGTNCCACAAGG---AAGT---ATCCTGGGNC---CGCTTTT-GTT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AA-TGT-A-AA-TTATTNT----TATATGCNGATGA---CAGTGC-N---AT---TCT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GATCCTAATGTTAT---T-GNAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTNN-TA--AAT---G--GCTAG-TTGACAACAAACTGTCNCTNCATCTNGGNAAAACCGAA-TGCA--TNTT--ATTT--GGNT------C----T-----T---TTAG---A-----A----GNC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCAC-AAAATTC---CGTCCAAGNA-AAA-----G---GTCAAATATCTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TG---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAGGTTAATTCNAGGATNAAAT-TTTT-GTATCGA-AACAGNC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-GTAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATNCATGCTCTTCNTGGTATGNCGGTCTTACNAAAANGTTAAA
gi|18358 : TGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTG-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TGAGCA----TTA--G-T-ATAAGTAAA-----A---AA-TGT-A-AAATCATTCT----C-TATGCCTATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATTCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTGCATCTGGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---A-----ATGCAGGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---C-AA----TTT--T-CAG---TGCTTA----GTAATGGTCAC-A-----C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTTGG------TGCA-A-TGTTAGATAATGATTTTTC----TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATATTGTT-AAAAA-GGTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTATAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTAATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACAGAAACGTTAAA
gi|18359 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAAG---AAGT---ATTTTGGGGC---CATTATT-GTT-T-TT-ATGCTATGTTAATGATA----TG--AG----TATTAG-T-ATAAGTCAA-----A---AA-TGTAA-AA-TCATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACCGTCATTGCATCTGGGACAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GGGT------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAGTGCT---TA----GTAATGGTCAC-A-----C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTT-G------TC---TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATAATGTT--AAAAAGGTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTACAGA-CACAAAC---ACTACT--T---A---AATTTATC--CC--TT-AGAA-AGACTC-TTT-GTAA----TTCTTTGA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18360 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTATGGGGC---CATAACT-GTT-T-TT-A----ATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--G-A-GTA--T-AAGTC-AA---AAATGT-A-AAATTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---T-CTC-ACATAAA----GATCCTGATGTAAT---T-AGTGA---AGTTTT---AGGCA-ATG---AAC-TA-----GAA---AAGTGTAA-TA--AAT---A--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--AGGA------C----------------AA---AACGC-A----GGC----T---TGCTTAAGTGAAA---C----A-A-TT----------------TTT--AGTGC---T---T----TGTAATGGTCAC-A-----T---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GATAAT-GATTT-G------TC---TG---CTACATCCACTTT-GA-------ACAA---T------------------ATTGTT--AAAAAGGTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---A---AA--T-TTATCCT-TA-AGAC-AGACTA-TTT-GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTGATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACAAAAACGTTTAAg
gi|18361 : ccgactttgaaaatattgtaTGTGGAGTTCCTCAAGG---AAGT---ATTTTGGTGC---CATTTCT-GTT-T-TT-ATGCTATGTAAATGATA----TG--AG----CAT--T-A-GCA--T-AAGTCAAA---AA-TGT-A-AAGTTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTCAC-ATA--AA----TATCCTAATGCTATAAGT-GAAGTTTAAGGC-----AAT-GAACC---A----------GAA---AATTGTTA-TA--AAT---G--ATAAA-TAGACAACAAACTTTCTTTTCATCCTGGAAAGACAGAA-TGTA--TATT--ATTT--GAGT------C----------------AA---AACGC-A----AGC----TTGCT---------AAAGTGA----A-A---CA-GT-----------TTT----CAG---T---GCTT-TATAATGGTCAC-A-----C---CATACAAGCA-CAACCATCA---GTCAAATATCTCGGTGCAATGTTA-GCTAAT-GATTT-G------TC---TG---CTA-C---AT--------------CCA---TT---GTG--A---ACAATATTGTT--AAAATGGTAAATTTTAGAATAACAT-TTTT-GTAT-------AGAC---ATGA--------------------AGAC--T---------ACT-------TAAA---T---TTA--TACAGTGTCATTTTGATTATGCATATTCTTCATGGTAT---AGTCTTACAAAAACGTTAAAg
gi|18362 : ccgattttgaaaatattgtaTGTGGCGTTCCACAGGG---TAGC---ATCTTAGGCC---CGCTTCT-ATT-T-GT--TACCATGTAAATGACA----TG--GT----TA---G-TAGCA--TTGACCC-CG---AA-TGT-A-AA-TAATTC-----TATATGCTGATGA---CAGCAC-G---AT---TCT-TAT---AGCTT-ATA--AC----TAATATAGTGTTAT---T-TCTTCT--AAATTTTGAAGT-GTGT--------TG-----G--------TGTCT-TGCTCATCTCG--GCTAG-AATATAATAAGCTGTCA-TACATCTTGGTTTAACCGAG-TGCG--TTAT--TTTT--GGCT------C---------------------A-----A----AAC----G---T---------AGATT-A----A-A-GCAA-GT---T-AACGATTTT--A-AAA---T---TGTT-TGAAATGGACCT-ATTATTT---AGTC---GAC-ACA-----GTCTGTGAAATATCTAGG------TCTT-ACTCTT-G--AA-A------T----TT---CT-------TTGT-CA---G---GTGAAACTAAT-GTA--A---ACAGTAATG-T-GAGTAAGGTAAATTTACGTCTTAAAG-TTTT-GTAT--A-TACAAGCAAGGTT-CA--T---A---GATAT-TAAAAC--T--AGAA-A-A-T--ATA--TATGTTCTGCTCTGA-TTCGATGTCATTTGGTCTATTCATGTTCTTCTTGGTACCTTAGCTTAAACAAAGGGTTAAg
gi|18363 : attttcaaagtataaatctgtaacaGGTGTTCCACAAGA---ATCT---ATTCTCAGGC---CACTTTT-GTT-TCTT-ATA-TATATAAATGACA----TG--CC----AAT----T-ATA--ACGAGGA-CAAATAA-TAT-A-TA-TAATAATGACCTCTATGCGGATGATTCCACTGTAT---ATGAATCT-AAT---CG------A--GATT--GATC--AATA--AT---T-GAATCT--ATAC-T---A--CAAATT---AGATTG-----AAA---AATATTGA-TG--ATT---GGTGCAAACTTAATAACA---TGTCACTACAACCCGGAAAATCAAAA-TGTA--TGAT--ATT
gi|18364 : gaaaatgattgtgaaatctTGTGGAGTGCCACAAG------GTTTAATTTTTGGAC---CACTACT-GTTCT-TT-AT-TTATGTGAATGAAA----TG--------TAA--GCT-G-----TGGTT---A---AA-AAC-A-AA-TTATTGT----TAGATGCAGATGA---aagtacaaattataaaacaaaacatgcaatgaatattaaattgcaaattggtaacacttcaattgaaaatgtaacaggacagactatattaggcgtatatgttgacaataatctaacttggcacaaccatgtaaaaatgttattgacaaaatcaattcgaaaatagcacttttg
gi|18364 : aatatcacaTAG-TC--AGT---G--GCTAG-TTGACAATAAATTATCTCTTCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--TTTC--GGTT------CAAAAT-----T---TTTGCTTA-----A----GTC--------T---------AAA---ttcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18364 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgtATGCCAGGTTGAAAT-TCTT-GTATCGT-AAGAAGG---ATTACC--T---TACAAA----TCATAC--CA-AGAC-A-CTC--CTT-GTCA----TGTCTTCGATTTAATGTCACTACGACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACtataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcatgccaggttgaaattcttgtatcgtaagaaggattaccttacaaatcataccaagacactccttgtcatgtcttcgatttaatgtcactacgactatgcctgctctatatggtattatggtctgac
gi|18365 : aatatcacatgtggagtgccacaaggtttaatttttggaccactactgttctttatttatgtgaatgaaatgtaagctgtggttaaaaacaaattattgttagatgcagatgattcttgtatttttgtgtcaggaaaaaataagttgcatgttgagaaggttctgacagagggcctacctactgttagtcagtggctagttgacaataaattatctcttcatttgggtaaaactgaatccatctttttcggttcaaaatttttgcttaagtctaaatataacttataatggtacagtgaacgaacccacactttcagttaaatatcttggtgcaacattggatcTGTGGAGTGCCACAAG------GTTCAATTCTTGGAC---CACTACT-GTT-C-TTGAT-TTATAAAAATGACA----TG--TC----AGC----T-G-----TGGTT---A---AA-CAC-A-AA-CTGTTGC----TATATGCAGATGA---
gi|18365 : tattacaTTGTTAATC--AGT---G--GCTAG-TGGACAATAAATTATTCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TTTT--ATTC--GGAT------C----------------AA---A-----A----TAC------------------------A----A-A-TTAAGGT---C-------TTA--A-TGG-------TACAGTG-ATCGGACCC-ACACTTT---C------------------A---GTTAAATATC-ATG------GTGC-AATATTGGATCA-G-----------TG---TTT-A---TCTTTCGA---T---GTCA---TG---GTT--C---ATTCAGTT-TT-AAAGAAGGCTAATGCCACGTTGAAAT-TCTT-GTAGCGT-AAGAAGA---ATTAC---C---T---AA-----CAAATCGTACCGAGCA-ACTCCTTA-TCATG---T-CTTTGA-TTCAATGTCACTATGATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACttcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcttgttaatcagtggctagtggacaataaattattcctgcatttgggtaaaactgaatccattttattcggatcaaaatacaaattaaggtcttaatggtacagtgatcggacccacactttcagttaaatatcatggtgcaatattggatcagtgtttatctttcgatgtcatggttcattcagttttaaagaaggctaatgccacgttgaaattcttgtagcgtaagaagaattacctaacaaatcgtaccgagcaactccttatcatgtctttgattcaatgtcactatgattatgcctgctctttatggtataacggtctgac
gi|18366 : tattacatgtggagtgccacaaggttcaattcttggaccactactgttcttgatttataaaaatgacatgtcagctgtggttaaacacaaactgttgctatatgcagatgattcttgtgtcaggaaaaaaagttgcaggttgagaatgttctgacaaaggacctacatcGGGGTCCCTCAAGG---ATCT---ATACTAGGTC---C--TATTAGTT-T-TA-ATAT-ATGTCAATGAT------G--TC----T----G-T--CG--TTG--TA-AA---AA-----A-AA-CTTCTTT----CATATGCTAATGA---C--TTC-CGAAAT---TCC-GGT---TACTG-GGA--AATACAAATCCCAA----AT---T-GAA-------ACTT----GTTTTATCTACA---TG-----TAA---A--------TG--AAT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTCATTTGATCTTGGGAAGACAGAA-TCAA--TTCC--TTTT--GGATATAACCC----TAGG--T---TTAG---A-----------TC----T---C--------------------A-G-TCCA-GT---C-A-----T--------A---T---TACA-TGTAATGG
gi|18367 : tatttcatatTGTGGAGTGCCACAAGGTTGAATT---ATT---GGAC---CACTTCT-GTT-C-TTGAT-TTATGTAAATGCCA----TG--TC-----AT--C-T-GTG--TTAA---------AA--AC-A-AA-CTATTGT----TATATGCAGATGA---TTCTTG-T---AT---TCTTGTTGCATGCTG-A-G--GA----GGTTCTGACG----------GAG-----GACCT---A----CATC----------------------TTGTTAGTC--AGT---G--GCTAG-TGGATAATAAATTATCCCTGCATTTGGGTAAAACTGAA-TCCA--TCTT--ATCC--GGTT------C----ggctattattcaggcagccaagtcagttaaaatcttggttttacgctggaccagcatatatttatctacaaaatagctagtgcagttttcaagaatgcaaatgctaggtaccgaaaaagccagtacttgactaagcataccaggaaattgttggtatcatctcttattcagtgtcacttcgattgttcatgttctttcaggttttctagtttgactcaaaacctgaagg
gi|18368 : atcgcaTGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTAATAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GTTAG-TTGATAATAAATTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--GTTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAAAGGTCAT-GAAATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---GTCAACTATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAA-GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATACCGA-AACTTTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-ATAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAaaaatacaaactaatgtaaggctgaagtctaaatataacttgtaatggtacaatgatcgaacacgcactttcagttaaatatcttggagcaacatttgat
gi|18369 : TGCGGCGTACCACAGAA---AAGC---ATCCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TA-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAA---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---TTGG---A-----A----GTC----T---T---------AAA---A----A-A-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCAT-GAAATTC---CGTCCCAGCA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-GG---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTTAAAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTTATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTCAA
gi|18370 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCTTGGCC---CTCTTTT-ATT-T-CT-ATGTTATGGCAATGATA----TG--CC----TAC--G-C-GTA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-C---AT---GTT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGACAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--CTTT--GGCT------C----T-----T---TTAA---A-----A----GAC----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCAT-GAAATTC---CGTCCATGGA-AAA-----T---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-AA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAAAAG-TTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATATGGA-AAATGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-AAAAG---TGCCTTAG-TACAAAGTCATTTTGATTATCC-TGTTC--CA---------GGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18371 : TGCGGCGTACCACAGGG---AAGC---ATCCATGGCC---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAATGT-A---AA---ATT-GTT---CGCTA-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAAAT--AGGCTT---AGTCGAATC---A---TG-----G-A---TATAGTTC-TG--CAA---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTTATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TATT---TTT--GCCT-----------T-----T---CTAG---A-----A----GCC----T---T---------AAA---A----A-G-TGCA-GT---C-A-----TTT--A-CAG---T---TACA-TGCAACGGTCAT-GAAATTC---CGTCACAGGA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-AAAATA-GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATATCAA-AACTGTC---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-T-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACTACAGAGTTAAA
gi|18372 : TGCAGCGTACCACAGGG---AAGA---AACCTGGGCC---CTCTTTT-ATT-G-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---A-----------TTATTAT----TATATGCAGATGA---CAGTGT-A---AT---ATT-GTT---CGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGCATA---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGATAATAAACTGTCCCTTCATCTAGGCAAAACCAAAGTTCA---GTC--ATTT--
gi|18372 : A---A----A-G-TTCA-GT---C-A-----TTT--A-CGG---T---TACA-TGCAACGGTCAT-GAAATTC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---GTCAAATATTTAGG------ATTA-ACTATT-GAAAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGTT-TAAAAAAGTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATATCGA-AACTGTC---GTTACT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAATGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAAacggttacatgcaacggtcatgaaattccgtcccaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgaaaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgtttaaaaaagttaattcgcggattgcttttttatatcgaaactgtcgttactttaaccttcaaactaagagaactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattcctgctcgtcttggtatgccggtcttactaaaaagttaaa
gi|18373 : tgcagcgtaccacagggaagaaacctgggccctcttttattgttatgttatgtcaatgatatgcctacgtgcatcgactccgattattattatatgcagatgacagtgtaatattgttcgctgacaaagaccctaatgttattgcagatagacttagtcgcataatggataattgttctacatggctagttgataataaactgtcccttcatctaggcaaaaccAGG---AAGT---AGCC----AT---TGCTTTC---T-T-TT-ATGCTACATCAATGATAGGAGTG--TCAGTATAA--G-T-AAA-----------A---AA-TGT-ACAA-TAATT-T----TACATGCAAATGC---TAGTAC-T---AT---CCT-TTT---C-TTGTATA--AA----GATCTTGATGTTGT---T-AATAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---
gi|18374 : gttcctggGTTCCTCGAGG---AAGT---ATC----AAT---TGCTTTA---T-T-TT-ATGCTACGTCAATGATA----TG--cttgaaaataagaagtcatcaaaggctgatag
gi|18374 : -ATA--AA----GATCCTGATGTTAT---T-AGAAAT--GTACTT---GG------C---A---TG-----GAA---agagtcagcataagtaaacaatgtacaataaagatcctgatgttattagaaatgtacttggcatggaacttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18375 : gttcctcgaggaagtatcaattgctttattttatgctacgtcaatgatatgagagtcagcataagtaaacaatgtacaAAG---AAGT---ATACTGGGTCAGTTGCTTTT-GTT-T----ATGTCGTGTCAATGCT------G--CA----TAA--G-T-AAA---------------AA-TGT-A-AA-TAAT-CT----TATATGCTGATGA---TAGTGC-T---AT---CCT-cttgaaaatatgagaaagtcattaaaggttgatag
gi|18376 : ttgcttgCAGGG---AAAC---ATCCTGTGCG---CTCTTTT-ATT-T-TT-ATGTTATGTCAATGATA----TG--CC----TAC--G-T-GCA--TCGACTC-CG---AT-TGT-A-AA-TTATTAT----TATATGCAGACGA---CAGTGT-A---AA---ATT-GTT---TGCTG-ACA--AA----GACCCTAATGTTAT---T-GCAGAT--AGACTT---AGTCGTATC---A---TG-----GAT---AATTGTTC-TA--CAT---G--GCTAG-TTGCTAATAAACTGTCCTTTCATCTAGGCAAAACCGAA-TGTA--TGTT--ATTT--GGCT------C----T-----T---CTAG---A-----A----GAT----T---T---------AAA---A----A-AGTTCA-GA---C-A-----ATT--A-CGG---T---AACA-TACAATGGTCAT-AAAA-TC---CGTCCCAGGA-AAA-----G---ATCAAATATTTAGG------ATAA-ACTATT-GACAA-G------T----TA---CTA-A---ACGGT-GA---G---GCGA---TA---GTT--G---ACTCCATTGCT-AAAAAA-GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGTCGA-AACTGTT---GTTATT--T---T---AACCT-TCAAAC--TA-AGAG-A-ACT--TTA-ATAAG---TGCCTTAG-TACAAGGTCATTTTGATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACTAAAAAGTTAAA
gi|18377 : ---AA-AGC-A-AA-TTTCTTT----TATATGTTGGTGA---ATACGG-A---AT---TCT-GTT---TACTG-GGA--AATGCAAATCTTAA----AT---T-GAAACT--A---TT-----TTATAT----A---GG-----GAACTAAA----AG-TG--AAT---G--ATTTG-TAGAAAACATGCTTTCATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CAATTATT--TTTT--GGAT------C----
gi|18378 : ttaaA-TTATTCT----C-TATGCCGATGA---TAGTGC-T---AT---TCT-TTT---CTC---ACATGAA----GATCCTAATGTCAT---T-AGTGA---AGGTTT---AG--GTA-----A---TGAACTAGAA---AATTGTAA-TA--AAT---G--GTTAA-TAGACAACAAACTGTCATTACATCTTGGAAAGACATAA-TATA--TATT--ATTT--GGG-----------------------TAA---AAACGCA----GGC----T---T---------GCT---A----A-A-GTGA-AA---CAA-----TTT--T-CAG---T---GCTT-TGTAATGGTCAC-A-----C---CATACAAGCACAAACATC-A---GTCAAATATCTAGG--------TG-CATATG-GA-AG-G------TGCAATG---TTA-A---ATAAT-GATTTGTCTGCTA---CACCCATT--GTGAACAATATTGTT--AAAAAGGTAACTTCTAGAAT-AAATATTTT-GTATAGA-CATAAAC---ACTACT--T---TAG-AAC------GAC--T----------CT--TT--GTAA----TTCTTTAA-TACAGTGTCATTTTTATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACAAAAATGTTTAA
gi|18379 : ATGA---TTGTGC-T---AT---CCT-ATT---CTCGC-ACA--AA----GATCCTGATGTTAT---TAGAAAAT--GTACTT---AG--AAATG---AAC-TT-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-CTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAACTGAA-TGCA--TTGT--ATTT--GGTT------C----T-----g
gi|18380 : G-----AAA---AATTGTAG-TA--AAT---G--TTTAG-TTGACAACAAATTATCGTTGCATCTTGGTAAAATTGAA-TGCA--TAGT--ATTT--GGTG------C----TAAGAATGAGTTAGC--G-----A----GTG----T---T---------GAA---A----G-A-TTCA-------------------A-TG--------TACATTGTAATGGACAC-Aaagagtaaattagcaaaggttgaaagttccaatgtacattgtagtaaacactcgaggatatattaagtatcttggaagtgttttggataatgatatttctgtcacatctgttgtttataatactgtaaaaaataaagtctaggttgaagtttctgtattgataaaaccattgtttaaat
gi|18381 : aatgtactta-----GAA---AAGTGTAG-TA--AAT---G--GTTAG-TTGGCAACAAATTATGGCTGCATCTTGGTAAAATTAAA-TGCA--CTTT--ATTT--GGTT------C----TAAACGTAAGTTAGCA-A-----A----TAT----T---T---------AAA---A----ATA-TTCA-ATGAAC-A-----TTctatagagtcttaaagatctgttaggtatcttggaagtgttttggatattgaccattctgccacatctactg
gi|18381 : atgtacttTGTT-AAAAA----TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAACA-CC---GTAATTGTT---T---AAATA-TGAACC--TC-AGAA-A-AAGG-TTATGCAAC---T-CTTTAA-TACAATGTCATTTGGAGTATGCATCCTCACCTTGGTAgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataatgttaaaaataattccaggctgaagtttctgtgtagacaacaccgtaattgtttaaatatgaacctcagaaaaaggttatgcaactctttaatacaatgtcatttggagtatgcatcctcaccttggtacagt
gi|18382 : atgtacttgaaaagtgtagtaaatggttagttggcaacaaattatggctgcatcttggtaaaattaaatgcactttatttggttctaaacgtaagttagcaaatatttaaaaatattcaatgaacattgtagtggacactgtatagatctgttaagtggtcttggaagtgttatagataataatatttttgccacatctattgtaaataataaTAT-TA--AGT---G--GTTGG-TTGACAACAAACTTTTATTGCATCTTGGGAAGACAGAA-T-CA---ATT--ATTTTCGGAT------C----T----------------A-----A----ACCTCGGT---T---------AAT---ATCTCA-A-TCCA-G------------TTTGAA-TAG-------TATA-TGTAA-AGTGACTATTATTCAGGCAGCCAAGTC-A-----------GTTAAATATCTTGGT-----GCTACACT------CGA-G------C----TGTATCT------ATCTT-AT---G---GCGAAT-TA---GCTAGG---A--TAATT-CT-AATAAAGGCAAATGCTTGGTTAAAGT-TTCT-ATACCGA-AAAAGCC---AGTACT--TGACT---AA----GCATAC---A-AGAA-A-ACTA-TTG-GTA------GCATC--------TGTCACTTCGATTATTCATTTTCTTTCTGGTATCTCAGTTTGACTCAAAcagt
gi|18383 : GACAACAAATTATATTTGCATCTTGATAAAACTGAA-T--A--TTTTTAATTT--GGTT------C----T-----a
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18384 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATAATGATCTTTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACA
Unaligned ( gi|18385 ): TTTCAATGTACAATGTAATGGACATACCATAGAGTCTCAGGGATCTGTTAAGTATCATGGAAGGGTTTTGGATTATGATCTCTCTGCCACATCTATTGTTTATAACATTGTTAAAATATCAATTCAGGGTTGAAGTATCTGTATAGACAT