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Reference ( gi|110124 ) : TATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--TT-ATC-AGTACACCACAT--TATT-AAAAAGTGACCAACCTCCGCTAATC---T-CCCAT--GATGT-ATCACAT-AG--TGGTACACAATGG-AT-TAAAAATA-TGTT--A--------AA--A-----A----TTGT-TATT-A-----AATTGTG-----A----TGTT----TGT-A-AAG---AAG-CACC--C---G-GCAGATTGC--T--CG-TACCT----A---A---AAAGCAC-C-A-TAA------TT-----AAAAAATATCTT---AAAA-------AATCCGA-TAT---CCCCTCAGATCAGATCTGC--TGA--G-AACTGATTAGTA--G-AAGTTGGTCA---CTA--TATA----TTT---A---T---AAGG---TAGTCTTGTGTAATTCAATAATGAGTAT--C---A---TGGC--ATTTCCTAACCATGATATTCCCTAGAACCGTACTCAAT-GTTGTGTAG---TGAATA---CG--G----AGTTGCCATATAGTCCCGTA
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Alignments
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Reference ( family-659 ) : TATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--TT-A-TTAGCACACCGCAT-GT-ATT-AAAANGTGACCAACCACCGTTAATC--T-CCCATNGTGTATCACATAGTGGTACANAATGGNTTAAAA-GTGTGTTAAA---A----T---AA-T--TNT-TA-TTAAATT-----GTGA-----TGTT----TGTA----AGGAA-GCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CG---TACC-TA---A---AAAGC---GC-C-A-TAA------TTAAAAAATATTTT---AAAA-AATCNGATATCACCTCAGATCAGATCTG-TGA--GAACTGATTAGCAGNAGTTGGTCA---CTA--NATA----TTT---A---T---AAAA---TAGTCTTGTGTAATTCTATANTGAATATC---A---TGGT--ATTTCCTAACCACAATATTCCCTAGAACCGTNCTCAATGNT-------GT-GTANTGAATACG--G-AGTTGCCATATAGTCCCGTA
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gi|110121 : tgtatatatttatagtatcagctgaagagggtattatcc-ATT-AGC-----ATATCGCAT--TTTT-AAAAACTGACCAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATTATACAGAATGGTTTAAGA-GTGTGTTAAA---AT---AA----A--AAT-AGTT-A-----AACTGTGAAAAA-TGTA----TAT-C----AGG--GCACC--CG-CCAG--CTCGC--G--CA---TACC-CA---A---AAAGC---GC-C-AATAG------TAAAATAGTATTTT----AAAA-A-ATCGAATATCATCTCAGATCAGATCTG--AAAAGAACTGATTAACAATAACTTGTCC---CT---GATA----TTTAGAATAAAAAAATAGTCTTGTGTAACTCTATATTGAATATC---A---GGGT--GGTAAGTATCCATAATATTCTCTACAACCGCTCTCAGTAGT-------AT-GTATTGAGTGCG--ATAA--GCCATATAATCCCGTA
gi|110122 : tgtatatatataaacagtataagctgaataaggtattatccTATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--T-T-ATT-AGT-----ACACCACAT--TATG-AAAATGTGACCAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATACTGGTACACAATGGACTAAAA-TAGTGTTAAA--------AATGTTT--TTT-TATT-A-----AATTGTGA-----TGTT----TGTAA----AAAAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CA---TACC-TA---A---AATGC---CC-T-A-TAA------TTAAGAAATATCTT----AAAA-A-ATCCGATATCCCCTCAGATCAGATCTGCTGA--GAACTGATTAGCAGAAGTT-GTCA---CTA--TATA----TTA---AT---TTGGTAGTCTTGTGTAATTCTATAATGAATATC---C---TGGC--ATTTCCTAACAACAATATTCCCTAGAACCGTACTCAATGCT-------GA-GTAGTGAATATG--G-AGTTGCCATATAGTCCCGTA
gi|110123 : gtaaaTATTGAAAAATGTTCGTCAGCCTTGCAATATT--T-T-ACT-AGT-----ACACCACAC--TATT-AAAAAGTGACCAACCACCGCTAATC--T-CCCATGATGTATCAGATATTGGTACACAATGGACTAAAA-GTATGTTAAA---A-----A----T--TGT-TATT-AAATTAAATTGTGA-----TGTT----TGT-A----AAGAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CG---TACC-TA---A---AAAGC---GC-C-A-TAA------TTAAAAAATATCTT----AAAA-A-ATCCGATATCCCCTCAGATCAGATCTGCTGA--GAACTGATTAGTAGAAGTTGGTCA---CTA--TATA----TTT---AT---AAGGTAGTCTTGTGTAATTCAATAATGAGTATC---A---TGGC--ATTTCCTAACCATGATATTCCCTAGAACCGTACTCAATGCT-------GT-GTAGTGAATACG--G-AGTTGCTATATAGTCCCGTA
gi|110124 : attTATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--T-T-ATC-AGT-----ACACCACAT--TATT-AAAAAGTGACCAACCTCCGCTAATC--T-CCCATGATGTATCACATAGTGGTACACAATGGATTAAAA-ATATGTTAAA---A-----A----T--TGT-TATT-A-----AATTGTGA-----TGTT----TGT-A----AAGAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CG---TACC-TA---A---AAAGC---AC-C-A-TAA------TTAAAAAATATCTT----AAAA-A-ATCCGATATCCCCTCAGATCAGATCTGCTGA--GAACTGATTAGTAGAAGTTGGTCA---CTA--TATA----TTT---AT---AAGGTAGTCTTGTGTAATTCAATAATGAGTATC---A---TGGC--ATTTCCTAACCATGATATTCCCTAGAACCGTACTCAATGTT-------GT-GTAGTGAATACG--G-AGTTGCCATATAGTCCCGTA
gi|110125 : TATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--T-T-ATT-ATT-----ACACCACAT--TATT-AAAATGTGACCAACCACCGCTAATC--T-CCCATTGTGTATCACATAGTGGTTCACAATGGACTAAAA-CTGTGTTAAA---TT---------T--TTT-TATT-A-----AATTGTGG-----TGTT----TGT-A----AAGAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CG---TACC-TA---A---AAAGC---GC-C-A-TAA------TTAAAAAATATCTT----AAAA-A-ACCCGATATCCCCTCAGATCAGATCTGCTGA--GAACTGATTAGCAGAAGTTGGTCA---CTA--TTTA----TTT---AT---TAAGTAGTCTTGTGTAATTCTATAATGAGTATC---C---TAGC--ATTTTCTAACCACGATATTACCTAGAACCGTACTCAATGCT-------GT-GTAGTGAATACG--G-AGTTGCCATATAGTCCCGTA
gi|110126 : TATTAAAATGTATTCGTCAGCCTTGCAATATT--T-T-ATT-AGT-----ACACCACAT--TATT-AAAATGTGACCAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAAG-ATATGTTAAA---G----AA----T--TGT-TATT-A-----AATTGTTA-----TGTT----TGT-A----AAGAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CG---TACC-TA---A---AAAGC---GC-C-A-TAA------TTAAAAAATATCTT----AAAG-A-ACTCGATAACCCCTCAGATCAGGTCTGCTGA--GAACTGATTGGCAGAAGCTGGTCA---CTA--TATA----TTT---AT---TAAGTAGTCTTGTGTAATTCTATAATGAGTATC---C---TGGC--ATTCCCTAACTACGATGTTTCCTAGATCCGTACTCAGTGCT-------GT-GTAGTGAATACG--G-AGTTGCCATATAGACCCGTA
gi|110127 : TCAGCCTTGCAATATT--A-T-ATTTAGT-----ACACCGCACGGTAT----AATTTTACCAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATGGTGGTACACAATGGTTTAAAA-TTAAATTAAA---AT---A-----T--TATATATTTA-----AACTGTGA-----AATT----TGT-A----AATAAGCACC--CG-GCAG--ATTGC--T--CA---TACC-TA---A---AAAGC---GC-C-A-TCT------TTAAAAAATGTTTT----AAAA-G-ATCCGTTATCTCCTCAGATCAGATCTGTTGA--GAACTGATTAACAAAGGTTGGTCA---CTAATAATA----T------T---AAAATAGGATTCTGTAATTCTATATTGAATATC---C---TGTT--ATTTTATAAACACAATATTCCCTAGAACCATATACAATGTT-------TTAACCTTGTATACG--G-ATTT
gi|110128 : TCAGCCTAGCAATATT--T-TTATT-AGT-----ACATCGCATG-TAT--AAAATGTGACCAAACCCCGTTAATC--T-CCCATAGTATATCATATAATGATACAGGATGGTTTTAAA-GAA-ACTAAA---AGGAAAA----T--TA---AAT-A-----AACTGTAG-----AATT----TGT-A----AAGAAGCATC--TG-GCAG--CTTGC--G--CA---TACA-TT---A---AAAGC---GC-C-A-ATA------TTAATAAATATTTTTAAAAAAA-A-AACG-ATATCAC-----ATCAGACCTT--TAATGAACTGATTAACAGGGGTTGGTCA---CTAACAATA----T------T---AAAACAGTCTTATGTAATTTTATATTGAA-ATC---A---TGGT--ATTT
gi|110129 : TACAGTATTATT-T-ATT-AGC-----ATAAAGCAT--TTTT-AAAAACTGACCAGTCACTGTTAATCGAT-TCATTTATGCATCA-ATATTGATACAGAATGGTTTAAAA-GTTAAATAAA---AC---AA----AAATAT-AAAT-A-----AACTGTGAAAAAAGGT------AT-A----ATAGGGCACC--CA-GCAA--CTTGC--A--CA---TACT-TT---T---AAAGC---GCAG-A-TAG------TAAAAAAAAAT
gi|110130 : TATT--TAT-ATT-CGTTAAACATATCACATA-CAT---AAACATGACCAGTTATTGTTAATCG-T-ACCA-AATGCATCACAACGTGATACAGACGGGTATAAAA-TTGTATTACA---GG---AA-------TAG-GAAT-A-----AACTGTGG-----TGTT----TGT-A----AACAAGCACC--TG-GGGGCAATTGCTAT--CA---TGTC-TG---A---TAAGCCCTGC-CAA-CAA------TT
gi|110131 : ACATA-TTGTCTAAAATGT-TATTAAA---AT---TA----T-------ATA-A-----GATTACGA-----TGT---------G----AGGAGGAA-----A-GGAA--AT-GC--TAACG---CATC-TGCT-ACTTAAAGC-------------------TTAAAAAATATTTT----AAAA-A-ATCGAATATCATTCTAGATCAGATCTA--GAATGAACTGATTAGCAtaccgtcttaagatagcgcacctgagaggccataggaactagtcaaactcaaaatcgattacaataaaaaaaatattgacattgaaaaaataaaaagttgtatggatccacaat
gi|110132 : ACATA-TTGTCTAAAATGT-TATTAAA---AT---TA----T-------ATA-A-----GATTACGA-----TGT---------G----AGGAGGAA-----A-GGAA--AT-GC--TAACG---CATC-TGCT-ACTTAAAGC-------------------TTGAAAAATATTTT----AAAA-A-ATCGAATATCATTCTAGATCAGATCTA--GAATGAACTGATTAGCA
gi|110133 : ACATA-TTGTCTAAAATGT-TATTAAA---AT---TA----T-------ATA-A-----GATTACGA-----TGTAAAGAGGA-A----AGGAAATACTAACG--CA---ACTGC--T--------ACT-TA---A---A-------GC--------------TTAAAAAATATTTC----AAAA-A-ATCGAATATCATTCTAGATCAGATTTA--GAATGAACTGATTAGCA
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gi|110141 : ------TTAAGAAATGTTTT----AAAA-G-ATCAGTTATCACTTCAAATCAGATTTG--TAATGAACTGATTAGCA
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