lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 11 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4444444444444 111 2222 22222222222222222222222222222 111 11 333333333 1 1 11 1 1 1 1
lowQualScore : 4 333 4 555 44 2 7777 5 333 22 7 1 7 3 44 2 9 2 1 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 22 777777 22 3333333333333 1 3 99 1 1 1 9 000 1111 1 55 1 333 3 66666666666666666666666666666 3 1 5 5 444 1 2 2 33 3 777777777 7 00 5 33 3 6 5 6 2 0 7 0
lowQualScore : . ... . ... .. . .... . ... .. . . . . .. . . . . . ........................................................................ ... .. ...... .. ............. . . .. . . . . ... .... . .. . ... . ............................. . . . . ... . . . .. . ......... . .. . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 9 777 3 444 88 5 2222 5 222 55 6 8 7 6 88 0 7 0 6 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 999 33 666666 33 6666666666666 7 3 66 7 7 7 9 555 4444 8 77 0 222 8 77777777777777777777777777777 2 0 0 0 000 4 5 5 88 2 000000000 0 55 0 88 2 0 0 0 0 5 0 0
consensus : TTCAATACCTGCCGAAC---GACACCAAGATCATCAAAN--T--CGG--A-A-A---GAAATG--GCCTC-TNGGC-A--GGGT-TTGAA-CATGGCACCCC---------A------TAAAT-GT-GTAC--A---TT----C--C-CT-GAA----A-TGCN--------C---GT--GT--T-TGCA--CGGG-A--C-C----N-T-TT-CTGACTA-A-AC-GGAGACAGATAGCTTATNTN-TT-TA-AGAACAAA---AGTTG-CTN---AGA--AN--C--AATTNN----TCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATAAAACATANTTTT--GGTATA-----CTC-ATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAA--TACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
Reference ( gi|15590 ) : TTCAATATCTACCGAAC---GACACCAAGATCAGCAAAA--T--CGG--A-A-A---GAAATG--GTCTC-TCGGC-A--GAGTATCGAA-CATGACACCCC--------CA------TAAAT-GT-GTAC--A---TT----C--C-CT-AAA----A-TGTC--------C---GT--GT--T-TGCA--CGGG-A--T-T----T-T-TT-CTGAGTA-A-AC-GGAGAGAGGTCGCTTATGTA-TT-TG-AGAACAAA---AATTG-TTA---AAA--AA--C--AATTGA----TCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATAAAACATACTTTT--GGTATA-----GTT-ATTGTTAACATTGAATAGATCTATACAATGGTGCACAAA--TACAGAATAATATTAACACAGAATTGTTGACAACTGTTTAATACATTATTTTAAAATTATTTATATTTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15589 : TTCAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCAACAAAA--T--CGG--A-A-A---GAAATG--GCCTC-TCGAC-A--GAGTCTCGAA-CATGACACCCC--------AA------TAAAT-GT-GTAC--A---TT----C--C-CT-AAA----A-TGTC--------C---GT--GT--T-TGCA--CGGG-GGTT-T----T-T-TT-CTGAGTA-A-AC-GGAGAGAGGTCGCTTATGTA-TT-TG-AGAACAAA---AAATG-TTT---AAA--AA--C--AATTGA----TCTACAACATATTTTTAGTATGTATCTTTCATGTTT-----GCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATAAAACATAATTTT--GGTATA-----CTC-ATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGAAAAAAACAACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAGTTGTTTAATACATTATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15592 : TTCAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCAACAAAA--T--CGG--A-A-A---GAAATG--GCCTC-TCGAC-A--GAGTCCCGAT-CATGCCACCCC--------CA------TAAAT-GT-GTAC--A---TT----C--C-CT-AAA----A-TGTC--------C---GT--GT--T-TGCA--CGGG-A--T-T----TCT-TT-ATGAGTA-A-AC-GGAGAGATATCGCTTATGTA-TT-TG-AGAACCAA---AATTG-TAT---GAA--AA--C--AATTGA----TCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTAT---GTTT---GCGAATGCGGCACGGGTCGAATCCGCAATGATAAAACATACTTTT--GGTATA-----CTT-ATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTTCAAAAA--TACACAATAATATTAACATATAAATGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15593 : TTCAATAATTGCCCAAC---GACACCAAGATCATCAAAT--T--CTG--ACA-A---AAAATG--GCCCT-TGGGC-AA-GGGT-TTGGA-CATGGCACCTA--------TAATCGACCAAAT-AT-G-AC--AAG-TT------------GAA----T-TGCA--------C---GA--GT--A-TGCA--CAGA-A--CAC----G-T-TT-CTGACTG-A-AC-GGAGACAGATAGCTTAT-CA-TTCTA-AAAACAAA---TGTTG-CTT---AGA--AT--T--AAATTT----TCTACAACATAT
gi|15595 : TTCAATACCTGTTGAAC---GACACCAAGATTA-TAAAATTT--TGA--A-A-A---GAAATG--GCCTC-TGGGCAA--GGGT-TTGAA-CATGGCACATA--------TAATAGACCAAAT-AT-GTTG--A---GT----TGGG-TT-GAA----T-TGTA--------C---G---GT--TATGCA--CGGG-A--CGC----G-T-TT-CTGACTA-A-AC-AAAGGCAGATAGCTTATCAC-TT-TA-AGAAC-AA---ATTTG--CA---CGG--AA--TGAAATTT-----TCTACACTATATTT
gi|15594 : TTCAATACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATCATAAAAT--T--CTG--A-CTA---GAAATG--GCCTC-TGGGC-AAGGGGT-TTGAA-CATGACACCTA--------TAATCGACCAAAT-AT-G-GC--GAGTTT----G--G-TT-GAA----T-TGCA--------C---GG--GT--A-TGAA--CGGA-A--CGC----G-T-TT-CTGACTG-A-AT-GGAGACAGATAGCTTATCAC-TC-TA-AGAACAAATGTAAC---TTA---AAA--TT--A--AATT-C----TCTACAACATAT
gi|15591 : TTTAATACCTACCCAAC---GACATAAAGATCATCAAAT--T--TCG--ATA-A---GAATTG--GCCTC-TGGGC-AA-GGGT-TTGAA-CATGGCACCTCATAATTGACA-------AAAT-AT-G-ACGAA---TT----T--GGTT-GAA----T-TGCA--------C---GG--GT--A-TGCA--GGGG-A--C-G----CGT-TT-CTGA-CATA-AC-GGAGACAGATAGGTTATCAC-TC-TA-AGAA---A---AATTG-TTGCTTAGA--AT--T--AAATTT----TCTACAACATAT
gi|15597 : TTCAATATCTGTCCAAC---AACATCAAGATCATCAAAT--T--CCG--ACA-A---GAATTG--GCCTC-TGGGC-AG-GAGT-TTGAA-CATGGCACC------------------TAAAT-TT-G--------------------CC-AAA----A-TG----------G---GT--GGAAT-TGCA--CGGG-----------T-A-TG-CAGGG-A-G-AC---AGATACATCAC--------TC-TA-AGAACAAA---TGTTG-CTA---AGA--AC--T--AAATTC----TCTACAATATAT
gi|15598 : TTCAATACCTGCCCAAC---GACATCAAGATCATCAAAT--T--CCG--ACA-A---GAAATG--ACCTC-TTGGC-AAGGGGT-TTGAA-CATGGCACC
gi|15596 : TTTAATACATGTCGAAC---AACATCAAGATCATCAAAT--TT-CGA--C-A-A---GAAATG--GCATC-TGGGC-A--TAGGTTTGAA-CATGTCACC
gi|15600 : TTCAATACCTACACAGT---GTTATTAAGTTCAACAAAA--T--CGGTCA-A-A---GAA-TG--AACTC-TTGGC-A--GCGATTTGAA-CATGACACttaagttaaaattgcttgcaattaaattctctacaa
gi|15602 : TCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATCATCAAAA--TTCCGA--C-A-A---GAAATC--GCCTC-TGGTC-A--GGGTTTTGAA-CATGGCACC----------------------------TAC--A---TT----T--T-CC-AAA----ATTGTTGGATTGCAC---GT--GT--T-TGCA--CGAG-A--C-G----CAT-TT-CCGAAAA-AGAC-GGAGAAAGATAGCTTATTTG-TT-GA-AGAAC-AA---AGTTGCTTA---GAATTAA--A--AA--AG----TACACAACATAT
gi|15605 : TCAATACCTACACAAT---GATACCAAGTTCAACAAAA--T--TGGT-C-A-A---GGAATA--AACTC-TTGGC-A--GCGATTTGAA-CATGGCA--------------------------GT-CT-T--A---TT----C--T-CT-ATA----A--GT---------C---AT--G------GCA--CGGC-A--T-T----T-T-TT-
gi|15601 : TCAATACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTTA--AAAA-----CGG--C-ACA---AGAATGACGTCAG-T-GGC-G--GGGT-TTGAA-CACGGCACCCC--------CA------T-------------------T----C--C-C--ATC----A-TGCA--------C---GT--GA--C-GGCA--CGGG-C--A-C----G-T-TT-CTGGCGA-A-AC-GGTGGTAGATAGCTTATTTC-TT-AA-AGAACAAA---AGTTGCTTA---GAA--TGGTC--A---GA----TCTACAACATtcaga
gi|15603 : TCAATACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTCATCAGAT--T--CCG--ACA-A---GAAATG--GCTTC-
gi|15604 : TCAATATCTGACGAAT---GGCACTAAAATAATTAAAT--T--CTG--ACA-A---GGAATG--AACTC-TCAGG-A--GGGaaattagttgaattgcatgtgttggcacgtaacgcgtttctgactaaacgtagacagatagcttaaaattttagaacaaaaaatgtgaatgacgagatcttcaacatatatgagcctctcattttctggcacgtgc
gi|15607 : CAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCAACAAAA--T--CGG--A-A-A---GAAATG--GCCTC-GTGAC-A--GAGTCTCGAA-CATGACACCCC--------AA------TAAAT-GT-GTAC--A---TT----C--C-CT-AAA----A-TGTC--------C---GT--GT--T-TGCA--CGGG-A--T-T----T-TTTT-CTGAGTA-G-AC-GGAGAGAGATCGCTTATGTA-TT-TG-AGAACAAA---ATTTG-TTT---AAA--AA--C--AATTGA----TCTACAACATACTTTTTGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCTTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATAAAACATAATTTT--GGTATACTTATTTT-ATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAA--TACAGAATATTATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAATATGTATCATTTTACACGACTTACATTTTAAAATTTAAATAATTTgttcaagccgttggaaccagagaccggcacgtgttggcacgggacgcatttccgaaaaaacggagacagagagcttatttttgaagaacaaaagttacttataatcattcagtacacaatatat
gi|15608 : AATACCTATCGAAT---GATACCAAATTCATCCAGT--T--CTGTCA-A-A---GAA-TG--AGGTC-ACGGA-A--GAGACTTGAA-CATGACACC------------------TAAAT-GCCGTTC--A---TG----T--G-TT-AG-------TATC--------CACGGT--GT--T-TGCA--CGGG-A--C-G----CGT-TT-CTGAATA-A-AC-GCTGACAGCTAGCTTAACTT-TT-TA-AGAAT-AA---AATTG-CTT---AGA--AT--T--GGTTTC----TCTAAAACATAT
gi|15610 : CGAAC---AAGACCAAACTTAAAAAAA--T--C----A-A-ACCGGAAGTG--GCCTC-TGTGC-AC-GGGT-TCGAATCTTGGTATCTC--------GG------TA----GG-GTA------------------------------------------------------T-TGTA--TGGG-A--T-T----T-T-TTTCTGACTT-A-AC-GGTTAACGTTAGCTCAAGAA-TT-TC-TATACAAA---AGTTG-CTC---AGG--AG--G--GTTTGC----TCTACAACATGTT
gi|15609 : acctttAAC---GATACCTATCTTGAAAAAA--T--CGG--ACA-A---GAAATG--GCCTC-TCGACTA--AGGT-TCAAG---------CCC--------TT------T---T-G--G---------------C--C-CTCAAG----C-TGAC--------C---GC--AT--C-TG-AGTTGGG-G--T-TAAGGT-T-CTACTGGCTA-A-AC-AGTTGGAGTTAGC-CATATACTT-TA-AAGACAAA---AGTTA-CTA---AGA--AT--T--AAATTC----CCTACAACATAT
gi|15611 : aagacctttccAAAA--A--CGG--C-ACA---AGAATG--ACATCATTGCC-G--GGGT-TTGAA-CACGACACCC----------------------------AC--A---GT----C--C-C--ACC----A-TGCA--------T---GT--G------GCA--TG---------------T-TT-CTGGCGA-A-AT-GGTGGTAGACAACTTATTTG-TT-AA-AGGACAAA---AGTTG-CTT---AGA--AT--C--GTTAAA----TCTACAACATAT
gi|15614 : -A-A---GAAATG--GCCTC-TTGGC-AAGGGGT-TTGAA-CATGGCA--CC--------TA------TAA-----------------T----CAAC-C--AAATATGA-TGAG--------C---ATGGGT--A-TGCA--CGGG-A--CGC----G-T-TT-CTAACTG-A-AC-GGAGACAGAAAGCTTATCAC-TC-TA-AAAACAAA---TTTTG-C-------A--TA--T--AATTAAATTTTCTACCACATAT
gi|15612 : -A-A---GGAATG--AGCTC-TATGC-A--GAGGCTCGAA-CATGATACC------------------TAAATCCC-GTAC--A---T--------------------A-TAGC--------A---GT--G-----TGCA--CGGG-G--CGC----G-T-TT-CTGAACT-A-AT-GGAGACAGATTGCTAAATTT-TC-TA-AGAAGAAA---ACTTG-CT
gi|15599 : C-A--GGGT-TTGAA-CATGGCACCCC-----------------AAAT--T-G-GC--A---TT----T--T-TG-GAA----T-TGCA--------C---GT--GT--T-GGCA--CGGGCA---------G-T-TT-CGGACTA-A-AC-GAAGACAGcaga
gi|15606 : ttcaatacctgccgaaccctgtgtcattgttaaaaacatcacaagaatgacgtcagtacTTGAA-CATGGAACCCC--------AA------TTGGC-GT--CAT--A---TTTTAAC--C-C---GA----A-TGGCA-------C---GT--GT--T-GGCA--CGGG-C--C-G----T-T-TT-G-GACTA-A-AT-GAAGACAGATAGCTGATCAC-TC-TA-AGAACAAA---AGTTG-CTC---AGA--AT--A--AGGTGT----TCTACAACATAT
gi|15616 : tcaatacctgttgaaccctgtgtccagtttaaaaacgtcacaagaatgacgtcagtaatggggtTTGAA-CATGACACCCC--------CA---------------GT-----------------C-CC-GCC----A-TGCA--------T---GT--GG--C-GGCA--CGGG-T--G-C----G-T-TT-CTG-GCG-A-ATTGGTGGTAGATAGCTTATTTG-TT-AA-AGAACAAA---AGTTGCTTA---GAA--AA--T--AA
gi|15615 : TTGAA-CATGACACCGC--------CA------T------------------------C--T-CG-GCA----A-GGTG--------C---GT--GT--C-GGTA--CAAG-C--G-C----G-T-TT-CTGACTA-A-AT-GGTGACAAATAACATACTTG-TT-AA-AGGACAAA---AGTTG-TTT---AAA--A
gi|15613 : aatgagcactccatagggatAA-CATGACACCCC---------------------------A---A---TT----C--C-C--GCC----A-CGTA--------C---GT--TT--C-GGCA--CGGG-C--G-C----G-T-TT-CTGGCGC-A-AC-GGTGGTAGATAGCTTATTTG-TT-TA-AGTACCAA---AGTTG-CTT---AGA--AT--C--GTTAAA----TCTACAACATAT
gi|15604 : aagaatgagctcaatacaggggttac--------C---GT--GT--T-GGCA--CGGG-A--C-G----CAT-TT-CCGAAAA-A-AC-GGAGACAGAGAGCTTAT-T--TT-TGAAGAACAAA---AGTTA-CTT---ATA--AT--C--ATTCAG----TACACAATATAT
gi|15603 : tcaatatctgacgaatggcactaaaataattaaattctgacaaggaatgaactctcaggaggggttcaagccgttggaaccagagaccggca---GT--GT--T-GGCA--CGTA-A--C-G----CGT-TT-CTGACTA-A-AC-GTAGACAGATAGCTTA-AAA-TT-TT-AGAACAAA---AAATG--TG---AAT--GA--C--GA--GA----TCTTCAACATA-------TATGAGCCTCTCAT-TTTCTGGCACGTGC
gi|15617 : tcaatacctgtcgaacaacatcgaggtcatcagattccgacaagaaatggcttcaaattagttgaattgcatACATTTTCGGTATTTATCTATAATCTTT---GTGTATTCTGCACGGGTCAATC---CATTTATGCAAATTTCTTTTACGGCA-A-----GCCAATTATTCACATTGAATTGATCTAAAGAATGGTATAAAAA--T
gi|15618 : TAA-ACTAACATATAATTGTTGACAATTATTTAATCTAATATTTCAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATTATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222 111 22222 11
lowQualScore : 77777 333 333 44444 55 22 66666666 4 222 444 222 3 444 5 1 1 2 2 1 33 3333 1 1 6666666666 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 2 1 0 8888 77777 2 3 1 0 1 22 1 3333 555 1 777777777777 1 7 2 111 88 8 1 8 4 00000 11 0 1 8
lowQualScore : ..... ... ... ..... .. .. ........ . ... ... ... . ... . . . . . . .. .... . . .......... ................................................................ . . . . .... ..... . . . . . .. . .... ... . ............ . . . ... .. . . . . ..... .. . . .
lowQualScore : 77777 222 999 33333 11 44 00000000 6 777 888 777 1 666 9 5 5 9 9 4 44 0000 4 4 5555555555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 2 7 1 2222 88888 2 3 7 3 7 33 7 7777 999 0 555555555555 0 5 5 777 88 0 0 0 6 00000 00 8 4 0
consensus : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--CG--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT-CTGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-T----ATCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTATT-----GTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
Reference ( family-658 ) : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--CG--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTGAA--AT-GCNC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CNTTT-CTGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-T----ATNTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTNAGAA---NC-AATTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTCATT-----GTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15589 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--CG--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGGGTT-TTTTT-CTGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-T----ATGTATTTGAGAACAAAAAATGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTAGTATGTATCTTTCATGTTT---GCG--TGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTCATT-----GTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGAAAAAAACAACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAGTTGTTTAATACATTATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15590 : TTCAATATCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--GC-----AAA-AT--CG--G--A-A-A---GAAATGGTCTC-TCGG---C-A---G-A-G-TATC-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----CCA--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTT-CTGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-T----ATGTATTTGAGAACAAAAATTGTTAAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATAGTTATT-----GTTAACATTGAATAGATCTATACAATGGTGCACAAAT--ACAGAATAATATTAACACAGAATTGTTGACAACTGTTTAATACATTATTTTAAAATTATTTATATTTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15591 : TTTAATACCTACCCAAC-----GACATA---AAGATCA--TC-----AAA-TT--TC--G--ATA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-T-----C-A--T------AATTGACAAAAT--A-T-G--ACGAA---TTT---GGTTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGCAGGGGA--CGCGTTT-CTGA-CATA-ACGG--AGACAGATAGGT-T----ATCACTCTAAGAAAAATTGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15592 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--CG--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-TCCC-G-AT--CA----T-GCCACC----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGAT-T-TCTTT-ATGA-GTAA-ACGG--AGAGATATCGCT-T----ATGTATTTGAGAACCAAAATTGTATGAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCT---ATGTTT---GCGAATGCGGCACGGGTCGAATCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATACTTATT-----GTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTTCAAAAAT--ACACAATAATATTAACATATAAATGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15593 : TTCAATAATTGCCCAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--CT--G--ACA-A---AAAATGGCCCT-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-GA--CA----T-GGCA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--AC--AAG-TT--------GAA--TT-GCAC-GAGT-A-TGCACAGAA--CACGTTT-CTGA-CTGA-ACGG--AGACAGATAGCT-T----ATCATTCTAAAAACAAATGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15594 : TTCAATACCTGCCCAAC-----AACGCC---AAGATCA--TA-----AAA-TT--CT--G--A-CTA---GAAATGGCCTC-TGGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--GC--GAGTTTG---G-TTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGAACGGAA--CGCGTTT-CTGA-CTGA-ATGG--AGACAGATAGCT-T----ATCACTCTAAGAACAAATGTAACTTAAAA---TT-AAATTCTCTACAACATAT
gi|15595 : TTCAATACCTGTTGAAC-----GACACC---AAGATTA--TA-----AAATTT--TG--A--A-A-A---GAAATGGCCTC-TGGG---CAA---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-CATATAATAGAC-C-----------------AA--------AT--A-T-GT-TG--A---GTTGG-G-TTGAA--TT-GTAC-G-GT-TATGCACGGGA--CGCGTTT-CTGA-CTAA-ACAA--AGGCAGATAGCT-T----ATCACTTTAAGAAC-AAATTTGCACGGAA---TG-AAATTTTCTACACTATATTT
gi|15596 : TTTAATACATGTCGAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAATTT--CG--A--C-A-A---GAAATGGCATC-TGGG---C-AT--A-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GTCA-C----------C-
gi|15597 : TTCAATATCTGTCCAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--CC--G--ACA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-A---G-GAG-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C------------T------AA--------AT--T-T-G------------------CCAAA--AT-GGGT-GGAA-T-TGCACGGG---------T-ATG--C----AGGG--AGACAGATA----C----ATCACTCTAAGAACAAATGTTGCTAAGAA---CT-AAATTCTCTACAATATATttaagttaaaattgcttgcaattaaattctctacaa
gi|15598 : TTCAATACCTGCCCAAC-----GACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--CC--G--ACA-A---GAAATGACCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-
gi|15599 : TTCAATACCTGCCGAACCCTGTGTCATTGTTAAAAACA--TC-----A-------C--------A-A---GAA-TGACGTC---AGTACC-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-----------AA--------AT----T-G--GC--A---TTT---T-TGGAA--TT-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-AGTTT-CGGA-CTAA-ACGA--AGACAG
gi|15600 : TTCAATACCTACACAGT-----GTTATT---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--CG--GTCA-A-A---G-AATGAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------
gi|15601 : TCAATACCTGTCGAACCCT--G-TGCC---CTGGTTA---------AAA-A---CG--G--C-ACA---AGAATGACGTCAGTGG---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GGCA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---TTC---C-C---ATCAT-GCAC-GTGA-C-GGCACGGGC--A-CGTTT-CTGG-CGAA-ACGG--TGGTAGATAGCT-T----ATTTCTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAATGGTC-A---GATCTACAACAT
gi|15602 : TCGATACCTGTCGAAC-----AATACC---AAGATCA--TC-----AAA-ATTCCG--A--C-A-A---GAAATCGCCTC-TGGT---C-A---G-G-GTT-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TA----C-A--TTTTCCAAA--------AT----T-GT------------------TGGA--TT-GCAC-GTGT-T-TGCACGAGA--CGCATTT-CCGA-AAAAGACGG--AGAAAGATAGCT-T----ATTTGTTGAAGAAC-AAAGTTGCTTAGAA---TTAAAAAAGTACACAACATAT
gi|15603 : TCAATACCTGTCGAAC-----AACATC---GAGGTCA--TC-----AGA-TT--CC--G--ACA-A---GAAATGGCTTC-AAAT---T-A---G-------TT-G-A----A----T-TGC-------------------------------------------AT--G-T-GT------------------TG-------GCAC-GTA-------ACG-------CGTTT-CTGA-CTAA-ACGT--AGACAGATAGCT-T----A-AAATTTTAGAACAAAAAATG-TGAATG---AC-GA--GATCTTCAACATA-------TATGAGCCTCTCAT-TTTCTGGCACGTGC
gi|15604 : TCAATATCTGACGAAT-----GGCACT---AAAATAA--TT-----AAA-TT--CT--G--ACA-A---GGAATGAACTC-TCAG---G-A---G-G-G-G-TT-C-AAGCCG----TTGGAA-C----------C---------A--G------AG--------A--------------------------CCG-------GCAC-GTGT-T-GGCACGGGA--CGCATTT-CCGA-AAAA-ACGG--AGACAGAGAGCT-T----AT-TTTTGAAGAACAAAAGTTACTTATAA---TC-ATTCAGTACACAATATAT
gi|15605 : TCAATACCTACACAAT-----GATACC---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--TG--GT-C-A-A---GGAATAAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-
gi|15606 : TCAATACCTGTTGAAC-------C-CT---GTGTCCAGTTT-----AAA-AA--CGTCA--C-A-A---GAA-TGACGTC---AG---T-AATGG-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGAA-C----------C-C-----C-A-------------------ATTGG-C-GTCAT--A---TTTTAAC-CCGAA--TG-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-CGTTT-TGGA-CTAA-ATGA--AGACAGATAGCT-G----ATCACTCTAAGAACAAAAGTTGCTCAGAA---TA-AGGTGTTCTACAACATATgtcttattctctataagtcatggcacggcatttttttcaga
gi|15607 : CAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--CG--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-GTGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTTTCTGA-GTAG-ACGG--AGAGAGATCGCT-T----ATGTATTTGAGAACAAAATTTGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATACTTTTTGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCTTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTTATTTTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATATTATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAATATGTATCATTTTACACGACTTACATTTTAAAATTTAAATAATTT
gi|15608 : AATACCTATCGAAT-----GATACC---AAATTCA--TC-----CAG-TT--CT--GTCA-A-A---G-AATGAGGTC-ACGG---A-A---GAG-A-C-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C------------T------AA--------AT--GCC-GT-TC--A---TGT---G-TTAGT--AT-CCACGGTGT-T-TGCACGGGA--CGCGTTT-CTGA-ATAA-ACGC--TGACAGCTAGCT-T----AACTTTTTAAGAATAAAA-TTGCTTAGAA---TT-GGTTTCTCTAAAACATAT
gi|15609 : AAGACCTTTCCAAC-----GATACC--------TA--TCTTGAAAAA-AT--CG--G--ACA-A---GAAATGGCCTC-TCGA---CTA---A-G-G-T-TC-A-AG--CCCTTTT-GGC--C----------C-T-----C-A---------AG--------CT--G-A-CC-GC--A---T-------CTGAG--TT-G----GGGT-T----AAGG-------TTCTACTGG-CTAA-ACAG--TTGGAGTTAGCCAT----ATA-CTTTAAAGACAAAAGTTACTAAGAA---TT-AAATTCCCTACAACATAT
gi|15610 : ACCTTTCGAAC-----AAGACC---AAACTTA--AA-----AAA-AT--C------A-A-ACCGGAAGTGGCCTC-TGTG---C-AC--G-G-G-T-TC-G-AAT-CT----T-GGTA-T----------C-T-----C-G---------------------------GT-A------------------------------GGGTAT-TGTATGGGAT-T-TTTTT-CTGA-CTTA-ACGGTTA-AC-GTTAGCT-CAAGAATTTCTAT----ACAAAAGTTGCTCAGGA---GG-GTTTGCTCTACAACATGTT
gi|15611 : -----AAA-AA--CG--G--C-ACA---AGAATGACATCATTGC---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GACA-C----------C-C--------------------------------------AC--A---GTC---C-C---ACCAT-GCAT-GTG-----GCATG---------TTT-CTGG-CGAA-ATGG--TGGTAGACAACT-T----ATTTGTTAAAGGACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15612 : -A-A---GGAATGAGCTC-TATG---C-A---GAG-G-C-TC-G-AA--CA----T-GATA-C----------C------------T------AA--------AT--C-CCGT-AC--A---T--------------ATAGCA--GTGT----GCACGGGG--CGCGTTT-CTGAACTAA--TGG--AGACAGATTGCT-A----AATTTTCTAAGAAGAAAACTTGCTCAGA
gi|15613 : -A-A---GAA-TGAGCTC-AATA---C-A---G-G-G-G-TT-ACAA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-A----------------------------------A---TTC---C-C-GCC--AC-GTAC-GTTT-C-GGCACGGGC--G-CGTTT-CTGG-CGCA-ACGG--TGGTAGATAGCT-T----ATTTGTTTAAGTACCAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15614 : -A-A---GAAATGGCCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TATAATC-AACC------AA--------AT--A-T-G------A---T---------GA------GCAT-GGGT-A-TGCACGGGA--CGCGTTT-CTAA-CTGA-ACGG--AGACAGAAAGCT-T----ATCACTCTAAAAACAAATTTTGCATATAA---TT-AAATTTTCTACCACATAT
gi|15615 : ---G-G-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------CGC-----C-A--T-------------------------------------C---T-CGGCA--AG-GTGC-GTGT-C-GGTACAAGC--G-CGTTT-CTGA-CTAA-ATGG--TGACAAATAACA-T----ACTTGTTAAAGGACAAAAGTTGTTTAAAA---
gi|15616 : aatgagcactccatag-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---GTC---C-C-GCC--AT-GCAT-GTGG-C-GGCACGGGT--G-CGTTT-CTGG-CGAA-TTGG--TGGTAGATAGCT-T----ATTTGTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---
gi|15617 : ACATTTTCGGTATTTATCTATAATCTTT---GTGTATTCTGCACGGGTCAATC---CATTTATGCAAATTTCTTTTACGGCAAGCCAATT-----ATTCACATTGAATTGATCTAAAGAATGGTATAAAAAT--aataa
gi|15618 : TAA-ACTAACATATAATTGTTGACAATTATTTAATCTAATATTTCAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATTATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222 111 22222 11
lowQualScore : 77777 333 333 44444 33 22 777777777 4 222 1 444 222 1 666 4 1 3 2 2 1 33 3333 1 1 6666666666 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 0 8888 77777 44 3333 1 0 1 22 1 7777777777 444444 33333 1 7 2 111 88 8 1 8 00000 11 0 1 8
lowQualScore : ..... ... ... ..... .. .. ......... . ... . ... ... . ... . . . . . . .. .... . . .......... ................................................................. . . . .... ..... .. .... . . . .. . .......... ...... ..... . . . ... .. . . . ..... .. . . .
lowQualScore : 77777 222 999 33333 33 44 777777777 6 777 1 888 777 5 111 4 5 0 9 9 4 44 0000 4 4 5555555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 7 1 2222 55555 00 5555 7 3 7 33 7 8888888888 777777 22222 0 5 5 777 88 0 0 0 00000 00 8 4 0
consensus : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
Reference ( family-658 ) : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15589 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGGGTT-TTTTT--C----TGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAAATGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTAGTATGTATCTTTCATGTTT---GCG--TGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTCAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGAAAAAAACAACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAGTTGTTTAATACATTATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15590 : TTCAATATCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--GC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGTCTC-TCGG---C-A---G-A-G-TATC-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----CCA--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTT--C----TGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAATTGTTAAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATAGTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTATACAATGGTGCACAAAT--ACAGAATAATATTAACACAGAATTGTTGACAACTGTTTAATACATTATTTTAAAATTATTTATATTTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15591 : TTTAATACCTACCCAAC-----GACATA---AAGATCA--TC-----AAA-TT--T-C--G--ATA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-T-----C-A--T------AATTGACAAAAT--A-T-G--ACGAA---TTT---GG-TTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGCAGGGGA--CGCGTTT--C----TGA-CATA-ACGG--AGACAGATAGGT-TA------TCACTCTAAGAAAAATTGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15592 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-TCCC-G-AT--CA----T-GCCACC----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA------TTT--CTTTATGA-GTAA-ACGG--AGAGATATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACCAAAATTGTATGAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCT---ATGTTT---GCGAATGCGGCACGGGTCGAATCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTTCAAAAAT--ACACAATAATATTAACATATAAATGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15593 : TTCAATAATTGCCCAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-T--G--ACA-A---AAAATGGCCCT-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-GA--CA----T-GGCA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--AC--AAG-TT---------GAA--TT-GCAC-GAGT-A-TGCACAGAA--CACGTTT--C----TGA-CTGA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCATTCTAAAAACAAATGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15594 : TTCAATACCTGCCCAAC-----AACGCC---AAGATCA--TA-----AAA-TT--C-T--G--A-CTA---GAAATGGCCTC-TGGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--GC--GAGTTTG---G--TTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGAACGGAA--CGCGTTT--C----TGA-CTGA-ATGG--AGACAGATAGCT-TA------TCACTCTAAGAACAAATGTAACTTAAAA---TT-AAATTCTCTACAACATAT
gi|15595 : TTCAATACCTGTTGAAC-----GACACC---AAGATTA--TA-----AAA-TT--TTG--A--A-A-A---GAAATGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-CATATAATAGAC-C-----------------AA--------AT--A-T-GT-TG--A---GTT---GGGTTGAA--TT-GTAC-G-GT-TATGCACGGGA--CGCGTTT--C----TGA-CTAA-ACAA--AGGCAGATAGCT-TA------TCACTTTAAGAAC-AAATTTGCACGGAA---TG-AAATTTTCTACACTATATTT
gi|15596 : TTTAATACATGTCGAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAATTT--C-G--A--C-A-A---GAAATGGCATC-TGGG---C-AT--A-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GTCA-C----------C-
gi|15597 : TTCAATATCTGTCCAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-C--G--ACA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-A---G-GAG-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C------------T------AA--------AT--T-T-G-------------------CCAAA--AT-GGGT-GGAA-T-TGCACGGG---------T--A----TG--C----AGGG--AGACAGATA----CA------TCACTCTAAGAACAAATGTTGCTAAGAA---CT-AAATTCTCTACAATATATttaagttaaaattgcttgcaattaaattctctacaa
gi|15598 : TTCAATACCTGCCCAAC-----GACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-C--G--ACA-A---GAAATGACCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-
gi|15599 : TTCAATACCTGCCGAACCCTGTGTCATTGTTAAAAACA--TC-----A-------C---------A-A---GAA-TGACGTC---AGTACC-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-----------AA--------AT----T-G--GC--A---TTT---T--TGGAA--TT-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-AGTTT--C----GGA-CTAA-ACGA--AGACAG
gi|15600 : TTCAATACCTACACAGT-----GTTATT---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--C-G--GTCA-A-A---G-AATGAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------
gi|15601 : TCAATACCTGTCGAACCCT--G-TGCC---CTGGTTA---------AAA-A---C-G--G--C-ACA---AGAATGACGTCAGTGG---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GGCA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---TTC---C--C---ATCAT-GCAC-GTGA-C-GGCACGGGC--A-CGTTT--C----TGG-CGAA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTCTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAATGGTC-A---GATCTACAACAT
gi|15602 : TCGATACCTGTCGAAC-----AATACC---AAGATCA--TC-----AAA-ATTCC-G--A--C-A-A---GAAATCGCCTC-TGGT---C-A---G-G-GTT-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TA----C-A--TTTTCCAAA--------AT----T-GT-------------------TGGA--TT-GCAC-GTGT-T-TGCACGAGA--CGCATTT--C----CGA-AAAAGACGG--AGAAAGATAGCT-TA------TTTGTTGAAGAAC-AAAGTTGCTTAGAA---TTAAAAAAGTACACAACATAT
gi|15603 : TCAATACCTGTCGAAC-----AACATC---GAGGTCA--TC-----AGA-TT--C-C--G--ACA-A---GAAATGGCTTC-AAAT---T-A---G-------TT-G-A----A----T-TGC-------------------------------------------AT--G-T-GT-------------------TG-------GCAC-GTA-------ACG-------CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGT--AGACAGATAGCT-TA-------AAATTTTAGAACAAAAAATGT---GAA---TG-ACGAGATCTTCAACATA-------TATGAGCCTCTCAT-TTTCTGGCACGTGC
gi|15604 : TCAATATCTGACGAAT-----GGCACT---AAAATAA--TT-----AAA-TT--C-T--G--ACA-A---GGAATGAACTC-TCAG---G-A---G-G-G-G-TT-C-AAGCCG----TTGGAA-C----------C---------A--G------AG--------A---------------------------CCG-------GCAC-GTGT-T-GGCACGGGA--CGCATTT--C----CGA-AAAA-ACGG--AGACAGAGAGCT-TA------T-TTTTGAAGAACAAAAGTTACTTATAA---TC-ATTCAGTACACAATATAT
gi|15605 : TCAATACCTACACAAT-----GATACC---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--T-G--GT-C-A-A---GGAATAAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-
gi|15606 : TCAATACCTGTTGAAC-------C-CT---GTGTCCAGTTT-----AAA-AA--C-GTCA--C-A-A---GAA-TGACGTC---AG---T-AATGG-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGAA-C----------C-C-----C-A-------------------ATTGG-C-GTCAT--A---TTTTAAC--CCGAA--TG-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-CGTTT--T----GGA-CTAA-ATGA--AGACAGATAGCT-GA------TCACTCTAAGAACAAAAGTTGCTCAGAA---TA-AGGTGTTCTACAACATATgtcttattctctataagtcatggcacggcatttttttcaga
gi|15607 : CAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-GTGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTTT-C----TGA-GTAG-ACGG--AGAGAGATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAATTTGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATACTTTTTGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCTTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTTATTTTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATATTATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAATATGTATCATTTTACACGACTTACATTTTAAAATTTAAATAATTT
gi|15608 : AATACCTATCGAAT-----GATACC---AAATTCA--TC-----CAG-TT--C-T--GTCA-A-A---GAA-TGAGGTC-ACGG---A-A---G-A-GAC-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C------------T------AA--------AT--GCC-GT-TC--A---TGT---G--TTAGT--AT-CCACGGTGT-T-TGCACGGGA--CGCGTTT--C----TGA-ATAA-ACGC--TGACAGCTAGCT-TA------ACTTTTTAAGAATAAAA-TTGCTTAGAA---TT-GGTTTCTCTAAAACATAT
gi|15609 : AAGACCTTTCCAAC-----GATACC--------TA--TCTTGAAAAA-AT--C-G--G--ACA-A---GAAATGGCCTC-TCGA---CTA---A-G-G-T-TC-A-AG--CCCTTTT-GGC--C----------C-T-----C-A---------AG--------CT--G-A-CC-GC--A---T--------CTGAG--TT-G----GGGT-T----AAGG--------TTCTAC----TGG-CTAA-ACAG--TTGGAGTTAGCCATA------TA-CTTTAAAGACAAAAGTTACTAAGAA---TT-AAATTCCCTACAACATAT
gi|15610 : ACCTTTCGAAC-----AAGACC---AAACTTA--AA-----AAA-AT--C-------A-A-ACCGGAAGTGGCCTC-TGTG---C-AC--G-G-G-T-TC-G-AAT-CT----T-GGTA-T----------C-T-----C-G---------------------------GT-A-------------------------------GGGTAT-TGTATGGGAT-T-TTTTT--C----TGA-CTTA-ACGGTTA-AC-GTTAGCT-CAAGAATTTCTAT------ACAAAAGTTGCTCAGGA---GG-GTTTGCTCTACAACATGTT
gi|15611 : -----AAA-AA--C-G--G--C-ACA---AGAATGACATCATTGC---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GACA-C----------C-C--------------------------------------AC--A---GTC---C--C---ACCAT-GCAT-GTG-----GCATG---------TTT--C----TGG-CGAA-ATGG--TGGTAGACAACT-TA------TTTGTTAAAGGACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15612 : -A-A---GGAATGAGCTC-TATG---C-A---GAG-G-C-TC-G-AA--CA----T-GATA-C----------C------------T------AA--------AT--C-CCGT-AC--A---T---------------ATAGCA--GTGT----GCACGGGG--CGCGTTT--C----TGAACTAA--TGG--AGACAGATTGCT-AA------ATTTTCTAAGAAGAAAACTTGCTCAGA
gi|15613 : -A-A---GAA-TGAGCTC-AATA---C-A---G-G-G-G-TT-ACAA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-A----------------------------------A---TTC---C--C-GCC--AC-GTAC-GTTT-C-GGCACGGGC--G-CGTTT--C----TGG-CGCA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTTAAGTACCAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15614 : -A-A---GAAATGGCCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TATAATC-AACC------AA--------AT--A-T-G------A---T----------GA------GCAT-GGGT-A-TGCACGGGA--CGCGTTT--C----TAA-CTGA-ACGG--AGACAGAAAGCT-TA------TCACTCTAAAAACAAATTTTGCATATAA---TT-AAATTTTCTACCACATAT
gi|15615 : ---G-G-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------CGC-----C-A--T-------------------------------------C---T--CGGCA--AG-GTGC-GTGT-C-GGTACAAGC--G-CGTTT--C----TGA-CTAA-ATGG--TGACAAATAACA-TA------CTTGTTAAAGGACAAAAGTTGTTTAAAA---
gi|15616 : aatgagcactccatag-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---GTC---C--C-GCC--AT-GCAT-GTGG-C-GGCACGGGT--G-CGTTT--C----TGG-CGAA-TTGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---
gi|15617 : ACATTTTCGGTATTTATCTATAATCTTT---GTGTATTCTGCACGGGTCAATC---CATTTATGCAAATTTCTTTTACGGCAAGCCAAT-----TATTCACATTGAATTGATCTAAAGAATGGTATAAAAAT--aataa
gi|15618 : TAA-ACTAACATATAATTGTTGACAATTATTTAATCTAATATTTCAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATTATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222 111 22222 11
lowQualScore : 77777 333 333 44444 33 22 777777777 4 222 1 444 222 1 666 4 1 3 2 2 1 33 3333 1 1 6666666666 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 0 8888 77777 44 3333 1 0 1 22 1 7777777777 444444 33333 1 7 2 111 88 8 1 8 00000 11 0 1 8
lowQualScore : ..... ... ... ..... .. .. ......... . ... . ... ... . ... . . . . . . .. .... . . .......... ................................................................. . . . .... ..... .. .... . . . .. . .......... ...... ..... . . . ... .. . . . ..... .. . . .
lowQualScore : 77777 222 999 33333 33 44 777777777 6 777 1 888 777 5 111 4 5 0 9 9 4 44 0000 4 4 5555555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 7 1 2222 55555 00 5555 7 3 7 33 7 8888888888 777777 22222 0 5 5 777 88 0 0 0 00000 00 8 4 0
consensus : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
Reference ( family-658 ) : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15589 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGGGTT-TTTTT--C----TGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAAATGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTAGTATGTATCTTTCATGTTT---GCG--TGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTCAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGAAAAAAACAACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAGTTGTTTAATACATTATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15590 : TTCAATATCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--GC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGTCTC-TCGG---C-A---G-A-G-TATC-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----CCA--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTT--C----TGA-GTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAATTGTTAAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATAGTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTATACAATGGTGCACAAAT--ACAGAATAATATTAACACAGAATTGTTGACAACTGTTTAATACATTATTTTAAAATTATTTATATTTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15591 : TTTAATACCTACCCAAC-----GACATA---AAGATCA--TC-----AAA-TT--T-C--G--ATA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-T-----C-A--T------AATTGACAAAAT--A-T-G--ACGAA---TTT---GG-TTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGCAGGGGA--CGCGTTT--C----TGA-CATA-ACGG--AGACAGATAGGT-TA------TCACTCTAAGAAAAATTGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15592 : TTCAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-TCCC-G-AT--CA----T-GCCACC----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA------TTT--CTTTATGA-GTAA-ACGG--AGAGATATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACCAAAATTGTATGAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCT---ATGTTT---GCGAATGCGGCACGGGTCGAATCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTTCAAAAAT--ACACAATAATATTAACATATAAATGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15593 : TTCAATAATTGCCCAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-T--G--ACA-A---AAAATGGCCCT-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-GA--CA----T-GGCA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--AC--AAG-TT---------GAA--TT-GCAC-GAGT-A-TGCACAGAA--CACGTTT--C----TGA-CTGA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCATTCTAAAAACAAATGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15594 : TTCAATACCTGCCCAAC-----AACGCC---AAGATCA--TA-----AAA-TT--C-T--G--A-CTA---GAAATGGCCTC-TGGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--A-T-G--GC--GAGTTTG---G--TTGAA--TT-GCAC-GGGT-A-TGAACGGAA--CGCGTTT--C----TGA-CTGA-ATGG--AGACAGATAGCT-TA------TCACTCTAAGAACAAATGTAACTTAAAA---TT-AAATTCTCTACAACATAT
gi|15595 : TTCAATACCTGTTGAAC-----GACACC---AAGATTA--TA-----AAA-TT--TTG--A--A-A-A---GAAATGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-CATATAATAGAC-C-----------------AA--------AT--A-T-GT-TG--A---GTT---GGGTTGAA--TT-GTAC-G-GT-TATGCACGGGA--CGCGTTT--C----TGA-CTAA-ACAA--AGGCAGATAGCT-TA------TCACTTTAAGAAC-AAATTTGCACGGAA---TG-AAATTTTCTACACTATATTT
gi|15596 : TTTAATACATGTCGAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAATTT--C-G--A--C-A-A---GAAATGGCATC-TGGG---C-AT--A-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GTCA-C----------C-
gi|15597 : TTCAATATCTGTCCAAC-----AACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-C--G--ACA-A---GAATTGGCCTC-TGGG---C-A---G-GAG-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C------------T------AA--------AT--T-T-G-------------------CCAAA--AT-GGGT-GGAA-T-TGCACGGG---------T--A----TG--C----AGGG--AGACAGATA----CA------TCACTCTAAGAACAAATGTTGCTAAGAA---CT-AAATTCTCTACAATATATttaagttaaaattgcttgcaattaaattctctacaa
gi|15598 : TTCAATACCTGCCCAAC-----GACATC---AAGATCA--TC-----AAA-TT--C-C--G--ACA-A---GAAATGACCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-
gi|15599 : TTCAATACCTGCCGAACCCTGTGTCATTGTTAAAAACA--TC-----A-------C---------A-A---GAA-TGACGTC---AGTACC-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-----------AA--------AT----T-G--GC--A---TTT---T--TGGAA--TT-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-AGTTT--C----GGA-CTAA-ACGA--AGACAG
gi|15600 : TTCAATACCTACACAGT-----GTTATT---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--C-G--GTCA-A-A---G-AATGAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------
gi|15601 : TCAATACCTGTCGAACCCT--G-TGCC---CTGGTTA---------AAA-A---C-G--G--C-ACA---AGAATGACGTCAGTGG---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GGCA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---TTC---C--C---ATCAT-GCAC-GTGA-C-GGCACGGGC--A-CGTTT--C----TGG-CGAA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTCTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAATGGTC-A---GATCTACAACAT
gi|15602 : TCGATACCTGTCGAAC-----AATACC---AAGATCA--TC-----AAA-ATTCC-G--A--C-A-A---GAAATCGCCTC-TGGT---C-A---G-G-GTT-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TA----C-A--TTTTCCAAA--------AT----T-GT-------------------TGGA--TT-GCAC-GTGT-T-TGCACGAGA--CGCATTT--C----CGA-AAAAGACGG--AGAAAGATAGCT-TA------TTTGTTGAAGAAC-AAAGTTGCTTAGAA---TTAAAAAAGTACACAACATAT
gi|15603 : TCAATACCTGTCGAAC-----AACATC---GAGGTCA--TC-----AGA-TT--C-C--G--ACA-A---GAAATGGCTTC-AAAT---T-A---G-------TT-G-A----A----T-TGC-------------------------------------------AT--G-T-GT-------------------TG-------GCAC-GTA-------ACG-------CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGT--AGACAGATAGCT-TA-------AAATTTTAGAACAAAAAATGT---GAA---TG-ACGAGATCTTCAACATA-------TATGAGCCTCTCAT-TTTCTGGCACGTGC
gi|15604 : TCAATATCTGACGAAT-----GGCACT---AAAATAA--TT-----AAA-TT--C-T--G--ACA-A---GGAATGAACTC-TCAG---G-A---G-G-G-G-TT-C-AAGCCG----TTGGAA-C----------C---------A--G------AG--------A---------------------------CCG-------GCAC-GTGT-T-GGCACGGGA--CGCATTT--C----CGA-AAAA-ACGG--AGACAGAGAGCT-TA------T-TTTTGAAGAACAAAAGTTACTTATAA---TC-ATTCAGTACACAATATAT
gi|15605 : TCAATACCTACACAAT-----GATACC---AAGTTCA--AC-----AAA-AT--T-G--GT-C-A-A---GGAATAAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-
gi|15606 : TCAATACCTGTTGAAC-------C-CT---GTGTCCAGTTT-----AAA-AA--C-GTCA--C-A-A---GAA-TGACGTC---AG---T-AATGG-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGAA-C----------C-C-----C-A-------------------ATTGG-C-GTCAT--A---TTTTAAC--CCGAA--TG-GCAC-GTGT-T-GGCACGGG---C-CGTTT--T----GGA-CTAA-ATGA--AGACAGATAGCT-GA------TCACTCTAAGAACAAAAGTTGCTCAGAA---TA-AGGTGTTCTACAACATATgtcttattctctataagtcatggcacggcatttttttcaga
gi|15607 : CAATACCTACCGAAC-----GACACC---AAGATCA--AC-----AAA-AT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-GTGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTAAA--AT-GTCC-GTGT-T-TGCACGGGA--T-TTTTTT-C----TGA-GTAG-ACGG--AGAGAGATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAATTTGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATACTTTTTGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCTTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTTATTTTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATATTATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAATATGTATCATTTTACACGACTTACATTTTAAAATTTAAATAATTT
gi|15608 : AATACCTATCGAAT-----GATACC---AAATTCA--TC-----CAG-TT--C-T--GTCA-A-A---GAA-TGAGGTC-ACGG---A-A---G-A-GAC-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C------------T------AA--------AT--GCC-GT-TC--A---TGT---G--TTAGT--AT-CCACGGTGT-T-TGCACGGGA--CGCGTTT--C----TGA-ATAA-ACGC--TGACAGCTAGCT-TA------ACTTTTTAAGAATAAAA-TTGCTTAGAA---TT-GGTTTCTCTAAAACATAT
gi|15609 : AAGACCTTTCCAAC-----GATACC--------TA--TCTTGAAAAA-AT--C-G--G--ACA-A---GAAATGGCCTC-TCGA---CTA---A-G-G-T-TC-A-AG--CCCTTTT-GGC--C----------C-T-----C-A---------AG--------CT--G-A-CC-GC--A---T--------CTGAG--TT-G----GGGT-T----AAGG--------TTCTAC----TGG-CTAA-ACAG--TTGGAGTTAGCCATA------TA-CTTTAAAGACAAAAGTTACTAAGAA---TT-AAATTCCCTACAACATAT
gi|15610 : ACCTTTCGAAC-----AAGACC---AAACTTA--AA-----AAA-AT--C-------A-A-ACCGGAAGTGGCCTC-TGTG---C-AC--G-G-G-T-TC-G-AAT-CT----T-GGTA-T----------C-T-----C-G---------------------------GT-A-------------------------------GGGTAT-TGTATGGGAT-T-TTTTT--C----TGA-CTTA-ACGGTTA-AC-GTTAGCT-CAAGAATTTCTAT------ACAAAAGTTGCTCAGGA---GG-GTTTGCTCTACAACATGTT
gi|15611 : -----AAA-AA--C-G--G--C-ACA---AGAATGACATCATTGC---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GACA-C----------C-C--------------------------------------AC--A---GTC---C--C---ACCAT-GCAT-GTG-----GCATG---------TTT--C----TGG-CGAA-ATGG--TGGTAGACAACT-TA------TTTGTTAAAGGACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15612 : -A-A---GGAATGAGCTC-TATG---C-A---GAG-G-C-TC-G-AA--CA----T-GATA-C----------C------------T------AA--------AT--C-CCGT-AC--A---T---------------ATAGCA--GTGT----GCACGGGG--CGCGTTT--C----TGAACTAA--TGG--AGACAGATTGCT-AA------ATTTTCTAAGAAGAAAACTTGCTCAGA
gi|15613 : -A-A---GAA-TGAGCTC-AATA---C-A---G-G-G-G-TT-ACAA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-A----------------------------------A---TTC---C--C-GCC--AC-GTAC-GTTT-C-GGCACGGGC--G-CGTTT--C----TGG-CGCA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTTAAGTACCAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15614 : -A-A---GAAATGGCCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TATAATC-AACC------AA--------AT--A-T-G------A---T----------GA------GCAT-GGGT-A-TGCACGGGA--CGCGTTT--C----TAA-CTGA-ACGG--AGACAGAAAGCT-TA------TCACTCTAAAAACAAATTTTGCATATAA---TT-AAATTTTCTACCACATAT
gi|15615 : ---G-G-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------CGC-----C-A--T-------------------------------------C---T--CGGCA--AG-GTGC-GTGT-C-GGTACAAGC--G-CGTTT--C----TGA-CTAA-ATGG--TGACAAATAACA-TA------CTTGTTAAAGGACAAAAGTTGTTTAAAA---
gi|15616 : aatgagcactccatag-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C---------------------------------C--A---GTC---C--C-GCC--AT-GCAT-GTGG-C-GGCACGGGT--G-CGTTT--C----TGG-CGAA-TTGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---
gi|15617 : ACATTTTCGGTATTTATCTATAATCTTT---GTGTATTCTGCACGGGTCAATC---CATTTATGCAAATTTCTTTTACGGCAAGCCAAT-----TATTCACATTGAATTGATCTAAAGAATGGTATAAAAAT--aataa
gi|15618 : TAA-ACTAACATATAATTGTTGACAATTATTTAATCTAATATTTCAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATTATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATATTTT
blockSeqs : CCTGT GTT GTT TTGAA TT TC GGTCA T CCG A AGT TAC T ATG C A T A C C GC CTTT T C ATATAATAGA TCATAATTGACAAAATATGACGAATTTGGTTGAAT A G TAT ACG TA TTTA A G TT A AGAATTTCTA TGGTC ATTGA G A G CTG CG C C A TTTAT . T A
blockSeqs : CCT . G . A . GTCAC C . T ATT . . AG C . A C . . T . . . . TATAATCGACCAAATATGGCGAGTTTGGTTGAAT . . ATT ACA T . . . . . TGTA TTA AATTT G C G . AA . C . . . A .
blockSeqs : . . T . T . TGTCA C . A TC . . AG A . . . . . . . . . . TATAATCGACCAAATATGACAAGTTGAAT . . TT ACG . . . . . . TCAC AC ATTGA T A G . CG . A . . . A .
blockSeqs : . . A . A . CGAT . . A TG . . AG . . . . . . . . . . . CCAATTGGCGTCATATTTTAACCCGAAT . . AT ACG . . . . . . TGTA TT AATTT G A C . CT . T . . . A .
blockSeqs : . . T . T . TGAC . . A TC . . A . . . . . . . . . . . CCCATAAATGTGTACATTCCCTAAAA . . TT ACG . . . . . . TCAT AC AATTC . . . . TA
blockSeqs : . . T . T . TGAA . . A TG . . A . . . . . . . . . . . CCAATAAATGTGTACATTCCCTAAAA . . AT ACG . . . . . . TCAC TT AATTT
blockSeqs : . . T . T . CGAC . . A TG . . A . . . . . . . . . . . CCATAAATGTGTACATTCCCTAAAA . . AT ACG . . . . . . TCAC TT AATTC
blockSeqs : . . T . T . CGAC . . T TG . . T . . . . . . . . . . . CAAATATGTTGAGTTGGGTTGAAT . . TT ATT . . . . . . TCAC TG AAAAG
blockSeqs : . . T . T . CGAC . . A TG . . C . . . . . . . . . . . TACATTTTCCAAAATTGTTGGAT . . TG GCG . . . . . . TTTC CT CGAGA
blockSeqs : . . T . A . TGAC . . A TG . . . . . . . . . . . . . . TAAATGCCGTTCATGTGTTAGTA . . CG ACG . . . . . . TTTG TG TTCAG
blockSeqs : . . T . A . GGTC . . A TT . . . . . . . . . . . . . . TATAATCAACCAAATATGATGA . . TT AT . . . . . . TCAC TC GGTGT
blockSeqs : . . A . A . GGAC . . A TT . . . . . . . . . . . . . . CCAAATTGGCATTTTTGGAAT . . TG CA . . . . . . TGTA TA ATTGA
blockSeqs : . . T . T . GGA . . A TG . . . . . . . . . . . . . . TCAAGCTGACCGCATCTGAGT . . TG AT . . . . . . ACTT AC GTTTC
blockSeqs : . . T . T . GGA . . A AA . . . . . . . . . . . . . . TAAATCCCGTACATA . . TT CG . . . . . . TTTG TT AATTC
blockSeqs : . . T . A . TGA . . A TC . . . . . . . . . . . . . . TAAATTTGCCAAAA . . TT CG . . . . . . ATTT TT TTTGC
blockSeqs : . . A . A . GAC . . A TT . . . . . . . . . . . . . . CCCATTCCCATCA . . CG TG . . . . . . TTTG GG TTAAA
blockSeqs : . . A . A . GGC . . A GT . . . . . . . . . . . . . . CACAGTCCCACCA . . AT A . . . . . . TCAC TC TTAAA
blockSeqs : . . T . T . GAC . . G AC . . . . . . . . . . . . . . CCAATTCCCGCCA . . CG C . . . . . . CTTG TC AATTT
blockSeqs : . . T . A . GGA . . A TC . . . . . . . . . . . . . . GCCATCTCGGCAA . . CG C . . . . . . TTTG TT GA
blockSeqs : . . A . A . GGC . . A TG . . . . . . . . . . . . . . CCCAGTCCCGCCA . . T . . . . . . . AAA
blockSeqs : . . . . A . A . . A TA . . . . . . . . . . . . . . ATGTGTTG . . . . . . . . . . TTT
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . AGAGACCG . . . . . . . . . . TAC
blockSeqs : . . . TT . . . . . . . . . . . . . . TCGGTA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : GGAC***** ACG** CG **
originalCons : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--C-G--G--A-A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGA--C-CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
finalCons : TTCAATACCTGCCGAAC-----GACACC---AAGATCA--TC-----AAA-NT--CGGAC-----A-A---GAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--G-T-GT-AC--A---TTC---C--CTGAA--AT-GCAC-GTGT-T-TGCACGGGACG--CGTTT--C----TGA-CTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATACTTAT-----TGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 22222 11
lowQualScore : 333 999999999 22 1 4 5 0 3 444 222 3 444 4 1 1 1 5 1 33 3333 1 1 6666666666 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 11 8888 77 1 5555 1 1 22 1 7777777777 444444 33333 1 2 2 111 88 8 1 8 00000 11 0 1 8
lowQualScore : ... ......... .. . . . . . ... ... . ... . . . . . . .. .... . . .......... ............................................................... . .. .... .. . .... . . .. . .......... ...... ..... . . . ... .. . . . ..... .. . . .
lowQualScore : 222 333333333 77 7 8 2 5 0 888 777 1 666 4 5 5 4 7 4 44 0000 4 4 5555555555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 88 3333 22 4 8888 7 7 33 7 8888888888 777777 22222 0 5 5 777 88 0 0 0 00000 00 8 4 0
consensus : TTCAATACCTGCCGAAC---GACACCAAGATCA--TC-----AAAN-T-CGG-ACAAGAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTGAA--AT-GCACG-TGT-T-TGCACGGG-ACGCGTTT----CTG-ACTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATAC-----TTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
Reference ( family-658 ) : TTCAATACCTGCCGAAC---GACACCAAGATCA--TC-----AAAN-T-CGG-ACAAGAAATGGCCTC-TNGG---C-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTGAA--AT-GCACG-TGT-T-TGCACGGG-ACGCGTTT----CTG-ACTAA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCTNTTTAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-AANTNNTCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATANTTT-TGGTATAC-----TTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15589 : TTCAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCA--AC-----AAAA-T-CGG-A-AAGAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCCG-TGT-T-TGCACGGG-G---GTTTTTTTCTG-AGTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAAATGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTAGTATGTATCTTTCATGTTT---GCG--TGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATAC-----TCATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGAAAAAAACAACAGAATAATATTAACATATAATTGTTGACAGTTGTTTAATACATTATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATAATTT
gi|15590 : TTCAATATCTACCGAAC---GACACCAAGATCA--GC-----AAAA-T-CGG-A-AAGAAATGGTCTC-TCGG---C-A---G-A-G-TATC-G-AA--CA----T-GACACC----------C-C-----C-A--T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCCG-TGT-T-TGCACGGG-AT-TTTTT----CTG-AGTAA-ACGG--AGAGAGGTCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAAATTGTTAAAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCGTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATAG-----TTATTGTTAACATTGAATAGATCTATACAATGGTGCACAAAT--ACAGAATAATATTAACACAGAATTGTTGACAACTGTTTAATACATTATTTTAAAATTATTTATATTTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15591 : TTTAATACCTACCCAAC---GACATAAAGATCA--TC-----AAAT-T-TCG-ATAAGAATTGGCCTC-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-T-----C-A--T------AATTGACAAAAT--AT-G--ACGAA---TTT---GGTTGAA--TT-GCACG-GGT-A-TGCAGGGG-ACGCGTTT----CTG-ACATA-ACGG--AGACAGATAGGT-TA------TCACTCTAAGAAAAATTGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15592 : TTCAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCA--AC-----AAAA-T-CGG-A-AAGAAATGGCCTC-TCGA---C-A---G-A-G-T-CCCG-AT--CA----T-GCCA-C----------C-C-----CCA--T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCCG-TGT-T-TGCACGGG-ATTTCTTT----ATG-AGTAA-ACGG--AGAGATATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACCAAAATTGTATGAAA---AC-AATTGATCTACAACATATTTTTGGTATGTATCTAT---GTTT---GCGAATGCGGCACGGGTCGAATCCGCAATGATA-AAACATACTTT-TGGTATAC-----TTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTTCAAAAAT--ACACAATAATATTAACATATAAATGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATCATTTTACACGTCTTACATTTT-AAATTTAAATAATTT
gi|15593 : TTCAATAATTGCCCAAC---GACACCAAGATCA--TC-----AAAT-T-CTG-ACAAAAAATGGCCCT-TGGG---C-AA--G-G-G-T-TT-G-GA--CA----T-GGCA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--AT-G--AC--AAG-TT--------GAA--TT-GCACG-AGT-A-TGCACAGA-ACACGTTT----CTG-ACTGA-ACGG--AGACAGATAGCT-TA------TCATTCTAAAAACAAATGTTGCTTAGAA---TT-AAATTTTCTACAACATAT
gi|15594 : TTCAATACCTGCCCAAC---AACGCCAAGATCA--TA-----AAAT-T-CTG-ACTAGAAATGGCCTC-TGGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-T-------A--T------AATCGACCAAAT--AT-G--GC--GAGTTTG---G-TTGAA--TT-GCACG-GGT-A-TGAACGGA-ACGCGTTT----CTG-ACTGA-ATGG--AGACAGATAGCT-TA------TCACTCTAAGAACAAATGTAACTTAAAA---TT-AAATTCTCTACAACATAT
gi|15595 : TTCAATACCTGTTGAAC---GACACCAAGATTA--TA-----AAAT-T-TTG-AAAAGAAATGGCCTC-TGGG---CAA---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-CATATAATAGAC-C-----------------AA--------AT--AT-GT-TG--A---GTTGG-G-TTGAA--TT-GTACG--GT-TATGCACGGG-ACGCGTTT----CTG-ACTAA-ACAA--AGGCAGATAGCT-TA------TCACTTTAAGAAC-AAATTTGCACGGAA---TG-AAATTTTCTACACTATATTT
gi|15596 : TTTAATACATGTCGAAC---AACATCAAGATCA--TC-----AAAT-T-TCG-ACAAGAAATGGCATC-TGGG---C-AT--A-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GTCA-C----------C-
gi|15597 : TTCAATATCTGTCCAAC---AACATCAAGATCA--TC-----AAAT-T-CCG-ACAAGAATTGGCCTC-TGGG---C-A---G-GAG-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C------------T------AA--------AT--TT-G------------------CCAAA--AT-GGGTG-GAA-T-TGCACGGGTATGC------------------AGGG--AGACAGATA----CA------TCACTCTAAGAACAAATGTTGCTAAGAA---CT-AAATTCTCTACAATATATttaagttaaaattgcttgcaattaaattctctacaa
gi|15598 : TTCAATACCTGCCCAAC---GACATCAAGATCA--TC-----AAAT-T-CCG-ACAAGAAATGACCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-
gi|15599 : TTCAATACCTGCCGAAC-------CCTGTGTCA--TTGTTAAAAACAT-C---ACAAGAA-TGACGTC---AGTACC-A---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-C-----C-A----------A--------AT---T-G--GC--A---TTT---T-TGGAA--TT-GCACG-TGT-T-GGCACGGG--CA-GTTT----CGG-ACTAA-ACGA--AGACAG
gi|15600 : TTCAATACCTACACAGT---GTTATTAAGTTCA--AC-----AAAA-T-CGG-TCAAAGAATGAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------
gi|15601 : TCAATACCTGTCGAACCCTG-TGCCCTGGTTA---------AAAA---CGGCACAAGAA-TGACGTCAGTGG---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GGCA-C----------C-C-----C--------------------------------C--A---TTC---C-C---ATCAT-GCACG-TGA-C-GGCACGGG--CACGTTT----CTG-GCGAA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTCTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAATGGTC-A---GATCTACAACAT
gi|15602 : TCGATACCTGTCGAAC---AATACCAAGATCA--TC-----AAAA-TTCCG-ACAAGAAATCGCCTC-TGGT---C-A---G-G-G-T-TTTG-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TA----C-A--TTTTCCAAA--------AT---T-GT------------------TGGA--TT-GCACG-TGT-T-TGCACGAG-ACGCATTT----CCG-AAAAAGACGG--AGAAAGATAGCT-TA------TTTGTTGAAGAAC-AAAGTTGCTTAGAA---TTAAAAAAGTACACAACATAT
gi|15603 : TCAATACCTGTCGAAC---AACATCGAGGTCA--TC-----AGAT-T-CCG-ACAAGAAATGGCTTC-AAAT---T-A---G-------TT-G-A----A----T-TGC-------------------------------------------AT--GT-GT------------------TG-------GCACG-T------------A-ACGCGTTT----CTG-ACTAA-ACGT--AGACAGATAGCT-TA-------AAATTTTAGAACAAAAAATGT---GAA---TG-ACGAGATCTTCAACATA-------TATGAGCCTCTCAT-TTTCTGGCACGTGC
gi|15604 : TCAATATCTGACGAAT---GGCACTAAAATAA--TT-----AAAT-T-CTG-ACAAGGAATGAACTC-TCAG---G-A---G-G-G-G-TT-C-AAGCCG----TTGGAA-C----------C---------A--G------AG--------A-------------------------CCG-------GCACG-TGT-T-GGCACGGG-ACGCATTT----CCG-AAAAA-ACGG--AGACAGAGAGCT-TA------T-TTTTGAAGAACAAAAGTTACTTATAA---TC-ATTCAGTACACAATATAT
gi|15605 : TCAATACCTACACAAT---GATACCAAGTTCA--AC-----AAAA-T-TGG-TCAAGGAATAAACTC-TTGG---C-A---GCG-A-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-
gi|15606 : TCAATACCTGTTGAAC-----C-CTGTGTCCAGTTT-----AAAA-A-CGTCACAAGAA-TGACGTC---AG---T-AATGG-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGAA-C----------C-C-----C-A-------------------ATTGGC-GTCAT--A---TTTTAAC-CCGAA--TG-GCACG-TGT-T-GGCACGGG--C-CGTTT----TGG-ACTAA-ATGA--AGACAGATAGCT-GA------TCACTCTAAGAACAAAAGTTGCTCAGAA---TA-AGGTGTTCTACAACATATgtcttattctctataagtcatggcacggcatttttttcaga
gi|15607 : CAATACCTACCGAAC---GACACCAAGATCA--AC-----AAAA-T-CGG-A-AAGAAATGGCCTC-GTGA---C-A---G-A-G-T-CTCG-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-AA-T------AA--------AT--GT-GT-AC--A---TTC---C-CTAAA--AT-GTCCG-TGT-T-TGCACGGG-ATTTTTTT----CTG-AGTAG-ACGG--AGAGAGATCGCT-TA------TGTATTTGAGAACAAAATTTGTTTAAAA---AC-AATTGATCTACAACATACTTTTTGTATGTATCTATCATGTTT---GCGCTTGCGGCACGGGTCGATTCCGCAATGATA-AAACATAATTT-TGGTATACTTATTTTATTGTTAACATTGAATAGATCTAAACAATGGTGCAAAAAT--ACAGAATATTATTAACATATAATTGTTGACAATTGTTTAATATAATATTTTAAAGTTATTTATAATTATTTCATAAATATGTATCATTTTACACGACTTACATTTTAAAATTTAAATAATTT
gi|15608 : AATACCTATCGAAT---GATACCAAATTCA--TC-----CAGT-T-CTG-TCAAAGAATGAGGTC-ACGG---A-A---G-A-GAC-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C------------T------AA--------AT--GCCGT-TC--A---TGT---G-TTAGT--AT-CCACGGTGT-T-TGCACGGG-ACGCGTTT----CTG-AATAA-ACGC--TGACAGCTAGCT-TA------ACTTTTTAAGAATAAAA-TTGCTTAGAA---TT-GGTTTCTCTAAAACATAT
gi|15609 : AAGACCTTTCCAAC---GATACC-----TA--TCTTGAAAAAA-T-CGG-ACAAGAAATGGCCTC-TCGA---CTA---A-G-G-T-TC-A-AG--CCCTTTT-GGC--C----------C-T-----C-A---------AG--------CT--GA-CC-GC--A---T-------CTGAG--TT-G---G-GGT-T----------AAG-GTTCTA--CTG-GCTAA-ACAG--TTGGAGTTAGCCATA------TA-CTTTAAAGACAAAAGTTACTAAGAA---TT-AAATTCCCTACAACATAT
gi|15610 : ACCTTTCGAAC---AAGACCAAACTTA--AA-----AAAA-T-CAA-ACCGGAAGTGGCCTC-TGTG---C-AC--G-G-G-T-TC-G-AAT-CT----T-GGTA-T----------C-T-----C-G--------------------------GT-A-----------------------------G-GGTAT-TGTATGGG-ATTTTTTT----CTG-ACTTA-ACGGTTA-AC-GTTAGCT-CAAGAATTTCTAT------ACAAAAGTTGCTCAGGA---GG-GTTTGCTCTACAACATGTT
gi|15611 : -----AAAA-A-CGGCACAAGAA-TGACATCATTGC---C-G---G-G-G-T-TT-G-AA--CA----C-GACA-C----------C-C-------------------------------------AC--A---GTC---C-C---ACCAT-GCATG-TG-----GCATG--------TTT----CTG-GCGAA-ATGG--TGGTAGACAACT-TA------TTTGTTAAAGGACAAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15612 : AAGGAATGAGCTC-TATG---C-A---GAG-G-C-TC-G-AA--CA----T-GATA-C----------C------------T------AA--------AT--CCCGT-AC--A---T--------------ATAGCA-G-TGT----GCACGGG-GCGCGTTT----CTGAACT-A-ATGG--AGACAGATTGCT-AA------ATTTTCTAAGAAGAAAACTTGCTCAGA
gi|15613 : AAGAA-TGAGCTC-AATA---C-A---G-G-G-G-TT-ACAA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C-A---------------------------------A---TTC---C-C-GCC--AC-GTACG-TTT-C-GGCACGGG--CGCGTTT----CTG-GCGCA-ACGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTTAAGTACCAAAGTTGCTTAGAA---TC-GTTAAATCTACAACATAT
gi|15614 : AAGAAATGGCCTC-TTGG---C-AAG-G-G-G-T-TT-G-AA--CA----T-GGCA-C----------C-TATAATC-AACC------AA--------AT--AT-G------A---T---------GA------GCATG-GGT-A-TGCACGGG-ACGCGTTT----CTA-ACTGA-ACGG--AGACAGAAAGCT-TA------TCACTCTAAAAACAAATTTTGCATATAA---TT-AAATTTTCTACCACATAT
gi|15615 : ---G-G-A-T-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------CGC-----C-A--T------------------------------------C---T-CGGCA--AG-GTGCG-TGT-C-GGTACAAG--CGCGTTT----CTG-ACTAA-ATGG--TGACAAATAACA-TA------CTTGTTAAAGGACAAAAGTTGTTTAAAA---
gi|15616 : aatgagcactccatag-TT-G-AA--CA----T-GACA-C----------C-C-----C--------------------------------C--A---GTC---C-C-GCC--AT-GCATG-TGG-C-GGCACGGG--TGCGTTT----CTG-GCGAA-TTGG--TGGTAGATAGCT-TA------TTTGTTAAAGAACAAAAGTTGCTTAGAA---
gi|15617 : ACATTTTCGGTATTTATCTATAATCTTT---GTGTATTCTGCACGGGTCAATC---CATTTATGCAAATTTCTTTTACGGCAAGC-----CAATTATTCACATTGAATTGATCTAAAGAATGGTATAAAAAT--aataa
gi|15618 : TAA-ACTAACATATAATTGTTGACAATTATTTAATCTAATATTTCAAAATTATTTATAATTATTTCATAAACATGTATTATTTTACACGTCTTACATTTT-AGATTTAAATATTTT