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Reference ( gi|114124 )       : CAGTTGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGATCGTGGAG-GATTG-ATCG--CCTTTTACTATCT-------------------TCTGTC-TATCT-TTCTTATG----T-CTG-ATAA-----TA------T--AA----CTTTCTGTTCT----TGTATTTGAATAAACCGGTT--------TGA-GTCCATATTTAATATGGATATCATA-TA-T-GATAACT-GGTT-T--T-TC--AAACAC------TA----TT--AGT---ATTCCGTTCT-GC----TTTCAG-ATTTGTCTACTAA---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-GTTTTATTCCGTACATGCCCGTATTAGTCT-T-TTCTCTT---AATTTACT
gi|114125                     : CAGTGGGATGAGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATTG-AGCG--CCTTTTACTATAT-------------------TCTCTC-TGTCT-TTCTT-TG----T-CTA-ATTA-----TA------T--AA----CTTTCTGTTTT----TGTGTTTGAATAAAACGGGT--------TGA-GTCCACATTTAATATGGATATCATA-TT-T-GATAACT-GTTT-T--T-TC--AAATAC------TA----TT--AGT---ACTTCGTTCT-G-----TTTCAG-ATTTATCTACTTT---AAC----GTTCGTTCTTCATCCTAAAG-CTTTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAG--A-T-TGCTTTTTGAAATTTACT
gi|114126                     : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGATACAATCACCGGTCGTGGAG-GACTG-AGCA--CCTTTTATTGCCT-------------------TCT----------TTCTTATG----T-TTA-ATAA------A------T--AAAAAACTTTCTTTTCTCAGTTTTGTTTGAATAAACCGGTT--------TGA-GTCCATATTTAATATGGATGTCATA-TT-T-GATAACT-GATT-T--T-TA--AAACAC------TA----TT--GGT---ACTCCGTTCT-GG----TTTCAG-ATTTGTCTGCTTG---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C--TTTT-TTCTATACATTCCCGTATTAGTCT-T-TTCTCTA---AACTTACT
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gi|114143                     :       GATATGATTG---TATTCTTG--CAAATG-TACAGTCGCCGGTCGTGG-T-GATTGGAACG--CCTTTT-CTATTC-------------------TCTTGC-TATCT-GTC-TATG----T-CT
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gi|114150                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATTA-AGCG--CCTGTC-CTATAT-------------------TCTcttct
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Alignments
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lowQualScore                  :                 777 000    77        1     0            3    3     77     6666666666666    5 4  00000000 6666666   888888 5   00000000000000000000000000     7     1  7  999999  555555  777  4    777  5555       22   1                    1  1      000   4 5 5  5       7    11 7  4     5555555555555555555555555555 9    555555      7    666     88888   1111    8               444                           7   444               
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Reference ( family-654 )      : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------CACTGTCT-TC--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAAT-AANGT------AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCATATTTAATATGGA-T-TCATA-T-TT-GATAACT-GGTT-TT-TCAAACAC---------TA----TTAGT---ACTCCGTTCTG-----ATTTCAGTATTT-T-CTGCTAA---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-TTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAG-TCT-T-TTCTCTAAATTTACT
gi|114124                     : CAGTTGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGATCGTGGAG-GATT-GATCG--CCTTT-----------TACTATCT-TC--------TG---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTGAT-AATAT------AA------CT---TTCTGTT---CT----TGTATTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCATATTTAATATGGA-TATCATA-T-AT-GATAACT-GGTT-TT-TCAAACAC---------TA----TTAGT---ATTCCGTTCTG-----CTTTCAG-ATTTGT-CTACTAA---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-GTTTTATTCCGTACATGCCCGTATTAG-TCT-T-TTCTCTTAATTTACT
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Reference ( family-654 )      : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------CACTGTCT-TC--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAAT-AANGT------AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCATATTTAATATGGATATCATA-T-TT-GATAACT-GGTTNT--TCAAACAC---------TA------TTAGTACTCCGNTCTGATTTCAGTATTT-T-CTGCTAA---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-TTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAG-TCT-T-TTCTCTAAATTTACT
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gi|114125                     : CAGTGGGATGAGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------TACTATAT-TC--------TC---TC-TGT-----CT-TTC-------T------------------T-TGT-CTAAT-TATAT------AA------CT---TTCTGTT---TT----TGTGTTT--GAATAAAACGGGTTGAGTCCACATTTAATATGGATATCATA-T-TT-GATAACT-GTTTTT--TCAAATAC---------TA------TTAGTACTTCGTTCTG-TTTCAG-ATTTAT-CTACTTT---AAC----GTTCGTTCTTCATCCTAAAG-CTTTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAGATTG-C-TTTTTGAAATTTACT
gi|114126                     : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGATACAATCACCGGTCGTGGAG-GACT-GAGCA--CCTTT-----------TATTGCCT-TC--------T------------------TTC-------T------------------TATGT-TTAAT-AAA-T------AAAAAA--CT---TTCTTTT---CTCAGTTTTGTTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCATATTTAATATGGATGTCATA-T-TT-GATAACT-GATTTT--TAAAACAC---------TA------TTGGTACTCCGTTCTGGTTTCAG-ATTTGT-CTGCTTG---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-TTTT--TTCTATACATTCCCGTATTAG-TCT-T-TTCTCTAAACTTACT
gi|114127                     : CAGCGTGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------TACTATTT-TC--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAGT-AACGT------AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAATCGGTTTGAGTCCGTATTTAATATGGATATCATA-T-TT-AATAACT-GGTTTT--TCAAACAC---------TA------TTAGTACACCG----------------T-T-CTGGTAA---AGC----TTTCGCTCTTCATCCTAAAA-C-TTGTTATACTGTACATTCCCGAGTTAG-TGTCT-TTCTCTAAATTTA
gi|114128                     : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAACG--CCTTT-----------TACTGTCT-TC--------TC--------------------------------------------------T-CTA----------------------------TCTTT----CT----TGTATTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCGTCTTTAATATGGATATCATA-T-TT-TATAACTCATTTTT--TCAAACAC---------TA------TTAGAACTCCGTTCTGGTTTCAG-ATTTGT-CTGCT-G---AAT----TTTCGTTCTTCATCTTAAAG-C-TTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAG-TCTGT-TTCTCGTGATTTACT
gi|114129                     : CAATAGGATGTGGTTG---T---CTGA--CAATTTCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------TACTGTCT-TC--------TG---TC-TAT-----CT-TTT-------T------------------TATGT-CTAAT-AACATAA----AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAACTAATATGAGTCCATATTTAATATGGATATCATA-T-TT-GATAA
gi|114130                     :  AGTGGAAGGTTGTTG---T---TTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTTGAT-GATT-GAGGG--CCTTT-----------TACTGTCT--C--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------A------------------TATGT-CTAAT-AAAGT------AA------CC---TCATTAT---CT----TGTGTTT--GAACAAACACGTTTGAGCCCATATCTACTGTGGAGTTCAAAGT-TT-GGCAACT-GGTTAT--TCTTACACTCTAGCTTTTA------TTA-TACT--GGTCTGATTTCAGTATTT-C-CTGCTAAATTAAG----TT---TTCTTTATCCTAAAG-T-ATTTTAT
gi|114131                     :  AGTGGAATGTTGTTG---T---TTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGCT-GACT-GAGCG--CCTTT-----------TACTGTCT--C--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------A------------------TATGT-CTAAT-AAAGT------AA------CC---TCATTAT---CT----TGTGTTT--GAACAAACACGTTTGAGTCCATATTTACTGTTGAGTTCAAAGT-GT-GGCAACT-GGTTAT--TCTTACACTCTAGCTTTTA------TTA-TACT--GGTCTGATTTCAGTATTT-C-CTGCTAA---AGCAAGAT----TTCTTTGTCCTAAAG-T-GTTTTATT
gi|114132                     :  AGTGGAATGTTGTTG---T---TTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAT-GATT-GAGCG--CCCTT-----------TGCTGTCTCTC--------TC---TC-TCT-----CT-CTC-------TCTCTCTCTCTCTCTTTCATATGT-CTAAT-AAAGT------AA------TC---TCATTAT---CC----TGTGTTT--GAACAAAC
gi|114133                     :  AGTGGAATGT---TG---T---TTTA--CAATTGCTACAATGGCCGGTCGTTGAT-GATT-GAGCG--CCTAT-----------TACTGTCT--C--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------A------------------TATGT-TTAAT-AAAGT------AA------CC---TCGTTAT---CT----TGTGTTT--GAACAAACACGTTTGAGTTCATATCTACTGTAGAGTTCAAAGT-TT-GGCAACT-GGTTATTGTTACACTC---------TAGTTT--TTATTATACTGGTCTGATTTCAGTATTT-C-CTGCTAAATTAAG----TT---TTTTTTATCCTACAGTT-TTTTTATT
gi|114134                     :  AGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATAGCTAGAATCGCCGGTCATGGAATGATT-GAGCG--CCTGT-----------CAATGTCT-TC--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAACAAATGTCTAACAAA------CTAACTTACTTT---CT----TG-ATTT--G-------------GAATCCATAATTACTACAGATATCATA-TATT-CATAACT-GGTTAT--CCTAACAC---------TATAACTTTCATTCTTCTGGCCTAATTTTAGTACTT-T-CTGCT-C---AAT----TCTCTTTCTTTATCCCAA
gi|114135                     :   GTGGGATGTGGTTG---T---TTTG--CAATTGATACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCA--CCTTT-----------TACTATCT-TC--------TC---TC-TAT----------------------------------------GT-CTAAT-AAGAT------AA------CT---TTCTGCT---CT----TGTGTTT--GAATTAACCGGTTTGAGTCCATATTTA-TATGGATATCATA-T-TT-GATAACT-GGTTCT--TCAAACAC---------TA------TCAGTACTCAATTCTGGTTTGAG-ATTTGT-CTGCTTA---AAC----TTTCATTCTTCATCCTAAAG-C-TTTTTATTCTGTACATTCCCGTATCAG-TCTGT-TTCTCTAAATATAC
gi|114136                     :   GTGGGATGTGGCTG---T---CTTA--CAATTGCTGCA-TCGCCGGTCGTGGAG-GATT-GATTG--CCTTT-----------TACTGTTT-TC--------TC---TC-TAC-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAAT-AACAT------AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCGTATTTAATATGGATATCATA-T-TT-GATAACT--GTTTT--TCAAGCAC---------TA------TTAGTACTCCAATCTGGTTTCAG-ATTT-GACTGGTAA---AAC----GTTCGTACTTCATCCTAAAG-T-TTTTTATTCTGTACATTCCCAGATTAG-TCT-GATTCTATAAATTTACT
gi|114137                     :   GTGGGATGTGGTTG---C---CATA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAT-GATT-GAGCGTCCCTTT-----------CACTGTCT-TA--------TC---TC-TAT-----AT-TTC-------T------------------TCTGT-CTAAT-GAAGT------AA------CA---TCGTTTT---CT----TGTGTTT--GAGGAAACCGGTTTGAGTTCATAT------------------T-TT-GGTAACT-GGTTAT--TCTTACAC---------T-----------------GGCCTTATTTCAGTATTT-TCCTGCT-A---AAT----TTTCTTTCTTTAT
gi|114138                     :   GTGGGATGTGGTTG---C---CATG--CAATTGCTACAATCGACGGTCGTGGTC-GATT-GAGCGTCCCTTT-----------CACTGTCT-TG--------TC---TC-TAT-----AT-TTC-------T------------------TATGT-TTAAC-GAAGT------AA------CA---TCGTTTT---CT----TGTGTTT--GAAGAAACCGGGTTGAGACCATAT------------------T-TT-GGTAACT-GGTTAT--TCTAACAC---------T-----------------GGCCTTATTACAGTATTT-T-CTGCT-A---AAT----TTTCTTTCTTTAT
gi|114139                     :   GTGGGATGTGGTTG---C---CATG--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAT-GATT-TAGCGTCCCTTT-----------TACTGTCT-TA--------GC---TC-TAT-----AT-TTC-------T------------------TCTGT-CTAAT-AAAGT------CA------CA---TCCTTTT---GT----TGTGTTT--GAAGAAACCGGTTTGAGTCCATAT------------------T-TT-GGTAACT-GGTTAT--TCTAACAC---------T-----------------GGCCTTATTTCAGTATTT-T-CTGAT-A---AAT----TTTC
gi|114140                     :   GTGGGAAGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-GAt
gi|114141                     :       GATGTGGTTG---C---CTTTTTCTATTGTT-CAGTCACCGGTCGTGGAG-GACT-GAACG--CCTTTTTCTGTCGTCTCACTGTCT-TC--------TCATATC-TACTTGTGCT-TCCATTCCAGT------------------CATGTGCTAGG-AAGG-------AAGCATCTCT---CTCTTCTAAACT----TTTACTCTAGAA-ATATCGGTGTGAGTCCATATTAATTGTGGATTTCATA-T-TTCGATATTC-GCTTCT--GCAACCTT---------TATCC---TTATTAATCCAGTCTGATTT
gi|114142                     :       GATGTGGTTG---C---CTTTTTCAATTGTT-CAGTCACCGGTCGTGGAC-GACT-GAACG--CCTTT-----------TTCTGTCG-TC--------TT---AC-TGT-----C--TTC-------T------------------CATAT-C
gi|114143                     :       GATATGATTG---TATTCTTG--CAAATG-TACAGTCGCCGGTCGTGG-T-GATTGGAACG--CCTTT-----------T-CTATTC-TC--------TT---GC-TAT-----CT-GTC--------------------------TATGT-CT
gi|114144                     :         TATGGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCA--CCTTT-----------C-CTATTT-TC--------T----TA-TAT-----AT-TTC-------T------------------TATttttaatccctcatttatagggtctgaat
gi|114145                     :           TGGTTGCTCT---CTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCG--GCTTT-----------C-CTATGT-TC--------T----TA-CAT-----AT-TTC-------T------------------TATctactgctactgtttactttt
gi|114146                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCG--CCTTT-----------C-CTATAT-TC--------T
gi|114147                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGTG--CCTTT-----------C-CTATTT-TC--------T----TA-CAT-----AT-TTC-------G------------------TATCTACTGCT-GCTGT------GA------CT---T--TTTT---CT----T
gi|114148                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCG--CCTTT-----------C-CTATAT-TCTTACATATTC---TCATAT-----CC-TTC-------T------------------
gi|114149                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCG--CCTTT-----------C-CTATAT-TC--------T-------TAC-----ATATTC-------T------------------TATATACTTCT-GCACT------AA------CT---TTTTTTT---TT----T
gi|114150                     :            GGTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAATCACCGGTCGTGGAG-GATT-AAGCG--CCTGT-----------C-CTATAT-TC--------T
gi|114151                     :            GGTTG---TATTCTTA--AAATTGCT-TAATCACCGTTCGTGGAG-GATT-AAGCG--CCTTT-----------TTCTATAT-TC--------TC----A-TAT-----AC-TTC-------T------------------
gi|114152                     :            GGTTGCACT---CTTA--CAATTGCT-TAATCCCCGGTCATGGAG-GATT-AAGTG--CCTCT-----------C-CTATGT-TC--------TG---TCATAC-----CT-
gi|114153                     :             GTTG---TATTCTTA--CAATTGCT-TAACCACCAGTCGTGGAG-GTTT-AAGCG--CCTTT-----------C-CTATAT-TC--------TT---ACATAT-----CT-


blockSeqs                     :                 CTC ATT    TT        A                  T    G     TC     TTCTGTCGTCTCA      C  TTACATAT CATATC    TTGTGC A   TCTCTCTCTCTCTCTTTCA            G     A  T  CTAACA  GCATCT  AAC  C    AAA  CAGT       TA   T                    T  A       A     G A  C       C    T TG  A     TCTAGCTTTTA         G    TC T    G      T    AT      AAATT   AAGA    G               CT                            A   CT 
blockSeqs                     :                 CAC ATT    TT        A                  .    .     TC     TA                 .  .        CTCA      C      .   ATTCCAGT                       A     .  A  AA      AAAA    .    C    .    .          .    T                    T  A       G     G .  .       .    T .   A     TCTAGCTTTTA         G    CC T    G      T    GT      AAATT   .       G               TT                            .   GT 
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     TC     TA                 .  .        GTCA      C      .   T                              A     .  C  .       .       .    C    .    .          .    T                    T  A       A     G .  .       .    T .   A     TATAACTT            G    CC T    A      T    GT      TT      .       G               C                             .   GT 
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TA                 .  .        TACA      C      .   T                              .     .  C  .       .       .    C    .    .          .    T                    T  A       A     . .  .       .    T .   A     TAGTTT              G    CC G    A      T    GT      TG      .       G               C                             .   GA 
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       C      .   T                              .     .  A  .       .       .    C    .    .          .    T                    T  A       A     . .  .       .    A .   T     TATCC               T    CT G    A      T    GA      AA      .       T               C                             .   C  
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       C      .   T                              .     .  A  .       .       .    A    .    .          .    C                    C  C       T     . .  .       .    A .   T     TA                  T    CT G    A      T    TC      AA      .       A               T                             .   T  
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TA                 .  .        GTC       C      .   A                              .     .  A  .       .       .    A    .    .          .    C                    T  C       T     . .  .       .    A .   A     TA                  G    CA G    G      T    T       TA      .       G               T                                    
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       C      .   A                              .     .  A  .       .       .    A    .    .          .    C                    C  C       T     . .  .       .    A .   T     TA                  G    CC T    G      .    C       AA      .       T               C                                    
blockSeqs                     :                 .   ATT    .         A                  .    .     .      TG                 .  .        CTC       C      .   A                              .     .  T  .       .       .    G    .    .          .    C                    T  C       A     . .  .       .    C .   A     TA                  T    CC A    A      .    C       G       .       T               T                                    
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       C      .   T                              .     .  G  .       .       .    A    .    .          .    T                    T  A       A     . .  .       .    T .   A     TA                  .    .  G    A      .    C       C       .       .                                                    
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      CA                 .  .        CTC       A      .   T                              .     .  C  .       .       .    C    .    .          .    T                    T  T       A     . .  .       .    A .   T     TA                  .    .  G    A      .    T       A       .       .                                                    
blockSeqs                     :                 .   .      .         G                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       A      .   T                              .     .  A  .       .       .    C    .    .          .    G                    T  .       T     . .  .       .    A .   T     T                   .    .  G    A      .    T       A       .       .                                                    
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       A      .   T                              .     .  A  .       .       .    G    .    .          .    G                    .  .       .     . .  .       .    A .   T     T                   .    .  G    .      .    T       A       .                                                            
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      CA                 .  .        CTC       C      .   T                              .     .  A  .       .       .    G    .    .          .    G                    .  .       .     . .  .       .    C .   A     T                   .    .  .    .                                                                                        
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      CA                 .  .        CTC       C      .   T                              .     .  G  .       .       .    C    .    .          .    .                    .  .       .     . .  .                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      TA                 .  .        CTC       A      .   T                              .     .  T  .       .       .    C    .    .          .    .                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                 .   .      .         A                  .    .     .      TT                 .  .        CTC       A      .   T                              .     .  A  .       .       .    T    .    .                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      TT                 .  .        TAC       A      .   G                              .     .  .  .       .       .    .    .    .                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      T                  .  .        TGC       C      .   T                              .                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        TA        A      .   T                              .                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        TA        A      .   T                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        TA        C      .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        CA        C      .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        C         .      .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        .         .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .        .         .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                 .   .      .         .                  .    .     .      C                  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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Reference ( family-654 )      : CAGTGGGATGTGGTTG---T---CTTA--CAATTGCTACAATCGCCGGTCGTGGAG-GATT-GAGCG--CCTTT-----------CACTGTCT-TC--------TC---TC-TAT-----CT-TTC-------T------------------TATGT-CTAAT-AANGT------AA------CT---TTCTTTT---CT----TGTGTTT--GAATAAACCGGTTTGAGTCCATATTTAATATGGATATCATA-T-TT-GATAACT-GGTTNT--TCAAACAC---------TA------TTAGTACTCCGGTCTGATTTCAGTA-TTT-CCTGCTAA---AAC----TTTCGTTCTTCATCCTAAAG-C-TTTTTATTCTGTACATTCCCGTATTAGTCTGTTTCTCTAAATTTACT
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