lowQualScore : 111 111111111111111111
lowQualScore : 3 3 1 22 0 6 9999999999999999 777777777777 5555 555 4 2 1 0 1 2 1 33333 5555 777 777777777777777777 4 222 777777777 1 1 3 7 2 2 1 3333 1 22 66666666 4 2 2 6 2 2 2 6
lowQualScore : . . . .. . . ................ ............ .... ... . . . . . . . ..... .... ... .................. . ... ......... . . . . . . . .... . .. ........ . . . . . . . .
lowQualScore : 6 2 3 00 8 0 5555555555555555 333333333333 0000 444 1 2 3 3 3 8 4 88888 3333 111 666666666666666666 9 444 333333333 2 2 0 5 2 0 5 3333 6 22 00000000 2 0 2 0 4 4 9 0
consensus : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-ATGG----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-CCGTGT-CCANCGGCCTGC-C----TCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAGACTCGTAA-CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Reference ( gi|25755 ) : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATCCAT----------------CCTCT------------A----ATTCATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-ATGG----T--G---T-T--A-TAAT---TG------G-CCGTGT-CCAACGGCCTGC-C----TCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAGACTTGTAA-CT-TAG-CAAAAGCTTTGAT
gi|25756 : ATTC-AA-TAATA--AAATGACATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-ATGG----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-CCGCAT-CCAACAGCCTGA-C----TCT-AC--TTCTAA--------TCGAATCGACAAGACTCGTAA-CT-TAG-CAAAAGCTTT
gi|25757 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATGTATTACA-TACTCTACACTTT-TG-T-TC--A--TC----AA--TGG----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-CCGTAT-CCAACGACCCGT-C----TCT-AT--TTCTAA--------TCGATGTGACGAGACTCGTAA-CT-TAG-CAAAAGCTTTAATa
gi|25758 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTACA-TGCTCTGCACTTT-TG-T-TC--A--TC----AA-ATGA----T--A---T-T--C-TAAT---TG------G-CTGTAT-CCAATGGCCTGC-C----CCT-AC--TTCTAA--------TCAATGCAATGAGACTCATAA-CT-TTG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25759 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCATTCTATTATTTAATGATCCTTT------------T----ATTTATTACA-TACTTTGCCCTTT-CG-T-TC--G--TC----AT-ATGG----T--G---T-T--C-TAAC---TT------G-CCGTAT-CCAACGGCCTGC-C----TCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAGAGTCGTAA-CT-TAG-CAAAAGCATTAAT
gi|25760 : ATTC-AA-CAATA--GAATGATATTCAT----------------TCTTTTATTTATTAATCATTTTATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-ATGA----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-CCGTAT-CCAATGGCCTGC-C----TCT-GC--TTCTAA--------CCGATGCGACGGGAGCCGTAA-CT-TAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25761 : ATTC-AA-TAATA--AAATGGTATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTTCA-TACTCTGCACTTC-TG-T-TC--G--TC----AT-AAGT----T--A---T-T--C-TAAT---TG------T-CCGTGT-CCAACGGCCTGC-T----TTA-AC--TCATAG--------TCGATGCGACGAGACACGTAA-CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25763 : ATCC-AA-TAATA--AAATAATATTCAA----------------CCTCA------------A----ATTTATTACA-TATTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-ATTC----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-TCATGT-CCAATGGCTTGT-A----TCT-AC--TTCTAA--------ACGATGCCATGAGACACGAAG-CT-AAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25764 : ATTT-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CTTTT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TT--G--TT----AA-ATGG----A--G---T-T--C-TAAT---TG------G-CCATAT-CCAACGGCATGC-C----TCT-AC--TTCT
gi|25765 : ATTC-AA-TGATA--AAATTGTATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTC-CG-T-TC--A--TC----AA-GTGG----G--G---C-T--A-TTAT---TG------G-GCGTGT-tagagtactcgtataatatactcggcaaa
gi|25762 : ATTC-TA-AAACA--AAATAAAATTCAT----------------CTTCT------------A----TAACATTACAGTGAT-TACATATT-CG-A-TC--A--TT----GA-TTGG----T--A---A-T--C-TGTT---CG------G-TCTATT-CCACCTACCAGC-C----TCT-AT--CTGTAA--------CCTATGCGATGAAACTCGTAG-CT-TTG-AAAAAG
gi|25767 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-CT-T-TC--A--TT----GA-AAGG----T--A---C-A--C-TAAC---TG------G-GTTTCT-CCGTCGACC-GCTT----TCC-AC--TTCCAA--------TCTATGAGAGGAAA
gi|25770 : ATTCTAA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGACATTTT-CG-T-TCAAG---C----AC-A-GG----C--G---T-T--T-TTTTCTCTG------GTTTGTG--CCATCAACCAGT-T----TCT-AT--TTCGAG--------TCGATGTGACGATACT
gi|25766 : ATTC-AAATAA-A--AAATGAAATTTGG----------------CCTTC------------A----AGATGTTACA-TATTCGGCATTTTCCGTT-TC--C--TC----TA---GG----A--G---T-T--T-TTAT---TG------T-TTTTTT-TCATCGTCCTGT-T----TCT-AT--TTCTTA--------CCTATGTGTCGActgagtctgcttaacgaaa
gi|25768 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-CT-T-TC--A--TT----GA-AAGG----T--A---C-A--C-TAAC---TG------G-CTTTCT-CCGTCGACCGTT-T----TCC-AC--TTACAA--------TATATGAGAGGAAAtattctaa
gi|25771 : ATTCTAA-TAA-A--AAATGTAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGGCATTTT-CG-T-TCA-G--AC----AC-A-GG----C--G---T-T--T-TCTC---TGGTTTATG-CCATGTACCA-------GT-T----TCT-AT--TTTGAG--------TCGATGTGACGATAC
gi|25773 : ATTT-GA-T--TA--AAATGGTATTTAT----------------CCTCT------------AGG--AT--ATTACA-CTGTTTACACATT-CT-G-TC--A--TT----GA-A--G----T--A---TAC--ACTGAC---TA------G-CTTTCT-CCACCGACC-GC-C----TTTCAC--TTCCTA--------TCTATGAGAGGAAAacg
gi|25772 : ATTC-AA-GAGTA--AAGTAAAATTCGT----------------CCTCA------------A----GTGTATTACA-CAAGAGGCATTTA-CG-T-TC--G--TT----TA-CGGG----T--A-----T--G-T-AT---TGA-----G-GTTTATGCCATCTTCCGGT-C----TCT-AT--TGCGAG--------TCTATGTGAAGAGACTCTTAGTCT-TA
gi|25769 : ATTC-AAATAAAA--AAATGAAATTCGT----------------TCTCC------------A----AGGTATTACA-TATTCTGCATTTT-C
gi|25774 : TTC-AA-TTATA--AAATGCTATTCAT----------------CCTTT------------A----GTTTATTACA-TAGTCTTCACTTC-CG-T-TT--G--TC----AG-ATGG----T--G---T-T----TTAT---TG------G-tatttttctctattgttttttccattgtcctgtttccttttttaacctatgcgcggatactc
gi|25775 : C-AA-TA-CA--AAATGATATTTAT----------------CCTCT------------A----AAACATTGCA-AATTCTGAA---T-CGAC-TA--GTATC----AA-A--A----TCAA---T-TCAA-TAA---------------CGTGA-CCATCTACCTAC-T----TCA-AC--TTCTAA--------TCTATGTAATGACACTCTTAA-TT-TTGACAAAA-CTT
gi|25777 : -AA-TAACG--AAATGATATTCGT----------------CTTTT------------A----ATACATTACA-CACTGCGCATATT-CA-TCTC--A--TT----GA-CAGGAA--T--A---C-T--C-T--C---TG------G-TCGAGA-CCATCGACCTGC-T----TC
gi|25776 : -AA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CCTAC------------A----AGATGTTACA-TATTTTGCATTTT-CT-G-TC--T--TCTCT-AG-AAGT----T--T---T-T--A-CTGT---TG---------TTTTT-TCACTGTCTTGT-T----TCT-AT--TTCTAA--------CCTATGCGCCGATACT
gi|25778 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-CT-C-TC--A--TC----AA---GG----TC-GACCC-T--G-T--T---T----------CTTGT-CTATCGACCTGA-T----TCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGACGATACTCGTAG-CTATAA-CActaagtcttgttgaagcctt
gi|25780 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-CT-C-TC--A--TC----AACGTCGACCCT--G---T-T---------------------TCTTGC-CCATCGACCTGA-T----TCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGATGACACTCGTAG-CT-T
gi|25779 : A-TAATACAAAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATATATTGCA-AATTCTACA---T-CG-T-CT--G--TTATCAAA-ATCA----T------T-T--C-T-AT---TA---------CGTGA-CATACAAACTAT-T----TAA-AC--TTCAAA--------TCTATGTGATGACACTCTTAA-TT-T
gi|25781 : ATA--AAATGAAATTCAT----------------CCTCT------------A----AAATATTGCA-TACATTACATTTT-CT-C-TG--A--TG----AA-CTTG----T--G----------TACT---TA------A-CGGTTT------AGCC--C-C----TCT-ACAAGTTTAAATAGCAAGTCTATGAGATGTGACTCTAAA-TT-TAG-TAAAA
gi|25782 : --AAGTGGTATTCGT----------------CTTCT------------A----AAATATTACA-TTGTCTGCATTTT-TT-A-TC--T--TG----AA-ATGG----A--A---C-A--C-TAAC---AG------G-TTTTGG-CCA----CCTAT-CGCATTCT-AC--TTCAAG--------TCTATGAGAAGATAGTCGTAA-TC-TTG-AAAAAGCTTT
gi|25783 : TGATATTCAT----------------T---T------------A----A---ATTACA-TACTCTGCATTTC-CA-T-TC--G--TC----AA-ATGG----A--A---T-T--C-TAAT---TG------G-ACG
gi|25784 : ATTACA-TACTCTGCACTTT-CG-T-TC--G--TC----AA-GTGA----T--G---T-T--C-TAAT---TG------G-TCGTAT-GCAACGGCCTGC-C----TCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAGAGTCGTTA-CT-TAG-CAAAAGCGTTAATatat
gi|25785 : CACATT-TA-T-TC--G--TC----AA-ATAG----T--T---T-T--C-TAAT---TG------G-TCATGT-CCAACGACCTAC-C----TCC-TC--TTCTAA--------ACGATGCGACGAAACACGTGA-TT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Alignments
lowQualScore : 3 3 0 22 0 0 9999999999999999 777777777777 2222 22 4 1 0 1 4444 1 33 11 2222 77 11 777777777 33 3 222 3333 44 222 0 2 3 1 3 2 1 22 55555555 1 1 0 33 1 555555 88888 1 2
lowQualScore : . . . .. . . ................ ............ .... .. . . . . .... . .. .. .... .. .. ......... .. . ... .... .. ... . . . . . . . .. ........ . . . .. . ...... ..... . .
lowQualScore : 5 1 9 00 5 5 1111111111111111 111111111111 9999 77 0 8 9 3 6666 3 11 88 7777 88 88 777777777 11 0 333 0000 11 333 4 8 8 9 0 9 5 00 44444444 5 6 6 77 6 222222 99999 9 2
consensus : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Reference ( family-638 ) : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25755 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATCCAT----------------CCTCT------------A----ATTCATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TA--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-ACTTGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTGAT
gi|25756 : ATTC-AA-TAATA--AAATGACATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--CAT-CCAACAGCCTGA-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGAATCGACAAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTA
gi|25757 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATGTATTACA-TACTCTACACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AA-TGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAACGACCCGT-CTCT-AT--TTCTAA--------TCGATGTGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25758 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTACA-TGCTCTGCACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AAATGA--T--A-T----TC--TAAT---T--G-G-CTG--TAT-CCAATGGCCTGC-CCCT-AC--TTCTAA--------TCAATGCAATGAG-ACTCATA------A-----CT-TTG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25759 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCATTCTATTATTTAATGATCCTTT------------T----ATTTATTACA-TACTTTGCCCTTT-C-G--T-TC--GT--C----ATATGG--T--G-T----TC--TAAC---T--T-G-CCG--TAT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCATTAAT
gi|25760 : ATTC-AA-CAATA--GAATGATATTCAT----------------TCTTTTATTTATTAATCATTTTATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAATGGCCTGC-CTCT-GC--TTCTAA--------CCGATGCGACGGG-AGCCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25761 : ATTC-AA-TAATA--AAATGGTATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTTCA-TACTCTGCACTTC-T-G--T-TC--GT--C----ATAAGT--T--A-T----TC--TAAT---T--G-T-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-TTTA-AC--TCATAG--------TCGATGCGACGAG-ACACGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25762 : ATTC-TA-AAACA--AAATAAAATTCAT----------------CTTCT------------A----TAACATTACAGTGAT-TACATATT-C-G--A-TC--AT--T----GATTGG--T--A-A----TC--TGTT---C--G-G-TCT--ATT-CCACCTACCAGC-CTCT-AT--CTGTAA--------CCTATGCGATGAA-ACTCGTA------G-----CT-TTG-AAAAAG
gi|25763 : ATCC-AA-TAATA--AAATAATATTCAA----------------CCTCA------------A----ATTTATTACA-TATTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATTC--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAATGGCTTGT-ATCT-AC--TTCTAA--------ACGATGCCATGAG-ACACGAA------G-----CT-AAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25764 : ATTT-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CTTTT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TT--GT--T----AAATGG--A--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCA--TAT-CCAACGGCATGC-CTCT-AC--TTCTTA------------------GAGTACTCGTATAATATA-----CT-CGG-CAAA
gi|25765 : ATTC-AA-TGATA--AAATTGTATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTC-C-G--T-TC--AT--C----AAGTGG--G--G-C----TA--TTAT---T--G-G-GCG--TGT-
gi|25766 : ATTC-AAATAA-A--AAATGAAATTTGG----------------CCTTC------------A----AGATGTTACA-TATTCGGCATTTTCC-GT-T-TC--CT--C----TA--GG--A--G-T----TT--TTAT---T--G-T-TTT--TTT-TCATCGTCCTGT-TTCT-AT--TTCTTA--------CCTATGTGTCGAT-ATTC-TA------A-----
gi|25767 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-GTT--TCT-CCGTCGACC-GCTTTCC-AC--TTCCAA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25768 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-CTT--TCT-CCGTCGACCGTT-TTCC-AC--TTACAA--------TATATGAGAGGAA-A
gi|25769 : ATTC-AAATAAAA--AAATGAAATTCGT----------------TCTCC------------A----AGGTATTACA-TATTCTGCATTTT-CTA--T-TT--TT--C----------------------TC--T-AT---T----G-TTT--TTT-CCATTGTCCTGT-TTCC-TT--TTTTAA--------CCTATGCGCGGAT-ACTC
gi|25770 : ATTCTAA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGACATTTT-C-G--T-TCAAG---C----ACA-GG--C--G-T----TT--TTTTCTCT--G-GTTTG--TG--CCATCAACCAGT-TTCT-AT--TTCGAG--------TCGATGTGACGAT-ACTC-TG------AGTCTGCT-TAA-CGAAA
gi|25771 : ATTCTAA-TAA-A--AAATGTAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGGCATTTT-C-G--T-TCA-GA--C----ACA-GG--C--G-TTTTCTC--TGGT---TTAT-G-CCA--TGTACCA-------GT-TTCT-AT--TTTGAG--------TCGATGTGACGAT-ACACG
gi|25772 : ATTC-AA-GAGTA--AAGTAAAATTCGT----------------CCTCA------------A----GTGTATTACA-CAAGAGGCATTTA-C-G--T-TC--GT--T----TACGGG--T--A-TG---T-----AT---T--GAG-GTT--TATGCCATCTTCCGGT-CTCT-AT--TGCGAG--------TCTATGTGAAGAG-ACTCTTA------GT----CT-TA
gi|25773 : ATTT-GA-T--TA--AAATGGTATTTAT----------------CCTCT------------A----GGATATTACA-CTGTTTACACATT-C-T--G-TC--AT--T----GAA--G--T--A-TAC--AC--TGAC---T--A-G-CTT--TCT-CCACCGACC-GC-CTTTCAC--TTCCTA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25774 : TTC-AA-TTATA--AAATGCTATTCAT----------------CCTTT------------A----GTTTATTACA-TAGTCTTCACTTC-C-G--T-TT--GT--C----AGATGG--T--G-T----TT--T-AT---T--G-G-
gi|25775 : C-AA-TA-CA--AAATGATATTTAT----------------CCTCT------------A----AAACATTGCA-AATTCTGAA---T-C-GA-C-TA--GTATC----AAA--A--TCAA-T----TCAATAA------------CG--TGA-CCATCTACCTAC-TTCA-AC--TTCTAA--------TCTATGTAATGAC-ACTCTTA------A-----TT-TTGACAAAA-CTT
gi|25776 : -AA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CCTAC------------A----AGATGTTACA-TATTTTGCATTTT-CTGTCT-TC---T--C----TAGAAG--T----T----TT--TACT--------G-TTGTTTTT-TCACTGTCTTGT-TTCT-AT--TTCTAA--------CCTATGCGCCGAT-ACTC-TA------AGT---CT-T-G-TTGAAGCCTT
gi|25777 : -AA-TAACG--AAATGATATTCGT----------------CTTTT------------A----ATACATTACA-CACTGCGCATATT-C-A--TCTC--AT--T----GACAGGAAT--A-C----TC--T--C---T--G-G-TCG--AGA-CCATCGACCTGC-TTC
gi|25778 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA--GG--TCGA-C----CC--TGTT---T-------CT--TGT-CTATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGACGAT-ACTCGTA------G-----CTATAA-CA
gi|25779 : A-TAATACAAAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATATATTGCA-AATTCTACA---T-C-G--T-CT--GT--TATCAAAATCA--T----T----TC--T-AT---T--A----CG--TGA-CATACAAACTAT-TTAA-AC--TTCAAA--------TCTATGTGATGAC-ACTCTTA------A-----TT-T
gi|25780 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA-CGT--C--GAC----CC--TGTT---T-------CT--TGC-CCATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGATGAC-ACTCGTA------G-----CT-T
gi|25781 : ATA--AAATGAAATTCAT----------------CCTCT------------A----AAATATTGCA-TACATTACATTTT-C-T--C-TG--AT--G----AACTTG--T--G-T----ACT-TAA------------CG---GT-TTA---GCC--C-CTCT-ACAAGTTTAAATAGCAAGTCTATGAGATGTG-ACTCTAA------A-----TT-TAG-TAAAA
gi|25782 : --AAGTGGTATTCGT----------------CTTCT------------A----AAATATTACA-TTGTCTGCATTTT-T-T--A-TC--TT--G----AAATGG--A--A-C----AC--TAAC---A--G-G-TTT--TGG-CCACCTATC-GCATTCT-AC--TTCAAG--------TCTATGAGAAGAT-AGTCGTA------A-----TC-TTG-AAAAAGCTTT
gi|25783 : TGATATTCAT----------------T---T------------A----A---ATTACA-TACTCTGCATTTC-C-A--T-TC--GT--C----AAATGG--A--A-T----TC--TAAT---T--G-G-ACG--
gi|25784 : ATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAGTGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCG--TAT-GCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTT------A-----CT-TAG-CAAAAGCGTTAATatat
gi|25785 : CACATT-T-A--T-TC--GT--C----AAATAG--T--T-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAACGACCTAC-CTCC-TC--TTCTAA--------ACGATGCGACGAA-ACACGTG------A-----TT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Alignments
lowQualScore : 3 3 0 22 0 0 9999999999999999 777777777777 2222 22 4 1 0 1 4444 1 33 11 2222 77 11 777777777 33 3 222 3333 44 222 0 2 3 1 3 2 1 22 55555555 1 1 0 33 1 555555 88888 1 2
lowQualScore : . . . .. . . ................ ............ .... .. . . . . .... . .. .. .... .. .. ......... .. . ... .... .. ... . . . . . . . .. ........ . . . .. . ...... ..... . .
lowQualScore : 5 1 9 00 5 5 1111111111111111 111111111111 9999 77 0 8 9 3 6666 3 11 88 7777 88 88 777777777 11 0 333 0000 11 333 4 8 8 9 0 9 5 00 44444444 5 6 6 77 6 222222 99999 9 2
consensus : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Reference ( family-638 ) : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25755 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATCCAT----------------CCTCT------------A----ATTCATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TA--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-ACTTGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTGAT
gi|25756 : ATTC-AA-TAATA--AAATGACATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--CAT-CCAACAGCCTGA-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGAATCGACAAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTA
gi|25757 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATGTATTACA-TACTCTACACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AA-TGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAACGACCCGT-CTCT-AT--TTCTAA--------TCGATGTGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25758 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTACA-TGCTCTGCACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AAATGA--T--A-T----TC--TAAT---T--G-G-CTG--TAT-CCAATGGCCTGC-CCCT-AC--TTCTAA--------TCAATGCAATGAG-ACTCATA------A-----CT-TTG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25759 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCATTCTATTATTTAATGATCCTTT------------T----ATTTATTACA-TACTTTGCCCTTT-C-G--T-TC--GT--C----ATATGG--T--G-T----TC--TAAC---T--T-G-CCG--TAT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCATTAAT
gi|25760 : ATTC-AA-CAATA--GAATGATATTCAT----------------TCTTTTATTTATTAATCATTTTATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAATGGCCTGC-CTCT-GC--TTCTAA--------CCGATGCGACGGG-AGCCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25761 : ATTC-AA-TAATA--AAATGGTATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTTCA-TACTCTGCACTTC-T-G--T-TC--GT--C----ATAAGT--T--A-T----TC--TAAT---T--G-T-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-TTTA-AC--TCATAG--------TCGATGCGACGAG-ACACGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25762 : ATTC-TA-AAACA--AAATAAAATTCAT----------------CTTCT------------A----TAACATTACAGTGAT-TACATATT-C-G--A-TC--AT--T----GATTGG--T--A-A----TC--TGTT---C--G-G-TCT--ATT-CCACCTACCAGC-CTCT-AT--CTGTAA--------CCTATGCGATGAA-ACTCGTA------G-----CT-TTG-AAAAAG
gi|25763 : ATCC-AA-TAATA--AAATAATATTCAA----------------CCTCA------------A----ATTTATTACA-TATTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATTC--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAATGGCTTGT-ATCT-AC--TTCTAA--------ACGATGCCATGAG-ACACGAA------G-----CT-AAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25764 : ATTT-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CTTTT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TT--GT--T----AAATGG--A--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCA--TAT-CCAACGGCATGC-CTCT-AC--TTCTTA------------------GAGTACTCGTATAATATA-----CT-CGG-CAAA
gi|25765 : ATTC-AA-TGATA--AAATTGTATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTC-C-G--T-TC--AT--C----AAGTGG--G--G-C----TA--TTAT---T--G-G-GCG--TGT-
gi|25766 : ATTC-AAATAA-A--AAATGAAATTTGG----------------CCTTC------------A----AGATGTTACA-TATTCGGCATTTTCC-GT-T-TC--CT--C----TA--GG--A--G-T----TT--TTAT---T--G-T-TTT--TTT-TCATCGTCCTGT-TTCT-AT--TTCTTA--------CCTATGTGTCGAT-ATTC-TA------A-----
gi|25767 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-GTT--TCT-CCGTCGACC-GCTTTCC-AC--TTCCAA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25768 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-CTT--TCT-CCGTCGACCGTT-TTCC-AC--TTACAA--------TATATGAGAGGAA-A
gi|25769 : ATTC-AAATAAAA--AAATGAAATTCGT----------------TCTCC------------A----AGGTATTACA-TATTCTGCATTTT-CTA--T-TT--TT--C----------------------TC--T-AT---T----G-TTT--TTT-CCATTGTCCTGT-TTCC-TT--TTTTAA--------CCTATGCGCGGAT-ACTC
gi|25770 : ATTCTAA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGACATTTT-C-G--T-TCAAG---C----ACA-GG--C--G-T----TT--TTTTCTCT--G-GTTTG--TG--CCATCAACCAGT-TTCT-AT--TTCGAG--------TCGATGTGACGAT-ACTC-TG------AGTCTGCT-TAA-CGAAA
gi|25771 : ATTCTAA-TAA-A--AAATGTAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGGCATTTT-C-G--T-TCA-GA--C----ACA-GG--C--G-TTTTCTC--TGGT---TTAT-G-CCA--TGTACCA-------GT-TTCT-AT--TTTGAG--------TCGATGTGACGAT-ACACG
gi|25772 : ATTC-AA-GAGTA--AAGTAAAATTCGT----------------CCTCA------------A----GTGTATTACA-CAAGAGGCATTTA-C-G--T-TC--GT--T----TACGGG--T--A-TG---T-----AT---T--GAG-GTT--TATGCCATCTTCCGGT-CTCT-AT--TGCGAG--------TCTATGTGAAGAG-ACTCTTA------GT----CT-TA
gi|25773 : ATTT-GA-T--TA--AAATGGTATTTAT----------------CCTCT------------A----GGATATTACA-CTGTTTACACATT-C-T--G-TC--AT--T----GAA--G--T--A-TAC--AC--TGAC---T--A-G-CTT--TCT-CCACCGACC-GC-CTTTCAC--TTCCTA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25774 : TTC-AA-TTATA--AAATGCTATTCAT----------------CCTTT------------A----GTTTATTACA-TAGTCTTCACTTC-C-G--T-TT--GT--C----AGATGG--T--G-T----TT--T-AT---T--G-G-
gi|25775 : C-AA-TA-CA--AAATGATATTTAT----------------CCTCT------------A----AAACATTGCA-AATTCTGAA---T-C-GA-C-TA--GTATC----AAA--A--TCAA-T----TCAATAA------------CG--TGA-CCATCTACCTAC-TTCA-AC--TTCTAA--------TCTATGTAATGAC-ACTCTTA------A-----TT-TTGACAAAA-CTT
gi|25776 : -AA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CCTAC------------A----AGATGTTACA-TATTTTGCATTTT-CTGTCT-TC---T--C----TAGAAG--T----T----TT--TACT--------G-TTGTTTTT-TCACTGTCTTGT-TTCT-AT--TTCTAA--------CCTATGCGCCGAT-ACTC-TA------AGT---CT-T-G-TTGAAGCCTT
gi|25777 : -AA-TAACG--AAATGATATTCGT----------------CTTTT------------A----ATACATTACA-CACTGCGCATATT-C-A--TCTC--AT--T----GACAGGAAT--A-C----TC--T--C---T--G-G-TCG--AGA-CCATCGACCTGC-TTC
gi|25778 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA--GG--TCGA-C----CC--TGTT---T-------CT--TGT-CTATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGACGAT-ACTCGTA------G-----CTATAA-CA
gi|25779 : A-TAATACAAAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATATATTGCA-AATTCTACA---T-C-G--T-CT--GT--TATCAAAATCA--T----T----TC--T-AT---T--A----CG--TGA-CATACAAACTAT-TTAA-AC--TTCAAA--------TCTATGTGATGAC-ACTCTTA------A-----TT-T
gi|25780 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA-CGT--C--GAC----CC--TGTT---T-------CT--TGC-CCATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGATGAC-ACTCGTA------G-----CT-T
gi|25781 : ATA--AAATGAAATTCAT----------------CCTCT------------A----AAATATTGCA-TACATTACATTTT-C-T--C-TG--AT--G----AACTTG--T--G-T----ACT-TAA------------CG---GT-TTA---GCC--C-CTCT-ACAAGTTTAAATAGCAAGTCTATGAGATGTG-ACTCTAA------A-----TT-TAG-TAAAA
gi|25782 : --AAGTGGTATTCGT----------------CTTCT------------A----AAATATTACA-TTGTCTGCATTTT-T-T--A-TC--TT--G----AAATGG--A--A-C----AC--TAAC---A--G-G-TTT--TGG-CCACCTATC-GCATTCT-AC--TTCAAG--------TCTATGAGAAGAT-AGTCGTA------A-----TC-TTG-AAAAAGCTTT
gi|25783 : TGATATTCAT----------------T---T------------A----A---ATTACA-TACTCTGCATTTC-C-A--T-TC--GT--C----AAATGG--A--A-T----TC--TAAT---T--G-G-ACG--
gi|25784 : ATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAGTGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCG--TAT-GCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTT------A-----CT-TAG-CAAAAGCGTTAATatat
gi|25785 : CACATT-T-A--T-TC--GT--C----AAATAG--T--T-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAACGACCTAC-CTCC-TC--TTCTAA--------ACGATGCGACGAA-ACACGTG------A-----TT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
blockSeqs : T A CA TCTATTATTTAATGAT TATTTATTAATC TTTT TT G C C TGTC C AA AT ATCA AT AA GTTTTC AA A CTC TAT TT GTT A A G T T C AA ATAGCAAG G C GT G TAATAT GTCTG A A
blockSeqs : T A . . . . TG G C . GT . A . . AT . ATAC T A . GA C G G A A C A . . . G T G G . GT . .
blockSeqs : . . . . . . TT G C . TA . . . . AT . CAAT . A . G C G . A G T . . . . A C G A . T . .
blockSeqs : . . . . . . TT . C . GA . . . . AT . CGAC . A . G C G . A G T . . . . G C G G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . C . G . . . . AA . ATG . A . G C G . A G T . . . . G C G G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . C . G . . . . TT . GAC . A . T C G . A G T . . . . G C G G . . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . A . G . . . . AT . GT . G . G C G . C A A . . . . T C G G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . T . G . . . . AT . GT . A . G T T . A G T . . . . G C A G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . C . G . . . . GT . AT . A . G T A . A G T . . . . T T G G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . C . G . . . . AA . GT . T . G C A . T T T . . . . T A T G . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . T . G . . . . AA . GT . T . G G G . T A G . . . . T A A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . G . G . . . . CG . AT . A . G T T . T A T . . . . T C A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . G . G . . . . AT . AA . A . G G T . T T A . . . . G T T G . . . .
blockSeqs : . . . . . . GG . T . G . . . . GA . GT . T . G C T . T A G . . . . G T T T . . . .
blockSeqs : . . . . . . TG . G . T . . . . CA . GT . G . G T T . T T T . . . . T T T G . . . .
blockSeqs : . . . . . . TG . G . T . . . . AT . GC . G . G C G . C A T . . . . T A G T . . . .
blockSeqs : . . . . . . TG . A . G . . . . CT . GT . A . A G A . T A T . . . . T T A G . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . G . G . . . . AT . AC . A . G C T . C T T . . . . T C C G . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . G . G . . . . AT . AC . G . G T T . T A T . . . . T A T G . . .
blockSeqs : . . . . . . AA . T . T . . . . GT . GT . G . A T G . T A T . . . . T T T . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . T . G . . . . AT . GT . A . G T G . A A T . . . . T A C . . .
blockSeqs : . . . . . . TA . C . A . . . . T . AC . A . G A T . T A T . . . . T A C .
blockSeqs : . . . . . TA . T . T . . . . A . GT . A . G T G . C G . . . . . T A G
blockSeqs : . . . . . TA . T . G . . . . A . AC . A . G T T . A A . . . . . G C T
blockSeqs : . . . . . TA . T . T . . . . A . AT . A . . . G . A G . . . . . G C G
blockSeqs : . . . . AA . C . T . . . . A . GT . . . . . T . . A . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . AA . G . T . . . . C . TT . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A . . . . . . T . . . . . G .
blockSeqs : . C . G . . . . . . T . . . . . A
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
finalCons : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Alignments
lowQualScore : 3 3 0 22 0 0 9999999999999999 777777777777 2222 22 4 1 0 1 4444 1 33 11 2222 77 11 777777777 33 3 222 3333 44 222 0 2 3 1 3 2 1 22 55555555 1 1 0 33 1 555555 88888 1 2
lowQualScore : . . . .. . . ................ ............ .... .. . . . . .... . .. .. .... .. .. ......... .. . ... .... .. ... . . . . . . . .. ........ . . . .. . ...... ..... . .
lowQualScore : 5 1 9 00 5 5 1111111111111111 111111111111 9999 77 0 8 9 3 6666 3 11 88 7777 88 88 777777777 11 0 333 0000 11 333 4 8 8 9 0 9 5 00 44444444 5 6 6 77 6 222222 99999 9 2
consensus : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
Reference ( family-638 ) : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCGT----------------CCTCT------------A----ATNTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCANCGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCNATGCGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25755 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATCCAT----------------CCTCT------------A----ATTCATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TA--TAAT---T--G-G-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-ACTTGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTGAT
gi|25756 : ATTC-AA-TAATA--AAATGACATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--CAT-CCAACAGCCTGA-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGAATCGACAAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTA
gi|25757 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATGTATTACA-TACTCTACACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AA-TGG--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAACGACCCGT-CTCT-AT--TTCTAA--------TCGATGTGACGAG-ACTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25758 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTACA-TGCTCTGCACTTT-T-G--T-TC--AT--C----AAATGA--T--A-T----TC--TAAT---T--G-G-CTG--TAT-CCAATGGCCTGC-CCCT-AC--TTCTAA--------TCAATGCAATGAG-ACTCATA------A-----CT-TTG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25759 : ATTC-AA-TAATA--AAATGATATTCATTCTATTATTTAATGATCCTTT------------T----ATTTATTACA-TACTTTGCCCTTT-C-G--T-TC--GT--C----ATATGG--T--G-T----TC--TAAC---T--T-G-CCG--TAT-CCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCATTAAT
gi|25760 : ATTC-AA-CAATA--GAATGATATTCAT----------------TCTTTTATTTATTAATCATTTTATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCG--TAT-CCAATGGCCTGC-CTCT-GC--TTCTAA--------CCGATGCGACGGG-AGCCGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25761 : ATTC-AA-TAATA--AAATGGTATTCAT----------------TCTCT------------A----ATTTATTTCA-TACTCTGCACTTC-T-G--T-TC--GT--C----ATAAGT--T--A-T----TC--TAAT---T--G-T-CCG--TGT-CCAACGGCCTGC-TTTA-AC--TCATAG--------TCGATGCGACGAG-ACACGTA------A-----CT-TAG-CAAAAGCTTTAAT
gi|25762 : ATTC-TA-AAACA--AAATAAAATTCAT----------------CTTCT------------A----TAACATTACAGTGAT-TACATATT-C-G--A-TC--AT--T----GATTGG--T--A-A----TC--TGTT---C--G-G-TCT--ATT-CCACCTACCAGC-CTCT-AT--CTGTAA--------CCTATGCGATGAA-ACTCGTA------G-----CT-TTG-AAAAAG
gi|25763 : ATCC-AA-TAATA--AAATAATATTCAA----------------CCTCA------------A----ATTTATTACA-TATTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAATTC--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAATGGCTTGT-ATCT-AC--TTCTAA--------ACGATGCCATGAG-ACACGAA------G-----CT-AAG-CAAAAGTTTTAAT
gi|25764 : ATTT-AA-TAATA--AAATGATATTCAT----------------CTTTT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TT--GT--T----AAATGG--A--G-T----TC--TAAT---T--G-G-CCA--TAT-CCAACGGCATGC-CTCT-AC--TTCTTA------------------GAGTACTCGTATAATATA-----CT-CGG-CAAA
gi|25765 : ATTC-AA-TGATA--AAATTGTATTCAT----------------CCTCT------------A----ATTTATTACA-TACTCTGCACTTC-C-G--T-TC--AT--C----AAGTGG--G--G-C----TA--TTAT---T--G-G-GCG--TGT-
gi|25766 : ATTC-AAATAA-A--AAATGAAATTTGG----------------CCTTC------------A----AGATGTTACA-TATTCGGCATTTTCC-GT-T-TC--CT--C----TA--GG--A--G-T----TT--TTAT---T--G-T-TTT--TTT-TCATCGTCCTGT-TTCT-AT--TTCTTA--------CCTATGTGTCGAT-ATTC-TA------A-----
gi|25767 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-GTT--TCT-CCGTCGACC-GCTTTCC-AC--TTCCAA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25768 : ATTC-GA-TT-TA--ATATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----AGATATTACA-CTGTTTAAACATT-C-T--T-TC--AT--T----GAAAGG--T--A-C----AC--TAAC---T--G-G-CTT--TCT-CCGTCGACCGTT-TTCC-AC--TTACAA--------TATATGAGAGGAA-A
gi|25769 : ATTC-AAATAAAA--AAATGAAATTCGT----------------TCTCC------------A----AGGTATTACA-TATTCTGCATTTT-CTA--T-TT--TT--C----------------------TC--T-AT---T----G-TTT--TTT-CCATTGTCCTGT-TTCC-TT--TTTTAA--------CCTATGCGCGGAT-ACTC
gi|25770 : ATTCTAA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGACATTTT-C-G--T-TCAAG---C----ACA-GG--C--G-T----TT--TTTTCTCT--G-GTTTG--TG--CCATCAACCAGT-TTCT-AT--TTCGAG--------TCGATGTGACGAT-ACTC-TG------AGTCTGCT-TAA-CGAAA
gi|25771 : ATTCTAA-TAA-A--AAATGTAATTCGT----------------CTTCT------------A----ATGAGTTGCA-AAGTTGGCATTTT-C-G--T-TCA-GA--C----ACA-GG--C--G-TTTTCTC--TGGT---TTAT-G-CCA--TGTACCA-------GT-TTCT-AT--TTTGAG--------TCGATGTGACGAT-ACACG
gi|25772 : ATTC-AA-GAGTA--AAGTAAAATTCGT----------------CCTCA------------A----GTGTATTACA-CAAGAGGCATTTA-C-G--T-TC--GT--T----TACGGG--T--A-TG---T-----AT---T--GAG-GTT--TATGCCATCTTCCGGT-CTCT-AT--TGCGAG--------TCTATGTGAAGAG-ACTCTTA------GT----CT-TA
gi|25773 : ATTT-GA-T--TA--AAATGGTATTTAT----------------CCTCT------------A----GGATATTACA-CTGTTTACACATT-C-T--G-TC--AT--T----GAA--G--T--A-TAC--AC--TGAC---T--A-G-CTT--TCT-CCACCGACC-GC-CTTTCAC--TTCCTA--------TCTATGAGAGGAA-A
gi|25774 : TTC-AA-TTATA--AAATGCTATTCAT----------------CCTTT------------A----GTTTATTACA-TAGTCTTCACTTC-C-G--T-TT--GT--C----AGATGG--T--G-T----TT--T-AT---T--G-G-
gi|25775 : C-AA-TA-CA--AAATGATATTTAT----------------CCTCT------------A----AAACATTGCA-AATTCTGAA---T-C-GA-C-TA--GTATC----AAA--A--TCAA-T----TCAATAA------------CG--TGA-CCATCTACCTAC-TTCA-AC--TTCTAA--------TCTATGTAATGAC-ACTCTTA------A-----TT-TTGACAAAA-CTT
gi|25776 : -AA-TGA-A--AAATGAAATTCGT----------------CCTAC------------A----AGATGTTACA-TATTTTGCATTTT-CTGTCT-TC---T--C----TAGAAG--T----T----TT--TACT--------G-TTGTTTTT-TCACTGTCTTGT-TTCT-AT--TTCTAA--------CCTATGCGCCGAT-ACTC-TA------AGT---CT-T-G-TTGAAGCCTT
gi|25777 : -AA-TAACG--AAATGATATTCGT----------------CTTTT------------A----ATACATTACA-CACTGCGCATATT-C-A--TCTC--AT--T----GACAGGAAT--A-C----TC--T--C---T--G-G-TCG--AGA-CCATCGACCTGC-TTC
gi|25778 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA--GG--TCGA-C----CC--TGTT---T-------CT--TGT-CTATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGACGAT-ACTCGTA------G-----CTATAA-CA
gi|25779 : A-TAATACAAAATGATATTCAT----------------CCTCT------------A----ATATATTGCA-AATTCTACA---T-C-G--T-CT--GT--TATCAAAATCA--T----T----TC--T-AT---T--A----CG--TGA-CATACAAACTAT-TTAA-AC--TTCAAA--------TCTATGTGATGAC-ACTCTTA------A-----TT-T
gi|25780 : A-TGATA--AAATGAAACTCGT----------------CTTCA------------A----GTATATTACAGTATT-TACATTTT-C-T--C-TC--AT--C----AA-CGT--C--GAC----CC--TGTT---T-------CT--TGC-CCATCGACCTGA-TTCA-AT--CTCTAA--------TCTATGAGATGAC-ACTCGTA------G-----CT-T
gi|25781 : ATA--AAATGAAATTCAT----------------CCTCT------------A----AAATATTGCA-TACATTACATTTT-C-T--C-TG--AT--G----AACTTG--T--G-T----ACT-TAA------------CG---GT-TTA---GCC--C-CTCT-ACAAGTTTAAATAGCAAGTCTATGAGATGTG-ACTCTAA------A-----TT-TAG-TAAAA
gi|25782 : --AAGTGGTATTCGT----------------CTTCT------------A----AAATATTACA-TTGTCTGCATTTT-T-T--A-TC--TT--G----AAATGG--A--A-C----AC--TAAC---A--G-G-TTT--TGG-CCACCTATC-GCATTCT-AC--TTCAAG--------TCTATGAGAAGAT-AGTCGTA------A-----TC-TTG-AAAAAGCTTT
gi|25783 : TGATATTCAT----------------T---T------------A----A---ATTACA-TACTCTGCATTTC-C-A--T-TC--GT--C----AAATGG--A--A-T----TC--TAAT---T--G-G-ACG--
gi|25784 : ATTACA-TACTCTGCACTTT-C-G--T-TC--GT--C----AAGTGA--T--G-T----TC--TAAT---T--G-G-TCG--TAT-GCAACGGCCTGC-CTCT-AC--TTCTAA--------TCGATGCGACGAG-AGTCGTT------A-----CT-TAG-CAAAAGCGTTAATatat
gi|25785 : CACATT-T-A--T-TC--GT--C----AAATAG--T--T-T----TC--TAAT---T--G-G-TCA--TGT-CCAACGACCTAC-CTCC-TC--TTCTAA--------ACGATGCGACGAA-ACACGTG------A-----TT-TAG-CAAAAGCTTTAAT