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Reference ( gi|49507 )        : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGT-TCACATGAA-ATT---TTA------G--GCA----GTG----------AA--AA-TATATA----T-GTTTGTTTAGTA-AAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49506                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGT-TCACATGAA-ATT---TTA------G--GCA----GTG----------AA--AA-TATATA----T-GTTTGTTTAGTA-AAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49505                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGT-TCACATGAA-ATT---TTA------G--GCA----GTG----------AA--AA-TATATA----T-GTTTGTTTAGTA-AAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49508                      :                                                                                                                                       ATTCGAAGTCAATTG---AAACGTCATATACGTGTGGTTGAC----TTTTTTATT-GTTTGCATGT-CTGTGAGAA-ATG---CTG------T--GCATCCAGTGCTACTGATATAA--AA-AGTAAAG---T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCGCCCCTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49518                      :                                                                                                                                                                                                                                        A----GT-----------AA--AG-TAT-------T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGC
gi|49519                      :                                                                                                                                                                                                                                        A----GT-----------AA--AG-TAAA-A----T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCGTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49521                      :                                                                                                                                                                                                                                        A----GTA----------AA--AA-T-TAAAG---T-ATTTGTTTGTTA-TAGTGTCATCCCTATTG-AAAAGGCCA
gi|49522                      :                                                                                                                                                                                                                                        A----GTC----------AA--AG-TAAA-G----T-GTTTGTTTAATA-TAGTGTCACCCTTATTG-AA--GGCC
gi|49523                      :                                                                                                                                                                                                                                         ----GTG----------AA--AG-TGTGTT----T-GTTTATT--ATA-TAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTC
gi|49524                      :                                                                                                                                                                                                                                         ----GTA----------AA--AG-TAAA-G----T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCAACCCTACTG-AAAGGACCA
gi|49525                      :                                                                                                                                                                                                                                                ----------AA--AA-TGTAAA----TTGTTTGTTTATTA-TAATGTCACCCTCATTG-AAAGGGCCA
gi|49526                      :                                                                                                                                                                                                                                                            --AA-CATA-G----T-GATTGTTTATTA-TAGTGTCACCTCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49527                      :                                                                                                                                                                                                                                                                   TATAG---T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCCTATTG-AAAGAGCCA
gi|49528                      :                                                                                                                                                                                                                                                                   TATAG---T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCACTATTG-AAAGGACCA
gi|49529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       ----T-GTGTGTTTATTA-CAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       ----T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCTTATTG-AAAGAGCCA
gi|49531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       ----T-GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCATAATG-AAAGGGCCA
gi|49532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            -GTTTGTTTATTA-TAGTGTCACCCCTATTG-AGAGAACCA
gi|49533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGTTTATTA-TAGTGTCACCCCTATTGAAAAGGGCCA
gi|49534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTTATTA-TAGTGTTACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA-AAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA





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lowQualScore                  :                                                                                                                                                  88  5      0    555            5    0       0    0  2     11  9 0   4  555555    5555  55555555555555  0 0  7 444                11               3         
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Reference ( family-637 )      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACGTTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTNTATTATT-TTTT-CACGTTCACGTGAA-ATTNTA------GGCA----GT-G------------AA-A-GT-ATA-GTGTTTGTTTATTATA--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49505                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATATATGTTTGTTTAGTAAA--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49506                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATATATGTTTGTTTAGTAAA--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49507                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATATATGTTTGTTTAGTAAA--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49508                      :                                                                                                                                       ATTCGAAGTCAATTG---AAACGTCATATACGTGTGGTTGAC----TTTTTTATT-GTTTGCATGTCTGTGAGAA-ATGCTG------TGCATCCAGT-GCTACTGATATAAAA-A-GT-AAA-GTGTTTGTTTATTATA--GTGTCGCCCCTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49514                      :                                                                                                                                                                acgtgttacgaaattcaattatagagaacactatataaacaTCAAATGAA-ATTATT------AGC------T-AC-----------AA-A-GT-GAA-ATATTTATTTATTATAA-GTGCCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49515                      :                                                                                                                                                                                                                  -ATTCCA------AGCT----GG-G------------AATA-AT-ATA-GTGTTTGTTTATTATA--GTGTCACCCCTATTG-AAAAGACCA
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gi|49519                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-AAA-ATGTTTGTTTATTATA--GTGTCACCCGTATTG-AAAGGGCCA
gi|49520                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-AAA-GTGTTTGCTTATTACA--GTGTCACCCCTATTA-AAAGGGCCA
gi|49521                      :                                                                                                                                                                                                                             agtgaA----GT-A------------AA-A-ATTAAA-GTATTTGTTTGTTATA--GTGTCATCCCTATTG-AAAAGGCCA
gi|49522                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT-C------------AA-A-GT-AAA-GTGTTTGTTTAATATA--GTGTCACCCTTATTG-AA--GGCC
gi|49523                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-G------------AA-A-GT-----GTGTTTGTTTATTATATAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTC
gi|49524                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-A------------AA-A-GT-AAA-GTGTTTGTTTATTATA--GTGTCAACCCTACTG-AAAGGACCA
gi|49525                      :                                                                                                                                                                                                                                           ------------AA-ATGT-AAA-TTGTTTGTTTATTATA--ATGTCACCCTCATTG-AAAGGGCCA
gi|49526                      :                                                                                                                                                                                                                                                             a-ATA-GTGATTGTTTATTATA--GTGTCACCTCTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49528                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-ATA-GTGTTTGTTTATTATA--GTGTCACCACTATTG-AAAGGACCA
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gi|49531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    TGTTTGTTTATTATA--GTGTCACCCATAATG-AAAGGGCCA
gi|49532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTTGTTTATTATA--GTGTCACCCCTATTG-AGAGAACCA
gi|49533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGTTTATTATA--GTGTCACCCCTATTGAAAAGGGCCA
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consensus                     : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACGTGAA-ATTNTA------GGCA----GT-G------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
Reference ( family-637 )      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACGTGAA-ATTNTA------GGCA----GT-G------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49505                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49506                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49507                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49508                      :                                                                                                                                       ATTCGAAGTCAATTG---AAACGTCATATACGTGTGGTTGAC----TTTTTTATT-GTTTGCATGTCTGTGAGAA-ATGCTG------TGCATCCAGT-GCTACTGATATAAAA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49509                      :                                                                                                                                                                                    GTTTATTATAATTTT-CA---TCACTTCAATATTATACGAGTTGACA----CTTA------------AA-A-GT-A-AT-GT---GTTTGTTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTCA
gi|49510                      :                                                                                                                                                                                             T-TTTT-GACATTCATTTG----CTATA------AAAA----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAACGGCCA
gi|49511                      :                                                                                                                                                                                             T-TTTT-GACATTCATTTG----CTATA------AAAA----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAACGGCCA
gi|49512                      :                                                                                                                                                                                              -TTTT-CATGGTTAAATAAA-GT----------GG-A----GT-G------------AATA----A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTTACCCCTTTTG-AAAGTGCCA
gi|49513                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-A-AACAT---GTTTGTTTATTCT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGACCA
gi|49514                      :                                                                                                                                                                      acgtgttacgaaattcaattatagagaacactataTCAAATGAA-ATTATT------AGC------T-AC-----------AA-A-GT-G-AA-AT---ATTTATTTATTATAA--GTGCCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49515                      :                                                                                                                                                                                                                  -ATTCCA------AGCT----GG-G------------AATA-AT-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAAGACCA
gi|49516                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-T-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49517                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49518                      :                                                                                                                                                                                                                                                         -A-GT-A-AA-GTATTGTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGC
gi|49519                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-AT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCGTATTG-AAAGGGCCA
gi|49520                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGCTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTA-AAAGGGCCA
gi|49521                      :                                                                                                                                                                                                                             agtgaA----GT-A------------AA-A-ATTA-AA-GT---ATTTGTTTGTTAT-A--GTGTCATCCCTATTG-AAAAGGCCA
gi|49522                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT-C------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTAATAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AA--GGCC
gi|49523                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-G------------AA-A-GT------GT---GTTTGTTTATTAT-ATAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTC
gi|49524                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-A------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCAACCCTACTG-AAAGGACCA
gi|49525                      :                                                                                                                                                                                                                                           ------------AA-ATGT-A-AA-TT---GTTTGTTTATTAT-A--ATGTCACCCTCATTG-AAAGGGCCA
gi|49526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 aA-GT---GATTGTTTATTAT-A--GTGTCACCTCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49527                      :                                                                                                                                                                                                                                                        aacatT-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGAGCCA
gi|49528                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCACTATTG-AAAGGACCA
gi|49529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTGTGTTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AAAGAGCCA
gi|49531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCATAATG-AAAGGGCCA
gi|49532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      ---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AGAGAACCA
gi|49533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTGAAAAGGGCCA
gi|49534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTATTAT-A--GTGTTACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA





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Reference ( family-637 )      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACGTGAA-ATTNTA------GGCA----GT-G------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49505                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49506                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49507                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49508                      :                                                                                                                                       ATTCGAAGTCAATTG---AAACGTCATATACGTGTGGTTGAC----TTTTTTATT-GTTTGCATGTCTGTGAGAA-ATGCTG------TGCATCCAGT-GCTACTGATATAAAA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49522                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT-C------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTAATAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AA--GGCC
gi|49523                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-G------------AA-A-GT------GT---GTTTGTTTATTAT-ATAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTC
gi|49524                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-A------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCAACCCTACTG-AAAGGACCA
gi|49525                      :                                                                                                                                                                                                                                           ------------AA-ATGT-A-AA-TT---GTTTGTTTATTAT-A--ATGTCACCCTCATTG-AAAGGGCCA
gi|49526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 aA-GT---GATTGTTTATTAT-A--GTGTCACCTCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49527                      :                                                                                                                                                                                                                                                        aacatT-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGAGCCA
gi|49528                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCACTATTG-AAAGGACCA
gi|49529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTGTGTTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AAAGAGCCA
gi|49531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCATAATG-AAAGGGCCA
gi|49532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      ---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AGAGAACCA
gi|49533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTGAAAAGGGCCA
gi|49534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTATTAT-A--GTGTTACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA


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Reference ( family-637 )      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACGTGAA-ATTNTA------GGCA----GT-G------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
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gi|49506                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49507                      : TACAGGGGCCATTTTTGTAAATTAATACATGTGGAGCTGAATTTAATAAAAAATAATAAGGTTAATTTTAGCCTGGTACACAATCATGTTTAATACATAAAGACAATGAGCAGCGTGCAACAGTTATGTCTTTAATTCCAAGTTA--TGGTCAGACATTAT---CGTGTAGGTGACGAGGTATATTATT-TTTT-CACGTTCACATGAA-ATTTTA------GGCA----GT-G------------AA-A-AT-ATAT-AT---GTTTGTTTAGTAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49508                      :                                                                                                                                       ATTCGAAGTCAATTG---AAACGTCATATACGTGTGGTTGAC----TTTTTTATT-GTTTGCATGTCTGTGAGAA-ATGCTG------TGCATCCAGT-GCTACTGATATAAAA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49509                      :                                                                                                                                                                                    GTTTATTATAATTTT-CA---TCACTTCAATATTATACGAGTTGACA----CTTA------------AA-A-GT-A-AT-GT---GTTTGTTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTCA
gi|49510                      :                                                                                                                                                                                             T-TTTT-GACATTCATTTG----CTATA------AAAA----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAACGGCCA
gi|49511                      :                                                                                                                                                                                             T-TTTT-GACATTCATTTG----CTATA------AAAA----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCGCCCCTATTG-AAACGGCCA
gi|49512                      :                                                                                                                                                                                              -TTTT-CATGGTTAAATAAA-GT----------GG-A----GT-G------------AATA----A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTTACCCCTTTTG-AAAGTGCCA
gi|49513                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-A-AACAT---GTTTGTTTATTCT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGACCA
gi|49514                      :                                                                                                                                                                      acgtgttacgaaattcaattatagagaacactataTCAAATGAA-ATTATT------AGC------T-AC-----------AA-A-GT-G-AA-AT---ATTTATTTATTATAA--GTGCCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49515                      :                                                                                                                                                                                                                  -ATTCCA------AGCT----GG-G------------AATA-AT-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAAGACCA
gi|49516                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-T-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49517                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49518                      :                                                                                                                                                                                                                                                         -A-GT-A-AA-GTATTGTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGC
gi|49519                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-AT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCGTATTG-AAAGGGCCA
gi|49520                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT--------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGCTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTA-AAAGGGCCA
gi|49521                      :                                                                                                                                                                                                                             agtgaA----GT-A------------AA-A-ATTA-AA-GT---ATTTGTTTGTTAT-A--GTGTCATCCCTATTG-AAAAGGCCA
gi|49522                      :                                                                                                                                                                                                                                  A----GT-C------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTAATAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AA--GGCC
gi|49523                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-G------------AA-A-GT------GT---GTTTGTTTATTAT-ATAGTGTCACCCCTATTG-AAAGGGTC
gi|49524                      :                                                                                                                                                                                                                                   ----GT-A------------AA-A-GT-A-AA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCAACCCTACTG-AAAGGACCA
gi|49525                      :                                                                                                                                                                                                                                           ------------AA-ATGT-A-AA-TT---GTTTGTTTATTAT-A--ATGTCACCCTCATTG-AAAGGGCCA
gi|49526                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 aA-GT---GATTGTTTATTAT-A--GTGTCACCTCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49527                      :                                                                                                                                                                                                                                                        aacatT-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGAGCCA
gi|49528                      :                                                                                                                                                                                                                                                             T-A-TA-GT---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCACTATTG-AAAGGACCA
gi|49529                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTGTGTTTATTAC-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49530                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCTTATTG-AAAGAGCCA
gi|49531                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     T---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCATAATG-AAAGGGCCA
gi|49532                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      ---GTTTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTG-AGAGAACCA
gi|49533                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGTTTATTAT-A--GTGTCACCCCTATTGAAAAGGGCCA
gi|49534                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTTATTAT-A--GTGTTACCCCTATTG-AAAGGGCCA
gi|49535                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAA-A--GTGTCACCCCTATTG-AAAGGGCCA