lowQualScore : 1 1 1 11 1 333 1 1 6666 3 222 111 111
lowQualScore : 5 4 4 7 55 1 22 2 6 1 6666666 0 3333 22 22 1 4 4 111 6 5 4 4 4 1 5555 2 3333 1 6666666 666 1 44444 7 0 1 0 11 999 111 0 333 1111 1 2222 0 333 222
lowQualScore : . . . . .. . .. . . . ....... . .... .. .. . . . ... . . . . . . .... . .... . ....... ... . ..... . . . . .. ... ... . ... .... . .... . ... ...
lowQualScore : 0 5 7 0 55 9 66 8 2 5 2222222 7 7777 22 22 4 0 0 555 0 0 0 0 0 8 3333 0 7777 9 2222222 777 9 88888 5 5 0 9 33 333 444 8 222 6666 2 1111 8 777 777
consensus : TTGGCTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTNAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAANAAAA---A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--TGCCTGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Reference ( gi|58675 ) : TTGGCTAGATCTAGCTCTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTTTGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATACATAATAACCTTGATACCATGGTCTAT-AAA-TAAAAAAAAAGCA-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTTGGGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58674 : TTGGCTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTAGT------AAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAACTTTAGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCCTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAAA-----GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58677 : TTGGCTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-CAA-TAAAAAAAA---A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTTCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58676 : TTGGCTAGATCAAGATCTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGA----CTTTGAAACAC-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AATTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATT-T-GGCCAA--T---TGAAA---CT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58678 : TTGGCTAGATCTAGATCATATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTAAAAAGTGTTTATTAATGATAAA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC-A----AGACAAATTTATTTTTTAAAATAT-CTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATATCCTTGATACCATTGTTTAT-GAA-TAAAAAA-----A-GCTAATAATGCATATAAAATAACACGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACA-TTAAGAC-TAC-----AAGTT--TGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---T---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58679 : TTGGCTAGATCTA------ATTTTAAAGCAAACGGCCATTGGCTACATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTGTTTTAGGTAGTATGATAAATAACAA----AGACAATTTTGTATTTTAAAATAT-TTTGTTTCGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACTTTAACATAT---ATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAAGGAATATTAAATAGCACACAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTA---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAAATGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58680 : TTGGCTAGATCTAGATCTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGCGTGTACGTCTCAATCTCAA--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGACTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58681 : TTGGCTATATCTAGATCTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTACGTCTC------AG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAATGCATATTAGATAAAACGTGGG----CTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACATAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58682 : TTGGCTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACAAACGGCCATTGGCTGTATTAATTCTATAATAAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCCCTGTACACTTG-TTATT--GTTAAATCCATTATTCATAATTTTGTTTAGTTGAAAGTGTTTATTTATGAAAT----------ATTGTAAGCATTTATTTATAGTAGTATATTAATTA----------ACATTTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAAC--TGATACCATTGTCTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGAAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-TGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAG----TG----------------G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58683 : TTGGCTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACGAACAGCCATTGGCTATATTAAATCTATATATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATATACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGTTTC---TTTT--TTT---------TGGTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAGTAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAA-TAGATACA----A-GCTAATATTGCATATTAAATAACACATGGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---GGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TTGCCAAAA---T-T---G---CCAGGGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58684 : TTGGCTAGATCTAGATCTAATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCATTATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGATCTCAG--TCTCTGTACAAATG-TTATT--GTTGAATCTATGATTCATATTT--GTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTAAGGTAGTATAATAAGTAACTA----AGACAACTTTATTTTTT-------------------AAGAACTGCTATGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTTTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAATACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTT-----------------------------GGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAG---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58685 : TTGGCTAGATCTAGATCTAATTTTAAAACCAAAGGC-------TATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTAG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATAGTAGTATAATAAATTACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTTT-AAA-TAGAAAAA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTCAAACAA-TTAATTTTGGCTTTA-------TTT---AGACATTTATG---TGCATGTGAAGTTTCAGTT-TAATTGGCCTGG-TGGTT
gi|58686 : TTGGCTAGATCAAGATCTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTTGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAAAA--A-GCTAATAATGCATATTTAATAACATGCATA----CTTTGtc
gi|58687 : TTGGCTATATCTTGATCTAATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGGTCTC----------TACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGTGTTTATTTACGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-TTTTTTAAATAT-GTT
gi|58688 : TTGGCTAGATCTTGATGTAATTTTAAAATGAACG-CCATTGGCTATATTGATTCTATAAAAAGAAATGTGTGTATGTCTC------AG--TCTCTGTTCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGCGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTCTTT-AATA---CTGCTTTG-AAAt
gi|58689 : GCTAGATCTAGATCT-ATTTTAAAACGAA
gi|58690 : CTAGATCTAGATCTTATTTTAAAACGAAAAGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACAATTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCGTTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTGGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCGTAACATATATATTAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAAAA-----CTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTAGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAATTAAATTCTAGCCCTGcatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcacttgccaaaattgccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58691 : CTTATTTTAAAACAAATGGCCATTGACTATATTAATTCTATAA-TAGAAATGTGTATATGTCTCACTCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GATGAATCCGTGACCGATATTTTTGTTTAGTTAAA-GTGTTCATTTATGATGTAACATAAATCATTATATGCATTTATTAATGGTAGTATAA------ATAA----AGACAATTTTATTTTTGAAAATAT-TTTGTTCTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACCTATAT---------GATACAATTGTCTAT-AAAATAACTACAA-----GCTAATAATGCATATTAAATAAAACACAGG----TTCTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTC-------ATT---AGTCATTTATGAC-TAC-----AAGTTTCTGGGAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GACTTCAAATT-T-GGCCTG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCACTGAATGGCCAAAA---T-T---G---CAAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAACCATG
gi|58692 : ctacataATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGATATGTGTGTATGTCTTAATCTCAG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTAATTCCATGATTTACATTTTTGTTTAGTCCAAAGTGTTTATTTATAATATA-------TTATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACTA----AGACAATTTTATATTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACTTATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-A----AAATAAATACCA-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTG
gi|58693 : TTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAA----A-GCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58689 : CTAGATCTATTTTA-AAACGAACATGTGTGTATGTCTCAATCTCGG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTACTATAATAAATAACAT----AGACAATTTTATT--------TAT-T----------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTAAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAA-TAAATACA----A-GCTAATAATGCATGTTAAATAACACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGCTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAATTTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TTGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCAC-AAAAAGTTAAATTCTAGCCATG
gi|58694 : gctagatCTCAA--TATC---ACACTGGGCTATAAAGTTGA--CAATGATTCGTATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACA-----ATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCGTAATATATATAATAACCTTGATAACGTTGTCTAT-A----AAAAAAAATACACGCTAATAATACATATTAAATAACACACGGG----CTTTGCAACAA-TTAATTTTGGGTTTG-------TTT---AGACATTTATGA----------------CTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCATAA---T-T---G---CCAGTGTACAAAAAAGGTAAATTCTAGCCCTG
gi|58695 : ttaatactataatgaaatggaagcgagaaACTCTTG-TTATT--GTCGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGATAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT------------------GTTTTGTAAATTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAA-TAAAAAAAA-----GCTAATAATGCATATTAAATAACATGCAGG----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTCAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58697 : GTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-TTTTTTAAATATGTTTG
gi|58698 : GTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTCTTT-AATA---CTGCTTTG-AAAaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaattgccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58696 : ACTGCTTTG-AAATTGAAATACTTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAATAAATACAA-----GCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGG----CTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGCGAAAATTAGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACcacatttaggacttccaagtttccgcaaaaactggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaactgccagtgcacaaaaaagttaagttctagccctg
gi|58697 : GTATAATAAGTAACA---AAGACAACTTT------A-TT--TTTTAAATATG-------TTTGAAACACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTTTGCGAAAATTGGTTTGGCGAGTTGG-TTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTCCAATTCTAGCCCTG
gi|58698 : GTATATTAAGTAACA--------------AAGACAACTTTATTTC---TTTAATACTGCTTTGAAACACATTTAGGACTTCC-----AAGTTTCCGCAAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---TT-TTA-G-GCAC----TGGCCAAAA---C-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAGTTCTAGCCCTG
gi|58699 : G----CTTTGAAACAA-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGAC-TAC-----AAGTTTCTGTGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATT-T-GGCCAG--T---TGAAA---CT-TTA-G-GCAC----TGGTCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58702 : TTCAAATT-C-AGCAAG--T---AGAAAAAATT-----G-GCAC----TTGCTAAAA---T-TT--G---CAAGTGGAAAAAAAAGTTAAATTTGATCCCTG
gi|58674 : CAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---
gi|58690 : ttggctagatctagatcttattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagcctctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatattttagtaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaactttagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccctaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58677 : ctagatctagatcttattttaaaacgaaaagccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagcctctctgtacaattgttattgttgaatccatgattcatattttggtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcgttgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgtttggtaaagtactgctttgaattgtaccgtaacatatatattaaccttgataccattgtctataaataaaaaaaaactaataatgcatattaaataacacgcaggcttagaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---GAAACCAGccagtgcacaaaaaaattaaattctagccctg
gi|58676 : ttggctagatctagatcttattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatcttagtctctgtacacttgttatgatttatattttggtttagttaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctatcaataaaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttcttcgaaaattggtttggctagCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAG---TT-TCA-----AT----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58693 : ttggctagatcaagatcttattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtccaatctcggtctctgtgcacttgttattgttgaatccatgattcatattttggttttgttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttattttttaaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattttacctttacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcagactttgaaacacttaattttgtgtttatttagacatttaggactacaattttctgcgaaaattggtttggctagttgttttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---GAAACCAGccagtgcacaaaaaagttaaattctagccttg
gi|58679 : ttttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatcttagtctctgtacacttgttatgatttatattttggtttagttaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58680 : ttggctagatctaattttaaagcaaacggccattggctacattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagtctctatacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttgttttaggtagtatgataaataacaaagacaattttgtattttaaaatattttgtttcgtaaagtactgctttgaattgtactttaacatatataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataaggaatattaaatagcacacaggctttgaaacaattaattttgggtttattaagacatttaggactacaagtttctgcgaaaaatggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58681 : ttggctagatctagatctaattttaaaacgaacgaccattggctatattaattctataaatagaaatgcgtgtacgtctcaatctcaatctctgtacacttgttattgttgaatccacgattcatatttttgtttagttaaaaatgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacagacaattttattttttaagtactgctttgaaattgaaataccttaacatatataataactttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatattaaataaaacgcgggctttgaaacaattaatgttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttgactagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58683 : ttggctatatctagatctaattttaaaacgaacgaccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtacgtctcagtctctgtacacttgttattgttgaatccacgattcatatttttgtttagttaaaaatgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacagacaattttattttttaagtactgctttgaaattgaaataccttaacatatataataactttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatattagataaaacgtgggctttgaaacaattaatgttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCAAG--TGCCTAAAA---TT-TC-----CAC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacataaaagttaaattctagccctg
gi|58684 : ttggctagatctagatcttattttaaaacgaacagccattggctatattaaatctatatatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagtctctatatacttgttattgttgaatccatgtttcttttttttggttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtatagtaagtaacaaagacaactttattttttaagtactgctttgaaattgaaataccttaacatatataataaccttgataccattgtctataaaatagatacaagctaatattgcatattaaataacacatgggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAACTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagggcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58695 : ttggctagatctagatctaattttaaaacgaacggccattggcattattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcgatctcagtctctgtacaaatgttattgttgaatctatgattcatatttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttaaggtagtataataagtaactaagacaactttattttttaagaactgctatgaaattgaaataccttaacatatataataaccttgataccattgtttataaaataaatacaagctaataatgcatattaaataatacgcgggctttgaaacaattaattttggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58689 : actcttgttattgtcgaatccatgattcatattttggtttagttaaagtgtttattaatgatatatcattgtatgcatttatttatgatagtataataaataacaaagacaattttgttttgtaaattactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacatgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacattcaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCAAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58696 : gctagatctagatctattttaaaacgaacatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58699 : actgctttgaaattgaaatactttaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatattaaataaaacgcgggctttgaaacaattaatgttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattagtttggctagttggtttCAATTT-T-GACCAG--TGCCTAAAG---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcac
gi|58697 : gctttgaaacaattaattttgtgtttatttagacatttaggactacaagtttctgtgaaaattggtttggctagttgttttCAATTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagttaaattctagccttg
gi|58678 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttAAATT-TTGGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---ccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58703 : ttggctagatctagatcatattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatattttggtttagtaaaaagtgtttattaatgataaatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaagacaaatttattttttaaaatatcttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccttaacatatataatatccttgataccattgtttatgaataaaaaaagctaataatgcatataaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacattaagactacaagtttgcgaaaattggtttggctagttggtttAAAT-----GCGAG--T---TGAAA---ATATTA-G--CAC----TGGCTAAAAAAAT---------CCAGTGGATAAAAAAGTTAAATTATACCCCTGccagtgcacaaaaaagttaaattctagccctg
gi|58694 : AATTAT-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---
gi|58700 : ttaatactataatgaaatggaagcgagaactcaatatcacactgggctataaagttgacaatgattcgtatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttttaaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaaattgaaataccgtaatatatataataaccttgataacgttgtctataaaaaaaaatacacgctaataatacatattaaataacacacgggctttgcaacaattaattttgggtttgtttagacatttatgactgcgaaaattggtttggctagttggtttATT-T-TGCGAG--T---TGAAA---TA-TCT-T-GTAC----TCGCAAAAA---T-TT--G---TGAGTGCAAAAAAAAGGTAATTTCTAGCCCTGgccagtgtacaaaaaaggtaaattctagccctg
gi|58701 : agttggtATT-T-TGTGAG--T---TGAAA---TA-TCT-T-GTAC----TCGC-AAAA---TGT---A---TGAGTGCA-AAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58698 : agttgatTT-T-GGCCAG--TGCCTAAAA---TT-TCA-----AC----TGGCCAAAT---T-T---G---
gi|58681 : gtatattaagtaacaaagacaactttatttctttaatactgctttgaaacacatttaggacttccaagtttccgcaaaaactggtttggctagttggttt-GGCTAGAAT---TTAAC---TT-TTATGTGCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAactgccagtgcacaaaaaagttaagttctagccctg
gi|58674 : ttggctatatctagatctaattttaaaacgaacgaccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtacgtctcagtctctgtacacttgttattgttgaatccacgattcatatttttgtttagttaaaaatgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacagacaattttattttttaagtactgctttgaaattgaaataccttaacatatataataactttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatattagataaaacgtgggctttgaaacaattaatgttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAActg
gi|58690 : ttggctagatctagatcttattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagcctctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatattttagtaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaactttagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccctaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58677 : ctagatctagatcttattttaaaacgaaaagccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagcctctctgtacaattgttattgttgaatccatgattcatattttggtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcgttgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgtttggtaaagtactgctttgaattgtaccgtaacatatatattaaccttgataccattgtctataaataaaaaaaaactaataatgcatattaaataacacgcaggcttagaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaaattaaattctagccctg
gi|58693 : ttggctagatctagatcttattttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatcttagtctctgtacacttgttatgatttatattttggtttagttaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctatcaataaaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttcttcgaaaattggtttggctagctggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58679 : ttttaaaacgaaaggccattggctatattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatcttagtctctgtacacttgttatgatttatattttggtttagttaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacaaagacaattttatttttttaaatattttgttttgtaaagtactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacacgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagctggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58680 : ttggctagatctaattttaaagcaaacggccattggctacattaattctataaatagaaatgtgtgtatgtctcaatctcagtctctatacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttgttttaggtagtatgataaataacaaagacaattttgtattttaaaatattttgtttcgtaaagtactgctttgaattgtactttaacatatataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataaggaatattaaatagcacacaggctttgaaacaattaattttgggtttattaagacatttaggactacaagtttctgcgaaaaatggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58695 : ttggctagatctagatctaattttaaaacgaacgaccattggctatattaattctataaatagaaatgcgtgtacgtctcaatctcaatctctgtacacttgttattgttgaatccacgattcatatttttgtttagttaaaaatgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtagtataataaataacagacaattttattttttaagtactgctttgaaattgaaataccttaacatatataataactttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatattaaataaaacgcgggctttgaaacaattaatgttgggtttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaaattggtttgactagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58697 : actcttgttattgtcgaatccatgattcatattttggtttagttaaagtgtttattaatgatatatcattgtatgcatttatttatgatagtataataaataacaaagacaattttgttttgtaaattactgctttgaattgtaccttaacatatataataaccttgataccattgtctataaataaaaaaaagctaataatgcatattaaataacatgcaggctttgaaacaattaattttgggtttatttagacattcaggactacaagtttctgcgaaaattggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaa---TT-TTG-T-GCAC----TGGC---AA---T-TTTGG---CCAGTGCCTAAAAaagttaaattctagccctg
gi|58704 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaaA-G-GC-T----TTGCCAAAA---T-T---G---CCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTGaagtccaattctagccctg
Alignments
lowQualScore : 1 1 222 1 222 666
lowQualScore : 2 1 4 55 1 22 3 1 5555555 0 3333 2 1 3 3 888 7 1 666 3 333 0 1 6666666 333 1 44444 1 777 3333 222 1 3
lowQualScore : . . . .. . .. . . ....... . .... . . . . ... . . ... . ... . . ....... ... . ..... . ... .... ... . .
lowQualScore : 2 0 9 22 8 55 4 0 9999999 7 7777 4 7 3 8 444 1 9 111 6 333 6 9 2222222 333 8 55555 7 555 3333 777 5 1
consensus : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTT-AAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAATA-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Reference ( family-636 ) : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTNAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAANA-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTGCCTGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58674 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTAGT------AAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAACTTTAGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCCTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAA-A-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58675 : TTGGCTAGATCTAGCT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTTTGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATACATAATAACCTTGATACCATGGTCTAT-AAAT-AAAAA-AAAAGCAGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTTGGGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58676 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAA-A-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGACTTTGAAACAC-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AATTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAAT---TGAAACTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58677 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-CAAT-AAAAA-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTTCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58678 : TTGGCTAGATCTAGAT-CATATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTAAAAAGTGTTTATTAATGATAAA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC-A----AGACAAATTTATTTTTTAAAATAT-CTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATATCCTTGATACCATTGTTTAT-GAAT-AA--A-AAA---AGCTAATAATGCATATAAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACA-TTAAGACT-AC-----AAGTT--TGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-TCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58679 : TTGGCTAGATCTA-------ATTTTAAAGCAAACGGCCATTGGCTACATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTGTTTTAGGTAGTATGATAAATAACAA----AGACAATTTTGTATTTTAAAATAT-TTTGTTTCGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACTTTAACATAT---ATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAAGGAATATTAAATAGCACACAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTA---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAAATGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58680 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGCGTGTACGTCTCAATCTCAA--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGACTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58681 : TTGGCTATATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTACGTCTC------AG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATATTAGATAAAACGTGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACATAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58682 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACAAACGGCCATTGGCTGTATTAATTCTATAATAAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCCCTGTACACTTG-TTATT--GTTAAATCCATTATTCATAATTTTGTTTAGTTGAAAGTGTTTATTTATGAAAT----------ATTGTAAGCATTTATTTATAGTAGTATATTAATTA----------ACATTTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAAC--TGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGAACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-TGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAG----TG--------------GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58683 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACAGCCATTGGCTATATTAAATCTATATATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATATACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGTTTC---TTTT--TTT---------TGGTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAGTAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTTTT-------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AGAT--ACA---AGCTAATATTGCATATTAAATAACACATGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTG---GAAATTTTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGGGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58684 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCATTATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGATCTCAG--TCTCTGTACAAATG-TTATT--GTTGAATCTATGATTCATATTT--GTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTAAGGTAGTATAATAAGTAACTA----AGACAACTTTATTTTTT-------------------AAGAACTGCTATGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTTTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAATACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTT-----------------------------GGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAG---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58685 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACCAA-----A--GGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTAG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATAGTAGTATAATAAATTACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTTT-AAAT-AGA-A-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTCAAACAA-TTAATTTTGGCTTTA-------TTT---AGACATTTATG--T-GCATGTGAAGTTTCAGTT-TAATTGGCCTGG-----T-GGTTTC
gi|58686 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTTGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAATAAAAAA-AAA---AGCTAATAATGCATATTTAATAACATGCATACTTTG
gi|58687 : TTGGCTATATCTTGAT-CTAATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGGTCTC----------TACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGTGTTTATTTACGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTTTT-AAATAT-GTT
gi|58688 : TTGGCTAGATCTTGAT-GTAATTTTAAAATGAACG-CCATTGGCTATATTGATTCTATAAAAAGAAATGTGTGTATGTCTC------AG--TCTCTGTTCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGCGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTCTTT-AATA---CTGCTTTG-AAAt
gi|58689 : GCTAGATCTAGAT-C-TATTTTAAAACGAAC
gi|58689 : CTAGATCTATTTTA-AAACGAACATGTGTGTATGTCTCAATCTCGG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTACTATAATAAATAACAT----AGACAATTTTATT--------TAT-T----------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTAAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATGTTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGCTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAATTTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC-AAAAAGTTAAATTCTAGCCATGatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcacttgccaaaattgccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58690 : gctagatCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAAGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACAATTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCGTTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTGGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCGTAACATATATATTAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAAAA-AAA---A-CTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTAGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAATTAAATTCTAGCCCTG
gi|58691 : CTACATACTTATTTTAAAACAAATGGCCATTGACTATATTAATTCTATAA-TAGAAATGTGTATATGTCTCACTCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GATGAATCCGTGACCGATATTTTTGTTTAGTTAAA-GTGTTCATTTATGATGTAACATAAATCATTATATGCATTTATTAATGGTAGTATAA------ATAA----AGACAATTTTATTTTTGAAAATAT-TTTGTTCTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACCTATAT---------GATACAATTGTCTAT-AAAA-TAACT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACACAGGTTCTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTC-------ATT---AGTCATTTATGACT-AC-----AAGTTTCTGGGAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GACTTCAAATTTGGCCTGT---TGAAATTTTAGGCACTGAATGGCCAAAA---T-T-GCAAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAACCATG
gi|58692 : ATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGATATGTGTGTATGTCTTAATCTCAG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTAATTCCATGATTTACATTTTTGTTTAGTCCAAAGTGTTTATTTATAATATA-------TTATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACTA----AGACAATTTTATATTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACTTATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACC---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTG
gi|58693 : TTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATTTTTTTAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAA-A-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58694 : TTAATACTATAA-T-GAAATGGAAGCGAG----AA-CTCAA--TATC---ACACTGGGCTATAAAGTTGA--CAATGATTCGTATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACA-----ATTTTTTAAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCGTAATATATATAATAACCTTGATAACGTTGTCTAT-AAAA-AAAAATACA---CGCTAATAATACATATTAAATAACACACGGGCTTTGCAACAA-TTAATTTTGGGTTTG-------TTT---AGACATTTATGA----------------CTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCATAA---T-T-GCCAGTGTACAAAAAAGGTAAATTCTAGCCCTG
gi|58695 : ACTCTTG-TTATT--GTCGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGATAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT------------------GTTTTGTAAATTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTAT-AAAT-AAA-A-AAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACATGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTCAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58696 : ACTGCTTTG-AAATTGAAATACTTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAAT-AAAT--ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTAGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC
gi|58697 : GTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTATTTTTT-AAATATGTTTG
gi|58697 : ACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTTTGCGAAAATTGGTTTGGCGAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTCCAATTCTAGCCCTGaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaattgccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58698 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacGTATATTAAGTAACA----------AAGACAACTTTATTTC---TTTAATACTGCTTTGAAACACATTTAGGACTTCC-----AAGTTTCCGCAAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAATTTTAGGCAC----TGGCCAAAA---C-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAGTTCTAGCCCTG
gi|58699 : GCTTTGAAACAA-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGTGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAGT---TGAAACTTTAGGCAC----TGGTCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58700 : AGTT-GGT-----ATTTTGCGAGT---TGAAATATCTTGTAC----TCGCAAAAA---T-TTGTGAGTGCAAAAAAAAGGTAATTTCTAGCCCTG
gi|58701 : AGTT-GAT-----ATTTTGTGAGT---TGAAATATCTTGTAC----TCGC-AAAA---TGT-ATGAGTGCA-AAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58702 : TTCAAATTCAGCAAGTAGAAAAAATT---GGCAC----TTGCTAAAA---T-TTGCAAGTGGAAAAAAAAGTTAAATTTGATCCCTG
gi|58703 : AAATATTAG-CAC----TGGCTAAAAAAAT----CCAGTGGATAAAAAAGTTAAATTATACCCCTG
gi|58704 : aaatgcgagttgaAGGC-T----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Alignments
lowQualScore : 11 222 2222
lowQualScore : 2 1 4 55 1 22 3 1 5555555 3333 3 3 33 5 1 9 7 888 6 2222 333 0 1 6666666 333 1 44444 1 222 1 3333 222 1 3
lowQualScore : . . . .. . .. . . ....... .... . . .. . . . . ... . .... ... . . ....... ... . ..... . ... . .... ... . .
lowQualScore : 2 0 9 22 8 55 4 0 9999999 7777 5 5 22 2 7 5 6 444 2 0000 333 6 9 2222222 333 8 55555 7 888 6 3333 777 5 1
consensus : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Reference ( family-636 ) : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58674 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTAGT------AAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAACTTTAGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCCTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58675 : TTGGCTAGATCTAGCT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTTTGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATACATAATAACCTTGATACCATGGTCTAT-AAATAAAAAAAAAGCAGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTTGGGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58676 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGACTTTGAAACAC-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AATTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAATTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58677 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATCAA-TAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTTCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58678 : TTGGCTAGATCTAGAT-CATATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTAAAAAGTGTTTATTAATGATAAA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC-A----AGACAAATTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-CTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATATCCTTGATACCATTGTTTAT-GAATAAA-AA-A---AGCTAATAATGCATATAAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACA-TTAAGACT-AC-----AAGTT--TGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-TCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58679 : TTGGCTAGATCTA-------ATTTTAAAGCAAACGGCCATTGGCTACATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTGTTTTAGGTAGTATGATAAATAACAA----AGACAATTTTG-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTCGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACTTTAACATAT---ATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAAGGAATATTAAATAGCACACAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTA---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAAATGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58680 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGCGTGTACGTCTCAATCTCAA--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGACTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58681 : TTGGCTATATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTACGTCTC------AG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAGATAAAACGTGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACATAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58682 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACAAACGGCCATTGGCTGTATTAATTCTATAATAAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCCCTGTACACTTG-TTATT--GTTAAATCCATTATTCATAATTTTGTTTAGTTGAAAGTGTTTATTTATGAAATA-------T---TGTAAGCATTTATTTATAGTAGTATATTAATTAACAT----------TTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACATATATAATAAC--TGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGAACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-TGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAG----TG--------------GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58683 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACAGCCATTGGCTATATTAAATCTATATATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATATACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGTTTC---TTTT--TTT---------TGGTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAGTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAGAT-ACA---AGCTAATATTGCATATTAAATAACACATGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTGGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGGGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58684 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCATTATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGATCTCAG--TCTCTGTACAAATG-TTATT--GTTGAATCTATGATTCATATTT--GTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTAAGGTAGTATAATAAGTAACTA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGAACTGCTATGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTTTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAATACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTT-----------------------------GGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAG---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58685 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACCAA-----A--GGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTAG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATAGTAGTATAATAAATTACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCT-TTAAATAGA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTCAAACAA-TTAATTTTGGCTTTA-------TTT---AGACATTTATG--T-GCATGTGAAGTTTCAGTT-TAATTGGCCTGG-----T-GGTTTC
gi|58686 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTTGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAATAAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTTAATAACATGCATACTTTG
gi|58687 : TTGGCTATATCTTGAT-CTAATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGGTCTC----------TACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGTGTTTATTTACGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-GTT
gi|58688 : TTGGCTAGATCTTGAT-GTAATTTTAAAATGAACG-CCATTGGCTATATTGATTCTATAAAAAGAAATGTGTGTATGTCTC------AG--TCTCTGTTCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGCGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTCTT-TAA-TA---CTGCTTTG-AAAt
gi|58689 : GCTAGATCTAGAT-C-TATTTTAAAACGAAC
gi|58689 : CTAGATCTATTTTA-AAACGAACATGTGTGTATGTCTCAATCTCGG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTACTATAATAAATAACAT----AGACAATTTTA-T-T---------TAT-T----------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTAAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATGTTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGCTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAATTTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC-AAAAAGTTAAATTCTAGCCATGatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcacttgccaaaattgccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58690 : gctagatCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAAGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACAATTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCGTTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTGGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCGTAACATATATATTAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AACTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTAGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAATTAAATTCTAGCCCTG
gi|58691 : CTACATACTTATTTTAAAACAAATGGCCATTGACTATATTAATTCTATAA-TAGAAATGTGTATATGTCTCACTCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GATGAATCCGTGACCGATATTTTTGTTTAGTTAAA-GTGTTCATTTATGATGTAACATAAATCATTATATGCATTTATTAATGGTAGTATAA------ATAA----AGACAATTTTA-T-TTTTG-AAAATAT-TTTGTTCTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACCTATAT---------GATACAATTGTCTATAAAATAACTA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACACAGGTTCTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTC-------ATT---AGTCATTTATGACT-AC-----AAGTTTCTGGGAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GACTTCAAATTTGGCCTGTTGAAA---TT-TTAGGCACTGAATGGCCAAAA---T-T-GCAAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAACCATG
gi|58692 : ATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGATATGTGTGTATGTCTTAATCTCAG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTAATTCCATGATTTACATTTTTGTTTAGTCCAAAGTGTTTATTTATAATATA-------TTATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACTA----AGACAATTTTA-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACTTATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACC---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTG
gi|58693 : TTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58694 : TTAATACTATAA-T-GAAATGGAAGCGAG----AA-CTCAA--TATC---ACACTGGGCTATAAAGTTGA--CAATGATTCGTATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT------TTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCGTAATATATATAATAACCTTGATAACGTTGTCTATAAAAAAAAATACA---CGCTAATAATACATATTAAATAACACACGGGCTTTGCAACAA-TTAATTTTGGGTTTG-------TTT---AGACATTTATGA----------------CTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCATAA---T-T-GCCAGTGTACAAAAAAGGTAAATTCTAGCCCTG
gi|58695 : ACTCTTG-TTATT--GTCGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGATAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT---------------------GTTTTGTAAATTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACATGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTCAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58696 : ACTGCTTTG-AAATTGAAATACTTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTAGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC
gi|58697 : GTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TATGTTTG
gi|58697 : ACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTTTGCGAAAATTGGTTTGGCGAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTCCAATTCTAGCCCTGaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaattgccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58698 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacGTATATTAAGTAACA----------AAGACAACTTTATTTC---TTTAATACTGCTTTGAAACACATTTAGGACTTCC-----AAGTTTCCGCAAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---C-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAGTTCTAGCCCTG
gi|58699 : GCTTTGAAACAA-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGTGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGTCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58700 : AGTT-GGT-----ATTTTGCGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGCAAAAA---T-TTGTGAGTGCAAAAAAAAGGTAATTTCTAGCCCTG
gi|58701 : AGTT-GAT-----ATTTTGTGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGC-AAAA---TGT-ATGAGTGCA-AAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58702 : TTCAAATTCAGCAAGTAGAAAAAATT----GGCAC----TTGCTAAAA---T-TTGCAAGTGGAAAAAAAAGTTAAATTTGATCCCTG
gi|58703 : AAAT---GCGAGTTGAAA---ATATTAG-CAC----TGGCTAAAAAAAT----CCAGTGGATAAAAAAGTTAAATTATACCCCTG
gi|58704 : AGGC-T----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Alignments
lowQualScore : 11 222 2222
lowQualScore : 2 1 4 55 1 22 3 1 5555555 3333 3 3 33 5 1 9 7 888 6 2222 333 0 1 6666666 333 1 44444 1 222 1 3333 222 1 3
lowQualScore : . . . .. . .. . . ....... .... . . .. . . . . ... . .... ... . . ....... ... . ..... . ... . .... ... . .
lowQualScore : 2 0 9 22 8 55 4 0 9999999 7777 5 5 22 2 7 5 6 444 2 0000 333 6 9 2222222 333 8 55555 7 888 6 3333 777 5 1
consensus : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Reference ( family-636 ) : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58674 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTAGT------AAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAACTTTAGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCCTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58675 : TTGGCTAGATCTAGCT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTTTGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATACATAATAACCTTGATACCATGGTCTAT-AAATAAAAAAAAAGCAGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTTGGGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58676 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGACTTTGAAACAC-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AATTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAATTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58677 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATCAA-TAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTTCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58678 : TTGGCTAGATCTAGAT-CATATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTAAAAAGTGTTTATTAATGATAAA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC-A----AGACAAATTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-CTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATATCCTTGATACCATTGTTTAT-GAATAAA-AA-A---AGCTAATAATGCATATAAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACA-TTAAGACT-AC-----AAGTT--TGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-TCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58679 : TTGGCTAGATCTA-------ATTTTAAAGCAAACGGCCATTGGCTACATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTGTTTTAGGTAGTATGATAAATAACAA----AGACAATTTTG-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTCGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACTTTAACATAT---ATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAAGGAATATTAAATAGCACACAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTA---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAAATGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58680 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGCGTGTACGTCTCAATCTCAA--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGACTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58681 : TTGGCTATATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTACGTCTC------AG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAGATAAAACGTGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACATAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58682 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACAAACGGCCATTGGCTGTATTAATTCTATAATAAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCCCTGTACACTTG-TTATT--GTTAAATCCATTATTCATAATTTTGTTTAGTTGAAAGTGTTTATTTATGAAATA-------T---TGTAAGCATTTATTTATAGTAGTATATTAATTAACAT----------TTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACATATATAATAAC--TGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGAACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-TGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAG----TG--------------GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58683 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACAGCCATTGGCTATATTAAATCTATATATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATATACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGTTTC---TTTT--TTT---------TGGTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAGTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAGAT-ACA---AGCTAATATTGCATATTAAATAACACATGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTGGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGGGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58684 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCATTATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGATCTCAG--TCTCTGTACAAATG-TTATT--GTTGAATCTATGATTCATATTT--GTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTAAGGTAGTATAATAAGTAACTA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGAACTGCTATGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTTTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAATACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTT-----------------------------GGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAG---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58685 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACCAA-----A--GGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTAG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATAGTAGTATAATAAATTACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCT-TTAAATAGA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTCAAACAA-TTAATTTTGGCTTTA-------TTT---AGACATTTATG--T-GCATGTGAAGTTTCAGTT-TAATTGGCCTGG-----T-GGTTTC
gi|58686 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTTGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAATAAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTTAATAACATGCATACTTTG
gi|58687 : TTGGCTATATCTTGAT-CTAATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGGTCTC----------TACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGTGTTTATTTACGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-GTT
gi|58688 : TTGGCTAGATCTTGAT-GTAATTTTAAAATGAACG-CCATTGGCTATATTGATTCTATAAAAAGAAATGTGTGTATGTCTC------AG--TCTCTGTTCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGCGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTCTT-TAA-TA---CTGCTTTG-AAAt
gi|58689 : GCTAGATCTAGAT-C-TATTTTAAAACGAAC
gi|58689 : CTAGATCTATTTTA-AAACGAACATGTGTGTATGTCTCAATCTCGG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTACTATAATAAATAACAT----AGACAATTTTA-T-T---------TAT-T----------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTAAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATGTTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGCTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAATTTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC-AAAAAGTTAAATTCTAGCCATGatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcacttgccaaaattgccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58690 : gctagatCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAAGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACAATTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCGTTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTGGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCGTAACATATATATTAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AACTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTAGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAATTAAATTCTAGCCCTG
gi|58691 : CTACATACTTATTTTAAAACAAATGGCCATTGACTATATTAATTCTATAA-TAGAAATGTGTATATGTCTCACTCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GATGAATCCGTGACCGATATTTTTGTTTAGTTAAA-GTGTTCATTTATGATGTAACATAAATCATTATATGCATTTATTAATGGTAGTATAA------ATAA----AGACAATTTTA-T-TTTTG-AAAATAT-TTTGTTCTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACCTATAT---------GATACAATTGTCTATAAAATAACTA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACACAGGTTCTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTC-------ATT---AGTCATTTATGACT-AC-----AAGTTTCTGGGAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GACTTCAAATTTGGCCTGTTGAAA---TT-TTAGGCACTGAATGGCCAAAA---T-T-GCAAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAACCATG
gi|58692 : ATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGATATGTGTGTATGTCTTAATCTCAG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTAATTCCATGATTTACATTTTTGTTTAGTCCAAAGTGTTTATTTATAATATA-------TTATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACTA----AGACAATTTTA-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACTTATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACC---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTG
gi|58693 : TTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58694 : TTAATACTATAA-T-GAAATGGAAGCGAG----AA-CTCAA--TATC---ACACTGGGCTATAAAGTTGA--CAATGATTCGTATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT------TTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCGTAATATATATAATAACCTTGATAACGTTGTCTATAAAAAAAAATACA---CGCTAATAATACATATTAAATAACACACGGGCTTTGCAACAA-TTAATTTTGGGTTTG-------TTT---AGACATTTATGA----------------CTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCATAA---T-T-GCCAGTGTACAAAAAAGGTAAATTCTAGCCCTG
gi|58695 : ACTCTTG-TTATT--GTCGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGATAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT---------------------GTTTTGTAAATTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACATGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTCAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58696 : ACTGCTTTG-AAATTGAAATACTTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTAGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC
gi|58697 : GTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TATGTTTG
gi|58697 : ACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTTTGCGAAAATTGGTTTGGCGAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTCCAATTCTAGCCCTGaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaattgccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58698 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacGTATATTAAGTAACA----------AAGACAACTTTATTTC---TTTAATACTGCTTTGAAACACATTTAGGACTTCC-----AAGTTTCCGCAAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---C-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAGTTCTAGCCCTG
gi|58699 : GCTTTGAAACAA-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGTGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGTCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58700 : AGTT-GGT-----ATTTTGCGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGCAAAAA---T-TTGTGAGTGCAAAAAAAAGGTAATTTCTAGCCCTG
gi|58701 : AGTT-GAT-----ATTTTGTGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGC-AAAA---TGT-ATGAGTGCA-AAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58702 : TTCAAATTCAGCAAGTAGAAAAAATT----GGCAC----TTGCTAAAA---T-TTGCAAGTGGAAAAAAAAGTTAAATTTGATCCCTG
gi|58703 : AAAT---GCGAGTTGAAA---ATATTAG-CAC----TGGCTAAAAAAAT----CCAGTGGATAAAAAAGTTAAATTATACCCCTG
gi|58704 : AGGC-T----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
blockSeqs : A T A CC G AA G A ACATAAA . T A TA A G A A AAA A AAAA AGC C ATACTGC GAA T ATGTG G AAA A TGAA AAA G T
blockSeqs : . T A . . . G A . . T A AA A . A A AAA A AAAA . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . T A . . . G A . . . . AA A . A A AAA A AAAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T A . . . G A . . . . TA . . A A AAA A ATAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . . T A . . . . TA . . A . AAA A AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . . T A . . . . A . . . . AAA A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T C . . . T A . . . . A . . . . AAA A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T C . . . T A . . . . A . . . . AAA A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . . G A . . . . A . . . . AAA A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . . G A . . . . A . . . . . T TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T A . . . T A . . . . A . . . . . A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T . . . T A . . . . T . . . . . A AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . . T A . . . . A . . . . . A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T C . . . G A . . . . A . . . . . A AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T A . . . T A . . . . A . . . . . A TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T T . . . T A . . . . A . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . G . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . T . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . TAC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ** **** A*
originalCons : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
finalCons : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTA-AA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Alignments
lowQualScore : 11 222 2222
lowQualScore : 2 1 4 55 1 22 3 1 5555555 3333 3 3 33 5 1 9 7 888 6 2222 333 0 1 6666666 333 1 44444 1 222 1 3333 222 1 3
lowQualScore : . . . .. . .. . . ....... .... . . .. . . . . ... . .... ... . . ....... ... . ..... . ... . .... ... . .
lowQualScore : 2 0 9 22 8 55 4 0 9999999 7777 5 5 22 2 7 5 6 444 2 0000 333 6 9 2222222 333 8 55555 7 888 6 3333 777 5 1
consensus : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
Reference ( family-636 ) : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTNGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATAACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58674 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTAGT------AAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAACTTTAGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCCTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58675 : TTGGCTAGATCTAGCT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTTTGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATACATAATAACCTTGATACCATGGTCTAT-AAATAAAAAAAAAGCAGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTTGGGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58676 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGACTTTGAAACAC-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AATTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAATTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58677 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATCAA-TAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTTCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58678 : TTGGCTAGATCTAGAT-CATATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTAAAAAGTGTTTATTAATGATAAA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC-A----AGACAAATTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-CTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATATCCTTGATACCATTGTTTAT-GAATAAA-AA-A---AGCTAATAATGCATATAAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACA-TTAAGACT-AC-----AAGTT--TGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-TCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58679 : TTGGCTAGATCTA-------ATTTTAAAGCAAACGGCCATTGGCTACATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTGTTTTAGGTAGTATGATAAATAACAA----AGACAATTTTG-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTCGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACTTTAACATAT---ATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAAGGAATATTAAATAGCACACAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTA---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAAATGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58680 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGCGTGTACGTCTCAATCTCAA--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGACTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58681 : TTGGCTATATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGACCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTACGTCTC------AG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCACGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAATGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAAC------AGACAATTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACTTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAGATAAAACGTGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACATAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58682 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACAAACGGCCATTGGCTGTATTAATTCTATAATAAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCCCTGTACACTTG-TTATT--GTTAAATCCATTATTCATAATTTTGTTTAGTTGAAAGTGTTTATTTATGAAATA-------T---TGTAAGCATTTATTTATAGTAGTATATTAATTAACAT----------TTTTA-T-TTTTT-AAAATAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACATATATAATAAC--TGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGAACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-TGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAG----TG--------------GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58683 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAACAGCCATTGGCTATATTAAATCTATATATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTATATACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGTTTC---TTTT--TTT---------TGGTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAGTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAGAT-ACA---AGCTAATATTGCATATTAAATAACACATGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTGGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGGGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58684 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACGAACGGCCATTGGCATTATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGATCTCAG--TCTCTGTACAAATG-TTATT--GTTGAATCTATGATTCATATTT--GTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTAAGGTAGTATAATAAGTAACTA----AGACAACTTTA-T-TTTTT--------------------AAGAACTGCTATGAAA-TTGAAATACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTTTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATATTAAATAATACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTT-----------------------------GGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAG---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58685 : TTGGCTAGATCTAGAT-CTAATTTTAAAACCAA-----A--GGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAG--TCTCTGTACACTAG-TTATT--GTTGAATCAATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATAGTAGTATAATAAATTACAA----AGACAATTTTATT-TTTTT-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCT-TTAAATAGA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTCAAACAA-TTAATTTTGGCTTTA-------TTT---AGACATTTATG--T-GCATGTGAAGTTTCAGTT-TAATTGGCCTGG-----T-GGTTTC
gi|58686 : TTGGCTAGATCAAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTC-CAATCTCGG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTTGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTTGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTAAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTT---TACCTTTACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAATAAAAAAAAA---AGCTAATAATGCATATTTAATAACATGCATACTTTG
gi|58687 : TTGGCTATATCTTGAT-CTAATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCGGTCTC----------TACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGTGTTTATTTACGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TAT-GTT
gi|58688 : TTGGCTAGATCTTGAT-GTAATTTTAAAATGAACG-CCATTGGCTATATTGATTCTATAAAAAGAAATGTGTGTATGTCTC------AG--TCTCTGTTCACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTTGAAGCGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATATTAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTCTT-TAA-TA---CTGCTTTG-AAAt
gi|58689 : GCTAGATCTAGAT-C-TATTTTAAAACGAAC
gi|58689 : CTAGATCTATTTTA-AAACGAACATGTGTGTATGTCTCAATCTCGG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTACTATAATAAATAACAT----AGACAATTTTA-T-T---------TAT-T----------AAGTACTGCTTTGAAA-TTGAAATACCTAAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACA---AGCTAATAATGCATGTTAAATAACACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGCTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAATTTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC-AAAAAGTTAAATTCTAGCCATGatgtgtgtatgtctcaatctcggtctctgtacacttgttattgttgaatccatgattcatatttttgtttagttaaaagtgtttatttatgatatatcattgtatgcatttatttatggtactataataaataacatagacaattttatttattaagtactgctttgaaattgaaatacctaaacatatataataaccttgataccattgtctataaaataaatacaagctaataatgcatgttaaataacacgcgggctttgaaacaattaattttgggcttatttagacatttaggactacaagtttctgcgaaatttggtttggctagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcacttgccaaaattgccagtgcacaaaaagttaaattctagccatg
gi|58690 : gctagatCTAGATCTAGAT-CTTATTTTAAAACGAAAAGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTCAGCCTCTCTGTACAATTG-TTATT--GTTGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCGTTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTGGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCGTAACATATATATTAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AACTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTAGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAATTAAATTCTAGCCCTG
gi|58691 : CTACATACTTATTTTAAAACAAATGGCCATTGACTATATTAATTCTATAA-TAGAAATGTGTATATGTCTCACTCTCAG--TCTCTGTACACTTG-TTATT--GATGAATCCGTGACCGATATTTTTGTTTAGTTAAA-GTGTTCATTTATGATGTAACATAAATCATTATATGCATTTATTAATGGTAGTATAA------ATAA----AGACAATTTTA-T-TTTTG-AAAATAT-TTTGTTCTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCTTAACCTATAT---------GATACAATTGTCTATAAAATAACTA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACACAGGTTCTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTC-------ATT---AGTCATTTATGACT-AC-----AAGTTTCTGGGAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GACTTCAAATTTGGCCTGTTGAAA---TT-TTAGGCACTGAATGGCCAAAA---T-T-GCAAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAACCATG
gi|58692 : ATTTTAAAACGAATGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGATATGTGTGTATGTCTTAATCTCAG--TCTCTGTGCACTTG-TTATT--GTTAATTCCATGATTTACATTTTTGTTTAGTCCAAAGTGTTTATTTATAATATA-------TTATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACTA----AGACAATTTTA-TATTTTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACTTATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAAT-ACC---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTG
gi|58693 : TTTTAAAACGAAAGGCCATTGGCTATATTAATTCTATAAATAGAAATGTGTGTATGTCTCAATCTTAG--TCTCTGTACACTTG-TTAT--------------GATTTATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTTA-T-TTTTTTAAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACACGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGCT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58694 : TTAATACTATAA-T-GAAATGGAAGCGAG----AA-CTCAA--TATC---ACACTGGGCTATAAAGTTGA--CAATGATTCGTATTTTTGTTTAGTTAAAAGTGTTTATTTATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGGTAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT------TTA-AAA-TAT-TTTGTTTTGTAAAGTACTGCTTTG-AAATTGAAATACCGTAATATATATAATAACCTTGATAACGTTGTCTATAAAAAAAAATACA---CGCTAATAATACATATTAAATAACACACGGGCTTTGCAACAA-TTAATTTTGGGTTTG-------TTT---AGACATTTATGA----------------CTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCATAA---T-T-GCCAGTGTACAAAAAAGGTAAATTCTAGCCCTG
gi|58695 : ACTCTTG-TTATT--GTCGAATCCATGATTCATATTTTGGTTTAGTTAAA-GTGTTTATTAATGATATA-------TCATTGTATGCATTTATTTATGATAGTATAATAAATAACAA----AGACAATTTT---------------------GTTTTGTAAATTACTGCTTTG-AA-TTG---TACCTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAA-TAAA-AAAA---AGCTAATAATGCATATTAAATAACATGCAGGCTTTGAAACAA-TTAATTTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTCAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58696 : ACTGCTTTG-AAATTGAAATACTTTAACATATATAATAACCTTGATACCATTGTCTATAAAATAAATA-CA---AGCTAATAATGCATATTAAATAAAACGCGGGCTTTGAAACAA-TTAATGTTGGGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGCGAAAATTAGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCAC
gi|58697 : GTATAATAAGTAACAA----AGACAACTTTA-T-TTTTT-AAA-TATGTTTG
gi|58697 : ACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTTTGCGAAAATTGGTTTGGCGAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTCCAATTCTAGCCCTGaaacacatttaggactacaagtttttgcgaaaattggtttggcgagttggtttcaaatttggccagttgaaattttaggcactggccaaaattgccagtgcacaaaaaagtccaattctagccctg
gi|58698 : gtataataagtaacaaagacaactttattttttaaatatgtttgaaacGTATATTAAGTAACA----------AAGACAACTTTATTTC---TTTAATACTGCTTTGAAACACATTTAGGACTTCC-----AAGTTTCCGCAAAAACTGGTTTGGCTAGTT-GGTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---TT-TTAGGCAC----TGGCCAAAA---C-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAGTTCTAGCCCTG
gi|58699 : GCTTTGAAACAA-TTAATTTTGTGTTTA-------TTT---AGACATTTAGGACT-AC-----AAGTTTCTGTGAAAATTGGTTTGGCTAGTT-GTTTTCAAATTTGGCCAGTTGAAA---CT-TTAGGCAC----TGGTCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCTTG
gi|58700 : AGTT-GGT-----ATTTTGCGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGCAAAAA---T-TTGTGAGTGCAAAAAAAAGGTAATTTCTAGCCCTG
gi|58701 : AGTT-GAT-----ATTTTGTGAGTTGAAA---TA-TCTTGTAC----TCGC-AAAA---TGT-ATGAGTGCA-AAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG
gi|58702 : TTCAAATTCAGCAAGTAGAAAAAATT----GGCAC----TTGCTAAAA---T-TTGCAAGTGGAAAAAAAAGTTAAATTTGATCCCTG
gi|58703 : AAAT---GCGAGTTGAAA---ATATTAG-CAC----TGGCTAAAAAAAT----CCAGTGGATAAAAAAGTTAAATTATACCCCTG
gi|58704 : AGGC-T----TTGCCAAAA---T-T-GCCAGTGCACAAAAAAGTTAAATTCTAGCCCTG