lowQualScore                  :                                                                   222222                                                              11111                                                                            5555555555555          4444444444444444444444444                                                                                                  1         2   2222222222222222222                                                                   33333333333333              1                                            1                                                       1      111                                                                                                                    44444444                                                      1                      3333             
lowQualScore                  :         5              33   5                 9999999999          111111          6       2                         33 9999         2 55555                 4       9999  6                                8  33 2     7777777777777     2    8888888888888888888888888         44         0                        1   2                          2   2           1     3   6     8   0000000000000000000              0  66666                 444  444     5       999    99999999999999   44    0    5          999                               6        555           6           3       888          5      000   44 0                        0          1                              88888 6      2   333                       99999999      7777      3                                 5   4                      6666  4          
lowQualScore                  :         .              ..   .                 ..........          ......          .       .                         .. ....         . .....                 .       ....  .                                .  .. .     .............     .    .........................         ..         .                        .   .                          .   .           .     .   .     .   ...................              .  .....                 ...  ...     .       ...    ..............   ..    .    .          ...                               .        ...           .           .       ...          .      ...   .. .                        .          .                              ..... .      .   ...                       ........      ....      .                                 .   .                      ....  .          
lowQualScore                  :         9              44   9                 7777777777          111111          7       2                         11 4444         0 77777                 3       4444  0                                1  44 5     3333333333333     5    9999999999999999999999999         22         6                        7   9                          9   9           5     1   0     7   7777777777777777777              6  77777                 777  777     0       999    22222222222222   22    5    0          333                               8        444           2           1       555          0      444   66 4                        2          8                              33333 7      1   777                       44444444      7777      1                                 4   3                      5555  8          
consensus                     : TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---N--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---N-TTGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAACCAGAGAC--G-CCCCCCGCCCC-GCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATTGGG-GGT-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GCGTCACACAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--TGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATNAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAGTT-T-A-T-TTTTTTT----AAAAAA-AGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
Reference ( gi|142203 )       : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---T-TTGAATTTAAACGTTTTTCTAAGAT----CAATAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTATAA--A-AAAAACCAGAGACGAGACCCCCCGCCCC-GCCCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAAATTTGTTGGGTGGT-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTTAACACAAA--TTTG--GCATCACACAT-TTT--TTTTAAAATAAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACTAATTCAAA---TTTTATAAACAAATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCCGTTTTC---AAA--TGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAGTT-TTG-TTTTTTTTT----AAAAAA-AGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATAGTAATCTGTTGTAACAACATAAT-TAATAAGATATTATAA
gi|142204                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAAACAGAGAC-----CCCCCGCCCC-GCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGTAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCAACTAGCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATTGTGGGGT-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GCATCACACATATTT--TTTTAAAATTAGCAATTTAA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGTGGTTTTC---AAA--TGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAGTT-TTT-TTTTTTTTT----TTTAAA-AGATCTTTTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTTTTGTAACAAC-------AATAAGATATTATAA
gi|142206                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTAACATCAT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA--GAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATAACAGCA-T---T-TTGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAA--CAGAGAC-----CCCCCGCCCC-GCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTTAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTAAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAGCTTGTAATTTTATTGGG-GGT-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAG--TTTG--GCATCACACAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGTTATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTATTC---AAA--TGTATGTATTTTTCAATTATACGATGACTTTATTAATTAAATATATTGGTAATGATTCTTTAAGCAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAGTT-----TATTTTTTTAAAAAAAAAA-AGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAAAATAAT-CAATAAGATATTATAA
gi|142205                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACCTTGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATAAATAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAAC-----A-GAGACCCCCCGCCCC-ACGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAATCAATGGAATAAGCCAGCGTTT-TTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGGGGGGT-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GAATCACACTT-TTT--TTTTTTAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAAATATTCAGATAAATTGATAGCAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAGTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--TGTATGTATTACTCAAATATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTTT-TAACTTACCTACAGTTTTAAGTTGTTGTTTTTTTTTT----AAAAAA-AGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAAT-CAATAAGATATTATAA
gi|142208                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGTACAA--A-AAAAAC-----A-GAGACCCCCCGCCCC-GCGCC-------------------TGTCTGTTTCTTTCAAATGTT-----------TAA---AGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GTACGCAAAACTTGTAATTTTATTGGGGGGT-------------------AATAATATAATTTGTTG-----GGATGTAGTTGAATAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GCATCATACAT-TTC--TTTTAAACTA-GCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAA-CAGATAATAGAATG-GGATGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--TGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACCGTTTTAAGTT-TTT-TTTTTTTTT-----AAAAA-AGATCCTCTCGTATATCGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAAT-CAATTAGATAGTATA
gi|142207                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAAC-----A-GAGACCCCCCGCCCC-GCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATTGAATAAGCCAGCGTTTTTTT-AT---------TACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGGG-GGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAATATAATGTGTTA-----AGATGTGGTTGAGTTAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GCATCACACAT-TTTTTTTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--TGTATGCATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG-----------TTTTT----AAAAAA-AGATCTTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAAT-CAATAAGATATTATAA
gi|142209                     : TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCACTGATATCGTTGTCTCTGGTGTAATTTACT---C--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATACCAAATGTTTATAAA--T----ATTACA-CT-T---TATTGAATTTAAACGTTTTCTTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAGTCAT-GTACAACAACAAAAATCAGAG-------CCCTTTCCCC-CCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAC-----------ATTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTT------TTATTGGG-GGT-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTATAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG-----TTACT--T-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTAA---TATAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAAATCATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--ATTGTGT-TTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATCGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATT----T-TAACTTACGTGCAGTTTTAAGTT-TAA----TTTTTC----AAAACT-AGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-GTAA-AATCTGTTGTAACAACATAATCTAAT--GATATTATAA
gi|142210                     : TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACT---C--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAATCGATTTCAAATGTTTATAAA--C----ATTAAACTA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--C-AAAAA----AAACAAGAGCCCCCTCCCCTG--AC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCTTG-CCC-GGAGGCAAAAC------ATTTATTGAG-GAT-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTAAGTAATTAATA---TATTTCAACACAAG--TTTG-----TTA-A-----TT--TTTTAAAGTTAGCTATTTT----TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---GTTTATAAACAGGTAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAA--ACTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA------------TTTTC----AAAAAT-AGATCCCCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-ATATTAATCTGTTGTAAAAATATAATCT--TATGATATTATA
gi|142211                     : TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACT---C--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACTGATTACAAATGTTTATAAA--T----ATTAAACAA-T---A-TTGAATTTATACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATTTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAACAAGAG------CCCCCTCCCCT-GAC---------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC------ATTTATTGAG-GAT-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTAAAGTAAT---TAATATATTTCAACACAAG--ATTG-----TTA---AT-TTT--TT--AAAGTTAGCTATTTTT---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---GTCTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTA--TATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA-----------TTTTTT----AGAAAT-AGATCCCGTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATCAATCTGTTGTAACAACATAATCT--TATGATATTATAA
gi|142212                     : TGTGAATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGCTATCGT----------GTAATTAACTTTTA--AA-ACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTTAAAAA--T----ATTACTGAA-T---T-TTTATTTTTAACGTTTTCCTATGAT----CAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAA--CAGA-ACA----CCCCCG--------CC-------------------TGTCTGTGT--TTCAAGTCTCAAACAATGCGATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAACTAAATTACCCCCTACCCCTGTCCC-GGAGGCAAAAATTGTAATTTTATTGGGTGTT--------------------ATAATATAATCTGCTAGAATGGAATGTAATTGAATAAT---TA---TATTTTAACACAAGTTTTTT--GT-TCA-GC-----T--TTTTAAAATTAGCTGTTTGA---TTTAACACTGATATTCAGATAAATTGATAATGAATTCAAACTTTTTTGTAAACAGATAATAAAGCGAGGAAAAAG--AAATATTAGC
gi|142213                     : TGTGTAGTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---C--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACATTGCCCTAAGGT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTTATAATCCTTGTACAA--C-AAGAgaataaatatat
gi|142215                     : TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACT---A--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATACAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-
gi|142214                     : TGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--CAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTATTTAACT---TTTAATACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTAATAAA--T----ATTACTGAT-T---T-TTTTATTTAAACATTTTCCAAAGAT----CAGTAAAATAGTATTCAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAAACAGAGca
gi|142216                     : TATGCATGGTTGTGTTCGTGTTA--TAGTCATCTCTTTGATATCGT----------GTATTCAACT---T--AATAGAAGTTAGTTATAA-TAGACCATTATCAAATG--TAAGAACGT----ATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTATTCCAAAGGT----CAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AA
gi|142218                     :  GTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTA--AA-ACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAA-T---T-TTTAATTTTAACGTTTTCCTAAGAT----CGGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAACCCAGAG
gi|142217                     :  GTGCATGTTTATTTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATGTCGT----------GTAATTAACTTTTA--AA-ACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCATTATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAATT---T-TTAAATTT-AACGTTATCCTAAGAT----CAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTA-AA--A-AAAAACCAGAG
gi|142219                     :                   TTTTAAATAGTCATTGCATAGATATCGT----------GTAATTAACT---TTTAATACAAGTTAGTTAAGA-AAGACCAGTATTAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-T---T-ATGAATTTcaaacaatacgataagccagtgtcttttatgaacttatttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtaattttattgggggttataacataatctgctagaatgtaattgagtaattatatttcaa
gi|142221                     :                                               ----------GTAATCCGTT---C--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCC-CCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATTCGG-GGT-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--TTGTT-C---T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142220                     :                                               ----------GTAATCCGTT---C--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-T---A-TTGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGTACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCC-CCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATTCGG-GGT-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--TTGTT-C---T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142223                     :                                                                                                                             TTA-AGCA-TATGC-TTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142222                     :                                                                                                                             TTA-AGCA-TATGC-TTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142224                     :                                                                                                                                                                                                                                    CCCCCCCCCCC-TTACC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAGTCTCAAACAATGGAATAAGCCAATGTTTATTT-ATTACCTTAATTACCGACTATCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC---TAATTTTATTGGG-GGT-------------------AATAATATAATTT----------------GTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAG--TTTG--TT-TCTCA----GTT--TTTTAAAATTATCTATTTGA---TTTAGCAAAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---TTTCATCAACAGATGATAGAACG-GGAGGAC---AAACGTAAGCGGTTTTCAA-AAA--T-TGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGTTTTATTAATTAAATGTATT
gi|142225                     :                                                                                                                                                                                                                                                   CC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCATACAATGGAATAAGCCAGCGTTTTTTTCATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGTGAAA-TTGTAATTTTATTGGGAGGT-------------------AATAATATAATTTGTGA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTG--GCA
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAAACAATACGATAAGCCAGTGTCT-TTT-ATGAACTTATTTACCCCCTACCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTATTGGG-GGT-------------------TATAACATAATCTGCTA-----GAATGTAATTGAGTAAT---TA---TATTTCAA
gi|142226                     :                                                                                                                                                                                         gtgcatgtttattttcgttttttagtcatcgcatagatgtcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccattatcaaatgtttataaatattacagaatttttaaatttaacgttatcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccttgtaaaaaaaaaccagagGGAGGT-------------------CATAATATAATCTGCTA-----GAATGTAGTTGGGTAAT---TA---TATTTCAACACAAG--TTTGTTGT-TCA-GC-----T--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATCGATATTCAGATAAATTGATATTAAATTAAAA---TTTTATGAACAGATAATAAAGCG-GGAAAAAAAGAAATATTAGCGGTTTTCTAAAAA--TTTGTGTATTTCTTAAATATGCGATTGCTTTATTAATCAAATGTGTTGGTAATAATAATTTAAACAAC-----T-TA
gi|142228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAAC
gi|142227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACa
gi|142230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAA--TGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAGTT-TAA----TTTTTC----AAAAAA-AGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAAa
gi|142229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAA--TGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAGTT-TAA----TTTTTC----AAAAAA-AGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142231                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTATGCCATTGCTTTATTAATTAAATGTGTTGGTAATAATTGTTTAAACAACGTATAT-TCATATGTTCATGTAATTTGTGTA
gi|142232                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTT-TATGTTATGTTCAGTTTTAAGTT-TAA-TTTTTC-------AAAAAATAGATCCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATTAATCTGTTGTGACAACATAATCT--TAAGATATTATAA
gi|142233                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-AGTTCTACT-GTATATCAAAGTGGTATGCGAAAAATATAAATATGTTGTAACAATATAAT-T-GTATGATATTATAA
gi|142234                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-AGTTCTTCT-GTATATGAAAGTGGTAGGCGAAAGATATTAATCTATTGTAACAATATATC-T--TATGATATTATAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                           111                                                                                                                                                 11    3333333          444444444444444    1111                                                                                                                   1111111111111111111                                                                 1111  22222222                                                                                                                                                                                                                                                2222222222                                                                                 222             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 1       1      33   1                 9999999999          555                  2                         22 8888         1 1 777                        8888                                  444    33 2     11    6666666     3    333333333333333    2222         33                                  1   2                          2   2           0            2 2  5  2 9999999999999999999                 66666                 444  444                  2222  55555555   33                    888                                        555                       2       777                 999    1                                   1                              77777 6      1   0 3                     3  9999999999     6666   66666                                    4                           666  2          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 .       .      ..   .                 ..........          ...                  .                         .. ....         . . ...                        ....                                  ...    .. .     ..    .......     .    ...............    ....         ..                                  .   .                          .   .           .            . .  .  . ...................                 .....                 ...  ...                  ....  ........   ..                    ...                                        ...                       .       ...                 ...    .                                   .                              ..... .      .   . .                     .  ..........     ....   .....                                    .                           ...  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 0       0      22   0                 2222222222          555                  1                         99 9999         9 0 000                        9999                                  111    22 4     11    9999999     5    333333333333333    1111         99                                  0   7                          7   7           8            5 5  0  5 4444444444444444444                 22222                 444  444                  1111  99999999   99                    888                                        000                       9       999                 666    5                                   0                              77777 2      2   2 1                     3  2222222222     2222   22222                                    3                           333  0          
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
Reference ( family-627 )      :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TNT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGACG---CCCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATNAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--ATTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
gi|142203                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTTCTAAGAT----CAATAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ATAA--A-AAAAACCAGAGACGAGACCCCCCGCCCC--------------GCCCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAAATTTGTT-G-GGTGG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTTAACACAAATTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATAAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACTAATTCAAA---TTTTATAAACAAATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCCGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----TTGTTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATAGTAATCTGTTGTAACAACATAAT-TAATAAGATATTATAA
gi|142204                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAGAC-----CCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGTAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCAACTAGCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-GTGG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CATATTT--TTTTAAAATTAGCAATTTAA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGTGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--TTTTTTTT---T---TTTTTAAAAGATCTTTTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTTTTGTAACAAC-------AATAAGATATTATAA
gi|142205                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACCTTGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATAAATAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC-----CCCCCGCCCC--------------ACGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAATCAATGGAATAAGCCAGCGTTT-TTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGG-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGAA-TCACA-CTT-TTT--TTTTTTAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAAATATTCAGATAAATTGATAGCAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAGTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTACTCAAATATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTTT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG-TTGTTGT--TTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142206                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTAACATCAT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA--GAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATAACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGAGAC-----CCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTT--TTTAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTAAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAGCTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGTTATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTATTC---AAATGTATGTATTTTTCAATTATACGATGACTTTATTAATTAAATATATTGGTAATGATTCTTTAAGCAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--ATTTTTTTAAAAAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAAAATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142207                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC-----CCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATTGAATAAGCCAGCGTTTTTTT-AT---------TACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAATATAATGTGTTA-----AGATGTGGTTGAGTTAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTTTTTTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGCATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG--------------TTTT---TAAA-----AAAAGATCTTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142208                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC-----CCCCCGCCCC--------------GCGCC----TGTCTGTTTCTTTCAAATGTT-----------TAA---AGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GTACGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GGGT-------------------AATAATATAATTTGTTG-----GGATGTAGTTGAATAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCATA-CAT-TTC--TTTTAAA-CTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAA-CAGATAATAGAATG-GGATGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACCGTTTTAAGTTT----T--TTTTTTTT---TTAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATCGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATC-AATTAGATAGTATA
gi|142209                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCACTGATATCGTTGTCTCTGGTGTAATTTACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATACCAAATGTTTATAAA--T----ATTACACTT-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAGTCAT-GT---ACAACAACAAAAATCAGAG-------CCCTTTCCCC--------------CCGCC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAC-----------ATTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTT------TTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTATAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTG----TTACT---T-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTAA---TATAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAAATCATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAATTGTGT-TTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATCGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATT----T-TAACTTACGTGCAGTTTTAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----ACTAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-GTA-AAATCTGTTGTAACAACATAATCTAAT--GATATTATAA
gi|142210                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAATCGATTTCAAATGTTTATAAA--C----ATTAAACTA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATCTAATAATCCTTGTACAACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC---------------TGAC----TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCTTG-CCC-GGAGGCAAAAC----A--TTTATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTAAGTAATTAATA---TATTTCAACACAAGTTT---G-TTA-A------TT--TTTTAAAGTTAGCTATTTT----TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---GTTTATAAACAGGTAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA---------------TTTT---CAAA-----AATAGATCCCCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-ATATTAATCTGTTGTAAAAATATAATCT--TATGATATTATA
gi|142211                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACTGATTACAAATGTTTATAAA--T----ATTAAACAA-TAT---TGAATTTATACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATTTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC---------------TGAC----TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC-----ATTT-ATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTAAAGTAAT---TAATATATTTCAACACAAGATTG----TTA----AT-TTT--TT--AAAGTTAGCTATTTTT---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---GTCTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTATATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA--------------TTTTT---TAGA-----AATAGATCCCGTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATCAATCTGTTGTAACAACATAATCT--TATGATATTATAA
gi|142212                     :                                                                                                                                                                                         TGTGAATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGCTATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTTAAAAA--T----ATTACTGAA-TTT---TTATTTTTAACGTTTTCCTATGAT----CAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGA-ACA---CCCC----------------------CGCC----TGTCTGTGT--TTCAAGTCTCAAACAATGCGATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAACTAAATTACCCCCTACCCCTGTCCC-GGAGGCAAAAATTGTAATTTTATT-G-GG-TG-T-------------------TATAATATAATCTGCTAGAATGGAATGTAATTGAATAAT---TA---TATTTTAACACAAGTTTTTTGTTCA-G-C-----T--TTTTAAAATTAGCTGTTTGA---TTTAACACTGATATTCAGATAAATTGATAATGAATTCAAACTTTTTTGTAAACAGATAATAAAGCGAGGAAAAAG--AAATATTAGCG
gi|142213                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTAGTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACATTGCCCTAAGGT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTTATAATCCTTGT---ACAA--C-AAGAaataaatatat
gi|142214                     :                                                                                                                                                                                         TGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--CAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTATTTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTAATAAA--T----ATTACTGAT-TTT---TTTATTTAAACATTTTCCAAAGAT----CAGTAAAATAGTATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAG
gi|142215                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATACAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-
gi|142216                     :                                                                                                                                                                                         TATGCATGGTTGTGTTCGTGTTA--TAGTCATCTCTTTGATATCGT----------GTATTCAACTT--AATAGAAGTTAGTTATAA-TAGACCATTATCAAATGT--AAGAACGT----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTATTCCAAAGGT----CAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAca
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                          GTGCATGTTTATTTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATGTCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCATTATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAATTTT---TAAATTT-AACGTTATCCTAAGAT----CAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---A-AA--A-AAAAACCAGAG
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAAACAATACGATAAGCCAGTGTCT-TTT-ATGAACTTATTTACCCCCTACCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------TATAACATAATCTGCTA-----GAATGTAATTGAGTAAT---TA---TATTTCAAcaaacaatacgataagccagtgtcttttatgaacttatttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtaattttattgggggttataacataatctgctagaatgtaattgagtaattatatttcaa
gi|142218                     : gtgcatgtttattttcgttttttagtcatcgcatagatgtcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccattatcaaatgtttataaatattacagaatttttaaatttaacgttatcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccttgtaaaaaaaaaccagagGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAA-TTT---TTAATTTTAACGTTTTCCTAAGAT----CGGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAACCCAGAG
gi|142219                     :                                                                                                                                                                                                           TTTTAAATAGTCATTGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-AAGACCAGTATTAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTA---TGAATTT
gi|142220                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCCC---CCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142221                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCCC---CCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---CCCCCCCCCCC--------------TTACC----TGTCTGTTT--TTCAAGTCTCAAACAATGGAATAAGCCAATGTTTATTT-ATTACCTTAATTACCGACTATCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC---TAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTT----------------GTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTT-GTT-TCTCA-----GTT--TTTTAAAATTATCTATTTGA---TTTAGCAAAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---TTTCATCAACAGATGATAGAACG-GGAGGAC---AAACGTAAGCGGTTTTCAA-AAAT-TGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGTTTTATTAATTAAATGTATT
gi|142225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CC----TGTCTGTTT--TTCAAATCTCATACAATGGAATAAGCCAGCGTTTTTTTCATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGTGAAA-TTGTAATTTTATT-G-GGAGG-T-------------------AATAATATAATTTGTGA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGC
gi|142226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -G-GA-GG-T-------------------CATAATATAATCTGCTA-----GAATGTAGTTGGGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-CAGC-----T--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATCGATATTCAGATAAATTGATATTAAATTAAAA---TTTTATGAACAGATAATAAAGCG-GGAAAAAAAGAAATATTAGCGGTTTTCTAAAAATTTGTGTATTTCTTAAATATGCGATTGCTTTATTAATCAAATGTGTTGGTAATAATAATTTAAACAAC-----T-TAa
gi|142227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142231                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTATGCCATTGCTTTATTAATTAAATGTGTTGGTAATAATTGTTTAAACAACGTATAT-TCATATGTTCATGTAATTTGTGTA
gi|142232                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTT-TATGTTATGTTCAGTTTTAAG-TT----T--AATTTTTC---AAAA-----AATAGATCCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATTAATCTGTTGTGACAACATAATCT--TAAGATATTATAA
gi|142233                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGTTCTACT-GTATATCAAAGTGGTATGCGAAAAATATAAATATGTTGTAACAATATAATT--GTATGATATTATAA
gi|142234                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGTTCTTCT-GTATATGAAAGTGGTAGGCGAAAGATATTAATCTATTGTAACAATAT-ATCT--TATGATATTATAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                           111                                                                                                                                                 11    111111     11         4444444444444444444                                                                                                                   1111111111111111111                                                                 1111  22222222                                                                                                                                                                                                                                                2222222222                                                                                 222             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 1       1      33   1                 9999999999          555                  2                         22 8888         1   777                        8888                                  444    33 2     11    000000     00    8    4444444444444444444         33                                  1   2                          2   2           0            2 2  5  2 9999999999999999999                 66666                 444  444                  2222  55555555   33                    888                                        555                       2       777                 999    1                                   1                              77777 6      1   0 3                     3  8888888888     6666   66666                                    4                           666  2          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 .       .      ..   .                 ..........          ...                  .                         .. ....         .   ...                        ....                                  ...    .. .     ..    ......     ..    .    ...................         ..                                  .   .                          .   .           .            . .  .  . ...................                 .....                 ...  ...                  ....  ........   ..                    ...                                        ...                       .       ...                 ...    .                                   .                              ..... .      .   . .                     .  ..........     ....   .....                                    .                           ...  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 0       0      22   0                 2222222222          555                  1                         99 9999         9   000                        9999                                  111    22 4     11    000000     11    5    3333333333333333333         99                                  0   7                          7   7           8            5 5  0  5 4444444444444444444                 22222                 444  444                  1111  99999999   99                    888                                        000                       9       999                 666    5                                   1                              77777 2      2   2 1                     3  1111111111     2222   22222                                    3                           333  0          
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
Reference ( family-627 )      :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
gi|142203                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTTCTAAGAT----CAATAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ATAA--A-AAAAACCAGAGACGAGACCCCCCGCCCCGCCCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAAATTTGTT-G-GGTGG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTTAACACAAATTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATAAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACTAATTCAAA---TTTTATAAACAAATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCCGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----TTGTTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATAGTAATCTGTTGTAACAACATAAT-TAATAAGATATTATAA
gi|142204                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGTAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCAACTAGCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-GTGG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CATATTT--TTTTAAAATTAGCAATTTAA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGTGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--TTTTTTTT---T---TTTTTAAAAGATCTTTTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTTTTGTAACAAC-------AATAAGATATTATAA
gi|142205                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACCTTGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATAAATAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCC-CCGCCCCACGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAATCAATGGAATAAGCCAGCGTTT-TTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGG-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGAA-TCACA-CTT-TTT--TTTTTTAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAAATATTCAGATAAATTGATAGCAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAGTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTACTCAAATATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTTT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG-TTGTTGT--TTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142206                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTAACATCAT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA--GAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATAACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGAGAC----CCC-CCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTTAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTAAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAGCTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGTTATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTATTC---AAATGTATGTATTTTTCAATTATACGATGACTTTATTAATTAAATATATTGGTAATGATTCTTTAAGCAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--ATTTTTTTAAAAAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAAAATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142207                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATTGAATAAGCCAGCGTTTTTTT-AT---------TACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAATATAATGTGTTA-----AGATGTGGTTGAGTTAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTTTTTTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGCATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG--------------TTTT---TAAA-----AAAAGATCTTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142208                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTTCTTTCAAATGTT-----------TAA---AGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GTACGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GGGT-------------------AATAATATAATTTGTTG-----GGATGTAGTTGAATAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCATA-CAT-TTC--TTTTAAA-CTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAA-CAGATAATAGAATG-GGATGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACCGTTTTAAGTTT----T--TTTTTTTT---TTAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATCGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATC-AATTAGATAGTATA
gi|142209                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCACTGATATCGTTGTCTCTGGTGTAATTTACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATACCAAATGTTTATAAA--T----ATTACACTT-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAGTCAT-GT---ACAACAACAAAAATCAGAG-------CCCTTTCCCCCCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAC-----------ATTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTT------TTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTATAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTG----TTACT---T-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTAA---TATAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAAATCATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAATTGTGT-TTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATCGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATT----T-TAACTTACGTGCAGTTTTAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----ACTAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-GTA-AAATCTGTTGTAACAACATAATCTAAT--GATATTATAA
gi|142210                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAATCGATTTCAAATGTTTATAAA--C----ATTAAACTA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATCTAATAATCCTTGTACAACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCTTG-CCC-GGAGGCAAAAC----A--TTTATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTAAGTAATTAATA---TATTTCAACACAAGTTT---G-TTA-A------TT--TTTTAAAGTTAGCTATTTT----TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---GTTTATAAACAGGTAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA---------------TTTT---CAAA-----AATAGATCCCCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-ATATTAATCTGTTGTAAAAATATAATCT--TATGATATTATA
gi|142211                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACTGATTACAAATGTTTATAAA--T----ATTAAACAA-TAT---TGAATTTATACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATTTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC-----ATTT-ATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTAAAGTAAT---TAATATATTTCAACACAAGATTG----TTA----AT-TTT--TT--AAAGTTAGCTATTTTT---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---GTCTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTATATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA--------------TTTTT---TAGA-----AATAGATCCCGTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATCAATCTGTTGTAACAACATAATCT--TATGATATTATAA
gi|142212                     :                                                                                                                                                                                         TGTGAATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGCTATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTTAAAAA--T----ATTACTGAA-TTT---TTATTTTTAACGTTTTCCTATGAT----CAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGA-AC----ACCCC-------CGCC-------------------TGTCTGTGT--TTCAAGTCTCAAACAATGCGATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAACTAAATTACCCCCTACCCCTGTCCC-GGAGGCAAAAATTGTAATTTTATT-G-GG-TG-T-------------------TATAATATAATCTGCTAGAATGGAATGTAATTGAATAAT---TA---TATTTTAACACAAGTTTTTTGTTCA-G-C-----T--TTTTAAAATTAGCTGTTTGA---TTTAACACTGATATTCAGATAAATTGATAATGAATTCAAACTTTTTTGTAAACAGATAATAAAGCGAGGAAAAAG--AAATATTAGCG
gi|142213                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTAGTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACATTGCCCTAAGGT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTTATAATCCTTGT---ACAA--C-AAGAaataaatatat
gi|142214                     :                                                                                                                                                                                         TGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--CAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTATTTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTAATAAA--T----ATTACTGAT-TTT---TTTATTTAAACATTTTCCAAAGAT----CAGTAAAATAGTATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAG
gi|142215                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATACAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-CA
gi|142216                     :                                                                                                                                                                                         TATGCATGGTTGTGTTCGTGTTA--TAGTCATCTCTTTGATATCGT----------GTATTCAACTT--AATAGAAGTTAGTTATAA-TAGACCATTATCAAATGT--AAGAACGT----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTATTCCAAAGGT----CAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AA
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                          GTGCATGTTTATTTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATGTCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCATTATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAATTTT---TAAATTT-AACGTTATCCTAAGAT----CAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---A-AA--A-AAAAACCAGAG
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAACAATACGATAAGCCAGTGTCT-TTT-ATGAACTTATTTACCCCCTACCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------TATAACATAATCTGCTA-----GAATGTAATTGAGTAAT---TA---TATTTCAAcaaacaatacgataagccagtgtcttttatgaacttatttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtaattttattgggggttataacataatctgctagaatgtaattgagtaattatatttcaa
gi|142218                     : gtgcatgtttattttcgttttttagtcatcgcatagatgtcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccattatcaaatgtttataaatattacagaatttttaaatttaacgttatcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccttgtaaaaaaaaaccagagGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAA-TTT---TTAATTTTAACGTTTTCCTAAGAT----CGGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAACCCAGAG
gi|142219                     :                                                                                                                                                                                                           TTTTAAATAGTCATTGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-AAGACCAGTATTAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTA---TGAATTT
gi|142220                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142221                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----CCCCCCCCCCCTTACC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAGTCTCAAACAATGGAATAAGCCAATGTTTATTT-ATTACCTTAATTACCGACTATCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC---TAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTT----------------GTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTT-GTT-TCTCA-----GTT--TTTTAAAATTATCTATTTGA---TTTAGCAAAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---TTTCATCAACAGATGATAGAACG-GGAGGAC---AAACGTAAGCGGTTTTCAA-AAAT-TGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGTTTTATTAATTAAATGTATT
gi|142225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCATACAATGGAATAAGCCAGCGTTTTTTTCATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGTGAAA-TTGTAATTTTATT-G-GGAGG-T-------------------AATAATATAATTTGTGA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGC
gi|142226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -G-GA-GG-T-------------------CATAATATAATCTGCTA-----GAATGTAGTTGGGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-CAGC-----T--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATCGATATTCAGATAAATTGATATTAAATTAAAA---TTTTATGAACAGATAATAAAGCG-GGAAAAAAAGAAATATTAGCGGTTTTCTAAAAATTTGTGTATTTCTTAAATATGCGATTGCTTTATTAATCAAATGTGTTGGTAATAATAATTTAAACAAC-----T-TAa
gi|142227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142231                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATGCCATTGCTTTATTAATTAAATGTGTTGGTAATAATTGTTTAAACAACGTATAT-TCATATGTTCATGTAATTTGTGTA
gi|142232                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTT-TATGTTATGTTCAGTTTTAAG-TT----T--AATTTTTC---AAAA-----AATAGATCCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATTAATCTGTTGTGACAACATAATCT--TAAGATATTATAA
gi|142233                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTACT-GTATATCAAAGTGGTATGCGAAAAATATAAATATGTTGTAACAATATAATT--GTATGATATTATAA
gi|142234                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTTCT-GTATATGAAAGTGGTAGGCGAAAGATATTAATCTATTGTAACAATAT-ATCT--TATGATATTATAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                           111                                                                                                                                                 11    111111     11         4444444444444444444                                                                                                                   1111111111111111111                                                                 1111  22222222                                                                                                                                                                                                                                                2222222222                                                                                 222             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 1       1      33   1                 9999999999          555                  2                         22 8888         1   777                        8888                                  444    33 2     11    000000     00    8    4444444444444444444         33                                  1   2                          2   2           0            2 2  5  2 9999999999999999999                 66666                 444  444                  2222  55555555   33                    888                                        555                       2       777                 999    1                                   1                              77777 6      1   0 3                     3  8888888888     6666   66666                                    4                           666  2          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 .       .      ..   .                 ..........          ...                  .                         .. ....         .   ...                        ....                                  ...    .. .     ..    ......     ..    .    ...................         ..                                  .   .                          .   .           .            . .  .  . ...................                 .....                 ...  ...                  ....  ........   ..                    ...                                        ...                       .       ...                 ...    .                                   .                              ..... .      .   . .                     .  ..........     ....   .....                                    .                           ...  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 0       0      22   0                 2222222222          555                  1                         99 9999         9   000                        9999                                  111    22 4     11    000000     11    5    3333333333333333333         99                                  0   7                          7   7           8            5 5  0  5 4444444444444444444                 22222                 444  444                  1111  99999999   99                    888                                        000                       9       999                 666    5                                   1                              77777 2      2   2 1                     3  1111111111     2222   22222                                    3                           333  0          
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
Reference ( family-627 )      :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
gi|142203                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTTCTAAGAT----CAATAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ATAA--A-AAAAACCAGAGACGAGACCCCCCGCCCCGCCCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAAATTTGTT-G-GGTGG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTTAACACAAATTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATAAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACTAATTCAAA---TTTTATAAACAAATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCCGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----TTGTTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATAGTAATCTGTTGTAACAACATAAT-TAATAAGATATTATAA
gi|142204                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGTAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCAACTAGCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-GTGG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CATATTT--TTTTAAAATTAGCAATTTAA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGTGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--TTTTTTTT---T---TTTTTAAAAGATCTTTTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTTTTGTAACAAC-------AATAAGATATTATAA
gi|142205                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACCTTGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATAAATAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCC-CCGCCCCACGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAATCAATGGAATAAGCCAGCGTTT-TTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGG-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGAA-TCACA-CTT-TTT--TTTTTTAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAAATATTCAGATAAATTGATAGCAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAGTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTACTCAAATATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTTT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG-TTGTTGT--TTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142206                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTAACATCAT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA--GAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATAACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGAGAC----CCC-CCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTTAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTAAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAGCTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGTTATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTATTC---AAATGTATGTATTTTTCAATTATACGATGACTTTATTAATTAAATATATTGGTAATGATTCTTTAAGCAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--ATTTTTTTAAAAAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAAAATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142207                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATTGAATAAGCCAGCGTTTTTTT-AT---------TACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAATATAATGTGTTA-----AGATGTGGTTGAGTTAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTTTTTTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGCATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG--------------TTTT---TAAA-----AAAAGATCTTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATC-AATAAGATATTATAA
gi|142208                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTTCTTTCAAATGTT-----------TAA---AGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GTACGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GGGT-------------------AATAATATAATTTGTTG-----GGATGTAGTTGAATAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCATA-CAT-TTC--TTTTAAA-CTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAA-CAGATAATAGAATG-GGATGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACCGTTTTAAGTTT----T--TTTTTTTT---TTAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATCGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATC-AATTAGATAGTATA
gi|142209                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCACTGATATCGTTGTCTCTGGTGTAATTTACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATACCAAATGTTTATAAA--T----ATTACACTT-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAGTCAT-GT---ACAACAACAAAAATCAGAG-------CCCTTTCCCCCCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAC-----------ATTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTT------TTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTATAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTG----TTACT---T-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTAA---TATAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAAATCATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAATTGTGT-TTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATCGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATT----T-TAACTTACGTGCAGTTTTAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----ACTAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-GTA-AAATCTGTTGTAACAACATAATCTAAT--GATATTATAA
gi|142210                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAATCGATTTCAAATGTTTATAAA--C----ATTAAACTA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATCTAATAATCCTTGTACAACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCTTG-CCC-GGAGGCAAAAC----A--TTTATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTAAGTAATTAATA---TATTTCAACACAAGTTT---G-TTA-A------TT--TTTTAAAGTTAGCTATTTT----TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---GTTTATAAACAGGTAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA---------------TTTT---CAAA-----AATAGATCCCCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-ATATTAATCTGTTGTAAAAATATAATCT--TATGATATTATA
gi|142211                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACTGATTACAAATGTTTATAAA--T----ATTAAACAA-TAT---TGAATTTATACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATTTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC-----ATTT-ATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTAAAGTAAT---TAATATATTTCAACACAAGATTG----TTA----AT-TTT--TT--AAAGTTAGCTATTTTT---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---GTCTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTATATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA--------------TTTTT---TAGA-----AATAGATCCCGTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATCAATCTGTTGTAACAACATAATCT--TATGATATTATAA
gi|142212                     :                                                                                                                                                                                         TGTGAATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGCTATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTTAAAAA--T----ATTACTGAA-TTT---TTATTTTTAACGTTTTCCTATGAT----CAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGA-AC----ACCCC-------CGCC-------------------TGTCTGTGT--TTCAAGTCTCAAACAATGCGATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAACTAAATTACCCCCTACCCCTGTCCC-GGAGGCAAAAATTGTAATTTTATT-G-GG-TG-T-------------------TATAATATAATCTGCTAGAATGGAATGTAATTGAATAAT---TA---TATTTTAACACAAGTTTTTTGTTCA-G-C-----T--TTTTAAAATTAGCTGTTTGA---TTTAACACTGATATTCAGATAAATTGATAATGAATTCAAACTTTTTTGTAAACAGATAATAAAGCGAGGAAAAAG--AAATATTAGCG
gi|142213                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTAGTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACATTGCCCTAAGGT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTTATAATCCTTGT---ACAA--C-AAGAaataaatatat
gi|142214                     :                                                                                                                                                                                         TGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--CAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTATTTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTAATAAA--T----ATTACTGAT-TTT---TTTATTTAAACATTTTCCAAAGAT----CAGTAAAATAGTATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAG
gi|142215                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATACAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-CA
gi|142216                     :                                                                                                                                                                                         TATGCATGGTTGTGTTCGTGTTA--TAGTCATCTCTTTGATATCGT----------GTATTCAACTT--AATAGAAGTTAGTTATAA-TAGACCATTATCAAATGT--AAGAACGT----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTATTCCAAAGGT----CAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AA
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                          GTGCATGTTTATTTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATGTCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCATTATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAATTTT---TAAATTT-AACGTTATCCTAAGAT----CAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---A-AA--A-AAAAACCAGAG
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAACAATACGATAAGCCAGTGTCT-TTT-ATGAACTTATTTACCCCCTACCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------TATAACATAATCTGCTA-----GAATGTAATTGAGTAAT---TA---TATTTCAAcaaacaatacgataagccagtgtcttttatgaacttatttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtaattttattgggggttataacataatctgctagaatgtaattgagtaattatatttcaa
gi|142218                     : gtgcatgtttattttcgttttttagtcatcgcatagatgtcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccattatcaaatgtttataaatattacagaatttttaaatttaacgttatcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccttgtaaaaaaaaaccagagGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAA-TTT---TTAATTTTAACGTTTTCCTAAGAT----CGGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAACCCAGAG
gi|142219                     :                                                                                                                                                                                                           TTTTAAATAGTCATTGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-AAGACCAGTATTAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTA---TGAATTT
gi|142220                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142221                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----CCCCCCCCCCCTTACC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAGTCTCAAACAATGGAATAAGCCAATGTTTATTT-ATTACCTTAATTACCGACTATCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC---TAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTT----------------GTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTT-GTT-TCTCA-----GTT--TTTTAAAATTATCTATTTGA---TTTAGCAAAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---TTTCATCAACAGATGATAGAACG-GGAGGAC---AAACGTAAGCGGTTTTCAA-AAAT-TGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGTTTTATTAATTAAATGTATT
gi|142225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCATACAATGGAATAAGCCAGCGTTTTTTTCATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGTGAAA-TTGTAATTTTATT-G-GGAGG-T-------------------AATAATATAATTTGTGA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGC
gi|142226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -G-GA-GG-T-------------------CATAATATAATCTGCTA-----GAATGTAGTTGGGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-CAGC-----T--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATCGATATTCAGATAAATTGATATTAAATTAAAA---TTTTATGAACAGATAATAAAGCG-GGAAAAAAAGAAATATTAGCGGTTTTCTAAAAATTTGTGTATTTCTTAAATATGCGATTGCTTTATTAATCAAATGTGTTGGTAATAATAATTTAAACAAC-----T-TAa
gi|142227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--A-ATTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATCT--TATGATATTGTAA
gi|142231                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATGCCATTGCTTTATTAATTAAATGTGTTGGTAATAATTGTTTAAACAACGTATAT-TCATATGTTCATGTAATTTGTGTA
gi|142232                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTT-TATGTTATGTTCAGTTTTAAG-TT----T--AATTTTTC---AAAA-----AATAGATCCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATTAATCTGTTGTGACAACATAATCT--TAAGATATTATAA
gi|142233                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTACT-GTATATCAAAGTGGTATGCGAAAAATATAAATATGTTGTAACAATATAATT--GTATGATATTATAA
gi|142234                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTTCT-GTATATGAAAGTGGTAGGCGAAAGATATTAATCTATTGTAACAATAT-ATCT--TATGATATTATAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      AA   A                 TGTCTCTGGT          TTT                  A                         CG GCAT         T   GCT                        TTCT                                  ACA    CA C     AC    AC         CG    G    ACACACACACACACCCTCT         CT                                  A   C                          T   C                        G T  A  G GGGGGGGGGGGGGGGGGGG                 GAATG                 TAA  ATA                  TTGT  ACACATA    TT                    AAT                                        CTT                       A       AAG                 TAA    G                                   T                              GTATA A      T     G                     T  GTTGTTTT       AAAA   TTTTT                                    C                           TAA  A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      .    A                 .                   TTT                  .                         .  GCAT         .   GCT                        TTCT                                  .      .  .     TC    AC         CG    A    ACACACACACACACCCTCT         .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GCA   ACACTT     .                     AAT                                        .                         .       G                   AA     G                                   T                              .     A      T     .                     .  TTTT           T      .                                        C                           AA   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      .    A                 .                   TTT                  .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     CA    AC         TT    G    .                           .                                   T   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GAA   ACACAT     .                     .                                          .                         .       .                   .      G                                   T                              .     .      T     .                     .  TATT           T      .                                        C                           AA   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      .    A                 .                   TTT                  .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     CA    AC         CT    G    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GCA   ACACAT     .                     .                                          .                         .       .                   .      G                                   T                              .     .      T     .                     .  TTTT           T      .                                        C                           AA   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      .    A                 .                   TTT                  .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     AC    AC         CT    G    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GCA   ATACAT     .                     .                                          .                         .       .                   .      G                                   T                              .     .      T     .                     .  TAAT           T      .                                        C                           AA   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       T      .    T                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     CC    AC         CC    C    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GCA   ACTT       .                     .                                          .                         .       .                   .      T                                   A                              .     .      T     .                     .  TAA            C      .                                        A                           AA   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       T      .    G                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     CC    CC         CC    C    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    TTG   CAGC       .                     .                                          .                         .       .                   .      C                                   G                              .     .      T     .                     .  TAA            C      .                                        C                           T    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       T      .    G                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     C     CC         CC    C    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    TTG   AAT        .                     .                                          .                         .       .                   .      C                                   G                              .     .      T     .                     .  TAA            T      .                                        C                           T    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       C      .    T                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     C     .          G     T    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    GTT   AGC        .                     .                                          .                         .       .                   .      T                                   T                              .     .      G     .                     .  .              C      .                                        A                           T    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       T      .    T                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     C     .          G     .    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    TTG   TCA        .                     .                                          .                         .       .                   .      G                                   C                              .     .      .     .                     .  .              C      .                                        A                           T    A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       C      .    T                 .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     C     .          G     .    .                           .                                   A   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    G     AA         .                     .                                          .                         .       .                   .      G                                   A                              .     .      .     .                     .  .              A      .                                        G                           T    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 A       T      .    A                 .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     C                .     .    .                           .                                   T   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    .     CT         .                     .                                          .                         .       .                   .      .                                   A                              .     .            .                                                                                       .                           G    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 G       C      .    T                 .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     .                           .                           .                                   .   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                    .     CT         .                     .                                          .                         .       .                                                              T                                                                                                                                         .                           T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       C      .    T                 .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .     .                                                                                           .   .                          .   .                        . .  .  . .                                   .                     .    .                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 T       C      .    T                 .                   A                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .                                                                                                                                                             . .  .  . .                                   .                     .    .                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                .    T                 .                   T                    .                         .  .            .   .                          .                                     .      .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                       .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                       .                   C                    .                         .  .            .   .                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AC****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TNNT******                                                                                 T**
originalCons                  :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCTAATANGATATTATAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TTTNNT------TTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCT--TANGATATTATAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                           111                                                                                                                                                 11    111111     11         4444444444444444444                                                                                                                   1111111111111111111                                                                 1111  22222222                                                                                                                                                                                                                                                2222222222                                                                                 11111             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 1       1      33   1                 9999999999          555                  2                         22 8888         1   777                        8888                                  444    33 2     11    000000     00    8    4444444444444444444         33                                  1   2                          2   2           0            2 2  5  2 9999999999999999999                 66666                 444  444                  2222  55555555   33                    888                                        555                       2       777                 999    1                                   1                              77777 6      1   0 3                     3  6666666666     6666   66666                                    4                           66666  3          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 .       .      ..   .                 ..........          ...                  .                         .. ....         .   ...                        ....                                  ...    .. .     ..    ......     ..    .    ...................         ..                                  .   .                          .   .           .            . .  .  . ...................                 .....                 ...  ...                  ....  ........   ..                    ...                                        ...                       .       ...                 ...    .                                   .                              ..... .      .   . .                     .  ..........     ....   .....                                    .                           .....  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                 0       0      22   0                 2222222222          555                  1                         99 9999         9   000                        9999                                  111    22 4     11    000000     11    5    3333333333333333333         99                                  0   7                          7   7           8            5 5  0  5 4444444444444444444                 22222                 444  444                  1111  99999999   99                    888                                        000                       9       999                 666    5                                   1                              77777 2      2   2 1                     3  9999999999     2222   22222                                    3                           44444  8          
consensus                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NNTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATC--T--TANGATATTATAA
Reference ( family-627 )      :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTNTTATGTTCGTTTTA--TAGNCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTN--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACCAGAGAC----CCCCCCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCG-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--NNTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATC--T--TANGATATTATAA
gi|142203                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTTCTAAGAT----CAATAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ATAA--A-AAAAACCAGAGACGAGACCCCCCGCCCCGCCCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAAATTTGTT-G-GGTGG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTTAACACAAATTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATAAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACTAATTCAAA---TTTTATAAACAAATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCCGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----TTGTTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATAGTAATCTGTTGTAACAACATAAT---TAATAAGATATTATAA
gi|142204                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGTAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCAACTAGCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-GTGG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CATATTT--TTTTAAAATTAGCAATTTAA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGTGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--TTTTTTTT---T---TTTTTAAAAGATCTTTTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTTTTGTAACAACA-A--------TAAGATATTATAA
gi|142205                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACCTTGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATAAATAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCC-CCGCCCCACGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAATCAATGGAATAAGCCAGCGTTT-TTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATTGG-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGAA-TCACA-CTT-TTT--TTTTTTAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAAATATTCAGATAAATTGATAGCAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAGTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTACTCAAATATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTTT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG-TTGTTGT--TTTTTTTT---TAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATCA-A--TAAGATATTATAA
gi|142206                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTAACATCAT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA--GAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATAACAGCA-TTT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGAGAC----CCC-CCGCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTTAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTAAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAGCTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGTTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGTTATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTATTC---AAATGTATGTATTTTTCAATTATACGATGACTTTATTAATTAAATATATTGGTAATGATTCTTTAAGCAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACAGTTTTAAG-TT----T--ATTTTTTTAAAAAAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAAAATAATCA-A--TAAGATATTATAA
gi|142207                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTATCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATTGAATAAGCCAGCGTTTTTTT-AT---------TACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-TGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAATATAATGTGTTA-----AGATGTGGTTGAGTTAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCACA-CAT-TTTTTTTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGCATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACCTACAGTTTTAAG--------------TTTT---TAAA-----AAAAGATCTTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCAAAACATTTTAATCTGTTGTAACATTATAATCA-A--TAAGATATTATAA
gi|142208                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAC-AGAGAC----CCCCC-GCCCCGCGCC-------------------TGTCTGTTTCTTTCAAATGTT-----------TAA---AGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GTACGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GGGT-------------------AATAATATAATTTGTTG-----GGATGTAGTTGAATAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGCA-TCATA-CAT-TTC--TTTTAAA-CTAGCTATTTGA---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAA-CAGATAATAGAATG-GGATGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAATGTATGTATTTCTCAATTATGCGATGACTTTATTAATTAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATTTTTCT-TAACTTACGTACCGTTTTAAGTTT----T--TTTTTTTT---TTAA-----AAAAGATCCTCTCGTATATCGAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGTTGTAACAACATAATCAAT--TA-GATAGTATA
gi|142209                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCACTGATATCGTTGTCTCTGGTGTAATTTACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATACCAAATGTTTATAAA--T----ATTACACTT-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTTAAGAT----CAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAGTCAT-GT---ACAACAACAAAAATCAGAG-------CCCTTTCCCCCCGCC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAC-----------ATTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTT------TTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTATAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTG----TTACT---T-TTT--TTTTAAAATTAGCTATTTAA---TATAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---TTTTATAAACAAATCATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAATTGTGT-TTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATCGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAATATT----T-TAACTTACGTGCAGTTTTAAG-TT----T--AA-TTTTT---CAAA-----ACTAGATCCTCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-GTA-AAATCTGTTGTAACAACATAATC--T--AATGATATTATAA
gi|142210                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAATCGATTTCAAATGTTTATAAA--C----ATTAAACTA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATCTAATAATCCTTGTACAACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCTTG-CCC-GGAGGCAAAAC----A--TTTATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTAAGTAATTAATA---TATTTCAACACAAGTTT---G-TTA-A------TT--TTTTAAAGTTAGCTATTTT----TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---GTTTATAAACAGGTAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA---------------TTTT---CAAA-----AATAGATCCCCTCGTATATTGAAGTGGTATGCGAAA-ATATTAATCTGTTGTAAAAATATAATC--T--TATGATATTATA
gi|142211                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTTTTATGTTTGTTTTA--TAGGCATCGTATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACTGATTACAAATGTTTATAAA--T----ATTAAACAA-TAT---TGAATTTATACGTTTTCCTAAGAT----CAGTAAAGTAATATCTAAATTTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAACAAGAG-------CCCCCTCCCC-TGAC-------------------TGTCTGTTT--TTCTAATCT------ATGGAATAAGCCAGTGTTTATCT-ATGACCTTAATTTACGACAACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC-----ATTT-ATT-G-AG-GA-T-------------------AATAATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTAAAGTAAT---TAATATATTTCAACACAAGATTG----TTA----AT-TTT--TT--AAAGTTAGCTATTTTT---TTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTCAAA---GTCTATAAACAGATAATAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTAGCGGTTTTC---AAAACTGTATATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATGAAATGTATTGGCGATAATTCTTTAAACAAC-----T-TAAT-T--------------------GTTTTAA--------------TTTTT---TAGA-----AATAGATCCCGTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATCAATCTGTTGTAACAACATAATC--T--TATGATATTATAA
gi|142212                     :                                                                                                                                                                                         TGTGAATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGCTATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTTAAAAA--T----ATTACTGAA-TTT---TTATTTTTAACGTTTTCCTATGAT----CAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAA--CAGA-AC----ACCCC-------CGCC-------------------TGTCTGTGT--TTCAAGTCTCAAACAATGCGATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGAACTAAATTACCCCCTACCCCTGTCCC-GGAGGCAAAAATTGTAATTTTATT-G-GG-TG-T-------------------TATAATATAATCTGCTAGAATGGAATGTAATTGAATAAT---TA---TATTTTAACACAAGTTTTTTGTTCA-G-C-----T--TTTTAAAATTAGCTGTTTGA---TTTAACACTGATATTCAGATAAATTGATAATGAATTCAAACTTTTTTGTAAACAGATAATAAAGCGAGGAAAAAG--AAATATTAGCG
gi|142213                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTAGTTTTATGTTTGTTTTA--TAGTCATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTC--AATACAAGTTAGTTATGA-TAAACCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACATTGCCCTAAGGT----CAGTAAAGTAATATGAAAATCTTATAATCCTTGT---ACAA--C-AAGAaataaatatat
gi|142214                     :                                                                                                                                                                                         TGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--CAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTATTTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-TAAACCATTATCAAATGTTAATAAA--T----ATTACTGAT-TTT---TTTATTTAAACATTTTCCAAAGAT----CAGTAAAATAGTATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAAACAGAG
gi|142215                     :                                                                                                                                                                                         TGTGTATTATTATGTTTGTTTTA--TAGACATCGCATTGATATCGT----------GTAATTAACTA--AATACAAGTTCGTTATGA-TAAACCAATACAAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-CA
gi|142216                     :                                                                                                                                                                                         TATGCATGGTTGTGTTCGTGTTA--TAGTCATCTCTTTGATATCGT----------GTATTCAACTT--AATAGAAGTTAGTTATAA-TAGACCATTATCAAATGT--AAGAACGT----ATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTATTCCAAAGGT----CAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AA
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                          GTGCATGTTTATTTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATGTCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCATTATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAATTTT---TAAATTT-AACGTTATCCTAAGAT----CAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---A-AA--A-AAAAACCAGAG
gi|142217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAACAATACGATAAGCCAGTGTCT-TTT-ATGAACTTATTTACCCCCTACCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------TATAACATAATCTGCTA-----GAATGTAATTGAGTAAT---TA---TATTTCAAcaaacaatacgataagccagtgtcttttatgaacttatttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtaattttattgggggttataacataatctgctagaatgtaattgagtaattatatttcaa
gi|142218                     : gtgcatgtttattttcgttttttagtcatcgcatagatgtcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccattatcaaatgtttataaatattacagaatttttaaatttaacgttatcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccttgtaaaaaaaaaccagagGTGCATGTTTATGTTCGTTTTT--TAGTCATCGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAAAACAAGTTAGTTAAGA-TAATCCAATATCAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGAA-TTT---TTAATTTTAACGTTTTCCTAAGAT----CGGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAACCCAGAG
gi|142219                     :                                                                                                                                                                                                           TTTTAAATAGTCATTGCATAGATATCGT----------GTAATTAACTTTTAATACAAGTTAGTTAAGA-AAGACCAGTATTAAATGTTTATAAA--T----ATTACAGCA-TTA---TGAATTT
gi|142220                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142221                     :                                                                                                                                                                                                                                       ----------GTAATCCGTTC--AATACAAATTAGTTATGA-TAAACAAATATCAAATGTTTATAAA--TGCATATTACAGCA-TAT---TGAATTTAAACGTTTTCTCAACGTTTCTCAGTAAAGTTATATGTAAATCTAATAATCCTTGT---ACAA--A-AAAAA--AGAGCC----CCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACCCTCTTGTCTGTTT--TTCAAATCTTAAACAATGGAATAAGCCAGTGTTTATTT-ATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTATT-C-GG-GG-T-------------------AATGATATAATTTGCTA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-C----T-TTT--TTTT--AATTATCTTTTTGA----TTAACA
gi|142222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-AGCA-TATGCTTGAATTTAAACGTTTTCCCAAGAA----CAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAAT
gi|142224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----CCCCCCCCCCCTTACC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAGTCTCAAACAATGGAATAAGCCAATGTTTATTT-ATTACCTTAATTACCGACTATCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC---TAATTTTATT-G-GG-GG-T-------------------AATAATATAATTT----------------GTTGAGTAAT---TA---TATTTCATCACAAGTTT-GTT-TCTCA-----GTT--TTTTAAAATTATCTATTTGA---TTTAGCAAAGATATTCAGATAAATTGATAACAAATTTAAA---TTTCATCAACAGATGATAGAACG-GGAGGAC---AAACGTAAGCGGTTTTCAA-AAAT-TGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGTTTTATTAATTAAATGTATT
gi|142225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CC-------------------TGTCTGTTT--TTCAAATCTCATACAATGGAATAAGCCAGCGTTTTTTTCATGACCTTAATTACCGACTACCCCTG-CCC-GGAGGTGAAA-TTGTAATTTTATT-G-GGAGG-T-------------------AATAATATAATTTGTGA-----GGATGTAGTTGAGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGGC
gi|142226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -G-GA-GG-T-------------------CATAATATAATCTGCTA-----GAATGTAGTTGGGTAAT---TA---TATTTCAACACAAGTTTGTTG-TT-CAGC-----T--TTTTAAAATTAGCTATTTGA---TTTAACATCGATATTCAGATAAATTGATATTAAATTAAAA---TTTTATGAACAGATAATAAAGCG-GGAAAAAAAGAAATATTAGCGGTTTTCTAAAAATTTGTGTATTTCTTAAATATGCGATTGCTTTATTAATCAAATGTGTTGGTAATAATAATTTAAACAAC-----T-TAa
gi|142227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTGAAATTTTAACATAGATATTCAGATAAATTGATAACA
gi|142229                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--AA-TTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATC--T--TATGATATTGTAA
gi|142230                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA---TTTTATAAATACATATTAGAACG-GGAGGAA---AAATGTTACCGGTTTTC---AAATGTGTGTATTTCTCAATTATGCGATGGCTTTATTAATAAAATGTATTGGTAATAATTCTTTAAACAAC-----TATAATATTTTTCA-TAACTTACGTACAGTTTGAAG-TT----T--AA-TTTTT---CAAA-----AAAAGATTCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCAAAACATATTAATCTGCTGTAACAACATAATC--T--TATGATATTGTAA
gi|142231                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATGCCATTGCTTTATTAATTAAATGTGTTGGTAATAATTGTTTAAACAACGTATAT-TCATATGTTCATGTAATTTGTGTA
gi|142232                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTT-TATGTTATGTTCAGTTTTAAG-TT----T--AATTTTTC---AAAA-----AATAGATCCTCTCGTATATTAAAGTGGTATGCGAAAAATATTAATCTGTTGTGACAACATAATC--T--TAAGATATTATAA
gi|142233                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTACT-GTATATCAAAGTGGTATGCGAAAAATATAAATATGTTGTAACAATATAATT--G--TATGATATTATAA
gi|142234                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTTCTTCT-GTATATGAAAGTGGTAGGCGAAAGATATTAATCTATTGTAACAATAT-ATC--T--TATGATATTATAA