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lowQualScore                  :          444   1                                      0            9   6          1   8                    9      0000     2                         5               5                  7     99   5     8   66     6 000         9  999999 11111 33      444             555555555555555555  111111         8888 99999 33    7   11   8   999 222 777   11             0   
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Reference ( gi|77310 )        :  TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGGTAATAGATGGATGTAGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATACGACATCAGTCATGTGATGTTTTGCTTATATTTA-ACAAATTGTTAAAAAAAGGA-GCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----CTGATCAGAACT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-A-TCAA-TTTTCAACATTGTAAAA
gi|77312                      :  TTTAAAAC---GAA-AATTTATTAATTGAAATAAAA-CAGTATCTTGCATTTT-GTGTGTTATAAA-TGGATAATAGATGGATGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACAT-TGACATCAGTCATGTGATGTATTGCTTGTATTTA-ACAAACCTTTAAAAAA-TGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-G-TCAA-TTTTCAACA
gi|77311                      :  TTTGAAAG---GAA-TTGTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGACATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATGATAGATGTGTGTTGGGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATCGTTGCAATATGCGACATCAGTCATATGATGGTTTGCTTATATTTA-ACAAACCGTT-AAAAAAGGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TA-AACACT---GGTCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGGGA-CCC---G---G-G-TCAA-TTTTCAACA
gi|77313                      :  TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGCCTTTCTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATCGGTGTTGTGTATTTAATGTCGACTGA-AAAGCG----TACCA-TGCTTATGTTTAATTGTTGTAACATTCGACATCAGTCATGTGATGTTTTACTTATATTTA-ACAACCCGTT-AAAAAAGGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACAAT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATTTGA-CCC---G---T-G-TCAA--TTTCAACGGTGTCAAA
gi|77315                      :  TCTAAATG---GAA-ATTTTATCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGCATTTTTGTTTGTAATAAA-TAGATAATAGATGGGAGTTGGATAGTTAATGTAGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCT--TGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTTTGCTTATATTTA-GCAAATCGTT--AAAAACGA-CCCCAT-T---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTTAACG-----A-C--T--G--TT-----TCGATCAGAATT-TA-A---T--GTCG-AAATGTGA-CGC---G---G-G-TCAA-TTTTCAAAGTTGTCAAA
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gi|77319                      :  TTTCAAAG---GAC-AGTTT-TTAATTGAAATGAAAACAGTATTTGGCATTTGTGTGTGTAATAAA-CGGATGATAGATGGATGTAGTGTATTTAATGTAGACTGA-AAAGCCTGAATACCAGGGCTTATGTTTAATAGTTGCAACATGCGACATCAGT--------------CTTATATTTA-ACAAACCGTT-AAAAAAGGA-CCCAAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCGACG-----G-C--T--T--TT-----TTGGTCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCCTT-G---GCG-TCAT-TATTCAAC
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gi|77321                      :  TTTAAAAG---GAT-ATTTTATTAATTGAAATAAAAATAGTATCAGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGAATAATAAATGGGGGTTGTGTAATTAATGTCGATTGA-AAACAT----TACCATGGCTTATGTTTAATGGTCACAACATGCGACAGTAGTCATGTGATACTTTGCTTATATTtgtaaa
gi|77322                      :   TCAAAAGTATGAACATTGTTTCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGGATTTTTGTATGTAATAAA-TGGATAATAGATGGTTGTTGTGTATTTAATGTCTATTGA-AAAGCT----TACCAGGGATTATGCTGAATTGTTGCAACGAGCGACATCAGTCATGTTACGTTTTGCTTATATTTA-ACAAACTGTT-AAAAAATGA-CCGCAT-G---TATGATCAA-AA------C-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-G-TCAA-TTTT-AACA
gi|77323                      :          ---GAA-ATTTTATCAATTGAAATAAAAACAGTATCTTGCATTCT-GTGTGTTATAAA-TGGATAATAGATAGTTGT---GTATTTAATGTCGATCGT-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATATAATGTTTTGCTTGTATTAA-ACAAAACGTTAAAAA--TGA-CCCCAT-G---TCTGATCTA-AA------T-----TT-AACACT---GATTAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-G-TAAA-TTTTCAACATTG
gi|77324                      :                                      ACTGTAGCTGGCAGTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATAGATGTTGTGTATTTAATGTCGATTAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGTTCATTTGTTGCAACATGCGACATC--------------TTGCTTGTATTTA-AATAACCGTTAAAAA--GGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TG-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--ATTG-AAATATGA-CAC---G---G-G-TCAA-TTTTCAACAggtcaa
gi|77325                      :                                                                                         TGTATTTAATGTCGATCGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTAATGTTTTGCTTATATTTA-ACAAACCGTT-AAAAAATGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-GTTCAT-TTTTCAAC
gi|77326                      :                                                                                               tgttcTCG-TTAC-AAAGCT----TATCAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTTGAATGATGTTTCGCTAATATTTA-ACAAACCGTTAAAAAAAGGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A----T--A--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATCTGA-CCC---G---G-T-TCAA-TTCTTAAggggtcaa
gi|77327                      :                                                                                                         TAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGCTTAATTGTTGCAACATGCGACA------------------GCTAATATTTA-ACAAACCGTTAAAAA--GGA-CCCCAT-G---TGTGATCAA-AA------T-----TT-CACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-CA-A---C--GTTG--AAT-TCA-TCG---G---G-G-TCAA-tgggatcaaa
gi|77328                      :                                                                                                         TGACAAAGCT----TATCATGGCTTATGTTTAAGTGTTGCATCATGCGACAT-----ATAT-ATATAT-----ATATATATATATATT--------AAGGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACAAT---GATCAGTTTTCATAG-----G-C--T--G--TT------TGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCT---G---G-G-TCAA-TTTTCAAC
gi|77329                      :                                                                                                            -AAGGCT----TACCCGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCAACATCAGTCATGTGATGTTTTGCTAATATTTT-GCAAACAGTTATAAAA-GGA--CCCATTG---TCTGATCAA-AA------T-----AT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTA-AAACGTGA-CCC---G---T-T-TCAA-TTTTCGACggggt
gi|77330                      :                                                                                                            -AAAGCT----TACGAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCAACATCAGTCATGTGATGTTTCGCTTATATTTA-ACAAACCGTT-AAAAAATGA-CCCCAT-G---TATGATCAA-AG------T-----TA-AA------------------AAAG-----ATC--T--G--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-T-TCAA-TTTTCAACA
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gi|77332                      :                                                                                                                                    GTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTC--------------TAATATTAA-ACAAACCGTTAAAAAA-GGA-CCCCAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTTTCAACG-----A-C--T--A--TT-----TTGATCAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-CCCTTGG---G-G-TCAT-TTTTCAACAaatttacttccttgat
gi|77333                      :                                                                                                                                                                       ATGCTTTGCTTATATTTA-ACAAACCGGTAAAAAACG-A-CCCCAT-G---TCTGATTAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCAGTTATCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGGTGAGAATT-TA-A---T--GTTG-AAATGTGA-TCC---G---G-G-TCAA-TTTTTAGTATTggatcaaa
gi|77334                      :                                                                                                                                                                                       TG-ACGAAATGTTAAA----GCATGCCC-T-GGCATCTGATCAA-AT------T-----TT-AACGTT---GATCAG-TATCAACG-----A-C--T--G--TA-----AAAATCTAAGTT-TT-A---A--GTTG-AAAttcaacggggtcaaa
gi|77335                      :                                                                                                                                                                                                     AAAAAAG------CAT-G---TCTGATCAA-AA------T-----TT-AACACT---GATCCGTTTTCAACG-----A-C--T--G--TT-----TTGATCAGGATT-TA-A---C--GTTG-AAATGTGA-CCC---G---G-G-TAAA-TTTTCAACA
gi|77323                      :                                                                                                                                                                                                          ttGA-CCCAAT-G---T-TGA---A-AA------T-----TT-ACC-CG---GGTCACATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAA
gi|77312                      :  gaaattttatcaattgaaataaaaacagtatcttgcattctgtgtgttataaatggataatagatagttgtgtatttaatgtcgatcgtaaagcttaccatggcttatgtttaattgttgcaacatgcgacatcagtcatataatgttttgcttgtattaaacaaaacgttaaaaatgaccccatgtctgatctaaatttaacactgattagt---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAaa
gi|77311                      :                   tttaaaacgaaaatttattaattgaaataaaacagtatcttgcattttgtgtgttataaatggataatagatggatgttgtgtatttaatgtcgattgaaaagcttaccatggcttatgtttaattgttgcaacattgacatcagtcatgtgatgtattgcttgtatttaacaaacctttaaaaaatgaccccatg---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GACCAGTGTTTAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatgttgaaatgtgacccgggtcaattttcaaca
gi|77315                      :                tttgaaaggaattgttattaattgaaataaaaacagtatctgacatttttgtgtgtaataaatggatgatagatgtgtgttgggtatttaatgtcgattgaaaagcttaccatggcttatgtttaatcgttgcaatatgcgacatcagtcatatgatggtttgcttatatttaacaaaccgttaaaaaaggaccccatg---TCTGATCGA-AACAGTCGT-----TA-AAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAAatttaatgttgaaatgggacccgggtcaattttcaaca
gi|77322                      :                    tctaaatggaaattttatcaattgaaataaaaacagtatttggcatttttgtttgtaataaatagataatagatgggagttggatagttaatgtagattgaaaagcttaccatggcttgtttaattgttgcaacatgcgacatcagtcatgtgatgttttgcttatatttagcaaatcgttaaaaacgaccccat---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTT-AA---------------G--TT-----TTGATCAatttaatgtcgaaatgtgacgcgggtcaattttcaaagttgtcaaa
gi|77316                      :           tcaaaagtatgaacattgtttcaattgaaataaaaacagtatttgggatttttgtatgtaataaatggataatagatggttgttgtgtatttaatgtctattgaaaagcttaccagggattatgctgaattgttgcaacgagcgacatcagtcatgttacgttttgcttatatttaacaaactgttaaaaaatgaccgcatgta---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatgttgaaatgtgacccgggtcaattttaaca
gi|77324                      :                           tttaaaacgaaattttattaaatgaaataaaaacagtatattacattttgtgttttataaatggaaaatatatggatgttgtgtatttaatgccgattgaaaagcttaccatgccttatgtttaattgttgcaacagtcatgtgatgttttgcttgtaattaacaaaccgttaaaaaatgaccccatg---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTTCAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatgtttaaatgtgacccgtgtcaattttcaaca
gi|77325                      :                                                               actgtagctggcagttttgtgtgtaataaatggataatagatagatgttgtgtatttaatgtcgattaaaaagcttaccagggtttatgttcatttgttgcaacatgcgacatcttgcttgtatttaaataaccgttaaaaaggaccccatg---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatattgaaatatgacacgggtcaattttcaaca
gi|77326                      :                                                                                             tgttctgtatttaatgtcgatcgaaaagcttaccatggcttatgtttaattgttgcaacatgcgacatcagtcatgtaatgttttgcttatatttaacaaaccgttaaaaaatgaccccatg---TCTGATCAA-AA------TATCG-TTGAAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatgttgaaatgtgacccgggttcatttttcaacggggtcaa
gi|77329                      :                                                                                                             tcgttacaaagcttatcagggcttatgtttaattgttgcaacatgcgacatcagttgaatgatgtttcgctaatatttaacaaaccgttaaaaaaaggaccccatg---TCTGATCAA-AACAGTCGT-----TG-AAAACT---GATCAGTGTT-A-------------T--A--TT-----TTGATCAGAatttaatgttgaaatctgacccggttcaattcttaatgggatcaaa
gi|77332                      :                                                                                                                     aaggcttacccgggcttatgtttaattgttgcaacatgcaacatcagtcatgtgatgttttgctaatattttgcaaacagttataaaaggacccattg---TCTGATCAA-AA------TAGTCGTTGAAAACT---GATCAGTGTTAAA------------------TT-----TTGATCAGAatttaatgttaaaacgtgacccgtttcaattttcgac
gi|77326                      :                                                                                                                                                             gtttaattgttgcaacatgcgacatcagtctaatattaaacaaaccgttaaaaaaggaccccatgATTAAGAA------T-----TG-AAC-CG---GGTCAGATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAA---TA-T---C--GTTG-AAAACTGA-TCA---GT--G-T-TAAA-TTTTatttaatgttgaaatgtgacccttggggtcatttttcaacaggatcaaa
gi|77336                      :                                                                                                             tcgttacaaagcttatcagggcttatgtttaattgttgcaacatgcgacatcagttgaatgatgtttcgctaatatttaacaaaccgttaaaaaaaggaccccatgtctgatcATTAA-A--------------T-AACAGTCGGGGTCAGTTTTCAG------------T--G--TTAAAAGTTGATCA---CT-CATC---T--GTTG-AAA-GTGA-CCCATGG---G-G-TCAT-TTTTCAACgggatcaaa
gi|77322                      :                                                                                                                                                                                                                               TTAA-AA------T-----T--GACCCG---GGTCACATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-TCA---G---T-G-TTAAGTTTTGATCATggggtcaaa
gi|77312                      :                      tcaaaagtatgaacattgtttcaattgaaataaaaacagtatttgggatttttgtatgtaataaatggataatagatggttgttgtgtatttaatgtctattgaaaagcttaccagggattatgctgaattgttgcaacgagcgacatcagtcatgttacgttttgcttatatttaacaaactgttaaaaaatgaccgcatgtAA-AA------T-----T--GACCCG---GGTCACATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-TCA---GT--G-T-TAAA-TTTTca
gi|77316                      :                      tttaaaacgaaaatttattaattgaaataaaacagtatcttgcattttgtgtgttataaatggataatagatggatgttgtgtatttaatgtcgattgaaaagcttaccatggcttatgtttaattgttgcaacattgacatcagtcatgtgatgtattgcttgtatttaacaaacctttaaaaaatgaccccatgtctgatcAA-AA------T-----T--GACACG---GGTCACATTTAAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-TCA---GT--G-T-TAAA-TTTTcaaca
gi|77325                      :                              tttaaaacgaaattttattaaatgaaataaaaacagtatattacattttgtgttttataaatggaaaatatatggatgttgtgtatttaatgccgattgaaaagcttaccatgccttatgtttaattgttgcaacagtcatgtgatgttttgcttgtaattaacaaaccgttaaaaaatgaccccatgtctgatcAA-AA------A-----TG-AACCCG---GGTCACATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-TCA---GT--G-T-TAAA-TTTTcaaca
gi|77335                      :                                                                                                tgttctgtatttaatgtcgatcgaaaagcttaccatggcttatgtttaattgttgcaacatgcgacatcagtcatgtaatgttttgcttatatttaacaaaccgttaaaaaatgaccccatgtctgatcAA-AA------T-----TT--ACCCG---GGTCACATTTCAACG-------T--TAAA--TC-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAA----A---C---G---G-A-TCAG-TGTTAAATTTTGcaacggggtcaa
gi|77313                      :                                                                                                                                                                                                               ttaaaaaagcatgtctgatA-AA------T-----T--GACACG---GGTCAAATTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAcaaca
gi|77317                      : tttaaaaggaaattttattaattgaaataaaaacagtatttggcctttctgtgtgtaataaatggataatagatcggtgttgtgtatttaatgtcgactgaaaagcgtaccatgcttatgtttaattgttgtaacattcgacatcagtcatgtgatgttttacttatatttaacaacccgttaaaaaaggaccccatgtctgatcaaaatttaacaatgatcagtA-AA------T-----T--GACCCG---GGTCATATTTCAAC------A-T--T--GAATT-----CTGATCAAAAC---A-AG--C--GTTG-AAA----A-CC--------G-A-TCAG-TGTTAAATTTTGcaacggtgtcaaa
gi|77327                      :                                            tttaaaaggaaataattaactgaaataaaaacagtattttacatttttgtgtataattagatggatggtgtgtatttaatgttgattgaaaatcataccagggcttatgtcaattgttgcatcatgcgacatcagtcatgttatattttgcttatatttaacaaaccgttaaaaaaaggaccctatgtcggat-----TT-GACCCC---GATGAATT--CAACG-------T--T--GAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-TCA---GTGTG-A---AA-TTTTccaacagggtcaaa
gi|77337                      :                                                                                                                                                                  taaaaagcttaccagggtttatgcttaattgttgcaacatgcgacagctaatatttaacaaaccgttaaaaaggaccccatgtgtgatc---GGTCAGTTTTCAA------------T--G--TTAAAAATTGATCA---CT-CA-----TCCGTTG-AAAAGTGA-CCCATGG---G-A-TCAT-TTTTTAAC
gi|77339                      :                                                                                                                                                                                                                                                           ---GGTCAGTTTTCAATGTTAAAA-A--T--G-----------GATCA---CT-CA-----TCCGTTG-AAAAGTGA-CCCATGG---G-G-TCAT-TTTTCAACAggggtcaaa
gi|77340                      :                                                                                                                                                                                                                                                           ---GGTCAGTTTTCAATGTTAAAA-A--T--G-----------GATCA---CT-CA-----TCCGTTG-AAAAGTGA-TCCATAG---G-G-TCAT-TTTTCAACgggttaaa
gi|77341                      :                                                                                                                                                                                                                                                           ---GGTCAGTTTTCAATGTTA--A-CAAT--G-----------GATCA---CT-CA-----TCCGTTG-AAAAGTGA-ACCATGG---G-G-TCAT-TTTTCAACggggtcaaa
gi|77338                      :                                                                                                                                                                                                                                                           ---GATCAGTTTTCAA------------T--G--TT-----AAAAATATATCTCTC-A---TCCGTTG-AAAAGTGA-CCCATTG---G-G-TTAT-TTTTCAACggggtcaaa
gi|77311                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTCAAC------A-T--T--AAATT-----CTGATCAAAAC---A-G---TC-GTTG-AAAACTGA-CCA---GT--G-T-TTAA-TTTTggggtcaaa
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gi|77333                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              ggtcagttttcaatgttaaaaatggatcactcatccA-A---T--ACTA-AAAATTGA-CCC---G---G-A-TCAC-ATTTCAACATTa
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Reference ( family-621 )      : TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATGGGTGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAACT-TA-AT--GTTGAAANGTGACCC---GG-G-TCANTTTTCAACATT--GTCAAA
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Alignments
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lowQualScore                  :         000   9                                      1            7              5                        8      9999     0                                         1      7                      5     4          888                    333             3  3     11111              222222  22               555  4 4   777777777          44        
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Reference ( family-621 )      : TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATGGGTGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCANGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTTCAACG--GGGTCAAA
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gi|77311                      : TTTGAAAG---GAA-TTGTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGACATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATGATAGATGTGTGTTGGGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATCGTTGCAATATGCGACATCAGTCATATGATGGTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTAAACACT---GGTCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGGGACCC---GG-G-TCA---------ATTTTCAACattgtaaaa
gi|77312                      : TTTAAAAC---GAA-AATTTATTAATTGAAATAAAA-CAGTATCTTGCATTTT-GTGTGTTATAAA-TGGATAATAGATGGATGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACAT-TGACATCAGTCATGTGATGTAT-TGCTTGTATTTAACAAACCTTTAAAAAA-TGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTTCAACa
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gi|77315                      : TCTAAATG---GAA-ATTTTATCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGCATTTTTGTTTGTAATAAA-TAGATAATAGATGGGAGTTGGATAGTTAATGTAGATTGA-AAAGCT----TACCATGGCT--TGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAGCAAATCGTT--AAAAACGACCCCATT---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTTAACGA-CTGTT-----TCGATCAGAATTTA------AT--GTCGAAATGTGACGC---GG-G-TCA---------ATTTTCAAAG--TTGTCAAAta
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gi|77319                      : TTTCAAAG---GAC-AGTTT-TTAATTGAAATGAAAACAGTATTTGGCATTTGTGTGTGTAATAAA-CGGATGATAGATGGATGTAGTGTATTTAATGTAGACTGA-AAAGCCTGAATACCAGGGCTTATGTTTAATAGTTGCAACATGCGACATCAGT---------------CTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAAGGACCCAATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCGACGG-CTTTT-----TTGGTCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCCTT-GGCG-TCA---------TTATTCAAC---GGGTCAAA
gi|77320                      : TTTAAAAG---GAA-ATATTATTTACTGAATTAAAAATAGTTTCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGAATAATAAATGGGTGTTGTGTAATTAATGCCGATTGA-AA-GCT----TACCATAGCTTATGTTTCATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-ATAAAAGGACCCTTTG---TCTGATCATAATTTAA-----------------CAACGA-CTCTT-----TTGATCAGAAAAAA------AT--GTTGAAATATGACCC---GT-G-TAA---------A
gi|77321                      : TTTAAAAG---GAT-ATTTTATTAATTGAAATAAAAATAGTATCAGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGAATAATAAATGGGGGTTGTGTAATTAATGTCGATTGA-AAACAT----TACCATGGCTTATGTTTAATGGTCACAACATGCGACAGTAGTCATGTGATACTT-TGCTTATATT
gi|77322                      :  TCAAAAGTATGAACATTGTTTCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGGATTTTTGTATGTAATAAA-TGGATAATAGATGGTTGTTGTGTATTTAATGTCTATTGA-AAAGCT----TACCAGGGATTATGCTGAATTGTTGCAACGAGCGACATCAGTCATGTTACGTTT-TGCTTATATTTAACAAACTGTT-AAAAAATGACCGCATG---TATGATCAAAACTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTT-AAC
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gi|77324                      :                                     ACTGTAGCTGGCAGTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATAGATGTTGTGTATTTAATGTCGATTAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGTTCATTTGTTGCAACATGCGACATC--------------T-TGCTTGTATTTAAATAACCGTTAAAA--AGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTGAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--ATTGAAATATGACAC---GG-G-TCA---------ATTTTCAAC
gi|77325                      :                                                                                   TGTTCTGTATTTAATGTCGATCGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTAATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAATGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-GTTCA---------TTTTTCAACG--GGGTCAAa
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gi|77327                      :                                                                                                        TAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGCTTAATTGTTGCAACATGCGACA-------------------GCTAATATTTAACAAACCGTTAAAA--AGGACCCCATG---TGTGATCAAAATTTCACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTCA------AC--GTTG-AAT-TCATCG---GG-G-TCA---------A
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Reference ( family-621 )      : TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATGGGTGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCANGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTTCAACG--GGGTCAAA
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gi|77317                      : TTTAAAAG---GAA-ATA--ATTAACTGAAATAAAAACAGTATTTTACATTTTTGTGTATAAT-----------TAGATGGATGGTGTGTATTTAATGTTGATTGA-AAATCA----TACCAGGGCTTATGTC-AATTGTTGCATCATGCGACATCAGTCATGTTATATTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCTATG---TCGGATCAAAATTTAACACT---GATCGGTTTTCAACGC-TTGTT-----TTGATCAGAATTCA------AT--GTTGAAATATGACCC---GG-G-TCA---------ATTTCCAACA--GGGTCAAAa
gi|77318                      : TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAATAGTATCTAGCATTTTTGTGTGTAATAAAATGAATAATAAATGGGTATTGTGTAATTAATGTCAATTGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATTAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTGACAAACCGTT-AAAAAGGGATCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAG---TCAATGA-CTGTT-----TTGATTAGAATTTA------AT--
gi|77319                      : TTTCAAAG---GAC-AGTTT-TTAATTGAAATGAAAACAGTATTTGGCATTTGTGTGTGTAATAAA-CGGATGATAGATGGATGTAGTGTATTTAATGTAGACTGA-AAAGCCTGAATACCAGGGCTTATGTTTAATAGTTGCAACATGCGACATCAGT---------------CTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAAGGACCCAATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCGACGG-CTTTT-----TTGGTCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCCTT-GGCG-TCA---------TTATTCAAC---GGGTCAAA
gi|77320                      : TTTAAAAG---GAA-ATATTATTTACTGAATTAAAAATAGTTTCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGAATAATAAATGGGTGTTGTGTAATTAATGCCGATTGA-AA-GCT----TACCATAGCTTATGTTTCATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-ATAAAAGGACCCTTTG---TCTGATCATAATTTAA-----------------CAACGA-CTCTT-----TTGATCAGAAAAAA------AT--GTTGAAATATGACCC---GT-G-TAA---------A
gi|77321                      : TTTAAAAG---GAT-ATTTTATTAATTGAAATAAAAATAGTATCAGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGAATAATAAATGGGGGTTGTGTAATTAATGTCGATTGA-AAACAT----TACCATGGCTTATGTTTAATGGTCACAACATGCGACAGTAGTCATGTGATACTT-TGCTTATATT
gi|77322                      :  TCAAAAGTATGAACATTGTTTCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGGATTTTTGTATGTAATAAA-TGGATAATAGATGGTTGTTGTGTATTTAATGTCTATTGA-AAAGCT----TACCAGGGATTATGCTGAATTGTTGCAACGAGCGACATCAGTCATGTTACGTTT-TGCTTATATTTAACAAACTGTT-AAAAAATGACCGCATG---TATGATCAAAACTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTT-AAC
gi|77323                      :         ---GAA-ATTTTATCAATTGAAATAAAAACAGTATCTTGCATTCT-GTGTGTTATAAA-TGGATAATAGATAG---TTGTGTATTTAATGTCGATCGT-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATATAATGTTT-TGCTTGTATTAAACAAAACGTT--AAAAATGACCCCATG---TCTGATCTAAATTTAACACT---GATTAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TAA---------ATTTTCAACATTGGGTCAAa
gi|77324                      :                                     ACTGTAGCTGGCAGTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATAGATGTTGTGTATTTAATGTCGATTAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGTTCATTTGTTGCAACATGCGACATC--------------T-TGCTTGTATTTAAATAACCGTTAAAA--AGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTGAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--ATTGAAATATGACAC---GG-G-TCA---------ATTTTCAAC
gi|77325                      :                                                                                   TGTTCTGTATTTAATGTCGATCGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTAATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAATGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-GTTCA---------TTTTTCAACG--GGGTCAAa
gi|77326                      :                                                                                                   TCG-TTAC-AAAGCT----TATCAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTTGAATGATGTTT-CGCTAATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA--TATT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATCTGACCC---GG-T-TCA---------ATTCTTAATG--GGATCAAA
gi|77327                      :                                                                                                        TAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGCTTAATTGTTGCAACATGCGACA-------------------GCTAATATTTAACAAACCGTTAAAA--AGGACCCCATG---TGTGATCAAAATTTCACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTCA------AC--GTTG-AAT-TCATCG---GG-G-TCA---------A
gi|77328                      :                                                                                                        TGACAAAGCT----TATCATGGCTTATGTTTAAGTGTTGCATCATGCGACAT-----ATAT-ATATATATATATATATATA--------TTAA-----GGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACAAT---GATCAGTTTTCATAGG-CTGTT-----T-GATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCT---GG-G-TCA---------ATTTTCAACG--GGGT
gi|77329                      :                                                                                                           -AAGGCT----TACCCGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCAACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTAATATTTTGCAAACAGTTATAAAA-GGACCCATTG---TCTGATCAAAATATAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTAAAACGTGACCC---GT-T-TCA---------ATTTTCGAC
gi|77330                      :                                                                                                           -AAAGCT----TACGAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCAACATCAGTCATGTGATGTTT-CGCTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAATGACCCCATG---TATGATCAAAGTTAAA------------------AAAGATCTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-T-TCA---------ATTTTCAAC
gi|77331                      :                                                                                                           -AAAGTT----TTCCAAGGTTTATGTTTAATTGTTGCAACATGTGACATCAGTCATTTGATGTTT-TGCTTA----TAACAAATCGTT-AAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAATTTTAATACT---AAGGAGTTTTAATTTA-CTTCC-----TTGATa
gi|77332                      :                                                                                                                                   GTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTC---------------TAATATTAAACAAACCGTTAAAA-AAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTATT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCCTTGGG-G-TCA---------TTTTTCAACA--GGATCAAA
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gi|77335                      :                                                                                                                                                                                                    AAAAAAG-----CATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCCGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGGATTTA------AC--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TAA---------ATTTTCAAC
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blockSeqs                     :         .     .                                      T            .              A                        .      .        T                                                .                      A                .                      .               C  .     .                  .       .                ATA  . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      T            .              A                        .      .        G                                                .                      A                .                      .               C  .     .                  .       .                ATG  . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      T            .              G                        .      .        T                                                .                      A                .                      .               T  .     .                  .       .                TT   . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      T            .              A                        .      .        G                                                .                      A                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      T            .              G                        .      .        T                                                .                      A                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      .            .              G                        .      .        T                                                .                      A                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      .            .              T                        .      .        G                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :         .     .                                      .            .              A                        .      .        T                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :                                                      .            .              .                        .      .        G                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        T                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        G                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        G                                                .                      .                .                      .               A  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        T                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        G                                                .                      .                .                      .               A  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        G                                                .                      .                .                      .               T  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                           .      .        A                                                .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .                      .                .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    .                      .               C  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .               .  .     .                  .       .                .    . .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .               .  .     .                  .       .                .    . .   .                    
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                           .               .  .     .                  .       .                                                
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Reference ( family-621 )      : TTTAAAAG---GAA-ATTTTATTAATTGAAATAAAAACAGTATCTGGCATTTTTGTGTGTAATAAA-TGGATAATAGATGGGTGTTGTGTATTTAATGTCGATTGA-AAAGCT----TACCANGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTGATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTTCAACG--GGGTCAAA
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gi|77322                      :  TCAAAAGTATGAACATTGTTTCAATTGAAATAAAAACAGTATTTGGGATTTTTGTATGTAATAAA-TGGATAATAGATGGTTGTTGTGTATTTAATGTCTATTGA-AAAGCT----TACCAGGGATTATGCTGAATTGTTGCAACGAGCGACATCAGTCATGTTACGTTT-TGCTTATATTTAACAAACTGTT-AAAAAATGACCGCATG---TATGATCAAAACTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TCA---------ATTTT-AAC
gi|77323                      :         ---GAA-ATTTTATCAATTGAAATAAAAACAGTATCTTGCATTCT-GTGTGTTATAAA-TGGATAATAGATAG---TTGTGTATTTAATGTCGATCGT-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATATAATGTTT-TGCTTGTATTAAACAAAACGTT--AAAAATGACCCCATG---TCTGATCTAAATTTAACACT---GATTAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TAA---------ATTTTCAACATTGGGTCAAa
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gi|77325                      :                                                                                   TGTTCTGTATTTAATGTCGATCGA-AAAGCT----TACCATGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTCATGTAATGTTT-TGCTTATATTTAACAAACCGTT-AAAAAATGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCC---GG-GTTCA---------TTTTTCAACG--GGGTCAAa
gi|77326                      :                                                                                                   TCG-TTAC-AAAGCT----TATCAGGGCTTATGTTTAATTGTTGCAACATGCGACATCAGTTGAATGATGTTT-CGCTAATATTTAACAAACCGTTAAAAAAAGGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCAGTTTTCAACGA--TATT-----TTGATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATCTGACCC---GG-T-TCA---------ATTCTTAATG--GGATCAAA
gi|77327                      :                                                                                                        TAA-AAAGCT----TACCAGGGTTTATGCTTAATTGTTGCAACATGCGACA-------------------GCTAATATTTAACAAACCGTTAAAA--AGGACCCCATG---TGTGATCAAAATTTCACACT---GATCAGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGAATTCA------AC--GTTG-AAT-TCATCG---GG-G-TCA---------A
gi|77328                      :                                                                                                        TGACAAAGCT----TATCATGGCTTATGTTTAAGTGTTGCATCATGCGACAT-----ATAT-ATATATATATATATATATA--------TTAA-----GGACCCCATG---TCTGATCAAAATTTAACAAT---GATCAGTTTTCATAGG-CTGTT-----T-GATCAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGACCT---GG-G-TCA---------ATTTTCAACG--GGGT
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gi|77333                      :                                                                                                                                                                      ATGCTT-TGCTTATATTTAACAAACCGGTAAAAAACG-ACCCCATG---TCTGATTAAAATTTAACACT---GATCAGTTATCAACGA-CTGTT-----TTGGTGAGAATTTA------AT--GTTGAAATGTGATCC---GG-G-TCAATTTTTAGTATTTTCAACG--GGGTCAAA
gi|77334                      :                                                                                                                                                                                       TGACGAAATGTTAAAGCATG---CCC-TGGCATCTGATCAAATTTTAACGTT---GATCAG-TATCAACGA-CTGTA-----AAAATCTAAGTTTT------AA--GTTGAAA
gi|77335                      :                                                                                                                                                                                                    AAAAAAG-----CATG---TCTGATCAAAATTTAACACT---GATCCGTTTTCAACGA-CTGTT-----TTGATCAGGATTTA------AC--GTTGAAATGTGACCC---GG-G-TAA---------ATTTTCAAC
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